lowQualScore                  :          444 4   00         0000      0      00   1 0 0      0000 0000  11111        0          00  11  0000 11111                
lowQualScore                  :          ... .   ..         ....      .      ..   . . .      .... ....  .....        .          ..  ..  .... .....                
lowQualScore                  :          444 4   66         9999      4      66   1 4 4      9999 9999  00000        6          66  00  9999 99999                
consensus                     :     ACAAT--NGCTAT--GAAACACGT----CAGACA-GCATTT--GACCC-A-ATGGCA----G----GT-----CGTATTGGCAAACTAGATC--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
Reference ( gi|49127 )        :     ACAAT--GGTTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACTC-A-ATGGCA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49202                      :     ACAAT--GGTTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACTC-A-ATGGCA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT--GT--TA----T-----ATCGACCATAGAATTT
gi|49132                      :     ACAAT--GGTTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACTC-A-ATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49130                      :     ACAAT--GGTTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACTC-A-ATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49129                      :     ACAAT--GGTTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACTC-A-ATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49219                      :     ACAAT--GGCTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACTC-A-ATGGTA----G----GT-----CATACTGGTAAACTAAATT--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49218                      :     ACAAC--GGCTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACTC-A-ATGGTA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49215                      :     ACAAT--GGCTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACTC-A-ATGGTA----G----GT-----CATACTGGTAAACTAAATT--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49213                      :     ACAAT--GGCTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GGCTC-A-ATGGTA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49109                      :     ACAAT--GGCTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACTC-A-ATGGTA----G----GT-----CATACTGGTAAACTAAATT--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49222                      :     ACAAT--GGCTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACTC-A-ATGGTA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT--GT--TA----T-----AATGACCATAGAATTT
gi|49176                      :     ACAAT--GGTTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACTC-A-ATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATCT
gi|49175                      :     ACAAT--GGTTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACTC-A-ATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATCT
gi|49131                      :     ACAAT--GGCTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACTC-A-ATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
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gi|49183                      :     ACAAT--GATTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACTC-A-ATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49177                      :     ACAAT--GGTTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACTC-A-ATGATA----G----GT-----CATATTGATAAACTAAATT--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
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gi|49200                      :     ACAAT--GGTTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACTC-A-ATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT--GT--TA----T-----AACGACAATAGAATTT
gi|49226                      :     ACAAT--AGCTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACTC-A-ATGGTA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT--GT--TA----T-----AACGGCCATAGAATTT
gi|49217                      :     ACAAT--GGTTAT--GAAACACAC----CAGACA-GCATTT--GACTC-A-ATGATA----G----GC-----CATATTGGTAAACTAAATT--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49174                      :     ACAAT--GGCTGT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACTC-A-ATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49172                      :     ACAAT--GGCTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACTC-A-ATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT--GT--TA----C-----AACGACCATAGAATTT
gi|49180                      :     ACAAT--GGCTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACTC-A-ATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT--GT--TA----T-----AACGACCATAAAATTT
gi|49198                      :     ACAAT--GGCTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACTC-A-ATGATC----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
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gi|49221                      :     ACAAT--GGCTAT--GAAACACAT----TAGACA-GCATTT--GACTC-A-ATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT--GT--TA----T-----AACGGCCATAGAATTT
gi|49185                      :     ACAAT--AGCTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACTC-A-ATGATA----G----GC-----CATATTGGTAAACTAAATT--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49224                      :     ACAAT--GGCTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACTT-A-ATGATA----G----GT-----CATATTGATAAACTAAATT--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49153                      :     ACAAT--GGCTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACCC-A-ATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT--GT--AA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49236                      :     ACAAT--GGCTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GATCC-A-ATGGAA----G----GT-----CATATTGGCAAACTAAATT--GT--TA----T-----AACGACCATAGTATTT
gi|49125                      :     ACAAT--TGCTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACAC-A-ATGGCA----G----GT-----CATACTGGCAAACTAAATT--GT--TA----T-----AACAACCATAGAATTT
gi|49122                      :     ACAAT--TGCTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACCC-A-ATGGCA----G----GT-----CATACTGGCAAACTAAATC--AT--TA----T-----AACGACCATAAAATT
gi|49139                      :     ACAAT--TGTTAT--GAAACACAT----CCGACA-GCATTT--GACCC-A-ATGGCA----G----GC-----CATACTGGCAAACTAAATC--GT--TA----A-----AACGACCATAGAATTT
gi|49116                      :     ACAAT--TGCTAT--GAAATACAT----CAGACA-GCATTT--GACCC-A-ATGGTA----G----GT-----TATATTGGCAAACTAAATC--GT--TA----T-----AACGACCATAGCATTT
gi|49138                      :     ACAAT--TGCTAT--GAAA-ATAT----CAGACA-GCATTT--GACCC-A-AAGGCA----G----GT-----CATATTGGCAAACTAAATC--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49212                      :     ACAAT--TGCTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACCC-A-ATGGCA----G----GC-----CATACTGGCGAACTAAATG--GT--TA----C-----AACGGCCATAGAATTT
gi|49165                      :     ACAAT--TGCCAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACCC-A-ATGGAA----G----GC-----CATACTGGCAAACCAAATC--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49171                      :     ACAAT--TGCTAT--TAAACACAC----CAAACA-GCATTT--GACCC-A-ATGGCA----G----GT-----CATACTGGCAAACTAAATC--GT--TA----T-----AACGATCATAGAATTT
gi|49114                      :     ACAAT--TGATAT--GAAATACAT----CAGACA-GCATTT--GACCC-G-ATGACA----G----GC-----CATACTGGCAAACTAAATC--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49179                      :     ACAAT--TGCTAT--GAAGCATAT----CAGACA-GCATTT--GACCC-A-ATGGCA----G----GT-----CATAATGGCAAATTAAATC--AT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49188                      :     ACAATTGAGTTAT--GAAACACAT----CAAACA-ACATTT--AACCC-A-ATGGCA----G----GC-----CATATTGGCAAACTAGATC--GT--TA----T-----AACGACCATCGAATTT
gi|49190                      :     ATAAT--TGACAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACTC-A-ATGGCA----G----GC-----CATAGTAGCAAACTAGATC--GT--TG----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49232                      :     ACAAT--TGCTAT--GAAACATAT----TAGACA-GCATTT--GACCC-A-ATGGCA----G----GT-----CGTAATGGCAAACTAAATC--TT--TA----T-----AACGGCCATAGGATT
gi|49234                      :     ACAAT--TGCTAT--GAAACAAAC----CAGACA-GGATTT--GACCC-A-ATGACA----G----GT-----CATACTAGCAATCTAAATC--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49107                      :     ACAAT--TGGTAT--GAAACACGT----CAGACA-ACATTT--GACTC-A-ATGACA----G----GT-----TGTATTGGTAAACTAGATC--GT--TG----T-----AACGAACATAGATTTT
gi|49140                      :     ACAAT--TGCCAT--GAAACATAT----CAGACA-GCATTT--GACCG-A-ATGGTA----G----GT-----TGTACTGACAAACTAAATC--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATT
gi|49135                      :     ACAAT--TGTTAT--GAAACATAT----CAGACA-GCATTT--GACCC-A-CTGACA----G----GC-----TATAATGGCAAACTTGATC--GT--TA----T-----AACGACCATGGAATTT
gi|49113                      :     ACAAT--TGGTCT--AAAACACGT----CATACA-GCATTT--GACCC-A-ATGGCA----A----GT-----TATACTGGCAAACTAGATC--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATT
gi|49204                      :     ACAAT--TGCTGC--AAAACACGC----TAGACA-GCATTT--GTCTC-A-ATGACA----G----GT-----TGTAATGGTAAACTAGATT--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49182                      :     ACAAT--TGCTAT--GAAACACGT----CAGACA-GCATTT--GACCT-A-AT-GCA----G----GC-----TATACTGGCAAACTAAAAC--GT--TA----T-----AACAACCACAGAATTT
gi|49157                      :     ACAAC--GGCTAT--AAAACACCT----CAGACA-GGATTT--GATCC-A-ATTACA----G----GT-----TGTATTGACAAACTAGATC--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49163                      :     ACAAT--TGGTAT--GAAACACGT----CAGACA-GCATTT--GCCTC-A-GTGGCA----G----GT-----TTTATTGGCAAACTGGATC--GT--TA----T-----AACAACCAAAGA
gi|49142                      :     ACAAT--TGATAT--GAAACACGT----CGGACA-GCAATT--GACCC-A-ATGGCAGGCTG----GC-----TGTATTGGCAAACTAGGTT--GT--TA----T-----TACGACCATAGAATTT
gi|49211                      :     ACAAT--TGGTAT--GAAACACGT----CATACA-GCATTT--GACTC-A-GTGGCA----G----GT-----TGTATTGGCAAAGTAGATT--GT--TA----T-----AACTACAACATAATTT
gi|49227                      :     ACAGT--TGCTAT--GACGCACGC----CAGACA-GCATTT---ACCC-A-ATGACA----G----GC-----CATACTGACAAACTAGATC--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49119                      :     ACAAT----TTATAAGAAACGCGT----CAGACA-GCATTT--GATCC-A-ATGACA----G----GT-----TGTATTGGCAAACTTGATC--GT--TA----T-----AACGACCCTAGAATTT
gi|49149                      :     ACAAT--TGCTAT--GAAACATGT----CAGACA-GTATTT--GATCC-A-ATGGCA----G----AT-----TGTATGGGCATATTAGATC--GT--TA----T-----AACGGCCATAGAATTT
gi|49143                      :     ACAAT--TGGTAT--GAAACATAT----CAGACA-GCATTT--GACCC-A-CTGGCA----G----GT-----TGTGTGGGCAAACTAGATC--GT--TA----T-----AACAACC-TTGAATTT
gi|49112                      :     ACAAT--TGGTAT--GAAACACGT----CAGACA-ACATTT--GACCC-A-ATGAAA----G----GC-----TGTATTTGCAAATTAGATC--GTTATA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49137                      :     ACAAT--TGGTAT--GAAACACGT----CAGACT-GCATTT--GACAT-A-ATGACA----G----GT-----TGTATTGGCAAATGAGATT--GT--AA----T-----AACAACCATAGAGTTT
gi|49123                      :     ACAAT--TGGTAT--GAAACATGT----CAGACA-GCATTT--GATCC-A-ATGACA----G----GT-----TGCATTAGCAAACTAGATT--GT--TA----T-----AACTACCAC--AATTT
gi|49208                      :     ACAAT--TGACAT--GAAAGACGT----CAGACA-GCATTT--GACCT-A-AGGGCA----G----GT-----TGTATTGGGAAACTAGATC--AT--TA----T-----AACGACTATAGGAT
gi|49167                      :     ACAAT--TGT-AT--GAAACACGT----TAGACA-ACATTT--GACCG-A-ATGGCA----G----GT-----TGTACTGGC-AACTAGATC--GT--TA----T-----AAAGACAATAGAATTT
gi|49148                      :     ACAAT--TGGTAT--GAAACATGT----TAGACA-GTATTT--AGCCC-A-ATGACT----G----GT-----TATATTGACAAACTAGATC--GT--TA----T-----AACAACTATAGGATTT
gi|49231                      :     ACAAT--TGGTAT--GAATGATGT----CAGACA-TCATTT--GGCCC-A-ATGACA----G----GC-----TATACTGGCGAACTAGATA--GT--TG----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49189                      :     ACAAT--TGGTAG--GAAGCACGTACGCCAGACA-GCATTT--GATCC-A-ATGGCA----T----GC-----TGTATTGGCAAACTAGATC--GT--TA----TTATTCAACGACCATAGAATTT
gi|49241                      :     ACAAT--TGGTAT--GAAACATGT----CGGACA-GCATTT--GACAC-C-ATTGGA----G----GT-----TGCATTGGCAAACTAGATC--AT--CA----T-----AATGACCACAGAATTT
gi|49242                      :     ACAAT--TGGCAT--GAAACACGT----CAGACA-GCATTT--GACCC-A-ATGACG----G----GT-----TGTATGGGCAAACTGGGTC--GC--TA----TGTAC-AACGGCC-TATAATTT
gi|49487                      :      CAAT--GGCTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACTC-A-ATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49485                      :      CAAT--TGCTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--TACGC-A-ATGGCA----G----GT-----CATACTGGCAAACTAAATC--GT--TA----C-----AACGACCATAGAATTT
gi|49490                      :      CAAT--TGGTAT--GAAACATGT----CAGACA-GCATTT--GACTC-A-ATGGCA----G----TT-----CATATTGGCAAACTAAATC--GT--T-----T-----AATGACCCTAGAATTT
gi|49486                      :      CAAT--AGGTAT--GAAACACAT----CAGACA-GAATTT--GACCC-A-ATGACA----G----GC-----TGTATTGGCAAATTTGATC--GT--TA----T-----AACGACCATCAAATT
gi|49491                      :      CAAT--TGCTAT--GAAACACGT----CAGGCA-GCATTTTAAAC-C-A-ATGGCG----G----GT-----TGTATGGGCAAACTAGATC--GT--TA----T-----AACGACTATAGAATCT
gi|49495                      :      CAAT--TGGTAT--GAAACACGT----CAGACA-ACATAT--GACCC-A-ATGGCA----G----GT-----TGTTTTGGCAAACTAAATC--GT--TG----T-----AACTATCATAG
gi|49494                      :      CAAT--TGCTAT--GAAACACGT----CAAACA-GCATTT--GACCC-A-A-GGT-----T----GT-----TGTATTGGCAAACTAGCTC--GT--TA----T-----AACGATCATAGAATTT
gi|49499                      :      CAAT--TGGTAT--GAAACACGT----TAGATA-GCATTT--GACCC-A-ACGCCA----A----ATTTGTACATATTGGCAAACTAGATC--GT--TATAAGT-----AACGACCATAGAATTT
gi|49498                      :      CAAT--TGGTAT--GAAACATGT----CAGACAAGCATTT--GACCC-A-ATGACA----GGTACGT-----TGTATTAGCAAACT-AGTTCGGTA-TA----T-----AACGACCATAGGATCT
gi|49527                      :       AAT--GGCTAT--GACACATGT----CAGACA-GCATTT--GATCC-A-ATGACA----G----GT-----TGTATTGACAAACTAGATT--GT--TA----T-----AACGACCATAGAAT
gi|49484                      :       AAT--GGT-AT--GAAACAAGT----CAGACA-GCATTT--GACCCCA-AAGACA----G----GA-----TGTATTGGCAAACTAGATC--GT--TG----T-----AACGGCCATAGAATTT
gi|49194                      :      caAT--AGGTAT--GAAATACGT----CAGAC-----TTT--GACCC-A-ATGACA----G----GT-----TGTACTGGTAAATTCGATC--GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49566                      :  acaattAT--TGCTGT--GAAACACGT----AAGACG-GCATTT--GACCC-A-ATGACA----G----AT-----TGTATGGGCAAAATAGATC--GT--TA----T-----AACGACTATAGAATTT
gi|49587                      :         T--GGCTAT--GAAACACAT----CAGACA-GCATTT--GACTC-A-ATGATA----G----GT-----CATACTGGTAAACTAAATC--AT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49564                      :         T--GGT-AT--AAAACAGGT----CAAACA-GTATTT--GACTC-A-ATGGCA----G----GT-----TGTATTGGCAAACTAGATC--GT--TA----T-----AACGACCACAGAATTT
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gi|49570                      :       atT--GGT-AT--GAAACACGT----CAGACA-TCATTT--GGCCC-A-GTGACA----G----GC-----TGTACCACCAAACTACATC--GT--TA----T-----AATGACCATAGAATTT
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gi|49623                      :               TAT--GAAACACGT----CAGACA-GCATTT--GACCC-A-ATGAAA----G----GT-----TGTATGGGCAAACTAGATC--GT--TA----T-----AACGATCAAAGAATTT
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Reference ( family-45 )       :         ACAATNG--CTA------TGAAACACGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGCA----G----GT-----CGTATTGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49107                      :         ACAATTG--GTA------TGAAACACGT----CAGAC-AACATTT-GAC-TC-AATGACA----G----GT-----TGTATTGGTAAACTAGATC-GT--TG----T-----AACGAACATAGATTTT
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gi|49223                      :         ACAATGG--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----A----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCGTAGAATTT
gi|49224                      :         ACAATGG--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TT-AATGATA----G----GT-----CATATTGATAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49226                      :         ACAATAG--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGGTA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGGCCATAGAATTT
gi|49227                      :         ACAGTTG--CTA------TGACGCACGC----CAGAC-AGCATTT--AC-CC-AATGACA----G----GC-----CATACTGACAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
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gi|49232                      :         ACAATTG--CTA------TGAAACATAT----TAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGCA----G----GT-----CGTAATGGCAAACTAAATC-TT--TA----T-----AACGGCCATAGGATT
gi|49234                      :         ACAATTG--CTA------TGAAACAAAC----CAGAC-AGGATTT-GAC-CC-AATGACA----G----GT-----CATACTAGCAATCTAAATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49236                      :         ACAATGG--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAT-CC-AATGGAA----G----GT-----CATATTGGCAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGTATTT
gi|49241                      :         ACAATTG--GTA------TGAAACATGT----CGGAC-AGCATTT-GACACC-ATTGG-A----G----GT-----TGCATTGGCAAACTAGATC-AT--CA----T-----AATGACCACAGAATTT
gi|49242                      :         ACAATTG--GCA------TGAAACACGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGACG----G----GT-----TGTATGGGCAAACTGGGTC-GC--TA----TGTAC-AACGGCC-TATAATTT
gi|49484                      :           AATGG---TA------TGAAACAAGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CCCAAAGACA----G----GA-----TGTATTGGCAAACTAGATC-GT--TG----T-----AACGGCCATAGAATTT
gi|49485                      :        caCAATTG--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-TAC-GC-AATGGCA----G----GT-----CATACTGGCAAACTAAATC-GT--TA----C-----AACGACCATAGAATTT
gi|49486                      :          CAATAG--GTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGAATTT-GAC-CC-AATGACA----G----GC-----TGTATTGGCAAATTTGATC-GT--TA----T-----AACGACCATCAAATT
gi|49487                      :          CAATGG--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49490                      :          CAATTG--GTA------TGAAACATGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGGCA----G----TT-----CATATTGGCAAACTAAATC-GT--T-----T-----AATGACCCTAGAATTT
gi|49491                      :          CAATTG--CTA------TGAAACACGT----CAGGC-AGCATTTTAAA-CC-AATGGCG----G----GT-----TGTATGGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACTATAGAATCT
gi|49494                      :          CAATTG--CTA------TGAAACACGT----CAAAC-AGCATTT-GAC-CC-AA-GGT-----T----GT-----TGTATTGGCAAACTAGCTC-GT--TA----T-----AACGATCATAGAATTT
gi|49495                      :          CAATTG--GTA------TGAAACACGT----CAGAC-AACATAT-GAC-CC-AATGGCA----G----GT-----TGTTTTGGCAAACTAAATC-GT--TG----T-----AACTATCATAG
gi|49498                      :          CAATTG--GTA------TGAAACATGT----CAGACAAGCATTT-GAC-CC-AATGACA----GGTACGT-----TGTATTAGCAAACTAGTTCGGTA-TA----T-----AACGACCATAGGATCT
gi|49499                      :          CAATTG--GTA------TGAAACACGT----TAGAT-AGCATTT-GAC-CC-AACGCCA----A----ATTTGTACATATTGGCAAACTAGATC-GT--TATAAGT-----AACGACCATAGAATTT
gi|49527                      :           AATGG--CTA------TGACACATGT----CAGAC-AGCATTT-GAT-CC-AATGACA----G----GT-----TGTATTGACAAACTAGATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAAT
gi|49530                      :           AATTA--CTA------TGAAACATGT----CACAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGACA----A----AT-----TGTATGGGCAAACTAAATC-GT--TA----T-----AACGACCACAGAATTT
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gi|49564                      :                   TA------TAAAACAGGT----CAAAC-AGTATTT-GAC-TC-AATGGCA----G----GT-----TGTATTGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCACAGAATTT
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gi|49566                      :            ATTG--CTG------TGAAACACGT----AAGAC-GGCATTT-GAC-CC-AATGACA----G----AT-----TGTATGGGCAAAATAGATC-GT--TA----T-----AACGACTATAGAATTT
gi|49568                      :             TGG--TTA------TGAA-CACGT----TAGAC-AGCATTT-GAC-CC-TGTGACA----G----GT-----TGTAGTGGCAAAGTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
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gi|49587                      :             TGG--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATACTGGTAAACTAAATC-AT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49623                      :                   TA------TGAAACACGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGAAA----G----GT-----TGTATGGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGATCAAAGAATTT
gi|49625                      :                   TA------TGAAACACGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATAGCA----G----GT-----TGTACTGGCAAACTAGCTC-GT--TA----T-----AACAACCATAGCATTT
gi|49629                      :                   TA------TGAAACACTT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGCA----G----GT-----TGTATGGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AGCGACTATAGAAATT
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consensus                     :      ACAATT---G--CTA------TGAAACACGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGCA----G----GT-----CGTATTGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
Reference ( family-45 )       :      ACAATT---G--CTA------TGAAACACGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGCA----G----GT-----CGTATTGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49107                      :      ACAATT---G--GTA------TGAAACACGT----CAGAC-AACATTT-GAC-TC-AATGACA----G----GT-----TGTATTGGTAAACTAGATC-GT--TG----T-----AACGAACATAGATTTT
gi|49108                      :      ATAGTT---G--ATA------TGAAATACGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CT-AATGACA----G----GT-----TATATTGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCAGAGAATTT
gi|49109                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGGTA----G----GT-----CATACTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49111                      :          TT---G---TA------TGAAACACGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGCA----G----GT-----TGTAATGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACAACCATAAAATTT
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gi|49132                      :      ACAATG---G--TTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
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gi|49163                      :      ACAATT---G--GTA------TGAAACACGT----CAGAC-AGCATTT-GCC-TC-AGTGGCA----G----GT-----TTTATTGGCAAACTGGATC-GT--TA----T-----AACAACCAAAGA
gi|49165                      :      ACAATT---G--CCA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGAA----G----GC-----CATACTGGCAAACCAAATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
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gi|49177                      :      ACAATG---G--TTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGATAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
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gi|49183                      :      ACAATG---A--TTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
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gi|49188                      :      ACAATT---GAGTTA------TGAAACACAT----CAAAC-AACATTT-AAC-CC-AATGGCA----G----GC-----CATATTGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCATCGAATTT
gi|49189                      :      ACAATT---G--GTA------GGAAGCACGTACGCCAGAC-AGCATTT-GAT-CC-AATGGCA----T----GC-----TGTATTGGCAAACTAGATC-GT--TA----TTATTCAACGACCATAGAATTT
gi|49190                      :      ATAATT---G--ACA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGGCA----G----GC-----CATAGTAGCAAACTAGATC-GT--TG----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49194                      :      ACAATTATAG--GTA------TGAAATACGT----CAGAC-----TTT-GAC-CC-AATGACA----G----GT-----TGTACTGGTAAATTCGATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49195                      :      ATAATT---T--GTA------TGAAACACGT----CAGAC-AGTATTC-GAC-CA-CGTGACA----G----AC-----TGTATTAGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACAACCATAGAATTT
gi|49198                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATC----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49200                      :      ACAATG---G--TTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACAATAGAATTT
gi|49202                      :      ACAATG---G--TTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGGCA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----ATCGACCATAGAATTT
gi|49203                      :      ACAATG---G--TTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGACA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AATTACCATAGAATTT
gi|49204                      :      ACAATT---G--CTG------CAAAACACGC----TAGAC-AGCATTT-GTC-TC-AATGACA----G----GT-----TGTAATGGTAAACTAGATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49208                      :      ACAATT---G--ACA------TGAAAGACGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CT-AAGGGCA----G----GT-----TGTATTGGGAAACTAGATC-AT--TA----T-----AACGACTATAGGAT
gi|49210                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTTAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49211                      :      ACAATT---G--GTA------TGAAACACGT----CATAC-AGCATTT-GAC-TC-AGTGGCA----G----GT-----TGTATTGGCAAAGTAGATT-GT--TA----T-----AACTACAACATAATTT
gi|49212                      :      ACAATT---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGCA----G----GC-----CATACTGGCGAACTAAATG-GT--TA----C-----AACGGCCATAGAATTT
gi|49213                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GGC-TC-AATGGTA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49215                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGGTA----G----GT-----CATACTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49217                      :      ACAATG---G--TTA------TGAAACACAC----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GC-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49218                      :      ACAACG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGGTA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49219                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGGTA----G----GT-----CATACTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49221                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----TAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGGCCATAGAATTT
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gi|49226                      :      ACAATA---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGGTA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGGCCATAGAATTT
gi|49227                      :      ACAGTT---G--CTA------TGACGCACGC----CAGAC-AGCATTT--AC-CC-AATGACA----G----GC-----CATACTGACAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
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gi|49242                      :      ACAATT---G--GCA------TGAAACACGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGACG----G----GT-----TGTATGGGCAAACTGGGTC-GC--TA----TGTAC-AACGGCC-TATAATTT
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gi|49486                      :       CAATA---G--GTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGAATTT-GAC-CC-AATGACA----G----GC-----TGTATTGGCAAATTTGATC-GT--TA----T-----AACGACCATCAAATT
gi|49487                      :       CAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49490                      :       CAATT---G--GTA------TGAAACATGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGGCA----G----TT-----CATATTGGCAAACTAAATC-GT--T-----T-----AATGACCCTAGAATTT
gi|49491                      :       CAATT---G--CTA------TGAAACACGT----CAGGC-AGCATTTTAAA-CC-AATGGCG----G----GT-----TGTATGGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACTATAGAATCT
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gi|49568                      :         ATT---GG-TTA------TGAA-CACGT----TAGAC-AGCATTT-GAC-CC-TGTGACA----G----GT-----TGTAGTGGCAAAGTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
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lowQualScore                  :           0000 222  222222          9999     4       4   4  4       8888 8888  00000                   4  99  8888 99999                
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Reference ( family-45 )       :      ACAATT---G--CTA------TGAAACACGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGCA----G----GT-----CGTATTGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49107                      :      ACAATT---G--GTA------TGAAACACGT----CAGAC-AACATTT-GAC-TC-AATGACA----G----GT-----TGTATTGGTAAACTAGATC-GT--TG----T-----AACGAACATAGATTTT
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gi|49111                      :          TT---G---TA------TGAAACACGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGCA----G----GT-----TGTAATGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACAACCATAAAATTT
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gi|49149                      :      ACAATT---G--CTA------TGAAACATGT----CAGAC-AGTATTT-GAT-CC-AATGGCA----G----AT-----TGTATGGGCATATTAGATC-GT--TA----T-----AACGGCCATAGAATTT
gi|49153                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--AA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49157                      :      ACAACG---G--CTA------TAAAACACCT----CAGAC-AGGATTT-GAT-CC-AATTACA----G----GT-----TGTATTGACAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49163                      :      ACAATT---G--GTA------TGAAACACGT----CAGAC-AGCATTT-GCC-TC-AGTGGCA----G----GT-----TTTATTGGCAAACTGGATC-GT--TA----T-----AACAACCAAAGA
gi|49165                      :      ACAATT---G--CCA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGAA----G----GC-----CATACTGGCAAACCAAATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49167                      :      ACAATT---G---TA------TGAAACACGT----TAGAC-AACATTT-GAC-CG-AATGGCA----G----GT-----TGTACTGGC-AACTAGATC-GT--TA----T-----AAAGACAATAGAATTT
gi|49171                      :      ACAATT---G--CTA------TTAAACACAC----CAAAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGCA----G----GT-----CATACTGGCAAACTAAATC-GT--TA----T-----AACGATCATAGAATTT
gi|49172                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----C-----AACGACCATAGAATTT
gi|49173                      :      ACAATT---G--CTACATGTATGAAGCACGT----CAGAC-AGCATTT-TAT-CC-AATGGAA----G----GC-----CGTACTGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49174                      :      ACAATG---G--CTG------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49175                      :      ACAATG---G--TTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATCT
gi|49176                      :      ACAATG---G--TTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATCT
gi|49177                      :      ACAATG---G--TTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGATAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49179                      :      ACAATT---G--CTA------TGAAGCATAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGCA----G----GT-----CATAATGGCAAATTAAATC-AT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49180                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAAAATTT
gi|49182                      :      ACAATT---G--CTA------TGAAACACGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CT-AAT-GCA----G----GC-----TATACTGGCAAACTAAAAC-GT--TA----T-----AACAACCACAGAATTT
gi|49183                      :      ACAATG---A--TTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49184                      :      ACAATG---G--TTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----A----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49185                      :      ACAATA---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GC-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49188                      :      ACAATT---GAGTTA------TGAAACACAT----CAAAC-AACATTT-AAC-CC-AATGGCA----G----GC-----CATATTGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCATCGAATTT
gi|49189                      :      ACAATT---G--GTA------GGAAGCACGTACGCCAGAC-AGCATTT-GAT-CC-AATGGCA----T----GC-----TGTATTGGCAAACTAGATC-GT--TA----TTATTCAACGACCATAGAATTT
gi|49190                      :      ATAATT---G--ACA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGGCA----G----GC-----CATAGTAGCAAACTAGATC-GT--TG----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49194                      :      ACAATTATAG--GTA------TGAAATACGT----CAGAC-----TTT-GAC-CC-AATGACA----G----GT-----TGTACTGGTAAATTCGATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49195                      :      ATAATT---T--GTA------TGAAACACGT----CAGAC-AGTATTC-GAC-CA-CGTGACA----G----AC-----TGTATTAGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACAACCATAGAATTT
gi|49198                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATC----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49200                      :      ACAATG---G--TTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACAATAGAATTT
gi|49202                      :      ACAATG---G--TTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGGCA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----ATCGACCATAGAATTT
gi|49203                      :      ACAATG---G--TTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGACA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AATTACCATAGAATTT
gi|49204                      :      ACAATT---G--CTG------CAAAACACGC----TAGAC-AGCATTT-GTC-TC-AATGACA----G----GT-----TGTAATGGTAAACTAGATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49208                      :      ACAATT---G--ACA------TGAAAGACGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CT-AAGGGCA----G----GT-----TGTATTGGGAAACTAGATC-AT--TA----T-----AACGACTATAGGAT
gi|49210                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTTAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49211                      :      ACAATT---G--GTA------TGAAACACGT----CATAC-AGCATTT-GAC-TC-AGTGGCA----G----GT-----TGTATTGGCAAAGTAGATT-GT--TA----T-----AACTACAACATAATTT
gi|49212                      :      ACAATT---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGCA----G----GC-----CATACTGGCGAACTAAATG-GT--TA----C-----AACGGCCATAGAATTT
gi|49213                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GGC-TC-AATGGTA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49215                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGGTA----G----GT-----CATACTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49217                      :      ACAATG---G--TTA------TGAAACACAC----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GC-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49218                      :      ACAACG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGGTA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49219                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGGTA----G----GT-----CATACTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49221                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----TAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGGCCATAGAATTT
gi|49222                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGGTA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AATGACCATAGAATTT
gi|49223                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----A----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCGTAGAATTT
gi|49224                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TT-AATGATA----G----GT-----CATATTGATAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49226                      :      ACAATA---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGGTA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGGCCATAGAATTT
gi|49227                      :      ACAGTT---G--CTA------TGACGCACGC----CAGAC-AGCATTT--AC-CC-AATGACA----G----GC-----CATACTGACAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49231                      :      ACAATT---G--GTA------TGAATGATGT----CAGAC-ATCATTT-GGC-CC-AATGACA----G----GC-----TATACTGGCGAACTAGATA-GT--TG----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49232                      :      ACAATT---G--CTA------TGAAACATAT----TAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGCA----G----GT-----CGTAATGGCAAACTAAATC-TT--TA----T-----AACGGCCATAGGATT
gi|49234                      :      ACAATT---G--CTA------TGAAACAAAC----CAGAC-AGGATTT-GAC-CC-AATGACA----G----GT-----CATACTAGCAATCTAAATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49236                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAT-CC-AATGGAA----G----GT-----CATATTGGCAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGTATTT
gi|49241                      :      ACAATT---G--GTA------TGAAACATGT----CGGAC-AGCATTT-GACACC-ATTGG-A----G----GT-----TGCATTGGCAAACTAGATC-AT--CA----T-----AATGACCACAGAATTT
gi|49242                      :      ACAATT---G--GCA------TGAAACACGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGACG----G----GT-----TGTATGGGCAAACTGGGTC-GC--TA----TGTAC-AACGGCC-TATAATTT
gi|49484                      :       CAAAT---G--GTA------TGAAACAAGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CCCAAAGACA----G----GA-----TGTATTGGCAAACTAGATC-GT--TG----T-----AACGGCCATAGAATTT
gi|49485                      :       CAATT---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-TAC-GC-AATGGCA----G----GT-----CATACTGGCAAACTAAATC-GT--TA----C-----AACGACCATAGAATTT
gi|49486                      :       CAATA---G--GTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGAATTT-GAC-CC-AATGACA----G----GC-----TGTATTGGCAAATTTGATC-GT--TA----T-----AACGACCATCAAATT
gi|49487                      :       CAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49490                      :       CAATT---G--GTA------TGAAACATGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGGCA----G----TT-----CATATTGGCAAACTAAATC-GT--T-----T-----AATGACCCTAGAATTT
gi|49491                      :       CAATT---G--CTA------TGAAACACGT----CAGGC-AGCATTTTAAA-CC-AATGGCG----G----GT-----TGTATGGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACTATAGAATCT
gi|49494                      :       CAATT---G--CTA------TGAAACACGT----CAAAC-AGCATTT-GAC-CC-AA-GGT-----T----GT-----TGTATTGGCAAACTAGCTC-GT--TA----T-----AACGATCATAGAATTT
gi|49495                      :       CAATT---G--GTA------TGAAACACGT----CAGAC-AACATAT-GAC-CC-AATGGCA----G----GT-----TGTTTTGGCAAACTAAATC-GT--TG----T-----AACTATCATAG
gi|49498                      :       CAATT---G--GTA------TGAAACATGT----CAGACAAGCATTT-GAC-CC-AATGACA----GGTACGT-----TGTATTAGCAAACTAGTTCGGTA-TA----T-----AACGACCATAGGATCT
gi|49499                      :       CAATT---G--GTA------TGAAACACGT----TAGAT-AGCATTT-GAC-CC-AACGCCA----A----ATTTGTACATATTGGCAAACTAGATC-GT--TATAAGT-----AACGACCATAGAATTT
gi|49527                      :        AATG---G--CTA------TGACACATGT----CAGAC-AGCATTT-GAT-CC-AATGACA----G----GT-----TGTATTGACAAACTAGATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAAT
gi|49530                      :        AATT---A--CTA------TGAAACATGT----CACAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGACA----A----AT-----TGTATGGGCAAACTAAATC-GT--TA----T-----AACGACCACAGAATTT
gi|49563                      :         ATT---G--GTG------TGAAACACGT----CAGAC-AGTATTT-GAC-CC-AAGGACA----G----GT-----TGTATAGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCACATAATTT
gi|49564                      :         ACT---G--GTA------TAAAACAGGT----CAAAC-AGTATTT-GAC-TC-AATGGCA----G----GT-----TGTATTGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCACAGAATTT
gi|49565                      :         ATT---G--GTA------TGGAACATGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CA-AATGGCA----G----GT-----TGTACTTGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCATAAAATTT
gi|49566                      :         ATT---G--CTG------TGAAACACGT----AAGAC-GGCATTT-GAC-CC-AATGACA----G----AT-----TGTATGGGCAAAATAGATC-GT--TA----T-----AACGACTATAGAATTT
gi|49568                      :         ATT---GG-TTA------TGAA-CACGT----TAGAC-AGCATTT-GAC-CC-TGTGACA----G----GT-----TGTAGTGGCAAAGTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49570                      :         ATT---G--GTA------TGAAACACGT----CAGAC-ATCATTT-GGC-CC-AGTGACA----G----GC-----TGTACCACCAAACTACATC-GT--TA----T-----AATGACCATAGAATTT
gi|49587                      :            ---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATACTGGTAAACTAAATC-AT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49623                      :                 tgTA------TGAAACACGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGAAA----G----GT-----TGTATGGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGATCAAAGAATTT
gi|49625                      :                   TA------TGAAACACGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATAGCA----G----GT-----TGTACTGGCAAACTAGCTC-GT--TA----T-----AACAACCATAGCATTT
gi|49629                      :                   TA------TGAAACACTT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGCA----G----GT-----TGTATGGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AGCGACTATAGAAATT
gi|49647                      :                    A------TGAAACACGT----CAGAC-AGCATTG-GAC-TC-AATGGCA----G----GT-----TGTATTGGCAAATTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCAAAGAATTT
gi|49653                      :                            GAAACACGT----CAGAC-AACATTT-GAC-CC-AATGGCA----G----GC-----CATACTGGCAAACTAAATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT


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blockSeqs                     :                A    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                G    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                T    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                T    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                T    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                T    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                T    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                T    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                G    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                T    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                A    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                G    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                G    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                G    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                T    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                T    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                T    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                T    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                T    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                G    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                A    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                G    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                G    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                T    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                T    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                T    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                A    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                G    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                T    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                G    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                G    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                G    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                G    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                G    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                G    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                G    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                G    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                G    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                G    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                G    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                G    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                G    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                C    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                .    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                .    .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                     .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                     .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                     .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                     .                                                                                              .    
blockSeqs                     :                                                                                                                    .    


blockSeqCons                  :      
originalCons                  :      ACAATT---G--CTA------TGAAACACGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGCA----G----GT-----CGTATTGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
finalCons                     :      ACAATT---G--CTA------TGAAACACGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGCA----G----GT-----CGTATTGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT

lowQualScore                  :           1111 333  111111          0000     0       0   0  0       0000 0000  11111                   0  00  0000 11111                
lowQualScore                  :           .... ...  ......          ....     .       .   .  .       .... ....  .....                   .  ..  .... .....                
lowQualScore                  :           0000 222  222222          9999     4       4   4  4       8888 8888  00000                   4  99  8888 99999                
consensus                     :      ACAATT---G--CTA------TGAAACACGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGCA----G----GT-----CGTATTGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
Reference ( family-45 )       :      ACAATT---G--CTA------TGAAACACGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGCA----G----GT-----CGTATTGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49107                      :      ACAATT---G--GTA------TGAAACACGT----CAGAC-AACATTT-GAC-TC-AATGACA----G----GT-----TGTATTGGTAAACTAGATC-GT--TG----T-----AACGAACATAGATTTT
gi|49108                      :      ATAGTT---G--ATA------TGAAATACGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CT-AATGACA----G----GT-----TATATTGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCAGAGAATTT
gi|49109                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGGTA----G----GT-----CATACTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49111                      :          TT---G---TA------TGAAACACGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGCA----G----GT-----TGTAATGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACAACCATAAAATTT
gi|49112                      : acattACAATT---G--GTA------TGAAACACGT----CAGAC-AACATTT-GAC-CC-AATGAAA----G----GC-----TGTATTTGCAAATTAGATC-GTTATA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49113                      :      ACAATT---G--GTC------TAAAACACGT----CATAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGCA----A----GT-----TATACTGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATT
gi|49114                      :      ACAATT---G--ATA------TGAAATACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-GATGACA----G----GC-----CATACTGGCAAACTAAATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49116                      :      ACAATT---G--CTA------TGAAATACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGTA----G----GT-----TATATTGGCAAACTAAATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGCATTT
gi|49119                      :      ACAATT---T--ATA------AGAAACGCGT----CAGAC-AGCATTT-GAT-CC-AATGACA----G----GT-----TGTATTGGCAAACTTGATC-GT--TA----T-----AACGACCCTAGAATTT
gi|49122                      :      ACAATT---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGCA----G----GT-----CATACTGGCAAACTAAATC-AT--TA----T-----AACGACCATAAAATT
gi|49123                      :      ACAATT---G--GTA------TGAAACATGT----CAGAC-AGCATTT-GAT-CC-AATGACA----G----GT-----TGCATTAGCAAACTAGATT-GT--TA----T-----AACTACCAC--AATTT
gi|49125                      :      ACAATT---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-AC-AATGGCA----G----GT-----CATACTGGCAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACAACCATAGAATTT
gi|49127                      :      ACAATG---G--TTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGGCA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49129                      :      ACAATG---G--TTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49130                      :      ACAATG---G--TTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49131                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49132                      :      ACAATG---G--TTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49134                      :      ACATTT---G--TTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGGCA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49135                      :      ACAATT---G--TTA------TGAAACATAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-ACTGACA----G----GC-----TATAATGGCAAACTTGATC-GT--TA----T-----AACGACCATGGAATTT
gi|49137                      :      ACAATT---G--GTA------TGAAACACGT----CAGAC-TGCATTT-GAC-AT-AATGACA----G----GT-----TGTATTGGCAAATGAGATT-GT--AA----T-----AACAACCATAGAGTTT
gi|49138                      :      ACAATT---G--CTA------TGAAA-ATAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AAAGGCA----G----GT-----CATATTGGCAAACTAAATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49139                      :      ACAATT---G--TTA------TGAAACACAT----CCGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGCA----G----GC-----CATACTGGCAAACTAAATC-GT--TA----A-----AACGACCATAGAATTT
gi|49140                      :      ACAATT---G--CCA------TGAAACATAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CG-AATGGTA----G----GT-----TGTACTGACAAACTAAATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATT
gi|49142                      :      ACAATT---G--ATA------TGAAACACGT----CGGAC-AGCAATT-GAC-CC-AATGGCAGGCTG----GC-----TGTATTGGCAAACTAGGTT-GT--TA----T-----TACGACCATAGAATTT
gi|49143                      :      ACAATT---G--GTA------TGAAACATAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-ACTGGCA----G----GT-----TGTGTGGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACAACC-TTGAATTT
gi|49148                      :      ACAATT---G--GTA------TGAAACATGT----TAGAC-AGTATTT-AGC-CC-AATGACT----G----GT-----TATATTGACAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACAACTATAGGATTT
gi|49149                      :      ACAATT---G--CTA------TGAAACATGT----CAGAC-AGTATTT-GAT-CC-AATGGCA----G----AT-----TGTATGGGCATATTAGATC-GT--TA----T-----AACGGCCATAGAATTT
gi|49153                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--AA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49157                      :      ACAACG---G--CTA------TAAAACACCT----CAGAC-AGGATTT-GAT-CC-AATTACA----G----GT-----TGTATTGACAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49163                      :      ACAATT---G--GTA------TGAAACACGT----CAGAC-AGCATTT-GCC-TC-AGTGGCA----G----GT-----TTTATTGGCAAACTGGATC-GT--TA----T-----AACAACCAAAGA
gi|49165                      :      ACAATT---G--CCA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGAA----G----GC-----CATACTGGCAAACCAAATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49167                      :      ACAATT---G---TA------TGAAACACGT----TAGAC-AACATTT-GAC-CG-AATGGCA----G----GT-----TGTACTGGC-AACTAGATC-GT--TA----T-----AAAGACAATAGAATTT
gi|49171                      :      ACAATT---G--CTA------TTAAACACAC----CAAAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGCA----G----GT-----CATACTGGCAAACTAAATC-GT--TA----T-----AACGATCATAGAATTT
gi|49172                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----C-----AACGACCATAGAATTT
gi|49173                      :      ACAATT---G--CTACATGTATGAAGCACGT----CAGAC-AGCATTT-TAT-CC-AATGGAA----G----GC-----CGTACTGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49174                      :      ACAATG---G--CTG------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49175                      :      ACAATG---G--TTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATCT
gi|49176                      :      ACAATG---G--TTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATCT
gi|49177                      :      ACAATG---G--TTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGATAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49179                      :      ACAATT---G--CTA------TGAAGCATAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGCA----G----GT-----CATAATGGCAAATTAAATC-AT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49180                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAAAATTT
gi|49182                      :      ACAATT---G--CTA------TGAAACACGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CT-AAT-GCA----G----GC-----TATACTGGCAAACTAAAAC-GT--TA----T-----AACAACCACAGAATTT
gi|49183                      :      ACAATG---A--TTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49184                      :      ACAATG---G--TTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----A----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49185                      :      ACAATA---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GC-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49188                      :      ACAATT---GAGTTA------TGAAACACAT----CAAAC-AACATTT-AAC-CC-AATGGCA----G----GC-----CATATTGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCATCGAATTT
gi|49189                      :      ACAATT---G--GTA------GGAAGCACGTACGCCAGAC-AGCATTT-GAT-CC-AATGGCA----T----GC-----TGTATTGGCAAACTAGATC-GT--TA----TTATTCAACGACCATAGAATTT
gi|49190                      :      ATAATT---G--ACA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGGCA----G----GC-----CATAGTAGCAAACTAGATC-GT--TG----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49194                      :      ACAATTATAG--GTA------TGAAATACGT----CAGAC-----TTT-GAC-CC-AATGACA----G----GT-----TGTACTGGTAAATTCGATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49195                      :      ATAATT---T--GTA------TGAAACACGT----CAGAC-AGTATTC-GAC-CA-CGTGACA----G----AC-----TGTATTAGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACAACCATAGAATTT
gi|49198                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATC----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49200                      :      ACAATG---G--TTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACAATAGAATTT
gi|49202                      :      ACAATG---G--TTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGGCA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----ATCGACCATAGAATTT
gi|49203                      :      ACAATG---G--TTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGACA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AATTACCATAGAATTT
gi|49204                      :      ACAATT---G--CTG------CAAAACACGC----TAGAC-AGCATTT-GTC-TC-AATGACA----G----GT-----TGTAATGGTAAACTAGATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49208                      :      ACAATT---G--ACA------TGAAAGACGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CT-AAGGGCA----G----GT-----TGTATTGGGAAACTAGATC-AT--TA----T-----AACGACTATAGGAT
gi|49210                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTTAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49211                      :      ACAATT---G--GTA------TGAAACACGT----CATAC-AGCATTT-GAC-TC-AGTGGCA----G----GT-----TGTATTGGCAAAGTAGATT-GT--TA----T-----AACTACAACATAATTT
gi|49212                      :      ACAATT---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGCA----G----GC-----CATACTGGCGAACTAAATG-GT--TA----C-----AACGGCCATAGAATTT
gi|49213                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GGC-TC-AATGGTA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49215                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGGTA----G----GT-----CATACTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49217                      :      ACAATG---G--TTA------TGAAACACAC----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GC-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49218                      :      ACAACG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGGTA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49219                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGGTA----G----GT-----CATACTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49221                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----TAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGGCCATAGAATTT
gi|49222                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGGTA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AATGACCATAGAATTT
gi|49223                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----A----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCGTAGAATTT
gi|49224                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TT-AATGATA----G----GT-----CATATTGATAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49226                      :      ACAATA---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGGTA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGGCCATAGAATTT
gi|49227                      :      ACAGTT---G--CTA------TGACGCACGC----CAGAC-AGCATTT--AC-CC-AATGACA----G----GC-----CATACTGACAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49231                      :      ACAATT---G--GTA------TGAATGATGT----CAGAC-ATCATTT-GGC-CC-AATGACA----G----GC-----TATACTGGCGAACTAGATA-GT--TG----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49232                      :      ACAATT---G--CTA------TGAAACATAT----TAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGCA----G----GT-----CGTAATGGCAAACTAAATC-TT--TA----T-----AACGGCCATAGGATT
gi|49234                      :      ACAATT---G--CTA------TGAAACAAAC----CAGAC-AGGATTT-GAC-CC-AATGACA----G----GT-----CATACTAGCAATCTAAATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49236                      :      ACAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAT-CC-AATGGAA----G----GT-----CATATTGGCAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGTATTT
gi|49241                      :      ACAATT---G--GTA------TGAAACATGT----CGGAC-AGCATTT-GACACC-ATTGG-A----G----GT-----TGCATTGGCAAACTAGATC-AT--CA----T-----AATGACCACAGAATTT
gi|49242                      :      ACAATT---G--GCA------TGAAACACGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGACG----G----GT-----TGTATGGGCAAACTGGGTC-GC--TA----TGTAC-AACGGCC-TATAATTT
gi|49484                      :       CAAAT---G--GTA------TGAAACAAGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CCCAAAGACA----G----GA-----TGTATTGGCAAACTAGATC-GT--TG----T-----AACGGCCATAGAATTT
gi|49485                      :       CAATT---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-TAC-GC-AATGGCA----G----GT-----CATACTGGCAAACTAAATC-GT--TA----C-----AACGACCATAGAATTT
gi|49486                      :       CAATA---G--GTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGAATTT-GAC-CC-AATGACA----G----GC-----TGTATTGGCAAATTTGATC-GT--TA----T-----AACGACCATCAAATT
gi|49487                      :       CAATG---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATATTGGTAAACTAAATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49490                      :       CAATT---G--GTA------TGAAACATGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGGCA----G----TT-----CATATTGGCAAACTAAATC-GT--T-----T-----AATGACCCTAGAATTT
gi|49491                      :       CAATT---G--CTA------TGAAACACGT----CAGGC-AGCATTTTAAA-CC-AATGGCG----G----GT-----TGTATGGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACTATAGAATCT
gi|49494                      :       CAATT---G--CTA------TGAAACACGT----CAAAC-AGCATTT-GAC-CC-AA-GGT-----T----GT-----TGTATTGGCAAACTAGCTC-GT--TA----T-----AACGATCATAGAATTT
gi|49495                      :       CAATT---G--GTA------TGAAACACGT----CAGAC-AACATAT-GAC-CC-AATGGCA----G----GT-----TGTTTTGGCAAACTAAATC-GT--TG----T-----AACTATCATAG
gi|49498                      :       CAATT---G--GTA------TGAAACATGT----CAGACAAGCATTT-GAC-CC-AATGACA----GGTACGT-----TGTATTAGCAAACTAGTTCGGTA-TA----T-----AACGACCATAGGATCT
gi|49499                      :       CAATT---G--GTA------TGAAACACGT----TAGAT-AGCATTT-GAC-CC-AACGCCA----A----ATTTGTACATATTGGCAAACTAGATC-GT--TATAAGT-----AACGACCATAGAATTT
gi|49527                      :        AATG---G--CTA------TGACACATGT----CAGAC-AGCATTT-GAT-CC-AATGACA----G----GT-----TGTATTGACAAACTAGATT-GT--TA----T-----AACGACCATAGAAT
gi|49530                      :        AATT---A--CTA------TGAAACATGT----CACAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGACA----A----AT-----TGTATGGGCAAACTAAATC-GT--TA----T-----AACGACCACAGAATTT
gi|49563                      :         ATT---G--GTG------TGAAACACGT----CAGAC-AGTATTT-GAC-CC-AAGGACA----G----GT-----TGTATAGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCACATAATTT
gi|49564                      :         ACT---G--GTA------TAAAACAGGT----CAAAC-AGTATTT-GAC-TC-AATGGCA----G----GT-----TGTATTGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCACAGAATTT
gi|49565                      :         ATT---G--GTA------TGGAACATGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CA-AATGGCA----G----GT-----TGTACTTGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCATAAAATTT
gi|49566                      :         ATT---G--CTG------TGAAACACGT----AAGAC-GGCATTT-GAC-CC-AATGACA----G----AT-----TGTATGGGCAAAATAGATC-GT--TA----T-----AACGACTATAGAATTT
gi|49568                      :         ATT---GG-TTA------TGAA-CACGT----TAGAC-AGCATTT-GAC-CC-TGTGACA----G----GT-----TGTAGTGGCAAAGTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49570                      :         ATT---G--GTA------TGAAACACGT----CAGAC-ATCATTT-GGC-CC-AGTGACA----G----GC-----TGTACCACCAAACTACATC-GT--TA----T-----AATGACCATAGAATTT
gi|49587                      :            ---G--CTA------TGAAACACAT----CAGAC-AGCATTT-GAC-TC-AATGATA----G----GT-----CATACTGGTAAACTAAATC-AT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT
gi|49623                      :                 tgTA------TGAAACACGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGAAA----G----GT-----TGTATGGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AACGATCAAAGAATTT
gi|49625                      :                   TA------TGAAACACGT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATAGCA----G----GT-----TGTACTGGCAAACTAGCTC-GT--TA----T-----AACAACCATAGCATTT
gi|49629                      :                   TA------TGAAACACTT----CAGAC-AGCATTT-GAC-CC-AATGGCA----G----GT-----TGTATGGGCAAACTAGATC-GT--TA----T-----AGCGACTATAGAAATT
gi|49647                      :                    A------TGAAACACGT----CAGAC-AGCATTG-GAC-TC-AATGGCA----G----GT-----TGTATTGGCAAATTAGATC-GT--TA----T-----AACGACCAAAGAATTT
gi|49653                      :                            GAAACACGT----CAGAC-AACATTT-GAC-CC-AATGGCA----G----GC-----CATACTGGCAAACTAAATC-GT--TA----T-----AACGACCATAGAATTT