lowQualScore                  :             11                          1111                                                                                        1111111111                                                                                                                                                     11111         444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444                  111111111              11                         1                              111                                                       
lowQualScore                  :     1  3    66 3333    2  1   1 1 11    8888  1 222 44444    5555555555 11 44  1   2 1 2  11  2 1      444444   333333   1  44  1 3 8888888888 1 22   22 1 44444  1     1      1    66     1  1   444     444  2 1 1   1 33   5555   33  44 5 3   22 444   555     1  222 444 1 22  1  3333 1 1 4  11111  66 22  111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 999999 22 666  666666666  22 6666     66     2 1      1 1 444444 1  5555   22 88888 1     1  3  111   1 4444 3  4444444  1  33 1  33 1     1 1    1       
lowQualScore                  :     .  .    .. ....    .  .   . . ..    ....  . ... .....    .......... .. ..  .   . . .  ..  . .      ......   ......   .  ..  . . .......... . ..   .. . .....  .     .      .    ..     .  .   ...     ...  . . .   . ..   ....   ..  .. . .   .. ...   ...     .  ... ... . ..  .  .... . . .  .....  .. ..  ............................................................................................................... . ...... .. ...  .........  .. ....     ..     . .      . . ...... .  ....   .. ..... .     .  .  ...   . .... .  .......  .  .. .  .. .     . .    .       
lowQualScore                  :     7  3    11 1111    8  4   4 4 99    6666  2 222 88888    4444444444 77 22  2   4 2 4  66  9 2      666666   777777   3  00  7 3 0000000000 6 22   22 6 00000  6     6      6    77     5  5   888     111  9 4 4   4 99   4444   55  00 8 0   11 000   444     5  888 777 6 22  6  4444 6 6 8  00000  00 22  000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 6 444444 22 000  000000000  22 6666     55     9 4      5 5 888888 6  9999   00 44444 4     4  0  111   5 6666 0  8888888  5  77 5  77 5     5 5    5       
consensus                     : ATAT-TT-CACC-GG----TTTT-CC-ATC-A-T--GAGA-T-CTT-T---T-----AAAG----TG----T--G--CC-CAT-A-C-AG--TGGA-TTTCAG------AGG------CAT-GT--TT-A-CT------G--A-C--CAA--C-A-----TC-CAAAC-TCAAAT-GATTN-ATTTG-AA-CAT---GAACG---AA-T-T-AAA-A--CTG--G-TTT--AA-CTTT-ACC--T--TTAC-A-TGATT-TT---A--CT-C--AC-AA----A-A-G-CA-----CC--G--AA----------TTG---------TG---------T---------AA---------A-------A-TC---------T---------------A---------C---------T-G------A--A---AANA-------GG--C----TATTTT-TAACG-A-GTACTC-G-A-----GTATG----AAA--A-T---T-TTAGT-CG-AT--GATC-G----G-TA-------CG-AC--C-GA--G-CGATA-G-TCGA-GTACTCG
Reference ( gi|86655 )        : ATAT-TT-CACC-TG----TTTT-CC-ATC-A-T--GAGA-C-ATT-T---T-----AAAG----TG----T--G--CC-CAT-A-C-AG--TGAA-TTTCAG------AGG------CAT-GT--TT-A-CT------T--A-C--CAA--C-A-----TC-CAAAC-TCAAAT-GATTC-ATTTG-AA-CAT---GAACG---AA-T-T-AAA-A--CTG--A-TTT--AA-CTCT-ACC--T--TTAC-A-TGATT-TT---A--TT-C--AC-AA----A-A-G-CA-----CT--G--AA----------TTG---------TG---------T---------AA---------A-------A-TC---------T---------------A---------C---------T-G------A--A---AATA-------GG--C----TATTTG-TAACG-A-GTACTC-G-A-----GTTTG----AAA--A-T---T-TTAGT-CG-AT--CATC-G----G-TA-------CG-AC--C-GA--G-CGATA-G-TCGA-GTACTCG
gi|86656                      : ATAT-TT-CACC-TG----TTT---C-ATC-A-T--GAGA-C-ATT-T---T-----AAAG-----G----T--G--CC-CAT-A-C-AG--TGAA-TTTCAG------AGG------CAT-GT--TT-A-CT------T--A-C--CAA--C-A-----TC-CAAAC-TCAAAT-G-TTC-ATTTG-AA-CAT---GA-CG---AA-T-T-AAA-A--CTG--A-TTT--AA-CTCT-ACC--T--TTAC-A-TGATT-TT---A--TT-C--AC-AA----A-A-G-CA-----CT--G--AA-----------TG---------TG---------T---------AA---------A-------A-TC---------T---------------A---------C---------T-GA-----A--A---AATA-------GG--C----TATTTG-TAACG-A-GTACTC-G-A-----GTTTG----AAA--A-T---T-TTAGT-CG-AT--CATC------G-TA-------CG-AC--C-GA--G-CGATA-G-TCGA-GTACTCG
gi|86662                      : ATAT-TT-CACC-CG----TTTT-CC-ATC-A-T--GAGA-T-ATT-T---T-----AAAG----TG----T--G--CC-CAT-A-C-AG--TGAA-TTTCAG------CGG------ATT-GT--TT-A-CT------G--A-C--CAA--C-A-----TC-CAAAC-TCAAAT-GATTC-ATTTG-AA-AAT---GAACG---AA-T-T-AAA-A--CTG--G-TTT--AA-CTTT-ACC--T--TTAC-G-TGATT-TT---T--TT-C--AC-AA----A-A-G-CA-----CT--G--AA----------TTG---------T----------T--------------------A-------A-TC---------T---------------A---------C---------T-G------A--AT--AATA-------GG--C----TATTTG-TAACG-A-GTACTC-G-A-----GTTTGA---AAA--A-T---T-TTAAT-CG-AT--CATT-C----G-TA-------CG-A
gi|86657                      : ATAT-TC-CATC-GG----TTTT-CC-ATC-A-T--GAGA-T-CTT-T---T-----AAAG----TG----T--G--CC-CAT-A-C-AG--TGAA-TTTCAG------ATG------CAT-GT--TT-A-CT------G--A-C--CAA--C-A-----TC-CAAAC-TCAAAT-GATTA-ATTTG-AA-CAT---GAACG---AA-T-T-ACA-A--CTA--A-TTT--AA-ATTT-ACC------------TGATT-TT---A--CT-C--AC-AA----A-A-G-CA-----CC--G--AA----------TAG---------TG---------T---------AACATCTTTATA-------A-TC---------T---------------A---------C---------T-G------A--A---GAAA-------GG--C----TATTTT-AAACG-A-GTACTC-G-A-----GTATG----GAA--A-T---T-TTAGT-CG-AT--GATC-G----G-TA-------CG-AC--C-GA--GCCGATA-GATCGA-GAACTCG
gi|86659                      : ATAT-TT-CATC-GG----TTTT-CC-ATC-A-T--GAGA-T-CTT-T---T-----AAAG----TG----T--G--CC-CAT-A-C-AG--TGGA-TTTCAG------ATG------CATTGT--TT-A-CT------G--A-C--CAA--C-A-----TC-CAAAC-TCAATA-GATTA-ATTTG-AA-CAT---GAACG---AA-T-T-ACA-A--CTA--A-TTT--AA-ATTT-ACC--T----------GATT-TT---A--CT-C--AC-AA----A-A-GGCA-----CC--G--AA----------TAG---------TG---------T---------AACATCTTTATA-------A-TC---------T---------------A---------C---------T-G------A--A---AAAAA------GG--C----TATTTT-TAACG-A-GTACTC-G-A-----GTATG----AAA--T-T---T-TTAGT-CG-AT--GATC-G----G-TA-------CG-AC--C-GA--G-CGATA-G-TCGA-GTACTCG
gi|86660                      : ATAT-TT-CATC-GG----TTTT-CC-ATC-A-T--GAGA-T-CTT-T---T-----AAAG----TG----T--ATACC-CAT-A-C-AG--CGAA-TTTTAG------ATG------CAT-GT--TT-A-CT------G--A-C--CAA--C-A-----TC-CAAAC-TCAAAT-GATTA-ATTTG-AA-CAT----AAGG---AA-T-T-ACA-T--CTA--A-TTC--AA-ATTT-ACC--T----------GATT-TT---A--CT-C--AC-AA----A-A-G-CA-----CC--G--AA----------TAG---------TG---------T---------AACATCTTTATA-------A-TC---------T---------------A---------C---------T-G------A--A---AAAA-------GG--C----TATTTT-TAACG-A-GTACTC-G-A-----GTATG----AAA--A-T---T-TTAGT-CG-AT--GATC-G----G-TA-------CG-AC--C-GA--G-CGATA-G-TCGA-GTACTCG
gi|86663                      : ATAT-TTACACC--G----TTTT-CC-ATC-A-T--GA-A-CGATA-T---T-----AAAG----TG----T--G--CCGCATTA-C-AG--T-AA-TTTCAC------GGA------TTT-GT--TT-A-CT------G--AAC--CAA--C-A-----TC---AACATCAAAT-GATTC-ATTTG-AA-AAT---GAACGG--AA-T-T-AAA-A--CTG--G-TTT--AA-CTT---CC--T--TTAC-G-TGATT-TT---T--TTTC--AC-AA----A-AAG-CAT----CT--GGGAT----------TTG---------TG---------T---------AA---------A-------AATC---------T---------------A---------C---------T-G------A--A---AATA-------GG--CC---TATTTG-TAACG-A-GTACTG-A-G-----GTTTG----AAA--AAT---T-TTAAT-CG-AT--CATCCG----G-TA-------C--AC--C-GA--G-CGATA-G-TCGA-TAACTCG
gi|86665                      : ATAT-TT-CATC-GG----TTTT-CC-ATC-A-T--GAGA-T-CTT-T---T-----AAAG-----G----T--G--C---AT-A-C-AG--TGAA-TTTCAG------ATG------CAT-GT--TT-A-CT------G--A-C--CAA--C-A-----TC-CAAAC-TCAAAT-GATTA-ATTTG-AA-CAT---GAACG---AA-T-T-ACA-A--CAG--A-TTA--AA-----------T--TTAC-C-TGATT-TT---A--CT-C--AC-AA----A-A-G-CA-----CC--G--AA----------TAG---------TGAAACATCTTT---------AT---------A-------A-TC---------T---------------A---------C---------T-GA-----A--A---AAAA-------GA--C----TATTTT-TAACG-A-GTACT--G----------TG----GAATCA-T---T-TTAAT-
gi|86667                      : ATAT-TTGCATC-GG----GTTT-CC-ATC-A-TCTGAGA-T-CTT-T---T-----AAAGA---TG----T--G--CC-CAT-A-C--G--TGAAATTTCAG------A--------CA--GT--TT-A-AC------TGGA-C--CAA--C-A-----TC-CAAAC-TCAAAT-GATT--ATTTG-AA-CAT---GAATG---AAAT-T-ACA-A---TA--A-TCT--AA-AT-T-A--------TAC-C-TGATTATT---A--T--C--AC-AA----A-A-G-CAA----CC--G--AA----------TAG---------TGACATCT---T---------AT---------A-------A-TC---------T---------------A---------C---------T-G------A--A---AA-A-------GG--CA---TATTTT-TAACG-A-GTACTCGG-A-----GTATG----AAC--A-T---TGTTAGT-CGAAT--GATC-G----A-TA-------CG-A---C-GA--G-CGATA-G-TCGA-GTCCT
gi|86670                      : ACAT-TT-CACT-GG----TTTT-CC-ATC-A-T--GCGA-T-----------------------------------CC-CAA-A-C-AG--TGGA-TTTCGG------AGG------CAT-GT--T---------------------------------------AT-TCAAAT-AATTT-ATTTG-AA-CAT---GAACG---AA-T-T-AAA-AACCCG----TTT--GA-ATTT-ACC--G--TTAC-A-TGATT-TT---A--CA-C--AC-AA----A-A-A-CA-----AT--G--AAGTGT------TTGGAATT----TA---------T---------AA---------A-------C-TT---------T---------------A---------C---------T-G------A--A---AAAA-------GG--C----TATTTT-TAATG-A-GTACTC-G-A-----CTAAG----AAA--A-A---T-TAAGT-CG-AT--GATC-G----G-AA-------AG-AC--C-GA--A-CGATA-G-TCGA-GTACTCG
gi|86671                      : ACAT-TT-CACT-GA----TTTT-CC-AT-------GAGA-T-----------------------------------CC-CAA-A-C-AG--TGGA-TTTCGG------AGG------CAG-GT--TTTA-CG------G--A-C--CAA--C-AATTAATT-GAAAC-TCAAAT-AATTT-ATATG-AA-CAT---GAATT---AA-T-T-AAATC--CCG--T-TTC--AA-TTC--ACA--T--TTAC-A-TGA-----------------AC-AACGTGA-G-G-TG-----TTTGG--AA----------TT----------TA---------T---------AA---------A-------C-TT---------T---------------A---------C---------T-G------A--A---AAGG-------GA--G----AATCTT-TAACG-A-ATACTC-G-A-----CTAAG----AAA--A-A---T-TTAGT-CG-AT--GACC-G----A-TA-------CG-AC--C-AA--G-CGATA-G-TCGA-GTAATCG
gi|86658                      : ATAT-TT-CACC-GG----TTTT-CC-ATC-A-T--GAGA-T-CTG-T---T-----AAAG----TA----T--G--CC-CAT-A-C-AG--TGGA-TTTCAG------AGA------TAT-G
gi|86673                      : ATAT-TT-CACT-GG----TTTT-CC-ATC-A-T--GGGATC-TTT-T---T-----AAAG----TA----T--G--CC-CAT-A-C-AG--TGGA-TTTCGG------AGG------TAT-G
gi|86661                      : ATAT-TT-CACC-GG----CTTT-CT-ATC-A-T--GAGA-T-CTG-T---T-----AAAG----TA----T--G--CC-CAT-A-C-AG--TGGA-TTTCAG------AGA------TAT-G
gi|86666                      : ATAT-TT-CACC-AG----TTTT-CC-ATC-A-T--GAGA-T-CTG-T---T-----AAAG----TA----T--G--CC-CAT-A-C-AG--TGGA--TTCAG------AGA------TAT-G
gi|86674                      : ACAT-TT-CACT-GGGTTTTTTT-TC-ATC-A-T--GCGA-T-----------------------------------CC-CA--A-C-AG--TGGA-TTTCGG------ATG------CAT-GT--TG-A-T------------------------------------------T-GA----ATTTG-----------AACG---AA-T-T-AAA-A--TCC--G-TTT--GA-TATC-ACC--T--TTAC-C-TGATT-TT---A--CT-C--CT-AA----A-A-A-CA-----CT--G--AA----------GTG---------TT---------T---------GG---------A-------A-TCTATTAACTTT---------------A---------C---------T-G------A--G---AAGG-------GG--C----TATTTT-TAACGCA-GT
gi|86668                      : ATAT-TT-CATCGCG----TTTT-CC-ATC-A-T--GAGA-T-CTCGT---T-----AAAG----TA----T--GA-CC-CAT-A-C-AGAATGGA-TTTCAG------A
gi|86669                      : ATAT-TT-CACC-GG----TTTT-CC-ATC-A-T--GAGA-A-CTG-T---T-----A----------------------CAT-A-C-AG--TGGA-TTTCAG------AGA------TAT-Gcgaat
gi|86672                      : ATAT-CT-AACT-GG----TTTT-CC-GTC-A-T--G-GA-T-CTT-T---TTA---AAAG----TA----T--GC-CC-CAT-A-CAAG--TGGA-TTTCGG------AGG------TAT-Gacagttcaatttcataattcatatataatgtatacatg
gi|86664                      : ATAT-TC-CACC-GG----TTGT-CC-ATCAA-T--GAGA-T-CTG-T---T------AAG----TA----T--G---C-CAT-ACC-AG--TGGA-TTTGAG------A
gi|86675                      :  TATATT-CATC-GG----TTTT-GC-TTC-A-T--GAGA-T-TGT-T---T-----AAAG----TG----T--G--CC-CAT-A-C-A---TGAA-TTTCAG------ATG------CAT-GT--TT-A-CT------G--A-C--CAA--C-A-----TC-CAA-C-TCAAAT-GATTA-ATTTG-AA-CAT---GAACT---GA-T-T-ACA-A--CTGTAA-TTTTAAA-TTTT-ACC--T--T-------GATT-TT---AACCT-C--AC-AA----A-A-G-GA-----CCC-G--AA----------TAGA--------TG-------------------AA---------C-------A-TC---------TTTTATAATT------A---------C---------T-G------A--A---AA-A-------AG--CAGTTTAGTTT-TAACG-A-GTACTC-G-A-----GTATG----AAA--A-A---T-TTAGT-CG-AT--GATC-G----G-TA-------CG-AC--C-GA--G-CGATA---TCTA-GTACTC
gi|86676                      :  TAT-TT-CATT-GG----TTTT-CC-ATC-A-T--GAGA-T-CTT-T---T-----AAAG----TG----T--G--CC-CAT-A-C-AG--TGAA-TTTCAG------ATG------CAT-GT--TT-A-CT------G--A-C--CAA--C-A-----TC-CAAAC-TCAAAT-GATTA-ATTTG-AA-CAT---GAACG---AA-T-T-ACA-A--CTA--A-TTT--AA-ATTT-ACC--TGATTTC---TGATT-T
gi|86677                      :   AT-TT-CATC-AG----TTTTTCC-ATC-A-T--GAGA-T-CTT-T---C-----AAAG----T-----T--G--CC-CAT-A---AG--TGGA-TTTCAG------AGG------CAT-GT--TT-G-TT------T--A-C--TGA--C--------C---AAC---------ATCC-ATTTG-AA-TAT---GAACG---CA-C-TAAAA-A--CTG--G-TTT--A
gi|86678                      :    T-TC-CACC-GT----TTTT-CC-ATC-A-T--GAGA-T-ACT-T---T-----AAAG----TG----T-----CC-CATTA-C-AG---GGA-TTTAAG------AGG------CAT-GT--TT-A-CTGTACATT--A-C--CAA--C-A-----TC-CAA-C-TCAATTTGATTCCATATG-AA-CAT---GAACG---AA-T-T-AAA-AAACTG--G-TTTC-AA-CTTT-ACC--T--GTAC-A-TCATT-T----A--TT-C--ACCAA----A-A-G-CAA----CT--G--AA----------TTG---------TG---------T---------AA---------A-------A-TC---------T---------------A---------C---------T-G------A--A---AATA-------GG--C----TATTT--TAGCGAA-GTACTC-G-A-----GTTTG----AAA--A-T---T-TTAGT-CG-AT--CATC-G----G-TA-------CG-AC--CTGA--A-CGATA-G-TCGA-GTACTCG
gi|86681                      :     -TT-CACC-GG----TTTTTCC-ATC-A-T--GAGA-T-ATG-T---T-----AAAG----TA----T--G---C-CAT-A-CAAG--TG-A-TTTCGG------A
gi|86684                      :               G----TTTT-CC-ATC-A-T--GAGA-T-CTT-T---C-----AAAG----T-----T--G--CC-ACT-A---AG--TGGA-TTTCAG------AGG------CAT-GT--TT-A-CT------G--A-C--CAA--C-A-----TC-CAAAC-TCAAAT-GATTC-ATTCG-AA-TAT---GAACG---AA-C-T-AAA-A--CTG--G-TTT--AA-CTTT-ACC--T--TTAC-A-TGATT-TT---A--CT-C--AC-AA----A-A-G-CA-----TT--G--AA----------TTG---------TG---------T---------AA---------A-------A-TC---------TTTAAAA---------A---------CTTCA-----T-G------A--A---AA-A-------AG--C----TATTTT-TAACG-A-GTAATC-G-A-----GTATG----AAA--A-T---T-TTAGT-CG-AT--GATC-G----G-TA-------CG-AC--C-GA--G-CGATA-G-TCGC-GTACTCGt
gi|86682                      :                ----TTTC-TC-ATA-A-T--G-TA-C-ATT-TCACT-----AAAG----TA----C--T--CC-TA--A-C-AA--TGAA-TTTCGG------AGT------CAT-AT--TT-A-CA------T--T-C--AGA--C-A-----TC-CAAAC-TAAAAT-GATTT-CTTTG-AG-CAA---GAATG---GA-T-T-AAA-A--CTG--G-TTT--GA-CATT-ATT--T--TTAC-A-CGATT-TT-------------C-GG----A-A-G-CATT---TT--G--AA----------TTA---------TG--------------------A---------A-------C-TT---------T---------------A---------T---------TAG------A--AT--AATA--------G--C----TATTTT-TGATA-A-GCACTT-G-A-----CTATG----AAA--T-T---T-TTTGT-CG-AT--GATC-A----G-CA-------TG-AC-----A--G-CGAT----TCGA-GTACTCG
gi|86680                      :       ttcattaaa----TTTT-CCTATC-A-T--GTGA-G-ATT-C---TTTCCGAAAGAGAATG----TCTG--CC-CAT-G-A-AG--TGGA-TTTCAGT-----AGG------CAT-GTG-TT-AGCT------G--A-CGGCAATTC-A-----TCGCAAAC-TCAAGC-TATTC-ATTTG-A
gi|86683                      :         tttcattgcggtTTT-CA-ATC-AGT--GAT--C-TTT-T---T-----AAAG----TA----T--G--CC-CCT-A-C-AG--TGGA-TTTCAGCGGGGCAGGGGGGCACAT-GCACTT-ATCT------G--A-C--CAA--C-A-----TC-CAAAC-TCAAAT-GATTT-ATTTGAAA-CAT---GAACG---AA-T-T-CAA-A--TTG--G-TTG--GACCTTT-ACC--T--TTAC-ATTGATT-TT---A--CT-T--AC-AA----ACA-G-CA-----CT--G--AAAGTGTTAACTTTA---------TG-------------------AA---------A-------A-TT---------T---------------A---------C---------T--------A--C---AAGG-------GG--C----TATTT--T-ACG-ACGTACTC-G-T-----GTATGA---AAA--A-T---T-TTAGC----AT--GATC-G----G-TAGAACACCCGTAC--C-GA--G-CGATA-G-TGGA-
gi|86685                      :                     cgg-CC-ATC-G-T--GACA-T-CTT-T---T-----GACA----TAACAAT--G--TT-CAA-A-C-AA--TGGA-TATTGG------AGG------C----------------------------CAA--C-G-----TC-CAAAT-TCAAAT-GATTT-ATTTG-AA-CAT---ATATG---AA-T-T-AAA-A--TCG--C-TTA--AA-CTTT-ACC--T--TTAC-A-TGATC-AT---G--TT-T--AT-AA----A-A-A-CA-----CA--G--AA----------GTGTTTAGAATTTA---------T---------AA---------A-------C-TT---------T---------------A---------C---------T-G------A--A---AA-A-------AA--A----AATT---TAACG-A-GTGCTC-G-A-----CAATG----CAA--A-A---T-TTAGT-CT-AT--GATC-G----G-TA-------CG-AT--C-GA--G-CGATA-G-TCGA-GTTCTCG
gi|86679                      :                                             TT-T---T-----AAAG----TG----T--G--CC-CAT-A-C-AG--TGCA-TTTCAG------ATG------CAT-GT--TT-A-CT------G--A----CAA----A-----TC-CAA---TCAAAT-GATTA-ATTTG-AA-CAT---GAAAG---AA---T-ACA-A--CTA--A-TTT--A---TTTAACC--T-----------ATT-TT---A--CT-C--AC-AA----A-G----A-----CC--G--AA----------TAG---------TG---------T---------AA---------ATATTTATA-TC---------T---------------A-------------------T-G------A--A---AA-A-------GG--C----TATTT--TAACG-A-GTA-TC-G-A-------TTG----AAA--A-T---T-TTAGT-CG-AT--GATC-G----G-TA--------G-ACA-C-GGC-G-CGATA-G-TCGA-GTA
gi|86687                      :                                tttcatcggtttcTT-T---T-----AAA-----TG----T--G--TC-CAA-A-C-----CGGA-TTTCGG------AGG------CAT-AT--TT-A-TA------G--A-C--CGA--C-A-----CC-CAAAC-TCCAAT-GATTT-ATTTG-AA-CAT---TAATA---AA-T-C---A-A--CTA--A-T
gi|86686                      :                                             TT-T---T-----AAAG----TG----T--G--CC-CAT-A-C-AG--TGGA-TTTCAG------AGG------CAT-G
gi|86688                      :                                                                      tcacaggttc-CAA-A-C-AT--TGGA-CTTCAG------AGG------CAT-GT--TT-A-CA------T--A-C--CGA--C-A-----TC-CAAAC-TCAAAT-GATTT-ATTCA-AA-CAT---GTACA---AA-T-C-AAA-A--CTG--G-TTT--GA-CTTT-
gi|86689                      :                                                                                    -A-C-CG--TGGA-TTTCAG------AGG------CAT-GT--TT-A-C------------C--CAA--TTA-----TT-TAAAC-TCAAGT-GATTT-ATTTG-AA-CAT---GTACG---AA-T-T-CAA-A--CTG--G-TTA--GA-CTTT-ACC--T--TTAC-A-TGATT-TT---A--CT-T--AT-AA----A-A-G-CA-----CT--A--AA----------GTG---------TT---------TAAAATTTTAAA---------A-------A-TT---------T---------------A---------C---------T-G------A--A---A--A-------AG--C----TATATT-TAACG-A-GTACTC-G-A-----GTATG----AAA--A-T---T-TTAGT-CG-AT--GATC-G----C-TA-------CG-AC--C-GA--C-CGATA-G-TTGA-ATACTCGtcgtgaatta
gi|86690                      :                                                                                                                                             --A-C--CAA--C-A-----TC-CAAAC-TCAATT-GATTC-ATATG-AA-CAT---GAACG---AA-T-T-AAA-A--CTG--G-TTC--AA-CTTT-ACC--T--GTAC-A-TGATT-TT---A--TT-C--AC-AA----A-A-G-CA-----CT--G--AA----------TTG---------TG---------T---------AA---------A-------A-TC---------T---------------A---------C---------T-G------A--A---AATA-------GG--C----TATTTT-TAGCG-A-GTACTC-G-A-----GTTTG----AAA--A-T---T-TTAGT-CG-AT--CATC-G----G-TA-------CG-AC--T-GA--G-CGATA-G-TCGA-GTACTCG
gi|86691                      :                                                                                                                                                                                      -ATCTG-AAACATTCCGAATGGATAA-T-T-CAA-A--CGA--G-TTT--GA-CTTT-ACT--T--TTAC-A-TGATT-TT---A--CT-C--AC-AA----A-A-ACCA-----CC--G--AG----------GTG---------TT---------T---------AG---------A-------A-TTTAGGAACA-T---------------A---------C---------T-T------A--A---AAAA-------GG--T----TATCTT-TGATG-A-GTACAC-G-A-----CTATGAAAAAAA--A--------TAGT-CG-AT--GATC-GATACG-TA-------CG-AC--T-GA--G-CGATA-G-TTGA-GTACTTG
gi|86692                      :                                                                                                                                                                                         aTA-AA-CATTA-GAAC-----A-T-T-ATA-A--ATG--AATTT------CCC-ACTGAT--TT-----TGATT-TTTTAA--CT-T--CC-AA----A-A---C------CT--G--AA----------GCG---------TA---------T---------ATTGT------A-------A-TT---------T---------------A-------------------T-G------A--ACTTAATACTTTAGAAG--C----TATTTTCTAA---A-GGACTC-G-A-----TTATG----AAA--A-----T-CTAGT-CG-ATGATATC-G----GCTA-------TG-GC--C-CA--G-CGA-A-G-TCGA-
gi|86693                      :                                                                                                                                                                                                       AACG---AAGTGT-AAA-A--CTG--G-TTT--AA-CTTTCACC--TA-TTACTA-TGATT-TT---A--CT-C--AC-AA----A-A-GGCA-----TTTGA--AA----------TTG---------TG---------T---------AA---------A-------A-TC---------TTTTGAACAAGAAAGAA---------C---------T-GCATGAAACCA---AAT--------GG--C----TATTTT-TAACG-A-GTACTC-GAA-----GTATG----AAA--A-----T-TTAGT-CGTAT--GATC-G----T-AA-------CG-AC--C-GACGG-CGATA-G--CGA-GTAC
gi|86694                      :                                                                                                                                                                                                                -T-T-AAA-A--CCG--G-TTT--TA-ATTT-ACC--T--TTAC-A-TGATT-TT---A--CT-GGAAA-AA----A-A-A-CAAAACTCT--A--AA----------GTG---------TT---------T---------AG---------A-------A-CT---------T---------------A---------TGACCGTCAAT-G------A--A---AAAA-------GGGGT----TTTTTT-TAACG-A-GTACTC-G-A-----CTAAG----AAA--A-A---A-TTAGT-AG-AT--GATC-G----A-TT-------CG-AG--C-GA--G-TGATA-G-TCGA-GTACTCG
gi|86695                      :                                                                                                                                                                                                                                               -ACC--T--TTAC-A-TGGTT-TT---A--CT-C--AC-AT----A-A-A-CA-----TA--G--AA----------CTG---------TT---------T---------AA---------G-------A-TT---------T---------------ATAAACTTTAC---------T-GT-----A--A---AAC--------GG--A----TATTTT-TAACG-A-GCACTC-G-A-----CTAAG----AAA--A-A---T-TTAGT-TG-AT--GATC-A----T-TA-------CG-AC--C-GA--G-CGATA-G-TCGA-GTACTCG
gi|86697                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           aaattgacggttttta-TAACG-A-GTACTC-G-ACCTATGTCTA----AAA--------T-TTAGT-CG-AT--CATC-GA---A-TA-------TG-ACGTC-TG--G-CGTTA-G-TCGATGTA
gi|86696                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tATG-A-GTACTT-G-A-----CT-------AAG--A-TATAT-TTAATACG-AT--GATC-G----GATA-------CG-AC--C-GA--G-CAATATG-TCGA-
gi|86698                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 tttacttaaagctatattttatcaacacaaccaagtgtttgatttcattttaattcttacatgaaatcttaaattttacc-A-GTACTC-G-A-----GTATG----AAA--------T-TTAGT-CG-AT--GATC-G----G-TA-------CG-AC--C-GA--G-CGATA-G-TCGA-GTA-TCG
gi|86699                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       G----AAA--A-A---T-TCAGT-CG-AT--AATC-G----G-TA-------CG-AC--C-GA--G-CGATA-T-TTGA-GTACCCG

lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                                                                 1111111111   33333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333333                                                                                                                                                       
lowQualScore                  :       3   22  1 2222    2  11    1 11 33 11      2  666    4444444444 11 44  1   2  3  11    1      444444   333333  2222 1  33  1 4 1  777777  22  1 22 1 33333  1     1      1    55     1  1   222    1 222  2 1 2    22   22    33  22  1 3    555   444   1  1  222 22   22  3  3333 1  4  3333333333   44444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 6666  777777 5555 4 3 22 33 1 1     1  22   2 1      1 1 33    666   11 5 1 2222    1  2   22  1  4444 2  4444444  1  33 1  33 1     1 1    1       
lowQualScore                  :       .   ..  . ....    .  ..    . .. .. ..      .  ...    .......... .. ..  .   .  .  ..    .      ......   ......  .... .  ..  . . .  ......  ..  . .. . .....  .     .      .    ..     .  .   ...    . ...  . . .    ..   ..    ..  ..  . .    ...   ...   .  .  ... ..   ..  .  .... .  .  ..........   .............................................................................................................. . ....  ...... .... . . .. .. . .     .  ..   . .      . . ..    ...   .. . . ....    .  .   ..  .  .... .  .......  .  .. .  .. .     . .    .       
lowQualScore                  :       0   00  4 8888    6  88    2 77 00 77      4  222    6666666666 77 11  2   3  4  66    1      444444   666666  7777 2  88  6 8 6  555555  11  5 11 5 88888  5     5      5    11     5  5   777    5 666  9 4 9    00   00    44  99  5 0    999   444   5  5  777 11   11  1  3333 5  6  3333333333   11111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 5 3333  555555 4444 0 1 11 77 5 5     4  00   8 4      4 4 00    666   99 8 4 1111    4  9   00  4  5555 9  6666666  4  55 5  55 5     5 5    5       
consensus                     : ATATTT-CAC--CG-G----TTTT-CC--ATCA-T--G--A--GATCTT-TT---AAAG----TG----T--G--CC-CAT-AC-AG--TGGA-TTTCAG------AGG------CA----T-GT--TT-A-C-TG------AC--CA-A--C-A-----TC-CAAAC-TCAAAT-GATTN-ATTTG-AA-CAT---GAAC-G---AA-T-T-AAAA--CTG--GTTT--AA-CTT-T-ACCT--TTAC-A-TGA-TT-TT---A--CTC--AC-AA----A-AG-CA-----CC---GAA----------TTG---------TG---------T---------AA---------A-------ATC---------T---------------A---------C---------T-G----AA------A----AAA-G--G--C-T-ATTTT-TA--ACG-A-GTACTC-G-A-GTATG---AAA--ATT-T----TAGT-CG-ATG--AT-CG----G-TA-------CG-AC--C-GA--G-CGATA-G-TCGA-GTACTCG
Reference ( family-469 )      : ATATTT-CAC--CG-G----TTTT-CC--ATCA-T--G--A--GATCTT-TT---AAAG----TG----T--G--CC-CAT-AC-AG--TGGA-TTTCAG------AGG------CA----T-GT--TT-A-C-TG------AC--CA-A--C-A-----TC-CAAAC-TCAAAT-GATTN-ATTTG-AA-CAT---GAAC-G---AA-T-T-AAAA--CTG--GTTT--AA-CTT-T-ACCT--TTAC-A-TGA-TT-TT---A--CTC--AC-AA----A-AG-CA-----CC---GAA----------TTG---------TG---------T---------AA---------A-------ATC---------T---------------A---------C---------T-G----AA------A----ANA-G--G--C-T-ATTTT-TA--ACG-A-GTACTC-G-A-GTATG---AAA--ATT-T----TAGT-CG-ATG--AT-CG----G-TA-------CG-AC--C-GA--G-CGATA-G-TCGA-GTACTCG
gi|86655                      : ATATTT-CAC--CT-G----TTTT-CC--ATCA-T--G--A--GACATT-TT---AAAG----TG----T--G--CC-CAT-AC-AG--TGAA-TTTCAG------AGG------CA----T-GT--TT-A-C-TT------AC--CA-A--C-A-----TC-CAAAC-TCAAAT-GATTC-ATTTG-AA-CAT---GAAC-G---AA-T-T-AAAA--CTG--ATTT--AA-CTC-T-ACCT--TTAC-A-TGA-TT-TT---A--TTC--AC-AA----A-AG-CA-----CT---GAA----------TTG---------TG---------T---------AA---------A-------ATC---------T---------------A---------C---------T-G----AA------A----ATA-G--G--C-T-ATTTG-TA--ACG-A-GTACTC-G-A-GTTTG---AAA--ATT-T----TAGT-CG-ATC--AT-CG----G-TA-------CG-AC--C-GA--G-CGATA-G-TCGA-GTACTCG
gi|86656                      : ATATTT-CAC--CT-G----TTT---C--ATCA-T--G--A--GACATT-TT---AAAG-----G----T--G--CC-CAT-AC-AG--TGAA-TTTCAG------AGG------CA----T-GT--TT-A-C-TT------AC--CA-A--C-A-----TC-CAAAC-TCAAAT-G-TTC-ATTTG-AA-CAT---GA-C-G---AA-T-T-AAAA--CTG--ATTT--AA-CTC-T-ACCT--TTAC-A-TGA-TT-TT---A--TTC--AC-AA----A-AG-CA-----CT---GAA-----------TG---------TG---------T---------AA---------A-------ATC---------T---------------A---------C---------T-GA---AA------A----ATA-G--G--C-T-ATTTG-TA--ACG-A-GTACTC-G-A-GTTTG---AAA--ATT-T----TAGT-CG-ATC--AT-C-----G-TA-------CG-AC--C-GA--G-CGATA-G-TCGA-GTACTCG
gi|86657                      : ATATTC-CAT--CG-G----TTTT-CC--ATCA-T--G--A--GATCTT-TT---AAAG----TG----T--G--CC-CAT-AC-AG--TGAA-TTTCAG------ATG------CA----T-GT--TT-A-C-TG------AC--CA-A--C-A-----TC-CAAAC-TCAAAT-GATTA-ATTTG-AA-CAT---GAAC-G---AA-T-T-ACAA--CTA--ATTT--AA-ATT-T-ACC----------TGA-TT-TT---A--CTC--AC-AA----A-AG-CA-----CC---GAA----------TAG---------TG---------T---------AACATCTTTATA-------ATC---------T---------------A---------C---------T-G----AA------G----AAA-G--G--C-T-ATTTT-AA--ACG-A-GTACTC-G-A-GTATG---GAA--ATT-T----TAGT-CG-ATG--AT-CG----G-TA-------CG-AC--C-GA--GCCGATA-GATCGA-GAACTCG
gi|86658                      : ATATTT-CAC--CG-G----TTTT-CC--ATCA-T--G--A--GATCTG-TT---AAAG----TA----T--G--CC-CAT-AC-AG--TGGA-TTTCAG------AGA------TA----T-G
gi|86659                      : ATATTT-CAT--CG-G----TTTT-CC--ATCA-T--G--A--GATCTT-TT---AAAG----TG----T--G--CC-CAT-AC-AG--TGGA-TTTCAG------ATG------CA----TTGT--TT-A-C-TG------AC--CA-A--C-A-----TC-CAAAC-TCAATA-GATTA-ATTTG-AA-CAT---GAAC-G---AA-T-T-ACAA--CTA--ATTT--AA-ATT-T-ACCT----------GA-TT-TT---A--CTC--AC-AA----A-AGGCA-----CC---GAA----------TAG---------TG---------T---------AACATCTTTATA-------ATC---------T---------------A---------C---------T-G----AA------A----AAAAG--G--C-T-ATTTT-TA--ACG-A-GTACTC-G-A-GTATG---AAA--TTT-T----TAGT-CG-ATG--AT-CG----G-TA-------CG-AC--C-GA--G-CGATA-G-TCGA-GTACTCG
gi|86660                      : ATATTT-CAT--CG-G----TTTT-CC--ATCA-T--G--A--GATCTT-TT---AAAG----TG----T--ATACC-CAT-AC-AG--CGAA-TTTTAG------ATG------CA----T-GT--TT-A-C-TG------AC--CA-A--C-A-----TC-CAAAC-TCAAAT-GATTA-ATTTG-AA-CAT----AAG-G---AA-T-T-ACAT--CTA--ATTC--AA-ATT-T-ACCT----------GA-TT-TT---A--CTC--AC-AA----A-AG-CA-----CC---GAA----------TAG---------TG---------T---------AACATCTTTATA-------ATC---------T---------------A---------C---------T-G----AA------A----AAA-G--G--C-T-ATTTT-TA--ACG-A-GTACTC-G-A-GTATG---AAA--ATT-T----TAGT-CG-ATG--AT-CG----G-TA-------CG-AC--C-GA--G-CGATA-G-TCGA-GTACTCG
gi|86661                      : ATATTT-CAC--CG-G----CTTT-CT--ATCA-T--G--A--GATCTG-TT---AAAG----TA----T--G--CC-CAT-AC-AG--TGGA-TTTCAG------AGA------TA----T-G
gi|86662                      : ATATTT-CAC--CC-G----TTTT-CC--ATCA-T--G--A--GATATT-TT---AAAG----TG----T--G--CC-CAT-AC-AG--TGAA-TTTCAG------CGG------AT----T-GT--TT-A-C-TG------AC--CA-A--C-A-----TC-CAAAC-TCAAAT-GATTC-ATTTG-AA-AAT---GAAC-G---AA-T-T-AAAA--CTG--GTTT--AA-CTT-T-ACCT--TTAC-G-TGA-TT-TT---T--TTC--AC-AA----A-AG-CA-----CT---GAA----------TTG---------T----------T--------------------A-------ATC---------T---------------A---------C---------T-G----AAT-----A----ATA-G--G--C-T-ATTTG-TA--ACG-A-GTACTC-G-A-GTTTGA--AAA--ATT-T----TAAT-CG-ATC--AT-TC----G-TA-------CG-A
gi|86663                      : ATATTTACAC--CG------TTTT-CC--ATCA-T--G--AACGATATT------AAAG----TG----T--G--CCGCATTAC-AG--TA-A-TTTCAC------GGA------TT----T-GT--TT-A-C-TGA-----AC--CA-A--C-A-----TC---AACATCAAAT-GATTC-ATTTG-AA-AAT---GAACGG---AA-T-T-AAAA--CTG--GTTT--AA-CTT----CCT--TTAC-G-TGATTT-TT---T--TTC--ACAAA----A-AG-CA-----TCTGGGAT----------TTG---------TG---------TA--------AA---------A-------ATC---------T---------------A---------C---------T-G----AA------A----ATA-G--GC-C-T-ATTTG-TA--ACG-A-GTACTG-A-G-GTTTGA--AAA--ATT-T----TAAT-CG-ATC--ATCCG----G-TA-------C--AC--C-GA--G-CGATA-G-TCGA-TAACTCG
gi|86664                      : ATATTC-CAC--CG-G----TTGT-CC--ATCAAT--G--A--GATCTG-TT---AA-G----TA----T--G--CC--AT-ACCAG--TGGA-TTTGAG------A
gi|86665                      : ATATTT-CAT--CG-G----TTTT-CC--ATCA-T--G--A--GATCTT-TT---AAAG-----G----T--G--C---AT-AC-AG--TGAA-TTTCAG------ATG------CA----T-GT--TT-A-C-TG------AC--CA-A--C-A-----TC-CAAAC-TCAAAT-GATTA-ATTTG-AA-CAT---GAAC-G---AA-T-T-ACAA--C-A--GATT--AA-ATT-T-ACC----------TGA-TT-TT---A--CTC--AC-AA----A-AG-CA-----CC---GAA----------TAG---------TGAAACATCTTT---------AT---------A-------ATC---------T---------------A---------C---------T-GA---AA------A----AAA-G--A--C-T-ATTTT-TA--ACG-A-GTAC--------TGTG---GAATCATT-T----TAAT-
gi|86666                      : ATATTT-CAC--CA-G----TTTT-CC--ATCA-T--G--A--GATCTG-TT---AAAG----TA----T--G--CC-CAT-AC-AG--TGGA--TTCAG------AGA------TA----T-G
gi|86667                      : ATATTTGCAT--CG-G----GTTT-CC--ATCA-TCTG--A--GATCTT-TT---AAAGA---TG----T--G--CC-CAT-AC--G--TGAAATTTCAG------A--------CA------GT--TT-AAC-TGG-----AC--CA-A--C-A-----TC-CAAAC-TCAAAT-GATT--ATTTG-AA-CAT---GAAT-G---AAAT-T-ACAA---TA--ATCT--AA-ATTAT-ACCT----------GA-TTATT---A---TC--AC-AA----A-AG-CAA----CC---GAA----------TAG---------TGACATCT---T---------AT---------A-------ATC---------T---------------A---------C---------T-G----AA------A----A-A-G--G--CAT-ATTTT-TA--ACG-A-GTACTCGG-A-GTATG---AAC--ATTGT----TAGT-CGAATG--AT-CG----A-TA-------CG-A---C-GA--G-CGATA-G-TCGA-GTCCT
gi|86668                      : ATATTT-CAT--CGCG----TTTT-CC--ATCA-T--G--A--GATCTCGTT---AAAG----TA----T--GA-CC-CAT-AC-AGAATGGA-TTTCAG------A
gi|86669                      : ATATTT-CAC--CG-G----TTTT-CC--ATCA-T--G--A--GAACTG-TT---A----------------------CAT-AC-AG--TGGA-TTTCAG------AGA------TA----T-Gcgaat
gi|86670                      : ACATTT-CAC--TG-G----TTTT-CC--ATCA-T--G--C--GATC-----------------------------C-CAA-AC-AG--TGGA-TTTCGG------AGG------CA----T-GT--T--------------------------------------AT-TCAAAT-AATTT-ATTTG-AA-CAT---GAAC-G---AA-T-TAAAAA--CCC--GTTT--GA-ATT-T-ACCG--TTAC-A-TGA-TT-TT---A--CAC--AC-AA----A-AA-CA-----AT---GAAGTGT------TTGGAATT----TA---------T---------AA---------A-------CTT---------T---------------A---------C---------T-G----AA------A----AAA-G--G--C-T-ATTTT-TA--ATG-A-GTACTC-G-A-CTAAG---AAA--AAT-T----AAGT-CG-ATG--AT-CG----G-AA-------AG-AC--C-GA--A-CGATA-G-TCGA-GTACTCGacagttcaatttcataattcatatataatgtatacatg
gi|86671                      : ACATTT-CAC--TG-A----TTTT-CC--AT------G--A--GATC-----------------------------C-CAA-AC-AG--TGGA-TTTCGG------AGG------CA----G-GT--TTTA-C-GG------AC--CA-A--C-AATTAATT-GAAAC-TCAAAT-AATTT-ATATG-AA-CAT---GAAT-T---AA-T-T-AAAT--CCC--GTTT--CA-ATT-C-ACAT--TTAC-A-TGA-----------------AC-AACGTGA-GG-TG-----TTTG-GAA----------TT----------TA---------T---------AA---------A-------CTT---------T---------------A---------C---------T-G----AA------A----AGG-G--A--G-A-ATCTT-TA--ACG-A-ATACTC-G-A-CTAAG---AAA--AAT-T----TAGT-CG-ATG--AC-CG----A-TA-------CG-AC--C-AA--G-CGATA-G-TCGA-GTAATCG
gi|86672                      : ATATCT-AAC--TG-G----TTTT-CC--GTCA-T--G-----GATCTT-TTTA-AAAG----TA----T--GC-CC-CAT-ACAAG--TGGA-TTTCGG------AGG------TA----T-G
gi|86673                      : ATATTT-CAC--TG-G----TTTT-CC--ATCA-T--G--G--GATCTT-TTT--AAAG----TA----T--G--CC-CAT-AC-AG--TGGA-TTTCGG------AGG------TA----T-G
gi|86674                      : ACATTT-CAC--TG-GGTTTTTTT-TC--ATCA-T--G--C--GATC-----------------------------C-CA--AC-AG--TGGA-TTTCGG------ATG------CA----T-GT--TG-A-T-TG------A---------------------------------------ATTTG-----------AAC-G---AA-T-T-AAAA--TCC--GTTT--GA-TAT-C-ACCT--TTAC-C-TGA-TT-TT---A--CTC--CT-AA----A-AA-CA-----CT---GAA----------GTG---------TT---------T---------GG---------A-------ATCTATTAACTTT---------------A---------C---------T-G----AG------A----AGG-G--G--C-T-ATTTT-TA--ACGCA-GT
gi|86675                      : ATATT--CAT--CG-G----TTTT-GC--TTCA-T--G--A--GATTGT-TT---AAAG----TG----T--G--CC-CAT-AC-A---TGAA-TTTCAG------ATG------CA----T-GT--TT-A-C-TG------AC--CA-A--C-A-----TC-CAA-C-TCAAAT-GATTA-ATTTG-AA-CAT---GAAC-T---GA-T-T-ACAA--CTGTAATTTTAAA-TTT-T-ACCT--T-------GA-TT-TT---AACCTC--AC-AA----A-AG-GA-----CCC--GAA----------TAGA--------TG-------------------AA---------C-------ATC---------TTTTATAATT------A---------C---------T-G----AA------A----AAA-GCAG--T-TTAGTTT-TA--ACG-A-GTACTC-G-A-GTATG---AAA--AAT-T----TAGT-CG-ATG--AT-CG----G-TA-------CG-AC--C-GA--G-CGATA---TCTA-GTACTC
gi|86676                      : tTATTT-CAT--TG-G----TTTT-CC--ATCA-T--G--A--GATCTT-TT---AAAG----TG----T--G--CC-CAT-AC-AG--TGAA-TTTCAG------ATG------CA----T-GT--TT-A-C-TG------AC--CA-A--C-A-----TC-CAAAC-TCAAAT-GATTA-ATTTG-AA-CAT---GAAC-G---AA-T-T-ACAA--CTA--ATTT--AA-ATT-T-ACCTGATTTC---TGA-TT-T
gi|86677                      :   ATTT-CAT--CA-G----TTTTTCC--ATCA-T--G--A--GATCTT-TC---AAAG----T-----T--G--CC-CAT-A--AG--TGGA-TTTCAG------AGG------CATGTTT-GT--TT-A-C-TG------AC--CA-A--C-A-----TC-C------------------ATTTG-AA-TAT---GAAC-G---CA-C-TAAAAA--CTG--GTTT--A
gi|86678                      :    TTC-CAC--CG-T----TTTT-CC--ATCA-T--G--A--GATACT-TT---AAAG----TG----T-----CC-CATTAC-AG---GGA-TTTAAG------AGG------CA----T-GT--TT-A-C-TGTACATTAC--CA-A--C-A-----TC-CAA-C-TCAATTTGATTCCATATG-AA-CAT---GAAC-G---AA-T-T-AAAAAACTG--GTTTC-AA-CTT-T-ACCT--GTAC-A-TCA-TT-T----A--TTC--ACCAA----A-AG-CAA----CT---GAA----------TTG---------TG---------T---------AA---------A-------ATC---------T---------------A---------C---------T-G----AA------A----ATA-G--G--C-T-A-TTT-TA--GCGAA-GTACTC-G-A-GTTTG---AAA--ATT-T----TAGT-CG-ATC--AT-CG----G-TA-------CG-AC--CTGA--A-CGATA-G-TCGA-GTACTCG
gi|86679                      :    TTT-CAT--CG-G----TTT-----------------------CTT-TT---AAAG----TG----T--G--CC-CAT-AC-AG--TGCA-TTTCAG------ATG------CA----T-GT--TT-A-C-TG------A---CA-A----A-----TC-CAA---TCAAAT-GATTA-ATTTG-AA-CAT---GAAA-G---AA---T-ACAA--CTA--ATTT--A---TT-TAACCT-----------A-TT-TT---A--CTC--AC-AA----A-G---A-----CC---GAA----------TAG---------TG---------T---------AA---------ATATTTATATC---------T---------------A-------------------T-G----AA------A----A-A-G--G--C-T-A-TTT-TA--ACG-A-GTA-TC-G-A--T-TG---AAA--ATT-T----TAGT-CG-ATG--AT-CG----G-TA--------G-ACA-C-GGC-G-CGATA-G-TCGA-GTA
gi|86680                      :    TTT-CATTGCG-G----TTTT-TCCTATCA-T--GTGA--GATTCT-TTCCGAAAGAGAATG----TCTG--CC-CAT-GA-AG--TGGA-TTTCAGT-----AGG------CA----T-GTG-TT-AGC-TG------ACGGCA-ATTC-A-----TCGCAAAC-TCAAGC-TATTC-ATTTG-A
gi|86681                      :     TT-CAC--CG-G----TTTTTCC--ATCA-T--G--A--GATATG-TT---AAAG----TA----T--G---C-CAT-ACAAG--T-GA-TTTCGG------A
gi|86682                      :                 ----TTTC-TC--ATAA-T--GT-A--CATTTCACT---AAAG----TA----C--T--CC-TA--AC-AA--TGAA-TTTCGG------AGT------CA----T-AT--TT-A-CAT--------T--CAGA--C-A-----TC-CAAAC-TAAAAT-GATTT-CTTTG-AG-CAA---GAAT-G---GA-T-T-AAAA--CTG--GTTT--GA-CAT-T-ATTT--TTAC-A-CGA-TT-TT------------C-GG----A-AG-CATT---TT---GAA----------TTA---------TG--------------------A---------A-------CTT---------T---------------A---------T---------TAG----AAT-----A----ATA----G--C-T-ATTTT-TG--ATA-A-GCACTT-G-A-CTATG---AAA--TTT-T----TTGT-CG-ATG--AT-CA----G-CA-------TG-AC-----A--G-CGAT----TCGA-GTACTCGt
gi|86683                      :  ttcattaaa--CG-G----TTT--CA--ATCA----G--T--GATCTT-TTT--AAAG----TA----T--G--CC-CCT-AC-AG--TGGA-TTTCAGCGGGGCAGGGGGGCACA----T-GCACTT-ATC-TG------AC--CA-A--C-A-----TC-CAAAC-TCAAAT-GATTT-ATTTGAAA-CAT---GAAC-G---AA-T-T-CAAA--TTG--GTTG--GACCTT-T-ACCT--TTAC-ATTGA-TT-TT---A--CTT--AC-AA----ACAG-CA-----CT---GAAAGTGTTAACTTTA---------TG-------------------AA---------A-------ATT---------T---------------A---------C---------T------AC------A----AGG-G--G--C-T-ATTTT-----ACG-ACGTACTC-G-T-GTATGA--AAA--ATT-T----TAGC----ATG--AT-CG----G-TAGAACACCCGTAC--C-GA--G-CGATA-G-TGGA-
gi|86684                      :               -G----TTTT-CC--ATCA-T--G--A--GATCTT-TC---AAAG----T-----T--G--CC-ACT-A--AG--TGGA-TTTCAG------AGG------CA----T-GT--TT-A-C-TG------AC--CA-A--C-A-----TC-CAAAC-TCAAAT-GATTC-ATTCG-AA-TAT---GAAC-G---AA-C-T-AAAA--CTG--GTTT--AA-CTT-T-ACCT--TTAC-A-TGA-TT-TT---A--CTC--AC-AA----A-AG-CA-----TT---GAA----------TTG---------TG---------T---------AA---------A-------ATC---------TTTAAAA---------A---------CTTCA-----T-G----AA------A----AAA----G--C-T-ATTTT-TA--ACG-A-GTAATC-G-A-GTATG---AAA--ATT-T----TAGT-CG-ATG--AT-CG----G-TA-------CG-AC--C-GA--G-CGATA-G-TCGC-GTACTCG
gi|86685                      :                         -CC--ATCG-T--G--A--CATCTT-TT---GACA----TAACAAT--G--TT-CAA-AC-AA--TGGA-TATTGG------AGG------C------------------------------CA-A--C-G-----TC-CAAAT-TCAAAT-GATTT-ATTTG-AA-CAT---ATAT-G---AA-T-T-AAAA--TCG--CTTA--AA-CTT-T-ACCT--TTAC-A-TGA-TC-AT---G--TTT--AT-AA----A-AA-CA-----CA---GAA----------GTGTTTAGAATTTA---------T---------AA---------A-------CTT---------T---------------A---------C---------T-G----AA------A----AAA-A---------AAATT-TA--ACG-A-GTGCTC-G-A-CAATG---CAA--AAT-T----TAGT-CT-ATG--AT-CG----G-TA-------CG-AT--C-GA--G-CGATA-G-TCGA-GTTCTCG
gi|86686                      :                               TCA-C--A--G--GTTCTT-TT---AAAG----TG----T--G--CC-CAT-AC-AG--TGGA-TTTCAG------AGG------CA----T-G
gi|86687                      :                                                TT-TT---AAA-----TG----T--G--TC-CAA-AC-----CGGA-TTTCGG------AGG------CA----T-AT--TT-A-T-AG------AC--CG-A--C-A-----CC-CAAAC-TCCAAT-GATTT-ATTTG-AA-CAT---TAAT-A---AA-T-C-AA
gi|86688                      :                                                                              -CAA-AC-AT--TGGA-CTTCAG------AGG------CA----T-GT--TT-A-C-AT------AC--CG-A--C-A-----TC-CAAAC-TCAAAT-GATTT-ATTCA-AA-CAT---GTAC-A---AA-T-C-AAAA--CTG--GTTT--GA-CTT-T-ctaat
gi|86689                      :                                                                                  -AC-CG--TGGA-TTTCAG------AGG------CA----T-GT--TT-A-C----------C--CA-A--TTA-----TT-TAAAC-TCAAGT-GATTT-ATTTG-AA-CAT---GTAC-G---AA-T-T-CAAA--CTG--GTTA--GA-CTT-T-ACCT--TTAC-A-TGA-TT-TT---A--CTT--AT-AA----A-AG-CA-----CT---AAA----------GTG---------TT---------TAAAATTTTAAA---------A-------ATT---------T---------------A---------C---------T-G----AA------A----AA-----G--C-T-ATATT-TA--ACG-A-GTACTC-G-A-GTATG---AAA--ATT-T----TAGT-CG-ATG--AT-CG----C-TA-------CG-AC--C-GA--C-CGATA-G-TTGA-ATACTCGtcgtgaatta
gi|86690                      :                                                                                                                                         ------AC--CA-A--C-A-----TC-CAAAC-TCAATT-GATTC-ATATG-AA-CAT---GAAC-G---AA-T-T-AAAA--CTG--GTTC--AA-CTT-T-ACCT--GTAC-A-TGA-TT-TT---A--TTC--AC-AA----A-AG-CA-----CT---GAA----------TTG---------TG---------T---------AA---------A-------ATC---------T---------------A---------C---------T-G----AA------A----ATA-G--G--C-T-ATTTT-TA--GCG-A-GTACTC-G-A-GTTTG---AAA--ATT-T----TAGT-CG-ATC--AT-CG----G-TA-------CG-AC--T-GA--G-CGATA-G-TCGA-GTACTCG
gi|86691                      :                                                                                                                                                                                      -ATCTG-AAACATTCCGAAT-GGATAA-T-T-CAAA--CGA--GTTT--GA-CTT-T-ACTT--TTAC-A-TGA-TT-TT---A--CTC--AC-AA----A-AACCA-----CC---GAG----------GTG---------TT---------T---------AG---------A-------ATTTAGGAACA-T---------------A---------C---------T-T----AA------A----AAA-G--G--T-T-ATCTT-TG--ATG-A-GTACAC-G-A-CTATG---AAA--A----AAAATAGT-CG-ATG--AT-CGATACG-TA-------CG-AC--T-GA--G-CGATA-G-TTGA-GTACTTG
gi|86692                      :                                                                                                                                                                                                                                                           a-TGA-TT-TTTTAA--CTT--CC-AA----A-A--C------CT---GAA----------GCG---------TA---------T---------ATTGT------A-------ATT---------T---------------A-------------------T-G----AACTTAATACTTTAGA-A--G--C-T-ATTTTCTA--A---A-GGACTC-G-A-TTATG---AAA--A-T-C----TAGT-CG-ATGATAT-CG----GCTA-------TG-GC--C-CA--G-CGA-A-G-TCGA-
gi|86693                      :                                                                                                                                                                taaacattagaacattataaatgaatttcccactgatttAAC-G---AAGTGT-AAAA--CTG--GTTT--AA-CTT-TCACCTA-TTACTA-TGA-TT-TT---A--CTC--AC-AA----A-AGGCA-----TTTG-AAA----------TTG---------TG---------T---------AA---------A-------ATC---------TTTTGAACAAGAAAGAA---------C---------T-GCATGAA------ACC--AAATG--G--C-T-ATTTT-TA--ACG-A-GTACTC-GAA-GTATG---AAA--A-T-T----TAGT-CGTATG--AT-CG----T-AA-------CG-AC--C-GACGG-CGATA-G--CGA-GTAC
gi|86694                      :                                                                                                                                                                                                                 -T-T-AAAA--CCG--GTTT--TA-ATT-T-ACCT--TTAC-A-TGA-TT-TT---A--CTGGAAA-AA----A-AA-CAAAACTCT---AAA----------GTG---------TT---------T---------AG---------A-------ACT---------T---------------A---------TGACCGTCAAT-G----AA------A----AAA-G--GGGT-T-TTTTT-TA--ACG-A-GTACTC-G-A-CTAAG---AAA--AAA-T----TAGT-AG-ATG--AT-CG----A-TT-------CG-AG--C-GA--G-TGATA-G-TCGA-GTACTCG
gi|86695                      :                                                                                                                                                                                                                              G--GTTT------TT-A-ACCT--TTAC-A-TGG-TT-TT---A--CTC--AC-AT----A-AA-CA-----TA---GAA----------CTG---------TT---------T---------AA---------G-------ATT---------T---------------ATAAACTTTAC---------T-G----TA------A----AAC-G--G--A-T-ATTTT-TA--ACG-A-GCACTC-G-A-CTAAG---AAA--AAT-T----TAGT-TG-ATG--AT-CA----T-TA-------CG-AC--C-GA--G-CGATA-G-TCGA-GTACTCG
gi|86696                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        aaattgacTTT-TACCATG-A-GTACTT-G-A-CTAAG---ATA--TAT-T----TAATACG-ATG--AT-CG----GATA-------CG-AC--C-GA--G-CAATATG-TCGA-
gi|86697                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tttacttaaagctatattttatcaacacaaccaagtgtttgatttcattttaattcttacatgaaatcttaaaT-TA--ACG-A-GTACTC-G-ACCTATGTCTAAA--A-T-T----TAGT-CG-ATC--AT-CGA---A-TA-------TG-ACGTC-TG--G-CGTTA-G-TCGATGTA
gi|86698                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -A-GTACTC-G-A-GTATG---AAA----T-T----TAGT-CG-ATG--AT-CG----G-TA-------CG-AC--C-GA--G-CGATA-G-TCGA-GTA-TCG
gi|86699                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             G---AAA--AAT-T----CAGT-CG-ATA--AT-CG----G-TA-------CG-AC--C-GA--G-CGATA-T-TTGA-GTACCCG