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Reference ( gi|30305 ) : GTGATACAGAG-T-AAGT--TT--A-AT-----TG--TCAAAT--A---TAT------TATA----TGA-A--G-CGA-GCG-G--C---------AA----T--GTC-A--C-C-T-AG------GT---GC-A--C-A----TT--TA-T----T-G---CTAGAA-C---T-G-G--CCG-A--A---GTT----G----A-A--T-G--TA-AA-T------T-----TCC--AG-AC-AT---GAATTATG-AAGGG-C-TG--CTC-CGAGATTCGGTGA
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Reference ( family-465 ) : GTGATA-GAG-AGTTAG-T--T-T--A----A-CAGT-CAAAT--A----AA--T------T---A-T----TTGA-A--G-CG-A-----GCG---G--C---------AA----T--GTC-A--CC-T-AG------GT---GC-AC-A------TTNA-T---T-G---CTA--GAA-C---C-GG--CCG-A---A-GC--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------TCCAG-AC-AT---GAATTATG--A--AGGAC-TG--CTC-CGAGATTCGGTGA
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gi|30312 : GTGATA-CTG-AGTTGG-T--T-T--A----A-TTGT-CAAAT--A----AC--T------T---A-T----TTGA-A--G-CG-G-----GTG---G--C---------AA----T--GTC-A--CC-T-AG------GT---GC-AC-A------TTTA-T---T-G---CTA--AAA-C---C-GG--TCG-A---G-GC--T-A----A-A--T-G--T---A-T-T----------TCCAG-AC-AT---GAATTATG--A--AGGAC-TG--CTC-GGAGATTCGGTGA
gi|30313 : GTGATA-CGG-ATTTAG-T--T-T--A----A-TAGT-CAAAT--A---------------T---A-T----ATGA-A--G-CG-A-----GCA---G--C---------AA----T--GTC-A--TAAT-AG------GT---GC-AC-A------TTAA-T---T-G---CTA--GAA-C---C-AG--CCA-T---A-GC--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------TTCAG-AC-AT---AAATTATG--A--AGGAT-GA--CTC-AGAGATTTGGTGA
gi|30314 : GTGATA-GAG-AGTTAG-T--T-T--A----A-CAAT-GAAAT--C----AC--T------T---A-T----TTGA-A--G-CG-A-----GTG---G--C---------AG----T--GTC-A--CC-T-AA------GT---GC-AC-A------TTAC-T---T-G---ATA--CAG-C---C-GG--CCG-A---A-GC--C-G----A-G--T-G--CT-TA-T-T----------TCCAG-AC-AA---GAATTATG--AATAGG---TG--CTC-CGAGATTCAGTG
gi|30315 : GTGATA-GAG-AGTTAG-T--T-T--A----A-CAAT-GAAAT--C----AC--T------T---A-T----TTG--A--G-CG-A-----GTG---G--C---------AG----T--GTC-AC-CC-T-AA------GT---GC-AC-A------TTAC-T---T-G---ATA--CAG-C---C-GG--CCG-A---A-GC--C-G----A-G--T-G--CT-TA-T-T----------CCCAG-AC-AA---GGATTATG--A--AGGAC-TG--CTC-CGAGATTCAGTG
gi|30316 : --T------T---A-T----CTGA-A--G-CG-A-----GCG---G--C---------AA----T--GTC-G--CC-T-AG------GT---TC-AT-ACATGTATCAA-T---T-G---CTA--GAA-C---C-GT--CCG-A---A-AA--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------TCCAG-AC-AT---GAATTATG--A--TGGAC-TG--CTC-CGAGATTCACTGA
gi|30317 : gtaataatgagttagtGTGATA-CTG-AGTTAG-T--G-T--A----A-TTGT-CAAAT--A----AC--T------T---A-T----TTGA-A--G-CG-A-----GCG---G--C---------A
gi|30318 : GTGATA-GAG-AGTTAT-T--T-T--A----A-CAAT-TAAATCCA----AA--T------T---A-T----TTGA-A--GGCG-C-----GTG---G--C---------AG----T--GTC-A--CT-G-AG------GC---TC-ATTA------TTAA-A---T-G---CTA--GAGGC---C-GA--CCA-A---A-GT--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------ACCAG-AC-AT---GAATTATG--A--ATGGC-TG--CTC-CGAGATTCAGGGA
gi|30319 : GTGATA-GAG-AGTTAA-T----------------G---AAAT--C----AC--T------T-----T----TTGA-A--G-CG-A-----GTG---G--C---------AG----T--GTC-A--CT-T-AA------GT---GC-AC-A------TTAC-T---T-G---ATA--CAG-C---C-G---CCG-A---A-GG--C-C----A-G--T-G--CT-TA-T-T----------CCCAG-AC-AA---GGATTATG--A--AGGAC-TG--CTC-CGAGATTCAGTG
gi|30320 : GTGGTA-ATG-AATTAG-T--T-TTAA----A-AAGT-TAAATC-G----AA--C-------------------GA-ACTG-CG-A-----TCG---G--C---------AG----T--GTC-A--CT-T-GA------CT---GC-AC-A------TTAA-T---T-G---CTA--GAA-C---T-GG--CCG-A---T-AC--T-G----A-A--T-A--TA-TA-T-T-------------------AT------TT--------AGAAC-TG--CTC-CGAGATTCGGTGA
gi|30321 : GTGATAAGAG--GTTAG-T--T-T--A----A--AAT--GACT--C----AC--T------T---A-T----TTGA-A--G-CG-A------CGT--G--C---------AG----T--GTC-A---C-T-A-------GT---GCTAC-A------TTGG-C---T-G---TCA--G-------C-GG--CCG-----A-GC--C-G----A-G--T-G--CT-TA-T-T----------T-CAGCACAAG---GAATTACGCAA--GGGAC-TG--CCCTCCAGATTCAGTG
gi|30322 : GCGATA-GAG-AGTTAG-TCCT-T--A----G-TAAT-CCAAT--C----AA--T------T---A-TG---TTGA-A----CG-A-----GCG---G--C---------A-----T--G---A--CT-T-AG------TT----C-AT-A------TCAA-T-----G---CTA--GAA-C-----GG--C-G-A---A-TC--TAG----A-A--T-C--T-----T-C----------CTCA--ACGAT---GAATT--G--A--TGGAC-TG--CTC-CGATATTCGGTGA
gi|30323 : GTGATA-GAG-AGTTAG-T--T-T--A----A-CAAT-CAAAT--A----AA--T------T---A-T----CTGA-A--G-CA-A-----ACG---G--C---------AA----T--GT
gi|30324 : GTAATG-CAG-CATTAG-T--TCT---------TAGT-GATAC--A----GAGTT------T---G-T----TTGA-A--G-TG-A-----GCG---G--C---------AA----TCGGTC-A--CC-T-AG------AT---TT-TC-C------TTAA-T---T-G---CTA--AAA-T---C-GA--CCG-A---A-G
gi|30325 : GTGATA-GAG-GGTTAACT--T-C--A----A-CA-T-GAAAT--C----AC--T------T---ATT----TTGA-A--G-CG-A-----GTG---G--CGGGGGGACAAG----T--GTC-A--TA-TAAG------GT---GC-AC----------TA-T---A-A---CTT--GAA-TGCGC-GG--CCG-ACC-A-GC--C-C----G-A--T-----------------------------AT-AT---AGGTTATG-----AGGAC-TG--CAC-CGA-ATTCAGGGA
gi|30326 : GTGA-A-GAG-AGCTAG-T-------A----A--AAT-GAAAT--C----A---C------T---A-T----T-GA-G--A-CG-A-----GTG---G--C---------AG----TT-GTCCA--CC-T-AG-------T---GC-AC-A------TTAC-T---T-T---ATA--CAG-C---C-GG--CCG-ATCGATGC--C-G----G-AG-T-G--TT-A--T-C----------TCCA---C-AA---GG-TT-CG--A--AGGAC-TG--CTC-
gi|30327 : TGATA--AG-AGTTAG-T--T-T--ACATAA-CAGTTCAAAT--C----AA--T------T---A-TAAATCTGATA--G-CG-A-----ACA---G--C---------AAAT--T--GTC-A--CC-T-AG------GTAATGC-AT-A------T-AA-C---T-G---TTA--GAA-T---T-GA--CCA-A---A-GC--T-G----C-A--T-GATTT-AA-T-T----------TGCAG-AC-ATCATGGATTATG--A--AGGAC-TG--CTC-CAAGATTCGGTGA
gi|30328 : TGATA-GAA-AGTTCG-T--T-T--A----G-CAGT-CAAAT--C----AC--A------T---A-C----CTGA-A--G-CG-A-----ACG---A--C---------------T--GTA-AAGCG-T-AC------GT------AC-A------TTAA-TAAAT-AGGCCTA--GAA-C---T-GG--CTG-A---A-GT--T-G----A-A--T-G--TG-TA-C-T----------TCCAG-AC-AT---GAATTATG--A--AGACC-TA--CTCAAAAGATTTAGCGA
gi|30329 : TGATA-GAG---TAAG-T--T-T--A----A-CAGT-TCAAT--A----AC--T------T---A-T----TGGA-A--G-TG-A-----ACG---G-------------------------------T-TG------AT---GT-AA-A------TTAA-A---T-A---CTA--AAG-C---C-AG--CCA-A---A-GT--T-G----A-G--T-G--TG-AA-T-T----------TCCAG-AC-TT---G---TATG--A--AAAAC-TG--CTT-TAAGATTCGG
gi|30330 : tgataaTGATA-GGC-GATTAG-T--T-T--A----A-CAAT---GAT--C----AC--T------C---A-T----TTGA-A--G-CGAA-----GTG---GGCC---------AG----T--GT--A--CC-T-AA------GT---GC-AC-A------CT
gi|30331 : GATA-CGG-ATTTAG-T--T-T--A----A-TAGT-CAAAT--A---------------T---A-T----ATGA-A--G-CG-A-----GCA---G--C---------AA----T--GTC-A--TAAT-AG------GT---GC-AC-A------TTAA-T---T-G---CTA--GAA-C---C-AG--CCATA---A-GC--T-G----A-A--T-G--TA-AATT-T----------TTCAG-AC-AT---AAATTATG--A--AGG---TGGACTC-AGAGATTTGGTG
gi|30332 : GATAAGAGGAGTTAG-T--T-T--A----AACAATGTAAAT--C----AC--T------T---A-T----TTGA-A--GGCG-A------TG---G--C---------GAGAGTT--GTC-A--CC-T-AA------AT---GC-AC-A------TTAC-T---T------TA---CA-C---C-GG---CG-A---A-GG--C-G----AGA--T-GC-TT-AA-T-T----------TCCAG-AC-AA---GGA-TA-G--A--AGGA--TG----T-CGAGATTCAGTG
gi|30333 : TA-GAG-AGATAA-C--T-T--A----G-CACT-CAAAT--A----AC--T------C---A-C----CTAA-A--A-TG-A-----ACG---A--C---------CG----T--GTC-T--CC-A-CA------AT---GC-A-----------AA-T---T-G---CTA--GAA-T---T------TA-A---A-GG--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------TTCAG-AC-AT---GAAGTATG--A--GGAAC-TA--CCT-CGAGGTT
gi|30334 : A-GAG-AGCTGG-T--T-T--T----A--AAT-CAAGT--ACACTAA--C------TTTAA-T----TTAG-A--A-CG-AATACAGCG---T--A---------AA----T--GTCCA--CT-T-AGTG----AT---GC-AT-AGTAG--TTAA-T---T-G---CTA--GAA-C---TGGG--CCA-A---A-ACGAT-G----A-AG-T-G--TA-AA-T-A----------TCCAG-AC-
gi|30335 : G-AGTTAG-T--C----A----A-CAAT-CAAAT--C----AA--T------T---A-T----TTGA-A--G-CG-A-----G---------------------------------------AG------------------------TTAA-A---T-G---CTG--GAA-C---T-GG--CCA-A---A-GT--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------TCCAA-AC--------------------GGAC-TG--TTC-CGAGATCCGGTGA
gi|30336 : -T----TTGA-C--G-CA-A-----TCATATG--C---------AA----T--GTC-A--CC-T-A-------------C-AG-A--------AA-A---T-A---CGAAAGAA-CG--C-GG--CCG-A---ACGC--T-GT---A-A--TAG--CA-GA-T-T----------TTCAG-AC-AT---GAATTATGC-C--AGGACTTG--CT--CGAGATTCGGTGA
gi|30337 : GN-A--G-CG-A-----GCA---G--C---------AA----A--GTC-A--AC-T-AATTATAAGT---GC-AC-A------AT---T---T-G---CTG--GGT-T---T-GG--CTG-A---A-GT--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------TCCAA-AT-AT---GAATTATC--A--AGGAC-TG--CTC-CGAGATTCGGTGA
gi|30338 : A-A--G-CG-A-----GCA---G--C---------AG----T--GTC-A--CC-T-AG------GT---TC-AT-A------TAAAAG---T-G---CTA--GAG-G---C-AG--CCG-A---A-GT--T-G----A-A--A-T--TA-AA-T-A----------TCTAG-AC-AT---GA
gi|30339 : ---G--C---------AA----T--GTC-A--CC-T-AA------AT---AC-AA-A-----------------------A--GAA-C---C-GG--CCG-A---A-GC--T-G----A-A--T-G--CA-AA-T-T----------TCCAG-AC-AT---GAATTATG--A--AGGAC-TG--CTC-CGAGATTCGGTGA
gi|30340 : ---G--C---------AA----T--GTC-A--CC-T-A-------------C-AG-A--------AA-TA--C-G---AAA--GAA-C---C-GG--CCG-A---A-GC--T-G----A-A--T-G--CA-GA-T-T----------TTCAG-AC-AT---GAATTATG--A--AGGACTTG--CT--CGAGATTCGGTGA
gi|30341 : ---------AA----T--TTC-A--CT-T-AG------GT---GC-AT-A------TTTA-T---T-G---CTA--GAA-C---T-GA--CCG-A---A-GT--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------TCCAG-AC-AT---GAATTATG--A--AGGGC-TG--CTC-CGAGATTCGGTGA
gi|30342 : -A------TTAA-T---TCG---CTA--GAA-A---C-AG--ACA-A---A-GC--T-GC---A-A--T-G--TA-A--T-T----------TCCTG-AC-AT---TGATTAAA--A--AGGAC-TG--CTC-AGAGATTCGGTGA
gi|30343 : ------TTAA-T-----G---CTA--GGA-A---A-AGACCCA-A---A-GC--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------TT--G-AC-AT---GAA-TACA--A--AGGAC-T---CTC-AGAGATTTCGTG
gi|30344 : ---T-G---CTA--GAG-C---C-GA--CCG-A---A-GT--T-G----A-AATT-A--AA-AA-TATCCAGTCCGAATCCAG-AC-AT---GGATTATG--A--ATGAC-TG--CTC-CGAGATTCAGCGA
gi|30345 : tag---CTA--GAA-A---T-GG--CTT-A---A-GT--T-GCATGA-A--T-G--TG-AA-T-T----------TTCAA-AC-AC---AATTTATG--A--AGGAC-TG--CTC-GGAGCTTCGATGA
gi|30346 : -GC--T-G----A-A--T-A--TA-AA-T-C----------CCCAG-AC-AT---GAATTATG--A--AAGAC-
gi|30347 : gaagtgtgcccaacctCG-A---A-GC--T-G----A-G--T-G--TA-AA-T-T----------TCCAG------------TAATG--A--AGGGT-CG--CTC-TGAGATTCGGTGA
gi|30348 : -A--T-G--TATAA-T-T----------TCCAG-AC-AT---GAATTACG--A--AGTAC-CG--CCC-CGAGATTCGGTGA
gi|30349 : G-AT-AT---GAATTATG--A--AGGAA-TG--CTC-CGAGTTTCGGTGA
Alignments
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lowQualScore : . . . .. .. .... .. . .. ...... .. .. . .... . .. . . ..... ... .. ......... .... .. . .. . . ....... ... . .. ...... . ... . ... .. . ... . .. . ... . .. . .... . .. . .. .. . . .......... . . ... .. .. . .. .
lowQualScore : 9 4 4 99 88 8888 22 5 22 555555 22 88 2 9999 2 66 4 2 99999 111 55 333333333 9999 66 3 77 3 1 1111111 000 1 22 444444 1 000 1 888 44 1 000 1 55 1 444 1 55 1 5555 1 66 1 55 22 1 1 6666666666 0 1 888 66 55 2 55 2
consensus : GTGATA-GAG-AGTTAG-T--TT--A----A-CAGT-CAAATC-----AC-TT--A-T----TTGA-A--G-CG-A-----GCG---G--C---------AA----T--GTC-A--CC-T-AG------GT---GC-AC-A------TTAA-T---T-G---CTA--GAA-C---C-GG--CCG-A---A-GC--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------TCCAG-AC-AT---GAATTATG--A--AGGAC-TG--CTC-CGAGATTCGGTGA
Reference ( family-465 ) : GTGATA-GAG-AGTTAG-T--TT--A----A-CAGT-CAAATN-----AN-TT--A-T----TTGA-A--G-CG-A-----GCG---G--C---------AA----T--GTC-A--CC-T-AG------GT---GC-AC-A------TTAA-T---T-G---CTA--GAA-C---C-GG--CCG-A---A-GC--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------TCCAG-AC-AT---GAATTATG--A--AGGAC-TG--CTC-CGAGATTCGGTGA
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gi|30306 : GTGATA-GAG---TTAG-T--TT--A----A-AAAT-TAAGTC-----AA-TT--A-T----TTGA-A--A-CG-A-----GCG---G--C---------AA----T--GGC-A---------------GT---G--AA-A------T----T---T-A---CTA--GAA-
gi|30307 : GTGATA-CAG-AGTAAG-T--TT--A----A-TTGT-CAAATACATGTATCTT--A-T----ATGA-A--G-CG-A-----GCG---G--C---------AA----T--GTC-A--CC-T-AG------GT---GC-AC-A------TTTA-T---T-G---CTA--GAA-C---T-GA--CCG-A---A-GT--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------TCCAG-AC-AT---GAATTATG--A--ATGGC-TG--CTC-CGAGATTCGGCGAgtg
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gi|30310 : GTGATA-CAG-ATTTAG-T--TT--A----A-TTGT-TAAATA-----AC-TT--A-T----CT-A-A--G-CG-A-----GCG---G--C---------AA----T--GTC-A--AC-T-AA------GT---GC-AC-A------TTTA-T---T-G---CTG--GAA-C---T-GG--CCG-A---A-GT--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------TCCAA-AT-AT---GAATTATC--A--AGGAC-TG--CTC-CGAGATTCGG
gi|30311 : GTGATA-GAG-AGTTAG-T--TT--A----A-CAAT-CAAATC-----AA-TT--A-T----TTCA-A--G-CA-A-----GCT---G--C---------AA----T--GTC-A--CC-T-AG------GT---GC-AC-A------TTAA-T---T-G---CTA--GAA-C---T-GG--CCG-A---A-GT--T-G----A-A--T-G--AA-AA-T-T----------TCCAG-AT-AT---GAATTATG--A--AGGAC-TG--CTC-CGAGATTCGGTGA
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gi|30315 : GTGATA-GAG-AGTTAG-T--TT--A----A-CAAT-GAAATC-----AC-TT--A-T----TTG--A--G-CG-A-----GTG---G--C---------AG----T--GTC-AC-CC-T-AA------GT---GC-AC-A------TTAC-T---T-G---ATA--CAG-C---C-GG--CCG-A---A-GC--C-G----A-G--T-G--CT-TA-T-T----------CCCAG-AC-AA---GGATTATG--A--AGGAC-TG--CTC-CGAGATTCAGTG
gi|30316 : T--A----A-TAAT-GAGTTA-----GT-TT--A-T----CTGA-A--G-CG-A-----GCG---G--C---------AA----T--GTC-G--CC-T-AG------GT---TC-AT-ACATGTATCAA-T---T-G---CTA--GAA-C---C-GT--CCG-A---A-AA--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------TCCAG-AC-AT---GAATTATG--A--TGGAC-TG--CTC-CGAGATTCACTGA
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gi|30322 : GCGATA-GAG-AGTTAG-TCCTT--A----G-TAAT-CCAATC-----AA-TT--A-TG---TTGA-A----CG-A-----GCG---G--C---------A-----T--G---A--CT-T-AG------TT----C-AT-A------TCAA-T-----G---CTA--GAA-C-----GG--C-G-A---A-TC--TAG----A-A--T-C--T-----T-C----------CTCA--ACGAT---GAATT--G--A--TGGAC-TG--CTC-CGATATTCGGTGA
gi|30323 : GTGATA-GAG-AGTTAG-T--TT--A----A-CAAT-CAAATA-----AA-TT--A-T----CTGA-A--G-CA-A-----ACG---G--C---------AA----T--GT
gi|30324 : -TT--G-T----TTGA-A--G-TG-A-----GCG---G--C---------AA----TCGGTC-A--CC-T-AG------AT---TT-TC-C------TTAA-T---T-G---CTA--AAA-T---C-GA--CCG-A---A-G
gi|30325 : gtaatgcagcattagttcttagtgatacagagtGTGATA-GAG-GGTTAACT--TC--A----A-CA-T-GAAATC-----AC-TT--ATT----TTGA-A--G-CG-A-----GTG---G--CGGGGGGACAAG----T--GTC-A--TA-TAAG------GT---GC-AC-T------ATAA-----------CTT--GAA-TGCGC-GG--CCG-ACC-A-GC--C-C----G-A--T-----------------------------AT-AT---AGGTTATG-----AGGAC-TG--CAC-CGA-ATTCAGGGA
gi|30326 : GTGA-A-GAG-AGCTAG-T------A----A--AAT-GAAATC-----AC-T---A-T----T-GA-G--A-CG-A-----GTG---G--C---------AG----TT-GTCCA--CC-T-AG-------T---GC-AC-A------TTAC-T---T-T---ATA--CAG-C---C-GG--CCG-ATCGATGC--C-G----G-AG-T-G--TT-A--T-C----------TCCA---C-AA---GG-TT-CG--A--AGGAC-TG--CTC-
gi|30327 : TGATA--AG-AGTTAG-T--TT--ACATAA-CAGTTCAAATC-----AA-TT--A-TAAATCTGATA--G-CG-A-----ACA---G--C---------AAAT--T--GTC-A--CC-T-AG------GTAATGC-AT-A------T-AA-C---T-G---TTA--GAA-T---T-GA--CCA-A---A-GC--T-G----C-A--T-GATTT-AA-T-T----------TGCAG-AC-ATCATGGATTATG--A--AGGAC-TG--CTC-CAAGATTCGGTGA
gi|30328 : TGATA-GAA-AGTTCG-T--TT--A----G-CAGT-CAAATC-----AC-AT--A-C----CTGA-A--G-CG-A-----ACG---A--C---------------T--GTA-AAGCG-T-AC------GT------AC-A------TTAA-TAAAT-AGGCCTA--GAA-C---T-GG--CTG-A---A-GT--T-G----A-A--T-G--TG-TA-C-T----------TCCAG-AC-AT---GAATTATG--A--AGACC-TA--CTCAAAAGATTTAGCGA
gi|30329 : TGATA-GAG---TAAG-T--TT--A----A-CAGT-TCAATA-----AC-TT--A-T----TGGA-A--G-TG-A-----ACG---G-------------------------------T-TG------AT---GT-AA-A------TTAA-A---T-A---CTA--AAG-C---C-AG--CCA-A---A-GT--T-G----A-G--T-G--TG-AA-T-T----------TCCAG-AC-TT---G---TATG--A--AAAAC-TG--CTT-TAAGATTCGG
gi|30330 : tgataaTGATA-GGC-GATTAG-T--TT--A----A-CAAT---GATC-----AC-TC--A-T----TTGA-A--G-CGAA-----GTG---GGCC---------AG----T--GT--A--CC-T-AA------GT---GC-AC-A------CT
gi|30331 : GATA-CGG-ATTTAG-T--TT--A----A-TAGT-CAAATA---------T--A-T----ATGA-A--G-CG-A-----GCA---G--C---------AA----T--GTC-A--TAAT-AG------GT---GC-AC-A------TTAA-T---T-G---CTA--GAA-C---C-AG--CCATA---A-GC--T-G----A-A--T-G--TA-AATT-T----------TTCAG-AC-AT---AAATTATG--A--AGG---TGGACTC-AGAGATTTGGTG
gi|30332 : GATAAGAGGAGTTAG-T--TT--A----AACAATGTAAATC-----AC-TT--A-T----TTGA-A--GGCG-A------TG---G--C---------GAGAGTT--GTC-A--CC-T-AA------AT---GC-AC-A------TTAC-T---T------TA---CA-C---C-GG---CG-A---A-GG--C-G----AGA--T-GC-TT-AA-T-T----------TCCAG-AC-AA---GGA-TA-G--A--AGGA--TG----T-CGAGATTCAGTG
gi|30333 : TA-GAG-AGATAA-C--TT--A----G-CACT-CAAATA-----AC-TC--A-C----CTAA-A--A-TG-A-----ACG---A--C---------CG----T--GTC-T--CC-A-CA------AT---GC-A-----------AA-T---T-G---CTA--GAA-T---T------TA-A---A-GG--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------TTCAG-AC-AT---GAAGTATG--A--GGAAC-TA--CCT-CGAGGTT
gi|30334 : A-GAG-AGCTGG-T--TT--T----A--AAT-CAAGTACACTAAC-TTTAA-T----TTAG-A--A-CG-AATACAGCG---T--A---------AA----T--GTCCA--CT-T-AGTG----AT---GC-AT-AGTAG--TTAA-T---T-G---CTA--GAA-C---TGGG--CCA-A---A-ACGAT-G----A-AG-T-G--TA-AA-T-A----------TCCAG-AC-
gi|30335 : G-AGTTAG-T--C---A----A-CAAT-CAAATC-----AA-TT--A-T----TTGA-A--G-CG-A-----G---------------------------------------AG------------------------TTAA-A---T-G---CTG--GAA-C---T-GG--CCA-A---A-GT--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------TCCAA-AC--------------------GGAC-TG--TTC-CGAGATCCGGTGA
gi|30336 : -T----TTGA-C--G-CA-A-----TCATATG--C---------AA----T--GTC-A--CC-T-A-------------C-AG-A--------AA-A---T-A---CGAAAGAA-CG--C-GG--CCG-A---ACGC--T-GT---A-A--TAG--CA-GA-T-T----------TTCAG-AC-AT---GAATTATGC-C--AGGACTTG--CT--CGAGATTCGGTGA
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gi|30342 : -A------TTAA-T---TCG---CTA--GAA-A---C-AG--ACA-A---A-GC--T-GC---A-A--T-G--TA-A--T-T----------TCCTG-AC-AT---TGATTAAA--A--AGGAC-TG--CTC-AGAGATTCGGTGA
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gi|30345 : tag---CTA--GAA-A---T-GG--CTT-A---A-GT--T-GCATGA-A--T-G--TG-AA-T-T----------TTCAA-AC-AC---AATTTATG--A--AGGAC-TG--CTC-GGAGCTTCGATGA
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gi|30347 : gaagtgtgcccaacctCG-A---A-GC--T-G----A-G--T-G--TA-AA-T-T----------TCCAG------------TAATG--A--AGGGT-CG--CTC-TGAGATTCGGTGA
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Alignments
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lowQualScore : . . .. .. .... .. . .. ...... ...... .. . .... . .. . . ..... ... .. ......... .... .. . .. . . ....... ... . .. ...... . ... . ... .. . ... . .. . ... . .. . .... . .. . .. .. . . .......... . . ... .. .. . .. .
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Reference ( family-465 ) : GTGATA-GAG-AGTTAGT--TT--A----A-CAGT-CAAAT---C--A-----CTT--A-T----TTGA-A--G-CG-A-----GCG---G--C---------AA----T--GTC-A--CC-T-AG------GT---GC-AC-A------TTAA-T---T-G---CTA--GAA-C---C-GG--CCG-A---A-GC--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------TCCAG-AC-AT---GAATTATG--A--AGGAC-TG--CTC-CGAGATTCGGTGA
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gi|30336 : -T----TTGA-C--G-CA-A-----TCATATG--C---------AA----T--GTC-A--CC-T-A-------------C-AG-A--------AA-A---T-A---CGAAAGAA-CG--C-GG--CCG-A---ACGC--T-GT---A-A--TAG--CA-GA-T-T----------TTCAG-AC-AT---GAATTATGC-C--AGGACTTG--CT--CGAGATTCGGTGA
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blockSeqs : . . . . . C C A C . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . A T C C . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T T C A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C C C A . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C C A C . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C G C C . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C G C A . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C C C C . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C T C C . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . T C A C . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C C C C . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . C C C C . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C A C . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons :
originalCons : GTGATA-GAG-AGTTAGT--TT--A----A-CAGT-CAAAT---C--A-----CTT--A-T----TTGA-A--G-CG-A-----GCG---G--C---------AA----T--GTC-A--CC-T-AG------GT---GC-AC-A------TTAA-T---T-G---CTA--GAA-C---C-GG--CCG-A---A-GC--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------TCCAG-AC-AT---GAATTATG--A--AGGAC-TG--CTC-CGAGATTCGGTGA
finalCons : GTGATA-GAG-AGTTAGT--TT--A----A-CAGT-CAAAT---C--A-----CTT--A-T----TTGA-A--G-CG-A-----GCG---G--C---------AA----T--GTC-A--CC-T-AG------GT---GC-AC-A------TTAA-T---T-G---CTA--GAA-C---C-GG--CCG-A---A-GC--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------TCCAG-AC-AT---GAATTATG--A--AGGAC-TG--CTC-CGAGATTCGGTGA
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lowQualScore : . . .. .. .... .. . .. ...... ...... .. . .... . .. . . ..... ... .. ......... .... .. . .. . . ....... ... . .. ...... . ... . ... .. . ... . .. . ... . .. . .... . .. . .. .. . . .......... . . ... .. .. . .. .
lowQualScore : 9 4 99 33 9999 11 3 88 888888 777777 88 2 9999 2 66 4 2 99999 111 55 333333333 9999 66 3 77 3 1 1111111 000 1 22 444444 1 000 1 888 44 1 000 1 55 1 444 1 55 1 5555 1 66 1 55 22 1 1 6666666666 0 1 888 66 55 2 55 2
consensus : GTGATA-GAG-AGTTAGT--TT--A----A-CAGT-CAAAT---C--A-----CTT--A-T----TTGA-A--G-CG-A-----GCG---G--C---------AA----T--GTC-A--CC-T-AG------GT---GC-AC-A------TTAA-T---T-G---CTA--GAA-C---C-GG--CCG-A---A-GC--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------TCCAG-AC-AT---GAATTATG--A--AGGAC-TG--CTC-CGAGATTCGGTGA
Reference ( family-465 ) : GTGATA-GAG-AGTTAGT--TT--A----A-CAGT-CAAAT---C--A-----CTT--A-T----TTGA-A--G-CG-A-----GCG---G--C---------AA----T--GTC-A--CC-T-AG------GT---GC-AC-A------TTAA-T---T-G---CTA--GAA-C---C-GG--CCG-A---A-GC--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------TCCAG-AC-AT---GAATTATG--A--AGGAC-TG--CTC-CGAGATTCGGTGA
gi|30305 : GTGATA-CAG-AGTAAGT--TT--A----A-TTGT-CAAAT---A--T-----ATT--A-T----ATGA-A--G-CG-A-----GCG---G--C---------AA----T--GTC-A--CC-T-AG------GT---GC-AC-A------TTTA-T---T-G---CTA--GAA-C---T-GG--CCG-A---A-GT--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------TCCAG-AC-AT---GAATTATG--A--AGGGC-TG--CTC-CGAGATTCGGTGA
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gi|30307 : GTGATA-CAG-AGTAAGT--TT--A----A-TTGT-CAAATA--C--ATGTATCTT--A-T----ATGA-A--G-CG-A-----GCG---G--C---------AA----T--GTC-A--CC-T-AG------GT---GC-AC-A------TTTA-T---T-G---CTA--GAA-C---T-GA--CCG-A---A-GT--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------TCCAG-AC-AT---GAATTATG--A--ATGGC-TG--CTC-CGAGATTCGGCGAgtg
gi|30308 : GTGATA-AAG-AGTTAGT--TT--A----A-TTGT-CAAAT---A--A-----CGT--A-T----TTGA-A--G-CG-A-----GCG---G--C---------AA----T--GTC-A--CC-T-AG------GT---GC-AC-A------TTTA-T---T-G---CTA--GAA-C---C-GG--TCG-A---A-GC--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------TTCAG-AA-AT---GAATTATG--A--ATGA------CTT-CGAGATTCGGTGA
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gi|30310 : GTGATA-CAG-ATTTAGT--TT--A----A-TTGT-TAAAT---A--A-----CTT--A-T----CT-A-A--G-CG-A-----GCG---G--C---------AA----T--GTC-A--AC-T-AA------GT---GC-AC-A------TTTA-T---T-G---CTG--GAA-C---T-GG--CCG-A---A-GT--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------TCCAA-AT-AT---GAATTATC--A--AGGAC-TG--CTC-CGAGATTCGG
gi|30311 : GTGATA-GAG-AGTTAGT--TT--A----A-CAAT-CAAAT---C--A-----ATT--A-T----TTCA-A--G-CA-A-----GCT---G--C---------AA----T--GTC-A--CC-T-AG------GT---GC-AC-A------TTAA-T---T-G---CTA--GAA-C---T-GG--CCG-A---A-GT--T-G----A-A--T-G--AA-AA-T-T----------TCCAG-AT-AT---GAATTATG--A--AGGAC-TG--CTC-CGAGATTCGGTGA
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gi|30314 : GTGATA-GAG-AGTTAGT--TT--A----A-CAAT-GAAAT---C--A-----CTT--A-T----TTGA-A--G-CG-A-----GTG---G--C---------AG----T--GTC-A--CC-T-AA------GT---GC-AC-A------TTAC-T---T-G---ATA--CAG-C---C-GG--CCG-A---A-GC--C-G----A-G--T-G--CT-TA-T-T----------TCCAG-AC-AA---GAATTATG--AATAGG---TG--CTC-CGAGATTCAGTG
gi|30315 : GTGATA-GAG-AGTTAGT--TT--A----A-CAAT-GAAAT---C--A-----CTT--A-T----TTG--A--G-CG-A-----GTG---G--C---------AG----T--GTC-AC-CC-T-AA------GT---GC-AC-A------TTAC-T---T-G---ATA--CAG-C---C-GG--CCG-A---A-GC--C-G----A-G--T-G--CT-TA-T-T----------CCCAG-AC-AA---GGATTATG--A--AGGAC-TG--CTC-CGAGATTCAGTG
gi|30316 : TT--A-T----CTGA-A--G-CG-A-----GCG---G--C---------AA----T--GTC-G--CC-T-AG------GT---TC-AT-ACATGTATCAA-T---T-G---CTA--GAA-C---C-GT--CCG-A---A-AA--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------TCCAG-AC-AT---GAATTATG--A--TGGAC-TG--CTC-CGAGATTCACTGA
gi|30317 : gtaataatgagttagtGTGATA-CTG-AGTTAGT--GT--A----A-TTGT-CAAAT---A--A-----CTT--A-T----TTGA-A--G-CG-A-----GCG---G--C---------A
gi|30318 : GTGATA-GAG-AGTTATT--TT--A----A-CAAT-TAAAT---CCAA-----ATT--A-T----TTGA-A--GGCG-C-----GTG---G--C---------AG----T--GTC-A--CT-G-AG------GC---TC-ATTA------TTAA-A---T-G---CTA--GAGGC---C-GA--CCA-A---A-GT--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------ACCAG-AC-AT---GAATTATG--A--ATGGC-TG--CTC-CGAGATTCAGGGA
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gi|30320 : GTGGTA-ATG-AATTAGT--TTTAA----A-AAGT-TAAAT---CGAA-----C-------------GA-ACTG-CG-A-----TCG---G--C---------AG----T--GTC-A--CT-T-GA------CT---GC-AC-A------TTAA-T---T-G---CTA--GAA-C---T-GG--CCG-A---T-AC--T-G----A-A--T-A--TA-TA-T-T-------------------AT------TT--------AGAAC-TG--CTC-CGAGATTCGGTGA
gi|30321 : GTGATAAGAG--GTTAGT--TT--A----A--AAT--GACT---C--A-----CTT--A-T----TTGA-A--G-CG-A------CGT--G--C---------AG----T--GTC-A---C-T-A-------GT---GCTAC-A------TTGG-C---T-G---TCA--G-------C-GG--CCG-----A-GC--C-G----A-G--T-G--CT-TA-T-T----------T-CAGCACAAG---GAATTACGCAA--GGGAC-TG--CCCTCCAGATTCAGTG
gi|30322 : GCGATA-GAG-AGTTAGTCCTT--A----G-TAAT-CCAAT---C--A-----ATT--A-TG---TTGA-A----CG-A-----GCG---G--C---------A-----T--G---A--CT-T-AG------TT----C-AT-A------TCAA-T-----G---CTA--GAA-C-----GG--C-G-A---A-TC--TAG----A-A--T-C--T-----T-C----------CTCA--ACGAT---GAATT--G--A--TGGAC-TG--CTC-CGATATTCGGTGA
gi|30323 : GTGATA-GAG-AGTTAGT--TT--A----A-CAAT-CAAAT---A--A-----ATT--A-T----CTGA-A--G-CA-A-----ACG---G--C---------AA----T--GT
gi|30324 : TT--G-T----TTGA-A--G-TG-A-----GCG---G--C---------AA----TCGGTC-A--CC-T-AG------AT---TT-TC-C------TTAA-T---T-G---CTA--AAA-T---C-GA--CCG-A---A-G
gi|30325 : gtaatgcagcattagttcttagtgatacagagtGTGATA-GAG-GGTTAAC--TTC-A----A-CA-T-GAAAT---C--A-----CTT--ATT----TTGA-A--G-CG-A-----GTG---G--CGGGGGGACAAG----T--GTC-A--TA-TAAG------GT---GC-AC-T------ATAA-----------CTT--GAA-TGCGC-GG--CCG-ACC-A-GC--C-C----G-A--T-----------------------------AT-AT---AGGTTATG-----AGGAC-TG--CAC-CGA-ATTCAGGGA
gi|30326 : GTGA-A-GAG-AGCTAGT------A----A--AAT-GAAAT---C--A-----CT---A-T----T-GA-G--A-CG-A-----GTG---G--C---------AG----TT-GTCCA--CC-T-AG-------T---GC-AC-A------TTAC-T---T-T---ATA--CAG-C---C-GG--CCG-ATCGATGC--C-G----G-AG-T-G--TT-A--T-C----------TCCA---C-AA---GG-TT-CG--A--AGGAC-TG--CTC-
gi|30327 : TGATA--AG-AGTTAGT--TT--ACATAA-CAGTTCAAAT---C--A-----ATT--A-TAAATCTGATA--G-CG-A-----ACA---G--C---------AAAT--T--GTC-A--CC-T-AG------GTAATGC-AT-A------T-AA-C---T-G---TTA--GAA-T---T-GA--CCA-A---A-GC--T-G----C-A--T-GATTT-AA-T-T----------TGCAG-AC-ATCATGGATTATG--A--AGGAC-TG--CTC-CAAGATTCGGTGA
gi|30328 : TGATA-GAA-AGTTCGT--TT--A----G-CAGT-CAAAT---C--A-----CAT--A-C----CTGA-A--G-CG-A-----ACG---A--C---------------T--GTA-AAGCG-T-AC------GT------AC-A------TTAA-TAAAT-AGGCCTA--GAA-C---T-GG--CTG-A---A-GT--T-G----A-A--T-G--TG-TA-C-T----------TCCAG-AC-AT---GAATTATG--A--AGACC-TA--CTCAAAAGATTTAGCGA
gi|30329 : TGATA-GAG---TAAGT--TT--A----A-CAGT-TCAAT---A--A-----CTT--A-T----TGGA-A--G-TG-A-----ACG---G-------------------------------T-TG------AT---GT-AA-A------TTAA-A---T-A---CTA--AAG-C---C-AG--CCA-A---A-GT--T-G----A-G--T-G--TG-AA-T-T----------TCCAG-AC-TT---G---TATG--A--AAAAC-TG--CTT-TAAGATTCGG
gi|30330 : tgataaTGATA-GGC-GATTAGT--TT--A----A-CAAT---GAT---C--A-----CTC--A-T----TTGA-A--G-CGAA-----GTG---GGCC---------AG----T--GT--A--CC-T-AA------GT---GC-AC-A------CT
gi|30331 : GATA-CGG-ATTTAGT--TT--A----A-TAGT-CAAAT------A-------T--A-T----ATGA-A--G-CG-A-----GCA---G--C---------AA----T--GTC-A--TAAT-AG------GT---GC-AC-A------TTAA-T---T-G---CTA--GAA-C---C-AG--CCATA---A-GC--T-G----A-A--T-G--TA-AATT-T----------TTCAG-AC-AT---AAATTATG--A--AGG---TGGACTC-AGAGATTTGGTG
gi|30332 : GATAAGAGGAGTTAGT--TT--A----AACAATGTAAAT---C--A-----CTT--A-T----TTGA-A--GGCG-A------TG---G--C---------GAGAGTT--GTC-A--CC-T-AA------AT---GC-AC-A------TTAC-T---T------TA---CA-C---C-GG---CG-A---A-GG--C-G----AGA--T-GC-TT-AA-T-T----------TCCAG-AC-AA---GGA-TA-G--A--AGGA--TG----T-CGAGATTCAGTG
gi|30333 : TA-GAG-AGATAAC--TT--A----G-CACT-CAAAT---A--A-----CTC--A-C----CTAA-A--A-TG-A-----ACG---A--C---------CG----T--GTC-T--CC-A-CA------AT---GC-A-----------AA-T---T-G---CTA--GAA-T---T------TA-A---A-GG--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------TTCAG-AC-AT---GAAGTATG--A--GGAAC-TA--CCT-CGAGGTT
gi|30334 : A-GAG-AGCTGGT--TT--T----A--AAT-CAAGTACACTAA-----CTTTAA-T----TTAG-A--A-CG-AATACAGCG---T--A---------AA----T--GTCCA--CT-T-AGTG----AT---GC-AT-AGTAG--TTAA-T---T-G---CTA--GAA-C---TGGG--CCA-A---A-ACGAT-G----A-AG-T-G--TA-AA-T-A----------TCCAG-AC-
gi|30335 : G-AGTTAGT--C---A----A-CAAT-CAAAT---C--A-----ATT--A-T----TTGA-A--G-CG-A-----G---------------------------------------AG------------------------TTAA-A---T-G---CTG--GAA-C---T-GG--CCA-A---A-GT--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------TCCAA-AC--------------------GGAC-TG--TTC-CGAGATCCGGTGA
gi|30336 : -T----TTGA-C--G-CA-A-----TCATATG--C---------AA----T--GTC-A--CC-T-A-------------C-AG-A--------AA-A---T-A---CGAAAGAA-CG--C-GG--CCG-A---ACGC--T-GT---A-A--TAG--CA-GA-T-T----------TTCAG-AC-AT---GAATTATGC-C--AGGACTTG--CT--CGAGATTCGGTGA
gi|30337 : GN-A--G-CG-A-----GCA---G--C---------AA----A--GTC-A--AC-T-AATTATAAGT---GC-AC-A------AT---T---T-G---CTG--GGT-T---T-GG--CTG-A---A-GT--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------TCCAA-AT-AT---GAATTATC--A--AGGAC-TG--CTC-CGAGATTCGGTGA
gi|30338 : A-A--G-CG-A-----GCA---G--C---------AG----T--GTC-A--CC-T-AG------GT---TC-AT-A------TAAAAG---T-G---CTA--GAG-G---C-AG--CCG-A---A-GT--T-G----A-A--A-T--TA-AA-T-A----------TCTAG-AC-AT---GA
gi|30339 : ---G--C---------AA----T--GTC-A--CC-T-AA------AT---AC-A-----------AA-------------A--GAA-C---C-GG--CCG-A---A-GC--T-G----A-A--T-G--CA-AA-T-T----------TCCAG-AC-AT---GAATTATG--A--AGGAC-TG--CTC-CGAGATTCGGTGA
gi|30340 : ---G--C---------AA----T--GTC-A--CC-T-A-------------C-AG-A--------AA-TA--C-G---AAA--GAA-C---C-GG--CCG-A---A-GC--T-G----A-A--T-G--CA-GA-T-T----------TTCAG-AC-AT---GAATTATG--A--AGGACTTG--CT--CGAGATTCGGTGA
gi|30341 : ---------AA----T--TTC-A--CT-T-AG------GT---GC-AT-A------TTTA-T---T-G---CTA--GAA-C---T-GA--CCG-A---A-GT--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------TCCAG-AC-AT---GAATTATG--A--AGGGC-TG--CTC-CGAGATTCGGTGA
gi|30342 : -A------TTAA-T---TCG---CTA--GAA-A---C-AG--ACA-A---A-GC--T-GC---A-A--T-G--TA-A--T-T----------TCCTG-AC-AT---TGATTAAA--A--AGGAC-TG--CTC-AGAGATTCGGTGA
gi|30343 : ------TTAA-T-----G---CTA--GGA-A---A-AGACCCA-A---A-GC--T-G----A-A--T-G--TA-AA-T-T----------TT--G-AC-AT---GAA-TACA--A--AGGAC-T---CTC-AGAGATTTCGTG
gi|30344 : ---T-G---CTA--GAG-C---C-GA--CCG-A---A-GT--T-G----A-AATT-A--AA-AA-TATCCAGTCCGAATCCAG-AC-AT---GGATTATG--A--ATGAC-TG--CTC-CGAGATTCAGCGA
gi|30345 : tag---CTA--GAA-A---T-GG--CTT-A---A-GT--T-GCATGA-A--T-G--TG-AA-T-T----------TTCAA-AC-AC---AATTTATG--A--AGGAC-TG--CTC-GGAGCTTCGATGA
gi|30346 : -GC--T-G----A-A--T-A--TA-AA-T-C----------CCCAG-AC-AT---GAATTATG--A--AAGAC-
gi|30347 : gaagtgtgcccaacctCG-A---A-GC--T-G----A-G--T-G--TA-AA-T-T----------TCCAG------------TAATG--A--AGGGT-CG--CTC-TGAGATTCGGTGA
gi|30348 : -A--T-G--TATAA-T-T----------TCCAG-AC-AT---GAATTACG--A--AGTAC-CG--CCC-CGAGATTCGGTGA
gi|30349 : G-AT-AT---GAATTATG--A--AGGAA-TG--CTC-CGAGTTTCGGTGA