lowQualScore : 222222
lowQualScore : 555 1 1 1 55 1 77777 22 3 3 1 444 1 2 44 222 111 7777 22 333 1 2 77777 1 111 3 1 22 2222 0 0 33 22 0 000000 0 555 22 0 111 0 3333 4444 0 22222 0 11 1 0 444 444 0 11 0 1 0 0 0 11 1 0 0
lowQualScore : ... . . . .. . ..... .. . . . ... . . .. ... ... .... .. ... . . ..... . ... . . .. .... . . .. .. . ...... . ... .. . ... . .... .... . ..... . .. . . ... ... . .. . . . . . .. . . .
lowQualScore : 222 7 6 5 22 5 22222 00 0 0 3 888 3 6 44 111 333 9999 99 222 1 3 11111 1 999 2 0 33 9999 9 9 88 99 9 000000 8 777 00 8 555 8 8888 4444 8 11111 8 11 7 8 666 333 8 55 8 7 8 8 8 11 7 9 9
consensus : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-AG-TA--T----AA-TAT-A--ATA--A-A-NN-A-T-G-C-C--TGC-A---A-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-A-C-C--C-C-TCGAAA
Reference ( gi|126752 ) : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-AG-TA--T----AA-TAT-A--ATA--A-A-AT-A-T-G-C-C--TGC-A---A-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-A-C-C--C-C-TTGAAA
gi|126753 : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-AG-TA--T----AA-TAT-A--ATA--A-A-CA-A-T-G-C-C--TGC-A---A-GA----GGG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-A-A-C-C--A-C-TTGAAA
gi|126758 : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-AG-TA--T----AA-TAT-G--AT---A-A-AT-A-A-G-C-A--TGG-A---A-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-A-C-C--C-T-TTGAac
gi|126754 : AAAAC---A-G-T-A--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-AG-TA--C----AA-TAT-A--ATA--A-A-TA-A-T-A-C-C--TGT-A---A-GA----GAG----GG-T-----T-AC--G-GT-AG---A---A-ATA-G-T-C-A-C-C--T-C-TTGAAA
gi|126755 : AAAAA---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GCAT-T---T-G-C--CA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-AG-TA--T----AA-TAT-A--ATA--A-A-TA-A-T-G-C-C--TGC-A---A-GA----GAG----GA-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-A-C-C--C-G-TTGAAAac
gi|126757 : AAAAG---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-AG-TA--T----AA-TAT-A--ACA--A-A-TA-A-T-G-A-C--TGC-A---A-GA----GAT----AG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-A-C-A--C-C-TTGAAAac
gi|126759 : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-C-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-AG-TA--C----AA-TAT-A--ATA--A-A-TA-A-T-G-C-A--TGC-A---A-GA----GAGGCCAGG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-A-C-C--C-C-ac
gi|126761 : AAGAC---A-G-T-TT-GC-A-----T--TTA-GAAT-T---C-G-T--AA---T-C-C----A--T---G-A-CA-----T-T---CAAG-TA--T----AA-TAT-A--A-A--A-A-GTAA-T-G-T-C--TGC-A---A-GA----G-G----GG-T-----T-AC--A--T-GG---A---A-ATA-G-T-C-A-C-C--C-C-TTGAAA
gi|126762 : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----A----A-TAAT-T---C-G-T--AA---T-C-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-AG-TA--T----AA-TAT-A--AT-----A-AT-AGT-G-T-C--TGC-A---A-GA----GAG----GGTT-----T-ACCAA-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-A---C--C-C-TTGAAAa
gi|126764 : AAAAC---A-G-T----GC-ACCTGTT--T-A-GA-T-T---T-G-T--AA---T---C----A--T---G-A-CAG----T-T---C-AG-TA--T----AA-TAT-A--ATA--T-A-AT-AAT-G-C-C--TGC-A---A-GA----GAG----GG-------T-AC--A-GTGGG---A---A-ATT-G-T-C-A-C-C--C-C-GAGAAA
gi|126760 : AAAAC---A-G-T-T--GC-------T--T-A-GAAT-T---T-A-T--AA---T-T-C----A--A---G-A-CA-----T-T---T-A---A--T----AA-TAT-A--ATA--A-A-TA-A-T-G-C-C--TGC-A---A-GA----GAG----GG-T-----T-A---A-GT-GG---A---A-ATA-G-T---A-C-C--C-C--TGAAAac
gi|126763 : AAAACTCTA-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---C-G-TG-AA---T-C-T----A--T---G-G-CACGA--T-T---C-AG-TA--T----AAATAT-A--ATA--A-T-A--A-T-G-C-CA-TGC-A---A-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GT---A---A-ACA-G-T-C-A-CGC--C-C-TTGAAAac
gi|126768 : AAAAC---A-G-T----GC-A-----T--T-A-GAAT-T---C-GGT--AA---T-C-C----A--T---G-AACA-----T-----C-AG-TA--TTTATAA-TAT-A--ATT--A-A-AT-A-T-G-C-C--TGCTA---A-GA----GA-----GG-T-----T-AT--A-GT-GGAAAA---A-ATT-GAT-CTA-C-C--C-C-TTGAAAac
gi|126765 : AAAAC---AAG-T-T--GC-AC----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----AT-T---G-A--A-----TGT---C-AG-TA--A----TA-TAT-AC-ATA--A-A-TA-A-T-G---C--TGC-A---A-GA----GAGC---GG-T-----T-AC----GT-GG---A---A---T-G-T-C-A-C-C--C-C-TTGAAAa
gi|126772 : AAAAC---A-G-GGT--GG-A-----TAGT-A-AGAG-T---T-G-TT-AC---T-T-C----AGTT---G-A-CA-----T-T---C-AG-TA--T----AG--AT-A--ATA--ATA-AT-A-T-G-C-C--TGC-C---A-AA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---G---A-AAT-G-T-C-A-C-C--C-CTTTGAAAac
gi|126767 : AAAAC---A-G-T-TT-GG-A-----T--T-AAGAGT-T---T-G-T--AA---TGT-C----A--T---GGA-CA-----T-T---C-AG-TA--T----AA-TA--A--TTA--C-A-GT-AAT-G-C----TGC-A---A-GA----GAG----GG-T-----T-AC--AGGT-GG---A---A-A-T-A-T-C-A---C--C-C-TTGAAAa
gi|126766 : AAAAC---A-G-T-T--GC-AGT---T--T-ACGAAT-T---TTG-A--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-C---C-AG-AA--T----AA-TCT-A--ATA--A-T-AA-A-T-G-C-C--TGC-A---A-GAT---GCG----GT-T-----T-TC--A-GT-GA---A---A-----G-T-C-A-C-CCTC-C-TTGAAAac
gi|126769 : AAAACCA-G-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-G---T-G-T--GA---G-TGC----A--G---A-G-CC-----T-TTCTC-GG-TA--T----AA-TAT-A---TA--A-A-TA-A-T-G-GAC--TGC-A---A-GA----GAG----GT-C-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-A-C-C--CAA-TTGAAAac
gi|126770 : AAACC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAG-TG--T-G-TGGAG---T-G-CG---A--T---G-A-GAC----T-T---CTCG-TA-------AA-TAT-A---TA--A-A-TA-A-T-G-GAC--TGC-A---A-GA----GAG----GT-C-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-A-C-C--A-A-TTGAAAac
gi|126771 : AAAAC---A-GGT-T--GCCA-----T--T-A-GAAT-TG--T-GGT--AGATGT-T-CG---A--T---G-AGCA-----T-T---CTCG-GA-------AA-TAT-A--ATA--A-A-TA-A-T-G-A-C--TGC-A---A-GA----GAG----GT-C-----T-AC--A-GT-GGA--A---A-ATA-G-TCC-A-C-C--CAA-TTGAAAac
gi|126756 : AAAAT---A-A-T-TTAGC-A-----T--G-A-G----T---T-A-A--AA---T--------A--T-----A-TA-----T-------AG-AA--T----AA-TAC-ATTATA--T-A-A--G-T-G-A-C--TGC-A---A-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-A-C-T--C-C-GAGAAAac
gi|126773 : AAGAC---G-G-T----GT-G-----T--T-G-GTAT-T---T-------------T-C----A--T-----A-CA-----T-T---C-AG-TA--T----AA-CAA-A--ATA--A-A--T-A-TTG-C-A--TGT-A---G-TT----GAG----G--T-----A-AC--A-GT-GA---A---A-ATG-T-T-C-A-C-C--C-C-TCGAAAac
gi|126774 : AAAT---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GA-T-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-TA-----T-T---C-AG-TGC-T----AA-TAG-A--ATG--A-ATAA-A-T-G-C-C--CGC-A---A-GA----GAG----GT-T-----T-AC----GC-TG---A---A-ATA-A-T-C-ACC-C--C-C-TTGGAA
gi|126775 : AAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-C-C----A--TG--G-A-CA-----T-T---C-AG--A--C-----A-TAT-A--ATA--A-A-ATAA-T-G-C-A--TGC-A---A-GA----GAGGCCAGG-T-----T-AC--A-GT-GG---AC--A-ATA-G-TCC-A-C-C--C-C-TTaac
gi|126776 : ---A-A-T-T--AC-A-----T--TCA-TAAT-TACAT-G-T--AA---T-T---------------A-CA-----T-A---C-AT-TG--T----TA-TGTTA--ATATTA-A-AT-AAT-G-A-C--TGC-A---A-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---AATTA-ATT-G-T-C-A-C-C--C-C-
gi|126777 : -T-T--G--A-----T--C-A-AAACAT---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-AG-TA--T----AA-TGT-A--ATA--A-A-TA-A-T-G-C-C--TGC-A---A-GA----GAA----AG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---GTTTT-G-T-C-A-C-A--C-C-TTGAAAcaaaaaac
gi|126778 : -T--GC-A-----T--T-A-AAAG-T---C-T-T--TA---T--------A--T---A-A-CA-----T-T---C-AG-TA--T----AA-----A--ACA--A-A--T-A-T-C-A-CATTGT-A---A-TT----GAG----GG-T-----A-AC--A-TT-GA---A---A-ATT-T-T-C-A-C-C--C-C-TCGAAA
gi|126779 : -----T--T-A-AGAT-T---A-G-T--GA---T-T------A--T---G-A-GAAGAATT-T---G-AGATAAAC----AA-TAT-A--ATA--A-A-TA-A-T-G-C-C--TGC-A---A-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-A-C-C--C-C-GAGAAAa
gi|126781 : T-T---T-G-T--TA---T-T-TTT--A--T---A-A-CA-----T-T---C-AG-TA--T----AA-CAA-A--AT---A-A-AT-A-T--------TGC-A---T-GACGTTGAG----GG-T-----A-AC--A-GT--G---A---A-ATT-T-T-C-A-C-C--C-C-TCGAAAac
gi|126780 : T-T---T-G-T--TA---T-T------A--TTTTA-A-CA-----T-T---C-AG-TA--T----AA-CAA-A--ATA--A-ATAT---T-G-C-A--TGT-A---G-TT----GAG----GG-T-----A-AC--A-TT-GA---A---A-ATT---T-C-A-C-C--C-C-TCGAAAa
gi|126782 : T-T---T-G-T--AT---T-T-TT---A--T---A-A-CA-----T-T---C-AG-TA--TT---AA-CAA-A--ATA--A-A--T-A-T--------TGC-ATGTA-GCTT--GAG----GG-T-----A-AC--A-GT-GGGA-A---A-ATT-T-T-C-A-C-C--C-C-TCGAAAac
gi|126783 : ---T-G-T--AT---T-T-CTATAA--T---G-A-CA-----T-T------------------A-TAT-A--TTA--A-T-AG-A-T-GGC-C--TGC-A---A-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GGAA-A---A-ATTAG-T-C-A-C-C--a
gi|126785 : ---T-T-T----A--T---A-A-CA-----T-T---C-AG-TA--T----AA-CAA-A--ATA--A-ATAT---T-G-C-A--TAT-A---G-TT----GAG----GG-T-----A-AC--A-TT-GA---A---A-ATT-T-T-C-A-C-C--C-C-TCGAAA
gi|126784 : ---T-T-T----A--T---A-A-CA-----T-T---C-AG-TA--T----AA-CAA-A--ATA--A-ATAT---T-G-C-A--TAT-A---G-TT----GAG----GG-T-----A-AC--A-TT-GA---A---A-ATT-T-T-C-A-C-C--C-C-TCGAAAa
gi|126786 : ---G-A-CA-----T-T------A-TA--T----AA--AT-A--ATG--G-A------------C--TGC-A---AAGA----GAG----GG-T-----TTAC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-A-C-C--C-C-a
gi|126787 : -A-CA-----C-T------G-TA--C----AT-TAT-A---TA--A-A-TA-A-T-G-A-C--TGC-A---A-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-A-C-C--C-cgagaaaac
gi|126789 : ---C-AA-TA--T----AT-TAT-A---TA--A-A-TA-A-T-G-A-C---GC-A---A-GA----GAG----TG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATG-G-T-C-A-C-C--C-taagaaaac
gi|126790 : -AG-TA--T----CA-T-T-AT-ATA--G-A-TA-A-T-G-C-C--TGC-A---A-GA----G------GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-A-C-C--C-C-TTGAAA
gi|126791 : G-TA--A----AA-CAT-T--ATA--A-A-AT-AAT-G-A-C--TGC-A---A-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-T-A-T-C--C-C-GAGAAAac
gi|126792 : -TA--T----AG-TAA-A--ATA--A-A-TA-A-T-A-A-C--TGC-A---A-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-A-C-C--T-C-GAGAAAa
gi|126795 : A--T----AA-TAT-A---TA--A-A-TT-A-T-G-C-A--TGC-A---A-AA----GAG----GG-T-----T-GC--A-GT-GG---A---C-ATT-T-T-C-A-C-C--C-C-GAGAAAac
gi|126794 : A--T----AA-T-T-A--ATA--A-A-TA-A-T-G-A-C--TGC-A---A-GA----GAG----GG-TTACTGT-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-A------C-C-TTGAGAac
gi|126788 : --T----AA-TAT-T--ATA--T-A-AT-A-A-G-A-C--TGC-A-----GA----GAG----GT-C-----T-AC--AAGT-GG---A---A-ATT-G-T-C-A-C-C--C-C-GAGAAAa
gi|126796 : t----AA-CAC-A--ATA--A--------T-G-A-C--TGC-A---A-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---AG--A-ATT-G-T-C-A-C-C--C-C-ac
gi|126798 : A-TAT-AG-ATA--A--------T-G-A-C--TGC-A---A-GA----GAT----GG-T-----T-AC--A-GT-AG---A---A-ATT-G-T-C-A-C-C--C-C-GAGAAAcgagaaac
gi|126793 : tA-CAT-T--ATAT-A-A-AT-AAT-G-A-C--TGC-A---T-GA----GAA----GG-T-----T-TC--A-GT-AG---A---A-ATT-G-T-C-A-C-C--C-C-GAGAAAac
gi|126797 : t--ATAT-A-A-AT-AAT-G-A-C--TGC-A---A-GA----GAG----GG-T-----T--C--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-A-C-C--C-C-AAGAAAac
gi|126799 : t--A-A-AT-AAT-G-A-C--TGC-A---A-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---AAG-A-ATT-G-T-C-A-C-C--C-C-GAGAAAa
gi|126800 : ac-A-T-G-A-C--TGC-A---A-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-A-C-C--C-C-CCGAGA
Alignments
lowQualScore : 555 1 1 1 55 1 77777 22 2 2 1 444 1 2 44 222 1 2 7777 22 333 1 2 77777 1 333 3 1 1 22 2222 0 0 33 0 1 0 444 1 55 0 0 0 3333 4444 0 22222 0 11 1 0 444 444 0 11 0 1 0 0 11 7777
lowQualScore : ... . . . .. . ..... .. . . . ... . . .. ... . . .... .. ... . . ..... . ... . . . .. .... . . .. . . . ... . .. . . . .... .... . ..... . .. . . ... ... . .. . . . . .. ....
lowQualScore : 000 6 5 5 00 5 00000 00 9 9 3 777 2 5 22 111 2 4 6666 88 222 1 3 11111 1 444 2 0 0 22 9999 9 9 99 9 7 8 222 6 11 8 8 8 7777 3333 8 00000 8 11 6 8 555 222 8 22 8 6 8 8 11 4444
consensus : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-AT-A-A-A-TAA-TGC-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--TCGAAA
Reference ( family-442 ) : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-AT-A-A-A-NNA-TGC-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--TCGAAA
gi|126752 : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-AT-A-A-A-ATA-TGC-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--TTGAAA
gi|126753 : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-AT-A-A-A-CAA-TGC-C-TGC-AA-GA----GGG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-A-AC-C--AC--TTGAAA
gi|126754 : AAAAC---A-G-T-A--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--C----AA-T-ATA-AT-A-A-A-TAA-TAC-C-TGT-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--G-GT-AG---A---A-ATA-G-T-C-AC-C--TC--TTGAAAac
gi|126755 : AAAAA---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GCAT-T---T-G-C--CA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-AT-A-A-A-TAA-TGC-C-TGC-AA-GA----GAG----GA-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-AC-C--CG--TTGAAAac
gi|126756 : AAAAT---A-A-T-TTAGC-A-----T--G-A-G----T---T-A-A--AA---T--------A--T-----A-TA-----T-------A-G-AA--T----AA-T-ACA-TT-A-T-A-TAAGTGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-T--CC--GAGAAAac
gi|126757 : AAAAG---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-AC-A-A-A-TAA-TGA-C-TGC-AA-GA----GAT----AG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-AC-A--CC--TTGAAAac
gi|126758 : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATG-AT-A-A-A-TAA--GC-A-TGG-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-AC-C--CT--TTGAac
gi|126759 : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-C-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--C----AA-T-ATA-AT-A-A-A-TAA-TGC-A-TGC-AA-GA----GAGGCCAGG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-AC-C--CC--
gi|126760 : AAAAC---A-G-T-T--GC-------T--T-A-GAAT-T---T-A-T--AA---T-T-C----A--A---G-A-CA-----T-T---T-A----A--T----AA-T-ATA-AT-A-A-A-TAA-TGC-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-A---A-GT-GG---A---A-ATA-G-T---AC-C--CC--T-GAAA
gi|126761 : AAGAC---A-G-T-TT-GC-A-----T--TTA-GAAT-T---C-G-T--AA---T-C-C----A--T---G-A-CA-----T-T---CAA-G-TA--T----AA-T-ATA-AA-A-A-G-TAA-TGT-C-TGC-AA-GA----G-G----GG-T-----T-AC--A--T-GG---A---A-ATA-G-T-C-AC-C--CC--TTGAAAac
gi|126762 : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----A----A-TAAT-T---C-G-T--AA---T-C-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-AT---A-A-TAG-TGT-C-TGC-AA-GA----GAG----GGTT-----T-ACCAA-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-A--C--CC--TTGAAAa
gi|126763 : AAAACTCTA-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---C-G-TG-AA---T-C-T----A--T---G-G-CACGA--T-T---C-A-G-TA--T----AAAT-ATA-AT-A-A---TAA-TGC-CATGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GT---A---A-ACA-G-T-C-ACGC--CC--TTGAAA
gi|126764 : AAAAC---A-G-T----GC-ACCTGTT--T-A-GA-T-T---T-G-T--AA---T---C----A--T---G-A-CAG----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-AT-ATA-A-TAA-TGC-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-------T-AC--A-GTGGG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--GAGAAAac
gi|126765 : AAAAC---AAG-T-T--GC-AC----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----AT-T---G-A--A-----TGT---C-A-G-TA--A----TA-T-ATACAT-A-A-A-TAA-TG--C-TGC-AA-GA----GAGC---GG-T-----T-AC----GT-GG---A---A---T-G-T-C-AC-C--CC--TTGAAAac
gi|126766 : AAAAC---A-G-T-T--GC-AGT---T--T-ACGAAT-T---TTG-A--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-C---C-A-G-AA--T----AA-T-CTA-AT-A-A-T-AAA-TGC-C-TGC-AA-GAT---GCG----GT-T-----T-TC--A-GT-GA---A---A-----G-T-C-AC-CCTCC--TTGAAAac
gi|126767 : AAAAC---A-G-T-TT-GG-A-----T--T-AAGAGT-T---T-G-T--AA---TGT-C----A--T---GGA-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-A-A-TT-ACA-G-TAA-TGC---TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--AGGT-GG---A---A-A-T-A-T-C-A--C--CC--TTGAAAac
gi|126768 : AAAAC---A-G-T----GC-A-----T--T-A-GAAT-T---C-GGT--AA---T-C-C----A--T---G-AACA-----T-----C-A-G-TA--TTTATAA-T-ATA-AT-T-A-A-ATA-TGC-C-TGCTAA-GA----GA-----GG-T-----T-AT--A-GT-GGAAAA---A-ATT-GAT-CTAC-C--CC--TTGAAAac
gi|126769 : AAAACCA-G-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-G---T-G-T--GA---G-TGC----A--G---A-G-CC-----T-TTCTC-G-G-TA--T----AA-T-ATA--T-A-A-A-TAA-TGGAC-TGC-AA-GA----GAG----GT-C-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-AC-C--Ca
gi|126770 : AAACC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAG-TG--T-G-TGGAG---T-G-CG---A--T---G-A-GAC----T-T---CTC-G-TA-------AA-T-ATA--T-A-A-A-TAA-TGGAC-TGC-AA-GA----GAG----GT-C-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-AC-C--AA--TTGAAAaattgaaaac
gi|126771 : AAAAC---A-GGT-T--GCCA-----T--T-A-GAAT-TG--T-GGT--AGATGT-T-CG---A--T---G-AGCA-----T-T---CTC-G-GA-------AA-T-ATA-AT-A-A-A-TAA-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GT-C-----T-AC--A-GT-GGA--A---A-ATA-G-TCC-AC-C--Cac
gi|126772 : AAAAC---A-G-GGT--GG-A-----TAGT-A-AGAG-T---T-G-TT-AC---T-T-C----AGTT---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AG---ATA-AT-A-ATA-ATA-TGC-C-TGC-CA-AA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---G---A-AAT-G-T-C-AC-C--CCT-TTGAAAaattgaaaac
gi|126773 : AAGAC---G-G-T----GT-G-----T--T-G-GTAT-T---T-------------T-C----A--T-----A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-C-AAA-AT-A-A-A-TAT-TGC-A-TGT-AG-TT----GAG----G--T-----A-AC--A-GT-GA---A---A-ATG-T-T-C-AC-C--CC--TCGAAAa
gi|126774 : AAAT---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GA-T-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-TA-----T-T---C-A-G-TGC-T----AA-T-AGA-AT-G-A-ATAAA-TGC-C-CGC-AA-GA----GAG----GT-T-----T-AC----GC-TG---A---A-ATA-A-T-C-AC-C--CCCTTGGAAA
gi|126775 : AAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-C-C----A--TG--G-A-CA-----T-T---C-A-G--A--C-----A-T-ATA-ATAA-A-A-TAA-TGC-A-TGC-AA-GA----GAGGCCAGG-T-----T-AC--A-GT-GG---AC--A-ATA-G-TCC-AC-C--CC--Tac
gi|126776 : ---A-A-T-T--AC-A-----T--TCA-TAAT-TACAT-G-T--AA---T-TAC----A--T-----A-CA-----T-TGT-T-ATG-T---T----AA-T-AT---T-A-A-A-TAA-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---AATTA-ATT-G-T-C-AC-C--CC---CAAAAt
gi|126777 : -T-T--G--A-----T--C-A-AAACAT---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-GTA-AT-A-A-A-TAA-TGC-C-TGC-AA-GA----GAA----AG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---GTTTT-G-T-C-AC-A--CC--TTGAAAaac
gi|126778 : -T--GC-A-----T--T-A-AAAG-T---C-T-T--TA---T--------A--T---A-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-----A-AC-A-A-A-TAT-CACAT-TGT-AA-TT----GAG----GG-T-----A-AC--A-TT-GA---A---A-ATT-T-T-C-AC-C--CC--TCGAAA
gi|126779 : -----T--T-A-AGAT-T---A-G-T--GA---T-T------A--T---G-A-GAAGAATT-T---G-A-GATAAAC----AA-T-ATA-AT-A-A-A-TAA-TGC-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--GAGAAAa
gi|126780 : T-T---T-G-T--TA---T-T------A--TTTTA-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-C-AAA-AT-A-A-A-TAT-TGC-A-TGT-AG-TT----GAG----GG-T-----A-AC--A-TT-GA---A---A-ATT---T-C-AC-C--CC--TCGAAAac
gi|126781 : T-T---T-G-T--TA---T-T-TTT--A--T---A-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-C-AAA-AT-A-A-A--TA-T-----TGC-AT-GACGTTGAG----GG-T-----A-AC--A-GT--G---A---A-ATT-T-T-C-AC-C--CC--TCGAAAac
gi|126782 : T-T---T-G-T--AT---T-T-TT---A--T---A-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--TT---AA-C-AAA-AT-A-A-A-TAT-TGC-A-TGT-A--GCTT--GAG----GG-T-----A-AC--A-GT-GGGA-A---A-ATT-T-T-C-AC-C--CC--TCGAAAa
gi|126783 : ---T-G-T--AT---T-T-CTATAA--T---G-A-CA-----T-T-------A-TA--T----A--T--TA-AT-A-G-A-TG---GC-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GGAA-A---A-ATTAG-T-C-AC-C--a
gi|126784 : ---T-T-T----A--T---A-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-C-AAA-AT-A-A-A-TAT-TGC-A-TAT-AG-TT----GAG----GG-T-----A-AC--A-TT-GA---A---A-ATT-T-T-C-AC-C--CC--TCGAAA
gi|126785 : ---T-T-T----A--T---A-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-C-AAA-AT-A-A-A-TAT-TGC-A-TAT-AG-TT----GAG----GG-T-----A-AC--A-TT-GA---A---A-ATT-T-T-C-AC-C--CC--TCGAAAa
gi|126786 : -T-ATA--T-A-A-A-TAA-TGGAC-TGC-AAAGA----GAG----GG-T-----TTAC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC---CGAGAa
gi|126787 : gacat-A-CA-----C-T-------G-TA--C----AT-T-ATA--T-A-A-A-TAA-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--Caaac
gi|126788 : -T---T-A-A-TA--T----TA-T-ATA-AT-A-A--------GA-C-TGC-A--GA----GAG----GT-C-----T-AC--AAGT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--GAGAAAtaagaaaac
gi|126789 : ---C-A-A-TA--T----AT-T-ATA--T-A-A-A-TAA-TGA-C--GC-AA-GA----GAG----TG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATG-G-T-C-AC-C--Cac
gi|126790 : -A-G-TA--T----CA-TTATA--T-A-G-A-TAA-TGC-C-TGC-AA-GA----G------GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--TTGAAA
gi|126791 : -G-TA--A----AA-C-ATT-AT-A-A-A-ATAATGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-T-AT-C--CC--GAGAAAac
gi|126792 : -TA--T----AG-T-AAA-AT-A-A-A-TAA-TAA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-A-----CC--TCGAGAa
gi|126793 : -TA--C----AT-T-ATA--T-A-A-A-TAA-TGA-C-TGC-AT-GA----GAA----GG-T-----T-TC--A-GT-AG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--GAGAAAaaac
gi|126794 : A--T----AA-T--TA-AT-A-A-A-TAA-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-TTACTGT-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--ac
gi|126795 : A--T----AA-T-ATA--T-A-A-A-TTA-TGC-A-TGC-AA-AA----GAG----GG-T-----T-GC--A-GT-GG---A---C-ATT-T-T-C-AC-C--CC--GAGAAAttgagaa
gi|126796 : -A-A-TAA-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---AG--A-ATT-G-T-C-AC-C--CC---CGAGAac
gi|126797 : aacac-T-ATA--T-A-A-A-TAA-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T--C--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--AAGAAAaac
gi|126798 : -T-ATA--T-A-G-A-TAA-TGA-C-TGC-AA-GA----GAT----GG-T-----T-AC--A-GT-AG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--GAGAAAa
gi|126799 : -AC-A-A-A-TAA-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---AAG-A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--GAGAAAac
gi|126800 : A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--CCGAGA
Alignments
lowQualScore : 555 1 1 1 55 1 77777 22 2 2 1 444 1 2 44 222 1 2 7777 22 333 1 2 77777 1 333 2 2 1 22 2222 0 0 444 0 2 0 0 11 0 55 0 0 0 3333 4444 0 22222 0 11 1 0 444 444 0 11 0 1 0 0 11 7777
lowQualScore : ... . . . .. . ..... .. . . . ... . . .. ... . . .... .. ... . . ..... . ... . . . .. .... . . ... . . . . .. . .. . . . .... .... . ..... . .. . . ... ... . .. . . . . .. ....
lowQualScore : 000 6 5 5 00 5 00000 00 9 9 3 777 2 5 22 111 2 4 6666 88 222 1 3 11111 1 555 2 1 0 22 9999 9 9 777 9 5 8 8 11 8 11 8 8 8 7777 3333 8 00000 8 11 6 8 555 222 8 22 8 6 8 8 11 4444
consensus : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-A-T-A-AA-T-A--A-TGC-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--TCGAAA
Reference ( family-442 ) : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-A-T-A-AA-T-A--A-TGC-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--TCGAAA
gi|126752 : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-A-T-A-AA-A-T--A-TGC-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--TTGAAA
gi|126753 : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-A-T-A-AA-C-A--A-TGC-C-TGC-AA-GA----GGG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-A-AC-C--AC--TTGAAA
gi|126754 : AAAAC---A-G-T-A--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--C----AA-T-ATA-A-T-A-AA-T-A--A-TAC-C-TGT-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--G-GT-AG---A---A-ATA-G-T-C-AC-C--TC--TTGAAAac
gi|126755 : AAAAA---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GCAT-T---T-G-C--CA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-A-T-A-AA-T-A--A-TGC-C-TGC-AA-GA----GAG----GA-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-AC-C--CG--TTGAAAac
gi|126756 : AAAAT---A-A-T-TTAGC-A-----T--G-A-G----T---T-A-A--AA---T--------A--T-----A-TA-----T-------A-G-AA--T----AA-T-ACA-T-T-A-TA-T-A--AGTGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-T--CC--GAGAAAac
gi|126757 : AAAAG---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-A-C-A-AA-T-A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAT----AG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-AC-A--CC--TTGAAAac
gi|126758 : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATG-A-T-A-AA-T-A--A--GC-A-TGG-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-AC-C--CT--TTGAac
gi|126759 : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-C-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--C----AA-T-ATA-A-T-A-AA-T-A--A-TGC-A-TGC-AA-GA----GAGGCCAGG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-AC-C--CC--
gi|126760 : AAAAC---A-G-T-T--GC-------T--T-A-GAAT-T---T-A-T--AA---T-T-C----A--A---G-A-CA-----T-T---T-A----A--T----AA-T-ATA-A-T-A-AA-T-A--A-TGC-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-A---A-GT-GG---A---A-ATA-G-T---AC-C--CC--T-GAAA
gi|126761 : AAGAC---A-G-T-TT-GC-A-----T--TTA-GAAT-T---C-G-T--AA---T-C-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-AAG-TA--T----AA-T-ATA-A-A-A-AG-T-A--A-TGT-C-TGC-AA-GA----G-G----GG-T-----T-AC--A--T-GG---A---A-ATA-G-T-C-AC-C--CC--TTGAAAac
gi|126762 : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----A----A-TAAT-T---C-G-T--AA---T-C-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-A-T---AA-T-A--G-TGT-C-TGC-AA-GA----GAG----GGTT-----T-ACCAA-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-A--C--CC--TTGAAAa
gi|126763 : AAAACTCTA-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---C-G-TG-AA---T-C-T----A--T---G-G-CACGA--T-T---C-A-G-TA--T----AAAT-ATA-A-T-A-A--T-A--A-TGC-CATGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GT---A---A-ACA-G-T-C-ACGC--CC--TTGAAA
gi|126764 : AAAAC---A-G-T----GC-ACCTGTT--T-A-GA-T-T---T-G-T--AA---T---C----A--T---G-A-CAG----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-A-T-ATAA-T-A--A-TGC-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-------T-AC--A-GTGGG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--GAGAAAac
gi|126765 : AAAAC---AAG-T-T--GC-AC----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----AT-T---G-A--A-----TGT---C-A-G-TA--A----TA-T-ATACA-T-A-AA-T-A--A-TG--C-TGC-AA-GA----GAGC---GG-T-----T-AC----GT-GG---A---A---T-G-T-C-AC-C--CC--TTGAAAac
gi|126766 : AAAAC---A-G-T-T--GC-AGT---T--T-ACGAAT-T---TTG-A--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-C---C-A-G-AA--T----AA-T-CTA-A-T-A-AT-A-A--A-TGC-C-TGC-AA-GAT---GCG----GT-T-----T-TC--A-GT-GA---A---A-----G-T-C-AC-CCTCC--TTGAAAac
gi|126767 : AAAAC---A-G-T-TT-GG-A-----T--T-AAGAGT-T---T-G-T--AA---TGT-C----A--T---GGA-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-A-A-T-T-ACAG-T-A--A-TGC---TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--AGGT-GG---A---A-A-T-A-T-C-A--C--CC--TTGAAAac
gi|126768 : AAAAC---A-G-T----GC-A-----T--T-A-GAAT-T---C-GGT--AA---T-C-C----A--T---G-AACA-----T-----C-A-G-TA--TTTATAA-T-ATA-ATT-A-AA-T----A-TGC-C-TGCTAA-GA----GA-----GG-T-----T-AT--A-GT-GGAAAA---A-ATT-GAT-CTAC-C--CC--TTGAAAac
gi|126769 : AAAACCA-G-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-G---T-G-T--GA---G-TGC----A--G---A-G-CC-----T-TTCTC-G-G-TA--T----AA-T-ATA---T-A-AA-T-A--A-TGGAC-TGC-AA-GA----GAG----GT-C-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-AC-C--Ca
gi|126770 : AAACC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAG-TG--T-G-TGGAG---T-G-CG---A--T---G-A-GAC----T-T---CTC-G-TA-------AA-T-ATA---T-A-AA-T-A--A-TGGAC-TGC-AA-GA----GAG----GT-C-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-AC-C--AA--TTGAAAaattgaaaac
gi|126771 : AAAAC---A-GGT-T--GCCA-----T--T-A-GAAT-TG--T-GGT--AGATGT-T-CG---A--T---G-AGCA-----T-T---CTC-G-GA-------AA-T-ATA-A-T-A-AA-T-A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GT-C-----T-AC--A-GT-GGA--A---A-ATA-G-TCC-AC-C--Cac
gi|126772 : AAAAC---A-G-GGT--GG-A-----TAGT-A-AGAG-T---T-G-TT-AC---T-T-C----AGTT---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AG---ATA-A-T---AA-T-AATA-TGC-C-TGC-CA-AA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---G---A-AAT-G-T-C-AC-C--CCT-TTGAAAaattgaaaac
gi|126773 : AAGAC---G-G-T----GT-G-----T--T-G-GTAT-T---T-------------T-C----A--T-----A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-C-AAA-A-T-A-AA-T-A--T-TGC-A-TGT-AG-TT----GA-----GG-T-----A-AC--A-GT-GA---A---A-ATG-T-T-C-AC-C--CC--TCGAAAa
gi|126774 : AAAT---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GA-T-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-TA-----T-T---C-A-G-TGC-T----AA-T-AGA-A-T-G-AA-TAA--A-TGC-C-CGC-AA-GA----GAG----GT-T-----T-AC----GC-TG---A---A-ATA-A-T-C-AC-C--CCCTTGGAAA
gi|126775 : AAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-C-C----A--TG--G-A-CA-----T-T---C-A-G--A--C-----A-T-ATA-A-TAA-AA-T-A--A-TGC-A-TGC-AA-GA----GAGGCCAGG-T-----T-AC--A-GT-GG---AC--A-ATA-G-TCC-AC-C--CC--Tac
gi|126776 : ---A-A-T-T--AC-A-----T--TCA-TAAT-TACAT-G-T--AA---T-TAC----A--T-----A-CA-----T-TGT-T-ATG-T---T----AA-T-AT----T-A-AA-T-A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---AATTA-ATT-G-T-C-AC-C--CC---CAAAAt
gi|126777 : -T-T--G--A-----T--C-A-AAACAT---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-GTA-A-T-A-AA-T-A--A-TGC-C-TGC-AA-GA----GAA----AG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---GTTTT-G-T-C-AC-A--CC--TTGAAAaac
gi|126778 : -T--GC-A-----T--T-A-AAAG-T---C-T-T--TA---T--------A--T---A-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-----A-A-C-A-AA-T-A--T-CACAT-TGT-AA-TT----GAG----GG-T-----A-AC--A-TT-GA---A---A-ATT-T-T-C-AC-C--CC--TCGAAA
gi|126779 : -----T--T-A-AGAT-T---A-G-T--GA---T-T------A--T---G-A-GAAGAATT-T---G-A-GATAAAC----AA-T-ATA-A-T-A-AA-T-A--A-TGC-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--GAGAAAa
gi|126780 : T-T---T-G-T--TA---T-T------A--TTTTA-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-C-AAA-A-T-A-AA-T-A--T-TGC-A-TGT-AG-TT----GAG----GG-T-----A-AC--A-TT-GA---A---A-ATT---T-C-AC-C--CC--TCGAAAac
gi|126781 : T-T---T-G-T--TA---T-T-TTT--A--T---A-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-C-AAA-A-T-A-AA-T-A--------T-TGC-AT-GACGTTGAG----GG-T-----A-AC--A-GT--G---A---A-ATT-T-T-C-AC-C--CC--TCGAAAac
gi|126782 : T-T---T-G-T--AT---T-T-TT---A--T---A-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--TT---AA-C-AAA-A-T-A-AA-T-A--T-TGC-A-TGT-A--GCTT--GAG----GG-T-----A-AC--A-GT-GGGA-A---A-ATT-T-T-C-AC-C--CC--TCGAAAa
gi|126783 : ---T-G-T--AT---T-T-CTATAA--T---G-A-CA-----T-T-------A-TA--T----A--T--TA-A-T-A-GA-T-G-----GC-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GGAA-A---A-ATTAG-T-C-AC-C--a
gi|126784 : ---T-T-T----A--T---A-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-C-AAA-A-T-A-AA-T-A--T-TGC-A-TAT-AG-TT----GAG----GG-T-----A-AC--A-TT-GA---A---A-ATT-T-T-C-AC-C--CC--TCGAAA
gi|126785 : ---T-T-T----A--T---A-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-C-AAA-A-T-A-AA-T-A--T-TGC-A-TAT-AG-TT----GAG----GG-T-----A-AC--A-TT-GA---A---A-ATT-T-T-C-AC-C--CC--TCGAAAa
gi|126786 : -T-ATA---T-A-AA-T-A--A-TGGAC-TGC-AAAGA----GAG----GG-T-----TTAC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC---CGAGAa
gi|126787 : gacat-A-CA-----C-T-------G-TA--C----AT-T-ATA---T-A-AA-T-A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--Caaac
gi|126788 : --T----AA-T-ATT-A-T-ATAA-T-A--A--GA-C-TGC-A--GA----GAG----GT-C-----T-AC--AAGT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--GAGAAAtaagaaaac
gi|126789 : t---C-A-A-TA--T----AT-T-ATA---T-A-AA-T-A--A-TGA-C--GC-AA-GA----GAG----TG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATG-G-T-C-AC-C--Cac
gi|126790 : -A-G-TA--T----CA-TTATA---T-A-GA-T-A--A-TGC-C-TGC-AA-GA----G------GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--TTGAAA
gi|126791 : -G-TA--A----AA-C-ATT-A-T-A-AAAT-A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-T-AT-C--CC--GAGAAAac
gi|126792 : -TA--T----AG-T-AAA-A-T-A-AA-T-A--A-TAA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-A-----CC--TCGAGAa
gi|126793 : -TA--C----AT-T-ATA---T-A-AA-T-A--A-TGA-C-TGC-AT-GA----GAA----GG-T-----T-TC--A-GT-AG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--GAGAAAaaac
gi|126794 : A--T----AA-T--TA-A-T-A-AA-T-A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-TTACTGT-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--ac
gi|126795 : A--T----AA-T-ATA---T-A-AA-T-T--A-TGC-A-TGC-AA-AA----GAG----GG-T-----T-GC--A-GT-GG---A---C-ATT-T-T-C-AC-C--CC--GAGAAAttgagaa
gi|126796 : -AA-T-A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---AG--A-ATT-G-T-C-AC-C--CC---CGAGAac
gi|126797 : aacac-T-ATA---T-A-AA-T-A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T--C--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--AAGAAAaac
gi|126798 : -T-ATA---T-A-GA-T-A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAT----GG-T-----T-AC--A-GT-AG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--GAGAAAa
gi|126799 : -A-C-A-AA-T-A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---AAG-A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--GAGAAAac
gi|126800 : -A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--CCGAGA
Alignments
lowQualScore : 555 1 1 1 55 1 77777 22 2 2 1 444 1 2 44 222 1 2 7777 22 333 1 2 77777 1 333 2 2 1 22 2222 0 0 444 0 2 0 0 11 0 55 0 0 0 3333 4444 0 22222 0 11 1 0 444 444 0 11 0 1 0 0 11 7777
lowQualScore : ... . . . .. . ..... .. . . . ... . . .. ... . . .... .. ... . . ..... . ... . . . .. .... . . ... . . . . .. . .. . . . .... .... . ..... . .. . . ... ... . .. . . . . .. ....
lowQualScore : 000 6 5 5 00 5 00000 00 9 9 3 777 2 5 22 111 2 4 6666 88 222 1 3 11111 1 555 2 1 0 22 9999 9 9 777 9 5 8 8 11 8 11 8 8 8 7777 3333 8 00000 8 11 6 8 555 222 8 22 8 6 8 8 11 4444
consensus : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-A-T-A-AA-T-A--A-TGC-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--TCGAAA
Reference ( family-442 ) : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-A-T-A-AA-T-A--A-TGC-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--TCGAAA
gi|126752 : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-A-T-A-AA-A-T--A-TGC-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--TTGAAA
gi|126753 : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-A-T-A-AA-C-A--A-TGC-C-TGC-AA-GA----GGG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-A-AC-C--AC--TTGAAA
gi|126754 : AAAAC---A-G-T-A--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--C----AA-T-ATA-A-T-A-AA-T-A--A-TAC-C-TGT-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--G-GT-AG---A---A-ATA-G-T-C-AC-C--TC--TTGAAAac
gi|126755 : AAAAA---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GCAT-T---T-G-C--CA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-A-T-A-AA-T-A--A-TGC-C-TGC-AA-GA----GAG----GA-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-AC-C--CG--TTGAAAac
gi|126756 : AAAAT---A-A-T-TTAGC-A-----T--G-A-G----T---T-A-A--AA---T--------A--T-----A-TA-----T-------A-G-AA--T----AA-T-ACA-T-T-A-TA-T-A--AGTGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-T--CC--GAGAAAac
gi|126757 : AAAAG---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-A-C-A-AA-T-A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAT----AG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-AC-A--CC--TTGAAAac
gi|126758 : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATG-A-T-A-AA-T-A--A--GC-A-TGG-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-AC-C--CT--TTGAac
gi|126759 : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-C-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--C----AA-T-ATA-A-T-A-AA-T-A--A-TGC-A-TGC-AA-GA----GAGGCCAGG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-AC-C--CC--
gi|126760 : AAAAC---A-G-T-T--GC-------T--T-A-GAAT-T---T-A-T--AA---T-T-C----A--A---G-A-CA-----T-T---T-A----A--T----AA-T-ATA-A-T-A-AA-T-A--A-TGC-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-A---A-GT-GG---A---A-ATA-G-T---AC-C--CC--T-GAAA
gi|126761 : AAGAC---A-G-T-TT-GC-A-----T--TTA-GAAT-T---C-G-T--AA---T-C-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-AAG-TA--T----AA-T-ATA-A-A-A-AG-T-A--A-TGT-C-TGC-AA-GA----G-G----GG-T-----T-AC--A--T-GG---A---A-ATA-G-T-C-AC-C--CC--TTGAAAac
gi|126762 : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----A----A-TAAT-T---C-G-T--AA---T-C-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-A-T---AA-T-A--G-TGT-C-TGC-AA-GA----GAG----GGTT-----T-ACCAA-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-A--C--CC--TTGAAAa
gi|126763 : AAAACTCTA-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---C-G-TG-AA---T-C-T----A--T---G-G-CACGA--T-T---C-A-G-TA--T----AAAT-ATA-A-T-A-A--T-A--A-TGC-CATGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GT---A---A-ACA-G-T-C-ACGC--CC--TTGAAA
gi|126764 : AAAAC---A-G-T----GC-ACCTGTT--T-A-GA-T-T---T-G-T--AA---T---C----A--T---G-A-CAG----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-A-T-ATAA-T-A--A-TGC-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-------T-AC--A-GTGGG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--GAGAAAac
gi|126765 : AAAAC---AAG-T-T--GC-AC----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----AT-T---G-A--A-----TGT---C-A-G-TA--A----TA-T-ATACA-T-A-AA-T-A--A-TG--C-TGC-AA-GA----GAGC---GG-T-----T-AC----GT-GG---A---A---T-G-T-C-AC-C--CC--TTGAAAac
gi|126766 : AAAAC---A-G-T-T--GC-AGT---T--T-ACGAAT-T---TTG-A--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-C---C-A-G-AA--T----AA-T-CTA-A-T-A-AT-A-A--A-TGC-C-TGC-AA-GAT---GCG----GT-T-----T-TC--A-GT-GA---A---A-----G-T-C-AC-CCTCC--TTGAAAac
gi|126767 : AAAAC---A-G-T-TT-GG-A-----T--T-AAGAGT-T---T-G-T--AA---TGT-C----A--T---GGA-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-A-A-T-T-ACAG-T-A--A-TGC---TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--AGGT-GG---A---A-A-T-A-T-C-A--C--CC--TTGAAAac
gi|126768 : AAAAC---A-G-T----GC-A-----T--T-A-GAAT-T---C-GGT--AA---T-C-C----A--T---G-AACA-----T-----C-A-G-TA--TTTATAA-T-ATA-ATT-A-AA-T----A-TGC-C-TGCTAA-GA----GA-----GG-T-----T-AT--A-GT-GGAAAA---A-ATT-GAT-CTAC-C--CC--TTGAAAac
gi|126769 : AAAACCA-G-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-G---T-G-T--GA---G-TGC----A--G---A-G-CC-----T-TTCTC-G-G-TA--T----AA-T-ATA---T-A-AA-T-A--A-TGGAC-TGC-AA-GA----GAG----GT-C-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-AC-C--Ca
gi|126770 : AAACC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAG-TG--T-G-TGGAG---T-G-CG---A--T---G-A-GAC----T-T---CTC-G-TA-------AA-T-ATA---T-A-AA-T-A--A-TGGAC-TGC-AA-GA----GAG----GT-C-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-AC-C--AA--TTGAAAaattgaaaac
gi|126771 : AAAAC---A-GGT-T--GCCA-----T--T-A-GAAT-TG--T-GGT--AGATGT-T-CG---A--T---G-AGCA-----T-T---CTC-G-GA-------AA-T-ATA-A-T-A-AA-T-A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GT-C-----T-AC--A-GT-GGA--A---A-ATA-G-TCC-AC-C--Cac
gi|126772 : AAAAC---A-G-GGT--GG-A-----TAGT-A-AGAG-T---T-G-TT-AC---T-T-C----AGTT---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AG---ATA-A-T---AA-T-AATA-TGC-C-TGC-CA-AA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---G---A-AAT-G-T-C-AC-C--CCT-TTGAAAaattgaaaac
gi|126773 : AAGAC---G-G-T----GT-G-----T--T-G-GTAT-T---T-------------T-C----A--T-----A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-C-AAA-A-T-A-AA-T-A--T-TGC-A-TGT-AG-TT----GA-----GG-T-----A-AC--A-GT-GA---A---A-ATG-T-T-C-AC-C--CC--TCGAAAa
gi|126774 : AAAT---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GA-T-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-TA-----T-T---C-A-G-TGC-T----AA-T-AGA-A-T-G-AA-TAA--A-TGC-C-CGC-AA-GA----GAG----GT-T-----T-AC----GC-TG---A---A-ATA-A-T-C-AC-C--CCCTTGGAAA
gi|126775 : AAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-C-C----A--TG--G-A-CA-----T-T---C-A-G--A--C-----A-T-ATA-A-TAA-AA-T-A--A-TGC-A-TGC-AA-GA----GAGGCCAGG-T-----T-AC--A-GT-GG---AC--A-ATA-G-TCC-AC-C--CC--Tac
gi|126776 : ---A-A-T-T--AC-A-----T--TCA-TAAT-TACAT-G-T--AA---T-TAC----A--T-----A-CA-----T-TGT-T-ATG-T---T----AA-T-AT----T-A-AA-T-A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---AATTA-ATT-G-T-C-AC-C--CC---CAAAAt
gi|126777 : -T-T--G--A-----T--C-A-AAACAT---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-GTA-A-T-A-AA-T-A--A-TGC-C-TGC-AA-GA----GAA----AG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---GTTTT-G-T-C-AC-A--CC--TTGAAAaac
gi|126778 : -T--GC-A-----T--T-A-AAAG-T---C-T-T--TA---T--------A--T---A-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-----A-A-C-A-AA-T-A--T-CACAT-TGT-AA-TT----GAG----GG-T-----A-AC--A-TT-GA---A---A-ATT-T-T-C-AC-C--CC--TCGAAA
gi|126779 : -----T--T-A-AGAT-T---A-G-T--GA---T-T------A--T---G-A-GAAGAATT-T---G-A-GATAAAC----AA-T-ATA-A-T-A-AA-T-A--A-TGC-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--GAGAAAa
gi|126780 : T-T---T-G-T--TA---T-T------A--TTTTA-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-C-AAA-A-T-A-AA-T-A--T-TGC-A-TGT-AG-TT----GAG----GG-T-----A-AC--A-TT-GA---A---A-ATT---T-C-AC-C--CC--TCGAAAac
gi|126781 : T-T---T-G-T--TA---T-T-TTT--A--T---A-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-C-AAA-A-T-A-AA-T-A--------T-TGC-AT-GACGTTGAG----GG-T-----A-AC--A-GT--G---A---A-ATT-T-T-C-AC-C--CC--TCGAAAac
gi|126782 : T-T---T-G-T--AT---T-T-TT---A--T---A-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--TT---AA-C-AAA-A-T-A-AA-T-A--T-TGC-A-TGT-A--GCTT--GAG----GG-T-----A-AC--A-GT-GGGA-A---A-ATT-T-T-C-AC-C--CC--TCGAAAa
gi|126783 : ---T-G-T--AT---T-T-CTATAA--T---G-A-CA-----T-T-------A-TA--T----A--T--TA-A-T-A-GA-T-G-----GC-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GGAA-A---A-ATTAG-T-C-AC-C--a
gi|126784 : ---T-T-T----A--T---A-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-C-AAA-A-T-A-AA-T-A--T-TGC-A-TAT-AG-TT----GAG----GG-T-----A-AC--A-TT-GA---A---A-ATT-T-T-C-AC-C--CC--TCGAAA
gi|126785 : ---T-T-T----A--T---A-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-C-AAA-A-T-A-AA-T-A--T-TGC-A-TAT-AG-TT----GAG----GG-T-----A-AC--A-TT-GA---A---A-ATT-T-T-C-AC-C--CC--TCGAAAa
gi|126786 : -T-ATA---T-A-AA-T-A--A-TGGAC-TGC-AAAGA----GAG----GG-T-----TTAC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC---CGAGAa
gi|126787 : gacat-A-CA-----C-T-------G-TA--C----AT-T-ATA---T-A-AA-T-A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--Caaac
gi|126788 : --T----AA-T-ATT-A-T-ATAA-T-A--A--GA-C-TGC-A--GA----GAG----GT-C-----T-AC--AAGT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--GAGAAAtaagaaaac
gi|126789 : t---C-A-A-TA--T----AT-T-ATA---T-A-AA-T-A--A-TGA-C--GC-AA-GA----GAG----TG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATG-G-T-C-AC-C--Cac
gi|126790 : -A-G-TA--T----CA-TTATA---T-A-GA-T-A--A-TGC-C-TGC-AA-GA----G------GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--TTGAAA
gi|126791 : -G-TA--A----AA-C-ATT-A-T-A-AAAT-A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-T-AT-C--CC--GAGAAAac
gi|126792 : -TA--T----AG-T-AAA-A-T-A-AA-T-A--A-TAA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-A-----CC--TCGAGAa
gi|126793 : -TA--C----AT-T-ATA---T-A-AA-T-A--A-TGA-C-TGC-AT-GA----GAA----GG-T-----T-TC--A-GT-AG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--GAGAAAaaac
gi|126794 : A--T----AA-T--TA-A-T-A-AA-T-A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-TTACTGT-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--ac
gi|126795 : A--T----AA-T-ATA---T-A-AA-T-T--A-TGC-A-TGC-AA-AA----GAG----GG-T-----T-GC--A-GT-GG---A---C-ATT-T-T-C-AC-C--CC--GAGAAAttgagaa
gi|126796 : -AA-T-A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---AG--A-ATT-G-T-C-AC-C--CC---CGAGAac
gi|126797 : aacac-T-ATA---T-A-AA-T-A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T--C--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--AAGAAAaac
gi|126798 : -T-ATA---T-A-GA-T-A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAT----GG-T-----T-AC--A-GT-AG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--GAGAAAa
gi|126799 : -A-C-A-AA-T-A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---AAG-A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--GAGAAAac
gi|126800 : -A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--CCGAGA
blockSeqs : TCT A G G TA C CCTGT AG T C A ACA T G GG ATG G G TATA GT TTT G A AGAAT G TCT T A A AA TTAT CA T AT GA CGTT GCCA TACTG CA G AAA ATT TA C CT CTTG
blockSeqs : CA . . . T . GT . C A . G . G G . . A TT T G . G CGA . GT T T . C T AT C . GA TT GCCA . . A GA AG A C . TTT
blockSeqs : . . . . T . C . . . . G . . T . . . G . . . . G . . . . . . . A T . CA T C . . . AA C A . . TT
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . C . . . . . . . A . . GA . . . . . A G A . . TT
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . T . . TT
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . C . . . . . . . A . . GA
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . A . . TT
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . A . . TT
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . A . . TT
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . A . . TT
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . A . . TT
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . A . . GA
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . . . . . T . . TT
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . T . . . . . . . T . . TT
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . T . . TT
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . C . . . . . . . T . . TT
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . A . . TT
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . A . . TC
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . A . . TT
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . T . . TC
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . G . . GA
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . A . . TC
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . A . . TC
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . T . . TC
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . T . . TC
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . T . . TC
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . T . . GA
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . T . . TT
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . T . . GA
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . T . . TC
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . T . . GA
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . T . . GA
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . T . . AA
blockSeqs : . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . T . . GA
blockSeqs : . . . . . . A . . A . . . . . . . T . . GA
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . . . . . G . . CC
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . . T . . T
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . . T . . C
blockSeqs : . . . . . . A . . . . . . . T . . C
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . T . . C
blockSeqs : . . . . . C . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . A . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . A . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-A-T-A-AA-T-A--A-TGC-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--TCGAAA
finalCons : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-A-T-A-AA-T-A--A-TGC-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--TCGAAA
Alignments
lowQualScore : 555 1 1 1 55 1 77777 22 2 2 1 444 1 2 44 222 1 2 7777 22 333 1 2 77777 1 333 2 2 1 22 2222 0 0 444 0 2 0 0 11 0 55 0 0 0 3333 4444 0 22222 0 11 1 0 444 444 0 11 0 1 0 0 11 7777
lowQualScore : ... . . . .. . ..... .. . . . ... . . .. ... . . .... .. ... . . ..... . ... . . . .. .... . . ... . . . . .. . .. . . . .... .... . ..... . .. . . ... ... . .. . . . . .. ....
lowQualScore : 000 6 5 5 00 5 00000 00 9 9 3 777 2 5 22 111 2 4 6666 88 222 1 3 11111 1 555 2 1 0 22 9999 9 9 777 9 5 8 8 11 8 11 8 8 8 7777 3333 8 00000 8 11 6 8 555 222 8 22 8 6 8 8 11 4444
consensus : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-A-T-A-AA-T-A--A-TGC-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--TCGAAA
Reference ( family-442 ) : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-A-T-A-AA-T-A--A-TGC-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--TCGAAA
gi|126752 : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-A-T-A-AA-A-T--A-TGC-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--TTGAAA
gi|126753 : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-A-T-A-AA-C-A--A-TGC-C-TGC-AA-GA----GGG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-A-AC-C--AC--TTGAAA
gi|126754 : AAAAC---A-G-T-A--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--C----AA-T-ATA-A-T-A-AA-T-A--A-TAC-C-TGT-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--G-GT-AG---A---A-ATA-G-T-C-AC-C--TC--TTGAAAac
gi|126755 : AAAAA---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GCAT-T---T-G-C--CA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-A-T-A-AA-T-A--A-TGC-C-TGC-AA-GA----GAG----GA-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-AC-C--CG--TTGAAAac
gi|126756 : AAAAT---A-A-T-TTAGC-A-----T--G-A-G----T---T-A-A--AA---T--------A--T-----A-TA-----T-------A-G-AA--T----AA-T-ACA-T-T-A-TA-T-A--AGTGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-T--CC--GAGAAAac
gi|126757 : AAAAG---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-A-C-A-AA-T-A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAT----AG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-AC-A--CC--TTGAAAac
gi|126758 : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATG-A-T-A-AA-T-A--A--GC-A-TGG-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-AC-C--CT--TTGAac
gi|126759 : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-C-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--C----AA-T-ATA-A-T-A-AA-T-A--A-TGC-A-TGC-AA-GA----GAGGCCAGG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-AC-C--CC--
gi|126760 : AAAAC---A-G-T-T--GC-------T--T-A-GAAT-T---T-A-T--AA---T-T-C----A--A---G-A-CA-----T-T---T-A----A--T----AA-T-ATA-A-T-A-AA-T-A--A-TGC-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-A---A-GT-GG---A---A-ATA-G-T---AC-C--CC--T-GAAA
gi|126761 : AAGAC---A-G-T-TT-GC-A-----T--TTA-GAAT-T---C-G-T--AA---T-C-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-AAG-TA--T----AA-T-ATA-A-A-A-AG-T-A--A-TGT-C-TGC-AA-GA----G-G----GG-T-----T-AC--A--T-GG---A---A-ATA-G-T-C-AC-C--CC--TTGAAAac
gi|126762 : AAAAC---A-G-T-T--GC-A-----A----A-TAAT-T---C-G-T--AA---T-C-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-A-T---AA-T-A--G-TGT-C-TGC-AA-GA----GAG----GGTT-----T-ACCAA-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-A--C--CC--TTGAAAa
gi|126763 : AAAACTCTA-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---C-G-TG-AA---T-C-T----A--T---G-G-CACGA--T-T---C-A-G-TA--T----AAAT-ATA-A-T-A-A--T-A--A-TGC-CATGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GT---A---A-ACA-G-T-C-ACGC--CC--TTGAAA
gi|126764 : AAAAC---A-G-T----GC-ACCTGTT--T-A-GA-T-T---T-G-T--AA---T---C----A--T---G-A-CAG----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-ATA-A-T-ATAA-T-A--A-TGC-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-------T-AC--A-GTGGG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--GAGAAAac
gi|126765 : AAAAC---AAG-T-T--GC-AC----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-T-C----AT-T---G-A--A-----TGT---C-A-G-TA--A----TA-T-ATACA-T-A-AA-T-A--A-TG--C-TGC-AA-GA----GAGC---GG-T-----T-AC----GT-GG---A---A---T-G-T-C-AC-C--CC--TTGAAAac
gi|126766 : AAAAC---A-G-T-T--GC-AGT---T--T-ACGAAT-T---TTG-A--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-C---C-A-G-AA--T----AA-T-CTA-A-T-A-AT-A-A--A-TGC-C-TGC-AA-GAT---GCG----GT-T-----T-TC--A-GT-GA---A---A-----G-T-C-AC-CCTCC--TTGAAAac
gi|126767 : AAAAC---A-G-T-TT-GG-A-----T--T-AAGAGT-T---T-G-T--AA---TGT-C----A--T---GGA-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-A-A-T-T-ACAG-T-A--A-TGC---TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--AGGT-GG---A---A-A-T-A-T-C-A--C--CC--TTGAAAac
gi|126768 : AAAAC---A-G-T----GC-A-----T--T-A-GAAT-T---C-GGT--AA---T-C-C----A--T---G-AACA-----T-----C-A-G-TA--TTTATAA-T-ATA-ATT-A-AA-T----A-TGC-C-TGCTAA-GA----GA-----GG-T-----T-AT--A-GT-GGAAAA---A-ATT-GAT-CTAC-C--CC--TTGAAAac
gi|126769 : AAAACCA-G-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-G---T-G-T--GA---G-TGC----A--G---A-G-CC-----T-TTCTC-G-G-TA--T----AA-T-ATA---T-A-AA-T-A--A-TGGAC-TGC-AA-GA----GAG----GT-C-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-AC-C--Ca
gi|126770 : AAACC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAG-TG--T-G-TGGAG---T-G-CG---A--T---G-A-GAC----T-T---CTC-G-TA-------AA-T-ATA---T-A-AA-T-A--A-TGGAC-TGC-AA-GA----GAG----GT-C-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATA-G-T-C-AC-C--AA--TTGAAAaattgaaaac
gi|126771 : AAAAC---A-GGT-T--GCCA-----T--T-A-GAAT-TG--T-GGT--AGATGT-T-CG---A--T---G-AGCA-----T-T---CTC-G-GA-------AA-T-ATA-A-T-A-AA-T-A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GT-C-----T-AC--A-GT-GGA--A---A-ATA-G-TCC-AC-C--Cac
gi|126772 : AAAAC---A-G-GGT--GG-A-----TAGT-A-AGAG-T---T-G-TT-AC---T-T-C----AGTT---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AG---ATA-A-T---AA-T-AATA-TGC-C-TGC-CA-AA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---G---A-AAT-G-T-C-AC-C--CCT-TTGAAAaattgaaaac
gi|126773 : AAGAC---G-G-T----GT-G-----T--T-G-GTAT-T---T-------------T-C----A--T-----A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-C-AAA-A-T-A-AA-T-A--T-TGC-A-TGT-AG-TT----GA-----GG-T-----A-AC--A-GT-GA---A---A-ATG-T-T-C-AC-C--CC--TCGAAAa
gi|126774 : AAAT---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GA-T-T---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-TA-----T-T---C-A-G-TGC-T----AA-T-AGA-A-T-G-AA-TAA--A-TGC-C-CGC-AA-GA----GAG----GT-T-----T-AC----GC-TG---A---A-ATA-A-T-C-AC-C--CCCTTGGAAA
gi|126775 : AAC---A-G-T-T--GC-A-----T--T-A-GAAT-T---T-G-T--AA---T-C-C----A--TG--G-A-CA-----T-T---C-A-G--A--C-----A-T-ATA-A-TAA-AA-T-A--A-TGC-A-TGC-AA-GA----GAGGCCAGG-T-----T-AC--A-GT-GG---AC--A-ATA-G-TCC-AC-C--CC--Tac
gi|126776 : ---A-A-T-T--AC-A-----T--TCA-TAAT-TACAT-G-T--AA---T-TAC----A--T-----A-CA-----T-TGT-T-ATG-T---T----AA-T-AT----T-A-AA-T-A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---AATTA-ATT-G-T-C-AC-C--CC---CAAAAt
gi|126777 : -T-T--G--A-----T--C-A-AAACAT---T-G-T--AA---T-T-C----A--T---G-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-T-GTA-A-T-A-AA-T-A--A-TGC-C-TGC-AA-GA----GAA----AG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---GTTTT-G-T-C-AC-A--CC--TTGAAAaac
gi|126778 : -T--GC-A-----T--T-A-AAAG-T---C-T-T--TA---T--------A--T---A-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-----A-A-C-A-AA-T-A--T-CACAT-TGT-AA-TT----GAG----GG-T-----A-AC--A-TT-GA---A---A-ATT-T-T-C-AC-C--CC--TCGAAA
gi|126779 : -----T--T-A-AGAT-T---A-G-T--GA---T-T------A--T---G-A-GAAGAATT-T---G-A-GATAAAC----AA-T-ATA-A-T-A-AA-T-A--A-TGC-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--GAGAAAa
gi|126780 : T-T---T-G-T--TA---T-T------A--TTTTA-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-C-AAA-A-T-A-AA-T-A--T-TGC-A-TGT-AG-TT----GAG----GG-T-----A-AC--A-TT-GA---A---A-ATT---T-C-AC-C--CC--TCGAAAac
gi|126781 : T-T---T-G-T--TA---T-T-TTT--A--T---A-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-C-AAA-A-T-A-AA-T-A--------T-TGC-AT-GACGTTGAG----GG-T-----A-AC--A-GT--G---A---A-ATT-T-T-C-AC-C--CC--TCGAAAac
gi|126782 : T-T---T-G-T--AT---T-T-TT---A--T---A-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--TT---AA-C-AAA-A-T-A-AA-T-A--T-TGC-A-TGT-A--GCTT--GAG----GG-T-----A-AC--A-GT-GGGA-A---A-ATT-T-T-C-AC-C--CC--TCGAAAa
gi|126783 : ---T-G-T--AT---T-T-CTATAA--T---G-A-CA-----T-T-------A-TA--T----A--T--TA-A-T-A-GA-T-G-----GC-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GGAA-A---A-ATTAG-T-C-AC-C--a
gi|126784 : ---T-T-T----A--T---A-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-C-AAA-A-T-A-AA-T-A--T-TGC-A-TAT-AG-TT----GAG----GG-T-----A-AC--A-TT-GA---A---A-ATT-T-T-C-AC-C--CC--TCGAAA
gi|126785 : ---T-T-T----A--T---A-A-CA-----T-T---C-A-G-TA--T----AA-C-AAA-A-T-A-AA-T-A--T-TGC-A-TAT-AG-TT----GAG----GG-T-----A-AC--A-TT-GA---A---A-ATT-T-T-C-AC-C--CC--TCGAAAa
gi|126786 : -T-ATA---T-A-AA-T-A--A-TGGAC-TGC-AAAGA----GAG----GG-T-----TTAC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC---CGAGAa
gi|126787 : gacat-A-CA-----C-T-------G-TA--C----AT-T-ATA---T-A-AA-T-A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--Caaac
gi|126788 : --T----AA-T-ATT-A-T-ATAA-T-A--A--GA-C-TGC-A--GA----GAG----GT-C-----T-AC--AAGT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--GAGAAAtaagaaaac
gi|126789 : t---C-A-A-TA--T----AT-T-ATA---T-A-AA-T-A--A-TGA-C--GC-AA-GA----GAG----TG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATG-G-T-C-AC-C--Cac
gi|126790 : -A-G-TA--T----CA-TTATA---T-A-GA-T-A--A-TGC-C-TGC-AA-GA----G------GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--TTGAAA
gi|126791 : -G-TA--A----AA-C-ATT-A-T-A-AAAT-A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-T-AT-C--CC--GAGAAAac
gi|126792 : -TA--T----AG-T-AAA-A-T-A-AA-T-A--A-TAA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-A-----CC--TCGAGAa
gi|126793 : -TA--C----AT-T-ATA---T-A-AA-T-A--A-TGA-C-TGC-AT-GA----GAA----GG-T-----T-TC--A-GT-AG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--GAGAAAaaac
gi|126794 : A--T----AA-T--TA-A-T-A-AA-T-A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-TTACTGT-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--ac
gi|126795 : A--T----AA-T-ATA---T-A-AA-T-T--A-TGC-A-TGC-AA-AA----GAG----GG-T-----T-GC--A-GT-GG---A---C-ATT-T-T-C-AC-C--CC--GAGAAAttgagaa
gi|126796 : -AA-T-A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---AG--A-ATT-G-T-C-AC-C--CC---CGAGAac
gi|126797 : aacac-T-ATA---T-A-AA-T-A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T--C--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--AAGAAAaac
gi|126798 : -T-ATA---T-A-GA-T-A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAT----GG-T-----T-AC--A-GT-AG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--GAGAAAa
gi|126799 : -A-C-A-AA-T-A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---AAG-A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--GAGAAAac
gi|126800 : -A--A-TGA-C-TGC-AA-GA----GAG----GG-T-----T-AC--A-GT-GG---A---A-ATT-G-T-C-AC-C--CC--CCGAGA