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Reference ( gi|64639 )        :                              CAATCG-G--AT-C--A--C-G-CT-C-GT---C--A-AT------TT-CCG-TAA--C----C--G-GT-----AAA--TA--GA---C-TC-G-G--AC---G-TG-G-A--T-C-GGC-G-C----A---A-GAA-T-TGC--AT---CA--A-------A-TC----GA---TGCATT-----T-T------TT-CG-C-C---GGAA---GC--GCGC-ATG-T-----G-G-AT----GAC-GTTAA--AA---GGCT--A-G-AAC-CG-AA--TCC-CT-----A-T--AA-A---AT-GT--AT-T-A-------T-TTA-----GA-A--------------G---T-A-----TG-A-TT-A-TG--TTTGA-CT-A-TA-T-ATA-T-AG--TTTTG-ATACC--A-TTAA--AGT--C-TTTTT-CACTC-AAC--TGCAT-AA-AC-AT-ATG-CATG-TATAAA-TTG-ATATT
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gi|64659                      :                              CAATCG-G--AT-C--A--C-G-CT-C-GT---C--A-AT------TT-CCG-TAA--C----C--G-GT-----
gi|64661                      :                              CAATCG-GCAAT-C---------CT-C-GG---C--T-AA------CT-CCG-TTA--CGCT-C--C-GT-----A----TA--AA---CCTC-G-G--AT---G-TG-A-A--T---GGT-G-T----A---G-GGA-TATGC--AT---CG--A-------T-TT----GA---TACATT-----T-C------TC-CG-C-C---GGAA---G
gi|64664                      :                              CAATCG-G--AT-C--A--C-G-CT-C-GT---C--A-TT------TT-CCG-TAA--C----C--G-GTTACGGAAA--TA--G
gi|64664                      :                              CAATCG-T--A-----A--CTA-CT-C-GG---C--T-AT------TT-CCG-TAA--C----C--G-GT-----ccgagtagttacgattgcatatgcatctt
gi|64662                      : caatcggatcacgctcgtcattttccgtaCAATCA-G--AT-C--A--C-G-CT-C-GT---T--A-TT------TC-CCG-TAA--C----C--G-AA-----AAG--AA--AA---C-TC-G-G--AC---A-TG-catatgcatctt
gi|64665                      :                              CAATCG-G--AT-C--AGAC-G-CT-C-GT---C--A-AT------TT-CCG-TAA--C----C--G-GT-----caatagg
gi|64666                      :                              CAATCG-GCAAT-C---------CT-C-GG---C--T-AA------CT-CCG-CTA--CGCCTC--C-GT-----A----TA--CA---CCTC-G-G--AT---G-TG-A-A--T---GGT-G-T----A---G-GGA-TATGC--AT---CG--A-------T-TT----GA---TACATT-----T-C------TC-CG-C-C---GGAA---G
gi|64663                      :                              CAATCG-T--AC-C-----T-A-CT-C-GG---C--A-AT------TT-CCG-TAA--C----C----GC-----AAA--TG--AAC--C-TC-G-T--AC---G-TA-G-A--T-C-GAC-G-C------------------C--AT---CA--A-------A-
gi|64667                      :                              CAATCG-G--AT-C--A--C-GGCT-C-GT---C--A-AT------TT-CCG-TAA--C----T--G-GT-----
gi|64668                      :                              CAATCG-GCAAT-C---------CT-C-GG---C--T-AA------CT-CCGCTAA--CGCT-C--C-GT-----ATA--C--------C-TC-G-G--AT---G-TG-A-A--T---GGT-G-T----A---G-GGA-TATTC--AT---CG--A-------T-TT----GA---TACATT-----T-C------TC-CG-C-C---GGAA---G
gi|64669                      :                              CAATCG-G--AT-C--A--C-G-CT-C-GT---C--A-AT------TT-CGG-TAA--A----C--G-GT-----
gi|64670                      :                              CAATCG-A--AT-C--A--C-G-CT-C-GT---C--A-TT------TT-CCG-TAT--C----C--G-GTTACGGAAA--TA--AA---C-
gi|64671                      :                              CAATCG-G--AT-C--A--T-G-CT-C-GT---C--A-TT------TA-CCG-TAA--C----C--G-GTTACGGAAA--TA--G
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gi|64673                      :                              CAATCG-G--AT-C--A--C-G-CT-C-GT---C--A-TT------TT-CCG-TAA--C----C--
gi|64674                      :                              CAATCG-G--AT-C--A--C-A-CT-C-GT---C--A-AT------TT-CCG-TAA--
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gi|64677                      :                               AATCA-G--AT-C--A--T-G-CT-C-GT---T--C-TT------CT-CTG-TAA--C----T--A-GA-----AAG--AA--AA---C-TC-G-G--AC---A-TA-G-A--A-C-AGC-A-C----A---A-GAA-T-TGC--AT---CA--A-------A-TC----AA---TACATT-----
gi|64676                      :                               AATCG-GC-AT-C-----C-G--T-C-GT------G-TT------TT-CCG-TAA--C----CTTG-GA-----AAG--TA--GA---C-TC-G-G--ACTTTT-TG------T-C-GGCTG-CCAATA---G-GAAGT-GGC--ACTCACA--A-------A-TCCTGTGAGTTTGAAGC-----T-T------AC-CGTC-C---GGAA---GC--GCGC-GTG-T-----G-G-AT----
gi|64679                      :                                ATCG----AT-C--A--C-G-CT-C-GT---C--AGAT------TT-CCG-TAA--C----C--G-GA-----AAG--TA--GA---C-TT-G-G--AC---G-T--G-A--T-C--GC-G-C----A---A-GAA-T-TGCATAT---CA--A-------AGTC----GA---TGCA-T-----T-T------TT-CG-C-C---GGAA---AC--GCGC-ATG-T-----G-G-AT----GAC--TTAA--AA---GGCT--A-GAAAC-CG-AA--T-C-CT-----G-T--AA-A---ATAAA--AT-T-AT------T-TTA-----GA-A--------------G---T-A-----GG-G-TT-G-TG---GTGA-C--A-TA-T-TTA-------TTTTG-ATACCCAG-TTAAT-AGT--A--TTTT-CACTC-AAA--TGCAT-AA-ACAAT-ATA-CAT
gi|64678                      :                                ATAG-G--AT-C--A--C-G-CT-CTGG---C--A-AT------T--CTG-TAA--C-------G-AA-----AGG--TA--GAA--C-GC-G-G--AT---G-TG---A--T-T-GGC-G-C----A---AAGAA-T-TGC--AT---CA--A-------A-TCA---GT---TGCATT-----T-A------TC-CG-C-C---AGAA---AC--GCGC-ATG-T-----G---AT----GAC-GTTAA--A-----GCT--A-G-AACTCG-AA--GCC-TT-----G-T--TA-A---AT-GTCAAT-T-A-------T-T-A-----GA-A--------------G---T-A-----TGGA-TT-GGTG--TTTGA-AC-A-TA-TTATT-T-AGC-TTTTG-A-ACC--A-TTAA--AGT--C--TTTT-CACTCAAAC--TGCAT-AA-A--AT-ATG-CAAGTTAT-AA-TTG-AAATT
gi|64680                      :                                 TCG-G--AT-C--AA-C-G-CT-C-GTA--C--A-AT------TT-CCG-TAA--C----C--G--------AAG--TA--GA---C-TC-G-G--CC---G-TG-G-A--T-C-GGC-G-CA---A---A-GAA-T-GGC--AT---CA--C-------A-TC----GA---TGCATT-----TAA------TC-CGTC-C---GGAA---GC--GCGC-ATG-T-----G----T----GCC-------------------------C-TG-----TCT-C------------A-A---AT-GT--AT-T-A---------ATA-----GA-A--------------T---T-A-----TG-AGTTGG-TGC-TTCGA----A-T--------------TTCTG-ATACC--A-TT-A--AGT--C-TTTTT-CACTC-AA---TGCAT-AACAC-AT-ATG-CAAG-TATAAA-
gi|64681                      :                                                                             T-CCG-TA--------------T-----AAA--C--------C-TC-G-G--AT---G-TG-A-A--T---GGT-G-T----A---G-GGA-TATGC--AT---CG--A-------A-TT----GA---TACATT-----T-C------TC-CG-C-C---GGAA---G
gi|64682                      :                                                                                                                    ---C-TC-G-G--AT---G-TG-A-A--T---GGT-G-T----A---G-GAA-TATGC--AT---CG--A-------T-TT----GA---TACATT-----T-C------TC-CG-C-C---GGAA---G
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gi|64661                      :                                                                                                                                                 -C-GGC-G------G---A-GAA-A-TGT--AT---CA--A-------A-TC----GA---TGCAT
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Reference ( family-429 )      :                              CAATCG-G--AT-C--A--C-G-CT-C-GT---C--A-AT------TT-CCG-TAA--C----C--GGTAAGT-A--GA---C-TC-G-G--AC---G-TG-G-A--T-C-GGC-G-C----A---A-GAA-T-TGC--AT---CA--A-------A-TC----GA---TGCATT-----T-NTC------C--G-C-C---GGAA---GC--GCGC-AT-G-T-----GG-AT----GAC-GTTAA--AA---GGCT--A-G-AAC-CG-AA--TCCCT-G--T--A-A-----A---AT-GT--AT-T-A-------T-TTAGA-A--------------G---T-A-----TG-A-----TT-A-TG--TTTGA-CC-A-TA-T-ATNTAG--TTTTG-ATACC--A-TTAA--AGT--C-TTTTT-CACTC-AAC--TGCAT-AA-AC-AT-ATG-CANG-TATA-AA-TTG-ATATT
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gi|64658                      :                              CAATCG-G--AT-C--A--C-G-CT-C-GT---C--A-AT------TT-CCG-TAA--C----C--GGTAAAT-
gi|64659                      :                              CAATCG-G--AT-C--A--C-G-CT-C-GT---C--A-AT------TT-CCG-TAA--C----C--GGTtttcggttacgggaatagccg
gi|64660                      :                              CAATCG-G--AT-C--A--C-G-CT-C-GT---C--A-AT------TT-CCG-TAA--C----C--GGT
gi|64661                      :                              CAATCG-GCAAT-C---------CT-C-GG---C--T-AA------CT-CCG-TTA--CGCT-C--CGTA--T-A--AA---CCTC-G-G--AT---G-TG-A-A--T---GGT-G-T----A---G-GGA-TATGC--AT---CG--A-------T-TT----GA---TACATT-----T-CTC------C--G-C-C---GGAA---G
gi|64662                      :                              CAATCA-G--AT-C--A--C-G-CT-C-GT---T--A-TT------TC-CCG-TAA--C----C--GAAAAGA-A--AA---C-TC-G-G--AC---A-TG-
gi|64663                      :                              CAATCG-T--AC-C-----T-A-CT-C-GG---C--A-AT------TT-CCG-TAA--C----C---GCAAAT-G--AAC--C-TC-G-T--AC---G-TA-G-A--T-C-GAC-G-C------------------C--AT---CA--A-------A-caatagg
gi|64664                      :                              CAATCG-G--AT-C--A--C-G-CT-C-GT---C--A-TT------TT-CCG-TAA--C----C--GGT
gi|64664                      :                              CAATCG-T--A-----A--CTA-CT-C-GG---C--T-AT------TT-CCG-TAA--C----C--GGTtacggaaatagccgagtagttacgattgcatatgcatctt
gi|64665                      : caatcggatcacgctcgtcattttccgtaCAATCG-G--AT-C--AGAC-G-CT-C-GT---C--A-AT------TT-CCG-TAA--C----C--GGTcatatgcatctt
gi|64666                      :                              CAATCG-GCAAT-C---------CT-C-GG---C--T-AA------CT-CCG-CTA--CGCCTC--CGTA--T-A--CA---CCTC-G-G--AT---G-TG-A-A--T---GGT-G-T----A---G-GGA-TATGC--AT---CG--A-------T-TT----GA---TACATT-----T-CTC------C--G-C-C---GGAA---G
gi|64667                      :                              CAATCG-G--AT-C--A--C-GGCT-C-GT---C--A-AT------TT-CCG-TAA--C----T--GGT
gi|64668                      :                              CAATCG-GCAAT-C---------CT-C-GG---C--T-AA------CT-CCGCTAA--C-------GCTCCGT-A--TA---CCTC-G-G--AT---G-TG-A-A--T---GGT-G-T----A---G-GGA-TATTC--AT---CG--A-------T-TT----GA---TACATT-----T-CTC------C--G-C-C---GGAA---G
gi|64669                      :                              CAATCG-G--AT-C--A--C-G-CT-C-GT---C--A-AT------TT-CGG-TAA--A----C--GGT
gi|64670                      :                              CAATCG-A--AT-C--A--C-G-CT-C-GT---C--A-TT------TT-CCG-TAT--C----C--GGT
gi|64671                      :                              CAATCG-G--AT-C--A--T-G-CT-C-GT---C--A-TT------TA-CCG-TAA--C----C--GGTtacggaaataaac
gi|64672                      :                              CAATCG-G--AT-C--A--T-G-CT-C-GT---C--A-TT------TT-CCG-TAA--C----T--GGTtacggaaatag
gi|64673                      :                              CAATCG-G--AT-C--A--C-G-CT-C-GT---C--A-TT------TT-CCG-TAA--C----C--
gi|64674                      :                              CAATCG-G--AT-C--A--C-A-CT-C-GT---C--A-AT------TT-CCG-TAA--
gi|64675                      :                              CAATCG-G--ATTC--A--C-G-CTTC-GT---C--A-AT------TTTCCG-TAA--C----C--GGT
gi|64676                      :                               AATCG-GC-AT-C-----C-G--T-C-GT------G-TT------TT-CCG-TAA--C----CTTGGAAAGT-A--GA---C-TC-G-G--ACTTTT-TG------T-C-GGCTG-CCAATA---G-GAAGT-GGC--ACTCACA--A-------A-TCCTGTGAGTTTGAAGC-----T-TAC------C--GTC-C---GGAA---GC--GCGC-GT-G-T-----GG-AT----
gi|64677                      :                               AATCA-G--AT-C--A--T-G-CT-C-GT---T--C-TT------CT-CTG-TAA--C----T--AGAAAGA-A--AA---C-TC-G-G--AC---A-TA-G-A--A-C-AGC-A-C----A---A-GAA-T-TGC--AT---CA--A-------A-TC----AA---TACATT-----
gi|64678                      :                                ATAG-G--AT-C--A--C-G-CT-CTGG---C--A-AT------T--CTG-TAA--C-------GAAAGGT-A--GAA--C-GC-G-G--AT---G-TG---A--T-T-GGC-G-C----A---AAGAA-T-TGC--AT---CA--A-------A-TCA---GT---TGCATT-----T-ATC------C--G-C-C---AGAA---AC--GCGC-AT-G-T-----G--AT----GAC-GTTAA--A-----GCT--A-G-AACTCG-AA--GCCTT-G--T--T-A-----A---AT-GTCAAT-T-A-------T-T-AGA-A--------------G---T-A-----TGGA-----TT-GGTG--TTTGA-AC-A-TA-TTATTTAGC-TTTTG-A-ACC--A-TTAA--AGT--C--TTTT-CACTCAAAC--TGCAT-AA-A--AT-ATG-CAAG-T-TATAA-TTG-AAATT
gi|64679                      :                                ATCG----AT-C--A--C-G-CT-C-GT---C--AGAT------TT-CCG-TAA--C----C--GGAAAGT-A--GA---C-TT-G-G--AC---G-T--G-A--T-C--GC-G-C----A---A-GAA-T-TGCATAT---CA--A-------AGTC----GA---TGCATT-----T-TT-------C--G-C-C---GGAA---AC--GCGC-AT-G-T-----GG-AT----GAC--TTAA--AA---GGCT--A-GAAAC-CG-AA--T-CCT-G--T--A-A-----A---ATAAA--AT-T-AT------T-TTAGA-A--------------G---T-A-----GG-G-----TT-G-TG---GTGA-C-----A-T-ATTTA---TTTTG-ATACCCAG-TTAAT-AGT--A--TTTT-CACTC-AAA--TGCAT-AA-ACAAT-ATA-CA
gi|64680                      :                                 TCG-G--AT-C--AA-C-G-CT-C-GTA--C--A-AT------TT-CCG-TAA--C----C--G--AAGT-A--GA---C-TC-G-G--CC---G-TG-G-A--T-C-GGC-G-CA---A---A-GAA-T-GGC--AT---CA--C-------A-TC----GA---TGCATT-----TAATC------C--GTC-C---GGAA---GC--GCGC-AT-G-T-----G---T----G-------------------------------------CCCT-GTCT--C-A-----A---AT-GT--AT-T-A---------ATAGA-A--------------T---T-A-----TG-AG----TTGG-TGC-TTCGA----A-T------------TTCTG-ATACC--A-TT-A--AGT--C-TTTTT-CACTC-AA---TGCAT-AACAC-AT-ATG-CAAG-TATA-AA-t
gi|64681                      :                                                                                                             ---C-TC-G-G--AT---G-TG-A-A--T---GGT-G-T----A---G-GGA-TATGC--AT---CG--A-------A-TT----GA---TACATT-----T-CTC------C--G-C-C---GGAA---G
gi|64682                      :                                                                                                  tccgtataaac---C-TC-G-G--AT---G-TG-A-A--T---GGT-G-T----A---G-GAA-TATGC--AT---CG--A-------T-TT----GA---TACATT-----T-CTC------C--G-C-C---GGAA---G
gi|64683                      :                                                                                                             ---C-TC-G-G--AT---G-TG-G-A--A-T-GGT-G-T----A---G-GGA-TATGC--AT---CG--A-------T-TTT---GA---TACATT-----T-CTC------C--G-C-C---GGAA---G
gi|64684                      :                                                                                                                                                                       --AT---TG--A-------G-TC----GA---TGCAAT-----T-ATT------T--A-C-T---TTAT---GC--ACGA-AT-G-TACTGTGG-AT----GAA-GTTAG--AA---GGCC--T-G-AAC-TG-AG--TCCCT-G--T----A-----A---AT-GT--GT-T-A-------TATT-------------------C---T-A------G-A-----TTCA-T---TTTCA-TA-A-TA-T-ATTGGG--TTGT--ATATG--A-TTAA--A
gi|64685                      :                                                                                                                                                                           ---CA--A-------A-TC----GA---TGCATT-----T-TTTTTTTTTC--G-C-C---GGAA---GC--GCGC-AT-G-T-----GG-AT----GACGGTTAA--AA---GGCT--A---AAC-CG-AA--TCCCTAA--T--A-A-----ACCTAT-TT--AT-T-A-------T-TTAGA-A--------------G---TAA-----TG-A------T-A-T---TTTGA-CT-ATTA-T-ATATAG--TTTTG-ATACA--A-TTAA--AGTCCC-TTTTT-CACTC-AAC--TGCATAAA-AC-AT-ATG-CTGA-TATA-AA-TTGAATATT
gi|64686                      :                                                                                                                                                                                                         CATT-----T-ATC------C--G-C-C---GGAA---GC--GCGC-AT-G-T-----GG-AT----G-------------------------------------CCCT-G--T--C-A-----A---AT-GT--AT-T-A-------T-TTAGA-A--------------T---T-A-----TG-A-----TT-G-TG--CTTGA-CN-N-NN-N-NNNNNN--NNNNN-NNNNN--N-NNNA--AATAAC-TTT
gi|64687                      :                                                                                                                                                                                                                                                      C-AT-G-T-----GG-AT----GCA-GTTAG--AA---GGCT--A-G-AAC-TG-AA--TCCCT-G--T--A-T-----A---AT-GT--GT-T-A-----------AGA-ACC------------G---T-A-----T
gi|64688                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                --A-G-AAC-CA-AA--TCCCT-G--T--A-T-----A---AT-GT--GT-T-A-------T-TAAGA-A--------------G---C-A-----AG-A-----TT-AATA--TTC-A-CC-A-CA-G-ATTCAG--TTTTG-GTATC--A-TTAA--AGT--C-TT