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lowQualScore                  :          44   44 6666 2 222  7777 111 22      0  0   0 222 0 11 3 11         1 11  0 0 22  111111   111  111 3 222 0 3333     0 0 222  0 5555555555 0  11   11  11 11  0 11 0 11 44444 111  5555 0 0 222222         11  1      1  1  1  22 333333 1 2222   44  1 222222222 11     11  1    
lowQualScore                  :          ..   .. .... . ...  .... ... ..      .  .   . ... . .. . ..         . ..  . . ..  ......   ...  ... . ... . ....     . . ...  . .......... .  ..   ..  .. ..  . .. . .. ..... ...  .... . . ......         ..  .      .  .  .  .. ...... . ....   ..  . ......... ..     ..  .    
lowQualScore                  :          88   22 1111 5 111  8888 999 55      9  8   8 111 8 88 0 88         5 00  8 8 88  555555   333  333 0 888 7 1111     7 7 111  8 0000000000 8  00   11  11 11  8 11 8 22 00000 666  6666 9 9 666666         44  1      1  1  1  77 333333 1 4444   00  2 666666666 88     99  4    
consensus                     : TGTAACAGA--GAC--A----T-T---TT-C--G---T--GCCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-T-C--TG---G--CAC---GA---C-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG--CC-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A-G----GCC--TG-T-NT-CC-C-A--CACTA--CC-ACAT
Reference ( gi|116328 )       : TGTAACAGA--GAC--A----T-T---TT-C--A---T--GCCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-T-C--TG---A--CAC---AA---C-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG--CC-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A-G----GCC--TG-T-TT-TC-T-A--CACTA--CC-ACAT
gi|116329                     : TGTAACAGA--GAC--A----T-T---TT-C--A---T--GCCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-T-C--TG---G--CAC---GG---C-A---G-A----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG--CC-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A------GCC--TG-T-TT-TC-T-A--CACTA--CC-ACAT
gi|116331                     : TGTAACAGA--GAC--A----T-T---TT-C--A---T--GCCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-T-C--TG---A--CAC---AA---C-A---G-T----CCAGT-G------C-T----------A-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG---C-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A-G----GCC--TG-T-TT-TC-T-A--CACTA---C-ACATt
gi|116332                     : TGTAACAGA--GAC--A----G-G---TT-T--G---T--GTCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCAGGA-A--CC-T-C--TG---G--CAC---AG---C-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG--CC-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A-G----GCC--TG-T-TT-TC-T-A--CACTA--CC-ACAT
gi|116330                     : TGTAACAGA--GAC--A----T-T---TT-C--A---T----CTCTTGC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-T-C--TG---G--CAC---GG---C-A---G-A----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG--CC-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A-G----GCC--TG-T-TT-TC-TCA--CACTA--CC-ACATt
gi|116333                     : TGTAACAGA--AAC--A----GGT---TT-G--G---T--GCCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-T-C--TG---A--CAC---AA---C-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CT--GATCACG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG--CC-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A-G----GCC--TGTT-TT-TC-TAA--CACTA--CA-ACATt
gi|116335                     : TGTAAGAGA--GAT--A----G-G---TT-T--G---T--GTCTCA-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCGGA-A--CC-T-C--TG---A--CAC---AA---C-A---G-T----ACAGT-G-T---TC-T----------A-CT--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-G------ACCCACTAG--CC-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A-G----GCC--TG-T-TT-TC-T-A--CCCTA--CC-ACAt
gi|116337                     : TGTAACAGA--GAC--A----T-T---TT-C--A---T--GCCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAAAC-GGG-A--C--T-C--TG------CAC---AC---C-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------AACC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG--CC-AGAGCT-GA-TA-GG--A------A-G----GCC--TG-T-AT-CA-C-A--CACTG--CC-ACA
gi|116338                     : TGTAACAGA--GAC--A----T-T---TA-C--A---T--GCCTCT-GC-TGA-G---G-A--TGC--GAACCCGGGGA--CC-T-C--TG---A--CAC---AA---C-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T--------ACGCACTAG--CC-AGAGCT-AG-TATGG--A------A-G----GCC--TG-T-AA-CA-C-A--CACTG---C-ACAT
gi|116334                     : TGTAACAGA--AAC--A----GAT---TT-G--T---T--GCCTCT-GC-TGA-G---GGA--T-C--GAACC-GGG-A--CC-T-C--TA---C--CAC---A----C-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------C-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG---C-AGAGCT-AG-TA-G----------A-G----GCC--TG-T-TT-TC-T-A--CACTA--CC-ACATt
gi|116340                     : TGTAACAGA--GAC--A----T-T---TTTC--A---T--GCTTCT-GC-TGG-G---A-T--T-T--GTTCCCGGG-------T-C--CA---G--CAC---AA---C-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCAGTAG--CC-AGAGCT-AG-TA-TG--A------A-G----GCC--TG-T-AT-CA-C-A--CACTG--CC-t
gi|116339                     : TGTAACAGA--GAC--AA---T-T---TT-C--A---T--GTCTCT-GA-TGA-G---A-T--T-T--GAACCTGGG-T--CC-T-C--TG---G--CAC---AA---C-A---G-T----CCATA-G-C---TC-T----------A-GT--GAT--CA--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ATCCCCTTG--CC-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A-G----GTC--TG-T-AT-CT-A-A--CACTA--CC-ACAT
gi|116341                     : TGTAACAGA--GAC--A----T-T---TT-C--A---T--GTCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-CT-GAACCCGGGAA--CC-T-CCTTG---G--CAC---GG---C-AG--G-T----CCAGT---CTCTTC-T----------A-CC--GAT--CGGCA--GC-T----A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG--CCAAGAGCT-AG-TA-GG--A------A-A----GGC--TG-T-AC-CA-C-A--CACTG--CCAACATt
gi|116336                     : TGTAAGAGAT-GAT--A----G-G---TT-T--G---T--GTCTCA-G--TGC-G---G-A--T-C--GAACCCGGA-A--CC-T-CC-TG---AA-CAC---AA---C-A---G-T----ACAGT-G-T---TCAT----------A-C---GAT--CG--A--GC-T--ATA--A-----G---GG----T-T-G------ACCCACTAG--CC-AGAGC--AG-TA-GG--A------A-A----GCC--TG-T-TT-TC-T-A--CCCTA--CC-ACAt
gi|116342                     : TGTTACAGC--GAC--A----T-T---TT-C--G---TT-GTCTCT-GG-TGG-G---A-T--T-T--GAATCCGGG-C--CT-T-C--TC---G--CAC---GA---T-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CC--GAC--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GA----T-T-A------ACGTACTCG--CC-ACAGCT-AG-TA-GG--A------A-G----GCC--TG-T-AT-CT-C-G--CACTG--CC-ACAct
gi|116345                     : TGTAACAGA--GGCT-A----G-T---TT----A---T--CCCTCT-GC-TGA-G---A-A--T-C--GAACCCGGT-A--CC-T-T--TG---G--CAC---GA---T-A---G-T----GCAGT-G-A---TC-T----------A-GT--GAT--TG--A--GT-T--A-ATCT-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG--CC-CGAGTT-AG-TA-CG--A------A-G----GC
gi|116343                     : TGTAACAGA--AAC--A----T-T---TT-TTTA---T--GTC----GC-TGA-T---G-AATT-T--GAACCCAGG----TT-T-C--TG---G--TAC---AA---C-T---G-T----CTAGT-T-C---TC-T----------A-CC--GA----------GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACAAG--CC-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A-G--------------TA-TC-TAA--CACTG--CG-ACAT
gi|116346                     : TGTAACAGA--GA---A----T-G---GTAT--G---T--GCCTCT-GT-GGA-G---A-A--T-C--GAACCCAGG-A--CC-T-C--AA---G--CAC---GA---C-A---G-TTCAGCTAGT-G-C---TT-T----------A-CCTGAAT--CA--A--GC-T--A-A--A-----G---GGTTAAT-T-A------ACGCACTAG--CC-AGAGTT-AA-TA-AG--A------A-G----GCC--t
gi|116347                     : TGTTACAGT--GAC--A----T-T---CC-C--A------GTCTCT-GT-TGG-G---A-T--T-T--GAACTTGGG-GGCCC-T-C--TC---G--CAC---GA---T-A---G-T----CCAAT-G-C---TC-T----------A-CC--GAT--CG--G--AC-T--A------------------------A------ACCTACTTA--CC-AGAGGT-AA-TA-GG--A------A-GCTATGCC--TG-T-AT-CT-C-G--CACTA--CC-TCAatggaacacaactacatt
gi|116348                     : TGTAACAGA--GAC--AAGTAT-A---TA-T--A---T--GCCTCT-AC-TGA-G---G-A--T-C--AAGCCCGGG-A--CC-C-C--AG---G--CAC---AG---C-A---G-T----CCAGT-G-G---TC-T----------A-CC--AAT--CC--A--GC-
gi|116349                     : TGTAACAGA--GAC--A----G-G---TT-T--A---T--TCCTCT-GC-TGA-GT--A-A--A-C--AAACCCAGG-T--CC-T-C--TG---G--CAC---AA---T-A---G-T----CCAAT-G-C---
gi|116350                     : TGTCACGGA--GGC--A----T-T---TTAC--A---T--GCATAT-GA-TG--G---A-A--T-TTTGAACCCTG--A--CCAT-C--TG---G--CTC---GA---C-A---T-T----CCAGT-A-C---TC-T----------A-CC--GAT--TG--A--GC-T--G-T--A-----G---G
gi|116351                     : TGTAACACA--TACT-G----T-G---TT--------T--GCATCT-GA-TGA-G---A-A--T-T--GAACTTGCG-A--CC-T-C--TA---T--TAC---GT---C-A---G-T----GCAGT-G-C---AC-T----------T-CT--GAT--CG--A--GG-T--C-A--A-----G---GT----T-C-A------GCCCATTAA--C
gi|116344                     : TGTAACAGA--AAC--A----T-T---TT-T--T---TTGGCCTCT-GA-TGG-G---A-T--T-T--GAACC------------------------------AA---C------------CCAGC-G-C---TC-T----------A-CT--AAT--CG--A--GC-T--A-A--AAACTGG---GG----T-T-G------AC
gi|116353                     : TGTAACAGA--GAC--A----G-G---TT-T--G---T--GA-TCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCGGG-
gi|116352                     : TGAAACAGA--GACTGA----C-T---T-----A---A--GCCTCA-GT-TGA-G---A-G--T-C---AACTCTAG-A--TC-T-C--TG---G--TAC---AA---C-A---G-T----CCA-T-G-CA--TC-T----------A-CC--
gi|116354                     : TGTCACAGA--GAC--A----T-T---TT-C--A---T--GTCTCT-GC-TG--G---G-A--T-
gi|116355                     :   TAATGGATGGAC--A----T-T---TTAC--A---T--GCATCT-GA-TGC-A---A-T--T-T--GAACTTGGA-T--CC-T-C--TG---G--CAT---AA---C-A---G-T----CCAGT-G-T---TC-T----------G-CC--AAT--TG--A--GC-T--T-T--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAA--CC-ATAGGT-AG-TA-GG--A------A-T----GCC--TG-T-AT-AT-C-A--CACTA--CC-ACAT
gi|116356                     :   TAATGGATGGAC--A----T-T---TTAC--A---T--GCATCT-GA-TCA-A---T----T-T--GAACTTGGA-T--CC-T-C--TG---G--CAT---AA---C-A---G-T----CCAGT-G-T---TC-T----------G-----AAT--TG--A--GC-T--T-T--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAA--CC-ATAGGT-AG-TA-GG--A------A-T----GCC--TG-T-AT-AT-C-A--CACTA--CC-ACATt
gi|116357                     :   TAAC-GA--GAC--AAGT-T-T---TT-C--A------GT-TCT-GA-TGA-G---A-T--T-T--GAAACTGGG-T--CC-T-C--TG---G--CAC---AA---C-A---G-T----C--AT-G-C---TC-T----------A-C---GAT--CG--A--TC-T--A-A--AA----G---GG--------A------ATCCACTTG--CC-AGAGCT-AG-TA-GA--A------A-G----GCC--TG-G-TA-CC-T-AACCACTAACTC-ACATt
gi|116359                     :      CAGA--GAC--A----T-T---TT-C--A---T--GCCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAATCCGGG-A--CC-TGC--TG---G--CAC----A---C-G---G-CGTTACCAGT-GCC---TC-TATCTTTTATCA-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GGTGA-T-T-A------A-CCGCTAG--CC-AGAGCT-TG-TA-GG--A------A-G----GCC--t
gi|116360                     :       AGA--GAG--A----T-TAGGTT-T--G---T--GTCTCA-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCGGA-A--CC-T-C--TG---A--TAC---AA---C-A---GAT----CCAGT-G-T---TC-T----------A--C--GAT--CG--A--GC-T--T-A--A---------GG----T-T-G------ACCCACTAG--CC-AGAGC--AG-TA-GGA-A------A-G----GCC--TG-T-TT-TC-T-A--CCCT
gi|116361                     :               --A----T-C---TT-C--ACCTT--CCCTTT-GC-TAG-A---G-A--T-C--GAACCCAGA-A--CC-T-C--TC---G--CAC---AA---A-AG--G-T----CCAGT-A-T---AA-T----------G-CC--GAT--CG--A--TC-A--A-A--A-----G---GG----G-T-A------ACACACTAG--
gi|116363                     :                         ---TT-T--G---T--GCCTCT-GCCTGA-GTGGA-A--T-C--GAACCCTGG-A--CC-T-C--TG---A--CAC---AA---C-A-----T----CCAGT-G-C---TC------------A-AC--GAT--CG--AAGACAT--A-A--A-----GAGAGG----CGT-A------ACCCACTTATCCC-AGAGCTAAG-TA--G--A------A-G----GCC--TG-T-TT-CT-C-A--CAGTA--AC-
gi|116364                     :                         ---TT-T--G---T--GCCTCT-GC-TGG-G---A-A--T-C--AAACACAGG-G--CC-T-C--TG---G--CAC---AA---C-A---G-T----TCAGT-G-T---TT-T----------A-CC--AAC--CA--A--TA-T--A-G--A---------GG----T-T-A------TTCCACTAG--CC-AG
gi|116366                     :                              -C--G---T--GTCTCT-GC-TAA-G---G-A--T-T--AAGCCTAGG-A--TC-T-C--T------------------------G-T----CCAAT-C-A---TT-T----------A-CC--GAT--CA--A--GG-TTAA-A--A-----G---GGTAAAT-T-A------AACCACTAA--CC-AGAGCG-AG-TA-GGTCA------A-G----GTCA-TG-TATC-TT-A-A--CACTA--CC-
gi|116367                     :                                   ---T--GTCTCT-AG-TG--G---G-A--T-T--TGACCTGGG-C--CC-T-C--TC---G--CAC---GA---T-A---G-T----CCAGTTG-C---TC-G----------A-CC--GAT--CG--A--GC----A-A--A-----G---GA----T-TCA------ACCTACTCG--CC-AAAATT-AG-TA-GG--A------A-T----GCC--TG-TATC-TT-C-G--CACTG--CC-ACAgaatt
gi|116368                     :                                   ---T--GTCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCAGG-A--CC-T-C--TG---G--CATGAAGA---C-A---G-T-----CAGT-A-T---TT-T----------A-CA--TAT--TG--A--GC-C--A-A--A-----G---GT----T-T-A------A
gi|116369                     :                                       --GCCTCT-GT-TGA-G---G-A--T-C--GAACCTATG-A--TC-T-C--TG---G--CAT---AA---C-T---A-T----CTAGT-G-
gi|116370                     :                                           CCCT-G---GA-G---G-A--TTC--GAACCCGGG-G--CC-T-G--CA---GTTCAC---AA---A-A----------CCGAT-G-C---TT-T----------A-CC--AAC--TG--A--GC-T--A-A--G-----A---AG----T-T-A------
gi|116362                     :                                          tCTCT-TC-CGA-G--------T-C--AAACCCGAG-A--CC-C-C--AG------CAT---GA---C-A---G-T----CCAGC-G-C---TC-G----------C-AC--AAT--GG--A--GC-T--T-A--A-----
gi|116358                     :                             tttttatttcttctgTTT-GT-TAG-G---A-A--T-C--GAACCCTGG-A--CT-T-CCATG---A--TG-----G---C-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-AC--AAT--CA--A--GC-A--A-A--A-----G---TG----T-T-G------ACAAACAAG--TT-ATAGCG-AA-TA-GA--A------AGG----GCA--TG-T-AT-CT-A-A--CACTG--C
gi|116371                     :                      acaaagactgcctgtcacagatTTT-GA-TGA-G---G-AA-T-C--GAACCAGGG-A--CC-T-C--TG---A--CAC---AA---C-A-----T----TCATT-G-C---CT-C----------A-CA--GAT--TG--A--CT-T--G-C--AT----G---GG----C-T-A------AC
gi|116372                     :                                             CT-GC-TGA-G---G-A--T-T--GAACCCAGG-A--CC-T-G--TG---A--CAT---GA---T-G---G-T----CCAGT-G-
gi|116373                     :                                               -GC-TGA-G---G-A--T-T--AGA-------------T-C--TG---G--CAC---A----------T-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-TC--GAT--CA--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCTCTGG--CC-AGGGCT-AT-CA-AC--ATTCAACA-A----GCCCATG-T-AT-CT-T-A--CACTA--CC-
gi|116374                     :                                               -GC-TGACG---G-A--TTC--GAACTCGGG-A--CC-T-G--CGTTTA--C----------C-A---G-T----CCGAT-G-C---TT-T----------A-CC--TAT--TG--A--GC-T--A-T--G-----A---AG----T-T-A------
gi|116376                     :                                                 C-CGG-G---A-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-C-C--TG------CAT---AA---CTA---G-T----CAGGT-G-C---TC-T----------A-AC--CAC--TG--A--GC-T--A-
gi|116375                     :                                                 C-CGG-G---A-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-C-C--TG------CAT---AA---CTA---G-T----CAGGT-G-C---TC-T----------A-AC--CAC--TG--A--GC-T--A-
gi|116379                     :                                                 C-CGG-G---A-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-C-C--TG------CAT---TA---CTA---G-T----CAGGT-G-C---TC-T----------A-AC--CAC--TG--A--GC-T--A-
gi|116378                     :                                                 C-CGG-G---A-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-C-C--TG------CAT---TA---CTA---G-T----CAGGT-G-C---TC-T----------A-AC--CAC--TG--A--GC-T--A-
gi|116377                     :                                                 C-CGG-G---A-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-C-C--TG------CAT---AATACT-A---G-T----CAGGT-G-C---TC-T----------A-AC--CAC--TG--A--GC-T--A-
gi|116380                     :                                                    GG-G---A-A--T-C--GAACCCAGG-A--CC-C-C--TG--------C---AT---T-A---G-T----CAGGT-G-C---TC-TAAAC------A-CT--GAT--CG--A--GC-T--A-
gi|116381                     :                                                      -G---G-A--TTC--GAACTCGGG-A--CC-T-G--CG---A--CTT---AC---C-A---G-T----CCGAT-G-C---TT-T----------A-CC--TAC--TG--A--GC-T--A-T--A-----A---AG----T-T-A------
gi|116382                     :                                                              --T-C--AAACCCGGG-A--CC-T-C--TG---G--CAC---AA---T-A------------------T---TC-T----------G-CC--GAT--CA--A--AT-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACAAACCAG--CC-AAGGAT-AA-CT-GG--A------A-A----ACCA-TG-T-AT-CT-T-A--CACTA--CC-ACAT
gi|116365                     :                                                                        CCCGGG-T--CC-T-C--TG---G--CAC---AA---C-T---G-T----ACAGT-G-C---TC-T----------A-AC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-A-A------ACCCTCTAG--CT-AGTGCT-AG-TG-GG--A------A-G----GCC--TG-T-AA-AT-C-A--CACTA--CC-ACAt
gi|116383                     :                                               catatctcccagttgattagatacaaaaggG-A--CC-T-C--TG---G--CAC---GA---C-ATCAG-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CT--GAT--CT--G--GT-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTCG--CC-AGAACT-AA-TA-AG--T------A-----------TA-T-GTATC-TAA--CACTA--CC-ATAct
gi|116384                     :                                                                                                --CGC---AG---T-G---G-T----ACACT-A-C---TA-T----------A-C---GGT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-ATACGCCGCCAACTAG--CC-AGAGCT-AG-TA--G--A------A-G----GCC--TG-T-AT-GCAC-A--CACTG--CC-ACA
gi|116385                     :                                                                                                                              T-G-T---TC-T----------A-GC--AAT--TG--A--GT-T--G-A--T-----G---GG----T-T-A------GCCACCTAG--CT-AGAGCC-AG-TA-GG--A------A-G----GCC--TG-
gi|116386                     :                                                                                                                                                     -CT--GAT--CG--A--GC-T--A-A--C-----G---GG----T-G-A------ACTTGGTAA--CC-AGAAGT-AG-TA-GG--A------A-G----CCT--TG-T-AT-CT-C-A--CACTA--CC-ACAT
gi|116387                     :                                                                                                                                                                                                      ------ACCCATTAG--CC-AGAGCT-AGATA--G--A------A-G----GCC--TG-T-AT-CC-C-A--CACT

lowQualScore                  :                           44   44 6666 1 222  7777 33      0  0   0 222 0 11 3 11         1 11  0 0 22 1 11 2222  7777 111 3 222 0 3333     0 0 222  0 4444444444 0  11   11  11 11  0 11 0 11 33333 111  5555 0 0 222222         11  1      1  1  1  22 333333 1 2222   55  1 1 1 66666 11     11  1    
lowQualScore                  :                           ..   .. .... . ...  .... ..      .  .   . ... . .. . ..         . ..  . . .. . .. ....  .... ... . ... . ....     . . ...  . .......... .  ..   ..  .. ..  . .. . .. ..... ...  .... . . ......         ..  .      .  .  .  .. ...... . ....   ..  . . . ..... ..     ..  .    
lowQualScore                  :                           77   22 1111 2 111  9999 66      9  8   8 111 8 88 0 88         5 00  7 7 88 0 88 6666  3333 333 0 777 7 1111     7 7 000  8 9999999999 7  00   00  00 00  8 11 8 22 99999 666  5555 9 9 666666         44  1      1  1  1  66 222222 1 4444   00  2 0 2 55555 77     88  3    
consensus                     :                  TGTAACAGA--GAC--A----T-T---TT-C-GT--GCCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-T-C--TGG--C----AC---GA---C-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG--CC-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A-G----GCC--TG-TAT-C-TC--A--CACTA--CC-ACAT
Reference ( family-377 )      :                  TGTAACAGA--GAC--A----T-T---TT-C-GT--GCCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-T-C--TGG--C----AC---GA---C-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG--CC-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A-G----GCC--TG-TNT-C-CC--A--CACTA--CC-ACAT
gi|116328                     :                  TGTAACAGA--GAC--A----T-T---TT-C-AT--GCCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-T-C--TGA--C----AC---AA---C-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG--CC-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A-G----GCC--TG-TTT-T-CT--A--CACTA--CC-ACAT
gi|116329                     :                  TGTAACAGA--GAC--A----T-T---TT-C-AT--GCCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-T-C--TGG--C----AC---GG---C-A---G-A----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG--CC-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A------GCC--TG-TTT-T-CT--A--CACTA--CC-ACAT
gi|116330                     :                  TGTAACAGA--GAC--A----T-T---TT-C-AT----CTCTTGC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-T-C--TGG--C----AC---GG---C-A---G-A----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG--CC-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A-G----GCC--TGTTTT-C-TC--A--CACTA--CC-ACATt
gi|116331                     :                  TGTAACAGA--GAC--A----T-T---TT-C-AT--GCCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-T-C--TGA--C----AC---AA---C-A---G-T----CCAGT-G------C-T----------A-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG---C-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A-G----GCC--TG-TTT-T-CT--A--CACTA---C-ACATt
gi|116332                     :                  TGTAACAGA--GAC--A----G-G---TT-T-GT--GTCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCAGGA-A--CC-T-C--TGG--C----AC---AG---C-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG--CC-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A-G----GCC--TG-TTT-T-CT--A--CACTA--CC-ACAT
gi|116333                     :                  TGTAACAGA--AAC--A----GGT---TT-G-GT--GCCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-T-C--TGA--C----AC---AA---C-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CT--GATCACG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG--CC-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A-G----GCC--TG-TTT-T-TCTAA--CACTA--CA-ACATt
gi|116334                     :                  TGTAACAGA--AAC--A----G-A---TT-T-GTT-GCCTCT-GC-TGA-G---GGA--T-C--GAACC-GGG-A--CC-T-C--TAC--C----AC----A---C-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------C-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG---C-AGAGCT-AG-TA-G----------A-G----GCC--TG-TTT-T-CT--A--CACTA--CC-ACATt
gi|116335                     :                  TGTAAGAGA--GAT--A----G-G---TT-T-GT--GTCTCA-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCGGA-A--CC-T-C--TGA--C----AC---AA---C-A---G-T----ACAGT-G-T---TC-T----------A-CT--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-G------ACCCACTAG--CC-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A-G----GCC--TG-TTT-T-CT--A--CCCTA--CC-ACAt
gi|116336                     :                  TGTAAGAGAT-GAT--A----G-G---TT-T-GT--GTCTCA-G--TGC-G---G-A--T-C--GAACCCGGA-A--CC-T-CC-TGAA-C----AC---AA---C-A---G-T----ACAGT-G-T---TCAT----------A-C---GAT--CG--A--GC-T--ATA--A-----G---GG----T-T-G------ACCCACTAG--CC-AGAGC--AG-TA-GG--A------A-A----GCC--TG-TTT-T-CT--A--CCCTA--CC-ACA
gi|116337                     :                  TGTAACAGA--GAC--A----T-T---TT-C-AT--GCCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAAAC-GGG-A--C--T-C--TG---C----AC---AC---C-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------AACC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG--CC-AGAGCT-GA-TA-GG--A------A-G----GCC--TG-TAT-C-AC--A--CACTG--CC-ACAct
gi|116338                     :                  TGTAACAGA--GAC--A----T-T---TA-C-AT--GCCTCT-GC-TGA-G---G-A--TGC--GAACCCGGGGA--CC-T-C--TGA--C----AC---AA---C-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T--------ACGCACTAG--CC-AGAGCT-AG-TATGG--A------A-G----GCC--TG-TAA-C-AC--A--CACTG---C-ACAT
gi|116339                     :                  TGTAACAGA--GAC--AA---T-T---TT-C-AT--GTCTCT-GA-TGA-G---A-T--T-T--GAACCTGGG-T--CC-T-C--TGG--C----AC---AA---C-A---G-T----CCATA-G-C---TC-T----------A-GT--GAT--CA--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ATCCCCTTG--CC-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A-G----GTC--TG-TAT-C-TA--A--CACTA--CC-ACATt
gi|116340                     :                  TGTAACAGA--GAC--A----T-T---TTTC-AT--GCTTCT-GC-TGG-G---A-T--T-T--GTTCCCGGG-------T-C--CAG--C----AC---AA---C-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCAGTAG--CC-AGAGCT-AG-TA-TG--A------A-G----GCC--TG-TAT-C-AC--A--CACTG--CC-t
gi|116341                     :                  TGTAACAGA--GAC--A----T-T---TT-C-AT--GTCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-CT-GAACCCGGGAA--CC-T-CCTTGG--C----AC---GG---C-AG--G-T----CCAGT---CTCTTC-T----------A-CC--GAT--CGGCA--GC-T----A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG--CCAAGAGCT-AG-TA-GG--A------A-A----GGC--TG-TAC-C-AC--A--CACTG--CCAACAT
gi|116342                     :                  TGTTACAGC--GAC--A----T-T---TT-C-GTT-GTCTCT-GG-TGG-G---A-T--T-T--GAATCCGGG-C--CT-T-C--TCG--C----AC---GA---T-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CC--GAC--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GA----T-T-A------ACGTACTCG--CC-ACAGCT-AG-TA-GG--A------A-G----GCC--TG-TAT-C-TC--G--CACTG--CC-ACAt
gi|116343                     :                  TGTAACAGA--AAC--A----T-T---TT-T-TT--ATGTC--GC-TGA-T---G-AATT-T--GAACCCAGG----TT-T-C--TGG--T----AC---AA---C-T---G-T----CTAGT-T-C---TC-T----------A-CC--GA----------GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACAAG--CC-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A------------G-TAT-C-TA--A--CACTG--CG-ACAT
gi|116344                     :                  TGTAACAGA--AAC--A----T-T---TT-T-TTTGGCCTCT-GA-TGG-G---A-T--T-T--GAACC--------------------------------------A---A-C----CCAGC-G-C---TC-T----------A-CT--AAT--CG--A--GC-T--A-A--AAACTGG---GG----T-T-G------ACt
gi|116345                     :                  TGTAACAGA--GGCT-A----G-T---TT---AT--CCCTCT-GC-TGA-G---A-A--T-C--GAACCCGGT-A--CC-T-T--TGG--C----AC---GA---T-A---G-T----GCAGT-G-A---TC-T----------A-GT--GAT--TG--A--GT-T--A-ATCT-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG--CC-CGAGTT-AG-TA-CG--A------A-G----GC
gi|116346                     :                  TGTAACAGA--GA---A----T-G---GTAT-GT--GCCTCT-GT-GGA-G---A-A--T-C--GAACCCAGG-A--CC-T-C--AAG--C----AC---GA---C-A---G-TTCAGCTAGT-G-C---TT-T----------A-CCTGAAT--CA--A--GC-T--A-A--A-----G---GGTTAAT-T-A------ACGCACTAG--CC-AGAGTT-AA-TA-AG--A------A-G----GCCA-TG-GA--------A--CACAA--CT-ACAT
gi|116347                     :                  TGTTACAGT--GAC--A----T-T---CC-C-A---GTCTCT-GT-TGG-G---A-T--T-T--GAACTTGGG-GGCCC-T-C--TCG--C----AC---GA---T-A---G-T----CCAAT-G-C---TC-T----------A-CC--GAT--CG--G--AC-T--A------------------------A------ACCTACTTA--CC-AGAGGT-AA-TA-GG--A------A-GCTATGCC--TG-TAT-C-TC--G--CACTA--CC-TCAt
gi|116348                     :                  TGTAACAGA--GAC--AAGTAT-A---TA-T-AT--GCCTCT-AC-TGA-G---G-A--T-C--AAGCCCGGG-A--CC-C-C--AGG--C----AC---AG---C-A---G-T----CCAGT-G-G---TC-T----------A-CC--AAT--CC--A--GC-
gi|116349                     :                  TGTAACAGA--GAC--A----G-G---TT-T-AT--TCCTCT-GC-TGA-GT--A-A--A-C--AAACCCAGG-T--CC-T-C--TGG--C----AC---AA---T-A---G-T----CCAAT-G-C---
gi|116350                     :                  TGTCACGGA--GGC--A----T-T---TTAC-AT--GCATAT-GA-TG--G---A-A--T-TTTGAACCCTG--A--CCAT-C--TGG--C----TC---GA---C-A---T-T----CCAGT-A-C---TC-T----------A-CC--GAT--TG--A--GC-T--G-T--A-----G---G
gi|116351                     :                  TGTAACACA--TACT-G----T-G---TT----T--GCATCT-GA-TGA-G---A-A--T-T--GAACTTGCG-A--CC-T-C--TAT--T----AC---GT---C-A---G-T----GCAGT-G-C---AC-T----------T-CT--GAT--CG--A--GG-T--C-A--A-----G---GT----T-C-A------GCCCATTAA--C
gi|116352                     :                  TGAAACAGA--GACTGA----C-T---T----AA--GCCTCA-GT-TGA-G---A-G--T-C---AACTCTAG-A--TC-T-C--TGG--T----AC---AA---C-A---G-T----CCA-T-G-CA--TC-T----------A-CC--
gi|116353                     :                  TGTAACAGA--GAC--A----G-G---TT-T-GT--GA-TCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCGGG-
gi|116354                     :                  TGTCACAGA--GAC--A----T-T---TT-C-AT--GTCTCT-GC-TG--G---G-A--T-
gi|116355                     :                    TAATGGATGGAC--A----T-T---TTAC-AT--GCATCT-GA-TGC-A---A-T--T-T--GAACTTGGA-T--CC-T-C--TGG--C----AT---AA---C-A---G-T----CCAGT-G-T---TC-T----------G-CC--AAT--TG--A--GC-T--T-T--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAA--CC-ATAGGT-AG-TA-GG--A------A-T----GCC--TG-TAT-A-TC--A--CACTA--CC-ACAT
gi|116356                     :                    TAATGGATGGAC--A----T-T---TTAC-AT--GCATCT-GA-TCA-A---T----T-T--GAACTTGGA-T--CC-T-C--TGG--C----AT---AA---C-A---G-T----CCAGT-G-T---TC-T----------G-----AAT--TG--A--GC-T--T-T--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAA--CC-ATAGGT-AG-TA-GG--A------A-T----GCC--TG-TAT-A-TC--A--CACTA--CC-ACATt
gi|116357                     :                    TAAC-GA--GAC--AAGT-T-T---TT-CAGT-----TCT-GA-TGA-G---A-T--T-T--GAAACTGGG-T--CC-T-C--TGG--C----AC---AA---C-A---G-T----C--AT-G-C---TC-T----------A-C---GAT--CG--A--TC-T--A-A--AA----G---GG--------A------ATCCACTTG--CC-AGAGCT-AG-TA-GA--A------A-G----GCC--TG-GTA-C-CT--AACCACTAACTC-ACATt
gi|116358                     :                                                         TTT-GT-TAG-G---A-A--T-C--GAACCCTGG-A--CT-T-CCATG--------AT---GG---C-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-AC--AAT--CA--A--GC-A--A-A--A-----G---TG----T-T-G------ACAAACAAG--TT-ATAGCG-AA-TA-GA--A------AGG----GCA--TG-TAT-C-TA--A--CACTG--Ct
gi|116359                     : acaaagactgcctgtcacagatCAGA--GAC--A----T-T---TT-C-AT--GCCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAATCCGGG-A--CC-TGC--TGG--C----AC----A---C-G---G-CGTTACCAGT-GCC---TC-TATCTTTTATCA-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GGTGA-T-T-A------A-CCGCTAG--CC-AGAGCT-TG-TA-GG--A------A-G----GCC--
gi|116360                     :                        AGA--GAG--A----T-TAGGTT-T-GT--GTCTCA-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCGGA-A--CC-T-C--TGA--T----AC---AA---C-A---GAT----CCAGT-G-T---TC-T----------A--C--GAT--CG--A--GC-T--T-A--A---------GG----T-T-G------ACCCACTAG--CC-AGAGC--AG-TA-GGA-A------A-G----GCC--TG-TTT-T-CT--A--CCCT
gi|116361                     :                                                       CCTTT-GC-TAG-A---G-A--T-C--GAACCCAGA-A--CC-T-C--TCG--C----AC---AA---A-AG--G-T----CCAGT-A-T---AA-T----------G-CC--GAT--CG--A--TC-A--A-A--A-----G---GG----G-T-A------ACACACTAG--
gi|116362                     :                                            atcttcaccttcCTCT-TC-CGA-G--------T-C--AAACCCGAG-A--CC-C-C---AG--C----AT---GA---C-A---G-T----CCAGC-G-C---TC-G----------C-AC--AAT--GG--A--GC-T--T-A--A-----
gi|116363                     :                           tttttatttcttctg---TT-T-GT--GCCTCT-GCCTGA-GTGGA-A--T-C--GAACCCTGG-A--CC-T-C--TGA--C----AC---AA---C-A-----T----CCAGT-G-C---TC------------A-AC--GAT--CG--AAGACAT--A-A--A-----GAGAGG----CGT-A------ACCCACTTATCCC-AGAGCTAAG-TA--G--A------A-G----GCC--TG-TTT-C-TC--A--CAGTA--AC-
gi|116364                     :                                          ---TT-T-GT--GCCTCT-GC-TGG-G---A-A--T-C--AAACACAGG-G--CC-T-C--TGG--C----AC---AA---C-A---G-T----TCAGT-G-T---TT-T----------A-CC--AAC--CA--A--TA-T--A-G--A---------GG----T-T-A------TTCCACTAG--CC-AG
gi|116365                     :                                                                                     CCCGGG-T--CC-T-C--TGG--C----AC---AA---C-T---G-T----ACAGT-G-C---TC-T----------A-AC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-A-A------ACCCTCTAG--CT-AGTGCT-AG-TG-GG--A------A-G----GCC--TG-TAA-A-TC--A--CACTA--CC-ACA
gi|116366                     :                 catatctcccagttgattagatacaaaagg-C-GT--GTCTCT-GC-TAA-G---G-A--T-T--AAGCCTAGG-A--TC-T-C--T-------------------------G-T----CCAAT-C-A---TT-T----------A-CC--GAT--CA--A--GG-TTAA-A--A-----G---GGTAAAT-T-A------AACCACTAA--CC-AGAGCG-AG-TA-GGTCA------A-G----GTCA-TG-TAT-C-TTA-A--CACTA--CC-ct
gi|116367                     :                                                   T--GTCTCT-AG-TG--G---G-A--T-T--TGACCTGGG-C--CC-T-C--TCG--C----AC---GA---T-A---G-T----CCAGTTG-C---TC-G----------A-CC--GAT--CG--A--GC----A-A--A-----G---GA----T-TCA------ACCTACTCG--CC-AAAATT-AG-TA-GG--A------A-T----GCC--TG-TAT-CTTC--G--CACTG--CC-ACAgaatt
gi|116368                     :                                                   T--GTCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCAGG-A--CC-T-C--TGG--C----ATGAAGA---C-A---G-T-----CAGT-A-T---TT-T----------A-CA--TAT--TG--A--GC-C--A-A--A-----G---GT----T-T-A------A
gi|116369                     :                                                    --GCCTCT-GT-TGA-G---G-A--T-C--GAACCTATG-A--TC-T-C--TGG--C----AT---AA---C-T---A-T----CTAGT-G-
gi|116370                     :                                                        CCCT-G---GA-G---G-A--TTC--GAACCCGGG-G--CC-T-G--CAGTTC----AC---AA---A-A----------CCGAT-G-C---TT-T----------A-CC--AAC--TG--A--GC-T--A-A--G-----A---AG----T-T-A------
gi|116371                     :                                                        tTTT-GA-TGA-G---G-AA-T-C--GAACCAGGG-A--CC-T-C--TGA--C----AC---AA---C-A-----T----TCATT-G-C---CT-C----------A-CA--GAT--TG--A--CT-T--G-C--AT----G---GG----C-T-A------AC
gi|116372                     :                                                          CT-GC-TGA-G---G-A--T-T--GAACCCAGG-A--CC-T-G--TGA--C----AT---GA---T-G---G-T----CCAGT-G-
gi|116373                     :                                                            -GC-TGA-G---G-A--T-T--AGA-------------T-C--TGG--C----AC----------A---T-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-TC--GAT--CA--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCTCTGG--CC-AGGGCT-AT-CA-AC--ATTCAACA-A----GCCCATG-TAT-C-TT--A--CACTA--CC-
gi|116374                     :                                                            -GC-TGACG---G-A--TTC--GAACTCGGG-A--CC-T------G--CGTTTAC--------C-A---G-T----CCGAT-G-C---TT-T----------A-CC--TAT--TG--A--GC-T--A-T--G-----A---AG----T-T-A------
gi|116375                     :                                                              C-CGG-G---A-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-C-C--T-G--C----AT---AA---CTA---G-T----CAGGT-G-C---TC-T----------A-AC--CAC--TG--A--GC-T--A-
gi|116376                     :                                                              C-CGG-G---A-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-C-C--T-G--C----AT---AA---CTA---G-T----CAGGT-G-C---TC-T----------A-AC--CAC--TG--A--GC-T--A-
gi|116377                     :                                                              C-CGG-G---A-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-C-C--T-G--C----AT---AATACT-A---G-T----CAGGT-G-C---TC-T----------A-AC--CAC--TG--A--GC-T--A-
gi|116378                     :                                                              C-CGG-G---A-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-C-C--T-G--C----AT---TA---CTA---G-T----CAGGT-G-C---TC-T----------A-AC--CAC--TG--A--GC-T--A-
gi|116379                     :                                                              C-CGG-G---A-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-C-C--T-G--C----AT---TA---CTA---G-T----CAGGT-G-C---TC-T----------A-AC--CAC--TG--A--GC-T--A-
gi|116380                     :                                                                 GG-G---A-A--T-C--GAACCCAGG-A--CC-C-C--T-G--C----AT--------T-A---G-T----CAGGT-G-C---TC-TAAAC------A-CT--GAT--CG--A--GC-T--A-
gi|116381                     :                                                                   -G---G-A--TTC--GAACTCGGG-A--CC-T-G--CGA--CTT--AC--------C-A---G-T----CCGAT-G-C---TT-T----------A-CC--TAC--TG--A--GC-T--A-T--A-----A---AG----T-T-A------
gi|116382                     :                                                                           --T-C--AAACCCGGG-A--CC-T-C--TGG--C----AC---AA---T-A------------------T---TC-T----------G-CC--GAT--CA--A--AT-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACAAACCAG--CC-AAGGAT-AA-CT-GG--A------A-A----ACCA-TG-TAT-C-TT--A--CACTA--CC-ACAT
gi|116383                     :                                                                                          G-A--CC-T-C--TGG--C----AC---GA---C-ATCAG-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CT--GAT--CT--G--GT-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTCG--CC-AGAACT-AA-TA-AG--T------A-------TA--TG-TAT-C-TA--A--CACTA--CC-ATAt
gi|116384                     :                                                                                                                              ---G-T----ACACT-A-C---TA-T----------A-C---GGT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-ATACGCCGCCAACTAG--CC-AGAGCT-AG-TA--G--A------A-G----GCC--TG-TATGC-AC--A--CACTG--CC-ACA
gi|116385                     :                                                                                                                                     cgcagtgT-G-T---TC-T----------A-GC--AAT--TG--A--GT-T--G-A--T-----G---GG----T-T-A------GCCACCTAG--CT-AGAGCC-AG-TA-GG--A------A-G----GCC--TG-
gi|116386                     :                                                                                                                                                                   -CT--GAT--CG--A--GC-T--A-A--C-----G---GG----T-G-A------ACTTGGTAA--CC-AGAAGT-AG-TA-GG--A------A-G----CCT--TG-TAT-C-TC--A--CACTA--CC-ACAT
gi|116387                     :                                                                                                                                                                                                                    ------ACCCATTAG--CC-AGAGCT-AGATA--G--A------A-G----GCC--TG-TAT-C-CC--A--CACT

lowQualScore                  :                           44   44 6666 1 222  7777 33      0  0   0 222 0 11 3 11         1 11  0 0 22 1 11 2222  7777 111 3 222 0 3333     0 0 222  0 4444444444 0  11   11  11 11  0 11 0 11 33333 111  5555 0 0 222222         11  1      1  1  1  22 333333 1 2222   55 1 1   1 33333 1     11  1    
lowQualScore                  :                           ..   .. .... . ...  .... ..      .  .   . ... . .. . ..         . ..  . . .. . .. ....  .... ... . ... . ....     . . ...  . .......... .  ..   ..  .. ..  . .. . .. ..... ...  .... . . ......         ..  .      .  .  .  .. ...... . ....   .. . .   . ..... .     ..  .    
lowQualScore                  :                           77   22 1111 2 111  9999 66      9  8   8 111 8 88 0 88         5 00  7 7 88 0 88 6666  3333 333 0 777 7 1111     7 7 000  8 9999999999 7  00   00  00 00  8 11 8 22 99999 666  5555 9 9 666666         44  1      1  1  1  66 222222 1 4444   00 2 2   2 55555 2     88  3    
consensus                     :                  TGTAACAGA--GAC--A----T-T---TT-C-GT--GCCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-T-C--TGG--C----AC---GA---C-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG--CC-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A-G----GCC--T-G-TAT-C-TC--A-CACTA--CC-ACAT
Reference ( family-377 )      :                  TGTAACAGA--GAC--A----T-T---TT-C-GT--GCCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-T-C--TGG--C----AC---GA---C-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG--CC-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A-G----GCC--T-G-TAT-C-TC--A-CACTA--CC-ACAT
gi|116328                     :                  TGTAACAGA--GAC--A----T-T---TT-C-AT--GCCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-T-C--TGA--C----AC---AA---C-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG--CC-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A-G----GCC--T-G-TTT-T-CT--A-CACTA--CC-ACAT
gi|116329                     :                  TGTAACAGA--GAC--A----T-T---TT-C-AT--GCCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-T-C--TGG--C----AC---GG---C-A---G-A----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG--CC-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A------GCC--T-G-TTT-T-CT--A-CACTA--CC-ACAT
gi|116330                     :                  TGTAACAGA--GAC--A----T-T---TT-C-AT----CTCTTGC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-T-C--TGG--C----AC---GG---C-A---G-A----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG--CC-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A-G----GCC--T-GTTTT-C-TC--A-CACTA--CC-ACATt
gi|116331                     :                  TGTAACAGA--GAC--A----T-T---TT-C-AT--GCCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-T-C--TGA--C----AC---AA---C-A---G-T----CCAGT-G------C-T----------A-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG---C-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A-G----GCC--T-G-TTT-T-CT--A-CACTA---C-ACATt
gi|116332                     :                  TGTAACAGA--GAC--A----G-G---TT-T-GT--GTCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCAGGA-A--CC-T-C--TGG--C----AC---AG---C-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG--CC-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A-G----GCC--T-G-TTT-T-CT--A-CACTA--CC-ACAT
gi|116333                     :                  TGTAACAGA--AAC--A----GGT---TT-G-GT--GCCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-T-C--TGA--C----AC---AA---C-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CT--GATCACG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG--CC-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A-G----GCC--T-G-TTT-T-TCTAA-CACTA--CA-ACATt
gi|116334                     :                  TGTAACAGA--AAC--A----G-A---TT-T-GTT-GCCTCT-GC-TGA-G---GGA--T-C--GAACC-GGG-A--CC-T-C--TAC--C----AC----A---C-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------C-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG---C-AGAGCT-AG-TA-G----------A-G----GCC--T-G-TTT-T-CT--A-CACTA--CC-ACATt
gi|116335                     :                  TGTAAGAGA--GAT--A----G-G---TT-T-GT--GTCTCA-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCGGA-A--CC-T-C--TGA--C----AC---AA---C-A---G-T----ACAGT-G-T---TC-T----------A-CT--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-G------ACCCACTAG--CC-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A-G----GCC--T-G-TTT-T-CT--A-CCCTA--CC-ACAt
gi|116336                     :                  TGTAAGAGAT-GAT--A----G-G---TT-T-GT--GTCTCA-G--TGC-G---G-A--T-C--GAACCCGGA-A--CC-T-CC-TGAA-C----AC---AA---C-A---G-T----ACAGT-G-T---TCAT----------A-C---GAT--CG--A--GC-T--ATA--A-----G---GG----T-T-G------ACCCACTAG--CC-AGAGC--AG-TA-GG--A------A-A----GCC--T-G-TTT-T-CT--A-CCCTA--CC-ACA
gi|116337                     :                  TGTAACAGA--GAC--A----T-T---TT-C-AT--GCCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAAAC-GGG-A--C--T-C--TG---C----AC---AC---C-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------AACC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG--CC-AGAGCT-GA-TA-GG--A------A-G----GCC--T-G-TAT-C-AC--A-CACTG--CC-ACAct
gi|116338                     :                  TGTAACAGA--GAC--A----T-T---TA-C-AT--GCCTCT-GC-TGA-G---G-A--TGC--GAACCCGGGGA--CC-T-C--TGA--C----AC---AA---C-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T--------ACGCACTAG--CC-AGAGCT-AG-TATGG--A------A-G----GCC--T-G-TAA-C-AC--A-CACTG---C-ACAT
gi|116339                     :                  TGTAACAGA--GAC--AA---T-T---TT-C-AT--GTCTCT-GA-TGA-G---A-T--T-T--GAACCTGGG-T--CC-T-C--TGG--C----AC---AA---C-A---G-T----CCATA-G-C---TC-T----------A-GT--GAT--CA--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ATCCCCTTG--CC-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A-G----GTC--T-G-TAT-C-TA--A-CACTA--CC-ACATt
gi|116340                     :                  TGTAACAGA--GAC--A----T-T---TTTC-AT--GCTTCT-GC-TGG-G---A-T--T-T--GTTCCCGGG-------T-C--CAG--C----AC---AA---C-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCAGTAG--CC-AGAGCT-AG-TA-TG--A------A-G----GCC--T-G-TAT-C-AC--A-CACTG--CC-t
gi|116341                     :                  TGTAACAGA--GAC--A----T-T---TT-C-AT--GTCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-CT-GAACCCGGGAA--CC-T-CCTTGG--C----AC---GG---C-AG--G-T----CCAGT---CTCTTC-T----------A-CC--GAT--CGGCA--GC-T----A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG--CCAAGAGCT-AG-TA-GG--A------A-A----GGC--T-G-TAC-C-AC--A-CACTG--CCAACAT
gi|116342                     :                  TGTTACAGC--GAC--A----T-T---TT-C-GTT-GTCTCT-GG-TGG-G---A-T--T-T--GAATCCGGG-C--CT-T-C--TCG--C----AC---GA---T-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CC--GAC--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GA----T-T-A------ACGTACTCG--CC-ACAGCT-AG-TA-GG--A------A-G----GCC--T-G-TAT-C-TC--G-CACTG--CC-ACAt
gi|116343                     :                  TGTAACAGA--AAC--A----T-T---TT-T-TT--ATGTC--GC-TGA-T---G-AATT-T--GAACCCAGG----TT-T-C--TGG--T----AC---AA---C-T---G-T----CTAGT-T-C---TC-T----------A-CC--GA----------GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACAAG--CC-AGAGCT-AG-TA-GG--A------A-------------G-TAT-C-TA--A-CACTG--CG-ACAT
gi|116344                     :                  TGTAACAGA--AAC--A----T-T---TT-T-TTTGGCCTCT-GA-TGG-G---A-T--T-T--GAACC--------------------------------------A---A-C----CCAGC-G-C---TC-T----------A-CT--AAT--CG--A--GC-T--A-A--AAACTGG---GG----T-T-G------ACt
gi|116345                     :                  TGTAACAGA--GGCT-A----G-T---TT---AT--CCCTCT-GC-TGA-G---A-A--T-C--GAACCCGGT-A--CC-T-T--TGG--C----AC---GA---T-A---G-T----GCAGT-G-A---TC-T----------A-GT--GAT--TG--A--GT-T--A-ATCT-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAG--CC-CGAGTT-AG-TA-CG--A------A-G----GC
gi|116346                     :                  TGTAACAGA--GA---A----T-G---GTAT-GT--GCCTCT-GT-GGA-G---A-A--T-C--GAACCCAGG-A--CC-T-C--AAG--C----AC---GA---C-A---G-TTCAGCTAGT-G-C---TT-T----------A-CCTGAAT--CA--A--GC-T--A-A--A-----G---GGTTAAT-T-A------ACGCACTAG--CC-AGAGTT-AA-TA-AG--A------A-G----GCCA-T-G-GA--------A-CACAA--CT-ACAT
gi|116347                     :                  TGTTACAGT--GAC--A----T-T---CC-C-A---GTCTCT-GT-TGG-G---A-T--T-T--GAACTTGGG-GGCCC-T-C--TCG--C----AC---GA---T-A---G-T----CCAAT-G-C---TC-T----------A-CC--GAT--CG--G--AC-T--A------------------------A------ACCTACTTA--CC-AGAGGT-AA-TA-GG--A------A-GCTATGCC--T-G-TAT-C-TC--G-CACTA--CC-TCAt
gi|116348                     :                  TGTAACAGA--GAC--AAGTAT-A---TA-T-AT--GCCTCT-AC-TGA-G---G-A--T-C--AAGCCCGGG-A--CC-C-C--AGG--C----AC---AG---C-A---G-T----CCAGT-G-G---TC-T----------A-CC--AAT--CC--A--GC-
gi|116349                     :                  TGTAACAGA--GAC--A----G-G---TT-T-AT--TCCTCT-GC-TGA-GT--A-A--A-C--AAACCCAGG-T--CC-T-C--TGG--C----AC---AA---T-A---G-T----CCAAT-G-C---
gi|116350                     :                  TGTCACGGA--GGC--A----T-T---TTAC-AT--GCATAT-GA-TG--G---A-A--T-TTTGAACCCTG--A--CCAT-C--TGG--C----TC---GA---C-A---T-T----CCAGT-A-C---TC-T----------A-CC--GAT--TG--A--GC-T--G-T--A-----G---G
gi|116351                     :                  TGTAACACA--TACT-G----T-G---TT----T--GCATCT-GA-TGA-G---A-A--T-T--GAACTTGCG-A--CC-T-C--TAT--T----AC---GT---C-A---G-T----GCAGT-G-C---AC-T----------T-CT--GAT--CG--A--GG-T--C-A--A-----G---GT----T-C-A------GCCCATTAA--C
gi|116352                     :                  TGAAACAGA--GACTGA----C-T---T----AA--GCCTCA-GT-TGA-G---A-G--T-C---AACTCTAG-A--TC-T-C--TGG--T----AC---AA---C-A---G-T----CCA-T-G-CA--TC-T----------A-CC--
gi|116353                     :                  TGTAACAGA--GAC--A----G-G---TT-T-GT--GA-TCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCGGG-
gi|116354                     :                  TGTCACAGA--GAC--A----T-T---TT-C-AT--GTCTCT-GC-TG--G---G-A--T-
gi|116355                     :                    TAATGGATGGAC--A----T-T---TTAC-AT--GCATCT-GA-TGC-A---A-T--T-T--GAACTTGGA-T--CC-T-C--TGG--C----AT---AA---C-A---G-T----CCAGT-G-T---TC-T----------G-CC--AAT--TG--A--GC-T--T-T--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAA--CC-ATAGGT-AG-TA-GG--A------A-T----GCC--T-G-TAT-A-TC--A-CACTA--CC-ACAT
gi|116356                     :                    TAATGGATGGAC--A----T-T---TTAC-AT--GCATCT-GA-TCA-A---T----T-T--GAACTTGGA-T--CC-T-C--TGG--C----AT---AA---C-A---G-T----CCAGT-G-T---TC-T----------G-----AAT--TG--A--GC-T--T-T--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTAA--CC-ATAGGT-AG-TA-GG--A------A-T----GCC--T-G-TAT-A-TC--A-CACTA--CC-ACATt
gi|116357                     :                    TAAC-GA--GAC--AAGT-T-T---TT-CAGT-----TCT-GA-TGA-G---A-T--T-T--GAAACTGGG-T--CC-T-C--TGG--C----AC---AA---C-A---G-T----C--AT-G-C---TC-T----------A-C---GAT--CG--A--TC-T--A-A--AA----G---GG--------A------ATCCACTTG--CC-AGAGCT-AG-TA-GA--A------A-G----GCC--TGG-TAC-C-TA--ACCACTAACTC-ACATt
gi|116358                     :                                                         TTT-GT-TAG-G---A-A--T-C--GAACCCTGG-A--CT-T-CCATG--------AT---GG---C-A---G-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-AC--AAT--CA--A--GC-A--A-A--A-----G---TG----T-T-G------ACAAACAAG--TT-ATAGCG-AA-TA-GA--A------AGG----GCA--T-G-TAT-C-TA--A-CACTG--Ct
gi|116359                     : acaaagactgcctgtcacagatCAGA--GAC--A----T-T---TT-C-AT--GCCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAATCCGGG-A--CC-TGC--TGG--C----AC----A---C-G---G-CGTTACCAGT-GCC---TC-TATCTTTTATCA-CC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GGTGA-T-T-A------A-CCGCTAG--CC-AGAGCT-TG-TA-GG--A------A-G----GCC--
gi|116360                     :                        AGA--GAG--A----T-TAGGTT-T-GT--GTCTCA-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCGGA-A--CC-T-C--TGA--T----AC---AA---C-A---GAT----CCAGT-G-T---TC-T----------A--C--GAT--CG--A--GC-T--T-A--A---------GG----T-T-G------ACCCACTAG--CC-AGAGC--AG-TA-GGA-A------A-G----GCC--T-G-T
gi|116361                     :                                                       CCTTT-GC-TAG-A---G-A--T-C--GAACCCAGA-A--CC-T-C--TCG--C----AC---AA---A-AG--G-T----CCAGT-A-T---AA-T----------G-CC--GAT--CG--A--TC-A--A-A--A-----G---GG----G-T-A------ACACACTAG--tttctaccct
gi|116362                     :                                            atcttcaccttcCTCT-TC-CGA-G--------T-C--AAACCCGAG-A--CC-C-C---AG--C----AT---GA---C-A---G-T----CCAGC-G-C---TC-G----------C-AC--AAT--GG--A--GC-T--T-A--A-----
gi|116363                     :                           tttttatttcttctg---TT-T-GT--GCCTCT-GCCTGA-GTGGA-A--T-C--GAACCCTGG-A--CC-T-C--TGA--C----AC---AA---C-A-----T----CCAGT-G-C---TC------------A-AC--GAT--CG--AAGACAT--A-A--A-----GAGAGG----CGT-A------ACCCACTTATCCC-AGAGCTAAG-TA--G--A------A-G----GCC--T-G-TTT-C-TC--A-CAGTA--AC-
gi|116364                     :                                          ---TT-T-GT--GCCTCT-GC-TGG-G---A-A--T-C--AAACACAGG-G--CC-T-C--TGG--C----AC---AA---C-A---G-T----TCAGT-G-T---TT-T----------A-CC--AAC--CA--A--TA-T--A-G--A---------GG----T-T-A------TTCCACTAG--CC-AG
gi|116365                     :                                                                                     CCCGGG-T--CC-T-C--TGG--C----AC---AA---C-T---G-T----ACAGT-G-C---TC-T----------A-AC--GAT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-A-A------ACCCTCTAG--CT-AGTGCT-AG-TG-GG--A------A-G----GCC--T-G-TAA-A-TC--A-CACTA--CC-ACA
gi|116366                     :                 catatctcccagttgattagatacaaaagg-C-GT--GTCTCT-GC-TAA-G---G-A--T-T--AAGCCTAGG-A--TC-T-C--T-------------------------G-T----CCAAT-C-A---TT-T----------A-CC--GAT--CA--A--GG-TTAA-A--A-----G---GGTAAAT-T-A------AACCACTAA--CC-AGAGCG-AG-TA-GGTCA------A-G----GTCA-T-G-TAT-C-TTA-A-CACTA--CC-ct
gi|116367                     :                                                   T--GTCTCT-AG-TG--G---G-A--T-T--TGACCTGGG-C--CC-T-C--TCG--C----AC---GA---T-A---G-T----CCAGTTG-C---TC-G----------A-CC--GAT--CG--A--GC----A-A--A-----G---GA----T-TCA------ACCTACTCG--CC-AAAATT-AG-TA-GG--A------A-T----GCC--T-G-TAT-CTTC--G-CACTG--CC-ACAgaatt
gi|116368                     :                                                   T--GTCTCT-GC-TGA-G---G-A--T-C--GAACCCAGG-A--CC-T-C--TGG--C----ATGAAGA---C-A---G-T-----CAGT-A-T---TT-T----------A-CA--TAT--TG--A--GC-C--A-A--A-----G---GT----T-T-A------A
gi|116369                     :                                                    --GCCTCT-GT-TGA-G---G-A--T-C--GAACCTATG-A--TC-T-C--TGG--C----AT---AA---C-T---A-T----CTAGT-G-
gi|116370                     :                                                        CCCT-G---GA-G---G-A--TTC--GAACCCGGG-G--CC-T-G--CAGTTC----AC---AA---A-A----------CCGAT-G-C---TT-T----------A-CC--AAC--TG--A--GC-T--A-A--G-----A---AG----T-T-A------
gi|116371                     :                                                        tTTT-GA-TGA-G---G-AA-T-C--GAACCAGGG-A--CC-T-C--TGA--C----AC---AA---C-A-----T----TCATT-G-C---CT-C----------A-CA--GAT--TG--A--CT-T--G-C--AT----G---GG----C-T-A------AC
gi|116372                     :                                                          CT-GC-TGA-G---G-A--T-T--GAACCCAGG-A--CC-T-G--TGA--C----AT---GA---T-G---G-T----CCAGT-G-
gi|116373                     :                                                            -GC-TGA-G---G-A--T-T--AGA-------------T-C--TGG--C----AC----------A---T-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-TC--GAT--CA--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCTCTGG--CC-AGGGCT-AT-CA-AC--ATTCAACA-A----GCCCAT-G-TAT-C-TT--A-CACTA--CC-
gi|116374                     :                                                            -GC-TGACG---G-A--TTC--GAACTCGGG-A--CC-T------G--CGTTTAC--------C-A---G-T----CCGAT-G-C---TT-T----------A-CC--TAT--TG--A--GC-T--A-T--G-----A---AG----T-T-A------
gi|116375                     :                                                              C-CGG-G---A-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-C-C--T-G--C----AT---AA---CTA---G-T----CAGGT-G-C---TC-T----------A-AC--CAC--TG--A--GC-T--A-
gi|116376                     :                                                              C-CGG-G---A-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-C-C--T-G--C----AT---AA---CTA---G-T----CAGGT-G-C---TC-T----------A-AC--CAC--TG--A--GC-T--A-
gi|116377                     :                                                              C-CGG-G---A-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-C-C--T-G--C----AT---AATACT-A---G-T----CAGGT-G-C---TC-T----------A-AC--CAC--TG--A--GC-T--A-
gi|116378                     :                                                              C-CGG-G---A-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-C-C--T-G--C----AT---TA---CTA---G-T----CAGGT-G-C---TC-T----------A-AC--CAC--TG--A--GC-T--A-
gi|116379                     :                                                              C-CGG-G---A-A--T-C--GAACCCGGG-A--CC-C-C--T-G--C----AT---TA---CTA---G-T----CAGGT-G-C---TC-T----------A-AC--CAC--TG--A--GC-T--A-
gi|116380                     :                                                                 GG-G---A-A--T-C--GAACCCAGG-A--CC-C-C--T-G--C----AT--------T-A---G-T----CAGGT-G-C---TC-TAAAC------A-CT--GAT--CG--A--GC-T--A-
gi|116381                     :                                                                   -G---G-A--TTC--GAACTCGGG-A--CC-T-G--CGA--CTT--AC--------C-A---G-T----CCGAT-G-C---TT-T----------A-CC--TAC--TG--A--GC-T--A-T--A-----A---AG----T-T-A------
gi|116382                     :                                                                           --T-C--AAACCCGGG-A--CC-T-C--TGG--C----AC---AA---T-A------------------T---TC-T----------G-CC--GAT--CA--A--AT-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACAAACCAG--CC-AAGGAT-AA-CT-GG--A------A-A----ACCA-T-G-TAT-C-TT--A-CACTA--CC-ACAT
gi|116383                     :                                                                                          G-A--CC-T-C--TGG--C----AC---GA---C-ATCAG-T----CCAGT-G-C---TC-T----------A-CT--GAT--CT--G--GT-T--A-A--A-----G---GG----T-T-A------ACCCACTCG--CC-AGAACT-AA-TA-AG--T------A-------TA--T-G-TAT-C-TA--A-CACTA--CC-ATAt
gi|116384                     :                                                                                                                              ---G-T----ACACT-A-C---TA-T----------A-C---GGT--CG--A--GC-T--A-A--A-----G---GG----T-T-ATACGCCGCCAACTAG--CC-AGAGCT-AG-TA--G--A------A-G----GCC--T-G-TATGC-AC--A-CACTG--CC-ACA
gi|116385                     :                                                                                                                                     cgcagtgT-G-T---TC-T----------A-GC--AAT--TG--A--GT-T--G-A--T-----G---GG----T-T-A------GCCACCTAG--CT-AGAGCC-AG-TA-GG--A------A-G----GCC--T-G-
gi|116386                     :                                                                                                                                                                   -CT--GAT--CG--A--GC-T--A-A--C-----G---GG----T-G-A------ACTTGGTAA--CC-AGAAGT-AG-TA-GG--A------A-G----CCT--T-G-TAT-C-TC--A-CACTA--CC-ACAT
gi|116387                     :                                                                                                                                                                                                                    ------ACCCATTAG--CC-AGAGCT-AGATA--G--A------A-G----GCC--T-G-TAT-C-CC--A-CACT