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lowQualScore                  :     .   .  . .. .    .. ..  ...   .  ......... .  ..  ....... .. ....... ..    .... ..  .. . . ....  ........ . ..   ... . . .....  ...... .  .. ...  ...... . ........ .......  .. . ...... .   .   ..........  .  . ... ..  ... .  . ... .. . ... .. ........ ... ... ........................ ....... . .   . ... . ......  ... ...  .. . ..    ..... .................  .. .. .. ..... ...... ......   . . ...  ..... ... .   ........  . . .. . .....   .      .    
lowQualScore                  :     1   9  3 77 7    99 11  777   0  888888888 5  22  0000000 22 0000000 55    2222 77  99 3 3 5555  77777777 3 11   444 2 2 66666  888888 2  99 555  777777 2 00000000 9999999  44 1 999999 0   0   2222222222  0  1 222 44  888 0  0 999 44 0 555 44 33333333 888 888 999999999999999999999999 6666666 0 0   0 888 1 111111  777 111  55 1 44    11111 66666666666666666  44 88 44 00000 999999 999999   0 0 888  66666 888 0   99999999  1 2 55 1 88888   2      7    
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Reference ( gi|34058 )        : TTGA-TTA-CA-G--C-CGAT--A--AA---TGG-AC--G-----CT-AT--TT-------C--C-------A-ATTCA---AC--AT--G-A-C----GA--------T-G--CGA---G-A-G-----AA--GA--G-AC--C---TT------G-AT-----C-G-------AG--T-T------G-CTG-CTAG---------AC-GG-T---A--GG---G-GT-C---T--A-A---T--T---A----T---A---AT-----G----A--T-AA-AT--TG--A----A-C-TTT-T-C-G-C------CG---A-A-AA--T-T--GCAA-----G--CT-----A-G-----GT--G--G--C-----T------G------GTA-A-A---TA-----A---G-AAAAC--C---AA-G-A--T-G-----GCG-GCGTGA-GATA
gi|34059                      : TTGA-TTA-CA-G--C-CGAT--A--AA---TGA-AC--G-----CT-AT--TT-------C--C-------A-ATTCA---GC--AT--G-A-C----GA--------T-G--CGA---G-A-G-----AA--GA--G-AC--C---TT------G-GT-----C-G-------AG--T-T------G-CTG-CTAG---------AC-GG-T---A--GG---G-GT-C---T--A-A---T--T---A----T---A---AT-----G----C--T-AA-AT--TG--A----A-C-TTT-T-C-G-C------CG---A-A-AA--T-T--GCAA-----G--TT-----A-G-----GT--G--G--C-----T------G------GTA-A-A---TA-----A---G-AAAAC--C---AA-G-A--T-G-----GCG-GCGTGA-GATA
gi|34060                      : TTGA-TTA-CA-G--C-CGAT--A--AA---TGG-AC--G-----CT-AT--TT-------C--C-------A-GTTCA---AC--AT--G-A-C----GA--------T-G--CGA---G-A-G-----AA--GA--G-AC--C---TT------G-AT-----A-G-------AG--T-T------T-CTT-CTGG---------AC-GG-T---A--GG---G-GT-C---T--A-A---T--T---A----T---A---AA-----G----T--T-AA-AT--CG--A----A-C-TTT-T-T-G-C------CG---A-A-AA--T-T--GCAA-----G--CT-----A-G-----GT--G--G--C-----T------G------ATA-A-A---TA-----A---G-AAAAC--C---AA-G-A--T-G-----GCG-GTGTGA-GATA
gi|34061                      : TTGA-TCA-TA-G--C-CGAT--A--AA---TGG-AC--T-----TT-AT--TT-------C--C-------A-GTTCA---CC--AT--T-A-C----AA--------T-G--CGA---G-A-G-----AA--GA--C-AC--C---TT------G-A------C-A-------TA--T-T--------CTG-CTAG---------AC-GG-T---A--GG---G-TT-A---T--A-A---T--T---C----T---A---GT-----A----A--T-AA-AT--CG--A----A-C-TTT-C-C-G-C------CG---A-A-AA--T-T--GCAA-----G--TG-----A-T-----GT--G--A--C-----T------GGTAGATGTA-A-A---TA-----A---G-AAAAC--C---AA-A-A--T-G-----GCA-GCATGA-TAT
gi|34062                      : TTAA-TTA-CA-G--C-CGAT--A--AA---TGG-AC--T-----CTTAT--TT-------C--C-------A-GTTAA---CC--AT--G-A-C----GA--------T-G--CGA---G-G-A-----AA--G---G-AC--C---TT------G-ACA----C-A-------GG--C-T------G-CTG-CTA----------AC-AG-T---A--GG---G-GT-C---T--A-A---T--T---C----T---A---AG-----A----A--T-GA-AT--GG--G----A-C-TTT-T-TTG-C------CG---A-C-AA--T-T--GCAA-----G--TG-----A-T-----GT--G--G--C-----T------G------GTA-A-A---TA-----A---G-GAATT--C---AA-G-A--A-G-----GCG-GCGTTC-GATA
gi|34064                      : TTGA-TTA-CATG--C-CGAT--A--AA---TGG-AC--T-----TT-AT--TT-------CG-C-------A-GTTCA---GCC-AT--G-A-C----GA--------T-GT-CGA---G-A-GG----AA--GG--G-AC--C---T-------G-AC-----A-G-------AG--C-T------GGCTG-CTAA---------AC-G--T---A--GG---G-GT-T---C--A-AAT-T--T---C----T---A---AG-----G----AA-T-TA-ATG-TG--A----C-T-TTT-T-T-G-C------CG---A-ACAA--T-T--GCAA-----G--TG-----A-TT----GT--G--G--C-----T------G------GTA-A-A---TA-----A---G-GAATT--C---AA-G-A--TGG-----GCG-GCGTGA-GATA
gi|34065                      : TTGAATTA-CAAG--C-CGAT--A--AA---TGG-AC--T-----TT-AT--TT-------C--C-------A-GTTCA---CC--AT--GAA-C----GA--------T-G--CGAC--G-A-G-----AA--GG--G-AT--CAT-TT------G-AC-----A-G-------AGCTT-C------G-CTG-CTAA---------AC-GA-----A--GG---G-GT-C---A--A-A---T--T---C----T---A---AG-----A----G--T-TA-ATG-TG-------A-C-TTTGTAT-G-C------CG---ACA-AA--T-T--GCAA-----G---T-----G-GAT---GT--G--GGCC-----T------G------GTA-A-A---TA-----G---G-AATTC--C---AAGG-A--T-G-----GCG-GCGTGA-GATA
gi|34066                      : TTAA-TTA-CA-G--C-CGGT--A--AA---TGG-AC--T-----TT-AT--TT-------C--C-------A-GTTCA---CC--AT--G-A-C----GA--------T-G--CGT---G-A-G-----AA--GG--G-AC--G---TT------G-AC-----A-G-------AG--C-T------G-ATG-CTAA---------AC-GG-T---A--AG---C-GT-G---T--A-A---A--G---G----C---A---AA-----G----A--T-AA-----CG--A----A-C-
gi|34067                      : TTGT-TTA-CC-G--C-CGAT--A--AA---TGG-AC--T-----AT-AT--TT-------C--C-------A-GTTCA---CC--AT--G-A-C----GA--------T-G--CGA---G-A-G-----AA--G-----------------------------------------G--C-T------G-CTG-CTAT---------AT-GG-T---A--GG---G-AT-C---T--A-A---T--T---C----T---A---AT-----A----A--T-TA-A
gi|34063                      : TTGA-TTA-C--G--C-CGAT--AGAAA---TGG-AC--T-----CT-AT--TT-------C--C-------A-ATTCA---AC--AT--G-A-C----AA--------T-G--C-A---G-A-G-----A----A--G-AC--TAG-TG------G-AT-----C-GTT-----AG--TGT------G-CTC-CTAGTTCTTAAGTAC--G-T---A--GG---G-GT-C---T--ATATTTT--T---A----T---AT--TT-----GACCTA--T-AA-TT--TGTAA----A-C-TTT-T-
gi|34068                      :  TGA-TTT-CA-G--C-CGAT--A--A-------------------------------------C-------A-GTTCA---CC--A---G-A-C----GT--------T-G--CAA---G-A-A-----AT--AA--G-TC--T---TT------A-AC-----A-G-------AG--T-T------G-CT--CTAA---------AC-GA-T---A--GG---G-AC-T---T--A-A---T--T---A----T---A---ATT----G----A-----A-AT--CG--A----A-C-TTT-TTC-G-C------CG---A-A-AA--T-T--GAAA-----G--CA-----A-T-----GC--A--G--C------------G------GTC-A-A---TA-----A---G-GAATA--A---AA-G-A--G-G-----ATG-GCGTGA-TAT
gi|34069                      :   GA-TTAGCA-GGAC-CGATT-A--AA---TGGCACCAG-----CT-AT--CTTCCCCACC--C-------ACATTAA---AC--AT--G-A-CCA--GA--------T-G--CGA---G-A-GC----AA--GACAG-AC--C---TTCT----G-AT-----CCG-------AG--T-TCACGCAG-CTG-CTA----------AC-GG-T---A--GG---G-GT-C---T--A-A---T--T---A----T---A---AT----------A--T-AA-AA--TG--A----A-C-TTT-T-T-G-C------CG---A-A-AA--A-T--GCAA-----A--CT-----A-G-----GT--G--A--C-----T------G------GTT-A-A---TA-----A---G-AAAAC--C---AA-G-A--T-G-----GCG-GCG-GA-GATA
gi|34070                      :   GA-TTA-CA-G--C-CGATGAA--GA---TGG--C--T-----AT-AT--TT-------C--C-------A-AATCA---ACCAAT--G-ATC----GA--------T-G---GA---G-A-G-----AA--AAG-G-ACA-C---TT------G-A------C-A-------AG--C-A------G-CTG-CTAA---------AC-GG-T---A---T---G-GT-CATAT--A-A---T--T---C----T---A---AG-----T----A--T-TA-AG--TG-------A-C-TTT-T-T-G-CG-----CG---A-C-AT--T-TGAGTAA-----G--TG-----ATG-----GT--GA-G--C-----T-------------GTA-A-A---TGTCTATA---G-AATTC--T---AA-G-A--A-G-----GCG-GCGTGAGGATA
gi|34071                      :     -TCA-CA-G--TTCAAT--A--AA---TGG-AC--T-----TT-AT--TT-------C--C-------A-GTTCA---CC--AT--T-A-C----GA--------T-G--CAA---G-A-G-----AA--GG--G-AC--C---TT------G-AC-----A-G-------AG--C-T------G-CTG-CTAA---------AC-GG-T---A--GG---G-GA-C---T--C-A---T--T---C----T---A---AA-----A----A--T-TA-AT--AG--G----A-C-TTT-T---G-C------CG---A-C-AA--T-T--TCAA-----G--T--------G-----GT--GTTG--C-----T------G------GAA-A-A---TA-----A---G-AAATT--C---AA-G-A--T-G-----GCG-GCGTGA-
gi|34072                      :         -CA-G--C-CGAT--A--AA---TAG-AC--G-----CT-AT--TT-------C--C-------A-GTTCA---TC--AT--G-A-C----GA--------T-G--TGA---G-A-G-----AG--GA--G-AC--C---TG------G-AT-----C-G-------AG--T-T------G-CTG-CTAG---------AC-GG-T---A--GG---G-GT-C---T--A-A---T--T---A----T---A---AT-----G----A--T-AA-AT--TG--A----A-C-TTT-T-C-G-C------CG---A-A-AA--T-T--GCAA-----G--CT-----A-G-----GT--G--G--C-----T------G------GTA-A-A---TT-----A---G-AAAAC--C---AA-G-A--T-G-----GCG-GCGTGA-GATA
gi|34073                      :           A-G--C-CGATT-A--AG---TGG-AC--T-----TT-ATG-TT-------C--C-------A-GTTCA---CC--AG--G-A-C----GA--------T-G--C-A---G-A-G-----AA--AG--G-ACTTC---TT------GGAC-----A-G-------AG--TCT------G-CTG--TAA---------AC-GG-T---AA-GG---G-GT-C---A--A-A---T--T---C----T---A---A------G----AATT-TA-AT--T---A----A-C-TTT-T---G-C------CG---A-C-AA--T----GCAA-----G--TG-----A-T-----GT--G--G--C-----T------G------GTA-A-A---TA-----A---G--GAGT--C---AA-G-A--T-G-----GCGTGCGTGA-GATA
gi|34074                      :                   GAT--A--A----TTG-AC--GGTTAATT-AT--TT-------C--C-------A-GTTCG---CC--AT--G-A-C----GA--------T-A--CGA---G-A-G-----AA--GA--T-AC--C---TT------G-AC-----A-G-------AG--T-T------G-CTG-CTAA---------AC-GG-T---A--CG---G-GT-C---T--A-A---T--T---C----C---A---AG-----A----A--T-TA-TT--AG--G----A-C-TTT-T-T-G-C------CG---A-A-AA--T-T--GCAA-----G--TG-----A-T-----GT--G--A--C-----T------G------GTA-A-A---TA-----A---G-GAATT--C---AA-A-G--G-G-----GTG-GCGTGG-GATA
gi|34075                      :                     T--A--AAATCTGG-AA--A-----TT-AT--TT-------CTCC-------A-GTTTA---TC--A---G-A-C----GA--------T-G--CAACAAG-A-A-----AG--GA--GCAC--T---TA------G-A------C-G-------AA--G-T------G-CT--CTAG---------AT-GG-T---A--GGT--G-GT-C---T--A-A---T--T---C----T---A---AT-----G----G--A-AG-AC--AG--G----A-C--TT-T-C-G-C-----------G-A-AT--T-T--GCAATG---G--TTG----A-T-----GT--G--A--CTGACAT------G------GTA-GCA---TA-----A---G-GAAAC--CA--AA-G-A--T-G-----G-G-GCG
gi|34076                      :                         --AG---TAG-AC--G-----AT-ATG-TT-------CA-T-------A-GTTCA---CT--AT--G-A-C----GA--------T-G--CGA---G-A-G-----AA--GG--G-AC--C---TT------G-AC-----A-G-------AG--C-T------G-CTT-CTAA---------AC-GG-T---A--AG---A-CT-C------A-A---T--T---C----T---A------------------T-GA-AT--TG--ATACGA-C-TTT-T-T-G-C------CG---C-C-AA--T-T--GCAA-----G--TG-----A-T-----GT--G--G--C-----T------G------GAA-G-A---TA-----A---G-GAATT--C---AA-G-A--T-T-----GCG-GCGTGA-GATA
gi|34077                      :                             ---TGG-AC--T-----TTTAT--TT-------C--C-------A-GTTTA---CC--AT--G-A-C-----A--------T-T--CAA---A-A-GTTAGTAA--GA--G-AC--C---TT------A-AC-----A-G-------AG--T-T------G-CTA-CT-G---------AC-GG-T---A--GG---G-GT-CAA-T--A-A---T--CCCGC----T---A---AT-----A----A--T-AA-AT--AG--G----A-C-TTT-T-----C------CG-----A-AA--T-T--GCAA-----ATCCG-----A-T-----GT--G--T--C-----TAGAATCG------GCA-A-A---TA-----A---G-AAAA
gi|34078                      :                                   -AC--G-----CT-ATGTTT-------C--CCCATAAAA-ATTCA---AC--ATTTG-A-CTCAGGA--------T-GAGCGA---C-A-G-----AAA-GC--G-AC--CAAACT------G-ATATTCGC-G-------AG--T-T------G-C-G-CTAGCT-------AC-TG-TGTCA--GGCTTG-GT-C---TC-A-A---TAGG---A----T---A---AT-----G----A--T-AA-AT--CC--G----A-CATTT-T-C-G-C------CGTACG-A-AA--C-T--GCAA-----A--CTGGCTAA-G-----GT--G--G--C-----T------G------GTA-A-T---AA-----A---GAAAAAA--C---AA-GCAGTC-G-----GCG-GCGTGA-
gi|34079                      :                                               T-AT--TT-------C--C-------A-GTTCA---CC--CT--G-A-C----AA--------T-G--TAA---G-A-G-----AT--AT--G-AC--C---TT------G-AC-----A-A-------AG--T-T------G-TTG-CTAG---------AC-AA-T---A--GT---A-GT-C---C--A-A---T--T---A----T---G---AC-----C----A--T-AA-AT--CA--A----A-CTTTT-T-C-A-A------TG---A-A-A----------AA-----G--CA-----A-T-----GC--A--G--C-----T------G------GTC-A-A---TG-----T---C-AAAA---C---AA-A-A--T-G-----GTG---GTGA-GATA
gi|34080                      :                                                -AT--TT-------C------------GTTTA---CC--AT--G-A-C----GA--------C-G--CGA---A-A-A-----A-------------C---TTAA----G-AT-----T-G-------A---T-T------G-CTG-CTAG---------AA-AG-T---A--GG---G-GTAC---T--A-A---T--T---C----T---AAGTAT-----T----A--T-AG-A----G--G----A-C--TT-T-C-G-C------CG-----A-AA--T-T--GCAA-----G--TG-----ATT-----GT--G--G--C-----T------G------GTA-A-A---TT-----A---A-AAG--------AA-G-A--T-G-----GTG-
gi|34081                      :                                                -AT--TT-------C--C-------A-GTGCA---CA--AT--G-A-C----GA--------T-G--CGA---G-A-G-----AT--AA--G-AC--C---TTAA----G-AT---------------AG--T-T------A-CTG-CTGA---------AC-
gi|34082                      :                                                   --TT-------C--C-------A-GTGTA---TA--AT--G---C----GA--------T-G--CAA---A-A-G-----AAA-GA--G-AC--C---TT------A-AC-----A-G-------AG--T-G------G-CTG-CTAG---------AT-GG-T---A--GT---G-GT-C---T--A-AT--T--T---C----T---A---AT----------A--TGAA-AG--AG--G----A-C-TTT-T-C-G-C------TG---A-A-AAATT-T--GCAA-----G--GTG----A-T-----GT--G--A--CTGACAT------G------GTA-C-AT--TA-----A---G-GAAAC--A---AA-G-A--T-G-----GGG-GCGTGtttttgcagaaatttgcttgcggtgcagctgttagaataaaacccaagatgacagcgtgatata
gi|34083                      :                                                   --TT-------C--C-------A-ACCCATCGACC-AT--G-A-C----GAGGCTTGGAT-G--CGG---G-AAG-----AA--G---G-AC--C---TT------G-A------C-GAGAGAGCAG--C-T--------CTG-CTAA---------AC-GGTT---A--GG---G-GT-C---A--A-A---T--T---C----TAAAA---AG-----A----A--T-TA-ATG-TG--A----C-C-TTT-T-T-G-C------CGGACA-A-GA--TGT--GTAA-----G---T-----A--------T--T--G--CG----T------G------GTA-A-AAGTTA-----G---G-AA
gi|34084                      :                                                   --TT-------C--C-------C-ACACA---A---AT--G-A-G----GA--------TTG--CGA---GGA-G-----AAAGGT--G-AC--C---T-------G-AC---------------AG--C-T--------CTGTCTAA---------AC-G--T---A--GG---G--T-C---T--A-AAT-T--C---AAAACT---A---ATTAGAAG----A--T-TATATGCTG--A----CTC-TTT-T-T-G-CTTCACACG---ACA-AA--T-T--GTAA-----AGTTT-----G-G-----GT--G--G--C-----T------G------GTA-A-AG--TA-----A---G-GGAAT--TCAAAA-G-A--T-GGGGACGCA-GCGTGA-AA
gi|34085                      :                                                                            TTTA---CC--AT--G-G-C----GA--------T-C--TGA---G-A-A-----AA--GG--G-AC--C---TT------A-AC-----A-G-------AG--T-T------G-TT---------------------T------GG---A-GT-T---T--A-A---T--T---C----T---A---AT-----T----A--T-AA-AT--AG--G----A-T-TTC-T-T-G-C------TG---A-A-AA--A-T--GCA------G--T--------G-----GTCTG--G--C-----T------T------GTA-A-A---TA-----A---G-GAAAT--A---AA-T-A--T-G-----GCG-GCGTGA-GATA
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lowQualScore                  :              9   7  0 44 5    99 11  777   1  6666 5  3  4444444 44  6    5 5 4 3   3 3 77  55555555 2 2   333 2 2 55555 6666 7777777777 2  88 999 66 55 1 1 888 66666  6666 44 888 999999 44   0   8888888888    0 111 0  888 0 44 0 888 33 0 33 33 777777777 777 777 7777777777 44 555 0 9999  1111 0 0   0 66 0 000000  666 1 0  44 0 44    222222222 88888888  0 888   0 44 00000 999999 999999   0 0 888  55555 888 0   00000000  1 1 44 1 77777   1      6    
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Reference ( family-473 )      :          TTGA-TTA-CA-G--C-CGAT--A--AA---TGG-ACT--CT-AT-TT-------C--CA-GTTC-A-C-C-ATG-A-C--GA--------T-G-CGA---G-A-G-----A----A--GA------G-AC--C---T--T--G-A-C---A-----GA----G--T---T------G--CTG-CTAG---------ACGG-T---A-GG---G-G--T-C---T--A-A--T--T---C-----T---A---A-T-----G--A--T-A-A-AT--CGA----A-C-TTT-T-CG-C------CG---A-A-AA--T-T--GCAA---------G--C-----GA-T---GTG-G--C-----T------G------GTA-A-A---TA-----A---G-AAAAC--C---AA-G-A--T-G-----GCG-GCGTGA-GATA
gi|34058                      :          TTGA-TTA-CA-G--C-CGAT--A--AA---TGG-ACG--CT-AT-TT-------C--CA-ATTC-A-A-C-ATG-A-C--GA--------T-G-CGA---G-A-G-----A----A--GA------G-AC--C---T--T--G-A-T---C-----GA----G--T---T------G--CTG-CTAG---------ACGG-T---A-GG---G-G--T-C---T--A-A--T--T---A-----T---A---A-T-----G--A--T-A-A-AT--TGA----A-C-TTT-T-CG-C------CG---A-A-AA--T-T--GCAA---------G--C-----TA-G---GTG-G--C-----T------G------GTA-A-A---TA-----A---G-AAAAC--C---AA-G-A--T-G-----GCG-GCGTGA-GATA
gi|34059                      :          TTGA-TTA-CA-G--C-CGAT--A--AA---TGA-ACG--CT-AT-TT-------C--CA-ATTC-A-G-C-ATG-A-C--GA--------T-G-CGA---G-A-G-----A----A--GA------G-AC--C---T--T--G-G-T---C-----GA----G--T---T------G--CTG-CTAG---------ACGG-T---A-GG---G-G--T-C---T--A-A--T--T---A-----T---A---A-T-----G--C--T-A-A-AT--TGA----A-C-TTT-T-CG-C------CG---A-A-AA--T-T--GCAA---------G--T-----TA-G---GTG-G--C-----T------G------GTA-A-A---TA-----A---G-AAAAC--C---AA-G-A--T-G-----GCG-GCGTGA-GATA
gi|34060                      :          TTGA-TTA-CA-G--C-CGAT--A--AA---TGG-ACG--CT-AT-TT-------C--CA-GTTC-A-A-C-ATG-A-C--GA--------T-G-CGA---G-A-G-----A----A--GA------G-AC--C---T--T--G-A-T---A-----GA----G--T---T------T--CTT-CTGG---------ACGG-T---A-GG---G-G--T-C---T--A-A--T--T---A-----T---A---A-A-----G--T--T-A-A-AT--CGA----A-C-TTT-T-TG-C------CG---A-A-AA--T-T--GCAA---------G--C-----TA-G---GTG-G--C-----T------G------ATA-A-A---TA-----A---G-AAAAC--C---AA-G-A--T-G-----GCG-GTGTGA-GATA
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gi|34062                      :          TTAA-TTA-CA-G--C-CGAT--A--AA---TGG-ACT--CTTAT-TT-------C--CA-GTTA-A-C-C-ATG-A-C--GA--------T-G-CGA---G---G-----A----A--AG------G-AC--C---T--T--G-A-C---A-----CAG---G--C---T------G--CTG-CTA----------ACAG-T---A-GG---G-G--T-C---T--A-A--T--T---C-----T---A---A-G-----A--A--T-G-A-AT--GGG----A-CTTTT-T-TG-C------CG---A-C-AA--T-T--GCAA---------G--T-----GA-T---GTG-G--C-----T------G------GTA-A-A---TA-----A---G-GAATT--C---AA-G-A--A-G-----GCG-GCGTTC-GATA
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gi|34064                      :          TTGA-TTA-CATG--C-CGAT--A--AA---TGG-ACT--TT-AT-TT-------CG-CA-GTTC-AGC-C-ATG-A-C--GA--------T-GTCGA---G-A-GG----A----A--GG------G-AC--C---T-----G-A-C---A-----GA----G--C---T------GG-CTG-CTAA---------ACG--T---A-GG---G-G--T-T---C--A-AATT--T---C-----T---A---A-G-----G--AA-T-T-A-ATG-TGA----C-T-TTT-T-TG-C------CG---A-ACAA--T-T--GCAA---------G--T-----GA-TT--GTG-G--C-----T------G------GTA-A-A---TA-----A---G-GAATT--C---AA-G-A--TGG-----GCG-GCGTGA-GATAatttgacctataatttgtaaactttt
gi|34065                      :          TTGAATTA-CAAG--C-CGAT--A--AA---TGG-ACT--TT-AT-TT-------C--CA-GTTC-A-C-C-ATGAA-C--GA--------T-G-CGAC--G-A-G-----A----A--GG------G-AT--CAT-T--T--G-A-C---A-----GA----GCTT---C------G--CTG-CTAA---------ACGA-----A-GG---G-G--T-C---A--A-A--T--T---C-----T---A---A-G-----A--G--T-T-A-AT--GTG----A-C-TTTGTATG-C------CG---ACA-AA--T-T--GCAA---------G--TG----GA-T---GTG-GGCC-----T------G------GTA-A-A---TA-----G---G-AATTC--C---AAGG-A--T-G-----GCG-GCGTGA-GATA
gi|34066                      :          TTAA-TTA-CA-G--C-CGGT--A--AA---TGG-ACT--TT-AT-TT-------C--CA-GTTC-A-C-C-ATG-A-C--GA--------T-G-CGT---G-A-G-----A----A--GG------G-AC--G---T--T--G-A-C---A-----GA----G--C---T------G--ATG-CTAA---------ACGG-T---A-AG---C-G--T-G---T--A-A--A--G---G-----C---A---A-A-----G--A--T-A-A-----CGA----A-C-
gi|34067                      :          TTGT-TTA-CC-G--C-CGAT--A--AA---TGG-ACT--AT-AT-TT-------C--CA-GTTC-A-C-C-ATG-A-C--GA--------T-G-CGA---G-A-G-----A----A--G-------------------------------------------G--C---T------G--CTG-CTAT---------ATGG-T---A-GG---G-A--T-C---T--A-A--T--T---C-----T---A---A-T-----A--A--T-T-A-A
gi|34068                      :           TGA-TTT-CA-G--C-CGAT--A--A-------------------------------CA-GTTC-A-C-C-A-G-A-C--GT--------T-G-CAA---G-A-A-----A----T--AA------G-TC--T---T--T--A-A-C---A-----GA----G--T---T------G--CT--CTAA---------ACGA-T---A-GG---G-A--C-T---T--A-A--T--T---A-----T---A---A-TT----G--A------A-AT--CGA----A-C-TTT-TTCG-C------CG---A-A-AA--T-T--GAAA---------G--C-----AA-T---GCA-G--C------------G------GTC-A-A---TA-----A---G-GAATA--A---AA-G-A--G-G-----ATG-GCGTGA-TAT
gi|34069                      :            GA-TTAGCA-GGAC-CGATT-A--AA---TGGCACCAGCT-AT-CTTCCCCACC--CACATTA-A-A-C-ATG-A-CCAGA--------T-G-CGA---G-A-GC----A----A--GACA----G-AC--C---T--TCTG-ATC---C-----GA----G--T---TCACGCAG--CTG-CTA----------ACGG-T---A-GG---G-G--T-C---T--A-A--T--T---A-----T---A---A-T--------A--T-A-A-AA--TGA----A-C-TTT-T-TG-C------CG---A-A-AA--A-T--GCAA---------A--C-----TA-G---GTG-A--C-----T------G------GTT-A-A---TA-----A---G-AAAAC--C---AA-G-A--T-G-----GCG-GCG-GA-GATA
gi|34070                      :            GA-TTA-CA-G--C-CGATGAA--GA---TGG--CT--AT-AT-TT-------C--CA-AATCAA-C-CAATG-ATC--GA--------T-G--GA---G-A-G-----A----A--AAG-----G-ACA-C---T--T--G-A-C---A------A----G--C---A------G--CTG-CTAA---------ACGG-T---A--T---G-G--T-CATAT--A-A--T--T---C-----T---A---AGT-----A--T--T-A-A-GT----G----A-C-TTT-T-TG-CG-----CG---A-C-AT--T-TGAGTAA---------G--T-----GA-TG--GTGAG--C-----T-------------GTA-A-A---TGTCTATA---G-AATTC--T---AA-G-A--A-G-----GCG-GCGTGAGGATA
gi|34071                      :              -TCA-CA-G--TTCAAT--A--AA---TGG-ACT--TT-AT-TT-------C--CA-GTTC-A-C-C-ATT-A-C--GA--------T-G-CAA---G-A-G-----A----A--GG------G-AC--C---T--T--G-A-C---A-----GA----G--C---T------G--CTG-CTAA---------ACGG-T---A-GG---G-G--A-C---T--C-A--T--T---C-----T---A---A-A-----A--A--T-T-A-AT--AGG----A-C-TTT-T--G-C------CG---A-C-AA--T-T--TCAA---------G--T-----GG-T---GTT-G--C-----T------G------GAA-A-A---TA-----A---G-AAATT--C---AA-G-A--T-G-----GCG-GCGTGA-
gi|34072                      :                  -CA-G--C-CGAT--A--AA---TAG-ACG--CT-AT-TT-------C--CA-GTTC-A-T-C-ATG-A-C--GA--------T-G-TGA---G-A-G-----A----G--GA------G-AC--C---T--G--G-A-T---C-----GA----G--T---T------G--CTG-CTAG---------ACGG-T---A-GG---G-G--T-C---T--A-A--T--T---A-----T---A---A-T-----G--A--T-A-A-AT--TGA----A-C-TTT-T-CG-C------CG---A-A-AA--T-T--GCAA---------G--C-----TA-G---GTG-G--C-----T------G------GTA-A-A---TT-----A---G-AAAAC--C---AA-G-A--T-G-----GCG-GCGTGA-GATA
gi|34073                      :                    A-G--C-CGATT-A--AG---TGG-ACT--TT-ATGTT-------C--CA-GTTC-A-C-C-AGG-A-C--GA--------T-G-C-A---G-A-G-----A----A--AG------G-ACTTC---T--T--GGA-C---A-----GA----G--TC--T------G--CTG--TAA---------ACGG-T---AAGG---G-G--T-C---A--A-A--T--T---C-----T---A---A-------G--AATT-T-A-AT--T-A----A-C-TTT-T--G-C------CG---A-C-AA--T----GCAA---------G--T-----GA-T---GTG-G--C-----T------G------GTA-A-A---TA-----A---G--GAGT--C---AA-G-A--T-G-----GCGTGCGTGA-GATA
gi|34074                      :                                                   T-AT-TT-------C--CA-GTTC-G-C-C-ATG-A-C--GA--------T-A-CGA---G-A-G-----A----A--GA------T-AC--C---T--T--G-A-C---A-----GA----G--T---T------G--CTG-CTAA---------ACGG-T---A-CG---G-G--T-C---T--A-A--T--T---C-----C---A---A-G-----A--A--T-T-A-TT--AGG----A-C-TTT-T-TG-C------CG---A-A-AA--T-T--GCAA---------G--T-----GA-T---GTG-A--C-----T------G------GTA-A-A---TA-----A---G-GAATT--C---AA-A-G--G-G-----GTG-GCGTGG-GATA
gi|34075                      :             gataattgacggttaatT--A--AAATCTGG-AAA--TT-AT-TT-------CTCCA-GTTT-A-T-C-A-G-A-C--GA--------T-G-CAACAAG-A-A-----A----G--GA------GCAC--T---T--A--G-A-C---G-----AA----G--T----------G--CT--CTAG---------ATGG-T---A-GGT--G-G--T-C---T--A-A--T--T---C-----T---A---A-T-----G--G--A-A-G-AC--AGG----A-C--TT-T-CG-C-----------G-A-AT--T-T--GCAAT--------GGTT-----GA-T---GTG-A--CTGACAT------G------GTA-GCA---TA-----A---G-GAAAC--CA--AA-G-A--T-G-----G-G-GCG
gi|34076                      :                                  --AG---TAG-ACG--AT-ATGTT-------CA-TA-GTTC-A-C-T-ATG-A-C--GA--------T-G-CGA---G-A-G-----A----A--GG------G-AC--C---T--T--G-A-C---A-----GA----G--C---T------G--CTT-CTAA---------ACGG-T---A-AG---A-C--T-C------A-A--T--T---C-----T------------------A--T-G-A-AT--TGATACGA-C-TTT-T-TG-C------CG---C-C-AA--T-T--GCAA---------G--T-----GA-T---GTG-G--C-----T------G------GAA-G-A---TA-----A---G-GAATT--C---AA-G-A--T-T-----GCG-GCGTGA-GATA
gi|34077                      :                                      ---TGG-ACT--TTTAT-TT-------C--CA-GTTT-A-C-C-ATG-A-C---A--------T-T-CAA---A-A-GTTAGTA----A--GA------G-AC--C---T--T--A-A-C---A-----GA----G--T---T------G--CTA-CT-G---------ACGG-T---A-GG---G-G--T-CAA-T--A-A--T--CCCGC-----T---A---A-T-----A--A--T-A-A-AT--AGG----A-C-TTT-T----C------CG-----A-AA--T-T--GCAA---------ATCC-----GA-T---GTG-T--C-----TAGAATCG------GCA-A-A---TA-----A---G-AAAA
gi|34078                      :                                                                  --CA-TTTG-A-CTC-AGG-A-T--GA----------G-CGA---C-A-G-----A----AA-GC------G-AC--CAAAC--T--G-A-T---ATTCGCGA----G--T---T------G--C-G-CTAGCT-------ACTG-TGTCA-GGCTTG-G--T-C---TC-A-A--TAGG---A-----T---A---A-T-----G--A--T-A-A-AT--CCG----A-CATTT-T-CG-C------CGTACG-A-AA--C-T--GCAA---------A--CTGGCTAA-G---GTG-G--C-----T------G------GTA-A-T---AA-----A---GAAAAAA--C---AA-GCAGTC-G-----GCG-GCGTGA-
gi|34079                      :                        acgctatgtttccccataaaaattcaaT-AT-TT-------C--CA-GTTC-A-C-C-CTG-A-C--AA--------T-G-TAA---G-A-G-----A----T--AT------G-AC--C---T--T--G-A-C---A-----AA----G--T---T------G--TTG-CTAG---------ACAA-T---A-GT---A-G--T-C---C--A-A--T--T---A-----T---G---A-C-----C--A--T-A-A-AT--CAA----A-CTTTT-T-CA-A------TG---A-A-A----------AA---------G--C-----AA-T---GCA-G--C-----T------G------GTC-A-A---TG-----T---C-AAAA---C---AA-A-A--T-G-----GTG---GTGA-GATA
gi|34080                      :                                                    -AT-TT-------C-----GTTT-A-C-C-ATG-A-C--GA--------C-G-CGA---A-A-A-----ACTTAA--GA----------------T--T--G-A--------------------T---T------G--CTG-CTAG---------AAAG-T---A-GG---G-G--TAC---T--A-A--T--T---C-----T---AAGTA-T-----T--A--T-A-G-A----GG----A-C--TT-T-CG-C------CG-----A-AA--T-T--GCAA---------G--T-----GATT---GTG-G--C-----T------G------GTA-A-A---TT-----A---A-AAG--------AA-G-A--T-G-----GTG-
gi|34081                      :                                                    -AT-TT-------C--CA-GTGC-A-C-A-ATG-A-C--GA--------T-G-CGA---G-A-G-----A----T--AA------G-AC--C---T--T--A-A-G---A-----TA----G--T---T------A--CTG-CTGA---------AC
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lowQualScore                  :              9   7  0 44 5    99 11  777   1  6666 5  3  4444444 44  6    5 5 4 3   3 3 77  55555555 2 2   333 2 2 55555 6666 7777777777 2  88 999 66 55 1 1 888 66666  6666 44 888 999999 44   0   8888888888    0 111 44  888 0  0 888 33 0 33 44 6666 888  3333 0  444444   33333333  0 2222  0 444 0 000000  666 1 0  44 0 44    222222222 88888888  0 888   0 44 00000 999999 999999   0 0 888  55555 888 0   00000000  1 1 44 1 77777   1      6    
consensus                     :          TTGA-TTA-CA-G--C-CGAT--A--AA---TGG-ACT--CT-AT-TT-------C--CA-GTTC-A-C-C-ATG-A-C--GA--------T-G-CGA---G-A-G-----A----A--GA------G-AC--C---T--T--G-A-C---A-----GA----G--T---T------G--CTG-CTAG---------ACGG-T---A--GG---G-GT-C---T--A-A--T--T---CT---AA--T-A-AT----A-AATNG------GA-C-T--TT-T-C-G-C------CG---A-A-AA--T-T--GCAA---------G--C-----GA-T---GTG-G--C-----T------G------GTA-A-A---TA-----A---G-AAAAC--C---AA-G-A--T-G-----GCG-GCGTGA-GATA
Reference ( family-473 )      :          TTGA-TTA-CA-G--C-CGAT--A--AA---TGG-ACT--CT-AT-TT-------C--CA-GTTC-A-C-C-ATG-A-C--GA--------T-G-CGA---G-A-G-----A----A--GA------G-AC--C---T--T--G-A-C---A-----GA----G--T---T------G--CTG-CTAG---------ACGG-T---A--GG---G-GT-C---T--A-A--T--T---CT---AA--T-A-AT----A-AATNG------GA-C-T--TT-T-C-G-C------CG---A-A-AA--T-T--GCAA---------G--C-----GA-T---GTG-G--C-----T------G------GTA-A-A---TA-----A---G-AAAAC--C---AA-G-A--T-G-----GCG-GCGTGA-GATA
gi|34058                      :          TTGA-TTA-CA-G--C-CGAT--A--AA---TGG-ACG--CT-AT-TT-------C--CA-ATTC-A-A-C-ATG-A-C--GA--------T-G-CGA---G-A-G-----A----A--GA------G-AC--C---T--T--G-A-T---C-----GA----G--T---T------G--CTG-CTAG---------ACGG-T---A--GG---G-GT-C---T--A-A--T--T---AT---AA--T-G-AT----A-AATTG------AA-C-T--TT-T-C-G-C------CG---A-A-AA--T-T--GCAA---------G--C-----TA-G---GTG-G--C-----T------G------GTA-A-A---TA-----A---G-AAAAC--C---AA-G-A--T-G-----GCG-GCGTGA-GATA
gi|34059                      :          TTGA-TTA-CA-G--C-CGAT--A--AA---TGA-ACG--CT-AT-TT-------C--CA-ATTC-A-G-C-ATG-A-C--GA--------T-G-CGA---G-A-G-----A----A--GA------G-AC--C---T--T--G-G-T---C-----GA----G--T---T------G--CTG-CTAG---------ACGG-T---A--GG---G-GT-C---T--A-A--T--T---AT---AA--T-G-CT----A-AATTG------AA-C-T--TT-T-C-G-C------CG---A-A-AA--T-T--GCAA---------G--T-----TA-G---GTG-G--C-----T------G------GTA-A-A---TA-----A---G-AAAAC--C---AA-G-A--T-G-----GCG-GCGTGA-GATA
gi|34060                      :          TTGA-TTA-CA-G--C-CGAT--A--AA---TGG-ACG--CT-AT-TT-------C--CA-GTTC-A-A-C-ATG-A-C--GA--------T-G-CGA---G-A-G-----A----A--GA------G-AC--C---T--T--G-A-T---A-----GA----G--T---T------T--CTT-CTGG---------ACGG-T---A--GG---G-GT-C---T--A-A--T--T---AT---AA--A-G-TT----A-AATCG------AA-C-T--TT-T-T-G-C------CG---A-A-AA--T-T--GCAA---------G--C-----TA-G---GTG-G--C-----T------G------ATA-A-A---TA-----A---G-AAAAC--C---AA-G-A--T-G-----GCG-GTGTGA-GATA
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gi|34062                      :          TTAA-TTA-CA-G--C-CGAT--A--AA---TGG-ACT--CTTAT-TT-------C--CA-GTTA-A-C-C-ATG-A-C--GA--------T-G-CGA---G---G-----A----A--AG------G-AC--C---T--T--G-A-C---A-----CAG---G--C---T------G--CTG-CTA----------ACAG-T---A--GG---G-GT-C---T--A-A--T--T---CT---AA--G-A-AT----G-AATGG------GA-CTT--TT-T-T-G-C------CG---A-C-AA--T-T--GCAA---------G--T-----GA-T---GTG-G--C-----T------G------GTA-A-A---TA-----A---G-GAATT--C---AA-G-A--A-G-----GCG-GCGTTC-GATA
gi|34063                      :          TTGA-TTA-C--G--C-CGAT--AGAAA---TGG-ACT--CT-AT-TT-------C--CA-ATTC-A-A-C-ATG-A-C--AA--------T-G-C-A---G-A-G-----A----A--GACTAGTGG-AT--CG--T--T-----------------A----G--TG--T------G--CTC-CTAGTTCTTAAGTACG--T---A--GG---G-GT-C---T--ATA--T--T---TT---TA--T-A-
gi|34064                      :          TTGA-TTA-CATG--C-CGAT--A--AA---TGG-ACT--TT-AT-TT-------CG-CA-GTTC-AGC-C-ATG-A-C--GA--------T-GTCGA---G-A-GG----A----A--GG------G-AC--C---T-----G-A-C---A-----GA----G--C---T------GG-CTG-CTAA---------ACG--T---A--GG---G-GT-T---C--A-AATT--T---CT---AA--GGA-AT----T-AATGT------GA-C-T--TT-T-TTG-C------CG---A-ACAA--T-T--GCAA---------G--T-----GA-TT--GTG-G--C-----T------G------GTA-A-A---TA-----A---G-GAATT--C---AA-G-A--TGG-----GCG-GCGTGA-GATAtttgacctataatttgtaaactttt
gi|34065                      :          TTGAATTA-CAAG--C-CGAT--A--AA---TGG-ACT--TT-AT-TT-------C--CA-GTTC-A-C-C-ATGAA-C--GA--------T-G-CGAC--G-A-G-----A----A--GG------G-AT--CAT-T--T--G-A-C---A-----GA----GCTT---C------G--CTG-CTAA---------ACGA-----A--GG---G-GT-C---A--A-A--T--T---CT---AA--G-A-GT----T-AATGT------GA-C-T--TTGTAT-G-C------CG---ACA-AA--T-T--GCAA---------G--TG----GA-T---GTG-GGCC-----T------G------GTA-A-A---TA-----G---G-AATTC--C---AAGG-A--T-G-----GCG-GCGTGA-GATA
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gi|34067                      :          TTGT-TTA-CC-G--C-CGAT--A--AA---TGG-ACT--AT-AT-TT-------C--CA-GTTC-A-C-C-ATG-A-C--GA--------T-G-CGA---G-A-G-----A----A--G-------------------------------------------G--C---T------G--CTG-CTAT---------ATGG-T---A--GG---G-AT-C---T--A-A--T--T---CT---AA--T-A-AT----T-AAaggcaaagataacgaac
gi|34068                      :           TGA-TTT-CA-G--C-CGAT--A--A-------------------------------CA-GTTC-A-C-C-A-G-A-C--GT--------T-G-CAA---G-A-A-----A----T--AA------G-TC--T---T--T--A-A-C---A-----GA----G--T---T------G--CT--CTAA---------ACGA-T---A--GG---G-AC-T---T--A-A--T--T---------A--T-A-ATTG--A-AATCG------AA-C-T--TT-TTC-G-C------CG---A-A-AA--T-T--GAAA---------G--C-----AA-T---GCA-G--C------------G------GTC-A-A---TA-----A---G-GAATA--A---AA-G-A--G-G-----ATG-GCGTGA-TAT
gi|34069                      :            GA-TTAGCA-GGAC-CGATT-A--AA---TGGCACCAGCT-AT-CTTCCCCACC--CACATTA-A-A-C-ATG-A-CCAGA--------T-G-CGA---G-A-GC----A----A--GACA----G-AC--C---T--TCTG-ATC---C-----GA----G--T---TCACGCAG--CTG-CTA----------ACGG-T---A--GG---G-GT-C---T--A-A--T--T---AT---AA--T-A--T----A-AAATG------AA-C-T--TT-T-T-G-C------CG---A-A-AA--A-T--GCAA---------A--C-----TA-G---GTG-A--C-----T------G------GTT-A-A---TA-----A---G-AAAAC--C---AA-G-A--T-G-----GCG-GCG-GA-GATA
gi|34070                      :            GA-TTA-CA-G--C-CGATGAA--GA---TGG--CT--AT-AT-TT-------C--CA-AATCAA-C-CAATG-ATC--GA--------T-G--GA---G-A-G-----A----A--AAG-----G-ACA-C---T--T--G-A-C---A------A----G--C---A------G--CTG-CTAA---------ACGG-T---A---T---G-GT-CATAT--A-A--T--T---CT---AAG-T-A-TT----A-AGT--------GA-C-T--TT-T-T-G-CG-----CG---A-C-AT--T-TGAGTAA---------G--T-----GA-TG--GTGAG--C-----T-------------GTA-A-A---TGTCTATA---G-AATTC--T---AA-G-A--A-G-----GCG-GCGTGAGGATA
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gi|34072                      :                  -CA-G--C-CGAT--A--AA---TAG-ACG--CT-AT-TT-------C--CA-GTTC-A-T-C-ATG-A-C--GA--------T-G-TGA---G-A-G-----A----G--GA------G-AC--C---T--G--G-A-T---C-----GA----G--T---T------G--CTG-CTAG---------ACGG-T---A--GG---G-GT-C---T--A-A--T--T---AT---AA--T-G-AT----A-AATTG------AA-C-T--TT-T-C-G-C------CG---A-A-AA--T-T--GCAA---------G--C-----TA-G---GTG-G--C-----T------G------GTA-A-A---TT-----A---G-AAAAC--C---AA-G-A--T-G-----GCG-GCGTGA-GATA
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gi|34074                      :                                                   T-AT-TT-------C--CA-GTTC-G-C-C-ATG-A-C--GA--------T-A-CGA---G-A-G-----A----A--GA------T-AC--C---T--T--G-A-C---A-----GA----G--T---T------G--CTG-CTAA---------ACGG-T---A--CG---G-GT-C---T--A-A--T--T---CC---AA--G-A-AT----T-ATTAG------GA-C-T--TT-T-T-G-C------CG---A-A-AA--T-T--GCAA---------G--T-----GA-T---GTG-A--C-----T------G------GTA-A-A---TA-----A---G-GAATT--C---AA-A-G--G-G-----GTG-GCGTGG-GATA
gi|34075                      :             gataattgacggttaatT--A--AAATCTGG-AAA--TT-AT-TT-------CTCCA-GTTT-A-T-C-A-G-A-C--GA--------T-G-CAACAAG-A-A-----A----G--GA------GCAC--T---T--A--G-A-C---G-----AA----G--T----------G--CT--CTAG---------ATGG-T---A--GGT--G-GT-C---T--A-A--T--T---CT---AA--T-G-GA----A-GACAG------GA-C----TT-T-C-G-C-----------G-A-AT--T-T--GCAAT--------GGTT-----GA-T---GTG-A--CTGACAT------G------GTA-GCA---TA-----A---G-GAAAC--CA--AA-G-A--T-G-----G-G-GCG
gi|34076                      :                                  --AG---TAG-ACG--AT-ATGTT-------CA-TA-GTTC-A-C-T-ATG-A-C--GA--------T-G-CGA---G-A-G-----A----A--GG------G-AC--C---T--T--G-A-C---A-----GA----G--C---T------G--CTT-CTAA---------ACGG-T---A--AG---A-CT-C------A-A--T--T---CT---AT--G-A-AT----T-GATAC------GA-C-T--TT-T-T-G-C------CG---C-C-AA--T-T--GCAA---------G--T-----GA-T---GTG-G--C-----T------G------GAA-G-A---TA-----A---G-GAATT--C---AA-G-A--T-T-----GCG-GCGTGA-GATA
gi|34077                      :                                      ---TGG-ACT--TTTAT-TT-------C--CA-GTTT-A-C-C-ATG-A-C---A--------T-T-CAA---A-A-GTTAGTA----A--GA------G-AC--C---T--T--A-A-C---A-----GA----G--T---T------G--CTA-CT-G---------ACGG-T---A--GG---G-GT-CAA-T--A-A--T--CCCGCT---AA--T-A-AT----A-AATAG------GA-C-T--TT-T-----C------CG-----A-AA--T-T--GCAA---------ATCC-----GA-T---GTG-T--C-----TAGAATCG------GCA-A-A---TA-----A---G-AAAA
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gi|34081                      :                                                    -AT-TT-------C--CA-GTGC-A-C-A-ATG-A-C--GA--------T-G-CGA---G-A-G-----A----T--AA------G-AC--C---T--T--A-A-G---A-----TA----G--T---T------A--CTG-CTGA---------AC
gi|34081                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                 G------AA-C-T--TT-T-T-G-C------AG---A-A-AT--T-T--GCTT---------G--C-----GG-T---GCA-G--C-----T------G------TTAGA-A---TA-----A------AACC--C---AA-G-A--T-G-----ACA-GCGTGA-TATAtttttgcagaaatttgcttgcggtgcagctgttagaataaaacccaagatgacagcgtgatata
gi|34082                      : atttccagtgcacaatgacgatgcgagagataagaccttaagatagttactgct-TT-------C--CA-GTGT-A-T-A-ATG---C--GA--------T-G-CAA---A-A-G-----A----AA-GA------G-AC--C---T--T--A-A-C---A-----GA----G--T---G------G--CTG-CTAG---------ATGG-T---A--GT---G-GT-C---T--A-AT-T--T---CT---AA--T-A-TG----A-AAGAG------GA-C-T--TT-T-C-G-C------TG---A-A-AAATT-T--GCAAG--------G--T-----GA-T---GTG-A--CTGACAT------G------GTA-C-AT--TA-----A---G-GAAAC--A---AA-G-A--T-G-----GGG-GCGTG
gi|34083                      :                                                                           -A-C-C-ATG-A-C--GAGGCTTGGAT-G-CGG---G-AAG-----A----A--G-------G-AC--C---T--T--G-A-CGAGA-----GA----G--C---A------GCTCTG-CTAA---------ACGGTT---A--GG---G-GT-C---A--A-A--T--T---CTAAAAA--G-A-AT----T-AATGT------GACC-T--TT-T-T-G-C------CGGACA-A-GA--TGT--GTAA---------G--T-----AT-T---GCG----------T------G------GTA-A-AAGTTA-----G---G-AA
gi|34084                      :                                                                    ttccaacccatcg-ATG-A-G--GA--------TTG-CGA---GGA-G-----A----AAGGT------G-AC--C---T-----G-A-C---A-----G--------C---T---------CTGTCTAA---------ACG--T---A--GG---G--T-C---T--A-AA-T--T---CA---AAACT-A-ATTAGAA-GATTATATGCTGA-C-TCTTT-T-T-G-CTTCACACG---ACA-AA--T-T--GTAA---------A--------GT-TTGGGTG-G--C-----T------G------GTA-A-AG--TA-----A---G-GGAAT--TCAAAA-G-A--T-GGGGACGCA-GCGTGA-AA
gi|34085                      :                                                             ttcccacacaaTTT-A-C-C-ATG-G-C--GA--------T-C-TGA---G-A-A-----A----A--GG------G-AC--C---T--T--A-A-C---A-----GA----G--T---T------G--TT--------------------T------GG---A-GT-T---T--A-A--T--T---CT---AA--T-T-AT----A-AATAG------GA-T-T--TC-T-T-G-C------TG---A-A-AA--A-T--GC-A---------G--T-----GG-T---CTG-G--C-----T------T------GTA-A-A---TA-----A---G-GAAAT--A---AA-T-A--T-G-----GCG-GCGTGA-GATA
gi|34086                      :                                                                               -C-ATA-A-C--GA--------G-G-CGA---A-A-A-----A----AA-GA------G-AC--C---T--C--A-A-C---A-----GA----G--T---T------G--CTG-CTAG---------AC-------A--GG---A-GT-T---T--A-C--T--T---CT---AA--T-T-TT----G-AATAG------AA-C-T--CT-T-T-G-C------TG---A-A-AA--T-T--GCAA---------G--T-----GA-T---GTG-G--C-----T------G------CTA-A-A---TA-----A---G-AAAAC--A---AA-G-A--T-G-----GCG-GTGTG
gi|34087                      :                                                                             aa-C-ATG-A-C--GA--------T-A-CGA-----A-G-----A----T--AA------G-AC--C---T--T--G-A-C---A-----GA----G--T---T------G--TTG-CTAG---------ACAA-G---A--AG---G-AC-T---TGCG-A--T--T---AT---CA--T-A-TT----G-CATAG------AA-A----TG-T-C-A-C------TG---A-A-AG--T-C--ATAA---------C--C-----GA-T---G
gi|34088                      :                                                                                     -A-C--GA--------T-G-CGA---G-A-G-----A----A--GG------G-AC--C---T--T--G-A-C---A-----GA----G--C---T------G--CTG---------------------------------GT-C---T--A-A--T--T---CT---AA--G-A-AT----T-AATAG------GA-C-T--TT-T-T-G-C------CC---A-C-AA--T-T--GTAA---------G--T-----GA-T---GTG-G--C-----A------G------GTA-A-A---CA-----A---G-GAATT--C---AA-A-A--T-G-----ATA-GCGTGA-AATAgc
gi|34089                      :                                                                                         --GA--------C-G-CGA---A-A-G-----A----A-------------C--C---TCTT--A-A-C---A-----GATT--G--TAGGT------G--CTG-CTAA---------AGAG--------GG---GTGT-C---T--A----T--T---CT---AA------AT----T-TAGAG------GA-C-T--TT-C-C-GGC------CC---A-A-AA--T-T--GCAATGACTGCTGG--CT----GA-T---GTG-G--C-----T------G------GTA-A-A---TA-----A---G-AAAG-------AA-G-A--T-G-----GTG-GTGTG
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gi|34100                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ggtctacatg---GTG-G--C-----T------G------GTA-A-A---TA-----A---G-AAAAC--C---AA-G-A--T-------GCG-GCGTGA-GATA
gi|34101                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              agTG-G--C-----T------G------ATA-A-A---TA-----A---G-AAAAC--C---AA-G-A--T-G-----GTT-GCGTGA-TATA