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Reference ( gi|17190 )        : AGCGA-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-C--CG---T--GC-G-T-T--T-ATTTT-----------C------------A----------------A-------T-AC----------A---------------C-------T-C-AT--G--T--CCC---T--C---T--------TA---A---TCCC-A---A----T---T-T--C--T-G--T-TA----AAA--GTA--AA---G---A-A-AGAA-TT--TGTG--------AT---A--A-A-ATTAATA-T---------TT-AA-A-----------------T-ATTTTT-----------TTCA-T--GA-CTTA-C--AA------CGTA-CCA-G-TG--ATA-G--------GTCCT-TGG---GTTG-TGTCGT-A---TCC-CGCCT-ACTA-CA-C--A-ATA---TATAACGTTTCCATCA
gi|17192                      : AGCGA-TCTTC--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-C--CG---T--GCAG-T-T--T-ACTTC-----------G------------A----------------A-------T-AC----------A---------------C---------C-AT--G--T--CCC---T--C---T---------A---A---TCCC-A---A----T---T-T--C--T-G--T-TA----AAA--GTA--AA---G---A-A-ATTA-TT---GTG--------AT---A--A-A-ATTAA-A-T---------TT-AA-A-----------------TGAATTTT-----------TTCA----AA-CTTA-C--AA------CGTA-CAAAG-TG--ATA-G--------GTCCT-TGA---GTTG-T-TCGT-A---TCC-CGCCT-ACTA-CA-C--A-ATA---TATAACGTTTCCATCA
gi|17191                      : AGCGA-TCTTC--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-C--CG---T--GCAG-T-T--T-ACTTC-----------G------------A----------------A-------T-AC----------A---------------C---------C-AT--G--T--CCC---T--C---T---------A---A---TCCC-A---A----T---T-T--C--T-G--T-TA----AAA--GTA--AA---G---A-A-ATTA-TT---GTG--------AT---A--A-A-ATTAA-A-T---------TT-AA-A-----------------TGAATTTT-----------TTCA----AA-CTTA-C--AA------CGTA-CAAAG-TG--ATA-G--------GTCCT-TGA---GTTG-T-TCGT-A---TCC-CGCCT-ACTA-CA-C--A-ATA---TATAACGTTTCCATCA
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gi|17194                      : AGCGA-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-C--CG---A--GC-G-T-T--T-ACTTT-----------C------------A----------------A-------T-GC----------A---------------C-------T-C-AT--G--T--CCC---TCAC---T--------TA---A----CCC-G---T----T---T-T--C--
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gi|17212                      :  GCGA-TCT-T--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-C--CT---T--GG-G-T-T--T-ATTTT-----------C------------A----------------G-------T-A
gi|17214                      :  GCGA-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-A----------GC-G-T-T--T-ATTTT-----------C------------A----------------G-------T-AC----------
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gi|17215                      :  GCGA--CT-C--C-GT-A-A---A----CA-T-TCCA-C--TG---T--GC-C-T-T--G-ATTTCAGTACAGTA--C------------A----------------AA------T-AC----------A---------------C-------T-T-AT--G--T--CTC---C--C---TTTTCTCTCTA---A---TTCT-A---A----A---A-T--C-------T-TA----AGT--GT--------G---A-A-AATA-TT--GCTG--------AT---A--A-G-Atctaaatcttaagtgtgaaaatattgccgatagcaaat
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gi|17219                      :   CGA-TCT-CGCC-GT-ATA---A----CA-T-TC-A-C--CG---T--GC-G-T-A--A-ATTTT-----------C------------A----------------A-------T-AC----------A---------------C-------T-CGAT--G--T--CCC---G--C---T---------A---A---TCCC-A---A----T---T-C--T--G-G--T-TA----AAAAAGTA--AA---G---A-A--GAA-TT--TGTG--------ATG--A--A-A-ATTAATAAT---------TT-AA-A-----------------T-ATTTTT-----------TGCAATA-GA-CCTATC--AA------CGT--CCA-G-TG--ATA-G---------TCCT-TGG---GTTG-TGTGCT-A---TCC-CGCCT-ACTA-CA-C--A-GTA---GATAACGT
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gi|17221                      :   CGA-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-C--CG---T--GC-G-T-T--T-ATTTT-----------C------------AGTGGTACAA-------A-------T-CC----------A---------------C-------T-C-AT--A--T--CCC---C--C---T--------TT---C---TCTC-T---A----T---T-T--C--T-A--T-TA----AAA--GTA--AA---G---A-A-AGAA-TT--TGTG--------AT---G--A-T-ATTTATA-T---------T
gi|17222                      :   CGA-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-C--CG---T--GC-G-T-T--T-ATTTT-----------CAGTATGGTACA-A----------------A-------T-AC----------A---------------C-------T-C-AT--A--T--CCC---C--CA--T--------T--------TTCC-T---A----TTTCT-T--C--T-G--T-TA----AAA--GTA--AA---G---A-A-AGAA-TT--TGTG--------AT---A--
gi|17223                      :   CGA-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-TGTC-A-C---GAA-T--GC-G-T-T--T-ATTTT-----------C------------AGTATCGTTTACAA---A-------T-AC----------A---------------C-------T-C-AT--G--T--CCC------C---T--------TT---C---TCCC-T---A----T---T-T--T--TTA--T-TA----AA----TA--AT---------A-AGAA-TT--TGTG--------AT---A--A-C-ACTAATA-T---------TC-AT-A-----------------T-A
gi|17224                      :   CGA-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-C--CG---T--GC-G-T-T--T-ATTTT-----------CAATACGGTACA-A----------------A-------T-AC----------A---------------C-------T-C-GT--G--T--CTC---T--CTATT--------TATCTA---TTCT-A---AAACCT---T-T--TAGT-G--T-TA----AAA--
gi|17226                      :     A-TCT-C--C-GT-A-A---AACGATA-T-CC-G-C--GG---TC-GC-G-TGT--T-ATTTT-----------CCATTGACGG---A----------------G-------T-AC----------AAAATAAG--------C-------TGC-AT--GATT--CCC---TG-C---T--------TC-------TCGC-A---A----T---T-C--G--T-G--T-TA----AAA--GTA--AA---GG--A-A-AGGA-TTAATGTG--------ATT--AT-A-A-ATTA-TA-T---------TT-AA-AG----------------T-GAATTT-----------TTCA-T--AA--TTA-C--AA------CGTA-CAA-G--G--ATG-GATTTTAGGGTCCT-TGG----TTGATGTCGT-A---TCC-AACCT-ACTA-CA-C--
gi|17225                      :     A-TCT-C--C-GT-A-A---AACGATA-T-CC-G-C--GG---TC-GC-G-TGT--T-ATTTT-----------CCATTGACGG---A----------------G-------T-AC----------AAAATAAG--------C-------TGC-AT--GATT--CCC---TG-C---T--------TC-------TCGC-A---A----T---T-C--G--T-G--T-TA----AAA--GTA--AA---GG--A-A-AGGA-TTAATGTG--------ATT--AT-A-A-ATTA-TA-T---------TT-AA-AG----------------T-GAATTT-----------TTCA-T--AA--TTA-C--AA------CGTA-CAA-G--G--ATG-GATTTTAGGGTCCT-TGG----TTGATGTCGT-A---TCC-AACCT-ACTA-CA-C--
gi|17227                      :      -TCT-T--C-GT-A-A---C----AA-T-TCCA-C--CG---CTAAT-G-G-T--T-AGTTT-----------C------------A----------------A---------AC----------A---------------C-------T-C-AT--G--T--CCC---T--C---T--------T----A---TCCC-A---A----T---T-T--C--T-G--T-------AAA--ATA--AA---G---A-A---GA-TT--TGGT--------AT------A-A-ATTAATG-----------TT-AA-A-----------------T-ATTTC-----------------T--AA-CTTA-C--A--------------A-G-TT--ACA-G--------GTCCT-GGG---ATTG-T-TCGT-A---TCC-C-CCT-ACTA--A-C--A--------ATAACGTATTCAT
gi|17228                      :      -TCT-C--T-GT-A-A---A----CA-T-TC-G-C--CG---T--GC-G-T-T--T-ATATCAGTA-------CGGTACA------A----------------A-------T-AC----------A---------------C-------T-C-AT--G--T--TTC---C--C---C--------TT---C---TCTT-T---A----T---T-T--C---------TA----AAA--
gi|17229                      :        CT-CT-C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-C---G---T--GC-A-T-TCTT-ATTTT-----------TCTA---------A----------------A-------T-ACC---------A---------------C-------T-C-ACTGG--T--CCCC--T--C---C--------TAT--A---TCCCCA---A----T---T-T--CC-T-G--T-TA----AA---GTC--AA---G---A-A-AGAACTT--TTTG--------AT---A--ACA-ATTAATA-T---------TTTAACA-----------------T-ATCTTTGTCATCGTCTATCCA-T--GA-CT-A-CCAAA------CTCATCCT-G-TT--ATCTA--------GTCCT-TGGTTCGTTG-T-TCTT-AGCCTCCGCGCCTTACT--CA-CGAA-ATA---TATAACGTTTCCA
gi|17230                      :                      ---A----CA-G-TC-C-C--CT---G--GT-G-T-T--T-ATTTT-----------C------------AGTACGGTACAA-----A-------T-AC----------A---------------C-------T-C-AT--G--C--CCC---C--C---T--------TT---C---TCCC-C---A----A---T-T--C--T-A--T-TA----AAA--GTA--AA---G---A-A-AGAA-TT--TGTG--------AT---A--A-A-ATTAAAA------------T-AA-A-----------------T-
gi|17231                      :                          ----CG-T-TC-A-C--AA---T--GA-GAT-T--T-ATTTC-----------A------------G----------------A-------T-AC----------A---------------C-------T-C-AT--G--T--CCC---T--C---TCT------TA---AAC-TCCC-A---A----CATCT-TGAC--T-G--A-TT----AAT--TTA--AA---ACGCA-A-AGAA-TT--TGTGTGACTAATAC---A--A-AGATTAACA-TAATATGTGACT-AA-ACGTAATACACGGGCACGT-ATTTTT-----------TTCA-T--AATCTCA-C--AATGCAAACGTT-CCT-G-TGGGATA-GT-------GTC---------GTTA--GTCGCCA---CCA-CGCCT-ACTA-CAGC--A-AT----TATA-CGTTTCCATCAtt
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Reference ( family-487 )      : AGCGA-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-C--CG---T--GC-G-T-T--T-ATTT-------T--------------------C--------G---------------A-A-------T-AC------A--------C-------T-C-AT--G--TC-CCC--C--T--TN----CT---CC---C-NA-T---T-T--C-TG-----T-TAA----AA--GTA--AA---G---A-A-AGAA-TT--TGTG--------AT---A--A-A-ATTAATA-T---------TTAA-A-----------------T-ATTTTTTTCA-T--A-A-CTTA-C------AACG--TA-CCA-G--------T--GATA---G--------GTCCT-TGG---GTTG-TGTCG-TA---TCC-CGCC-TACTA-CA-C--A-ATA---TATA-ACGTTTCCATCA
gi|17190                      : AGCGA-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-C--CG---T--GC-G-T-T--T-ATTT-------T--------------------C------------------------A-A-------T-AC------A--------C-------T-C-AT--G--TC-CCT--C--T--TA----AT---CC---C-AA-T---T-T--C-TG-----T-TAA----AA--GTA--AA---G---A-A-AGAA-TT--TGTG--------AT---A--A-A-ATTAATA-T---------TTAA-A-----------------T-ATTTTTTTCA-T--G-A-CTTA-C------AACG--TA-CCA-G--------T--GATA---G--------GTCCT-TGG---GTTG-TGTCG-TA---TCC-CGCC-TACTA-CA-C--A-ATA---TATA-ACGTTTCCATCA
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gi|17202                      :  GCGA-TCT-C--TTGT-A-A---A----CA-T--C-A-C--AG---T--GC-G-T-T--T-ATTT-------T--------------------C--------ATTACAGCGACGAAAAA-A-------T-AC------A--------C-------T-C-AT--G--TC-CCT--C--TAATT----CT---CCTAGT-GA-T---T-T--C-TA-----T-TAC----AATGATA--AA---A---A-GTAAAA-TT--GTTG--------ATAG-A--A-A-ATAAATA-T---------T
gi|17203                      :  GCGA-TAT-C--T-GC-A-A---A----CA-T-TC-A-C--CG---T--GC-G-T-T--T-ATTT-------TCAGTATGGTA----------C--------A---------------A-A-------T-AC------A--------C-------T-C-GT--G--TC-CCC--C--T--TT----CT---CT---C-TA-T---T-T--C-T
gi|17204                      :  GTGA-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-T-TT-A-C--TG---T--GC-G-T-T--T-ATTT-------TCAGTACGGTA----------C--------A---------------A-A-------T-AC------A--------C-------T-C-AT--G--TC-TCC--C--G--TT----CT---CT---C-TA-T---T-T--C-T
gi|17205                      :  GCGA-CCT-C--C-GT-A-A---A----TA-C-TC-A-C--CG---T--GT-G-T-T--T-ATTT-------T--------------------C------------------------A-G-------T-ACACATGTA--------C-------T-C-AT--G--TC-TTC--CA-T--TT----CT---CT---C-TA-T---A-T--C----------TAA----AATCGTA--AGTGTG---A-A-AATA-TT--GCTG--------ATCGGA--A-A-A
gi|17206                      :  GCGA-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-G-C--CG---T--GC-G-T-T--T-ATTT-------T--------------------C--------AGTACGGTACAA----A-A-------T-AC------A--------T-------T-T-AT--G--TC-CCT--C--T--TT----CT---CT---C-TA-T---T-T--C----------TAA----AAT-CTA--AGTGTG---A-A-AATA-TT--GCCG--------AT---AGCA-A-ATT
gi|17207                      :  GCGT-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-C-TC-A-C--CG---T--GC-G-T-T--T-ATTT-------TCAGTATGGTA----------C--------A---------------A-A-------T-AC------A--------C-------T-A-AT--G--AC-CCC--C--T--TT----CT---CT---C-TA-T---T-T--C----------TAA----AA--ttttacatgggtcattgaagact
gi|17208                      :  GCGA-TC--C--C-GT-A-A---A----CAAT-TT-A-T--C----T--GC-A-T-T----ATTCAGTACAGT--------------------A--------G---------------A-A-------A-AT------A--------CCATCT--T-C-AT--G--TC-CCC--C--T--TT----CT---CC---CTAA-T---T-T--C-TAC----T-T------AA--GTA--AA---G---ACA-AGAA-TT--TG-G--------AT---A--A-A-ATTTATA-----------TTAT-A-----------------T-ATT
gi|17209                      :  GCGA-TCT-C--C-GT-A-A---T----CA-T-TC-A-C--AG---T--GC-A-T-T--T-ATTT-------TCAGTACGGTA----------C--------A---------------A-A-------T-AC------A--------C-------T-C-AT--A--TT-CCC--C--T--TT----CT---CT---C-TG-T---T-T--
gi|17210                      :  GCTA-TCT-C--T-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-C--CG---T--GT-G-T-T--T-ACTT-------C--------------------C--------AGTACAGTAC------A-A-------T-AT------A--------C-------T-CAAT--G--TC-CCC--C--T--Tgaaaata
gi|17211                      :  GCAA-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-C--AG---T--GC-A-T-T--T-ATTT-------CAGTACGGTA-----------C--------A---------------A-A-------T-GC------A--------C-------T-C-AT--A--TT-CCC--C--T--TT----CT---CT---C-TA-T---T-T--C-T
gi|17212                      :  GCGA-TCT-T--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-C--CT---T--GG-G-T-T--T-ATTT-------T--------------------C--------aatatcttaggtgtgaaaatattagccgatagcaaatatcttta
gi|17213                      :  GCCA-TCT-C--C-AT-A-A---A----CA-T-TC-G-T--AG---T--GC-A-T-C--T-ATTT-------TCAGACGGTA-----------C--------A---------------A-A-------T-AC------A--------C-------T-C-AT--G--T--CCC--C--T--TT----CT---CT---C-TA-T---T-T--agta
gi|17214                      :  GCGA-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-A----------GC-G-T-T--T-ATTT-------T--------------------C------------------------A-G-------T-AC------tctaaatcttaagtgtgaaaatattgccgatagcaaat
gi|17215                      :  GCGA--CT-C--C-GT-A-A---A----CA-T-TCCA-C--TG---T--GC-C-T-T--G-ATTT-------CAGTACAGTA-----------C--------A---------------A-A-------T-AC------A--------C-------T-T-AT--G--TCTCCC--T--T--TT----CT---CT---C-TA-A---T-T--C-TAAAATCT-TAA----GT--GT--------G---A-A-AATA-TT--GCTG--------AT---A--A-G-A
gi|17216                      :   CGA-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-C--CG---T--GC-G-T-T--T-ACTT-------T--------------------C------------------------A-A-------T-AC------A--------C-------T-T-AT--G--TC-CCT--C--T--TA----AT---CC---C-AA-T---T-T--C-TG-----T-TAA----AA--GTT--AA---G---A-A-AGAA-TT--TGTG--------AT---A--A-A-ATTAATA-T---------TTGA-A-----------------T-ATTTTTTTCA-T--A-A-CCTA-C------AACG--TA-CTA-G--------T--GATA---G--------GTCCT-TGG---GTTG-TGTCG-TA---TCC-CGCC-TACTA-CA-C--A-GTA---GATA-ACGT
gi|17217                      :   CGA-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-T--CG---T--GC-G-T-T--T-ACTT-------T--------------------C------------------------A-A-------T-AC------A--------C-------T-C-AT--G--TC-CCT--C--T--TA----AT---CC---C-AA-T---T-T--C-TG-----T-TAA----AA--GTA--AA---G---A-A-AGAA-TT--TGTG--------AT---A--A-A-ATTAATATT---------TTAA-A-----------------T-A-TTTTTTCA-T--A-A-CCTA-C------AACG--TA-CCA-GA-------T--GATA---G--------GTCC---GG---GTTG-TGTCG-TA---TCC-CGCC-TACTA-CA-C--A-GTA---GATA-ACGT
gi|17218                      :   CGA-TCT-C--C-GT-A-A--------CA-T-TC-A-C--CG---T--GC-G-T-T--A-ATTT-----------------------------------------------------A-A-------T-AC------A--------C-------T-C-AC--G--TC-CTC-----T--TA----AT---CC---C-AA-T---T-T--C-TG-----T-TAA----AA--GTA--AG---G---A-G-AGAA-TT--GGTG--------AT---A--A-A-AT-AATA-T---------TTAA-A-----------------T-ATTTTTTTCA-T--A-A-CTTA-C------AACG--T-----------------------------------TCCT-TGG---GTGG-TCTCG-TA---TCC-CGCC-TACTA-CA-C--A-ATA---T-TATACGTTTCCATCA
gi|17219                      :   CGA-TCT-CGCC-GT-ATA---A----CA-T-TC-A-C--CG---T--GC-G-T-A--A-ATTT-------T--------------------C------------------------A-A-------T-AC------A--------C-------T-CGAT--G--TC-CCG--C--T---A----AT---CC---C-AA-T---T-C--T-GG-----T-TAA----AAAAGTA--AA---G---A-A--GAA-TT--TGTG--------ATG--A--A-A-ATTAATAAT---------TTAA-A-----------------T-ATTTTTTGCAAT--AGA-CCTATC------AACG--T--CCA-G--------T--GATA---G---------TCCT-TGG---GTTG-TGTGC-TA---TCC-CGCC-TACTA-CA-C--A-GTA---GATA-ACGT
gi|17220                      :   CGA-TCT-C--C-GT-A-A--------CA-T-TC-A-C--CG---T--GC-G-T-T--T-ACTT-------T--------------------C------------------------A-A-------TAAC------A--------C-------T-C-AT-----TC-CTC--------TA----AT---CC---C-TA-A---T-T--C-TGTA---T-TAA----A----T---AA---C---A-A-AGAA-TT--TGTG--------AT------A-A-ATTAATATT---------TTAA-A-----------------T-A-TTTTTTCA-CTAA-A-CCTA-CA-----AACG--TAGCCC-A--------T--GATT---A--------GTCC--TGG-----TG-TGTCA-TA---T-C-CGCC-TAC-A-CA-G--G-ATAACGTATA-
gi|17221                      :   CGA-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-C--CG---T--GC-G-T-T--T-ATTT-------T--------------------C--------AGTGGTACA-------A-A-------T-CC------A--------C-------T-C-AT--A--TC-CCC--C--T--TT----CT---CT---C-TA-T---T-T--C-TA-----T-TAA----AA--GTA--AA---G---A-A-AGAA-TT--TGTG--------AT---G--A-T-ATTTATA-T---------T
gi|17222                      :   CGA-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-C--CG---T--GC-G-T-T--T-ATTT-------TCAGTATGGTA----------C--------A---------------A-A-------T-AC------A--------C-------T-C-AT--A--TC-CCC--C--A--TT-----T---TC---C-TA-TTTCT-T--C-TG-----T-TAA----AA--GTA--AA---G---A-A-AGAA-TT--TGTG--------AT---A--
gi|17223                      :   CGA-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-TGTC-A-C---GAA-T--GC-G-T-T--T-ATTT-------T--------------------C--------AGTATCGTTTACA---A-A-------T-AC------A--------C-------T-C-AT--G--T--CCC--C--T--TT----CT---CC---C-TATT---T-T--T-TA-----T-TAA----A----TA--A--------T-A-AGAA-TT--TGTG--------AT---A--A-C-ACTAATA-T---------TCAT-A-----------------T-A
gi|17224                      :   CGA-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-C--CG---T--GC-G-T-T--T-ATTT-------TCAATACGGTA----------C--------A---------------A-A-------T-AC------A--------C-------T-C-GT--G--TC-TCT--C--T--
gi|17225                      :     A-TCT-C--C-GT-A-A---AACGATA-T-CC-G-C--GG---TC-GC-G-TGT--T-ATTT-------T--------------------CCATTGACGG---------------A-G-------T-AC------AAAATAAG-C-------TGC-AT--GATTC-CCT--G--C--TT----CT---CG---C-AA-T---T-C--G-TG-----T-TAA----AA--GTA--AA---GG--A-A-AGGA-TTAATGTG--------ATT--AT-A-A-ATTA-TA-T---------TTAA-AG----------------T-GAATTTTTCA-T--A-A--TTA-C------AACG--TA-CAA-G-----------GATG---GATTTTAGGGTCCT-TGG----TTGATGTCG-TA---TCC-AACC-TACTA-CA-C--atttatctattctaaaaccttttagtgttaaaa
gi|17226                      :     A-TCT-C--C-GT-A-A---AACGATA-T-CC-G-C--GG---TC-GC-G-TGT--T-ATTT-------T--------------------CCATTGACGG---------------A-G-------T-AC------AAAATAAG-C-------TGC-AT--GATTC-CCT--G--C--TT----CT---CG---C-AA-T---T-C--G-TG-----T-TAA----AA--GTA--AA---GG--A-A-AGGA-TTAATGTG--------ATT--AT-A-A-ATTA-TA-T---------TTAA-AG----------------T-GAATTTTTCA-T--A-A--TTA-C------AACG--TA-CAA-G-----------GATG---GATTTTAGGGTCCT-TGG----TTGATGTCG-TA---TCC-AACC-TACTA-CA-C--
gi|17227                      :      -TCT-T--C-GT-A-A---C----AA-T-TCCA-C--CG---CTAAT-G-G-T--T-AGTT-------T--------------------C--------A---------------A-A----------C------A--------C-------T-C-AT--G--TC-CCT--C--T--TA-----T---CC---C-AA-T---T-T--C-TG-----T---A----AA--ATA--AA---G---A-A---GA-TT--TGGT--------AT------A-A-ATTAATG-----------TTAA-A-----------------T-ATTTC------T--A-A-CTTA-C------A----------A-G--------T--TACA---G--------GTCCT-GGG---ATTG-T-TCG-TA---TCC-C-CC-TACTA--A-C--A--------ATA-ACGTATTCAT
gi|17228                      :      -TCT-C--T-GT-A-A---A----CA-T-TC-G-C--CG---T--GC-G-T-T--T-ATAT-------CAGTACGGTA-----------C--------A---------------A-A-------T-AC------A--------C-------T-C-AT--G--TT-TCC--C--C--TT----CT---CT---T-TA-T---T-T--C----------TAA----AA--
gi|17229                      :        CT-CT-C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-C---G---T--GC-A-T-TCTT-ATTT-------T--------------------TCT------A---------------A-A-------T-ACC-----A--------C-------T-C-ACTGG--TC-CCCTCC--TA-TA----TC---CC---C-AA-T---T-T--CCTG-----T-TAA----A---GTC--AA---G---A-A-AGAACTT--TTTG--------AT---A--ACA-ATTAATATT---------TTAACA-----------------T-ATCTTTGTCA-T--C-G-TCTATC------CATGACTA-CCA-AACTCATCCT--GTTATCTA--------GTCCT-TGGTTCGTTG-T-TCT-TAGCCTCCGCGCCTTACT--CA-CGAA-ATA---TATA-ACGTTTCCA
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gi|17231                      :                          ----CG-T-TC-A-C--AA---T--GA-GAT-T--T-ATTT----------------------------C--------A---------------G-A-------T-AC------A--------C-------T-C-AT--G--TC-CCT--C--T--CTTAAACT---CC---C-AA-CATCT-TGAC-TG-----A-TTA----AT--TTA--AA---ACGCA-A-AGAA-TT--TGTGTGACTAATAC---A--A-AGATTAACA-TAATATGTGACTAA-ACGTAATACACGGGCACGT-ATTTTTTTCA-T--A-ATCTCA-CAATGCAAACG--TT-CCT-G--------TGGGATA---GT-------GTC---------GTTA--GTCGCCA---CCA-CGCC-TACTA-CAGC--A-AT----TAT--ACGTTTCCATCAtt
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Reference ( family-487 )      : AGCGA-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-C--CG---T--GC-G-T-T--T-ATTT-------T--------------------C--------G---------------A-A-------T-AC------A--------C-------T-C-AT--G--TC-CCC--C--T--T-T----CTCC---C-NA--T---T-T--CTG-----T-TAA----AA--GTA--AA---G---A-A-AGAA-TT--TGTG--------AT---A--A-A-ATTAATA-T---------TTAA-A-----------------T-ATTTTTTTCA-T--A-A-CTTA-C------AACG--TA-CCA-G--------T--GATA---G--------GTCCT-TGG---GTTG-TGTCG-TA---TCC-CGCC-TACTA-CA-C--A-ATA---TATA-ACGTTTCCATCA
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gi|17198                      :  GTGA-TCT-C--C-GT-G-C---A----CA-T-TC-A-C--CG---T--GA-G-T-T--C-ATTT-------TGAGTACAGTA----------C--------A---------------A-A-------T-AC------A--------C-------T-C-AT--C--TC-CAC--C--T--T-T----CTCC---C-TA--T---T-T--CTA-----T-TTT----AA--GTA--AA---G---A-A-AGAA-CT--TGTG--------AT---A--A-A-ATTATTA-T---------TTAA-A-----------------TCATTTT
gi|17199                      :  GTGA-TCT-C--C-GTTA-A---A----CA-T-TC-AAC--CG---T--GC-G-T-AA-T-ATTT-------CAGTACCAGTAA---------C--------G---------------A-AA------T-AC------A--------C-------T-C-AT--G--TT-CCC--CACT--T-T----CTCC---T-TA--T---T-T--CTA-----T-CAA----AA--GTATAAA---A---A-A-AGAA-TT--TGTG--------AT---A--A-A-ATTAATA-T---------TT---A-----------------T-ATTc
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gi|17201                      :  GCGA-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-C--CG---T--GC-G-T-T--T-ATTT-------TCAGTACGGTA----------C--------A---------------A-A-------T-AC------A--------C-------T-C-AT--G---C-CCC--C--T--T-T----CTCT---C-TA--T---T-T--C---------TAA----AA--caataaattt
gi|17202                      :  GCGA-TCT-C--TTGT-A-A---A----CA-T--C-A-C--AG---T--GC-G-T-T--T-ATTT-------T--------------------C--------ATTACAGCGACGAAAAA-A-------T-AC------A--------C-------T-C-AT--G--TC-CCT--C--TAAT-T----CTCCTAGT-GA--T---T-T--CTA-----T-TAC----AATGATA--AA---A---A-GTAAAA-TT--GTTG--------ATAG-A--A-A-ATAAATA-T---------T
gi|17203                      :  GCGA-TAT-C--T-GC-A-A---A----CA-T-TC-A-C--CG---T--GC-G-T-T--T-ATTT-------TCAGTATGGTA----------C--------A---------------A-A-------T-AC------A--------C-------T-C-GT--G--TC-CCC--C--T--T-T----CTCT---C-TA--T---T-T--CT
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gi|17206                      :  GCGA-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-G-C--CG---T--GC-G-T-T--T-ATTT-------T--------------------C--------AGTACGGTACAA----A-A-------T-AC------A--------T-------T-T-AT--G--TC-CCT--C--T--T-T----CTCT---C-TA--T---T-T--C---------TAA----AAT-CTA--AGTGTG---A-A-AATA-TT--GCCG--------AT---AGCA-A-ATT
gi|17207                      :  GCGT-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-C-TC-A-C--CG---T--GC-G-T-T--T-ATTT-------TCAGTATGGTA----------C--------A---------------A-A-------T-AC------A--------C-------T-A-AT--G--AC-CCC--C--T--T-T----CTCT---C-TA--T---T-T--C---------TAA----AA--ttttacatgggtcattgaagact
gi|17208                      :  GCGA-TC--C--C-GT-A-A---A----CAAT-TT-A-T--C----T--GC-A-T-T----ATTCAGTACAGT--------------------A--------G---------------A-A-------A-AT------A--------CCATCT--T-C-AT--G--TC-CCC--C--T--T-T----CTCC---CTAA--T---T-T--CTAC----T-T------AA--GTA--AA---G---ACA-AGAA-TT--TG-G--------AT---A--A-A-ATTTATA-----------TTAT-A-----------------T-ATT
gi|17209                      :  GCGA-TCT-C--C-GT-A-A---T----CA-T-TC-A-C--AG---T--GC-A-T-T--T-ATTT-------TCAGTACGGTA----------C--------A---------------A-A-------T-AC------A--------C-------T-C-AT--A--TT-CCC--C--T--T-T----CTCT---C-TG--T---T-T--
gi|17210                      :  GCTA-TCT-C--T-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-C--CG---T--GT-G-T-T--T-ACTT-------C--------------------C--------AGTACAGTAC------A-A-------T-AT------A--------C-------T-CAAT--G--TC-CCC--C--T--T-gaaaata
gi|17211                      :  GCAA-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-C--AG---T--GC-A-T-T--T-ATTT-------CAGTACGGTA-----------C--------A---------------A-A-------T-GC------A--------C-------T-C-AT--A--TT-CCC--C--T--T-T----CTCT---C-TA--T---T-T--CT
gi|17212                      :  GCGA-TCT-T--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-C--CT---T--GG-G-T-T--T-ATTT-------T--------------------C--------aatatcttaggtgtgaaaatattagccgatagcaaatatcttta
gi|17213                      :  GCCA-TCT-C--C-AT-A-A---A----CA-T-TC-G-T--AG---T--GC-A-T-C--T-ATTT-------TCAGACGGTA-----------C--------A---------------A-A-------T-AC------A--------C-------T-C-AT--G--T--CCC--C--T--T-T----CTCT---C-TA--T---T-T--agta
gi|17214                      :  GCGA-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-A----------GC-G-T-T--T-ATTT-------T--------------------C------------------------A-G-------T-AC------tctaaatcttaagtgtgaaaatattgccgatagcaaat
gi|17215                      :  GCGA--CT-C--C-GT-A-A---A----CA-T-TCCA-C--TG---T--GC-C-T-T--G-ATTT-------CAGTACAGTA-----------C--------A---------------A-A-------T-AC------A--------C-------T-T-AT--G--TCTCCC--T--T--T-T----CTCT---C-TA--A---T-T--CTAAAATCT-TAA----GT--GT--------G---A-A-AATA-TT--GCTG--------AT---A--A-G-A
gi|17216                      :   CGA-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-C--CG---T--GC-G-T-T--T-ACTT-------T--------------------C------------------------A-A-------T-AC------A--------C-------T-T-AT--G--TC-CCT--C--T--T-A----ATCC---C-AA--T---T-T--CTG-----T-TAA----AA--GTT--AA---G---A-A-AGAA-TT--TGTG--------AT---A--A-A-ATTAATA-T---------TTGA-A-----------------T-ATTTTTTTCA-T--A-A-CCTA-C------AACG--TA-CTA-G--------T--GATA---G--------GTCCT-TGG---GTTG-TGTCG-TA---TCC-CGCC-TACTA-CA-C--A-GTA---GATA-ACGT
gi|17217                      :   CGA-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-T--CG---T--GC-G-T-T--T-ACTT-------T--------------------C------------------------A-A-------T-AC------A--------C-------T-C-AT--G--TC-CCT--C--T--T-A----ATCC---C-AA--T---T-T--CTG-----T-TAA----AA--GTA--AA---G---A-A-AGAA-TT--TGTG--------AT---A--A-A-ATTAATATT---------TTAA-A-----------------T-A-TTTTTTCA-T--A-A-CCTA-C------AACG--TA-CCA-GA-------T--GATA---G--------GTCC---GG---GTTG-TGTCG-TA---TCC-CGCC-TACTA-CA-C--A-GTA---GATA-ACGT
gi|17218                      :   CGA-TCT-C--C-GT-A-A--------CA-T-TC-A-C--CG---T--GC-G-T-T--A-ATTT-----------------------------------------------------A-A-------T-AC------A--------C-------T-C-AC--G--TC-CTC-----T--T-A----ATCC---C-AA--T---T-T--CTG-----T-TAA----AA--GTA--AG---G---A-G-AGAA-TT--GGTG--------AT---A--A-A-AT-AATA-T---------TTAA-A-----------------T-ATTTTTTTCA-T--A-A-CTTA-C------AACG--T-----------------------------------TCCT-TGG---GTGG-TCTCG-TA---TCC-CGCC-TACTA-CA-C--A-ATA---T-TATACGTTTCCATCA
gi|17219                      :   CGA-TCT-CGCC-GT-ATA---A----CA-T-TC-A-C--CG---T--GC-G-T-A--A-ATTT-------T--------------------C------------------------A-A-------T-AC------A--------C-------T-CGAT--G--TC-CCG--C--T--A------ATCC---C-AA--T---T-C--TGG-----T-TAA----AAAAGTA--AA---G---A-A--GAA-TT--TGTG--------ATG--A--A-A-ATTAATAAT---------TTAA-A-----------------T-ATTTTTTGCAAT--AGA-CCTATC------AACG--T--CCA-G--------T--GATA---G---------TCCT-TGG---GTTG-TGTGC-TA---TCC-CGCC-TACTA-CA-C--A-GTA---GATA-ACGT
gi|17220                      :   CGA-TCT-C--C-GT-A-A--------CA-T-TC-A-C--CG---T--GC-G-T-T--T-ACTT-------T--------------------C------------------------A-A-------TAAC------A--------C-------T-C-AT-----TC-CTC--------T-A----ATCC---C-TA--A---T-T--CTGTA---T-TAA----A----T---AA---C---A-A-AGAA-TT--TGTG--------AT------A-A-ATTAATATT---------TTAA-A-----------------T-A-TTTTTTCA-CTAA-A-CCTA-CA-----AACG--TAGCCC-A--------T--GATT---A--------GTCC--TGG-----TG-TGTCA-TA---T-C-CGCC-TAC-A-CA-G--G-ATAACGTATA-
gi|17221                      :   CGA-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-C--CG---T--GC-G-T-T--T-ATTT-------T--------------------C--------AGTGGTACA-------A-A-------T-CC------A--------C-------T-C-AT--A--TC-CCC--C--T--T-T----CTCT---C-TA--T---T-T--CTA-----T-TAA----AA--GTA--AA---G---A-A-AGAA-TT--TGTG--------AT---G--A-T-ATTTATA-T---------T
gi|17222                      :   CGA-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-C--CG---T--GC-G-T-T--T-ATTT-------TCAGTATGGTA----------C--------A---------------A-A-------T-AC------A--------C-------T-C-AT--A--TC-CCC--C--A--T-T-----TTC---C-TA--TTTCT-T--CTG-----T-TAA----AA--GTA--AA---G---A-A-AGAA-TT--TGTG--------AT---A--
gi|17223                      :   CGA-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-TGTC-A-C---GAA-T--GC-G-T-T--T-ATTT-------T--------------------C--------AGTATCGTTTACA---A-A-------T-AC------A--------C-------T-C-AT--G--T--CCC--C--T--T-T----CTCC---C-TAT-T---T-T--TTA-----T-TAA----A----TA--A--------T-A-AGAA-TT--TGTG--------AT---A--A-C-ACTAATA-T---------TCAT-A-----------------T-A
gi|17224                      :   CGA-TCT-C--C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-C--CG---T--GC-G-T-T--T-ATTT-------TCAATACGGTA----------C--------A---------------A-A-------T-AC------A--------C-------T-C-GT--G--TC-TCT--C--T--A-T----TTAT---C-TA--T---T-
gi|17225                      :     A-TCT-C--C-GT-A-A---AACGATA-T-CC-G-C--GG---TC-GC-G-TGT--T-ATTT-------T--------------------CCATTGACGG---------------A-G-------T-AC------AAAATAAG-C-------TGC-AT--GATTC-CCT--G--C--T-T----CTCG---C-AA--T---T-C--GTG-----T-TAA----AA--GTA--AA---GG--A-A-AGGA-TTAATGTG--------ATT--AT-A-A-ATTA-TA-T---------TTAA-AG----------------T-GAATTTTTCA-T--A-A--TTA-C------AACG--TA-CAA-G-----------GATG---GATTTTAGGGTCCT-TGG----TTGATGTCG-TA---TCC-AACC-TACTA-CA-C--ctaaaaccttttagtgttaaaa
gi|17226                      :     A-TCT-C--C-GT-A-A---AACGATA-T-CC-G-C--GG---TC-GC-G-TGT--T-ATTT-------T--------------------CCATTGACGG---------------A-G-------T-AC------AAAATAAG-C-------TGC-AT--GATTC-CCT--G--C--T-T----CTCG---C-AA--T---T-C--GTG-----T-TAA----AA--GTA--AA---GG--A-A-AGGA-TTAATGTG--------ATT--AT-A-A-ATTA-TA-T---------TTAA-AG----------------T-GAATTTTTCA-T--A-A--TTA-C------AACG--TA-CAA-G-----------GATG---GATTTTAGGGTCCT-TGG----TTGATGTCG-TA---TCC-AACC-TACTA-CA-C--
gi|17227                      :      -TCT-T--C-GT-A-A---C----AA-T-TCCA-C--CG---CTAAT-G-G-T--T-AGTT-------T--------------------C--------A---------------A-A----------C------A--------C-------T-C-AT--G--TC-CCT--C-----T-T----ATCC---C-AA--T---T-T--CTG-----T---A----AA--ATA--AA---G---A-A---GA-TT--TGGT--------AT------A-A-ATTAATG-----------TTAA-A-----------------T-ATTTC------T--A-A-CTTA-C------A----------A-G--------T--TACA---G--------GTCCT-GGG---ATTG-T-TCG-TA---TCC-C-CC-TACTA--A-C--A--------ATA-ACGTATTCAT
gi|17228                      :      -TCT-C--T-GT-A-A---A----CA-T-TC-G-C--CG---T--GC-G-T-T--T-ATAT-------CAGTACGGTA-----------C--------A---------------A-A-------T-AC------A--------C-------T-C-AT--G--TT-TCC--C--C--T-T----CTCT---T-TA--T---T-T--C---------TAA----AA--
gi|17229                      :        CT-CT-C-GT-A-A---A----CA-T-TC-A-C---G---T--GC-A-T-TCTT-ATTT-------T--------------------TCT------A---------------A-A-------T-ACC-----A--------C-------T-C-ACTGG--TC-CCCTCC--T--A-T----ATCC---C-CAATT---T-C--CTG-----T-TAA----A---GTC--AA---G---A-A-AGAACTT--TTTG--------AT---A--ACA-ATTAATATT---------TTAACA-----------------T-ATCTTTGTCA-T--C-G-TCTATC------CATGACTA-CCA-AACTCATCCT--GTTATCTA--------GTCCT-TGGTTCGTTG-T-TCT-TAGCCTCCGCGCCTTACT--CA-CGAA-ATA---TATA-ACGTTTCCA
gi|17230                      :                      ---A----CA-G-TC-C-C--CT---G--GT-G-T-T--T-ATTT-------T--------------------C--------AGTACGGTACA-----A-A-------T-AC------A--------C-------T-C-AT--G--CC-CCC--C--T--T-T----CTCC---C-CA--A---T-T--CTA-----T-TAA----AA--GTA--AA---G---A-A-AGAA-TT--TGTG--------AT---A--A-A-ATTAAAA------------TAA-A-----------------T-
gi|17231                      :                          ----CG-T-TC-A-C--AA---T--GA-GAT-T--T-ATTT----------------------------C--------A---------------G-A-------T-AC------A--------C-------T-C-AT--G--TC-CCT--C--T--C-TTAAACTCC---C-AA--CATCT-TGACTG-----A-TTA----AT--TTA--AA---ACGCA-A-AGAA-TT--TGTGTGACTAATAC---A--A-AGATTAACA-TAATATGTGACTAA-ACGTAATACACGGGCACGT-ATTTTTTTCA-T--A-ATCTCA-CAATGCAAACG--TT-CCT-G--------TGGGATA---GT-------GTC---------GTTA--GTCGCCA---CCA-CGCC-TACTA-CAGC--A-AT----TAT--ACGTTTCCATCAtt
gi|17232                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTTTTTGA-T--A-A-CTTA-C------AACA--TA-CCA-G--------T--GATA---G--------GTCCT-TGG---GTTG------------------------------------TA---TATA-ACGTTTCCATCA