lowQualScore : 2222222222222222222222222 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 111111111 222222222222222222222222222222 111 111111
lowQualScore : 1 0 0 0 1 1 11 0 0 0 1 2 0 2 777777777777 3333333 44 0 1 11 0 0 222 1 44444444444 1 44444 11 22 444 0 7777777777777 3 333 33 2222222 99999 0 5555555 333 0 2222222222222222222222222 2222 33 1 0 999999 555 33333 6666666666666666 2222 3333 0 88888888 11 1 2 222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222222 11 11 1 222 11 4 1 11 1 1 1 7777777777777 1 9999999 2 1 1 88888888 1 1 11 1 1 555555 1 4 11 1 1 6666 1 11 2 33 555555555 1 2 222 222 66666666666 99 44 1 1 222 1 2222 2 888888888888888888888888888888 1 33 1 33 333 3 000000 4444 1 1 6666666 3 4444 666 11 22 22 6666666 1 1 1
lowQualScore : . . . . . . .. . . . . . . . ............ ....... .. . . .. . . ... . ........... . ..... .. .. ... . ............. . ... .. ....... ..... . ....... ... . ......................... .... .. . . ...... ... ..... ................ .... .... . ........ .. . . ............................................................................................................... .. .. . ... .. . . .. . . . ............. . ....... . . . ........ . . .. . . ...... . . .. . . .... . .. . .. ......... . . ... ... ........... .. .. . . ... . .... . .............................. . .. . .. ... . ...... .... . . ....... . .... ... .. .. .. ....... . . .
lowQualScore : 8 9 9 9 7 7 11 8 8 8 7 5 8 5 111111111111 5555555 33 8 7 11 8 8 333 7 44444444444 7 66666 11 00 888 8 3333333333333 3 999 55 7777777 44444 8 7777777 111 8 9999999999999999999999999 7777 88 8 9 111111 111 11111 0000000000000000 0000 3333 9 11111111 55 1 2 111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 66 77 2 222 77 8 2 77 2 2 2 9999999999999 2 8888888 2 2 2 99999999 3 3 88 3 3 666666 3 0 88 3 3 8888 3 88 6 55 444444444 3 7 333 333 11111111111 00 44 3 3 333 3 7777 6 666666666666666666666666666666 2 00 2 00 777 9 555555 0000 3 3 8888888 9 0000 666 99 00 00 8888888 6 6 6
consensus : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A---C-T-------C---G-T---G-T--G--AT---A-T----------T--T-T---TT--C-------A-----T-A-------T---C-A-------C---------A--C--A-GT----A--T-G-T-AT---T--TC-----C----------------T----ACG----CC-G--C----GT--G-A-C---GA----A---------------A-T-----------------C--A---------------GGA-----------C------------G-A-C--A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TNA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TTA-T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA---AN---T-TC-T---TC---A-----------AN-A--TT-T-G---A-AA----A-CAAT------------------N----A-A----T-TT--ATATG-A--TTG--TT-A--N---GA----AA-T-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
Reference ( gi|116543 ) : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A---C-T-------T---G-T---G-T--G--AT---A-T----------T--T-T---TT--C-------A-----T-A-------T---C-A-------C---------A--T--A-GT----A--T-G-T-AT---T--TC-----C----------------T----ACG----CC-G--C----AT--G-A-C---AA----A---------------A-T-----------------C--A---------------GAA-----------C------------G-A-C--A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TCA-T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TG---AT---T-TC-T---TC---A-----------AC-A--TT-T-G---A-AA----A-CAAT------------------C----A-C----T-TT--ATATG-A--TTG--GT-A--T---GA----AA-T-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116544 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A---C-T-------T---G-T---G-T--G--AT---A-T----------T--T-T---TTT-C-------A-----T-A-------T---C-A-------C---------A--T--A-GT----AA-T-G-T-AT---T---C-----C----------------T----ACG----CC-G--C----AT--G---C---AA----A---------------A-T-----------------C--A---------------GAA-----------C------------G-A-C--A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TCA-T-AAA--------A--TATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-T---G-A--TG---AT---T-TC-T---TC---A-----------AC-A--TT-T-G---A-AA----A-CAAT------------------C----A-C----T-TT--ATATG-A--TTG--GT-A--T---GA----AA-T-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116545 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A---C-T-------T---G-T---G-T--G--AT---ATT----------T--T-T---TT--C-------A-----T-A-------T---C-A-------C---------A--T--A-GT----A--T-G-T-A----T--TC-----T----------------T----ACG----CC-G--C----AT--G-A-C---GA----A---------------A-T-----------------C--A---------------GGA-----------T------------G-A-C--A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TTA-T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TG---AT---T-TC-T---TC---A-----------AC-A--TT-T-G---A-AA----A-CAAT------------------C----A-A----T-TT--ATATG-A--TTG--CT-A--T---AA----AA-T-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--
gi|116547 : TAT-CA-CT-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A---A-T-------T---G-T---G-T--G--AT---A-T----------T--T-T---TT--C-------T-----T-A-------T---C-A-------C---------A--T--A-GG----A--T-A-T-AT---T---C-----C----------------T----ACG----CC-G--C----AT--G-A-C---GA----A---------------A-T-----------------C--A---------------GGA-----------C------------G-A-C--A---A---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T-AACGGATATCA-T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TG---AT---T-TC-T---TC---A-----------AC-A--TT-T-G---A-AA----A-CAAT------------------C----A-A----T-TT--ATATG-A--TAA--TT-A--T---GA----AA-T-TAGTC-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116546 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-G-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A---C-T-------T---G-T---G-T--G--ATA--A-T----------T--T-T---TT--C-------A-----T-A-------T---C-A-------C---------A--T--A-GT----A--T-G-T-A----T--TC-----C----------------T----ACG----CC-G--C----AT--GAA-C---GA----A---------------A-T-----------------C--A---------------GGA-----------C------------G-A-CT-A---A---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T---------TTA-T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TGAA----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--GCG--TA---AT---T-TC-T---GC---A-----------AC-A--TT-T-G---A-AA----A-CAAT------------------C----A-A----T-TT--ATATG-A--TTGT-TT-A--T---GA----AA-T-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116548 : TAT-CA-CA-T---TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-C------------TT-------G--A-T-A--T-C-A---C-T-------T---A-T---G-T--G--AT---A-T----------T--T-T---AT--C-------A-----T-A-------T---C-A-------C---------C--TGGA-GT----A--T-G-T-AC---T---C-----C----------------T----ACG----CC-G--C----GT--G-A-C---GA----A---------------A-T-----------------C--A---------------GGA-----------T------------G-A-C--A---T---A----AT--TTC--C-A---A--TAA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TTA-T-AAA--------A-ATAACGA-TAGA--AG-TG-A----A-A-T-T--G-A-T----G-TT--C-A--TA---AA---T-TC-T---TT---A-----------AA-A--TT-T-G---A-AA----A-CAAC------------------A----A-A----T-TT--ATATG-A--TTG--TT-A--A---GA----AA-T-AAGTT-------AA-GATT----G---A--AATAA--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116551 : TAT-TA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TTTCCAGTTG--A-T-A--T-C-A---C-T-------T---G-T---G-T--G--AT---T-T----------T--T-T---TTT-C-------A-----T-AG------T---C-A-------CTCC------A--C--A-GT-------T-G-T-AT---T--CC-----T----------------T----ACG----CC-G--C----GT--G-A-C---GA----A---------------A-T-----------------C--A---------------GGA-----------T------------G-A-C--A---G---A----AG--TCC--CAA---A--TAA-A--T-C-G-A-------------T-GT------TCG-TAAAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG--G-A----A-A-C----G-A-TG---G-TT--G-A--TA---AA---T-TCAT---TC---A-----------AA-AT-TT-T-G---A-AA----A-CAAT------------------A----A-A----TGTT--ATATG-A--TTGT-GT-A--A---GA----AA-T-T-GTT-------AA-GATC----T---T--AGAGG--C--C---------G-T-CATT
gi|116550 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A---C-T-------T---G-T---G-T--G--AT---A-T----------T--TGT---TT--C-------A-----T-A-------T---C-A-------C---------A--T--A-GT----A--T-G-T-A----T--TC-----C----------------T----ACG----CC-G--C----AT--G-A-C---GA----A---------------A-T-----------------C--A---------------GGA-----------C------------G-A-C--A---T---ATT--AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TCA-T-AAA--------C-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-
gi|116559 : TATACA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------GC-A-T-A--T-C-A---C-T-------T---G-T---G-T--G--AT---A-T----------T--T-T---TT--CCTATCAAA-----T-A-------T---C-A-------T---------A--TA-A-GTC---A--T-G-T-A-------TC-----C----------------T----ACG----CC-G--C----AT--G-ACC---AA----A---------------A-T-----------------C--AAGG------------AAA-----------T------------G-ACC--A---G---A----AT--TCC--C-A---C--TCATA--T-C-G-A-------------T-A-------TCA-T---A--------A-ATATTGA-TGGA--AT-T-------A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TG---ATAA-T-TC-T---TC---A-----------AC-ATCTT-T-G---A-AA----A--AAT------------------C----A-T----G-TTAAATATG-AG-TTG--TT-A--T---GA----AA-CATAGTT--------A-GATCT---G---ACCAAA---------------C-G-T-CATTT
gi|116554 : TAT-CAACA-T-A-TTA-A--C-CC-CTT--A-TC-C-A-G------------TTT------G--A-T-A--T-C-A---C-T-------T---G-T---G-T--G--AT---A-T----------T--T-T---TTTTC-------A-----T-A-------T---C-A-------CCCTAC----G--C--A-GT----A--T-G-T-AT---T---C-----C----------------T----ACG----CC-GACCGTAGAT--T-A-C---GA----A---------------A-T-----------------C--A---------------GGA-----------T------------G-A----A---C---A----ATGATGCTAC-A---A--TAA-A--T---G-A-------------T-A-------TTA-T-AAAG-------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----ACA-C-TCCG-A-T----G-TT--G-A--TA---AA---T-TC-T---TG---A-----------AA-AA-TT-T-G---A-AA----AACAAT-----------------------A-T----G-TT--AGATG-A--TTG--TT-A--A---GA----AA-T-TTGTA-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116558 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-T-A-G------------TT-------G--A-T-T--T-C-A---C-T-------T---G-T---G-T--G--AT---A-TG---------T--T-T---TT--C-------A-----T-A-------T---C-ACC-----C---------A--C--A-GT----A--T-G-T-A----T--TC-----C----------------T----ACG----CC-G--C----GT--G-A-C---GA-----------------------------------------------------------------------------------------------------A----AT--TCC--C-A---A--TAA-A--T-C-G-A-------------T-AG------TC--T-AAA--------A-AATTTGA-TTGA--AG-TG-A----G-A-C-T--A-A-T----G-TC--G-A--TA---AA---T-TC-T---TT---A-----------AA-A--TT-T-G---A-AA----A-CAAT------------------C----A-A----T-TT--ATATG-A--TT
gi|116557 : TAT-CA-CA-T-A-TTC-A--C-CT-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--A-C-A---C-T-------C---A-T---A-T--G--ATC--A-A----------T--T-T---TT--C-------A-----C-------------C-A-----------------A--C--A-GT----A--T-G-T-AT---T---C-----C----------------T----ACG----CT-G--C----GT--G-A-C---GA----A---------------A-T---------------------------------------------------------------G-A-C--A---G---A----AT--TCT--C-T---A--TAA-A--T-C-G-A-------------T-A-------CCA-T-AAC--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----T-A-T-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA---AA---T-TC---------------------------------------------A-CGAT------------------A----A-A----T-TT--ATATG-A--TTA--TC-A--A---GA----AA-T-TTGTT-------AA-GATT----G---A--AAAGG--T--C-------C-G-T-CATTTatcaagaattt
gi|116552 : TAT-CA-CA-T-A-T------C-CC-CTT-TAATC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A---C-T-------T---G-T---GGT--G--AT---A-T----------T--T-TT--TT--C-------A-----T-A-------T---C-A-------C---------A--T--A-GT----A--T-G-T-AT---G--TC-----C----------------T----ACG---------------------------AA----------------------------------------C--A---------------GA----------------------------------------A----AT--TCC--C-A---A---CA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TTA-T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A----------------------------------------------------A-----------ACAA--TT-T-G---A-AA----A-CAAT------------------C----A-A----T-TT--ATATGAA--TTG--TT-A--A---GA----AA-T-TAGCT-------AAGGATC----GA--A--AAAGG--C--C-------T-G-TCCATTT
gi|116555 : TAT-CT-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TA-------G--A-T-A--A-C-A---C-T-------C---G-T---T-T--G--AT---A-A----------AA-T-T---GT--C-------A-----T-A-------T---C-G-------CCT-------A--C--A-GT----A--T-G-T-AT---T--TC----------------------T----ACG----CC-G--C----GT--G-A-C---GA----A---------------A-TGTGTATTGAAGCTTGATC--A---------------GGG-----------T------------G-A-C--A---GCTGA----AT--TCC--A-A---A--TAA-A--T-T-G-A-------------T-A-------TTA-T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----C-A-G-T--G-A-T----G-TT--G-A--TATACATGTAT-TC-T---TT---A-----------AA-A--TT-T-G---A-AA----A-CAAT------------------A----A-A----T-TC--GTATG-A--TTT--GTCA--A---GA----AG-T-TGGTT-------AA-GATC----
gi|116556 : TAT-CT-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC---A-G------------TA-------G--A-A-A------A---C-T-------C---G-T---T-T--G--AT---A------------------AAATT--C-------A-----T-A-------T---C-G-------CCT-------A--C--A-GT----A--T-G-T-AT---T--TC-----T----------------T-----CG----CC-G--C----GT--G-A-C---GA----A---------------A-TGTGTATTGAAGCTTGATC--A---------------GGG-----------T------------G-A-C--A---GCTGA----AT--TCC--A-A---A--TAA-A--T-T-G-A-------------T-A-------TTA-T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----C-A-G-T--G-A-T----G-TT--G-A--TATACATG--TATT-T---TT---A-----------AA-A--TT-T-G---A-AA----A-CAAT------------------A----A-A----T-TC--GTATG-A--TTT--GTCA--A---GA----AG-T-TGGTT-------AA-GATC----
gi|116560 : TATACA-CA-TTA-TTTTA--C-CC-CTC-TA-AC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A---C-T-----------A-T---GCT--G--AT---A-T----------C--T-T---TT--C-------A-----T-AAAA----T---C-AA------C---------A--T--A-GT----AG-T-G-T-AT---T---C-----C----------------T----ACG----CC-G--C-----T--G-A-C---GA----A---------------G-------------------------------------------------------------------------------------AT--TCC--C-A---A--TAA-A--T-C-G-A-------------T-AGACTAG-TTA-T-AAA--------TTATCTTGA-TGGA--AG-TG-G----C-A-CCT--A-A-TC---G-TG--G-A--TA---AA---T-TC-T---TT---A-----------AA-A--TT---G---A-AA----A-CAAT------------------A----AAT----T-TT--ATATG-A--TTA--TC-A--A---AA----AA-T-TGCTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--CGCGCTGGC-G-T-CATTT
gi|116553 : TAT-CA-CA-T-AATCT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A---C-T-------T---G-T---G-T--GATAT---A-T----------T--C-T---TT--C-------A-----T-A-------T---C-ACATAGCTC---------A--T--A-GT----A--T-G-T-A----T--TC-----C----------------T----ACG----C----------------A-C---AA----A---------------------------------------------------------------------------------------------------------TTC--C-A---A--TCA-A----C-G-A-------------T-A-------TTATT-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A----------------------------------------------------------------AC-A--TTAT-G---A-AA----A-C---------------------C----A-CATAAT-TT--A-ATT-A--TT---TT-A--T---GAT---AA-T-TAGCT-------AAGGATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T--ATTT
gi|116563 : TAT-CA-CA-T-A-TTTCA--C-CC-CTT-TA-TC-T-A-G------------TT-------G--A-TAA--T-C-A---C-T-------T---G-T---GTT--G--AT---A-T----------T--T-T---TTC-C-------A-----T-A-------TC--C-A-------C---------A--T--A-GT----AATT-G-T-A----T--TC-----C----------------T----ATG----CC-A--C----AT--G-A-C---AA----AT--------------A-T-----------------C--A---------------GGA-----------C------------G-A-CA-A---G---A----AT----C--C-A---A--TCA-A--T-C-GAA-------------T-A-------TTA-T-AGA--------
gi|116562 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A---C-T-------T---G-T---G-T--G--AT---A-T----------T--TCT---TT--C-------A-----T-A-------T---T-ACC-----C---------A--C--A-GT----A--T-G-T-A----T--TC-----C----------------T----ACG----CT-G--C----GT--G-A-C---GA----A---------------A-T-----------------C--A---------------AGA-----------T------------G-A-C--A---G---A----
gi|116564 : TAT-TA-CA-T-G-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-A------------TT-------G--A-T-A--A-C-A---C-T-------G---A-T---G-C--A--ATG--G-T----------T--T-T---TT--C-------A-----T-A-------T---C-A-------CGA-------A--C--A-GT----A--T-G-C-AT---T--TCAATGTC----------------TTGTGACGAAATGT-G--C----ATTGG-AGCTTGAA----ACTGG-----------A-T-----------------C--A---------------GGG-----------T------------G-G-C--A---G---GT---AT--CCC--A-A---A--TAA-A--T-C-A-A-------------T-G-------TTA-T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG--G-A----GCA-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA---AA---T-TC-T---TC---A-----------AA-G--TT-C-C---A-AA----A-
gi|116568 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CA-CTT-TA-TC-C-A-T------------TT-------G--A-T-A--T-C-A---C-T-------T---G-T---G-T--G--AT---A-TNNNNNNNNNNN--N-N---NN--N-------N-----N-N-------N---N-N-------N---------N--N--N-NN----N--N-N-N-NN---N--NN-----N----------------N----NNN----NN-N--N----NN--N-N-N---NN----N---------------N-N-----------------N--N---------------NNN-----------N------------N-N-N--N---N---N----NN--NNN--N-N---N--NCA-A--T-C-G-A-------------T-T-------TCA-T-AGA--------A-ATATTGG-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--T
gi|116565 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-GTT-TA-T----A-A------------TT-------TTTA-T-A--T-C-A---C-TAAAACCTC---G-T------------------T----------T--T-T---TT--T-------A-----T-A-------T---C-A-------CC--------A--C--A-GT----A--T-A-T-TT---TATTC-----T----------------T----ACG----GC-G--A----GT--G-A-C---GA----A---------------A-TGTG--------------T--ATT-------------GAAAATGGTTAGTCT------------G-A-C--A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TAA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TCA-T-AAT--------A-ATATTGT-TAGA--AG-TG-G----C-A-C------------------------------T---T-TC-T---TC---A-----------A--A--TA-T-G---A-AA----A-CAAT------------------A----A-A----C-TT--AAAT-----CTG-----A--A---GA----AA-T-TGGAT-------AA-AATT----G---A--
gi|116566 : TAT-CA-CA-T-A-TAT-G--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--A-C-A---C-T-------A---A-T---G-TTAA--AA---A-A----------G--T-T---TT--C-------A-----T-G-------T---C-A-------CCA-------A--C--A-GT----A--T-G-T-A----T--TC-----C----------------T----ATA----CC-A--C----GT--G-A-C---AA----AATGTGTTGAAGCTGGA-T-----------------C--A---------------AGG-----------T------------G-A-C--A---A---A----AT--TCC--C-A---A--TAA-G--T-C-G-A-------------T-A-------TTG-T-AA
gi|116567 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC--TT-TA-TCTC-A-GG-----------TT-------G--A-T-AATT-C-AA--C-G-------A---G-T---GCT--G--ATT--A-T----------T--GGT---TT--G-------A-----C-AGATTGATT---C-A-------C---------AAGC--A-GT----AG-T-G-T-AT---T--CC-----CACAAGCAGACCCCCCAT----ACG----CC-G--C----AT--G-A-C---GA----A---------------A-T-----------------C----------------------------------------------------------------------CC--C-A---A--TCA-A--TGC-G-AC------------T-A-------TTA-T-AAA--------A-A-ATTGA-TG-ATTAT-TG-ATAATA-A-C-T--G-A-TAAGAG-TTTCG-AGTTG---AC---T-TC-TCTGTC---ACCAAAAAACCGAC-A--TT-TTG---ATAA----A-CTGT------------------C----A-A----T-TT--ATATG-A--TT---GT-G--T---GAGTTGAA-T-TAGCT-------AAGGATC----G---A--ACAGG--C--
gi|116561 : TAT-TA-CA-T-A-TTT-A--C-AC-CCT-TA-TC-C-A-G------------TG-------G--A-T-A--T-C-A---C-T-------C---A-T---G-C--A--AT---A-T----------CA-T-G---TT--C-------A-----T-A-------TC--C-A-------C---------A--C----TT----A--T-G-T-A----T--TC-----C----------------T----ACG----CC-A--G----GT--G-A-CGT-AATGTTA---------------ATT-----------------C--A---------------AAA-----------T--------------A-C--ATGTG---C----AT--TGG--A-A---A--TGA-A--T-T-A-AGGTGACAAAATTCC-A-------TTG-T-AAA--------A-A-ATT-A-TGAT--AG-TG-G----C-G-C-A--G-G-T----G-TT--GTA--AG---A------TC-T---TC---A-----------AA-A--TT-A-G---A-GAAGGGA-GAA----------------------------------T--ATATG-A----------A--T---GA----------AGTT-------AA-GATCAAGGG---A--ACAGG--A--C-------T-G-T-CA
gi|116569 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A------A---C-T-------C---A-T---G-T--G--AT---A-T----------T--T-T---TT--C-------A-----T-A-------T---T-A-------
gi|116571 : TAT-CA-CA-T-T-ATT-A--C-CA-TTT-TA-TC-C-A-GGT----------TC-------G--A-T-A--TCC-A---CAT-------T---GTT---G-T--G--A----A------------T--T-T---TT--C-------A-----T-A-------T---C-ACC-----C---------A--C--ACGT----A--T-GAT-A----T--TC-----C----------------T----ACG----CC-G--C-----T--G-A-C---GA----A---------------
gi|116570 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC--TT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A------A---C-T-------C---A-T---T-T--G--AT---A-T----------T--T-T---TT--C-------A-----T-A-------T---T-A-------tatactctaaaaaaaaatatggaagttggcaataatgtggattaattctttaaaaatccatgattatcaaaaaacttgtcaagatccgaaagccctcattt
gi|116572 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-C--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-AGGTC-A-------T---G-T---G-A--GT-AT---A-T----------T--TCT---TT--C-------AATAATT-A-------TCTCC-A-------C---------A-----G-GT----A--TGG-T-AT---T--TC-----C----------------
gi|116573 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--C-TC-CTT-TA-TC-C-C-G------------TG-------G--A-T-A--T-T-A---C-T-------C---A-T---A-A--C--AT---A-A----------A--T-T---CT--A-------AT----T-A-------T---T-A-------T---------A--T-----T----A--T-G-T--T---T--TC-----C----------------T----ACG----CC-GATT----GT--G-A-C-------------------------A-T-----------------C--AC--------------AAA-----------C------------GTA-CGTA---A---A----AT--Taggtggcgtga
gi|116574 : TAT-TA-CA-A-A-TTT-A--C-TC-ATT-TA-TC-C-A-C------------TT-------G--A-C-A--A-C-A---C-T-------A---A-T---G-C--G--AA---T-T----------T--T-T---TT--C-------A-----T-A-------T---C-ACC-----C---------A--C--A-GT----A--G-G-T-AT---T--TC-----
gi|116549 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CAT-TA-TC-C-A-GTTCCCATATCCATT-------G--A-T-A--T-C-A---C-T-------T---G-T---G-T-----AT---A-T----------T--T-T---T-----------A-----G-G-------T---C-A-------C---------T--G--A-GT----A--
gi|116577 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--T-TC-CTT-TA-TC-C-C-G------------TG-------G--A-T-A--T-C-A---C-T-------C---A-T---A-A--C--AT---A-A----------A--T-T---CT--A-------AT----T-A-------T---T-A-------C---------A--C-----T----G--T-G-T--T---T--TC-----C----------------T----ACG----CC-G--
gi|116575 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--C-TC-CTT-TA-TC-C-GCG------------TG-------G--A-T-A--T-C-A---C-T-------C---A-T---A-A--C--AT---A-A----------A--T-T---CT--G-------AT----T-A-------T---T-A-------C---------A--C-----T----G--T-G-T--T---T--TC-----C----------------T----ACG----CC-G--
gi|116578 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--C-TC-CTT-TA-TC-C-C-G------------TG-------G--A-T-A--T-C-A---C-T-------C---A-T---A-A--C--AT---A-A----------A--T-T---CT--A-------AT----T-A-------T---T-A-------C---------A--C-----T----G--T-G-T--T---T--TC-----C----------------T----ACG----CC-
gi|116580 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-ATAC-TC-CTT-TA-TC-C-T-G------------TG-------G--A-T-A--T-C-A---C-T-------A---A-T---A-A--C--AT---A-C----------T--T-T---CT--A-------A-----TTA-------C---C-G-------T---------A--C--A-CT----G--T-G-T--T---T--TC-----C----------------T----ACG----CC-
gi|116581 : TAT-CA-CA-T-G-ATT-A--C-TC-CTT-TA-TC-C-C-G------------TG-------G--A-T-A--T-C-A---C-T-------CATAG-C---A-T--G--A----A-T----------T--C-TAA-T-----------------T-A-------T---T-A-------C---------A--C-----T----G--T-G-T--T---T--TC-----C----------------T----ACG----CC-G--aattgtgacatcacaa
gi|116576 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--C-TC-CTT-TA-TC-C-C-G------------TG-------G--A-T-A--T-C-A---C-T-------C---A-T---A-A--C--AT---A-A----------A--T-T---CT--A-------AT----T-A-------T---T-A-------C---------A--C-----T----A--T-G-T-TT---T--ACT----C----------------T----ACG----CC-G--
gi|116579 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--C-TC-CTC-TA-TC-C-C-G------------TG-------G--A-T-A--C-C-A---C-T-------C---A-T---A-A--C--AT---A-A----------A--T-T---CT--A-------AT----T-A-------T---T-A-------C---------A--C-----T----A--T-C-T--T---T--TC-----C----------------T----ACA----CC-G-------AT--T-G-C---GA----C---------------G-T-----------------C--AC--------------AAA-----------C------------GTA-CGTA---A---A----AT--Tattgtgaacgtcaaacg
gi|116582 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--C-TC-CTC-TA-TC-C-C-A------------TG-------G--A-C-A--T-C-A---C-T-------C---A-TAACA-T--A--ATTTAA-T----------TAAT-T---CT--A-------AT----T-A-------T---T-A-------C---------A--C-----T----G--T-G-T--T---T--TC-----C----------------T----ACA----CT-GATT----GT--G-A-C-------------------------A-T-----------------C--AC--------------AAA-----------C------------GTA-CGTA---A---A----AT--T
gi|116583 : AT-CA-CC-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A---C-T-------T---A-T---G-T--G--AT---A-T----------TG-T-T---TT--C-------A-----T-A-------T---C-A-------CCCACTGTGAA--TG-A-GT----A--T-G-T-AT---T---C-----C----------------T----ACG----CC-G--C----GT--G-A-C---GA----A---------------A-TG----------------T--G---------------GAA-----------CTGAATCAAG---G-A-C--A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TAA-A--T-G-A-A-------------T-A-------TTA-T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-C----A---C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA---AA---T-TG-T---TC---A-----------AA-A--TT-T-G---A-AA----A-CAAT------------------A----A-A----T-TT--AAATG-A--TTG--TT-A--A---GA----AA-T-TGGTT-------AA-GATC----A---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116584 : AT-CA-CC-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------T--------G--A-T-A--T-C-A---C-T-------T---A-----G-T--G--AT---A-T----------TG-T-T---TT--C-------A-----T-A-------T---C-A-------CCCACTGTGAA--TG-A-GT----A--T-G-T-AT---T---C-----C----------------T----ACG----CC-G--C----GT--G-A-C---GG----A---------------A-TGT---------------T--G---------------GAA-----------CTGAATCAAG---G-A-C--A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TAA-A--T-G-A-A-------------T-A-------TTA-T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-C----A---C-T--G-A-T------TT--G-A--TA---AA---T-TG-T---TC---A-----------AA-A--TT-T-G---A-AA----A-CAAT------------------A----A-T----T-TT--AAATG-A--TTG--TT-A--A---GA----AA-T-TGGTT-------AA-GATC----A---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116585 : AT-C--CA-T-A-TTT-A--CACC-CTT-T---C-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T---A---C-T-------C---A-TC--G-T--G--AT---T-T----------T--T-TCT-TT--C-------A-----T-A-------T---C-A-------CC--------A--C--A-ACCCCCA--T-G-T-AT-------C-----C----------------T----ACG----CTTG--C----GT--G-A-C---GA----AC--------------A-TAGG--------------C--T---------------GGA-----------C------------A-T-C--G---G---ACCATAT--CCA--C-ACACACTTCC-A--T-C-G-A-------------T-G-------TTA-T-AAG--------T--TATTGA-TGGA--AA-TG-GC---A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-ACATA---AT---T-TT-T---TCCCCA-----------A--A--TT-T-G---A-CA----A-CAAT------------------A----A-A----T-T---ATG-G-A--TTG--TC-A-------A----AACT-TGGTCC------AA-GACT----ACACA--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATCT
gi|116586 : T-CA-CAAT-ACTTT-A--C-CC-TCT-TACTC-CTA-G------------T--------G--A-TCA--T-CCA---C-T-------T---GCT---GCT--G--AT---A-CCTTTC-----T--T-T---TC--C-------A-----T-A-------T---T-A-------C---------A--T-----T----A--T-G-TTATGTAT--TC-----C----------------T----ACGGC--CC-G--C----AT--G-A-C---GA----------------------T-----------------CGAA---------------GAA-----------C------------G-A-C--A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-AATT-C-----------------T-G-------TTA-T-ATATTGACACCA-ATAT-GACTGGA--AG-TG-A----A-AAC-T--G-A-TC---G-TT--G-A--TG---AT---T-TCCT---TC---A-----------AC-G--TT-T-G---A-AA----AACAAT------------------CCCAAA-C----T-TT--ATATG-GACTTG--TT-ACTT---GA----CA-T-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T---T-CATTT
gi|116587 : T-CA-CA-T-A-TTT-A--C-C----T-TA-TCTC-ATG------------TT-------G--AAT-A--T-C-------T-------T---A-T---G-T--G--AT---A-T----------T--T-T---TT--C-------AA----T-A-------T---CCA-------C---------A--T--A--T----A--TTG-T-AT---T---C-----C----------------T----ACG----TC-G--C----TT--G-A-C---AA----A---------------A-T-----------------C-----------------------------------------------------------------------C--C-A---A--T-A-A--T-C-G-A-------------TTA-------GC--T-AAGTCTAT---A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-G----C-A-CAT--A-A-T----G-TC--G-A--TA---AA---T-TC-T---TT---A-----------AA-A--TA-T-G---A-AA----A-CACT------------------A----AGT----T-TT--ATATG-A--TT----T-A--TCAAGA----AA-T-TCCT---------A-GAAT----G---A--AAAGG--C--CG------TGG-T-CATTT
gi|116588 : T-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-C-G------------TT-------GATA-T-A--T-C-A---C-T-------A---A-T---G-T--G--AT---A-T----------T--T-T---TT--T-------A-----T-A-------
gi|116589 : A-T-A-TT--A--C-CTTCTT-TA-TCGC-A-GC-----------TT-------GTAA-T-A--T-C-A---C-T-------T---G-TG--G-T--G---T---A-T----------T--T-T---TT--C-------AG----T-AT------T---C-A-------C------------T--A-GT----A----G-T-AT---T--TC-----C----------------T----A-G-----C-G--CA---AT--G-A-C----G----A---------------A-T-----------------C--A---------------G-A-----------C------------A-A----A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-CGG-A-------------T-A-------T---T-AAA--------A-AAGTT---TGGA--AGCTG-A----A-A-C-T--GTACT----G-TT--G-A--TA---ATC--T-TC-T---TC---------------AC-A--TT-T-G-----AA----A-C-AT------------------C----A-A----T-TT--ATATG-A--T----GT-A--T---G-----AA-T-TAGTT-------AA-GATC----C---G--ACAGGCCC--C-------T-GTT-CATTT
gi|116590 : TT-A--C-CC-CTTGTA-TC-A-AAG------------TT-------G--A-T-A--T-C-A---CGT-------T---G-TT--G-T--G--AT---A-T----------T--T-T---TT--C-------A-----T-A-------T---C-AC------C---------A--CA-A-GT----A--T-G---AA---T--TC-----C----------------T----GCG----TC-G--------T--G-A-CG--AA----A---------------A-T-----------------T--G---------------GAA-----------CTGATGAAGGGAGA-A-C--A---G---A----A---TCC--C-A---A--TAA-A--T-C-G-----------------A-------TCA-T-TAT--------A-ACAT----------AG-C---------A-CTT--G-A-T----GTTT--G-A--TA---AA---T-TG-T---TC---A-----------A--A---T-T-GAAAA-AA----A-CAAT------------------A----A-A----T-TTA-ATA-A-A--TTG--TT-A--A---GA----AA-T-GGGTT-------AA-GATC----G---A--CAAAG--C--T-----------T-CATTT
gi|116591 : TT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A---C-T-------T---A-T---T-C--G--AT---A-T----------T--T-T---TT--
gi|116592 : -T----------T--G-T---TT--C-------A-----T-A-------T---C-A-------C---------A--T--A-GT----A--T-G-T-AT---T---C-----C----------------T----ACG----CC-G--CC---AT--G-A-C---GA----A---------------A-T-----------------C--A---------------GAAA----------C------------G-A-C--A---G---A----AT--CTC--C-C---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TTA-T-AAA--------A-ATATT-A-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-T---G-A--TG---AT---T--C-T---TC---A-----------AC-A--TT-T-G---A-AA----A-CAAT------------------C----A-A----T-GT--ATATG-A--TTG--TT-A--T---GA----AA-T-TAGTT-------AA-GATC----GA--A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTTtca
gi|116593 : ---TT--C-------A-----T-A-------T---C-AC------C---------A--C--A-AT----A--T-G-T-G----T--TC-----C----------------T----ACA----CT-G--C----GT--G-A-A---GT----A---------------A-T-----------------C--ATAAATGTGTATATTGGAA-----------CTGGT--------G-G-C--A---G---A----AT--TCC--C-A---A--T-A-A-----------------------------------------------------ATTGA-TGGA--AG-TC-A----A-A-C-G--G-G-C----A-TT--T-A---G--------T-TC-------------------------------T-A---A-AA----A-CAAT------------------G----A-A----T-TC--ATACG-----TGAAGT-A--C------------T-CAGTTG------AA-GATT----G---A--GAGAA--CCAC-------T-G-T-
gi|116594 : -C-A-A-------------T-A-------GAA-T-AAA--------A-CTATTGA-TGGA--AG-TG-G----C-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA---AA---T-TT-T---TC---A-----------AA-A--TT-T-G---A-AA----A-CAATATGTTGTTTTTGTGAAAACAATAA-A----T-TT--ATATG-A---TG--GTCA--A---GA----AA-T-TGGTT-------AA-GATC----A---A--AAACG--C--
gi|116595 : -TT--G-A--TA---AA---T-TC-T---TC---A-----------AA-A--TT-T-G---A-AA----A--------------------------------------------TG-A--TTG--TT-A--A---AA----AA-T-TAGTT-------AA-AATC----GA--A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116596 : ---A-----------AC-A--TT-T-G---A-AA----A-CAAT------------------C----A-A----T-TT--ATATG-A--TTG--TT-A--T---GA----AA-T-TAGTTAAAATCGAA-GATC----G---A--AAATG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116598 : ----T-TT--ATATG-C--TTG--TT-A--A---GA----AA-T-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-A-T-CATTT
gi|116597 : ----T-TT--ATATG-C--TTG--TT-A--A---GA----AA-T-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-A-T-CATTT
Alignments
lowQualScore : 11111 111111111111111111111111111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111111111111111111111
lowQualScore : 1 0 0 0 1 1 11 0 0 0 1 2 0 2 666666666666 3333333 44 0 1 11 0 0 1 1 66666666666 1 333 4 11 222 444 222 6666666666666 3 11 33 2222222 00000 0 5555555 0 0 999999999999999999999999999 2222 33 1 555 555 0 5555555555555555 11 0 77 2 3333 1 4444444 1111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111111 1 2 666666666666 11 11 1 222 11 2 1 11 1 1 1 7777777777777 1 7777777 1 22 1 88888888 1 1 11 2 1 444444 1 2 11 1 1 6666 1 11 1 33 44 999999 222 2 333333 11 3 888888888 1 222 1 2 1111111111111111111111 66666 1 2 44 1 1 55 1 1 2 222 11 1 1 6666666 3 3333 666 11 11 11 6666666 1 1 1
lowQualScore : . . . . . . .. . . . . . . . ............ ....... .. . . .. . . . . ........... . ... . .. ... ... ... ............. . .. .. ....... ..... . ....... . . ........................... .... .. . ... ... . ................ .. . .. . .... . ....... .................................................................................................... . . ............ .. .. . ... .. . . .. . . . ............. . ....... . .. . ........ . . .. . . ...... . . .. . . .... . .. . .. .. ...... ... . ...... .. . ......... . ... . . ...................... ..... . . .. . . .. . . . ... .. . . ....... . .... ... .. .. .. ....... . . .
lowQualScore : 7 9 9 9 7 6 11 8 8 8 6 4 8 4 999999999999 5555555 22 8 6 11 8 8 6 6 33333333333 6 111 9 11 666 777 222 5555555555555 2 99 44 6666666 33333 8 6666666 8 8 666666666666666666666666666 7777 77 7 999 999 9 9999999999999999 22 9 55 0 0000 0 4444444 4444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 1 3 333333333333 66 66 2 111 66 1 2 66 2 2 2 6666666666666 2 2222222 1 77 1 44444444 2 2 77 4 2 777777 2 5 77 2 2 4444 2 77 2 33 22 222222 222 5 666666 77 5 999999999 2 111 2 4 1111111111111111111111 11111 2 4 00 2 2 11 2 2 4 666 66 2 2 4444444 6 8888 111 88 88 88 3333333 5 5 5
consensus : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------C---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--C--------A-GT----A--T-GTAT-T--TC-C----------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----C------------GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TNA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------CA--AAA---------TT-TG---A-AAA-CA----------------------AT-N---AA-T-TT--ATAT-G-A--TT-G-T-TAA--G--A-AAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
Reference ( family-393 ) : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------C---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--C--------A-GT----A--T-GTAT-T--TC-C----------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----C------------GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TNA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA--A-----NT---TC-TT------CA--ANA---------TT-TG---A-AAA-CA----------------------AT-N---AA-T-TT--ATAT-G-A--TT-G-T-TAN--G--A-AAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116543 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GT----A--T-GTAT-T--TC-C----------------TACG--CC-G--C-ATG----A-CA-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GA---A-----C------------GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TC-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TG--A-----TT---TC-TT------CA--ACA---------TT-TG---A-AAA-CA----------------------AT-C---AC-T-TT--ATAT-G-A--TT-G-G-TAT--G--A-AAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116544 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TTT-C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GT----AA-T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CC-G--C-ATG------CA-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GA---A-----C------------GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TC-A--T-AAA--------A--TATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-T---G-A--TG--A-----TT---TC-TT------CA--ACA---------TT-TG---A-AAA-CA----------------------AT-C---AC-T-TT--ATAT-G-A--TT-G-G-TAT--G--A-AAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116545 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---AT--T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GT----A--T-GTA--T--TC-T----------------TACG--CC-G--C-ATG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----T------------GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TG--A-----TT---TC-TT------CA--ACA---------TT-TG---A-AAA-CA----------------------AT-C---AA-T-TT--ATAT-G-A--TT-G-C-TAT--A--A-AAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--
gi|116546 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-G-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---ATA--A---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GT----A--T-GTA--T--TC-C----------------TACG--CC-G--C-ATGA---A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----C------------GA-CTA---A---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T---------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TGAA----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--GCG--TA--A-----TT---TC-TG------CA--ACA---------TT-TG---A-AAA-CA----------------------AT-C---AA-T-TT--ATAT-G-A--TT-GTT-TAT--G--A-AAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116547 : TAT-CA-CT-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-A-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------T-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GG----A--T-ATAT-T---C-C----------------TACG--CC-G--C-ATG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----C------------GA-C-A---A---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T-AACGGATATC-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TG--A-----TT---TC-TT------CA--ACA---------TT-TG---A-AAA-CA----------------------AT-C---AA-T-TT--ATAT-G-A--TA-A-T-TAT--G--A-AAT-TAGTC-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116548 : TAT-CA-CA-T---TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-C------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---A-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--AT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C--------CTGG-----A-GT----A--T-GTAC-T---C-C----------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----T------------GA-C-A---T---A----AT--TTC--C-A---A--TAA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATAACGA-TAGA--AG-TG-A----A-A-T-T--G-A-T----G-TT--C-A--TA--A-----AT---TC-TT------TA--AAA---------TT-TG---A-AAA-CA----------------------AC-A---AA-T-TT--ATAT-G-A--TT-G-T-TAA--G--A-AAT-AAGTT-------AA-GATT----G---A--AATAA--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116549 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CAT-TA-TC-C-A-GTTCCCATATCCATT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T------AT---A---T----------T--T-T--T-----------A-----G-G-------T-C-A-------C-----T--G--------A-GT----A--
gi|116550 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--TGT--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GT----A--T-GTA--T--TC-C----------------TACG--CC-G--C-ATG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----C------------GA-C-A---T---ATT--AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TC-A--T-AAA--------C-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-
gi|116551 : TAT-TA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TTTCCAGTTG--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---T---T----------T--T-T--TTT-C-------A-----T-AG------T-C-A-------CTCC--A--C--------A-GT-------T-GTAT-T--CC-T----------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----T------------GA-C-A---G---A----AG--TCC--CAA---A--TAA-A--T-C-G-A-------------T-G-------TTCG--TAAAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG--G-A----A-A-C----G-A-TG---G-TT--G-A--TA--A-----AT---TCATT------CA--AAAT--------TT-TG---A-AAA-CA----------------------AT-A---AA-TGTT--ATAT-G-A--TT-G-TGTAA--G--A-AAT-T-GTT-------AA-GATC----T---T--AGAGG--C--C---------G-T-CATT
gi|116552 : TAT-CA-CA-T-A-T------C-CC-CTT-TAATC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---GGT--G---AT---A---T----------T--T-TT-TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GT----A--T-GTAT-G--TC-C----------------TACG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AA-C-A---GA--A----AT--TCC--C-A---A---CA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-----------------------------------------------------A--CAA---------TT-TG---A-AAA-CA----------------------AT-C---AA-T-TT--ATAT-GAA--TT-G-T-TAA--G--A-AAT-TAGCT-------AAGGATC----GA--A--AAAGG--C--C-------T-G-TCCATTT
gi|116553 : TAT-CA-CA-T-AATCT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--GAT-AT---A---T----------T--C-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-ACATAGCTC-----A--T--------A-GT----A--T-GTA--T--TC-C----------------TACG--C--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------A-C-A-------A----AT--T-C--C-A---A--TCA-A----C-G-A-------------T-A-------TT-AT-T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C--------------------------------------------------------A---------TTATG---A-AAA-CC----------------------ACAT---AA-T-TT--A-AT-T-A--TT---T-TAT--G--ATAAT-TAGCT-------AAGGATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T--ATTT
gi|116554 : TAT-CAACA-T-A-TTA-A--C-CC-CTT--A-TC-C-A-G------------TTT------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TTTTC-------A-----T-A-------T-C-A-------CCCTACG--C--------A-GT----A--T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CC-GACC-GTAGATTA-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----T------------GA---A---C---A----ATGATGCTAC-A---A--TAA-A--T---G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAAG-------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----ACA-C-TCCG-A-T----G-TT--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------GA--AAAA--------TT-TG---A-AAAACA----------------------AT------A-TGTT--AGAT-G-A--TT-G-T-TAA--G--A-AAT-TTGTA-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116555 : TAT-CT-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TA-------G--A-T-A--A-C-A-C-T-------C---G-T---T-T--G---AT---A---A----------AA-T-T--GT--C-------A-----T-A-------T-C-G-------CCT---A--C--------A-GT----A--T-GTAT-T--TC------------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------TGTGTATTGAAGCTTGATC--A--------------GG---G-----T------------GA-C-A---GCTGA----AT--TCC--A-A---A--TAA-A--T-T-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----C-A-G-T--G-A-T----G-TT--G-A--TAT-ACATGTAT---TC-TT------TA--AAA---------TT-TG---A-AAA-CA----------------------AT-A---AA-T-TC--GTAT-G-AT-TT-G-T-CAA--G--A-AGT-TGGTT-------AA-GATC----
gi|116556 : TAT-CT-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC---A-G------------TA-------G--A-A-A------A-C-T-------C---G-T---T-T--G---AT---AAAAT----------T-----------C-------A-----T-A-------T-C-G-------CCT---A--C--------A-GT----A--T-GTAT-T--TC-T----------------T-CG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------TGTGTATTGAAGCTTGATC--A--------------GG---G-----T------------GA-C-A---GCTGA----AT--TCC--A-A---A--TAA-A--T-T-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----C-A-G-T--G-A-T----G-TT--G-A--TAT-AC----ATGTATT-TT------TA--AAA---------TT-TG---A-AAA-CA----------------------AT-A---AA-T-TC--GTAT-G-AT-TT-G-T-CAA--G--A-AGT-TGGTT-------AA-GATC----
gi|116557 : TAT-CA-CA-T-A-TTC-A--C-CT-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--A-C-A-C-T-------C---A-T---A-T--G---ATC--A---A----------T--T-T--TT--C-------A-----C-----------C-A-------------A--C--------A-GT----A--T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CT-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------------------------------------------------GA-C-A---G---A----AT--TCT--C-T---A--TAA-A--T-C-G-A-------------T-A-------CC-A--T-AAC--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----T-A-T-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA--A-----AT---TC-------------------------------------A-CG----------------------AT-A---AA-T-TT--ATAT-G-A--TT-A-T-CAA--G--A-AAT-TTGTT-------AA-GATT----G---A--AAAGG--T--C-------C-G-T-CATTT
gi|116558 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-T-A-G------------TT-------G--A-T-T--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---TG---------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-ACC-----C-----A--C--------A-GT----A--T-GTA--T--TC-C----------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------A------------------------------------------------------------------------------------------------------------------A----AT--TCC--C-A---A--TAA-A--T-C-G-A-------------T-A-------GT-C--T-AAA--------A-AATTTGA-TTGA--AG-TG-A----G-A-C-T--A-A-T----G-TC--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------TA--AAA---------TT-TG---A-AAA-CA----------------------AT-C---AA-T-TT--ATAT-G-A--TT-A-T-CAA--G--A-ATT-T
gi|116559 : TATACA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------GC-A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--CCTATCAAA-----T-A-------T-C-A-------T-----A--TA-------A-GTC---A--T-GTA-----TC-C----------------TACG--CC-G--C-ATG----ACCA-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------AGGAAA-----T------------GACC-A---G---A----AT--TCC--C-A---C--TCATA--T-C-G-A-------------T-A-------TC-A--T---A--------A-ATATTGA-TGGA--AT-T-------A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TGATA-----AT---TC-TT------CA--ACATC-------TT-TG---A-AAA--A----------------------AT-C---AT-G-TTAAATAT-G-AG-TT-G-T-TAT--G--A-AACATAGTT--------A-GATCT---G---ACCAAA---------------C-G-T-CATTT
gi|116560 : TATACA-CA-TTA-TTTTA--C-CC-CTC-TA-AC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-----------A-T---GCT--G---AT---A---T----------C--T-T--TT--C-------A-----T-AAAA----T-C-AA------C-----A--T--------A-GT----AG-T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CC-G--C--TG----A-CG-------AA---------------G------------------------------------------------------------------------------------------------------AT--TCC--C-A---A--TAA-A--T-C-G-A-------------T-AGACTAG-TT-A--T-AAA--------TTATCTTGA-TGGA--AG-TG-G----C-A-CCT--A-A-TC---G-TG--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------TA--AAA---------TT--G---A-AAA-CA----------------------AT-A---AA-T-TTT-ATAT-G-A--TT-A-T-CAA--A--A-AAT-TGCTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--CGCGCTGGC-G-T-CATTT
gi|116561 : TAT-TA-CA-T-A-TTT-A--C-AC-CCT-TA-TC-C-A-G------------TG-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------C---A-T---G-C--A---AT---A---T----------CA-T-G--TT--C-------A-----T-A-------T-C---------C-----A--C--------ACTT----A--T-GTA--T--TC-C----------------TACG--CC-A--G-GTG----A-CGTAATGTTAA---------------T------------------------T-----------------C--A--------------AA---A-----T-------------A-C-ATGTG---C----AT--TGG--A-A---A--TGA-A--T-T-A-AGGTGACAAAATTCC-A-------TT-G--T-AAA--------A-A-ATT-A-TGAT--AG-TG-G----C-G-C-A--G-G-T----G-TT--G----TA--A-----GA---TC-TT------CA--AAA---------TT-AG---A-GAA-GG----------------------GA-G---AA----T--ATAT-G-A----------AT--G--A------AGTT-------AA-GATCAAGGG---A--ACAGG--A--C-------T-G-T-CA
gi|116562 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--TCT--TT--C-------A-----T-A-------T-T-ACC-----C-----A--C--------A-GT----A--T-GTA--T--TC-C----------------TACG--CT-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------AG---A-----T------------GA-C-A---G---A----
gi|116563 : TAT-CA-CA-T-A-TTTCA--C-CC-CTT-TA-TC-T-A-G------------TT-------G--A-TAA--T-C-A-C-T-------T---G-T---GTT--G---AT---A---T----------T--T-T--TTC-C-------A-----T-A-------TCC-A-------C-----A--T--------A-GT----AATT-GTA--T--TC-C----------------TATG--CC-A--C-ATG----A-CA-------AAT--------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----C------------GA-CAA---G---A----AT----C--C-A---A--TCA-A--T-C-GAA-------------T-A-------TT-A--T-AGA--------
gi|116564 : TAT-TA-CA-T-G-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-A------------TT-------G--A-T-A--A-C-A-C-T-------G---A-T---G-C--A---ATG--G---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------CGA---A--C--------A-GT----A--T-GCAT-T--TC-A-----------------ATG--TC-T--T-GTG----A-CG-------AA---------------ATGTGCATTGGAGCTTGAAACTGGAT-----------------C--A--------------GG---G-----T------------GG-C-A---G---GT---AT--CCC--A-A---A--TAA-A--T-C-A-A-------------T-G-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG--G-A----GCA-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------CA--AAG---------TT-CC---A-AAA-
gi|116565 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-GTT-TA-T----A-A------------TT-------TTTA-T-A--T-C-A-C-TAAAACCTC---G-T---------------------T----------T--T-T--TT--T-------A-----T-A-------T-C-A-------CC----A--C--------A-GT----A--T-ATTT-TATTC-T----------------TACG--GC-G--A-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------TGTGTATTGAAAATGGT-T--A--------------GT---C-----T------------GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TAA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TC-A--T-AAT--------A-ATATTGT-TAGA--AG-TG-G----C-A-C-T---------------------------------T---TC-TT------CA--A-A---------TA-TG---A-AAA-CA----------------------AT-A---AA-C-TT--AAAT------CT-G----AA--G--A-AAT-TGGAT-------AA-AATT----G---A--
gi|116566 : TAT-CA-CA-T-A-TAT-G--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--A-C-A-C-T-------A---A-T---G-TTAA---AA---A---A----------G--T-T--TT--C-------A-----T-G-------T-C-A-------CCA---A--C--------A-GT----A--T-GTA--T--TC-C----------------TATA--CC-A--C-GTG----A-CA-------AAATGTGTTGAAGCTGGA------------------------T-----------------C--A--------------AG---G-----T------------GA-C-A---A---A----AT--TCC--C-A---A--TAA-G--T-C-G-A-------------T-A-------TT-G--T-AA
gi|116567 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC--TT-TA-TCTC-A-GG-----------TT-------G--A-T-AATT-C-AAC-G-------A---G-T---GCT--G---ATT--A---T----------T--GGT--TT--G-------A-----C-AGATTGATT-C-A-------C-----AAGC--------A-GT----AG-T-GTAT-T--CC-CACAAGCAGACCCCCCATACG--CC-G--C-ATG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C----------------------------------------------------------------CC--C-A---A--TCA-A--TGC-G-AC------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-A-ATTGA-TG-ATTAT-TG-ATAATA-A-C-T--G-A-TAAGAG-TTTCG-AGTTG--A-----CT---TC-TCTGTCACCA--AAAAACCGACATTT-TG---ATAAA-CT----------------------GT-C---AA-T-TT--ATAT-G-A--TT-G-TGTGA--GTTG-AAT-TAGCT-------AAGGATC----G---A--ACAGG--C--
gi|116568 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CA-CTT-TA-TC-C-A-T------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---TNNNNNNNNNNN--N-N--NN--N-------N-----N-N-------N-N-N-------N-----N--N--------N-NN----N--N-NNNN-N--NN-N----------------NNNN--NN-N--N-NNN----N-NN-------NN---------------N------------------------N-----------------N--N--------------NN---N-----N------------NN-N-N---N---N----NN--NNN--N-N---N--NCA-A--T-C-G-A-------------T-T-------TC-A--T-AGA--------A-ATATTGG-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--T
gi|116569 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A------A-C-T-------C---A-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-T-A-------
gi|116570 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC--TT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A------A-C-T-------C---A-T---T-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-T-A-------
gi|116571 : TAT-CA-CA-T-T-ATT-A--C-CA-TTT-TA-TC-C-A-GGT----------TC-------G--A-T-A--TCC-A-CAT-------T---GTT---G-T--G---A----A--------------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-ACC-----C-----A--C--------ACGT----A--T-G-ATAT--TC-C----------------TACG--CC-G--C--TG----A-CG-------AAT--------------A------------------------T-----------------------------------------------------------------------------AC--TC------------TAA-A----------------------------------------AAA--------A-A-AT--A-TGGA--AGTTG-G----C-A-A-T--A-A-T----G-TG--G-A--TT--A-----AT---TC-TT------TA--AA-------------------------A----------------------AT-C-------------CAT-G-A--TT-A-T-CAA--A--A-AAC-TTGTC-------AA-GATC----C---G--AAAGC--C--C-----------T-CATTT
gi|116572 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-C--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-AGG-T-------C---A-T---G-T--GAGTAT---A---T----------T--TCT--TT--C-------AATAATT-A-------T-CTC-------C-----A--C--------AGGT----A--TGGTAT-T--TC-C-----------------AGG--TG-G--C-GTG----A-
gi|116573 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--C-TC-CTT-TA-TC-C-C-G------------TG-------G--A-T-A--T-T-A-C-T-------C---A-T---A-A--C---AT---A---A----------A--T-T--CT--A-------AT----T-A-------T-T-A-------T-----A--T-----------T----A--T-GT-T-T--TC-C----------------TACG--CC-GATT-GTG----A-C-------------------------A------------------------T-----------------C--A--------------
gi|116574 : TAT-TA-CA-A-A-TTT-A--C-TC-ATT-TA-TC-C-A-C------------TT-------G--A-C-A--A-C-A-C-T-------A---A-T---G-C--G---AA---T---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-ACC-----C-----A--C--------A-GT----A--G-GTAT-T--TC-caaacgtacgtaaaatt
gi|116575 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--C-TC-CTT-TA-TC-C-GCG------------TG-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------C---A-T---A-A--C---AT---A---A----------A--T-T--CT--G-------AT----T-A-------T-T-A-------C-----A--C-----------T----G--T-GT-T-T--TC-C----------------TACG--CC-G--
gi|116576 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--C-TC-CTT-TA-TC-C-C-G------------TG-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------C---A-T---A-A--C---AT---A---A----------A--T-T--CT--A-------AT----T-A-------T-T-A-------C-----A--C-----------T----A--T-GTTT-T--ACTC----------------TACG--CC-GATT-GTG----A-
gi|116577 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--T-TC-CTT-TA-TC-C-C-G------------TG-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------C---A-T---A-A--C---AT---A---A----------A--T-T--CT--A-------AT----T-A-------T-T-A-------C-----A--C-----------T----G--T-GT-T-T--TC-C----------------TACG--CC-G--acgtcaaacg
gi|116578 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--C-TC-CTT-TA-TC-C-C-G------------TG-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------C---A-T---A-A--C---AT---A---A----------A--T-T--CT--A-------AT----T-A-------T-T-A-------C-----A--C-----------T----G--T-GT-T-T--TC-C----------------TACG--CC-
gi|116579 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--C-TC-CTC-TA-TC-C-C-G------------TG-------G--A-T-A--C-C-A-C-T-------C---A-T---A-A--C---AT---A---A----------A--T-T--CT--A-------AT----T-A-------T-T-A-------C-----A--C-----------T----A--T-CT-T-T--TC-C----------------TACA--CC-GATT-GCG----A-CG-------
gi|116580 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-ATAC-TC-CTT-TA-TC-C-T-G------------TG-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------A---A-T---A-A--C---AT---A---C----------T--T-T--CT--A-------A-----TTA-------C-C-G-------T-----A--C--------A-CT----G--T-GT-T-T--TC-C----------------TACG--CC-AATT-GTG----A-C-------------------------A------------------------T-----------------C--A--------------tcacaaacgtacgtaaaatt
gi|116581 : TAT-CA-CA-T-G-ATT-A--C-TC-CTT-TA-TC-C-C-G------------TG-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------CATAG-C---A-T--G---A----A---T----------T--C-T--------------AAT---T-A-------T-T-A-------C-----A--C-----------T----G--T-GT-T-T--TC-C----------------TACG--CC-G--caa
gi|116582 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--C-TC-CTC-TA-TC-C-C-A------------TG-------G--A-C-A--T-C-A-C-T-------C---A-TAACA-T--A---ATTTAA---T----------TAAT-T--CT--A-------AT----T-A-------T-T-A-------C-----A--C-----------T----G--T-GT-T-T--TC-C----------------TACA--CT-GATT-GTG----A-C-------------------------A------------------------T-----------------C--A--------------
gi|116583 : AT-CA-CC-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---A-T---G-T--G---AT---A---T----------TG-T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------CCC---A--CTGTGAATGA-GT----A--T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------TG----------------T--G--------------GA---A-----CTGAATCAAG---GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TAA-A--T-G-A-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-C----A---C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA--A-----AT---TG-TT------CA--AAA---------TT-TG---A-AAA-CA----------------------AT-A---AA-T-TT--AAAT-G-A--TT-G-T-TAA--G--A-AAT-TGGTT-------AA-GATC----A---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTTcaaacgtacgtaaaatt
gi|116584 : AT-CA-CC-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------T--------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---A-----G-T--G---AT---A---T----------TG-T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------CCC---A--CTGTGAATGA-GT----A--T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------GA---------------A------------------------TGT---------------T--G--------------GA---A-----CTGAATCAAG---GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TAA-A--T-G-A-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-C----A---C-T--G-A-T------TT--G-A--TA--A-----AT---TG-TT------CA--AAA---------TT-TG---A-AAA-CA----------------------AT-A---AT-T-TT--AAAT-G-A--TT-G-T-TAA--G--A-AAT-TGGTT-------AA-GATC----A---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116585 : AT-C--CA-T-A-TTT-A--CACC-CTT-T---C-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T---A-C-T-------C---A-TC--G-T--G---AT---T---T----------T--T-TCTTT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------CC----A--C--------A-ACCCCCA--T-GTAT-----C-C----------------TACG--CTTG--C-GTG----A-CG-------AAC--------------A------------------------TAGG--------------C--T--------------GG---A-----C------------AT-C-G---G---ACCATAT--CCA--C-ACACACTTCC-A--T-C-G-A-------------T-G-------TT-A--T-AAG--------T--TATTGA-TGGA--AA-TG-GC---A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-ACATA--A-----TT---TT-TT------CCCCAAA---------TT-TG---A-CAA-CA----------------------AT-A---AA-T-T---ATG--G-A--TT-G-T-CAA-----A-ACT-TGGTCC------AA-GACT----ACACA--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATCT
gi|116586 : T-CA-CAAT-ACTTT-A--C-CC-TCT-TACTC-CTA-G------------T--------G--A-TCA--T-CCA-C-T-------T---GCT---GCT--G---AT---A---CCTTTC-----T--T-T--TC--C-------A-----T-A-------T-T-A-------C-----A--TTAT-----G-TT----A--T-GTAT-T---C-C----------------TACGGCCC-G--C-ATG----A-CG-------A-----------------------------------------T-----------------CGAA--------------GA---A-----C------------GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-AATT-C-----------------T-G-------TT-A--T-ATATTGACACCA-ATAT-GACTGGA--AG-TG-A----A-AAC-T--G-A-TC---G-TT--G-A--TG--A-----TT---TCCTT------CA--ACG---------TT-TG---A-AAAACA----------------------AT-CCCAAACT-TT--ATAT-G-GACTT-G-T-TACTTG--A-CAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T---T-CATTT
gi|116587 : T-CA-CA-T-A-TTT-A--C-C----T-TA-TCTC-ATG------------TT-------G--AAT-A--T-C-----T-------T---A-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------AA----T-A-------T-C---------C-----A--C--------ATAT----A--TTGTAT-T---C-C----------------TACG--TC-G--C-TTG----A-CA-------AA---------------A------------------------T-----------------C-----------------------------------------------------------------C--C-A---A--T-A-A--T-C-G-A-------------T----------T-AGCT-AAGTCTAT---A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-G----C-A-CAT--A-A-T----G-TC--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------TA--AAA---------TA-TG---A-AAA-CA----------------------CT-A---AG-T-TTT-ATAT-G-A--TTTA-T-CAA--G--A-AAT-TCCT---------A-GAAT----G---A--AAAGG--C--CG------TGG-T-CATTT
gi|116588 : T-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-C-G------------TT-------GATA-T-A--T-C-A-C-T-------A---A-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--T-------A-----T-A-------
gi|116589 : A-T-A-TT--A--C-CTTCTT-TA-TCGC-A-GC-----------TT-------GTAA-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---GGT--G----T---A---T----------T--T-T--TT--C-------AG----T-AT------T-C-A-------C--------T--------A-GT----A----GTAT-T--TC-C----------------TA-G---C-G--CAATG----A-CG--------A---------------A------------------------T-----------------C--A---------------G---A-----C------------AA---A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-CGG-A-------------T-A-------TT-A----AAA--------A-A-GTT---TGGA--AGCTG-A----A-A-C-T--GTACT----G-TT--G-A--TA--AT----CT---TC-TT------C---ACA---------TT-TG-----AAA-C-----------------------AT-C---AA-T-TT--ATAT-G-A---T-G---TAT--G----AAT-TAGTT-------AA-GATC----C---G--ACAGGCCC--C-------T-GTT-CATTT
gi|116590 : TT-A--C-CC-CTTGTA-TC-A-AAG------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-CGT-------T---G-TT--G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-AC------C-----A--CA-------A-GT----A--T-G-AA-T--TC-C----------------TGCG--T-----C-GTG----A-CGA------AA---------------A------------------------T-----------------T--G--------------GA---A-----CTGATGAAGGGAGAA-C-A---G---A----A---TCC--C-A---A--TAA-A--T-C-G-A-------------TCA-------TT-A--T--AA--------C-ATA---------------G-C----A-C-T-T--G-A-T----GTTT--G-A--TA--A-----AT---TG-TT------CA--AA-----------T-TGAAAA-AAA-CA----------------------AT-A---AA-T-TT--A-ATAA-A--TT-G-T-TAA--G--A-AAT-GGGTT-------AA-GATC----G---A--CAAAG--C--T-----------T-CATTT
gi|116591 : TT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---A-T---T-C--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--
gi|116592 : ---T----------T--G-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GT----A--T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CC-G--CCATG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GA---AA----C------------GA-C-A---G---A----AT--CTC--C-C---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATT-A-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-T---G-A--TG--A------T---TC-TT------CA--ACA---------TT-TG---A-AAA-CA----------------------AT-C---AA-T-GT--ATAT-G-A--TT-G-T-TAT--G--A-AAT-TAGTT-------AA-GATC----GA--A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTTtca
gi|116593 : --TT--C-------A-----T-A-------T-C-AC------C-----A--C--------A-AT----A--T-GTG--T--TC-C----------------TACA--CT-G--C-GTG----A-AG-------TA---------------A------------------------T-----------------C--ATAAATGTGTATATTGG---AACTGGT------------GG-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TAA---------------------------------------------------------ATTGA-TGGA--AG-TC-A----A-A-C-G--G-G-C----A-TT-------T---A-----GT---TC----------------------------TA---A-AAA-CA----------------------AT-G---AA-T-TC--ATAC-G-----T-G----AA--G--T-ACT-CAGTTG------AA-GATT----G---A--GAGAA--CCAC-------T-G-T-
gi|116594 : -A--T-AAA--------A-CTATTGA-TGGA--AG-TG-G----C-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA--A-----AT---TT-TT------CA--AAA---------TT-TG---A-AAA-CAATATGTTGTTTTTGTGAAAACAAT-A---AA-T-TT--ATAT-G-A--TG-G-T-CAA--G--A-AAT-TGGTT-------AA-GATC----A---A--AAACG--C--
gi|116595 : caataga-TT--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------CA--AAA---------TT-TG---A-AAA--------------------------------------------T-G-A--TT-G-T-TAA--A--A-AAT-TAGTT-------AA-AATC----GA--A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116596 : A--ACA---------TT-TG---A-AAA-CA----------------------AT-C---AA-T-TT--ATAT-G-A--TT-G-T-TAT--G--A-AAT-TAGTTAAAATCGAA-GATC----G---A--AAATG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116597 : -T-TT--ATAT-G-C--TT-G-T-TAA--G--A-AAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-A-T-CATTT
gi|116598 : -T-TT--ATAT-G-C--TT-G-T-TAA--G--A-AAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-A-T-CATTT
Alignments
lowQualScore : 11111 111111111111111111111111111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111111111111111111111
lowQualScore : 1 0 0 0 1 1 11 0 0 0 1 2 0 2 666666666666 3333333 44 0 1 11 0 0 1 1 66666666666 1 333 4 11 222 333 66666666666666666 3 11 33 2222222 00000 0 5555555 0 0 999999999999999999999999999 2222 33 1 444 666 0 5555555555555555 11 0 77 2 3333 1 4444444 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 2 666666666666 11 11 1 222 11 2 1 11 1 1 1 7777777777777 1 7777777 1 22 1 88888888 1 1 11 2 1 444444 1 2 11 1 1 6666 1 11 1 11 55 777777 222 2 555555 888888888 333 1 1 1111111111111111111111 4444 3 2 11 1 1 66 1 2 11 11 1 6666666 3 3333 666 11 11 11 6666666 1 1 1
lowQualScore : . . . . . . .. . . . . . . . ............ ....... .. . . .. . . . . ........... . ... . .. ... ... ................. . .. .. ....... ..... . ....... . . ........................... .... .. . ... ... . ................ .. . .. . .... . ....... .................................................................................................... . . ............ .. .. . ... .. . . .. . . . ............. . ....... . .. . ........ . . .. . . ...... . . .. . . .... . .. . .. .. ...... ... . ...... ......... ... . . ...................... .... . . .. . . .. . . .. .. . ....... . .... ... .. .. .. ....... . . .
lowQualScore : 7 9 9 9 7 6 11 8 8 8 6 4 8 4 999999999999 5555555 22 8 6 11 8 8 6 6 33333333333 6 111 9 11 666 999 88888888888888888 2 99 44 6666666 33333 8 6666666 8 8 666666666666666666666666666 7777 77 7 888 999 9 9999999999999999 22 9 55 0 0000 0 4444444 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 3 999999999999 66 66 2 111 66 1 2 66 2 2 2 6666666666666 2 2222222 1 77 1 44444444 2 2 77 4 2 777777 2 5 77 2 2 4444 2 77 2 77 55 000000 222 5 888888 999999999 333 2 2 1111111111111111111111 8888 5 4 66 2 2 33 2 4 66 66 2 4444444 6 8888 111 88 88 88 3333333 5 5 5
consensus : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------C---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--C--------A-GT----A--T-GTAT-T--TC-C----------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----C------------GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TNA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------CAAAA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATN---AA-T-TT--ATAT-G-A--TTG-T-TAA--G--AAAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
Reference ( family-393 ) : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------C---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--C--------A-GT----A--T-GTAT-T--TC-C----------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----C------------GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TNA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------CAAAA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATN---AA-T-TT--ATAT-G-A--TTG-T-TAA--G--AAAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116543 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GT----A--T-GTAT-T--TC-C----------------TACG--CC-G--C-ATG----A-CA-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GA---A-----C------------GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TC-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TG--A-----TT---TC-TT------CAACA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATC---AC-T-TT--ATAT-G-A--TTG-G-TAT--G--AAAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116544 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TTT-C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GT----AA-T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CC-G--C-ATG------CA-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GA---A-----C------------GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TC-A--T-AAA--------A--TATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-T---G-A--TG--A-----TT---TC-TT------CAACA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATC---AC-T-TT--ATAT-G-A--TTG-G-TAT--G--AAAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116545 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---AT--T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GT----A--T-GTA--T--TC-T----------------TACG--CC-G--C-ATG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----T------------GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TG--A-----TT---TC-TT------CAACA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATC---AA-T-TT--ATAT-G-A--TTG-C-TAT--A--AAAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--
gi|116546 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-G-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---ATA--A---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GT----A--T-GTA--T--TC-C----------------TACG--CC-G--C-ATGA---A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----C------------GA-CTA---A---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T---------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TGAA----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--GCG--TA--A-----TT---TC-TG------CAACA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATC---AA-T-TT--ATAT-G-A--TTGTT-TAT--G--AAAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116547 : TAT-CA-CT-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-A-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------T-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GG----A--T-ATAT-T---C-C----------------TACG--CC-G--C-ATG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----C------------GA-C-A---A---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T-AACGGATATC-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TG--A-----TT---TC-TT------CAACA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATC---AA-T-TT--ATAT-G-A--TAA-T-TAT--G--AAAT-TAGTC-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116548 : TAT-CA-CA-T---TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-C------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---A-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--AT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C--------CTGG-----A-GT----A--T-GTAC-T---C-C----------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----T------------GA-C-A---T---A----AT--TTC--C-A---A--TAA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATAACGA-TAGA--AG-TG-A----A-A-T-T--G-A-T----G-TT--C-A--TA--A-----AT---TC-TT------TAAAA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ACA---AA-T-TT--ATAT-G-A--TTG-T-TAA--G--AAAT-AAGTT-------AA-GATT----G---A--AATAA--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116549 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CAT-TA-TC-C-A-GTTCCCATATCCATT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T------AT---A---T----------T--T-T--T-----------A-----G-G-------T-C-A-------C-----T--G--------A-GT----A--
gi|116550 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--TGT--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GT----A--T-GTA--T--TC-C----------------TACG--CC-G--C-ATG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----C------------GA-C-A---T---ATT--AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TC-A--T-AAA--------C-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-
gi|116551 : TAT-TA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TTTCCAGTTG--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---T---T----------T--T-T--TTT-C-------A-----T-AG------T-C-A-------CTCC--A--C--------A-GT-------T-GTAT-T--CC-T----------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----T------------GA-C-A---G---A----AG--TCC--CAA---A--TAA-A--T-C-G-A-------------T-G-------TTCG--TAAAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG--G-A----A-A-C----G-A-TG---G-TT--G-A--TA--A-----AT---TCATT------CAAAAT--------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATA---AA-TGTT--ATAT-G-A--TTG-TGTAA--G--AAAT-T-GTT-------AA-GATC----T---T--AGAGG--C--C---------G-T-CATT
gi|116552 : TAT-CA-CA-T-A-T------C-CC-CTT-TAATC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---GGT--G---AT---A---T----------T--T-TT-TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GT----A--T-GTAT-G--TC-C----------------TACG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AA-C-A---GA--A----AT--TCC--C-A---A---CA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-----------------------------------------------------ACAA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATC---AA-T-TT--ATAT-GAA--TTG-T-TAA--G--AAAT-TAGCT-------AAGGATC----GA--A--AAAGG--C--C-------T-G-TCCATTT
gi|116553 : TAT-CA-CA-T-AATCT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--GAT-AT---A---T----------T--C-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-ACATAGCTC-----A--T--------A-GT----A--T-GTA--T--TC-C----------------TACG--C--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------A-C-A-------A----AT--T-C--C-A---A--TCA-A----C-G-A-------------T-A-------TT-AT-T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C------A-T----T-AT--G-A---A--A-----A-----C-CA------CATAA---------TTT-----------A----------------------ATT----A-T-TT---TAT-G-A--T--------------AAT-TAGCT-------AAGGATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T--ATTT
gi|116554 : TAT-CAACA-T-A-TTA-A--C-CC-CTT--A-TC-C-A-G------------TTT------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TTTTC-------A-----T-A-------T-C-A-------CCCTACG--C--------A-GT----A--T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CC-GACC-GTAGATTA-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----T------------GA---A---C---A----ATGATGCTAC-A---A--TAA-A--T---G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAAG-------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----ACA-C-TCCG-A-T----G-TT--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------GAAAAA--------TTTGA--A-AAA-CA----------------------AT-----A-TGTT--AGAT-G-A--TTG-T-TAA--G--AAAT-TTGTA-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116555 : TAT-CT-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TA-------G--A-T-A--A-C-A-C-T-------C---G-T---T-T--G---AT---A---A----------AA-T-T--GT--C-------A-----T-A-------T-C-G-------CCT---A--C--------A-GT----A--T-GTAT-T--TC------------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------TGTGTATTGAAGCTTGATC--A--------------GG---G-----T------------GA-C-A---GCTGA----AT--TCC--A-A---A--TAA-A--T-T-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----C-A-G-T--G-A-T----G-TT--G-A--TAT-ACATGTAT---TC-TT------TAAAA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATA---AA-T-TC--GTAT-G-AT-TTG-T-CAA--G--AAGT-TGGTT-------AA-GATC----
gi|116556 : TAT-CT-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC---A-G------------TA-------G--A-A-A------A-C-T-------C---G-T---T-T--G---AT---AAAAT----------T-----------C-------A-----T-A-------T-C-G-------CCT---A--C--------A-GT----A--T-GTAT-T--TC-T----------------T-CG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------TGTGTATTGAAGCTTGATC--A--------------GG---G-----T------------GA-C-A---GCTGA----AT--TCC--A-A---A--TAA-A--T-T-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----C-A-G-T--G-A-T----G-TT--G-A--TAT-AC----ATGTATT-TT------TAAAA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATA---AA-T-TC--GTAT-G-AT-TTG-T-CAA--G--AAGT-TGGTT-------AA-GATC----
gi|116557 : TAT-CA-CA-T-A-TTC-A--C-CT-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--A-C-A-C-T-------C---A-T---A-T--G---ATC--A---A----------T--T-T--TT--C-------A-----C-----------C-A-------------A--C--------A-GT----A--T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CT-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------------------------------------------------GA-C-A---G---A----AT--TCT--C-T---A--TAA-A--T-C-G-A-------------T-A-------CC-A--T-AAC--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----T-A-T-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA--A-----AT---TC----------------------------------A-CG----------------------ATA---AA-T-TT--ATAT-G-A--TTA-T-CAA--G--AAAT-TTGTT-------AA-GATT----G---A--AAAGG--T--C-------C-G-T-CATTT
gi|116558 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-T-A-G------------TT-------G--A-T-T--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---TG---------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------CCC---A--C--------A-GT----A--T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------T---------------------------------------------------------------------------------TCC--C-A---A--TAA-A--T-C-G-A-------------T-A-------GT-C--T-AAA--------A-AATTTGA-TTGA--AG-TG-A----G-A-C-T--A-A-T----G-TC--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------TAAAA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATC---AA-T-TT--ATAT-G-A--TTA-T-CAA--G--AATT-T
gi|116559 : TATACA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------GC-A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--CCTATCAAA-----T-A-------T-C-A-------T-----A--TA-------A-GTC---A--T-GTA-----TC-C----------------TACG--CC-G--C-ATG----ACCA-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------AGGAAA-----T------------GACC-A---G---A----AT--TCC--C-A---C--TCATA--T-C-G-A-------------T-A-------TC-A--T---A--------A-ATATTGA-TGGA--AT-T-------A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TGATA-----AT---TC-TT------CAACATC-------TTTG---A-AAA--A----------------------ATC---AT-G-TTAAATAT-G-AG-TTG-T-TAT--G--AAACATAGTT--------A-GATCT---G---ACCAAA---------------C-G-T-CATTT
gi|116560 : TATACA-CA-TTA-TTTTA--C-CC-CTC-TA-AC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-----------A-T---GCT--G---AT---A---T----------C--T-T--TT--C-------A-----T-AAAA----T-C-AA------C-----A--T--------A-GT----AG-T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CC-G--C--TG----A-CG-------AA---------------G------------------------------------------------------------------------------------------------------AT--TCC--C-A---A--TAA-A--T-C-G-A-------------T-AGACTAG-TT-A--T-AAA--------TTATCTTGA-TGGA--AG-TG-G----C-A-CCT--A-A-TC---G-TG--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------TAAAA----------TTG---A-AAA-CA----------------------ATA---AATT-TT--ATAT-G-A--TTA-T-CAA--A--AAAT-TGCTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--CGCGCTGGC-G-T-CATTT
gi|116561 : TAT-TA-CA-T-A-TTT-A--C-AC-CCT-TA-TC-C-A-G------------TG-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------C---A-T---G-C--A---AT---A---T----------CA-T-G--TT--C-------A-----T-A-------T-C---------C-----A--C--------ACTT----A--T-GTA--T--TC-C----------------TACG--CC-A--G-GTG----A-CGTAATGTTAA---------------T------------------------T-----------------C--A--------------AA---A-----T-------------A-C-ATGTG---C----AT--TGG--A-A---A--TGA-A--T-T-A-AGGTGACAAAATTCC-A-------TT-G--T-AAA--------A-A-ATT-A-TGAT--AG-TG-G----C-G-C-A--G-G-T----G-TT--G----TA--A-----GA---TC-TT------CAAAA---------TTAG---A-GAA-GG----------------------GAG---AA----T--ATAT-G-A--ATG----A------------AGTT-------AA-GATCAAGGG---A--ACAGG--A--C-------T-G-T-CA
gi|116562 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--TCT--TT--C-------A-----T-A-------T-T-ACC-----C-----A--C--------A-GT----A--T-GTA--T--TC-C----------------TACG--CT-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------AG---A-----T------------GA-C-A---G---A----
gi|116563 : TAT-CA-CA-T-A-TTTCA--C-CC-CTT-TA-TC-T-A-G------------TT-------G--A-TAA--T-C-A-C-T-------T---G-T---GTT--G---AT---A---T----------T--T-T--TTC-C-------A-----T-A-------TCC-A-------C-----A--T--------A-GT----AATT-GTA--T--TC-C----------------TATG--CC-A--C-ATG----A-CA-------AAT--------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----C------------GA-CAA---G---A----AT----C--C-A---A--TCA-A--T-C-GAA-------------T-A-------TT-A--T-AGA--------
gi|116564 : TAT-TA-CA-T-G-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-A------------TT-------G--A-T-A--A-C-A-C-T-------G---A-T---G-C--A---AT---GG--T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------CGA---A--C--------A-GT----A--T-GCAT-T--TC-A-----------------ATG--TC-T--T-GTG----A-CG-------AA---------------ATGTGCATTGGAGCTTGAAACTGGAT-----------------C--A--------------GG---G-----T------------GG-C-A---G---GT---AT--CCC--A-A---A--TAA-A--T-C-A-A-------------T-G-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG--G-A----GCA-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------CAAAG---------TTCC---A-AAA-
gi|116565 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-GTT-TA-T----A-A------------TT-------TTTA-T-A--T-C-A-C-TAAAACCTC---G-T---------------------T----------T--T-T--TT--T-------A-----T-A-------T-C-A-------CC----A--C--------A-GT----A--T-ATTT-TATTC-T----------------TACG--GC-G--A-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------TGTGTATTGAAAATGGT-T--A--------------GT---C-----T------------GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TAA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TC-A--T-AAT--------A-ATATTGT-TAGA--AG-TG-G----C-A-C-T---------------------------------T---TC-TT------C-AAA---------TATG---A-AAA-CA----------------------ATA---AA-C-TT--AAAT------CTG----AA--G--AAAT-TGGAT-------AA-AATT----G---A--
gi|116566 : TAT-CA-CA-T-A-TAT-G--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--A-C-A-C-T-------A---A-T---G-TTAA---AA---A---A----------G--T-T--TT--C-------A-----T-G-------T-C-A-------CCA---A--C--------A-GT----A--T-GTA--T--TC-C----------------TATA--CC-A--C-GTG----A-CA-------AAATGTGTTGAAGCTGGA------------------------T-----------------C--A--------------AG---G-----T------------GA-C-A---A---A----AT--TCC--C-A---A--TAA-G--T-C-G-A-------------T-A-------TT-G--T-AA
gi|116567 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC--TT-TA-TCTC-A-GG-----------TT-------G--A-T-AATT-C-AAC-G-------A---G-T---GCT--G---ATT--A---T----------T--GGT--TT--G-------A-----C-AGATTGATT-C-A-------C-----AAGC--------A-GT----AG-T-GTAT-T--CC-CACAAGCAGACCCCCCATACG--CC-G--C-ATG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C----------------------------------------------------------------CC--C-A---A--TCA-A--TGC-G-AC------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-A-ATTGA-TG-ATTAT-TG-ATAATA-A-C-T--G-A-TAAGAG-TTTCG-AGTTG--A-----CT---TC-TCTGTCACCAAAAAACCGACATTTTG---ATAAA-CT----------------------GTC---AA-T-TT--ATAT-G-A--TTG-TGTGA--GTTGAAT-TAGCT-------AAGGATC----G---A--ACAGG--C--
gi|116568 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CA-CTT-TA-TC-C-A-T------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---TNNNNNNNNNNN--N-N--NN--N-------N-----N-N-------N-N-N-------N-----N--N--------N-NN----N--N-NNNN-N--NN-N----------------NNNN--NN-N--N-NNN----N-NN-------NN---------------N------------------------N-----------------N--N--------------NN---N-----N------------NN-N-N---N---N----NN--NNN--N-N---N--NCA-A--T-C-G-A-------------T-T-------TC-A--T-AGA--------A-ATATTGG-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--T
gi|116569 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A------A-C-T-------C---A-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-T-A-------
gi|116570 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC--TT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A------A-C-T-------C---A-T---T-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-T-A-------
gi|116571 : TAT-CA-CA-T-T-ATT-A--C-CA-TTT-TA-TC-C-A-GGT----------TC-------G--A-T-A--TCC-A-CAT-------T---GTT---G-T--G---A----A--------------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-ACC-----C-----A--C--------ACGT----A--T-G-ATAT--TC-C----------------TACG--CC-G--C--TG----A-CG-------AAT--------------A------------------------T-----------------------------------------------------------------------------AC--TC------------TAA-A----------------------------------------AAA--------A-A-AT--A-TGGA--AGTTG-G----C-A-A-T--A-A-T----G-TG--G-A--TT--A-----AT---TC-TT------TAAA------------------------A----------------------ATC-------------CAT-G-A--TTA-T-CAA--A--AAAC-TTGTC-------AA-GATC----C---G--AAAGC--C--C-----------T-CATTT
gi|116572 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-C--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-AGG-T-------C---A-T---G-T--GAGTAT---A---T----------T--TCT--TT--C-------AATAATT-A-------T-CTC-------C-----A--C--------AGGT----A--TGGTAT-T--TC-C-----------------AGG--TG-G--C-GTG----A-
gi|116573 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--C-TC-CTT-TA-TC-C-C-G------------TG-------G--A-T-A--T-T-A-C-T-------C---A-T---A-A--C---AT---A---A----------A--T-T--CT--A-------AT----T-A-------T-T-A-------T-----A--T-----------T----A--T-GT-T-T--TC-C----------------TACG--CC-GATT-GTG----A-C-------------------------A------------------------T-----------------C--A--------------
gi|116574 : TAT-TA-CA-A-A-TTT-A--C-TC-ATT-TA-TC-C-A-C------------TT-------G--A-C-A--A-C-A-C-T-------A---A-T---G-C--G---AA---T---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-ACC-----C-----A--C--------A-GT----A--G-GTAT-T--TC-caaacgtacgtaaaatt
gi|116575 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--C-TC-CTT-TA-TC-C-GCG------------TG-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------C---A-T---A-A--C---AT---A---A----------A--T-T--CT--G-------AT----T-A-------T-T-A-------C-----A--C-----------T----G--T-GT-T-T--TC-C----------------TACG--CC-G--
gi|116576 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--C-TC-CTT-TA-TC-C-C-G------------TG-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------C---A-T---A-A--C---AT---A---A----------A--T-T--CT--A-------AT----T-A-------T-T-A-------C-----A--C-----------T----A--T-GTTT-T--ACTC----------------TACG--CC-GATT-GTG----A-
gi|116577 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--T-TC-CTT-TA-TC-C-C-G------------TG-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------C---A-T---A-A--C---AT---A---A----------A--T-T--CT--A-------AT----T-A-------T-T-A-------C-----A--C-----------T----G--T-GT-T-T--TC-C----------------TACG--CC-G--acgtcaaacg
gi|116578 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--C-TC-CTT-TA-TC-C-C-G------------TG-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------C---A-T---A-A--C---AT---A---A----------A--T-T--CT--A-------AT----T-A-------T-T-A-------C-----A--C-----------T----G--T-GT-T-T--TC-C----------------TACG--CC-
gi|116579 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--C-TC-CTC-TA-TC-C-C-G------------TG-------G--A-T-A--C-C-A-C-T-------C---A-T---A-A--C---AT---A---A----------A--T-T--CT--A-------AT----T-A-------T-T-A-------C-----A--C-----------T----A--T-CT-T-T--TC-C----------------TACA--CC-GATT-GCG----A-CG-------
gi|116580 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-ATAC-TC-CTT-TA-TC-C-T-G------------TG-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------A---A-T---A-A--C---AT---A---C----------T--T-T--CT--A-------A-----TTA-------C-C-G-------T-----A--C--------A-CT----G--T-GT-T-T--TC-C----------------TACG--CC-AATT-GTG----A-C-------------------------A------------------------T-----------------C--A--------------tcacaaacgtacgtaaaatt
gi|116581 : TAT-CA-CA-T-G-ATT-A--C-TC-CTT-TA-TC-C-C-G------------TG-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------CATAG-C---A-T--G---A----A---T----------T--C-T--------------AAT---T-A-------T-T-A-------C-----A--C-----------T----G--T-GT-T-T--TC-C----------------TACG--CC-G--caa
gi|116582 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--C-TC-CTC-TA-TC-C-C-A------------TG-------G--A-C-A--T-C-A-C-T-------C---A-TAACA-T--A---ATTTAA---T----------TAAT-T--CT--A-------AT----T-A-------T-T-A-------C-----A--C-----------T----G--T-GT-T-T--TC-C----------------TACA--CT-GATT-GTG----A-C-------------------------A------------------------T-----------------C--A--------------
gi|116583 : AT-CA-CC-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---A-T---G-T--G---AT---A---T----------TG-T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------CCC---A--CTGTGAATGA-GT----A--T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------TG----------------T--G--------------GA---A-----CTGAATCAAG---GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TAA-A--T-G-A-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-C----A---C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA--A-----AT---TG-TT------CAAAA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATA---AA-T-TT--AAAT-G-A--TTG-T-TAA--G--AAAT-TGGTT-------AA-GATC----A---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTTcaaacgtacgtaaaatt
gi|116584 : AT-CA-CC-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------T--------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---A-----G-T--G---AT---A---T----------TG-T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------CCC---A--CTGTGAATGA-GT----A--T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------GA---------------A------------------------TGT---------------T--G--------------GA---A-----CTGAATCAAG---GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TAA-A--T-G-A-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-C----A---C-T--G-A-T------TT--G-A--TA--A-----AT---TG-TT------CAAAA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATA---AT-T-TT--AAAT-G-A--TTG-T-TAA--G--AAAT-TGGTT-------AA-GATC----A---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116585 : AT-C--CA-T-A-TTT-A--CACC-CTT-T---C-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T---A-C-T-------C---A-TC--G-T--G---AT---T---T----------T--T-TCTTT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------CC----A--C--------A-ACCCCCA--T-GTAT-----C-C----------------TACG--CTTG--C-GTG----A-CG-------AAC--------------A------------------------TAGG--------------C--T--------------GG---A-----C------------AT-C-G---G---ACCATAT--CCA--C-ACACACTTCC-A--T-C-G-A-------------T-G-------TT-A--T-AAG--------T--TATTGA-TGGA--AA-TG-GC---A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--CAT-A-----AT---TT-TTTCC---CCAAA---------TTTG---A-CAA-CA----------------------ATA---AA-T-T---ATG--G-A--TTG-T-CAA-----AACT-TGGTCC------AA-GACT----ACACA--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATCT
gi|116586 : T-CA-CAAT-ACTTT-A--C-CC-TCT-TACTC-CTA-G------------T--------G--A-TCA--T-CCA-C-T-------T---GCT---GCT--G---AT---A---CCTTTC-----T--T-T--TC--C-------A-----T-A-------T-T-A-------C-----A--TTAT-----G-TT----A--T-GTAT-T---C-C----------------TACGGCCC-G--C-ATG----A-CG-------A-----------------------------------------T-----------------CGAA--------------GA---A-----C------------GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-AATT-C-----------------T-G-------TT-A--T-ATATTGACACCA-ATAT-GACTGGA--AG-TG-A----A-AAC-T--G-A-TC---G-TT--G-A--TG--A-----TT---TCCTT------CAACG---------TTTG---A-AAAACA----------------------ATCCCAAACT-TT--ATAT-G-GACTTG-T-TACTTG--ACAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T---T-CATTT
gi|116587 : T-CA-CA-T-A-TTT-A--C-C----T-TA-TCTC-ATG------------TT-------G--AAT-A--T-C-----T-------T---A-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------AA----T-A-------T-C---------C-----A--C--------ATAT----A--TTGTAT-T---C-C----------------TACG--TC-G--C-TTG----A-CA-------AA---------------A------------------------T-----------------C-----------------------------------------------------------------C--C-A---A--T-A-A--T-C-G-A-------------T----------T-AGCT-AAGTCTAT---A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-G----C-A-CAT--A-A-T----G-TC--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------TAAAA---------TATG---A-AAA-CA----------------------CTA---AGTT-TT--ATAT-G-AT-TTA-T-CAA--G--AAAT-TCCT---------A-GAAT----G---A--AAAGG--C--CG------TGG-T-CATTT
gi|116588 : T-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-C-G------------TT-------GATA-T-A--T-C-A-C-T-------A---A-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--T-------A-----T-A-------
gi|116589 : A-T-A-TT--A--C-CTTCTT-TA-TCGC-A-GC-----------TT-------GTAA-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---GGT--G----T---A---T----------T--T-T--TT--C-------AG----T-AT------T-C-A-------C--------T--------A-GT----A----GTAT-T--TC-C----------------TA-G---C-G--CAATG----A-CG--------A---------------A------------------------T-----------------C--A---------------G---A-----C------------AA---A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-CGG-A-------------T-A-------TT-A----AAA--------A-A-GTT---TGGA--AGCTG-A----A-A-C-T--GTACT----G-TT--G-A--TA--AT----CT---TC-TT------C-ACA---------TTTG-----AAA-C-----------------------ATC---AA-T-TT--ATAT-G-A---TG-T---A--T--GAAT-TAGTT-------AA-GATC----C---G--ACAGGCCC--C-------T-GTT-CATTT
gi|116590 : TT-A--C-CC-CTTGTA-TC-A-AAG------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-CGT-------T---G-TT--G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-AC------C-----A--CA-------A-GT----A--T-G-AA-T--TC-C----------------TGCG--T-----C-GTG----A-CGA------AA---------------A------------------------T-----------------T--G--------------GA---A-----CTGATGAAGGGAGAA-C-A---G---A----A---TCC--C-A---A--TAA-A--T-C-G-A-------------TCA-------TT-A--T--AA--------C-ATA---------------G-C----A-C-T-T--G-A-T----GTTT--G-A--TA--A-----AT---TG-TT------CAAA-----------TTGAAAA-AAA-CA----------------------ATA---AA-T-TT--A-ATAA-A--TTG-T-TAA--G--AAAT-GGGTT-------AA-GATC----G---A--CAAAG--C--T-----------T-CATTT
gi|116591 : TT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---A-T---T-C--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--
gi|116592 : ---T----------T--G-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GT----A--T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CC-G--CCATG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GA---AA----C------------GA-C-A---G---A----AT--CTC--C-C---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATT-A-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-T---G-A--TG--A------T---TC-TT------CAACA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATC---AA-T-GT--ATAT-G-A--TTG-T-TAT--G--AAAT-TAGTT-------AA-GATC----GA--A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTTtca
gi|116593 : --TT--C-------A-----T-A-------T-C-AC------C-----A--C--------A-AT----A--T-GTG--T--TC-C----------------TACA--CT-G--C-GTG----A-AG-------TA---------------A------------------------T-----------------C--ATAAATGTGTATATTGG---AACTGGT------------GG-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TAA---------------------------------------------------------ATTGA-TGGA--AG-TC-A----A-A-C-G--G-G-C----A-TT-------T---A-----GT---TC-------------------------TA---A-AAA-CA----------------------ATG---AA-T-TC--ATAC-G-----TG----AA--G--TACT-CAGTTG------AA-GATT----G---A--GAGAA--CCAC-------T-G-T-
gi|116594 : -A--T-AAA--------A-CTATTGA-TGGA--AG-TG-G----C-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA--A-----AT---TT-TT------CAAAA---------TTTG---A-AAA-CAATATGTTGTTTTTGTGAAAACAATA---AA-T-TT--ATAT-G-A--TGG-T-CAA--G--AAAT-TGGTT-------AA-GATC----A---A--AAACG--C--
gi|116595 : caataga-TT--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------CAAAA---------TTTG---A-AAA-------------------------------------------T-G-A--TTG-T-TAA--A--AAAT-TAGTT-------AA-AATC----GA--A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116596 : AACA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATC---AA-T-TT--ATAT-G-A--TTG-T-TAT--G--AAAT-TAGTTAAAATCGAA-GATC----G---A--AAATG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116597 : -T-TT--ATAT-G-C--TTG-T-TAA--G--AAAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-A-T-CATTT
gi|116598 : -T-TT--ATAT-G-C--TTG-T-TAA--G--AAAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-A-T-CATTT
Alignments
lowQualScore : 11111 111111111111111111111111111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111111111111111111111
lowQualScore : 1 0 0 0 1 1 11 0 0 0 1 2 0 2 666666666666 3333333 44 0 1 11 0 0 1 1 66666666666 1 333 4 11 222 333 66666666666666666 3 11 33 2222222 00000 0 5555555 0 0 999999999999999999999999999 2222 33 1 444 666 0 5555555555555555 11 0 77 2 3333 1 4444444 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 2 666666666666 11 11 1 222 11 2 1 11 1 1 1 7777777777777 1 7777777 1 22 1 88888888 1 1 11 2 1 444444 1 2 11 1 1 6666 1 11 1 11 55 777777 222 2 555555 888888888 333 1 1 1111111111111111111111 4444 3 2 11 1 1 66 1 2 11 11 1 6666666 3 3333 666 11 11 11 6666666 1 1 1
lowQualScore : . . . . . . .. . . . . . . . ............ ....... .. . . .. . . . . ........... . ... . .. ... ... ................. . .. .. ....... ..... . ....... . . ........................... .... .. . ... ... . ................ .. . .. . .... . ....... .................................................................................................... . . ............ .. .. . ... .. . . .. . . . ............. . ....... . .. . ........ . . .. . . ...... . . .. . . .... . .. . .. .. ...... ... . ...... ......... ... . . ...................... .... . . .. . . .. . . .. .. . ....... . .... ... .. .. .. ....... . . .
lowQualScore : 7 9 9 9 7 6 11 8 8 8 6 4 8 4 999999999999 5555555 22 8 6 11 8 8 6 6 33333333333 6 111 9 11 666 999 88888888888888888 2 99 44 6666666 33333 8 6666666 8 8 666666666666666666666666666 7777 77 7 888 999 9 9999999999999999 22 9 55 0 0000 0 4444444 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 3 999999999999 66 66 2 111 66 1 2 66 2 2 2 6666666666666 2 2222222 1 77 1 44444444 2 2 77 4 2 777777 2 5 77 2 2 4444 2 77 2 77 55 000000 222 5 888888 999999999 333 2 2 1111111111111111111111 8888 5 4 66 2 2 33 2 4 66 66 2 4444444 6 8888 111 88 88 88 3333333 5 5 5
consensus : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------C---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--C--------A-GT----A--T-GTAT-T--TC-C----------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----C------------GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TNA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------CAAAA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATN---AA-T-TT--ATAT-G-A--TTG-T-TAA--G--AAAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
Reference ( family-393 ) : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------C---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--C--------A-GT----A--T-GTAT-T--TC-C----------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----C------------GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TNA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------CAAAA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATN---AA-T-TT--ATAT-G-A--TTG-T-TAA--G--AAAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116543 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GT----A--T-GTAT-T--TC-C----------------TACG--CC-G--C-ATG----A-CA-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GA---A-----C------------GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TC-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TG--A-----TT---TC-TT------CAACA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATC---AC-T-TT--ATAT-G-A--TTG-G-TAT--G--AAAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116544 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TTT-C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GT----AA-T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CC-G--C-ATG------CA-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GA---A-----C------------GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TC-A--T-AAA--------A--TATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-T---G-A--TG--A-----TT---TC-TT------CAACA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATC---AC-T-TT--ATAT-G-A--TTG-G-TAT--G--AAAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116545 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---AT--T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GT----A--T-GTA--T--TC-T----------------TACG--CC-G--C-ATG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----T------------GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TG--A-----TT---TC-TT------CAACA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATC---AA-T-TT--ATAT-G-A--TTG-C-TAT--A--AAAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--
gi|116546 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-G-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---ATA--A---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GT----A--T-GTA--T--TC-C----------------TACG--CC-G--C-ATGA---A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----C------------GA-CTA---A---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T---------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TGAA----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--GCG--TA--A-----TT---TC-TG------CAACA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATC---AA-T-TT--ATAT-G-A--TTGTT-TAT--G--AAAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116547 : TAT-CA-CT-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-A-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------T-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GG----A--T-ATAT-T---C-C----------------TACG--CC-G--C-ATG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----C------------GA-C-A---A---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T-AACGGATATC-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TG--A-----TT---TC-TT------CAACA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATC---AA-T-TT--ATAT-G-A--TAA-T-TAT--G--AAAT-TAGTC-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116548 : TAT-CA-CA-T---TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-C------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---A-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--AT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C--------CTGG-----A-GT----A--T-GTAC-T---C-C----------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----T------------GA-C-A---T---A----AT--TTC--C-A---A--TAA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATAACGA-TAGA--AG-TG-A----A-A-T-T--G-A-T----G-TT--C-A--TA--A-----AT---TC-TT------TAAAA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ACA---AA-T-TT--ATAT-G-A--TTG-T-TAA--G--AAAT-AAGTT-------AA-GATT----G---A--AATAA--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116549 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CAT-TA-TC-C-A-GTTCCCATATCCATT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T------AT---A---T----------T--T-T--T-----------A-----G-G-------T-C-A-------C-----T--G--------A-GT----A--
gi|116550 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--TGT--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GT----A--T-GTA--T--TC-C----------------TACG--CC-G--C-ATG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----C------------GA-C-A---T---ATT--AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TC-A--T-AAA--------C-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-
gi|116551 : TAT-TA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TTTCCAGTTG--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---T---T----------T--T-T--TTT-C-------A-----T-AG------T-C-A-------CTCC--A--C--------A-GT-------T-GTAT-T--CC-T----------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----T------------GA-C-A---G---A----AG--TCC--CAA---A--TAA-A--T-C-G-A-------------T-G-------TTCG--TAAAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG--G-A----A-A-C----G-A-TG---G-TT--G-A--TA--A-----AT---TCATT------CAAAAT--------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATA---AA-TGTT--ATAT-G-A--TTG-TGTAA--G--AAAT-T-GTT-------AA-GATC----T---T--AGAGG--C--C---------G-T-CATT
gi|116552 : TAT-CA-CA-T-A-T------C-CC-CTT-TAATC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---GGT--G---AT---A---T----------T--T-TT-TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GT----A--T-GTAT-G--TC-C----------------TACG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AA-C-A---GA--A----AT--TCC--C-A---A---CA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-----------------------------------------------------ACAA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATC---AA-T-TT--ATAT-GAA--TTG-T-TAA--G--AAAT-TAGCT-------AAGGATC----GA--A--AAAGG--C--C-------T-G-TCCATTT
gi|116553 : TAT-CA-CA-T-AATCT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--GAT-AT---A---T----------T--C-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-ACATAGCTC-----A--T--------A-GT----A--T-GTA--T--TC-C----------------TACG--C--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------A-C-A-------A----AT--T-C--C-A---A--TCA-A----C-G-A-------------T-A-------TT-AT-T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C------A-T----T-AT--G-A---A--A-----A-----C-CA------CATAA---------TTT-----------A----------------------ATT----A-T-TT---TAT-G-A--T--------------AAT-TAGCT-------AAGGATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T--ATTT
gi|116554 : TAT-CAACA-T-A-TTA-A--C-CC-CTT--A-TC-C-A-G------------TTT------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TTTTC-------A-----T-A-------T-C-A-------CCCTACG--C--------A-GT----A--T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CC-GACC-GTAGATTA-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----T------------GA---A---C---A----ATGATGCTAC-A---A--TAA-A--T---G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAAG-------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----ACA-C-TCCG-A-T----G-TT--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------GAAAAA--------TTTGA--A-AAA-CA----------------------AT-----A-TGTT--AGAT-G-A--TTG-T-TAA--G--AAAT-TTGTA-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116555 : TAT-CT-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TA-------G--A-T-A--A-C-A-C-T-------C---G-T---T-T--G---AT---A---A----------AA-T-T--GT--C-------A-----T-A-------T-C-G-------CCT---A--C--------A-GT----A--T-GTAT-T--TC------------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------TGTGTATTGAAGCTTGATC--A--------------GG---G-----T------------GA-C-A---GCTGA----AT--TCC--A-A---A--TAA-A--T-T-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----C-A-G-T--G-A-T----G-TT--G-A--TAT-ACATGTAT---TC-TT------TAAAA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATA---AA-T-TC--GTAT-G-AT-TTG-T-CAA--G--AAGT-TGGTT-------AA-GATC----
gi|116556 : TAT-CT-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC---A-G------------TA-------G--A-A-A------A-C-T-------C---G-T---T-T--G---AT---AAAAT----------T-----------C-------A-----T-A-------T-C-G-------CCT---A--C--------A-GT----A--T-GTAT-T--TC-T----------------T-CG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------TGTGTATTGAAGCTTGATC--A--------------GG---G-----T------------GA-C-A---GCTGA----AT--TCC--A-A---A--TAA-A--T-T-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----C-A-G-T--G-A-T----G-TT--G-A--TAT-AC----ATGTATT-TT------TAAAA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATA---AA-T-TC--GTAT-G-AT-TTG-T-CAA--G--AAGT-TGGTT-------AA-GATC----
gi|116557 : TAT-CA-CA-T-A-TTC-A--C-CT-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--A-C-A-C-T-------C---A-T---A-T--G---ATC--A---A----------T--T-T--TT--C-------A-----C-----------C-A-------------A--C--------A-GT----A--T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CT-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------------------------------------------------GA-C-A---G---A----AT--TCT--C-T---A--TAA-A--T-C-G-A-------------T-A-------CC-A--T-AAC--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----T-A-T-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA--A-----AT---TC----------------------------------A-CG----------------------ATA---AA-T-TT--ATAT-G-A--TTA-T-CAA--G--AAAT-TTGTT-------AA-GATT----G---A--AAAGG--T--C-------C-G-T-CATTT
gi|116558 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-T-A-G------------TT-------G--A-T-T--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---TG---------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------CCC---A--C--------A-GT----A--T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------T---------------------------------------------------------------------------------TCC--C-A---A--TAA-A--T-C-G-A-------------T-A-------GT-C--T-AAA--------A-AATTTGA-TTGA--AG-TG-A----G-A-C-T--A-A-T----G-TC--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------TAAAA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATC---AA-T-TT--ATAT-G-A--TTA-T-CAA--G--AATT-T
gi|116559 : TATACA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------GC-A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--CCTATCAAA-----T-A-------T-C-A-------T-----A--TA-------A-GTC---A--T-GTA-----TC-C----------------TACG--CC-G--C-ATG----ACCA-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------AGGAAA-----T------------GACC-A---G---A----AT--TCC--C-A---C--TCATA--T-C-G-A-------------T-A-------TC-A--T---A--------A-ATATTGA-TGGA--AT-T-------A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TGATA-----AT---TC-TT------CAACATC-------TTTG---A-AAA--A----------------------ATC---AT-G-TTAAATAT-G-AG-TTG-T-TAT--G--AAACATAGTT--------A-GATCT---G---ACCAAA---------------C-G-T-CATTT
gi|116560 : TATACA-CA-TTA-TTTTA--C-CC-CTC-TA-AC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-----------A-T---GCT--G---AT---A---T----------C--T-T--TT--C-------A-----T-AAAA----T-C-AA------C-----A--T--------A-GT----AG-T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CC-G--C--TG----A-CG-------AA---------------G------------------------------------------------------------------------------------------------------AT--TCC--C-A---A--TAA-A--T-C-G-A-------------T-AGACTAG-TT-A--T-AAA--------TTATCTTGA-TGGA--AG-TG-G----C-A-CCT--A-A-TC---G-TG--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------TAAAA----------TTG---A-AAA-CA----------------------ATA---AATT-TT--ATAT-G-A--TTA-T-CAA--A--AAAT-TGCTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--CGCGCTGGC-G-T-CATTT
gi|116561 : TAT-TA-CA-T-A-TTT-A--C-AC-CCT-TA-TC-C-A-G------------TG-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------C---A-T---G-C--A---AT---A---T----------CA-T-G--TT--C-------A-----T-A-------T-C---------C-----A--C--------ACTT----A--T-GTA--T--TC-C----------------TACG--CC-A--G-GTG----A-CGTAATGTTAA---------------T------------------------T-----------------C--A--------------AA---A-----T-------------A-C-ATGTG---C----AT--TGG--A-A---A--TGA-A--T-T-A-AGGTGACAAAATTCC-A-------TT-G--T-AAA--------A-A-ATT-A-TGAT--AG-TG-G----C-G-C-A--G-G-T----G-TT--G----TA--A-----GA---TC-TT------CAAAA---------TTAG---A-GAA-GG----------------------GAG---AA----T--ATAT-G-A--ATG----A------------AGTT-------AA-GATCAAGGG---A--ACAGG--A--C-------T-G-T-CA
gi|116562 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--TCT--TT--C-------A-----T-A-------T-T-ACC-----C-----A--C--------A-GT----A--T-GTA--T--TC-C----------------TACG--CT-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------AG---A-----T------------GA-C-A---G---A----
gi|116563 : TAT-CA-CA-T-A-TTTCA--C-CC-CTT-TA-TC-T-A-G------------TT-------G--A-TAA--T-C-A-C-T-------T---G-T---GTT--G---AT---A---T----------T--T-T--TTC-C-------A-----T-A-------TCC-A-------C-----A--T--------A-GT----AATT-GTA--T--TC-C----------------TATG--CC-A--C-ATG----A-CA-------AAT--------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----C------------GA-CAA---G---A----AT----C--C-A---A--TCA-A--T-C-GAA-------------T-A-------TT-A--T-AGA--------
gi|116564 : TAT-TA-CA-T-G-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-A------------TT-------G--A-T-A--A-C-A-C-T-------G---A-T---G-C--A---AT---GG--T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------CGA---A--C--------A-GT----A--T-GCAT-T--TC-A-----------------ATG--TC-T--T-GTG----A-CG-------AA---------------ATGTGCATTGGAGCTTGAAACTGGAT-----------------C--A--------------GG---G-----T------------GG-C-A---G---GT---AT--CCC--A-A---A--TAA-A--T-C-A-A-------------T-G-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG--G-A----GCA-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------CAAAG---------TTCC---A-AAA-
gi|116565 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-GTT-TA-T----A-A------------TT-------TTTA-T-A--T-C-A-C-TAAAACCTC---G-T---------------------T----------T--T-T--TT--T-------A-----T-A-------T-C-A-------CC----A--C--------A-GT----A--T-ATTT-TATTC-T----------------TACG--GC-G--A-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------TGTGTATTGAAAATGGT-T--A--------------GT---C-----T------------GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TAA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TC-A--T-AAT--------A-ATATTGT-TAGA--AG-TG-G----C-A-C-T---------------------------------T---TC-TT------C-AAA---------TATG---A-AAA-CA----------------------ATA---AA-C-TT--AAAT------CTG----AA--G--AAAT-TGGAT-------AA-AATT----G---A--
gi|116566 : TAT-CA-CA-T-A-TAT-G--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--A-C-A-C-T-------A---A-T---G-TTAA---AA---A---A----------G--T-T--TT--C-------A-----T-G-------T-C-A-------CCA---A--C--------A-GT----A--T-GTA--T--TC-C----------------TATA--CC-A--C-GTG----A-CA-------AAATGTGTTGAAGCTGGA------------------------T-----------------C--A--------------AG---G-----T------------GA-C-A---A---A----AT--TCC--C-A---A--TAA-G--T-C-G-A-------------T-A-------TT-G--T-AA
gi|116567 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC--TT-TA-TCTC-A-GG-----------TT-------G--A-T-AATT-C-AAC-G-------A---G-T---GCT--G---ATT--A---T----------T--GGT--TT--G-------A-----C-AGATTGATT-C-A-------C-----AAGC--------A-GT----AG-T-GTAT-T--CC-CACAAGCAGACCCCCCATACG--CC-G--C-ATG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C----------------------------------------------------------------CC--C-A---A--TCA-A--TGC-G-AC------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-A-ATTGA-TG-ATTAT-TG-ATAATA-A-C-T--G-A-TAAGAG-TTTCG-AGTTG--A-----CT---TC-TCTGTCACCAAAAAACCGACATTTTG---ATAAA-CT----------------------GTC---AA-T-TT--ATAT-G-A--TTG-TGTGA--GTTGAAT-TAGCT-------AAGGATC----G---A--ACAGG--C--
gi|116568 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CA-CTT-TA-TC-C-A-T------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---TNNNNNNNNNNN--N-N--NN--N-------N-----N-N-------N-N-N-------N-----N--N--------N-NN----N--N-NNNN-N--NN-N----------------NNNN--NN-N--N-NNN----N-NN-------NN---------------N------------------------N-----------------N--N--------------NN---N-----N------------NN-N-N---N---N----NN--NNN--N-N---N--NCA-A--T-C-G-A-------------T-T-------TC-A--T-AGA--------A-ATATTGG-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--T
gi|116569 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A------A-C-T-------C---A-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-T-A-------
gi|116570 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC--TT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A------A-C-T-------C---A-T---T-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-T-A-------
gi|116571 : TAT-CA-CA-T-T-ATT-A--C-CA-TTT-TA-TC-C-A-GGT----------TC-------G--A-T-A--TCC-A-CAT-------T---GTT---G-T--G---A----A--------------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-ACC-----C-----A--C--------ACGT----A--T-G-ATAT--TC-C----------------TACG--CC-G--C--TG----A-CG-------AAT--------------A------------------------T-----------------------------------------------------------------------------AC--TC------------TAA-A----------------------------------------AAA--------A-A-AT--A-TGGA--AGTTG-G----C-A-A-T--A-A-T----G-TG--G-A--TT--A-----AT---TC-TT------TAAA------------------------A----------------------ATC-------------CAT-G-A--TTA-T-CAA--A--AAAC-TTGTC-------AA-GATC----C---G--AAAGC--C--C-----------T-CATTT
gi|116572 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-C--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-AGG-T-------C---A-T---G-T--GAGTAT---A---T----------T--TCT--TT--C-------AATAATT-A-------T-CTC-------C-----A--C--------AGGT----A--TGGTAT-T--TC-C-----------------AGG--TG-G--C-GTG----A-
gi|116573 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--C-TC-CTT-TA-TC-C-C-G------------TG-------G--A-T-A--T-T-A-C-T-------C---A-T---A-A--C---AT---A---A----------A--T-T--CT--A-------AT----T-A-------T-T-A-------T-----A--T-----------T----A--T-GT-T-T--TC-C----------------TACG--CC-GATT-GTG----A-C-------------------------A------------------------T-----------------C--A--------------
gi|116574 : TAT-TA-CA-A-A-TTT-A--C-TC-ATT-TA-TC-C-A-C------------TT-------G--A-C-A--A-C-A-C-T-------A---A-T---G-C--G---AA---T---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-ACC-----C-----A--C--------A-GT----A--G-GTAT-T--TC-caaacgtacgtaaaatt
gi|116575 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--C-TC-CTT-TA-TC-C-GCG------------TG-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------C---A-T---A-A--C---AT---A---A----------A--T-T--CT--G-------AT----T-A-------T-T-A-------C-----A--C-----------T----G--T-GT-T-T--TC-C----------------TACG--CC-G--
gi|116576 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--C-TC-CTT-TA-TC-C-C-G------------TG-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------C---A-T---A-A--C---AT---A---A----------A--T-T--CT--A-------AT----T-A-------T-T-A-------C-----A--C-----------T----A--T-GTTT-T--ACTC----------------TACG--CC-GATT-GTG----A-
gi|116577 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--T-TC-CTT-TA-TC-C-C-G------------TG-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------C---A-T---A-A--C---AT---A---A----------A--T-T--CT--A-------AT----T-A-------T-T-A-------C-----A--C-----------T----G--T-GT-T-T--TC-C----------------TACG--CC-G--acgtcaaacg
gi|116578 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--C-TC-CTT-TA-TC-C-C-G------------TG-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------C---A-T---A-A--C---AT---A---A----------A--T-T--CT--A-------AT----T-A-------T-T-A-------C-----A--C-----------T----G--T-GT-T-T--TC-C----------------TACG--CC-
gi|116579 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--C-TC-CTC-TA-TC-C-C-G------------TG-------G--A-T-A--C-C-A-C-T-------C---A-T---A-A--C---AT---A---A----------A--T-T--CT--A-------AT----T-A-------T-T-A-------C-----A--C-----------T----A--T-CT-T-T--TC-C----------------TACA--CC-GATT-GCG----A-CG-------
gi|116580 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-ATAC-TC-CTT-TA-TC-C-T-G------------TG-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------A---A-T---A-A--C---AT---A---C----------T--T-T--CT--A-------A-----TTA-------C-C-G-------T-----A--C--------A-CT----G--T-GT-T-T--TC-C----------------TACG--CC-AATT-GTG----A-C-------------------------A------------------------T-----------------C--A--------------tcacaaacgtacgtaaaatt
gi|116581 : TAT-CA-CA-T-G-ATT-A--C-TC-CTT-TA-TC-C-C-G------------TG-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------CATAG-C---A-T--G---A----A---T----------T--C-T--------------AAT---T-A-------T-T-A-------C-----A--C-----------T----G--T-GT-T-T--TC-C----------------TACG--CC-G--caa
gi|116582 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--C-TC-CTC-TA-TC-C-C-A------------TG-------G--A-C-A--T-C-A-C-T-------C---A-TAACA-T--A---ATTTAA---T----------TAAT-T--CT--A-------AT----T-A-------T-T-A-------C-----A--C-----------T----G--T-GT-T-T--TC-C----------------TACA--CT-GATT-GTG----A-C-------------------------A------------------------T-----------------C--A--------------
gi|116583 : AT-CA-CC-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---A-T---G-T--G---AT---A---T----------TG-T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------CCC---A--CTGTGAATGA-GT----A--T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------TG----------------T--G--------------GA---A-----CTGAATCAAG---GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TAA-A--T-G-A-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-C----A---C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA--A-----AT---TG-TT------CAAAA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATA---AA-T-TT--AAAT-G-A--TTG-T-TAA--G--AAAT-TGGTT-------AA-GATC----A---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTTcaaacgtacgtaaaatt
gi|116584 : AT-CA-CC-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------T--------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---A-----G-T--G---AT---A---T----------TG-T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------CCC---A--CTGTGAATGA-GT----A--T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------GA---------------A------------------------TGT---------------T--G--------------GA---A-----CTGAATCAAG---GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TAA-A--T-G-A-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-C----A---C-T--G-A-T------TT--G-A--TA--A-----AT---TG-TT------CAAAA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATA---AT-T-TT--AAAT-G-A--TTG-T-TAA--G--AAAT-TGGTT-------AA-GATC----A---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116585 : AT-C--CA-T-A-TTT-A--CACC-CTT-T---C-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T---A-C-T-------C---A-TC--G-T--G---AT---T---T----------T--T-TCTTT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------CC----A--C--------A-ACCCCCA--T-GTAT-----C-C----------------TACG--CTTG--C-GTG----A-CG-------AAC--------------A------------------------TAGG--------------C--T--------------GG---A-----C------------AT-C-G---G---ACCATAT--CCA--C-ACACACTTCC-A--T-C-G-A-------------T-G-------TT-A--T-AAG--------T--TATTGA-TGGA--AA-TG-GC---A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--CAT-A-----AT---TT-TTTCC---CCAAA---------TTTG---A-CAA-CA----------------------ATA---AA-T-T---ATG--G-A--TTG-T-CAA-----AACT-TGGTCC------AA-GACT----ACACA--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATCT
gi|116586 : T-CA-CAAT-ACTTT-A--C-CC-TCT-TACTC-CTA-G------------T--------G--A-TCA--T-CCA-C-T-------T---GCT---GCT--G---AT---A---CCTTTC-----T--T-T--TC--C-------A-----T-A-------T-T-A-------C-----A--TTAT-----G-TT----A--T-GTAT-T---C-C----------------TACGGCCC-G--C-ATG----A-CG-------A-----------------------------------------T-----------------CGAA--------------GA---A-----C------------GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-AATT-C-----------------T-G-------TT-A--T-ATATTGACACCA-ATAT-GACTGGA--AG-TG-A----A-AAC-T--G-A-TC---G-TT--G-A--TG--A-----TT---TCCTT------CAACG---------TTTG---A-AAAACA----------------------ATCCCAAACT-TT--ATAT-G-GACTTG-T-TACTTG--ACAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T---T-CATTT
gi|116587 : T-CA-CA-T-A-TTT-A--C-C----T-TA-TCTC-ATG------------TT-------G--AAT-A--T-C-----T-------T---A-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------AA----T-A-------T-C---------C-----A--C--------ATAT----A--TTGTAT-T---C-C----------------TACG--TC-G--C-TTG----A-CA-------AA---------------A------------------------T-----------------C-----------------------------------------------------------------C--C-A---A--T-A-A--T-C-G-A-------------T----------T-AGCT-AAGTCTAT---A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-G----C-A-CAT--A-A-T----G-TC--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------TAAAA---------TATG---A-AAA-CA----------------------CTA---AGTT-TT--ATAT-G-AT-TTA-T-CAA--G--AAAT-TCCT---------A-GAAT----G---A--AAAGG--C--CG------TGG-T-CATTT
gi|116588 : T-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-C-G------------TT-------GATA-T-A--T-C-A-C-T-------A---A-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--T-------A-----T-A-------
gi|116589 : A-T-A-TT--A--C-CTTCTT-TA-TCGC-A-GC-----------TT-------GTAA-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---GGT--G----T---A---T----------T--T-T--TT--C-------AG----T-AT------T-C-A-------C--------T--------A-GT----A----GTAT-T--TC-C----------------TA-G---C-G--CAATG----A-CG--------A---------------A------------------------T-----------------C--A---------------G---A-----C------------AA---A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-CGG-A-------------T-A-------TT-A----AAA--------A-A-GTT---TGGA--AGCTG-A----A-A-C-T--GTACT----G-TT--G-A--TA--AT----CT---TC-TT------C-ACA---------TTTG-----AAA-C-----------------------ATC---AA-T-TT--ATAT-G-A---TG-T---A--T--GAAT-TAGTT-------AA-GATC----C---G--ACAGGCCC--C-------T-GTT-CATTT
gi|116590 : TT-A--C-CC-CTTGTA-TC-A-AAG------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-CGT-------T---G-TT--G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-AC------C-----A--CA-------A-GT----A--T-G-AA-T--TC-C----------------TGCG--T-----C-GTG----A-CGA------AA---------------A------------------------T-----------------T--G--------------GA---A-----CTGATGAAGGGAGAA-C-A---G---A----A---TCC--C-A---A--TAA-A--T-C-G-A-------------TCA-------TT-A--T--AA--------C-ATA---------------G-C----A-C-T-T--G-A-T----GTTT--G-A--TA--A-----AT---TG-TT------CAAA-----------TTGAAAA-AAA-CA----------------------ATA---AA-T-TT--A-ATAA-A--TTG-T-TAA--G--AAAT-GGGTT-------AA-GATC----G---A--CAAAG--C--T-----------T-CATTT
gi|116591 : TT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---A-T---T-C--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--
gi|116592 : ---T----------T--G-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GT----A--T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CC-G--CCATG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GA---AA----C------------GA-C-A---G---A----AT--CTC--C-C---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATT-A-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-T---G-A--TG--A------T---TC-TT------CAACA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATC---AA-T-GT--ATAT-G-A--TTG-T-TAT--G--AAAT-TAGTT-------AA-GATC----GA--A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTTtca
gi|116593 : --TT--C-------A-----T-A-------T-C-AC------C-----A--C--------A-AT----A--T-GTG--T--TC-C----------------TACA--CT-G--C-GTG----A-AG-------TA---------------A------------------------T-----------------C--ATAAATGTGTATATTGG---AACTGGT------------GG-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TAA---------------------------------------------------------ATTGA-TGGA--AG-TC-A----A-A-C-G--G-G-C----A-TT-------T---A-----GT---TC-------------------------TA---A-AAA-CA----------------------ATG---AA-T-TC--ATAC-G-----TG----AA--G--TACT-CAGTTG------AA-GATT----G---A--GAGAA--CCAC-------T-G-T-
gi|116594 : -A--T-AAA--------A-CTATTGA-TGGA--AG-TG-G----C-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA--A-----AT---TT-TT------CAAAA---------TTTG---A-AAA-CAATATGTTGTTTTTGTGAAAACAATA---AA-T-TT--ATAT-G-A--TGG-T-CAA--G--AAAT-TGGTT-------AA-GATC----A---A--AAACG--C--
gi|116595 : caataga-TT--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------CAAAA---------TTTG---A-AAA-------------------------------------------T-G-A--TTG-T-TAA--A--AAAT-TAGTT-------AA-AATC----GA--A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116596 : AACA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATC---AA-T-TT--ATAT-G-A--TTG-T-TAT--G--AAAT-TAGTTAAAATCGAA-GATC----G---A--AAATG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116597 : -T-TT--ATAT-G-C--TTG-T-TAA--G--AAAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-A-T-CATTT
gi|116598 : -T-TT--ATAT-G-C--TTG-T-TAA--G--AAAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-A-T-CATTT
blockSeqs : A A T TA A T C TTCCCATATCCA TCCAGTT TT A AT A A AAAACCTC T AAC G TA AGT TTA TNNNNNNNNNNN G CT TT CTATCAA ATAAT GATTGAT CCCACTGTGAATGA CCCC AT G ATA ATT ACAAGCAGACCCCCCA GC AC A GATT TAATGTT ATGTGCATTGGAGCTTGAAACTGGATCAGGGT C T GACCAT GA TA A CAC CT C T AT G G A GGTGACAAAATTC C ACGGATA C GC A TTGACACC T C TT T A TAATA A C CC T C AAGA T TC C GT AT CATGTA GTA A TGTCAC AACCGACAT AAA T A ATATGTTGTTTTTGTGAAAACA CCCA T G AA A A AC T G TT TT A AAAATCG G AAGG CAC CC CC CA GCGCTGG G T C
blockSeqs : A C C . C T T GT T AT C . G G CATA C C C . AT A CCTTTCT C T T . AT AAA CCCACTGTGAATGA C A T AT T . . AT C A A ATCATAAATGTGTATATTGGAACTGGT . A GCTGA . . . . . C . . . . . C . GACTAG . T . TCTAT . . . C . AC . A . . . G . . . . T CA . C TCC TC A . . . C C G . . . T . G . . . C G T A . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . G A G . TA . . . . T . T T . . C AAATT G . T . T G CATAGCTCATA . G . AT T . . AT . . . ATGTGTATTGAAGCTTGATCAGGGT . . GCTGA . . . . . C . . . . . . . . . . . G . . . . . GC . . . . . C . . . . T TC . . . T . . . . C T . . . . T . . . . . G G . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . C . C . . . . T . . C . . T TTAA C . C . T T CCCTACGCA . G . AC T . . AT . . . ATGTGTATTGAAGCTTGATCAGGGT . . TGTGC . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . C . . . . T T . . . A . . . . C . . . . . G . . . . . . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . C . . . TTT . . . . T . CTCCACA . . . AT C . . AT . . . ATGTGTATTGAAAATGGTTAGTCT . . TATT . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . C . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . G . . . AAA . . . . T . CCCACAC . . . AT T . . AT . . . ATGTGTTGAAGCTGGATCAAGGT . . GAA . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . TGT . . . . T . CATTATG . . . AT T . . . . . . ATTGGAACTGATGAAGGGAG . . GGT . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . TCA . . . . T . CCTGGA . . . AT T . . . . . . ATGTTGGAACTGAATCAAG . . GA . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . GTT . . . . T . CCTACA . . . AT T . . . . . . ATGTGGAACTGAATCAAG . . GA . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . TTG . . . . A . CCTACA . . . AT T . . . . . . CATAGGCTGGAC . . AA . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . TTG . . . . G . CCCACA . . . AT T . . . . . . ATCAAGGAAAT . . AA . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . TT . . . . . . CCCACA . . . AT T . . . . . . TATCAGGAC . . TA . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . TT . . . . . . CGAACA . . . AT T . . . . . . TCGAAGAAC . . GA . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . TT . . . . . . CCAACA . . . TT T . . . . . . ATCAGAAAC . . CA . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . TT . . . . . . CAAGCA . . . AT T . . . . . . ATCAGAAC . . GA . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . TT . . . . . . CCCACA . . . NN C . . . . . . ATCAGGAT . . GA . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . TT . . . . . . CCACAA . . . AT N . . . . . . ATCAGGAC . . GA . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . TT . . . . . . TATAA . . . AT T . . . . . . ATCAGGAC . . GA . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . TT . . . . . . ACATA . . . TT T . . . . . . ATCAGGAT . . GA . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . TT . . . . . . CACAC . . . AT T . . . . . . ATCAGGAC . . AA . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . TT . . . . . . CCACA . . . AT T . . . . . . ATCAGGAT . . NN . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . AT . . . . . . CACAG . . . AT T . . . . . . ATCAGGAT . . GA . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . TT . . . . . . CCACA . . . AT A . . . . . . TTCAAAAT . . GA . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . TC . . . . . . CACAT . . . AT T . . . . . . ATCAAGAT . . GA . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . TT . . . . . . CCACA . . . AT T . . . . . . NNNNNNNN . . GA . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . TT . . . . . . CATA . . . AA T . . . . . . ATCAGAC . . GA . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . TT . . . . . . CATA . . . AT T . . . . . . ATC . . GA . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . AG . . . . . . CATA . . . A T . . . . . . TAT . . GA . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . TT . . . . . . CATA . . . A T . . . . . . ATC . . A . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . TT . . . . . . CTGA . . . A T . . . . . . AT . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . TT . . . . . . CATA . . . A T . . . . . . AT . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . TT . . . . . . CATA . . . A T . . . . . . G . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . AA . . . . . . CATA . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . TT . . . . . . NNNN . . . A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . AA . . . . . . TACA . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . AA . . . . . . CATA . . . A . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . AA . . . . . . ACA . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . AA . . . . . . TAT . . . T . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . AA . . . . . . CAC . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . CT . . . . . . CAC . . . T . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . TT . . . . . . CAC . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . TT . . . . . . CAC . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . TT . . . . . . CAC . . . T . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . A . . . . . . TT . . . . . . CAC . . . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . TT . . . . . . CAC . . . G .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . TT . . . . . . CTA . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . T . . . . . . TT . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . .
blockSeqs : T . . . . . .
blockSeqs : . .
blockSeqCons :
originalCons : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------C---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--C--------A-GT----A--T-GTAT-T--TC-C----------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----C------------GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TNA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------CAAAA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATN---AA-T-TT--ATAT-G-A--TTG-T-TAA--G--AAAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
finalCons : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------C---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--C--------A-GT----A--T-GTAT-T--TC-C----------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----C------------GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TNA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------CAAAA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATN---AA-T-TT--ATAT-G-A--TTG-T-TAA--G--AAAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
Alignments
lowQualScore : 11111 111111111111111111111111111 6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1111111111111111111111
lowQualScore : 1 0 0 0 1 1 11 0 0 0 1 2 0 2 666666666666 3333333 44 0 1 11 0 0 1 1 66666666666 1 333 4 11 222 333 66666666666666666 3 11 33 2222222 00000 0 5555555 0 0 999999999999999999999999999 2222 33 1 444 666 0 5555555555555555 11 0 77 2 3333 1 4444444 0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 1 2 666666666666 11 11 1 222 11 2 1 11 1 1 1 7777777777777 1 7777777 1 22 1 88888888 1 1 11 2 1 444444 1 2 11 1 1 6666 1 11 1 11 55 777777 222 2 555555 888888888 333 1 1 1111111111111111111111 4444 3 2 11 1 1 66 1 2 11 11 1 6666666 3 3333 666 11 11 11 6666666 1 1 1
lowQualScore : . . . . . . .. . . . . . . . ............ ....... .. . . .. . . . . ........... . ... . .. ... ... ................. . .. .. ....... ..... . ....... . . ........................... .... .. . ... ... . ................ .. . .. . .... . ....... .................................................................................................... . . ............ .. .. . ... .. . . .. . . . ............. . ....... . .. . ........ . . .. . . ...... . . .. . . .... . .. . .. .. ...... ... . ...... ......... ... . . ...................... .... . . .. . . .. . . .. .. . ....... . .... ... .. .. .. ....... . . .
lowQualScore : 7 9 9 9 7 6 11 8 8 8 6 4 8 4 999999999999 5555555 22 8 6 11 8 8 6 6 33333333333 6 111 9 11 666 999 88888888888888888 2 99 44 6666666 33333 8 6666666 8 8 666666666666666666666666666 7777 77 7 888 999 9 9999999999999999 22 9 55 0 0000 0 4444444 8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 1 3 999999999999 66 66 2 111 66 1 2 66 2 2 2 6666666666666 2 2222222 1 77 1 44444444 2 2 77 4 2 777777 2 5 77 2 2 4444 2 77 2 77 55 000000 222 5 888888 999999999 333 2 2 1111111111111111111111 8888 5 4 66 2 2 33 2 4 66 66 2 4444444 6 8888 111 88 88 88 3333333 5 5 5
consensus : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------C---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--C--------A-GT----A--T-GTAT-T--TC-C----------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----C------------GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TNA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------CAAAA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATN---AA-T-TT--ATAT-G-A--TTG-T-TAA--G--AAAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
Reference ( family-393 ) : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------C---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--C--------A-GT----A--T-GTAT-T--TC-C----------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----C------------GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TNA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------CAAAA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATN---AA-T-TT--ATAT-G-A--TTG-T-TAA--G--AAAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116543 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GT----A--T-GTAT-T--TC-C----------------TACG--CC-G--C-ATG----A-CA-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GA---A-----C------------GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TC-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TG--A-----TT---TC-TT------CAACA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATC---AC-T-TT--ATAT-G-A--TTG-G-TAT--G--AAAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116544 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TTT-C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GT----AA-T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CC-G--C-ATG------CA-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GA---A-----C------------GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TC-A--T-AAA--------A--TATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-T---G-A--TG--A-----TT---TC-TT------CAACA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATC---AC-T-TT--ATAT-G-A--TTG-G-TAT--G--AAAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116545 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---AT--T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GT----A--T-GTA--T--TC-T----------------TACG--CC-G--C-ATG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----T------------GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TG--A-----TT---TC-TT------CAACA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATC---AA-T-TT--ATAT-G-A--TTG-C-TAT--A--AAAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--
gi|116546 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-G-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---ATA--A---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GT----A--T-GTA--T--TC-C----------------TACG--CC-G--C-ATGA---A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----C------------GA-CTA---A---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T---------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TGAA----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--GCG--TA--A-----TT---TC-TG------CAACA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATC---AA-T-TT--ATAT-G-A--TTGTT-TAT--G--AAAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116547 : TAT-CA-CT-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-A-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------T-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GG----A--T-ATAT-T---C-C----------------TACG--CC-G--C-ATG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----C------------GA-C-A---A---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T-AACGGATATC-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TG--A-----TT---TC-TT------CAACA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATC---AA-T-TT--ATAT-G-A--TAA-T-TAT--G--AAAT-TAGTC-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116548 : TAT-CA-CA-T---TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-C------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---A-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--AT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C--------CTGG-----A-GT----A--T-GTAC-T---C-C----------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----T------------GA-C-A---T---A----AT--TTC--C-A---A--TAA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATAACGA-TAGA--AG-TG-A----A-A-T-T--G-A-T----G-TT--C-A--TA--A-----AT---TC-TT------TAAAA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ACA---AA-T-TT--ATAT-G-A--TTG-T-TAA--G--AAAT-AAGTT-------AA-GATT----G---A--AATAA--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116549 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CAT-TA-TC-C-A-GTTCCCATATCCATT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T------AT---A---T----------T--T-T--T-----------A-----G-G-------T-C-A-------C-----T--G--------A-GT----A--
gi|116550 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--TGT--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GT----A--T-GTA--T--TC-C----------------TACG--CC-G--C-ATG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----C------------GA-C-A---T---ATT--AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TC-A--T-AAA--------C-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-
gi|116551 : TAT-TA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TTTCCAGTTG--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---T---T----------T--T-T--TTT-C-------A-----T-AG------T-C-A-------CTCC--A--C--------A-GT-------T-GTAT-T--CC-T----------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----T------------GA-C-A---G---A----AG--TCC--CAA---A--TAA-A--T-C-G-A-------------T-G-------TTCG--TAAAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG--G-A----A-A-C----G-A-TG---G-TT--G-A--TA--A-----AT---TCATT------CAAAAT--------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATA---AA-TGTT--ATAT-G-A--TTG-TGTAA--G--AAAT-T-GTT-------AA-GATC----T---T--AGAGG--C--C---------G-T-CATT
gi|116552 : TAT-CA-CA-T-A-T------C-CC-CTT-TAATC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---GGT--G---AT---A---T----------T--T-TT-TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GT----A--T-GTAT-G--TC-C----------------TACG----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------AA-C-A---GA--A----AT--TCC--C-A---A---CA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-----------------------------------------------------ACAA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATC---AA-T-TT--ATAT-GAA--TTG-T-TAA--G--AAAT-TAGCT-------AAGGATC----GA--A--AAAGG--C--C-------T-G-TCCATTT
gi|116553 : TAT-CA-CA-T-AATCT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--GAT-AT---A---T----------T--C-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-ACATAGCTC-----A--T--------A-GT----A--T-GTA--T--TC-C----------------TACG--C--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------A-C-A-------A----AT--T-C--C-A---A--TCA-A----C-G-A-------------T-A-------TT-AT-T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----A-A-C------A-T----T-AT--G-A---A--A-----A-----C-CA------CATAA---------TTT-----------A----------------------ATT----A-T-TT---TAT-G-A--T--------------AAT-TAGCT-------AAGGATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T--ATTT
gi|116554 : TAT-CAACA-T-A-TTA-A--C-CC-CTT--A-TC-C-A-G------------TTT------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TTTTC-------A-----T-A-------T-C-A-------CCCTACG--C--------A-GT----A--T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CC-GACC-GTAGATTA-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----T------------GA---A---C---A----ATGATGCTAC-A---A--TAA-A--T---G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAAG-------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----ACA-C-TCCG-A-T----G-TT--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------GAAAAA--------TTTGA--A-AAA-CA----------------------AT-----A-TGTT--AGAT-G-A--TTG-T-TAA--G--AAAT-TTGTA-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116555 : TAT-CT-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TA-------G--A-T-A--A-C-A-C-T-------C---G-T---T-T--G---AT---A---A----------AA-T-T--GT--C-------A-----T-A-------T-C-G-------CCT---A--C--------A-GT----A--T-GTAT-T--TC------------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------TGTGTATTGAAGCTTGATC--A--------------GG---G-----T------------GA-C-A---GCTGA----AT--TCC--A-A---A--TAA-A--T-T-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----C-A-G-T--G-A-T----G-TT--G-A--TAT-ACATGTAT---TC-TT------TAAAA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATA---AA-T-TC--GTAT-G-AT-TTG-T-CAA--G--AAGT-TGGTT-------AA-GATC----
gi|116556 : TAT-CT-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC---A-G------------TA-------G--A-A-A------A-C-T-------C---G-T---T-T--G---AT---AAAAT----------T-----------C-------A-----T-A-------T-C-G-------CCT---A--C--------A-GT----A--T-GTAT-T--TC-T----------------T-CG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------TGTGTATTGAAGCTTGATC--A--------------GG---G-----T------------GA-C-A---GCTGA----AT--TCC--A-A---A--TAA-A--T-T-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----C-A-G-T--G-A-T----G-TT--G-A--TAT-AC----ATGTATT-TT------TAAAA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATA---AA-T-TC--GTAT-G-AT-TTG-T-CAA--G--AAGT-TGGTT-------AA-GATC----
gi|116557 : TAT-CA-CA-T-A-TTC-A--C-CT-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--A-C-A-C-T-------C---A-T---A-T--G---ATC--A---A----------T--T-T--TT--C-------A-----C-----------C-A-------------A--C--------A-GT----A--T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CT-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------------------------------------------------GA-C-A---G---A----AT--TCT--C-T---A--TAA-A--T-C-G-A-------------T-A-------CC-A--T-AAC--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-A----T-A-T-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA--A-----AT---TC----------------------------------A-CG----------------------ATA---AA-T-TT--ATAT-G-A--TTA-T-CAA--G--AAAT-TTGTT-------AA-GATT----G---A--AAAGG--T--C-------C-G-T-CATTT
gi|116558 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-T-A-G------------TT-------G--A-T-T--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---TG---------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------CCC---A--C--------A-GT----A--T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------T---------------------------------------------------------------------------------TCC--C-A---A--TAA-A--T-C-G-A-------------T-A-------GT-C--T-AAA--------A-AATTTGA-TTGA--AG-TG-A----G-A-C-T--A-A-T----G-TC--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------TAAAA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATC---AA-T-TT--ATAT-G-A--TTA-T-CAA--G--AATT-T
gi|116559 : TATACA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------GC-A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--CCTATCAAA-----T-A-------T-C-A-------T-----A--TA-------A-GTC---A--T-GTA-----TC-C----------------TACG--CC-G--C-ATG----ACCA-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------AGGAAA-----T------------GACC-A---G---A----AT--TCC--C-A---C--TCATA--T-C-G-A-------------T-A-------TC-A--T---A--------A-ATATTGA-TGGA--AT-T-------A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TGATA-----AT---TC-TT------CAACATC-------TTTG---A-AAA--A----------------------ATC---AT-G-TTAAATAT-G-AG-TTG-T-TAT--G--AAACATAGTT--------A-GATCT---G---ACCAAA---------------C-G-T-CATTT
gi|116560 : TATACA-CA-TTA-TTTTA--C-CC-CTC-TA-AC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-----------A-T---GCT--G---AT---A---T----------C--T-T--TT--C-------A-----T-AAAA----T-C-AA------C-----A--T--------A-GT----AG-T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CC-G--C--TG----A-CG-------AA---------------G------------------------------------------------------------------------------------------------------AT--TCC--C-A---A--TAA-A--T-C-G-A-------------T-AGACTAG-TT-A--T-AAA--------TTATCTTGA-TGGA--AG-TG-G----C-A-CCT--A-A-TC---G-TG--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------TAAAA----------TTG---A-AAA-CA----------------------ATA---AATT-TT--ATAT-G-A--TTA-T-CAA--A--AAAT-TGCTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--CGCGCTGGC-G-T-CATTT
gi|116561 : TAT-TA-CA-T-A-TTT-A--C-AC-CCT-TA-TC-C-A-G------------TG-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------C---A-T---G-C--A---AT---A---T----------CA-T-G--TT--C-------A-----T-A-------T-C---------C-----A--C--------ACTT----A--T-GTA--T--TC-C----------------TACG--CC-A--G-GTG----A-CGTAATGTTAA---------------T------------------------T-----------------C--A--------------AA---A-----T-------------A-C-ATGTG---C----AT--TGG--A-A---A--TGA-A--T-T-A-AGGTGACAAAATTCC-A-------TT-G--T-AAA--------A-A-ATT-A-TGAT--AG-TG-G----C-G-C-A--G-G-T----G-TT--G----TA--A-----GA---TC-TT------CAAAA---------TTAG---A-GAA-GG----------------------GAG---AA----T--ATAT-G-A--ATG----A------------AGTT-------AA-GATCAAGGG---A--ACAGG--A--C-------T-G-T-CA
gi|116562 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---T----------T--TCT--TT--C-------A-----T-A-------T-T-ACC-----C-----A--C--------A-GT----A--T-GTA--T--TC-C----------------TACG--CT-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------AG---A-----T------------GA-C-A---G---A----
gi|116563 : TAT-CA-CA-T-A-TTTCA--C-CC-CTT-TA-TC-T-A-G------------TT-------G--A-TAA--T-C-A-C-T-------T---G-T---GTT--G---AT---A---T----------T--T-T--TTC-C-------A-----T-A-------TCC-A-------C-----A--T--------A-GT----AATT-GTA--T--TC-C----------------TATG--CC-A--C-ATG----A-CA-------AAT--------------A------------------------T-----------------C--A--------------GG---A-----C------------GA-CAA---G---A----AT----C--C-A---A--TCA-A--T-C-GAA-------------T-A-------TT-A--T-AGA--------
gi|116564 : TAT-TA-CA-T-G-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-A------------TT-------G--A-T-A--A-C-A-C-T-------G---A-T---G-C--A---AT---GG--T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------CGA---A--C--------A-GT----A--T-GCAT-T--TC-A-----------------ATG--TC-T--T-GTG----A-CG-------AA---------------ATGTGCATTGGAGCTTGAAACTGGAT-----------------C--A--------------GG---G-----T------------GG-C-A---G---GT---AT--CCC--A-A---A--TAA-A--T-C-A-A-------------T-G-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG--G-A----GCA-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------CAAAG---------TTCC---A-AAA-
gi|116565 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-GTT-TA-T----A-A------------TT-------TTTA-T-A--T-C-A-C-TAAAACCTC---G-T---------------------T----------T--T-T--TT--T-------A-----T-A-------T-C-A-------CC----A--C--------A-GT----A--T-ATTT-TATTC-T----------------TACG--GC-G--A-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------TGTGTATTGAAAATGGT-T--A--------------GT---C-----T------------GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TAA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TC-A--T-AAT--------A-ATATTGT-TAGA--AG-TG-G----C-A-C-T---------------------------------T---TC-TT------C-AAA---------TATG---A-AAA-CA----------------------ATA---AA-C-TT--AAAT------CTG----AA--G--AAAT-TGGAT-------AA-AATT----G---A--
gi|116566 : TAT-CA-CA-T-A-TAT-G--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--A-C-A-C-T-------A---A-T---G-TTAA---AA---A---A----------G--T-T--TT--C-------A-----T-G-------T-C-A-------CCA---A--C--------A-GT----A--T-GTA--T--TC-C----------------TATA--CC-A--C-GTG----A-CA-------AAATGTGTTGAAGCTGGA------------------------T-----------------C--A--------------AG---G-----T------------GA-C-A---A---A----AT--TCC--C-A---A--TAA-G--T-C-G-A-------------T-A-------TT-G--T-AA
gi|116567 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC--TT-TA-TCTC-A-GG-----------TT-------G--A-T-AATT-C-AAC-G-------A---G-T---GCT--G---ATT--A---T----------T--GGT--TT--G-------A-----C-AGATTGATT-C-A-------C-----AAGC--------A-GT----AG-T-GTAT-T--CC-CACAAGCAGACCCCCCATACG--CC-G--C-ATG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C----------------------------------------------------------------CC--C-A---A--TCA-A--TGC-G-AC------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-A-ATTGA-TG-ATTAT-TG-ATAATA-A-C-T--G-A-TAAGAG-TTTCG-AGTTG--A-----CT---TC-TCTGTCACCAAAAAACCGACATTTTG---ATAAA-CT----------------------GTC---AA-T-TT--ATAT-G-A--TTG-TGTGA--GTTGAAT-TAGCT-------AAGGATC----G---A--ACAGG--C--
gi|116568 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CA-CTT-TA-TC-C-A-T------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---G-T--G---AT---A---TNNNNNNNNNNN--N-N--NN--N-------N-----N-N-------N-N-N-------N-----N--N--------N-NN----N--N-NNNN-N--NN-N----------------NNNN--NN-N--N-NNN----N-NN-------NN---------------N------------------------N-----------------N--N--------------NN---N-----N------------NN-N-N---N---N----NN--NNN--N-N---N--NCA-A--T-C-G-A-------------T-T-------TC-A--T-AGA--------A-ATATTGG-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--T
gi|116569 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A------A-C-T-------C---A-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-T-A-------
gi|116570 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC--TT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A------A-C-T-------C---A-T---T-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-T-A-------
gi|116571 : TAT-CA-CA-T-T-ATT-A--C-CA-TTT-TA-TC-C-A-GGT----------TC-------G--A-T-A--TCC-A-CAT-------T---GTT---G-T--G---A----A--------------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-ACC-----C-----A--C--------ACGT----A--T-G-ATAT--TC-C----------------TACG--CC-G--C--TG----A-CG-------AAT--------------A------------------------T-----------------------------------------------------------------------------AC--TC------------TAA-A----------------------------------------AAA--------A-A-AT--A-TGGA--AGTTG-G----C-A-A-T--A-A-T----G-TG--G-A--TT--A-----AT---TC-TT------TAAA------------------------A----------------------ATC-------------CAT-G-A--TTA-T-CAA--A--AAAC-TTGTC-------AA-GATC----C---G--AAAGC--C--C-----------T-CATTT
gi|116572 : TAT-CA-CA-T-A-TTT-C--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-AGG-T-------C---A-T---G-T--GAGTAT---A---T----------T--TCT--TT--C-------AATAATT-A-------T-CTC-------C-----A--C--------AGGT----A--TGGTAT-T--TC-C-----------------AGG--TG-G--C-GTG----A-
gi|116573 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--C-TC-CTT-TA-TC-C-C-G------------TG-------G--A-T-A--T-T-A-C-T-------C---A-T---A-A--C---AT---A---A----------A--T-T--CT--A-------AT----T-A-------T-T-A-------T-----A--T-----------T----A--T-GT-T-T--TC-C----------------TACG--CC-GATT-GTG----A-C-------------------------A------------------------T-----------------C--A--------------
gi|116574 : TAT-TA-CA-A-A-TTT-A--C-TC-ATT-TA-TC-C-A-C------------TT-------G--A-C-A--A-C-A-C-T-------A---A-T---G-C--G---AA---T---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-ACC-----C-----A--C--------A-GT----A--G-GTAT-T--TC-caaacgtacgtaaaatt
gi|116575 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--C-TC-CTT-TA-TC-C-GCG------------TG-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------C---A-T---A-A--C---AT---A---A----------A--T-T--CT--G-------AT----T-A-------T-T-A-------C-----A--C-----------T----G--T-GT-T-T--TC-C----------------TACG--CC-G--
gi|116576 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--C-TC-CTT-TA-TC-C-C-G------------TG-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------C---A-T---A-A--C---AT---A---A----------A--T-T--CT--A-------AT----T-A-------T-T-A-------C-----A--C-----------T----A--T-GTTT-T--ACTC----------------TACG--CC-GATT-GTG----A-
gi|116577 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--T-TC-CTT-TA-TC-C-C-G------------TG-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------C---A-T---A-A--C---AT---A---A----------A--T-T--CT--A-------AT----T-A-------T-T-A-------C-----A--C-----------T----G--T-GT-T-T--TC-C----------------TACG--CC-G--acgtcaaacg
gi|116578 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--C-TC-CTT-TA-TC-C-C-G------------TG-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------C---A-T---A-A--C---AT---A---A----------A--T-T--CT--A-------AT----T-A-------T-T-A-------C-----A--C-----------T----G--T-GT-T-T--TC-C----------------TACG--CC-
gi|116579 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--C-TC-CTC-TA-TC-C-C-G------------TG-------G--A-T-A--C-C-A-C-T-------C---A-T---A-A--C---AT---A---A----------A--T-T--CT--A-------AT----T-A-------T-T-A-------C-----A--C-----------T----A--T-CT-T-T--TC-C----------------TACA--CC-GATT-GCG----A-CG-------
gi|116580 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-ATAC-TC-CTT-TA-TC-C-T-G------------TG-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------A---A-T---A-A--C---AT---A---C----------T--T-T--CT--A-------A-----TTA-------C-C-G-------T-----A--C--------A-CT----G--T-GT-T-T--TC-C----------------TACG--CC-AATT-GTG----A-C-------------------------A------------------------T-----------------C--A--------------tcacaaacgtacgtaaaatt
gi|116581 : TAT-CA-CA-T-G-ATT-A--C-TC-CTT-TA-TC-C-C-G------------TG-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------CATAG-C---A-T--G---A----A---T----------T--C-T--------------AAT---T-A-------T-T-A-------C-----A--C-----------T----G--T-GT-T-T--TC-C----------------TACG--CC-G--caa
gi|116582 : TAT-CA-CA-T-G-TTT-A--C-TC-CTC-TA-TC-C-C-A------------TG-------G--A-C-A--T-C-A-C-T-------C---A-TAACA-T--A---ATTTAA---T----------TAAT-T--CT--A-------AT----T-A-------T-T-A-------C-----A--C-----------T----G--T-GT-T-T--TC-C----------------TACA--CT-GATT-GTG----A-C-------------------------A------------------------T-----------------C--A--------------
gi|116583 : AT-CA-CC-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---A-T---G-T--G---AT---A---T----------TG-T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------CCC---A--CTGTGAATGA-GT----A--T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------AA---------------A------------------------TG----------------T--G--------------GA---A-----CTGAATCAAG---GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TAA-A--T-G-A-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-C----A---C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA--A-----AT---TG-TT------CAAAA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATA---AA-T-TT--AAAT-G-A--TTG-T-TAA--G--AAAT-TGGTT-------AA-GATC----A---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTTcaaacgtacgtaaaatt
gi|116584 : AT-CA-CC-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------T--------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---A-----G-T--G---AT---A---T----------TG-T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------CCC---A--CTGTGAATGA-GT----A--T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CC-G--C-GTG----A-CG-------GA---------------A------------------------TGT---------------T--G--------------GA---A-----CTGAATCAAG---GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TAA-A--T-G-A-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-C----A---C-T--G-A-T------TT--G-A--TA--A-----AT---TG-TT------CAAAA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATA---AT-T-TT--AAAT-G-A--TTG-T-TAA--G--AAAT-TGGTT-------AA-GATC----A---A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116585 : AT-C--CA-T-A-TTT-A--CACC-CTT-T---C-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T---A-C-T-------C---A-TC--G-T--G---AT---T---T----------T--T-TCTTT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------CC----A--C--------A-ACCCCCA--T-GTAT-----C-C----------------TACG--CTTG--C-GTG----A-CG-------AAC--------------A------------------------TAGG--------------C--T--------------GG---A-----C------------AT-C-G---G---ACCATAT--CCA--C-ACACACTTCC-A--T-C-G-A-------------T-G-------TT-A--T-AAG--------T--TATTGA-TGGA--AA-TG-GC---A-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--CAT-A-----AT---TT-TTTCC---CCAAA---------TTTG---A-CAA-CA----------------------ATA---AA-T-T---ATG--G-A--TTG-T-CAA-----AACT-TGGTCC------AA-GACT----ACACA--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATCT
gi|116586 : T-CA-CAAT-ACTTT-A--C-CC-TCT-TACTC-CTA-G------------T--------G--A-TCA--T-CCA-C-T-------T---GCT---GCT--G---AT---A---CCTTTC-----T--T-T--TC--C-------A-----T-A-------T-T-A-------C-----A--TTAT-----G-TT----A--T-GTAT-T---C-C----------------TACGGCCC-G--C-ATG----A-CG-------A-----------------------------------------T-----------------CGAA--------------GA---A-----C------------GA-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-AATT-C-----------------T-G-------TT-A--T-ATATTGACACCA-ATAT-GACTGGA--AG-TG-A----A-AAC-T--G-A-TC---G-TT--G-A--TG--A-----TT---TCCTT------CAACG---------TTTG---A-AAAACA----------------------ATCCCAAACT-TT--ATAT-G-GACTTG-T-TACTTG--ACAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T---T-CATTT
gi|116587 : T-CA-CA-T-A-TTT-A--C-C----T-TA-TCTC-ATG------------TT-------G--AAT-A--T-C-----T-------T---A-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------AA----T-A-------T-C---------C-----A--C--------ATAT----A--TTGTAT-T---C-C----------------TACG--TC-G--C-TTG----A-CA-------AA---------------A------------------------T-----------------C-----------------------------------------------------------------C--C-A---A--T-A-A--T-C-G-A-------------T----------T-AGCT-AAGTCTAT---A-ATATTGA-TGGA--AG-TG-G----C-A-CAT--A-A-T----G-TC--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------TAAAA---------TATG---A-AAA-CA----------------------CTA---AGTT-TT--ATAT-G-AT-TTA-T-CAA--G--AAAT-TCCT---------A-GAAT----G---A--AAAGG--C--CG------TGG-T-CATTT
gi|116588 : T-CA-CA-T-A-TTT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-C-G------------TT-------GATA-T-A--T-C-A-C-T-------A---A-T---G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--T-------A-----T-A-------
gi|116589 : A-T-A-TT--A--C-CTTCTT-TA-TCGC-A-GC-----------TT-------GTAA-T-A--T-C-A-C-T-------T---G-T---GGT--G----T---A---T----------T--T-T--TT--C-------AG----T-AT------T-C-A-------C--------T--------A-GT----A----GTAT-T--TC-C----------------TA-G---C-G--CAATG----A-CG--------A---------------A------------------------T-----------------C--A---------------G---A-----C------------AA---A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TCA-A--T-CGG-A-------------T-A-------TT-A----AAA--------A-A-GTT---TGGA--AGCTG-A----A-A-C-T--GTACT----G-TT--G-A--TA--AT----CT---TC-TT------C-ACA---------TTTG-----AAA-C-----------------------ATC---AA-T-TT--ATAT-G-A---TG-T---A--T--GAAT-TAGTT-------AA-GATC----C---G--ACAGGCCC--C-------T-GTT-CATTT
gi|116590 : TT-A--C-CC-CTTGTA-TC-A-AAG------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-CGT-------T---G-TT--G-T--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-AC------C-----A--CA-------A-GT----A--T-G-AA-T--TC-C----------------TGCG--T-----C-GTG----A-CGA------AA---------------A------------------------T-----------------T--G--------------GA---A-----CTGATGAAGGGAGAA-C-A---G---A----A---TCC--C-A---A--TAA-A--T-C-G-A-------------TCA-------TT-A--T--AA--------C-ATA---------------G-C----A-C-T-T--G-A-T----GTTT--G-A--TA--A-----AT---TG-TT------CAAA-----------TTGAAAA-AAA-CA----------------------ATA---AA-T-TT--A-ATAA-A--TTG-T-TAA--G--AAAT-GGGTT-------AA-GATC----G---A--CAAAG--C--T-----------T-CATTT
gi|116591 : TT-A--C-CC-CTT-TA-TC-C-A-G------------TT-------G--A-T-A--T-C-A-C-T-------T---A-T---T-C--G---AT---A---T----------T--T-T--TT--
gi|116592 : ---T----------T--G-T--TT--C-------A-----T-A-------T-C-A-------C-----A--T--------A-GT----A--T-GTAT-T---C-C----------------TACG--CC-G--CCATG----A-CG-------AA---------------A------------------------T-----------------C--A--------------GA---AA----C------------GA-C-A---G---A----AT--CTC--C-C---A--TCA-A--T-C-G-A-------------T-A-------TT-A--T-AAA--------A-ATATT-A-TGGA--AG-TG-A----A-A-C-T--G-A-T----G-T---G-A--TG--A------T---TC-TT------CAACA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATC---AA-T-GT--ATAT-G-A--TTG-T-TAT--G--AAAT-TAGTT-------AA-GATC----GA--A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTTtca
gi|116593 : --TT--C-------A-----T-A-------T-C-AC------C-----A--C--------A-AT----A--T-GTG--T--TC-C----------------TACA--CT-G--C-GTG----A-AG-------TA---------------A------------------------T-----------------C--ATAAATGTGTATATTGG---AACTGGT------------GG-C-A---G---A----AT--TCC--C-A---A--TAA---------------------------------------------------------ATTGA-TGGA--AG-TC-A----A-A-C-G--G-G-C----A-TT-------T---A-----GT---TC-------------------------TA---A-AAA-CA----------------------ATG---AA-T-TC--ATAC-G-----TG----AA--G--TACT-CAGTTG------AA-GATT----G---A--GAGAA--CCAC-------T-G-T-
gi|116594 : -A--T-AAA--------A-CTATTGA-TGGA--AG-TG-G----C-A-C-T--G-A-T----G-TT--G-A--TA--A-----AT---TT-TT------CAAAA---------TTTG---A-AAA-CAATATGTTGTTTTTGTGAAAACAATA---AA-T-TT--ATAT-G-A--TGG-T-CAA--G--AAAT-TGGTT-------AA-GATC----A---A--AAACG--C--
gi|116595 : caataga-TT--G-A--TA--A-----AT---TC-TT------CAAAA---------TTTG---A-AAA-------------------------------------------T-G-A--TTG-T-TAA--A--AAAT-TAGTT-------AA-AATC----GA--A--AAAGG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116596 : AACA---------TTTG---A-AAA-CA----------------------ATC---AA-T-TT--ATAT-G-A--TTG-T-TAT--G--AAAT-TAGTTAAAATCGAA-GATC----G---A--AAATG--C--C-------T-G-T-CATTT
gi|116597 : -T-TT--ATAT-G-C--TTG-T-TAA--G--AAAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-A-T-CATTT
gi|116598 : -T-TT--ATAT-G-C--TTG-T-TAA--G--AAAT-TAGTT-------AA-GATC----G---A--AAAGG--C--C-------T-A-T-CATTT