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Reference ( gi|67293 )        :                          AATTAACCATCT---G--A--TTTT------TT--TTT-T-CA-T-TTT-AGT--G-C-AA--TT-TG--TCAGA-GATA--T--G--AC-TTTT-AA----CA-T-T-AT--A------C--A-G--T----G-T-A-TT--GTTT-G-----T--A-TA--GTA-CCAA----A-TT-C--TG-A-CGTG-C-T-C-CGT--GA--C--CC-CA--TT--TT---CAC--AG-TT-T-T-A-----------AA--TCT--G---AAA-TA-A-C-T-T-TTAG-AT-A-T-------A-T-CGGAA-T--A-TAT-T-----G----GA-----AA--TT--TTT-------AA-TT-AGA--TTT--AG--TT---G--G-A-TT-TAT---GG-T-T-AAAA--C---AT-A-TC--T-A-C-C-A---AATT-TG-G-T-----T--AT--A-A-T----------A-T-GACG----T---T--AAATAAAA-TA-GT-T-----A-T-GA-CAA-------AA-A--TCTA--CGTA-TTTTTTGAA----CGG-C--CCTCGTA
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gi|67288                      :      aaatggggtaaaaatatttgatTTAAGCATCT---ATTA--TTTT------TT--TTT-T-CA-T-TTT-AGT--G-C-AA--TT-TG--TC
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Reference ( family-479 )      :                                          AATTAAGCATC----T---G--A--TTTT------TT--TTT-T-CGT--TTT-AGT--G-C-AA--TT-TG--TCAGA-GATA--T--G----ACTTT-A-AA---C-A-T-T-AT--A------C--A-G--T----G-T-A-TT--GTTT-G-----T--A-TA--GTA-CCAA----A-TT-C--CG-A-CGT-GC-T-C-CGT--GA--C--CC-CA--TT--TT---CAC--AG-TT-T-T-A-----------AA--TCT--G---AAA-TA-A-C-T-T-TTAG-A-TA-T-------A-T-CGGAA-T--A-TAT-T-----G----GA-----AG--T--T--TTT------AA---TT--AAAATT---AG--TT---G--G-A-TT-TAT---GG-T-T-AAAA--C---AT-ATC--T-A-C-C-A---AATTTG-G-T-----T--A-T--A-A--T----------A-T-GACG----T---T--AAATAAAA-TA-GT-T-----A-T-GA-C--AA-------AA-GTCTA--CGTA-TTTTTTGAA----CGG-C--CCTCGTA
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Reference ( family-479 )      :                                          AATTAAGCATC----T---G--A--TTTT------TT--TTT-T-CGT--TTT-AGT--G-C-AA--TT-TG--TCAGA-GATA--T--G----ACTTT-A-AA---C-A-T-T-AT--A------C--A-G--T----G-T-A-TT--GTTT-G-----T--A-TA--GTA-CCAA----A-TT-C--CG-A-CGT-GC-T-C-CGT--GA--C--CC-CA--TT--TT---CAC--AG-TT-T-T-A-----------AA--TCT--G---AAA-TA-A-C-T-T-TTAG-A-TA-T-------A-T-CGGAA-T--A-TAT-T-----G----GA-----AG--T--T--TTT------AA---TT--AAAATT---AG--TT---G--G-A-TT-TAT---GG-T-T-AAAA--C---AT-ATC--T-A-C-C-A---AATTTG-G-T-----T--A-T--A-A--T----------A-T-GACG----T---T--AAATAAAA-TA-GT-T-----A-T-GA-C--AA-------AA-GTCTA--CGTA-TTTTTTGAA----CGG-C--CCTCGTA
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blockSeqs                     :                                                     G    ATT    G     .       .    AT    G    .   .  G .  .   .  .      .    AG .  G        . .  A   . A . .  T  TTA       . .  T    . . C  C     T .     .  .  AA   A    GA   A  . .   G .   .  T . .   G   .  .   .  T   .   .     TT  T  . . . .            TT   .  TAT   .  . . T . .    T .  G A       T C     . G  .   C G     A     .     GTT .  G    A       AC   A       CTG  .   .   AT . .  .   .    . . A    TTC     G   A  A T . . .        . . G     .  . .  . G  .          . .    .    A   A         .  G  . TACG  . .  . A   .        .     .     .         .      . . 
blockSeqs                     :                                                     .    AG     .     .       .    T     .    .   .  A .  .   .  .      .    .  .  .        . .  A   . . . .  .  TC        . .  .    . . .  .     T .     .  .  T    .    .    A  . .   . .   .  . . .   .   .  .   .  .   .   .     .   T  . . . .            A    .  .     .  . . . . .    . .  . .       . A     . .  .   . .     .     .     GT  .  G    A       .    T       .    .   .   .  . .  .   .    . . .    CA      .   .  G . . . .        . . .     .  . .  . A  .          . .    .    .   A         .  .  . .     . .  . .   .        .     .     .         .      . . 
blockSeqs                     :                                                     .    G      .     .       .    T     .    .   .  . .  .   .  .      .    .  .  .        . .  .   . . . .  .  C         . .  .    . . .  .     . .     .  .  .    .    .    G  . .   . .   .  . . .   .   .  .   .  .   .   .     .   .  . . . .            .    .  .     .  . . . . .    . .  . .       . .     . .  .   . .     .     .     A   .  .    .       .    .       .    .   .   .  . .  .   .    . . .    AC      .   .  . . . . .        . . .     .  . .  . C  .          . .    .    .   .         .  .  . .     . .  . .   .        .     .     .         .      . . 
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blockSeqs                     :                                                     .    A      .     .       .    T     .    .   .  . .  .   .  .      .    .  .  .        . .  .   . . . .  .  C         . .  .    . . .  .     . .     .  .  .    .    .    .  . .   . .   .  . . .   .   .  .   .  .   .   .     .   .  . . . .            .    .  .     .  . . . . .    . .  . .       . .     . .  .   . .     .     .     G   .  .    .       .    .       .    .   .   .  . .  .   .    . . .    C       .   .  . . . . .        . . .     .  . .  . .  .          . .    .    .   .         .  .  . .     . .  . .   .        .     .     .         .      . . 
blockSeqs                     :                                                     .    G      .     .       .    T     .    .   .  . .  .   .  .      .    .  .  .        . .  .   . . . .  .  T         . .  .    . . .  .     . .     .  .  .    .    .    .  . .   . .   .  . . .   .   .  .   .  .   .   .     .   .  . . . .            .    .  .     .  . . . . .    . .  . .       . .     . .  .   . .     .     .     T   .  .    .       .    .       .    .   .   .  . .  .   .    . . .    C       .   .  . . . . .        . . .     .  . .  . .  .          . .    .    .   .         .  .  . .     . .  . .   .        .     .     .         .      . . 
blockSeqs                     :                                                     .    T      .     .       .    T     .    .   .  . .  .   .  .      .    .  .  .        . .  .   . . . .  .  T         . .  .    . . .  .     . .     .  .  .    .    .    .  . .   . .   .  . . .   .   .  .   .  .   .   .     .   .  . . . .            .    .  .     .  . . . . .    . .  . .       . .     . .  .   . .     .     .     A   .  .    .       .    .       .    .   .   .  . .  .   .    . . .    C       .   .  . . . . .        . . .     .  . .  . .  .          . .    .    .   .         .  .  . .     . .  . .   .        .     .     .         .      . . 
blockSeqs                     :                                                     .    G      .     .       .    T     .    .   .  . .  .   .  .      .    .  .  .        . .  .   . . . .  .  T         . .  .    . . .  .     . .     .  .  .    .    .    .  . .   . .   .  . . .   .   .  .   .  .   .   .     .   .  . . . .            .    .  .     .  . . . . .    . .  . .       . .     . .  .   . .     .     .     G   .  .    .       .    .       .    .   .   .  . .  .   .    . . .    C       .   .  . . . . .        . . .     .  . .  . .  .          . .    .    .   .         .  .  . .     . .  . .   .        .     .     .         .      . . 
blockSeqs                     :                                                     .    G      .     .       .    T     .    .   .  . .  .   .  .      .    .  .  .        . .  .   . . . .  .  T         . .  .    . . .  .     . .     .  .  .    .    .    .  . .   . .   .  . . .   .   .  .   .  .   .   .     .   .  . . . .            .    .  .     .  . . . . .    . .  . .       . .     . .  .   . .     .     .     T   .  .    .       .    .       .    .   .   .  . .  .   .    . . .    C       .   .  . . . . .        . . .     .  . .  . .  .          . .    .    .   .         .  .  . .     . .  . .   .        .     .     .         .      . . 
blockSeqs                     :                                                     .    T      .     .       .    T     .    .   .  . .  .   .  .      .    .  .  .        . .  .   . . . .  .  C         . .  .    . . .  .     . .     .  .  .    .    .    .  . .   . .   .  . . .   .   .  .   .  .   .   .     .   .  . . . .            .    .  .     .  . . . . .    . .  . .       . .     . .  .   . .     .     .     T   .  .    .       .    .       .    .   .   .  . .  .   .    . . .    C       .   .  . . . . .        . . .     .  . .  . .  .          . .    .    .   .         .  .  . .     . .  . .   .        .     .     .         .      . . 
blockSeqs                     :                                                     .    G      .     .       .    T     .    .   .  . .  .   .  .      .    .  .  .        . .  .   . . . .  .  C         . .  .    . . .  .     . .     .  .  .    .    .    .  . .   . .   .  . . .   .   .  .   .  .   .   .     .   .  . . . .            .    .  .     .  . . . . .    . .  . .       . .     . .  .   . .     .     .     G   .  .    .       .    .       .    .   .   .  . .  .   .    . . .    G       .   .  . . . . .        . . .     .  . .  . .  .          . .    .    .   .         .  .  . .     . .  . .   .        .     .     .         .      . . 
blockSeqs                     :                                                     .    G      .     .       .    .     .    .   .  . .  .   .  .      .    .  .  .        . .  .   . . . .  .  T         . .  .    . . .  .     . .     .  .  .    .    .    .  . .   . .   .  . . .   .   .  .   .  .   .   .     .   .  . . . .            .    .  .     .  . . . . .    . .  . .       . .     . .  .   . .     .     .     T   .  .    .       .    .       .    .   .   .  . .  .   .    . . .    T       .   .  . . . . .        . . .     .  . .  . .  .          . .    .    .   .         .  .  . .     . .  . .   .        .     .     .         .      . . 
blockSeqs                     :                                                     .    A      .     .       .    .     .    .   .  . .  .   .  .      .    .  .  .        . .  .   . . . .  .  T         . .  .    . . .  .     . .     .  .  .    .    .    .  . .   . .   .  . . .   .   .  .   .  .   .   .     .   .  . . . .            .    .  .     .  . . . . .    . .  . .       . .     . .  .   . .     .     .     A   .  .    .       .    .       .    .   .   .  . .  .   .    . . .    C       .   .  . . . . .        . . .     .  . .  . .  .          . .    .    .   .         .  .  . .     . .  . .   .        .     .     .         .      . . 
blockSeqs                     :                                                     .    .      .     .       .    .     .    .   .  . .  .   .  .      .    .  .  .        . .  .   . . . .  .  C         . .  .    . . .  .     . .     .  .  .    .    .    .  . .   . .   .  . . .   .   .  .   .  .   .   .     .   .  . . . .            .    .  .     .  . . . . .    . .  . .       . .     . .  .   . .     .     .     G   .  .    .       .    .       .    .   .   .  . .  .   .    . . .    C       .   .  . . . . .        . . .     .  . .  . .  .          . .    .    .   .         .  .  . .     . .  . .   .        .     .     .         .      . . 
blockSeqs                     :                                                     .    .      .     .       .    .     .    .   .  . .  .   .  .      .    .  .  .        . .  .   . . . .  .  C         . .  .    . . .  .     . .     .  .  .    .    .    .  . .   . .   .  . . .   .   .  .   .  .   .   .     .   .  . . . .            .    .  .     .  . . . . .    . .  . .       . .     . .  .   . .     .     .     A   .  .    .       .    .       .    .   .   .  . .  .   .    . . .    C       .   .  . . . . .        . . .     .  . .  . .  .          . .    .    .   .         .  .  . .     . .  . .   .        .     .     .         .      . . 
blockSeqs                     :                                                     .    .      .     .       .    .     .    .   .  . .  .   .  .      .    .  .  .        . .  .   . . . .  .  T         . .  .    . . .  .     . .     .  .  .    .    .    .  . .   . .   .  . . .   .   .  .   .  .   .   .     .   .  . . . .            .    .  .     .  . . . . .    . .  . .       . .     . .  .   . .     .     .     T   .  .    .       .    .       .    .   .   .  . .  .   .    . . .    C       .   .  . . . . .        . . .     .  . .  . .  .          . .    .    .   .         .  .  . .     . .  . .   .        .     .     .         .      . . 
blockSeqs                     :                                                     .    .      .     .       .    .     .    .   .  . .  .   .  .      .    .  .  .        . .  .   . . . .  .  C         . .  .    . . .  .     . .     .  .  .    .    .    .  . .   . .   .  . . .   .   .  .   .  .   .   .     .   .  . . . .            .    .  .     .  . . . . .    . .  . .       . .     . .  .   . .     .     .     G   .  .    .       .    .       .    .   .   .  . .  .   .    . . .    C       .   .  . . . . .        . . .     .  . .  . .  .          . .    .    .   .         .  .  . .     . .  . .   .        .     .     .         .      . . 
blockSeqs                     :                                                                 .     .       .    .     .    .   .  . .  .   .  .      .    .  .  .        . .  .   . . . .  .  C         . .  .    . . .  .     . .     .  .  .    .    .    .  . .   . .   .  . . .   .   .  .   .  .   .   .     .   .  . . . .            .    .  .     .  . . . . .    . .  . .       . .     . .  .   . .     .     .     G   .  .    .       .    .       .    .   .   .  . .  .   .    . . .    C       .   .  . . . . .        . . .     .  . .  . .  .          . .    .    .   .         .  .  . .     . .  . .   .        .     .     .         .          
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Reference ( family-479 )      :                                          AATTAAGCATC----T---G--A--TTTT------TT--TTT-T-CGT--TTT-AGT--G-C-AA--TT-TG--TCAGA-GATA--T--G----ACTTT-A-AA---C-A-T-T-AT--A------C--A-G--T----G-T-A-TT--GTTT-G-----T--A-TA--GTA-CCAA----A-TT-C--CG-A-CGT-GC-T-C-CGT--GA--C--CC-CA--TT--TT---CAC--AG-TT-T-T-A-----------AA--TCT--G---AAA-TA-A-C-T-T-TTAG-A-TA-T-------A-T-CGGAA-T--A-TAT-T-----G----GA-----AG--T--T--TTT------AA---TT--AAAATT---AG--TT---G--G-A-TT-TAT---GG-T-T-AAAA--C---AT-ATC--T-A-C-C-A---AATTTG-G-T-----T--A-T--A-A--T----------A-T-GACG----T---T--AAATAAAA-TA-GT-T-----A-T-GA-C--AA-------AA-GTCTA--CGTA-TTTTTTGAA----CGG-C--CCTCGTA
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gi|67307                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         G-G-T-----T--A-T--G-A--T----------A-T-GGCG----T---T--AAATAAAA-TA-GT-TAATAAA-T-GA-C--AA-------AA-GTCTA--CGTA-TTTTTTGA
gi|67308                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -----A-T-GA-C--AA-------AA-GTCTA--CGTA-TATTTTGAA----CGG-C--TCTCGTA