lowQualScore                  :                22222    111111111                                                                            11111                                                                                                                             33333333333333333333333333333333333333333333333                                                                                                                   1111111    111      
lowQualScore                  :                11111    111111111  222  2222  333333  1    2222  1   2222   1  999 11 7777777 1  1  1 2222 1 11111 444444 11    1  44444444444444 11 33333333   22    11  111 0 77777777 0  11 1111 111 0  333 222 444444444 1111     2222 444 88888888888888888888888888888888888888888888888 555555555555 11 7777  11    11 22  1    44 11 1 55555 1  2222    55 2  1      1 1    33333 11 1  5     222 1  1   4444444    666      
lowQualScore                  :                .....    .........  ...  ....  ......  .    ....  .   ....   .  ... .. ....... .  .  . .... . ..... ...... ..    .  .............. .. ........   ..    ..  ... . ........ .  .. .... ... .  ... ... ......... ....     .... ... ............................................... ............ .. ....  ..    .. ..  .    .. .. . ..... .  ....    .. .  .      . .    ..... .. .  .     ... .  .   .......    ...      
lowQualScore                  :                44444    000000000  333  7777  555555  2    5555  1   4444   1  111 55 2222222 1  1  0 1111 0 99999 000000 44    0  00000000000000 33 55555555   22    22  666 9 66666666 9  22 9999 666 9  222 888 999999999 9999     0000 222 55555555555555555555555555555555555555555555555 888888888888 33 5555  33    33 66  0    55 44 0 99999 1  3333    99 3  2      2 2    22222 88 3  7     333 3  5   4444444    000      
consensus                     :         ATAAAAC---A-TGCT--N------TT---CC----CA------TA-GACT----TC-AAT----GTA-AA-A-T--T--CTA--G-GTGAA-A----T-A----AA------T--CAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGTG----G---A---A-----------T-----------A---T--T--T---AT-T--T------------G--A-T--GA--ACCC--T--TC-AAAA--T--G-A-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-A-TCCC-----A--C-CATCCATT---T-AC-TAG------ATATG--AAATATG
Reference ( gi|96032 )        :         ATAAAAC---T-TGCT--A------TT---CC----CA------TA-GACT----TC-AAT----GTA-AA-G-T--T--CTG--G-GTGAA-A----T-A----TA------T--CAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGTG----G---A---A-----------C-----------A---T--T--T---AT-C--T------------G--A-C--GA--ACCC--T--TC-AAAA--T--G-A-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-A-TCCC-----A--C-CACCCATT---T-AC-TAG------GTATG--CAATATG
gi|96033                      :         ATGAAAT---A-TGCT--A------TT---CC----CA------TA-GATT----TC-AAT----GTA-AA-G-T--T--CTG--G-TTAAA-A----T-A----TACATGTAT--TAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGTG----G---A---A-----------C-----------A---T--T--TTT-AT-T--T------------G--A-C--AA--ACCC--T--TC-AAAA--T--G-A-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-A-TCCC-----A--C-CACCCATT---T-AT-TAG------ATATG--AAATATG
gi|96034                      :         ATAAAAC---A-TGTT--A------TT---CC----CA------TA-TACT----CC-ACT----GTA-AA-A-T--T--GTG--G-GTGAA-A----T-A----AA------T--CAAG-GA-------C------T--A--------ATC--AAAT--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGTG----G---A---A-----------T-----------A---T--T--TTC-AT-T--T------------G--A-C--GA--GCCC--T--TC-AAAA--T--G-A-----T-AC----CATG--A-TT-GCAAAA-A-TCCC-----A--C-CATTCATT---T-AC-TAG------ATATG--AAATATG
gi|96036                      :         ACAAAAC---A-TGCT--ACATGTATT---CC----TA------TA-GACT----TC-AAT----GTA-AA-A-T--T--CTG--G-GTTAA-A----T-A----TA------T--CAAG-CA-------G------T--A--------ATA--AAAA--AAAAAT-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGATG----G---A---A-----------T-----------A---T--T--TTT-AT-T--T------------G--A-C--GA--ACCC--T--TC-AAAA--T--G-A-----T-AC----CATG--A-TT-ACATAA-A-TCCC-----A--C-CATCCATT---T-AC-TAGATACATGTATG--AAATACG
gi|96037                      :         ATAAAAC---A-TACT--A------TT---CC----CA------AA-GACT----TC-AAT----GTA-AA-A-T--T--CTG--G-GTAAA-A----T-A----TT------T--CAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----C---T-TC---C---T---------G----TGGTG----G---A---A-----------T-----------ACT-T--T--T---AT-T--T------------G--A-T--GA--ACCC--T--TC-AAAA--T--G-A-----T-AC----CGTGATA-TT-ACAAAA-A-TCCC-----A----CATCCATT---T-A
gi|96040                      :         ATAAAGC---A-TTAT--A------TT---CC----CA------TA-CACT----TC-AAT----GTA-AA---------------------------T-A----TA------T--CAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGTG----G---C---C-----------C-----------A---T--T--TTT-AT-T--T------------G--A-C--AA--ACCC--T--TC-AAAA--T--G-A-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-A-TCCC-----A--C-CACCCATT---T-AC-TAG------ATTTG--AAATATG
gi|96035                      :         ATAAAAC---A-TGCT--G------TT---CC----CA------TA-GACA----TC-AAT----GTA-AA-A-T--T--CCA--G-GGAAA-A----T-A----AA------T--CAAG-CA-------G------T--A--------ATC--CAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------T----TGAAA----G---A---A-----------T-----------A---T--T--TTAAAT----T------------G--A-T--GA--ACCC--T--TC-AAAA--T--G-A-----T-AC----CATG--A-TA-ACCAAA-A-TCCC-----A--C-CATTTATT---T-AC-TAG------ATATG--AAATATG
gi|96039                      :         ATAAAAC---A-TGCT--T------TT---CC----CA------TA-TATT----TC-AAT----GTA-AA-A-T--T--CCG--G-GGGAA-A----TTA----AA------T--CAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------T----TGGTG----G---A---A-----------T-----------A---T--T--TTA-AT-T--T------------G--A-T--GA--ACCC--T--TC-AAAA--T--G-A-----C-AC----CATA--A-TA-ACCAAA-A-TCGG-----A--C-GATTCATT---T-AC-TAG------ATATG--AAATATG
gi|96041                      :         ATAAAAC---A-TGCT--C------TT---CC----CA------TA-GACT----CT-AAA----GTA-AACG-C--T---TG--GTATAAACA----A-A----AA------C--CAAG-CA-------A------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGATG----G---ATT-G-----------C-----------T---T--C--T---AT-T--T------------C--A-T--GA--TCGC--T--TC-AAAA--T--G-A-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-A-TTCC-----A--T-CATCCATT---T-AC-TAG------ATATG--AAATACG
gi|96042                      :         ATAAAAC---A-TGTT--T------CT---CC----CA------TA-CAC------C-AAT----GTA-AA-A-T--T--CTA--G-GTGAA-A----T-A----AA------T--CAAG-TA-------T------T--A--------ATC--AAAA---T---T-T--------A-AA--A----A---A-TC---C---A---------A----TGGTG----G---ATT-A-----------T-----------T---T--T--T---AT-T--T------------G--A-T--GA--ACTC--T--TC-AAAAT-T--G-A-----T-AC----CATG--A-TT-ACAGAA-A-TCCA-----A--C-C-TTCATT---T-ACTTGG------GTATT--TAATATG
gi|96038                      :         ATAAAAC---A-TACT--A------TT---CC----AA-------A-GACT----TC-AAT----GTA-AA-A-T--G---TG--G-GTAAA-A------A----TT------T--CAAG-CA--------------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-TT-------G-AA--A----C---T-TC---C---T---------G----TGGTG----G---A---A-----------T-----------ACT-T--T--T---AT-T--T------------G--A-T--GA--ACCC--T--TC--AAA--T--G-A-----T-AC----CGTGATA-TT-ACAAAA----TCC-----A----CATCCATTTTAT-AC-TA
gi|96043                      :         ATAAAAC---A-TTTT--C------TT---CC----CA------TA-GTCT----TC-AAT----GTA-AA-A-T--T--CTA--G-GTGAA-A----T-A----AA------T--GAAA-CA-------G------T--T--------ATC--AAAA--TT---T--------------------------------C---C---------A----TGGTA----G---A---T-----------T-----------A---T--T--TTC-AT-T--A------------G--A-T--GA--AGCA--T--TC-AGAA--T----A-----T-AC----GATG--G-TT-ACAAAA-A-TCCC-----A--C-CATTCATT---T-AT-TAG------ATAT
gi|96044                      :         ATAAAAC---A-AGCT--C------TT---CC----CAGTCGGCCG-GACT----TC-AATTAATGTA-AA-G-C--T--CGA--T-ATAAA-A----T-A----AA------T--CGAG-CA-------A------T--A--------ATT--G-----TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGCG----G---A-------------------------------T--TAAT---AT-T--T------------G--G-T--GA--ACCC--T--TC-AAAA--C--G-ATACG-T-AC----CATG--A-TT-GCAAAA-A-ACC---------C-CATCCTTT---T-AC-TAG------ATATG--AAATATGaa
gi|96046                      :         ATAAAGC---A-TGCT--C------TT---AC-----A-------A-GACT----TC-AAT----GTA-AA-A-T--T--CAA--G-ATGAA-A----T-A----AA------T--TGGG-CA-------G------A--A--------GTA--AAAA--TT---T-T--------G-TA--A----A---T-TC---C---T---------T----TGGGG----GTT-A---A-----------T---------------T--T--C---AT-T--T------------G--A-T--AA--ACCC--T--TC-CAAA--T--G-A-----T-AC----CACA--A-TT-ATAAAA-A-TCAT-----A--C-CACTCATT---T-
gi|96045                      :         ATAAAAC---A-TGCT--C------TC---CA----AA------TA-GACG----T--AAT----TTA-AA-A-TACTAGCTA--G-GTCTA-A----T-A----AA------T--CAAA-AA-------G------T--G---------TT--GTTG--TT---T-TTTAAAT--G-AA--C----A---T-TT---C---T---------G----TGGTT----G---ATG-A-----------T-----------T---T--T--T---AT-T--T------------G--A-T--GA--ACCC--T--TC-AAAA--T--G-A-----C-AC----CATG--A-TT-ACGAAA-A-TCCC-----A--C-CATCTATT---T-AC-TAG------ATATG--AAATATG
gi|96047                      :         ATAAAAT---A-TGCT--T------TT---CC----CA------TG-GATT----TC-AAT----GTA-AA---T--T--CTT--G-GTCAA-A----C-A----AT------T--CAAA-TA-------G------A--A--------ATA--AAAA--TT---C-T--------G-AA--A----A---T-TC---T---T---------A----CGGTA----G---A---T-----------G-----------A---T--T--TTC-AT-T--T------------G--A--------ACCC--T--TC-AAAA--T--G-A-----T-AC----CATG--C-TT-ACAAAA-A-
gi|96050                      :         ATAAAAC---A-TGCT--G------TT---CC----CA------TA-AACT----TT-A-T----GTA-CA-A-T--T--CTG--G-GTGAA-A----T-A----TA------T--CAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-CC---C---TTA-------A----TGAT
gi|96048                      :         ATAAAGC---A-TGCC--C------TT---TC----CA------TA-GATT--------------GTA-----------------G-GTAAA-A----T-A----AA------T--CAAT-AA-------G------T--G--------ATC--AAAA--TT---T-C--------T-AA--A----A---T--C---T---T---------A----TGGTG----ATTTA---A-----------T---------------T--T--C---AT-T--T------------G--A-A--TA--ACTC--T--TC-AAAA--G--T-A-----T-AC----CATA--A-TT-ACAAAA-A-TTCC-----C--C-CATTAATT---T-AT-CAG------ATATG--ACATATGtagggatgt
gi|96049                      :         ATGAAAC---A-TGCT--G------TT---CC----CA------TA-GACT----TC-AAT----GTA-AA-AAT--T--CTA--G-ATCAA-A----T-G----AA------T--AAAG-AA-------A------T--A--------ATC--AAAA--GT---T-T--------G-AA--A----A---T-TT---C---T---------A----TGGTG----GGT-A---AT----------T-----------T---T--T--T---AT-T--C------------G--A-C--GA--
gi|96051                      :         ATAAAAC---A-TCTT--G------TT---CC----CA------TA-GACT----TC-AAT----GTA-A
gi|96052                      :         ACAAAACA--TATGCT--C------TT---CC----CA------TA-TACT----TC-AAT-----TG-AA-G-T--C--AT-----------A----T-A----AA------T--CAAA--A-------G------T--A--------ATC--AAAA--AT---A-T--------G-AA--G----A---T-TC---T---T---------A----TGGTG----G---G----------------------------------T--T---ATAT--T------------G--A-T--GA--ACTC--T--Tttaaacttttgaaactttttatggtggaataattttatttgacgaacccttctaaaggataccatg
gi|96054                      :         ATATAAC---A-TGCT--C------TT---CA----CA------CA-GACT----TC-G-T----GTA-AA-A-T--T--CTACTG-GTGAA-A----T-A----AA------T--CACG-CA-------G------T--AAAAAGGTTATC--AAAA--TT---T-T--------A-AA--T----A---T-
gi|96053                      :         ATAAAAG---TATGTT--C------TT---CCTAGTCA------TATGACTGAATTT-ATT----GTA-AA-A-T--T--CAA--G-GGGAG-A----T-A----AA------T--CAAG-CT-------G------T--A--------ATC--AAAA--GT---T-T--------G-TA--A----A---T-TC---T---G---------A----TGATG----G---A---T-----------T-----------A---T--T--TTTGAT----T------------A--A-C--AA--AAAT--C--AC-AAAATTT--A-AT----T-AT----TATATTA-TT-ATAAAA-A-T
gi|96055                      :         ATAAAAC---A-TGAT--A------TT---CT----CA------TA-AACT----TC-AAT----GTA-AA-A-T--A--CTG--G-GT--A-A----T-A----T
gi|96056                      :          TAGAAC---A-TGCT--C------TT---TC----CA------TA-GACT----CC-AAG----GTA-AA-A-T--T--CTA--G-GTGAC-A----T-T----AA------T--CAAA-CA-------C------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---C---------A----TGGTG----G---A---T-----------T-----------A---T--T--TTC-AT-T--T------------G--A-T--GA--ACCC--T--TC-AAAA--T--G-A-----C-AC----CATG--ATTT-GCTAAA-A-TGCC-----A--C-CATCTATT---A-CC-TAGT-----ATATG--AAATATG
gi|96057                      :          TAAAACGGCC-TGCT--A------TT---TC-----A------CA-AACT----TT-AAT----GTC-AA-A-T--T--CTT--G-GTGAA-A----T-A----AA------T--CAAG-CA-------G------T--A--------ATT--GAAA--TT---T-C--------ATAATTA----A---T-TC---C---C---------G-----AGAG----G---A---------------------------T---T--T--T---AG-T--T------------C--A-CT-GA--ACCA--A--TC-AAAA--T--G-A-----T-GCCATGCATG--A-TT-AC--AA-A-TCCC-----A--C-CATACATT---T-
gi|96058                      :          TAAAAC---A-TGCC--C------TTTCACC----C-------TG-CACT----TT-AAT----GTA-AA-A-T--T--CTA--A-GTAAA-G----T-A-----A------T--AAA-----------------------------------AAAA--TT---C------------AA--A----A---T-TC---C---A---------A----TGGTG----A---A---T-----------T-----------A---T--T--TTT-AT-T--T------------G--A-T--GA--ACCC--T--TC-ACAG--T--G-A-----T-AC----CATG--ctttgatagaaaatgtg
gi|96059                      : taaaacatgcAAAGC---A-TGCTCTA------TT---T------A------TA-AACT----TC-AAT----GTA-AA-A-T--C--CAA--A-GTAAA-A----T-AGCGGTAA-----T--CAAG-TACTAGTTCG------T--A--------ATA--AGAA--TT---T-T--------G--------------C-TT---C---T---------A----TAGTG----T---A---T-----------T-----------A---T--T--TTT-AT-T--T------------G--A-T--AA--ATCC--C--TA-AAAA--T--G-A-----T-AC----CATG--A-TC-ATAAAA-A---CT-----ATTC-CACCCATT---
gi|96061                      :             AAC---A-TGCT--C------TT---TT----CT------TA-GAC------C-AAT----GTA-AA-G-T-------------------------------A------T--CAAG-CA-------G------T--A--------ATG--AAAG--TT---T-T--------C-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGTG----A---ATT-A-----------T-----------T---T--T--T---GT-T--T------------G--A-T--GA--ACCC--T--TC-AACA--C--G-A-----T-A
gi|96064                      :                    -TGCT--C------AT---CC----TA------TA-GATT----TC-AGT----GTG-AA-A-T--T--GGA--G-GTCAA-A----T-A----AG------T--CTAG-CA-------G------T--T--------ATC--GAAA--TT---T-T--------G-TA--A----A---T-TC---C---TGTGGTTTTGA----TGGTG----G---A---T-----------T-----------G---T--TC-T---CT-CC-T------------G--A-TTAAA--ACCC--T--TC-AA
gi|96062                      :                       aT--A------TC---CC----TG------TA-GACG----TC-GTT----ATC-GA---T--T--TTGA-G-GTGAA-A----T-G----TA------C--CA---------------------------------C--A-----TT---T-T--------G-AA--A----A---A-TC---C---T---------A----GGGTGTGTTG---T---A-----------CTCCCGGGTTGTA---C--T--T---AT-T--T------------G--T-T--AA--ACCC--T--TC-AAAA--T--G-A-----T-AC----TATG--G-AT-ACAAAA-A-TC
gi|96065                      :                  aacaaat--A------CT---CC------------TA-GACT----TC-AAT----GTAGAA-A-C--T--CTA--G-ATGAA-A----T-A----AA------A--CAAG-CC-------G------T--T--------ATC--AAAA--TT---C-T--------G--A--A----C---T-TC---C---T---------G----TGGTG----G---gcccgttcgcgttattaga
gi|96066                      :                                              A------TA-TACT----TC-AAT----GCC-AA-A-T--T--TAA--G-GTGAG-A----T-T----AA------T--CAAG-CA-------G------T--A--------ATT--AAAA--CT---T-T--------G-AA--A----A---AATC---CAATC---------A----TGATG----G---A---A-----------T-----------A---TATT--T---AT-T--T------------G--A-T--AA--AACC--T--TC-AGGT--T--G-A-----T-AC----CATG--A-TT-ATAAAA-A-CCAC-----A--C-CATCCATA---C-AC-AAG------ATATG--AAATGTG
gi|96060                      :                                               ------TA-GACT----CCCAAT----ATA-AA-A-T--C--TTA--G-ATGAA-AACTCC-A----CA------T--CAAG-CA-------G------TTAA--------GTC--AAAA--AT---T-T--------G-AA--A----A---T-TCATAC---T---------C----TGGTG----G---ATTTA-----------T-----------T---T--T--T---GT-T--C------------T--A-T--AA--ACCC--CCATCGAAAA--T--GAA-----T-AC----CATG--ATTT-GC-AAA-A-TCCTTAAAAA--T-TA-CAGTT---T-AG-TAG------ATATG--AAATATG
gi|96067                      :                                          aaaatatattcttcattt----TC-AAT----GTA-AA-A-T--T--TGA--A-GTGAA-A----A-A----AA------G--CAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-TA--A----A---T-TCTTGC---T---------G----AGGTG-------------------------------------------T--T---AT----T------------A--A-----A--ACCC--TGCTC-CGAA--T--G-
gi|96063                      :                                                                 C-AAT----ATA-GA-A-T--T--TAC--G-GTGAA-A----T-A----AG------C--CAAG-CA-------C------T--G--------AGA--ACAA--TT---T-T--------G-TA--A----A---T-CC---C---T---------T----TGGTG----A---A---T-----------T-----------A---TTCT--T---AT-T--T------------G--A-T--GA--ATCT--A--TC--AAA--T--G-A-----T-AC----TATG--A-T
gi|96068                      :                                       acatgttcttcctaaattcactttgaa-AAT----GTA-AA-A-G--T--CAA--G-GTGAA-A----T-A----TG------T--CAAG-CA-------ATATGCCT--A--------ATG--AAAC--TT---T-T--------A-TC--A----A----------C---T---------A----TGTTG----G---ATT-A-----------T-----------T---T--T--T---AT-T--T------------G--A-T--AA--ACCA--T--TC-AAAA--TTAT-A-----T-AC----CATG--G-TTGATAAAA-A-TCAC-----A--T-CA---ATT---T-
gi|96069                      :                                                                             -AA-A-C--T--CAA--G-GTGTA-A----T-A----AA------T--CAAG-TA-------A------T--A--------ATC--AAGA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---T---G---------A----TGGGG----G---G---GGGAGGGGGTGGT-----------A---T--T--T---------T------------G--T-T--GA--ACCA--T--TC-AAAA--T--G-A-----T-AC----CATG--A-TT-TCGAAA-A-TCCC-----A--C-CGTCCATT---C-AC-TAA------ATATG--AAAT
gi|96070                      :                                                                                  -T--T--CTG--G-GTAAA-A----T-A----AA------G--CA-G-CA-------G------T--A--------ATTTAAAGA--CT---T-T--------C-AA--T----A---T-TC---G---T---------A----TGTTG----A---A---T-----------T-----------A---T--T--TCT-AT-T--T------------A--A-T--GA--AATG--T--TC-AAAAA-T--G-A-----T-AC----TATT--A-TT-ACAAAATA-T-TT-----A--C-CATTCATT---T-AC-TAG------AAATA--AAAT
gi|96072                      :                                                                                                   AA-A----T-A----AA------T--CAAGGCA-------G------T--A--------ATCC-AAAA--TT---T-TT-------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------T----TGGTG----G---A---A-----------T-----------ACGTT--T--T---AA-G--T------------G--A-T--GA--AACCTTT--TC-CAAA--T--G-A-----TAAC----CATC--G-TA-ACCAAA-T-TCCC-----A--CACATTCATT---T-AC-TGG------ATA
gi|96071                      :                                                                                                   AA-A----T-A----TA------TAATAAG-CA-------GAT----T--T--------ATA--AAAGATTT---T-T--------G-AA--A----A---A-TC---CCT-T---------A----TGGTG----G---A---A-----------C-----------A---T--C--TTC-AT-T--T------------G--AAC--GAGAAACC--T--TC-AAA---T--G-A-----T-AC----CATG--A-TT-A-GAAA-A-T--C-----A--C---CCCATT---T--C-TAG------CTATG--AAATatggaaata
gi|96073                      :                                                                                                   aA-A----C-A----CA------T--CAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--C----A---T-TC---C---C---------A----TGGCG----G---A---A-----------C-----------ATT-T--T--T---AT-T--T------------G--A-C--GA--ATCC-------------------------C-AC----CA-------------------CCC---------------ATT---T-AC-TAG------ATATG--AAATATG
gi|96074                      :                                                                                                                                   A-------G------T--A--------ATC--AAAG--TT---T-T--------G-TA--A----A---T-TC---C---T---------A----CTATG----C---A---A------------------------------T--T---A---------------------------A--ACTC--T--TC-AAAA--T--G-A-----C-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATTCCC-----A--T---TCTGTT---TGAT-TAG------ATATG--AAA
gi|96051                      :                                                                                                                                    -------G------T--A--------ATT--AAAC--TT---T-T--------G-AA--A----C---T-TT---T---T---------A----TGGTG----G---A---A-----------T-----------AAT-T--T--T---AT-T--T------------G--A-C--GA--ACCC--T--TC-TAAA--G--G-A-----T-AC----CATG--
gi|96075                      :                                                                                                              ataaaacatcttgttcccatagacttcaat------T--A--------AT---GAAA--TT---TAT--------G-AA--GCATTA---T-TC---T---T---------G----GGGTG----A---A---T-----------T-----------A---T--T--T----T-CATT------------A--A-T--GA--AATC--T--TC-AAAA--T--G-AAATGAT-CC----CATA--A-TT-ACAAAT-A-TCCC-----A--C-CATCCATT---T-AC-TA
gi|96076                      :                                                                                                                                                                 --AAAA--GT---T-A--------G-AA--A----AATAT-TT---C---T---------G----GGGTG----G---A---T-----------T-----------A---C--TG-T---AT-T--TT-----------G--A-T--AA--ATCC--G--TC-CATA--T--T-G-----T-AT----TATG--A-TT-ACAAAA-A-TCAC-----A--C-CAGCCATC---T-AT-TAG------ATATG--AAATATGaat
gi|96077                      :                                                                                                                                                                    AAA--TT---T-TAATAGAGAG-AA--A----G---T-GC---A---T---------A----TGGTG----G---G---A-----------T-----------A---T--A--T---AT-T--TCAAGTGTATGAAGTTA-T--GA--ACCC--T--TC-AAAA--T--G-A-----T-AC----CATATAA-TT-ACAAAA-A-TCCT-----A--C-CATACATT---T-AC-CAGATAC--GTATA--AAATAT
gi|96078                      :                                                                                                                                                                      A--TT---T-T--------G-AC--A--------T-CC---C---T---------ACTTATGATG----G---A---A-----------T-----------A---T--T--TTT-AT-T--T------------G--A-T--GA--ACCC--T--
gi|96079                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          CT--T--TC-AAAAA-T--A-A-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-A-TCCC-----A--C-CACCCAT---------TAA------ATCTGTCCAATATG





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                     2222222222222222222222222222                                                                                                                                                    
lowQualScore                  :               1  222 11   4444444  222 1 2222  333333  1 11   2222 2222 1   2222   1   1 11 11 3333   22   2222 1 55555 111 11     1  3333333 444444 11 33333333   22    11  111 0 77777777 0  11 1111 111 0  333 222 444444444 1111    11 1111 444 2222222222222222222222222222  0 11 555555555555 11 0 222      11 22  1    3 11  33333 1  4444    44 1  2      1     11 11 1  1  1  1 1 222 1 11 1  222 1 444444 1  1 3333       
lowQualScore                  :               .  ... ..   .......  ... . ....  ......  . ..   .... .... .   ....   .   . .. .. ....   ..   .... . ..... ... ..     .  ....... ...... .. ........   ..    ..  ... . ........ .  .. .... ... .  ... ... ......... ....    .. .... ... ............................  . .. ............ .. . ...      .. ..  .    . ..  ..... .  ....    .. .  .      .     .. .. .  .  .  . . ... . .. .  ... . ...... .  . ....       
lowQualScore                  :               2  111 77   5555555  111 2 6666  333333  1 66   4444 4444 1   3333   1   0 44 44 1111   11   0000 0 77777 777 33     0  1111111 000000 33 44444444   22    22  555 9 44444444 9  22 8888 555 9  111 888 888888888 9999    22 9999 000 6666666666666666666666666666  9 22 666666666666 22 9 888      33 66  0    1 44  77777 1  6666    55 1  4      2     77 77 2  2  2  2 2 111 2 88 4  444 4 111111 5  5 3333       
consensus                     :         ATAAAA-CA---T--GCTC------TT---C-C----CA------TA-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CTA--GGTG-AAA----T-A-----A---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGT--G----G---A---A-----------TA---T--T-T--AT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATCCC--A--C-CA-TC-CA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
Reference ( family-447 )      :         ATAAAA-CA---T--GCTN------TT---C-C----CA------TA-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CTA--GGTG-AAA----T-A-----A---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGT--G----G---A---A-----------TA---T--T-T--AT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATCCC--A--C-CA-TC-CA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96032                      :         ATAAAA-CT---T--GCTA------TT---C-C----CA------TA-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAG-T--T--CTG--GGTG-AAA----T-A-----T---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGT--G----G---A---A-----------CA---T--T-T--AT-C--T------------G--A-C---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATCCC--A--C-CA-CC-CA-T-T---T-A--C-TA---G-G------T-AT-G----CAATATG
gi|96033                      :         ATGAAA-TA---T--GCTA------TT---C-C----CA------TA-G--ATT----T----C-AAT----GTA-AAG-T--T--CTG--GTTA-AAA----T-ATAC--ATGTA--TTAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGT--G----G---A---A-----------CA---T--T-TTTAT-T--T------------G--A-C---AAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATCCC--A--C-CA-CC-CA-T-T---T-A--T-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96034                      :         ATAAAA-CA---T--GTTA------TT---C-C----CA------TA-T--ACT----C----C-ACT----GTA-AAA-T--T--GTG--GGTG-AAA----T-A-----A---A--TCAAG-GA-------C------T--A--------ATC--AAAT--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGT--G----G---A---A-----------TA---T--T-TTCAT-T--T------------G--A-C---GAGCCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-GCAAAA-ATCCC--A--C-CA-TT-CA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96035                      :         ATAAAA-CA---T--GCTG------TT---C-C----CA------TA-G--ACA----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CCA--GGGA-AAA----T-A-----A---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--CAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------T----TGAA--A----G---A---A-----------TA---T--T-TTAAA-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TA-ACCAAA-ATCCC--A--C-CA-TT-TA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96036                      :         ACAAAA-CA---T--GCTACATGTATT---C-C----TA------TA-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CTG--GGTT-AAA----T-A-----T---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATA--AAAA--AAAAAT-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGAT--G----G---A---A-----------TA---T--T-TTTAT-T--T------------G--A-C---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACATAA-ATCCC--A--C-CA-TC-CA-T-T---T-A--C-TA---G-ATACATGT-AT-G----AAATACG
gi|96037                      :         ATAAAA-CA---T--ACTA------TT---C-C----CA------AA-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CTG--GGTA-AAA----T-A-----T---T--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----C---T-TC---C---T---------G----TGGT--G----G---A---A-----------TACT-T--T-T--AT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CGTGATA-TT-ACAAAA-ATCCC--A----CA-TC-CA-T-T---T-A--
gi|96038                      :         ATAAAA-CA---T--ACTA------TT---C-C----AA-------A-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--G---TG--GGTA-AAA------A-----T---T--TCAAG-CA--------------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-TT-------G-AA--A----C---T-TC---C---T---------G----TGGT--G----G---A---A-----------TACT-T--T-T--AT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC--AAA-T--GA-----T-AC----CGTGATA-TT-ACAAAA---TCC--A----CA-TC-CA-T-TTTAT-A--C-TA---
gi|96039                      :         ATAAAA-CA---T--GCTT------TT---C-C----CA------TA-T--ATT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CCG--GGGG-AAA----TTA-----A---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------T----TGGT--G----G---A---A-----------TA---T--T-TTAAT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----C-AC----CATA--A-TA-ACCAAA-ATCGG--A--C-GA-TT-CA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96040                      :         ATAAAG-CA---T--TATA------TT---C-C----CA------TA-C--ACT----T----C-AAT----GTA-AA-------------------------T-A-----T---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGT--G----G---CCC-A-----------TT---T--T-T--AT-T--T------------G--A-C---AAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATCCC--A--C-CA-CC-CA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-TT-G----AAATATG
gi|96041                      :         ATAAAA-CA---T--GCTC------TT---C-C----CA------TA-G--ACT----C----T-AAA----GTA-AA--C--G--CTT--GGTATAAA----C-A-----A---AAACCAAG-CA-------A------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGAT--G----G---A---T-----------TG---C--T-TCTAT-T--T------------C--A-T---GATCGC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATTCC--A--T-CA-TC-CA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATACG
gi|96042                      :         ATAAAA-CA---T--GTTT------CT---C-C----CA------TA-C--AC----------C-AAT----GTA-AAA-T--T--CTA--GGTG-AAA----T-A-----A---A--TCAAG-TA-------T------T--A--------ATC--AAAA---T---T-T--------A-AA--A----A---A-TC---C---A---------A----TGGT--G----G---ATT-A-----------TT---T--T-T--AT-T--T------------G--A-T---GAACTC--T--TC-AAAATT--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAGAA-ATCCA--A--C-C--TT-CA-T-T---T-A--CTTG---G-G------T-AT-T----TAATATG
gi|96043                      :         ATAAAA-CA---T--TTTC------TT---C-C----CA------TA-G--TCT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CTA--GGTG-AAA----T-A-----A---A--TGAAA-CA-------G------T--T--------ATC--AAAA--TT---T--------------------------------C---C---------A----TGGT--A----G---A---T-----------TA---T--T-TTCAT-T--A------------G--A-T---GAAGCA--T--TC-AGAA-T---A-----T-AC----GATG--G-TT-ACAAAA-ATCCC--A--C-CA-TT-CA-T-T---T-A--T-TA---G-A------T-AT-A----
gi|96044                      :         ATAAAA-CA---A--GCTC------TT---C-C----CAGTCGGCCG-G--ACT----T----C-AATTAATGTA-AAG-C--T--CGA--TATA-AAA----T-A-----A---A--TCGAG-CA-------A------T--A--------ATT--G-----TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGC--G----G---A---T-----------TA---A--T----AT-T--T------------G--G-T---GAACCC--T--TC-AAAA-C--GA-----T-ACGTACCATG--A-TT-GCAAAA-AACCC-------CA-TC-CT-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96045                      :         ATAAAA-CA---T--GCTC------TC---C-A----AA------TA-G--ACG----T------AAT----TTA-AAA-TACTAGCTA--GGTC-TAA----T-A-----A---A--TCAAA-AA-------G------T--G---------TT--GTTG--TT---T-TTTAAAT--G-AA--C----A---T-TT---C---T---------G----TGGT--T----G---ATG-A-----------TT---T--T-T--AT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----C-AC----CATG--A-TT-ACGAAA-ATCCC--A--C-CA-TC-TA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96046                      :         ATAAAG-CA---T--GCTC------TT---A-C-----A-------A-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CAA--GATG-AAA----T-A-----A---A--TTGGG-CA-------G------A--A--------GTA--AAAA--TT---T-T--------G-TA--A----A---T-TC---C---T---------T----TGGG--G----GTT-A---A-----------T----T--T-C--AT-T--T------------G--A-T---AAACCC--T--TC-CAAA-T--GA-----T-AC----CACA--A-TT-ATAAAA-ATCAT--A--C-CA-CT-CA-T-T---T-
gi|96047                      :         ATAAAA-TA---T--GCTT------TT---C-C----CA------TG-G--ATT----T----C-AAT----GTA-AA--T--T--CTT--GGTC-AAA----C-A-----A---T--TCAAA-TA-------G------A--A--------ATA--AAAA--TT---C-T--------G-AA--A----A---T-TC---T---T---------A----CGGT--A----G---ATG-A-----------TT---T--T-C--AT-T--------------------T---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--C-TT-ACAAAA-A
gi|96048                      :         ATAAAG-CA---T--GCCC------TT---T-C----CA------TA-G--A----------------------------T--T--GTA--GGTA-AAA----T-A-----A---A--TCAAT-AA-------G------T--G--------ATC--AAAA--TT---T-C--------T-AA--A----A---T--C---T---T---------A----TGGT--G----ATTTA---A-----------T----T--T-C--AT-T--T------------G--A-A---TAACTC--T--TC-AAAA-G--TA-----T-AC----CATA--A-TT-ACAAAA-ATTCC--C--C-CA-TT-AA-T-T---T-A--T-CA---G-A------T-AT-G----ACATATG
gi|96049                      :         ATGAAA-CA---T--GCTG------TT---C-C----CA------TA-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAAAT--T--CTA--GATC-AAA----T-G-----A---A--TAAAG-AA-------A------T--A--------ATC--AAAA--GT---T-T--------G-AA--A----A---T-TT---C---T---------A----TGGT--G----GGT-A---AT----------TT---T--T-T--AT-T--C------------G--A-C---GA
gi|96050                      :         ATAAAA-CA---T--GCTG------TT---C-C----CA------TA-A--ACT----T----T-A-T----GTA-CAA-T--T--CTG--GGTG-AAA----T-A-----T---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-CC---C---TTA-------A----TGATTAG----G---G---A-----------TG---T--
gi|96051                      :         ATAAAA-CA---T--CTTG------TT---C-C----CA------TA-G--AC---------------------------T--T--C------------------------A---A--T--------------G------T--A--------ATT--AAAC--TT---T-T--------G-AA--A----C---T-TT---T---T---------A----TGGT--G----G---A---A-----------TAAT-T--T-T--AT-T--T------------G--A-C---GAACCC--T--TC-TAAA-G--GA-----T-AC----CATG--
gi|96052                      :         ACAAAA-CA---TATGCTC------TT---C-C----CA------TA-T--ACT----T----C-AAT-----TG-AA--------------GTC-ATA----T-A-----A---A--TCAAA--A-------G------T--A--------ATC--AAAA--AT---A-T--------G-AA--G----A---T-TC---T---T---------A----TGGT--G----G---G-----------------------T-T--ATAT--T------------G--A-T---GAACTC--T--T
gi|96053                      :         ATAAAAGTA---T--GTTC------TT---C-CTAGTCA------TATG--ACTGAATT----T-ATT----GTA-AAA-T--T--CAA--GGGG-AGA----T-A-----A---A--TCAAG-CT-------G------T--A--------ATC--AAAA--GT---T-T--------G-TA--A----A---T-TC---T---G---------A----TGAT--G----G---A---T-----------TA---T--T-----T-T--T------------G--A-T---TAAC
gi|96054                      :         ATATAA-CA---T--GCTC------TT---C-A----CA------CA-G--ACT----T----C-G-T----GTA-AAA-T--T--CTACTGGTG-AAA----T-A-----A---A--TCACG-CA-------G------T--AAAAAGGTTATC--AAAA--TT---T-T--------A-AA--T----A---T-aaaaatcacaaaatttaattattatattattataaaaat
gi|96055                      :         ATAAAA-CA---T--GATA------TT---C-T----CA------TA-A--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--A--CTG--GGT---AA----T-A-----
gi|96056                      :          TAGAA-CA---T--GCTC------TT---T-C----CA------TA-G--ACT----C----C-AAG----GTA-AAA-T--T--CTA--GGTG-ACA----T-T-----A---A--TCAAA-CA-------C------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---C---------A----TGGT--G----G---A---T-----------TA---T--T-TTCAT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----C-AC----CATG--ATTT-GCTAAA-ATGCC--A--C-CA-TC-TA-T-T---A-C--C-TA---GTA------T-AT-G----AAATATGt
gi|96057                      :          TAAAA-CGGCCT--GCTA------TT---T-C-----A------CA-A--ACT----T----T-AAT----GTC-AAA-T--T--CTT--GGTG-AAA----T-A-----A---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATT--GAAA--TT---T-C--------ATAATTA----A---T-TC---C------------------CGAG--A----G---G---A-----------T----T--T-T--AG-T--T------------C--ACT---GAACCA--A--TC-AAAA-T--GA-----T-GCCATGCATG--A-TT-AC--AA-ATCCC--A--C-CA-TA-CA-T-T---T-C--T-TT---G-A------T-AG-A----AAATGTG
gi|96058                      :          TAAAA-CA---T--GCCC------TTTCAC-C----C-------TG-C--ACT----T----T-AAT----GTA-AAA-T--T--CTA--AGTA-AAG----T-A-----A----------------------------T--A--------A-A--AAAA--TT---C------------AA--A----A---T-TC---C---A---------A----TGGT--G----A---A---T-----------TA---T--T-TTTAT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC-ACAG-T--GA-----T-AC----CATG--
gi|96059                      : taaaacatgcAAAG-CA---T--GCTC------TA---T-T----TA------TA-A--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--C--CAA--AGTA-AAA----T-AGCGGTA---A--TCAAG-TACTAGTTCG------T--A--------ATA--AGAA--TT---T-T--------G--------------C-TT---C---T---------A----TAGT--G----T---A---T-----------TA---T--T-TTTAT-T--T------------G--A-T---AAATCC--C--TA-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TC-ATAAAA-A--CT--ATTC-CA-CC-CA-T-T---
gi|96060                      :           AAAA-TA---T--ATTC------TT---CAT----TT------TA-G--ACT----C----CCAAT----ATA-AAA-T--C--TTA--GATG-AAAACTCC-A-----C---A--TCAAG-CA-------G------TTAA--------GTC--AAAA--AT---T-T--------G-AA--A----A---T-TCATAC---T---------C----TGGT--G----G---ATTTA-----------TT---T--T-T--GT-T--C------------T--A-T---AAACCC--CCATCGAAAA-T--GAA----T-AC----CATG--A-TTTGCAAAA--TCCTTAA--A-AA-TTACAGT-T---T-A--G-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96061                      :             AA-CA---T--GCTC------TT---T-T----CT------TA-G--AC----------C-AAT----GTA-AAG-T----------------------------------A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATG--AAAG--TT---T-T--------C-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGT--G----A---ATT-A-----------TT---T--T-T--GT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC-AACA-C--GA-----T-A
gi|96062                      :             AA-CA---A--ATTA------TC---C-C----TG------TA-G--ACG----T----C-GTT----ATC-GAT-T--T--TGA--GGTG-AAA----T-----------------------------G------T--A----------C--CACA--TT---T-T--------G-AA--A----A---A-TC---C---T---------A----GGGT--GTGTTG---T---ACTCCCGGGTTGTA---C--T-T--AT-T--T------------G--T-T---AAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----TATG--G-AT-ACAAAA-ATCGC-----C-CG-TT-CG-CGT---T-A--T-TA---G-A------
gi|96063                      :              A-CA---T--GTTC------TT---C-C----TA------AA-TTCACT----TTGAAC-AAT----ATA-GAA-T--T---TAC-GGTG-AAA----T-A-----A---G--CCAAG-CA-------C------T--G--------AGA--ACAA--TT---T-T--------G-TA--A----A---T-CC---C---T---------T----TGGT--G----A---A---T-----------TA---TTCT-T--AT-T--T------------G--A-T---GAATCT--A--TC--AAA-T--GA-----T-AC----TATG--A-T
gi|96064                      :                 A---T--GCTC------AT---C-C----TA------TA-G--ATT----T----C-AGT----GTG-AAA-T--T--GGA--GGTC-AAA----T-A-----A---G--TCTAG-CA-------G------T--T--------ATC--GAAA--TT---T-T--------G-TA--A----A---T-TC---C---TGTGGTTTTGA----TGGT--G----G---A---T-----------TG---T--T-C--TC-TCCT------------G--A-TTA-AAACCC--T--TC-AA
gi|96065                      :                                                ------TA-G--ACT----T----C-AAT----GTAGAAA-C--T--CTA--GATG-AAA----T-A-----A---A--ACAAG-CC-------G------T--T--------ATC--AAAA--TT---C-T--------G--A--A----C---T-TC---C---T---------G----TGGT--G----G---
gi|96066                      :                                          actccA------TA-T--ACT----T----C-AAT----GCC-AAA-T--T--TAA--GGTG-AGA----T-T-----A---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATT--AAAA--CT---T-T--------G-AA--A----A---AATC---CAATC---------A----TGAT--G----G---A---A-----------TA---TATT-T--AT-T--T------------G--A-T---AAAACC--T--TC-AGGT-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ATAAAA-ACCAC--A--C-CA-TC-CA-T-A---C-A--C-AA---G-A------T-AT-G----AAATGTG
gi|96067                      :                                                               ----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--TGA--AGTG-AAA----A-A-----A---A--GCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-TA--A----A---T-TCTTGC---T---------G----AGGT--G--------------------------------T-T--AT-T------------------A-----AAACCC--TGCTC-CGAA-T--G
gi|96068                      :                                                                         -AAT----GTA-AAA-G--T--CAA--GGTG-AAA----T-A-----T---G--TCAAG-CA-------ATATGCCT--A--------ATG--AAAC--TT---T-T--------A-TC--A----A----------C---T---------A----TGTT--G----G---ATT-A-----------TT---T--T-T--AT-T--T------------G--A-T---AAACCA--T--TC-AAAA-TTATA-----T-AC----CATG--G-TTGATAAAA-ATCAC--A--T-CA-----A-T-T---T-
gi|96069                      :                                                                                    -AAA-C--T--CAA--GGTG-TAA----T-A-----A---A--TCAAG-TA-------A------T--A--------ATC--AAGA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---T---G---------A----TGGG--G----G---G---GGGAGGGGGTGGTA---T--T-T--------T------------G--T-T---GAACCA--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-TCGAAA-ATCCC--A--C-CG-TC-CA-T-T---C-A--C-TA---A-A------T-AT-G----AAAT
gi|96070                      :                                                                                        -T--T--CTG--GGTA-AAA----T-A-----A---A--GCA-G-CA-------G------T--A--------ATTTAAAGA--CT---T-T--------C-AA--T----A---T-TC---G---T---------A----TGTT--G----A---A---T-----------TA---T--T-TCTAT-T--T------------A--A-T---GAAATG--T--TC-AAAAAT--GA-----T-AC----TATT--A-TT-ACAAAATATTT---A--C-CA-TT-CA-T-T---T-A--C-TA---G-A------A-AT-A----AAAT
gi|96071                      :                                                                                                        -AAA----T-ATAT--A---A--T-AAG-CA-------GAT----T--T--------ATA--AAAGATTT---T-T--------G-AA--A----A---A-TC---CCT-T---------A----TGGT--G----G---A---A-----------CA---T--C-TTCAT-T--T------------G--A-ACGAGAAACC--T--TC-AAA--T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-A-GAAA-AT--C--A--C-C---C-CA-T-T---T----C-TA---G-C------T-AT-G----AAAT
gi|96072                      :                                                                                                       a-AAA----T-A-----A---A--TCAAGGCA-------G------T--A--------ATCC-AAAA--TT---T-TT-------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------T----TGGT--G----G---A---A-----------TACGTT--T-T--AA-G--T------------G--A-T---GAAACCTTT--TC-CAAA-T--GA-----TAAC----CATC--G-TA-ACCAAA-TTCCC--A--CACA-TT-CA-T-T---T-A--C-TG---G-A------TAATGG----AAATA
gi|96073                      :                                                                                                          AA----C-A-----C---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--C----A---T-TC---C---C---------A----TGGC--G----G---A---A-----------CATT-T--T-T--AT-T--T------------G--A-C---GAATCC-----------------------C-AC----CA------------------CCC--------------A-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96074                      :                                                                                                                                      A-------G------T--A--------ATC--AAAG--TT---T-T--------G-TA--A----A---T-TC---C---T---------A----CTAT--G----C---A---A-----------T------------------------------------T---AAACTC--T--TC-AAAA-T--GA-----C-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATTC------C-CATTC-TG-T-T---TGA--T-TA---G-A------T-AT-G----AAA
gi|96075                      :                                                                                                                                               ------T--A--------AT---GAAA--TT---TAT--------G-AA--GCATTA---T-TC---T---T---------G----GGGT--G----A---A---T-----------TA---T--T-TTCAT-T---------------A--A-T---GAAATC--T--TC-AAAA-T--GAAATGAT-CC----CATA--A-TT-ACAAAT-ATCCC--A--C-CA-TC-CA-T-T---T-A--C-TA---A-A------T-
gi|96076                      :                                                                                                                                                                    --AAAA--GT---T-A--------G-AA--A----AATAT-TT---C---T---------G----GGGT--G----G---A---T-----------TA---C--TGT--AT-T--TT-----------G--A-T---AAATCC--G--TC-CATA-T--TG-----T-AT----TATG--A-TT-ACAAAA-ATCAC--A--C-CA-GC-CA-T-C---T-A--T-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96077                      :                                                                                                                                                                       AAA--TT---T-TAATAGAGAG-AA--A----G---T-GC---A---T---------A----TGGT--G----G---G---A-----------TA---T--A-T--AT-T--TCAAGTGTATGAAGTTA-T---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATATAA-TT-ACAAAA-ATCCT--A--C-CA-TA-CA-T-T---T-A--C-CA---G-A------T-AC-GTATAAAATAT
gi|96078                      :                                                                                                                                                                         A--TT---T-T--------G-AC--A--------T-CC---C---T---------ACTTATGAT--G----G---A---A-----------TA---T--T-TTTAT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--
gi|96079                      :                                                                                                                                                                                                                                                     ---A-----------TA---T--T-T--CA-G--T------------G--A-T---ACAACT--T--TC-AAAAAT--AA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATCCC--A--C-CA-CC-CA-T-T---A-AATC-TGTCCA-A------T-AT-G----AAATATG





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                     2222222222222222222222222222                                                                                                                                                    
lowQualScore                  :               1  222 11   5555555  222 1 2222  333333  1 11   2222 2222 1   2222   1   1 11 11 3333   22   2222 1 55555 111 11     1  3333333 444444 11 33333333   22    11  111 0 77777777 0  11 1111 111 0  333 222 444444444 1111    11 1111 444 2222222222222222222222222222  0 11 555555555555 11 0 222      11 22  1    3 11  33333 1  4444    44 1  2      1     11 11 1  1  1  1 1 222 1 11 1  222 1 444444 1  1 3333       
lowQualScore                  :               .  ... ..   .......  ... . ....  ......  . ..   .... .... .   ....   .   . .. .. ....   ..   .... . ..... ... ..     .  ....... ...... .. ........   ..    ..  ... . ........ .  .. .... ... .  ... ... ......... ....    .. .... ... ............................  . .. ............ .. . ...      .. ..  .    . ..  ..... .  ....    .. .  .      .     .. .. .  .  .  . . ... . .. .  ... . ...... .  . ....       
lowQualScore                  :               2  111 77   5555555  111 2 6666  333333  1 66   4444 4444 1   3333   1   0 44 44 1111   11   0000 0 77777 777 33     0  1111111 000000 33 44444444   22    22  555 9 44444444 9  22 8888 555 9  111 888 888888888 9999    22 9999 000 6666666666666666666666666666  9 22 666666666666 22 9 888      33 66  0    1 44  77777 1  6666    55 1  4      2     77 77 2  2  2  2 2 111 2 88 4  444 4 111111 5  5 3333       
consensus                     :         ATAAAA-CA---T--GCT-C-----TT---C-C----CA------TA-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CTA--GGTG-AAA----T-A-----A---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGT--G----G---A---A-----------TA---T--T-T--AT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATCCC--A--C-CA-TC-CA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
Reference ( family-447 )      :         ATAAAA-CA---T--GCT-C-----TT---C-C----CA------TA-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CTA--GGTG-AAA----T-A-----A---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGT--G----G---A---A-----------TA---T--T-T--AT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATCCC--A--C-CA-TC-CA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96032                      :         ATAAAA-CT---T--GCT-A-----TT---C-C----CA------TA-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAG-T--T--CTG--GGTG-AAA----T-A-----T---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGT--G----G---A---A-----------CA---T--T-T--AT-C--T------------G--A-C---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATCCC--A--C-CA-CC-CA-T-T---T-A--C-TA---G-G------T-AT-G----CAATATG
gi|96033                      :         ATGAAA-TA---T--GCT-A-----TT---C-C----CA------TA-G--ATT----T----C-AAT----GTA-AAG-T--T--CTG--GTTA-AAA----T-ATAC--ATGTA--TTAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGT--G----G---A---A-----------CA---T--T-TTTAT-T--T------------G--A-C---AAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATCCC--A--C-CA-CC-CA-T-T---T-A--T-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96034                      :         ATAAAA-CA---T--GTT-A-----TT---C-C----CA------TA-T--ACT----C----C-ACT----GTA-AAA-T--T--GTG--GGTG-AAA----T-A-----A---A--TCAAG-GA-------C------T--A--------ATC--AAAT--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGT--G----G---A---A-----------TA---T--T-TTCAT-T--T------------G--A-C---GAGCCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-GCAAAA-ATCCC--A--C-CA-TT-CA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96035                      :         ATAAAA-CA---T--GCT-G-----TT---C-C----CA------TA-G--ACA----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CCA--GGGA-AAA----T-A-----A---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--CAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------T----TGAA--A----G---A---A-----------TA---T--T-TTAAA-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TA-ACCAAA-ATCCC--A--C-CA-TT-TA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96036                      :         ACAAAA-CA---T--GCTACATGTATT---C-C----TA------TA-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CTG--GGTT-AAA----T-A-----T---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATA--AAAA--AAAAAT-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGAT--G----G---A---A-----------TA---T--T-TTTAT-T--T------------G--A-C---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACATAA-ATCCC--A--C-CA-TC-CA-T-T---T-A--C-TA---G-ATACATGT-AT-G----AAATACG
gi|96037                      :         ATAAAA-CA---T--ACT-A-----TT---C-C----CA------AA-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CTG--GGTA-AAA----T-A-----T---T--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----C---T-TC---C---T---------G----TGGT--G----G---A---A-----------TACT-T--T-T--AT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CGTGATA-TT-ACAAAA-ATCCC--A----CA-TC-CA-T-T---T-A--
gi|96038                      :         ATAAAA-CA---T--ACT-A-----TT---C-C----AA-------A-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--G---TG--GGTA-AAA------A-----T---T--TCAAG-CA--------------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-TT-------G-AA--A----C---T-TC---C---T---------G----TGGT--G----G---A---A-----------TACT-T--T-T--AT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC--AAA-T--GA-----T-AC----CGTGATA-TT-ACAAAA---TCC--A----CA-TC-CA-T-TTTAT-A--C-TA---
gi|96039                      :         ATAAAA-CA---T--GCT-T-----TT---C-C----CA------TA-T--ATT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CCG--GGGG-AAA----TTA-----A---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------T----TGGT--G----G---A---A-----------TA---T--T-TTAAT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----C-AC----CATA--A-TA-ACCAAA-ATCGG--A--C-GA-TT-CA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96040                      :         ATAAAG-CA---T--TAT-A-----TT---C-C----CA------TA-C--ACT----T----C-AAT----GTA-AA-------------------------T-A-----T---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGT--G----G---CCC-A-----------TT---T--T-T--AT-T--T------------G--A-C---AAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATCCC--A--C-CA-CC-CA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-TT-G----AAATATG
gi|96041                      :         ATAAAA-CA---T--GCT-C-----TT---C-C----CA------TA-G--ACT----C----T-AAA----GTA-AA--C--G--CTT--GGTATAAA----C-A-----A---AAACCAAG-CA-------A------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGAT--G----G---A---T-----------TG---C--T-TCTAT-T--T------------C--A-T---GATCGC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATTCC--A--T-CA-TC-CA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATACG
gi|96042                      :         ATAAAA-CA---T--GTT-T-----CT---C-C----CA------TA-C--AC----------C-AAT----GTA-AAA-T--T--CTA--GGTG-AAA----T-A-----A---A--TCAAG-TA-------T------T--A--------ATC--AAAA---T---T-T--------A-AA--A----A---A-TC---C---A---------A----TGGT--G----G---ATT-A-----------TT---T--T-T--AT-T--T------------G--A-T---GAACTC--T--TC-AAAATT--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAGAA-ATCCA--A--C-C--TT-CA-T-T---T-A--CTTG---G-G------T-AT-T----TAATATG
gi|96043                      :         ATAAAA-CA---T--TTT-C-----TT---C-C----CA------TA-G--TCT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CTA--GGTG-AAA----T-A-----A---A--TGAAA-CA-------G------T--T--------ATC--AAAA--TT---T--------------------------------C---C---------A----TGGT--A----G---A---T-----------TA---T--T-TTCAT-T--A------------G--A-T---GAAGCA--T--TC-AGAA-T---A-----T-AC----GATG--G-TT-ACAAAA-ATCCC--A--C-CA-TT-CA-T-T---T-A--T-TA---G-A------T-AT-A----
gi|96044                      :         ATAAAA-CA---A--GCT-C-----TT---C-C----CAGTCGGCCG-G--ACT----T----C-AATTAATGTA-AAG-C--T--CGA--TATA-AAA----T-A-----A---A--TCGAG-CA-------A------T--A--------ATT--G-----TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGC--G----G---A---T-----------TA---A--T----AT-T--T------------G--G-T---GAACCC--T--TC-AAAA-C--GA-----T-ACGTACCATG--A-TT-GCAAAA-AACCC-------CA-TC-CT-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96045                      :         ATAAAA-CA---T--GCT-C-----TC---C-A----AA------TA-G--ACG----T------AAT----TTA-AAA-TACTAGCTA--GGTC-TAA----T-A-----A---A--TCAAA-AA-------G------T--G---------TT--GTTG--TT---T-TTTAAAT--G-AA--C----A---T-TT---C---T---------G----TGGT--T----G---ATG-A-----------TT---T--T-T--AT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----C-AC----CATG--A-TT-ACGAAA-ATCCC--A--C-CA-TC-TA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96046                      :         ATAAAG-CA---T--GCT-C-----TT---A-C-----A-------A-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CAA--GATG-AAA----T-A-----A---A--TTGGG-CA-------G------A--A--------GTA--AAAA--TT---T-T--------G-TA--A----A---T-TC---C---T---------T----TGGG--G----GTT-A---A-----------T----T--T-C--AT-T--T------------G--A-T---AAACCC--T--TC-CAAA-T--GA-----T-AC----CACA--A-TT-ATAAAA-ATCAT--A--C-CA-CT-CA-T-T---T-
gi|96047                      :         ATAAAA-TA---T--GCT-T-----TT---C-C----CA------TG-G--ATT----T----C-AAT----GTA-AA--T--T--CTT--GGTC-AAA----C-A-----A---T--TCAAA-TA-------G------A--A--------ATA--AAAA--TT---C-T--------G-AA--A----A---T-TC---T---T---------A----CGGT--A----G---ATG-A-----------TT---T--T-C--AT-T--------------------T---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--C-TT-ACAAAA-A
gi|96048                      :         ATAAAG-CA---T--GCC-C-----TT---T-C----CA------TA-G--A----------------------------T--T--GTA--GGTA-AAA----T-A-----A---A--TCAAT-AA-------G------T--G--------ATC--AAAA--TT---T-C--------T-AA--A----A---T--C---T---T---------A----TGGT--G----ATTTA---A-----------T----T--T-C--AT-T--T------------G--A-A---TAACTC--T--TC-AAAA-G--TA-----T-AC----CATA--A-TT-ACAAAA-ATTCC--C--C-CA-TT-AA-T-T---T-A--T-CA---G-A------T-AT-G----ACATATG
gi|96049                      :         ATGAAA-CA---T--GCT-G-----TT---C-C----CA------TA-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAAAT--T--CTA--GATC-AAA----T-G-----A---A--TAAAG-AA-------A------T--A--------ATC--AAAA--GT---T-T--------G-AA--A----A---T-TT---C---T---------A----TGGT--G----GGT-A---AT----------TT---T--T-T--AT-T--C------------G--A-C---GA
gi|96050                      :         ATAAAA-CA---T--GCT-G-----TT---C-C----CA------TA-A--ACT----T----T-A-T----GTA-CAA-T--T--CTG--GGTG-AAA----T-A-----T---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-CC---C---TTA-------A----TGATTAG----G---G---A-----------TG---T--
gi|96051                      :         ATAAAA-CA---T--CTT-G-----TT---C-C----CA------TA-G--AC---------------------------T--T--C------------------------A---A--T--------------G------T--A--------ATT--AAAC--TT---T-T--------G-AA--A----C---T-TT---T---T---------A----TGGT--G----G---A---A-----------TAAT-T--T-T--AT-T--T------------G--A-C---GAACCC--T--TC-TAAA-G--GA-----T-AC----CATG--
gi|96052                      :         ACAAAA-CA---TATGCT-C-----TT---C-C----CA------TA-T--ACT----T----C-AAT-----TG-AA--------------GTC-ATA----T-A-----A---A--TCAAA--A-------G------T--A--------ATC--AAAA--AT---A-T--------G-AA--G----A---T-TC---T---T---------A----TGGT--G----G---G-----------------------T-T--ATAT--T------------G--A-T---GAACTC--T--T
gi|96053                      :         ATAAAAGTA---T--GTT-C-----TT---C-CTAGTCA------TATG--ACTGAATT----T-ATT----GTA-AAA-T--T--CAA--GGGG-AGA----T-A-----A---A--TCAAG-CT-------G------T--A--------ATC--AAAA--GT---T-T--------G-TA--A----A---T-TC---T---G---------A----TGAT--G----G---A---T-----------TA---T--T-----T-T--T------------G--A-T---TAAC
gi|96054                      :         ATATAA-CA---T--GCT-C-----TT---C-A----CA------CA-G--ACT----T----C--GT----GTA-AAA-T--T--CTACTGGTG-AAA----T-A-----A---A--TCACG-CA-------G------T--AAAAAGGTTATC--AAAA--TT---T-T--------A-AA--T----A---T-aaaaatcacaaaatttaattattatattattataaaaat
gi|96055                      :         ATAAAA-CA---T--GAT-A-----TT---C-T----CA------TA-A--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--A--CTG--GGT---AA----T-A-----
gi|96056                      :          TAGAA-CA---T--GCT-C-----TT---T-C----CA------TA-G--ACT----C----C-AAG----GTA-AAA-T--T--CTA--GGTG-ACA----T-T-----A---A--TCAAA-CA-------C------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---C---------A----TGGT--G----G---A---T-----------TA---T--T-TTCAT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----C-AC----CATG--ATTT-GCTAAA-ATGCC--A--C-CA-TC-TA-T-T---A-C--C-TA---GTA------T-AT-G----AAATATGt
gi|96057                      :          TAAAA-CGGCCT--GCT-A-----TT---T-C-----A------CA-A--ACT----T----T-AAT----GTC-AAA-T--T--CTT--GGTG-AAA----T-A-----A---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATT--GAAA--TT---T-C--------ATAATTA----A---T-TC---C------------------CGAG--A----G---G---A-----------T----T--T-T--AG-T--T------------C--ACT---GAACCA--A--TC-AAAA-T--GA-----T-GCCATGCATG--A-TT-AC--AA-ATCCC--A--C-CA-TA-CA-T-T---T-C--T-TT---G-A------T-AG-A----AAATGTG
gi|96058                      :          TAAAA-CA---T--GCC-C-----TTTCAC-C----C-------TG-C--ACT----T----T-AAT----GTA-AAA-T--T--CTA--AGTA-AAG----T-A-----A----------------------------T--A--------A-A--AAAA--TT---C------------AA--A----A---T-TC---C---A---------A----TGGT--G----A---A---T-----------TA---T--T-TTTAT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC-ACAG-T--GA-----T-AC----CATG--
gi|96059                      : taaaacatgcAAAG-CA---T--GCT-C-----TA---T-T----TA------TA-A--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--C--CAA--AGTA-AAA----T-AGCGGTA---A--TCAAG-TACTAGTTCG------T--A--------ATA--AGAA--TT---T-T--------G--------------C-TT---C---T---------A----TAGT--G----T---A---T-----------TA---T--T-TTTAT-T--T------------G--A-T---AAATCC--C--TA-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TC-ATAAAA-A--CT--ATTC-CA-CC-CA-T-T---
gi|96060                      :           AAAA-TA---T--ATT-C-----TT---CAT----TT------TA-G--ACT----C----CCAAT----ATA-AAA-T--C--TTA--GATG-AAAACTCC-A-----C---A--TCAAG-CA-------G------TTAA--------GTC--AAAA--AT---T-T--------G-AA--A----A---T-TCATAC---T---------C----TGGT--G----G---ATTTA-----------TT---T--T-T--GT-T--C------------T--A-T---AAACCC--CCATCGAAAA-T--GAA----T-AC----CATG--A-TTTGCAAAA--TCCTTAA--A-AA-TTACAGT-T---T-A--G-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96061                      :             AA-CA---T--GCT-C-----TT---T-T----CT------TA-G--AC----------C-AAT----GTA-AAG-T----------------------------------A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATG--AAAG--TT---T-T--------C-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGT--G----A---ATT-A-----------TT---T--T-T--GT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC-AACA-C--GA-----T-A
gi|96062                      :             AA-CA---A--ATT-A-----TC---C-C----TG------TA-G--ACG----T----C-GTT----ATC-GAT-T--T--TGA--GGTG-AAA----T-----------------------------G------T--A----------C--CACA--TT---T-T--------G-AA--A----A---A-TC---C---T---------A----GGGT--GTGTTG---T---ACTCCCGGGTTGTA---C--T-T--AT-T--T------------G--T-T---AAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----TATG--G-AT-ACAAAA-ATCGC-----C-CG-TT-CG-CGT---T-A--T-TA---G-A------
gi|96063                      :              A-CA---T--GTT-C-----TT---C-C----TA------AA-TTCACT----TTGAAC-AAT----ATA-GAA-T--T---TAC-GGTG-AAA----T-A-----A---G--CCAAG-CA-------C------T--G--------AGA--ACAA--TT---T-T--------G-TA--A----A---T-CC---C---T---------T----TGGT--G----A---A---T-----------TA---TTCT-T--AT-T--T------------G--A-T---GAATCT--A--TC--AAA-T--GA-----T-AC----TATG--A-T
gi|96064                      :                 A---T--GCT-C-----AT---C-C----TA------TA-G--ATT----T----C-AGT----GTG-AAA-T--T--GGA--GGTC-AAA----T-A-----A---G--TCTAG-CA-------G------T--T--------ATC--GAAA--TT---T-T--------G-TA--A----A---T-TC---C---TGTGGTTTTGA----TGGT--G----G---A---T-----------TG---T--T-C--TC-TCCT------------G--A-TTA-AAACCC--T--TC-AA
gi|96065                      :                                                ------TA-G--ACT----T----C-AAT----GTAGAAA-C--T--CTA--GATG-AAA----T-A-----A---A--ACAAG-CC-------G------T--T--------ATC--AAAA--TT---C-T--------G--A--A----C---T-TC---C---T---------G----TGGT--G----G---
gi|96066                      :                                          actccA------TA-T--ACT----T----C-AAT----GCC-AAA-T--T--TAA--GGTG-AGA----T-T-----A---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATT--AAAA--CT---T-T--------G-AA--A----A---AATC---CAATC---------A----TGAT--G----G---A---A-----------TA---TATT-T--AT-T--T------------G--A-T---AAAACC--T--TC-AGGT-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ATAAAA-ACCAC--A--C-CA-TC-CA-T-A---C-A--C-AA---G-A------T-AT-G----AAATGTG
gi|96067                      :                                                               ----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--TGA--AGTG-AAA----A-A-----A---A--GCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-TA--A----A---T-TCTTGC---T---------G----AGGT--G--------------------------------T-T--AT-T------------------A-----AAACCC--TGCTC-CGAA-T--G
gi|96068                      :                                                                         -AAT----GTA-AAA-G--T--CAA--GGTG-AAA----T-A-----T---G--TCAAG-CA-------ATATGCCT--A--------ATG--AAAC--TT---T-T--------A-TC--A----A----------C---T---------A----TGTT--G----G---ATT-A-----------TT---T--T-T--AT-T--T------------G--A-T---AAACCA--T--TC-AAAA-TTATA-----T-AC----CATG--G-TTGATAAAA-ATCAC--A--T-CA-----A-T-T---T-
gi|96069                      :                                                                                    -AAA-C--T--CAA--GGTG-TAA----T-A-----A---A--TCAAG-TA-------A------T--A--------ATC--AAGA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---T---G---------A----TGGG--G----G---G---GGGAGGGGGTGGTA---T--T-T--------T------------G--T-T---GAACCA--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-TCGAAA-ATCCC--A--C-CG-TC-CA-T-T---C-A--C-TA---A-A------T-AT-G----AAAT
gi|96070                      :                                                                                        -T--T--CTG--GGTA-AAA----T-A-----A---A--GCA-G-CA-------G------T--A--------ATTTAAAGA--CT---T-T--------C-AA--T----A---T-TC---G---T---------A----TGTT--G----A---A---T-----------TA---T--T-TCTAT-T--T------------A--A-T---GAAATG--T--TC-AAAAAT--GA-----T-AC----TATT--A-TT-ACAAAATATTT---A--C-CA-TT-CA-T-T---T-A--C-TA---G-A------A-AT-A----AAAT
gi|96071                      :                                                                                                        -AAA----T-ATAT--A---A--T-AAG-CA-------GAT----T--T--------ATA--AAAGATTT---T-T--------G-AA--A----A---A-TC---CCT-T---------A----TGGT--G----G---A---A-----------CA---T--C-TTCAT-T--T------------G--A-ACGAGAAACC--T--TC-AAA--T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-A-GAAA-AT--C--A--C-C---C-CA-T-T---T----C-TA---G-C------T-AT-G----AAAT
gi|96072                      :                                                                                                       a-AAA----T-A-----A---A--TCAAGGCA-------G------T--A--------ATCC-AAAA--TT---T-TT-------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------T----TGGT--G----G---A---A-----------TACGTT--T-T--AA-G--T------------G--A-T---GAAACCTTT--TC-CAAA-T--GA-----TAAC----CATC--G-TA-ACCAAA-TTCCC--A--CACA-TT-CA-T-T---T-A--C-TG---G-A------TAATGG----AAATA
gi|96073                      :                                                                                                          AA----C-A-----C---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--C----A---T-TC---C---C---------A----TGGC--G----G---A---A-----------CATT-T--T-T--AT-T--T------------G--A-C---GAATCC-----------------------C-AC----CA------------------CCC--------------A-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96074                      :                                                                                                                                      A-------G------T--A--------ATC--AAAG--TT---T-T--------G-TA--A----A---T-TC---C---T---------A----CTAT--G----C---A---A-----------T------------------------------------T---AAACTC--T--TC-AAAA-T--GA-----C-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATTC------C-CATTC-TG-T-T---TGA--T-TA---G-A------T-AT-G----AAA
gi|96075                      :                                                                                                                                               ------T--A--------AT---GAAA--TT---TAT--------G-AA--GCATTA---T-TC---T---T---------G----GGGT--G----A---A---T-----------TA---T--T-TTCAT-T---------------A--A-T---GAAATC--T--TC-AAAA-T--GAAATGAT-CC----CATA--A-TT-ACAAAT-ATCCC--A--C-CA-TC-CA-T-T---T-A--C-TA---A-A------T-
gi|96076                      :                                                                                                                                                                    --AAAA--GT---T-A--------G-AA--A----AATAT-TT---C---T---------G----GGGT--G----G---A---T-----------TA---C--TGT--AT-T--TT-----------G--A-T---AAATCC--G--TC-CATA-T--TG-----T-AT----TATG--A-TT-ACAAAA-ATCAC--A--C-CA-GC-CA-T-C---T-A--T-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96077                      :                                                                                                                                                                       AAA--TT---T-TAATAGAGAG-AA--A----G---T-GC---A---T---------A----TGGT--G----G---G---A-----------TA---T--A-T--AT-T--TCAAGTGTATGAAGTTA-T---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATATAA-TT-ACAAAA-ATCCT--A--C-CA-TA-CA-T-T---T-A--C-CA---G-A------T-AC-GTATAAAATAT
gi|96078                      :                                                                                                                                                                         A--TT---T-T--------G-AC--A--------T-CC---C---T---------ACTTATGAT--G----G---A---A-----------TA---T--T-TTTAT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--
gi|96079                      :                                                                                                                                                                                                                                                     ---A-----------TA---T--T-T--CA-G--T------------G--A-T---ACAACT--T--TC-AAAAAT--AA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATCCC--A--C-CA-CC-CA-T-T---A-AATC-TGTCCA-A------T-AT-G----AAATATG





Alignments
lowQualScore                  :                                                                                                                                                                                                                                                     2222222222222222222222222222                                                                                                                                                    
lowQualScore                  :               1  222 11   5555555  222 1 2222  333333  1 11   2222 2222 1   2222   1   1 11 11 3333   22   2222 1 55555 111 11     1  3333333 444444 11 33333333   22    11  111 0 77777777 0  11 1111 111 0  333 222 444444444 1111    11 1111 444 2222222222222222222222222222  0 11 555555555555 11 0 222      11 22  1    3 11  33333 1  4444    44 1  2      1     11 11 1  1  1  1 1 222 1 11 1  222 1 444444 1  1 3333       
lowQualScore                  :               .  ... ..   .......  ... . ....  ......  . ..   .... .... .   ....   .   . .. .. ....   ..   .... . ..... ... ..     .  ....... ...... .. ........   ..    ..  ... . ........ .  .. .... ... .  ... ... ......... ....    .. .... ... ............................  . .. ............ .. . ...      .. ..  .    . ..  ..... .  ....    .. .  .      .     .. .. .  .  .  . . ... . .. .  ... . ...... .  . ....       
lowQualScore                  :               2  111 77   5555555  111 2 6666  333333  1 66   4444 4444 1   3333   1   0 44 44 1111   11   0000 0 77777 777 33     0  1111111 000000 33 44444444   22    22  555 9 44444444 9  22 8888 555 9  111 888 888888888 9999    22 9999 000 6666666666666666666666666666  9 22 666666666666 22 9 888      33 66  0    1 44  77777 1  6666    55 1  4      2     77 77 2  2  2  2 2 111 2 88 4  444 4 111111 5  5 3333       
consensus                     :         ATAAAA-CA---T--GCT-C-----TT---C-C----CA------TA-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CTA--GGTG-AAA----T-A-----A---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGT--G----G---A---A-----------TA---T--T-T--AT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATCCC--A--C-CA-TC-CA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
Reference ( family-447 )      :         ATAAAA-CA---T--GCT-C-----TT---C-C----CA------TA-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CTA--GGTG-AAA----T-A-----A---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGT--G----G---A---A-----------TA---T--T-T--AT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATCCC--A--C-CA-TC-CA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96032                      :         ATAAAA-CT---T--GCT-A-----TT---C-C----CA------TA-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAG-T--T--CTG--GGTG-AAA----T-A-----T---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGT--G----G---A---A-----------CA---T--T-T--AT-C--T------------G--A-C---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATCCC--A--C-CA-CC-CA-T-T---T-A--C-TA---G-G------T-AT-G----CAATATG
gi|96033                      :         ATGAAA-TA---T--GCT-A-----TT---C-C----CA------TA-G--ATT----T----C-AAT----GTA-AAG-T--T--CTG--GTTA-AAA----T-ATAC--ATGTA--TTAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGT--G----G---A---A-----------CA---T--T-TTTAT-T--T------------G--A-C---AAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATCCC--A--C-CA-CC-CA-T-T---T-A--T-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96034                      :         ATAAAA-CA---T--GTT-A-----TT---C-C----CA------TA-T--ACT----C----C-ACT----GTA-AAA-T--T--GTG--GGTG-AAA----T-A-----A---A--TCAAG-GA-------C------T--A--------ATC--AAAT--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGT--G----G---A---A-----------TA---T--T-TTCAT-T--T------------G--A-C---GAGCCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-GCAAAA-ATCCC--A--C-CA-TT-CA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96035                      :         ATAAAA-CA---T--GCT-G-----TT---C-C----CA------TA-G--ACA----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CCA--GGGA-AAA----T-A-----A---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--CAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------T----TGAA--A----G---A---A-----------TA---T--T-TTAAA-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TA-ACCAAA-ATCCC--A--C-CA-TT-TA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96036                      :         ACAAAA-CA---T--GCTACATGTATT---C-C----TA------TA-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CTG--GGTT-AAA----T-A-----T---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATA--AAAA--AAAAAT-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGAT--G----G---A---A-----------TA---T--T-TTTAT-T--T------------G--A-C---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACATAA-ATCCC--A--C-CA-TC-CA-T-T---T-A--C-TA---G-ATACATGT-AT-G----AAATACG
gi|96037                      :         ATAAAA-CA---T--ACT-A-----TT---C-C----CA------AA-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CTG--GGTA-AAA----T-A-----T---T--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----C---T-TC---C---T---------G----TGGT--G----G---A---A-----------TACT-T--T-T--AT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CGTGATA-TT-ACAAAA-ATCCC--A----CA-TC-CA-T-T---T-A--
gi|96038                      :         ATAAAA-CA---T--ACT-A-----TT---C-C----AA-------A-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--G---TG--GGTA-AAA------A-----T---T--TCAAG-CA--------------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-TT-------G-AA--A----C---T-TC---C---T---------G----TGGT--G----G---A---A-----------TACT-T--T-T--AT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC--AAA-T--GA-----T-AC----CGTGATA-TT-ACAAAA---TCC--A----CA-TC-CA-T-TTTAT-A--C-TA---
gi|96039                      :         ATAAAA-CA---T--GCT-T-----TT---C-C----CA------TA-T--ATT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CCG--GGGG-AAA----TTA-----A---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------T----TGGT--G----G---A---A-----------TA---T--T-TTAAT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----C-AC----CATA--A-TA-ACCAAA-ATCGG--A--C-GA-TT-CA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96040                      :         ATAAAG-CA---T--TAT-A-----TT---C-C----CA------TA-C--ACT----T----C-AAT----GTA-AA-------------------------T-A-----T---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGT--G----G---CCC-A-----------TT---T--T-T--AT-T--T------------G--A-C---AAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATCCC--A--C-CA-CC-CA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-TT-G----AAATATG
gi|96041                      :         ATAAAA-CA---T--GCT-C-----TT---C-C----CA------TA-G--ACT----C----T-AAA----GTA-AA--C--G--CTT--GGTATAAA----C-A-----A---AAACCAAG-CA-------A------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGAT--G----G---A---T-----------TG---C--T-TCTAT-T--T------------C--A-T---GATCGC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATTCC--A--T-CA-TC-CA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATACG
gi|96042                      :         ATAAAA-CA---T--GTT-T-----CT---C-C----CA------TA-C--AC----------C-AAT----GTA-AAA-T--T--CTA--GGTG-AAA----T-A-----A---A--TCAAG-TA-------T------T--A--------ATC--AAAA---T---T-T--------A-AA--A----A---A-TC---C---A---------A----TGGT--G----G---ATT-A-----------TT---T--T-T--AT-T--T------------G--A-T---GAACTC--T--TC-AAAATT--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAGAA-ATCCA--A--C-C--TT-CA-T-T---T-A--CTTG---G-G------T-AT-T----TAATATG
gi|96043                      :         ATAAAA-CA---T--TTT-C-----TT---C-C----CA------TA-G--TCT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CTA--GGTG-AAA----T-A-----A---A--TGAAA-CA-------G------T--T--------ATC--AAAA--TT---T--------------------------------C---C---------A----TGGT--A----G---A---T-----------TA---T--T-TTCAT-T--A------------G--A-T---GAAGCA--T--TC-AGAA-T---A-----T-AC----GATG--G-TT-ACAAAA-ATCCC--A--C-CA-TT-CA-T-T---T-A--T-TA---G-A------T-AT-A----
gi|96044                      :         ATAAAA-CA---A--GCT-C-----TT---C-C----CAGTCGGCCG-G--ACT----T----C-AATTAATGTA-AAG-C--T--CGA--TATA-AAA----T-A-----A---A--TCGAG-CA-------A------T--A--------ATT--G-----TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGC--G----G---A---T-----------TA---A--T----AT-T--T------------G--G-T---GAACCC--T--TC-AAAA-C--GA-----T-ACGTACCATG--A-TT-GCAAAA-AACCC-------CA-TC-CT-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96045                      :         ATAAAA-CA---T--GCT-C-----TC---C-A----AA------TA-G--ACG----T------AAT----TTA-AAA-TACTAGCTA--GGTC-TAA----T-A-----A---A--TCAAA-AA-------G------T--G---------TT--GTTG--TT---T-TTTAAAT--G-AA--C----A---T-TT---C---T---------G----TGGT--T----G---ATG-A-----------TT---T--T-T--AT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----C-AC----CATG--A-TT-ACGAAA-ATCCC--A--C-CA-TC-TA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96046                      :         ATAAAG-CA---T--GCT-C-----TT---A-C-----A-------A-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CAA--GATG-AAA----T-A-----A---A--TTGGG-CA-------G------A--A--------GTA--AAAA--TT---T-T--------G-TA--A----A---T-TC---C---T---------T----TGGG--G----GTT-A---A-----------T----T--T-C--AT-T--T------------G--A-T---AAACCC--T--TC-CAAA-T--GA-----T-AC----CACA--A-TT-ATAAAA-ATCAT--A--C-CA-CT-CA-T-T---T-
gi|96047                      :         ATAAAA-TA---T--GCT-T-----TT---C-C----CA------TG-G--ATT----T----C-AAT----GTA-AA--T--T--CTT--GGTC-AAA----C-A-----A---T--TCAAA-TA-------G------A--A--------ATA--AAAA--TT---C-T--------G-AA--A----A---T-TC---T---T---------A----CGGT--A----G---ATG-A-----------TT---T--T-C--AT-T--------------------T---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--C-TT-ACAAAA-A
gi|96048                      :         ATAAAG-CA---T--GCC-C-----TT---T-C----CA------TA-G--A----------------------------T--T--GTA--GGTA-AAA----T-A-----A---A--TCAAT-AA-------G------T--G--------ATC--AAAA--TT---T-C--------T-AA--A----A---T--C---T---T---------A----TGGT--G----ATTTA---A-----------T----T--T-C--AT-T--T------------G--A-A---TAACTC--T--TC-AAAA-G--TA-----T-AC----CATA--A-TT-ACAAAA-ATTCC--C--C-CA-TT-AA-T-T---T-A--T-CA---G-A------T-AT-G----ACATATG
gi|96049                      :         ATGAAA-CA---T--GCT-G-----TT---C-C----CA------TA-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAAAT--T--CTA--GATC-AAA----T-G-----A---A--TAAAG-AA-------A------T--A--------ATC--AAAA--GT---T-T--------G-AA--A----A---T-TT---C---T---------A----TGGT--G----GGT-A---AT----------TT---T--T-T--AT-T--C------------G--A-C---GA
gi|96050                      :         ATAAAA-CA---T--GCT-G-----TT---C-C----CA------TA-A--ACT----T----T-A-T----GTA-CAA-T--T--CTG--GGTG-AAA----T-A-----T---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-CC---C---TTA-------A----TGATTAG----G---G---A-----------TG---T--
gi|96051                      :         ATAAAA-CA---T--CTT-G-----TT---C-C----CA------TA-G--AC---------------------------T--T--C------------------------A---A--T--------------G------T--A--------ATT--AAAC--TT---T-T--------G-AA--A----C---T-TT---T---T---------A----TGGT--G----G---A---A-----------TAAT-T--T-T--AT-T--T------------G--A-C---GAACCC--T--TC-TAAA-G--GA-----T-AC----CATG--
gi|96052                      :         ACAAAA-CA---TATGCT-C-----TT---C-C----CA------TA-T--ACT----T----C-AAT-----TG-AA--------------GTC-ATA----T-A-----A---A--TCAAA--A-------G------T--A--------ATC--AAAA--AT---A-T--------G-AA--G----A---T-TC---T---T---------A----TGGT--G----G---G-----------------------T-T--ATAT--T------------G--A-T---GAACTC--T--T
gi|96053                      :         ATAAAAGTA---T--GTT-C-----TT---C-CTAGTCA------TATG--ACTGAATT----T-ATT----GTA-AAA-T--T--CAA--GGGG-AGA----T-A-----A---A--TCAAG-CT-------G------T--A--------ATC--AAAA--GT---T-T--------G-TA--A----A---T-TC---T---G---------A----TGAT--G----G---A---T-----------TA---T--T-----T-T--T------------G--A-T---TAAC
gi|96054                      :         ATATAA-CA---T--GCT-C-----TT---C-A----CA------CA-G--ACT----T----C--GT----GTA-AAA-T--T--CTACTGGTG-AAA----T-A-----A---A--TCACG-CA-------G------T--AAAAAGGTTATC--AAAA--TT---T-T--------A-AA--T----A---T-aaaaatcacaaaatttaattattatattattataaaaat
gi|96055                      :         ATAAAA-CA---T--GAT-A-----TT---C-T----CA------TA-A--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--A--CTG--GGT---AA----T-A-----
gi|96056                      :          TAGAA-CA---T--GCT-C-----TT---T-C----CA------TA-G--ACT----C----C-AAG----GTA-AAA-T--T--CTA--GGTG-ACA----T-T-----A---A--TCAAA-CA-------C------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---C---------A----TGGT--G----G---A---T-----------TA---T--T-TTCAT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----C-AC----CATG--ATTT-GCTAAA-ATGCC--A--C-CA-TC-TA-T-T---A-C--C-TA---GTA------T-AT-G----AAATATGt
gi|96057                      :          TAAAA-CGGCCT--GCT-A-----TT---T-C-----A------CA-A--ACT----T----T-AAT----GTC-AAA-T--T--CTT--GGTG-AAA----T-A-----A---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATT--GAAA--TT---T-C--------ATAATTA----A---T-TC---C------------------CGAG--A----G---G---A-----------T----T--T-T--AG-T--T------------C--ACT---GAACCA--A--TC-AAAA-T--GA-----T-GCCATGCATG--A-TT-AC--AA-ATCCC--A--C-CA-TA-CA-T-T---T-C--T-TT---G-A------T-AG-A----AAATGTG
gi|96058                      :          TAAAA-CA---T--GCC-C-----TTTCAC-C----C-------TG-C--ACT----T----T-AAT----GTA-AAA-T--T--CTA--AGTA-AAG----T-A-----A----------------------------T--A--------A-A--AAAA--TT---C------------AA--A----A---T-TC---C---A---------A----TGGT--G----A---A---T-----------TA---T--T-TTTAT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC-ACAG-T--GA-----T-AC----CATG--
gi|96059                      : taaaacatgcAAAG-CA---T--GCT-C-----TA---T-T----TA------TA-A--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--C--CAA--AGTA-AAA----T-AGCGGTA---A--TCAAG-TACTAGTTCG------T--A--------ATA--AGAA--TT---T-T--------G--------------C-TT---C---T---------A----TAGT--G----T---A---T-----------TA---T--T-TTTAT-T--T------------G--A-T---AAATCC--C--TA-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TC-ATAAAA-A--CT--ATTC-CA-CC-CA-T-T---
gi|96060                      :           AAAA-TA---T--ATT-C-----TT---CAT----TT------TA-G--ACT----C----CCAAT----ATA-AAA-T--C--TTA--GATG-AAAACTCC-A-----C---A--TCAAG-CA-------G------TTAA--------GTC--AAAA--AT---T-T--------G-AA--A----A---T-TCATAC---T---------C----TGGT--G----G---ATTTA-----------TT---T--T-T--GT-T--C------------T--A-T---AAACCC--CCATCGAAAA-T--GAA----T-AC----CATG--A-TTTGCAAAA--TCCTTAA--A-AA-TTACAGT-T---T-A--G-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96061                      :             AA-CA---T--GCT-C-----TT---T-T----CT------TA-G--AC----------C-AAT----GTA-AAG-T----------------------------------A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATG--AAAG--TT---T-T--------C-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGT--G----A---ATT-A-----------TT---T--T-T--GT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC-AACA-C--GA-----T-A
gi|96062                      :             AA-CA---A--ATT-A-----TC---C-C----TG------TA-G--ACG----T----C-GTT----ATC-GAT-T--T--TGA--GGTG-AAA----T-----------------------------G------T--A----------C--CACA--TT---T-T--------G-AA--A----A---A-TC---C---T---------A----GGGT--GTGTTG---T---ACTCCCGGGTTGTA---C--T-T--AT-T--T------------G--T-T---AAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----TATG--G-AT-ACAAAA-ATCGC-----C-CG-TT-CG-CGT---T-A--T-TA---G-A------
gi|96063                      :              A-CA---T--GTT-C-----TT---C-C----TA------AA-TTCACT----TTGAAC-AAT----ATA-GAA-T--T---TAC-GGTG-AAA----T-A-----A---G--CCAAG-CA-------C------T--G--------AGA--ACAA--TT---T-T--------G-TA--A----A---T-CC---C---T---------T----TGGT--G----A---A---T-----------TA---TTCT-T--AT-T--T------------G--A-T---GAATCT--A--TC--AAA-T--GA-----T-AC----TATG--A-T
gi|96064                      :                 A---T--GCT-C-----AT---C-C----TA------TA-G--ATT----T----C-AGT----GTG-AAA-T--T--GGA--GGTC-AAA----T-A-----A---G--TCTAG-CA-------G------T--T--------ATC--GAAA--TT---T-T--------G-TA--A----A---T-TC---C---TGTGGTTTTGA----TGGT--G----G---A---T-----------TG---T--T-C--TC-TCCT------------G--A-TTA-AAACCC--T--TC-AA
gi|96065                      :                                                ------TA-G--ACT----T----C-AAT----GTAGAAA-C--T--CTA--GATG-AAA----T-A-----A---A--ACAAG-CC-------G------T--T--------ATC--AAAA--TT---C-T--------G--A--A----C---T-TC---C---T---------G----TGGT--G----G---
gi|96066                      :                                          actccA------TA-T--ACT----T----C-AAT----GCC-AAA-T--T--TAA--GGTG-AGA----T-T-----A---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATT--AAAA--CT---T-T--------G-AA--A----A---AATC---CAATC---------A----TGAT--G----G---A---A-----------TA---TATT-T--AT-T--T------------G--A-T---AAAACC--T--TC-AGGT-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ATAAAA-ACCAC--A--C-CA-TC-CA-T-A---C-A--C-AA---G-A------T-AT-G----AAATGTG
gi|96067                      :                                                               ----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--TGA--AGTG-AAA----A-A-----A---A--GCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-TA--A----A---T-TCTTGC---T---------G----AGGT--G--------------------------------T-T--AT-T------------------A-----AAACCC--TGCTC-CGAA-T--G
gi|96068                      :                                                                         -AAT----GTA-AAA-G--T--CAA--GGTG-AAA----T-A-----T---G--TCAAG-CA-------ATATGCCT--A--------ATG--AAAC--TT---T-T--------A-TC--A----A----------C---T---------A----TGTT--G----G---ATT-A-----------TT---T--T-T--AT-T--T------------G--A-T---AAACCA--T--TC-AAAA-TTATA-----T-AC----CATG--G-TTGATAAAA-ATCAC--A--T-CA-----A-T-T---T-
gi|96069                      :                                                                                    -AAA-C--T--CAA--GGTG-TAA----T-A-----A---A--TCAAG-TA-------A------T--A--------ATC--AAGA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---T---G---------A----TGGG--G----G---G---GGGAGGGGGTGGTA---T--T-T--------T------------G--T-T---GAACCA--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-TCGAAA-ATCCC--A--C-CG-TC-CA-T-T---C-A--C-TA---A-A------T-AT-G----AAAT
gi|96070                      :                                                                                        -T--T--CTG--GGTA-AAA----T-A-----A---A--GCA-G-CA-------G------T--A--------ATTTAAAGA--CT---T-T--------C-AA--T----A---T-TC---G---T---------A----TGTT--G----A---A---T-----------TA---T--T-TCTAT-T--T------------A--A-T---GAAATG--T--TC-AAAAAT--GA-----T-AC----TATT--A-TT-ACAAAATATTT---A--C-CA-TT-CA-T-T---T-A--C-TA---G-A------A-AT-A----AAAT
gi|96071                      :                                                                                                        -AAA----T-ATAT--A---A--T-AAG-CA-------GAT----T--T--------ATA--AAAGATTT---T-T--------G-AA--A----A---A-TC---CCT-T---------A----TGGT--G----G---A---A-----------CA---T--C-TTCAT-T--T------------G--A-ACGAGAAACC--T--TC-AAA--T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-A-GAAA-AT--C--A--C-C---C-CA-T-T---T----C-TA---G-C------T-AT-G----AAAT
gi|96072                      :                                                                                                       a-AAA----T-A-----A---A--TCAAGGCA-------G------T--A--------ATCC-AAAA--TT---T-TT-------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------T----TGGT--G----G---A---A-----------TACGTT--T-T--AA-G--T------------G--A-T---GAAACCTTT--TC-CAAA-T--GA-----TAAC----CATC--G-TA-ACCAAA-TTCCC--A--CACA-TT-CA-T-T---T-A--C-TG---G-A------TAATGG----AAATA
gi|96073                      :                                                                                                          AA----C-A-----C---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--C----A---T-TC---C---C---------A----TGGC--G----G---A---A-----------CATT-T--T-T--AT-T--T------------G--A-C---GAATCC-----------------------C-AC----CA------------------CCC--------------A-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96074                      :                                                                                                                                      A-------G------T--A--------ATC--AAAG--TT---T-T--------G-TA--A----A---T-TC---C---T---------A----CTAT--G----C---A---A-----------T------------------------------------T---AAACTC--T--TC-AAAA-T--GA-----C-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATTC------C-CATTC-TG-T-T---TGA--T-TA---G-A------T-AT-G----AAA
gi|96075                      :                                                                                                                                               ------T--A--------AT---GAAA--TT---TAT--------G-AA--GCATTA---T-TC---T---T---------G----GGGT--G----A---A---T-----------TA---T--T-TTCAT-T---------------A--A-T---GAAATC--T--TC-AAAA-T--GAAATGAT-CC----CATA--A-TT-ACAAAT-ATCCC--A--C-CA-TC-CA-T-T---T-A--C-TA---A-A------T-
gi|96076                      :                                                                                                                                                                    --AAAA--GT---T-A--------G-AA--A----AATAT-TT---C---T---------G----GGGT--G----G---A---T-----------TA---C--TGT--AT-T--TT-----------G--A-T---AAATCC--G--TC-CATA-T--TG-----T-AT----TATG--A-TT-ACAAAA-ATCAC--A--C-CA-GC-CA-T-C---T-A--T-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96077                      :                                                                                                                                                                       AAA--TT---T-TAATAGAGAG-AA--A----G---T-GC---A---T---------A----TGGT--G----G---G---A-----------TA---T--A-T--AT-T--TCAAGTGTATGAAGTTA-T---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATATAA-TT-ACAAAA-ATCCT--A--C-CA-TA-CA-T-T---T-A--C-CA---G-A------T-AC-GTATAAAATAT
gi|96078                      :                                                                                                                                                                         A--TT---T-T--------G-AC--A--------T-CC---C---T---------ACTTATGAT--G----G---A---A-----------TA---T--T-TTTAT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--
gi|96079                      :                                                                                                                                                                                                                                                     ---A-----------TA---T--T-T--CA-G--T------------G--A-T---ACAACT--T--TC-AAAAAT--AA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATCCC--A--C-CA-CC-CA-T-T---A-AATC-TGTCCA-A------T-AT-G----AAATATG


blockSeqs                     :               G  GCC AT   ACATGTA  TCA A TAGT  GTCGGC  T TC   GAAT TGAA C   TAAT   G   A AC AG TACT   AT   ACTC   GCGGT TGT AA        CTAGTTC TATGCC TA AAAAGGTT   TA    AT  AAA   AATAGAGA    TT CATT ATA    ATA AAT GTGGTTTTG CTTA    TA TGTT TTT ACTCCCGGGTTGTACTT               CC CAAGTGTATGAA TT   CGA      TT CA  G    T TA  AATGA A  GTAC    AT T  T      T     TA TT A  T  A  G G TTA G AT T  TCC T TACATG A  G TATA
blockSeqs                     :               .  .   .    A        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  TAC    A    .      TAC   .   .         .       AT     .  .          C     .   .     TTAAAT      .  .    .      TTG CT  TA        .       .  .    TT  GGGAGGGGGTGGTATTT               .  T            .    TA       .  GC  .    A .   A     .  CATG    AT .  G      .     .  .  .  .  .  . . .   . .  .  .   . .      .  . .   
blockSeqs                     :               .  .   .    A        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  TG     G    .      TAT   .   .         .       .      .  .          .     .   .     T           .  .    .      .   .   .         .       .  .    GT  TTTATTTTT                       .  .            .    .        .  .   .    A .   .     .  .       TA .  .      .     .  .  .  .  .  . . .   . .  .  .   . .      .  . .   
blockSeqs                     :               .  .   .    G        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  TG     A    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     T           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   ATACGTTTT                       .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .  .      .     .  .  .  .  .  . . .   . .  .  .   . .      .  . .   
blockSeqs                     :               .  .   .    A        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  CA     T    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   ACATTTTT                        .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .  .      .     .  .  .  .  .  . . .   . .  .  .   . .      .  . .   
blockSeqs                     :               .  .   .    A        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  TG     A    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   ATATTTTC                        .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .  .      .     .  .  .  .  .  . . .   . .  .  .   . .      .  . .   
blockSeqs                     :               .  .   .    T        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  TG     A    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   ATATTTTA                        .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .  .      .     .  .  .  .  .  . . .   . .  .  .   . .      .  . .   
blockSeqs                     :               .  .   .    A        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  TG     G    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   ATATTTTT                        .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .  .      .     .  .  .  .  .  . . .   . .  .  .   . .      .  . .   
blockSeqs                     :               .  .   .    C        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  CG     G    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   ATACTTTT                        .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .  .      .     .  .  .  .  .  . . .   . .  .  .   . .      .  . .   
blockSeqs                     :               .  .   .    T        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  TT     G    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   ATACTTTT                        .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .  .      .     .  .  .  .  .  . . .   . .  .  .   . .      .  . .   
blockSeqs                     :               .  .   .    C        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  TA     A    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   ATATTTTA                        .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .  .      .     .  .  .  .  .  . . .   . .  .  .   . .      .  . .   
blockSeqs                     :               .  .   .    C        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  TA     C    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   CCATTTTT                        .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .  .      .     .  .  .  .  .  . . .   . .  .  .   . .      .  . .   
blockSeqs                     :               .  .   .    C        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  GA     G    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   TTGCTTCT                        .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .  .      .     .  .  .  .  .  . . .   . .  .  .   . .      .  . .   
blockSeqs                     :               .  .   .    C        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  TA     C    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   TTATTTTT                        .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .  .      .     .  .  .  .  .  . . .   . .  .  .   . .      .  . .   
blockSeqs                     :               .  .   .    T        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  AA     A    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   TTATTTTC                        .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .  .      .     .  .  .  .  .  . . .   . .  .  .   . .      .  . .   
blockSeqs                     :               .  .   .    C        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  TT     C    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   TGATTTTT                        .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .  .      .     .  .  .  .  .  . . .   . .  .  .   . .      .  . .   
blockSeqs                     :               .  .   .    G        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  TA     G    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   TGATTTTC                        .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .  .      .     .  .  .  .  .  . . .   . .  .  .   . .      .  . .   
blockSeqs                     :               .  .   .    G        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  TA     C    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   ATAATTTT                        .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .  .      .     .  .  .  .  .  . . .   . .  .  .   . .      .  . .   
blockSeqs                     :               .  .   .    G        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  TG     G    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   TTATTTTC                        .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .  .      .     .  .  .  .  .  . . .   . .  .  .   . .      .  . .   
blockSeqs                     :               .  .   .    C        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  AA     G    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   TTATTTTT                        .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .  .      .     .  .  .  .  .  . . .   . .  .  .   . .      .  . .   
blockSeqs                     :               .  .   .    C        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  TG     G    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   TTATTTTT                        .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .  .      .     .  .  .  .  .  . . .   . .  .  .   . .      .  . .   
blockSeqs                     :               .  .   .    C        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  TA     G    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   TTATTTTT                        .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .  .      .     .  .  .  .  .  . . .   . .  .  .   . .      .  . .   
blockSeqs                     :               .  .   .    A        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  TT     A    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   TTATTCTT                        .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .  .      .     .  .  .  .  .  . . .   . .  .  .   . .      .  . .   
blockSeqs                     :               .  .   .    C        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  TA     A    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   ATATATTT                        .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .  .      .     .  .  .  .  .  . . .   . .  .  .   . .      .  . .   
blockSeqs                     :               .  .   .    A        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  AA     G    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   TTATTTTT                        .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .  .      .     .  .  .  .  .  . . .   . .  .  .   . .      .  . .   
blockSeqs                     :               .  .   .    C        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  TA     G    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   TTATTTCT                        .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .  .      .     .  .  .  .  .  . . .   . .  .  .   . .      .        
blockSeqs                     :               .  .   .    C        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  GA     G    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   ACATCTTC                        .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .  .      .     .  .  .  .  .  . . .   . .  .  .   . .               
blockSeqs                     :               .  .   .    C        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  GA     C    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   ACATTTTT                        .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .  .      .     .  .  .  .  .  . . .   . .  .  .                     
blockSeqs                     :               .  .   .    C        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  TA     G    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   TTATTTTC                        .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .  .      .     .  .  .  .  .  . . .   . .                           
blockSeqs                     :               .  .   .    A        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  AA     G    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   ATATTTTT                        .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .  .      .     .  .  .  .  .  . . .   .                             
blockSeqs                     :               .  .   .    C        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  GA     G    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   ATTTTTT                         .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .  .      .     .  .  .  .  .  . . .   .                             
blockSeqs                     :                  .   .    C        .   . .     .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  AA     G    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   TTACTGT                         .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .  .      .     .  .  .  .  .  . . .                                 
blockSeqs                     :                                                .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  AA     G    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   TTGTTC                          .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .  .      .                                                          
blockSeqs                     :                                                .       . .    .    .    .   .      .   . .  .  TG     A    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   ATATAT                          .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .  .                                                                    
blockSeqs                     :                                                               .    .    .   .      .   . .  .  .      .    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   ATATTT                          .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .                                                                       
blockSeqs                     :                                                                         .   .      .   . .  .  .      .    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   TTAAT                           .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .  .       .                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                    .   . .  .  .      .    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   ATTTC                           .  .            .    .        .  .   .    . .   .     .                                                                                  
blockSeqs                     :                                                                                        . .  .  .      .    .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   ATTTC                           .  .            .    .        .  .   .    . .                                                                                            
blockSeqs                     :                                                                                                            .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   TTATT                           .  .            .    .        .  .   .                                                                                                   
blockSeqs                     :                                                                                                            .      .     .   .         .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   ATTTT                           .  .            .    .        .  .                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                            .      .                   .       .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   TT                              .  .            .    .        .  .                                                                                                       
blockSeqs                     :                                                                                                                                               .      .  .          .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   TT                              .  .            .    .                                                                                                                   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                    .     .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .   AT                              .  .            .    .                                                                                                                   
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                          .   .     .           .  .    .      .   .   .         .       .  .    .                                                                                                                                                                            
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                          .   .     .           .  .    .                                                                                                                                                                                                                     


blockSeqCons                  :                                                                                                                                                                                                                                                     NTATTTTT********************
originalCons                  :         ATAAAA-CA---T--GCT-C-----TT---C-C----CA------TA-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CTA--GGTG-AAA----T-A-----A---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGT--G----G---A---A-----------TA---T--T-T--AT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATCCC--A--C-CA-TC-CA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
finalCons                     :         ATAAAA-CA---T--GCT-C-----TT---C-C----CA------TA-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CTA--GGTG-AAA----T-A-----A---A--TCAAG-CA-------G------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGT--G----G---ANTATTTTT--------------------AT-T--T------------G--A-T---GAACCC--T--TC-AAAA-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATCCC--A--C-CA-TC-CA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG





Alignments
lowQualScore                  :               1  222 11   5555555  222 1 2222  333333  1 11   2222 2222 1   2222   1   1 11 11 3333   22   2222 1 55555 111 11     1  3333333 11 11 66666666   22    11  111 0 77777777 0  11 1111 111 0  111 222 444444444 1111     5555555555555  555555555555 0 11 222   222222   2222     222      11 22  1    44 11  44444 1  4444    55 1  2      1     11 11 1  1  1  1 1 222 1 11 1  222 1 444444 1  1 3333       
lowQualScore                  :               .  ... ..   .......  ... . ....  ......  . ..   .... .... .   ....   .   . .. .. ....   ..   .... . ..... ... ..     .  ....... .. .. ........   ..    ..  ... . ........ .  .. .... ... .  ... ... ......... ....     .............  ............ . .. ...   ......   ....     ...      .. ..  .    .. ..  ..... .  ....    .. .  .      .     .. .. .  .  .  . . ... . .. .  ... . ...... .  . ....       
lowQualScore                  :               2  111 77   5555555  111 2 6666  333333  1 66   4444 4444 1   3333   1   0 44 44 1111   11   0000 0 77777 777 33     0  1111111 33 33 00000000   22    22  555 9 44444444 9  22 8888 555 9  666 888 888888888 9999     0000000000000  444444444444 9 33 666   777777   0000     888      33 66  0    44 44  66666 0  5555    88 1  3      1     77 77 2  2  2  2 2 111 2 88 4  444 4 111111 5  5 3333       
consensus                     :         ATAAAA-CA---T--GCT-C-----TT---C-C----CA------TA-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CTA--GGTG-AAA----T-A-----A---A--TCAAG-CA-------G--T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGTG-------------GAN-----------T-A--T---TTT------TAT----TTGAT---GAACCC--T--TC-AAAA--T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATCCC--A--C-CA-TC-CA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
Reference ( family-447 )      :         ATAAAA-CA---T--GCT-C-----TT---C-C----CA------TA-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CTA--GGTG-AAA----T-A-----A---A--TCAAG-CA-------G--T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGTG-------------GAN-----------T-A--T---TTT------TAT----TTGAT---GAACCC--T--TC-AAAA--T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATCCC--A--C-CA-TC-CA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96032                      :         ATAAAA-CT---T--GCT-A-----TT---C-C----CA------TA-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAG-T--T--CTG--GGTG-AAA----T-A-----T---A--TCAAG-CA-------G--T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGTG-------------GAA-----------C-A-------TT------TAT----CTGAC---GAACCC--T--TC-AAAA--T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATCCC--A--C-CA-CC-CA-T-T---T-A--C-TA---G-G------T-AT-G----CAATATG
gi|96033                      :         ATGAAA-TA---T--GCT-A-----TT---C-C----CA------TA-G--ATT----T----C-AAT----GTA-AAG-T--T--CTG--GTTA-AAA----T-ATAC--ATGTA--TTAAG-CA-------G--T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGTG-------------GAA-----------C-A--T---TTT------TAT----TTGAC---AAACCC--T--TC-AAAA--T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATCCC--A--C-CA-CC-CA-T-T---T-A--T-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96034                      :         ATAAAA-CA---T--GTT-A-----TT---C-C----CA------TA-T--ACT----C----C-ACT----GTA-AAA-T--T--GTG--GGTG-AAA----T-A-----A---A--TCAAG-GA-------C--T--A--------ATC--AAAT--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGTG-------------GAA-----------T-A--T---TTT------CAT----TTGAC---GAGCCC--T--TC-AAAA--T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-GCAAAA-ATCCC--A--C-CA-TT-CA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96035                      :         ATAAAA-CA---T--GCT-G-----TT---C-C----CA------TA-G--ACA----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CCA--GGGA-AAA----T-A-----A---A--TCAAG-CA-------G--T--A--------ATC--CAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------T----TGAAA-------------GAA-----------T-A--T---TTT------AAA----TTGAT---GAACCC--T--TC-AAAA--T--GA-----T-AC----CATG--A-TA-ACCAAA-ATCCC--A--C-CA-TT-TA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96036                      :         ACAAAA-CA---T--GCTACATGTATT---C-C----TA------TA-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CTG--GGTT-AAA----T-A-----T---A--TCAAG-CA-------G--T--A--------ATA--AAAA--AAAAAT-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGATG-------------GAA-----------T-A--T---TTT------TAT----TTGAC---GAACCC--T--TC-AAAA--T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACATAA-ATCCC--A--C-CA-TC-CA-T-T---T-A--C-TA---G-ATACATGT-AT-G----AAATACG
gi|96037                      :         ATAAAA-CA---T--ACT-A-----TT---C-C----CA------AA-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CTG--GGTA-AAA----T-A-----T---T--TCAAG-CA-------G--T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----C---T-TC---C---T---------G----TGGTG-------------GAA-----------T-A--C---TTT------TAT----TTGAT---GAACCC--T--TC-AAAA--T--GA-----T-AC----CGTGATA-TT-ACAAAA-ATCCC--A----CA-TC-CA-T-T---T-A--
gi|96038                      :         ATAAAA-CA---T--ACT-A-----TT---C-C----AA-------A-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--G---TG--GGTA-AAA------A-----T---T--TCAAG-CA----------T--A--------ATC--AAAA--TT---T-TT-------G-AA--A----C---T-TC---C---T---------G----TGGTG-------------GAA-----------T-A--C---TTT------TAT----TTGAT---GAACCC--T--TC--AAA--T--GA-----T-AC----CGTGATA-TT-ACAAAA---TCC--A----CA-TC-CA-T-TTTAT-A--C-TA---
gi|96039                      :         ATAAAA-CA---T--GCT-T-----TT---C-C----CA------TA-T--ATT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CCG--GGGG-AAA----TTA-----A---A--TCAAG-CA-------G--T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------T----TGGTG-------------GAA-----------T-A--T---TTT------AAT----TTGAT---GAACCC--T--TC-AAAA--T--GA-----C-AC----CATA--A-TA-ACCAAA-ATCGG--A--C-GA-TT-CA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96040                      :         ATAAAG-CA---T--TAT-A-----TT---C-C----CA------TA-C--ACT----T----C-AAT----GTA-AA-------------------------T-A-----T---A--TCAAG-CA-------G--T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGTG-------------GCC-----------C-A--T---TTT------TAT----TTGAC---AAACCC--T--TC-AAAA--T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATCCC--A--C-CA-CC-CA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-TT-G----AAATATG
gi|96041                      :         ATAAAA-CA---T--GCT-C-----TT---C-C----CA------TA-G--ACT----C----T-AAA----GTA-AA--C--G--CTT--GGTATAAA----C-A-----A---AAACCAAG-CA-------A--T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGATG-------------GAT-----------T-G--C---TTC------TAT----TTCAT---GATCGC--T--TC-AAAA--T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATTCC--A--T-CA-TC-CA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATACG
gi|96042                      :         ATAAAA-CA---T--GTT-T-----CT---C-C----CA------TA-C--AC----------C-AAT----GTA-AAA-T--T--CTA--GGTG-AAA----T-A-----A---A--TCAAG-TA-------T--T--A--------ATC--AAAA---T---T-T--------A-AA--A----A---A-TC---C---A---------A----TGGTG-------------GAT-----------T-A--T---TTT------TAT----TTGAT---GAACTC--T--TC-AAAAT-T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAGAA-ATCCA--A--C-C--TT-CA-T-T---T-A--CTTG---G-G------T-AT-T----TAATATG
gi|96043                      :         ATAAAA-CA---T--TTT-C-----TT---C-C----CA------TA-G--TCT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CTA--GGTG-AAA----T-A-----A---A--TGAAA-CA-------G--T--T--------ATC--AAAA--TT---T--------------------------------C---C---------A----TGGTA-------------GAT-----------T-A--T---TTT------CAT----TAGAT---GAAGCA--T--TC-AGAA--T---A-----T-AC----GATG--G-TT-ACAAAA-ATCCC--A--C-CA-TT-CA-T-T---T-A--T-TA---G-A------T-AT-A----
gi|96044                      :         ATAAAA-CA---A--GCT-C-----TT---C-C----CAGTCGGCCG-G--ACT----T----C-AATTAATGTA-AAG-C--T--CGA--TATA-AAA----T-A-----A---A--TCGAG-CA-------A--T--A--------ATT--G-----TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGCG-------------GAT-----------T-A--A---T---------AT----TTGGT---GAACCC--T--TC-AAAA--C--GA-----T-ACGTACCATG--A-TT-GCAAAA-AACCC-------CA-TC-CT-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96045                      :         ATAAAA-CA---T--GCT-C-----TC---C-A----AA------TA-G--ACG----T------AAT----TTA-AAA-TACTAGCTA--GGTC-TAA----T-A-----A---A--TCAAA-AA-------G--T--G---------TT--GTTG--TT---T-TTTAAAT--G-AA--C----A---T-TT---C---T---------G----TGGTT-------------GAT-----------G-A--T---TTT------TAT----TTGAT---GAACCC--T--TC-AAAA--T--GA-----C-AC----CATG--A-TT-ACGAAA-ATCCC--A--C-CA-TC-TA-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96046                      :         ATAAAG-CA---T--GCT-C-----TT---A-C-----A-------A-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--CAA--GATG-AAA----T-A-----A---A--TTGGG-CA-------G--A--A--------GTA--AAAA--TT---T-T--------G-TA--A----A---T-TC---C---T---------T----TGG-G-------------GGT-----------T-A--A---TTT------CAT----TTGAT---AAACCC--T--TC-CAAA--T--GA-----T-AC----CACA--A-TT-ATAAAA-ATCAT--A--C-CA-CT-CA-T-T---T-
gi|96047                      :         ATAAAA-TA---T--GCT-T-----TT---C-C----CA------TG-G--ATT----T----C-AAT----GTA-AA--T--T--CTT--GGTC-AAA----C-A-----A---T--TCAAA-TA-------G--A--A--------ATA--AAAA--TT---C-T--------G-AA--A----A---T-TC---T---T---------A----CGGTA-------------GAT-----------G-A--T---TTT------CAT----T---T---GAACCC--T--TC-AAAA--T--GA-----T-AC----CATG--C-TT-ACAAAA-A
gi|96048                      :         ATAAAG-CA---T--GCC-C-----TT---T-C----CA------TA-G--A----------------------------T--T--GTA--GGTA-AAA----T-A-----A---A--TCAAT-AA-------G--T--G--------ATC--AAAA--TT---T-C--------T-AA--A----A---T--C---T---T---------A----TGGTG-------------ATT-----------T-A--A---TTT------CAT----TTGAA---TAACTC--T--TC-AAAA--G--TA-----T-AC----CATA--A-TT-ACAAAA-ATTCC--C--C-CA-TT-AA-T-T---T-A--T-CA---G-A------T-AT-G----ACATATG
gi|96049                      :         ATGAAA-CA---T--GCT-G-----TT---C-C----CA------TA-G--ACT----T----C-AAT----GTA-AAAAT--T--CTA--GATC-AAA----T-G-----A---A--TAAAG-AA-------A--T--A--------ATC--AAAA--GT---T-T--------G-AA--A----A---T-TT---C---T---------A----TGGTG-------------G-G-----------T-AATT---TTT------TAT----TCGAC---GA
gi|96050                      :         ATAAAA-CA---T--GCT-G-----TT---C-C----CA------TA-A--ACT----T----T-A-T----GTA-CAA-T--T--CTG--GGTG-AAA----T-A-----T---A--TCAAG-CA-------G--T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-CC---C---TTA-------A----TGAT
gi|96051                      :         ATAAAA-CA---T--CTT-G-----TT---C-C----CA------TA-G--AC---------------------------T--T--C------------------------A---A--T--------------G--T--A--------ATT--AAAC--TT---T-T--------G-AA--A----C---T-TT---T---T---------A----TGGTG-------------GAA-----------T-A--A---TTT------TAT----TTGAC---GAACCC--T--TC-TAAA--G--GA-----T-AC----CATG--tagggatgt
gi|96052                      :         ACAAAA-CA---TATGCT-C-----TT---C-C----CA------TA-T--ACT----T----C-AAT-----TG-AA--------------GTC-ATA----T-A-----A---A--TCAAA--A-------G--T--A--------ATC--AAAA--AT---A-T--------G-AA--G----A---T-TC---T---T---------A----TGGTG-------------GGT-----------T-A---------------TA-----TTGAT---GAACTC--T--T
gi|96053                      :         ATAAAAGTA---T--GTT-C-----TT---C-CTAGTCA------TATG--ACTGAATT----T-ATT----GTA-AAA-T--T--CAA--GGGG-AGA----T-A-----A---A--TCAAG-CT-------G--T--A--------ATC--AAAA--GT---T-T--------G-TA--A----A---T-TC---T---G---------A----TGATG-------------GAT-----------T-A--T---TTT------TGA----TTAAC---AAAAAT--C--AC-AAAATTT--AAT----T-AT----TATATTA-TT-ATAAAA-AT
gi|96054                      :         ATATAA-CA---T--GCT-C-----TT---C-A----CA------CA-G--ACT----T----C--GT----GTA-AAA-T--T--CTACTGGTG-AAA----T-A-----A---A--TCACG-CA-------G--T--AAAAAGGTTATC--AAAA--TT---T-T--------A-AA--T----A---T-
gi|96055                      :         ATAAAA-CA---T--GAT-A-----TT---C-T----CA------TA-A--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--A--CTG--GGT---AA----T-A-----
gi|96056                      :          TAGAA-CA---T--GCT-C-----TT---T-C----CA------TA-G--ACT----C----C-AAG----GTA-AAA-T--T--CTA--GGTG-ACA----T-T-----A---A--TCAAA-CA-------C--T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---C---C---------A----TGGTG-------------GAT-----------T-A--T---TTT------CAT----TTGAT---GAACCC--T--TC-AAAA--T--GA-----C-AC----CATG--ATTT-GCTAAA-ATGCC--A--C-CA-TC-TA-T-T---A-C--C-TA---GTA------T-AT-G----AAATATGt
gi|96057                      :          TAAAA-CGGCCT--GCT-A-----TT---T-C-----A------CA-A--ACT----T----T-AAT----GTC-AAA-T--T--CTT--GGTG-AAA----T-A-----A---A--TCAAG-CA-------G--T--A--------ATT--GAAA--TT---T-C--------ATAATTA----A---T-TC---C---C---------G--------A-------------GAG-----------G-A--T---TTT------AGT----TCACT---GAACCA--A--TC-AAAA--T--GA-----T-GCCATGCATG--A-TT-AC--AA-ATCCC--A--C-CA-TA-CA-T-T---T-C--T-TT---G-A------T-AG-A----AAATGTG
gi|96058                      :          TAAAA-CA---T--GCC-C-----TTTCAC-C----C-------TG-C--ACT----T----T-AAT----GTA-AAA-T--T--CTA--AGTA-AAG----T-A-----A------------------------T--A--------A-A--AAAA--TT---C------------AA--A----A---T-TC---C---A---------A----TGGTG-------------AAT-----------T-A--T---TTT------TAT----TTGAT---GAACCC--T--TC-ACAG--T--GA-----T-AC----CATG--
gi|96059                      : taaaacatgcAAAG-CA---T--GCT-C-----TA---T-T----TA------TA-A--ACT----T----C-AAT----GTA-AAA-T--C--CAA--AGTA-AAA----T-AGCGGTA---A--TCAAG-TACTAGTTCG--T--A--------ATA--AGAA--TT---T-T--------G--------------C-TT---C---T---------A----TAGTG-------------TAT-----------T-A--T---TTT------TAT----TTGAT---AAATCC--C--TA-AAAA--T--GA-----T-AC----CATG--A-TC-ATAAAA-A--CT--ATTC-CA-CC-CA-T-T---
gi|96060                      :           AAAA-TA---T--ATT-C-----TT---CAT----TT------TA-G--ACT----C----CCAAT----ATA-AAA-T--C--TTA--GATG-AAAACTCC-A-----C---A--TCAAG-CA-------G--TTAA--------GTC--AAAA--AT---T-T--------G-AA--A----A---T-TCATAC---T---------C----TGGTG-------------GAT-----------TTA--T---TTT------TGT----TCTAT---AAACCC--CCATCGAAAA--T--GAA----T-AC----CATG--A-TTTGCAAAA--TCCTTAA--A-AA-TTACAGT-T---T-A--G-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96061                      :             AA-CA---T--GCT-C-----TT---T-T----CT------TA-G--AC----------C-AAT----GTA-AAG-T----------------------------------A--TCAAG-CA-------G--T--A--------ATG--AAAG--TT---T-T--------C-AA--A----A---T-TC---C---T---------A----TGGTG-------------AAT-----------T-A--T---TTT------TGT----TTGAT---GAACCC--T--TC-AACA--C--GA-----T-A
gi|96062                      :             AA-CA---A--ATT-A-----TC---C-C----TG------TA-G--ACG----T----C-GTT----ATC-GAT-T--T--TGA--GGTG-AAA----T-----------------------------G--T--A----------C--CACA--TT---T-T--------G-AA--A----A---A-TC---C---T---------A----GGGTGTGTTGTACTCCCGGGT-----------T-G--T---ACT------TAT----TTGTT---AAACCC--T--TC-AAAA--T--GA-----T-AC----TATG--G-AT-ACAAAA-ATCGC-----C-CG-TT-CG-CGT---T-A--T-TA---G-A------
gi|96063                      :              A-CA---T--GTT-C-----TT---C-C----TA------AA-TTCACT----TTGAAC-AAT----ATA-GAA-T--T---TAC-GGTG-AAA----T-A-----A---G--CCAAG-CA-------C--T--G--------AGA--ACAA--TT---T-T--------G-TA--A----A---T-CC---C---T---------T----TGGTG-------------AAT-----------T-A--T---TCT------TAT----TTGAT---GAATCT--A--TC--AAA--T--GA-----T-AC----TATG--A-T
gi|96064                      :                 A---T--GCT-C-----AT---C-C----TA------TA-G--ATT----T----C-AGT----GTG-AAA-T--T--GGA--GGTC-AAA----T-A-----A---G--TCTAG-CA-------G--T--T--------ATC--GAAA--TT---T-T--------G-TA--A----A---T-TC---C---TGTGGTTTTGA----TGGTG-------------GAT-----------T-G--T---TCT------CTC----CTGATTA-AAACCC--T--TC-AA
gi|96065                      :                                                ------TA-G--ACT----T----C-AAT----GTAGAAA-C--T--CTA--GATG-AAA----T-A-----A---A--ACAAG-CC-------G--T--T--------ATC--AAAA--TT---C-T--------G--A--A----C---T-TC---C---T---------G----TGGTG-------------G
gi|96066                      :                                          actccA------TA-T--ACT----T----C-AAT----GCC-AAA-T--T--TAA--GGTG-AGA----T-T-----A---A--TCAAG-CA-------G--T--A--------ATT--AAAA--CT---T-T--------G-AA--A----A---AATC---CAATC---------A----TGATG-------------GAA-----------T-A--T---ATT------TAT----TTGAT---AAAACC--T--TC-AGGT--T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-ATAAAA-ACCAC--A--C-CA-TC-CA-T-A---C-A--C-AA---G-A------T-AT-G----AAATGTG
gi|96067                      :                                                               ----T----C-AAT----GTA-AAA-T--T--TGA--AGTG-AAA----A-A-----A---A--GCAAG-CA-------G--T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-TA--A----A---T-TC---T------------------TGCTG-------------AGG-----------T-G--T---TAT------TA-------------AAACCC--TGCTC-CGAA--T--G
gi|96068                      :                                                                         -AAT----GTA-AAA-G--T--CAA--GGTG-AAA----T-A-----T---G--TCAAG-CA-------A--T--ATGCCTA--ATG--AAAC--TT---T-T--------A-TC--A----A----------C---T---------A----TGTTG-------------GAT-----------T-A--T---TTT------TAT----TTGAT---AAACCA--T--TC-AAAA--TTATA-----T-AC----CATG--G-TTGATAAAA-ATCAC--A--T-CA-----A-T-T---T-
gi|96069                      :                                                                                    -AAA-C--T--CAA--GGTG-TAA----T-A-----A---A--TCAAG-TA-------A--T--A--------ATC--AAGA--TT---T-T--------G-AA--A----A---T-TC---T---G---------A----TGGGG-------------GGGGGAGGGGGTGGT-A--T---TTT---------------GTT---GAACCA--T--TC-AAAA--T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-TCGAAA-ATCCC--A--C-CG-TC-CA-T-T---C-A--C-TA---A-A------T-AT-G----AAAT
gi|96070                      :                                                                                        -T--T--CTG--GGTA-AAA----T-A-----A---A--GCA-G-CA-------G--T--A--------ATTTAAAGA--CT---T-T--------C-AA--T----A---T-TC---G---T---------A----TGTTG-------------AAT-----------T-A--T---TTC------TAT----TTAAT---GAAATG--T--TC-AAAAA-T--GA-----T-AC----TATT--A-TT-ACAAAATATTT---A--C-CA-TT-CA-T-T---T-A--C-TA---G-A------A-AT-A----AAAT
gi|96071                      :                                                                                                        -AAA----T-ATAT--A---A--T-AAG-CA-------GATT--T--------ATA--AAAGATTT---T-T--------G-AA--A----A---A-TC---CCT-T---------A----TGGTG-------------GAA-----------C-A--T---CTT------CAT----TTGAACGAGAAACC--T--TC-AAA---T--GA-----T-AC----CATG--A-TT-A-GAAA-AT--C--A--C-C---C-CA-T-T---T----C-TA---G-C------T-AT-G----AAAT
gi|96072                      :                                                                                                       a-AAA----T-A-----A---A--TCAAGGCA-------G--T--A--------ATCC-AAAA--TT---T-TT-------G-AA--A----A---T-TC---C---T---------T----TGGTG-------------GAA-----------T-A--CG--TTT------TAA----GTGAT---GAAACCTTT--TC-CAAA--T--GA-----TAAC----CATC--G-TA-ACCAAA-TTCCC--A--CACA-TT-CA-T-T---T-A--C-TG---G-A------TAATGG----AAATA
gi|96073                      :                                                                                                          AA----C-A-----C---A--TCAAG-CA-------G--T--A--------ATC--AAAA--TT---T-T--------G-AA--C----A---T-TC---C---C---------A----TGGCG-------------GAA-----------C-A--T---TTT------TAT----TTGAC---GAATCC------------------------C-AC----CA------------------CCC--------------A-T-T---T-A--C-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96074                      :                                                                                                                                      A-------G--T--A--------ATC--AAAG--TT---T-T--------G-TA--A----A---T-TC---C---T---------A----CTATG-------------CAA-----------T----------------------------T---AAACTC--T--TC-AAAA--T--GA-----C-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATTC------C-CATTC-TG-T-T---TGA--T-TA---G-A------T-AT-G----AAA
gi|96075                      :                                                                                                                                               --T--A--------AT---GAAA--TT---TAT--------G-AA--GCATTA---T-TC---T---T---------G----GGGTG-------------AAT-----------T-A--T---TTT------CAT----T-AAT---GAAATC--T--TC-AAAA--T--GAAATGAT-CC----CATA--A-TT-ACAAAT-ATCCC--A--C-CA-TC-CA-T-T---T-A--C-TA---A-A------T-
gi|96076                      :                                                                                                                                                                --AAAA--GT---T-A--------G-AA--A----AATAT-TT---C---T---------G----GGGTG-------------GAT-----------T-A--C---TGT------ATT----TTGAT---AAATCC--G--TC-CATA--T--TG-----T-AT----TATG--A-TT-ACAAAA-ATCAC--A--C-CA-GC-CA-T-C---T-A--T-TA---G-A------T-AT-G----AAATATG
gi|96077                      :                                                                                                                                                                   AAA--TT---T-TAATAGAGAG-AA--A----G---T-GC---A---T---------A----TGGTG-------------GGA-----------T-A--TATATTTCAAGTGTATGAAGTT-AT---GAACCC--T--TC-AAAA--T--GA-----T-AC----CATATAA-TT-ACAAAA-ATCCT--A--C-CA-TA-CA-T-T---T-A--C-CA---G-A------T-AC-GTATAAAATAT
gi|96078                      :                                                                                                                                                                     A--TT---T-T--------G-AC--A--------T-CC---C---T---------ACTTATGATG-------------GAA-----------T-A--T---TTT------TAT----TTGAT---GAACCC--T--
gi|96079                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                           TGAT---ACAACT--T--TC-AAAAA-T--AA-----T-AC----CATG--A-TT-ACAAAA-ATCCC--A--C-CA-CC-CA-T-T---A-AATC-TGTCCA-A------T-AT-G----AAATATG