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Reference ( gi|11082 ) : ATTAAAAAGTAGATGCGCTC-A-CCTTT--AT--A-CA-AA-TTT---A-ATTTTC--T-T--G-G-T-A-AA--TTT--------T---T----T--C-A-T-CT-A-----TAG-A-A--GT--CTTTT--C--GA-TTGC--AAACGGG--------A-T--G--TA------T---T--T--TG--T--TG-TT---TA--T--A--A-T--C-G-T------TT-G-G-TT-T-G-A---A---A--G-----A---A--AA-C--ATC-GACG-TTAGA--TGTA----A-CGT---C-A-CA-A-T----G---C-A-CT-A----TTT-ACGC---C--TCGACG-TT-AG-ATG----G--AA-CGT---C-ACA-A-----G---C-AC-T-G-TT--T-A--GC-C---AGCTGA-C-G-TT-A----TAT----TTCCCG-CATTAC-GC-TGTGA
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gi|11095 : tttagtat-TTAC--AAACGGG--------A-T--G--CA------T---T------G--T--TG-----------------------------------G-G-CT-T-G-A---A---A--G-----A---A--AA-T--GTC-GACG-CTAAA--TATG----A-CGT---C-A-CA-A-T----G---C-A-C--A----TTTGACGT---C--tggcgttgtattccttgcgtta
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gi|11067 : aaaaaaaaaaatatacgacaagtattagaaagtgctccccttttagcaaatttgattttctgggttatgttaatttcatctagatagtctttgcttgcaaagggaatgtaattagttgatttttacatcgttttgtttcgaaaaaataca-ATGCGCTT---CC-TTT-TTTTGCA-A----T--TT---A-ATTCTT--T-T--G-G-TT-AAT---TT---T---T---TTTCA-T-CT-A-----TAGCA---G-T--CTTTT--A--G--ACTTGC--A------AACGGGA-T--------GC-TA------T----------T--T--TA--T--T----G--TT---TA--T--A--A-T--C------T--TT-G------G-TT-T--GAAA---A--G--G---A--AA-C--A-----TC-GACG-TTAGA-T-TAA-CGT---CTT-CA-A-T----GCACC-A-CT-G-TTT-ACGC---C--
gi|11067 : aaaattaaaaaaatattgcgatattgc--TCGACG-TTAG-A--T-TA----A-C-GTC-TTCA-A-T----GC-A-CCACTG-TT-T-A-CGC-CAAGCTGACC-G------TT-AT-AA-TTCCCT-CG--TTAaagctgaccgttataattccctcgtta
gi|11068 : aaaattaaaaaaatattgcgatattgcatgcgcttcctttttttgcaatttaattcttttggttaattttttttcatctatagcagtcttttagacttgcaaacgggatgctattttattgtttataatctttggtttgaaaaggaaaca-ATACGCTT-A-CT-TTT-TC--GCA-AA---T--TG---A-AATATT--T-T--G-G-TT-ATT---TT---G---T---TT--A-T-TT-A-----T----------------------------TGC--A------AACGGGA-T--------G--TA------T----------TC-T--TG--T--T----
gi|11069 : aaataaaaaaatatacgatattatacATTAAAA-------GCGCTC-C-TC-TTT-TA--GTA-AA---TATTT---G-ATGTTC--T-T--G-G-TT-AAT---TT---T---TATGTT--AAT-CT-A-------GTA---G-T--CTTTT--A--G--C-TTGCCCA------AACGGAAAT--------G--TA------T----------TA-T--TG--G--T----GG-TT---TT--T--T--A-T--C----GGT--TT-G------T-TT-T--G-AA---A--AGAA---A--AA-C--A-----TC-GACGGTTAGA-TGTAA-CGT---C-A-CA-A-T----G---C-A-CT-G-TTT-ACGC---CAGTTGACG-TTA
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gi|11070 : aaaaaaaaaattacgacagtattaaaagcgctcctcttttagtaaatatttgatgttcttggttaatttttatgttaatctagtagtcttttagcttgcccaaacggaaatgtattattggtggttttttatcggtttgttttgaaaagaaaaacaT--GCA-GAATTT--TT---G-ATTT-C--T-T--G-C-TT-AAT---TT---TATGT---TT--A-T-CT-AGTACATATAA---G-T--CTTTT--A-----A-CTGC--A------A-CGGAA-T--------G--TA------T----------TA-T--TG--T--T----G--TT---TT--T--A--A-TATC----G-T--TT-G------T-TTGT--G-AA---A--G--A---A--G--C--A-----TC-GACG-T-AGA-TGTAA-CGT---C---CA-A-T----G---C-A-CT-G-TTT-ACGC---
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gi|11071 : aaaaaaaaaatatacgaacagtatttgcagaatttttgatttcttgcttaattttatgtttatctagtacatataagtcttttaactgcaacggaatgtattattgttgtttttaatatcgtttgtttgtgaaagaaATTAAAAGG--------CTC-C-CCGTTT-A---G-A-AA---T--TT---G-ATTTTC--T-T--G-G-TT-AGT---TT---TA--T---GT--A-T--T-A-----TAGTA---G-T--CTTTT--A--G--CTTTGC---------AACGGGA-T--------GTTTA------T----------T--G--TG--T--T----A--TT---T---T--A--A-T--C----G-TA-TT-G------T-TT-T--G-AA---A--G---------AA-C--------TC-GACGTTTAGA-TG
gi|11072 : aaaaaaaaaatcatacgaacagt--A-T-CT-A-----T-GTT---G-T--CTTTT--C--AGCA-TTGC--ATGCCTAAACGGAA-T--------G--AA------TAATAATAAAAC--C--TG--C--TTAACGATTT---TA--T--AT-A-T--TCTCTG-T--TT-G------C-TT-TTTG-AAGATA--A--A---A--AA-C--A-----TC-GACG-TATGA-TGTCA-CGTCAAC-A-TA-A-T----G---C-C-AT-G-TTT-ACGCAA-G--TTGACG-TTActcacg
gi|11073 : aaaaactaaaaatatgtgaggcgagattccgcttattaaaagcgctacctacccttttagacacaaattctgattattcattggtttatgccgatgttaatgttgcgtatataaA-ATGCGCTT-A-AC-TTC-TT--GTA-AA---T--TT---A-ATTTTC--T-T--G-G-TT-AAT---T
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gi|11083 : ATTAAAA-GTAGATGC-CTC-A-C--TTT-AT--ACA-AA---T--CT---ACATTTTC--T-T--G---TT-AAT---TT---TG--T---TC--A-T-CT-A-----TAGAA---G-T--CTTTT--TC-G--A-TT-C--A------A-CGGGA-T--------GG-TA------T----------TA-T--TG--T--T----G--TT---TAT-T--A--A-T--C----G-T--TC-G------G--T-T--G-AA---A--G--A---A--AA-C--A-----TT-GACG-TTAGA-TGTAA-CGT---C-A-CA-A-T----G---C-A-CT-
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gi|11087 : tagatgcgctcacctttatacaaatttaattttcttggttaattttgttcatctatagaagtcttttcgattgcaaacgggatgtattcttgttgtttataatcgtttggtttgaaagaaaaca-ATGCGCT--A-CC-TTTTAT--ACA-AT---T--TT---A-ATTTTCC-T-T--G-G-TA-AAT---TT---T---T---TTTCA-T-C--------TAGAA---G-T--CTTTT--C--G--A-TTGCA-A------AACGGAA-T--------G--TAT-----T----------T--T--TG--T--T----G--TT---TA--T--A--A-T--C----G-T--T---------G-TT-T--G--A---A--G--A---A--AA-C--A-----TT-GACG-TTAGA-TGT-A-CGT---C-A-C--A-T----G---C-A-CTAA-TTT-GC---------TGACG-TTA
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gi|11089 : tagatgcgctccctttatgcaaatttgattttcttggataaatttgttcatctaagaagtattttccgatgcaaacgggatgcattcttgttgtttataatcgtttgttgaaagaaaacgtattg-ATGCGCTC-A-CC-TTT-AT--ACA-AA---T--TT---A-ATTTTC--T-T--G-G-TT-AAT---TT---TG--T---TC--A-T-CT-A-----TAGAA---G-T--CTTTT--C--G--A-TTGC--A------AACGGGA-T--------G--CA------T----------TC-T--TG--C--T----G--TT---TA--T--A--A-T--C----G-T--TT-G------G-TT-T--G-AA---A--G--A---A--AA-C--A-----TC-GACG-TT
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gi|11091 : gcgctcacctttatgcaatgtaattttcttgataaaatttgtcattataggaagtaattttttgattgcaaacgggatgcattcttgttgttttataatatcgcttggtttgaaagaacaC-TTT-AT--GCA-AA---T--TT---A-ATTTTC--T-T--G-A-TT-AAT---TT---T---TGT-TC--A-T-CTCG-----TAGAA---G-T--ATTTT--C--G--A-TTGC--A------A--GGGA-T--------G--CA------T----------T--C--T---T--T----G--TT---TA--T--A--A-T--T----G-T--TTAG------G-TT-T--G-AA---A--G--A---A--AA-C--A-----TC-GACG-TTAGA-TGTAA-CGT---C-A-CA-A-T----G---C-A-CT-G-CTT-ACGC---CAGCTGACG-TT
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gi|11092 : gctacactttatgcaaatttaattttcttgattaatttttgttcatctcgtagaagtattttcgattgcaagggatgcattctttgtttataattgtttaggtttgaaagaaaacaA-AT---T--TT---A-AATTCG--A-T--G-A-TT-AAT---TT---TG--C---TT--A-T-TT-A-----TAGCA---G-T--CTGTT--A--G--A-TTGC--A------AACCAGA-T--------G--TACAGTATT----------C--T--TG--T--T----A--TC---TA--T--A--A-T--G----G-T--TG-G------A-TT-T--G-GA---A--G--A---A--AA-C--A-----TC-GATG-TTAAA-TGTGA-CGT---C-A-TA-A-T----G---C-A-CT-G-CTT-CCG
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gi|11093 : aattttaaattcgatgattaattttgcttatttatagcagtctgttagattgcaaaccagatgtacagtattcttgttatctataatggttggatttggaagaaaacaAGCA---G-C--CTTTT--C--G--A-TTAG--A------AATGGGA-T--------G--CA------T----------T------G--T--T----G--T-------------------C----C-T--TT-G------A-TT-T--G-AA---A--G--A---A--AT-C--A-----TC-GACA-CTAAA-TATGA-CAT---C-T-TA-A-T----G---C-A-CT-G-TTT-ACGC---C--
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gi|11094 : --TCGACG-CTTA-A--CGTG----A-C-GTC-A-CA-A-T----GCAA-C---AA-TT-G-A-CGT-C-GGCTGG-C-G------TT-GT-CT-TCCTCG-CG--Tacaattgacgtcggctggcgttgtcttcctcgcgt
gi|11095 : ttttaatattacaaacaggatgcattgtttggtttgaaagaaaca-TTAC--A------AACGGGA-T--------G--CA------T----------T------G--T--T----G-----------------------------------G------G-CT-T--G-AA---A--G--A---A--AA-T--G-----TC-GACG-CTAAA-TATGA-CGT---C-A-CA-A-T----G---C-A-CA-T-TTG-ACGT---C--
gi|11095 : tttagtat--TCGACG-CTAA-A--TATG----A-C-GTC-A-CA-A-T----GC-A-C---AT-TT-G-A-CGT-C-GGCTGG-T-G------TT-GT-AT-TCCTCG-CG--TTAggctggtgttgtattcctcgcgtta
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gi|11082 : aaatataaacaatatcgataacacttatattttccccATTAAAAAGTAGATGCGCTC-A-CC-TTT-AT--ACA-AA---T--TT---A-ATTTTC--T-T--G-G-TA-AAT---TT---T---T---TC--A-T-CT-A-----TAGAA---G-T--CTTTT--C--G--A-TTGC--A------AACGGGA-T--------G--TA------T----------T--T--TG--T--T----G--TT---TA--T--A--A-T--C----G-T--TT-G------G-TT-T--G-AA---A--G--A---A--AA-C--A-----TC-GACG-TTAGA-TGTAA-CGT---C-A-CA-A-T----G---C-A-CT-A-TTT-ACGC---C--TCGACG-TTAG-A--TGGA----A-C-GTC-A-CA-A------G---C-A-C---TG-TT-T-A--GC-C-AGCTGA-C-G-TT-AT-AT-T----TCCC-G-CA--TTAC-G--C-TGTGAggctgctgtta
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gi|11086 : tag--TCGACG-TTAG-A--TGTA----A-C-GTC-A-CA-A-T----G---C-A-C---TG-TT-T-A-CGC-C-AGTTGA-C-G-TT-AT-CT-T----TCCC-A-TG--TTAC-G--T-TGTGAtctttcccatgttacgttgtga
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Reference ( family-463 ) : ATTAAAAAGTA-ATGCGCTC-A-CC-TTT-AT--GCA-AA---T--TT---A-ATTTTC--T-T--G-G-TT-AAT---TT---T---T---TT--A-T-CT-A-----TAGNA---G-T--CTTTT--N--G--A-TTGC--A------AACGGGA-T--------G--TA------T----------T--T--TG--T--T----G--TT---TA--T--A--A-T--C----G-T--TT-G------G-TT-T--G-AA---A--G--A---A--AA-C--A-----TC-GACG-TTAGA-TGTAA-CGT---C-A-CA-A-T----G---C-A-CT-G-TTT-ACGC---C--TCGACG-TTAG-A--TGTA----A-C-GTC-A-CA-A-T----G---C-A-C---TG-TT-T-A-CGC-C-AGCTGA-C-G-TT-AT-NT-T----TCCC-G-CG--TTAC-G--T-TGTGA
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gi|11064 : aaaaaaaaaaatatacgacagtattaaaagcgctccccttagcaaatttgaattttttctggtttaattttattttatctagatagtccttttaacttgcaaacgggattgtatttattgcttgtttttatcgtttgtattgaaaagaaaaacaATTAAAAAG------CGCTC-C-CC-T---AT--GCA-AA---T--TTG--A-ATTTTT--TCT--G-G-TT-AAT---TTA--T---T---TT--A-T-CT-A-------GTA---G-T--CTCTT--T--A--ACTTGC--A------AACGGGA-TT-------G--TA------T----------T--TATTG--TCTT----G--TT---TT--T--A----T--C----G-T--TT-G--------TT-T--G-AA---AA-G--A---ATAAA-C--A-----TC-GACG-TTAGA-GTTAA-CGT---C-A-CA-A-TGGC-G---T-A-CT-G-TTT-ACGCA--G--TTGACG-TTA
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gi|11065 : aaaaaaaaaaattatcgtacagttattaaaaagcgctcccctatgcaaatttgaattttttctggttaatttattttatctagtagtctctttaacttgcaaacgggattgtatttattgtcttgtttttatcgtttgtttgaaaagaataaacaTAAAAAG------CGCTC-C-CC-TTT-TA--GCA-A----T--TT---G-ATTTTC--TCT--G-G-TT-AAT---TT---T---T---TTT-A-T-CT-A-------GTA---G-TTCCCTTT--A--G--C-TTGCC-A------AACGGGG-TTT------G--TA------T----------TA-T--TG--T--T----GG-TT---TT--T--A--AGT--C----G-T--TT-G------T-TT-T--G-AA---A--G--A---A--AA----A-----CC-GACG-TTTGA-TGTAA-CGT---C-A-C--A-T----G---CAA-AT-GTTTT-ACGC---CAGTTGACG-TTAT-A--TTTC----A-C-GTT-A-C
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gi|11067 : aaaaaaaaaaatatacgacaagtattagaaagtgctccccttttagcaaatttgattttctgggttatgttaatttcatctagatagtctttgcttgcaaagggaatgtaattagttgatttttacatcgttttgtttcgaaaaaataca-ATGCGCTT---CC-TTT-TTTTGCA-A----T--TT---A-ATTCTT--T-T--G-G-TT-AAT---TT---T---T---TTTCA-T-CT-A-----TAGCA---G-T--CTTTT--A--G--ACTTGC--A------AACGGGA-T--------GC-TA------T----------T--T--TA--T--T----G--TT---TA--T--A--A-T--C------T--TT-G------G-TT-T--GAAA---A--G--G---A--AA-C--A-----TC-GACG-TTAGA-T-TAA-CGT---CTT-CA-A-T----GCACC-A-CT-G-TTT-ACGC---C--
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gi|11091 : gcgctcacctttatgcaatgtaattttcttgataaaatttgtcattataggaagtaattttttgattgcaaacgggatgcattcttgttgttttataatatcgcttggtttgaaagaacaC-TTT-AT--GCA-AA---T--TT---A-ATTTTC--T-T--G-A-TT-AAT---TT---T---TGT-TC--A-T-CTCG-----TAGAA---G-T--ATTTT--C--G--A-TTGC--A------A--GGGA-T--------G--CA------T----------T--C--T---T--T----G--TT---TA--T--A--A-T--T----G-T--TTAG------G-TT-T--G-AA---A--G--A---A--AA-C--A-----TC-GACG-TTAGA-TGTAA-CGT---C-A-CA-A-T----G---C-A-CT-G-CTT-ACGC---CAGCTGACG-TT
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gi|11092 : gctacactttatgcaaatttaattttcttgattaatttttgttcatctcgtagaagtattttcgattgcaagggatgcattctttgtttataattgtttaggtttgaaagaaaacaA-AT---T--TT---A-AATTCG--A-T--G-A-TT-AAT---TT---TG--C---TT--A-T-TT-A-----TAGCA---G-T--CTGTT--A--G--A-TTGC--A------AACCAGA-T--------G--TACAGTATT----------C--T--TG--T--T----A--TC---TA--T--A--A-T--G----G-T--TG-G------A-TT-T--G-GA---A--G--A---A--AA-C--A-----TC-GATG-TTAAA-TGTGA-CGT---C-A-TA-A-T----G---C-A-CT-G-CTT-CCG
gi|11092 : --TCGATG-TTAA-A--TGTG----A-C-GTC-A-TA-A-T----G---C-A-C---TG-CT-T-C-CGG-T-AGGTGG-C-G-TT-AT-AT-T----CCCC-G-CA--TTAgtaggtggcgttatattccccgcatta
gi|11093 : aattttaaattcgatgattaattttgcttatttatagcagtctgttagattgcaaaccagatgtacagtattcttgttatctataatggttggatttggaagaaaacaAGCA---G-C--CTTTT--C--G--A-TTAG--A------AATGGGA-T--------G--CA------T----------T------G--T--T----G--T-------------------C----C-T--TT-G------A-TT-T--G-AA---A--G--A---A--AT-C--A-----TC-GACA-CTAAA-TATGA-CAT---C-T-TA-A-T----G---C-A-CT-G-TTT-ACGC---C--
gi|11093 : --TCGACA-CTAA-A--TATG----A-C-ATC-T-TA-A-T----G---C-A-C---TG-TT-T-A-CGC-C-GGCTGT-C-G-TT-GT-AT-T----CCGT-G-CG--TTAggctgtcgttgtattccgtgcgtta
gi|11094 : agcagccttttcgattagaaatgggatgcattgttgtcctttgatttgaaagaaatcaTTTT--A--AT-A-TTAC--A------AACAGGA-T--------G--CA------T----------T---------------------------------------------G-T--TT-G------G-TT-T--G-AA---A--G--A---A--A--C--A-----TC-GACG-CTTAA-CGTGA-CGT---C-A-CA-A-T----G---C-A-
gi|11094 : --TCGACG-CTTA-A--CGTG----A-C-GTC-A-CA-A-T----G---CAA-C---AA-TT-G-A-CGT-C-GGCTGG-C-G-TT-GT-CT-T----CCTC-G-CG--Tacaattgacgtcggctggcgttgtcttcctcgcgt
gi|11095 : ttttaatattacaaacaggatgcattgtttggtttgaaagaaaca-TTAC--A------AACGGGA-T--------G--CA------T----------T------G--T--T----G-----------------------------------G------G-CT-T--G-AA---A--G--A---A--AA-T--G-----TC-GACG-CTAAA-TATGA-CGT---C-A-CA-A-T----G---C-A-CA-T-TTG-ACGT---C--
gi|11095 : tttagtat--TCGACG-CTAA-A--TATG----A-C-GTC-A-CA-A-T----G---C-A-C---AT-TT-G-A-CGT-C-GGCTGG-T-G-TT-GT-AT-T----CCTC-G-CG--TTAggctggtgttgtattcctcgcgtta
gi|11096 : tttagtatttacaaacgggatgcattgttgggcttgaaagaaaatg-TTAC--A------AACGGGA-T--------A--CA------T----------T---------------------------------------------G-T--TT-G------G-TT-T--G-AA---A--G--A---A--AA-T--A-----TC-GACG-CTAAA-TGTGA-CGT---C-A-CA-A-T----G---C-A-CA-A-TTG-ATG-------TCGAC
gi|11096 : tttagtat--TCGACG-CTAA-A--TGTG----A-C-GTC-A-CA-A-T----G---C-A-C---AA-TT-G-A-TGT-C-GACTGG-C-G-TT-GT-AT-T----CCTT-G-CG--TTAtggcgttgtattccttgcgtta
gi|11097 : tttagtatttacaaacgggatacattgtttggtttgaaagaaaataC--A------AACGGGA-T--------G--CA------T----------T---------------------------------------------G-T--TT-G------G-TT-T--GAAA---A--G--A---A--AA-C--A-----TTGGACG-CTAAA-TGTGACCGT---C-A-CA-A-T----G---C-A-CA-G-TT
gi|11097 : GACG-CTAA-A--TGTG----A-CCGTC-A-CA-A-T----G---C-A-C---AG-TT-G-ATCGT-C-AGCTGG-C-G-TT-GT-AT-T----CCTC-gatcgtcagctggcgttgtattcctctcctaagtttcg
gi|11098 : caaacgggatgcattgtttggtttgaaaagaaaacattg-T--TT-G------C-TT-T--G-AA---A--G--A---A--AA-C--A-----TC-AACA-CTAAG-TGTGA-CGT---C-A-CA-A-T----G---C-A-CA-G-TTG-ACGT---C--tcctaagtttcg
gi|11098 : --TCAACA-CTAA-G--TGTG----A-C-GTC-A-CA-A-T----G---C-A-C---AG-TT-G-A-CGT-C-GGCTGG-C-G-TT-GT-AT-T----CCTC-G-CA--TTAggctggcgttgtattcctcgcatta
gi|11099 : tttgctttgaaagaaaaca--TT-T------G-TT-T--G-AA---A--G--A---A--AAAC--A-----TT-GACG-CTAG------A-CGT---C-AGCA-A-T----G---C-A-CA-G-TTTGACG-------TCAGCG-TTGGCG--TGTA----
gi|11100 : -TT-T--G-AA---A--G--A---A--A--T--A-----TC-GACG-CTAAA-TGTGA-CGT---C-A-CA-A-T----G---C-A-CA-G-TTG-ACGT---C--ttccttctc
gi|11100 : --TCGACG-CTAA-A--TGTG----A-C-GTC-A-CA-A-T----G---C-A-C---AG-TT-G-A-CGT-C-GGCTGG-C-G-TT-GT-CA-T----TCTC-G-CG--TTAggctggcgttgtcattctcgcgtta
gi|11101 : tttgaaagaaata-AA---A--G--A---A--AA-C--A-----TT-GACG-CTAAA-TGTGA-CGT---C-A-CA-ATT----G---C-A-CA-G-TT
gi|11101 : ttgat--TTGACG-CTAA-A--TGTG----A-C-GTC-A-CA-ATT----G---C-A-C---AG-TTGG-A-CGT-C-AGCTGG-C-G-TT-GT-ggacgtcagctggcgttgt
gi|11102 : ttgataaagaaaaca--A---A--AA-C--A-----AT-GACG-ACGAG-TATGA-CGT---C-A-CA-A-T----G---C-A-CT-G-TTT-AC
gi|11102 : CGACG---AG----TATG----A-C-GTC-A-CA-A-T----G---C-A-C---TG-TT-T-A-CAT-T-AATCAG-C-A-TA-AT-AT-T----TCCC-G-CG--TTattaatcagcataatatttcccgcgtt
gi|11103 : aaaacaatgaCGACG-CTAA-A--TATGGCGTA-C-GTC-A-CA-A-T----G---C-A-C---AG-TT-G-A-CGT-C-GGCTGG-C-G-TT-TT-AT-T----CCTC-G-CG--TTA
gi|11104 : aaaatacACG-TTAG-GATTGTA----AAC-GTC-A-CA-A-T----G---C-A-C---TG-TT-T-A-CGC-C-AGCTGA-C-GTTT-AT-AT-T------CC-GTCA--TTAC-GC-T-TGT
gi|11105 : TA----A-C-GTC-A-CA-A-C----T---C-A-C---TG-GT-T-A-CGC-C-AGTTGA-C-G-TT-AT-CT-T----TCCC-A-GT--TTAC-G--T-TGTGA
blockSeqs : ATTACAT AA G TTTT T ATT AT CAC C AT C T C A T GAA TTATG TC A G C GTACAT T ACT . TC CAGCA CC TGCCTA A ATACAAAT TT CAGTAT AATAATAAAA TAT TC CT TAAC AT GCC AAT TT ATA AT CTCT G TC C CAATTGG G TT A GAT AG GA . TA A GT AAACA G G G T CAA T G G T TATA CAC A C A T A TAGC C AT GCGT T C T T G T TATA GCG A C CAC G G . A T A C A T G CC A ATAC A T AT GTT G
blockSeqs : AGTAGAT TA . TGT . A . G T C C T . . T . TATGT TC G . . G T A . AA AGAGA C . . TT C T ATA TAT C . . G . AT . AG . T . A A TG . C A TGA A GA . . . . . . T . C . T . T . GGC . . C G . G CAG . G . A . . . T . G . . . C . . . T . . . . . A C . . . . T GG .
blockSeqs : AGTAGAT C . TAT . A . G . . C . . . . . TATT T . . . G T . . . TCGGA A . . T G T A TAT T . . A . T . CA . . . . . GT . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . CAG . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . A C . . . . . GG .
blockSeqs : GTAGAT C . AT . . . G . . C . . . . . TATT . . . . G T . . . TAAC . . . T . . . AT . . . G . T . TA . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . CAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . AA .
blockSeqs : GTAGAT C . TA . . . . . . . . . . . . AATT . . . . T T . . . TAAC . . . . . . . CT . . . T . T . AG . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . GC .
blockSeqs : AGT A . TA . . . . . . . . . . . . TTGT . . . . T C . . . AGAC . . . . . . . AT . . . . . T . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . G .
blockSeqs : AG C . TC . . . . . . . . . . . . ATT . . . . T T . . . AGCT . . . . . . . AT . . . . . A . A . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . T .
blockSeqs : AG C . TA . . . . . . . . . . . . TAT . . . . T A . . . TCGA . . . . . . . TA . . . . . T . A . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . G .
blockSeqs : GG A . TT . . . . . . . . . . . . TTA . . . . T T . . . CCGA . . . . . . . AT . . . . . T . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . G .
blockSeqs : AG C . TC . . . . . . . . . . . . TGT . . . . T T . . . AATA . . . . . . . CT . . . . . A . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . G .
blockSeqs : . C . TT . . . . . . . . . . . . TAT . . . . C T . . . AAC . . . . . . . CT . . . . . T . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AGC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . G .
blockSeqs : . A . TT . . . . . . . . . . . . TTG . . . . T T . . . AGC . . . . . . . CT . . . . . A . A . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . G .
blockSeqs : . A . AT . . . . . . . . . . . . CTT . . . . T C . . . AGC . . . . . . . GC . . . . . A . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . A .
blockSeqs : . A . AT . . . . . . . . . . . . TGT . . . . T T . . . AGC . . . . . . . AT . . . . . A . A . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . G .
blockSeqs : A . AT . . . . . . . . . . . . TGT . . . . T T . . . AGC . . . . . . . AT . . . . . A . A . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . .
blockSeqs : A . AT . . . . . . . . . . . . TGT . . . . T T . . . AGA . . . . . . . CT . . . . . A . A . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . .
blockSeqs : A . AT . . . . . . . . . . . . TGT . . . . T C . . . AGA . . . . . . . CT . . . . . A . A . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . .
blockSeqs : A . AT . . . . . . . . . . . . TGC . . . . T T . . . AGA . . . . . . . CT . . . . . A . A . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . .
blockSeqs : A . AT . . . . . . . . . . . . TT . . . . T A . . . AAA . . . . . . . CT . . . . . A . A . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . .
blockSeqs : A . AT . . . . . . . . . . . . TT . . . . T A . . . AAA . . . . . . . T . . . . . A . A . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . .
blockSeqs : A . AT . . . . . . . . . . . . GT . . . . T A . . . CGA . . . . . . . T . . . . . A . A . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . TA . . . . T A . . . CGA . . . . . . . G . . . . . A . A . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . GT . . . . T A . . . CGA . . . . . . . C . . . . . A . A . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . TG . . . . T A . . . CGA . . . . . . . C . . . . . A . A . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . . . . . . . . . TT . . . . T A . . . CGA . . . . . . . C . . . . . A . A . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . . GT . . . . T A . . . TGA . . . . . . . T . . . . . . . A . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . TT . . . . . G . . . CGA . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . GT . . . . . A . . . AGA . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . TG . . . . . C . . . CGA . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . GC . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
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originalCons : ATTAAAAAGTA-ATGCGCTC-A-CC-TTT-AT--GCA-AA---T--TT---A-ATTTTC--T-T--G-G-TT-AAT---TT---T---T---TT--A-T-CT-A-----TAGNA---G-T--CTTTT--N--G--A-TTGC--A------AACGGGA-T--------G--TA------T----------T--T--TG--T--T----G--TT---TA--T--A--A-T--C----G-T--TT-G------G-TT-T--G-AA---A--G--A---A--AA-C--A-----TC-GACG-TTAGA-TGTAA-CGT---C-A-CA-A-T----G---C-A-CT-G-TTT-ACGC---C--TCGACG-TTAG-A--TGTA----A-C-GTC-A-CA-A-T----G---C-A-C---TG-TT-T-A-CGC-C-AGCTGA-C-G-TT-AT-NT-T----TCCC-G-CG--TTAC-G--T-TGTGA
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consensus : ATTAAAAAGT--ATGCGCT---C-A-CCTTTN-T--G----C-A-AA---T--T-T---A-ATT-TT-C--T-T--G-GTT------------AA-T-T--T-T---GTTT-A-T------CT-A-----TAGNA---G-T--C-TTTT--N--G--A-TTG-C--A------AACGGGA--T--------G--TA-----T-----T----C-TTG-T--T----G--TT---T-A--T--A-A-T--C----G-T------TT-G-G-TT-T--G-A---A---A-G-----A---A--AA-C--ATC-GACG-TTAGA-TGTAA-CGTC-A---CA-A-T----G---C-A-CT-G-TT-T-A-CGC-C-AGTCGA-CG-TTAG-A--TGTA----A-CGTC-A-CA-AT----GC-A-C---TG-TTT-A-CGC-C-AGCTGA-C-G-TT-AT-NT-T----TCCC-G-CG--TTAC-G--T-TGTGA
Reference ( family-463 ) : ATTAAAAAGTA-ATGCGCT---C-A-CCTTTN-T--G----C-A-AA---T--T-T---A-ATT-TT-C--T-T--G-GTT------------AA-T-T--T-T---GTTT-A-T------CT-A-----TAGNA---G-T--C-TTTT--N--G--A-TTG-C--A------AACGGGA--T--------G--TA-----T-----T----C-TTG-T--T----G--TT---T-A--T--A-A-T--C----G-T------TT-G-G-TT-T--G-A---A---A-G-----A---A--AA-C--ATC-GACG-TTAGA-TGTAA-CGTC-A---CA-A-T----G---C-A-CT-G-TT-T-A-CGC-C-AGTCGA-CG-TTAG-A--TGTA----A-CGTC-A-CA-AT----GC-A-C---TG-TTT-A-CGC-C-AGCTGA-C-G-TT-AT-NT-T----TCCC-G-CG--TTAC-G--T-TGTGA
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gi|11086 : tagTCGA-CG-TTAG-A--TGTA----A-CGTC-A-CA-AT----GC-A-C---TG-TTT-A-CGC-C-AGTTGA-C-G-TT-AT-CT-T----TCCC-A-TG--TTAC-G--T-TGTGAtctttcccatgttacgttgtga
gi|11087 : tagatgcgctcacctttatacaaatttaattttcttggttaattttgttcatctatagaagtcttttcgattgcaaacgggatgtattcttgttgtttataatcgtttggtttgaaagaaaaca-ATGCGCT-----A-CCTTTTAT--A----C-A-AT---T--T-T---A-ATT-TTCC--T-T--G-GTA------------AA-T-T--T-T---TTTTCA-T------C--------TAGAA---G-T--C-TTTT--C--G--A-TTG-CA-A------AACGGAA--T--------G--TA-----T-----T----T-TTG-T--T----G--TT---T-A--T--A-A-T--C----G-T------T----G-TT-T--G-----A---A-G-----A---A--AA-C--ATT-GACG-TTAGA-TGT-A-CGTC-A---C--A-T----G---C-A-CTAA-TT-T----------GCTGA-CG-TTA
gi|11088 : tag-ATGCGCT---C---CCTTTA-T--G----C-A-AA---T--T-T---G-ATT-TT-C--T-T--G-GAT------------AA-A-T--T-T---GTTC-A-T------CT-A------AGAA---G-T--A-TTTT--CC-G--A-T-G-C--A------AACGGGA--T--------G--CA-----T-----T----C-TTG-T--T----G--TT---T-A--T--A-A-T--C----G-T------TT-G----T-T--G-A---A---A-G-----A---A--AA-CGTATT-G-CG-TTA-A-TGTAA--GTC-A---CA-A-TA---G---C-G-CTGG-TT-T-A-AG--C-AGCTGA-TG-TTA
gi|11088 : tag-CG-TTA--A--TGTA----A--GTC-A-CA-ATA---GC-G-C---TGGTTT-A-AGC---AGCTGA-T-G-TTAAT-AT-T----ACCT-G-CG--TGAC-atattacctgcgtgac
gi|11089 : tagatgcgctccctttatgcaaatttgattttcttggataaatttgttcatctaagaagtattttccgatgcaaacgggatgcattcttgttgtttataatcgtttgttgaaagaaaacgtattg-ATGCGCT---C-A-CCTTTA-T--A----C-A-AA---T--T-T---A-ATT-TT-C--T-T--G-GTT------------AA-T-T--T-T---GTTC-A-T------CT-A-----TAGAA---G-T--C-TTTT--C--G--A-TTG-C--A------AACGGGA--T--------G--CA-----T-----T----C-TTG-C--T----G--TT---T-A--T--A-A-T--C----G-T------TT-G-G-TT-T--G-A---A---A-G-----A---A--AA-C--ATC-GACG-TT
gi|11090 : tagGCGCT---C-A-CCTTTA-T--G----C-A-A----T--G-T---A-ATT-TT-C--T-T--G-ATA------------AA-A-T--T-T---GTC--A-T-------T-A-----TAGGAA--G-TAAT-TTTT--T--G--A-TTG-C--A------AACGGGA--T--------G--CA-----T-----T----C-TTG-T--T----G--TT---TTA--T--A-A-TATC----G-C------TT-G-G-TT-T--G-A---A---A-G-----A---A-----C--ATC-GACG-TTAGA-TGTAATCGTC-A---CA-A-T----G---C-A-CT-G-TT-T-A-CGC-C-AGCTGA-CG-TTA
gi|11090 : TCGA-CG-TTAG-A--TGTA----ATCGTC-A-CA-AT----GC-A-C---TG-TTT-A-CGC-C-AGCTGA-C-G-TTAAT-CT-TATACTCTTAG-CGATTTAC-A--C-TGTGAatcttatactcttagcgatttacactgtga
gi|11091 : gcgctcacctttatgcaatgtaattttcttgataaaatttgtcattataggaagtaattttttgattgcaaacgggatgcattcttgttgttttataatatcgcttggtttgaaagaacaCTTTA-T--G----C-A-AA---T--T-T---A-ATT-TT-C--T-T--G-ATT------------AA-T-T--T-TT--GTTC-A-T------CTCG-----TAGAA---G-T--A-TTTT--C--G--A-TTG-C--A------A--GGGA--T--------G--CA-----T-----T----C-TT-----T----G--TT---T-A--T--A-A-T--T----G-T------TTAG-G-TT-T--G-A---A---A-G-----A---A--AA-C--ATC-GACG-TTAGA-TGTAA-CGTC-A---CA-A-T----G---C-A-CT-G-CT-T-A-CGC-C-AGCTGA-CG-TT
gi|11091 : gctacaTCGA-CG-TTAG-A--TGTA----A-CGTC-A-CA-AT----GC-A-C---TG-CTT-A-CGC-C-AGCTGA-C-G-TT--T-ATAT----TCCC-G-CT--TTACAA--C-TGTGAtatattcccgctttacaactgtga
gi|11092 : gctacactttatgcaaatttaattttcttgattaatttttgttcatctcgtagaagtattttcgattgcaagggatgcattctttgtttataattgtttaggtttgaaagaaaaca-A-AT---T--T-T---A-AAT-TC-G--A-T--G-ATT------------AA-T-T--T-T---GCTT-A-T------TT-A-----TAGCA---G-T--C-TGTT--A--G--A-TTG-C--A------AACCAGA--T--------G--TACAGTAT-----T----C-TTG-T--T----A--TC---T-A--T--A-A-T--G----G-T------TG-G-A-TT-T--G-G---A---A-G-----A---A--AA-C--ATC-GATG-TTAAA-TGTGA-CGTC-A---TA-A-T----G---C-A-CT-G-CT-T-C-CGG-T-AGGTGG-CG-TTAT-A--T
gi|11093 : AGCA---G-C--C-TTTT--C--G--A-TTA-G--A------AATGGGA--T--------G--CA-----T-----T--------G-T--T----G--T-------------------C----C-T------TT-G-A-TT-T--G-A---A---A-G-----A---A--AT-C--ATC-GACA-CTAAA-TATGA-CATC-T---TA-A-T----G---C-A-CT-G-TT-T-A-CGC-C-GGCTGT-CG-TTtccccgcatta
gi|11093 : TCGA-CA-CTAA-A--TATG----A-CATC-T-TA-AT----GC-A-C---TG-TTT-A-CGC-C-GGCTGT-C-G-TT-GT-AT-T----CCGT-G-CG--TTAgtattccgtgcgtta
gi|11094 : agcagccttttcgattagaaatgggatgcattgttgtcctttgatttgaaagaaatca-TTTT--A--AT-A-TTA-C--A------AACAGGA--T--------G--CA-----T-----T----------------------------------------------G-T------TT-G-G-TT-T--G-A---A---A-G-----A---A--A--C--ATC-GACG-CTTAA-CGTGA-CGTC-A---CA-A-T----G---CAA-CA-A-TT-G-A-CGT-C-GGCTGG-CG-TT
gi|11094 : TCGA-CG-CTTA-A--CGTG----A-CGTC-A-CA-AT----GCAA-C---AA-TTG-A-CGT-C-GGCTGG-C-G-TT-GT-CT-T----CCTC-G-CG--Tgtcttcctcgcgt
gi|11095 : ttttaatattacaaacaggatgcattgtttggtttgaaagaaaca-TTA-C--A------AACGGGA--T--------G--CA-----T-----T--------G-T--T----G---------------------------------------G-G-CT-T--G-A---A---A-G-----A---A--AA-T--GTC-GACG-CTAAA-TATGA-CGTC-A---CA-A-T----G---C-A-CA-T-TT-G-A-CGT-C-GGCTGG-TG-TT
gi|11095 : tttagtatGTCGA-CG-CTAA-A--TATG----A-CGTC-A-CA-AT----GC-A-C---AT-TTG-A-CGT-C-GGCTGG-T-G-TT-GT-AT-T----CCTC-G-CG--TTAgtattcctcgcgtta
gi|11096 : tttagtatttacaaacgggatgcattgttgggcttgaaagaaaat-TTA-C--A------AACGGGA--T--------A--CA-----T-----T----------------------------------------------G-T------TT-G-G-TT-T--G-A---A---A-G-----A---A--AA-T--ATC-GACG-CTAAA-TGTGA-CGTC-A---CA-A-T----G---C-A-CA-A-TT-G-A-TGT-C-GACTGG-CG-TT
gi|11096 : tttagtatTCGA-CG-CTAA-A--TGTG----A-CGTC-A-CA-AT----GC-A-C---AA-TTG-A-TGT-C-GACTGG-C-G-TT-GT-AT-T----CCTT-G-CG--TTAgtattccttgcgtta
gi|11097 : tttagtatttacaaacgggatacattgtttggtttgaaagaaaata-C--A------AACGGGA--T--------G--CA-----T-----T----------------------------------------------G-T------TT-G-G-TT-T--GAA---A---A-G-----A---A--AA-C--ATTGGACG-CTAAA-TGTGACCGTC-A---CA-A-T----G---C-A-CA-G-TT-G-ATCGT-C-AGCTGG-CG-TT
gi|11098 : -T------TT-G-C-TT-T--G-A---A---A-G-----A---A--AA-C--ATC-AACA-CTAAG-TGTGA-CGTC-A---CA-A-T----G---C-A-CA-G-TT-G-A-CGT-C-GGCTGG-CG-TTgtattcctctcctaagtttcg
gi|11098 : TCAA-CA-CTAA-G--TGTG----A-CGTC-A-CA-AT----GC-A-C---AG-TTG-A-CGT-C-GGCTGG-C-G-TT-GT-AT-T----CCTC-G-CA--TTAgtattcctcgcatta
gi|11099 : tttgctttgaaagaaaaca------TT-T-G-TT-T--G-A---A---A-G-----A---A--AAAC--ATT-GACG-CTAG------A-CGTC-AG--CA-A-T----G---C-A-CA-G-TT-TGA-CGT-C-AG-----CG-TTGGCG--TGTA----
gi|11100 : -TT-T--G-A---A---A-G-----A---A--A--T--ATC-GACG-CTAAA-TGTGA-CGTC-A---CA-A-T----G---C-A-CA-G-TT-G-A-CGT-C-GGCTGG-CG-TTttccttctc
gi|11100 : TCGA-CG-CTAA-A--TGTG----A-CGTC-A-CA-AT----GC-A-C---AG-TTG-A-CGT-C-GGCTGG-C-G-TT-GT-CA-T----TCTC-G-CG--TTAgtcattctcgcgtta
gi|11101 : tttgaaagaaata-A---A---A-G-----A---A--AA-C--ATT-GACG-CTAAA-TGTGA-CGTC-A---CA-ATT----G---C-A-CA-G-TTGG-A-CGT-C-AGCTGG-CG-TT
gi|11102 : ttgatCGA-CG---AG----TATG----A-CGTC-A-CA-AT----GC-A-C---TG-TTT-A-CAT-T-AATCAG-C-A-TA-AT-AT-T----TCCC-G-CG--TTgt
gi|11103 : aaaacaatgaCGA-CG-CTAA-A--TATGGCGTA-CGTC-A-CA-AT----GC-A-C---AG-TTG-A-CGT-C-GGCTGG-C-G-TT-TT-AT-T----CCTC-G-CG--TTA
gi|11104 : aaaatacA-CG-TTAG-GATTGTA----AACGTC-A-CA-AT----GC-A-C---TG-TTT-A-CGC-C-AGCTGA-C-GTTT-AT-AT-T------CC-GTCA--TTAC-GC-T-TGT
gi|11105 : TA----A-CGTC-A-CA-AC----TC-A-C---TG-GTT-A-CGC-C-AGTTGA-C-G-TT-AT-CT-T----TCCC-A-GT--TTAC-G--T-TGTGA