lowQualScore                  :                        1                                                                                                                                            1111  11111111                             2222222222222222222222222222222222222222222                                      11      1111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                   
lowQualScore                  :     44   3 3 1 888888  4 1 22 11 1   1 55 2 44 4444 2222 4444 33 1 1 1 1 11 4444 1 1  1  1 1  11 999999   22 444444  2 2  444444 333333 22 2 2 2  3 1 1 2  666666 1 2222  22222222    1  333 222 22  1 1 1 1 2 5555555555555555555555555555555555555555555 444 1  888  2   1  1 11   2222  44   22  222 8888888888888888888888888888888888888888 33333 4444   8888888 22 33  2 1 2 22 1  33 2 1 3333  3 33 1 1 999999  55555 22 3333 22 33 2222  3333 1 1 22 1 1     222  3        
lowQualScore                  :     ..   . . . ......  . . .. .. .   . .. . .. .... .... .... .. . . . . .. .... . .  .  . .  .. ......   .. ......  . .  ...... ...... .. . . .  . . . .  ...... . ....  ........    .  ... ... ..  . . . . . ........................................... ... .  ...  .   .  . ..   ....  ..   ..  ... ........................................ ..... ....   ....... .. ..  . . . .. .  .. . . ....  . .. . . ......  ..... .. .... .. .. ....  .... . . .. . .     ...  .        
lowQualScore                  :     44   1 1 5 888888  0 4 00 99 4   4 22 7 55 2222 8888 2222 55 2 2 2 2 77 3333 2 2  2  2 2  77 999999   88 333333  4 4  444444 888888 77 2 2 3  4 1 1 3  555555 1 9999  11111111    1  666 000 77  1 1 1 1 2 4444444444444444444444444444444444444444444 333 2  000  3   2  2 77   7777  22   44  222 2222222222222222222222222222222222222222 22222 7777   7777777 00 55  9 4 9 00 4  33 8 4 0000  0 55 5 5 888888  22222 11 3333 22 88 5555  4444 6 6 22 6 6     999  6        
consensus                     : AATA--TAA-C-A-AA-----CTGT-T--G--A-ATC-TT-A-A--G----G----C----AA-A-G-T-A-C--A--A-C-G-AA-TG-G-GA--T--A---TAT--G----G-AG-A-GA------T-C----T--G-A-T-CA-G-T-C-GC-T----G-A--C-AA------C-TCCT-TC---G---T--AA-A-C-A-A-T------------A-----------T---------A--T-----T---C-TT-C-GT-CAA-TC-A--AAA----AA--TCC-GGG---A--------------A-------------------------A-----A----GTT-------C--T--GT-G-G-A--A-AA--T-G-C----TA-C--A-T-A------TA-----A--C----C--G--A--A-CG----T-G-T--G-A-AAAGA---CG-GGGTTTGC
Reference ( gi|110813 )       : AATA--TAA-C-A-AA-----CTCT-T--G--A-ATC-TT-A-A--G----G----C----AA-A-G-T-A-C--A--A-C-G-AA-TG-G-GA--T--G---TAT--G----G-AG-A-GA------T-C----T--G-A-T-CA-G-T-C-GC-T----G-A--T-AA------T-TCCT-TC---G---T--AA-A-C-A-A-T------------A-----------T---------A--A-----T---C-TT-T-GT-CAA-TC-A--AAA----AA--TCC-TGG---A--------------A-------------------------A-----A----GTT-------C--T--GT-G-G-A--A-AA--T-G-C----TA-C--A-T-A------TA-----A--C----C--G--A--A-CG----T-G-T--G-A-AAAGA---CG-GGGTTTGC
gi|110815                     : AATT--TAA-C-A-AA-----CTGT-T--G--A-ATC-TT-A-A--G----G----C----AA-A-G-T-A-C--A--A-C-G-AA-TG-G-GA--T--A---TAT--G----G-AG-A-GA------T-A----T--G-A-T-CA-G-T-C-GC-T----G-A--C-AA------C-TCTT-TC---A---T--AA-A-T-A-A-T------------A-----------T---------A--T-----T---C-TT-C-GT-CAA-TA-A--AAA----AA--TCC-TGG---A--------------A-------------------------A-----A----GTT-------C--T--GT-G-G-A--A-AA--T-G-C----TA-C--A-T-A------TA-----A--C----
gi|110814                     : AATA--TAA-C-A-AA-----CTGT-T--G--A-ATA-T--A-A--G----G----C----AA-C-G-T-A-C--A--A-C-G-AA-TG-A-GA--T--A---TGT--G----G-AG-A-GA------T-A----T--G-A-T-CA-G-T-C-GC-T----G-A--C-AA------C-TCCT-TC---G---T--AA-A-C-A-A-T------------A-----------T---------A--T-----T---C-TT-C-GT-TAG-TC-A--AAT----AA------GGG---A--------------A-------------------------A-----A----GTT-------A--GAAGT-G-G-A--A-AA--T-G-C----TA-C--A-T-A------TA-----A--C----T--G--A--A-CA----T-G-T--G-A-AAAGA---CG-GGGTTTGC
gi|110817                     : AATA--TAAAC-A-AA-----CT-----------------------G----G----C----AC-A-G-T-A-C--A--A-C-G-AA-TG-GAGA--T--A---TAT--G----G-AG-A-AA------A-C----T--G-A-T-CA-G-T-C-GC-A----G-A--C-AA------C-TCCT-TC---G---T--AA-A-C-A-A-TA-----------A-----------T---------A--T-----T---C-TTGC-GT-CAA-TC----AAA----AA--TCC--GG---G--------------C-------------------------A-----A----GTT-------C--T--GT-G-G-A--A-AA--T-G-C----TA-C--A-T-A------TA-----A--C----C--G--A--C-CG----T-G-T--G-G-AAAGA---C--GGGTTTGC
gi|110818                     : AATACTTAA-C-A-AA-----CTTT-TTTG--A-ATC-TT-A-A--G----A----CC---AACA-G-T-A-C--A--A-C-GGAA-TG-G-GAAAT--A---TAT--G----G-AG-A-GA------T-C----T--ATA-TTCA-G-T-C-GC-T----G-A--C-AA------C-TCCG-TCAGCG---T--AA-A-C-A-A-T------------A-----------T---------AT-A-----TT--C-TT-C-GT-CAA-TC----AAA----AA--TCC-AGG---G--------------AC------------------------A-----A----GTT-------C--T--GT-GAG-AACA-AA--T-G-C----TACC--A-T-A------TA-----C--C----C--GA-A--A-CG----T-G-T--G-A-AAAA-----G-GGGTT
gi|110819                     : AATA--TAA-C-A-AA-----CTGT-T--G--A-ATCCTT-A-A--G----G----C----AC-A-G-T-A-C--A--AAC-G-AA-TG-G-CA--T--A---TAT--G----G-AG-A-GA------T-C----T--G-A------G-T-C-TC-C----G-----------------CCT-TT---G---T--AA-A-C-A-A-T------------A-----------T---------A--T-----T---C-TT-C-GT-CAA-TT-A--AAAAAAGAA--CTC-GGG---A--------------AT------------------------A-----A----GTT-------C--T--GT-G-G-A--A-AA--TGG-C----TA-CA-A-T-A------TA-----
gi|110820                     : AATA--TAA-C-A-AA-----CTGT-T--G--A-ATC-TT-A-A--G----C----A----AA-A-G-T-A-CGAG--A-C-G-AA-TG-------C--G---TAT----------------------------------A-T-CA-G-T-C-GC-T----G-A--C-AC------T-ACCT-TC---T---T--AA-A-C-A-A-T------------A-----------T---------ATTT-----T---C-TT-C-GT-CAA-C-----AAA----AA--TCC-TGG---A--------------A-------------------------A-----A----G-------------------------A-AA--T-G-A----TACC--A-T-A------TA-----A--C----C--G--G--A-CG----T-GCT--G-A-AAAGA---CG-GGGTTTG
gi|110822                     : AATA--TAA-C-A-AA-----CAGT-T--G--A-ATC-TT-A-A--GCATAGTAACC----AA-A-A-T-A-C--A--A---G-AA-TG-G-GA--T--A---TAT--G----G-AGAA-AA------T-C----T--G-A-T-CA-G-T-C-TA-G----A-A--C-AA------C-T-CT-TC---G---T--AA-A-C-A-A-TC-----------A-----------T---------A--T-----T---T-TT-TCGT-CAA-TC-A--AAA----AA--TCCGGGG---G--------------A-------------------------A-----A----GTT-------C--T--AT-----------A--T-G-G----AA-C--A-C-A------TA-----A-------C--G--A--A-CG----T-G-TTGG-A-AGAG----CT-GGGTTT
gi|110821                     : AATA--TA--C-A-AA-----CCTA-T--GGGA-ATC-TA-A-C--G----G----C----AA-T-G-TCA-C--A------G-AA-TG-A--A--T--A---TAT--G----G-AG-A-GA------T-A----T--G-A-T-CA-G---C-AC-T----G-A--C-AA------T--CCT-TC---G---T--AA-A-C-A-A-T------------G-----------T---------A--T-----T---C-TT-C-GT-CAA-TC-A--AAT----A----TA-TGG---G--------------A-------------------------A-----A----GTT-------C--T--AT-G-GAA--A-AA--T-G-C------------C-A------TA-----A--C----T--G--A--A-TG----T-G-C--G-ATCAAGA---AG-GGGTT
gi|110823                     : AATA--TAA-C-A-AAA----CGTT-T--G--A-ATC-TT-A-A--G----G----C----AA-A-G-T-A-C--A--A-C-G-AA--G-G-GA--T--A---CAT--GGA--G-AG-A-GA------T-A----T--G-A-T-CA-G-T-C-GC-T----G-A--CAAA------C-TTCT-TC---G---T--AA-A-C---A-T------------A-----------T---------A--T-----T---C----T-GT-CAA-TA-A--AAA----AAAGTC--------A--------------A-------------------------A-----A----GTT-------
gi|110824                     : AATA--TAA-C-A-G------CTAT-T--G--A-ATG-TT-A-A--G----G----C----AA-G-A-T-A-------A-C-G-AA-TG-G-GA--TC-A---TAT--G----G-AG-AAGA------T-A----T--G-A-T-CA-G-T-C-GCCT----G-A--C-AAA-----C-TCCT-T-----------GA-A-C-C-A-T------------A-----------T---------A--------T---T-TT-C-GT-CGA-TT-A--AAA----AAA-TCC-TTG---A--------------A-------------------------A-----G----G-----------------------------------C----TA-C--A-T-A------TAG----A--C----C--ATTA--C-CG----T-T-T--G-A-AAAGA---CGCGGGTTTG
gi|110826                     : AATA--TAA-----AA-----C----------A-AAC-TT------G----G----C----AC-A-G-T-A-C--A--A-C-G-AA-TG-G--A--T--A---TTT--G----G-GG-A-GAGAGAAAT-C----TTGG-A-T-CA-G-T-C-GC-A----G-AC-T-AA------C-TC---------------------------------------------------T---------A--A-----T---T-TT-CCGT-CAAATC-A--AAA----AA---CC-GGG---G--------------A-------------------------A-----A-----TT-------C--T--GT-G-G-A--A-AAA-T-G-C----TA-C--A-T-AA-----TA-----A--C----C--G--A--AACG----T-G-T--G-G-AAATA---CG-GGGTTTGC
gi|110825                     : AATACTTAA-CCA-AA-----CTGT-T--G--A-AAC-----------------------------------C--A--A-C-G-AA-TG-G-GA--T--A---TAT--G----G-AG-A-GAT-----T-C----TG-G-A-T-CA-G-T-C-GC-T----G-A--C-AA------C-TCCT-TTCG-G---TTAAA-A-C-A-ACT------------A-----------T---------ATTA-----T---T-TT-T-GCATAA-AC----AAA----AA--TC---GG---AG-------------G-------------------------A-----A----GTT-------C--T--GT-G-G-A--A-AA--T-G-CTATGTA-C--A-T-A------TACTAGGA--C----C--G--ATTA-CG----T-A-T--G-A-AGAGA---
gi|110827                     : AATA--TAA-C-A-AA-----CTGT-T--G--A-ATC-GT-A-A--G----G----T----AA-A-G-T-A-C--A--A-C-A-AA-TG-G-GA--T--A---CAT--G----G-AG-A-AA------T----------------------------------A--T-GA------T-TCCT-TC---G---T--AA-A-C-A-A-T------------A-----------T---------A--T-----T---C-TT-C-GT-C
gi|110828                     : AATA--TAA-C-A-A------TTGT-T--G--A-ATC-TT-A-A--G----G----C----AC-A-C-T-A-C--A--A-C-G-AA-TG-G-GA--T--A---TAT--G----G-A--A-GA------T-C----T--G-A-T-CA-G-TCC-GC-T----G-A--C-A-----------CT-CC---A---T--AA-A-A-A-A-T------------A-----------A---------A--A-----T---
gi|110816                     : AATT--TAA-CTA-AA-----CTGT-T--G--AGATC-TT-ACA--GC---G----C----AA-A-G-T-AGC--A--AGC-G-AA-TG-T-GA--TTGA---TAT--GTGATG-AT-A-GT------T-A----T--G-AAT-CA-G-T-CTGT-TT---G-ACAT-AG------C-TCTT-TC---A---T--AA-A-T-A-A-T------------A-----------T---------A--T-----T---C-TT-C-GT-CAA-TA-ATTAAA----AA--TCC-TGG---A--------------A-------------------------A-----ATAATATA-------CATT--GT-G-G-A--A-AA--T-G-C----a
gi|110829                     : AATT--TAA-C-A-A--------CTGT--G--A--TC-T--A-A--G----G----C----AC-ATG-T-T-C--AC-A-C-T-AA-TG-A-GA--T--A---TAT--G----G--G-A-GA------T-C----T--G-A-T-CA-G-T-CGGC-TG---G-A--C-AA------C-TCCT-TC---G---T--AACA-C-A-AGT------------A-----------C---------A--T-----T---C-TT-C-GT-CAA-TT-----------AA--TCTGTGG---A--------------A-------------------------A-----
gi|110830                     : AATA--TAAAC-A-AATGA--CTGT-T--G--A-ATC-TT-ATA--G----G----CACATAG-A-G-T-A-A--A--A-C-G-AA-TA-G-G---------------------------GA------T-C----T--G-A-TCCA-G-T-C-GT-TGACAG-A--C-AA------C-TCCTCTC---G---T--AA-A-CAA-A-T------------AG----------T---------A--T-----T---C-TT-C-GT-CAA-T
gi|110832                     :  ATA--TAA-C-ACAG-----CAGT-T--G--A-ATC-T--A-A--G----G----C----AG-A-G-T-A-----------A-AA-TT-A-GA--T--A---CATAAG----G-AG-A-TA------T-C----T--G-A-T-CT-G-T-C-AC-A----G-A--T-AA------T-TCCT-TC-------T--AA-A-C-A-A-T------------ATTTCAGTATTGT---------A--ATATATT---C-TT-C-GT-CAA-TC-A--TAA----AA--T-C-TAG---A--------------A-------------------------A-----A----G
gi|110833                     :   TA--TAA-C-A-AA-----CTGT-T--G--A-ATC-T--A-A--T----G----C----AA-A-G-T-A-C--A--A-C-G-AA-TG-A-GA--T--A---TTT--G----G-AG-A-GA------T-A----T--G-A-A-CA-A-T-T-GC-T----G-A--C-AA------C-TCCT-TT---G---T--AA-A-C-A-A-T------------A-----------T---------A--T-----T---C-TT-C-GT-AAA-TC-A--AAA----AA--TCT-GGG---A--------------A-------------------------A-----A----GTT-------C--T--GT-G-G-A--A-AA--T-G-C----TA-CATA-T-A------TA-----A--C----T--G--A--C-CG----C-G-T--G-A-AGAGA---CG-GGGTTTGCg
gi|110834                     :   TA--TAA-C-A-AATTAAACTGT-T--G--A-ATC-TT-G-AT-G----G----C----AA-A---T-G-C--A----C-G-AA-TG-G-GA--T--A---TAT--G-----------GA------T-CTAAAT--G-A-T-CAGG-T-C-GC-T----G-A--T-GA------T-TCTT-TG---G---A--AG-A-C-A-A-A------------A-----------T---------
gi|110835                     :    A--TAA-C-A-A------CTGT-T--G--A-ATT-TTTA-A--G----G----C----AC-A-G-T-A-C--A--A-C-G-AAATG-G-AA--T--A---CAT--G----G-AG-A---------T-T----T--G-A-T-CA-G-T-C-GC-T----G-A----AA------CATCCT-T----G---T--AA-A-C-A---T------------A-----------T---------T--A-----TT--C-TT-C-GT-CAA-TC-A--ATA----AA--TCC-GGG---A--------------A-------------------------A-----AAA--GTT-------C--T--GC-T-G-G--A-AA--T-G-C----TA-C--A-T-ACATGTATA-----A--C----G--G--A--A-CG----T-G-T--G-G-AAAGA---CG-GGGTTTGC
gi|110836                     :    A--TAA-C-A-A------TTGT-T--G--A-ATC-TTTA-A--G----C----C----AC-G-A-T-A-C--A--A-C-G-AA-TGAG-GA--A--A---TAT--G------AG-A-GA------T-C-------G-A-T-CA-G-T-C-G--T----G-A--C-AA------A-TCCT-TC---G---T--AA-A-C-A-A-T------------A-----------T------------------T---C-TT-C-GT-CAA-TC-A--CAA----AA--TCC--GG---G--------------A-------------------------A-----A----GTT-------T--A--GT-G-G-G--A-AAATT-G-C----T--C--A-T-A------TA-----A--C----C--G--G--A-CG----T-G-G--T-A-AAAGA---CG-GGTTTTGC
gi|110837                     :    A--TAA-C-A-AA-----CTGT-T--A--A-----TT-A----G----C----C----AC-A-G-T-A-C--A--A-C-G-AA----G-GA--T--A---TATT-G----G-AGTATGA------T-C----T--G-A-T-CAAG-T-C-GC-T----G-A--A-AC------T-TCCT-T----G---T--AA-A-C-A-A-T------------A-----------T---------T--A-----T---TGCT-C-GT-CAA-AA-A--AAA----AAC-TCC-GGA---A--------------A-------------------------A-----A----GTT-------C--T--GT-G-G-A--A-AA--T-G-C----TA-C--A-T-A------TA-----A--CGTAACCAA--A--A-CG----T-G-T--G-A-AAAGA---CG-
gi|110838                     :    A--TAA-C-A-AA-----CTGT-T--G--A-ATG-TT-A-A------------------------------------C-G-AA-TG-G-GA--T--A---TAT--G----G-AG-A-GA------T-C----T--G-A-
gi|110839                     :     --TAA-C-A-AA-----CTGT----A--A-GTC-TT-A-AATG----G----C----AACA-G-T-A-C--ACTA-T-A-AA-TG-G-GA--T--G---TAT--G----GAAG-A-AA------T-G----T--G---T-CA-G-T-C-GC-A----GAA--C-AA--------TCCT-TC---GGGAG--AG-A-T-A-A--------------A-----------T---------A--T-----T---C-TT-C-GT-CAA-T--A--AAA----AG--TCG-GGG---G--------------A-------------------------A-----A-----TT-------C--T--GT-G-G-A--A-AA--T-G-C----TA-C--A-TGA------TA-----A--C----C--G--T--A-CG----TGG-T--G-G-AAAGA---CG-GGGTTTGC
gi|110840                     :         A-C-A-AA-----ATGA-T--G--A-ATA-AA-A-A--G----A----C----AA-A-G-T-A-C--A--A-A-A-AA-AG-A-GA--A--A---TAT--A----G-AG-A-AA------T-C----T--A-A-T-CA-G-T-A-GCAT----A-A----AA------C-TCCT-TC---G---T--TA-A-C-A-A-C------------A-----------T---------A--T-----T---C-TT-C-GT-CAA-TC-A--AAA----AG--TCC-GGG---G--------------A-------------------------A-----A----ATT-------C--T--GT-G-G-A--A-AA--T-G-C----TA-C--A-G-A------TA-----A--C----C--G--T--A-CG----T-G-T--G-G-AAAGA---CG-GGGTTTGC
gi|110841                     :                 -----CTAT-T--G--A-ATC-TT-A-AA-G----G----C----AA-A-GCT-A-C--A--A-CCG-AA-TG-G-AA--T--A---TAT--G----G-A--A-GA------T-A----T--G-A-T-CATG-T-C-GC-T----G-A--C-AA------A-TGCT-TC---G---T--AA-C-C-A-A-T------------A-----------T---------A--------T---C-TT-C-GT-CAA-TC-A--AAA----AA--ATC-TGG---G--------------A-------------------------A-----A----GTT-------A--T--GT-G-G-A--A-AA--T-G-C----TA-C--A-T-ATTT---TA-----A--C----C--G--C--C-CG----T-G-T--G---AAAGA---CGAAGGTTT
gi|110842                     :                         T-T--G--A-ATT-TT-A-A--G----G----C----AC-A-G-T-A-C--A--A-C-G-AA-TG--------------------------------A------T-C----T--G-A-T-CA-G-C-C-GC-T----G-A--C-AA----------CT-TC---G---T--AA-A-C-A-T-A------------A-----------T---------A--T-----T---C-TT-C-GT-CAA-TC-C--AAA----AA--TCC-GGG---A--------------T-------------------------A-----A----
gi|110831                     :                             tg--A-ATC-T--A-A--G----G----C----AG-A-G-T-A-C-----A-C----A-TG-A-GA--T--G---TAT--G----GAAG-G-GA------T-C----T--G-ATT-CA-GTT-C-GC-TGG--G-A--C-AACTTTTTC-TCCT-TC---A---CG-GA-A-C-A-A-TTCTAGGTTGTAAA-----------T---------A--T-----T---C-TT-C-GTCCAA-TT-A--AAA----A----TC-TGG---
gi|110845                     :                   aatataaaatggcgaagtaacT-A-A--G----G----C----AA-A-G-T---------------------G-GA--T--A---TAT--A----T-GG-A-GA------T-C----T--G-A-T-CA-G-T-C-AC-T----G-A--C-AA------C-Tgga
gi|110846                     :                                                               A-A-G-T-A-T--A--AAC-G-TA-TG-A-GA--------------G----A-AG-A-AA------T-A----T--G-A-T--A-G-T-C-GC-T----G-AACC-AA------C-TCCT-TC---G---T--AA-A-C-A-A-
gi|110844                     :                                                                -A-G-T-A-C--AG-A-C-G-AA-TG-G--A--T--G---TAT--G------AG-A-AA------TAT----T--G-A-T-CA-G-T-C-GC-A----G-A--C-AA------C-TCCT-TC---G---T--AA-A-C-A-A-C------------A-----------T---------A--T-----T---C-TT-T-GT-CAA-TCAA--AAA----AA--TCC-GGG---G--------------A-------------------------A-----A----GTT-------C--T--GT-G-GAA--A-AA--T-G-C----TA-C--A-T-AT-----TA-----A--C----C--G--A--A-CG----T-G-T--G-G-AAAGA---CG-
gi|110847                     :                                                                       gaatataacaaac-AA-TG-A-GA--T--AAAATAT--G----G-AG-A-GA------T-C----T--G-A-T-CA-G-T-C-AC-T----G-A--C-AA------C-TCC--TC---G---T--TA-A-C-ATA-TTTCATGTGTA--A-----------T---------A--T-----T---C-TT-C-GT-CAA-T
gi|110848                     :                                                                                                           --G----G-GA-A-TA------T-C----T--GGA-T-CA-G-T-C-GC-T----G-A--C-AA------C-CTCA-TC---G---T--AA-A-C-A-A-TA-----------A-----------T---------A--AT----T---C-TT-T-GT-C-A-TA-A--AAA----AA--TC---GG---A--------------C-------------------------A-----A----ATT-------C-----GT-G-G-A--A-AA--T-G-T----TA-C--AGG-A------TA-----A--C----C--G--A--A-CGCGTTC-G-T--G-A-AAA
gi|110849                     :                                                                                                                        gaA------T-C----T--G-A-T-CA-G-T-C-GC-G----A-A--C-AA------C-CCTT-TC---G---G--AA-A-T-A-A-T------------A-----------T---------T--------T---C-TT-T--T-CAA-TC-A--AAA----AA--TCC--GG---G--------------A-------------------------A-----A----GTT-------C--G--GT-G-G-A--A-AA--T-G-T----TA-C--A-T-G------TA-----A--C----------A--A-CG----T-G-T--G-A-AAAAA---
gi|110843                     :                                                                                                                                            -A-T-CA-C-G-C-GC-A----G-A--CCAA------C-TCCT-TC---G---T--AA-AAC-A-A-T------------A-----------T---------A--T-----T---C-TT-C-GT-CAA-TC-A--AAA----AA--TCC-GGG---G--------------A-------------------------A-----A----GTT-------C--T--GT---G-A--A-AA--T-G-
gi|110850                     :                                                                                                                                                  gctgaattgaaagtatatcagatataacaaactgtgt-TC---G---T--AA-A-C-A-A-T------------A-----------TTCTATGTGCA--A-----TATTC-TT-C-CT-CAA-TC-A--AAA----AA--TCT-GGG---G--------------AGGGCTAAATAGTGATAAATTGCATCA-----A----GTTGCCAAC-C--T--CT-G-G-A--A-AA--T-G-C----TT-C--A-C-A------TA-----A--T----T--G--A--C-CG----T-G-T--G-A-AAAGA---CA-GGTTTTG
gi|110851                     :                                                                                                                                                                                                    acccac-A-A-T------------A-----------T------------------T---C-TT-C-CT-CAA-TC-A--AAA----AA--TCT-GGG---AGGCAATAGTGATTAA-------------------------ATCATCA----GTTGCCCAACC--T--CT-G-G-A--ACAA--T-G-C----TT-C--A-C-A------TA-----A--T----T--G--A----CG----T-G-T--G-A-AAAGA---CA-AGGTTT
gi|110852                     :                                                                                                                                                                                                               a------------A-----------T---------A--T-----T---C-TT-CCGT-CAA-TC-A--AGA----AA--TCC-GGGGAGA--------------A-------------------------A-----A----GTT-------T--TT-GTTG-G-A--A-AA--TTGTC----TA-C--A-T-A------TA-----AAGC----C--G--A--A-CG----T-G-T--GAA-AAAGAAACCG-GGGTTTGC
gi|110853                     :                                                                                                                                                                                                                                                                     -GT-TAA-TC-A--AAA----AA--TCC-TGG---A--------------A-------------------------A-----A----GTT-------C--T--GTTG-G-A--A-AA--T-A-C----TA-C--A-C-A------TA-----A--C----C--G--A--A-CG----T-G-T--G-A-AAAGA---CG-GGATTTGC
gi|110854                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             T-G-G-A--A-AA--T-G-A----CA-C--A-T-A------T---------C----T--G--A--C-CA----T-G-T--G-A-AAAGA---CG-GGGTTTGC
gi|110855                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          --T-G-C----TA-C--A-T-A------TA-----A--C----C--G--A--A-CG----T-G-T--G-G-AAAGA---CG-GGGTT

lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                 111111111111                                                                  1111111111111111111111111111111111111111111                                                                                                                                      
lowQualScore                  :                         44   3 3 1 666666 1    33 1 1   1 44 2 44 4444 2222 4444 33 1 1 1 1  55555 1 1  1  1 1  11 22 222   22 4444 1 1 1 2  555555 222222 22 2 2 2  3 1 1 2  1 6666  22 3 11 444444 1 1   1  333  22  1 1 8888888888888888 2 2 333333333333 22 999999999999 11     4444 1  1   1  2222  1 2222  44   2 1 222 9999999999999999999999999999999999999999999 33333 2222 1  8888888 22 22 1 1 1 2 11 1  44 1 1 2222  2 33 555555 2 333  55555 22 3333 22 55 22   3333 1 1 22 1 1     222  3        
lowQualScore                  :                         ..   . . . ...... .    .. . .   . .. . .. .... .... .... .. . . . .  ..... . .  .  . .  .. .. ...   .. .... . . . .  ...... ...... .. . . .  . . . .  . ....  .. . .. ...... . .   .  ...  ..  . . ................ . . ............ .. ............ ..     .... .  .   .  ....  . ....  ..   . . ... ........................................... ..... .... .  ....... .. .. . . . . .. .  .. . . ....  . .. ...... . ...  ..... .. .... .. .. ..   .... . . .. . .     ...  .        
lowQualScore                  :                         22   0 0 5 777777 4    33 3 3   3 77 6 44 0000 7777 0000 11 2 2 2 2  55555 2 2  2  2 2  66 88 111   77 0000 1 1 1 3  444444 777777 66 2 2 2  3 1 1 2  1 1111  66 3 55 222222 1 1   1  555  66  1 1 5555555555555555 2 2 555555555555 66 444444444444 66     7777 1  1   1  5555  2 6666  11   4 2 111 5555555555555555555555555555555555555555555 11111 7777 3  4444444 00 00 4 4 4 8 99 4  55 3 3 9999  9 44 555555 9 999  00000 00 1111 11 22 11   3333 5 5 11 5 5     888  5        
consensus                     :                     AATA--TAA-C-A-AA-----C-TGTT--G-A-ATC-TT-A-A--G----G----C----AA-A-G-T-A-CA--A--C-G-AA-TG-G-GA--T--A---TAT--G----G-A-G-A-GA------T-C----T--G-A-T-CA-G-T-C-GC-T----GA--C-A--A------C-T-CCT-TC---GT--AA-A-C----------------A-A-T------------A--T------------A--TTCTT----C-GT-CAA-TC-A--AA-A----AA--TCC-G-G---G--A--------------A-------------------------A-----A----G-TT-------C--T--G-T-G-G-A--A-AA--T-G-C----TA-C--A------T-A---TA-----A--C----C--G--A--ACG----T-G-T--G-A-AAAGA---CG-GGGTTTGC
Reference ( family-486 )      :                     AATA--TAA-C-A-AA-----C-TGTT--G-A-ATC-TT-A-A--G----G----C----AA-A-G-T-A-CA--A--C-G-AA-TG-G-GA--T--A---TAT--G----G-A-G-A-GA------T-C----T--G-A-T-CA-G-T-C-GC-T----GA--C-A--A------C-T-CCT-TC---GT--AA-A-C----------------A-A-T------------A--T------------A--TTCTT----C-GT-CAA-TC-A--AA-A----AA--TCC-G-G---G--A--------------A-------------------------A-----A----G-TT-------C--T--G-T-G-G-A--A-AA--T-G-C----TA-C--A------T-A---TA-----A--C----C--G--A--ACG----T-G-T--G-A-AAAGA---CG-GGGTTTGC
gi|110813                     :                     AATA--TAA-C-A-AA-----C-TCTT--G-A-ATC-TT-A-A--G----G----C----AA-A-G-T-A-CA--A--C-G-AA-TG-G-GA--T--G---TAT--G----G-A-G-A-GA------T-C----T--G-A-T-CA-G-T-C-GC-T----GA--T-A--A------T-T-CCT-TC---GT--AA-A-C----------------A-A-T------------A--T------------A--ATCTT----T-GT-CAA-TC-A--AA-A----AA--TCC-T-G---G--A--------------A-------------------------A-----A----G-TT-------C--T--G-T-G-G-A--A-AA--T-G-C----TA-C--A------T-A---TA-----A--C----C--G--A--ACG----T-G-T--G-A-AAAGA---CG-GGGTTTGC
gi|110814                     :                     AATA--TAA-C-A-AA-----C-TGTT--G-A-ATA-T--A-A--G----G----C----AA-C-G-T-A-CA--A--C-G-AA-TG-A-GA--T--A---TGT--G----G-A-G-A-GA------T-A----T--G-A-T-CA-G-T-C-GC-T----GA--C-A--A------C-T-CCT-TC---GT--AA-A-C----------------A-A-T------------A--T------------A--TTCTT----C-GT-TAG-TC-A--AA-T----AA------G-G---G--A--------------A-------------------------A-----A----G-TT-------A--GAAG-T-G-G-A--A-AA--T-G-C----TA-C--A------T-A---TA-----A--C----T--G--A--ACA----T-G-T--G-A-AAAGA---CG-GGGTTTGC
gi|110815                     :                     AATT--TAA-C-A-AA-----C-TGTT--G-A-ATC-TT-A-A--G----G----C----AA-A-G-T-A-CA--A--C-G-AA-TG-G-GA--T--A---TAT--G----G-A-G-A-GA------T-A----T--G-A-T-CA-G-T-C-GC-T----GA--C-A--A------C-T-CTT-TC---AT--AA-A-T----------------A-A-T------------A--T------------A--TTCTT----C-GT-CAA-TA-A--AA-A----AA--TCC-T-G---G--A--------------A-------------------------A-----A----G-TT-------C--T--G-T-G-G-A--A-AA--T-G-C----TA-C--A------T-A---TA-----A--C----
gi|110816                     :                     AATT--TAA-CTA-AA-----C-TGTT--G-AGATC-TT-ACA--GC---G----C----AA-A-G-T-AGCA--AG-C-G-AA-TG-T-GA--TTGA---TAT--GTGATG-A-T-A-GT------T-A----T--G-AAT-CA-G-T-CTGT-TT---GA--C-ATAG------C-T-CTT-TC---AT--AA-A-T----------------A-A-T------------A--T------------A--TTCTT----C-GT-CAA-TA-ATTAA-A----AA--TCC-T-G---G--A--------------A-------------------------A-----ATAATA-TA-------CATT--G-T-G-G-A--A-AA--T-G-C----
gi|110817                     :                     AATA--TAAAC-A-AA-----C-TG-------------------------G----C----AC-A-G-T-A-CA--A--C-G-AA-TG-GAGA--T--A---TAT--G----G-A-G-A-AA------A-C----T--G-A-T-CA-G-T-C-GC-A----GA--C-A--A------C-T-CCT-TC---GT--AA-A-C----------------A-A-TA-----------A--T------------A--TTCTTG---C-GT-CAA-TC----AA-A----AA--TCC-G-G---G-----------------C-------------------------A-----A----G-TT-------C--T--G-T-G-G-A--A-AA--T-G-C----TA-C--A------T-A---TA-----A--C----C--G--A--CCG----T-G-T--G-G-AAAGA---C--GGGTTTGC
gi|110818                     :                     AATACTTAA-C-A-AA-----C-TTTTTTG-A-ATC-TT-A-A--G----A----CC---AACA-G-T-A-CA--A--C-GGAA-TG-G-GAAAT--A---TAT--G----G-A-G-A-GA------T-C----T--ATA-TTCA-G-T-C-GC-T----GA--C-A--A------C-T-CCG-TCAGCGT--AA-A-C----------------A-A-T------------A--TAT----------A--TTCTT----C-GT-CAA-TC----AA-A----AA--TCCAG-G---G--A--------------C-------------------------A-----A----G-TT-------C--T--G-T-GAG-AACA-AA--T-G-C----TACC--A------T-A---TA-----C--C----C--GA-A--ACG----T-G-T--G-A-AAAA-----G-GGGTT
gi|110819                     :                     AATA--TAA-C-A-AA-----C-TGTT--G-A-ATCCTT-A-A--G----G----C----AC-A-G-T-A-CA--AA-C-G-AA-TG-G-CA--T--A---TAT--G----G-A-G-A-GA------T-C----T--G-A------G-T-C-TC-C----G-------------------CCT-TT---GT--AA-A-C----------------A-A-T------------A--T------------A--TTCTT----C-GT-CAA-TT-A--AA-AAAAGAA--CTC-G-G---G--A--------------AT------------------------A-----A----G-TT-------C--T--G-T-G-G-A--A-AA--TGG-C----TA-CA-A------T-A---TA-----
gi|110820                     :                     AATA--TAA-C-A-AA-----C-TGTT--G-A-ATC-TT-A-A--G----C----A----AA-A-G-T-A-CG--AGAC-G-AA-TG-C-G----------TAT-----------------------------------A-T-CA-G-T-C-GC-T----GA--C----A------C-TACCT-TC---TT--AA-A-C----------------A-A-T------------A--T------------ATTTTCTT----C-GT-CAA-C-----AA-A----AA--TCC-T-G---G--A--------------A-------------------------A-----A----G---------------------------A-AA--T-G-A----TACC--A------T-A---TA-----A--C----C--G--G--ACG----T-GCT--G-A-AAAGA---CG-GGGTTTG
gi|110821                     :                     AATA--TA--C-A-AA-----CCTATG--GGA-ATC-TA-A-C--G----G----C----AA-T-G-TCA-CA-------G-AA-TG-A--A--T--A---TAT--G----G-A-G-A-GA------T-A----T--G-A-T-CA-G---C-AC-T----GA--C-A--A--------T-CCT-TC---GT--AA-A-C----------------A-A-T------------G--T------------A--TTCTT----C-GT-CAA-TC-A--AATA----TA--T-----G---G--G--------------A-------------------------A-----A----G-TT-------C--T--A-T-G-GAA--A-AA--T-G-C-----------------C-A---TA-----A--C----T--G--A--ATG----T-G-C--G-ATCAAGA---AG-GGGTT
gi|110822                     :                     AATA--TAA-C-A-AA-----C-AGTT--G-A-ATC-TT-A-A--GCATAGTAACC----AA-A-A-T-A-CA--A----G-AA-TG-G-GA--T--A---TAT--G----G-A-G-A-AAA-----T-C----T--G-A-T-CA-G-T-C-TA-G----AA--C-A--A------C-T-C-T-TC---GT--AA-A-C----------------A-A-TC-----------A--T------------A--TTTTTT---C-GT-CAA-TC-A--AA-A----AA--TCCGG-G---G--G--------------A-------------------------A-----A----G-TT-------C--T--A-T-----------A--T-G-G----AA-C--A------C-A---TA-----A-------C--G--A--ACG----T-G-TTGG-A-AGAG----CT-GGGTTT
gi|110823                     :                     AATA--TAA-C-A-AA-----A-CGTTT-G-A-ATC-TT-A-A--G----G----C----AA-A-G-T-A-CA--A--C-G-AA--G-G-GA--T--A---CAT--GGA--G-A-G-A-GA------T-A----T--G-A-T-CA-G-T-C-GC-T----GA--CAA--A------C-T-TCT-TC---GT--AA-A-C------------------A-T------------A--T------------A--TTCT-------GT-CAA-TA-A--AA-A----AAAGTC-----------A--------------A-------------------------A-----A----G-TT-------
gi|110824                     :                     AATA--TAA-C-A-G------C-TATT--G-A-ATG-TT-A-A--G----G----C----AA-G-A-T-A-----A--C-G-AA-TG-G-GA--TC-A---TAT--G----G-A-G-AAGA------T-A----T--G-A-T-CA-G-T-C-GCCT----GA--C-A--AA-----C-T-CCT-T--------GA-A-C----------------C-A-T------------A--T------------A--TT-TT----C-GT-CGA-TT-A--AA-A----AAA-TCC----------------------------------------------------------------TT-------------------G-A--A-AG----G-C----TA-C--A------T-A---TAG----A--C----C--ATTA--CCG----T-T-T--G-A-AAAGA---CGCGGGTTTG
gi|110825                     :                     AATACTTAA-CCA-AA-----C-TGTT--G-A-AAC-----------------------------------CA--A--C-G-AA-TG-G-GA--T--A---TAT--G----G-A-G-A-GAT-----T-C----TG-G-A-T-CA-G-T-C-GC-T----GA--C-A--A------C-T-CCT-TTCG-GTTAAA-A-C----------------A-ACT------------A--T------------A--TTATTTTTGC-AT-AAA--C-A--AA-A----A----TC-G-G---A--G--------------G-------------------------A-----A----G-TT-------C--T--G-T-G-G-A--A-AA--T-G-CTATGTA-C--A------T-A---TACTAGGA--C----C--G--ATTACG----T-A-T--G-A-AGAGA---
gi|110826                     :                     AATA--TAA-----AA-----C---------A-AAC-TT------G----G----C----AC-A-G-T-A-CA--A--C-G-AA-TG-G--A--T--A---TTT--G----G-G-G-A-GAGAGAAAT-C----TTGG-A-T-CA-G-T-C-GC-A----GA--CTA--A------C-T-C--------------------------------------T------------A---------------A--TTTTC----C-GT-CAAATC-A--AA-A----AA---CC-G-G---G--G--------------A-------------------------A-----A------TT-------C--T--G-T-G-G-A--A-AAA-T-G-C----TA-C--A------TAA---TA-----A--C----C--GA-A--ACG----T-G-T--G-G-AAATA---CG-GGGTTTGC
gi|110827                     :                     AATA--TAA-C-A-AA-----C-TGTT--G-A-ATC-GT-A-A--G----G----T----AA-A-G-T-A-CA--A--C-A-AA-TG-G-GA--T--A---CAT--G----G-A-G-A-AA------T-A----T--G-A-T------------------------------------T-CCT-TC---GT--AA-A-C----------------A-A-T------------A--T------------A--TTCTT----C-GT-C
gi|110828                     :                     AATA--TAA-C-A-A------T-TGTT--G-A-ATC-TT-A-A--G----G----C----AC-A-C-T-A-CA--A--C-G-AA-TG-G-GA--T--A---TAT--G----G-A---A-GA------T-C----T--G-A-T-CA-G-TCC-GC-T----GA--C-A--------------CT-CC---AT--AA-A-A----------------A-A-T------------A--
gi|110829                     :                     AATT--TAA-C-A-A------C-TGT-----G-ATC-T--A-A--G----G----C----AC-ATG-T-T-CAC-A--C-T-AA-TG-A-GA--T--A---TAT--G----G---G-A-GA------T-C----T--G-A-T-CA-G-T-CGGC-TG---GA--C-A--A------C-T-CCT-TC---GT--AACA-C----------------A-AGT------------A--C------------A--TTCTT----C-GT-CAA-TT------------AA--TCT-GTG---G--A--------------A-------------------------A-----aaata
gi|110830                     :                     AATA--TAAAC-A-AATGA--C-TGTT--G-A-ATC-TT-ATA--G----G----CACATAG-A-G-T-A-AA--A--C-G-AA-TA-G-G----------------------------GA------T-C----T--G-A-TCCA-G-T-C-GT-TGACAGA--C-A--A------C-T-CCTCTC---GT--AA-A-CA---------------A-A-T------------AG-T------------A--TTCTT----C-GT-CAA-T
gi|110831                     :                                                   -A-ATC-T--A-A--G----G----C----AG-A-G-T-A-C---A--C----A-TG-A-GA--T--G---TAT--G----GAA-G-G-GA------T-C----T--G-ATT-CA-GTT-C-GC-TGG--GA--C-A--ACTTTTTC-T-CCT-TC---ACG-GA-A-C----------------A-A-TTCTAGGTTGTAAA--T------------A--TTCTT----C-GTCCAA-TT----AA-A----AA--TCT-G-G---G--G--------------A-------------------------
gi|110832                     : aatataaaatggcgaagtaacATA--TAA-C-ACAG-----C-AGTT--G-A-ATC-T--A-A--G----G----C----AG-A-G-T-A----------A-AA-TT-A-GA--T--A---CATAAG----G-A-G-A-TA------T-C----T--G-A-T-CT-G-T-C-AC-A----GA--T-A--A------T-T-CCT-TC----T--AA-A-CAATATTTCAGTATTGTA-A-T------------A--T------------A--TTCTT----C-GT-CAA-TC-A--TA-A----AA--TCT-A-G---A--A--------------A-------------------------A-----G----G-
gi|110833                     :                       TA--TAA-C-A-AA-----C-TGTT--G-A-ATC-T--A-A--T----G----C----AA-A-G-T-A-CA--A--C-G-AA-TG-A-GA--T--A---TTT--G----G-A-G-A-GA------T-A----T--G-A-A-CA-A-T-T-GC-T----GA--C-A--A------C-T-CCT-TT---GT--AA-A-C----------------A-A-T------------A--T------------A--TTCTT----C-GT-AAA-TC-A--AA-A----AA--TCT-G-G---G--A--------------A-------------------------A-----A----G-TT-------C--T--G-T-G-G-A--A-AA--T-G-C----TA-CATA------T-A---TA-----A--C----T--G--A--CCG----C-G-T--G-A-AGAGA---CG-GGGTTTGC
gi|110834                     :                       TA--TAA-C-A-AATTAAAC-TGTT--G-A-ATC-TT-G-AT-G----G----C----AA-A---T-G-CA-----C-G-AA-TG-G-GA--T--A---TAT--G------------GA------T-CTAAAT--G-A-T-CAGG-T-C-GC-T----GA--T-G--A------T-T-CTT-TG---GA--AG-A-C----------------A-A-A------------A--T------------
gi|110835                     :                        A--TAA-C-A-A------C-TGTT--G-A-ATT-TTTA-A--G----G----C----AC-A-G-T-A-CA--A--C-G-AAATG-G-AA--T--A---CAT--G----G-A-G-A---------T-T----T--G-A-T-CA-G-T-C-GC-T----GA----A--A------CAT-CCT-T----GT--AA-A-C----------------ATA-T---------------T------------A--TTCTT----C-GT-CAA-TC-A--AT-A----AA--TCC-G-G---GAAA--------------A-------------------------A-----A----G-TT-------C--T--G-C-T-G-G--A-AA--T-G-C----TA-C--ATACATGT-A---TA-----A--C----G--G--A--ACG----T-G-T--G-G-AAAGA---CG-GGGTTTGC
gi|110836                     :                        A--TAA-C-A-A------T-TGTT--G-A-ATC-TTTA-A--G----C----C----AC-G-A-T-A-CA--A--C-G-AA-TGAG-GA--A--A---TAT--G------A-G-A-GA------T-C-------G-A-T-CA-G-T-C-G--T----GA--C-A--A------A-T-CCT-TC---GT--AA-A-C----------------A-A-T------------A--T----------------TCTT----C-GT-CAA-TC-A--CA-A----AA--TCC-G-G---G-----------------A-------------------------A-----A----G-TT-------T--A--G-T-G-G-G--A-AAATT-G-C----T--C--A------T-A---TA-----A--C----C--G--G--ACG----T-G-G--T-A-AAAGA---CG-GGTTTTGC
gi|110837                     :                        A--TAA-C-A-AA-----C-TGTT--A-A-----TT-A----G----C----C----AC-A-G-T-A-CA--A--C-G-AA----G-GA--T--A---TATT-G----G-A-GTATGA------T-C----T--G-A-T-CAAG-T-C-GC-T----GA----A--A------C-T-TCC-TT---GT--AA-A-C----------------A-A-T------------A--TT-----------A--TTGCT----C-GT-CAA-AA-A--AA-A----AAC-TCC-G-G---A--A--------------A-------------------------A-----A----G-TT-------C--T--G-T-G-G-A--A-AA--T-G-C----TA-C--A------T-A---TA-----A--CGTAACCAA--A--ACG----T-G-T--G-A-AAAGA---CG-
gi|110838                     :                        A--TAA-C-A-AA-----C-TGTT--G-A-ATG-TT-A-A-----------------------------------C-G-AA-TG-G-GA--T--A---TAT--G----G-A-G-A-GA------T-C----T--G-A-
gi|110839                     :                         --TAA-C-A-AA-----C-TGT---A-A-GTC-TT-A-AATG----G----C----AACA-G-T-A-CACTA--T-A-AA-TG-G-GA--T--G---TAT--G----G-AAG-A-AA------T-G----T--G---T-CA-G-T-C-GC-A----GAA-C-A--A--------T-CCT-TC---GG--GA-G-A----------------G-A-T------------AAAT------------A--TTCTT----C-GT-CAA-T--A--AA-A----AG--TCG-G-G---G--G--------------A-------------------------A-----A------TT-------C--T--G-T-G-G-A--A-AA--T-G-C----TA-C--A------TGA---TA-----A--C----C--G--T--ACG----TGG-T--G-G-AAAGA---CG-GGGTTTGC
gi|110840                     :                             A-C-A-AA-----A-TGAT--G-A-ATA-AA-A-A--G----A----C----AA-A-G-T-A-CA--A--A-A-AA-AG-A-GA--A--A---TAT--A----G-A-G-A-AA------T-C----T--A-A-T-CA-G-T-A-GC-A----TA--A-A--A------C-T-CCT-TC---GT--TA-A-C----------------A-A-C------------A--T------------A--TTCTT----C-GT-CAA-TC-A--AA-A----AG--TCC-G-G---G--G--------------A-------------------------A-----A----A-TT-------C--T--G-T-G-G-A--A-AA--T-G-C----TA-C--A------G-A---TA-----A--C----C--G--T--ACG----T-G-T--G-G-AAAGA---CG-GGGTTTGC
gi|110841                     :                                     -----C-TATT--G-A-ATC-TT-A-AA-G----G----C----AA-A-GCT-A-CA--A--CCG-AA-TG-G-AA--T--A---TAT--G----G-A---A-GA------T-A----T--G-A-T-CATG-T-C-GC-T----GA--C-A--A------A-T-GCT-TC---GT--AA-C-C----------------A-A-T------------A--T------------A--T-CTT----C-GT-CAA-TCAA--AA-A----AA--TCT-G-G---G-----------------A-------------------------A-----A----G-TT-------A--T--G-T-G-G-A--A-AA--T-G-C----TA-C--A------T-ATTTTA-----A--C----C--G--C--CCG----T-G-T--G---AAAGA---CGAAGGTTT
gi|110842                     :                                           -TGTT--G-A-ATT-TT-A-A--G----G----C----AC-A-G-T-A-CA--A--C-G-AA-TG---------------------------------A------T-C----T--G-A-T-CA-G-C-C-GC-T----GA--C-A--A------C-T-----TC---GT--AA-A-C----------------A-T-A------------A--T------------A--TTCTT----C-GT-CAA-TC-C--AA-A----AA--TCC-G-G---G--A--------------T-------------------------A-----A----
gi|110843                     :                                                                                                                                                               -A-T-CA-C-G-C-GC-A----GA--CCA--A------C-T-CCT-TC---GT--AA-AAC----------------A-A-T------------A--T------------A--TTCTT----C-GT-CAA-TC-A--AA-A----AA--TCC-G-G---G--G--------------A-------------------------A-----A----G-TT-------C--T--G-T---G-A--A-AA--T-G-
gi|110844                     :                                              gctgaattgaaagtatatcagatataacaaactgtgt-A-G-T-A-CAG-A--C-G-AA-TG-G--A--T--G---TAT--G------A-G-A-AA------TAT----T--G-A-T-CA-G-T-C-GC-A----GA--C-A--A------C-T-CCT-TC---GT--AA-A-C----------------A-A-C------------A--T------------A--TTCTT----T-GT-CAA-TCAA--AA-A----AA--TCC-G-G---G--G--------------A-------------------------A-----A----G-TT-------C--T--G-T-G-GAA--A-AA--T-G-C----TA-C--A------T-AT--TA-----A--C----C--G--A--ACG----T-G-T--G-G-AAAGA---CG-
gi|110845                     :                                              gaatataacaaacT-A-A--G----G----C----AA-A-G-T--------------------G-GA--T--A---TAT--A----T-G-G-A-GA------T-C----T--G-A-T-CA-G-T-C-AC-T----GA--C-A--A------C-T-
gi|110846                     :                                                                                  A-A-G-T-A-TA--AA-C-G-TA-TG-A-GA--------------G----A-A-G-A-AA------T-A----T--G-A-T--A-G-T-C-GC-T----GAACC-A--A------C-T-CCT-TC---GT--AA-A-C----------------A-A-
gi|110847                     :                                                                                                      -AA-TG-A-GA--T--AAAATAT--G----G-A-G-A-GA------T-C----T--G-A-T-CA-G-T-C-AC-T----GA--C-A--A------C-T-CC--TC---GT--TA-A-C----------------ATA-TTTCATGTGTA--A--T------------A--TTCTT----C-GT-CAA-T
gi|110848                     :                                                                                                                             --G----G-G-A-A-TA------T-C----T--GGA-T-CA-G-T-C-GC-T----GA--C-A--A------C-C-TCA-TC---GT--AA-A-C----------------A-A-TA-----------A--TA-----------A--TTCTT----T-GT-C-A-TA-A--AA-A----AA--TC----G---G--A--------------C-------------------------A-----A----A-TT-------C-----G-T-G-G-A--A-AA--T-G-T----TA-C--AG-----G-A---TA-----A--C----C--G--A--ACGCGTTC-G-T--G-A-AAA
gi|110849                     :                                                                                                                                           gaA------T-C----T--G-A-T-CA-G-T-C-GC-G----AA--C-A--A------C-C-CTT-TC---GG--AA-A-T----------------A-A-T------------A--T---------------TTCTT----T--T-CAA-TC-A--AA-A----AA--TCC-G-G---G-----------------A-------------------------A-----A----G-TT-------C--G--G-T-G-G-A--A-AA--T-G-T----TA-C--A------T-G---TA-----A--C----------A--ACG----T-G-T--G-A-AAAAA---
gi|110850                     :                                                                                                                                                                                            --A------C-C-CAC-TC---GT--AA-A-C----------------A-A-T------------A--TTCTATGTGCAATA--TTCTT----C-CT-CAA-TC-A--AA-A----AA--TCT-G-G---G--G--------------AGGGCTAAATAGTGATAAATTGCATCA-----A----G-TTGCCAAC-C--T--C-T-G-G-A--A-AA--T-G-C----TT-C--A------C-A---TA-----A--T----T--G--A--CCG----T-G-T--G-A-AAAGA---CA-GGTTTTG
gi|110851                     :                                                                                                                                                                                                                                                 ------------A--T------------A--TTCTT----C-CT-CAA-TC-A--AA-A----AA--TCT-G-G---G--AGGCAATAGTGATTAA-------------------------ATCATCA----G-TTGCCCAACC--T--C-T-G-G-A--ACAA--T-G-C----TT-C--A------C-A---TA-----A--T----T--G--A---CG----T-G-T--G-A-AAAGA---CA-AGGTTT
gi|110852                     :                                                                                                                                                                                                                                               aa------------A--T------------A--TTCTT----CCGT-CAA-TC-A--AG-A----AA--TCC-G-GGGAG--A--------------A-------------------------A-----A----GTTT-------T--T--GTT-G-G-A--A-AAT-T-GTC----TA-C--A------T-A---TA-----AAGC----C--G--A--ACG----T-G-T--GAA-AAAGAAACCG-GGGTTTGC
gi|110853                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                          -GT-TAA-TC-A--AA-A----AA--TCC-T-G---G--A--------------A-------------------------A-----A----G-TT-------C--T--G-TTG-G-A--A-AA--T-A-C----TA-C--A------C-A---TA-----A--C----C--G--A--ACG----T-G-T--G-A-AAAGA---CG-GGATTTGC
gi|110854                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -T-G-G-A--A-AA--T-G-A----CA-C--A------T-A---T---------C----T--G--A--CCA----T-G-T--G-A-AAAGA---CG-GGGTTTGC
gi|110855                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     --T-G-C----TA-C--A------T-A---TA-----A--C----C--G--A--ACG----T-G-T--G-G-AAAGA---CG-GGGTT