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Reference ( gi|54091 ) : CGTTCT--A-TTG--C--CC--TCG---G--C------T-G---GC--------GC----C---T----C--G---G--G--C--AA-T--A-G-AAC-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-C--GGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C--GG---T-C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AC-C----A---G-A----CA-T-TAA-A-T-A-A--CTG-TATATTA
gi|54095 : CGTTCT--A-TCG--C--CT--TCG---G--C------T-G---GC--------GC----C---T----C--G---G--G--C--AA-C--A-G-AAC-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-G-TTCT---CAG--TA-C--C-T-C--GGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C--GG---T-C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA-T-TAA-A-T-A-A--CTG-TATATTA
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gi|54125 : CT--G-TTG--C--CC--TCG---G--C------C-T---GCCG------GC----C---T----C--A---G--G--C--AA-C--A-G-caagtgcattgagctgttccatacgagggaaaaatatttccggtctattgaactgatcagacattaaatactgttttatta
gi|54127 : --C------C-G---GC--------GC----C---T----C--G---G--G--C--AA-T--A-G-AAC-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-C--GGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C--GG---T-C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA-T-TTA-A-T-A-A--CTG-Tttctcttggtcatccccgatactgaggacaatggtttggactgttacccaaatacccatggaataactgttttatta
gi|54119 : ggtt-G---GC--------GC----CAAGC----C--G---G--GG-C--AAAT--A-TTAAC-G--TCG-C-A-T--T-G-ATAGC-T-G-TTCC---CAA--TA-C--CGTAT--GGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C--GG---T-C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA-T-T-A-A-T-A-A--ATG-T
gi|54126 : tctactttgccga---GC--------GC----C---T----C--G---G--G--C--AA-T----G-AAC-G----G-C-A-TGCT-G----GC-T-G-TTCC---TA---TA-C--C-G-A--GGG---A-AA--A---T-A-T---T--C-C--GG---T-C-T-----A-T---G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA-T-TAA-A-G-A-A--CTG-Tttttatt
gi|54130 : cagggc----C--G---G--G--CC-AA-T--A-G-ACG-G--T-G-CCA-T--T-G-A--GC-TAG-TTCC---CAG--TA-C--A-A-C---GG---A-GA--A--AT-A-T---T--C-CG-GG---T-CTT-----A-G-T-G--A-C-T---------G-AA-T----A---C-ATGTGCA-T-TAA-A-T-A-A--CTtttat
gi|54131 : cg--G---G--G--C--AA-T--A-G-AAC-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-C--GGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C--GG---T-C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA-T-TAA-A-T-A-A--CTA-T
gi|54132 : --G---G--G--C--AA-G--A-G-AAC-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-T-TTCC---CAG--TA-C--G-T-C--GGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C--GG---T-C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA-T-TAA-A-T-A-A--CTG-TATATTA
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gi|54133 : gccga--G---G--G--C--AA-T--A-G-AAC-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-A-CG-GGG---A-AA--A--AT-A-G---T--C-C--GG---T-C-TATTAAA-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA-T-TAA-A-T-A-A--CTG-T
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gi|54141 : --TA-C--C-T-C--GGG---A-AA--A--AT-A-T---TT-C-C--GG---T-C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----GA-A-T-A-A--
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Reference ( family-410 ) : CGTTCT--A-TTG-C--CC--TCG-G--C--C------G---G-C--GC---C---T----CG---GG--C--AA-T--A-G-AAC-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-C--GGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TA-A-A-T-A-A--CTG--TT-T--ATTA
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gi|54118 : TTCT--A-TTG-G--CC--TCG-G--C--T------GC--G-C---C---C---T----CG---GG--C--AA-T--A-G-AAC-GC-T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-C--GGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----ATT-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CC----T-T----A-T-A-A--CTG--T
gi|54119 : ------G---G-C--GC---CAAGC----CG---GGG-C--AAAT--A-TTAAC-G--TCG-C-A-T--T-G-ATAGC-T-G-TTCC---CAA--TA-C--CGTAT--GGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-T--A-A-T-A-A--ATG--TT-T---TTAatt
gi|54120 : tctactttgccgaTCT--A-TTGGC--CC--GCGAG------------G---G-C--GCTAGC---C----CGAA-GG--C-----T--A-G-AAA-GAGT-GAC-A-T--T-G-A--GC-T-G-TTCCATCCAA--GA-----------GGG---A-AATTA--AT-A-T---C--CAC---GG-T--C-T-----AAT-T-GG-A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TA-A-A-T-A-A--CTG--TT-T--ATTAtt
gi|54121 : CT--A-TTG-C--CC--TCG-G--C--C------G---G-T--GC---C---T----TG---GG--C--AA-T--A-G-AAC-A--T-G-C-ATT--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-CT-AGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A-----A----CA----T-TA-T-A-T-ATA--CTG--T
gi|54122 : CT--A-TTG-C--CC--TCG-G--C--C------G---G-T--GC---C---T----TG---GG--C--AA-T--A-G-AAC-A--T-G-C-ATT--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-CT-AGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A-----A----CA----T-TA-T-A-T-ATA--CTG--T
gi|54123 : CT--A-TTG-C--CC--TCG-G--C--C------G---G-T--GC---C---T----TG---GG--C--AA-T--A-G-AAC-A--T-G-C-ATT--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-CT-AGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A-----A----CA----T-TA-T-A-T-ATA--CTG--T
gi|54124 : CT--A-ATG-C--CC--TCG-G--C--T------G---G-T--GC---C---T----CA---GG--CCAAA-T--A---AAC-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-GCTTCC---CAG--TA-C--C-T-C--GG------AA--A--AT-A-T---T--C-C---GGTT--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----AG--G-A----CA------TA-A-A-T-A-A--
gi|54125 : CT--G-TTG-C--CC--TCG-G--C--C------T---G-CCGGC---C---T----CA---GG--C--AA-C--A-G-
gi|54125 : CT--G-TTG-C--CT--GAG-G--C--C------G---G-CAGGC---C---G----AG---GG--C--AA-C--A-G--------T-T-C-T-C--T-T-G--GT-C-A-TCCC---CGA--TA-C--T------GAG---G-AC--A--AT-G-G---T--T-T---GG-A--C-T-----G-T-T-A--C-C-C---------A-AA-T----A---C-C----CA----T-GG-A-A-T-A-A--CTGT-TT-T--ATTAttctcttggtcatccccgatactgaggacaatggtttggactgttacccaaatacccatggaataactgttttatta
gi|54126 : ---G-C--GC---C---T----CG---GG--C--AA-T----G-AAC-G----G-C-A-TGCT-G----GC-T-G-TTCC---TA---TA-C--C-G-A--GGG---A-AA--A---T-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T---G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TA-A-A-G-A-A--CTG--TT-T--
gi|54127 : cagggc--C--C------G---G-C--GC---C---T----CG---GG--C--AA-T--A-G-AAC-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-C--GGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TT-A-A-T-A-A--CTG--Ttat
gi|54128 : ggttG---GG--C--AA-T--A-G-AAC-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-C--GGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------A-AT-C----A---A-A----CA----T-TA-A-A-T-A-A--CTGT-TT-T--ATTA
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gi|54134 : G---GG--C--AA-T--A-G-AAC-A------C-A-T--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-C--GGG---A-AA--A--AT-A-C---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G---------------------------------A-T-A-A--CTGT-TT-T--ATTA
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gi|54137 : ---GG--C--AA-T--A-G-AAC-G--T-G-C-GCT--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-C--GGG---A-AA--A--A--A-T---T--C-C---G--T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TA-A-A-T-A-A--CTGT-TT-T--ATTA
gi|54138 : ---GG--C--AA-T--A-GGAAC-A------C-T-T--T-G-A--GCCT-G-TTCT----GG--TA-CACC-T-C--GG------AA--A--AT-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--AGC-TCGAGTAA--G-AT-C----A---GTA----CT----TATA-A-A-TGA-A--CTG--T
gi|54139 : -C-A-T--T-A-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-C--GGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-A--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TA-A-A-T-A-A--CTG--TA-T--ATTA
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gi|54141 : --TA-C--C-T-C--GGG---A-AA--A--AT-A-T---TT-C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA-------G-A-A-T-A-A--
gi|54142 : --GGA---A-AA--A--GT-A-T---T--C-----GG-T--C-T-----A-T-T-G--AAC-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TG-A-----A-A--CTG--TT-T--
Alignments
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Reference ( family-410 ) : CGTTCT--A-TTG-C--CC--TCG-G--C--C------G---G-C--GC---C---T----CG---GG--C--AA-T--A-G-AAC-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-C--GGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TA-A-A-T-A-A--CTG--TT-T--ATTA
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gi|54108 : CGTTCT--ACTTG-C--CC--TCG-A------------G---G-C--GCG--C---C----CG---AGATC--AA-T--A-A-AACCG--T-G-C-A-TG-T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAA--TA-C--G---A--GGG---A-AA--A--AT-A-TGGTC--C-C---GG-T--C-T-----AAT-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TA-T-A-T-A-A--CTG--TT-T--TTT
gi|54109 : CGTTCT--A-TTG-CGCCC--TCG-G--C--C------T---GTC--GC---C---T----CG---GG--C--AA-T--A-G-AACCG--T-G-C-T-T--G-G-A--G----G-TTCC---CAAGTTA-C--C-T-C--GGG---A-AAT-A--ATTA-T---T--T-C---GGATA-C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-CGATCA---G-A----CA----T-TA-A-A-T-A-A--CTG--Tt
gi|54110 : CGTTAT--A-T-G-T--CC--ACG-G--G--C------GC--A-C--GG---C---G----AG---GG--C--A--T--A-G-AAC-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-G-TCCC---------A-C--C-C-CGAGGG---A-AA--A--AT---T---T--CGC---GG-T--C-T-----ATT-T-G--A-C-T---------G-A--C----A---G-A----CT----T-AA-A-A-T-A-A---TGT-TT-T--ATTA
gi|54111 : CGTTCT--A-T-G-C--CC--TCG----C--C------GT--G-C--GC---C---CG---TG---GA--C--A--T--A-T-AAC-G--T-G-C-A-T--T-G-A--G--T-G-T-CC---CA---TA-C--C---C--AGG---A-AA--A---T-A-T------C-C---GG-T--C-T-----A-TAT-G--A-C-T---------G-AT-C----A---T-A----CA----T-TA-A-A-T-A-A--CTG--
gi|54112 : GTTCT--A-TTG-C--CC--AAG-GCAC--C------G--------GC---C---G----AG---GG--C--AA-T--A-G-CAA-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-G-TTCC-----A--TA----C-G-A--GGG---A-AA--A--AT-ATT---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-GA-A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TA-A-A-T---A--CTGT-TT-T--ATTA
gi|54113 : GTTCT--A-TTG-C--CC--AAG-GCAC--C------G--------GC---C---G----AG---GG--C--AA-T--A-G-CAA-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-G-TTCC-----A--TA----C-G-A--GGG---A-AA--A--AT-ATT---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-GA-A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TA-A-A-T---A--CTGT-TT-T--ATTA
gi|54114 : GTTCT--A-TTG-C--CC--AAG-GCAC--C------G--------GC---C---G----AG---GG--C--AA-T--A-G-CAA-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-G-TTCC-----A--TA----C-G-A--GGG---A-AA--A--AT-ATT---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-GA-A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TA-A-A-T---A--CTGT-TT-T--ATTA
gi|54115 : GTTCT--A-TTG-C-------------C--A------G---G-CA-GC---C---TAGTCCGA--GG--C--AA-T--A-G-AAC-G--T-GCC-A-T--T-G-A--GC-T-G-TT-C---CAA--TA-C--C-G-A--GGG-----AA--A--AT-ATT---T--C-C---GG------T-----A-T-TGG--A-CTT---------G-A-------A---G-A----CA----T-GT-A-A-TAA-A--CTGGTTT-T--ATT
gi|54116 : GTTCT--G-TTG-C--CC--TCG-G--C--T------GCTGG-C--CT---C---T----TG---GG--C--AT-T--G-G-AAC-G--C-G-G------T-A-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-C--GGG---A-CA--A--AT-A-T---T--C-T---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TA-A-T-T-A-
gi|54117 : GTTCT--A-TTG-C--CC--GAG-G--CGAC------A---G----GC---C---G----AG---GG--CGCAA-T--A-G-AAC-G--TGG-C-A----T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAAT-TA-C--C-G-A--GGG---A-TA--A--AT-T-A---T--C-C---GG-T----T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---GCA----CA----TGTA-A-A-T-A-ATTCTG--TT-T--ATTA
gi|54118 : TTCT--A-TTG-G--CC--TCG-G--C--T------GC--G-C---C---C---T----CG---GG--C--AA-T--A-G-AAC-GC-T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-C--GGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----ATT-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CC----T-T----A-T-A-A--CTG--T
gi|54119 : ------G---G-C--GC---CAAGC----CG---GGG-C--AAAT--A-TTAAC-G--TCG-C-A-T--T-G-ATAGC-T-G-TTCC---CAA--TA-C--CGTAT--GGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-T--A-A-T-A-A--ATG--TT-T---TTAatt
gi|54120 : tctactttgccgaTCT--A-TTGGC--CC--GCGAG------------G---G-C--GCTAGC---C----CGAA-GG--C-----T--A-G-AAA-GAGT-GAC-A-T--T-G-A--GC-T-G-TTCCATCCAA--GA-----------GGG---A-AATTA--AT-A-T---C--CAC---GG-T--C-T-----AAT-T-GG-A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TA-A-A-T-A-A--CTG--TT-T--ATTAtt
gi|54121 : CT--A-TTG-C--CC--TCG-G--C--C------G---G-T--GC---C---T----TG---GG--C--AA-T--A-G-AAC-A--T-G-C-ATT--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-CT-AGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A-----A----CA----T-TA-T-A-T-ATA--CTG--T
gi|54122 : CT--A-TTG-C--CC--TCG-G--C--C------G---G-T--GC---C---T----TG---GG--C--AA-T--A-G-AAC-A--T-G-C-ATT--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-CT-AGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A-----A----CA----T-TA-T-A-T-ATA--CTG--T
gi|54123 : CT--A-TTG-C--CC--TCG-G--C--C------G---G-T--GC---C---T----TG---GG--C--AA-T--A-G-AAC-A--T-G-C-ATT--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-CT-AGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A-----A----CA----T-TA-T-A-T-ATA--CTG--T
gi|54124 : CT--A-ATG-C--CC--TCG-G--C--T------G---G-T--GC---C---T----CA---GG--CCAAA-T--A---AAC-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-GCTTCC---CAG--TA-C--C-T-C--GG------AA--A--AT-A-T---T--C-C---GGTT--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----AG--G-A----CA------TA-A-A-T-A-A--
gi|54125 : CT--G-TTG-C--CC--TCG-G--C--C------T---G-CCGGC---C---T----CA---GG--C--AA-C--A-G-
gi|54125 : CT--G-TTG-C--CT--GAG-G--C--C------G---G-CAGGC---C---G----AG---GG--C--AA-C--A-G--------T-T-C-T-C--T-T-G--GT-C-A-TCCC---CGA--TA-C--T------GAG---G-AC--A--AT-G-G---T--T-T---GG-A--C-T-----G-T-T-A--C-C-C---------A-AA-T----A---C-C----CA----T-GG-A-A-T-A-A--CTGT-TT-T--ATTAttctcttggtcatccccgatactgaggacaatggtttggactgttacccaaatacccatggaataactgttttatta
gi|54126 : ---G-C--GC---C---T----CG---GG--C--AA-T----G-AAC-G----G-C-A-TGCT-G----GC-T-G-TTCC---TA---TA-C--C-G-A--GGG---A-AA--A---T-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T---G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TA-A-A-G-A-A--CTG--TT-T--
gi|54127 : cagggc--C--C------G---G-C--GC---C---T----CG---GG--C--AA-T--A-G-AAC-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-C--GGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TT-A-A-T-A-A--CTG--Ttat
gi|54128 : ggttG---GG--C--AA-T--A-G-AAC-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-C--GGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------A-AT-C----A---A-A----CA----T-TA-A-A-T-A-A--CTGT-TT-T--ATTA
gi|54129 : gccga---GG--C--AAAT--A-G-AAC-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-G--TCC---TAG--TA-C--CGT-C--GGG---A-AA--AGTAT-A-C---TTGC-C---GG-T--C-T-----A-TGTGG--A-C-T---------GTATGC----AAAGG-A----CA----A-TC-A-A-T-A-A--CTG--
gi|54130 : gctga----CG---GG--CC-AA-T--A-G-ACG-G--T-G-CCA-T--T-G-A--GC-TAG-TTCC---CAG--TA-C--A-A-C---GG---A-GA--A--AT-A-T---T--C-CG--GG-T--CTT-----A-G-T-G--A-C-T---------G-AA-T----A---C-ATGTGCA----T-TA-A-A-T-A-A--CT
gi|54131 : cgG---GG--C--AA-T--A-G-AAC-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-C--GGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TA-A-A-T-A-A--CTA--T
gi|54132 : G---GG--C--AA-G--A-G-AAC-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-T-TTCC---CAG--TA-C--G-T-C--GGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TA-A-A-T-A-A--CTG--TA-T--ATTA
gi|54133 : G---GG--C--AA-T--A-G-AAC-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-A-CG-GGG---A-AA--A--AT-A-G---T--C-C---GG-T--C-TATTAAA-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TA-A-A-T-A-A--CTG--TT-tt
gi|54134 : G---GG--C--AA-T--A-G-AAC-A------C-A-T--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-C--GGG---A-AA--A--AT-A-C---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G---------------------------------A-T-A-A--CTGT-TT-T--ATTA
gi|54135 : G---GG--C--AA-T--A-G-AAC-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-----TTTC---CAG--TA-C--T-A-C--GGGA--A-AA--A--AT-A-T---T----C---GG-T--C-------A-T-T-G--A---T---------G-AC-A----G---G-A----CA----T-TA-A-A-T-A-A--CTG--T
gi|54136 : G---GG--C--AA-T--AAG-AAC-A------C-T-T--T-GGA--GC-T-G-TTCC---CTG---A-C--C-T-C--AGG---A-AA--A---T-A-T--------C---GG-T--C-TG----A-T-T-GTGA-C-TCATATATGAG-AT-T----C---A-A----CA----T-TT-A-A-T-A-A--CTG--TTAT--ATTA
gi|54137 : ---GG--C--AA-T--A-G-AAC-G--T-G-C-GCT--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-C--GGG---A-AA--A--A--A-T---T--C-C---G--T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TA-A-A-T-A-A--CTGT-TT-T--ATTA
gi|54138 : ---GG--C--AA-T--A-GGAAC-A------C-T-T--T-G-A--GCCT-G-TTCT----GG--TA-CACC-T-C--GG------AA--A--AT-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--AGC-TCGAGTAA--G-AT-C----A---GTA----CT----TATA-A-A-TGA-A--CTG--T
gi|54139 : -C-A-T--T-A-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-C--GGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-A--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TA-A-A-T-A-A--CTG--TA-T--ATTA
gi|54140 : -A--GC-T-G-TTCC---CAA--TA-C--C-G-A--GGG---G-AA--A---T-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------A-AT-C----A---G-A----CA----T-TA-A-A-T-A-A--CTGT-TT-T--ATTAtt
gi|54141 : --TA-C--C-T-C--GGG---A-AA--A--AT-A-T---TT-C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA-------G-A-A-T-A-A--
gi|54142 : --GGA---A-AA--A--GT-A-T---T--C-----GG-T--C-T-----A-T-T-G--AAC-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TG-A-----A-A--CTG--TT-T--
blockSeqs : TA C G GC AAGA A CGCCAAAAA CTG T CG TAG TAGTCC AGG AT GC A TA T C AG G C T GC TA A ATC AGT AC CCGA GAA G TT GT T GGT TG A AAG T AT ATTAA T A G TT C CATATATGA GATC AAG A TGTG ATAC G T A T TT GT A TA
blockSeqs : . . . . TC . CCCTTTTT C . AG G AAGCC AA G CA A . G C C C A T G . A A AT . GTAT G T T T T . T G G A A G A G G GA T CGAGTAA A G C TG T A T A T . T . .
blockSeqs : . . . . TC . ACTA T . T . AGCC AA . T . . . . . . . T . . A T G . TCT A . . . T . . G . T . . T . . TG G . . . T C . . . G T . T . .
blockSeqs : . . . . TC . CACC C . A . AGCC A . C . . . . . . . C . . . . A . TCT . . . . T . . A . . . . T . . A A . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . TC . CACC . . A . AGCC A . . . . . . . . . . . . . . G . TCT . . . . . . . . . . . . A . . A . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . TC . CACC . . . . AGCA A . . . . . . . . . . . . . . G . GTC . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . TC . CGAC . . . . AGCC . . . . . . . . . . . . . . . A . ACG . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . GA . CT . . . . ATC . . . . . . . . . . . . . . . A . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . TC . CT . . . . GCC . . . . . . . . . . . . . . . G . GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . GA . CT . . . . CGT . . . . . . . . . . . . . . . A . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . TC . AT . . . . TC . . . . . . . . . . . . . . . A . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . TC . CT . . . . TC . . . . . . . . . . . . . . . G . GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . AC . GC . . . . TC . . . . . . . . . . . . . . . A . GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . TC . CT . . . . TC . . . . . . . . . . . . . . . G . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . AA . CC . . . . GA . . . . . . . . . . . . . . . G . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . AA . CC . . . . TC . . . . . . . . . . . . . . . G . GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . AA . GC . . . . GA . . . . . . . . . . . . . . . A . CG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . .
blockSeqs : . . . . TC . CC . . . . TC . . . . . . . . . . . . . . . A . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . GA . CA . . . . GA . . . . . . . . . . . . . . . A . GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . TC . CT . . . . CC . . . . . . . . . . . . . . . A . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . GC . CT . . . . TC . . . . . . . . . . . . . . . A . GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . TC . CC . . . . GA . . . . . . . . . . . . . . . G . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . TC . CC . . . . GA . . . . . . . . . . . . . . . G . GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . TC . CC . . . . GA . . . . . . . . . . . . . . . A . GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . TC . CT . . . . GA . . . . . . . . . . . . . . . A . GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . TC . CC . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . G . GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . GA . CC . . . . GA . . . . . . . . . . . . . . . G . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . CC . . . . TC . . . . . . . . . . . . . . . G . GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . C . . . . CC . . . . . . . . . . . . . . . G . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . A . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . G . GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . G . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . . . . G . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . . . . G . AC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . GA . . . . . . . . . . . . . . . G . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . TC . . . . . . . . . . . . . . . G . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . TC . . . . . . . . . . . . . . . G . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . G . AC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . G . GA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . A . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
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Reference ( family-410 ) : CGTTCT--A-TTG-C--CC--TCG-G--C--C------G---G-C--GC---C---T----CG---GG--C--AA-T--A-G-AAC-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-C--GGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TA-A-A-T-A-A--CTG--TT-T--ATTA
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gi|54120 : tctactttgccgaTCT--A-TTGGC--CC--GCGAG------------G---G-C--GCTAGC---C----CGAA-GG--C-----T--A-G-AAA-GAGT-GAC-A-T--T-G-A--GC-T-G-TTCCATCCAA--GA-----------GGG---A-AATTA--AT-A-T---C--CAC---GG-T--C-T-----AAT-T-GG-A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TA-A-A-T-A-A--CTG--TT-T--ATTAtt
gi|54121 : CT--A-TTG-C--CC--TCG-G--C--C------G---G-T--GC---C---T----TG---GG--C--AA-T--A-G-AAC-A--T-G-C-ATT--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-CT-AGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A-----A----CA----T-TA-T-A-T-ATA--CTG--T
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gi|54127 : cagggc--C--C------G---G-C--GC---C---T----CG---GG--C--AA-T--A-G-AAC-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-C--GGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TT-A-A-T-A-A--CTG--Ttat
gi|54128 : ggttG---GG--C--AA-T--A-G-AAC-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-C--GGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------A-AT-C----A---A-A----CA----T-TA-A-A-T-A-A--CTGT-TT-T--ATTA
gi|54129 : gccga---GG--C--AAAT--A-G-AAC-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-G--TCC---TAG--TA-C--CGT-C--GGG---A-AA--AGTAT-A-C---TTGC-C---GG-T--C-T-----A-TGTGG--A-C-T---------GTATGC----AAAGG-A----CA----A-TC-A-A-T-A-A--CTG--
gi|54130 : gctga----CG---GG--CC-AA-T--A-G-ACG-G--T-G-CCA-T--T-G-A--GC-TAG-TTCC---CAG--TA-C--A-A-C---GG---A-GA--A--AT-A-T---T--C-CG--GG-T--CTT-----A-G-T-G--A-C-T---------G-AA-T----A---C-ATGTGCA----T-TA-A-A-T-A-A--CT
gi|54131 : cgG---GG--C--AA-T--A-G-AAC-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-C--GGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TA-A-A-T-A-A--CTA--T
gi|54132 : G---GG--C--AA-G--A-G-AAC-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-T-TTCC---CAG--TA-C--G-T-C--GGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TA-A-A-T-A-A--CTG--TA-T--ATTA
gi|54133 : G---GG--C--AA-T--A-G-AAC-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-A-CG-GGG---A-AA--A--AT-A-G---T--C-C---GG-T--C-TATTAAA-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TA-A-A-T-A-A--CTG--TT-tt
gi|54134 : G---GG--C--AA-T--A-G-AAC-A------C-A-T--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-C--GGG---A-AA--A--AT-A-C---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G---------------------------------A-T-A-A--CTGT-TT-T--ATTA
gi|54135 : G---GG--C--AA-T--A-G-AAC-G--T-G-C-A-T--T-G-A--GC-----TTTC---CAG--TA-C--T-A-C--GGGA--A-AA--A--AT-A-T---T----C---GG-T--C-------A-T-T-G--A---T---------G-AC-A----G---G-A----CA----T-TA-A-A-T-A-A--CTG--T
gi|54136 : G---GG--C--AA-T--AAG-AAC-A------C-T-T--T-GGA--GC-T-G-TTCC---CTG---A-C--C-T-C--AGG---A-AA--A---T-A-T--------C---GG-T--C-TG----A-T-T-GTGA-C-TCATATATGAG-AT-T----C---A-A----CA----T-TT-A-A-T-A-A--CTG--TTAT--ATTA
gi|54137 : ---GG--C--AA-T--A-G-AAC-G--T-G-C-GCT--T-G-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-C--GGG---A-AA--A--A--A-T---T--C-C---G--T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TA-A-A-T-A-A--CTGT-TT-T--ATTA
gi|54138 : ---GG--C--AA-T--A-GGAAC-A------C-T-T--T-G-A--GCCT-G-TTCT----GG--TA-CACC-T-C--GG------AA--A--AT-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--AGC-TCGAGTAA--G-AT-C----A---GTA----CT----TATA-A-A-TGA-A--CTG--T
gi|54139 : -C-A-T--T-A-A--GC-T-G-TTCC---CAG--TA-C--C-T-C--GGG---A-AA--A--AT-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-A--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TA-A-A-T-A-A--CTG--TA-T--ATTA
gi|54140 : -A--GC-T-G-TTCC---CAA--TA-C--C-G-A--GGG---G-AA--A---T-A-T---T--C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------A-AT-C----A---G-A----CA----T-TA-A-A-T-A-A--CTGT-TT-T--ATTAtt
gi|54141 : --TA-C--C-T-C--GGG---A-AA--A--AT-A-T---TT-C-C---GG-T--C-T-----A-T-T-G--A-C-T---------G-AT-C----A---G-A----CA-------G-A-A-T-A-A--
gi|54142 : --GGA---A-AA--A--GT-A-T---T--C-----GG-T--C-T-----A-T-T-G--AAC-T---------G-AT-C----A---G-A----CA----T-TG-A-----A-A--CTG--TT-T--