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Alignments
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Reference ( family-414 )      : TATGGAG--C-G-CC---AA--A-TT----A---A-CAT-AAA-C-T----C-AAA-T-----A--A-TT-GA--AG-A------T-A-TC-TTT-AATT
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gi|32411                      :      AG--C-G-CC---AA--A-TT----A---C-CAT-AAA-C-T----C-AAA-T-----A--G-TT-CA--AA-A------T-A-TC-TTTCAATT


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blockSeqs                     :        .       .    .     .    .               .          .     .        .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :        .       .    .     .    .               .          .     .        .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :        .       .    .     .    .               .          .     .        .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :        .       .    .     .    .               .          .     .        .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :        .       .    .     .    .               .          .     .        .   . .        .  .   .
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blockSeqs                     :        .       .    .     .    .               .          .     .        .   . .        .  .   .
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blockSeqs                     :        .       .    .     .    .               .          .     .        .   . .        .  .   .
blockSeqs                     :        .       .    .     .    .               .          .     .        .   . .        .  .    
blockSeqs                     :        .       .    .     .    .               .          .     .        .   . .        .  .    
blockSeqs                     :        .       .    .     .    .               .          .     .        .   . .        .  .    
blockSeqs                     :        .       .    .     .    .               .          .     .        .   . .        .       
blockSeqs                     :        .       .    .     .    .               .          .     .        .   . .        .       
blockSeqs                     :        .       .    .     .    .               .          .     .        .   . .        .       
blockSeqs                     :        .       .    .     .    .               .          .     .        .   . .                
blockSeqs                     :        .       .    .     .    .               .          .     .        .   .                  


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : TATGGAG--C-G-CC---AA--A-TT----A---A-CAT-AAA-C-T----C-AAA-T-----A--A-TT-GA--AG-A------T-A-TC-TTT-AATT
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Alignments
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lowQualScore                  :        .. . .  ...  .. .  .... ... .   .   . . .... .   . ..... .. .  .  ..  . ...... . .  .   .    
lowQualScore                  :        00 8 8  333  00 8  6666 333 8   8   8 8 6666 8   8 66666 88 8  8  00  5 000000 8 6  7   8    
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Reference ( family-414 )      : TATGGAG--C-G-CC---AA--A-TT----A---A-CAT-AAA-C-T----C-AAA-T-----A--A-TT-GA--AG-A------T-A-TC-TTT-AATT
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gi|32391                      : TATGGAG--C-G-CC---AA--A-TA----A---A-CAT-AAA-T-T----C-AAG-T-----T--A-TG-GG--AG-A------T-A-TCTTTT-AATT
gi|32392                      : TATGAAT--T-G-AC---AA--A-TT----A---A-CAT-AAA-C-T----C-AAA-T-----A--A-TT-GA--AATAC-----T-A-TC-TTT-AATT
gi|32393                      : TATGGGG--C-G-CC---AA--T-TT----A---A-CAT-ACA-C-T----C-GAA-T-----A--A-TT-GA--CG-A------T-A-TA-ATT-AATT
gi|32394                      : TATGGAG--T-G-CC---AA--A-TT----T---A-CAT-GAT-C-T----T-AAA-T-----A--A-TT-GACTAG-A------T-A-TC-ATT-AATT
gi|32395                      : TATGGAG--C-A-CC---AA--G-TT----A---A-CAT-AAA-T-TCATGC-AAA-T-----A--A-TT-GA--AG-A------T-A-
gi|32396                      : TATGGAG--C-A-CC---AA--A-TA----A---A-CAT-ACA-C-T----C-AAA-T-----A--A-TT-GA--TG-A------T-
gi|32397                      : TATGGAG--C-T-TCTGAAA--A-TC----A---A-CAT-GAA-C-T----C-AAA-T-----A--A-TC-GA--AG-A------T-A-TC-
gi|32398                      : TATGGGG--C-A-AA---AA--A-TT----C---A-CAT-AAA-C-T----C-AAA-T-----A--A-CT-GA--AG-A------T-G-TC-ATT-GATT
gi|32399                      :  ATGGAG--C-G-CC---AA--A-TT----A---A-CAT-AAA-C-T----C-AAA-T-----A--A-GT-GA--AG-A------T-A-TC-TTT-AATT
gi|32400                      :  ATTGAA--C-A-TC---AA--A-TT----A---A-CAT-AAA-C-T----C-AAA-T-----A--A-TT-AA--CG-A------T-G-TC-TTT-AAT
gi|32401                      :  ATGGAG--C-A-CC---AA----TT----A---A-CAT-AAA-C-T----C-AAA-T-----A--A-TT-GA--AG-A------T-T-TC-TTT-AATT
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gi|32403                      :  ATGGAG--C-G-CC---AA--A-TT----A---A-CAA-GAT-C-T----C-AAC-T-----A--A-TT-GT--AG-A------T-A-TC-TTT-AATT
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gi|32406                      :   TGGGG--C-T-CC---AA--A-TT----A---G-AA--AAA-C-T----C-AAA-T-----A--A-TT-GA--AG-A------T-A-T--TTT-AATT
gi|32407                      :   TGAAG--C-G-CC---AT--A-TT----A---A-CAT-AAA-C-T----A-AAA-A-----A--A-TT--A--AC-A------T-A-TC-TTT-AATT
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gi|32409                      :     GAG--C-G-CC---AA--A-TT----A---A-CGT-AAA-C-T----C-AAA-T-----A--A-TT-GA--AG-A------T-A-TC-TTT-
gi|32410                      :      AG--T-G-CC---AA--A-TT----A---A-CAT-AAA-C-T----C-AAA-T-----A--A-TC-GA--AG-A------T-A-CT-TTT-AAT
gi|32411                      :      AG--C-G-CC---AA--A-TT----A---C-CAT-AAA-C-T----C-AAA-T-----A--G-TT-CA--AA-A------T-A-TC-TTTCAATT