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Reference ( gi|32302 )        : GTTT-TAGGGG-CCA-G---CCC-T---T-C---------A-----A-AT---T--A-A--G-G-GCTG-G-----------------------AGA-GG--G-------------GTC----C--AA-A--C----T-A--TT-T----T--CT-A-A--A-T---A-T---C--------T--C---AA-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---G--A-----A-T--TT-G---TT---AA--G-C-A--T-T--AT---T-GAA--G-C-AA-A--G--T--TG--CTTGCT
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gi|32337                      :  TTT-TAGGG---CA-T---CCC-T---T-C---------G-----T-AT---T--A-A--G-G-AC---G-----------------------AAA-GG--G-------------GTC----A--AA-A--AG---T-A--TT-T----T--TG-A-T--A-T---A-A---C--------T--A---AA-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---T--A-----A-C--TT-G---TT---AAG-G-C-A--T-T--AA---T-AAA--G-C-AA-A--G--C--T---CTTGT
gi|32339                      :  TTT-TAGGGA-CCA-G---TTC-T---T-C---------A-----A-AT---A--A-A--A-G-GCCG-A-----------------------AAA-GG--G---------------C----CA-AA-A--G----T-A--TT-T----T--CC-A-A--A-C---A-T---C--------T--A---AA-A-A-A-----A--A--A-A--A---A--A-----
gi|32341                      :   TC-TAAGGG-CCA-G---TCC-T---T-C---------A-----A-AA---T--A-A--G-G-GCTG-A-----------------------A-A-GG--G-------------GTC----A--AA-A--G----T-A--TT-T----T--CG-A-G--A-T---A-T---C--------T--C---AA-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---T--A-----A-T--TT-G---TT---AA--G-C-A--T-T--AA---T-TAA--A-C-AA-A--G--T--TG--CTTGTc
gi|32342                      :   TT-TAGGGG-CCA-----CCC-T---T-C---------AC----A-AT---T--A-G--G-G-GCTG-------------------------AGA-GG--G-------------GTC----A--AATA--T----T-AA-TT-T----T--CT-A-A--A-T---A-T---C--------T--CA--AA-A-A-AC-T--A--AC-A-A--A---G--AT----A-C--TT-GC--TT---AA--G-C-A--T-T--AT---T-GAA--G-C-AACA--G--T--TG--TTTG
gi|32347                      :   TT-TGGAGG-TCA-G---CCT-T---T-C---------A-----A-AT---A--A-A--G-G-GCTG-------------------------AGA-GG--G-------------GTC----A--GA-A--T----T-A--TT-T----T--CT-A-G--A-T---A-T---C--------T--C---AA-A-A-AC-T--G--A--C-A--G---G--A-----A-T--GA-G---TT---AA--G-T-A--T-T--AA---T-GAA--G-G-AA-A--A--T--TG--CTTGT
gi|32344                      :   TT-TAGGG--CCA-G---CC--T---T-C---------A-----A--T---T--A-A--G-G-GCTG-------------------------AGA-GG--G--------------TC----C--AA-A--C----T-A--TT-T-------CT-A-A--A-T---A-T---C--------TA-A---AA-A-A-AC-T-----A--A-A--A---G--A-----A----TT-G---TTA--AA--G-C-A--T-TG-AT---T-GAA--G-CAAA-A--G--T--TGCACTTGC
gi|32340                      :   TT-TAGGGG-CCA-T---CCC-T---T-C---------G-----T-AT---T--A-A--G-G-GCCG-A-----------------------AA---G--G-------------GTC----A--AA-A--G----T-A--TT-T----T--T----G--A-T---A-TAAAC--------T--A---AA-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---T--A-----A-T--TT-G---TT---AA--G-C-A--T-TA-AT---T-AAA--G-C-AA-A--G--C--TG--CTTGT
gi|32345                      :   TT-TAGGGG-C-A-G---CCC-T---T-C---------A-----A--T---T-------G-G-GCTG-G-----------------------AG---G--G-------------GTC----A--CA-A--T----T----TT-T----T--CT-A-A--A-T---A-T---C--------T--C----A-A-A-AC-T--A--A--A-----------G-----A-C--TT-G---TT---AA--GCC-A--T-C--AT---TGGAA--A-C-AA-A--G--T--TG--CTTGC
gi|32346                      :   TT-TAGGG--CCA-T---CCC-T---T-C---------G-----T-AT---G--A-A--G-G-CC---G-----------------------AAA-GG--G--------------TC----A--AA-AG-T----T-A--TTCT----T--CG-A-T--A-T---A-A---C--------T-------A-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---T--A-----A-T--T--G---TT---AA--G------T-T--AA---T-AAA--G-C-AA-A--G--C--TG--CTTGT
gi|32348                      :   TT-TAGGGG-CCA-G---TCC-T---C-C---------A-----A-AT---A--ATA--G-G-GCT--G-----------------------AGA-GG--G-------------GCC----C--AA-A--A----T-T--TT-T----T--CT-A-G--A-T---T-T---G--------T--T---AA-A-G-AC-C--G--A--A-
gi|32349                      :   TT-TGAAGG-CCA-G---TAA-T---G-C---------A-----A--T---T--A-AAGG-G-GCTG-A-----------------------A-A-GT--G-------------GTC----A--GA-A--T----T-A--AA-T----T---T-A-G--A-T---A-T---C--------T--C---AA-A-A-AC-T--A--AAGA-A--A---G--A-----A----TC-G---GG---AA--G-T-A--T-TG-ATTAAT-AAA--G-C-AA-A--A--T--TG--CTT
gi|32343                      :   TT-TAAGGG-CCA-T---CCCCT---T-C---------G-----T-AA---T--A-A--T-G-GCCG-A-----------------------A-A-GG--G-------------GTC----A--AA-AG-T----T-A--TT-TGCGAT--CT-A------T---A-A---C--------T--A---AACA-A-AC-T--A--A--A-T--A---TT-A-----C-T--TT-GGA-TT---AA--G-T-AA-T-T--AA---T-AAA--G-C-AA-A--GCTC--TG--TTTG
gi|32350                      :    T-TAGGGGGCCA-G---CC--T---G-C---------A-----A-AT---T--A-G--G-G-GCTG-------------------------AGA-GG--G-------------GTC----A--AA-AATT----T-A--TT-T----T--CT-A-A--A-T---A-T---C--------T--CC--AA-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---G--A-----A-C--TT-G---TT---AA--G-C-A--T-T--AT---T-GAA--G-C-AA-A--G--T--TG--TTTGT
gi|32351                      :    T-TAGGGC-TCA-G---TCT-TAAAT-C---------AGCACAA-AT---T--ATG--G-G-GCTG-AGC---------------------AGA-GG--C-------------GTA----C--AC-A--CATTTT-T--TT-T----T--CT-A-A--AAT---A-T---C--------TGGC---AA-A-A-AC-T--A--A--A-ACAA---A--A-----A-TC-TT-G---TT---AA--G-C-AA-T-C--AT---T-GAA--G-C-AA-A--G--T--
gi|32352                      :     -TAGGGA-CTA-T---TCC-T---T-C---------A-----A-AT---A--A-A--G-G-GCCG-------------------------AGA-GT--G-------------GTC----A--AA-A--G----T-A--TT-T----T--CT-A-G--A-T---A-T---C--------T--T---AA-A-A-GT-G--A--A--T-G--A---G--A-----A-A--TT-G---CA---AA--G-C-A--T-T--AT---T-GAA--A-C-AA-A--G--T--TG--CTT
gi|32353                      :        GGGG-CC--G---CCC-T---T-C---------A-----A-AT---T--A-G--G-T-GGTG-GTGTTTCTACCTTTGAAGTCTGAAAGA-GG--G-------------GTC----A--AA-A--A----TCA--TT-T----T--CA-A-G--A-T---A-T---TCTGCATTGT--C---AC-ATA-AC-T--AGAA--A-A--A---T--A-----A-T--TT-G---TT---A---G-C-A--T-T--GT---T-GCA----C-AA-A--G--T--TG--CTTGTttt
gi|32354                      :          GG-CCAAG---CGC-T---T-T---------A-----A-TT---T--A-A--A-G-GC---G-----------------------AAACGG--G-------------GTC----A--AA-A--C----T-A--TT-T----T--CT-A-A--A-T---A-T---C--------T--T---AA-A-A-AC-TA-A--A--A-A--A---G--G-----A-T--TT-G---TTA--AA--G-C-A--T-T--AT---T-GAA--G-C-GA-A--G--
gi|32355                      :               A-G---CCC-T---T-C---------A-----A-AA---T--T-A--G-G-GCTG-------------------------AGA-GG--G-------------GTC----C--AA-A--C----T-A--TT-T----T--CT-A-A--A-T---A-T---C--------T--C---AA-A-ATACTT--A--G--ACA--A---G--ACAGACA-C--TT-T---TC---AA--A-C----T-T---T---T-CAA--G-C-Aactcgtt
gi|32356                      :                  ---CTC-T---T-C---------A-----A-ATCTAT--A-GC-G-G-GCTG-------------------------AGA-GGT-G-------------GTCACATC--AA-AGTC----T-A--TT-T----TA-CT-A-A--A-T---A-T---C--------T--C---AA-A-A-AC-T-----A--A-A--A---G--A-----A-CGGCT-----CT---AA--G-C-A--T-TC-AT---T-GAA--G-C-AA-AC-G--T--TGC-CTTGT
gi|32357                      :                        -T---T-C---------A-----C-AT---T--A-A--A-G-GCCG-A-----------------------A-A-TTTTG-------------GTT----C--AA-A--CC---T-A--TT-T----T--TTTA-G--A-T---A-T---C--------T--C---CA-A-A-GC-T--A--A--A-A--A---T--A-----A-T--TG-C---TT---AA--G-CAA--T-A--AT---T-GAA--G-
gi|32358                      :                                                                      -G-----------------------AGA-GG--G-------------GTC----A--AA-A--G----T-A--TT-T----T--CT-A-A--A-T---A-T---C--------T--C---AA-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---G--A-----A-T--TT-G---TA---AA--A-C-A--T-T--AT---T-GAA--G-C-AA-A--G--T--TG--CTTGT

lowQualScore                  :                                                            222222222222222222222222222                                                                                                                                                                                                           
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lowQualScore                  :     .     ..   . ...   . ... .  ..... .  ... .. . .. . . . ........................... ... . ... . .  . . .............  . ... .. ..  . .... ..  ... . .. . ... . ... ........ ......  . . .  . .. .. .. . .. ... .. ..... ....   ...  ...  .. . . .. . ..  ... .   .. . .  . .. .. ..  .. .     
lowQualScore                  :     8     11   7 000   1 333 7  66666 4  999 99 4 88 4 7 7 000000000000000000000000000 000 7 222 4 7  4 4 3333333333333  4 444 33 33  4 2222 44  666 7 00 4 999 7 222 22222222 888888  7 7 4  7 11 77 77 4 00 777 00 55555 3333   111  888  88 0 5 55 5 77  333 7   00 5 3  8 88 11 11  77 8     
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Reference ( family-386 )      : GTTT-TAGGGG-CCA-G---CCC-T---T-CA-----A-AT---T--A-A--G-G-G-CTG-G-----------------------AG--A-G---G-G-GT-C-A-------------AA-A-N-T--A--TT-T----T--CT---A-A--A-T---A-T---C--------T--C---AA-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---G--A-----A-T--TTG---TT---AA--G-C-A--T-T--AT---T-GAA--G-C-AA-A--G--T--TG--C-TTGTT
gi|32301                      : GTTT-TAGGGG-CCA-G---CCC-T---T-CA-----A-AT---T--A-G--G-G-G-CT--G-----------------------AT--A-G---G-G-GT-C-C-------------AA-A-C-T--AT-TT-T----T--CT---A-A--A-T---A-T---C--------T--C---AA-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---G--A-----A-C--TTG---TT---AA--G-C-A--T-T--AT---T-GAA--G-C-AA-A--G--T--TG--T-TTGTT
gi|32302                      : GTTT-TAGGGG-CCA-G---CCC-T---T-CA-----A-AT---T--A-A--G-G-G-CTG-G-----------------------AG--A-G---G-G-GT-C-C-------------AA-A-C-T--A--TT-T----T--CT---A-A--A-T---A-T---C--------T--C---AA-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---G--A-----A-T--TTG---TT---AA--G-C-A--T-T--AT---T-GAA--G-C-AA-A--G--T--TG--C-TTGCT
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gi|32315                      : GTTT-TAGGGG-CC--G---CTT-T---T-CA-----C-AT---T--A-G--G-G-G-CTG-------------------------AG--A-G---G-G-GT-C-A-------------AA-T-T-T--T--TT-T----T--CT---A-A----T---A-T---C--------T--C---AA-A-A-AC-T--A--A--A-A--AA--G--A-----A-C--TTGG--TT---AA--GGC-AATT-C--AT---T-GAA--G-C-AA-A--G--T--TG--C-TTGTT
gi|32316                      : GTTT-TTAGGG-CCA-G---CC--T---T-CA-----A-AT------A-A--G-G-G-CTG-------------------------AG--A-G---G-G-GT-C-C-------------AA-A-C-T--A--TT-T----T--CT---A-A--A-T---ATT---C--------T--C----A-A-A-AC-TA-A--A--A-A--A---G--A-----ATT--TTG---TT---AA--GCC-A--T-T--AT---T-GAA--G-C-AA-A--G--T--TG--C-TT
gi|32317                      : GTTT-T-GAGG-CCA-G---CCC-T---T-CA-----A-AT---T--A-A--G-G-G---GCG-----------------------AG--A-G---GTG-GT-C-A-------------AA-A-T-T--A--TT-T----T--CT---A-A--A-A---A-T---C--------T--C---AA-A-A-AC-TGAA--A--A-A--G---G--A-----A-C--TTGTTTTT---AA--G-C-A--T-T--AT---T-GAA--GCC-AA-A--G--T--TG--T-TTGTT
gi|32318                      : GTTT-TAGGG--CCA-G---CCC-T---T-CA-----T-AT---T--A-G--A-G-G-CT--G-----------------------AG--A-G---G-G-GT-C-A-------------AA-T-T-T--T--TG-T----C--CT---A-A--A-T---A-T---C--------T--TTTAAA-A-A-AC-T-----A--A-A--A---G--A-----A-C--TTG---TT---AA--G-C-A--TCT--AT---T-GAA----C-AA-A--G--T--TG--T-TTGTT
gi|32319                      : GTTT---GGGG-CT--G---CCC-G---T-TA-----A-AT------A-A--G-GTG-C---G-----------------------CG--A-A---G-G--T-C-A-------------AA-A---T--A--TT-T----T--TT---A-A--A-T---A-C---T--------T-------A-A-A-AC-TTTA--A--A-A--A---C--A-----A-T--TTGATTTT---AA--A-A-A--T-T--AT---T-GAA--G-C-AA-A--G--A--TG--C-T
gi|32320                      : GTTT-TAGGGG-C-A-G---CCC-T---T-CA-----A-AT---T--A----G-G-G-CTA-------------------------AG--A-G---G-G-GT-C-A-------------AA-A---T--A--TC-T----C-------A-A--A-T---A-T---C--------T--C---AA-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---A--A-----T-T--TTG---AT---AA--G-C-A--T-T--AT---T-GAA--G-C-AA-A--G--T--TG--C-TTGTT
gi|32321                      : GTTT-TAGGGG-CCA-----CCC-T---T-CA-----A--T---T--A-A--G-G-G-CCG-A-----------------------A---A-G---G-G-GT-C-A-------------AA-A-G-T--A--TT-T----C--TT---A-A--A-----A-T---C--------T--C------A-A-AC-T--A--A--A-A--A---T--A-----A-T--TTG----T---AA--G-C-A--T-T--AT---T-GAA--G-C--A-A--T--T--TG--C-TTTTT
gi|32322                      : GTTT-TAGGG--CCA-G---CCCCT---T-CA-----G-AT---T--A-A--G-G-G-C----------------------------A--A-A---G-G-GT-C-A-------------AA-A-G-T--A--TT-T----T--CT---AGA--A-T---A-T---C--------T--C---AA-A-A--C-T--A--A--A-A--A---T--A-----A-T--TTG---TT---AA--G-C-AAGT-T--AT---T-GAA--G-C-AA-A--------TG--C-TTGCT
gi|32323                      : GTGT-TAGGGG-C---A---TCC-T---T-CA-----A-TT---T--G----G-G-G-CTG-G-----------------------AG--A-G---G-G-TT-C-A-------------AG-A-A-T--A--TT-T----T--CT---A-A--A-T---A--------------T--T---AA-T-A-AC-T--AT-A--A-A--A---G--A-----A----TTG---TT---AATGG-C-A--T-T--A----T-GAA--G-C--A-A--G--T--TGT-T-TTGTT
gi|32324                      : GTTT-TAGGGG-TAA-T---CTC--------------A-AT---TGGA-A--G-G-G--TG-T-----------------------A---A-G---G-G-G----A-------------AA-A-T-T--A--TT-T----TAATA---A-A--A-T---A-----A--------G--C---AA-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---G--A-----A-C--TTG---T-----A--G-C-A--T-C--AT---T-GAA--G-C-AA-G--------TG--C-TTGTT
gi|32325                      : GTTT-TAGGG---CA-G---CTT-T---A-CA-----AGAT---T--A-AT-A-G-G-CTG-------------------------AG--A-G---G-G-GT-C-C-------------GA-A-A-T--A--TT-T----T--CT---A-A--A-T-----T---C--------T------AA-A-A-------A--A--A-A--A---G--A-----A----TTG---TT---AG--------------AT---T-G--------GA-A--G--T--TG--CTTTGTT
gi|32326                      : GTTT-TAGGGG-CCA-G---ACT-T---T-CA-----A-AT---T--A-G--G-G-G-CTG-------------------------AG--A-G---G-G-GT-C-A-------------AA-A-G-T--A--TT-T----T--CA---A-G--A-T---A-T---C--------T--C---AA-A-A-AG-T--A--G--A-A--A---T--A-----A-T--TTG---TG---AA--G-C-A--T-T--AA---T-GAA--A-CAAA-A--G--T--TG--C-TTGTT
gi|32327                      : GTTT-TAGGGG-CAA-------C-TG--T-CA-----A-AT---T--A-G--G-G-G-CTG-A-----------------------AG--------G-G-GT-C-A-------------CA-A-T-T--T--TTCT----T--CT---A-A--A-T-----T---CG-------T--C---CA-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---G--A-----A-C--TTG--------AA--G-C-A--T-T--AT---T-GAA--G-C-AA-A--G--T--TG----TTGTT
gi|32328                      : GTTT-TAGGG---CA-G---CC--T---T-CA-----A-AT---T--A-AT-G-G-G-CT--G-----------------------AG--A-T---G-G-GT-T-C-------------AA-A-T-T--A--TT-T--------T---A-A--A-T---A-T---C--------T--C----A-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---G--A-----A----TTG---TT---AA--G-C-AG-T-TAAAT---T-GAA--G-C-AA-G--------TG--T-TTGT
gi|32329                      : GTTT-TAGGGG-CCG-------C-TG--T-CAT----A-AT---T--A-A--G-G-G-CTGAG-----------------------AG----G---G-G-GT-CAA-------------AA-A-C-T--A--TT-TA---A--CT---A-A--A-TC--A-T---C--------T---------A-A-AC-TG-A--A--A-A--A---G--A-----A----TTG---TT---AA--G-C-A--T-T--A----T-GAA--G-C-AA-AGGG--TTGTG--C-TTGTT
gi|32330                      : GTTT-TAAGGG-CCA-T---CCC-TG--T-CG-----T-AT---T--A-A--G-G-G-CCG-A-----------------------AA--------G-G-GT-C-A-------------AA-A-G-T--A--TT-T----T--C----G-A--T-T---A-A---C--------T------AA-A-A-TA-T--A--A--A-A--A---T--A-----A----TTG---TT----A--G-C-A--T-T--AA---T-AAA--G-C-AA-A--G-----TG--C-TTGTT
gi|32331                      : GTTTATAGAGG-CCA-G---TCT-C---T-CA-----A-AA------A-A--G-G-G-CCA-------------------------AG--A-G---G-G-GT-T-A-------------AA-A-G-T--A--TT-T----G--CT---A-A--A-T---A-T---T--------T--C---AA-A-A--C-T--A--A--A-A--A---G--A-----A-T--TTG---TA---AC--T-C-A--T-T--AT---T-GAG--A-C-AA-A--G--T--TG--C-CT
gi|32332                      : GTTT-T-GGGG-CCA-G---CCC-T---T--A-----A-ATA--T--A-A--G-G-G-CTG-------------------------AG--A-G---T-G-GT-A-A-------------AA-A-C-T--A--TT-T----T---T---A-A--A-T---A-T---C--------T--C---AA-A-A-AC-C--A--A--A-A--GAATA--A-----A-T--TCA---CTTAAAA--G-C-A--TATA-AT---T-GAC--G-CTGA-A--G--T--TG--C-TT
gi|32333                      : GTTT-TAGGGC-CC--G---CCC-T---T-CA-----ACAT---TAGA-G--G-G-G-CTGAG-----------------------AG--G-G---G-G-TC-C-A-------------AA-G-C-G--A--TT-T----T--CTA--A-A--A-T---A-T---C--------TACC---AA-A-A-
gi|32334                      : GTTT-TAGGG--CCA-T---CCC-T---T-CG-----T-AT---T--A-A--G-----CCG-A-----------------------AA--------G-G-GT-C-A-------------AA-A-AGT--A--TT-T----T--CG---A-T--A-T---A-A---C--------T--A---AA-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---T--A-----A----TTG---TT---AA--G-C-A----T--AA---T-AAA--GCC-AA-A--G-----TG--C--TGTT
gi|32335                      : GTTT-TAGGGG-CTA-C---CCC-C---C-CCCCCC-A-AT---A--A-A--A-A-G-A-G-G-----------------------AGCTA-G---C-G------A-------------AA-A-G-T--A--TT-T----T--CA---A-A--A-----A-T---C--------T--A---AA-A-C-TC-T--A--A--A-G--A---G--A-----A-G--TTG---TC---AA--G-T-A---------------AA--G-C-AA-A--A--T--TG--C-TTGTT
gi|32336                      :  TTT-TAGGGG-CCA-G---CCC-T---T-CA-----A-AT---T--A-G--GCG-G-CT--------------------------AG--A-G---G-G-GT-CCA-------------AA-A-T-T--A--TT-A----T--CT---A-A--AAT---A-T---C--------T--C---AA-A-AAAC-T--A--A--A-A--A---A--A-----A-C--TTG---TT---AA--G-C-A--T-T--AT---T-GAA--G-C-CA-A--G--T--TG--T-TTGTT
gi|32337                      :  TTT-TAGGG---CA-T---CCC-T---T-CG-----T-AT---T--A-A--G-G-A-C---G-----------------------AA--A-G---G-G-GT-C-A-------------AA-A-AGT--A--TT-T----T--TG---A-T--A-T---A-A---C--------T--A---AA-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---T--A-----A-C--TTG---TT---AAG-G-C-A--T-T--AA---T-AAA--G-C-AA-A--G--C--T---C-TTGTT
gi|32338                      :  TTT-CAGGGG-CCA-GGCACCC-T---T-CA-----A-AT---A--A-AC-G-G-G-TCT-G-----------------------AG--A-G---G-A-TC-C-ACTTAGATGTATCCAA-A-C-T--AGTCT-T----T--CT---A-ATCA-TTTTA-T---C--------TT-C---AA-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---G--A-----A-T--T-G---TT---AA--G-C-A--T-T--AT---T-GAA--G-C-AA-A--G--T--TG--C-T
gi|32339                      :  TTT-TAGGGA-CCA-G---TTC-T---T-CA-----A-AT---A--A-A--A-G-G-CCG-A-----------------------AA--A-G---G-G--C-C-A-------------AA-A-G-T--A--TT-T----T--CC---A-A--A-C---A-T---C--------T--A---AA-A-A-A-----A--A--A-A--A---A--A-----
gi|32340                      :   TT-TAGGGG-CCA-T---CCC-T---T-CG-----T-AT---T--A-A--G-G-G-CCG-A-----------------------AA--------G-G-GT-C-A-------------AA-A-G-T--A--TT-T----T--T------G--A-T---A-TAAAC--------T--A---AA-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---T--A-----A-T--TTG---TT---AA--G-C-A--T-TA-AT---T-AAA--G-C-AA-A--G--C--TG--C-TTGTTc
gi|32341                      :   TC-TAAGGG-CCA-G---TCC-T---T-CA-----A-AA---T--A-A--G-G-G-CTG-A-----------------------A---A-G---G-G-GT-C-A-------------AA-A-G-T--A--TT-T----T--CG---A-G--A-T---A-T---C--------T--C---AA-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---T--A-----A-T--TTG---TT---AA--G-C-A--T-T--AA---T-TAA--A-C-AA-A--G--T--TG--C-TTGTT
gi|32342                      :   TT-TAGGGG-CCA-----CCC-T---T-CAC----A-AT---T--A-G--G-G-G-CTG-------------------------AG--A-G---G-G-GT-C-A-------------AATA-T-T--AA-TT-T----T--CT---A-A--A-T---A-T---C--------T--CA--AA-A-A-AC-T--A--AC-A-A--A---G--AT----A-C--TTGC--TT---AA--G-C-A--T-T--AT---T-GAA--G-C-AACA--G--T--TG--T-TTG
gi|32343                      :   TT-TAAGGG-CCA-T---CCCCT---T-CG-----T-AA---T--A-A--T-G-G-CCG-A-----------------------A---A-G---G-G-GT-C-A-------------AA-AGT-T--A--TT-TGCGAT--CT--------A-T---A-A---C--------T--A---AACA-A-AC-T--A--A--ATA--T---T--A-----C-T--TTGGA-TT---AA--G-TAA--T-T--AA---T-AAA--G-C-AA-A--GCTC--TG--T-TTG
gi|32344                      :   TT-TAGGG--CCA-G---CC--T---T-CA-----A--T---T--A-A--G-G-G-CTG-------------------------AG--A-G---G-G--T-C-C-------------AA-A-C-T--A--TT-T-------CT---A-A--A-T---A-T---C--------TA-A---AA-A-A-AC-T-----A--A-A--A---G--A-----A----TTG---TTA--AA--G-C-A--T-TG-AT---T-GAA--G-CAAA-A--G--T--TGCAC-TTGCT
gi|32345                      :   TT-TAGGGG-C-A-G---CCC-T---T-CA-----A--T---T-------G-G-G-CTG-G-----------------------AG--------G-G-GT-C-A-------------CA-A-T-T-----TT-T----T--CT---A-A--A-T---A-T---C--------T--C----A-A-A-AC-T--A--A--A-----------G-----A-C--TTG---TT---AA--GCC-A--T-C--AT---TGGAA--A-C-AA-A--G--T--TG--C-TTGCT
gi|32346                      :   TT-TAGGG--CCA-T---CCC-T---T-CG-----T-AT---G--A-A--G-G-C-C---G-----------------------AA--A-G---G-G--T-C-A-------------AA-A-G-TT-A--TTCT----T--CG---A-T--A-T---A-A---C--------T-------A-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---T--A-----A----TTG---TT---AA--G------T-T--AA---T-AAA--G-C-AA-A--G--C--TG--C-TTGTT
gi|32347                      :   TT-TGGAGG-TCA-G---CCT-T---T-CA-----A-AT---A--A-A--G-G-G-CTG-------------------------AG--A-G---G-G-GT-C-A-------------GA-A-T-T--A--TT-T----T--CT---A-G--A-T---A-T---C--------T--C---AA-A-A-AC-T--G--A--C-A--G---G--A-----A-T--GAG---TT---AA--G-T-A--T-T--AA---T-GAA--G-G-AA-A--A--T--TG--C-TTGTT
gi|32348                      :   TT-TAGGGG-CCA-G---TCC-T---C-CA-----A-AT---A--ATA--G-G-G-CT--G-----------------------AG--A-G---G-G-GC-C-C-------------AA-A-A-T--T--TT-T----T--CT---A-G--A-T---T-T---G--------T--T---AA-A-G-AC-C--G--A--A-
gi|32349                      :   TT-TGAAGG-CCA-G---TAA-T---G-CA-----A--T---T--A-AAGG-G-G-CTG-A-----------------------A---A-G---T-G-GT-C-A-------------GA-A-T-T--A--AA-T----T---T---A-G--A-T---A-T---C--------T--C---AA-A-A-AC-T--A--AAGA-A--A---G--A-----A----TCG---GG---AA--G-T-A--T-TG-ATTAAT-AAA--G-C-AA-A--A--T--TG--C-TT
gi|32350                      :    T-TAGGGGGCCA-G---CC--T---G-CA-----A-AT---T--A-G--G-G-G-CTG-------------------------AG--A-G---G-G-GT-C-A-------------AA-A-A-TTTA--TT-T----T--CT---A-A--A-T---A-T---C--------T--CC--AA-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---G--A-----A-C--TTG---TT---AA--G-C-A--T-T--AT---T-GAA--G-C-AA-A--G--T--TG--T-TTGTT
gi|32351                      :    T-TAGGGC-TCA-G---TCT-TAAAT-CAGCACAA-AT---T--ATG--G-G-G-CTG-AGC---------------------AG--A-G---G-C-GTAC-A-------------CACA-T-T--T--TT-T----T--TTCTAA-A--A-T---A-T---C--------TGGC---AA-A-A-AC-T--A--A--A-ACAA---A--A-----A-TC-TTG---TT---AA--G-C-AA-T-C--AT---T-GAA--G-C-AA-A--G--T--
gi|32352                      :     -TAGGGA-CTA-T---TCC-T---T-CA-----A-AT---A--A-A--G-G-G-CCG-------------------------AG--A-G---T-G-GT-C-A-------------AA-A-G-T--A--TT-T----T--CT---A-G--A-T---A-T---C--------T--T---AA-A-A-GT-G--A--A--T-G--A---G--A-----A-A--TTG---CA---AA--G-C-A--T-T--AT---T-GAA--A-C-AA-A--G--T--TG--C-TTTTT
gi|32353                      :        GGGG-CC--G---CCC-T---T-CA-----A-AT---T--A-G--G-T-G-GTG-GTGTTTCTACCTTTGAAGTCTGAAAG--A-G---G-G-GT-C-A-------------AA-A-A-TC-A--TT-T----T--CA---A-G--A-T---A-T---TCTGCATTGT--C---AC-ATA-AC-T--AGAA--A-A--A---T--A-----A-T--TTG---TT---A---G-C-A--T-T--GT---T-GCA----C-AA-A--G--T--TG--C-TTGTT
gi|32354                      :          GG-CCAAG---CGC-T---T-TA-----A-TT---T--A-A--A-G-G-C---G-----------------------AA--ACG---G-G-GT-C-A-------------AA-A-C-T--A--TT-T----T--CT---A-A--A-T---A-T---C--------T--T---AA-A-A-AC-TA-A--A--A-A--A---G--G-----A-T--TTG---TTA--AA--G-C-A--T-T--AT---T-GAA--G-C-GA-A--G------A--C-TCGTT
gi|32355                      :               A-G---CCC-T---T-CA-----A-AA---T--T-A--G-G-G-CTG-------------------------AG--A-G---G-G-GT-C-C-------------AA-A-C-T--A--TT-T----T--CT---A-A--A-T---A-T---C--------T--C---AA-A-ATACTT--A--G--ACA--A---G--ACAGACA-C--TTT---TC---AA--A-C----T-T---T---T-CAA--G-C-A
gi|32356                      :                  ---CTC-T---T-CA-----A-ATCTAT--A-GC-G-G-G-CTG-------------------------AG--A-G---GTG-GT-C-ACATC---------AA-A-G-TCTA--TT-T----TA-CT---A-A--A-T---A-T---C--------T--C---AA-A-A-AC-T-----A--A-A--A---G--A-----A-CGGCT----CT---AA--G-C-A--T-TC-AT---T-GAA--G-C-AA-AC-G--T--TGC-C-TTGTT
gi|32357                      :                        -T---T-CA-----C-AT---T--A-A--A-G-G-CCG-A-----------------------A---A-TTTTG-G-TT-C-A-------------AA-C-C-T--A--TT-T----T--TTT--A-G--A-T---A-T---C--------T--C---CA-A-A-GC-T--A--A--A-A--A---T--A-----A-T--TGC---TT---AA--G-CAA--T-A--AT---T-GAA--G-
gi|32358                      :                                                              -G-----------------------AG--A-G---G-G-GT-C-A-------------AA-A-G-T--A--TT-T----T--CT---A-A--A-T---A-T---C--------T--C---AA-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---G--A-----A-T--TTG---TA---AA--A-C-A--T-T--AT---T-GAA--G-C-AA-A--G--T--TG--C-TTGTT

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lowQualScore                  :     .     ..   . ...   . ... .  ..... .  ... .. . .. . . . ........................... ... . ... . .  . . .............  . ... .. ..  . .... ..  ... . .. . ... . ... ........ ......  . . .  . .. .. .. . .. ... .. ..... ....   ...  ...  .. . . .. . ..  ... .   .. . .  . .. .. ..  .. .     
lowQualScore                  :     8     11   7 000   1 333 7  66666 4  999 99 4 88 4 7 7 000000000000000000000000000 000 7 222 4 7  4 4 3333333333333  4 444 33 33  4 2222 44  666 7 00 4 999 7 222 22222222 888888  7 7 4  7 11 77 77 4 00 777 00 55555 3333   111  888  88 0 5 55 5 77  333 7   00 5 3  8 88 11 11  77 8     
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Reference ( family-386 )      : GTTT-TAGGGG-CCA-G---CCC-T---T-CA-----A-AT---T--A-A--G-G-G-CTG-G-----------------------AG--A-G---G-G-GT-C-A-------------AA-A-N-T--A--TT-T----T--CT---A-A--A-T---A-T---C--------T--C---AA-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---G--A-----A-T--TTG---TT---AA--G-C-A--T-T--AT---T-GAA--G-C-AA-A--G--T--TG--C-TTGTT
gi|32301                      : GTTT-TAGGGG-CCA-G---CCC-T---T-CA-----A-AT---T--A-G--G-G-G-CT--G-----------------------AT--A-G---G-G-GT-C-C-------------AA-A-C-T--AT-TT-T----T--CT---A-A--A-T---A-T---C--------T--C---AA-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---G--A-----A-C--TTG---TT---AA--G-C-A--T-T--AT---T-GAA--G-C-AA-A--G--T--TG--T-TTGTT
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gi|32333                      : GTTT-TAGGGC-CC--G---CCC-T---T-CA-----ACAT---TAGA-G--G-G-G-CTGAG-----------------------AG--G-G---G-G-TC-C-A-------------AA-G-C-G--A--TT-T----T--CTA--A-A--A-T---A-T---C--------TACC---AA-A-A-
gi|32334                      : GTTT-TAGGG--CCA-T---CCC-T---T-CG-----T-AT---T--A-A--G-----CCG-A-----------------------AA--------G-G-GT-C-A-------------AA-A-AGT--A--TT-T----T--CG---A-T--A-T---A-A---C--------T--A---AA-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---T--A-----A----TTG---TT---AA--G-C-A----T--AA---T-AAA--GCC-AA-A--G-----TG--C--TGTT
gi|32335                      : GTTT-TAGGGG-CTA-C---CCC-C---C-CCCCCC-A-AT---A--A-A--A-A-G-A-G-G-----------------------AGCTA-G---C-G------A-------------AA-A-G-T--A--TT-T----T--CA---A-A--A-----A-T---C--------T--A---AA-A-C-TC-T--A--A--A-G--A---G--A-----A-G--TTG---TC---AA--G-T-A---------------AA--G-C-AA-A--A--T--TG--C-TTGTT
gi|32336                      :  TTT-TAGGGG-CCA-G---CCC-T---T-CA-----A-AT---T--A-G--GCG-G-CT--------------------------AG--A-G---G-G-GT-CCA-------------AA-A-T-T--A--TT-A----T--CT---A-A--AAT---A-T---C--------T--C---AA-A-AAAC-T--A--A--A-A--A---A--A-----A-C--TTG---TT---AA--G-C-A--T-T--AT---T-GAA--G-C-CA-A--G--T--TG--T-TTGTT
gi|32337                      :  TTT-TAGGG---CA-T---CCC-T---T-CG-----T-AT---T--A-A--G-G-A-C---G-----------------------AA--A-G---G-G-GT-C-A-------------AA-A-AGT--A--TT-T----T--TG---A-T--A-T---A-A---C--------T--A---AA-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---T--A-----A-C--TTG---TT---AAG-G-C-A--T-T--AA---T-AAA--G-C-AA-A--G--C--T---C-TTGTT
gi|32338                      :  TTT-CAGGGG-CCA-GGCACCC-T---T-CA-----A-AT---A--A-AC-G-G-G-TCT-G-----------------------AG--A-G---G-A-TC-C-ACTTAGATGTATCCAA-A-C-T--AGTCT-T----T--CT---A-ATCA-TTTTA-T---C--------TT-C---AA-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---G--A-----A-T--T-G---TT---AA--G-C-A--T-T--AT---T-GAA--G-C-AA-A--G--T--TG--C-T
gi|32339                      :  TTT-TAGGGA-CCA-G---TTC-T---T-CA-----A-AT---A--A-A--A-G-G-CCG-A-----------------------AA--A-G---G-G--C-C-A-------------AA-A-G-T--A--TT-T----T--CC---A-A--A-C---A-T---C--------T--A---AA-A-A-A-----A--A--A-A--A---A--A-----
gi|32340                      :   TT-TAGGGG-CCA-T---CCC-T---T-CG-----T-AT---T--A-A--G-G-G-CCG-A-----------------------AA--------G-G-GT-C-A-------------AA-A-G-T--A--TT-T----T--T------G--A-T---A-TAAAC--------T--A---AA-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---T--A-----A-T--TTG---TT---AA--G-C-A--T-TA-AT---T-AAA--G-C-AA-A--G--C--TG--C-TTGTTc
gi|32341                      :   TC-TAAGGG-CCA-G---TCC-T---T-CA-----A-AA---T--A-A--G-G-G-CTG-A-----------------------A---A-G---G-G-GT-C-A-------------AA-A-G-T--A--TT-T----T--CG---A-G--A-T---A-T---C--------T--C---AA-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---T--A-----A-T--TTG---TT---AA--G-C-A--T-T--AA---T-TAA--A-C-AA-A--G--T--TG--C-TTGTT
gi|32342                      :   TT-TAGGGG-CCA-----CCC-T---T-CAC----A-AT---T--A-G--G-G-G-CTG-------------------------AG--A-G---G-G-GT-C-A-------------AATA-T-T--AA-TT-T----T--CT---A-A--A-T---A-T---C--------T--CA--AA-A-A-AC-T--A--AC-A-A--A---G--AT----A-C--TTGC--TT---AA--G-C-A--T-T--AT---T-GAA--G-C-AACA--G--T--TG--T-TTG
gi|32343                      :   TT-TAAGGG-CCA-T---CCCCT---T-CG-----T-AA---T--A-A--T-G-G-CCG-A-----------------------A---A-G---G-G-GT-C-A-------------AA-AGT-T--A--TT-TGCGAT--CT--------A-T---A-A---C--------T--A---AACA-A-AC-T--A--A--ATA--T---T--A-----C-T--TTGGA-TT---AA--G-TAA--T-T--AA---T-AAA--G-C-AA-A--GCTC--TG--T-TTG
gi|32344                      :   TT-TAGGG--CCA-G---CC--T---T-CA-----A--T---T--A-A--G-G-G-CTG-------------------------AG--A-G---G-G--T-C-C-------------AA-A-C-T--A--TT-T-------CT---A-A--A-T---A-T---C--------TA-A---AA-A-A-AC-T-----A--A-A--A---G--A-----A----TTG---TTA--AA--G-C-A--T-TG-AT---T-GAA--G-CAAA-A--G--T--TGCAC-TTGCT
gi|32345                      :   TT-TAGGGG-C-A-G---CCC-T---T-CA-----A--T---T-------G-G-G-CTG-G-----------------------AG--------G-G-GT-C-A-------------CA-A-T-T-----TT-T----T--CT---A-A--A-T---A-T---C--------T--C----A-A-A-AC-T--A--A--A-----------G-----A-C--TTG---TT---AA--GCC-A--T-C--AT---TGGAA--A-C-AA-A--G--T--TG--C-TTGCT
gi|32346                      :   TT-TAGGG--CCA-T---CCC-T---T-CG-----T-AT---G--A-A--G-G-C-C---G-----------------------AA--A-G---G-G--T-C-A-------------AA-A-G-TT-A--TTCT----T--CG---A-T--A-T---A-A---C--------T-------A-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---T--A-----A----TTG---TT---AA--G------T-T--AA---T-AAA--G-C-AA-A--G--C--TG--C-TTGTT
gi|32347                      :   TT-TGGAGG-TCA-G---CCT-T---T-CA-----A-AT---A--A-A--G-G-G-CTG-------------------------AG--A-G---G-G-GT-C-A-------------GA-A-T-T--A--TT-T----T--CT---A-G--A-T---A-T---C--------T--C---AA-A-A-AC-T--G--A--C-A--G---G--A-----A-T--GAG---TT---AA--G-T-A--T-T--AA---T-GAA--G-G-AA-A--A--T--TG--C-TTGTT
gi|32348                      :   TT-TAGGGG-CCA-G---TCC-T---C-CA-----A-AT---A--ATA--G-G-G-CT--G-----------------------AG--A-G---G-G-GC-C-C-------------AA-A-A-T--T--TT-T----T--CT---A-G--A-T---T-T---G--------T--T---AA-A-G-AC-C--G--A--A-
gi|32349                      :   TT-TGAAGG-CCA-G---TAA-T---G-CA-----A--T---T--A-AAGG-G-G-CTG-A-----------------------A---A-G---T-G-GT-C-A-------------GA-A-T-T--A--AA-T----T---T---A-G--A-T---A-T---C--------T--C---AA-A-A-AC-T--A--AAGA-A--A---G--A-----A----TCG---GG---AA--G-T-A--T-TG-ATTAAT-AAA--G-C-AA-A--A--T--TG--C-TT
gi|32350                      :    T-TAGGGGGCCA-G---CC--T---G-CA-----A-AT---T--A-G--G-G-G-CTG-------------------------AG--A-G---G-G-GT-C-A-------------AA-A-A-TTTA--TT-T----T--CT---A-A--A-T---A-T---C--------T--CC--AA-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---G--A-----A-C--TTG---TT---AA--G-C-A--T-T--AT---T-GAA--G-C-AA-A--G--T--TG--T-TTGTT
gi|32351                      :    T-TAGGGC-TCA-G---TCT-TAAAT-CAGCACAA-AT---T--ATG--G-G-G-CTG-AGC---------------------AG--A-G---G-C-GTAC-A-------------CACA-T-T--T--TT-T----T--TTCTAA-A--A-T---A-T---C--------TGGC---AA-A-A-AC-T--A--A--A-ACAA---A--A-----A-TC-TTG---TT---AA--G-C-AA-T-C--AT---T-GAA--G-C-AA-A--G--T--
gi|32352                      :     -TAGGGA-CTA-T---TCC-T---T-CA-----A-AT---A--A-A--G-G-G-CCG-------------------------AG--A-G---T-G-GT-C-A-------------AA-A-G-T--A--TT-T----T--CT---A-G--A-T---A-T---C--------T--T---AA-A-A-GT-G--A--A--T-G--A---G--A-----A-A--TTG---CA---AA--G-C-A--T-T--AT---T-GAA--A-C-AA-A--G--T--TG--C-TTTTT
gi|32353                      :        GGGG-CC--G---CCC-T---T-CA-----A-AT---T--A-G--G-T-G-GTG-GTGTTTCTACCTTTGAAGTCTGAAAG--A-G---G-G-GT-C-A-------------AA-A-A-TC-A--TT-T----T--CA---A-G--A-T---A-T---TCTGCATTGT--C---AC-ATA-AC-T--AGAA--A-A--A---T--A-----A-T--TTG---TT---A---G-C-A--T-T--GT---T-GCA----C-AA-A--G--T--TG--C-TTGTT
gi|32354                      :          GG-CCAAG---CGC-T---T-TA-----A-TT---T--A-A--A-G-G-C---G-----------------------AA--ACG---G-G-GT-C-A-------------AA-A-C-T--A--TT-T----T--CT---A-A--A-T---A-T---C--------T--T---AA-A-A-AC-TA-A--A--A-A--A---G--G-----A-T--TTG---TTA--AA--G-C-A--T-T--AT---T-GAA--G-C-GA-A--G------A--C-TCGTT
gi|32355                      :               A-G---CCC-T---T-CA-----A-AA---T--T-A--G-G-G-CTG-------------------------AG--A-G---G-G-GT-C-C-------------AA-A-C-T--A--TT-T----T--CT---A-A--A-T---A-T---C--------T--C---AA-A-ATACTT--A--G--ACA--A---G--ACAGACA-C--TTT---TC---AA--A-C----T-T---T---T-CAA--G-C-A
gi|32356                      :                  ---CTC-T---T-CA-----A-ATCTAT--A-GC-G-G-G-CTG-------------------------AG--A-G---GTG-GT-C-ACATC---------AA-A-G-TCTA--TT-T----TA-CT---A-A--A-T---A-T---C--------T--C---AA-A-A-AC-T-----A--A-A--A---G--A-----A-CGGCT----CT---AA--G-C-A--T-TC-AT---T-GAA--G-C-AA-AC-G--T--TGC-C-TTGTT
gi|32357                      :                        -T---T-CA-----C-AT---T--A-A--A-G-G-CCG-A-----------------------A---A-TTTTG-G-TT-C-A-------------AA-C-C-T--A--TT-T----T--TTT--A-G--A-T---A-T---C--------T--C---CA-A-A-GC-T--A--A--A-A--A---T--A-----A-T--TGC---TT---AA--G-CAA--T-A--AT---T-GAA--G-
gi|32358                      :                                                              -G-----------------------AG--A-G---G-G-GT-C-A-------------AA-A-G-T--A--TT-T----T--CT---A-A--A-T---A-T---C--------T--C---AA-A-A-AC-T--A--A--A-A--A---G--A-----A-T--TTG---TA---AA--A-C-A--T-T--AT---T-GAA--G-C-AA-A--G--T--TG--C-TTGTT


blockSeqs                     :           GG     GCA   T AAA    GCACA G  CTA GG T AG T     TGGTGTTTCTACCTTTGAAGTCTGAA  GCT   TTT T    T A CTTAGATGTATCC  T AG  TT GT  C GCGA AA  CTA      A TTT   AAA CTGCATTG TTTA        A    GA GA AG T CA AAT AA CAGAC CGG    TTT  TAA  TG C A AT C AA  TAA     GT C A    GG CT TG  CA
blockSeqs                     :           G      G     C G      CCCC  C  A   AG T T  C     TGAGC                       G     .   T    A C CATC           C AG  CT A   C A    T   A        A C     .   G        AAA         T    TT T  C  C .  A   .  T     TT     ATT  A    G  G A AT A A   .       .  C T    C  .  .   T 
blockSeqs                     :           G      .     C G      T     .  .   .  . T  .     TGAG                        G     .   .    . . .              . GT  T  .   . .    A   T        . .     .   .        ACC         .    A  .  .  . .  A   .  .     TC     GA   A    .  C . AG . A   .       .  . A    .  .  .   C 
blockSeqs                     :           G      .     . G      C     .  .   .  . C  .     TGAG                        G     .   .    . . .              . C   C  .   . .    .   .        . .     .   .        GGC         .    G  .  .  . .  .   .  .     T      G    .    .  C . G  . G   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . C  .     TGAG                        G     .   .    . . .              . C   .  .   . .    .   .        . .     .   .        TC          .    A  .  .  . .  .   .  .     T      C    .    .  . . A  . G   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     TGG                         A     .   .    . . .              . T   .  .   . .    .   .        . .     .   .        CA          .    .  .  .  . .  .   .  .     C      .    .    .  . . .  . C   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     TGC                         A     .   .    . . .              . T   .  .   . .    .   .        . .     .   .        AA          .    .  .  .  . .  .   .  .     C      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           C      .     . .      .     .  .   .  . .  .     TGA                         A     .   .    . . .              . G   .  .   . .    .   .        . .     .   .        CC          .    .  .  .  . .  .   .  .     T      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     CGA                         G     .   .    . . .              . C   .  .   . .    .   .        . .     .   .        C           .    .  .  .  . .  .   .  .     T      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     GCG                         G     .   .    . . .              . C   .  .   . .    .   .        . .     .   .        C           .    .  .  .  . .  .   .  .     T      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     CGA                         A     .   .    . . .              . C   .  .   . .    .   .        . .     .   .        C           .    .  .  .  . .  .   .  .     C      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     TGG                         G     .   .    . . .              . T   .  .   . .    .   .        . .     .   .        C           .    .  .  .  . .  .   .  .     C      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     TGT                         A     .   .    . . .              . A   .  .   . .    .   .        . .     .   .        T           .    .  .  .  . .  .   .  .     T      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     TGA                         G     .   .    . . .              . G   .  .   . .    .   .        . .     .   .        T           .    .  .  .  . .  .   .  .     T      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     CGA                         G     .   .    . . .              . C   .  .   . .    .   .        . .     .   .        C           .    .  .  .  . .  .   .  .     T      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     CGA                         G     .   .    . . .              . C   .  .   . .    .   .        . .     .   .        C           .    .  .  .  . .  .   .  .     C      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     CTG                         G     .   .    . . .              . T   .  .   . .    .   .        . .     .   .        A           .    .  .  .  . .  .   .  .     C      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     CGA                         G     .   .    . . .              . C   .  .   . .    .   .        . .     .   .        T           .    .  .  .  . .  .   .  .     C      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     CGA                         G     .   .    . . .              . T   .  .   . .    .   .        . .     .   .        T           .    .  .  .  . .  .   .  .     T      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     TGA                         A     .   .    . . .              . T   .  .   . .    .   .        . .     .   .        C           .    .  .  .  . .  .   .  .     T      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     CGA                         G     .   .    . . .              . G   .  .   . .    .   .        . .     .   .        C           .    .  .  .  . .  .   .  .     T      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     TGG                         G     .   .    . . .              . G   .  .   . .    .   .        . .     .   .        C           .    .  .  .  . .  .   .  .     T      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     TGA                         G     .   .    . . .              . A   .  .   . .    .   .        . .     .   .        C           .    .  .  .  . .  .   .  .     C      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     CGA                         G     .   .    . . .              . T   .  .   . .    .   .        . .     .   .        C           .    .  .  .  . .  .   .  .     T      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     TG                          G     .   .    . . .              . A   .  .   . .    .   .        . .     .   .        C           .    .  .  .  . .  .   .  .     C      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     TG                          G     .   .    . . .              . G   .  .   . .    .   .        . .     .   .        T           .    .  .  .  . .  .   .  .     T      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     CA                          A     .   .    . . .              . T   .  .   . .    .   .        . .     .   .        C           .    .  .  .  . .  .   .  .     T      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           C      .     . .      .     .  .   .  . .  .     TG                          G     .   .    . . .              . T   .  .   . .    .   .        . .     .   .        C           .    .  .  .  . .  .   .  .     G      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     TG                          G     .   .    . . .              . C   .  .   . .    .   .        . .     .   .        C           .    .  .  .  . .  .   .  .     C      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     TG                          G     .   .    . . .              . G   .  .   . .    .   .        . .     .   .        C           .    .  .  .  . .  .   .  .     C      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     TG                          A     .   .    . . .              . G   .  .   . .    .   .        . .     .   .        C           .    .  .  .  . .  .   .  .     T      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           A      .     . .      .     .  .   .  . .  .     TA                          G     .   .    . . .              . C   .  .   . .    .   .        . .     .   .        C           .    .  .  .  . .  .   .  .     T      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     TG                          A     .   .    . . .              . C   .  .   . .    .   .        . .     .   .        A           .    .  .  .  . .  .   .  .     T      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     TG                          G     .   .    . . .              . G   .  .   . .    .   .        . .     .   .        A           .    .  .  .  . .  .   .  .     C      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     TG                          A     .   .    . . .              . T   .  .   . .    .   .        . .     .   .        C           .    .  .  .  . .  .   .  .     T      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     CA                          A     .   .    . . .              . C   .  .   . .    .   .        . .     .   .        A           .    .  .  .  . .  .   .  .     C      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     TG                          G     .   .    . . .              . G   .  .   . .    .   .        . .     .   .        A           .    .  .  .  . .  .   .  .     T      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     GG                          G     .   .    . . .              . G   .  .   . .    .   .        . .     .   .        A           .    .  .  .  . .  .   .  .     C      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     TG                          G     .   .    . . .              . G   .  .   . .    .   .        . .     .   .        C           .    .  .  .  . .  .   .  .     A      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     TG                          A     .   .    . . .              . T   .  .   . .    .   .        . .     .   .        A           .    .  .  .  . .  .   .  .     T      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           C      .     . .      .     .  .   .  . .  .     TG                          G     .   .    . . .              . C   .  .   . .    .   .        . .     .   .        C           .    .  .  .  . .  .   .  .     T      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           A      .     . .      .     .  .   .  . .  .     TG                          G     .   .    . . .              . T   .  .   . .    .   .        . .     .   .        C           .    .  .  .  . .  .   .  .     C      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     TG                          G     .   .    . . .              . G   .  .   . .    .   .        . .     .   .        T           .    .  .  .  . .  .   .  .     T      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           G      .     . .      .     .  .   .  . .  .     CG                          G     .   .    . . .              . T   .  .   . .    .   .        . .     .   .        C           .    .  .  .  . .  .   .  .     T      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           .      .     . .      .     .  .   .  . .  .     TG                          G     .   .    . . .              . A   .  .   . .    .   .        . .     .   .        T           .    .  .  .  . .  .   .  .     .      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           .      .     . .      .     .  .   .  . .  .     TG                          G     .   .    . . .              . T   .  .   . .    .   .        . .     .   .        C           .    .  .  .  . .  .   .  .     .      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           .      .     . .      .     .  .   .  . .  .     G                           A     .   .    . . .              . A   .  .   . .    .   .        . .     .   .        T           .    .  .  .  . .  .   .  .     .      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           .      .     . .      .     .  .   .  . .  .     G                           G     .   .    . . .              . T   .  .   . .    .   .        . .     .   .        C           .    .  .  .  . .  .   .  .     .      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           .      .     . .      .     .  .   .  . .  .     G                           G     .   .    . . .              . G   .  .   . .    .   .        . .     .   .        C           .    .  .  .  . .  .   .  .     .      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .   . 
blockSeqs                     :           .      .     . .      .     .  .   .  . .  .     C                           G     .   .    . . .              . A   .  .   . .    .   .        . .     .   .        C           .    .  .  .  . .  .   .  .     .      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .  .     
blockSeqs                     :           .      .     . .      .     .  .   .  . .  .     G                           .     .   .    . . .              . C   .  .   . .    .   .        . .     .   .        C           .    .  .  .  . .  .   .  .     .      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .    .  .        
blockSeqs                     :           .      .     . .      .     .  .   .  . .  .     T                           .     .   .    . . .              . C   .  .   . .    .   .        . .     .   .        .           .    .  .  .  . .  .   .  .     .      .    .    .  . . .  . .   .       .  . .                
blockSeqs                     :           .      .     . .      .     .  .   .  . .  .     G                           .     .   .    . . .              . G   .  .   . .    .   .        . .     .   .        .           .    .  .  .  . .  .   .  .     .      .    .    .  . . .  . .   .       .  .                  
blockSeqs                     :                  .     . .      .     .  .   .  . .  .     G                           .     .   .    . . .              . C   .  .   . .    .   .        . .     .   .        .           .    .  .  .  . .  .   .  .                                                                    
blockSeqs                     :                  .     . .      .     .  .   .  . .  .     G                           .     .   .    . . .              . G   .  .   . .    .   .        . .     .   .        .           .    .  .  .  .                                                                                
blockSeqs                     :                        . .      .     .  .   .  . .  .     .                           .     .   .    . . .              . .   .  .   . .    .   .        . .     .   .        .           .                                                                                              
blockSeqs                     :                                                                                        .     .   .    . . .              . .   .  .                                                                                                                                                       


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