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gi|101561 : TTTT-TAAAGTCC-G-C--C--GCC-A-AT-T-ACG-A-C-T--A---A-----GC--A-CTAGAG-C-----CGA-TTCA--T-CAAA-TA-T------CCTC------C-A---T------C--------C---A--A--A-----A--ATAAAT-G--T--TG---T-T----G-A--A-GCA-TGG-A-A-T--TT--GG-A--T-A-----C--TCG-A-AC-----CC--CCG-GATA-T-C-T-G--A---AGT-TTT
gi|101562 : TTTT-TAA-GTCC-G-C--C--GCC-A-AT-T-ACC-A-C-C--T---A-----AC--A-C----A-C-----CGA-TTCA--T-CAAA-TA-T------CCTC------C-A---T------C--------C---------A-----A--A-AAAA-A--A--TG---T-T----G-A--A-G-A-TCG-A-A-T--TT--GG-A--T-A--T--T--TCT---AC-----CC--CCG-GATA-T-T-TCG--A---AGT-TTT
gi|101563 : TT-CAA-GTCC-G-C--C--GCC-A-AT-T-ACG-A-C-C--T---A-----AC--A-C----G-C-----GGA-TTCA--T-CAAA-TA-T------CCTC------C-G---T------C--------C---A--A--G-----T--A-AGAA-A--A---G---T-T----G-A--A-G-A-TCG-A-A-T--TT--GG-A--T-A--T--C--TCG-A-AC-----TG--CCC-GATA-T-C-TCG--A---AGT-TTT
gi|101564 : ttaTTCT-TAA-GTCT-AAC--C--GCC-A-AT-T-ATG-A-C-C--T---A-----AC--A-T----G-C-----CGA-TTCA--T-CAAA-TA-T------CCTC------C-G---T------C--------C---A--AGTA-----A--A-GAAA-A--A--TG---T-T----G-A--A-G-A-TGG-A-A-T--TT--GG-A--T-A--T--C--TCA-A-AC-----CC--CCG-GATA-T-C-TCG--A---AGT-TTT
gi|101565 : tTTTT-TAA-GTCC-G-C--C--GCC-A-AT-T-ACG-A-A-A--T---A-----AC--A-C----G-C-----CGA-TTCA--T-CAAA-AT-T------CCTC------C-G---T------C--------T---A--A--AAAT--A--A-AAAA-A--A--TG---T-T----G-A--A-G-A-TCG-A-A-T--TT--GG-A--T-A--T--C--TCA-A-A------CC--CCG-GATA-T-C-TCG--A---AGT-TTT
gi|101566 : tTTTT-TAA-GTCC-G-C--C--GCC-A-AT-T-ACG-A-A-A--T---A-----AC--A-C----G-C-----CGA-TTCAG-T-CAAA-TA-T------CCTC------C-G---T------C--------T---A--A--A-----ATAA-AAAA-A--A--TG---T-T----G-A--A-G-A-TCG-A-A-T--TT--GG-A--T-A--T--C--TCA-A-AC-----CC--CCG-GATG-A-T-TCGA-A---AGT-TTT
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gi|101569 : TTTT-TAA-GTCC-G-C--C--GCC-A-AT-T-ACG-A-C-C--C---A-----AC--A-C----G-C-----CGA-TTCA--T-CACA-AA-T------TCTCGACACCC-G---T------C--------C---A--A--A-----A--A-AAA--------T----T-T----G-A--A-G-A-TGG-A-G-T--TT--GG-A--T-A--T--C--TCG-A-AC-----CC--CCG-GATA-T-C-TCG--A---AGT-TTT
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gi|101571 : tTTTT-TAA-GTCC-G-C--C--GCC-A-AT-T-ACG-A-C-C--T---A-----AC--A-TG---G-C-----CGA-TTCA--T-CACA-AA-TTCTTGACCTC------CGG---T------C--------C---A--A--A-----A--A-AAAA-A--AT-TG---T-TGAAAG-A--A-G-A-TCG-AGG-T--TT--GG-A--T-A--TTCT--TCG-A-A------CC--CCG-GATA-T-CTTCG--A---AGT-TTT
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gi|101574 : TTTT-TAAAGTCC-G-C--C--GCC-A-AT-T-ACA-A-C-C--A---A-----AC--A-C----G-C-----CCA-TTCA--T-CAAA-TA-T------CCTC------C-A---T------C--------C---A--AT-A-----C--A-AAAA-A--A--TG---T-T----G-A--A-G-A-TCG-A-A-T--TT--GG-A--T-A--
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gi|101582 : TTTT-TAA-GTTC-G-C--C--ACC-A-AT-T-ACA-A-C-C--T---A-----AT--G-C----G-C-----TGA-TTC
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gi|101584 : TTTT-GAA-GTCC-G-C--C--GCC-A-AT-TTACC-A-C-C--G---A-----AC--A-C----G-C-----CGA-TTCA--T-CAAA-TA-T------CCTC------C-G---T------C--------C---A--A--AC----A--A-AAAACA--A--TG---T-T----G-A--A-G-A-TCG-A-G-A--TT--GG-A--T-A--T--C--TCGAA-AC-----CC--CCG-GATA-T-C-TCGAAA---AGT-TTT
gi|101585 : TTTT-AAA-GTCC-G-C--C--CCC-A-AT-T-ACC-A-C-C--G---A-----AA--T-C----G-C-----CGA-TTCA--
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gi|101587 : agG-A-C-C--G---A-----AC--A-C----G-T-----TGA-TTAA--T-CAAA-TA-T---------------------------------------------A--A-----A--A-AAAA-A--A--TG---T-T----G-A--A-G-A-TCG-A-A-T--TT--GG-A--T-A--T--C--TCG-A-AC-----CC--CCA-GATA-T-C-TCG--A---AGT-TTT
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gi|101597 : ---T------T--------C---A--A--A-----A--C-AAAATG--A--TA---T-T----G-G--A-A-G-TCA-A-C-T--TC--GG-A--T-A--T--C--TCG-A-AC-----CC--CCA-GATA-T-C-TCG--A---ACT-TTT
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gi|101599 : --A-----A--A-ACAA-A--G--TGATAT-T----G-G--A-A-G-TTA-A-C-T--TC--GG-A--T-A--T--C--TCG-A-GC-----CC--CCG-GATA-T-C-TCG--A---ACT-TTT
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gi|101600 : aattcac-TCG-A-A-T--TCACGG-A--T-A--T--C--TCG-A-AT-----TC--ACG-GATA-T-C-TCG--A---ACT-TTTttcacggatatctcgaactttt
gi|101601 : aattcacggatatc---T-T----G-A--AAG-A-TAG-A-T-T--TT--AG-A--T-A--T--C--TCG-A-AC-----CC--CCG-GATA-T-C-TCG--A---AGT-TTT
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Alignments
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lowQualScore : . . . . .. .. . . . . . . . ...... ..... .. . .... . ..... . .. . . . ...... ...... . ... ...... ........ ...... ........ .. . . ..... ... . .... . .. . . . . . . .. .. . .. . .. .. .. . . ..... .. . . . . .. ... .
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Reference ( family-435 ) : TTTT-TAA-GTCC-G-C--C--GCC-A-AT-T-ACG-A-C-C--T---A-----AC--A-C----G-C-----CGA-TTCA--T-CAAA-TA-T------CCTC------C-G---T------C--------C---A--A--A-----A--A-AAAA-A--A--TG---T-T----G-A--A-G-A-TCG-A-A-T--TT--GG-A--T-A--T--C--TCG-A-AC-----CC--CCG-GATA-T-C-TCG--A---AGT-TTT
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gi|101564 : ttaTTCT-TAA-GTCT-AAC--C--GCC-A-AT-T-ATG-A-C-C--T---A-----AC--A-T----G-C-----CGA-TTCA--T-CAAA-TA-T------CCTC------C-G---T------C--------C---A--AGTA-----A--A-GAAA-A--A--TG---T-T----G-A--A-G-A-TGG-A-A-T--TT--GG-A--T-A--T--C--TCA-A-AC-----CC--CCG-GATA-T-C-TCG--A---AGT-TTT
gi|101565 : tTTTT-TAA-GTCC-G-C--C--GCC-A-AT-T-ACG-A-A-A--T---A-----AC--A-C----G-C-----CGA-TTCA--T-CAAA-AT-T------CCTC------C-G---T------C--------T---A--A--AAAT--A--A-AAAA-A--A--TG---T-T----G-A--A-G-A-TCG-A-A-T--TT--GG-A--T-A--T--C--TCA-A-A------CC--CCG-GATA-T-C-TCG--A---AGT-TTT
gi|101566 : tTTTT-TAA-GTCC-G-C--C--GCC-A-AT-T-ACG-A-A-A--T---A-----AC--A-C----G-C-----CGA-TTCAG-T-CAAA-TA-T------CCTC------C-G---T------C--------T---A--A--A-----ATAA-AAAA-A--A--TG---T-T----G-A--A-G-A-TCG-A-A-T--TT--GG-A--T-A--T--C--TCA-A-AC-----CC--CCG-GATG-A-T-TCGA-A---AGT-TTT
gi|101567 : tTTTT-TAA-GTCC-G-C--C--GCC-A-AT-T-AAT-A-C-C--T---A-----AC--A-C----G-C-----CGA-CTCA--T-CAAA-TT-A------CCTC------C-G---T------C--------C---A--A--ACCAAAA--A-AAAA-AC-A--TG---T-T----G-A--A-G-A-TCA-G-A-T--TT--GG-A--T-A--T--C--TCG-A-AC-----CC--CCG-GATA-T-C-TCG--A---AGT-TTT
gi|101568 : tTTTT-TAAAGTCT-G-C--T--GCC-A-AT-T-AAT-A-C-C--T---A-----AC--A-C----G-C-----TGA-CTCA--T-TAAA-TT-A------CCTC------C-G---T------C--------C---A--A--ACA---A--A-AAAA-A--A--TG---T-T----G-A--A-G-A-TCA-A-A-T--TT--GG-A--T-A--T--C--TCA-A-AC-----CC--CCG-GATA-T-C-TCG--A---AGT-TTT
gi|101569 : TTTT-TAA-GTCC-G-C--C--GCC-A-AT-T-ACG-A-C-C--C---A-----AC--A-C----G-C-----CGA-TTCA--T-CACA-AA-T------TCTCGACACCC-G---T------C--------C---A--A--A-----A--A-AAA--------T----T-T----G-A--A-G-A-TGG-A-G-T--TT--GG-A--T-A--T--C--TCG-A-AC-----CC--CCG-GATA-T-C-TCG--A---AGT-TTT
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gi|101571 : tTTTT-TAA-GTCC-G-C--C--GCC-A-AT-T-ACG-A-C-C--T---A-----AC--A-TG---G-C-----CGA-TTCA--T-CACA-AA-TTCTTGACCTC------CGG---T------C--------C---A--A--A-----A--A-AAAA-A--AT-TG---T-TGAAAG-A--A-G-A-TCG-AGG-T--TT--GG-A--T-A--TTCT--TCG-A-A------CC--CCG-GATA-T-CTTCG--A---AGT-TTT
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gi|101584 : TTTT-GAA-GTCC-G-C--C--GCC-A-AT-TTACC-A-C-C--G---A-----AC--A-C----G-C-----CGA-TTCA--T-CAAA-TA-T------CCTC------C-G---T------C--------C---A--A--AC----A--A-AAAACA--A--TG---T-T----G-A--A-G-A-TCG-A-G-A--TT--GG-A--T-A--T--C--TCGAA-AC-----CC--CCG-GATA-T-C-TCGAAA---AGT-TTT
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gi|101588 : ---A-----AC--A-C----AAC-----CGA-TTCT--C-CAAG-TA-T------CCTC------C-G---T------C--------T---A--A--A-----G--A-ACAA-G--A--TG---T-T----G-A--ATG-A-TCGAA-A-T--TT--GG-A--T-A--T--C--TCA-ACAC-----CC--CC--AATA-TCC-TCG--A---ACT-TTT
gi|101589 : -----CGA-TACA--T-CAAA-TACT------CCCC------C-C---C------C--------C---C--C--A-----A--A-AAAA-A------------------------G-A-TCG-A-T-T--TT--GT-A--T-A--T--C--TCT-A-ACACCAGTC--CCG-GATA-T-C-TCG--A---AGT-TTT
gi|101590 : GA-TACA--T-CAAA-TA-T------CCTC------C-G---T------T--------C---A--A--T-----A--A-A----------TG---T-T----C-A--A-G-A-TTG-A---T--CTCGGG-A--T-A--T--C--TCG-A-TC-----CC--CCG-GATA-T-C-TCG--A---AGT-TTT
gi|101591 : GA-TGCA--T-CAAA-TA-T------CCTC------T-G---T------T---------------------------A-AAAA-A--A--TG---T-T----C-C--A-G-A-TCG-A-T-T--TT--GG-A--T-A--T--C--TCA-A-AC-----CC--ACG-AATA-T-T-TC
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gi|101595 : TCA--T-CAAA-TT-A------CCTC------C-G---T------C--------C---A--A--A-----C--A-AAAA-ATCA--TG---T-T----G-A--A-A-A-TCA-A-A-T--CT--GG-A--T-A--T--C--TCG-A-AC-----CC--CCG-GATA-T-C-TCG--A---AGT-TTT
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gi|101601 : aattcacggatatc---T-T----G-A--AAG-A-TAG-A-T-T--TT--AG-A--T-A--T--C--TCG-A-AC-----CC--CCG-GATA-T-C-TCG--A---AGT-TTT
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Reference ( family-435 ) : TTTT-TAA-GTCC-G-C--C--GCC-A-AT-T-ACG-A-C-C--T---A-----AC--A-C----G-C-----CGA-TTCA--T-CAAA-TA-T------CCTC------C-G---T------C--------C---A--A--A-----A--A-AAAA-A--A--TG---T-T----G-A--A-G-A-TCG-A-A-T--TT--GG-A--T-A--T--C--TCG-A-AC-----CC--CCG-GATA-T-C-TCG--A---AGT-TTT
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gi|101584 : TTTT-GAA-GTCC-G-C--C--GCC-A-AT-TTACC-A-C-C--G---A-----AC--A-C----G-C-----CGA-TTCA--T-CAAA-TA-T------CCTC------C-G---T------C--------C---A--A--AC----A--A-AAAACA--A--TG---T-T----G-A--A-G-A-TCG-A-G-A--TT--GG-A--T-A--T--C--TCGAA-AC-----CC--CCG-GATA-T-C-TCGAAA---AGT-TTT
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gi|101586 : A-GTCC-G-C--C--GAC-A-AT-T-ACG-G-C-C--T---A-----AA--A-C----A-C-----CGA-TTCA--T-CAAA-TA-T------CCTC------C-G---T------C---------------A--A-----A--A-AAAA-A--A--TG---T-T----G-A--A-G-A-TAG-A-A-T--TT--GG-A--T-A--A--C--TTG-A-AC-----TC--CCG-GATA-T-C-TCG--A---AGT-TTT
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gi|101588 : ---A-----AC--A-C----AAC-----CGA-TTCT--C-CAAG-TA-T------CCTC------C-G---T------C--------T---A--A--A-----G--A-ACAA-G--A--TG---T-T----G-A--ATG-A-TCGAA-A-T--TT--GG-A--T-A--T--C--TCA-ACAC-----CC--CC--AATA-TCC-TCG--A---ACT-TTT
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gi|101592 : GA-TGCA--TTCAAA-TA-T------CCTC------T-G---T----------------------------------A-AAAA-A--A--TG---T-T----C-C--A-G-A-TCG-A-T-T--TT--GG-A--T-A--T--C--TCA-A-AC-----CC--ACG-AATA-T-T-TC
gi|101593 : A-TTTA--A-TAAT-TA-T------CCTT------C-G---T------C--------C---A--A--A-----A--A-A-----------------------------G-A-TTG-A-A-T--TT--GG-A--T-A--T--C--TCG-A-AC-----AC--CCG-GATA-T-C-TCG--A---AGT-TTT
gi|101594 : -TTCA--G-CTAA-TA-T------CCTC------C-G---T------C--------C---A--A--A-----A--A-AGAA-A-----TG---T-T----G-A--A-G-A-TCG-A-A-T--TT--GG-A--T-A--T--C--TCG-A-AC-----CC--CTG-CATA-T-C-ACG--A---AGT-TTT
gi|101595 : TCA--T-CAAA-TT-A------CCTC------C-G---T------C--------C---A--A--A-----C--A-AAAA-ATCA--TG---T-T----G-A--A-A-A-TCA-A-A-T--CT--GG-A--T-A--T--C--TCG-A-AC-----CC--CCG-GATA-T-C-TCG--A---AGT-TTT
gi|101596 : -TA-T------CGCC------C-G---T------C--------CAAAA--A--A-----A--A-AAAA-A--A--CG---T-T----GAA--A-G-ACTCG-A-A-T--TT--GG-AC-T-A--C--CCTTCG-A-AC-----CCAGCCG-ATCA-TGC-TCG--
gi|101597 : ---T------T--------C---A--A--A-----A--C-AAAATG--A--TA---T-T----G-G--A-A-G-TCA-A-C-T--TC--GG-A--T-A--T--C--TCG-A-AC-----CC--CCA-GATA-T-C-TCG--A---ACT-TTT
gi|101598 : --A--A-----A--A-AAAA-ATTA--TA---T-TTG--G-A--A-G---TCA-A-C-TA-TC--GG-A--T-A--T--C--TCG-A-AC-----CC--CCG-GATA-TGC-TCG--A---ACT-TTT
gi|101599 : --A-----A--A-ACAA-A--G--TGATAT-T----G-G--A-A-G-TTA-A-C-T--TC--GG-A--T-A--T--C--TCG-A-GC-----CC--CCG-GATA-T-C-TCG--A---ACT-TTT
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gi|101600 : aattcac-TCG-A-A-T--TCACGG-A--T-A--T--C--TCG-A-AT-----TC--ACG-GATA-T-C-TCG--A---ACT-TTTttcacggatatctcgaactttt
gi|101601 : aattcacggatatc---T-T----G-A--AAG-A-TAG-A-T-T--TT--AG-A--T-A--T--C--TCG-A-AC-----CC--CCG-GATA-T-C-TCG--A---AGT-TTT
gi|101602 : a---T-T----G-G--A-A-G-TTA-A-C-T--TC--GG-A--T-A--T--C--TCG-A-AC-----CC--CCG-GATA-T-C-TCG--A---ACT-TTT
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gi|101604 : gatt-T----G-A--A-G-A-TCG-A-A-T--TG--GG-A--T-A--T--C--TCG-A-AC-----CC--CCG-GATA-T-C-TCG--A---AGT-TTT
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