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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T TGCTATGTGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TATA . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G TGCTATGTGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAAT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T TGCTATGTGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G TGCTATGTGT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C CT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAT . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GAT . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C T . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : .
blockSeqCons :
originalCons : CAATC-G-T-AA-C-TA------C------T---C-GGC-T-ATTCCCGT-A-ACC-------GA-AAA--TG-AA-CC---T-CG-T--AT-G-TAG-ATCG--A----C-GCCATC-A-----A-AA-GTNTGT-----------T---------AC---------GCAAAC-GGTAC-T------A----T--G----ACG-TC-A-C----AGT-CAAA-CATA--CG-T---TACGAT-TT--GAAA-CAA-T-GC-ATT----TG-A---G---------A---------T-----------AGC-T-AAGA---TATTC-CAATA
finalCons : CAATC-G-T-AA-C-TA------C------T---C-GGC-T-ATTCCCGT-A-ACC-------GA-AAA--TG-AA-CC---T-CG-T--AT-G-TAG-ATCG--A----C-GCCATC-A-----A-AA-GTNTGT-----------T---------AC---------GCAAAC-GGTAC-T------A----T--G----ACG-TC-A-C----AGT-CAAA-CATA--CG-T---TACGAT-TT--GAAA-CAA-T-GC-ATT----TG-A---G---------A---------T-----------AGC-T-AAGA---TATTC-CAATA
Alignments
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Reference ( family-482 ) : CAATC-G-T-AA-C-TA------C------T---C-GGC-T-ATTCCCGT-A-ACC-------GA-AAA--TG-AA-CC---T-CG-T--AT-G-TAG-ATCG--A----C-GCCATC-A-----A-AA-GTNTGT-----------T---------AC---------GCAAAC-GGTAC-T------A----T--G----ACG-TC-A-C----AGT-CAAA-CATA--CG-T---TACGAT-TT--GAAA-CAA-T-GC-ATT----TG-A---G---------A---------T-----------AGC-T-AAGA---TATTC-CAATA
gi|18593 : CAATC-G-T-AA-C-TA------C------T---C-GGC-T-ATTCCCGT-A-ACC-------GA-AAA--TG-AA-CC---T-CG-T--AT-G-TAG-ATTG--A----C-GCCATC-A-----A-AA-GTGTGT-----------T---------AC---------GCAAAC-GGTAC-T------A----T--G----ACG-TC-A-C----AGT-CAAA-CATA--CG-T---TAAGAT-TT--GAAA-AAA-T-GC-ATT----TG-A---G---------A---------T-----------AGC-A-AAGA---TATTC-CAATA
gi|18594 : CAATT-G-T-AA-C-TA------C------T---C-GGC-T-ATTCCCGT-A-ACC-------GA-AAA--TG-AA-CC---T-CG-T--AT-G-TAG-ATTG--A----C-GCCATC-A-----A-AA-GTGTGT-----------T---------AC---------ACAAAC-GGTAC-TTATA--A----T--G----ACG-TC-A-C----AGT-CAAA-CATA--CG-T---TACGAT-TT--GAAA-CAA-T-GC-ATT----TG-A---G---------A---------T-----------AGC-T-AAGA---TATTC-TTATA
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gi|18596 : CAATC-G-T-AA-C-TA------C------T---C-GGCCT-ATTCCCGT-A-ACC-------GA-AAAACTA-AA-CC---T-CG-T--AT-G-TAG-ATTG--A----C--CCATC-A-----A-AA-GTTTGT-----------T---------AC---------GCAA-C-GGTAC-T------A----T--G----ACA-TC-A-C----AGT-CAAA-CATA--CG-T---TACGAT-TTA-AAAA-CAA-T-GC-ATT----TG-A---G---------A---------T-----------AGC-T-AAGA---TATTC-CAATA
gi|18597 : CAATC-G----A-C-TA------C------T---C-GGC-T-ATTCTCGTTA-ACC-------GA-AA---TG-AA-CC---T-CG----AT-G-TAG-ATTGGGA----C-GCCATC-A-----A-AA-GTTTGTC----------T---------AC---------G-AAGC-TGTAC-T------A----T--G----ACACTC-A-C----AGT-CAAA-CTTA--AG-T---TACGAT-TT--TGAA-CAA-TGGC-ATT----TG-A-------------A---------T-----------AGC-T-AAGA---TAT
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gi|18599 : CAATC-G-T-AA-C-TA------C------T---C-G-C-T-ATTCC-GT-A-ACC-------GA-AAA--TGGAA-CCG--T-CG-T--AT-G-TAG-ATTG--A----C-GC-ATC-A-----A-AA-GTGTGT-----------T---------AC---------GCAAAC-GGTAC-T------A----TATG----ACG-T--A-C----AGT-CAAA-CAAA--CG-T---TACGATATT--G-AA-CGA-T-GC-ATT----TG-A---G---------A---------T-----------AGC-T-AAGA---TATTT-CCATA
gi|18600 : CAATC-G-T-AA-C-TA------C------T---C-GGC-T-ATTCCCGT-A-ACC-------GA-AAA--TG-AA-CC---T-CG-T--AT-G-TAG-ATCG--A----C-GTCATC-A-----A-AA-GTTTGTTGCTATGTG--T---------AC---------GCAAAC-GGTAC-T------A----T--G----ACG-TC-A-C----AGT-CAAA-CACA--CG-T---TACGAT-TT--GAA
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gi|18602 : CAATC-G-T-AA-C-TA------CGGTACTT---C-G-C-A-ATTTCTGT-A-ACT-------GC-AAA--TG-AG-CC---T-CA-T--GT-G-TAG-ATCG--A----C-GCCATC-A-----A-AA-GTCTGT-----------TGCTATGTGTAC---------GCAAAT-GTTAC-T------A----T--G----ACG-TC-A-C----AGT-TAAA-CATA--TG-T---TACGAT-TT--GAAA-CAA-T-GT-ATT----TG-A---A---------ATATCATATGT-----------AGC-T--AGA---TATTC-TAACA
gi|18603 : CAATC-G-T-AC-C-TA------C------T---C-GGC-A-ATTTCCGT-A-ACC-------GC-AAA--TG-AA-CC---T-CG-T--AC-G-TAG-ATCG--A----C-GCCATC-A-----A-AA-GTCTG
gi|18604 : CAATC-G-G-AA-C-TAAATATAC------T---C-GGC-C-ATTTCTGC-A-ACT-------GC-AAA--TA-AA-CC---T-TG-C--AT-G-TAG-ATCG--A----C-GCCATC-A-----A-AA-GTG--------------T---------AC---------GTAAAT-GTGAC-T------G----T--G-------------------GTACAAA-CGTG--CG-T---TACACT-AT--GAAA-CA
gi|18605 : CAATC-G-T-AA-C-TA------C------TACTT-GGC-T-ATTCCTGT-A-ACC-------GA-AAA--TG-AA-CC---T-CT-T--AT-G-TAG-ATCG-------------TC-A-----A-AA-GTTTGTTGCTATGTG--T---------AC---------GCAAAC-
gi|18606 : CAATT-GGT-AA-CATA------C------T---T-GTC-T-ATTTCTGT-ATACT-------GA-AAA--TG-AAACC---T-CG-T--AT-G-TAG--TTG--A----CAGGCATC-G-----ATCA-TTGTGT-----------T---------GCTATAGTGTTACGAACAGGTAC-TAA----A----T--GT---ACA-TC-AGA----AGT-ATAA-CATAGTCA-T---TAAGAT-CT--GAAA--AA-T-GC--TT----TA-A---T---------A---------TA----------AGC-T-AAGA---TTTT
gi|18607 : CAATC-G-T-AA-C-TA------C------T---C-GGC-T-ATTCCCGT-A-ACC-------GA-AAA--TG-AA-
gi|18608 : CAATC-A-T-AA-C-TA------C------T---T-CGC-A-ATTTCTGT-A-ACT-------GC-AAA--TG---------T-C------T-G-T--------------T-GCCAT---------------GTGT---------------------AT---------GCAAAC-GTTTT-T------A----T--G----ACG-TC-A-C----AGT---------------T---T---AT-TT-----A-CGA-T-GC-ATT----TT-A---GTTATCAAACA---------T-----------AGC-T-AAGA---TATTC-TAA
gi|18609 : CAATC-G-T-AA-C-TA------CGTAC--T---C-GGC-T-ATTCCCGT-A-ACC-------GA-AAA--TT-TA-CC---G-GT-T--AC-G-GAA-ATTG--A----C-G---------------A-GCGTGA-----------T---------CC---------G--ATT-GGTAG-TATATGCA----T--G----ACG-TC-A-CAGAAAGT-AATA-TATG--CA-T---TAC
gi|18610 : CAATC-G-T-AA-C-TA------C------T---C-GGC-T-ATTTCCGT-A-ACC-------GA-AAA--TG-
gi|18611 : CAATC-G-T-AA-C-TA------C------T---C-GGC-T-ATTCCCGT-A-ACC-------G----G--T---------------T--AC-G-GAA-ATTG--ACGAGC-GTGATC-C-----G-A---TTGGT-----------A---------AC---------GC-AAT-GG-AC-T------C----T--A----ACG-TC-A-T----AGT-
gi|18612 : CAATC-G-TCAA-C-TA-------------T---C-GGC-T-ATTCCCGT-A-ATC-------AA-AAA--TG-AA-CC---
gi|18613 : CAATC-G-T-AG-C-TA------C------T---C-GGC-T-ATTTCCGT-A-ACT-------GC-AAA--TG-A---C---C-AG-T--AC-G-GAA-AATG--A----C-Ggtttaccgaaattgacg
gi|18614 : CAATC-G-T-AG-C-TA------C------T---C-GGC-T-ATTTCCGT-A-ACT-------GC-AAA--TG-A
gi|18615 : CAATC-G-T-AA-C-TA------C------T---C-GGC-T-ATTTCCGT-A-ACC-------GC-AAA--TG-
gi|18616 : CAATC-G-T-AA-C-TA------C------TT--C-GGC-T-ATT-CCGTAA-ACC-------GA-AAA--T
gi|18617 : CAATC-G-T-AA-C-TA------C------T---C-GGC-T-ATTCCCGT-A-ACC-------G
gi|18618 : CAATC-G-T-AA-C-TA------C------T---C-GGC-T-ATTTCCGT-A-ACCGGTTACGGA-AAA--TG-A
gi|18619 : CAATC-G-T-AA-C-TA------C------T---C-GGC-T-ATTTCCGT-A-ACC-------TA-AAG--T
gi|18620 : CAATC-G-T-AA-C-TA------C------T---C-GGC-T-GTTTCCGT-G-ACC-------GC-ATA--TA-AA-
gi|18621 : CAATC-T-T-AA-A-TA------C------T---C-GGC-T-ATTTCCGT-A-ACC-------GC-AAA--TT-AT-CA---T-CGAT--AT-
gi|18622 : AATC-G-T-AATC-TA------C------T---C-GGC-T-TTTCCCGT-A-ACC-------GA-AA---TG-AA-CC---T-CG-T--AT-G-TAG-ATTG--A----C-GCCATC-A-----A-AA-GTTTGT-----------T---------AC---------GTAAGC-TGTAC-T------A----T--G----ACC-TC-A-C----AGT-CAAA-CTTA--CG-T---TACGAT-TT--GAAA-CAA-T-GC-ATT----TG-A---G---------A---------T-----------AGC-T-AAGA---TATTC-TAATAtttctctatcaaaa
gi|18623 : AATC-G-T-AAAC-TA------T------T---CAGGC-T-ATTCCCGT-A-ATC-------GAGAAA--T--AA-CCTTGT-CG-T--AT-G-TAGAATCGA-A----C-GCCATC-ATGGTGA-AA-GT
gi|18624 : ATC-G-T-AA-C-TC------C------TG--C-GGT-T--TCCCTGT-A-ACC-------GA-AAA--TG-GA-AC---T-CG-T--AT-G-TAG-ATCG--A----C-GTCTTCAA-----A-AA-GTTTGTTGGCTAATGTGT---------AC---------GCAAACGGGTACTT------A----T--G----A-G-TC-A-C----AGT-C-AA-CACA--CG-T---TACAAC-TT--TAAA-CAA-T-GC-ATT----TT-A---GA--------A---------T-----------AGC-T--AGA---AATTC-CAATAt
gi|18625 : ATC-G-T-AA-C-TA------C------T---T-GGC-T-ATTCCCGT-A-ACC-------GA-AAA--TG-AA--C---T-CG-T--AT-GTTAG-ATTG--A----C-GCCAT
gi|18626 : ATC-G-T-AA-C-TA------C------T---C-GGC-T-ATTCCCGT-A-ACC-------GA-AAA--TG-A
gi|18627 : -T-AA-C-TA------C------T---C-GGC-T-ATTTCCAT-A-ACC-------G--------------------CG-A--AT-A-TAG-ATCG--A----T-ACCATC-A-----A-AA-GTCTGT-----------TGCTATGTGTAC---------GTAAAC-GTTAC-T------A----T--G----ACG-TCTA-T----AGT-CAAA-CATA--CG-T---TACGAT-TT--GATA-CAATT-GT-ATT----TG-A---G---------A---------T-----------AG
gi|18628 : -T-AA-C-TA------C------T---C-GGC-T-AATCCCGT-A-ACC-------GA-AAA--TT-AA-C
gi|18629 : -------GA-AAC--TC-AA-CC---T-AG-TTCAT-G-CAG-ATTG--A----C-GCCATC-A-----A-AA-GTTTGT-----------T---------AC---------GTAAGC-TGTAC-T------A----T--G----ACC-TC-A-C----AGT-CAAA-CTTA--CG-T---TACGAT-TT--GAAA-CAA-T-GC-ATT----TG-A---G---------A---------T-----------AGC-T-AAGA---TATTCGTAATA
gi|18630 : G--A----C-TCTGTC-A-----A-AA-GTCTGT-----------TGCTATGTGTAC---------GCAA-T-GTTAT-T------A----C--G----ACG-TC-A-C----AGT-CAGA-CATA--TG-T---TATGAT-TT--GAAG-CAA-T-GC-ATT----TG-A---G---------A---------TTTCATATGTACAGT-T-AAAA---TATTC-TAACA
gi|18631 : -A-----A-AA-GTTTGT-----------T---------AC---------GCAAAC-GGTAC-T------A----T--GG---ACG-TC-A-C----AGT-CAAA-CATA--CG-T---TACGAT-TT--
gi|18632 : TATGTC----------T---------AC---------GCAAAC-GGCAC-T------ACAAAT--GTATTATG-TC-G-T----AGT-CAAA-CATA--CT-T---TACTAT-TT--GAAT-CAA-T-GC-ATT----TG-A---G---------A---------
gi|18633 : gtCAAAG-AATAC-T------A----T--G----AC---T-A-C-----GT-CAAAACACA--CG-TG--TACG-T-TT--GAAA-CAA-T-GCGATT----TA-ACACG---------A---------T-----------CGCAT-AAGAT--TATTT-
gi|18634 : ----ACG-TC-A-C----AGT-CAAG-CACA--CGTT---TCCGAT-TTTAGCAATCAATT-GC-ATTTCTCTGTA---G---------A---------T-----------AGCTT-AAGATTTTATTC-
gi|18635 : G-T---TACGAT-TT--GAAA-CGA-T-GC-ATT----TG-A---G---------A---------T-----------AGG-T-AATA---TATTC-CAATA