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lowQualScore                  :              . ........ ...  ..  .. . . ...........   .... . ...... . . .. .. ....  . .. ......  . . .. .. .. . ......  . ... . . .   .  .  . .. .    
lowQualScore                  :              0 33333333 666  22  22 7 7 11111111111   9999 7 555555 1 4 77 77 8888  7 00 999999  4 4 00 00 00 7 000000  8 999 4 7 9   7  7  8 88 6    
consensus                     :         ATGAC-G--------G---AA--TG--A-C-G-----------GAA----T-G------A-C-G--G--A----AC-A--G------GG-T-A--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CCC-CC-GG-C--C-ATTT
Reference ( gi|88102 )        :         ATGAC-G--------G---AA--TG--A-C-A-----------GAA----T-G------A-C-G--G--A----AC-A--G------GG-T-A--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CCC-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88103                      :         ATGAC-G--------G---AA--GG--A-C-A-----------GAA----T-G------A-C-G--G--A----AC-A--G------GG-T-A--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CCC-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88104                      :         ATGAC-G--------G---AA--GG--A-C-G-----------GAA----T-G------A-C-G--G--A----AC-A--G------GG-T-A--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CCC-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88084                      :         ATGAC-A--------G---AA--TG--A-C-G-----------GAA----T-G------A-C-G--G--A----AC-A--G------GG-T-A--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CCC-CC-AG-C--C-ATTT
gi|88105                      :        aATGAC-G--------G---AA--TG--A-C-A-----------GAA----T-G------A-C-G--G--A----AC-A--G------GG-T-A--A--C--C-A------TA-T---A-T-G-CCC-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88106                      :         ATGAC-G--------G---AA--TG--A-C-A-------------A----T-G------A-C-G--G--A----AC-A--G------GG-T-A--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CCC-CC-GG-T--C-ATTT
gi|88107                      :         ATAAC-G--------G---AA--TG--A-C-A-----------GAA----T-G------A-C-G--G--A----AC-A--G------GG-T-A--A--C--A-CTTCATGTA-T---A-T-G-CCC-CT-GG-C--C-ATTT
gi|88108                      :         ATGAT-G--------G---AA--TG--A-C-A-----------GAA----T-G------A-C-G--G--A----AC-A--G------GG-T-A--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CCC-AC-GG-CAAC-ATT
gi|88109                      :         ATGAC-G--------G---AA--TG--A-C-A------------AA----C-G------A-C-G--G--A----AC-A--G------GG-T-A--A--C--A-C------TA-T---A-TGG-CCC-CC-GG-C--
gi|88088                      :         ATGAC-G------------AA--GG--A-C-A-----------GAA----T-G------A-C-GT-G--A----AC-A--G------GG-T----A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CGC-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88089                      :        aATGAC-G--------G---AAA-TG--A-C-A-----------GAA----T-G------G---A--G--A----AC-A--G------GG-T-A--A--C--A-C------TA-T---A-T-G--CC-CC-GG-C--C-TTTT
gi|88110                      :        aATGAC-G--------G---AA--GG--A-C-G-----------GAA----T-GACAATTA-C-G--G--A----AC-A--T------GG-T-A--A--C--A-G------CA-T---A-T-G-CCC-CC-AG-C--C-ATTT
gi|88111                      :         ATGAC-AA-------G---AA--TG--A-CCA-----------GAAC---T-G------A-C-A--G--A----AC-A--G------GG-T-A--A--C--A-C-------A-T---A-T-G--CC-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88112                      :         ATGAC-G--------G---GAATTG--A-C-A-----------GAA----T-G------A-C-G--G--A----AC-A--G------GG------------------------T---A-T-G-CCC-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88113                      :         ATCAC-G--------G---AA--TG--A-C-A-----------GAAA---T-G------A-C-G--G--A----AC-A--G------AG-T-A--A--C--A-C------TA-T---G-A-G-CCC-CC----C--CAATTT
gi|88114                      :         ATGAC-G--------G---AA--TG--A-C-AAGAATGCTACGGAA----T-GC-----A-C-G--G--A----AC-A--G------GGGT-A--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CCC-C---G-C--C-ATCT
gi|88115                      :         ATGAC-G--------G---AA--TGG-A-C-A-----------GAA----T-G------A---G--G--A----ACTA--G------GG-T-A--A--CAAA-C------TAGTAAGA-T-G--CC-TC-GG-C--C-ATTT
gi|88095                      :         ATGAA-T--------G---AA--GG--A-C-A-----------GAA----T-G------A-T-G--G--A----CT-G--A------TG-C-A--A--C--A-C------TA-C---A-T-G-CTC-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88116                      :        aATGACTG--------G---AA--GG--A-C-G-----------GAA----T-G------T-A-G--G--A----AC----G------GG-T-A--A--C--A-C------TA-T---A-A-T-TCC-CC-GG-C--CTATTT
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gi|88099                      :        aATGAC-A--------G---AA--GG--A-C-A-----------GAA----T-G------A-C-A--G-------AC-A--G------GA-CAA--A--A--A-C------AA-T---A-T-G-CCC-CC-G-----C-ATCT
gi|88100                      :        aATGAC-GGAAGGATGG---AA--TG--A-C-A-----------GAA----T--------A-C-G--GATA----AC-A---------GG-T-A--A--C--A-C------TA-TGC-A-T-G-GCC-CC----C--C-ATTT
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gi|88117                      :         aTGAC-G--------G---AA--TG--A-C-A-----------GAA----T-G------A-C-G--GC-A----AC-A--GTCAGA-GG-T-A--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-----CC-GG-C--C-ATTT
gi|88118                      :          TGAC-A--------G---AA--TG--A-C-G-----------GAA----T-G------A-C-GCGA--A----AC-A--G------GG-T-A--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CCCACC-GGTC--C-ATT
gi|88119                      :          TGAC-G--------G---AA--TG--A-C-A-----------GAA----T-T------A-T-G--G--A----AA-A--G------GG-T-A--A--C--A-C------TA-T---A-T-G--CC-CC-G-----C-ATTT
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gi|88090                      :        aagGAC-G--------G---AA--TGG-A-C-A-----------GAC----T-G------AGCAG--G--A----AC-ACCG------GG-T-A--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CCC-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88086                      :        aagGAC-G--------G---AA--TG--A-C-A-----------GAA----TAG------A-CAG--G--A----AC-A----------G-T-A--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CCC-CCAGA-C--C-ATTT
gi|88120                      :        aagGAC-G--------G---AA--TG--A-C-A-----------AAA----T-G------A-C----G--A----AC-A--G------GG---A--A--C--A-C------TA-T---A-T-G--CC-CC-GG-C--A-ATTT
gi|88121                      :           GAC-G--------G---AA--TG--AAC-A-----------GAA----T-G------AAC-G--G--A----AC----G------GG-T-A--A--C--ATC------TAAT---AAT-G-CCC-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88093                      :           GAC-G--------G---AA--TG--A-C-A-----------GAA----T-G------A-C-G--G--A----AC-A--G------GG-T-A--A-----A-C------GT-T---A-T-G-CCC-C
gi|88122                      :        aagGAC-G--------G---AA--TG--A-C-A-----------GAAAT--T-G------G---A--G--A----AC-A--GA-----GG-T-A--A--C--A-C------TA-T---A-T-G--CC-CC-GG-CT-T-ATTT
gi|88094                      :           GAC-A--------G---AA--TG--A---------------AAA----T-G------A-C-G--G--A----AC-A--G------GG-A-A--A--C--A--------TA-----G-T-G-CCC-CC-GG-C--C-ATT
gi|88096                      : aatgacggagGAC-G--------G---AAA-TGG-A-C-A-----------GAA----T-GT-----A-C-G--G--AT---AC-A--G------GG-T-A--A--C----C------TAAT---AAT-G-CCC-CC-GG-C--C-AT
gi|88124                      :        aagGAC-A--------G---AA--GG--A-C-A-----------GAA----T-G------A-T-G--G--AC---AA-A--A------TG-C-A--A--C--A-C------TA-A---A-T-GCCCC-CC-AG-C--C-ATTT
gi|88123                      :           GAC-A--------G---AA--GG--A-C-A-----------GAA----T-G------A-T-G--G--AC---AA-A--A------TG-C-A--A--C--A-C------TA-A---A-T-GCCCC-CC-AG-C--C-ATTT
gi|88125                      :            AC-G--------G---AAA-CG--A-A-A-----------TGA----T-G------A-C-G--G--A----AG-A--C------GG-T-A--A--C--A-C------TA-T---A-T-GTCCC-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88126                      :            AC-G--------G---AA--GG--A-C-G-----------GAGCACTT-G------A-C-G--G--A-----C-A--G------TG-C-A--A--C--A-CAC----TAGT---A-T-G-CCC-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88127                      :             C-G--------G---AA--TG--G-C-A-----------GAA----T-G------AGC-G--G--A----AC-A--G------GG-T-A--A--C--A-T------TA-T---A-T-G-CCC-CC-AG-C--C-ATTT
gi|88128                      :              -G--------G---AA--GG--A-C-A-----------GAA----T-G------A-C-G--G--A----AC-A--G------GGTT-AACA--C--A-C------TA-T---C-T-G-CCC-CC-AG-C--C-ATTT
gi|88129                      :                --------G---AA--TGGGA-C-A-----------GAA----T-G------A---G--G--ATACTAC-A--G------GG-T-A--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CCC-CC--G-C--C-ATTT
gi|88130                      :                         ---AA--TG--A-T-G-----------GAA----G-G------A-C-G--G--A----CT-G--G------TG-C-A--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CTC-CC-AG-C--C-ATTT
gi|88131                      :                             A--TG--A-C-G-----------GAA----T-G------A-C-G--G--A----AC-A--G------GG-T-A--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CCC-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88132                      :                             A--TG--A-C-G-----------GAA----G-G------A-C-G--G--A----AT-A--G------GG-C-A--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CCC-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88134                      :                             A--TG--A-C-G-----------GAA----T-G------A-C-G--G--A-----C-A--G------GG-T-A-----C--A-C------TA-T---A-T-G-CCC-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88091                      :                             A--TG--A-C-G-----------GAA----T-T------A-C-G--G--A----AC-A--G------GG-T-A--A--C--A-C------TA-TA--A-T-G-CCC-CC-GG-C--C-AT
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gi|88133                      :                             A--TG--A-T-G-----------GAA----T-G------A-C-G--G--A----AC-A--G------GA-T-A--G--C--A-CTATATGTA-T---A-T-G-CCC-CC-G
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gi|88141                      :                                                                         --G--A----AC-A--G------GG-T-A--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CCC-CC-TG-C--C-AT





Alignments
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lowQualScore                  :                         . .   ..  .. . ..   .... . . ... ...... .. . ....  . ........ .....  .  .. .. .. . ......  . ... . . .  . .  .  . .. .    
lowQualScore                  :                         0 8   55  22 7 77   9999 7 4 333 444444 66 7 5555  7 44444444 55555  4  99 99 99 1 999999  8 888 4 7 4  4 7  7  8 88 5    
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Reference ( family-391 )      :                    ATGAC-G-GAA--TG--A-C-GGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88084                      :                    ATGAC-A-GAA--TG--A-C-GGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-AG-C--C-ATTT
gi|88085                      :                     aGAC-G-GAA--TG--A-C-AGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------GC----GG-TA--ACCC--A-C------TA-T---A-T-G--C-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88086                      :                   aagGAC-G-GAA--TG--A-C-AGAA----TAG-A---CA-----G--G-A----AC-A---------------G-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CCAGA-C--C-ATTT
gi|88087                      :                   aagGAC-G-GAA--TG--A-A-AGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------T-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CT-GT-C--C-ATTT
gi|88088                      :                 aagATGAC-G--AA--GG--A-C-AGAA----T-G-A---C------GT-G-A----AC-A--------G-----GG-TA-----C--A-C------TA-T---A-T-G-CG-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88089                      :                   aATGAC-G-GAAA-TG--A-C-AGAA----T-G-G----------A--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G--C-C-CC-GG-C--C-TTTT
gi|88090                      :                     aGAC-G-GAA--TGG-A-C-AGAC----T-G-AG--CA-----G--G-A----AC-ACC------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88091                      :                           aagA--TG--A-C-GGAA----T-T-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-TA--A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-AT
gi|88092                      :              aatgaacggaaacaatg--TG--A-C-GGAA----T-G-A---C------G--A-A----AC-A--------G-----TG-TA--A--C--A-C------TT-T---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88093                      :  aatgaacggaattcaaatggGAC-G-GAA--TG--A-C-AGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A-----A-C------GT-T---A-T-G-CC-C-C
gi|88094                      :                   aagGAC-A-GAA--TG--A----AAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-AA--A--C--A--------TA-----G-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATT
gi|88095                      :          aatgacggagATGAA-T-GAA--GG--A-C-AGAA----T-G-A---T------G--G-A----CT-G--------A-----TG-CA--A--C--A-C------TA-C---A-T-G-CT-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88096                      :                     aGAC-G-GAAA-TGG-A-C-AGAA----T-GTA---C------G--G-AT---AC-A--------G-----GG-TA--A--C----C------TAAT---AAT-G-CC-C-CC-GG-C--C-AT
gi|88097                      :                        aag-GAA--GG--A-C-GGAA----T-G-A---C------A--G-A----CA-A--------GA----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CT-GG------ATTT
gi|88098                      : aatgacggaacaatgatacATGAC-A-GAA--GG--A-C-AGAA----T-G-A---C------A--G-A----A--A--------G-----GA-CA--A--A--A-C------AA-T---A-T-G-CC-C-CC-
gi|88099                      :                   aATGAC-A-GAA--GG--A-C-AGAA----T-G-A---C------A--G-A-----C-A--------G-----GA-CA--A--A--AAC------AA-T---A-T-G-CC-C-CC-G-----C-ATCT
gi|88100                      :                   aATGAC-G-GAA--GG--A-T-GGAA----T-G-A---C------A--G-A----AT-ACGGATAACA-----GG-TA--A--C--A-C------TA-TGC-A-T-G-GC-C-CC----C--C-ATTT
gi|88101                      :                   aATGAC-A-GAG--TG--A-C-AGAA----T-G-A---C------A--G-A-----C-A--------G-----GA-CA--A--A--AAC------AA-T---A-T-G-CC-C-CC-
gi|88102                      :                   aATGAC-G-GAA--TG--A-C-AGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88103                      :                    ATGAC-G-GAA--GG--A-C-AGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88104                      :                    ATGAC-G-GAA--GG--A-C-GGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88105                      :                    ATGAC-G-GAA--TG--A-C-AGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--C-A------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88106                      :                    ATGAC-G-GAA--TG--A-C---AA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-GG-T--C-ATTT
gi|88107                      :                    ATAAC-G-GAA--TG--A-C-AGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-CTTCATGTA-T---A-T-G-CC-C-CT-GG-C--C-ATTT
gi|88108                      :                    ATGAT-G-GAA--TG--A-C-AGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-AC-GG-CAAC-ATT
gi|88109                      :                    ATGAC-G-GAA--TG--A-C-A-AA----C-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-TGG-CC-C-CC-GG-C--
gi|88110                      :                    ATGAC-G-GAA--GG--A-C-GGAA----T-G-A---CAATTACG--G-A----AC-A--------T-----GG-TA--A--C--A-G------CA-T---A-T-G-CC-C-CC-AG-C--C-ATTT
gi|88111                      :                    ATGAC-AAGAA--TG--A-CCAGAAC---T-G-A---C------A--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C-------A-T---A-T-G--C-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88112                      :                    ATGAC-G-GGAATTG--A-C-AGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-----------------------T---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88113                      :                    ATCAC-G-GAA--TG--A-C-AGAAA---T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----AG-TA--A--C--A-C------TA-T---G-A-G-CC-C-CC----C--CAATTT
gi|88114                      :                    ATGAC-AAGAA--TGCTA-C-GGAA----T-GCA---C------G--G-A----AC-A--------G-----GGGTA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-C---G-C--C-ATCT
gi|88115                      :            atgacggaATGAC-G-GAA--TGG-A-C-AGAA----T-G-A----------G--G-A----ACTA--------G-----GG-TA--A--CAAA-C------TAGTAAGA-T-G--C-C-TC-GG-C--C-ATTT
gi|88116                      :                    ATGACTG-GAA--GG--A-C-GGAA----T-G-T---A------G--G-A----AC----------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-A-T-TC-C-CC-GG-C--CTATTT
gi|88117                      :                     TGAC-G-GAA--TG--A-C-AGAA----T-G-A---C------G--GCA----AC-A--------GTCAGAGG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G------CC-GG-C--C-ATTT
gi|88118                      :                     TGAC-A-GAA--TG--A-C-GGAA----T-G-A---C------GCGA-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-CACC-GGTC--C-ATT
gi|88119                      :                     TGAC-G-GAA--TG--A-C-AGAA----T-T-A---T------G--G-A----AA-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G--C-C-CC-G-----C-ATTT
gi|88120                      :                      GAC-G-GAA--TG--A-C-AAAA----T-G-A---C---------G-A----AC-A--------G-----GG--A--A--C--A-C------TA-T---A-T-G--C-C-CC-GG-C--A-ATTT
gi|88121                      :                      GAC-G-GAA--TG--AAC-AGAA----T-G-AA--C------G--G-A----AC----------G-----GG-TA--A--C--ATC------TAAT---AAT-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88122                      :                      GAC-G-GAA--TG--A-C-AGAAAT--T-G-G----------A--G-A----AC-A--------GA----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G--C-C-CC-GG-CT-T-ATTT
gi|88123                      :                      GAC-A-GAA--GG--A-C-AGAA----T-G-A---T------G--G-AC---AA-A--------A-----TG-CA--A--C--A-C------TA-A---A-T-G-CCCC-CC-AG-C--C-ATTT
gi|88124                      :                      GAC-A-GAA--GG--A-C-AGAA----T-G-A---T------G--G-AC---AA-A--------A-----TG-CA--A--C--A-C------TA-A---A-T-G-CCCC-CC-AG-C--C-ATTT
gi|88125                      :                       AC-G-GAA------A-C-GAAA----T-G-ATGAC------G--G-A----AG-A--------C-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-GTCC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88126                      :                       AC-G-GAA--GG--A-C-GGAGCACTT-G-A---C------G--G-A-----C-A--------G-----TG-CA--A--C--A-CAC----TAGT---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88127                      :                        C-G-GAA--TG--G-C-AGAA----T-G-AG--C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-T------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-AG-C--C-ATTT
gi|88128                      :                         -G-GAA--GG--A-C-AGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GGTTAACA--C--A-C------TA-T---C-T-G-CC-C-CC-AG-C--C-ATTT
gi|88129                      :                           -GAA--TGGGA-C-AGAA----T-G-A----------G--G-ATACTAC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC--G-C--C-ATTT
gi|88130                      :                             AA--TG--A-T-GGAA----G-G-A---C------G--G-A----CT-G--------G-----TG-CA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CT-C-CC-AG-C--C-ATTT
gi|88131                      :                              A--TG--A-C-GGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88132                      :                              A--TG--A-C-GGAA----G-G-A---C------G--G-A----AT-A--------G-----GG-CA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88133                      :                              A--TG--A-T-GGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GA-TA--G--C--A-CTATATGTA-T---A-T-G-CC-C-CC-G
gi|88134                      :                              A--TG--A-C-GGAA----T-G-A---C------G--G-A-----C-A--------G-----GG-TA-----C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88135                      :                              A--TG--A-C-GGAA----G-G-A----------A--G-A----AT-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-GCCC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88136                      :                              A--TG--A-C-GGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------------GG-TA--A--C--T-C------TA-T---A-T-G-CC-C-AC-GG----C-ATTT
gi|88137                      :                              A--TG--A-C-GGAA----T-G-A---C---------G-A----AC-A--------GT----GG-TA--A--C--A-C------TA-----A-T---CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88138                      :                              A--TG--A-C-AGAA----G-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-
gi|88139                      :                                          GAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G--C-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88140                      :                                          GAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------T--T---A-T---CC-T-CC--G-C--C-ATTT
gi|88141                      :                                                                 --G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-TG-C--C-AT





Alignments
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lowQualScore                  :                         . .   ..  .. . ..   .... . . ... ...... .. . ....  . ........ .....  .  .. .. .. . ......  . ... . . .  . .  .  . .. .    
lowQualScore                  :                         0 8   55  22 7 77   9999 7 4 333 444444 66 7 5555  7 44444444 55555  4  99 99 99 1 999999  8 888 4 7 4  4 7  7  8 88 5    
consensus                     :                    ATGAC-G-GAA--TG--A-C-GGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
Reference ( family-391 )      :                    ATGAC-G-GAA--TG--A-C-GGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88084                      :                    ATGAC-A-GAA--TG--A-C-GGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-AG-C--C-ATTT
gi|88085                      :                     aGAC-G-GAA--TG--A-C-AGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------GC----GG-TA--ACCC--A-C------TA-T---A-T-G--C-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88086                      :                   aagGAC-G-GAA--TG--A-C-AGAA----TAG-A---CA-----G--G-A----AC-A---------------G-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CCAGA-C--C-ATTT
gi|88087                      :                   aagGAC-G-GAA--TG--A-A-AGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------T-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CT-GT-C--C-ATTT
gi|88088                      :                 aagATGAC-G--AA--GG--A-C-AGAA----T-G-A---C------GT-G-A----AC-A--------G-----GG-TA-----C--A-C------TA-T---A-T-G-CG-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88089                      :                   aATGAC-G-GAAA-TG--A-C-AGAA----T-G-G----------A--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G--C-C-CC-GG-C--C-TTTT
gi|88090                      :                     aGAC-G-GAA--TGG-A-C-AGAC----T-G-AG--CA-----G--G-A----AC-ACC------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88091                      :                           aagA--TG--A-C-GGAA----T-T-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-TA--A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-AT
gi|88092                      :              aatgaacggaaacaatg--TG--A-C-GGAA----T-G-A---C------G--A-A----AC-A--------G-----TG-TA--A--C--A-C------TT-T---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88093                      :  aatgaacggaattcaaatggGAC-G-GAA--TG--A-C-AGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A-----A-C------GT-T---A-T-G-CC-C-C
gi|88094                      :                   aagGAC-A-GAA--TG--A----AAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-AA--A--C--A--------TA-----G-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATT
gi|88095                      :          aatgacggagATGAA-T-GAA--GG--A-C-AGAA----T-G-A---T------G--G-A----CT-G--------A-----TG-CA--A--C--A-C------TA-C---A-T-G-CT-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88096                      :                     aGAC-G-GAAA-TGG-A-C-AGAA----T-GTA---C------G--G-AT---AC-A--------G-----GG-TA--A--C----C------TAAT---AAT-G-CC-C-CC-GG-C--C-AT
gi|88097                      :                        aag-GAA--GG--A-C-GGAA----T-G-A---C------A--G-A----CA-A--------GA----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CT-GG------ATTT
gi|88098                      : aatgacggaacaatgatacATGAC-A-GAA--GG--A-C-AGAA----T-G-A---C------A--G-A----A--A--------G-----GA-CA--A--A--A-C------AA-T---A-T-G-CC-C-CC-
gi|88099                      :                   aATGAC-A-GAA--GG--A-C-AGAA----T-G-A---C------A--G-A-----C-A--------G-----GA-CA--A--A--AAC------AA-T---A-T-G-CC-C-CC-G-----C-ATCT
gi|88100                      :                   aATGAC-G-GAA--GG--A-T-GGAA----T-G-A---C------A--G-A----AT-ACGGATAACA-----GG-TA--A--C--A-C------TA-TGC-A-T-G-GC-C-CC----C--C-ATTT
gi|88101                      :                   aATGAC-A-GAG--TG--A-C-AGAA----T-G-A---C------A--G-A-----C-A--------G-----GA-CA--A--A--AAC------AA-T---A-T-G-CC-C-CC-
gi|88102                      :                   aATGAC-G-GAA--TG--A-C-AGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88103                      :                    ATGAC-G-GAA--GG--A-C-AGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88104                      :                    ATGAC-G-GAA--GG--A-C-GGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88105                      :                    ATGAC-G-GAA--TG--A-C-AGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--C-A------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88106                      :                    ATGAC-G-GAA--TG--A-C---AA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-GG-T--C-ATTT
gi|88107                      :                    ATAAC-G-GAA--TG--A-C-AGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-CTTCATGTA-T---A-T-G-CC-C-CT-GG-C--C-ATTT
gi|88108                      :                    ATGAT-G-GAA--TG--A-C-AGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-AC-GG-CAAC-ATT
gi|88109                      :                    ATGAC-G-GAA--TG--A-C-A-AA----C-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-TGG-CC-C-CC-GG-C--
gi|88110                      :                    ATGAC-G-GAA--GG--A-C-GGAA----T-G-A---CAATTACG--G-A----AC-A--------T-----GG-TA--A--C--A-G------CA-T---A-T-G-CC-C-CC-AG-C--C-ATTT
gi|88111                      :                    ATGAC-AAGAA--TG--A-CCAGAAC---T-G-A---C------A--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C-------A-T---A-T-G--C-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88112                      :                    ATGAC-G-GGAATTG--A-C-AGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-----------------------T---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88113                      :                    ATCAC-G-GAA--TG--A-C-AGAAA---T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----AG-TA--A--C--A-C------TA-T---G-A-G-CC-C-CC----C--CAATTT
gi|88114                      :                    ATGAC-AAGAA--TGCTA-C-GGAA----T-GCA---C------G--G-A----AC-A--------G-----GGGTA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-C---G-C--C-ATCT
gi|88115                      :            atgacggaATGAC-G-GAA--TGG-A-C-AGAA----T-G-A----------G--G-A----ACTA--------G-----GG-TA--A--CAAA-C------TAGTAAGA-T-G--C-C-TC-GG-C--C-ATTT
gi|88116                      :                    ATGACTG-GAA--GG--A-C-GGAA----T-G-T---A------G--G-A----AC----------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-A-T-TC-C-CC-GG-C--CTATTT
gi|88117                      :                     TGAC-G-GAA--TG--A-C-AGAA----T-G-A---C------G--GCA----AC-A--------GTCAGAGG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G------CC-GG-C--C-ATTT
gi|88118                      :                     TGAC-A-GAA--TG--A-C-GGAA----T-G-A---C------GCGA-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-CACC-GGTC--C-ATT
gi|88119                      :                     TGAC-G-GAA--TG--A-C-AGAA----T-T-A---T------G--G-A----AA-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G--C-C-CC-G-----C-ATTT
gi|88120                      :                      GAC-G-GAA--TG--A-C-AAAA----T-G-A---C---------G-A----AC-A--------G-----GG--A--A--C--A-C------TA-T---A-T-G--C-C-CC-GG-C--A-ATTT
gi|88121                      :                      GAC-G-GAA--TG--AAC-AGAA----T-G-AA--C------G--G-A----AC----------G-----GG-TA--A--C--ATC------TAAT---AAT-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88122                      :                      GAC-G-GAA--TG--A-C-AGAAAT--T-G-G----------A--G-A----AC-A--------GA----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G--C-C-CC-GG-CT-T-ATTT
gi|88123                      :                      GAC-A-GAA--GG--A-C-AGAA----T-G-A---T------G--G-AC---AA-A--------A-----TG-CA--A--C--A-C------TA-A---A-T-G-CCCC-CC-AG-C--C-ATTT
gi|88124                      :                      GAC-A-GAA--GG--A-C-AGAA----T-G-A---T------G--G-AC---AA-A--------A-----TG-CA--A--C--A-C------TA-A---A-T-G-CCCC-CC-AG-C--C-ATTT
gi|88125                      :                       AC-G-GAA------A-C-GAAA----T-G-ATGAC------G--G-A----AG-A--------C-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-GTCC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88126                      :                       AC-G-GAA--GG--A-C-GGAGCACTT-G-A---C------G--G-A-----C-A--------G-----TG-CA--A--C--A-CAC----TAGT---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88127                      :                        C-G-GAA--TG--G-C-AGAA----T-G-AG--C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-T------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-AG-C--C-ATTT
gi|88128                      :                         -G-GAA--GG--A-C-AGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GGTTAACA--C--A-C------TA-T---C-T-G-CC-C-CC-AG-C--C-ATTT
gi|88129                      :                           -GAA--TGGGA-C-AGAA----T-G-A----------G--G-ATACTAC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC--G-C--C-ATTT
gi|88130                      :                             AA--TG--A-T-GGAA----G-G-A---C------G--G-A----CT-G--------G-----TG-CA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CT-C-CC-AG-C--C-ATTT
gi|88131                      :                              A--TG--A-C-GGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88132                      :                              A--TG--A-C-GGAA----G-G-A---C------G--G-A----AT-A--------G-----GG-CA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88133                      :                              A--TG--A-T-GGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GA-TA--G--C--A-CTATATGTA-T---A-T-G-CC-C-CC-G
gi|88134                      :                              A--TG--A-C-GGAA----T-G-A---C------G--G-A-----C-A--------G-----GG-TA-----C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88135                      :                              A--TG--A-C-GGAA----G-G-A----------A--G-A----AT-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-GCCC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88136                      :                              A--TG--A-C-GGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------------GG-TA--A--C--T-C------TA-T---A-T-G-CC-C-AC-GG----C-ATTT
gi|88137                      :                              A--TG--A-C-GGAA----T-G-A---C---------G-A----AC-A--------GT----GG-TA--A--C--A-C------TA-----A-T---CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88138                      :                              A--TG--A-C-AGAA----G-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-
gi|88139                      :                                          GAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G--C-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88140                      :                                          GAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------T--T---A-T---CC-T-CC--G-C--C-ATTT
gi|88141                      :                                                                 --G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-TG-C--C-AT


blockSeqs                     :                           A   AT  CT   CA   CACT   T TGA AATTAC CG   TACT    CGGATAAC TCAGA  G           A TTCATG  A AAG A   T  C         AA A
blockSeqs                     :                           A   A   GG   A    AT     C G   A      T    T       CC       C      T           A TATATG  G GC  A   C  C         T  T
blockSeqs                     :                           .   A   G    A    C      . A   A      .    C       .        A      .           T AC      A A   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   G    A    A      . G   .      .    C       .        A      .           . .       G .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   G    A    .      . .   .      .    .       .        T      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    A    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    A    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    G    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    G    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    A    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    A    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    A    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    G    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    A    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    A    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    G    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    A    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    A    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    A    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    G    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    A    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    A    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    A    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    A    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    G    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    A    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    A    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    G    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    A    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    G    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    A    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    G    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    A    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    A    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    A    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    A    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    A    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    A    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    G    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    G    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    A    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    A    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                           .   .   .    A    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                               .   .    G    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                               .   .    G    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                               .   .    G    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                               .   .    G    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                               .   .    G    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                               .   .    G    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                               .   .    G    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                               .   .    G    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .  .
blockSeqs                     :                               .   .    A    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .         .   
blockSeqs                     :                               .   .    .    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .             
blockSeqs                     :                               .   .    .    .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .             
blockSeqs                     :                                             .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .             
blockSeqs                     :                                             .      . .   .      .    .       .        .      .           . .       . .   .   .  .             
blockSeqs                     :                                                                 .    .       .        .      .           . .       . .   .                    


blockSeqCons                  :                    
originalCons                  :                    ATGAC-G-GAA--TG--A-C-GGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
finalCons                     :                    ATGAC-G-GAA--TG--A-C-GGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT





Alignments
lowQualScore                  :                         1 1   22  44 0 11   3333 0 1 333 333333 11 0 3333  0 33333333 44444  1  00 00 00 2 444444  2 222 1 0 1  1 0  0  0 11 1    
lowQualScore                  :                         . .   ..  .. . ..   .... . . ... ...... .. . ....  . ........ .....  .  .. .. .. . ......  . ... . . .  . .  .  . .. .    
lowQualScore                  :                         0 8   55  22 7 77   9999 7 4 333 444444 66 7 5555  7 44444444 55555  4  99 99 99 1 999999  8 888 4 7 4  4 7  7  8 88 5    
consensus                     :                    ATGAC-G-GAA--TG--A-C-GGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
Reference ( family-391 )      :                    ATGAC-G-GAA--TG--A-C-GGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88084                      :                    ATGAC-A-GAA--TG--A-C-GGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-AG-C--C-ATTT
gi|88085                      :                     aGAC-G-GAA--TG--A-C-AGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------GC----GG-TA--ACCC--A-C------TA-T---A-T-G--C-C-CC-GG-C--C-ATTT
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gi|88087                      :                   aagGAC-G-GAA--TG--A-A-AGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------T-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CT-GT-C--C-ATTT
gi|88088                      :                 aagATGAC-G--AA--GG--A-C-AGAA----T-G-A---C------GT-G-A----AC-A--------G-----GG-TA-----C--A-C------TA-T---A-T-G-CG-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88089                      :                   aATGAC-G-GAAA-TG--A-C-AGAA----T-G-G----------A--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G--C-C-CC-GG-C--C-TTTT
gi|88090                      :                     aGAC-G-GAA--TGG-A-C-AGAC----T-G-AG--CA-----G--G-A----AC-ACC------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88091                      :                           aagA--TG--A-C-GGAA----T-T-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-TA--A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-AT
gi|88092                      :              aatgaacggaaacaatg--TG--A-C-GGAA----T-G-A---C------G--A-A----AC-A--------G-----TG-TA--A--C--A-C------TT-T---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88093                      :  aatgaacggaattcaaatggGAC-G-GAA--TG--A-C-AGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A-----A-C------GT-T---A-T-G-CC-C-C
gi|88094                      :                   aagGAC-A-GAA--TG--A----AAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-AA--A--C--A--------TA-----G-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATT
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gi|88096                      :                     aGAC-G-GAAA-TGG-A-C-AGAA----T-GTA---C------G--G-AT---AC-A--------G-----GG-TA--A--C----C------TAAT---AAT-G-CC-C-CC-GG-C--C-AT
gi|88097                      :                        aag-GAA--GG--A-C-GGAA----T-G-A---C------A--G-A----CA-A--------GA----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CT-GG------ATTT
gi|88098                      : aatgacggaacaatgatacATGAC-A-GAA--GG--A-C-AGAA----T-G-A---C------A--G-A----A--A--------G-----GA-CA--A--A--A-C------AA-T---A-T-G-CC-C-CC-
gi|88099                      :                   aATGAC-A-GAA--GG--A-C-AGAA----T-G-A---C------A--G-A-----C-A--------G-----GA-CA--A--A--AAC------AA-T---A-T-G-CC-C-CC-G-----C-ATCT
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gi|88107                      :                    ATAAC-G-GAA--TG--A-C-AGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-CTTCATGTA-T---A-T-G-CC-C-CT-GG-C--C-ATTT
gi|88108                      :                    ATGAT-G-GAA--TG--A-C-AGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-AC-GG-CAAC-ATT
gi|88109                      :                    ATGAC-G-GAA--TG--A-C-A-AA----C-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-TGG-CC-C-CC-GG-C--
gi|88110                      :                    ATGAC-G-GAA--GG--A-C-GGAA----T-G-A---CAATTACG--G-A----AC-A--------T-----GG-TA--A--C--A-G------CA-T---A-T-G-CC-C-CC-AG-C--C-ATTT
gi|88111                      :                    ATGAC-AAGAA--TG--A-CCAGAAC---T-G-A---C------A--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C-------A-T---A-T-G--C-C-CC-GG-C--C-ATTT
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gi|88113                      :                    ATCAC-G-GAA--TG--A-C-AGAAA---T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----AG-TA--A--C--A-C------TA-T---G-A-G-CC-C-CC----C--CAATTT
gi|88114                      :                    ATGAC-AAGAA--TGCTA-C-GGAA----T-GCA---C------G--G-A----AC-A--------G-----GGGTA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-C---G-C--C-ATCT
gi|88115                      :            atgacggaATGAC-G-GAA--TGG-A-C-AGAA----T-G-A----------G--G-A----ACTA--------G-----GG-TA--A--CAAA-C------TAGTAAGA-T-G--C-C-TC-GG-C--C-ATTT
gi|88116                      :                    ATGACTG-GAA--GG--A-C-GGAA----T-G-T---A------G--G-A----AC----------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-A-T-TC-C-CC-GG-C--CTATTT
gi|88117                      :                     TGAC-G-GAA--TG--A-C-AGAA----T-G-A---C------G--GCA----AC-A--------GTCAGAGG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G------CC-GG-C--C-ATTT
gi|88118                      :                     TGAC-A-GAA--TG--A-C-GGAA----T-G-A---C------GCGA-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-CACC-GGTC--C-ATT
gi|88119                      :                     TGAC-G-GAA--TG--A-C-AGAA----T-T-A---T------G--G-A----AA-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G--C-C-CC-G-----C-ATTT
gi|88120                      :                      GAC-G-GAA--TG--A-C-AAAA----T-G-A---C---------G-A----AC-A--------G-----GG--A--A--C--A-C------TA-T---A-T-G--C-C-CC-GG-C--A-ATTT
gi|88121                      :                      GAC-G-GAA--TG--AAC-AGAA----T-G-AA--C------G--G-A----AC----------G-----GG-TA--A--C--ATC------TAAT---AAT-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88122                      :                      GAC-G-GAA--TG--A-C-AGAAAT--T-G-G----------A--G-A----AC-A--------GA----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G--C-C-CC-GG-CT-T-ATTT
gi|88123                      :                      GAC-A-GAA--GG--A-C-AGAA----T-G-A---T------G--G-AC---AA-A--------A-----TG-CA--A--C--A-C------TA-A---A-T-G-CCCC-CC-AG-C--C-ATTT
gi|88124                      :                      GAC-A-GAA--GG--A-C-AGAA----T-G-A---T------G--G-AC---AA-A--------A-----TG-CA--A--C--A-C------TA-A---A-T-G-CCCC-CC-AG-C--C-ATTT
gi|88125                      :                       AC-G-GAA------A-C-GAAA----T-G-ATGAC------G--G-A----AG-A--------C-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-GTCC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88126                      :                       AC-G-GAA--GG--A-C-GGAGCACTT-G-A---C------G--G-A-----C-A--------G-----TG-CA--A--C--A-CAC----TAGT---A-T-G-CC-C-CC-GG-C--C-ATTT
gi|88127                      :                        C-G-GAA--TG--G-C-AGAA----T-G-AG--C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-T------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-AG-C--C-ATTT
gi|88128                      :                         -G-GAA--GG--A-C-AGAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GGTTAACA--C--A-C------TA-T---C-T-G-CC-C-CC-AG-C--C-ATTT
gi|88129                      :                           -GAA--TGGGA-C-AGAA----T-G-A----------G--G-ATACTAC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC--G-C--C-ATTT
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gi|88139                      :                                          GAA----T-G-A---C------G--G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G--C-C-CC-GG-C--C-ATTT
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gi|88141                      :                                                                 --G-A----AC-A--------G-----GG-TA--A--C--A-C------TA-T---A-T-G-CC-C-CC-TG-C--C-AT