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Reference ( gi|67309 ) : ATTA--AT-A-T-AA-T-AA---T-G-TT--A--CAT--T-TT----G-A-GTG-T-A------C--------T----A-T-GC--CAA-------AA---TA------G---T--AA-TCAGG--G-TTTT--GA----C-G---C------A-T--G-GT--C-C----AC--G-AG-C---C-G-A--AG------G--C--G--A----GTG-GAC-T--A-T------G---C-G----TC-AAA---A---CC-C-G--AC-T--A---C------TA---TT-------TTG--GC-A-TA--------G------T-A-CA-C-GC------AA-A--AT--G--T--AA-C-ATT-AT-TATT
gi|67310 : ATTA--AT-A-T-AA-T-AA---T-G-TT--A--CAT--T-TT----G-A-GTG-T-A------C--------T----A---GC--CAA-------AA---TA------G---T--AA-TCAGG--G-TTTT--GA----C-G---C------A-T--G-GT--C-C----AC--G-AG-C---C-G-A--AG------G--C--G--A----GTG-GAC-T--A-T------G---C-G----TC-AAA---A---CC-CTG--AC-T--A---C------TA---TT-------TTG--GC-A-TA--------G------TAA-CA-C-GC------AA-A--AT--G--T--AA-C-ATT-AT-TATT
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gi|67339 : -A-T-AA-T-AA---T---TT--A--C-T--T-TT----G-C-GTG-T-A------C--------T----A-T-GC--CAA-------AAAA-TA------G---T--AG-TCAGG--G-TTTTTTGA----CCG---C------A-T--A-GT--C-C----AC--T-CG-C---C-T-T--CG------G--C--T--C----GTG-GAC-C--A-T------G---C-G----TC-AAA---A---CC-CTG--AC-T--A---T------TA---TT-------TTG--GC-A-TA--------G------T-ACCA-CTTC------AA-A--AT--G--T--AA-C-ATT-AT-TAT
gi|67338 : -A-T-AA-T-AA---T-G-TT--A--CAT--T-TT----G-AAGTGGT-A------C--------T----A-T-GC--CAA-------AA---TA------A---T--AG-TCAGG--G-TTTT--GA----C-G---C------A-T--G-GT--C-C----AC--G-AG-C---C-G-A--AG------G--C--G--A----GTG-GAC-T--A-T------G---CGG----TC-AAA---AAACCC-T-G--AC-T--A---C------TATT-TT-------TTG--GC-A-TA--------G------T-A-CA-C-GC------AA-A--A---G--T--AA---ATT-AT-TATTt
gi|67338 : -A-T-AA-T-AA---T---TT--A--C-T--T-TT----G-C-GTG-T-A------C--------T----A-T-GC--CAA-------AAAA-TA------G---T--AG-TCAGG--G-TTTTTTGA----CCG---C------A-T--A-GT--C-C----AC--T-CG-C---C-T-T--CG------G--C--T--C----GTG-GAC-C--A-T------G---C-G----TC-AAA---A---CC-CTG--AC-T--A---T------TA---TT-------TTG--GC-A-TA--------G------T-ACCA-CTTC------AA-A--AT--G--T--AA-C-ATT-AT-TAT
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gi|67340 : -A-T-AA-T-AA---T-G-TT--A--CATATT-TT----G-C-GTG-T-A------C--------A----C-T-GC--CAA------------TA------G---T--AG-TCAGG--G-TT----GAA---C-G---T------A-T--A-GT--C-C----AC--T-CG-C---C-T-T--CG------G--C--T--C----GTG-GAC-C--A-T------G---C-G----TCGAAA---A---CC-CTG--AC-T--A---C------TA---TT-------TTG--GC-A-TA--------G------T-A-CA-C-TC------AA-A--AT--G--T--AA-C-ATT-AT-TATat
gi|67333 : -A-T-AA-T-AA---T-G-TT--A--CAT--T-TT----G-A-GTG-T-A------C--------T----A-T-GC--CAA-------AA---TA------G---T--AG-TCAGG--G-TTTTC-GA----C-G---C------A-T--G-GT--C-C----AC--G-AG-C---C-G-A--AG------G--C--G--A----GTG-GAC-T--A-T------A---C-G----TT-CAA---C---CC-T-G--AC-T--A---C------TA---TT---------G--GC-A-GT--------G------T-A-CA-C-GC------AA-A--ATATG--T--AA-C-ATT-AT-TATTtat
gi|67333 : at-A-T-AA-T-AA---T-G-TT--A--CATATT-TT----G-C-GTG-T-A------C--------A----C-T-GC--CAA------------TA------G---T--AG-TCAGG--G-TT----GAA---C-G---T------A-T--A-GT--C-C----AC--T-CG-C---C-T-T--CG------G--C--T--C----GTG-GAC-C--A-T------G---C-G----TCGAAA---A---CC-CTG--AC-T--A---C------TA---TT-------TTG--GC-A-TA--------G------T-A-CA-C-TC------AA-A--AT--G--T--AA-C-ATT-AT-TAT
gi|67326 : ata-A-T-AA-T-AA---TTG-TTTAA--CAT--T-TTT---G-C-GTG-T-A------C--------T----A-TTGC--CAA-------AA---TA------G---T--AG-TCAG-----TTTT--GA----C-GG--C------AAT--A-GT--C-C----AC--TTCG-C---C-T-T--CG------A--C--T--C----GTG--AC-C--A-T------G---C-G----TC-AAA---AAC-CC-T-G--AC-T--A---C------TA---TT-------TTG--GC-A-TA--------T------T-A-CA-C-TC-------A-A--AT--G--T--AA-C-ATT-AT-
gi|67315 : tata-A-T-AA-T-AA---TTG-TT--A--CAT--T-TT----G-C-GTG-TTA------C--------T----A-T-GC--CAA-------AA---TA------G---T--AG-TCAGG--G-TTTT--GA----C-G---C------A-T--A-GT--C-C----AA--C-TG-CCTTC-G-----G------A--C--T--C----GT--GAC-C----T------G---C-G----TC-AAA---A---CC-CTG--AA-C--A---T------CATATTT-------TTG--GC-A-TA--------G------T-A-CA-C-TC------AAGA--AT--G--TG-AA-C-ATT-tat
gi|67314 : attacaatacacc-A-T-AA-T-AA---TTG-TT--A--CAT--T-TT----G-C-GTG-TTA------C--------T----A-T-GC--CAA-------AA---TA------G---T--AG-TCAGG--G-TTTT--GA----C-G---C------A-T--A-GT--C-C----AA--C-TG-CCTTC-G-----G------A--C--T--C----GT--GAC-C----T------G---C-G----TC-AAA---A---CC-CTG--AA-C--A---T------CATATTT-------TTG--GC-A-TA--------G------T-A-CA-C-TC------AAGA--AT--G--TG-AA-C-ATT-ta
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gi|67354 : tata-A-T-AA-T-AG---T-G-TT--A--CAT--A-TT----G-C-GTG-T-G------C--------T----A-T-GC--CAA-------AA---TG------G---T--AT-TCAGG--A-TTTT--GA----C-G---C------A-T--A-GT--C-C----AC-------T---C-G-C--AT------T--C--G--ACTC-GTG-GAC-C--A-T------C---C-G----TG-AAA---A---CC-CTG--AC-
gi|67356 : -A-T-AA-T-AA---T-G-TT--A--CAT--T-TT----G-A-GTG-T-A------C--------T----A-T-GC--CAA-------AA---TA------G---T--AG-TCAGG--G-TTTT--GA----C-G---C------A-T--G-GT--C-C----AC--G-AG-C---C-G-A--AG------G--C--G--A----Gcat
gi|67342 : atgcttc-A-T-AA-T-AA---T-G-TT--A--CAT--T-TT----G-A-GTG-T-A------C--------T----A-T-GC--CAA-------AA---TA------G---T--AG-TCAGG--G-TTTT--GA----C-G---C------A-T--G-GT--C-C----AC--G-AG-C---C-G-A--AG------G--C--G--
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gi|67352 : -A-T-AA-T-AA---T-G-CT--A--CAT--T-TT----G-A-GTG-T-A------C--------T----C-T-GC--CAA-------AA---TA------G---T--AG-TCAGG--G-TTTT--GA----C-G---C------A-T--G-GT--T-C----AC--G-AG-C---C-G-A--A-----------------------------T--G-T------G---C-A----TT-AAA---A---AC------AC-C--A---C------CA---CT-------TTGA-GT-A-TA--------ttt
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gi|67345 : -A-T-GA-T-AA---T-G-TT--A--CAT--A-AT----G-C-GTG-T-A------C--------T----A-T-GC--Catagtacacgcattatgtaacattatcattat
gi|67319 : ataataatgttacattttgagtgtaggcctactatgccaaaatagtagtcagggttatggcgcatggtccacgagctgaa-A-T-AA-T-AA---T-G-TT--A--CAT--T-TT----G-A-GTG-T-AGGCCTAC--------T----A-T-GC--CAA-------AA---TA------G---T--AG-TCAGG--G-TTAT--GG----C-G---C------A-T--G-GT--C-C----AC--G-AG-C---T-G-A--AG------G--C--tat
gi|67351 : ataataatgataatgttacataatgcgtgtactat-A-T-AA-TCAA---T-GGTT--GACCAT--TGTT----G-A-ATG-T-A------C--------T----A---GC--CAA-------AA---TA------G---T---A-TCA-T--A-TTTT--GAAACGT-G---C------A-T--A-GT--C-C----AC--T-CG-C---CTT-C--CG------GCTC--G-------GTG-GAC-CCAA-T------G---A-G----TC-AAA---A---CC-CTG--AC-T--A---C-------A---GT-------TTG--GC---TA--------T------C-A-CA-C-
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gi|67344 : ttat-A-T-AA-T-AA---T-A-TT--A--CAG--T-TT----A-A-GTA-T-ATATATAC--------C----A-T-GC--CAA-------AA---TA------G---TTAAG-TTATG--G-ATTA--AA----C-A---A------A-C--A-GT--G-C----AC--A-AT-C---G-T-A--AG------G--A--G--A----GTG-CAC-T--A-A------T---T-G----TT-AAA---A---CC-CTG--AC-T--A---C------TA---TT-------ATG--GC-A-TGCCCGGCCGG------T-A-TA-C-TC------AA-G--AT--G--T--AA-C-ATT-AT-TAT
gi|67344 : -A-T-AA-T-AA---T-G-TT--A--CAT--C-TT----G-A-GTA-T-A------CCGGCCGGGC----A-T-GC--CAT-------AA---TA------G---T--AG-TCAGG--G-TTTT--AA----C-A---A------T-T--A-GT--G-C----AC--T-CT-C---C-T-T--A----------C--G--ATT--GTG-CAC-T--G-T------T---T-G----TT-TAA---T---CCAT-A--AC-TTAA---C------TA---TT-------TTG--GC-A-TG--------GTATATAT-A-TA-C-TT------AA-A--CT--G--T--AA-T-ATT-AT-TAT
gi|67334 : -A-T-AA-T-AA---T-G-TT--A--CAT--T-TT----G-C-GTT-T-A------C--------T----
gi|67341 : ata-A-T-AA-T-AA---T-G-TG--A--CAT--T-TT----G-A-GTG-T-A------C--------T----A-T-GC--CAA-------AA---TA------G---T--Atcggcacatggacgtatgcgttaaaacctgactactattttgccatagtacatgcaaaataacattaattattat
gi|67362 : -A-T-AA-T-AA---T-G-TG--A--CAT--T-TT----G-A-GTG-T-A------C--------T----A-T-GC--CAA-------AA---TA------G---T--Ag
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gi|67360 : -A-T-AA-T-AA---A-G-TT--A--CAA--T-TT----G-G-GTA-T-T------C--------T----A-T-GC--CAA-------AA---TA------G---T--AG-TCAGG--G-TT
gi|67361 : tgtacaatttgccc-A-T-TA-T-AA---T-G-TT--A--CAT--T-TT----G-T-ATG-T-C------C--------T----A-A-GC--TAA-------A----TA------G---T--AG-TCAGG--G-TTTT--GA----C-
gi|67346 : -A-T-TA-T-AA---T-G-TT--A--CAT--T-TT----G-T-ATG-T-C------C--------T----A-A-GC--T-A-------AA---TA------G---T--AG-TCAGG--G-TTTT--GA----C-
gi|67336 : -A-T-AA-T-AA---T-G-TT--A--CAT--T-TT----G-C-TTG-T-A------C--------T----A-T-GCGTCAA-------AA---
gi|67322 : ta-T-AA-T-AT---T-G-TT-------T--T-AT----G-C-ATG-T-A------G--------T----A-T-GT--CAA-------AA---CA------G---T--AG-TTAAA--C-TTTT--GA----C-A---T------A-C--A-GT--G-C----AT--A-AA-G---T-A-G--AG------A--A--G--T----GCG-GAT-T--A-TATATAGG---T-A----TC-AAA---A---CC-CTG--ACTT--AATTC------TA---TT-------TCA--AC-A-T
gi|67348 : attatgatatacaatgtcatgcattctagctgattcatg-AA-T-CA---T-G-T---A--CAC--T-TTCTTGA-A-GCG---A------C--------T----A-TAGC--CAATCACGACAA---TA------G---T--AG-TCAGG--G-TTTT--GA----CTGCCCC------A-T--G-GTCGC-T----AC--G-AG-C---C-G-AATAG------G--C--AT-A----GTG-CAC-C--A-ctgt
gi|67320 : -T-AA---T-G-TT--A--CAA--T-TT----GCG-GTG-T-A------C--------T----A-T-CC--AAA-------AA---TA------G---T--CG-T------A-TTTT--CA----C-G---C------A-TT-A-AT--CGC----AC--T-CG-CTC-C-G-C----------G--C-----------TGTGAC-C--A-T------G---C-GA---TC-AAA---C---CC-T-G--AC-T--A---C------TA---AT-------T----GC-ACTA--------G------T-A-TT-C--T------AA-A--AT--G-----AA-C-ATTAAT-TAactaatgtaactagttctagttattattaattagtattatatctattattattattattat
gi|67349 : ataatat-T-AA---T-G-TT--A--CAA--T-TT----GCG-GTG-T-A------C--------T----A-T-CC--AAA-------AA---TA------G---T--CG-T------A-TTTT--CA----C-G---C------A-TT-A-AT--CGC----AC--T-CG-CTC-C-G-C----------G--C-----------TGTGAC-C--A-T------G---C-GA---TC-AAA---C---CC-T-G--AC-T--A---C------TA---AT-------T----GC-ACTA--------G------T-A-TT-C--T------AA-A--AT--G-----AA-C-ATTAAT-TA
gi|67314 : -AA---T-G-TTC-A--CAT--TCTT----G-A-GTG-T-A------C--------T----A-T-GC--CAA-------AAATATG------A---T--GT-TCAGG--G-TTTT--GA----C-G---C------A----G-GT--C------AC--G-AGTC---C-G-A--AG------G--C--A--G----TTG-GAC-T--A-T------G---C-G----TC-AAA---A---CC-CTG--AC-T--A---C------TA---TT-------TTG--GC-A-TA--------G------TAA-CA-C-GC------AA-A--AT--G--T--AA-CAATT-AT-TATTatat
gi|67353 : attt-TT--T--CAT--T-TT----G-C-GTG-T-A------C--------T----A-T-GC--CAA-------AA---TA------G---T--AG-TCAGG--G-TTTT--GA----C-G---C------A-T--G-GT--C-C----AC--G-AG-C---C-G-A--GT------G--T--C--C----AT---AA-T--G-T------G---C-A----TT-AAA---A---AC------AC-C--A---C------CA---CT-------TTG--
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gi|67329 : -A-GTG-T-G------A--------T----A---GC--CAA-------AC---T-------G---T--AG-TCAGG--G-TTTT--GA----C-T---C------A-TTGG-GT--C-C----ACC-G-AG-C---C-GGA--AG------G--C--G--A----GTG-GAC-T--A-T------G---C-ACGTTTC-AAA---A---TA-T-G--A--T--A---C------TA---TT-------TTG--GC---TA--------G------T-A-CA-T-TC------AACA--AT--GGTC--AACC-ATTGAT-TATT
gi|67351 : tata-GTG-T-G------A--------T----A---GC--CAA-------AC---T-------G---T--AG-TCAGG--G-TTTT--GA----C-T---C------A-TTGG-GT--C-C----ACC-G-AG-C---C-GGA--AG------G--C--G--A----GTG-GAC-T--A-T------G---C-ACGTTTC-AAA---A---TA-T-G--A--T--A---C------TA---TT-------TTG--GC---TA--------G------T-A-CA-T-TC------AACA--AT--GGTC--AACC-ATTGAT-TATT
gi|67354 : -TCAGG--G-TTTT--CA----C-G---G------A-T--G-GT--C-C----AC--G-AG-T---C-G-A--AT------G--C--G--A----GTG-GAC-T--A-T------G---C-G----TC-AAA---AT--CC-T-G--AA-T--A---C------CA---TT-------TTG--GC-A-TA--------G------C-A-CA-C-GC------AA-T--AT--G--T--AA-C-ACT-AT-TAT
gi|67317 : g-TCAGG--G-TTTT--CA----C-G---G------A-T--G-GT--C-C----AC--G-AG-T---C-G-A--AT------G--C--G--A----GTG-GAC-T--A-T------G---C-G----TC-AAA---AT--CC-T-G--AA-T--A---C------CA---TT-------TTG--GC-A-TA--------G------C-A-CA-C-GC------AA-T--AT--G--T--AA-C-ACT-AT-TATcat
gi|67318 : ataatgG--G-TTTT--GA----C-G---C------A-T--G-GT--C-C----AT--G-AG-C---T-G-A--AG------G--C--TCCA----GTT-TCC-T--A-C----------C-A----CA-AAA---A---AC-C-GTGAC-T--A---C------TA---TT-------TTG--GC-A-TA--------G------T-A-CA-C-AC------AA-A--AT--G--T--AA-C-ATT-AT-TATTc
gi|67355 : atgatG--G-TTTT--GA----C-G---C------A-T--G-GT--C-C----AT--G-AG-C---T-G-A--AG------G--C--TCCA----GTT-TCC-T--A-C----------C-A----CA-AAA---A---AC-C-GTGAC-T--A---C------TA---TT-------TTG--GC-A-TA--------G------T-A-CA-C-AC------AA-A--AT--G--T--AA-C-ATT-AT-TATT
gi|67357 : ---C-G-A--AG------G--C--G--A----GTG-GAC-T--A--------G---C------TC-AAA---C---CC-T-G--AC-T--A---C------TA---TT-------TT---GC-A-TA--------T------T-A-CA-C-AC------AA-A--AT--A--T--AA-C-A-T-AT-TATat
gi|67334 : G------G--C--A--C----ATG-GACGT--A-T------G---C-G----TT-AAA---A---CC-T-G--AC-T--A---C------TA---TT-------TTG--CC-A-TA--------G------T-A-CA-T-GC------AA-A--A------T--AA-C-ATTAAT-TATTaat
gi|67330 : ataataataatgttacattttgcgtttacttcG------G--C--A--C----ATG-GACGT--A-T------G---C-G----TT-AAA---A---CC-T-G--AC-T--A---C------TA---TT-------TTG--CC-A-TA--------G------T-A-CA-T-GC------AA-A--A------T--AA-C-ATTAAT-TATTat
gi|67321 : tatG------G--C--G--A----GTG-GAC-T--A--------G---C------TC-AAA---C---CC-T-G--AC-T--A---C------TA---TT-------TT---GC-A-TA--------T------T-A-CA-C-AC------AA-A--AT--A--T--AA-C-A-T-AT-TATgaag
gi|67356 : att----GTG-GAC-C--A-T------G---C-G----TC-AAA---A---CC-CTG--AC-T--A---C------TA---TT-------TTG--GC-A-TA--------G------T-A-CA-C-TC------AA-A--AT--G--T--AA-C-ATT-AT-TAT
gi|67342 : atgcttcctcgccttcggctc----GTG-GAC-C--A-T------G---C-G----TC-AAA---A---CC-CTG--AC-T--A---C------TA---TT-------TTG--GC-A-TA--------G------T-A-CA-C-TC------AA-A--AT--G--T--AA-C-ATT-AT-TAT
gi|67343 : ----GTG-AAC-C--A-T------G---C-G----TC-AAA---A---CC-CTG--AC-T--A---C------TA---TT-------TTG--GC-A-GA--------G------T-A-CA-C-TC------AA-A--AT--G--T--AG-C-ATT-AT-TATgagccgaaggcg
gi|67352 : ----GTG-AAC-C--A-T------G---C-G----TC-AAA---A---CC-CTG--AC-T--A---C------TA---TT-------TTG--GC-A-GA--------G------T-A-CA-C-TC------AA-A--AT--G--T--AG-C-ATT-AT-TATgagccgaatgtgcattaaaaacaccaccactttgagtatattt
gi|67345 : tatactcaaagtggtggtgtttttaatgcacattcggctc----GTG-GAC-C--A-T------G---C-G----CC-ATA---A---CC-CTG--AC-T--A---C------TA---TT-------TTG--GC-A-TA--------GTAGGCCT-A-CA-C-TC------AA-A--AT--G--T--AA-C-ATT-AT-TAT
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gi|67356 : AT-AA-T-AATGTT-A--CATT-TT----GA-GTG---T-A------CTA-T-GCCAA-------AA---TAG---T--A-GTCAGG--G-TTTT-GA-C-G---C------AT--G-GT--CC----AC-GAG-C-CG-A--AGG-CG--A----Gat
gi|67357 : atgcttc-CG-A--AGG-CG--A----GTG-GAC-T-A--------G-C------TC--AAA---CCCTGAC-TA---C------TA--TTTT---GC-AT--------ATT-ACA-CAC-AA-A--ATA--T--AA-C-A-T-ATTAT
gi|67358 : TG--ATAT-A--T-AATGTT-GG-CATT-TT----AC-GAT---T-A------CTG-T-GC--A-------AA---TAG---T--A-GTCAGG--G-TTTT-GA-C-G---CA-----AT--G-GTC-CC----AC-GAG-C-Caat
gi|67359 : TA--ATAT-TG-T-AATGTT-A--CATT-GT----GT-ATG---T-C------CTA-A-GCTAA-------AA---TAG---T--A-GTCAGG--G-TTTT-GA-C-G---C------AT--A-GT--------AC-AAG-C-t
gi|67360 : AT-AA-T-AAAGTT-A--CAAT-TT----GG-GTA---T-T------CTA-T-GCCAA-------AA---TAG---T--A-GTCAGG--G-TT
gi|67361 : tgtacaatttgccc-G----TC--AAAA--CCCTGAC-TA---C------TA---TTTA--GC-TT--------AGG-ACA-TAC-AA-A--ATG--T--AA-C-ATT-ATAAT
gi|67362 : AT-AA-T-AATGTG-A--CATT-TT----GA-GTG---T-A------CTA-T-GCCAA-------AA---TAG---T--A-G
blockSeqs : TG A ATG C CTTG A ATT T GGCCTA G TCACGAC ATA AAT TA A TA T C T CCC CTATAT TG C CG ACTG C T G G AT C CC CTTT C A A T ATATAG C G CGTT AA AAC T ATT TACATG TT AC A GCCCGGCC A C A C AT GT TA C A G
blockSeqs : . A ATG C . A ATT T TATATA G . ATA AAT TA A TA T C T . CTATAT TG C C ACTG C T G G . C CC CTTT C A A T ATATAG C G CGTT AA AAC T ATT TACATG TT A A GCCCGGCC A C A C AT GT TA C A G
blockSeqs : . . CA . . . G . TATATA . . . . . . . . . . . A . . C . . . . . . . A . . . . . . . . TT . C . . . . A . . A . . . . . . . A .
blockSeqs : . . CA . . . G . GGCCTA . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . A . . . . . . . . TT . C . . . . . . . A . . . . . . . A .
blockSeqs : . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . T . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . TA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . GG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . GG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . .
blockSeqs : . . .
blockSeqCons :
originalCons : ATTA--ATAT-AA-T-AATGTT-A--CATT-TT----GA-GTG---T-A------CTA-T-GCCAA-------AA---TAG---T--A-GTCAGG--G-TTTT-GA-C-G---C------AT--G-GT--CC----AC-GAG-C-CG-A--AGG-CG--A----GTG-GAC-T-A-T------G-C-G----TC--AAAA--CCCTGAC-TA---C------TA--TTTTG--GC-AT--------AGT-ACA-CGC-AA-A--ATG--T--AA-C-ATT-ATTATT
finalCons : ATTA--ATAT-AA-T-AATGTT-A--CATT-TT----GA-GTG---T-A------CTA-T-GCCAA-------AA---TAG---T--A-GTCAGG--G-TTTT-GA-C-G---C------AT--G-GT--CC----AC-GAG-C-CG-A--AGG-CG--A----GTG-GAC-T-A-T------G-C-G----TC--AAAA--CCCTGAC-TA---C------TA--TTTTG--GC-AT--------AGT-ACA-CGC-AA-A--ATG--T--AA-C-ATT-ATTATT
Alignments
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lowQualScore : .. . . . .... . .... . ... . ...... . . ....... ... ... .. . .. . . . . ... ...... .. . .. .... . . . . .. . .. .... . . . . ...... . . .... .. ... . ... ...... .. .. . ........ . . . . .. .. .. . . .
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consensus : ATTA--ATAT-AA-T-AATGTT-A--CATT-TT----GA-GTG---T-A------CTA-T-GCCAA-------AA---TAG---T--A-GTCAGG--G-TTTT-GA-C-G---C------AT--G-GT--CC----AC-GAG-C-CG-A--AGG-CG--A----GTG-GAC-T-A-T------G-C-G----TC--AAAA--CCCTGAC-TA---C------TA--TTTTG--GC-AT--------AGT-ACA-CGC-AA-A--ATG--T--AA-C-ATT-ATTATT
Reference ( family-409 ) : ATTA--ATAT-AA-T-AATGTT-A--CATT-TT----GA-GTG---T-A------CTA-T-GCCAA-------AA---TAG---T--A-GTCAGG--G-TTTT-GA-C-G---C------AT--G-GT--CC----AC-GAG-C-CG-A--AGG-CG--A----GTG-GAC-T-A-T------G-C-G----TC--AAAA--CCCTGAC-TA---C------TA--TTTTG--GC-AT--------AGT-ACA-CGC-AA-A--ATG--T--AA-C-ATT-ATTATT
gi|67309 : ATTA--ATAT-AA-T-AATGTT-A--CATT-TT----GA-GTG---T-A------CTA-T-GCCAA-------AA---TAG---T--A-ATCAGG--G-TTTT-GA-C-G---C------AT--G-GT--CC----AC-GAG-C-CG-A--AGG-CG--A----GTG-GAC-T-A-T------G-C-G----TC--AAAA--CCC-GAC-TA---C------TA--TTTTG--GC-AT--------AGT-ACA-CGC-AA-A--ATG--T--AA-C-ATT-ATTATT
gi|67310 : ATTA--ATAT-AA-T-AATGTT-A--CATT-TT----GA-GTG---T-A------CTA---GCCAA-------AA---TAG---T--A-ATCAGG--G-TTTT-GA-C-G---C------AT--G-GT--CC----AC-GAG-C-CG-A--AGG-CG--A----GTG-GAC-T-A-T------G-C-G----TC--AAAA--CCCTGAC-TA---C------TA--TTTTG--GC-AT--------AGTAACA-CGC-AA-A--ATG--T--AA-C-ATT-ATTATT
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gi|67332 : TG--ATAT-A--C-AATGTC-ATGCATT-CT----AG-CTGATTC-A------TGA-T-GTTGA-------AA---TAGAATT--AAGTCAGG--G-TTTT-GA-T-A---CCTATATAT--A-AT--CC----GC-ACT-T-CT--------CT--ACTTTATG-CAC-T-G-T------A-T-G----TC--AAAA--GTTTAAC-TA---C------TG--TTTTG--AC-AT--------ACT-ACA-TGC-AT-A--A-------AA-C-AAT-ATTACTcatgaatcagctagaatgcatgacattgtatatcat
gi|67333 : tacAT-AA-T-AATGTT-A--CATT-TT----GA-GTG---T-A------CTA-T-GCCAA-------AA---TAG---T--A-GTCAGG--G-TTTTCGA-C-G---C------AT--G-GT--CC----AC-GAG-C-CG-A--AGG-CG--A----GTG-GAC-T-A-T------A-C-GT---TC----AA--CCCTGAC-TA---C------TA----TTG--GC-AG--------TGT-ACA-CGC-AA-AATATG--T--AA-C-ATT-ATTATTt
gi|67334 : at--------AGT-AAA-CGC-AA-A--ATG--T--AA-C-ATT-ATTATT
gi|67334 : atTA--ATA--AT-T-AATGTT-A----TT-TT----GC-ATG---T-A------CTA-T-GGCAA-------AA---TAG---T--A-GTCA-G--G-TTTT-AA-C-G---C------AT--ACGT--CC----AT-GTG-C-CG-A--AGtcggcacatggacgtatgcgttaaaacctgactactattttgccatagtacatgcaaaataacattaattattat
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gi|67346 : ataataatgttacattttgagtgtaggcctactatgccaaaatagtagtcagggttatggcgcatggtccacgagctgaa-G----TC--AAAA--CCCTGAC-TA---C------TA---TTTA--GC-TT--------AGG-ACA-TAC-AA-A--ATG--T--AA-C-ATT-ATAATat
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gi|67351 : -GTG---T-G------ATA---GCCAA-------AC---T-G---T--A-GTCAGG--G-TTTT-GA-C-T---C------ATTGG-GT--CC----ACCGAG-C-CGGA--AGG-CG--A----GTG-GAC-T-A-T------G-C-ACGTTTC--AAAA---TATGA--TA---C------TA--TTTTG--GC--T--------AGT-ACA-TTC-AACA--ATGGTC--AACC-ATTGATTATT
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