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lowQualScore                  :      11     1 1 11  8888 1  2   222 1 1  33 2222  222 44444 11  44 333 8888     666   1 1 2  1    999999999999999999    1  3333333   55555555  2 1 1  1   3 33 11 2 2 11  1 1 1   333  11 777      1 44 333  11 1  1   88   44444444444 55555   11 1 1  999999999999999999 2 333333 222 1  555555 4444444 1 222   6  11 11 11 22  0 1 1 1  999999  1   1  2  1  6666  4444444   4444 1  1  444  1 1  33333333333  1 9999999999999999  222 1 33  333333 2  2 2  888 1  2 555555555555555  55555 1 33 88888   44444 2222 1 666666666 2222 1 33  1  1  22 222 3333   44 333  1 1 1 777777 1 66 3 1    1 3   1 3 1 1  22     22   777777 1 1   22  1 1 1 333  22 0000000 333 1  3 1 22     88888   3333333333333333  2  2 22 3 333 2 2    2 555  333      2 22  2  1 555 7 2  1   00000 1 22   1 22   3 777777777777777777777777 1  1  3   222  1  888 44 666 5555 222 22     1  1 5 1 1 1 00000000   3333    22 99999999999999 1 22 333 5   3 22    7777   66666  777   1        44  2    
lowQualScore                  :      ..     . . ..  .... .  .   ... . .  .. ....  ... ..... ..  .. ... ....     ...   . . .  .    ..................    .  .......   ........  . . .  .   . .. .. . . ..  . . .   ...  .. ...      . .. ...  .. .  .   ..   ........... .....   .. . .  .................. . ...... ... .  ...... ....... . ...   .  .. .. .. ..  . . . .  ......  .   .  .  .  ....  .......   .... .  .  ...  . .  ...........  . ................  ... . ..  ...... .  . .  ... .  . ...............  ..... . .. .....   ..... .... . ......... .... . ..  .  .  .. ... ....   .. ...  . . . ...... . .. . .    . .   . . . .  ..     ..   ...... . .   ..  . . . ...  .. ....... ... .  . . ..     .....   ................  .  . .. . ... . .    . ...  ...      . ..  .  . ... . .  .   ..... . ..   . ..   . ........................ .  .  .   ...  .  ... .. ... .... ... ..     .  . . . . . ........   ....    .. .............. . .. ... .   . ..    ....   .....  ...   .        ..  .    
lowQualScore                  :      77     2 2 77  4444 2  5   222 2 2  00 7777  222 44444 77  22 444 8888     444   2 2 5  2    222222222222222222    2  9999999   66666666  4 2 2  2   8 00 77 4 5 77  2 2 2   444  77 222      2 00 222  88 3  3   22   99999999999 00000   88 3 3  555555555555555555 6 777777 333 3  000000 2222222 3 333   9  99 99 99 33  2 4 4 4  777777  4   4  8  4  2222  5555555   8888 4  4  555  4 4  44444444444  4 1111111111111111  444 4 33  666666 8  8 8  444 4  8 333333333333333  66666 4 44 33333   77777 8888 3 777777777 8888 4 33  4  4  11 777 5555   11 222  8 8 8 777777 9 33 8 9    9 6   8 8 8 8  44     55   222222 8 9   88  9 9 9 333  66 2222222 333 9  8 9 66     88888   7777777777777777  0  0 88 3 555 0 0    1 000  777      1 99  1  9 222 4 5  7   55555 7 44   7 44   5 111111111111111111111111 7  7  5   999  7  111 00 999 0000 999 33     7  7 0 7 7 7 44444444   5555    33 33333333333333 8 55 222 1   6 55    1111   44444  999   8        55  0    
consensus                     : TACAG--TCAAC-T-C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC---T-----T--TT--G---T-T--CTTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------GTTA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-ATT---TC--C-G-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--AGT--------T--C-T---GCC--A-T-TT------------------T-G------T---A-GA------A-------A-A---AGAGTT--A--C--C-GCTGT-T-T-TC------CA-TGT-TT-GC-TT----AT-------ATA----A-TT-CA-T-GT-A-AA-----------TA-T----------------TT---T-C--TG--TN--A-TA-A-AT---T-TA-T--------T------TT---A-A-A--A--TT-TTT-----T----A-A---------C----A-T--GA-TT-AT--T---T--G-TTT--A---AA-C-A-T------C-AC-A-A-AATC-C-TTT-C-C-T-TT--TTATC--TTC-G-A--A-A-CTCN-AA-A-G-A---AC--T-------C---T-CT-T-T-CGTGGC--T--AAG---CC--------G--TA-CC-T--AAA---C-T-GAAA-CGG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-T---AAAAAT-AACAC--GA-C--TAC-A--TCT-C----A----T-AT---T-AAGTC-T-TT-TC-TTG---TT-TA---C--T---T----A---A--CACAG-TA-A-T-T-A-C----C-G-GGG----TCTT--TC-G-C---------A-C--A---GGTGG-A--CACC-G--GAG-----AT--CGAT-AATGACCA--AT-TTAC
Reference ( gi|56103 )        : TACAG--TCAAC-T-C--TC---AA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC---T-----T--TT--G---T-C--CTTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------ATTA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-ATT---TC--C-A-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--AGT--------T--C-T---GCC--A-T-TT------------------T-G------T---A-GA------A-------A-A---AGAATT--A--C--C-GCTGT-T-T-TC------CA-TGT-TT-GC-TT----AT-------ATA----A-TT-CA-G-GT-A-AA-----------TA-T----------------TT---T-C--TG--TT--A-TA-A-AT---T-TA-T--------A------TT---A-A-A--A--TT-TTT-----T----A-A---------C----A-T--GA-TT-AT--T---T--G-TTT--A---AA-C-A-T------C-AT-A-A-AATC-C-TTT-C-C-T-TT--TTATC--TTC-A-A--A-A-CTCT-AA-A-G-A---AC--T-------C---T-CT-T-T-TGTGGC--C--AAG---TC--------G--TA-CC-T--ACA---C-T-GAAA-CGG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-T---ACAGAT-AACAG--GA-C--TAC-A--TCT-C----A----C-AT---T-AAATC-T-TT-TC-TTG---TT-TA---C--T---T----A---A--CACAG-TA-A-T-T-A-C----T-G-GGG----TCTT--T----C---------A-C--A---GTTGG-A--CACC-A--GAG-----AT--AGAT-AATGACCA--AT-TTAC
gi|56105                      : TAC-G--TCAAC-T-C--TC---GA-TA-A-----C-G-CC--A----CC---T-----T--TT--G---T-T--CTTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------ATTA-TA-------A-G--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-ATT---TC--C-G-C-ATTT-T--G---AA--G-AA-AAA---GT--------T--C-T---TCC--A-T-TT------------------T-G------T---A-GA------A-------A-A---AGAGTT--A--C--C-GTTGT-T-T-TC------CA-TGT-TT-GC-TT----AT-------GTA----A-TT-CA-T-GT-A-AA-----------TA-T----------------TT---T-C--TG--TA--A-TG-A-AT---AATA-T--------T------TT---A-A-G--A--TT-TTT-----T----A-A---------C----A-T--GA-TT-AT--T---T--G-TTT--A---AA-C-A-T------C-AC-A-A-AATC-C-TTT-C-C-T-TT--TTATC--TTC-G-A--A-A-CTCT-AA-A-G-A---AC--T-------C---C-CT-T-T-TGTGGC--C--AAG---AC--------G--TA-CC-T--ACA---C-T-GAAA-CAG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-T---ACAGAT-AA-AC--GA-C--CAC-A--TCT-C----A----T-AG---T-AAGTC-T-TT-TC-TTG---TT-TA---C--C---T----A---A--CACAG-TA-A-T-T-A-C----T-G-GGG----TCTT--TCAG-C---------A-C--A---GGTGGAA--CA-T-G--GAG-----AT--TGAT-AATGACCA--AT-TTAC
gi|56104                      : TACAG--TCAAC-T-C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC---T-----T--TT--G---T-T--CTTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------ATTA-T--------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-C--TT-G-A-ATT---TC--C-C-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--AGT--------T--C-T---GCC--A-T-TT------------------T-G------T---A-GA------A-------A-A---AGAGTT--A--C--C-ATTAT-T-T-TC------CA-TGT-TT-GC-TG----AT-------ATA----A-TT-CA-T-GT-A-CA-----------TA-T----------------TT---T-C--TG--CA--A-TA-A-AT---T-CA-T---------------TT---A-A-A--A--CA-TTT-----T----A-A---------C----A-T--GA-TT-AT--T---T--G-TTT--A---AA-A-A-T------C-AC-A-A-AATC-C-TTT-A-C-T-TT--TTATC--TTC-A-A--A-A-CTCT-AG-A-G-A---AC--T-------C---T-CT-T-T---------A--AAG---TCTCTCTAAAG--TA-CC-T--AAA---C-T-GAAA-CGG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-T---ACAGAT-AACGC--GA-C--TAC-A--TCT-C----A----T-AT---T-ACATC-T-TT-TC-TTG---TT-TA---C--T---T----A---A--CACAG-TA-A-T-T-A-C----T-G-GGG----TCTC--CCAG-C---------A-T--A---GGTGG-A--CACT-G--GAG-----AT--CGAT-AATGACCA--ATATTA
gi|56106                      : TACAG--TCAAA-T-C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC---T-----T--TT--G---T-T--CTTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------GTTA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-ATT---TC--C-G-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--AGT--------T--T-G---GCC--A-T-TT------------------T-A------T---A-GA------A-------A-A---AGAGTT--G--C--C-GCTGT-T-T-TC------CG-TGT-TT-GT-TT----AT-------ATA----A-TT-CA-T-AT-A-AA-----------TA-T----------------TT---T-CT-TG--TA--A-TA-ATTT---T-TT-T--------A------TT---T-A-A--A---T-TTT-----C----A-A---------C----A-T--GA-TT-AT--T---T--C-TTT--A---AA-C-A-T------C-AC-A-A-AATC-CTTTT-C-C-T-TT--TTATC--TTT-A-GC-A-A-CTCA-AA-A-A-A---AC--T-------C---T-CA-T-C-CGTTGC--T--AAG---CC--------A--TA-CC-T--AAA---C-T-GAAA-CAT-GT---TTTCTA-T--AA-TG-T---AAAAAT-AAC-G--CA-C--TAC-A--TCT-C----A----T-AT---T-AAGTA-T-TT-GCTTTG---TC-TA---C--T---TA---A---A--CAC-G-TA-ATT-T-A-C----C-G-GGA----TCTT--TTTCGC---------A-C--G---GTGGG-A--CACT-G--GAG-----AT--CGAT-AATGACCA--AT-TTAC
gi|56107                      : TACAG--TCAAC-T-C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC---T-----T--TT--G---T-T--CTTTT---AAA-T-C-TT-TGGC------------------ATTA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-TCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-ATT--------------------------------------------------T--C-C---GCC--A-T-TT------------------T-G------T---C-GA------A-------A-A---AGATTT--A--C--C-GCTGT-T-T-TC------CA-TGT-TT-GT---------------------------------GT-A-AA-----------TA-T----------------TT---T-C--TG--TA--A-TA-A-AT---T-TA-T---------------TT---A-A-A--A--TTATTT-----T----A-A---------C----A-T--GA-TT-AT--T---T--G-TTT--A---AA-C-A-T------C-AC-A-A-AATT-C-TTT-C-C-T-TT--TCATC--TTC-G-A--A-A-CTCT-AA-A-G-A---AC--T-------C---T-AT-T-T-TGTGGA--C--AAG---CC--------A--TA-CC-T--AAG---C-T-AAAA-CAG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-T---ACAGAT-AA-AGC-GA-C--TAC-A--TCT-C----A----T-AT---T-ACATC-T-TT-TC-TTG---TG-TA---C--T---T----A---A--CACAG-TA-A-T-T-A-C----T-G-GGG----TCTT--TCAG-C---------A-C--A---GATGT-A--CAAC-A--GAA-----AT--CGAT--ATGACCA--AT-TTAC
gi|56109                      : TACAG--TAAAG-T-C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC---T-----T--TT--G---T-T--CTTTTTG-AAA-T-C-TT-GCGC------------------AT-A-TA-------ATACATACAGAAA-T-T-TG-GAG-A--T--T-G-A--TT-G-ATATC---TC--C-G-TCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA---GT--------T--C-T---GCC--A-T-TT------------------TTG------T---A-GA------A-------A-G---AG--TT--A--C--CAGCTGT-T-T-TC------CA-TGT-TT-GC-TT-----T-------ATA----A-TT-CA-T-GT-A-AA-----------TA-T----------------TT---T-C--TG--TA--A-TA-A-AT---T-TA-T---------------TT---A-A-A--A--AT-TTT-----T----A-A---------C----A-T--GA-TT-AT--T---T--G-TTT--A---AA-C-A-T------C-ACAA-A-AATT-C-ATT-T-T-A-CT--TTATC--TTC-G-A--A-A-CTCT-AA-A-G-A---AC----------C---T-CT-T-T-TGTGGC--C--AAG---CC--------G--TA-CC-T--AAA---C-T-GAAA-C-G-GT---TTTCTA-T--AA-TG-T---ACAGAT-AAC-----G-C--GAC-A--TCT-CATCTA----T-AT---T-ACATC-T-TT-TC-TTG---TTCTA---T--TA--T----ATATA--CACAG-TATA-T-T-A-C----T---GGG----TCTT--TCAG-C---------A-C--A---GGTGGAA--CACT-G--GAG-----AT--CGAT-AATGA-CA--TT-TTAC
gi|56111                      : TACAG--TCAAC-T-C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC---T-----T--TT--G---T-TGGCTTTT---GAA-T-C-TT-TGGCTATTATATATTTTTAATTATTAATA-------ACG--------AAAT-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-ATT---TC--C-G-CCATTT-T--C---AG--A-AA-AAA--AGT--------T--C-T---GC---A-T-TT------------------T-G------T---A-GA------A-------A-A---AGAATT--A--C--C-GCTGT-T-T-TC------CA-TGT-TT-TA-TA----AT-------ATA----A-TT-CA-T-TT-A-AA-----------TA-T----------------TT---T-C--TG--A---A-TG-A-AT---T-AT-T--------T------TT---A-A-A--A--TT-TTA-----T----------------C----A-T--GA-TT-AT--T---T--G-TTT--A---AA-C-A-T------C-AT-A-A-AATC-C-TTT-C-C-T-TT--TTATC--TTC-G-A--A-A-CTCA-AA-A-G-A---ACTAT-------A---T-CT-T-T-TGTGGC--T--AAG---CC--------G--TA-CC-T--AAA---C-T-GAAA-TGG-GT---TTTCTA-T--AA-T-----------T-AA------------GT-A--TTT-C----------------------C-T-T-------G---TT-TA---C--C---TA---A---A--CACAG-TA-A-T-T-A-C----C-G-GGG----TCTT--TAAG-C---------A-C--A---GGTGG-A--CATT-G--GAG-----AT--CGAT-AATGACCA--
gi|56113                      : TACA---TCAAC-TGC--TT---CG-TA-AAC---CAG-CC--A----CCAATT-----TGATT--A---T-C---TTTT---GAA-T-C-TT--GGC------------------ATTA-TA-------ACG--------AA-TATATG-GCG-AAAG--A-A-A--TT-G-A-ATT---TC----G-CCATTT-TTGA---AA--G-AA-AAA--AGT--------T--C-T---GC---A-T-TT------------------T-G------T---A-GA------A-------A-A----GAATT--AACCGAC-GCTGTATAT-TC------CC-TAT-TT-GC-TT----AT-------ATATAGAA-TT--A-T-GT-A-AA-----------TA-T----------------TT---TAT--TG--TT--A-TATA-AT---C-TA-T--------T------TT---G-A-A--A--TT-TTT-----TTAATA-A---------C----A-T--GA-TT-AT--T---T--G-TTT--A---CA---A-T------C-AC-A-A-AATC---TTT-C-C-T-TT--TTATC--TTC-GCA--A-A-CTCT-AA-A-G-A---AC--T-------C---T-ATAT-T-TGTGGC--C--AAGG--CC--------A--TA-CA-T--AAA---C-TCGAAT-CGG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-T---ACAGAT-AACAGT-AA-C--TAC-A--TCT-C----A----T-ATA--T-ACATC-T-TT-TC--TG---TT-TA---C--T---T----A---A--CACCG-TA-ATT-T-A-CT---T-A-GGG----TCTT--T----C---------AGC--ACAGGGTGG-A--CACC-A--GAT-----AT--AGAT-AATGACCAG-AT-TTAC
gi|56110                      : TACAG--TCAAC-T-C--TC---GA-TA-AAC---T-G-CC--A----CC---T-----T--TT--G---T-----TTCT---A----------------------------------TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-ATT---TC--C-G-CCATTT-T--G---AA--T-AA-AAA--AGT--------T--C-T---GCC--C-T-TT------------------T-G------T---A-GA------A-------A-A---AGAGTT--C--C--T-ACTAT-T-T-TC---------------------------------------------------------A-----------TG-T----------------TT---G-C--TT--TT--A-TA-A--T---T-CA-T--------G------TA---A-A-T--A--TT-TTC-----T----GTA---------T----AAT--GA-TT-AT--T---T--G-TTT--A----------T------C-AC-A-T-AATT-C-AAT-C-G-T-TT--TTATC--TTC-A-A--A-A-CTCA-AA-A-G-A---AT--T-------C---T-CC-T-C-TGTGGC--T--AAG---CC--------G--TA-CC-T--AAA---C-T-GAAA-CGG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-G---AAAAAT-AACGC--GA-C--TAC-A--TTT-C----A----T-AT---A-AAGTC-T-TT-TC-TTG---TT-TA---C--T---T----A---A--CACAG-TA-A-T-T-A-C----TGG-GGG----TCTT--TCTG-C---------A-C--A---GGTGA-A--CACC-G--GAG-----AT--CGAT-AATGACCA--AT-TTAC
gi|56114                      : TACAG--TCAAC-T-C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC---T-----T--TT--G---T-T--CTTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------ATTA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GTG-A--T--G-A-C--TT-G-A-ATT---TC--C-G-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AA---AGT--------T--C-T---GCC--A-T-TT------------------T-G------T---A-GA------A-------A-A---AGAGTT--A--C--C-GCTGT-T-T-TC------CA-TGT-TT-GC-TT----AC-------ATA----A-TT-CA-A-GT-A-AA-----------TA-T----------------TT---T-C--TG--TA--A-TA-A-AT---T-TA-T---------------TT---G-A-ACCA---T-TTT-----T----A-A---------C----A-T--GA-TT-AT--T---T--C-TTT--A---AA-C-A-T------C-AC-A-A-AATC-C-TTT-A-C-T-TT--TTATC--TTC-G-T--A-A-CTC---A-A-G-A---AC--T-------C---T-CT-T-T-TGTGGA--C--AAG---CC--------
gi|56112                      : TACAG--TCAAA-T-C--TC---GA-TA-AACTCCC-G-CCCCA----CC---CCCCCGT--TT--G---T-T--CTTTT---GTA-T-C-TT--GGC------------------GTT--TA-------A-G--------AA-T-T-TG--CG-A-----G-A-A--TT-G-A-ATT----C--C-G-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--ATT--------T--CAG---GCC--A-T-TT------------------T-A------T---A-GA------A-------A-A---AGATTG--A--C--C-CCGCT-T-T-TC------CG-TGT-TT-GT-TT----AT-------ATA----A-TT-CATG-AT-A-AA-----------TATT----------------TT---T-C--TG--TA--A-TA-A-AT---T-TA-T--------T------TT---T-A-A--A--AT-CTT-----T----A-A---------C----A-T--GA-TT-AT--T---T--C-TTTA-A---AA-C-A-T------C-AA-A-A-AATC-CTTTT-C-C-T-TT--TTATC--TTT-A-GC-A-A-CTCA-AA-A-A-A---AC--TCCTC---C---T-CC-T-G-CGTGG---T--AAG----C--------A--TA-CC-T--AAA---C-T-GAAA-CAT-GT---TTTCTA-T--AA-TG-T---AAAAAT-AACGC--GA-C--TACTT--TCT-C----A----T-AT---T-TA-------------------T-TAGATC--T---T----A---A--CACAGTTA-A-T-T-A-C----CGG-GGG----TCTT--T----TTGCA-----A-C--G---GGTGG-A--CACTGA--GAG-----AT--CGAT-AATGGCCA--TT-CTAC
gi|56116                      : TACAG--TTAAA-T-C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC---T-----T--TT--G---T-T--CTTGT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------GTTA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-ATT---TC--C-G-CCATTT-T--G---AA--G--A-AAA--AGT--------T--C-----GCC--A---TT------------------T-A------T---A-G-------A-------A-A---AGAGTT--G--C--C-GCTGT-T-T-TC------CG-TGT-TTCGT-TT----AT-------ATA----A-TT-CA-T-AT-A-AA-----------TA-T----------------TT---T-C--TG--CTAAA-TA-A-AT---T-TATT--------T------TT---A-A-A--A-----TTT-----C----A-A---------C----A-T--GA-TT-AT--T---T--C-TTT--A---AA-C-ATT------C-AC-A-A-AATC-C--TT-C-C-T-TT--
gi|56117                      : TACAG--TCAAC-T-C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC---T-----T--TT--G---T-T--CTTCT---GAA-T---TT-TGGC------------------GTTA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-ATT---TC--C-G-CAATTT-T--G---TA--G-AA-AAAG-AGTTGCCTCTCT--T-T---TCC--A-TGTT------------------T-GCATATAT---A-TA------ATTCAAATA-A---AGAGTT--A--T--C-ACTCT-T-T-TC------CA-TTT-TT-GC-AT----AT-------ATA----T-TT-CA-T-GT-A-AA-----------TA-T----------------TT---T-C--TG--TT--A--A-A-A------------------------------A-G-A--A--TGATTT-----C----A-A---------C----A-T--GG-TT-AT--T---
gi|56121                      : TATAG--TCAAC-T-C--TC---GA-TG-AAC---C-G-CC--A----CC---T-----T--TT--T---T-T--CTCCT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------GTGA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-ATT---TC--C-G-CAATTT-T--G---TA--G-AA-AAAG-AGT--------TTCC-T---CTC--T-T-TTTCATGTTTGCTTATACAGT-G------T---A-TACAATTCA-------A-ATAAAGAGTT--A--C--C-CCTCT-T-T-TC------CA-TTT-TT-GC-TT----AT-------ATA----T-TT-CA-T-GT-A-CA-----------TA-T----------------TT---T-C--TG--TT----TA-A-A------------------A------AT---A-A----------TTT-----C----A-A---------C----A-T--GG-TT-AT--T---T--G-TTT--A---AA-C-A-T------C-AC-A-T-AA---C-TTT-
gi|56118                      : TACAG--TCAAC-T-C--TTTCTGA-TA-AAC---C-GACC--AAACGCC---TC----T--TT--GGTAT-C--CTTAT---GAA-TTC-TT-TGGC------------------ATTA-TATTACACAACG--------AA-T-T-TG-GCG-AG-T--GTATA--TT-G-A-ATTGAGTC--C-GGCCATTT-T--GCCAAA--A-AA-AAATGAGT--------T--C-T---GCC--ACT-TT------------------T-G------T---A-GA------A-------A-C---GAGATT--A--C--A-GCTAT-T-T-TCT-----CA-TGT-TTGGC-TTG---AT-------ATA----A-TT-CT-GCAT-A-AA-----------TA-T----------------TT---A-C--TG--TA--AGTA-ACATAA-T-TA-T--------ATTAGTTTT---A-A-A--A--TTGTTC-----C----A-AT--------C----A-T--GATTT-ATCAT---T--G-TTTACA---AA-CTA-TCGCGGAC-AT-A-A-ATGT-C-TTT-CGG-T-TTCATTATC--TTC-C-AGTA-A-CTAA-AATA-G-AGTTAC--T-------CCGAT-CC-T-T-GATGGC--T--AAGGGACCA-------G--AA-CT-T--A-AGATC-T-GAAA-CGGTGTAGGTCGTGA-T--AAGTG-TTAAATAAATCGACAGCTGATT--TAC-A--TCTGCATCAA----T-AT---T-AAGTC-T-TT-TC-TTG---TT-TA---C--T---TACTAA---A--CATCG-TA-A-T-TAA-C----T-GTGGG----T
gi|56120                      : TACAG--TCAAC-T-C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC---T-----T--TT--G---T-T--CTTTT---GAA-T-C-TA-TGGC------------------GTTA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-ATT---TC--C-G-CAATTT-T--G---TA--G-AA-AAAG-AGT--------TA-C-C---TCT--T-T-TT------------------T-T------T-------------------------------TT--T--T--T-TTTTT-T-T-TTTTTTTACA-TTT-TT-GC-TT----AT-------ATA----A-TT-CA-G-GA-A-AAGAGTGGTTGCTTA-TATCATTCATGTAAATATT---T-T--CG--TTA-A-TA-A-AT---T-GA-T--------T------TT---A-A-A--A--AC-ATT-----C----A-G---------C----A-T--GG-TT-AT--T---T--G-TT
gi|56122                      : TACAG--TCAAC-T-C--TC---GA-TA-AAC---C-A-CC--A----CC---T-----T--TT--G---T-T--CTTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------ATTA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-G-A--TT-G-A-ATT---TC--T-G-CCATTT-T--G---A
gi|56119                      : TACAG--TCACC-T-C--TC---GA-TA-A-C---C-G-CCC-A----CC---T-----T--TT--G---T-T--CTTTTT--GAA-T-C-TT-TG-C------------------TTAA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCATA--T--G-A-ATCTT-GAA-ATT---TC--C-A-CCA-AT-T--G---AA--G-GACAAAC-AGT--------T--C-C---GCCAAA-T-TT------------------TAG------T---A-GA------A-------A-A---AG-TTT--G--C--C-GCTGT-C-CGTT------CA-TGT-TG-GCTTT----AT-------AGA----A-TC-CA-T-GT-A-
gi|56123                      : TACAG--TCAAC-T-C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC---T-----T--TTG-G---T-T--CTTTT---GAA-T-C-CA-TGGC------------------GTTA-TA-------ACG--------AATT-T-TG-GCG-A--T--G---A--TT-G-A-ATT---TCTGC-A-TTA-TT-T--G---TA--G-AA-AAAG-AGT-------------T---ACC--T-C-TT------------------T-T------T-------------------------------TT------------TTT-T-T-TA------CA-CTT-TT-GC-TT----AT-------ATA----A-TT-CA-G-GA-A-AAG----------GA-G----------------TG---T-G--TGC-TT--A-TATC-AT---T-CA-T--------G------GT---A-A-AT-A--TT-TTCG----T----A-A---------T----A----GA-TTGAT--T---T--A---A--A---AA-C-A-T------
gi|56124                      : TGCAG--TCAAC-T-T--TC---GA-TA-AAC---C-G-TC--A----TC---T-----T--TT--G---T-T--CCTCT---GAA-T-T-TTGTGGC------------------ATTA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GTG-A--T--G-G-A--TT-G-A-ATT---TC--C-G-CGATTT-T--G---tccagcatggttatttgttttatcaacaa
gi|56108                      : TACAG--TCAAC-T-C--TC---AA-TA-AAC---C-G-CC--G----TC---T-----T--TT--G---T-T--TTTTT---CAA-T-A-TT-TGGC------------------ATTA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-
gi|56125                      : TACAG--TCAAA-T-C--TT---GA-TA-AAC---T-A-CC--A----CC---T-----T--GT--G---T-T--CTTCT---GAA-T-T-TA-TGGA------------------GATA-TA-------GCG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-CTT---TC--T-G-CCATTT-T--G---
gi|56126                      : TACAG--TCAAC-T-C--TC---GA-TA-AA----C-G-CC--A----CC---T-----T--TT--GT--T-C--TTTTT---GAATT-C-CA-TGGC------------------GTTA-T--------ACG--------AA---T-TG-GCGAA--T--T-A-A--TT-G-A-ATT---TC--C---CAATTT-T--G---AA--GCAA-AAG--AGT--------TACC-T---CTT--T-T-TT------------------T-G------T-------------------------------TT--T--T--T-TTTTT-T-T-TTTTTA--CATTTT-TT-GC-TT----AT-------ATA----ATTT-CA-G-AG-A-AAAGGAGTGG---TG-C----------------TTAAAT-CATTC--AT--G-TA-A-ATA--T-TT-T--------T------TT---A-ATA--A--TTGTTT-----T----A-AAAACTTTAGC----A-T--GG-TT-AT--T---T--GTTTT--ATATAA-C-A----------AT-A-A-GA-------------T-TT--TTAT---TTC-A-A--A-
gi|56128                      : TACAG--CCAAC-T-C--TC---GA-TA-GGC---C-A-CC--A----C----T-----T--TT--G---A-T--TTTCT---GAA-T-T-TA-TGGT------------------ATTA-TA-------ATG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-ATT---TC--C-A-CCTTCT-T--T---GG--G-A--------------------------------A-T-CT------------------T-G------T---A-TAT-----G-------T-G---AGAATT--A---------TGT-T-T-TC------CT-TAT-----C-TT----CA-------ATA----C-CT-GA-T-GT-A-AA-----------AA-T----------------AG---C-T--TG---T--A--A-A-ATA--T-CA-T--------T------TT---C-A-A--A--AT-TTT-----C----A-G---------C----A-T--AA-TT-
gi|56127                      : TACAG--TCAAA-T-C--TC---GC-TA-AAC---T-G-CC--A----CA---T-----G--TT--G---T-T--TTTCT---GAA-T-G-TA-TGGC------------------GATA-CA-------ACG--------AA-T-T-TG-GTA-A--T--G-A-A--TT-G-A-ATT---TC--C-A-CCATAT-T--G---GG--G-AA-TA--------------T--C-T-----T--A---TT------------------T-G------T-------------A-------A-A---AG--TT--A--T--C------------------------T-TT-G--------AT-------GCA----A------------A-AA-----------CA-T----------------C-------------TT--G-TA-A-AA---T-AA-T--------T------TT---C-A-T--A--TT-TTT-----T----A-G---------C----A-T--GA-TT-
gi|56129                      : TACAG--TCAAA-T-C--TC---GAGTA-AAC---C-A-CC--A----CT---T-----A--TT--G--------CTTCT---GAA-T-G-TC-TGGC------------------GATA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A-----G-ATA--TT-G-A-AT
gi|56130                      : TACAG--TCAAC-T-C--TC---TA-TA-AAC---C-A-CA--A----CC---T-----T--TT--G---T-T--CTTCT---GAA-T-----------------------------TTA----------------------------TG-GCA-A--T--G-A-A--TT-G-A-ATT---TC--T-A-CCATCT-T--G---G---------------------------------GTA--A-T-CT------------------T-G------T---A-TA------A-------GCA---AGATTT--A--T--C-------T-T-TC----------AT-TT-AT-TTCC--A--------ATA----C-TT-GA-T-GT-A-AA-----------AA-T----------------AT---C-A--TG---T--A--A-A-ATA--T-TA-C--------T------TT---C-A-A--A--TG-TTT-----T----A-G---------C----A-T--GA-TT-gttttcgcta
gi|56115                      : TACAG--TCAAC-T-C--TC---GA-TA-AAC---C-A-CC--G----CC---T-----T--TT--G---T-T--CTT
gi|56131                      : TACAG--TCAGC-T-C--TC---GA-TACAAC---G-G-CC--A----C-----------------G---T-T--CATTC---CAA-T-CATT-TACC------------------ATTA-TA-------AGG--------AA-T-C-TG-
gi|56132                      :  ATAG--TCAAC-T-C--TC---CA-TA-AAC---C-G-C---A----CC---T-----T--TTTTG---T-T--CTTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------AT-A-TA-------ATG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-A-A-ATT---TC--C-G-TCATTT-TT-G---AA--G-AA-AAA--AGT--------T--C-TCT-GCC--A-T-TC------------------T-G------T---A-GA------A-------A-A---AGAGTT--A--T--T-ACTAT-T-T-TC-------A-TGT-TT-GC-TT----AC-------ATA----A-TT-CA-T-GT-A-AA-----------TA-T----------------TT---T-C--TGCATTGAA-TA-A-AT---T-TA-T--------T------TTTC-A-A-A--A--TT-TT-----------A-A---------C----A-T--GA-TT-AT--T---T--G-TTT--A---AA-C-A-T------C-AC-A-G-AATT-C-TTT---C-G-TT--TTATC--TTC-A-A--A-ACCTCA-AA-A-G-A---AC--T-------C---T-CT-T-C-TGTGGC--T--AAG---TC--------G--T--CC-T--AAA---C-T-GAAA-CGG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-T---AAAAAT-AAC-----A-C--TAC-A--TCT-CT---A----T-AT---T-AAGTC-T-TT-TC-TTG---TT-TA---C--T---T----A---A--AACAG-TA-T-T-T-A-C----T-G-GGG----TCTT--TCTG-C---------A-C--A---GGTGA-A--CACC-G--GAG-----AT--CGAT-AATGACTA--CT-TTAC
gi|56133                      :  ATAG--TCAAC-T-C--TC---CA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC---T-----T--TTT-G---T-T--CTTTTT--GAA-T-CCTT-TGGC------------------CATA-TA-------ATG--------AA-T-T-TG--CGTA--T--G-A-A--TTTA-A-ATTC--TC--C-G-TCATTT-TT-G---AA--G-AA-AAA--AGT--------T--C-TCTCGCC--A-T-TC------------------T-G------T---A-GA------A-------A-A---AGAGTT--A--T--T-ACTAT-T-T-TT------CA-TGT-TT-GC-TT----AC-------ATA----A-TT-CA-T-GT-ATAA-----------TA-T----------------TT---T-C--TG---C--A-TG-A-ATAAAT-TA-T--------T------TTTCAA-A-A--A-----TTT-----T----A-A---------C----A-T--GA-TT-AT--T---T--G-TTT--A---AA-C-A-T------C-AC-AGA-AGTT-C-TCT-CTC-G-TT--TTATC--TTCAA-A--A-A-CTCCAAA-A-G-A---AC--T-------C---T-CT-T-TCTGTGGCTTT--AAG---TC--------GTCTA-CC-T--AAA---CTT-GAAA-CGG-GT---TTTCTATT--AA-TGAT---AAAAAT-AAC-----A-C--TAC-A--TCT-C----A----T-AT---T-AAAGT-C-TT-TC-TTG---TT-TA---CTTT---T----A---A--AACAG-TA-T-T-T-A-C------G-GGT----TCTT--CCTG-C---------A-C--A---GGTGA-AACCACC-G--GAGC----AT---CAT-AATG
gi|56134                      :  ACAGGTTCAAC-T-C--TC---AA-TATAAC---C-G-CC-------CC---T-----T--TT--G---T-T--CTTTTTTATAA-T-A-TT-TGGC------------------AT---TA-------ATGC-------AA-T-T-TT-GCA-A--T--G-A-A--TT-T-A-ATT---TC--A-T-CCATTTAT--G---AT--G-A
gi|56135                      :    AG--TGAACAT-CCTTC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC---T-----T--CT--G---TGT--CTTTT---GAA-T-C--T-TGGC------------------GTTA-TT-------ACG--------AA-T-T-TGCGCG-A--T--GAA-A--TT-G-A-ATT---TA--C-G-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--AGA--------G--C-G---GTC--C-T-TG------------------T-A------TATAA-GA------A-------A-A---AGATTT--A--T--C-GCTGT-T-T-TCG-----TA-CTTATT-GT-TT----AT-------ATA----A-TTCCA-G-ATAA-AA-----------TA------------------GT---T-C--TG--TA--AGTA-A-A----G-TA-T--------T------TT---T-A-A--A--TT-TTT-----T----A-A---------C----A-T--GA----AT--T---T--T-TTT--
gi|56136                      :                                                                                T---GAA-T-C-AA-TGTC------------------ATTA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--T--A-A-ATT---------A---ATT-------------------GA--ATT--------T--C-C---GCC--A-T-TT------------------T-G------A---A-GA------A-------A-A---AGAGTT--A--C--C-GCTCT-T-T-TG------CA-TGT-TT-GC-TTATACAT-------ATA----A-TT-CA-T-GT-A-AA-----------TA-T----------------TT---T-C--TG--TA--A-TC-A-AT---T-GATT--------T------TT---A-C-A--ATTTT-TTT-----T----A-A---------CAAGAA-TTAGA-TT-AT--T---T--G-TTT--A---AA-T-A-T------C-AC-A-A-AATC-C-TGT-C-CTT-TT--TTTTC--TTC-G-A--A-A-CTCA-AA-A-G-A---AC--T-------C---T-CT-T-C-CATGAC--G--AAG---CT--------A--TA-CC-C--AAT---C-T-GAAT-TAT-GT---TTTCTA-T--A-------------AT-AACAG----------C-A-------------------------------T-TT-TC-TTG---TT-TA---T--T---T----A---A--CACAG-CA-A-T-T-A-C----C-G-AGG----TCTT--TTTG-C---------A-C--G---GGTGG-A--TGCC-G--GAG-----AT--CGAT-AATGACCA--AT-TTAC
gi|56137                      :                                                                                                                      TTA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GTG-A--TCGA-A-A--TT-G-A-ATT---TC--CCG-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--G----------T--C-T---GCT--A-C-CC------------------A-G------C---A-GA------A-------
gi|56138                      :                                                                                                                                                                --G-A-A--TT-G-A-ATT---TC--C-G-CCATTT-T--GA--AA--A-AA-AAA--AGT--------T--C-T---GCA--C-T-TT------------------T-G------T---A-GA------A-------A-A---tccacgtacgatcaactcaacacagagtaaaacgaggttaatagaaaagaatagtgacgacgcatcggctgttttccatgtttgcttctattcaataaatatttctgttaataaatttatttgaataacatttttaaccatgattatttctttaaatcatcaacataaatcgctttacttttttatcttcgtaactcagaactctacttgttgtggacaagccttaccattaacactgaaaccgagttttctatgcaaagtaacagataactcgacacaatcctcagtagcaaggtctttctcttgctttctacttgtatcatcgtattctatccgtctatcacaagtggaccaatgaggacgaattgatgaatgaccaattt
gi|56139                      :                                                                                                                                                                                 TT---CC--C-A-CCACTT-T--G---AA--G-AA-ATA--AGT--------C--T-C---GC---A-T-TT------------------T-G------T---ATGT------A-------A-A---AGAGTTGAA--C--C-GCTGT-T-T-TC------CA-TGT-TT-GC-CT----TT-------ATAAT--A-TT-CACT-TT-C-AA-----------TA-T----------------TT---T-C------TT--G-T--A-AT---T-TA----------A------TT---GTA-A--G--TT-GTT-----T----A-A-------------------AA-TT-GT--T---T--
gi|56140                      :                                                                                                                                                                                        --C-G-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--AGT--------T--C-T---GTC--A-T-TT------------------T-G------T---A-GA------A-------A-A---AGAGTT--A--C--T-GCTGT-T-T-TC------TA-TGT-TT-GT---------------------------------------A-----------TA-T----------------TT---T-C--TG--TA--A-TA-A-AT---T-TA-T--------T------TT---T-A-A--A--AT-TTT-----C----A-A---------C----a
gi|56141                      :                                                                                                                                                                                               CATTT-T--G---AAAGG-GG-GAA--A----------T--C-G---GCC--A-T-TT------------------T-G------T---A-GA------A-------A-A---AGAGTT--G--C--C-GCTGT-T-T-TC------CT-TAT-TT-GC-TT----ATATAAAGAATA----A-TT-CT-T-GT-A-AA-----------TA-T----------------TT---T-C--TG--TA--A-TA-A-AT---T-TA-T--------T------TT---
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gi|56137                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               -GCTGT-T-T-TC------CA-TGT-TT-GC-TT----CT--------------A-TT-CA---AT-A-AA-----------TA------------------TT---T-C--TG--TTA-A-TA-A-AT---T-TA-TTTG-----A------AT---A-A-C--A--TT-TTT-----A----A-C---------C----A-T--GA-TT-AT--T---T--C-TTT--A---AATC-A-T------CAAC-ATA-AATCGC-TTTAC-T-T-TT--TTATC--TTC-G-T--A-A-CTC-----A-G-A---AC--T-------C---TACT-TGT-TGTGGA--C--AAG---CC--------T--TA-CCATTAACA---C-T-GAAACCGA-GT---TTTCTA-TGCAA-AG-TA--ACAGAT-AACTC--GA-C---AC-AATCCT-C----AGTAGC-A------AGGTC-T-TTCTC-TTGCTTTC-TA---C--TTG-T----A---T--CATCG-TA-T-TCT-ATC----C-----G----TCTA--T----C---------A-C--A---AGTGG-----ACC-AATGAGGACGAAT--TGATGAATGACCA--AT-TT
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lowQualScore                  :      ..     . .. ..  ...  .  .   ... . .  .. ....  .. .....   .. ... . .. .    ...   . . .  .    ................... .  .  .......   ........  . . .  .   . .. .. . . ..  . . . ..  ...   . .      . .. ...  .. .  .   .. .  ..............  ... . .   . ...... ... .  . ....... .       .. .. .. ..    . . .  .....................  .   .  . . . ......... .  ....... ....  .... .   ... ..................  . ................................................................ .  . ......  ......................... . . ...  .............  .. .. . ...........  ... ..... ....   ..........  .  ..... . .   .  .. ... .. .   . ..  . . . .. ....  . .  .  . . .   . . . .  ..    . ..   . . ..  .  . .  .  . ...  .. ....... ... .  . . .......     .....   ...  ....    ..   . .. . .   . . ...  ...      . ..  .  .   .       ...   ........   . ..   .... .... . . ....... ........... .  .  .   ...  .  ... .. ... .... ... ..     .  . . . . . ........  .   ..   . .  .  .. . .....  .  . .. .  .  .   ....    . . .     ....   ..  .    
lowQualScore                  :      77     2 77 77  111  2  4   111 2 2  99 6666  77 22222   11 111 2 33 4    000   2 2 4  2    7777777777777777777 2  2  8888888   44444444  4 2 2  2   6 99 66 4 4 77  2 2 2 66  222   1 1      1 99 111  77 2  2   22 2  00000000000000  444 2 2   5 666666 222 2  2 1111111 6       88 88 88 99    3 3 3  222222222222222222222  3   3  3 3 3 222222222 3  5555555 7777  8888 3   333 333333333333333333  2 7777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 3  3 666666  1111111111111111111111111 3 3 000  5555555555555  44 55 3 66666666666  333 33333 2222   3333333333  3  44444 4 4   4  11 777 22 6   7 44  7 7 7 44 4444  7 2  9  9 9 6   8 9 8 8  44    8 55   5 8 55  8  8 2  8  8 222  55 8888888 222 8  6 8 6666666     11111   000  1111    55   9 66 9 9   0 0 222  555      0 88  0  8   7       000   33333333   7 33   2222 2222 3 0 6666666 66666666666 7  7  7   888  6  888 88 666 4444 888 22     6  6 8 6 6 6 55555555  6   44   6 7  7  33 7 22222  7  7 00 7  7  7   2222    7 7 7     7777   11  8    
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Reference ( family-417 )      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------GT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--AGTT--------C-T---GCC--A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--C--C-GCTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------T-AT-------A----TA----A-TTC---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------TG----------T--N----A------T-A-A---AT---T---------TA--T--T-T---T-------AA---A-----AT-T-TTT-----T----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTT-A--AA-C-A-T--C----AC-A-AA-AT-C-C-TTT-C-C-T-TT--TTAT-C--TTC-G-A--AA-CT-CNAA-AG-A---AC--T-------C---T-CT-T-T-----C-GTGGC--T--AAG---CC-G--TACC--TAA-A--C-T-GAA-A-CGG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-TAA-AAATAACA-CGAC--------TAC-A--TCT----C----A-T-A---T---T----AA-GT-CT-TT-TC-TTG---TT-TA---C--T---T----A---A--CACAG-TA-A-T-T-A-C----C-G-GG-GTC--TTT-C-GC-AC--A-G-----GT-GG-A--C-AC-CG-GAG----ATCG-A-T-AATGA----CCA--AT-TTAC
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gi|56108                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---AA-TA-AAC---C-G-CC--G----TC--T-----TTT--G---T-T--T-TTTT---CAA-T-A-TT-TGGC------------------AT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-
gi|56109                      : TACAG--TAAAG-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTTTG-AAA-T-C-TT---GC------------------GCATA-TA-------ATACATACAGAAA-T-T-TG-GAG-A--T--T-G-A--TT-G-ATA--TC---TCC-G-TCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA---GTT--------C-T---GCC--A-T-TTTTG------T---A-GA-A-------A---GAGTT--A--C--CAGCTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------T--T-------A----TA----A-TTC---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------TG----------T--A----A------T-A-A---AT---T---------TA--T--T-T---A-------AA---A-----AT-T-TTT----------AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTT-A--AA-C-A-T--C----ACAA-AA-AT-T-C-ATT-T-T-A-CT--TTAT-C--TTC-G-A--AA-CT-CTAA-AG-A---AC----------C---T-CT-T-T-----T-GTGGC--C--AAG---CC-G--TACC--TAA-A--C-T-GAA-A-C-G-GT---TTTCTA-T--AA-TG-TAC-AGATAACG-CG-----------AC-A--TCT----CATCTA-T-A---T---T----AC-AT-CT-TT-TC-TTG---TTCTA---T--TA--T----ATATA--CACAG-TATA-T-T-A-C----T---GG-GTC--TTT-CAGC-AC--A-G-----GT-GGAA--C-AC-TG-GAG----ATCG-A-T-AATGA-----CA--TT-TTAC
gi|56110                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---T-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T---------------T-C-TA-T-------------------------A-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CCATTT-T--G---AA--T-AA-AAA--AGTT--------C-T---GCC--C-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--C--C--T-ACTAT-T-T-TC----------------------A-TGT-TT-G-C-T---------T-TT-------A----TA----A-TTC---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------TG----------T-------A------T-A-A------------------------------------------------------------------------------T-G-ATT-AT--T---T--G-TTT-A---------T--C----AC-A-TA-AT-T-C-AAT-C-G-T-TT--TTAT-C--TTC-A-A--AA-CT-CAAA-AG-A---AT--T-------C---T-CC-T-C-----T-GTGGC--T--AAG---CC-G--TACC--TAA-A--C-T-GAA-A-CGG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-GAA-AAATAACG-CGAC--------TAC-A--TTT----C----A-T-A---T---A----AA-GT-CT-TT-TC-TTG---TT-TA---C--T---T----A---A--CACAG-TA-A-T-T-A-C----TGG-GG-GTC--TTT-CTGC-AC--A-G-----GT-GA-A--C-AC-CG-GAG----ATCG-A-T-AATGA----CCA--AT-TTAC
gi|56111                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-TGGC-TTTT---GAA-T-C-TT-TGGCTATTATATATTTTTAATTAT-TAATA-------ACG--------AAAT-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CCATTT-T--C---AG--A-AA-AAA--AGTT--------C-T---GC---A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAATT--A--C--C-GCTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-T-A-T---------A-AT-------A----TA----A-TTC---A-----------TT-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------TG-------------A----A------T-G-A---AT---T---------AT--T--T-T---T-------AA---A-----AT-T-TTA-----T-------CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTT-A--AA-C-A-T--C----AT-A-AA-AT-C-C-TTT-C-C-T-TT--TTAT-C--TTC-G-A--AA-CT-CAAA-AG-A---ACTAT-------A---T-CT-T-T-----T-GTGGC--T--AAG---CC-G--TACC--TAA-A--C-T-GAA-A-TGG-GT---TTTCTA-T--AA-T--TAA-----------------------------------------G-T-A---T---T--------------T-CC-TTG---TT-TA---C--C---TA---A---A--CACAG-TA-A-T-T-A-C----C-G-GG-GTC--TTTAA-GC-AC--A-G-----GT-GG-A--C-AT-TG-GAG----ATCG-A-T-AATGA----CCA--
gi|56112                      : TACAG--TCAAA-T--C--TC---GA-TA-AACTCCC-G-CCCCA----CC--CCCCCGTTT--G---T-T--C-TTTT---GTA-T-C-TT--GGC------------------GT-T--TA-------A-G--------AA-T-T-TG--CG-A-----G-A-A--TT-G-A-A--TT----CC-G-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--ATTT--------CAG---GCC--A-T-TTT-A------T---A-GA-A-------A-AAGATTG--A--C--C-CCGCT-T-T-TC---------------------CG-TGT-TT-G-T-T---------T-AT-------A----TA----A-TTC---A-----------TGA----TA-A--------------A-----------T-------------AT-----T----------------T-TT-C------TG----------T--A----A------T-A-A---AT---T---------TA--T--T-T---T-------TA---A-----AA-T-CTT-----T----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--C-TTTAA--AA-C-A-T--C----AA-A-AA-AT-C-CTTTT-C-C-T-TT--TTAT-C--TTTAG-C--AA-CT-CAAA-AA-A---AC--TCCTC---C---T-CC-T-G-----C-GTGG---T--AAG----C-A--TACC--TAA-A--C-T-GAA-A-CAT-GT---TTTCTA-T--AA-TG-TAA-AAATAACG-CGAC--------TACTT--TCT----C----A-T-A---T---T----TA--------------------T-TAGATC--T---T----A---A--CACAGTTA-A-T-T-A-C----CGG-GG-GTCT-TTT-T-GCAAC--G-G-----GT-GG-A--C-AC-TGAGAG----ATCG-A-T-AATGG----CCA--TT-CTAC
gi|56113                      : TACA---TCAAC-TGCT--TC---G--TA-AAC---CAG-CC--A----CCAAT-----TTG--A---T-TATC-TTTT---GAA-T-C-TT--GGC------------------AT-TA-TA-------ACG--------AA-TATATG-GCG-AAAG--A-A-A--TT-G-A-A--TT---TC--G-CCATTT-TTGA---AA--G-AA-AAA--AGTT--------C-T---GC---A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-A-GAATT--AACCGAC-GCTGTATAT-TC---------------------CC-TAT-TT-G-C-T---------T-AT-------A----TATAGAA-TT----A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TTAT------TG----------T--T----A------T-ATA---AT---C---------TA--T--T-T---T-------GA---A-----AT-T-TTT-----TTAATAA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTT-A--CA---A-T--C----AC-A-AA-AT-C---TTT-C-C-T-TT--TTAT-C--TTC-GCA--AA-CT-CTAA-AG-A---AC--T-------C---T-ATAT-T-----T-GTGGC--C--AAGG--CC-A--TACA--TAA-A--C-TCGAA-T-CGG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-TAC-AGATAACAGTAAC--------TAC-A--TCT----C----A-T-A---TA--T----AC-AT-CT-TT-TC--TG---TT-TA---C--T---T----A---A--CACCG-TA-ATT-T-A-CT---T-A-GG-GTC--TTT-CAGC-AC--AGG-----GT-GG-A--C-AC-CA-GAT----ATAG-A-T-AATGA----CCAG-AT-TTAC
gi|56114                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------AT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GTG-A--T--G-A-C--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AA---AGTT--------C-T---GCC--A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--C--C-GCTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------T-AC-------A----TA----A-TTC---A-----------AG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------TG----------T--A----A------T-A-A---AT---T---------TA--T--T-T---G-------AA---C-----CA-T-TTT-----T----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--C-TTT-A--AA-C-A-T--C----AC-A-AA-AT-C-C-TTT-A-C-T-TT--TTAT-C--TTC-G-T--AA-CT-C--A-AG-A---AC--T-------C---T-CT-T-T-----T-GTGGA--C--AAG---CC-
gi|56115                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-A-CC--G----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TT
gi|56116                      : TACAG--TTAAA-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTGT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------GT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CCATTT-T--G---AA--G--A-AAA--AGTT--------C-----GCC--A---TTT-A------T---A-G--A-------A-AAGAGTT--G--C--C-GCTGT-T-T-TC---------------------CG-TGT-TTCG-T-T---------T-AT-------A----TA----A-TTC---A-----------TA-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------TG----------CTAA----A------T-A-A---AT---T---------TAT-T--T-T---T-------AA---A-----A----TTT-----C----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--C-TTT-A--AA-C-ATT--C----AC-A-AA-AT-C-C--TT-C-C-T-TT--
gi|56117                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTCT---GAA-T---TT-TGGC------------------GT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CAATTT-T--G---TA--G-AA-AAAG-AGTTGCCTCTCTT-T---TCC--A-TGTTT-GCATATAT---A-TA-ATTCAAATA-AAGAGTT--A--T--C-ACTCT-T-T-TC---------------------CA-TTT-TT-G-C-A---------T-AT-------A----TA----T-TTC---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------TG----------T--T----A--------A-A---A-----------------------------------AG---A-----AT-GATTT-----C----AA-CA-----T-G-GTT-AT--T---
gi|56118                      : TACAG--TCAAC-T--C--TTTCTGA-TA-AAC---C-GACC--AAACGCC--TC----TTT--GGTAT-C--C-TTAT---GAA-TTC-TT-TGGC------------------AT-TA-TATTACACAACG--------AA-T-T-TG-GCG-AG-T--GTATA--TT-G-A-A--TTGAGTCC-GGCCATTT-T--GCCAAA--A-AA-AAATGAGTT--------C-T---GCC--ACT-TTT-G------T---A-GA-A-------ACGAGA-TT--A--C--A-GCTAT-T-T-TCT--------------------CA-TGT-TT-GGC-T---------TGAT-------A----TA----A-TTC---------------TGCA---TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TA-C------TG----------T--A----AGTAACAT-A-ATT-ATA--T---------TAG-T--T-T---T-------AA---A-----AT-TGTTC-----C----AATCA-----T-G-ATTTATCAT---T--G-TTT-ACAAA-CTA-T--CGCGGAC-ATAA-ATGT-C-TTT-C-GGT-TTCATTAT-C--TTC-C-AGTAA-CT-AAAATAG-AGTTAC--T-------CCGAT-CC-T-T-----G-ATGGC--T--AAGGGACCAG--AACT--TAA-GATC-T-GAA-A-CGGTGTAGGTCGTGA-T--AAGTG-TTA-AA-TAAAT-CGACAGCTGATTTAC-A--TCTGCATC----AAT-A---T---T----AA-GT-CT-TT-TC-TTG---TT-TA---C--T---TACTAA---A--CATCG-TA-A-T-TAA-C----T-GTGG-GT
gi|56119                      : TACAG--TCACC-T--C--TC---GA-TA-A-C---C-G-CCC-A----CC--T-----TTT--G---T-T--CTTTTT---GAA-T-C-TT-T-GC------------------TT-AA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCATA--T--G-A-ATCTT-GAA-A--TT---TCC-A-CCA-AT-T--G---AA--G-GACAAAC-AGTT--------C-C---GCCAAA-T-TTTAG------T---A-GA-A-------A-AAG-TTT--G--C--C-GCTGT-C-CGTT---------------------CA-TGT-TG-G-CTT---------T-AT-------A----GA----A-TCC---A-----------TG-----TA-
gi|56120                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTT---GAA-T-C-TA-TGGC------------------GT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G--CA------------------------------------------------A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--C--C-TCTTT-T-T-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACA-TTT-TT-G-C-T---------T-AT-------A----TA----A-TTC---A-----------GG-----AA-A--------------AGAGTGGTTGCTT-------------A------TATCATTCATGTAAATAT-TT-T------CG----------TT-A----A------T-A-A---AT---T---------GA--T--T-T---T-------AA---A-----AA-C-ATT-----C----AG-CA-----T-G-GTT-AT--T---T--G-TT
gi|56121                      : TATAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TG-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--T---T-T--C-TCCT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------GT-GA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G--CA------------------------------------------------A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--T--C--C-TCTCT-T-T-TT---------------------CA-TGT-TT-G-C-TTATACAGTGT-AT-------A----CA----A-TTC---A-----------AA-----TA-A--------------AGAGT-------T-------------ACCCCTCT----------------T-TT-CCATTTTTGC---------T--T----A------T-A-T---AT---TTCATGTACATA--T--T-T---TCTGTTTAAA---A-----ATAA-TTT-----C----AA-CA-----T-G-GTT-AT--T---T--G-TTT-A--AA-C-A-T--C----AC-A-TA-A----C-TTT-
gi|56122                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-A-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------AT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-G-A--TT-G-A-A--TT---TCT-G-CCATTT-T--G---A
gi|56123                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTTG-G---T-T--C-TTTT---GAA-T-C-CA-TGGC------------------GT-TA-TA-------ACG--------AATT-T-TG-GCG-A--T--G---A--TT-G-A-A--TT---TCT-G--CATT---------A----------------------------------------TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--C--C-TCTTT-T-T-TTTTTTTTA--------------CA-CTT-TT-G-C-T---------T-AT-------A----TA----A-TTC---A-----------GG-----AA-AAGGAGTGTGTGCTTA-----------T-------------A------T----------------CATT-CA-----TGGTAAATATTTT--C----G------T-A-ATAGAT---T---------GA--T--T-T---A-------AA---A-----AC-A-TTC-----C----AG-CA-----T-G-GTT-AT--T---T--G-TTT-T--AT-C-A---------AC-A-A
gi|56124                      : TGCAG--TCAAC-T--T--TC---GA-TA-AAC---C-G-TC--A----TC--T-----TTT--G---T-T--C-CTCT---GAA-T-T-TTGTGGC------------------AT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GTG-A--T--G-G-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CGATTT-T--G---
gi|56125                      : TACAG--TCAAA-T--C--TT---GA-TA-AAC---T-A-CC--A----CC--T-----TGT--G---T-T--C-TTCT---GAA-T-T-TA-TGGA------------------GA-TA-TA-------GCG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-C--TT---TCT-G-CCATTT-T--G---
gi|56126                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AA----C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--CTTTTT---GAATT-C-CA-TGGC------------------GT-TA-T--------ACG--------AA---T-TG-GCGAA--T--T-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC---CAATTT-T--G---AA--GCAA-AAG--AGTTAC------C-T---CTT--T-T-TTT-G------T-----------------------TT--T--T--T-TTTTT-T-T-TTTTTA-----------------CATTTT-TT-G-C-T---------T-AT-------A----TA----ATTTC---AGAGAAAAGGAGTGGTGCTTA-A--------------A-----------TCATTCATGTAAATA------T----------------T-TT-T------T-----------T--A----A------T-A-A--------T---------TG--T--T-T---T-------AA---A-----A--A-CTT-----T----AG-CA-----T-G-GTT-AT--T---T--G-TTT----TA-T-A-T--A----AC-A-A
gi|56127                      : TACAG--TCAAA-T--C--TC---GC-TA-AAC---T-G-CC--A----CA--T-----GTT--G---T-T--T-TTCT---GAA-T-G-TA-TGGC------------------GA-TA-CA-------ACG--------AA-T-T-TG-GTA-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-A-CCATAT-T--G---GG--G-AA-TA------T--------C-T-----T--A---TTT-G------T------------------AAAAGTT--A--T--C---------------------------------------T-TT-G---------------AT-------G----CA----A---------------------------A-A--------------A-----------C-------------A------T----------------C-TT----------------------------G------T-A-A---AA---T---------AA--T--T-T---T-------CA---T-----AT-T-TTT-----T----AG-CA-----T-G-ATT-taagatttttatttcaaa
gi|56128                      : TACAG--CCAAC-T--C--TC---GA-TA-GGC---C-A-CC--A----C---T-----TTT--G---A-T--T-TTCT---GAA-T-T-TA-TGGT------------------AT-TA-TA-------ATG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-A-CCTTCT-T--T---GG--G-A------------------------------A-T-CTT-G------T---A-TATG-------T-GAGAATT--A---------TGT-T-T-TC---------------------CT-TAT------C-T---------T-CA-------A----TA----C-CTG---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------A-------------A------T----------------A-GC-T------TG----------T--A-------------A-A---ATA--T---------CA--T--T-T---T-------CA---A-----AA-T-TTT-----C----AG-CA-----T-A-ATT-
gi|56129                      : TACAG--TCAAA-T--C--TC---GAGTA-AAC---C-A-CC--A----CT--T-----ATT--G--------C-TTCT---GAA-T-G-TC-TGGC------------------GA-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A-----G-ATA--TT-G-A-ATGTT---TTC-G-CTA
gi|56130                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---TA-TA-AAC---C-A-CA--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTCT---GAA-T-----------------------------T-TA----------------------------TG-GCA-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCT-A-CCATCT-T--G---G-------------------------------GTA--A-T-CTT-G------T---A-TA-A-------GCAAGATTT--A--T--C-------T-T-TC-------------------------AT-TT-A-T-T---------T-CCA------A----TA----C-TTG---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------A-------------A------T----------------A-TC-A------TG----------T--A-------------A-A---ATA--T---------TA--C--T-T---T-------CA---A-----AT-G-TTT-----T----AG-CA-----T-G-ATT-
gi|56131                      : TACAG--TCAGC-T--C--TC---GA-TACAAC---G-G-CC--A----C--------------G---T-T--C-ATTC---CAA-T-CATT-TACC------------------AT-TA-TA-------AGG--------AA-T-C-TG-
gi|56132                      :  ATAG--TCAAC-T--C--TC---CA-TA-AAC---C-G-C---A----CC--T-----TTTTTG---T-T--C-TTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------AT--A-TA-------ATG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-A-A-A--TT---TCC-G-TCATTT-TT-G---AA--G-AA-AAA--AGTT--------C-TCT-GCC--A-T-TCT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--T--T-ACTAT-T-T-TC----------------------A-TGT-TT-G-C-T---------T-AC-------A----TA----A-TTC---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------TG----------C--ATTGAA------T-A-A---AT---T---------TA--T--T-T---TTC-----AA---A-----A----TTT-----T----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTT-A--AA-C-A-T--C----AC-A-GA-AT-T-C-TTT---C-G-TT--TTAT-C--TTC-A-A--AACCT-CAAA-AG-A---AC--T-------C---T-CT-T-C-----T-GTGGC--T--AAG---TC-G--T-CC--TAA-A--C-T-GAA-A-CGG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-TAA-AAATAAC----AC--------TAC-A--TCT----CT---A-T-A---T---T----AA-GT-CT-TT-TC-TTG---TT-TA---C--T---T----A---A--AACAG-TA-T-T-T-A-C----T-G-GG-GTC--TTT-CTGC-AC--A-G-----GT-GA-A--C-AC-CG-GAG----ATCG-A-T-AATGA----CTA--CT-TTAC
gi|56133                      :  ATAG--TCAAC-T--C--TC---CA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTTT-G---T-T--C-TTTTT--GAA-T-CCTT-TGGC------------------CA-TA-TA-------ATG--------AA-T-T-TG--CGTA--T--G-A-A--TTTA-A-A--TTC--TCC-G-TCATTT-TT-G---AA--G-AA-AAA--AGTT--------C-TCTCGCC--A-T-TCT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--T--T-ACTAT-T-T-TT---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------T-AC-------A----TA----A-TTC---A-----------TG-----TATA--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------TG-------------C----A------T-G-A---ATAAAT---------TA--T--T-T---TTCA----AA---A-----A----TTT-----T----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTT-A--AA-C-A-T--C----AC-AGAA-GT-T-C-TCT-CTC-G-TT--TTAT-C--TTCAA-A--AA-CTCCAAA-AG-A---AC--T-------C---T-CT-T-T-----CTGTGGCTTT--AAG---TC-GTCTACC--TAA-A--CTT-GAA-A-CGG-GT---TTTCTATT--AA-TGATAA-AAATAAC----AC--------TAC-A--TCT----C----A-T-A---T---TA---AA-GT-C--TT-TC-TTG---TT-TA---CTTT---T----A---A--AACAG-TA-T-T-T-A------C-G-GG-TTC--TTC-CTGC-AC--A-G-----GT-GA-AACC-AC-CG-GAGC---ATC--A-T-AATG
gi|56134                      :  ACAGGTTCAAC-T--C--TC---AA-TATAAC---C-G-CC-------CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTTTTATAA-T-A-TT-TGGC------------------AT----TA-------ATGC-------AA-T-T-TT-GCA-A--T--G-A-A--TT-T-A-A--TT---TCA-T-CCATTTAT--G---AT--G-A
gi|56135                      :    AG--TGAACAT--CCTTC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TCT--G---TGT--C-TTTT---GAA-T-C--T-TGGC------------------GT-TA-TT-------ACG--------AA-T-T-TGCGCG-A--T--GAA-A--TT-G-A-A--TT---TAC-G-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--AGAG--------C-G---GTC--C-T-TGT-A------TATAA-GA-A-------A-AAGATTT--A--T--C-GCTGT-T-T-TCG--------------------TA-CTTATT-G-T-T---------T-AT-------A----TA----A-TTCCAGA-----------TA------A-A--------------A-----------T-------------A-----------------------G-TT-C------TG----------T--A----AG-----T-A-A---A----G---------TA--T--T-T---T-------TA---A-----AT-T-TTT-----T----AA-CA-----T-G-A---AT--T---T--T-TTT-
gi|56136                      :                                                                               T---GAA-T-C-AA-TGTC------------------AT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--T--A-A-A--TT----------AATT-------------------GA--ATTT--------C-C---GCC--A-T-TTT-G------A---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--C--C-GCTCT-T-T-TG---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------T-AT-------ACATATA----A-TTC---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------TG----------T--A----A------T-C-A---AT---T---------GA--T--T-T---TT------AC---A-----AT-T-TTT-----TTT--AA-CAAGAATTAG-ATT-AT--T---T--G-TTT-A--AA-T-A-T--C----AC-A-AA-AT-C-C-TGT-C-C-T-TT--TTTTTC--TTC-G-A--AA-CT-CAAA-AG-A---AC--T-------C---T-CT-T-C-----C-ATGAC--G--AAG---CT-A--TACC--CAA-T--C-T-GAA-T-TAT-GT---TTTCTA-T--AA-T-------AACAGCA--------------------------------------------------------T-TT-TC-TTG---TT-TA---T--T---T----A---A--CACAG-CA-A-T-T-A-C----C-G-AG-GTCT-TTT-T-GC-AC--G-G-----GT-GG-A--T-GC-CG-GAG----ATCG-A-T-AATGA----CCA--AT-TTAC
gi|56137                      :                                                                                                                     T-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GTG-A--TCGA-A-A--TT-G-A-A--TT---TCCCG-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--G--T--------C-T---GCT--A-C-CCA-G------C---A-GA-A-------
gi|56137                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -GCTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------T-CT------------------A-TTC---A------------A-----TA-A--------------A-----------T-------------A-----------------------T-TT-C------TGT---------T--A----A------T-A-A---AT---T---------TA--T--T-TGAAT-------AA---C-----AT-T-TTT-----A----AC-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--C-TTT-A--AATC-A-T--CA---AC-ATAA-AT-CGC-TTTAC-T-T-TT--TTAT-C--TTC-G-T--AA-CT-C----AG-A---AC--T-------C---TACT-TGT-----T-GTGGA--C--AAG---CC-T--TACCATTAACA--C-T-GAA-ACCGA-GT---TTTCTA-TGCAA-AG-TAACAGATAACT-CGAC---------AC-AATCCT----C----AGT-A---G---C----AAGGT-CT-TTCTC-TTGCTTTC-TA---C--TTG-T----A---T--CATCG-TA-T-TCT-ATC----C------GTC--TAT----C-AC--A-A-----GT-GG-AC-C-AA-TG-AGGACGAATTG-A-TGAATGA----CCA--AT-TTtccacgtacgatcaactcaacacagagtaaaacgaggttaatagaaaagaatagtgacgacgcatcggctgttttccatgtttgcttctattcaataaatatttctgttaataaatttatttgaataacatttttaaccatgattatttctttaaatcatcaacataaatcgctttacttttttatcttcgtaactcagaactctacttgttgtggacaagccttaccattaacactgaaaccgagttttctatgcaaagtaacagataactcgacacaatcctcagtagcaaggtctttctcttgctttctacttgtatcatcgtattctatccgtctatcacaagtggaccaatgaggacgaattgatgaatgaccaattt
gi|56138                      :                       ttataacgaatttggtgatcgaaattgaatttcccgccattttgaagaaaaagtctgctacccagcagaatccacgtacgatcaactcaacacagagtaaaacgaggttaatagaaaagaatagtgacgacgcatcg--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CCATTT-T--GA--AA--A-AA-AAA--AGTT--------C-T---GCA--C-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-A
gi|56139                      :                                                                                                                                                                                 --TT---CCC-A-CCACTT-T--G---AA--G-AA-ATA--AGTC--------T-C---GC---A-T-TTT-G------T---ATGT-A-------A-AAGAGTTGAA--C--C-GCTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-G-C-C---------T-TT-------A----TAAT--A-TTC---AC----------TT-----TC-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-CT-----TG----------T--A----AT-----T-T-A---AT---TG--------TAAGTTGT-T---T-------AA---A-----AT-T-GTT-----T----A
gi|56140                      :                                                                                                                                                                                          C-G-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--AGTT--------C-T---GTC--A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--C--T-GCTGT-T-T-TC---------------------TA-TGT-TT-G-T------------------------------------------------------------------------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------TG----------T--A----A------T-A-A---AT---T---------TA--T--T-T---T-------TA---A-----AA-T-TTT-----C----AA-C
gi|56141                      :                                                                                                                                                                                               CATTT-T--G---AAAGG-GG-GAA--A--T--------C-G---GCC--A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--G--C--C-GCTGT-T-T-TC---------------------CT-TAT-TT-G-C-T---------T-ATATAAAGAA----TA----A-TTC---T-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------TG----------T--A----A------T-A-A---AT---T---------TA--T--T-T---T-------
gi|56142                      :                                                                                                                                                                                                                    -AAA--AGTT--------C-T---GTC--A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AGGAATT--A--C--C-GCTGta
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gi|56153                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TG---TT-TA---C--T---TT---A---A--CACAG-TA-A-T-T-A-C----C-G-GG-GTC--TTT-CTGC-AC--A-G-----GT-GG-A--C-AC-CG-GAA----ATCG-A-T-AATGA----CCA--AT-
gi|56154                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        C--TTT-CTGC-AC--A-G-----GT-GG-A--C-AC-CG-GAG----ATTG-A-T-AATGA----CTA--AT-TTAC





Alignments
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lowQualScore                  :      ..     . .. ..  ...  .  .   ... . .  .. ....  .. .....   .. ... . .. .    ...   . . .  .    ................... .  .  .......   ........  . . .  .   . .. .. . . ..  . . . ..  ...   . .      . .. ...  .. .  .   .. .  ..............  ... . .   . ...... ... .  . ....... .       .. .. .. ..    . . .  .....................  .   .  . . . ......... .  ....... ....  .... .   ... ..................  . ........................................ ...... ................ .  . ...... . . ..................... . . ..  . .........  .. .. . ...........  ... ..... ....   ..........  .  ..... . .   .  .. ... .. .    ..  . . . .. ....  . .  .  . . .   . . . .  ..    . ..   . . ..   . . .  .  . ...  .. . .... .  . . .......     .....   ...  ....    ..   . .. . .   . . ...  ...      . ..  .  .   .       ..    ........   . ..   .... .... . . ....... ....  .. .. .  .  .   ...  .  ... .. ... .... ... ..     .  . .  .  ...... .          . ..... .  .. . .....  .  . .. .  .  .   ....    . . .     ....   ..  .    
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Reference ( family-417 )      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------GT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--AGTT--------C-T---GCC--A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--C--C-GCTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------T-AT-------A----TA----A-TTC---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---A----A------------T-A-A--AT-T---------TA--T--T-T---T-------AA---A-----AT-T-TTT-----T----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTTA--AA-C-A-T--C----AC-A-AA-AT-C-C-TTT-C-C-T-TT--TTAT-C--TTC-G-A--AAC-T-CAAA-AG-A---AC--T-C----T-CT-T-T-----C-GTGGC--T--AAG---CC-G--TACC--TAA-A--C-T-GAA-A-CGG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-TAA-AAATAAC-GCGAC--------TAC-A--TCT----C----A-T-A---T---T----AA-GT-CT-TT-TC-TTG---TT-TA---C--T---T----A---A--CACAG-TA-A-TT-AC----C-G-GGGTCTTTCT-G-----C-AC--A-G-----GT-GG-A--C-AC-CG-GAG----ATCG-A-T-AATGA----CCA--AT-TTAC
gi|56103                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---AA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-C--C-TTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------AT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-A-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--AGTT--------C-T---GCC--A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAATT--A--C--C-GCTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------T-AT-------A----TA----A-TTC---A-----------GG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---T----A------------T-A-A--AT-T---------TA--T--A-T---T-------AA---A-----AT-T-TTT-----T----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTTA--AA-C-A-T--C----AT-A-AA-AT-C-C-TTT-C-C-T-TT--TTAT-C--TTC-A-A--AAC-T-CTAA-AG-A---AC--T-C----T-CT-T-T-----T-GTGGC--C--AAG---TC-G--TACC--TAC-A--C-T-GAA-A-CGG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-TAC-AGATAAC-AGGAC--------TAC-A--TCT----C----A-C-A---T---T----AA-AT-CT-TT-TC-TTG---TT-TA---C--T---T----A---A--CACAG-TA-A-TT-AC----T-G-GGGTCTTT---------C-AC--A-G-----TT-GG-A--C-AC-CA-GAG----ATAG-A-T-AATGA----CCA--AT-TTAC
gi|56104                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------AT-TA-TA--------CG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-C--TT-G-A-A--TT---TCC-C-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--AGTT--------C-T---GCC--A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--C--C-ATTAT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------G-AT-------A----TA----A-TTC---A-----------TG-----TA-C--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-C---A----A------------T-A-A--AT-T---------CA--T--T-T-----------AA---A-----AC-A-TTT-----T----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTTA--AA-A-A-T--C----AC-A-AA-AT-C-C-TTT-A-C-T-TT--TTAT-C--TTC-A-A--AAC-T-CTAG-AG-A---AC--T-C----T-CT-T-TAAAGTC--TCTC--T--AAA------G--TACC--TAA-A--C-T-GAA-A-CGG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-TAC-AGATAAC-GCGAC--------TAC-A--TCT----C----A-T-A---T---T----AC-AT-CT-TT-TC-TTG---TT-TA---C--T---T----A---A--CACAG-TA-A-TT-AC----T-G-GGGTCTCCCA-G-----C-AT--A-G-----GT-GG-A--C-AC-TG-GAG----ATCG-A-T-AATGA----CCA--ATATTA
gi|56105                      : TAC-G--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-A-----C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------AT-TA-TA-------A-G--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-C-ATTT-T--G---AA--G-AA-AAA---GTT--------C-T---TCC--A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--C--C-GTTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------T-AT-------G----TA----A-TTC---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---A----A------------T-G-A--AT-AA--------TA--T--T-T---T-------AA---G-----AT-T-TTT-----T----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTTA--AA-C-A-T--C----AC-A-AA-AT-C-C-TTT-C-C-T-TT--TTAT-C--TTC-G-A--AAC-T-CTAA-AG-A---AC--T-C----C-CT-T-T-----T-GTGGC--C--AAG---AC-G--TACC--TAC-A--C-T-GAA-A-CAG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-TAC-AGATAA--ACGAC--------CAC-A--TCT----C----A-T-A---G---T----AA-GT-CT-TT-TC-TTG---TT-TA---C--C---T----A---A--CACAG-TA-A-TT-AC----T-G-GGGTCTTTCA-G-----C-AC--A-G-----GT-GG-A----ACATG-GAG----ATTG-A-T-AATGA----CCA--AT-TTAC
gi|56106                      : TACAG--TCAAA-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------GT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--AGTT--------T-G---GCC--A-T-TTT-A------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--G--C--C-GCTGT-T-T-TC---------------------CG-TGT-TT-G-T-T---------T-AT-------A----TA----A-TTC---A-----------TA-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-CT-----T-G-T---A----A------------T-A-A--TT-T---------TT--TTAT-T---T-------AA---A--------T-TTT-----C----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--C-TTTA--AA-C-A-T--C----AC-A-AA-AT-C-CTTTT-C-C-T-TT--TTAT-C--TTTAG-C--AAC-T-CAAA-AA-A---AC--T-C----T-CA-T-C-----C-GTTGC--T--AAG---CC-A--TACC--TAA-A--C-T-GAA-A-CAT-GT---TTTCTA-T--AA-TG-TAA-AAATAAC-GC-AC--------TAC-A--TCT----C----A-T-A---T---T----AA-GT-AT-TT-GCTTTG---TC-TA---C--T---TA---A---A--CAC-G-TA-ATTT-AC----C-G-GGATCTTTTTCG-----C-AC----G-----GTGGG-A--C-AC-TG-GAG----ATCG-A-T-AATGA----CCA--AT-TTAC
gi|56107                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTT---AAA-T-C-TT-TGGC------------------AT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-TCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CCATTT-T--G--------------------T--------C-------------------------------GA-A-------A-AAGATTT--A--C--C-GCTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-G-------------------------------------------------------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---A----A------------T-A-A--AT-T---------TA-----T-T---T-------AA---A-----AT-TATTT-----T----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTTA--AA-C-A-T--C----AC-A-AA-AT-T-C-TTT-C-C-T-TT--TCAT-C--TTC-G-A--AAC-T-CTAA-AG-A---AC--T-C----T-AT-T-T-----T-GTGGA--C--AAG---CC-A--TACC--TAA-G--C-T-AAA-A-CAG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-TAC-AGATAAA-GCGAC--------TAC-A--TCT----C----A-T-A---T---T----AC-AT-CT-TT-TC-TTG---TG-TA---C--T---T----A---A--CACAG-TA-A-TT-AC----T-G-GGGTCTTTCA-G-----C-AC--A-G-----AT-GT-A--C-AA-CA-GAA----ATCG-A-T--ATGA----CCA--AT-TTAC
gi|56108                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---AA-TA-AAC---C-G-CC--G----TC--T-----TTT--G---T-T--T-TTTT---CAA-T-A-TT-TGGC------------------AT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-
gi|56109                      : TACAG--TAAAG-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTTTG-AAA-T-C-TT---GC------------------GCATA-TA-------ATACATACAGAAA-T-T-TG-GAG-A--T--T-G-A--TT-G-ATA--TC---TCC-G-TCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA---GTT--------C-T---GCC--A-T-TTTTG------T---A-GA-A-------A---GAGTT--A--C--CAGCTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------T--T-------A----TA----A-TTC---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---A----A------------T-A-A--AT-T---------TA--T--T-T---A-------AA---A-----AT-T-TTT----------AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTTA--AA-C-A-T--C----ACAA-AA-AT-T-C-ATT-T-T-A-CT--TTAT-C--TTC-G-A--AAC-T-CTAA-AG-A---AC----C----T-CT-T-T-----T-GTGGC--C--AAG---CC-G--TACC--TAA-A--C-T-GAA-A-C-G-GT---TTTCTA-T--AA-TG-TAC-AGATAAC-GCG-----------AC-A--TCT----CATCTA-T-A---T---T----AC-AT-CT-TT-TC-TTG---TTCTA---T--TA--T----ATATA--CACAG-TATA-TT-AC----T---GGGTCTTTCA-G-----C-AC--A-G-----GT-GGAA--C-AC-TG-GAG----ATCG-A-T-AATGA-----CA--TT-TTAC
gi|56110                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---T-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T---------------T-C-TA-T-------------------------A-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CCATTT-T--G---AA--T-AA-AAA--AGTT--------C-T---GCC--C-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--C--C--T-ACTAT-T-T-TC----------------------A-TGT-TT-G-C-T---------T-TT-------A----TA----A-TTC---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---A----------------------------------------------------------------------------------T----AA--------T-G-ATT-AT--T---T--G-TTTA---------T--C----AC-A-TA-AT-T-C-AAT-C-G-T-TT--TTAT-C--TTC-A-A--AAC-T-CAAA-AG-A---AT--T-C----T-CC-T-C-----T-GTGGC--T--AAG---CC-G--TACC--TAA-A--C-T-GAA-A-CGG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-GAA-AAATAAC-GCGAC--------TAC-A--TTT----C----A-T-A---T---A----AA-GT-CT-TT-TC-TTG---TT-TA---C--T---T----A---A--CACAG-TA-A-TT-AC----TGG-GGGTCTTTCT-G-----C-AC--A-G-----GT-GA-A--C-AC-CG-GAG----ATCG-A-T-AATGA----CCA--AT-TTAC
gi|56111                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-TGGC-TTTT---GAA-T-C-TT-TGGCTATTATATATTTTTAATTAT-TAATA-------ACG--------AAAT-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CCATTT-T--C---AG--A-AA-AAA--AGTT--------C-T---GC---A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAATT--A--C--C-GCTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-T-A-T---------A-AT-------A----TA----A-TTC---A-----------TT-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-----A----A------------T-G-A--AT-T---------AT--T--T-T---T-------AA---A-----AT-T-TTA-----T-------CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTTA--AA-C-A-T--C----AT-A-AA-AT-C-C-TTT-C-C-T-TT--TTAT-C--TTC-G-A--AAC-T-CAAA-AG-A---ACTAT-A----T-CT-T-T-----T-GTGGC--T--AAG---CC-G--TACC--TAA-A--C-T-GAA-A-TGG-GT---TTTCTA-T--AA-T--TAA-----------------------------------------G-T-A---T---T--------------T-CC-TTG---TT-TA---C--C---TA---A---A--CACAG-TA-A-TT-AC----C-G-GGGTCTTTAA-G-----C-AC--A-G-----GT-GG-A--C-AT-TG-GAG----ATCG-A-T-AATGA----CCA--
gi|56112                      : TACAG--TCAAA-T--C--TC---GA-TA-AACTCCC-G-CCCCA----CC--CCCCCGTTT--G---T-T--C-TTTT---GTA-T-C-TT--GGC------------------GT-T--TA-------A-G--------AA-T-T-TG--CG-A-----G-A-A--TT-G-A-A--TT----CC-G-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--ATTT--------CAG---GCC--A-T-TTT-A------T---A-GA-A-------A-AAGATTG--A--C--C-CCGCT-T-T-TC---------------------CG-TGT-TT-G-T-T---------T-AT-------A----TA----A-TTC---A-----------TGA----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TTTC------T-G-T---A----A------------T-A-A--AT-T---------TA--T--T-T---T-------TA---A-----AA-T-CTT-----T----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--C-TTTA--AAAC-A-T--C----AA-A-AA-AT-C-C-TTTTC-C-T-TT--TTAT-C--TTTAG-C--AAC-T-CAAA-AA-A---AC--T-CCTCCT-CC-T-G-----C-GTGG---T--AAG---C--A--TACC--TAA-A--C-T-GAA-A-CAT-GT---TTTCTA-T--AA-TG-TAA-AAATAAC-GCGAC--------TACTT--TCT----C----A-T-A---T---T----TA--------------------T-TAGATC--T---T----A---A--CACAGTTA-A-TT-AC----CGG-GGGTCTTTTT-G-----CAAC--G-G-----GT-GG-A--C-AC-TGAGAG----ATCG-A-T-AATGG----CCA--TT-CTAC
gi|56113                      : TACA---TCAAC-TGCT--TC---G--TA-AAC---CAG-CC--A----CCAAT-----TTG--A---T-TATC-TTTT---GAA-T-C-TT--GGC------------------AT-TA-TA-------ACG--------AA-TATATG-GCG-AAAG--A-A-A--TT-G-A-A--TT---TC--G-CCATTT-TTGA---AA--G-AA-AAA--AGTT--------C-T---GC---A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-A-GAATT--AACCGAC-GCTGTATAT-TC---------------------CC-TAT-TT-G-C-T---------T-AT-------A----TATAGAA-TT----A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TTAT------T-G-T---T----A------------T-ATA--AT-C---------TA--T--T-T---T-------GA---A-----AT-T-TTT-----TTAATAA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTTA--CA---A-T--C----AC-A-AA-AT-C---TTT-C-C-T-TT--TTAT-C--TTC-GCA--AAC-T-CTAA-AG-A---AC--T-C----T-ATAT-T-----T-GTGGC--C--AAGG--CC-A--TACA--TAA-A--C-TCGAA-T-CGG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-TAC-AGATAACAGTAAC--------TAC-A--TCT----C----A-T-A---TA--T----AC-AT-CT-TT-TC--TG---TT-TA---C--T---T----A---A--CACCG-TA-ATTT-ACT---T-A-GGGTCTTTCA-G-----C-AC--AGG-----GT-GG-A--C-AC-CA-GAT----ATAG-A-T-AATGA----CCAG-AT-TTAC
gi|56114                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------AT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GTG-A--T--G-A-C--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AA---AGTT--------C-T---GCC--A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--C--C-GCTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------T-AC-------A----TA----A-TTC---A-----------AG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---A----A------------T-A-A--AT-T---------TA--T--T-T---G-------AA---C-----CA-T-TTT-----T----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--C-TTTA--AA-C-A-T--C----AC-A-AA-AT-C-C-TTT-A-C-T-TT--TTAT-C--TTC-G-T--AAC-T-C--A-AG-A---AC--T-C----T-CT-T-T-----T-GTGGA--C--AAG---CC-
gi|56115                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-A-CC--G----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TT
gi|56116                      : TACAG--TTAAA-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTGT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------GT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CCATTT-T--G---AA--G--A-AAA--AGTT--------C-----GCC--A---TTT-A------T---A-G--A-------A-AAGAGTT--G--C--C-GCTGT-T-T-TC---------------------CG-TGT-TTCG-T-T---------T-AT-------A----TA----A-TTC---A-----------TA-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-CTA-A----A------------T-A-A--AT-T---------TAT-T--T-T---T-------AA---A-----A----TTT-----C----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--C-TTTA--AA-C-ATT--C----AC-A-AA-AT-C-C--TT-C-C-T-TT--
gi|56117                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTCT---GAA-T---TT-TGGC------------------GT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CAATTT-T--G---TA--G-AA-AAAG-AGTTGCCTCTCTT-T---TCC--A-TGTTT-GCATATAT---A-TA-ATTCAAATA-AAGAGTT--A--T--C-ACTCT-T-T-TC---------------------CA-TTT-TT-G-C-A---------T-AT-------A----TA----T-TTC---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---------------------T-A-A--A-------------A-------------------AG---A-----AT-GATTT-----C----AA-CA-----T-G-GTT-AT--T---
gi|56118                      : TACAG--TCAAC-T--C--TTTCTGA-TA-AAC---C-GACC--AAACGCC--TC----TTT--GGTAT-C--C-TTAT---GAA-TTC-TT-TGGC------------------AT-TA-TATTACACAACG--------AA-T-T-TG-GCG-AG-T--GTATA--TT-G-A-A--TTGAGTCC-GGCCATTT-T--GCCAAA--A-AA-AAATGAGTT--------C-T---GCC--ACT-TTT-G------T---A-GA-A-------ACGAGA-TT--A--C--A-GCTAT-T-T-TCT--------------------CA-TGT-TT-GGC-T---------TGAT-------A----TA----A-TTC---------------TGCA---TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TA-C------T-G-T---A----AGTAACA------T-A-ATTATAT---------TAG-T--T-T---T-------AA---A-----AT-TGTTC-----C----AATCA-----T-G-ATTTATCAT---T--G-TTTACAAA-CTA-T--CGCGGAC-ATAA-ATGT-C-TTT-C-GGT-TTCATTAT-C--TTC-C-AGTAAC-T-AAAATAG-AGTTAC--T-CCGA-T-CC-T-T-----G-ATGGC--T--AAGGGACCAG--AACT--TAA-GATC-T-GAA-A-CGGTGTAGGTCGTGA-T--AAGTG-TTA-AA-TAAA-TCGACAGCTGATTTAC-A--TCTGCATC----AAT-A---T---T----AA-GT-CT-TT-TC-TTG---TT-TA---C--T---TACTAA---A--CATCG-TA-A-TTAAC----T-GTGGGT
gi|56119                      : TACAG--TCACC-T--C--TC---GA-TA-A-C---C-G-CCC-A----CC--T-----TTT--G---T-T--CTTTTT---GAA-T-C-TT-T-GC------------------TT-AA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCATA--T--G-A-ATCTT-GAA-A--TT---TCC-A-CCA-AT-T--G---AA--G-GACAAAC-AGTT--------C-C---GCCAAA-T-TTTAG------T---A-GA-A-------A-AAG-TTT--G--C--C-GCTGT-C-CGTT---------------------CA-TGT-TG-G-CTT---------T-AT-------A----GA----A-TCC---A-----------TG-----TA-
gi|56120                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTT---GAA-T-C-TA-TGGC------------------GT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G--CA------------------------------------------------A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--C--C-TCTTT-T-T-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACA-TTT-TT-G-C-T---------T-AT-------A----TA----A-TTC---A-----------GG-----AA-A--------------AGAGTGGTTGCTT-------------A------TATCATTCATGTAAATAT-TT-T------C-GTT---A----A------------T-A-A--AT-T---------GA--T--T-T---T-------AA---A-----AA-C-ATT-----C----AG-CA-----T-G-GTT-AT--T---T--G-TT
gi|56121                      : TATAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TG-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--T---T-T--C-TCCT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------GT-GA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G--CA------------------------------------------------A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--T--C--C-TCTCT-T-T-TT---------------------CA-TGT-TT-G-C-TTATACAGTGT-AT-------A----CA----A-TTC---A-----------AA-----TA-A--------------AGAGT-------T-------------ACCCCTCT----------------T-TT-CCATTTTT-GCT---T----A------------T-A-T--AT-TTCATGTACATA--T--T-T---TCTGTTTAAA---A-----ATAA-TTT-----C----AA-CA-----T-G-GTT-AT--T---T--G-TTTA--AA-C-A-T--C----AC-A-TA-A----C-TTT-
gi|56122                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-A-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------AT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-G-A--TT-G-A-A--TT---TCT-G-CCATTT-T--G---A
gi|56123                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTTG-G---T-T--C-TTTT---GAA-T-C-CA-TGGC------------------GT-TA-TA-------ACG--------AATT-T-TG-GCG-A--T--G---A--TT-G-A-A--TT---TCT-G--CATT---------A----------------------------------------TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--C--C-TCTTT-T-T-TTTTTTTTA--------------CA-CTT-TT-G-C-T---------T-AT-------A----TA----A-TTC---A-----------GG-----AA-AAGGAGTGTGTGCTTA-----------T-------------A------T----------------CATT-CA-----TGG-T---A----AATATTTTCGTAAT-A-G--AT-T---------GA--T--T-T---A-------AA---A-----AC-A-TTC-----C----AG-CA-----T-G-GTT-AT--T---T--G-TTTT--AT-C-A---------AC-A-A
gi|56124                      : TGCAG--TCAAC-T--T--TC---GA-TA-AAC---C-G-TC--A----TC--T-----TTT--G---T-T--C-CTCT---GAA-T-T-TTGTGGC------------------AT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GTG-A--T--G-G-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CGATTT-T--G---
gi|56125                      : TACAG--TCAAA-T--C--TT---GA-TA-AAC---T-A-CC--A----CC--T-----TGT--G---T-T--C-TTCT---GAA-T-T-TA-TGGA------------------GA-TA-TA-------GCG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-C--TT---TCT-G-CCATTT-T--G---
gi|56126                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AA----C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--CTTTTT---GAATT-C-CA-TGGC------------------GT-TA-T--------ACG--------AA---T-TG-GCGAA--T--T-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC---CAATTT-T--G---AA--GCAA-AAG--AGTTAC------C-T---CTT--T-T-TTT-G------T-----------------------TT--T--T--T-TTTTT-T-T-TTTTTA-----------------CATTTT-TT-G-C-T---------T-AT-------A----TA----ATTTC---AGAGAAAAGGAGTGGTGCTTA-A--------------A-----------TCATTCATGTAAATA------T----------------T-TT-T------T---T---A----A------------T-A-A-----T---------TG--T--T-T---T-------AA---A-----A--A-CTT-----T----AG-CA-----T-G-GTT-AT--T---T--G-TTT---TA-T-A-T--A----AC-A-A
gi|56127                      : TACAG--TCAAA-T--C--TC---GC-TA-AAC---T-G-CC--A----CA--T-----GTT--G---T-T--T-TTCT---GAA-T-G-TA-TGGC------------------GA-TA-CA-------ACG--------AA-T-T-TG-GTA-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-A-CCATAT-T--G---GG--G-AA-TA------T--------C-T-----T--A---TTT-G------T------------------AAAAGTT--A--T--C---------------------------------------T-TT-G---------------AT-------G----CA----A---------------------------A-A--------------A-----------C-------------A------T----------------C-T---------T-G-T---A----A--------------A-A-----T---------AA--T--T-T---T-------CA---T-----AT-T-TTT-----T----AG-CA-----T-G-ATT-taagatttttatttcaaa
gi|56128                      : TACAG--CCAAC-T--C--TC---GA-TA-GGC---C-A-CC--A----C---T-----TTT--G---A-T--T-TTCT---GAA-T-T-TA-TGGT------------------AT-TA-TA-------ATG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-A-CCTTCT-T--T---GG--G-A------------------------------A-T-CTT-G------T---A-TATG-------T-GAGAATT--A---------TGT-T-T-TC---------------------CT-TAT------C-T---------T-CA-------A----TA----C-CTG---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------A-------------A------T----------------A-GC-T------T-G-T---A-------------------A-A--ATAT---------CA--T--T-T---T-------CA---A-----AA-T-TTT-----C----AG-CA-----T-A-ATT-
gi|56129                      : TACAG--TCAAA-T--C--TC---GAGTA-AAC---C-A-CC--A----CT--T-----ATT--G--------C-TTCT---GAA-T-G-TC-TGGC------------------GA-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A-----G-ATA--TT-G-A-ATGTT---TTC-G-CTA
gi|56130                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---TA-TA-AAC---C-A-CA--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTCT---GAA-T-----------------------------T-TA----------------------------TG-GCA-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCT-A-CCATCT-T--G---G-------------------------------GTA--A-T-CTT-G------T---A-TA-A-------GCAAGATTT--A--T--C-------T-T-TC-------------------------AT-TT-A-T-T---------T-CCA------A----TA----C-TTG---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------A-------------A------T----------------A-TC-A------T-G-T---A-------------------A-A--ATAT---------TA--C--T-T---T-------CA---A-----AT-G-TTT-----T----AG-CA-----T-G-ATT-
gi|56131                      : TACAG--TCAGC-T--C--TC---GA-TACAAC---G-G-CC--A----C--------------G---T-T--C-ATTC---CAA-T-CATT-TACC------------------AT-TA-TA-------AGG--------AA-T-C-TG-
gi|56132                      :  ATAG--TCAAC-T--C--TC---CA-TA-AAC---C-G-C---A----CC--T-----TTTTTG---T-T--C-TTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------AT--A-TA-------ATG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-A-A-A--TT---TCC-G-TCATTT-TT-G---AA--G-AA-AAA--AGTT--------C-TCT-GCC--A-T-TCT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--T--T-ACTAT-T-T-TC----------------------A-TGT-TT-G-C-T---------T-AC-------A----TA----A-TTC---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-C---ATTGAA------------T-A-A--AT-T---------TA--T--T-T---TTC-----AA---A-----AT-T-TT-----------AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTTA--AA-C-A-T--C----AC-A-GA-AT-T-C-TTT-C-G-T-TT--T-AT-C--TTC-A-A--AACCT-CAAA-AG-A---AC--T-C----T-CT-T-C-----T-GTGGC--T--AAG---TC-G--T-CC--TAA-A--C-T-GAA-A-CGG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-TAA-AAATAAC----AC--------TAC-A--TCT----CT---A-T-A---T---T----AA-GT-CT-TT-TC-TTG---TT-TA---C--T---T----A---A--AACAG-TA-T-TT-AC----T-G-GGGTCTTTCT-G-----C-AC--A-G-----GT-GA-A--C-AC-CG-GAG----ATCG-A-T-AATGA----CTA--CT-TTAC
gi|56133                      :  ATAG--TCAAC-T--C--TC---CA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTTT-G---T-T--C-TTTTT--GAA-T-CCTT-TGGC------------------CA-TA-TA-------ATG--------AA-T-T-TG--CGTA--T--G-A-A--TTTA-A-A--TTC--TCC-G-TCATTT-TT-G---AA--G-AA-AAA--AGTT--------C-TCTCGCC--A-T-TCT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--T--T-ACTAT-T-T-TT---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------T-AC-------A----TA----A-TTC---A-----------TG-----TATA--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-CATGA----A------------T-A-A--A--T---------TA--T--T-T---TTCA----AA---A-----A----TTT-----T----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTTA--AA-C-A-T--C----AC-AGAA-GT-T-C-TCT-CTC-G-TT--TTAT-C--TTCAA-A--AAC-TCCAAA-AG-A---AC--T-C----T-CT-T-T-----CTGTGGCTTT--AAG---TC-GTCTACC--TAA-A--CTT-GAA-A-CGG-GT---TTTCTATT--AA-TGATAA-AAATAAC----AC--------TAC-A--TCT----C----A-T-A---T---TA---AA-GT-C--TT-TC-TTG---TT-TA---CTTT---T----A---A--AACAG-TA-T-TT-A-----C-G-GGTTCTTCCT-G-----C-AC--A-G-----GT-GA-AACC-AC-CG-GAGC---ATC--A-T-AATG
gi|56134                      :  ACAGGTTCAAC-T--C--TC---AA-TATAAC---C-G-CC-------CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTTTTATAA-T-A-TT-TGGC------------------AT----TA-------ATGC-------AA-T-T-TT-GCA-A--T--G-A-A--TT-T-A-A--TT---TCA-T-CCATTTAT--G---AT--G-A
gi|56135                      :    AG--TGAACAT--CCTTC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TCT--G---TGT--C-TTTT---GAA-T-C--T-TGGC------------------GT-TA-TT-------ACG--------AA-T-T-TGCGCG-A--T--GAA-A--TT-G-A-A--TT---TAC-G-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--AGAG--------C-G---GTC--C-T-TGT-A------TATAA-GA-A-------A-AAGATTT--A--T--C-GCTGT-T-T-TCG--------------------TA-CTTATT-G-T-T---------T-AT-------A----TA----A-TTCCAGA-----------TA------A-A--------------A-----------T-------------A-----------------------G-TT-C------T-G-T---A----AG-----------T-A-A--A--G---------TA--T--T-T---T-------TA---A-----AT-T-TTT-----T----AA-CA-----T-G-A---AT--T---T--T-TTT
gi|56136                      :                                                                               T---GAA-T-C-AA-TGTC------------------AT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--T--A-A-A--TT----------AATT-------------------GA--ATTT--------C-C---GCC--A-T-TTT-G------A---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--C--C-GCTCT-T-T-TG---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------T-AT-------ACATATA----A-TTC---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---A----A------------T-C-A--AT-T---------GA--T--T-T---TT------AC---A-----AT-T-TTT-----TTT--AA-CAAGAATTAG-ATT-AT--T---T--G-TTTA--AA-T-A-T--C----AC-A-AA-AT-C-C-TGT-C-C-T-TT--TTTTTC--TTC-G-A--AAC-T-CAAA-AG-A---AC--T-C----T-CT-T-C-----C-ATGAC--G--AAG---CT-A--TACC--CAA-T--C-T-GAA-T-TAT-GT---TTTCTA-T-------------AATAAC---------------------------------------------------A-GC-AT-TT-TC-TTG---TT-TA---T--T---T----A---A--CACAG-CA-A-TT-AC----C-G-AGGTCTTTTT-G-----C-AC--G-G-----GT-GG-A--T-GC-CG-GAG----ATCG-A-T-AATGA----CCA--AT-TTAC
gi|56137                      :                                                                                                                     T-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GTG-A--TCGA-A-A--TT-G-A-A--TT---TCCCG-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--G--T--------C-T---GCT--A-C-CCA-G------C---A-GA-A-------
gi|56137                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -GCTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------T-CT------------------A-TTC---A------------A-----TA-A--------------A-----------T-------------A-----------------------T-TT-C------T-GTT---A----A------------T-A-A--AT-T---------TA--T--T-TGAAT-------AA---C-----AT-T-TTT-----A----AC-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--C-TTTA--AATC-A-T--CA---AC-ATAA-AT-CGC-TTTAC-T-T-TT--TTAT-C--TTC-G-T--AAC-T-C----AG-A---AC--T-C----TACT-TGT-----T-GTGGA--C--AAG---CC-T--TACCATTAACA--C-T-GAA-ACCGA-GT---TTTCTA-TGCAA-AG-TAACAGATAAC-TCGAC---------AC-AATCCT----C----AGT-A---G---C----AAGGT-CT-TTCTC-TTGCTTTC-TA---C--T---T---------------G-T--A-TC-AT----C-G-TATTCTATCC-GTCTATC-AC--A-A-----GT-GG-AC-C-AA-TG-AGGACGAATTG-A-TGAATGA----CCA--AT-TTtccacgtacgatcaactcaacacagagtaaaacgaggttaatagaaaagaatagtgacgacgcatcggctgttttccatgtttgcttctattcaataaatatttctgttaataaatttatttgaataacatttttaaccatgattatttctttaaatcatcaacataaatcgctttacttttttatcttcgtaactcagaactctacttgttgtggacaagccttaccattaacactgaaaccgagttttctatgcaaagtaacagataactcgacacaatcctcagtagcaaggtctttctcttgctttctacttgtatcatcgtattctatccgtctatcacaagtggaccaatgaggacgaattgatgaatgaccaattt
gi|56138                      :                       ttataacgaatttggtgatcgaaattgaatttcccgccattttgaagaaaaagtctgctacccagcagaatccacgtacgatcaactcaacacagagtaaaacgaggttaatagaaaagaatagtgacgacgcatcg--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CCATTT-T--GA--AA--A-AA-AAA--AGTT--------C-T---GCA--C-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-A
gi|56139                      :                                                                                                                                                                                 --TT---CCC-A-CCACTT-T--G---AA--G-AA-ATA--AGTC--------T-C---GC---A-T-TTT-G------T---ATGT-A-------A-AAGAGTTGAA--C--C-GCTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-G-C-C---------T-TT-------A----TAAT--A-TTC---AC----------TT-----TC-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-CT-----T-G-T---A----AT-----------T-T-A--AT-TG--------TAAGTTGT-T---T-------AA---A-----AT-T-GTT-----T----A
gi|56140                      :                                                                                                                                                                                          C-G-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--AGTT--------C-T---GTC--A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--C--T-GCTGT-T-T-TC---------------------TA-TGT-TT-G-T------------------------------------------------------------------------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---A----A------------T-A-A--AT-T---------TA--T--T-T---T-------TA---A-----AA-T-TTT-----C----AA-C
gi|56141                      :                                                                                                                                                                                               CATTT-T--G---AAAGG-GG-GAA--A--T--------C-G---GCC--A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--G--C--C-GCTGT-T-T-TC---------------------CT-TAT-TT-G-C-T---------T-ATATAAAGAA----TA----A-TTC---T-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---A----A------------T-A-A--AT-T---------TA--T--T-T---T-------
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lowQualScore                  :      ..     . .. ..  ...  .  .   ... . .  .. ....  .. .....   .. ... . .. .    ...   . . .  .    ................... .  .  .......   ........  . . .  .   . .. .. . . ..  . . . ..  ...   . .      . .. ...  .. .  .   .. .  ..............  ... . .   . ...... ... .  . ....... .       .. .. .. ..    . . .  .....................  .   .  . . . ......... .  ....... ....  .... .   ... ..................  . ........................................ ...... ................ .  . ...... . . ..................... . . ..  . .........  .. .. . ...........  ... ..... ....   ..........  .  ..... . .   .  .. ... .. .    ..  . . . .. ....  . .  .  . . .   . . . .  ..    . ..   . . ..   . . .  .  . ...  .. . .... .  . . .......     .....   ...  ....    ..   . .. . .   . . ...  ...      . ..  .  .   .       ..    ........   . ..   .... .... . . ....... ....  .. .. .  .  .   ...  .  ... .. ... .... ... ..     .  . .  .  ...... .          . ..... .  .. . .....  .  . .. .  .  .   ....    . . .     ....   ..  .    
lowQualScore                  :      77     2 77 77  111  2  4   111 2 2  99 6666  77 22222   11 111 2 33 4    000   2 2 4  2    7777777777777777777 2  2  8888888   44444444  4 2 2  2   6 99 66 4 4 77  2 2 2 66  222   1 1      1 99 111  77 2  2   22 2  00000000000000  444 2 2   5 666666 222 2  2 1111111 6       88 88 88 99    3 3 3  222222222222222222222  3   3  3 3 3 222222222 3  5555555 7777  8888 3   333 333333333333333333  2 9999999999999999999999999999999999999999 777777 5555555555555555 3  6 666666 3 9 888888888888888888888 3 3 88  9 777777777  44 55 3 66666666666  333 33333 8888   3333333333  3  44444 4 4   4  11 777 22 6    44  5 7 7 44 4444  7 2  9  9 9 8   6 9 8 8  44    8 55   5 8 55   8 8 5  8  6 222  55 8 0000 8  6 8 6666666     11111   000  1111    55   9 66 9 9   0 0 666  555      0 88  0  8   7       11    33333333   7 33   2222 2222 3 0 6666666 9999  22 22 7  7  7   888  6  888 88 444 4444 888 22     6  6 8  6  222222 6          7 22222 7  33 7 22222  7  7 00 7  7  7   2222    7 7 7     7777   11  8    
consensus                     : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------GT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--AGTT--------C-T---GCC--A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--C--C-GCTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------T-AT-------A----TA----A-TTC---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---A----A------------T-A-A--AT-T---------TA--T--T-T---T-------AA---A-----AT-T-TTT-----T----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTTA--AA-C-A-T--C----AC-A-AA-AT-C-C-TTT-C-C-T-TT--TTAT-C--TTC-G-A--AAC-T-CAAA-AG-A---AC--T-C----T-CT-T-T-----C-GTGGC--T--AAG---CC-G--TACC--TAA-A--C-T-GAA-A-CGG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-TAA-AAATAAC-GCGAC--------TAC-A--TCT----C----A-T-A---T---T----AA-GT-CT-TT-TC-TTG---TT-TA---C--T---T----A---A--CACAG-TA-A-TT-AC----C-G-GGGTCTTTCT-G-----C-AC--A-G-----GT-GG-A--C-AC-CG-GAG----ATCG-A-T-AATGA----CCA--AT-TTAC
Reference ( family-417 )      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------GT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--AGTT--------C-T---GCC--A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--C--C-GCTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------T-AT-------A----TA----A-TTC---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---A----A------------T-A-A--AT-T---------TA--T--T-T---T-------AA---A-----AT-T-TTT-----T----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTTA--AA-C-A-T--C----AC-A-AA-AT-C-C-TTT-C-C-T-TT--TTAT-C--TTC-G-A--AAC-T-CAAA-AG-A---AC--T-C----T-CT-T-T-----C-GTGGC--T--AAG---CC-G--TACC--TAA-A--C-T-GAA-A-CGG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-TAA-AAATAAC-GCGAC--------TAC-A--TCT----C----A-T-A---T---T----AA-GT-CT-TT-TC-TTG---TT-TA---C--T---T----A---A--CACAG-TA-A-TT-AC----C-G-GGGTCTTTCT-G-----C-AC--A-G-----GT-GG-A--C-AC-CG-GAG----ATCG-A-T-AATGA----CCA--AT-TTAC
gi|56103                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---AA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-C--C-TTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------AT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-A-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--AGTT--------C-T---GCC--A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAATT--A--C--C-GCTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------T-AT-------A----TA----A-TTC---A-----------GG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---T----A------------T-A-A--AT-T---------TA--T--A-T---T-------AA---A-----AT-T-TTT-----T----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTTA--AA-C-A-T--C----AT-A-AA-AT-C-C-TTT-C-C-T-TT--TTAT-C--TTC-A-A--AAC-T-CTAA-AG-A---AC--T-C----T-CT-T-T-----T-GTGGC--C--AAG---TC-G--TACC--TAC-A--C-T-GAA-A-CGG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-TAC-AGATAAC-AGGAC--------TAC-A--TCT----C----A-C-A---T---T----AA-AT-CT-TT-TC-TTG---TT-TA---C--T---T----A---A--CACAG-TA-A-TT-AC----T-G-GGGTCTTT---------C-AC--A-G-----TT-GG-A--C-AC-CA-GAG----ATAG-A-T-AATGA----CCA--AT-TTAC
gi|56104                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------AT-TA-TA--------CG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-C--TT-G-A-A--TT---TCC-C-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--AGTT--------C-T---GCC--A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--C--C-ATTAT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------G-AT-------A----TA----A-TTC---A-----------TG-----TA-C--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-C---A----A------------T-A-A--AT-T---------CA--T--T-T-----------AA---A-----AC-A-TTT-----T----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTTA--AA-A-A-T--C----AC-A-AA-AT-C-C-TTT-A-C-T-TT--TTAT-C--TTC-A-A--AAC-T-CTAG-AG-A---AC--T-C----T-CT-T-TAAAGTC--TCTC--T--AAA------G--TACC--TAA-A--C-T-GAA-A-CGG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-TAC-AGATAAC-GCGAC--------TAC-A--TCT----C----A-T-A---T---T----AC-AT-CT-TT-TC-TTG---TT-TA---C--T---T----A---A--CACAG-TA-A-TT-AC----T-G-GGGTCTCCCA-G-----C-AT--A-G-----GT-GG-A--C-AC-TG-GAG----ATCG-A-T-AATGA----CCA--ATATTA
gi|56105                      : TAC-G--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-A-----C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------AT-TA-TA-------A-G--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-C-ATTT-T--G---AA--G-AA-AAA---GTT--------C-T---TCC--A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--C--C-GTTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------T-AT-------G----TA----A-TTC---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---A----A------------T-G-A--AT-AA--------TA--T--T-T---T-------AA---G-----AT-T-TTT-----T----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTTA--AA-C-A-T--C----AC-A-AA-AT-C-C-TTT-C-C-T-TT--TTAT-C--TTC-G-A--AAC-T-CTAA-AG-A---AC--T-C----C-CT-T-T-----T-GTGGC--C--AAG---AC-G--TACC--TAC-A--C-T-GAA-A-CAG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-TAC-AGATAA--ACGAC--------CAC-A--TCT----C----A-T-A---G---T----AA-GT-CT-TT-TC-TTG---TT-TA---C--C---T----A---A--CACAG-TA-A-TT-AC----T-G-GGGTCTTTCA-G-----C-AC--A-G-----GT-GG-A----ACATG-GAG----ATTG-A-T-AATGA----CCA--AT-TTAC
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gi|56107                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTT---AAA-T-C-TT-TGGC------------------AT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-TCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CCATTT-T--G--------------------T--------C-------------------------------GA-A-------A-AAGATTT--A--C--C-GCTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-G-------------------------------------------------------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---A----A------------T-A-A--AT-T---------TA-----T-T---T-------AA---A-----AT-TATTT-----T----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTTA--AA-C-A-T--C----AC-A-AA-AT-T-C-TTT-C-C-T-TT--TCAT-C--TTC-G-A--AAC-T-CTAA-AG-A---AC--T-C----T-AT-T-T-----T-GTGGA--C--AAG---CC-A--TACC--TAA-G--C-T-AAA-A-CAG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-TAC-AGATAAA-GCGAC--------TAC-A--TCT----C----A-T-A---T---T----AC-AT-CT-TT-TC-TTG---TG-TA---C--T---T----A---A--CACAG-TA-A-TT-AC----T-G-GGGTCTTTCA-G-----C-AC--A-G-----AT-GT-A--C-AA-CA-GAA----ATCG-A-T--ATGA----CCA--AT-TTAC
gi|56108                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---AA-TA-AAC---C-G-CC--G----TC--T-----TTT--G---T-T--T-TTTT---CAA-T-A-TT-TGGC------------------AT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-
gi|56109                      : TACAG--TAAAG-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTTTG-AAA-T-C-TT---GC------------------GCATA-TA-------ATACATACAGAAA-T-T-TG-GAG-A--T--T-G-A--TT-G-ATA--TC---TCC-G-TCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA---GTT--------C-T---GCC--A-T-TTTTG------T---A-GA-A-------A---GAGTT--A--C--CAGCTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------T--T-------A----TA----A-TTC---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---A----A------------T-A-A--AT-T---------TA--T--T-T---A-------AA---A-----AT-T-TTT----------AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTTA--AA-C-A-T--C----ACAA-AA-AT-T-C-ATT-T-T-A-CT--TTAT-C--TTC-G-A--AAC-T-CTAA-AG-A---AC----C----T-CT-T-T-----T-GTGGC--C--AAG---CC-G--TACC--TAA-A--C-T-GAA-A-C-G-GT---TTTCTA-T--AA-TG-TAC-AGATAAC-GCG-----------AC-A--TCT----CATCTA-T-A---T---T----AC-AT-CT-TT-TC-TTG---TTCTA---T--TA--T----ATATA--CACAG-TATA-TT-AC----T---GGGTCTTTCA-G-----C-AC--A-G-----GT-GGAA--C-AC-TG-GAG----ATCG-A-T-AATGA-----CA--TT-TTAC
gi|56110                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---T-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T---------------T-C-TA-T-------------------------A-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CCATTT-T--G---AA--T-AA-AAA--AGTT--------C-T---GCC--C-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--C--C--T-ACTAT-T-T-TC----------------------A-TGT-TT-G-C-T---------T-TT-------A----TA----A-TTC---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---A----------------------------------------------------------------------------------T----AA--------T-G-ATT-AT--T---T--G-TTTA---------T--C----AC-A-TA-AT-T-C-AAT-C-G-T-TT--TTAT-C--TTC-A-A--AAC-T-CAAA-AG-A---AT--T-C----T-CC-T-C-----T-GTGGC--T--AAG---CC-G--TACC--TAA-A--C-T-GAA-A-CGG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-GAA-AAATAAC-GCGAC--------TAC-A--TTT----C----A-T-A---T---A----AA-GT-CT-TT-TC-TTG---TT-TA---C--T---T----A---A--CACAG-TA-A-TT-AC----TGG-GGGTCTTTCT-G-----C-AC--A-G-----GT-GA-A--C-AC-CG-GAG----ATCG-A-T-AATGA----CCA--AT-TTAC
gi|56111                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-TGGC-TTTT---GAA-T-C-TT-TGGCTATTATATATTTTTAATTAT-TAATA-------ACG--------AAAT-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CCATTT-T--C---AG--A-AA-AAA--AGTT--------C-T---GC---A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAATT--A--C--C-GCTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-T-A-T---------A-AT-------A----TA----A-TTC---A-----------TT-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-----A----A------------T-G-A--AT-T---------AT--T--T-T---T-------AA---A-----AT-T-TTA-----T-------CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTTA--AA-C-A-T--C----AT-A-AA-AT-C-C-TTT-C-C-T-TT--TTAT-C--TTC-G-A--AAC-T-CAAA-AG-A---ACTAT-A----T-CT-T-T-----T-GTGGC--T--AAG---CC-G--TACC--TAA-A--C-T-GAA-A-TGG-GT---TTTCTA-T--AA-T--TAA-----------------------------------------G-T-A---T---T--------------T-CC-TTG---TT-TA---C--C---TA---A---A--CACAG-TA-A-TT-AC----C-G-GGGTCTTTAA-G-----C-AC--A-G-----GT-GG-A--C-AT-TG-GAG----ATCG-A-T-AATGA----CCA--
gi|56112                      : TACAG--TCAAA-T--C--TC---GA-TA-AACTCCC-G-CCCCA----CC--CCCCCGTTT--G---T-T--C-TTTT---GTA-T-C-TT--GGC------------------GT-T--TA-------A-G--------AA-T-T-TG--CG-A-----G-A-A--TT-G-A-A--TT----CC-G-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--ATTT--------CAG---GCC--A-T-TTT-A------T---A-GA-A-------A-AAGATTG--A--C--C-CCGCT-T-T-TC---------------------CG-TGT-TT-G-T-T---------T-AT-------A----TA----A-TTC---A-----------TGA----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TTTC------T-G-T---A----A------------T-A-A--AT-T---------TA--T--T-T---T-------TA---A-----AA-T-CTT-----T----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--C-TTTA--AAAC-A-T--C----AA-A-AA-AT-C-C-TTTTC-C-T-TT--TTAT-C--TTTAG-C--AAC-T-CAAA-AA-A---AC--T-CCTCCT-CC-T-G-----C-GTGG---T--AAG---C--A--TACC--TAA-A--C-T-GAA-A-CAT-GT---TTTCTA-T--AA-TG-TAA-AAATAAC-GCGAC--------TACTT--TCT----C----A-T-A---T---T----TA--------------------T-TAGATC--T---T----A---A--CACAGTTA-A-TT-AC----CGG-GGGTCTTTTT-G-----CAAC--G-G-----GT-GG-A--C-AC-TGAGAG----ATCG-A-T-AATGG----CCA--TT-CTAC
gi|56113                      : TACA---TCAAC-TGCT--TC---G--TA-AAC---CAG-CC--A----CCAAT-----TTG--A---T-TATC-TTTT---GAA-T-C-TT--GGC------------------AT-TA-TA-------ACG--------AA-TATATG-GCG-AAAG--A-A-A--TT-G-A-A--TT---TC--G-CCATTT-TTGA---AA--G-AA-AAA--AGTT--------C-T---GC---A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-A-GAATT--AACCGAC-GCTGTATAT-TC---------------------CC-TAT-TT-G-C-T---------T-AT-------A----TATAGAA-TT----A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TTAT------T-G-T---T----A------------T-ATA--AT-C---------TA--T--T-T---T-------GA---A-----AT-T-TTT-----TTAATAA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTTA--CA---A-T--C----AC-A-AA-AT-C---TTT-C-C-T-TT--TTAT-C--TTC-GCA--AAC-T-CTAA-AG-A---AC--T-C----T-ATAT-T-----T-GTGGC--C--AAGG--CC-A--TACA--TAA-A--C-TCGAA-T-CGG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-TAC-AGATAACAGTAAC--------TAC-A--TCT----C----A-T-A---TA--T----AC-AT-CT-TT-TC--TG---TT-TA---C--T---T----A---A--CACCG-TA-ATTT-ACT---T-A-GGGTCTTTCA-G-----C-AC--AGG-----GT-GG-A--C-AC-CA-GAT----ATAG-A-T-AATGA----CCAG-AT-TTAC
gi|56114                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------AT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GTG-A--T--G-A-C--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AA---AGTT--------C-T---GCC--A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--C--C-GCTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------T-AC-------A----TA----A-TTC---A-----------AG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---A----A------------T-A-A--AT-T---------TA--T--T-T---G-------AA---C-----CA-T-TTT-----T----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--C-TTTA--AA-C-A-T--C----AC-A-AA-AT-C-C-TTT-A-C-T-TT--TTAT-C--TTC-G-T--AAC-T-C--A-AG-A---AC--T-C----T-CT-T-T-----T-GTGGA--C--AAG---CC-
gi|56115                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-A-CC--G----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TT
gi|56116                      : TACAG--TTAAA-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTGT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------GT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CCATTT-T--G---AA--G--A-AAA--AGTT--------C-----GCC--A---TTT-A------T---A-G--A-------A-AAGAGTT--G--C--C-GCTGT-T-T-TC---------------------CG-TGT-TTCG-T-T---------T-AT-------A----TA----A-TTC---A-----------TA-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-CTA-A----A------------T-A-A--AT-T---------TAT-T--T-T---T-------AA---A-----A----TTT-----C----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--C-TTTA--AA-C-ATT--C----AC-A-AA-AT-C-C--TT-C-C-T-TT--
gi|56117                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTCT---GAA-T---TT-TGGC------------------GT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CAATTT-T--G---TA--G-AA-AAAG-AGTTGCCTCTCTT-T---TCC--A-TGTTT-GCATATAT---A-TA-ATTCAAATA-AAGAGTT--A--T--C-ACTCT-T-T-TC---------------------CA-TTT-TT-G-C-A---------T-AT-------A----TA----T-TTC---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---------------------T-A-A--A-------------A-------------------AG---A-----AT-GATTT-----C----AA-CA-----T-G-GTT-AT--T---
gi|56118                      : TACAG--TCAAC-T--C--TTTCTGA-TA-AAC---C-GACC--AAACGCC--TC----TTT--GGTAT-C--C-TTAT---GAA-TTC-TT-TGGC------------------AT-TA-TATTACACAACG--------AA-T-T-TG-GCG-AG-T--GTATA--TT-G-A-A--TTGAGTCC-GGCCATTT-T--GCCAAA--A-AA-AAATGAGTT--------C-T---GCC--ACT-TTT-G------T---A-GA-A-------ACGAGA-TT--A--C--A-GCTAT-T-T-TCT--------------------CA-TGT-TT-GGC-T---------TGAT-------A----TA----A-TTC---------------TGCA---TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TA-C------T-G-T---A----AGTAACA------T-A-ATTATAT---------TAG-T--T-T---T-------AA---A-----AT-TGTTC-----C----AATCA-----T-G-ATTTATCAT---T--G-TTTACAAA-CTA-T--CGCGGAC-ATAA-ATGT-C-TTT-C-GGT-TTCATTAT-C--TTC-C-AGTAAC-T-AAAATAG-AGTTAC--T-CCGA-T-CC-T-T-----G-ATGGC--T--AAGGGACCAG--AACT--TAA-GATC-T-GAA-A-CGGTGTAGGTCGTGA-T--AAGTG-TTA-AA-TAAA-TCGACAGCTGATTTAC-A--TCTGCATC----AAT-A---T---T----AA-GT-CT-TT-TC-TTG---TT-TA---C--T---TACTAA---A--CATCG-TA-A-TTAAC----T-GTGGGT
gi|56119                      : TACAG--TCACC-T--C--TC---GA-TA-A-C---C-G-CCC-A----CC--T-----TTT--G---T-T--CTTTTT---GAA-T-C-TT-T-GC------------------TT-AA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCATA--T--G-A-ATCTT-GAA-A--TT---TCC-A-CCA-AT-T--G---AA--G-GACAAAC-AGTT--------C-C---GCCAAA-T-TTTAG------T---A-GA-A-------A-AAG-TTT--G--C--C-GCTGT-C-CGTT---------------------CA-TGT-TG-G-CTT---------T-AT-------A----GA----A-TCC---A-----------TG-----TA-
gi|56120                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTT---GAA-T-C-TA-TGGC------------------GT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G--CA------------------------------------------------A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--C--C-TCTTT-T-T-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACA-TTT-TT-G-C-T---------T-AT-------A----TA----A-TTC---A-----------GG-----AA-A--------------AGAGTGGTTGCTT-------------A------TATCATTCATGTAAATAT-TT-T------C-GTT---A----A------------T-A-A--AT-T---------GA--T--T-T---T-------AA---A-----AA-C-ATT-----C----AG-CA-----T-G-GTT-AT--T---T--G-TT
gi|56121                      : TATAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TG-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--T---T-T--C-TCCT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------GT-GA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G--CA------------------------------------------------A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--T--C--C-TCTCT-T-T-TT---------------------CA-TGT-TT-G-C-TTATACAGTGT-AT-------A----CA----A-TTC---A-----------AA-----TA-A--------------AGAGT-------T-------------ACCCCTCT----------------T-TT-CCATTTTT-GCT---T----A------------T-A-T--AT-TTCATGTACATA--T--T-T---TCTGTTTAAA---A-----ATAA-TTT-----C----AA-CA-----T-G-GTT-AT--T---T--G-TTTA--AA-C-A-T--C----AC-A-TA-A----C-TTT-
gi|56122                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-A-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------AT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-G-A--TT-G-A-A--TT---TCT-G-CCATTT-T--G---A
gi|56123                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTTG-G---T-T--C-TTTT---GAA-T-C-CA-TGGC------------------GT-TA-TA-------ACG--------AATT-T-TG-GCG-A--T--G---A--TT-G-A-A--TT---TCT-G--CATT---------A----------------------------------------TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--C--C-TCTTT-T-T-TTTTTTTTA--------------CA-CTT-TT-G-C-T---------T-AT-------A----TA----A-TTC---A-----------GG-----AA-AAGGAGTGTGTGCTTA-----------T-------------A------T----------------CATT-CA-----TGG-T---A----AATATTTTCGTAAT-A-G--AT-T---------GA--T--T-T---A-------AA---A-----AC-A-TTC-----C----AG-CA-----T-G-GTT-AT--T---T--G-TTTT--AT-C-A---------AC-A-A
gi|56124                      : TGCAG--TCAAC-T--T--TC---GA-TA-AAC---C-G-TC--A----TC--T-----TTT--G---T-T--C-CTCT---GAA-T-T-TTGTGGC------------------AT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GTG-A--T--G-G-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CGATTT-T--G---
gi|56125                      : TACAG--TCAAA-T--C--TT---GA-TA-AAC---T-A-CC--A----CC--T-----TGT--G---T-T--C-TTCT---GAA-T-T-TA-TGGA------------------GA-TA-TA-------GCG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-C--TT---TCT-G-CCATTT-T--G---
gi|56126                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AA----C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--CTTTTT---GAATT-C-CA-TGGC------------------GT-TA-T--------ACG--------AA---T-TG-GCGAA--T--T-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC---CAATTT-T--G---AA--GCAA-AAG--AGTTAC------C-T---CTT--T-T-TTT-G------T-----------------------TT--T--T--T-TTTTT-T-T-TTTTTA-----------------CATTTT-TT-G-C-T---------T-AT-------A----TA----ATTTC---AGAGAAAAGGAGTGGTGCTTA-A--------------A-----------TCATTCATGTAAATA------T----------------T-TT-T------T---T---A----A------------T-A-A-----T---------TG--T--T-T---T-------AA---A-----A--A-CTT-----T----AG-CA-----T-G-GTT-AT--T---T--G-TTT---TA-T-A-T--A----AC-A-A
gi|56127                      : TACAG--TCAAA-T--C--TC---GC-TA-AAC---T-G-CC--A----CA--T-----GTT--G---T-T--T-TTCT---GAA-T-G-TA-TGGC------------------GA-TA-CA-------ACG--------AA-T-T-TG-GTA-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-A-CCATAT-T--G---GG--G-AA-TA------T--------C-T-----T--A---TTT-G------T------------------AAAAGTT--A--T--C---------------------------------------T-TT-G---------------AT-------G----CA----A---------------------------A-A--------------A-----------C-------------A------T----------------C-T---------T-G-T---A----A--------------A-A-----T---------AA--T--T-T---T-------CA---T-----AT-T-TTT-----T----AG-CA-----T-G-ATT-taagatttttatttcaaa
gi|56128                      : TACAG--CCAAC-T--C--TC---GA-TA-GGC---C-A-CC--A----C---T-----TTT--G---A-T--T-TTCT---GAA-T-T-TA-TGGT------------------AT-TA-TA-------ATG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-A-CCTTCT-T--T---GG--G-A------------------------------A-T-CTT-G------T---A-TATG-------T-GAGAATT--A---------TGT-T-T-TC---------------------CT-TAT------C-T---------T-CA-------A----TA----C-CTG---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------A-------------A------T----------------A-GC-T------T-G-T---A-------------------A-A--ATAT---------CA--T--T-T---T-------CA---A-----AA-T-TTT-----C----AG-CA-----T-A-ATT-
gi|56129                      : TACAG--TCAAA-T--C--TC---GAGTA-AAC---C-A-CC--A----CT--T-----ATT--G--------C-TTCT---GAA-T-G-TC-TGGC------------------GA-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A-----G-ATA--TT-G-A-ATGTT---TTC-G-CTA
gi|56130                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---TA-TA-AAC---C-A-CA--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTCT---GAA-T-----------------------------T-TA----------------------------TG-GCA-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCT-A-CCATCT-T--G---G-------------------------------GTA--A-T-CTT-G------T---A-TA-A-------GCAAGATTT--A--T--C-------T-T-TC-------------------------AT-TT-A-T-T---------T-CCA------A----TA----C-TTG---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------A-------------A------T----------------A-TC-A------T-G-T---A-------------------A-A--ATAT---------TA--C--T-T---T-------CA---A-----AT-G-TTT-----T----AG-CA-----T-G-ATT-
gi|56131                      : TACAG--TCAGC-T--C--TC---GA-TACAAC---G-G-CC--A----C--------------G---T-T--C-ATTC---CAA-T-CATT-TACC------------------AT-TA-TA-------AGG--------AA-T-C-TG-
gi|56132                      :  ATAG--TCAAC-T--C--TC---CA-TA-AAC---C-G-C---A----CC--T-----TTTTTG---T-T--C-TTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------AT--A-TA-------ATG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-A-A-A--TT---TCC-G-TCATTT-TT-G---AA--G-AA-AAA--AGTT--------C-TCT-GCC--A-T-TCT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--T--T-ACTAT-T-T-TC----------------------A-TGT-TT-G-C-T---------T-AC-------A----TA----A-TTC---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-C---ATTGAA------------T-A-A--AT-T---------TA--T--T-T---TTC-----AA---A-----AT-T-TT-----------AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTTA--AA-C-A-T--C----AC-A-GA-AT-T-C-TTT-C-G-T-TT--T-AT-C--TTC-A-A--AACCT-CAAA-AG-A---AC--T-C----T-CT-T-C-----T-GTGGC--T--AAG---TC-G--T-CC--TAA-A--C-T-GAA-A-CGG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-TAA-AAATAAC----AC--------TAC-A--TCT----CT---A-T-A---T---T----AA-GT-CT-TT-TC-TTG---TT-TA---C--T---T----A---A--AACAG-TA-T-TT-AC----T-G-GGGTCTTTCT-G-----C-AC--A-G-----GT-GA-A--C-AC-CG-GAG----ATCG-A-T-AATGA----CTA--CT-TTAC
gi|56133                      :  ATAG--TCAAC-T--C--TC---CA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTTT-G---T-T--C-TTTTT--GAA-T-CCTT-TGGC------------------CA-TA-TA-------ATG--------AA-T-T-TG--CGTA--T--G-A-A--TTTA-A-A--TTC--TCC-G-TCATTT-TT-G---AA--G-AA-AAA--AGTT--------C-TCTCGCC--A-T-TCT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--T--T-ACTAT-T-T-TT---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------T-AC-------A----TA----A-TTC---A-----------TG-----TATA--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-CATGA----A------------T-A-A--A--T---------TA--T--T-T---TTCA----AA---A-----A----TTT-----T----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTTA--AA-C-A-T--C----AC-AGAA-GT-T-C-TCT-CTC-G-TT--TTAT-C--TTCAA-A--AAC-TCCAAA-AG-A---AC--T-C----T-CT-T-T-----CTGTGGCTTT--AAG---TC-GTCTACC--TAA-A--CTT-GAA-A-CGG-GT---TTTCTATT--AA-TGATAA-AAATAAC----AC--------TAC-A--TCT----C----A-T-A---T---TA---AA-GT-C--TT-TC-TTG---TT-TA---CTTT---T----A---A--AACAG-TA-T-TT-A-----C-G-GGTTCTTCCT-G-----C-AC--A-G-----GT-GA-AACC-AC-CG-GAGC---ATC--A-T-AATG
gi|56134                      :  ACAGGTTCAAC-T--C--TC---AA-TATAAC---C-G-CC-------CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTTTTATAA-T-A-TT-TGGC------------------AT----TA-------ATGC-------AA-T-T-TT-GCA-A--T--G-A-A--TT-T-A-A--TT---TCA-T-CCATTTAT--G---AT--G-A
gi|56135                      :    AG--TGAACAT--CCTTC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TCT--G---TGT--C-TTTT---GAA-T-C--T-TGGC------------------GT-TA-TT-------ACG--------AA-T-T-TGCGCG-A--T--GAA-A--TT-G-A-A--TT---TAC-G-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--AGAG--------C-G---GTC--C-T-TGT-A------TATAA-GA-A-------A-AAGATTT--A--T--C-GCTGT-T-T-TCG--------------------TA-CTTATT-G-T-T---------T-AT-------A----TA----A-TTCCAGA-----------TA------A-A--------------A-----------T-------------A-----------------------G-TT-C------T-G-T---A----AG-----------T-A-A--A--G---------TA--T--T-T---T-------TA---A-----AT-T-TTT-----T----AA-CA-----T-G-A---AT--T---T--T-TTT
gi|56136                      :                                                                               T---GAA-T-C-AA-TGTC------------------AT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--T--A-A-A--TT----------AATT-------------------GA--ATTT--------C-C---GCC--A-T-TTT-G------A---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--C--C-GCTCT-T-T-TG---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------T-AT-------ACATATA----A-TTC---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---A----A------------T-C-A--AT-T---------GA--T--T-T---TT------AC---A-----AT-T-TTT-----TTT--AA-CAAGAATTAG-ATT-AT--T---T--G-TTTA--AA-T-A-T--C----AC-A-AA-AT-C-C-TGT-C-C-T-TT--TTTTTC--TTC-G-A--AAC-T-CAAA-AG-A---AC--T-C----T-CT-T-C-----C-ATGAC--G--AAG---CT-A--TACC--CAA-T--C-T-GAA-T-TAT-GT---TTTCTA-T-------------AATAAC---------------------------------------------------A-GC-AT-TT-TC-TTG---TT-TA---T--T---T----A---A--CACAG-CA-A-TT-AC----C-G-AGGTCTTTTT-G-----C-AC--G-G-----GT-GG-A--T-GC-CG-GAG----ATCG-A-T-AATGA----CCA--AT-TTAC
gi|56137                      :                                                                                                                     T-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GTG-A--TCGA-A-A--TT-G-A-A--TT---TCCCG-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--G--T--------C-T---GCT--A-C-CCA-G------C---A-GA-A-------
gi|56137                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -GCTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------T-CT------------------A-TTC---A------------A-----TA-A--------------A-----------T-------------A-----------------------T-TT-C------T-GTT---A----A------------T-A-A--AT-T---------TA--T--T-TGAAT-------AA---C-----AT-T-TTT-----A----AC-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--C-TTTA--AATC-A-T--CA---AC-ATAA-AT-CGC-TTTAC-T-T-TT--TTAT-C--TTC-G-T--AAC-T-C----AG-A---AC--T-C----TACT-TGT-----T-GTGGA--C--AAG---CC-T--TACCATTAACA--C-T-GAA-ACCGA-GT---TTTCTA-TGCAA-AG-TAACAGATAAC-TCGAC---------AC-AATCCT----C----AGT-A---G---C----AAGGT-CT-TTCTC-TTGCTTTC-TA---C--T---T---------------G-T--A-TC-AT----C-G-TATTCTATCC-GTCTATC-AC--A-A-----GT-GG-AC-C-AA-TG-AGGACGAATTG-A-TGAATGA----CCA--AT-TTtccacgtacgatcaactcaacacagagtaaaacgaggttaatagaaaagaatagtgacgacgcatcggctgttttccatgtttgcttctattcaataaatatttctgttaataaatttatttgaataacatttttaaccatgattatttctttaaatcatcaacataaatcgctttacttttttatcttcgtaactcagaactctacttgttgtggacaagccttaccattaacactgaaaccgagttttctatgcaaagtaacagataactcgacacaatcctcagtagcaaggtctttctcttgctttctacttgtatcatcgtattctatccgtctatcacaagtggaccaatgaggacgaattgatgaatgaccaattt
gi|56138                      :                       ttataacgaatttggtgatcgaaattgaatttcccgccattttgaagaaaaagtctgctacccagcagaatccacgtacgatcaactcaacacagagtaaaacgaggttaatagaaaagaatagtgacgacgcatcg--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CCATTT-T--GA--AA--A-AA-AAA--AGTT--------C-T---GCA--C-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-A
gi|56139                      :                                                                                                                                                                                 --TT---CCC-A-CCACTT-T--G---AA--G-AA-ATA--AGTC--------T-C---GC---A-T-TTT-G------T---ATGT-A-------A-AAGAGTTGAA--C--C-GCTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-G-C-C---------T-TT-------A----TAAT--A-TTC---AC----------TT-----TC-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-CT-----T-G-T---A----AT-----------T-T-A--AT-TG--------TAAGTTGT-T---T-------AA---A-----AT-T-GTT-----T----A
gi|56140                      :                                                                                                                                                                                          C-G-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--AGTT--------C-T---GTC--A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--C--T-GCTGT-T-T-TC---------------------TA-TGT-TT-G-T------------------------------------------------------------------------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---A----A------------T-A-A--AT-T---------TA--T--T-T---T-------TA---A-----AA-T-TTT-----C----AA-C
gi|56141                      :                                                                                                                                                                                               CATTT-T--G---AAAGG-GG-GAA--A--T--------C-G---GCC--A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--G--C--C-GCTGT-T-T-TC---------------------CT-TAT-TT-G-C-T---------T-ATATAAAGAA----TA----A-TTC---T-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---A----A------------T-A-A--AT-T---------TA--T--T-T---T-------
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gi|56149                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -TAG-AAATAAC-ATGAC--------TAC-A--TCTT---C----A-T-A---C---T----AA-GT-AT-TT-TC-TTG---TA-TA---T--T---TTTAAA---A--AACAG-CA-A-TT-AC----C-G-AGGTCTTTCT-G-----C-AC--A-G-----GT-AG-A--C-GC-CG-GAG----ATCG-A-T-AATGA----CCA--AT-TTAC
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gi|56153                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TG---TT-TA---C--T---TT---A---A--CACAG-TA-A-TT-AC----C-G-GGGTCTTTCT-G-----C-AC--A-G-----GT-GG-A--C-AC-CG-GAA----ATCG-A-T-AATGA----CCA--AT-
gi|56154                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTTTCT-G-----C-AC--A-G-----GT-GG-A--C-AC-CG-GAG----ATTG-A-T-AATGA----CTA--AT-TTAC


blockSeqs                     :      GT     A GC CT  TCT  G  C   TCC A A  CC AACG  AA CCCCG   TT GTA G GG T    TTA   T T A  G    TATTATATATTTTTAATTA A  A  TTACACA   CATACAGA  A A A  C   T AA CG T T TC  T A T TG  GAG   C G      A TG CCA  AG C  C   TG    GCCTCTCTTT      CAA C G   T CATATA ATA T  T TTCAAAT C       GA AC GA AG    A A G  TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTA  T   A  C G T TATACAGTG G  ATAAAGA CATA  TAGA T   CAG GAGAAAAGGAGTGGTGCT  T AGGAGTGTGTGCTTAT                         CCCCTC ATCATTCATGTAAATA A  T CATTTT G T AAATATTTTCGTAA        C T TT  A TCATGTACA  AG TA G TCTGTTTA     GCC TTTAA TTA    ATTAAT      T  AGAAT A G   T  CA AAA TG A    CA  A T T AA GCGG  A T  T  G G T   T T G G  CA    T CT   A C GT   C C T  T  C GTT  TA T CTCC A  A G AAAGTC      TTT     GGA  GTC     AT   C AT T C   T C GGT  AGG      T GC  G  A   C       AG    AGCTGATT   T AT   GCAT ATCT A G TGTA    CATG  GG AA A  C  T   CTT  C  GAT TT TAA ACTA TAT AA     T  T T  A  CGATC  T          C TCTAT A  CA G GTACA  G  A AC T  A  A   ACGA    T G G     TCCT   AG  A
blockSeqs                     :      .      . .  .   .    .  T   .   . .  C  .     .  C       G  .   . AT T    TG    . . C  .    A                   .  .  .         C         T . .  .   A G  .  A T .   . . . .   C     . .      . T  A    .  .  .   G     CTCTC           C   . .   A .      .   .  . .       C       .  .  .  A     . . .  TTTTTTA                .   .  . . . .         .  A       .     GCT  .   .   TGCA                . ATCATTCATGTAAAT                          .      .                .  A T      . C AAGTAACA              . . .   A A          T  TG . TTCA         .   .     TGA    TTAAT       .  .     . .   .  .  .   .  .    .   T . . .  A     . G  .  . . .   A . . .  .     . .    A . .    . . T  .  T .    .  . CGA  .  C . CT          TTA     G    AG      C    . .  . .   . . GG   .        . .   .  .   .       G     TT         . .    T    T    G T CCAT    A     TG C  .  .  .   .    .  AGT G  A   TTAA .   .      .  . T  .  TG     .          . .     .  .  . .      .  . C  .  .  .   C       . . .     .      G   .
blockSeqs                     :      .      . .  .   .    .  .   .   . .  .  .     .  .       T  .   . .  .    T     . . .  .    A                   .  .  .         .         . . .  .   T .  .  . . .   . . . .   .     . .      . T  .    .  .  .   C     ACCT            C   . .   . .      .   .  . .       .       .  .  .  G     . . .  TTTA                   .   .  . . . .         .  .       .     AT   .   .   TGA                 . AGAGTGGTTGCTT                            .      .                .  . A      . T ATTGAA                . . .   A G          G  .  . GAAT         .   .     TTG    TTT         .  .     . .   .  .  .   .  .    .   . . . .  .     . T  .  . . .   . . . .  .     . .    A . .    . . A  .  . .    .  . .    .  . . T           T       .    G       .    . .  . .   . . AG   .        . .   .  .   .       A     .          . .    .    .    . A TA      G     A  C  .  .  .   .    .  TT  .  .   TTA  .   .      .  . A  .  CG     .          . .     .  .  . .      .  . .  .  .  .   .       . . .     .      .   .
blockSeqs                     :      .      . .  .   .    .  .   .   . .  .  .     .  .       .  .   . .  .    .     . . .  .    G                   .  .  .         .         . . .  .   . .  .  . . .   . . . .   .     . .      . .  .    .  .  .   .     CTCT            C   . .   . .      .   .  . .       .       .  .  .  G     . . .  T                      .   .  . . . .         .  .       .     .    .   .   CTT                 . AGAGTT                                   .      .                .  . T      . . ATGAA                 . . .   . .          .  .  . CTTT         .   .     TAA    T           .  .     . .   .  .  .   .  .    .   . . . .  .     . .  .  . . .   . . . .  .     . .    . . .    . . T  .  . .    .  . .    .  . . C           C       .    G       .    . .  . .   . . AT   .        . .   .  .   .       G     .          . .    .    .    . . T       .     G  A  .  .  .   .    .  .   .  .   A    .   .      .  . .  .  TT     .          . .     .  .  . .      .  . .  .  .  .   .       . . .     .      .   .
blockSeqs                     :      .      . .  .   .    .  .   .   . .  .  .     .  .       .  .   . .  .    .     . . .  .    A                   .  .  .         .         . . .  .   . .  .  . . .   . . . .   .     . .      . .  .    .  .  .   .     CAG             C   . .   . .      .   .  . .       .       .  .  .  G     . . .  G                      .   .  . . . .         .  .       .     .    .   .   TG                  . AT                                       .      .                .  . .      . . TAAA                  . . .   . .          .  .  . TTC          .   .     TCA    T           .  .     . .   .  .  .   .  .    .   . . . .  .     . .  .  . . .   . . . .  .     . .    . . .    . . T  .  . .    .  . .    .  . . T           T       .    A       .    . .  . .   . . AG   .        . .   .  .   .       G     .          . .    .    .    . . G       .     G  C  .  .  .   .    .  .   .  .   A    .   .      .  . .  .  T      .          . .     .  .  . .      .  . .  .  .  .   .       . . .     .      .   .
blockSeqs                     :      .      . .  .   .    .  .   .   . .  .  .     .  .       .  .   . .  .    .     . . .  .    A                   .  .  .         .         . . .  .   . .  .  . . .   . . . .   .     . .      . .  .    .  .  .   .     CT              C   . .   . .      .   .  . .       .       .  .  .  A     . . .  .                      .   .  . . . .         .  .       .     .    .   .   TG                  . AT                                       .      .                .  . .      . . CCAA                  . . .   . .          .  .  . TT           .   .     CA     C           .  .     . .   .  .  .   .  .    .   . . . .  .     . .  .  . . .   . . . .  .     . .    . . .    . . A  .  . .    .  . .    .  . . T           C       .    A       .    . .  . .   . . GG   .        . .   .  .   .       G     .          . .    .    .    . . T       .     A  C  .  .  .   .    .  .   .  .   T    .   .      .  . .  .  T      .          . .     .  .  . .      .  . .  .  .  .   .       . . .     .      .   .
blockSeqs                     :      .      . .  .   .    .  .   .   . .  .  .     .  .       .  .   . .  .    .     . . .  .    G                   .  .  .         .         . . .  .   . .  .  . . .   . . . .   .     . .      . .  .    .  .  .   .     CT              C   . .   . .      .   .  . .       .       .  .  .  G     . . .  .                      .   .  . . . .         .  .       .     .    .   .   TA                  . AT                                       .      .                .  . .      . . AAG                   . . .   . .          .  .  . T            .   .     TT     T           .  .     . .   .  .  .   .  .    .   . . . .  .     . .  .  . . .   . . . .  .     . .    . . .    . . A  .  . .    .  . .    .  . . T           C       .    G       .    . .  . .   . . GG   .        . .   .  .   .       G     .          . .    .    .    . . T       .     A  C  .  .  .   .    .  .   .  .   .    .   .      .  . .  .  C      .          . .     .  .  . .      .  . .  .  .  .   .       . . .     .      .   .
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lowQualScore                  :      ..     . .. ..  ...  .  .   ... . .  .. ....  .. .....   .. ... . .. .    ...   . . .  .    ................... .  .  .......   ........  . . .  .   . .. .. . . ..  . . . ..  ...   . .      . .. ...  .. .  .   .. .  ..............  ... . .   . ...... ... .  . ....... .       .. .. .. ..    . . .  .....................  .   .  . . . ......... .  ....... ....  .... .   ... ..................  . ........................................ ...... ................ .  . ...... . . ..................... . . ..  . .........  .. .. . ...........  ... ..... ....   ..........  .  ..... . .   .  .. ... .. .    ..  . . . .. ....  . .  .  . . .   . . . .  ..    . ..   . . ..   . . .  .  . ...  .. . .... .  . . .......     .....   ...  ....    ..   . .. . .   . . ...  ...      . ..  .  .   .       ..    ........   . ..   .... .... . . ....... ....  .. .. .  .  .   ...  .  ... .. ... .... ... ..     .  . .  .  ...... .          . ..... .  .. . .....  .  . .. .  .  .   ....    . . .     ....   ..  .    
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Reference ( family-417 )      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------GT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--AGTT--------C-T---GCC--A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--C--C-GCTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------T-AT-------A----TA----A-TTC---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---A----A------------T-A-A--AT-T---------TA--T--T-T---T-------AA---A-----AT-T-TTT-----T----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTTA--AA-C-A-T--C----AC-A-AA-AT-C-C-TTT-C-C-T-TT--TTAT-C--TTC-G-A--AAC-T-CAAA-AG-A---AC--T-C----T-CT-T-T-----C-GTGGC--T--AAG---CC-G--TACC--TAA-A--C-T-GAA-A-CGG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-TAA-AAATAAC-GCGAC--------TAC-A--TCT----C----A-T-A---T---T----AA-GT-CT-TT-TC-TTG---TT-TA---C--T---T----A---A--CACAG-TA-A-TT-AC----C-G-GGGTCTTTCT-G-----C-AC--A-G-----GT-GG-A--C-AC-CG-GAG----ATCG-A-T-AATGA----CCA--AT-TTAC
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gi|56108                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---AA-TA-AAC---C-G-CC--G----TC--T-----TTT--G---T-T--T-TTTT---CAA-T-A-TT-TGGC------------------AT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-
gi|56109                      : TACAG--TAAAG-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTTTG-AAA-T-C-TT---GC------------------GCATA-TA-------ATACATACAGAAA-T-T-TG-GAG-A--T--T-G-A--TT-G-ATA--TC---TCC-G-TCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA---GTT--------C-T---GCC--A-T-TTTTG------T---A-GA-A-------A---GAGTT--A--C--CAGCTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------T--T-------A----TA----A-TTC---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---A----A------------T-A-A--AT-T---------TA--T--T-T---A-------AA---A-----AT-T-TTT----------AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTTA--AA-C-A-T--C----ACAA-AA-AT-T-C-ATT-T-T-A-CT--TTAT-C--TTC-G-A--AAC-T-CTAA-AG-A---AC----C----T-CT-T-T-----T-GTGGC--C--AAG---CC-G--TACC--TAA-A--C-T-GAA-A-C-G-GT---TTTCTA-T--AA-TG-TAC-AGATAAC-GCG-----------AC-A--TCT----CATCTA-T-A---T---T----AC-AT-CT-TT-TC-TTG---TTCTA---T--TA--T----ATATA--CACAG-TATA-TT-AC----T---GGGTCTTTCA-G-----C-AC--A-G-----GT-GGAA--C-AC-TG-GAG----ATCG-A-T-AATGA-----CA--TT-TTAC
gi|56110                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---T-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T---------------T-C-TA-T-------------------------A-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CCATTT-T--G---AA--T-AA-AAA--AGTT--------C-T---GCC--C-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--C--C--T-ACTAT-T-T-TC----------------------A-TGT-TT-G-C-T---------T-TT-------A----TA----A-TTC---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---A----------------------------------------------------------------------------------T----AA--------T-G-ATT-AT--T---T--G-TTTA---------T--C----AC-A-TA-AT-T-C-AAT-C-G-T-TT--TTAT-C--TTC-A-A--AAC-T-CAAA-AG-A---AT--T-C----T-CC-T-C-----T-GTGGC--T--AAG---CC-G--TACC--TAA-A--C-T-GAA-A-CGG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-GAA-AAATAAC-GCGAC--------TAC-A--TTT----C----A-T-A---T---A----AA-GT-CT-TT-TC-TTG---TT-TA---C--T---T----A---A--CACAG-TA-A-TT-AC----TGG-GGGTCTTTCT-G-----C-AC--A-G-----GT-GA-A--C-AC-CG-GAG----ATCG-A-T-AATGA----CCA--AT-TTAC
gi|56111                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-TGGC-TTTT---GAA-T-C-TT-TGGCTATTATATATTTTTAATTAT-TAATA-------ACG--------AAAT-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CCATTT-T--C---AG--A-AA-AAA--AGTT--------C-T---GC---A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAATT--A--C--C-GCTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-T-A-T---------A-AT-------A----TA----A-TTC---A-----------TT-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-----A----A------------T-G-A--AT-T---------AT--T--T-T---T-------AA---A-----AT-T-TTA-----T-------CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTTA--AA-C-A-T--C----AT-A-AA-AT-C-C-TTT-C-C-T-TT--TTAT-C--TTC-G-A--AAC-T-CAAA-AG-A---ACTAT-A----T-CT-T-T-----T-GTGGC--T--AAG---CC-G--TACC--TAA-A--C-T-GAA-A-TGG-GT---TTTCTA-T--AA-T--TAA-----------------------------------------G-T-A---T---T--------------T-CC-TTG---TT-TA---C--C---TA---A---A--CACAG-TA-A-TT-AC----C-G-GGGTCTTTAA-G-----C-AC--A-G-----GT-GG-A--C-AT-TG-GAG----ATCG-A-T-AATGA----CCA--
gi|56112                      : TACAG--TCAAA-T--C--TC---GA-TA-AACTCCC-G-CCCCA----CC--CCCCCGTTT--G---T-T--C-TTTT---GTA-T-C-TT--GGC------------------GT-T--TA-------A-G--------AA-T-T-TG--CG-A-----G-A-A--TT-G-A-A--TT----CC-G-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--ATTT--------CAG---GCC--A-T-TTT-A------T---A-GA-A-------A-AAGATTG--A--C--C-CCGCT-T-T-TC---------------------CG-TGT-TT-G-T-T---------T-AT-------A----TA----A-TTC---A-----------TGA----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TTTC------T-G-T---A----A------------T-A-A--AT-T---------TA--T--T-T---T-------TA---A-----AA-T-CTT-----T----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--C-TTTA--AAAC-A-T--C----AA-A-AA-AT-C-C-TTTTC-C-T-TT--TTAT-C--TTTAG-C--AAC-T-CAAA-AA-A---AC--T-CCTCCT-CC-T-G-----C-GTGG---T--AAG---C--A--TACC--TAA-A--C-T-GAA-A-CAT-GT---TTTCTA-T--AA-TG-TAA-AAATAAC-GCGAC--------TACTT--TCT----C----A-T-A---T---T----TA--------------------T-TAGATC--T---T----A---A--CACAGTTA-A-TT-AC----CGG-GGGTCTTTTT-G-----CAAC--G-G-----GT-GG-A--C-AC-TGAGAG----ATCG-A-T-AATGG----CCA--TT-CTAC
gi|56113                      : TACA---TCAAC-TGCT--TC---G--TA-AAC---CAG-CC--A----CCAAT-----TTG--A---T-TATC-TTTT---GAA-T-C-TT--GGC------------------AT-TA-TA-------ACG--------AA-TATATG-GCG-AAAG--A-A-A--TT-G-A-A--TT---TC--G-CCATTT-TTGA---AA--G-AA-AAA--AGTT--------C-T---GC---A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-A-GAATT--AACCGAC-GCTGTATAT-TC---------------------CC-TAT-TT-G-C-T---------T-AT-------A----TATAGAA-TT----A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TTAT------T-G-T---T----A------------T-ATA--AT-C---------TA--T--T-T---T-------GA---A-----AT-T-TTT-----TTAATAA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTTA--CA---A-T--C----AC-A-AA-AT-C---TTT-C-C-T-TT--TTAT-C--TTC-GCA--AAC-T-CTAA-AG-A---AC--T-C----T-ATAT-T-----T-GTGGC--C--AAGG--CC-A--TACA--TAA-A--C-TCGAA-T-CGG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-TAC-AGATAACAGTAAC--------TAC-A--TCT----C----A-T-A---TA--T----AC-AT-CT-TT-TC--TG---TT-TA---C--T---T----A---A--CACCG-TA-ATTT-ACT---T-A-GGGTCTTTCA-G-----C-AC--AGG-----GT-GG-A--C-AC-CA-GAT----ATAG-A-T-AATGA----CCAG-AT-TTAC
gi|56114                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------AT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GTG-A--T--G-A-C--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AA---AGTT--------C-T---GCC--A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--C--C-GCTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------T-AC-------A----TA----A-TTC---A-----------AG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---A----A------------T-A-A--AT-T---------TA--T--T-T---G-------AA---C-----CA-T-TTT-----T----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--C-TTTA--AA-C-A-T--C----AC-A-AA-AT-C-C-TTT-A-C-T-TT--TTAT-C--TTC-G-T--AAC-T-C--A-AG-A---AC--T-C----T-CT-T-T-----T-GTGGA--C--AAG---CC-
gi|56115                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-A-CC--G----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TT
gi|56116                      : TACAG--TTAAA-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTGT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------GT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CCATTT-T--G---AA--G--A-AAA--AGTT--------C-----GCC--A---TTT-A------T---A-G--A-------A-AAGAGTT--G--C--C-GCTGT-T-T-TC---------------------CG-TGT-TTCG-T-T---------T-AT-------A----TA----A-TTC---A-----------TA-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-CTA-A----A------------T-A-A--AT-T---------TAT-T--T-T---T-------AA---A-----A----TTT-----C----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--C-TTTA--AA-C-ATT--C----AC-A-AA-AT-C-C--TT-C-C-T-TT--
gi|56117                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTCT---GAA-T---TT-TGGC------------------GT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CAATTT-T--G---TA--G-AA-AAAG-AGTTGCCTCTCTT-T---TCC--A-TGTTT-GCATATAT---A-TA-ATTCAAATA-AAGAGTT--A--T--C-ACTCT-T-T-TC---------------------CA-TTT-TT-G-C-A---------T-AT-------A----TA----T-TTC---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---------------------T-A-A--A-------------A-------------------AG---A-----AT-GATTT-----C----AA-CA-----T-G-GTT-AT--T---
gi|56118                      : TACAG--TCAAC-T--C--TTTCTGA-TA-AAC---C-GACC--AAACGCC--TC----TTT--GGTAT-C--C-TTAT---GAA-TTC-TT-TGGC------------------AT-TA-TATTACACAACG--------AA-T-T-TG-GCG-AG-T--GTATA--TT-G-A-A--TTGAGTCC-GGCCATTT-T--GCCAAA--A-AA-AAATGAGTT--------C-T---GCC--ACT-TTT-G------T---A-GA-A-------ACGAGA-TT--A--C--A-GCTAT-T-T-TCT--------------------CA-TGT-TT-GGC-T---------TGAT-------A----TA----A-TTC---------------TGCA---TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TA-C------T-G-T---A----AGTAACA------T-A-ATTATAT---------TAG-T--T-T---T-------AA---A-----AT-TGTTC-----C----AATCA-----T-G-ATTTATCAT---T--G-TTTACAAA-CTA-T--CGCGGAC-ATAA-ATGT-C-TTT-C-GGT-TTCATTAT-C--TTC-C-AGTAAC-T-AAAATAG-AGTTAC--T-CCGA-T-CC-T-T-----G-ATGGC--T--AAGGGACCAG--AACT--TAA-GATC-T-GAA-A-CGGTGTAGGTCGTGA-T--AAGTG-TTA-AA-TAAA-TCGACAGCTGATTTAC-A--TCTGCATC----AAT-A---T---T----AA-GT-CT-TT-TC-TTG---TT-TA---C--T---TACTAA---A--CATCG-TA-A-TTAAC----T-GTGGGT
gi|56119                      : TACAG--TCACC-T--C--TC---GA-TA-A-C---C-G-CCC-A----CC--T-----TTT--G---T-T--CTTTTT---GAA-T-C-TT-T-GC------------------TT-AA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCATA--T--G-A-ATCTT-GAA-A--TT---TCC-A-CCA-AT-T--G---AA--G-GACAAAC-AGTT--------C-C---GCCAAA-T-TTTAG------T---A-GA-A-------A-AAG-TTT--G--C--C-GCTGT-C-CGTT---------------------CA-TGT-TG-G-CTT---------T-AT-------A----GA----A-TCC---A-----------TG-----TA-
gi|56120                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTT---GAA-T-C-TA-TGGC------------------GT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G--CA------------------------------------------------A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--C--C-TCTTT-T-T-TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTACA-TTT-TT-G-C-T---------T-AT-------A----TA----A-TTC---A-----------GG-----AA-A--------------AGAGTGGTTGCTT-------------A------TATCATTCATGTAAATAT-TT-T------C-GTT---A----A------------T-A-A--AT-T---------GA--T--T-T---T-------AA---A-----AA-C-ATT-----C----AG-CA-----T-G-GTT-AT--T---T--G-TT
gi|56121                      : TATAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TG-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTT--T---T-T--C-TCCT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------GT-GA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G--CA------------------------------------------------A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--T--C--C-TCTCT-T-T-TT---------------------CA-TGT-TT-G-C-TTATACAGTGT-AT-------A----CA----A-TTC---A-----------AA-----TA-A--------------AGAGT-------T-------------ACCCCTCT----------------T-TT-CCATTTTT-GCT---T----A------------T-A-T--AT-TTCATGTACATA--T--T-T---TCTGTTTAAA---A-----ATAA-TTT-----C----AA-CA-----T-G-GTT-AT--T---T--G-TTTA--AA-C-A-T--C----AC-A-TA-A----C-TTT-
gi|56122                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-A-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------AT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-G-A--TT-G-A-A--TT---TCT-G-CCATTT-T--G---A
gi|56123                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTTG-G---T-T--C-TTTT---GAA-T-C-CA-TGGC------------------GT-TA-TA-------ACG--------AATT-T-TG-GCG-A--T--G---A--TT-G-A-A--TT---TCT-G--CATT---------A----------------------------------------TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--C--C-TCTTT-T-T-TTTTTTTTA--------------CA-CTT-TT-G-C-T---------T-AT-------A----TA----A-TTC---A-----------GG-----AA-AAGGAGTGTGTGCTTA-----------T-------------A------T----------------CATT-CA-----TGG-T---A----AATATTTTCGTAAT-A-G--AT-T---------GA--T--T-T---A-------AA---A-----AC-A-TTC-----C----AG-CA-----T-G-GTT-AT--T---T--G-TTTT--AT-C-A---------AC-A-A
gi|56124                      : TGCAG--TCAAC-T--T--TC---GA-TA-AAC---C-G-TC--A----TC--T-----TTT--G---T-T--C-CTCT---GAA-T-T-TTGTGGC------------------AT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GTG-A--T--G-G-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CGATTT-T--G---
gi|56125                      : TACAG--TCAAA-T--C--TT---GA-TA-AAC---T-A-CC--A----CC--T-----TGT--G---T-T--C-TTCT---GAA-T-T-TA-TGGA------------------GA-TA-TA-------GCG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-C--TT---TCT-G-CCATTT-T--G---
gi|56126                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---GA-TA-AA----C-G-CC--A----CC--T-----TTT--G---T-T--CTTTTT---GAATT-C-CA-TGGC------------------GT-TA-T--------ACG--------AA---T-TG-GCGAA--T--T-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC---CAATTT-T--G---AA--GCAA-AAG--AGTTAC------C-T---CTT--T-T-TTT-G------T-----------------------TT--T--T--T-TTTTT-T-T-TTTTTA-----------------CATTTT-TT-G-C-T---------T-AT-------A----TA----ATTTC---AGAGAAAAGGAGTGGTGCTTA-A--------------A-----------TCATTCATGTAAATA------T----------------T-TT-T------T---T---A----A------------T-A-A-----T---------TG--T--T-T---T-------AA---A-----A--A-CTT-----T----AG-CA-----T-G-GTT-AT--T---T--G-TTT---TA-T-A-T--A----AC-A-A
gi|56127                      : TACAG--TCAAA-T--C--TC---GC-TA-AAC---T-G-CC--A----CA--T-----GTT--G---T-T--T-TTCT---GAA-T-G-TA-TGGC------------------GA-TA-CA-------ACG--------AA-T-T-TG-GTA-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-A-CCATAT-T--G---GG--G-AA-TA------T--------C-T-----T--A---TTT-G------T------------------AAAAGTT--A--T--C---------------------------------------T-TT-G---------------AT-------G----CA----A---------------------------A-A--------------A-----------C-------------A------T----------------C-T---------T-G-T---A----A--------------A-A-----T---------AA--T--T-T---T-------CA---T-----AT-T-TTT-----T----AG-CA-----T-G-ATT-taagatttttatttcaaa
gi|56128                      : TACAG--CCAAC-T--C--TC---GA-TA-GGC---C-A-CC--A----C---T-----TTT--G---A-T--T-TTCT---GAA-T-T-TA-TGGT------------------AT-TA-TA-------ATG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-A-CCTTCT-T--T---GG--G-A------------------------------A-T-CTT-G------T---A-TATG-------T-GAGAATT--A---------TGT-T-T-TC---------------------CT-TAT------C-T---------T-CA-------A----TA----C-CTG---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------A-------------A------T----------------A-GC-T------T-G-T---A-------------------A-A--ATAT---------CA--T--T-T---T-------CA---A-----AA-T-TTT-----C----AG-CA-----T-A-ATT-
gi|56129                      : TACAG--TCAAA-T--C--TC---GAGTA-AAC---C-A-CC--A----CT--T-----ATT--G--------C-TTCT---GAA-T-G-TC-TGGC------------------GA-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A-----G-ATA--TT-G-A-ATGTT---TTC-G-CTA
gi|56130                      : TACAG--TCAAC-T--C--TC---TA-TA-AAC---C-A-CA--A----CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTCT---GAA-T-----------------------------T-TA----------------------------TG-GCA-A--T--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCT-A-CCATCT-T--G---G-------------------------------GTA--A-T-CTT-G------T---A-TA-A-------GCAAGATTT--A--T--C-------T-T-TC-------------------------AT-TT-A-T-T---------T-CCA------A----TA----C-TTG---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------A-------------A------T----------------A-TC-A------T-G-T---A-------------------A-A--ATAT---------TA--C--T-T---T-------CA---A-----AT-G-TTT-----T----AG-CA-----T-G-ATT-
gi|56131                      : TACAG--TCAGC-T--C--TC---GA-TACAAC---G-G-CC--A----C--------------G---T-T--C-ATTC---CAA-T-CATT-TACC------------------AT-TA-TA-------AGG--------AA-T-C-TG-
gi|56132                      :  ATAG--TCAAC-T--C--TC---CA-TA-AAC---C-G-C---A----CC--T-----TTTTTG---T-T--C-TTTT---GAA-T-C-TT-TGGC------------------AT--A-TA-------ATG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--TT-A-A-A--TT---TCC-G-TCATTT-TT-G---AA--G-AA-AAA--AGTT--------C-TCT-GCC--A-T-TCT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--T--T-ACTAT-T-T-TC----------------------A-TGT-TT-G-C-T---------T-AC-------A----TA----A-TTC---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-C---ATTGAA------------T-A-A--AT-T---------TA--T--T-T---TTC-----AA---A-----AT-T-TT-----------AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTTA--AA-C-A-T--C----AC-A-GA-AT-T-C-TTT-C-G-T-TT--T-AT-C--TTC-A-A--AACCT-CAAA-AG-A---AC--T-C----T-CT-T-C-----T-GTGGC--T--AAG---TC-G--T-CC--TAA-A--C-T-GAA-A-CGG-GT---TTTCTA-T--AA-TG-TAA-AAATAAC----AC--------TAC-A--TCT----CT---A-T-A---T---T----AA-GT-CT-TT-TC-TTG---TT-TA---C--T---T----A---A--AACAG-TA-T-TT-AC----T-G-GGGTCTTTCT-G-----C-AC--A-G-----GT-GA-A--C-AC-CG-GAG----ATCG-A-T-AATGA----CTA--CT-TTAC
gi|56133                      :  ATAG--TCAAC-T--C--TC---CA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TTTT-G---T-T--C-TTTTT--GAA-T-CCTT-TGGC------------------CA-TA-TA-------ATG--------AA-T-T-TG--CGTA--T--G-A-A--TTTA-A-A--TTC--TCC-G-TCATTT-TT-G---AA--G-AA-AAA--AGTT--------C-TCTCGCC--A-T-TCT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--T--T-ACTAT-T-T-TT---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------T-AC-------A----TA----A-TTC---A-----------TG-----TATA--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-CATGA----A------------T-A-A--A--T---------TA--T--T-T---TTCA----AA---A-----A----TTT-----T----AA-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--G-TTTA--AA-C-A-T--C----AC-AGAA-GT-T-C-TCT-CTC-G-TT--TTAT-C--TTCAA-A--AAC-TCCAAA-AG-A---AC--T-C----T-CT-T-T-----CTGTGGCTTT--AAG---TC-GTCTACC--TAA-A--CTT-GAA-A-CGG-GT---TTTCTATT--AA-TGATAA-AAATAAC----AC--------TAC-A--TCT----C----A-T-A---T---TA---AA-GT-C--TT-TC-TTG---TT-TA---CTTT---T----A---A--AACAG-TA-T-TT-A-----C-G-GGTTCTTCCT-G-----C-AC--A-G-----GT-GA-AACC-AC-CG-GAGC---ATC--A-T-AATG
gi|56134                      :  ACAGGTTCAAC-T--C--TC---AA-TATAAC---C-G-CC-------CC--T-----TTT--G---T-T--C-TTTTTTATAA-T-A-TT-TGGC------------------AT----TA-------ATGC-------AA-T-T-TT-GCA-A--T--G-A-A--TT-T-A-A--TT---TCA-T-CCATTTAT--G---AT--G-A
gi|56135                      :    AG--TGAACAT--CCTTC---GA-TA-AAC---C-G-CC--A----CC--T-----TCT--G---TGT--C-TTTT---GAA-T-C--T-TGGC------------------GT-TA-TT-------ACG--------AA-T-T-TGCGCG-A--T--GAA-A--TT-G-A-A--TT---TAC-G-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--AGAG--------C-G---GTC--C-T-TGT-A------TATAA-GA-A-------A-AAGATTT--A--T--C-GCTGT-T-T-TCG--------------------TA-CTTATT-G-T-T---------T-AT-------A----TA----A-TTCCAGA-----------TA------A-A--------------A-----------T-------------A-----------------------G-TT-C------T-G-T---A----AG-----------T-A-A--A--G---------TA--T--T-T---T-------TA---A-----AT-T-TTT-----T----AA-CA-----T-G-A---AT--T---T--T-TTT
gi|56136                      :                                                                               T---GAA-T-C-AA-TGTC------------------AT-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GCG-A--T--G-A-A--T--A-A-A--TT----------AATT-------------------GA--ATTT--------C-C---GCC--A-T-TTT-G------A---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--C--C-GCTCT-T-T-TG---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------T-AT-------ACATATA----A-TTC---A-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---A----A------------T-C-A--AT-T---------GA--T--T-T---TT------AC---A-----AT-T-TTT-----TTT--AA-CAAGAATTAG-ATT-AT--T---T--G-TTTA--AA-T-A-T--C----AC-A-AA-AT-C-C-TGT-C-C-T-TT--TTTTTC--TTC-G-A--AAC-T-CAAA-AG-A---AC--T-C----T-CT-T-C-----C-ATGAC--G--AAG---CT-A--TACC--CAA-T--C-T-GAA-T-TAT-GT---TTTCTA-T-------------AATAAC---------------------------------------------------A-GC-AT-TT-TC-TTG---TT-TA---T--T---T----A---A--CACAG-CA-A-TT-AC----C-G-AGGTCTTTTT-G-----C-AC--G-G-----GT-GG-A--T-GC-CG-GAG----ATCG-A-T-AATGA----CCA--AT-TTAC
gi|56137                      :                                                                                                                     T-TA-TA-------ACG--------AA-T-T-TG-GTG-A--TCGA-A-A--TT-G-A-A--TT---TCCCG-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--G--T--------C-T---GCT--A-C-CCA-G------C---A-GA-A-------
gi|56137                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -GCTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-G-C-T---------T-CT------------------A-TTC---A------------A-----TA-A--------------A-----------T-------------A-----------------------T-TT-C------T-GTT---A----A------------T-A-A--AT-T---------TA--T--T-TGAAT-------AA---C-----AT-T-TTT-----A----AC-CA-----T-G-ATT-AT--T---T--C-TTTA--AATC-A-T--CA---AC-ATAA-AT-CGC-TTTAC-T-T-TT--TTAT-C--TTC-G-T--AAC-T-C----AG-A---AC--T-C----TACT-TGT-----T-GTGGA--C--AAG---CC-T--TACCATTAACA--C-T-GAA-ACCGA-GT---TTTCTA-TGCAA-AG-TAACAGATAAC-TCGAC---------AC-AATCCT----C----AGT-A---G---C----AAGGT-CT-TTCTC-TTGCTTTC-TA---C--T---T---------------G-T--A-TC-AT----C-G-TATTCTATCC-GTCTATC-AC--A-A-----GT-GG-AC-C-AA-TG-AGGACGAATTG-A-TGAATGA----CCA--AT-TTtccacgtacgatcaactcaacacagagtaaaacgaggttaatagaaaagaatagtgacgacgcatcggctgttttccatgtttgcttctattcaataaatatttctgttaataaatttatttgaataacatttttaaccatgattatttctttaaatcatcaacataaatcgctttacttttttatcttcgtaactcagaactctacttgttgtggacaagccttaccattaacactgaaaccgagttttctatgcaaagtaacagataactcgacacaatcctcagtagcaaggtctttctcttgctttctacttgtatcatcgtattctatccgtctatcacaagtggaccaatgaggacgaattgatgaatgaccaattt
gi|56138                      :                       ttataacgaatttggtgatcgaaattgaatttcccgccattttgaagaaaaagtctgctacccagcagaatccacgtacgatcaactcaacacagagtaaaacgaggttaatagaaaagaatagtgacgacgcatcg--G-A-A--TT-G-A-A--TT---TCC-G-CCATTT-T--GA--AA--A-AA-AAA--AGTT--------C-T---GCA--C-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-A
gi|56139                      :                                                                                                                                                                                 --TT---CCC-A-CCACTT-T--G---AA--G-AA-ATA--AGTC--------T-C---GC---A-T-TTT-G------T---ATGT-A-------A-AAGAGTTGAA--C--C-GCTGT-T-T-TC---------------------CA-TGT-TT-G-C-C---------T-TT-------A----TAAT--A-TTC---AC----------TT-----TC-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-CT-----T-G-T---A----AT-----------T-T-A--AT-TG--------TAAGTTGT-T---T-------AA---A-----AT-T-GTT-----T----A
gi|56140                      :                                                                                                                                                                                          C-G-CCATTT-T--G---AA--G-AA-AAA--AGTT--------C-T---GTC--A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--A--C--T-GCTGT-T-T-TC---------------------TA-TGT-TT-G-T------------------------------------------------------------------------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---A----A------------T-A-A--AT-T---------TA--T--T-T---T-------TA---A-----AA-T-TTT-----C----AA-C
gi|56141                      :                                                                                                                                                                                               CATTT-T--G---AAAGG-GG-GAA--A--T--------C-G---GCC--A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AAGAGTT--G--C--C-GCTGT-T-T-TC---------------------CT-TAT-TT-G-C-T---------T-ATATAAAGAA----TA----A-TTC---T-----------TG-----TA-A--------------A-----------T-------------A------T----------------T-TT-C------T-G-T---A----A------------T-A-A--AT-T---------TA--T--T-T---T-------
gi|56142                      :                                                                                                                                                                                                                    -AAA--AGTT--------C-T---GTC--A-T-TTT-G------T---A-GA-A-------A-AGGAATT--A--C--C-GCTGta
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gi|56153                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               TG---TT-TA---C--T---TT---A---A--CACAG-TA-A-TT-AC----C-G-GGGTCTTTCT-G-----C-AC--A-G-----GT-GG-A--C-AC-CG-GAA----ATCG-A-T-AATGA----CCA--AT-
gi|56154                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CTTTCT-G-----C-AC--A-G-----GT-GG-A--C-AC-CG-GAG----ATTG-A-T-AATGA----CTA--AT-TTAC