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gi|29263                      :       TGT-C--C--G--C-A-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A---C-G-A-T-TT-G--C-A--GG--A-T-TTC--A-A--T-G-AA-A----T-TT--G-TG--G---A-GT-G--TT--AG---A----A-TA--CA-T-A-A------T----G-G--G-A-T-G-A-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-G--TT-TT--G-G--A-CAA--A---A----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
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gi|29323                      :       TGT-C--C--G--C-A-A---C-T-C---C-TGCC-T-A-A---C-G-A-C-TT-T--C-A--GG--A-T-TTT--TTA--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG--G---C-GT-G--TT--AG---A----T-CA--CA-T-A-A------T----G-GA-G-AAT-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-G--TT-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-TT-T--GT--T-C---A-G--A-TATGA-attt
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gi|29322                      :       TGT-C--C--A--C-A-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-A-A-C-CT-G--C-A--GG--A-T-TTT--A-A--T-A-AA-A--C-T-TT--G-TT--G---A-GT-G--AA--AG---A----T-TA--CA-T-A-A------T----G-GA-G-G-T-T-T-G-C-AT-A-TTT-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-A--T---T----T-TA-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGta
gi|29264                      :       TGT-C--T--G--C-A-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TAT--A-A--T-A-AA-A--C-T-TT--G-TG--G---A-GT-G--TT--AG---ATTACA-TA--T--T-A-A------T----G-GA-G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-T--AT-TC--A-G--C-C-A--A---T----T-TA-T--GT--G-G-A-A-G--A-TGTG
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gi|29275                      :       TGT-C--C--A--C-A-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-A-A-C-TT-G--C-G--GG--G-T-TTT--A-A--T-G-AA-A--C-T-TG--G-AG--G---A-GT-G--TT--AG---A----T-TA--CA-T-A-A------T----G-GA-G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-AT--G-G-AA--TT--T---T-A--TC-TC--G-G--A-C-A--A---T----T-Tatttt
gi|28993                      :       TGT-C--C--G--C-A-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-T-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTC--A-A--T-G-AA-A--C-T-TG--T-TG--G---A--T-G--TT--AG---A----A-TAGTCA-T-A-A------T----G-GA-G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTGTT-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-AGTA---T----T-TT-attta
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gi|28997                      :      ttgT-C--C--G--C-A-----C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT--T-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG--G---A-GT-G--TT--AG---A----A--A--TA-T-A-A------TAATGG-GA-G-A-T-G-T-GAA-AT-A-TTG-TAC-A---G-G-AA--TT--T---T-G--TT-TT----G--A-C-A--A---T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGt
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Reference ( family-44 )       :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-N-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---A-T-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
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gi|29181                      :    tgcgtTGT-C--CC-G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-CT-T--C-A--GG--A-T-TTT-T-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GG-G--TT--AG---A---A-T-A--TA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-G--TT-TT--G-A--A-C-A--A--------T-TT-T--GT--A-C-A-AGG--A-TATGA-ACGTT
gi|29182                      :     tgcgtGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-G-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---T-T-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AG--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-TA-T--GT--A-C-A-A-A--A-TATG
gi|29184                      :     tgtgTGT-C-----G--CA-G-----T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C---A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT---A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---A-T-A--TA---T-A-A-T----G-GA------G-A-TGG-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---A-T--TT-TT--G-G--A-C-A--A--------T-TT-T--GT--A-C-A-A-A--A-TATGA-ACGTT
gi|29187                      :    tgtgtTGT-C--C--C--AA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A---G--A-TATTT-T-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---A-A-T--TA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-GAAA--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-A--G--------T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
gi|29188                      :    tgtgtTGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT---A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-T--G---A-GT-GT-TT--AG---A---A-T-A--TA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TT--T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TT--T-G--A-C-A--A---T----T-TT-T--G---A-C-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
gi|29189                      :            tg--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--G---A-T-TTC-A-A--T-G-AA-A--C-T-TTT-G-TG-G---A-GT-G--TT--AA---A---A-TTA--TA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---TAA--TT-TTGGG-G--A-C-A--A---T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
gi|29191                      : tgcgtcgtTGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-TTACA-A-T-G-A-C-TT-GT-C-A--GG--A-T-TTT-T-A--A-G-AATA--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-T--CT--AG---A---T-C-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AA-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-G--TT-TT--G-G--A-C-A--AT--T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATG
gi|29194                      :       tgTGT-C--C-----CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--G---A-T-TTT-T-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-----A-GT-G--TT--AG---A---T-T-A--CA---T-A-A-T----G-GA------A-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTT-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-G--TT-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-TTAT--GT--A-C-A-A-A--A-TATG
gi|29196                      :      tgtgtt-C--C--G---A-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A---TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-A-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-T-----GT-G--TT--AG---A---A-T-A--TA-----A-C-T----G-AA------G-ATT-G-T-G-CAAT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
gi|29201                      :    tgcgttgT-T--C--G--C------C-T-C---C-T-C--T-A-A-A-T-G-A-C-TT-T--C-A--GG--A-T-TTT-A-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---ATTCA-T-A--TA---T---A-T----G-G-------G-A-T-G-TGG-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G--A--TT--T---T-G--TT-TT----G--A-C-A--A---T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TTTAT-ACGTT
gi|29227                      :     tgttTGT-C--C--G--CA-A---A-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-T-A--T-G-AA-AACT-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---T-C-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-G--TT-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-TT-TTGAT--A-C-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
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gi|29246                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-T-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---A-T-A--TG---T-G-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
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gi|29267                      :         TGT-C--C--A--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTC-T-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---A-T-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AC-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-G--TT-TA--G-G--A-C-T--A---T----C-TA-T--GT--A-G-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
gi|29268                      :         TGT-C--T--G--CA-A---C-T-C---C-T-TC-T-A-A-A-C-G-A-C-CT-G--C-T--GG--G-T-TTT-T-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---C-T-T--CA---T-A-A-A----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-G--TT-TT--G-G--A-C-A--A---T----A-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATG
gi|29269                      :         TGT-C--T--G--CA-A---C-T-C---C-T-TC-T-A-A-A-C-G-A-C-CT-G--C-T--GG--T-T-TTT-A-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---C-T-T--CA---T-A-A------G-GA------G-A-T-G-TGG-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-GGTTT-TT--G-G--GCC-A--A---T----A-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATG
gi|29270                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTC-A-A--T-G--A-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-GTTTT--AG---A---AGT-A--CAT--T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-GAAA--TT--T---T-G--TT-
gi|29271                      :         TGT-C--C--A--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TC-G--C-A--GG--A-T-TTT-A-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TT-G---A-TT-G--TT--TT---A---T-T-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-G-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-TA-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGcg
gi|29272                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-C-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT---A--T-A-TA-A--C-T-TT--G-TG-----A-GT-G--TT--AG---A---T-C-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AC-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T----TT-TT----G--A-C-A--A---T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TAT
gi|29273                      :         TGT-T--C--A--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TC-G--C-A--GG--A-T-TTT-A-A--T-G-AA-A--C-T-TT--A-TG-G---A-GT-G--TT--AT---A---T-T-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-T---G-G-AA--TT--T---T-
gi|29274                      :         TGT-C--C--A--CA-A---C-T-C---C-T-GC-T-A-A-A-C-G-A-C-TC-G--C-A--GG--A-T-TTT-A-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-A---A-GT-T--AT--AG---A---T-T-A--CA---T-A-A-T----T-GA------G-A-T-A-T-G-C-A--A-TTG-T-C-A---G-G-AA--AT--T---t
gi|29275                      :         TGT-C--C--A--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-A-A-C-TT-G--C-G--GG--G-T-TTT-A-A--T-G-AA-A--C-T-TG--G-AG-G---A-GT-G--TT--AG---A---T-T-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-AT--G-G-AA--TT--T---T-A--TC-TC--G-G--A-C-A--A---T----T-T
gi|29283                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T--C-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GT--A-T-TTT-T-A--T-G-AA-A--CTT-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---T-C-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-C-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-A--T---T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGA-ACGTTattta
gi|29284                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A---C-G-A-C-TT-G--CCA--GT--A-T-TTT-T-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-A---A-GTTG--TT--AGT--A---A-T-C--AA---T-A-A-T----GTGA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-C-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TG--G-A--A-C-A--T---T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
gi|29285                      :         TGT-C--C--A--CA-AAA-C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-T-A--T-G-AA-A--C-T-TA--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---T-T-A--AA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--AT--T---T-A--TC-GC--A-G--A-C-A--A---T----T-T
gi|29286                      :         TGT-C--C--G--CA-A---A-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-A-A-T-TG-G--C-A--GG--A-T-TTT-A-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---T-T-A--TA---T-A-A-T----G-GA------A-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---atttt
gi|29287                      :         TGT-C--C--A--CA-AAAAC-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT---A--T-G-AA-A--C---TT--G-TG-G---ATGTAG--TT-----------A-T-A---A---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA------------A--TTATC--GAG--A-C-A--A---T----T-T
gi|29290                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TTCGT-C-A--GT--A-T-TTT-T-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---G-AT-G--TT--AG---A---A-T-A--TA---T-A-A-T----G-GA------A-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTT-C-T-A---G-G-AA--TT--T---T-AT-TT-TT--G-G--A-C-A--GT--T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGatttta
gi|29291                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-C-----T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-TTA--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-GCG-A-GT-G--TT--AG---A---A-T-A--TA---T-A-A-T----G-GAATTGGAG-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G--A--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-TT-T--GC----T-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
gi|29292                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--TT--A-T-TTT---A--T-G--A-A--C-T-TT--G-TG-GAGTA-GT-G--TT--AG---A---A-T-A--TA---T-A-A-T----G-GA--------A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA---T--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-A--G---T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATG
gi|29294                      :         TGC-C--C--A--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-T-G-A-C-TC-G--C-A--GG--G-T-TTT-A-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--CT--AG---C---T-T-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-GA--TT--T---T-A--TT-TT--A-G--A-C-A--A---TTTTGT-TT-T--TT--A-C-A-A-A--A-TATGA-ACGTT
gi|29297                      :         TGT-C--C--A--AA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-G-A-T-G-A-C-TC-G--C-A--GG--A-T-TTT-A-A--T-G-AC-A--C-T-TA--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---T-T-A--CA---C-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-A-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TC-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-TA-T--GT--A-G-A-A-G--G-TATG
gi|29298                      :         TGT-C--C--G--CA-AAA-C-T-C---C-T-CC-T-A-A-T-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--T-T-TTC-A-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---A-T-A--C----T-A-A-T----G-GA------G-A-T-GTT-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G--A--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-CAA--A---T----T-TT-T--GT--A-C-AGA-G--A-TATG--ACGTT
gi|29299                      :         TGT-C--C--G--CA-AA--C-T-C---C---CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-T----T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT---G---A---A-T-A--TA-----A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-ATAA-TTG-T-C-A-----G-AA--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-CAA--A---T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATG
gi|29302                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTC-A-A--T-G-AA-A--C-T-TT--T-TGTG---A-GT-G--TT--AG---A---A-T-AT-TA---G-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTGTT-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-A--A--------T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATG
gi|29304                      :         TGT-C--C--G--CA-AA--C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-T-A--TTG-AA-A--C-T-TTT-G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---A-T----TA---T-A-ATT----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-----G-G-AA--TT--TTTGT-T--TT-TT--G-G--A-CAA--A---T----T-TT-T--
gi|29305                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC---A-A-A-C-G-A-CCTT-G--C-A--GG--AAT-TTT-T-A--TTG-AA-A--C-T-CT--G-TG-G---A--T-G--TT--AG---AC--A-T-A--TA---T-A-AGT----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-CCA---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-A--AT--T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
gi|29316                      :         TGT-C--C--A--CA-A---T-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TC-G--C-A--GG--A-T-TTT-A-A--T-G-AA-A--C-T-TA--C-TG-G---A-GT-G--TT--AG---G---A-T-A--CA---T-A-A-T----A-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--AT-TT--G-A--A-C-A--A---T----A-TA-T--GT--A-A-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
gi|29317                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC---A-A-A-C-G-A-C-TTTG--C-A--GG--A-T-TTT---A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---A-T-A--TA---T-A-AAT----G-GA------GGA-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TT----G--A-C-A--A---T----TGGT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
gi|29318                      :         TGT-C--C--G--CA-----C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT------T-G-AA-A--C-T-T---G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---A-T-A--TA---T-A-A-T----G--A------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-T-G-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-GT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATG
gi|29319                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CCCT-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-G--GA--T-T-TTT-T-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AGATCA---A-T-A---------A-A-TG---G-GA------A-A-T-G-T-G-C-GC-ATTTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-T--TT-TT--T-G--A-C-A--A---T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-T
gi|29322                      :         TGT-C--C--A--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-A-A-C-CT-G--C-A--GG--A-T-TTT-A-A--T-A-AA-A--C-T-TT--G-TT-G---A-GT-G--AA--AG---A---T-T-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-G-T-T-T-G-C-AT-A-TTT-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-A--T---T----T-TA-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGta
gi|29323                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-TGCC-T-A-A---C-G-A-C-TT-T--C-A--GG--A-T-TTT-TTA--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---C-GT-G--TT--AG---A---T-C-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-AAT-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-G--TT-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-TT-T--GT--T-C---A-G--A-TATGA-
gi|29324                      :         TGT-C--C--A--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-G-A-A-G-G-A-A-TT-G--C-A--AG--A-T-TTT-A-A--T-G-AA-A--T-T-TA--G-TG-G---A-GT-C--TT--AG---A---T-T-G--CA---T-A-A-T----G-AA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TC--G-G--A-C-A--A---T----T-Tttg
gi|29326                      :         TGT-C--C--A--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A---C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-T-A--T-G-AA-A--C-T-CT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---A-T-A--CA---T-A-A-T------GA------G-A-T---T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AAT-TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-A--A--------T-TA-T--GT--A-G-A------A-TATGA-ACGTT
gi|29332                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-CTCCC-T-CC-T-A-A-A-C-GGA-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-T-AA-T-G-AA-A--C-T-TT--GGTG-G---A-GT-G--TT--AG---A---A-T-A--TA---T-A-A-T----G-GA------G-A-TGG-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-ATGTT-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-TT-
gi|29335                      :         TGT-C--C--A--CA-A---A-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-T-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-A-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---T-T-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-T-C-AT-G-TT--T-C-A---A-T-AA--TT--T---T-A--TC-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-attt
gi|29336                      :         TGT-C--T--G--CA-A---C-T-C---C-T-TC-T-A-A---C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-T-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-T--A---A-AT-G--TT--AG-------A-T-T--CA---T-A-A-A----G-GA------G---T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA---T--T---T-G--TT-TT--G-G--A-C----A---T----T-TA-T--GT--A-C-A-A-G--
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gi|29394                      :                 --G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-CCG-A-C-TTTG--C-A--GG--A-TGTTT-T-A--T-G-AA-A--C-T-TT----TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---A-T-A--T----T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A-----G-AA--TT--T---T-A--TT-TT--G-GA-A-C-A--A---T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-T--A-TATGA-ACGTT
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Reference ( family-44 )       :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-N-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---A-T-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
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gi|29016                      :      ttgTGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-T--GG--A-T-TTT-A-AAAT-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GTAG--TT--AG---A---A-T-A--CA---T-A-A-TG---G-GA------G-T-T-G---G-C-AT-A-TTG-TCC-A---G-G-AA--TT--T---T-A---T-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-TT-T--GTAAA-C-A-G-G--A-TAT
gi|29017                      :     ttgtTGT-CTTC--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-C---C-TT-G--G-G--GG--A-T-TTT-A-A--T-G-AA-A--C-T-TG--G-TA-C---A-AA-G--AA--AG---A---T-C-A--CA---A-T-G-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG---C-AAGGG-G-AA--TG--C---T-G--TT-T-----G--A-T-G--T---T----T-TT-T--AT--agttgtt
gi|29019                      :        tTGT-C--TTTG--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-C---C-TT-G--G-G--GG--A-T-TTT-G-A--T-G-AA-A--C-T-TG--G-TA-C---A-AA-G--AA--AG---A---T-C-A--CA---A-T-G-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-C-A-A---G-G-ttagaggagttagggccctt
gi|29180                      :        tTGT-C-----G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-CT-T--C-A--GG--A-T-TTT-T-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GG-G--TT--AG---A---A-T-A--TA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT---TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-G--TT-TT--G-A--A-C-A--A--------T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGA-ACGTTggagtgctgtccaatgttttttaaaggagttatggcc
gi|29181                      :    tgcgtTGT-C--CC-G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-CT-T--C-A--GG--A-T-TTT-T-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GG-G--TT--AG---A---A-T-A--TA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-G--TT-TT--G-A--A-C-A--A--------T-TT-T--GT--A-C-A-AGG--A-TATGA-ACGTT
gi|29182                      :     tgcgtGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-G-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---T-T-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AG--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-TA-T--GT--A-C-A-A-A--A-TATG
gi|29184                      :     tgtgTGT-C-----G--CA-G-----T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C---A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT---A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---A-T-A--TA---T-A-A-T----G-GA------G-A-TGG-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---A-T--TT-TT--G-G--A-C-A--A--------T-TT-T--GT--A-C-A-A-A--A-TATGA-ACGTT
gi|29187                      :    tgtgtTGT-C--C--C--AA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A---G--A-TATTT-T-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---A-A-T--TA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-GAAA--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-A--G--------T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
gi|29188                      :    tgtgtTGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT---A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-T--G---A-GT-GT-TT--AG---A---A-T-A--TA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TT--T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TT--T-G--A-C-A--A---T----T-TT-T--G---A-C-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
gi|29189                      :            tg--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--G---A-T-TTC-A-A--T-G-AA-A--C-T-TTT-G-TG-G---A-GT-G--TT--AA---A---A-TTA--TA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---TAA--TT-TTGGG-G--A-C-A--A---T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
gi|29191                      : tgcgtcgtTGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-TTACA-A-T-G-A-C-TT-GT-C-A--GG--A-T-TTT-T-A--A-G-AATA--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-T--CT--AG---A---T-C-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AA-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-G--TT-TT--G-G--A-C-A--AT--T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATG
gi|29194                      :       tgTGT-C--C-----CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--G---A-T-TTT-T-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-----A-GT-G--TT--AG---A---T-T-A--CA---T-A-A-T----G-GA------A-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTT-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-G--TT-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-TTAT--GT--A-C-A-A-A--A-TATG
gi|29196                      :      tgtgtt-C--C--G---A-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A---TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-A-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-T-----GT-G--TT--AG---A---A-T-A--TA-----A-C-T----G-AA------G-ATT-G-T-G-CAAT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
gi|29201                      :    tgcgttgT-T--C--G--C------C-T-C---C-T-C--T-A-A-A-T-G-A-C-TT-T--C-A--GG--A-T-TTT-A-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---ATTCA-T-A--TA---T---A-T----G-G-------G-A-T-G-TGG-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G--A--TT--T---T-G--TT-TT----G--A-C-A--A---T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TTTAT-ACGTT
gi|29227                      :     tgttTGT-C--C--G--CA-A---A-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-T-A--T-G-AA-AACT-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---T-C-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-G--TT-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-TT-TTGAT--A-C-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
gi|29228                      :                g--G--CA-A---C-T-C---C-T-CT-A-A-A-A-C-G-AGC-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-C-AA-T-G-AA-G--C-T-T---G--G-G---A-GT-G--TT--AG---A---A-T-A--CA-------A-T----G-AA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--C---T-A--TT-TT--G-A--A-C-A--A---T----T-TT-T--GT------A-A-G--A-TATGA-CCGTT
gi|29245                      :   gttttaTGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-T--C-A--GG--A-T-TTT-T-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---T-C-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-G--TT-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-GT-A-TATGA-ACGTT
gi|29246                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-T-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---A-T-A--TG---T-G-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
gi|29247                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-T---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--G-T-TTT-T-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-GT-TT--AG---A---A-T-A--TA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---A-G-AA--TT--T--------TT-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
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gi|29249                      :         TGT-C--C--G--CA-----C-T-C---C-T-CC-T-A-ACA-C-G-A-C-TT-T--C-AAAGG--A-T-TTT-A-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---A-T-A--TA---T-T-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-CAAT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA---T--T---T-A--TTATT--G-GAAA-C-A--A---T----T-TT-T--GT--A-C-ATA-G--A-TATG
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gi|29256                      :         TGT-C--C--A--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-G-A-A-T-G-A-C-TT-G--C-A--GG--G-T-TTT-A-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---T-T-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-G-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-TA-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
gi|29257                      :         TGT-C--C--A--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-G-A-A-T-G-A-C-TT-G--C-A--GG--G-T-TTT-A-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---T-T-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-G-CTG-T-C-A---G-G-AA--AT--T---C-A--TA-TG--G-G--A-C-A--A---T----T-TA-T--GT--A-G-A-A-A--A-TATGA-ACGTT
gi|29258                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT---A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---A-T-A--TT---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AATTTT--T---T-G--TT-TT--G-G--A-C-A--AT--T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
gi|29259                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-T----T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G-----GT-G--TT--AG---A---A-T-A--TA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AAT-TT--T---T-A--TTGTC--G-G--A-A-A--A---T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
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gi|29262                      :         TGT-C--C--G--CA-AA--C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G---C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTC-A-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-AT-G--TT--AG---A---A---A--CA---T-A-A-T----G-GAA-----G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-G--TT-TT--G-G--A-C-A--A---A----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
gi|29263                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A---C-G-A-T-TT-G--C-A--GG--A-T-TTC-A-A--T-G-AA-A----T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---A-T-A--CA---T-A-A-T----G-G-------G-A-T-G-A-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-G--TT-TT--G-G--A-CAA--A---A----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
gi|29264                      :         TGT-C--T--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TAT-A-A--T-A-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---T-T-A--CATATT-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-T--AT-TC--A-G--C-C-A--A---T----T-TA-T--GT--G-G-A-A-G--A-TGTG
gi|29265                      :         TGT-C--C--A--CA-A---C-T-C---C-T------A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-A-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-----T--AG---A---T-T-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-A-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--AT--T---C-C--TC-TG--G-G--A-C-A--A---T----T-TA-T--TT--A-G-A-A-A--A-TATG
gi|29266                      :         TGT-C--C--A--CA-A---C-T-C---C-T------A-A-A-T-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTC-A-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---T-T-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-A-AT-T-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-TA-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATG
gi|29267                      :         TGT-C--C--A--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTC-T-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---A-T-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AC-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-G--TT-TA--G-G--A-C-T--A---T----C-TA-T--GT--A-G-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
gi|29268                      :         TGT-C--T--G--CA-A---C-T-C---C-T-TC-T-A-A-A-C-G-A-C-CT-G--C-T--GG--G-T-TTT-T-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---C-T-T--CA---T-A-A-A----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-G--TT-TT--G-G--A-C-A--A---T----A-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATG
gi|29269                      :         TGT-C--T--G--CA-A---C-T-C---C-T-TC-T-A-A-A-C-G-A-C-CT-G--C-T--GG--T-T-TTT-A-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---C-T-T--CA---T-A-A------G-GA------G-A-T-G-TGG-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-GGTTT-TT--G-G--GCC-A--A---T----A-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATG
gi|29270                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTC-A-A--T-G--A-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-GTTTT--AG---A---AGT-A--CAT--T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-GAAA--TT--T---T-G--TT-
gi|29271                      :         TGT-C--C--A--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TC-G--C-A--GG--A-T-TTT-A-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TT-G---A-TT-G--TT--TT---A---T-T-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-G-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-TA-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGcg
gi|29272                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-C-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT---A--T-A-TA-A--C-T-TT--G-TG-----A-GT-G--TT--AG---A---T-C-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AC-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T----TT-TT----G--A-C-A--A---T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TAT
gi|29273                      :         TGT-T--C--A--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TC-G--C-A--GG--A-T-TTT-A-A--T-G-AA-A--C-T-TT--A-TG-G---A-GT-G--TT--AT---A---T-T-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-T---G-G-AA--TT--T---T-
gi|29274                      :         TGT-C--C--A--CA-A---C-T-C---C-T-GC-T-A-A-A-C-G-A-C-TC-G--C-A--GG--A-T-TTT-A-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-A---A-GT-T--AT--AG---A---T-T-A--CA---T-A-A-T----T-GA------G-A-T-A-T-G-C-A--A-TTG-T-C-A---G-G-AA--AT--T---t
gi|29275                      :         TGT-C--C--A--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-A-A-C-TT-G--C-G--GG--G-T-TTT-A-A--T-G-AA-A--C-T-TG--G-AG-G---A-GT-G--TT--AG---A---T-T-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-AT--G-G-AA--TT--T---T-A--TC-TC--G-G--A-C-A--A---T----T-T
gi|29283                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T--C-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GT--A-T-TTT-T-A--T-G-AA-A--CTT-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---T-C-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-C-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-A--T---T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGA-ACGTTattta
gi|29284                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A---C-G-A-C-TT-G--CCA--GT--A-T-TTT-T-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-A---A-GTTG--TT--AGT--A---A-T-C--AA---T-A-A-T----GTGA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-C-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TG--G-A--A-C-A--T---T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
gi|29285                      :         TGT-C--C--A--CA-AAA-C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-T-A--T-G-AA-A--C-T-TA--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---T-T-A--AA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--AT--T---T-A--TC-GC--A-G--A-C-A--A---T----T-T
gi|29286                      :         TGT-C--C--G--CA-A---A-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-A-A-T-TG-G--C-A--GG--A-T-TTT-A-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---T-T-A--TA---T-A-A-T----G-GA------A-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---atttt
gi|29287                      :         TGT-C--C--A--CA-AAAAC-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT---A--T-G-AA-A--C---TT--G-TG-G---ATGTAG--TT-----------A-T-A---A---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA------------A--TTATC--GAG--A-C-A--A---T----T-T
gi|29290                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TTCGT-C-A--GT--A-T-TTT-T-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---G-AT-G--TT--AG---A---A-T-A--TA---T-A-A-T----G-GA------A-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTT-C-T-A---G-G-AA--TT--T---T-AT-TT-TT--G-G--A-C-A--GT--T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGatttta
gi|29291                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-C-----T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-TTA--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-GCG-A-GT-G--TT--AG---A---A-T-A--TA---T-A-A-T----G-GAATTGGAG-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G--A--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-TT-T--GC----T-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
gi|29292                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--TT--A-T-TTT---A--T-G--A-A--C-T-TT--G-TG-GAGTA-GT-G--TT--AG---A---A-T-A--TA---T-A-A-T----G-GA--------A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA---T--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-A--G---T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATG
gi|29294                      :         TGC-C--C--A--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-T-G-A-C-TC-G--C-A--GG--G-T-TTT-A-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--CT--AG---C---T-T-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-GA--TT--T---T-A--TT-TT--A-G--A-C-A--A---TTTTGT-TT-T--TT--A-C-A-A-A--A-TATGA-ACGTT
gi|29297                      :         TGT-C--C--A--AA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-G-A-T-G-A-C-TC-G--C-A--GG--A-T-TTT-A-A--T-G-AC-A--C-T-TA--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---T-T-A--CA---C-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-A-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TC-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-TA-T--GT--A-G-A-A-G--G-TATG
gi|29298                      :         TGT-C--C--G--CA-AAA-C-T-C---C-T-CC-T-A-A-T-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--T-T-TTC-A-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---A-T-A--C----T-A-A-T----G-GA------G-A-T-GTT-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G--A--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-CAA--A---T----T-TT-T--GT--A-C-AGA-G--A-TATG--ACGTT
gi|29299                      :         TGT-C--C--G--CA-AA--C-T-C---C---CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-T----T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT---G---A---A-T-A--TA-----A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-ATAA-TTG-T-C-A-----G-AA--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-CAA--A---T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATG
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gi|29304                      :         TGT-C--C--G--CA-AA--C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-T-A--TTG-AA-A--C-T-TTT-G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---A-T----TA---T-A-ATT----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-----G-G-AA--TT--TTTGT-T--TT-TT--G-G--A-CAA--A---T----T-TT-T--
gi|29305                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC---A-A-A-C-G-A-CCTT-G--C-A--GG--AAT-TTT-T-A--TTG-AA-A--C-T-CT--G-TG-G---A--T-G--TT--AG---AC--A-T-A--TA---T-A-AGT----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-CCA---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-A--AT--T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
gi|29316                      :         TGT-C--C--A--CA-A---T-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TC-G--C-A--GG--A-T-TTT-A-A--T-G-AA-A--C-T-TA--C-TG-G---A-GT-G--TT--AG---G---A-T-A--CA---T-A-A-T----A-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--AT-TT--G-A--A-C-A--A---T----A-TA-T--GT--A-A-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
gi|29317                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CC---A-A-A-C-G-A-C-TTTG--C-A--GG--A-T-TTT---A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---A-T-A--TA---T-A-AAT----G-GA------GGA-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TT----G--A-C-A--A---T----TGGT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGA-ACGTT
gi|29318                      :         TGT-C--C--G--CA-----C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT------T-G-AA-A--C-T-T---G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---A-T-A--TA---T-A-A-T----G--A------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-T-G-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-GT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATG
gi|29319                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-T-CCCT-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-G--GA--T-T-TTT-T-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AGATCA---A-T-A---------A-A-TG---G-GA------A-A-T-G-T-G-C-GC-ATTTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-T--TT-TT--T-G--A-C-A--A---T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-T
gi|29322                      :         TGT-C--C--A--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-C-A-A-C-CT-G--C-A--GG--A-T-TTT-A-A--T-A-AA-A--C-T-TT--G-TT-G---A-GT-G--AA--AG---A---T-T-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-G-T-T-T-G-C-AT-A-TTT-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-A--T---T----T-TA-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATGta
gi|29323                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-C---C-TGCC-T-A-A---C-G-A-C-TT-T--C-A--GG--A-T-TTT-TTA--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---C-GT-G--TT--AG---A---T-C-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-AAT-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-G--TT-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-TT-T--GT--T-C---A-G--A-TATGA-
gi|29324                      :         TGT-C--C--A--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-G-A-A-G-G-A-A-TT-G--C-A--AG--A-T-TTT-A-A--T-G-AA-A--T-T-TA--G-TG-G---A-GT-C--TT--AG---A---T-T-G--CA---T-A-A-T----G-AA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TC--G-G--A-C-A--A---T----T-Tttg
gi|29326                      :         TGT-C--C--A--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A---C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-T-A--T-G-AA-A--C-T-CT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---A-T-A--CA---T-A-A-T------GA------G-A-T---T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AAT-TT--T---T-A--TT-TT--G-G--A-C-A--A--------T-TA-T--GT--A-G-A------A-TATGA-ACGTT
gi|29332                      :         TGT-C--C--G--CA-A---C-T-CTCCC-T-CC-T-A-A-A-C-GGA-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-T-AA-T-G-AA-A--C-T-TT--GGTG-G---A-GT-G--TT--AG---A---A-T-A--TA---T-A-A-T----G-GA------G-A-TGG-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-ATGTT-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-TT-
gi|29335                      :         TGT-C--C--A--CA-A---A-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-T-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-A-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---T-T-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-T-C-AT-G-TT--T-C-A---A-T-AA--TT--T---T-A--TC-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-attt
gi|29336                      :         TGT-C--T--G--CA-A---C-T-C---C-T-TC-T-A-A---C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-T-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-T--A---A-AT-G--TT--AG-------A-T-T--CA---T-A-A-A----G-GA------G---T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA---T--T---T-G--TT-TT--G-G--A-C----A---T----T-TA-T--GT--A-C-A-A-G--
gi|29393                      :           T-T--C--G--CA-A---C-TTC---C-T-CC-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-T-A--T-G-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---A-T-A--TA---T-A-A-T----G-G-------G-A-T-G-T-G-C-AT-A---G-T-C-A---G-GAAA--TT--T---T-A--TT-TTG-G-G--A-C-T--A--------T-TT-T--GT--AGC-A-A-G----TATG--GCGTT
gi|29394                      :                 --G--CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-A-CCG-A-C-TTTG--C-A--GG--A-TGTTT-T-A--T-G-AA-A--C-T-TT----TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---A-T-A--T----T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A-----G-AA--TT--T---T-A--TT-TT--G-GA-A-C-A--A---T----T-TT-T--GT--A-C-A-A-T--A-TATGA-ACGTT
gi|29416                      :           ttt--C--A--CA-A---C-T-C---C-T-AC-T-A-A-A-T-G-G-C-TC-G--C-A--GG--A-T-ATT-A-A--T-G-AA-A--C-C-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---T-T-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-G--TT-TT--G-G--A-C-A--A---T----T-TA-T--GT--A-CAA-A-A--A-TATGA-ACGTT
gi|29423                      :             t--C--G--CA-A---C-T-C---CCT-CCAG-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--G---A-T-TTT-T-A--T-G-AA----C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AG---A---A-T-A--TA-----A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TTG-G-G--A-C-A--ATT-T----T-TT-T--TT--A-CAA-A-G--A-TATGA-ACGTT
gi|29497                      :                    --CA-A---C-T-C---C-T-CC-T-A-A-G-C-A-A-C-TA-G--C-G--GG--A-T-TTT-G-A--T-A-AA-A--C-T-TT--G-TG-G---A-GT-G--TT--AA---A---C-T-A--CA---T-A-A-T----G-GA------T-A-T-G-T-G-C-AT-A-CTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-A--TT-TT--G-A--A-C-A--A---T----T-TA-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATG
gi|29558                      :                                          C-T-A-A-A-C-G-A-C-TT-G--C-A--GG--A-T-TTT-T-A--T-G-AA-A--C-TATT--A-TG-AT--A-GT-G--TT--AG---A---T-C-A--CA---T-A-A-T----G-GA------G-A-T-G-T-G-C-AT-A-TTG-T-C-A---G-G-AA--TT--T---T-G--TT-TT--G-G--A-C-A--A---G----T-TT-T--GT--A-C-A-A-G--A-TATAG-ACGTTtttgtt


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blockSeqs                     :                          .                        .          . .           .     C   .         .       .  .    .      . .       .   A           .       . .       .      . .     .                  .     .  .            .   .  .    .    .    .                 .          . 
blockSeqs                     :                          .                        .          . .           .     A   .         .       .  .    .      . .       .   T           .       . .       .      . .     .                  .     .  .            .   .  .    .    .    .                 .          . 
blockSeqs                     :                          .                        .          . .           .     A   .         .       .  .    .      . .       .   T           .       . .       .      . .     .                  .     .  .            .   .  .    .    .    .                 .          . 
blockSeqs                     :                          .                        .          . .           .     A   .         .       .  .    .      . .       .   A           .       . .       .      . .     .                  .     .  .            .   .  .    .    .    .                 .          . 
blockSeqs                     :                          .                        .          . .           .     A   .         .       .  .    .      . .       .   T           .       . .       .      . .     .                  .     .  .            .   .  .    .    .    .                 .          . 
blockSeqs                     :                          .                        .          . .           .     A   .         .       .  .    .      . .       .   T           .       . .       .      . .     .                  .     .  .            .   .  .    .    .    .                 .          . 
blockSeqs                     :                          .                        .          . .           .     A   .         .       .  .    .      . .       .   A           .       . .       .      . .     .                  .     .  .            .   .  .    .    .    .                 .          . 
blockSeqs                     :                          .                        .          . .           .     G   .         .       .  .    .      . .       .   A           .       . .       .      . .     .                  .     .  .            .   .  .    .    .    .                 .          . 
blockSeqs                     :                          .                        .          . .           .     T   .         .       .  .    .      . .       .   T           .       . .       .      . .     .                  .     .  .            .   .  .    .    .    .                 .          . 
blockSeqs                     :                          .                        .          . .           .     T   .         .       .  .    .      . .       .   A           .       . .       .      . .     .                  .     .  .            .   .  .    .    .    .                 .          . 
blockSeqs                     :                          .                        .          . .           .     G   .         .       .  .    .      . .       .   A           .       . .       .      . .     .                  .     .  .            .   .  .    .    .    .                 .          . 
blockSeqs                     :                          .                        .          . .           .     T   .         .       .  .    .      . .       .   A           .       . .       .      . .     .                  .     .  .            .   .  .    .    .    .                 .          . 
blockSeqs                     :                          .                        .          . .           .     A   .         .       .  .    .      . .       .   A           .       . .       .      . .     .                  .     .  .            .   .  .    .    .    .                 .          . 
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blockSeqs                     :                          .                        .          . .           .     C   .         .       .  .    .      . .       .   T           .       . .       .      . .     .                  .     .  .            .   .  .    .    .    .                 .          . 
blockSeqs                     :                          .                        .          . .           .     T   .         .       .  .    .      . .       .   A           .       . .       .      . .     .                  .     .  .            .   .  .    .    .    .                 .          . 
blockSeqs                     :                          .                        .          . .           .     T   .         .       .  .    .      . .       .   A           .       . .       .      . .     .                  .     .  .            .   .  .    .    .    .                 .          . 
blockSeqs                     :                          .                        .          . .           .     T   .         .       .  .    .      . .       .   A           .       . .       .      . .     .                  .     .  .            .   .  .    .    .    .                 .          . 
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blockSeqs                     :                          .                        .          . .           .     A   .         .       .  .    .      . .       .   T           .       . .       .      . .     .                  .     .  .            .   .  .    .    .    .                 .          . 
blockSeqs                     :                          .                        .          . .           .     T   .         .       .  .    .      . .       .   A           .       . .       .      . .     .                  .     .  .            .   .  .    .    .    .                 .          . 
blockSeqs                     :                          .                        .          . .           .     A   .         .       .  .    .      . .       .   A           .       . .       .      . .     .                  .     .  .            .   .  .    .    .    .                 .          . 
blockSeqs                     :                          .                        .          . .           .     A   .         .       .  .    .      . .       .   A           .       . .       .      . .     .                  .     .  .            .   .  .    .    .    .                 .          . 
blockSeqs                     :                          .                        .          . .           .     A   .         .       .  .    .      . .       .   A           .       . .       .      . .     .                  .     .  .            .   .  .    .    .    .                 .          . 
blockSeqs                     :                          .                        .          . .           .     A   .         .       .  .    .      . .       .   A           .       . .       .      . .     .                  .     .  .            .   .  .    .    .    .                 .          . 
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blockSeqs                     :                          .                        .          . .           .     T   .         .       .  .    .      . .       .   T           .       . .       .      . .     .                  .     .  .            .   .  .    .    .    .                 .          . 
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blockSeqs                     :                          .                        .          . .           .     A   .         .       .  .    .      . .       .   C           .       . .       .      . .     .                  .     .  .            .   .  .    .    .    .                 .          . 
blockSeqs                     :                          .                        .          . .           .     A   .         .       .  .    .      . .       .   C           .       . .       .      . .     .                  .     .  .            .   .  .    .    .    .                 .          . 
blockSeqs                     :                          .                        .          . .           .     A   .         .       .  .    .      . .       .   T           .       . .       .      . .     .                  .     .  .            .   .  .    .    .    .                 .          . 
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