lowQualScore : 111111111111111111111111111
lowQualScore : 11 11 888 1 11 1 1 3333 1 2 1 11 11 22 1 1 666666666666666666666666666 444 2 66666 1 333 22222 2 11 1 1 22 1 111 2 1 1 11 1 2
lowQualScore : .. .. ... . .. . . .... . . . .. .. .. . . ........................... ... . ..... . ... ..... . .. . . .. . ... . . . .. . .
lowQualScore : 77 77 444 1 44 0 0 2222 0 0 0 33 33 77 2 0 777777777777777777777777777 777 0 11111 0 777 44444 0 44 0 0 44 0 888 1 1 1 77 3 8
consensus : ATGTCG--G--TC--AAAA-G--CTC-T-CTG----GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT-------------T-G-------C--ATN--TG-CA-----T-A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
Reference ( gi|89901 ) : ATGTCG--G--TT--AAAA-G--CTC-T-CTG----GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT-------------T-G-------C--TTT--TG-CA-----T-A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89899 : ATGTCG--G--TT--AAAA-G--CTC-T-CTG----GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT-------------T-G-------C--TTT--TG-CA-----T-A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89902 : ATGTCG--G--TT--AAAA-G--CTC-T-CTG----GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT-------------T-G-------CT-TTT--TG-CA-----T-A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89900 : ATGTCG--G--TT--AAAA-G--CTC-T-CTG----GAAGC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT-------------T-G-------C--TTT--TG-CA-----T-A---T-----C-GA--C-TTTA-A----AAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TTGCTATTC
gi|89903 : ATGTCG--G--TC--AAAA-G--CTC-T-CTG----GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT--GT-------------T-G-------C--ATG--TG-CA-----T-A---C-----C-GA--C-TTTA-AT--TAAA-T---C-TTA-T-TAT--A-GT-CTATTCT
gi|89904 : ATGTCA--G--TC--AAAA-G--CTC-T-CTG----GA-GC-TTG-TG--TGTTG--TATT--AT-------------T-G-------C--ATG--TG-CA-----T-A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTAT
gi|89905 : ATGTCG--G--TC--GAAA-G--CTC-T-CTG----GA-GC-ATG-TG--T--TG--TATT--GT-------------A-G-------C--ATG--TG-CA-----T-A---T-----C-GA--C-TTTA-AA--TCAA-T---C-TCA-T-TCT--A-TT-CTATTC
gi|89906 : ATGTCG--G--TC--AAAA-G--TTC-T-CTG----GA-GC-TTG-TG--T--TG--TA-T-TAT-------------T-A-------C--ATA--GG-CA-----T-A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-----C-TTATT-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89907 : ATGTCG--G--TC--AAAA-G--CTC-T-C-----------------------TG--TATT-TGT-------------T-A-------C--ATT--TG-CA-----T-A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89908 : ATATCG--G--TC--AAAA-G--CTC-T-CAG----GA-GC-TTG-TG--T--TA--TA-T-TGT-------------T-G-------C--ATG--TG-CA-----T-A---C-----C-GA--C-TTTA-AAT-TAGACT---C-TTA-T-TCT--A-TTACTA
gi|89909 : ATGTCG--G--TC--AAAA-G--CTC-T-CTT----GA-GC-TTG-TG--T--TG--TA-T-TGT-------------T-G-------C--ATG--TG-CA-----T-A---C-----C-GA--C-ATTA-AA--TCAA-T---C-TCA-T-
gi|89911 : ATGTCT--G--TC--AAA--G--CAC-T-CTG----TA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT-------------T-A-------C--ATT--TG-CAT----T-A---C-----G-GA--C-TTTA-GA--TAAA-T---C-TTA-
gi|89910 : ATGTCG--G--TC--AAAA-G--CTC-T-CTG----GA-GC-TTG-TG--T--TG--TA-T-TGT-------------T-A-------C--ATG--TG-C--------------------------------A--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATT
gi|89912 : ATGTCG--G--TCTAAAAA-G--CTC-A-CTG----GA-GC-TTA-TG--T--TA--C-TT-TGT-------------T-ATAAATGAC--TTT------------------C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-G---C-TTA---TCT--A--T-CTAT
gi|89913 : ATGTCG--G--TC--AAAA-T--CTC-T-CTG----G----------------------TT-TGT-------------T-G-------C--ATG--TG-CA-----T-A---C-----C-GA--C----------TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-CC-CT
gi|89914 : ATGTCG--G--TCC-AAAA-G--CTC-C-CTG----GA-AC-TTA-TG--T--TT--CACT--GT-------------T---------C--AAT--GG-TA-----C-G---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-GTG-T-CTT--A-TC-TTAT
gi|89915 : ATGTCG--T--TCC-AAAA-G--CTC-A-CTG----GA-GT-TCA-TG--T--TT--CAAT--GT-------------T-A-------T--ATT--CA-TA-----T-G---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAGA-G---C-TTA-T-TTT--A-TC-TTAT
gi|89918 : ATGTCG--G--TC--ATAA-G--CTC-T-ACA----GA-GC-TTA-TG--T--TA-----C-TG---------------------------TTT--TA-AA-----T-AT--C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-A---T-T---T-TCTGAA-TT-CT
gi|89916 : ATATCG--G--TC--AAAA-G--CTC-C-TTAATTAGA-GC-TTA-TG--T--TG--TA-T-TGT-------------T-G-------C--ATG--TG-CA-----T-A---C-----
gi|89917 : ATGTCG--G--TCTAAAAA-G--CTC-T-ATG----GA-GCTTTA-TG--T--TA---ATT-TGT-------------T-A-------T--ATA--TGACT-----T-G---C-----C-GA--C--TTA-AAGCTTAA-T---C-TT
gi|89919 : ATGTCG--G--TC--ACAA-C--CTC-T-CTG----GA-GC-TTG-TG--T--TG--
gi|89920 : TGTCGTCG--TT--AAAA-G--C-C-T-CTGA---GA-GC-TTG-TG--T--TT--TATTATGT-------------C-------------TT--TG-CA-----T-A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---CTTTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89921 : TGTCG--A--TC--AAAA-G--CTC-T-------------------------------TT-AGT-------------T-G-------C--ATG--TG-CA-----T-A---C-----C-GA--C-TGTA-AA--TAAA-T---C-CTA-T-TCT--A-TT-CTAT
gi|89922 : TGCTG--G--TC--AAAA-G--TTCGT-CTG----GA-GCGTTG-TG--T--TG--TATT-TGTATAAGATGTGCAAT-G-------C--TTC--AG-TA-------A---C-----C-GA--A-TATA-AA--TAA
gi|89924 : GTCG--G--TT--AAAA-GAGCTC-A-CTA----GA-GC-TCA-TG--T--T----ATT-TGT-------------T-A-------T--ATA--TG-TA-----T-A---CAGTGCC-GA--C-TTTA-AA--TAAA-A---T-TTA-C-T
gi|89923 : GTCG--G--AT--AAAAAG--CTC-T-ACA----GA-GC-TTG-TG--T--TGTTTGTT-TGTA------------T-G-------T--ATA--TA--A-----T-A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-A---T-TTA-C-T
gi|89925 : GTCG--G--TA--GATA-G--CTC-T-ATA----GA-GC-TAA-TG--T--TG--T------C-------------T-G-------C--AT------CA-----T-ATACC-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA--------TA-T-TTT--A-TT-TTATTTT
gi|89928 : GTCG--G--AA--AATA-G--CTC-T-TTA----GA-GC-TAA-TG--T--T----ATT-TGT-------------A--------------T--TG-AA-----T-AT--C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---A-TTA-T-TTG--A-TT-TGATT
gi|89929 : GTCG--G--TA--AATA-G--CTC-T---A----GA-GC-TAA-TG--T--T----ATT-TGT-------------A--------------T--TG-TA-----T-A---C-----CCAA--C-TTTA-AA--TAAA-T---A-TTA-T-TTG--A-TT-
gi|89927 : GTCG--GACTA--AAAA-G--CTA-T-ACA----GA-GC-TTA-TG--T--TGACTGTT-TATA------------T-G-----------TA--TG-TAG----T-A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T-----TTA-C-TTT--A-CT-TTACTTT
gi|89930 : TCG--G--TT--AAAA-G--CTC-T-CTG----GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATC-TGT-------------T-G-------C--TTT--TG-CA-----T-A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89932 : G--G--TT--AAAA-G--CTC-T-CTG----GG-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT-------------T-G-------C--GTT--TG-CT-----T-A---C-----C-GAATC-TTT---A--TAAA-T---
gi|89933 : --G--TT--AGAA-G--CTC-T-ATG----GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT-------------T-G-------C--TTT--TG-CA-----T-A---T-----T-GA--C-TTTA-GA--TAAA-T---C-TTA-T-TCC--A-
gi|89934 : --AAAA-G--CTC-T-CTG----GA-GC-TTG-TGTTT--TG--TGTT-TGT-------------T-A-------CAGTTT--GG-CA-----T-A---C-----TGGA--C-TTTACAA--TAAA-T---C--TA-T-TCT--A-TT--TATT
gi|89931 : c--AAAA-G--CTC-TTCTG----GA-GC-TTGATG--C--TG--TGAT-TGT-------------TTG-------C--ATTGCTA-CA-----TTA---A-----C-AA--C-TTTC-AA--TAAA-T---CTTTA-TATCT--AGTT-CT
gi|89926 : tcgtgtca--AAAA-G--CTC-T-ACA----GA-GC-TTG-TG--T--TG---A-T-TGT-------------T-A-------T--ATG--TA-TATAG--T-A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-A---T-TTA-
gi|89935 : gttggata--AAAA-G--CTC-T-ACA----GA-GC-TTG-TG--T--TC--TTTT-TGT-------------T-A-----------TA--TGTCATATAGT-A---C-----C--A--C-TTTA-AA--TAAA-TTTAC-TTA-C-TCT--
gi|89936 : AA-G--CTC-T-CTG----GA-GC-TTG-TG--T--TG--TGTT-TGT-------------T-A-------C--ATT--TG-CA-----T-A---C-----T-GA--CTTTTA-CA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTA
gi|89937 : A-G--CTC-T-CTG----GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT-------------T-A-------C--ATT--TG-CA-----T-A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATT
gi|89938 : -T-CTG----GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT--GT-------------T-G-------C--ATG--TG-GA-----T-A---T-----A-GA--C-TTTA-GA--TAAT-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATT
gi|89939 : A-AC-TTG-T---T--TG--TATT-TGT-------------T---------C--TTT--TG-CA-----T-A---C--------A--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-
gi|89940 : TA-TG--T--TG--TATT-TGT-------------T-GG------C--TTT--TG-CA-----T-A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A--T-CTATTCT
gi|89941 : T-TGT-------------T-A-------C--TTG--TG-CA-----T-A---C-----C-AA--C-TTTA-AA--TAAA-T---G-TTA-T-TCT--A-TT-
Alignments
lowQualScore : 22 33 55 1 11 1 3333 1 1 2 1 11 11 22 1 1 55555555 222 1 1 555 1 1 55555 33333 333 22222 2 11 1 1 22 1 111 2 1 1 11 1 2
lowQualScore : .. .. .. . .. . .... . . . . .. .. .. . . ........ ... . . ... . . ..... ..... ... ..... . .. . . .. . ... . . . .. . .
lowQualScore : 77 99 11 0 44 0 1111 0 0 0 0 33 33 66 0 0 44444444 000 0 0 111 0 9 00000 33333 666 44444 0 33 0 0 33 0 888 1 1 1 77 2 7
consensus : ATGTCG--G--TC--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-G-C-A-TN--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
Reference ( family-483 ) : ATGTCG--G--TC--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-G-C-A-TN--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89899 : ATGTCG--G--TT--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-G-C-T-TT--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89900 : ATGTCG--G--TT--AAAA-G--CTC-T----CTG-GAAGC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-G-C-T-TT--T-G-CA-----T-----A---T-----C-GA--C-TTTA-A----AAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TTGCTATTC
gi|89901 : ATGTCG--G--TT--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-G-C-T-TT--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89902 : ATGTCG--G--TT--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-G-CTT-TT--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89903 : ATGTCG--G--TC--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT--GT--------T-G-C-A-TG--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AT--TAAA-T---C-TTA-T-TAT--A-GT-CTATTCT
gi|89904 : ATGTCA--G--TC--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--TGTTG--TATT--AT--------T-G-C-A-TG--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTAT
gi|89905 : ATGTCG--G--TC--GAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-ATG-TG--T--TG--TATT--GT--------A-G-C-A-TG--T-G-CA-----T-----A---T-----C-GA--C-TTTA-AA--TCAA-T---C-TCA-T-TCT--A-TT-CTATTC
gi|89906 : ATGTCG--G--TC--AAAA-G--TTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TA-T-TAT--------T-A-C-A-TA--G-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-----C-TTATT-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89907 : ATGTCG--G--TC--AAAA-G--CTC-T----C--------------------TG--TATT-TGT--------T-A-C-A-TT--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89908 : ATATCG--G--TC--AAAA-G--CTC-T----CAG-GA-GC-TTG-TG--T--TA--TA-T-TGT--------T-G-C-A-TG--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AAT-TAGACT---C-TTA-T-TCT--A-TTACTA
gi|89909 : ATGTCG--G--TC--AAAA-G--CTC-T----CTT-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TA-T-TGT--------T-G-C-A-TG--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-ATTA-AA--TCAA-T---C-TCA-T-
gi|89910 : ATGTCG--G--TC--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TA-T-TGT--------T-A-C-A-TG--T-G-C------------------------------------A--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATT
gi|89911 : ATGTCT--G--TC--AAA--G--CAC-T----CTG-TA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-A-C-A-TT--T-G-CAT----T-----A---C-----G-GA--C-TTTA-GA--TAAA-T---C-TTA-
gi|89912 : ATGTCG--G--TCTAAAAA-G--CTC-A----CTG-GA-GC-TTA-TG--T--TA--C-TT-TGT--------T-A-T-A-AA--T-GACT-----T-----T---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-G---C-TTA---TCT--A--T-CTAT
gi|89913 : ATGTCG--G--TC--AAAA-T--CTC-T----CTG-G----------------------TT-TGT--------T-G-C-A-TG--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C----------TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-CC-CT
gi|89914 : ATGTCG--G--TCC-AAAA-G--CTC-C----CTG-GA-AC-TTA-TG--T--TT--CACT--GT--------T-C-A-A-TG----G-TA-----C-----G---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-GTG-T-CTT--A-TC-TTAT
gi|89915 : ATGTCG--T--TCC-AAAA-G--CTC-A----CTG-GA-GT-TCA-TG--T--TT--CAAT--GT--------T-A-T-A-TT--C-A-TA-----T-----G---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAGA-G---C-TTA-T-TTT--A-TC-TTAT
gi|89916 : ATATCG--G--TC--AAAA-G--CTC-CTTAATTA-GA-GC-TTA-TG--T--TG--TA-T-TGT--------T-G-C-A-TG--T-G-CA-----T-----A---C-----
gi|89917 : ATGTCG--G--TCTAAAAA-G--CTC-T----ATG-GA-GCTTTA-TG--T--TA---ATT-TGT--------T-A-T-A-TA--T-GACT-----T-----G---C-----C-GA--C--TTA-AAGCTTAA-T---C-TT
gi|89918 : ATGTCG--G--TC--ATAA-G--CTC-T----ACA-GA-GC-TTA-TG--T--TA-----C-TGT----------------TT--T-A-AA-----T-----AT--C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-A---T-T---T-TCTGAA-TT-CT
gi|89919 : ATGTCG--G--TC--ACAA-C--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--
gi|89920 : TGTCGTCG--TT--AAAA-G--C-C-T----CTGAGA-GC-TTG-TG--T--TT--TATTATGT--------C-------TT--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---CTTTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89921 : TGTCG--A--TC--AAAA-G--CTC-T-------------------------------TT-AGT--------T-G-C-A-TG--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TGTA-AA--TAAA-T---C-CTA-T-TCT--A-TT-CTAT
gi|89922 : TGCTG--G--TC--AAAA-G--TTCGT----CTG-GA-GCGTTG-TG--T--TG--TATT-TGTATAAGATGT-G-C-A--A--T-G-CT-----TCAGTAA---C-----C-GA--A-TATA-AA--TAA
gi|89923 : GTCG--GA-TA--AAAA-G--CTC-T----ACA-GA-GC-TTG-TG--T--TGTTTGTT-TGTA-------T-G-T-A-TA--T-A--A-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-A---T-TTA-C-T
gi|89924 : GTCG--G--TT--AAAA-GAGCTC-A----CTA-GA-GC-TCA-TG--T--T----ATT-TGT--------T-A-T-A-TA--T-G-TA-----T-----A---CAGTGCC-GA--C-TTTA-AA--TAAA-A---T-TTA-C-T
gi|89925 : GTCG--G--TA--GATA-G--CTC-T----ATA-GA-GC-TAA-TG--T--TG--T------C--------T-G-C-A-T-------CA-----T-----ATACC-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA--------TA-T-TTT--A-TT-TTATTTT
gi|89926 : GTTG--GA-TA--AAAA-G--CTC-T----ACA-GA-GC-TTG-TG--T--TG---A-T-TGT--------T-A-T-A-TG--T-A-TATAG--T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-A---T-TTA-
gi|89927 : GTCG--GACTA--AAAA-G--CTA-T----ACA-GA-GC-TTA-TG--T--TGACTGTT-TATA-------T-G-T-A-TG--T-A--G-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T-----TTA-C-TTT--A-CT-TTACTTT
gi|89928 : GTCG--G--AA--AATA-G--CTC-T----TTA-GA-GC-TAA-TG--T--T----ATT-TGT--------------A-T---T-G-AA-----T-----AT--C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---A-TTA-T-TTG--A-TT-TGATT
gi|89929 : GTCG--G--TA--AATA-G--CTC-T------A-GA-GC-TAA-TG--T--T----ATT-TGT--------------A-T---T-G-TA-----T-----A---C-----CCAA--C-TTTA-AA--TAAA-T---A-TTA-T-TTG--A-TT-
gi|89930 : TCG--G--TT--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATC-TGT--------T-G-C-T-TT--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89931 : TCGT-G--TC--AAAAAG--CTC-TT---CTG-GA-GC-TTGATG--C--TG--TGAT-TGT--------TTG-C-A-TTGCT-A-CA-----TT----A---A-----C-AA--C-TTTC-AA--TAAA-T---CTTTA-TATCT--AGTT-CT
gi|89932 : G--G--TT--AAAA-G--CTC-T----CTG-GG-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-G-C-G-TT--T-G-CT-----T-----A---C-----C-GAATC-TTT---A--TAAA-T---
gi|89933 : --G--TT--AGAA-G--CTC-T----ATG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-G-C-T-TT--T-G-CA-----T-----A---T-----T-GA--C-TTTA-GA--TAAA-T---C-TTA-T-TCC--A-
gi|89934 : C--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TGTTT--TG--TGTT-TGT--------T-A-C-AGTT--TGG-CA-----T-----A---C-----TGGA--C-TTTACAA--TAAA-T---C--TA-T-TCT--A-TT--TATT
gi|89935 : --AAAA-G--CTC-T----ACA-GA-GC-TTG-TG--T--TC--TTTT-TGT--------T-A-T-A-TG--T---CATATAGT-----A---C-----C--A--C-TTTA-AA--TAAA-TTTAC-TTA-C-TCT--
gi|89936 : AA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TGTT-TGT--------T-A-C-A-TT--T-G-CA-----T-----A---C-----T-GA--CTTTTA-CA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTA
gi|89937 : A-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-A-C-A-TT--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATT
gi|89938 : -T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT--GT--------T-G-C-A-TG--T-G-GA-----T-----A---T-----A-GA--C-TTTA-GA--TAAT-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATT
gi|89939 : A-AC-TTG-T---T--TG--TATT-TGT--------T---C-T-TT--T-G-CA-----T-----A---C--------A--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-
gi|89940 : TA-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-GGC-T-TT--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A--T-CTATTCT
gi|89941 : T-TGT--------T-A-C-T-TG--T-G-CA-----T-----A---C-----C-AA--C-TTTA-AA--TAAA-T---G-TTA-T-TCT--A-TT-
Alignments
lowQualScore : 22 33 55 1 11 1 3333 1 1 2 1 11 11 22 1 1 55555555 222 1 1 555 1 1 55555 33333 333 22222 2 11 1 1 22 1 111 2 1 1 11 1 2
lowQualScore : .. .. .. . .. . .... . . . . .. .. .. . . ........ ... . . ... . . ..... ..... ... ..... . .. . . .. . ... . . . .. . .
lowQualScore : 77 99 11 0 44 0 1111 0 0 0 0 33 33 66 0 0 44444444 000 0 0 111 0 9 00000 33333 666 44444 0 33 0 0 33 0 888 1 1 1 77 2 7
consensus : ATGTCG--G--TC--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-G-C-A-TN--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
Reference ( family-483 ) : ATGTCG--G--TC--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-G-C-A-TN--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89899 : ATGTCG--G--TT--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-G-C-T-TT--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89900 : ATGTCG--G--TT--AAAA-G--CTC-T----CTG-GAAGC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-G-C-T-TT--T-G-CA-----T-----A---T-----C-GA--C-TTTA-A----AAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TTGCTATTC
gi|89901 : ATGTCG--G--TT--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-G-C-T-TT--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89902 : ATGTCG--G--TT--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-G-CTT-TT--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89903 : ATGTCG--G--TC--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT--GT--------T-G-C-A-TG--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AT--TAAA-T---C-TTA-T-TAT--A-GT-CTATTCT
gi|89904 : ATGTCA--G--TC--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--TGTTG--TATT--AT--------T-G-C-A-TG--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTAT
gi|89905 : ATGTCG--G--TC--GAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-ATG-TG--T--TG--TATT--GT--------A-G-C-A-TG--T-G-CA-----T-----A---T-----C-GA--C-TTTA-AA--TCAA-T---C-TCA-T-TCT--A-TT-CTATTC
gi|89906 : ATGTCG--G--TC--AAAA-G--TTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TA-T-TAT--------T-A-C-A-TA--G-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-----C-TTATT-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89907 : ATGTCG--G--TC--AAAA-G--CTC-T----C--------------------TG--TATT-TGT--------T-A-C-A-TT--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89908 : ATATCG--G--TC--AAAA-G--CTC-T----CAG-GA-GC-TTG-TG--T--TA--TA-T-TGT--------T-G-C-A-TG--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AAT-TAGACT---C-TTA-T-TCT--A-TTACTA
gi|89909 : ATGTCG--G--TC--AAAA-G--CTC-T----CTT-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TA-T-TGT--------T-G-C-A-TG--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-ATTA-AA--TCAA-T---C-TCA-T-
gi|89910 : ATGTCG--G--TC--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TA-T-TGT--------T-A-C-A-TG--T-G-C------------------------------------A--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATT
gi|89911 : ATGTCT--G--TC--AAA--G--CAC-T----CTG-TA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-A-C-A-TT--T-G-CAT----T-----A---C-----G-GA--C-TTTA-GA--TAAA-T---C-TTA-
gi|89912 : ATGTCG--G--TCTAAAAA-G--CTC-A----CTG-GA-GC-TTA-TG--T--TA--C-TT-TGT--------T-A-T-A-AA--T-GACT-----T-----T---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-G---C-TTA---TCT--A--T-CTAT
gi|89913 : ATGTCG--G--TC--AAAA-T--CTC-T----CTG-G----------------------TT-TGT--------T-G-C-A-TG--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C----------TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-CC-CT
gi|89914 : ATGTCG--G--TCC-AAAA-G--CTC-C----CTG-GA-AC-TTA-TG--T--TT--CACT--GT--------T-C-A-A-TG----G-TA-----C-----G---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-GTG-T-CTT--A-TC-TTAT
gi|89915 : ATGTCG--T--TCC-AAAA-G--CTC-A----CTG-GA-GT-TCA-TG--T--TT--CAAT--GT--------T-A-T-A-TT--C-A-TA-----T-----G---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAGA-G---C-TTA-T-TTT--A-TC-TTAT
gi|89916 : ATATCG--G--TC--AAAA-G--CTC-CTTAATTA-GA-GC-TTA-TG--T--TG--TA-T-TGT--------T-G-C-A-TG--T-G-CA-----T-----A---C-----
gi|89917 : ATGTCG--G--TCTAAAAA-G--CTC-T----ATG-GA-GCTTTA-TG--T--TA---ATT-TGT--------T-A-T-A-TA--T-GACT-----T-----G---C-----C-GA--C--TTA-AAGCTTAA-T---C-TT
gi|89918 : ATGTCG--G--TC--ATAA-G--CTC-T----ACA-GA-GC-TTA-TG--T--TA-----C-TGT----------------TT--T-A-AA-----T-----AT--C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-A---T-T---T-TCTGAA-TT-CT
gi|89919 : ATGTCG--G--TC--ACAA-C--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--
gi|89920 : TGTCGTCG--TT--AAAA-G--C-C-T----CTGAGA-GC-TTG-TG--T--TT--TATTATGT--------C-------TT--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---CTTTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89921 : TGTCG--A--TC--AAAA-G--CTC-T-------------------------------TT-AGT--------T-G-C-A-TG--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TGTA-AA--TAAA-T---C-CTA-T-TCT--A-TT-CTAT
gi|89922 : TGCTG--G--TC--AAAA-G--TTCGT----CTG-GA-GCGTTG-TG--T--TG--TATT-TGTATAAGATGT-G-C-A--A--T-G-CT-----TCAGTAA---C-----C-GA--A-TATA-AA--TAA
gi|89923 : GTCG--GA-TA--AAAA-G--CTC-T----ACA-GA-GC-TTG-TG--T--TGTTTGTT-TGTA-------T-G-T-A-TA--T-A--A-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-A---T-TTA-C-T
gi|89924 : GTCG--G--TT--AAAA-GAGCTC-A----CTA-GA-GC-TCA-TG--T--T----ATT-TGT--------T-A-T-A-TA--T-G-TA-----T-----A---CAGTGCC-GA--C-TTTA-AA--TAAA-A---T-TTA-C-T
gi|89925 : GTCG--G--TA--GATA-G--CTC-T----ATA-GA-GC-TAA-TG--T--TG--T------C--------T-G-C-A-T-------CA-----T-----ATACC-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA--------TA-T-TTT--A-TT-TTATTTT
gi|89926 : GTTG--GA-TA--AAAA-G--CTC-T----ACA-GA-GC-TTG-TG--T--TG---A-T-TGT--------T-A-T-A-TG--T-A-TATAG--T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-A---T-TTA-
gi|89927 : GTCG--GACTA--AAAA-G--CTA-T----ACA-GA-GC-TTA-TG--T--TGACTGTT-TATA-------T-G-T-A-TG--T-A--G-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T-----TTA-C-TTT--A-CT-TTACTTT
gi|89928 : GTCG--G--AA--AATA-G--CTC-T----TTA-GA-GC-TAA-TG--T--T----ATT-TGT--------------A-T---T-G-AA-----T-----AT--C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---A-TTA-T-TTG--A-TT-TGATT
gi|89929 : GTCG--G--TA--AATA-G--CTC-T------A-GA-GC-TAA-TG--T--T----ATT-TGT--------------A-T---T-G-TA-----T-----A---C-----CCAA--C-TTTA-AA--TAAA-T---A-TTA-T-TTG--A-TT-
gi|89930 : TCG--G--TT--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATC-TGT--------T-G-C-T-TT--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89931 : TCGT-G--TC--AAAAAG--CTC-TT---CTG-GA-GC-TTGATG--C--TG--TGAT-TGT--------TTG-C-A-TTGCT-A-CA-----TT----A---A-----C-AA--C-TTTC-AA--TAAA-T---CTTTA-TATCT--AGTT-CT
gi|89932 : G--G--TT--AAAA-G--CTC-T----CTG-GG-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-G-C-G-TT--T-G-CT-----T-----A---C-----C-GAATC-TTT---A--TAAA-T---
gi|89933 : --G--TT--AGAA-G--CTC-T----ATG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-G-C-T-TT--T-G-CA-----T-----A---T-----T-GA--C-TTTA-GA--TAAA-T---C-TTA-T-TCC--A-
gi|89934 : C--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TGTTT--TG--TGTT-TGT--------T-A-C-AGTT--TGG-CA-----T-----A---C-----TGGA--C-TTTACAA--TAAA-T---C--TA-T-TCT--A-TT--TATT
gi|89935 : --AAAA-G--CTC-T----ACA-GA-GC-TTG-TG--T--TC--TTTT-TGT--------T-A-T-A-TG--T---CATATAGT-----A---C-----C--A--C-TTTA-AA--TAAA-TTTAC-TTA-C-TCT--
gi|89936 : AA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TGTT-TGT--------T-A-C-A-TT--T-G-CA-----T-----A---C-----T-GA--CTTTTA-CA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTA
gi|89937 : A-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-A-C-A-TT--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATT
gi|89938 : -T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT--GT--------T-G-C-A-TG--T-G-GA-----T-----A---T-----A-GA--C-TTTA-GA--TAAT-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATT
gi|89939 : A-AC-TTG-T---T--TG--TATT-TGT--------T---C-T-TT--T-G-CA-----T-----A---C--------A--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-
gi|89940 : TA-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-GGC-T-TT--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A--T-CTATTCT
gi|89941 : T-TGT--------T-A-C-T-TG--T-G-CA-----T-----A---C-----C-AA--C-TTTA-AA--TAAA-T---G-TTA-T-TCT--A-TT-
blockSeqs : TC AC TA A AG G TTAA A T TT GT TT ATAAGATG TG TGC A TATAG CAGTA TAC AGTGC C AT GC C TTA T T A GA G G
blockSeqs : T A TA . . . T . G . . AC A GG T A TAG T T . G . T . . T . . . . A
blockSeqs : . A C . . . . . . . . . A G T . T . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . C . . . . . . . . . . G T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . C T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G A . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G G . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . G T . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A T . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A G . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . A T . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G G . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . A T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : ATGTCG--G--TC--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-G-C-A-TN--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
finalCons : ATGTCG--G--TC--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-G-C-A-TN--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
Alignments
lowQualScore : 22 33 55 1 11 1 3333 1 1 2 1 11 11 22 1 1 55555555 222 1 1 555 1 1 55555 33333 333 22222 2 11 1 1 22 1 111 2 1 1 11 1 2
lowQualScore : .. .. .. . .. . .... . . . . .. .. .. . . ........ ... . . ... . . ..... ..... ... ..... . .. . . .. . ... . . . .. . .
lowQualScore : 77 99 11 0 44 0 1111 0 0 0 0 33 33 66 0 0 44444444 000 0 0 111 0 9 00000 33333 666 44444 0 33 0 0 33 0 888 1 1 1 77 2 7
consensus : ATGTCG--G--TC--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-G-C-A-TN--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
Reference ( family-483 ) : ATGTCG--G--TC--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-G-C-A-TN--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89899 : ATGTCG--G--TT--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-G-C-T-TT--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89900 : ATGTCG--G--TT--AAAA-G--CTC-T----CTG-GAAGC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-G-C-T-TT--T-G-CA-----T-----A---T-----C-GA--C-TTTA-A----AAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TTGCTATTC
gi|89901 : ATGTCG--G--TT--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-G-C-T-TT--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89902 : ATGTCG--G--TT--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-G-CTT-TT--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89903 : ATGTCG--G--TC--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT--GT--------T-G-C-A-TG--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AT--TAAA-T---C-TTA-T-TAT--A-GT-CTATTCT
gi|89904 : ATGTCA--G--TC--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--TGTTG--TATT--AT--------T-G-C-A-TG--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTAT
gi|89905 : ATGTCG--G--TC--GAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-ATG-TG--T--TG--TATT--GT--------A-G-C-A-TG--T-G-CA-----T-----A---T-----C-GA--C-TTTA-AA--TCAA-T---C-TCA-T-TCT--A-TT-CTATTC
gi|89906 : ATGTCG--G--TC--AAAA-G--TTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TA-T-TAT--------T-A-C-A-TA--G-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-----C-TTATT-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89907 : ATGTCG--G--TC--AAAA-G--CTC-T----C--------------------TG--TATT-TGT--------T-A-C-A-TT--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89908 : ATATCG--G--TC--AAAA-G--CTC-T----CAG-GA-GC-TTG-TG--T--TA--TA-T-TGT--------T-G-C-A-TG--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AAT-TAGACT---C-TTA-T-TCT--A-TTACTA
gi|89909 : ATGTCG--G--TC--AAAA-G--CTC-T----CTT-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TA-T-TGT--------T-G-C-A-TG--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-ATTA-AA--TCAA-T---C-TCA-T-
gi|89910 : ATGTCG--G--TC--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TA-T-TGT--------T-A-C-A-TG--T-G-C------------------------------------A--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATT
gi|89911 : ATGTCT--G--TC--AAA--G--CAC-T----CTG-TA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-A-C-A-TT--T-G-CAT----T-----A---C-----G-GA--C-TTTA-GA--TAAA-T---C-TTA-
gi|89912 : ATGTCG--G--TCTAAAAA-G--CTC-A----CTG-GA-GC-TTA-TG--T--TA--C-TT-TGT--------T-A-T-A-AA--T-GACT-----T-----T---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-G---C-TTA---TCT--A--T-CTAT
gi|89913 : ATGTCG--G--TC--AAAA-T--CTC-T----CTG-G----------------------TT-TGT--------T-G-C-A-TG--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C----------TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-CC-CT
gi|89914 : ATGTCG--G--TCC-AAAA-G--CTC-C----CTG-GA-AC-TTA-TG--T--TT--CACT--GT--------T-C-A-A-TG----G-TA-----C-----G---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-GTG-T-CTT--A-TC-TTAT
gi|89915 : ATGTCG--T--TCC-AAAA-G--CTC-A----CTG-GA-GT-TCA-TG--T--TT--CAAT--GT--------T-A-T-A-TT--C-A-TA-----T-----G---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAGA-G---C-TTA-T-TTT--A-TC-TTAT
gi|89916 : ATATCG--G--TC--AAAA-G--CTC-CTTAATTA-GA-GC-TTA-TG--T--TG--TA-T-TGT--------T-G-C-A-TG--T-G-CA-----T-----A---C-----
gi|89917 : ATGTCG--G--TCTAAAAA-G--CTC-T----ATG-GA-GCTTTA-TG--T--TA---ATT-TGT--------T-A-T-A-TA--T-GACT-----T-----G---C-----C-GA--C--TTA-AAGCTTAA-T---C-TT
gi|89918 : ATGTCG--G--TC--ATAA-G--CTC-T----ACA-GA-GC-TTA-TG--T--TA-----C-TGT----------------TT--T-A-AA-----T-----AT--C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-A---T-T---T-TCTGAA-TT-CT
gi|89919 : ATGTCG--G--TC--ACAA-C--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--
gi|89920 : TGTCGTCG--TT--AAAA-G--C-C-T----CTGAGA-GC-TTG-TG--T--TT--TATTATGT--------C-------TT--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---CTTTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89921 : TGTCG--A--TC--AAAA-G--CTC-T-------------------------------TT-AGT--------T-G-C-A-TG--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TGTA-AA--TAAA-T---C-CTA-T-TCT--A-TT-CTAT
gi|89922 : TGCTG--G--TC--AAAA-G--TTCGT----CTG-GA-GCGTTG-TG--T--TG--TATT-TGTATAAGATGT-G-C-A--A--T-G-CT-----TCAGTAA---C-----C-GA--A-TATA-AA--TAA
gi|89923 : GTCG--GA-TA--AAAA-G--CTC-T----ACA-GA-GC-TTG-TG--T--TGTTTGTT-TGTA-------T-G-T-A-TA--T-A--A-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-A---T-TTA-C-T
gi|89924 : GTCG--G--TT--AAAA-GAGCTC-A----CTA-GA-GC-TCA-TG--T--T----ATT-TGT--------T-A-T-A-TA--T-G-TA-----T-----A---CAGTGCC-GA--C-TTTA-AA--TAAA-A---T-TTA-C-T
gi|89925 : GTCG--G--TA--GATA-G--CTC-T----ATA-GA-GC-TAA-TG--T--TG--T------C--------T-G-C-A-T-------CA-----T-----ATACC-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA--------TA-T-TTT--A-TT-TTATTTT
gi|89926 : GTTG--GA-TA--AAAA-G--CTC-T----ACA-GA-GC-TTG-TG--T--TG---A-T-TGT--------T-A-T-A-TG--T-A-TATAG--T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-A---T-TTA-
gi|89927 : GTCG--GACTA--AAAA-G--CTA-T----ACA-GA-GC-TTA-TG--T--TGACTGTT-TATA-------T-G-T-A-TG--T-A--G-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T-----TTA-C-TTT--A-CT-TTACTTT
gi|89928 : GTCG--G--AA--AATA-G--CTC-T----TTA-GA-GC-TAA-TG--T--T----ATT-TGT--------------A-T---T-G-AA-----T-----AT--C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---A-TTA-T-TTG--A-TT-TGATT
gi|89929 : GTCG--G--TA--AATA-G--CTC-T------A-GA-GC-TAA-TG--T--T----ATT-TGT--------------A-T---T-G-TA-----T-----A---C-----CCAA--C-TTTA-AA--TAAA-T---A-TTA-T-TTG--A-TT-
gi|89930 : TCG--G--TT--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATC-TGT--------T-G-C-T-TT--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATTCT
gi|89931 : TCGT-G--TC--AAAAAG--CTC-TT---CTG-GA-GC-TTGATG--C--TG--TGAT-TGT--------TTG-C-A-TTGCT-A-CA-----TT----A---A-----C-AA--C-TTTC-AA--TAAA-T---CTTTA-TATCT--AGTT-CT
gi|89932 : G--G--TT--AAAA-G--CTC-T----CTG-GG-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-G-C-G-TT--T-G-CT-----T-----A---C-----C-GAATC-TTT---A--TAAA-T---
gi|89933 : --G--TT--AGAA-G--CTC-T----ATG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-G-C-T-TT--T-G-CA-----T-----A---T-----T-GA--C-TTTA-GA--TAAA-T---C-TTA-T-TCC--A-
gi|89934 : C--AAAA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TGTTT--TG--TGTT-TGT--------T-A-C-AGTT--TGG-CA-----T-----A---C-----TGGA--C-TTTACAA--TAAA-T---C--TA-T-TCT--A-TT--TATT
gi|89935 : --AAAA-G--CTC-T----ACA-GA-GC-TTG-TG--T--TC--TTTT-TGT--------T-A-T-A-TG--T---CATATAGT-----A---C-----C--A--C-TTTA-AA--TAAA-TTTAC-TTA-C-TCT--
gi|89936 : AA-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TGTT-TGT--------T-A-C-A-TT--T-G-CA-----T-----A---C-----T-GA--CTTTTA-CA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTA
gi|89937 : A-G--CTC-T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-A-C-A-TT--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATT
gi|89938 : -T----CTG-GA-GC-TTG-TG--T--TG--TATT--GT--------T-G-C-A-TG--T-G-GA-----T-----A---T-----A-GA--C-TTTA-GA--TAAT-T---C-TTA-T-TCT--A-TT-CTATT
gi|89939 : A-AC-TTG-T---T--TG--TATT-TGT--------T---C-T-TT--T-G-CA-----T-----A---C--------A--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A-
gi|89940 : TA-TG--T--TG--TATT-TGT--------T-GGC-T-TT--T-G-CA-----T-----A---C-----C-GA--C-TTTA-AA--TAAA-T---C-TTA-T-TCT--A--T-CTATTCT
gi|89941 : T-TGT--------T-A-C-T-TG--T-G-CA-----T-----A---C-----C-AA--C-TTTA-AA--TAAA-T---G-TTA-T-TCT--A-TT-