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Reference ( gi|63876 ) : ACT-AAAC-TT-CG-T--A---CG-T-C----AC-A-A-T----T--------C-T--------------------AT--A----C-GT---------CAC-----A----G-A-C--AA--A---T--G--A-------------T-C--G--A----TTC--CT---------T-A----------T-T--GT-G--A-C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AA--A-----------T-----TC---C------T----A-----C----A-T----G-----------------------A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TGTTAT
gi|63863 : ACT-GAAC-TT-CG-T--A---CG-T-C----AC-A-A-T----T--------C-T--------------------AT--A----C-GT---------CAC-----A----G-A-C--AA--A---T--G--A-------------T-C--G--A----TTC--CT---------T-A----------T-T--GT-G--A-C--GTCTGAAT-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AA--A-----------T-----TC---C------TACG-A-----C----A-T----G-----------------------A--A-A---T-T--TG----A--CA-T---T-TA----T--T-T-
gi|63864 : aACT-GAAC-TT-CG-T--A---CG-T-C----AC-A-A-T----TT-------C-T--------------------AT--A----C-GT---------CAC-----A----G-A-C--AA--A---T--G--A-------------T-C--G--A----TTC--CT---------T-A----------T-T--GT-G--A-C--GTCTGAAT-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AA--ATC---------T-----TA---C------G----A-----C----A-T----G-----------------------A--A-A---T-T--TG----A--CA-T---T-TA----T--T-T-TGTTAT
gi|63865 : aACTGAAAC-TT-CG-T--GTACCG-T-C----AC-A-G-T----T--------C-T--------------------AT--A----C-GT---------CAC-----A----G-A-C--AA--A---T--G--A-------------T-C--G--A----TT---CT---------T-A----------T-T--GT-G--A-C--G------T-C--A-G----------T--G-----A-AG--C--T-AA--A-----------T-----TC---C------TACG-A-----C----A-T----G-----------------------A--A-A---T-T--TG----A--CA-T---T-TA----T--T-TGTGTTAT
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gi|63882 : aACT-GAAC-TT-C--T--A----G-T-C----AC-G-----------------T-T--------------------AT--A----C-G----------CA------A----G-A-C--AA--T---T--G--A-------------T-C--G--A----TTC--CT---------T-A----------T-T--GT-G--A-C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AA--A-----------T-----TC---C------TACG-A-----C----A-T----G-----------------------A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TGTTATgacat
gi|63881 : ACT-GAAC-TT-CG-T--A---TG-T-C----ACCA-A-T----T--------C-T--------------------AT--A----C-TT---------CAC-----A----G-A-C--AA--A---T--G--A-------------TTC--G--A----TTC--CT---------T-A----------T-T--GT-G--A-C--G------T-C--A-GTTTT------T--G-------AG--C--T--A--A-----------T-----TC---C------TACG-A-----C----A-T----G--------------------------A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG-------T-T-TGTTAT
gi|63866 : ACT-GAAC-TT-CG-T--A---CG-T-C----AC-A-AAT----T--------C-T--------------------AT--A----C-GT---------CAC-----A----G-A-C--AA--A---T--G--A-------------T-C--G--ATT--TTC--CT---------T-AT---------T-T--GT-G--A-C--G------T-T--A-G---T------T--------A-AG--C--T-TA--A-----------TA----TC---C------TACGGA-----C----A-T----G-----------------------A--A-A---T-T--T-----A--CA-T---T-TA----T--T-T-TGTTAT
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gi|63884 : ACT-GAAC-TT-CG-T--A---CG-T-C----AC-A-A-T----T--------C-T--------------------AT--A----C-GT---------CAC-----A----G-A-C--AA--A---T--A--G-------------T-T--G--A----ATC--GT---------A-A----------T-T--AT-G--A-T--G------T-C--A-G---T------A--G-----A-AG--G--G-AA--A-----------T-----cacagttctac
gi|63877 : ACT-GAAT-TT--G-T--A---CG-T-C----AC-A-A-T----T--------T-T--------------------AT--AC---C-GT---------CAC----------C-A-C--AA--C---A--G--A-------------T-C--G--A----AGC--GT---------T-ATT--------T-T--AT-GC-A-C--G------T-C--A-G---T------G--G-----A-GG--C--T-AA--A-----------TG----TC---C------TACG-A-----C----A-T----G-----------------------A--A-T---T-T--TG----A--CA-T---T-TA----TTAT-T-TGTTATcacagttctac
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gi|63887 : ACT-GAACGTT-CG-T--A---CGGT-C----AC-A-A-T----T--------C-A--------------------CT--A----T-GT---------CAC-----A----GGA-G--AA--AGGTT--G--AAA-----------T-C--GGGA----TTC--CT---------T-AAAAATATGCAC-T--AT-G----C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-GA--AACAATCTCCACT-----TA---C------G----A-----C----A-T----G-----------------------A--A-CGGTT-C--TG----A--CATT---T-TG----T--T-T-TGTT
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gi|63874 : aACT-GAAC-T---G-C--A---CG-T-C----AC-A-A-T----T--------C-T---------------------T--A----C-GT---------CAC-----A----G-A-C--AA--A---T--GC-AATCGGACACATCCT-C--G--A----TTT--CCGAAGAGCGGT-ATGTC------T-T--G--G--A-C--G------T-T--ATG---TGACTAGT--G-----A-A---C--T-AA--A-----------T-----TC---C------TC---A-----C----A-T----------------------------A--A-C---C-T--TG----A---A-T---T-TA----T--T-T-T
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gi|63875 : aACT-GAAC-TT-CG-T--A---CG-T-C----AC-A-A------T--------C-T--------------------AT--A----C-GT---------CAC-----A----A-A-gaacatcact
gi|63888 : aCT-GAAC-TA-TG-T--A---CG-T-C----AC-A-G-T----T--------T-T--------------------AC--A----C-GT---------CAC-----A----G-A-C--AA--A---T--G--A-------------T-C--G--A----AGT--GT---------T-A----------T-T--AT-G--A-C--G------T-T--G-T---T------T--G-----A-GG--C--A-AA--A-----------T-----TT---A------T----ACAG--C----A-T----G-----------------------A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TGTTATaggaaaaaaatcaaggtgt
gi|63889 : CT-GAAC-TT-TA-T--A---CG-T-C----GC-A-G-T----A--------G-T--------------------AC--A----C-AT---------CAC-----A----G-A-C--AA--A---T--G--A-------------T-C--G--A----AGT--GT---------T-A----------T-T--AT-G--A-C--G------T-T--G-T---T------T--G-----A-AG--C--A-AA--A-----------T-----TC---A------T----ACGG--C----A-T----G-----------------------A--A-C---G-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TGTTAT
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gi|63892 : CT-AAAA-TT-TG-T--A---CA-T-C----AC-A-G-T----T--------G-T--------------------AC--A----C-GT---------CAC-----A----G-A-C--AA--A---T--G--A-------------T-C--G--A----AGT--GT---------T-A----------T-T--AT-G--A-T--G------T-T--G-T---T------T--G-----A-GG--T--A-AA--A-----------T-----CC---A------T----ATGG--C----A-T----G-----------------------A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---A-TGT---T--T-T-TGTTAT
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gi|63905 : C-TT-CG-T--A---CG-T-C----AC-A-A-T----T--------C-T--------------------ATGAA----C-GC---------CAC-----AA---G-A-C--AA--AA--T--G--A-------------T-C--G--A----TTC--CT---------T-A----------T-T--GT-G--A-CGTG------T-C--A-G---T------T--G-----A-----CT-T-AA--A-----------T-----TCTA-C------G----A-----C----A-T----G--------------------------A-C---T-T--TG----A--CA-G---T-TT----TA-T-T-TGTTAT
gi|63906 : -T--A---CA-T-C----AC-A-G-T----T--------C-T--------------------AC--A----C-GT---------CAC-----A----G-A-C--AA--A---T--G--A-------------T-C--G--A----AGT--GT---------T-A----------T-T--AT-G--A-C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--A--T-AA--A-----------T-----TC---C------TACG-A-----C----A-T----G-----------------------A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TATTAT
gi|63907 : -T--A---AG-T-C----AC-A-G-T----T--------C-T--------------------AC--A----C-AT---------CAC-----A----G-A-C--AT--A---T--G--A-------------T-C--G--A----AGC--GT---------T-A----------T-T--AT-G--ACC--G------T-C--G-G---T------T--G-----A-AG--C--TAAA--A-----------T-----TC---T------TACG-A-----C----A-T----G-----------------------G--A-C-----T--TA----A--CA-TA--T-TG----T--T-T-TGTTAT
gi|63910 : -T--A---AG-T-C----GC-A-G-T----T--------T-T--------------------AC--A----C-GA---------CAC-----A----G-A-C--AA--A---T--T--A-------------T-C--G--A----AGC--GC---------T-A----------T-T--AT-G--A-C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-TG--C--T-AA--A-----------C-----T----T------T----A-----CAA--A-G----A-----------------------A--A-C---TAT--TAC---A--CA-T---T-TG----T--T-T-TGT
gi|63909 : -T--A---CA-T-A----AC-A-G-T----T--------C-T--------------------AC--A----C-GT---------CAC-----A----G-A-C--AA--A---T--G--A-------------T-C--G--A----GGC--GT---------T-A----------T-T--AT-G--A-C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-
gi|63908 : -T--A---AG-T-C----AC-A-G-T----T--------C-T--------------------AC--AA---C-ATT--------CAC-----A----G-A-C--TA--T---T--G--A-------------T-C--G--A----AGC--GT---------T-A----------T-T--ATTG--A-T--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AA--A-----------
gi|63911 : -T--A---AG-T-C----AC-A-G-T----T--------C-T--------------------AT--A----C-TT---------GGC-----A----G-A-C--AA--A---T--G--A-------------T-CAAA--A----TGC-------------T-A----------T-T--AT-G--A-C--A------T-C--A-G---T------T--G-----A-
gi|63885 : ---CG-T-C----ACTA-A-TA---T--------A-T--------------------AT--A------GT----------AC-----A----G-A----AATTA---T--G--A-------------T-C--G--A----TTC--CT---------T-A----------T-T--GT----A-C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AA--A-----------T-----TC---C------TACG-A-----C----A-T----GA----------------------A--A-A---T-T--TG----A--CA-T---T-TA----T--TGT-TGTTAT
gi|63913 : actgaatct-T-T----AC-A-A-T----T--------C-T--------------------AT--A----C-GT---------CAC-----A----G-A-C--AA--A---T--G--A-------------T-C--G--A----T----CT---------T------------T-T--GT-G--A-C--GT-----T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AA--A-----------T-----TC---C------TACCGA-----C----A-T----G-----------------------A--A-C-----T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-
gi|63914 : -T-C----AC-A-G-T----T--------C-T--------------------AC--A----C-GT---------CAC-----A----G-A-C--AA--A---T--G--A-------------T-C--G--A----AAT--GT---------T-A----------T-T--AT-G--A-T--G------T-C--A-G----------------------------------A-----------T-----TT---C------TCCG-A-----C----A-T----G-----------------------A--A-C---C-T--TG----A--AA-T---T-TG----T--T-T-TGTTAT
gi|63912 : -T-C----AC-A-G-T----T--------C-T---------------------C--A----C-AT---------CAC-----A----G-A-C--AT--A---T--G--A-------------T-C--G--A----AGCG-TT---------T-A----------T-T--AT-G--A-C--G------T-C--G-G----------T--G-----A-AG--C--T-AA--G-----------TCACAGTT---C------T----A-----C----A-
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gi|63915 : tgaactaatcacgctaac-A-G-T----T--------C-T--------------------AT--GATTCC-GT---------CAT-----AACAGG-A-C--AA--A---T--A---------------------G--A----TTT--CTGAT------T-AGCGT------T-T--GT-AGAA-C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--T--T-AA--A-----------T-----TC---TACGGTGT----AT----C----A-T----G-----------------------A--A-C---T-T--TG----T--TA-T---C-AT----T--T-T-TG
gi|63916 : --------C-T--------------------AT--G----C-TA---------CCC-----G----G-A-C--AA--A---T--T--A-------------T-C--G--A----AAT--GT---------T-A----------T-T--TT-G--A-C--G------T-T--G-T---T------T--G-----A-AT--C--A-AA--A-----------T-----TC---A------T----ACGG--C----A-T----G-----------------------A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--
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Reference ( family-368 ) : ACTGAA-C-T--T-CG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-TAT--A----C-GT---------CAC-----A----GA-C--AA--A---T-G--A-TC---G-A--NN--CG--T---T----------A--T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AAA-----T-----TCC---TAC--A------C-AT----G-----------------A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TGTTAT
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gi|63889 : CTGAA-C-T--T-TA-T--A---CG-T------------------------CG--C-A-G-T----A--------G-TAC--A----C-AT---------CAC-----A----GA-C--AA--A---T-G--A-TC---G-A--AG--TG--T---T----------A--T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-T--G-T---T------T--G-----A-AG--C--A-AAA-----T-----TCA---TACG-G------C-AT----G-----------------A--A-C---G-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TGTTAT
gi|63890 : CTGAG-C-T--T-TA-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------G-TAC--A----C-GT---------CCT-----A----GA-C--AA--A---T-G--A-TC---G-A--AG--TG--T---T----------A--C-------------T-----A-A------G-A---C--T------T-T--A-T---T------T--G-----A-AG--C--C-AAA-----T-----TCA---TACG-G------C-AT----G-----------------A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TGTTAT
gi|63891 : CTGAA-C-T--T-TG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-G-C----T--------C-TAT--A----C-TT---------CAC-----A----GA-C--AA--A---T-G--A-TC---G-A--AG--TG--A---T----------A--C-------------C-----A-T------G-G---C--G------T-T--A-C---T------G--G-----A-AG--G--A-AAA-----T-----CCA---TACG-G------C-AT----G-----------------A--A-CT--T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TGTTAT
gi|63892 : CTAAA-A-T--T-TG-T--A---CA-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------G-TAC--A----C-GT---------CAC-----A----GA-C--AA--A---T-G--A-TC---G-A--AG--TG--T---T----------A--T-------------T-----A-T------G-A---T--G------T-T--G-T---T------T--G-----A-GG--T--A-AAA-----T-----CCA---TATG-G------C-AT----G-----------------A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---A-TGT---T--T-T-TGTTAT
gi|63893 : CTGAA-C-T--T-TG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-G-TAAAAT----------TAC--A----C-GT---------CAC-----A----GA-C--AA--AA--T-G--A-TC---G-A--AG--TG--T---T----------A--T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-T----G---T------TAGA-----A-AG--T--A-AAA-----T-----TCA---TAC--GT-----C-AT----G-----------------A--A-C---T-T--TT----A--CG-T---T-TG----T--T-T-TGTT
gi|63894 : CTGAA-C-T--T-TG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-G-TAAAAT----------TAC--A----C-GT---------CAC-----A----GA-C--AA--A---T-G--A-TC---G-A--AG--TG--T---T----------A--T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-T----G---T------TAGA-----A-AG--T--A-AAA-----T-----TCA---TAC--GT-----C-AT----G-----------------A--A-T---T-T--TT----A--CG-T---T-TG-------T-T-TGTTAT
gi|63895 : CTCAA-C-T--T-TG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-G-T----TGTTCACAGT-TGTTCA----C-GT---------CAC-----A----GA-C--AA--A---T-G--A-TC---G-A--AG--TG--T---C----------A--T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-T--G-T---T------T--G-----A-AG--C----AAG----------------------G------C-AT----G-----------------A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TGTTAT
gi|63896 : CTGAA-C-T--T-CG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-TGC--A----C-GT---------CAC-----A----GA-CA-AA--A---T-G--A-TC---G-A--AG--CG--T---T----------A--T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AA--C--T-ACA-----T-----
gi|63897 : CTTAA-C-T--T-TG-T--A---CG-T------------------------CA--C-C-G-T----T--------G-TAC--A----C-GT---------CAC-----A----TA-C--AA--A---T-G--A-TC---G-A--GG--TG--T---T----------A--T-------------T-----A-T------G-A---C--G------C-T--G-T---T------T--G-----A-AG--C--A-AAC-----T-----TCA---TGCG-G------C-AT----T-----------------A--A-C---T-T--TG----A--CATT---T-TG----T--T-T-Taacagttctac
gi|63898 : CTGAA-C-T--T-TG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------G-TAC--A----C-GT---------CAT-----A----AA-C--AA--A---T-G--A-TC---A-A--AG--TG--T---T----------A--T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-T--A-T---T------T--G-----A-AG--C--A-AAA-----T-----TC
gi|63899 : TGAA-C-T--T-CG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-A-T----T--------C-TAT--A----C-GT---------CAG-----A----GA-C--AA--A---T-G--A-TC-----A--TT--CG--T---T----------AATT-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--G-G---T------T--T-----A-AG--C--T-AAA-----T-----TCC---TACG-A------C-AT----G-----------------A--A-C---T-T--Tgagatatctgtgaatttg
gi|63900 : TGAA-C-T--T-CG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-G------T--------C-TAT--A----C-AT---------CCCA----A----GACC--AA--A---T-G--A-TC---GAA--AT--CG--T---T----------A--T-------------T-----A-T------G-A---CG-G------T-C--A-GT--T------T--G-----A-AG--C--T-AAG-----TCACAGTTC---TACA-A------C-AT----
gi|63901 : TGAA-T-T--T-CA-T--A---CA-T------------------------CA--C-A-A-T----T--------C-TAT--A----C-GTAAGTAATGTCGC-----A----GA-C--AA--A---A-G--A-TC---G-A--AG--CA--T---C----------A--T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AAG-----TCACAGTTC---TAC--A------C-ATCACAGACAAATAATCAAAGCGTA--A-C---T-T--TG----A--CG-TTAAT-TG----T--T-T-TGTTAT
gi|63902 : TGAA-C-TAAT-C-----A---CG-C------------------------TAACC-A-A-T----T--------C-TAT--A----CCGT---------CAC-----A----GA----AA--A---T-G--A-GC---G-A--TT--CG--T---T-------------T-------------A-----A-T------G-AAAAC--GA-----T-C--G-GC--T------T--G-----ACAG--C--T-AAA-----T-----TCC---TACG-A------C-AT----G-----------------A--A-------T--TGTCATA--CA-T-----------T--T-T-TGTTAT
gi|63903 : TGAA-C-T--T-CGAT--A---CA-T------------------------CA--C-A-A-T----T--------C-TAT--AA---C-GT---------CAC-----A----GA-C--AA--A---T-A-----C---G-A--TT--CAATT---T----------A--T-------------T-----A-T------GTA---T--A------TAC--A-G---G------T--GTTAATA-AG--------AA-----T-----CTC---TAA--A------T--T----G-----------------A--A-C---G-T--TG----AGTCAGT---T-TA----T--T-T-T
gi|63904 : A-C-T--T-TG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------G-TAC--A----C-GT---------CAC-----G----GG-C--AA--A---T-G--A-TC---G-A--AG--TG--T---T----------A--T-------------A-----A-T------G-A---C--GTTT---T-T--A-G-------------A-----A-AG--C--A-AAA-----T-----T
gi|63905 : -C-T--T-CG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-A-T----T--------C-TATGAA----C-GC---------CACA----A----GA-CA-AA--A---T-G--A-TC---G-A--TT--CC--T---T----------A--T-------------T-----G-T------G-A---CGTG------T-C--A-G---T------T--G-----A-----CT-T-AAA-----T-----T-C---TACG-A------C-AT----G--------------------A-C---T-T--TG----A--CA-G---T-TT----TA-T-T-TGTTAT
gi|63906 : -T--A---CA-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-TAC--A----C-GT---------CAC-----A----GA-C--AA--A---T-G--A-TC---G-A--AG--TG--T---T----------A--T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--A--T-AAA-----T-----TCC---TACG-A------C-AT----G-----------------A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TATTAT
gi|63907 : -T--A---AG-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-TAC--A----C-AT---------CAC-----A----GA-C--AT--A---T-G--A-TC---G-A--AG--CG--T---T----------A--T-------------T-----A-T------G-AC--C--G------T-C--G-G---T------T--G-----A-AG--C--TAAAA-----T-----TCT---TACG-A------C-AT----G-----------------G--A-C-----T--TA----A--CA-TA--T-TG----T--T-T-TGTTAT
gi|63908 : -T--A---AG-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-TAC--AA---C-ATT--------CAC-----A----GA-C--TA--T---T-G--A-TC---G-A--AG--CG--T---T----------A--T-------------T-----ATT------G-A---T--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AAA-----
gi|63909 : -T--A---CA-T------------------------AA--C-A-G-T----T--------C-TAC--A----C-GT---------CAC-----A----GA-C--AA--A---T-G--A-TC---G-A--GG--CG--T---T----------A--T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-
gi|63910 : -T--A---AG-T------------------------CG--C-A-G-T----T--------T-TAC--A----C-GA---------CAC-----A----GA-C--AA--A---T-T--A-TC---G-A--AG--CG--C---T----------A--T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-TG--C--T-AAA-----C-----T-T---TAC--A------A-AG----A-----------------A--A-C---TAT--TAC---A--CA-T---T-TG----T--T-T-TGT
gi|63911 : -T--A---AG-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-TAT--A----C-TT---------GGC-----A----GA-C--AA--A---T-G--A-TC---A-A--AA--TG--C---T----------A--T-------------T-----A-T------G-A---C--A------T-C--A-G---T------T--G-----A-
gi|63912 : -T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-T-C--A----C-AT---------CAC-----A----GA-C--AT--A---T-G--A-TC---G-A--AG--CGT-T---T----------A--T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--G-G----------T--G-----A-AG--C--T-AAG-----TCACAGTTC---TAC--A------C-AT----
gi|63913 : -T------------------------TA--C-A-A-T----T--------C-TAT--A----C-GT---------CAC-----A----GA-C--AA--A---T-G--A-TC---G-A--TC------T---T-------------T-------------T-----G-T------G-A---C--GT-----T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AAA-----T-----TCC---TACCGA------C-AT----G-----------------A--A-C-----T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-
gi|63914 : -T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-TAC--A----C-GT---------CAC-----A----GA-C--AA--A---T-G--A-TC---G-A--AA--TG--T---T----------A--T-------------T-----A-T------G-A---T--G------T-C--A-G--------------------------------A-----T-----TTC---TCCG-A------C-AT----G-----------------A--A-C---C-T--TG----A--AA-T---T-TG----T--T-T-TGTTAT
gi|63915 : -A-G-T----T--------C-TAT--GATTCC-GT---------CAT-----AACAGGA-C--AA--A---TAG--A-TTTCTG-A--TTAGCG--T---T----------T--G-------------T-----A-G------A-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--T--T-AAA-----T-----T-C---TAC--GGTGTATC-AT----G-----------------A--A-C---T-T--TG----T--TA-T---C-AT----T--T-T-TG
gi|63916 : --------C-TAT--G----C-TA---------CCC-----G----GA-C--AA--A---T-T--A-TC---G-A--AA--TG--T---T----------A--T-------------T-----T-T------G-A---C--G------T-T--G-T---T------T--G-----A-AT--C--A-AAA-----T-----TCA---TACG-G------C-AT----G-----------------A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--
gi|63917 : --A----C-GT---------CCC-----AC---GA-C--AA------T-G--A-TC---G-A--AG--TG--T---T----------A--T-------------TTA---A-T------G-A---C--G------T-T--G-T---T------T--G-----A-AG--C--A-AAA-----T-----TCA---TG---G------C-AT----G-----------------A--A-C---T-T--TG----A--AA-T---T-TG----T--T-T-TGTTAT
gi|63918 : T---------CAT-----A----GA-A--CC--A---T-G----TC---A-A--GT---G--C---T----------A--T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AAA-----T-----CCC---TACG-G------C-AT----G-----------------A--A-C---T-T--TA----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TGATAT
gi|63919 : AC-----A----GA-C--AA--T---T-G--A-TC---G-A--TC--C---T---T----------A--T-------------TCC---G-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------TT-G-----A-AG--C--T-AAA-----T-----TTCAGCTACG-A------C-AT----G-----------------A--A-C---T-T--TG----A--GA-T---T-TA----T--T-T-
gi|63920 : -----A----GA-CT-AA--A---T-G--A-TC---G-A--AG--TG--T---T----------A--T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--T--T-AAA-----T-----TCC---TAG--A------C-AT----G-----------------A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TATTAT
gi|63921 : -----A----GA-C--AA------T-G--A-TC---G-A--TT--CC--T---T----------A--T-------------T-----G-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T--AA-----T-----TCC---TACG-A------C-AT----G-----------------A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-------A--T-T-TGTTAT
gi|63922 : -----A----GA-CTAAA--A---T-G--AATC---G-A--AGATTG--T---T----------A--T-------------T-----A-T------GGA---C--G------T-C--AAG---T------T--G-----A-AG--T--T-AAA-----T-----TCC---TACG-A------C-AT----G-----------------A--ACC---T-T--TG----A--CA-T---TATG----T--T-T-TATTAT
gi|63923 : -----A----GA-C--AA--A---T-G--A-TC---G-A--TT--CC--T---T----------A--T-------------T-----G-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--------A-AG--C--T--AA-----T-----TCCA--TACG-A------C-AT----G-----------------A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TATTTTT--T-T-TGTTAT
gi|63924 : --T---T----------A--T-------------T-----G-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------TT-G-----A-AG--C--T-AAA-----T-----TCC---TACG-A------C-AT----G-----------------A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TA----T--T-T-TGTTAT
Alignments
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lowQualScore : . . .. . . .. ... . ........................ .. . . . .... ........ . .. .... . ......... . .... ..... . .. .. ... .. .. .. . ... .. ...... .. ... .... .......... ............. ..... . ...... . ... .. ...... . .. . ... ...... .. ..... . .. .. . .. ..... ..... ... . . ........ ..... . ........... . . .. . ... . .. .... .. . ... . .... .. . .
lowQualScore : 9 9 33 9 8 11 444 3 222222222222222222222222 11 5 5 5 0000 44444444 7 00 0000 5 666666666 3 0000 33333 7 66 99 888 99 77 99 7 888 66 444444 66 111 1111 5555555555 7777777777777 44444 7 000000 1 999 66 666666 7 99 4 666 000000 00 77777 7 77 77 7 00 88888 00000 444 8 8 77777777 66666 8 88888888888 8 7 22 9 333 9 22 7777 22 6 444 9 7777 11 9 9
consensus : ACTGAA-C-T--T-CG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-TAT--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--NN--CG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AA--A-----T-----TCC---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TGTTAT
Reference ( family-368 ) : ACTGAA-C-T--T-CG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-TAT--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--NN--CG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AA--A-----T-----TCC---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TGTTAT
gi|63863 : ACTGAA-C-T--T-CG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-A-T----T--------C-TAT--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--TT--CC--T---T----A----------T-------------T-----G-T------G-A---C--GTCTGAAT-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AA--A-----T-----TCC---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-A---T-T--TG----A--CA-T---T-TA----T--T-T-
gi|63864 : aACTGAA-C-T--T-CG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-A-T----TT-------C-TAT--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--TT--CC--T---T----A----------T-------------T-----G-T------G-A---C--GTCTGAAT-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AA--A-----------TCT---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-A---T-T--TG----A--CA-T---T-TA----T--T-T-TGTTAT
gi|63865 : aACTGAAAC-T--T-CG-T--GTACCG-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-TAT--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--TT--C---T---T----A----------T-------------T-----G-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T---------G-----A-AG--C--T-AA--A-----T-----TCC---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-A---T-T--TG----A--CA-T---T-TA----T--T-TGTGTTAT
gi|63866 : aACTGAA-C-T--T-CG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-AAT----T--------C-TAT--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--ATTTT--CC--T---T----AT---------T-------------T-----G-T------G-A---C--G------T-T--A-G---T------T--------A-AG--C--T-TA--A-----TA----TCC---T-A-CG-------GA-----C-A-----------T-G-A--A-A---T-T--T-----A--CA-T---T-TA----T--T-T-TGTTAT
gi|63867 : aACTGAA-C-T--T-CG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-A-T----T--------C-TAT--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-A---G--A--TT--CC--T---T----A------------------------T-----G-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AA--A-----T-----TCC---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-
gi|63868 : aACTGAA-C-T--TGCG-T--A---CG-TT-----------------------CA--C-ATA-T----T--------C-TAT--A----C-GT---------CAC-G----A-----G-C--AA--A---TT-G--A--T-C---G--A--TT--CC--T---TC---A----------T-------------T-----G-T------G-A---C--G------T-CGTA-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AA--A-----T-----TCC---T-A-C--------GA-----CGA-----------T-G-A--A-A---T-T--TG----A--CA-T---T-TT----A--T-T-TGTTAT
gi|63869 : aACTGAA-C-T--T-CG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-A-T----T--------C-TAT--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C---A--A---T--G--A--T-C---G--AT-TT--CC--T---T----A----------T-------------TTGTCGA-T------G-A-------------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AGATA-----T-----TCCA--TAA-T--------GAG----C-A-----------T-G-A--A-------T--TG----A--C--T---T-TA----T--T-T-
gi|63870 : aACTGA--C-T--T-CG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-A-T----T--------C-TAT--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--GCAA--T-C---G--G--AA--CA--T---C----A----------C-------------T-----
gi|63871 : aACTGAA-C-T--T-CG-T--A---CA-T-------------------------A--C-ATA-T----T--------C-TAT--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--GCAA--T-C---G--G--AA--CA--T---C----A----------C-------------T-----
gi|63872 : aACTGAA-C-T--C-CG----G---CGTT------------------------CA--C-A-A-T----T--------C-TAA--A----C-GT---------CGC-A----G-----A-C---A--A---T--G--AG-T-T---G--A--AA--AG--TGACT----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C---------T-C--A-A---T------T--G-----A-TGGTCAAT-AA--T-----T-----TCC---T-A-C--------GAT----C-A-----------TCG-AATA-C---T-TTGTG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-T-TTA
gi|63873 : aACTGAA-C-T--T-CG-TTAA---CG-T------------------------CA--C-A-AAT----T--------C-TAT--A----C-GT---------CAC-A----G-----G-C--AA--A---T--GCAA--T-C---G--G--AA--CA--T---
gi|63874 : aACTGAA-C-T-----G-C--A---CG-T------------------------CA--C-A-A-T----T--------C-T-T--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--GCAA--T-CG--G--A--CA--CA--T---CCTCGA----------TTTCCGAAGAGCGGT-----A-TGTCTTGG-A---C--G------T-T--ATG---TGACTAGT--G-----A-A---C--T-AA--A-----T-----TCC---T---C---------A-----C-A-----------T---A--A-C---C-T--TG----A---A-T---T-TA----T--T-T-T
gi|63875 : aACTGAA-C-T--T-CG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-A------T--------C-TAT--A----C-GT---------CAC-A----A-----A-
gi|63876 : aACTAAA-C-T--T-CG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-A-T----T--------C-TAT--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--TT--CC--T---T----A----------T-------------T-----G-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AA--A-----T-----TCC---T-------------A-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TGTTATaggaaaaaaatcaaggtgt
gi|63877 : ACTGAA-T-T--T--G-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-A-T----T--------T-TAT--A----CCGT---------CAC-C----------A-C--AA--C---A--G--A--T-C---G--A--AG--CG--T---T----A----------T-------------TTT---A-T------GCA---C--G------T-C--A-G---T------G--G-----A-GG--C--T-AA--A-----TG----TCC---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-T---T-T--TG----A--CA-T---T-TA----TTAT-T-TGTTAT
gi|63878 : ACTGAA-C-T--T-CG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-A-T----T--------C-TAA--A----C-AT---------CAC-A----G-----A-CA-AA--A---T--G--A--T-T---G--A--AG--CG--T---T----A----------C-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AA--C--T-AC--A-----T-----
gi|63879 : ACTGAA-C-T--T-CG-T--A---CG-TCTGACACAATTCTTAACGTCACAGCA--C-A-G-T----T--------G-TAC--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--AG--CA--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--T--T-AA--A-----T-----TCT---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TATTATcacagttctac
gi|63880 : ACTGAA-C-T--G-TG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-A-T----T--------C-TAT--A----C-GT---------CAT-A----GGGAAGA-C--AA--A---CC-G--A--TTC---G--A--TT--TG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---T--G------T-C--G-G---T------TT-G-----A-CG--C--T-AA--A-----T-----TCC---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TA----T--T-T-TGTTA
gi|63881 : ACTGAA-C-T--T-CG-T--A---TG-T------------------------CA--CCA-A-T----T--------C-TAT--A----C-TT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--AT-T-C---G--A--TT--CC--T---T----A----------T-------------T-----G-T------G-A---C--G------T-C--A-GTTTT------T--G-------AG--C--T--A--A-----T-----TCC---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G----A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG-------T-T-TGTTAT
gi|63882 : ACTGAA-C-T--T-C--T--A----G-T------------------------CA--C---G-T----T-----------AT--A----C-G----------CA--A----G-----A-C--AA--T---T--G--A--T-C---G--A--TT--CC--T---T----A----------T-------------T-----G-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AA--A-----T-----TCC---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TGTTAT
gi|63883 : ACTGAA-C-T--T--G-T------CG-T------------------------CA--C-A-A-T----T--------C-TAT--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--G---T--G--A--T-C---G--A--TT--CG--T---G----A------------------------T-----G-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AAT-T--T-AA--A-----T-------C---T-A-C--------GA-------A-----------T-G-A--A-C-----T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TATTAT
gi|63884 : ACTGAA-C-T--T-CG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-A-T----T--------C-TAT--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--A--G--T-T---G--A--AT--CG--T---A----A----------T-------------T-----A-T------G-A---T--G------T-C--A-G---T------A--G-----A-AG--G--G-AA--A-----T-----
gi|63885 : ACTGAA-T-C--T-CG-T----------------------------------CA--CTA-A-TA---T--------A-TAT--A------GT----------AC-A----G-----A----AATTA---T--G--A--T-C---G--A--TT--CC--T---T----A----------T-------------T-----G-T--------A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AA--A-----T-----TCC---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-GAA--A-A---T-T--TG----A--CA-T---T-TA----T--TGT-TGTTATcacagttctac
gi|63886 : ACTGAA-C-T--T-CG-T--A---CGAT------------------------CA--C-A-A-T----T--------CGTAT--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---TGGG--A--T-C---G--A--TT--CG--T---T----G----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--G-G---G------T--G-----
gi|63887 : ACTGAA-CGT--T-CG-T--A---CGGT------------------------CA--C-A-A-T----T--------C-ACT--A----T-GT---------CAC-A----GG----A-G--AA--AGGTT--G--AAAT-C---GGGA--TT--CC--T---T----AAAAATATGCAC-------------T-----A-T------G-----C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-GA--AACAATC-----TCCACTT-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-CGGTT-C--TG----A--CATT---T-TG----T--T-T-TGTT
gi|63888 : CTGAA-C-T--A-TG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------T-TAC--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--AG--TG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-T--G-T---T------T--G-----A-GG--C--A-AA--A-----T-----TTA---T-A-C--------AG-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TGTTAT
gi|63889 : CTGAA-C-T--T-TA-T--A---CG-T------------------------CG--C-A-G-T----A--------G-TAC--A----C-AT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--AG--TG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-T--G-T---T------T--G-----A-AG--C--A-AA--A-----T-----TCA---T-A-C--------GG-----C-A-----------T-G-A--A-C---G-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TGTTAT
gi|63890 : CTGAG-C-T--T-TA-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------G-TAC--A----C-GT---------CCT-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--AG--TG--T---T----A----------C-------------T-----A-A------G-A---C--T------T-T--A-T---T------T--G-----A-AG--C--C-AA--A-----T-----TCA---T-A-C--------GG-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TGTTAT
gi|63891 : CTGAA-C-T--T-TG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-G-C----T--------C-TAT--A----C-TT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--AG--TG--A---T----A----------C-------------C-----A-T------G-G---C--G------T-T--A-C---T------G--G-----A-AG--G--A-AA--A-----T-----CCA---T-A-C--------GG-----C-A-----------T-G-A--A-CT--T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TGTTAT
gi|63892 : CTAAA-A-T--T-TG-T--A---CA-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------G-TAC--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--AG--TG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---T--G------T-T--G-T---T------T--G-----A-GG--T--A-AA--A-----T-----CCA---T-A-T--------GG-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---A-TGT---T--T-T-TGTTAT
gi|63893 : CTGAA-C-T--T-TG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-G-TAAAAT----------TAC--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--AA--T--G--A--T-C---G--A--AG--TG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-T----G---T------T--AGA---A-AG--T--A-AA--A-----T-----TCA---T-A-C--------GT-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TT----A--CG-T---T-TG----T--T-T-TGTT
gi|63894 : CTGAA-C-T--T-TG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-G-TAAAAT----------TAC--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--AG--TG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-T----G---T------TAGA-----A-AG--T--A-AA--A-----T-----TCA---T-A-C--------GT-----C-A-----------T-G-A--A-T---T-T--TT----A--CG-T---T-TG-------T-T-TGTTAT
gi|63895 : CTCAA-C-T--T-TG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-G-T----TGTTCACAGT-TGTTCA----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--AG--TG--T---C----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-T--G-T---T------T--G-----A-AG--C----AA---------------------------------GG-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TGTTAT
gi|63896 : CTGAA-C-T--T-CG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-TGC--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-CA-AA--A---T--G--A--T-C---G--A--AG--CG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AA--C--T-AC--A-----T-----
gi|63897 : CTTAA-C-T--T-TG-T--A---CG-T------------------------CA--C-C-G-T----T--------G-TAC--A----C-GT---------CAC-A----T-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--GG--TG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------C-T--G-T---T------T--G-----A-AG--C--A-AA--C-----T-----TCA---T-G-C--------GG-----C-A-----------T-T-A--A-C---T-T--TG----A--CATT---T-TG----T--T-T-Taacagttctac
gi|63898 : CTGAA-C-T--T-TG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------G-TAC--A----C-GT---------CAT-A----A-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---A--A--AG--TG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-T--A-T---T------T--G-----A-AG--C--A-AA--A-----T-----T---------C--------GA-----G-A-----------T---A--T-C---T-G--TG----A---A-T---T-TG----
gi|63899 : TGAA-C-T--T-CG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-A-T----T--------C-TAT--A----C-GT---------CAG-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C------A--TT--CG--T---T----AAT--------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--G-G---T------T--T-----A-AG--C--T-AA--A-----T-----TCC---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--T
gi|63900 : TGAA-C-T--T-CG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-G------T--------C-TAT--A----C-AT---------CCCAA----G-----ACC--AA--A---T--G--A--T-C---GA-A--AT--CG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---CG-G------T-C--A-GT--T------T--G-----A-AG--C--T-AA--G-----TCACAGTTC---T-A-C--------AA-----C-A-----------T-
gi|63901 : TGAA-T-T--T-CA-T--A---CA-T------------------------CA--C-A-A-T----T--------C-TAT--A----C-GTAAGTAATGTCGC-A----G-----A-C--AA--A---A--G--A--T-C---G--A--AG--CA--T---C----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AA--G-----TCACAGTTC---T-A-CACATCACAGA-----C-AAATAATCAAAGC-GTA--A-C---T-T--TG----A--CG-TTAAT-TG----T--T-T-TGTTAT
gi|63902 : TGAA-C-TAAT-C-----A---CG-C------------------------TAACC-A-A-T----T--------C-TAT--A----CCGT---------CAC-A----G-----A----AA--A---T--G--A--G-C---G--A--TT--CG--T---T---------------T-------------A-----A-T------G-AAAAC--GA-----T-C--G-GC--T------T--G-----ACAG--C--T-AA--A-----T-----TCC---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-------T--TGTCATA--CA-T-----------T--T-T-TGTTAT
gi|63903 : TGAA-C-T--T-CGAT--A---CA-T------------------------CA--C-A-A-T----T--------C-TAT--AA---C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--A-------C---G--A--TT--CAATT---T----A----------T-------------T-----A-T------GTA---T--A------TAC--A-G---G------T--GTTAATA-AG--------A--A-----T-----CTC---T-A-----------A-----A-T-----------T-G-A--A-C---G-T--TG----AGTCAGT---T-TA----T--T-T-T
gi|63904 : A-C-T--T-TG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------G-TAC--A----C-GT---------CAC-G----G-----G-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--AG--TG--T---T----A----------T-------------A-----A-T------G-A---C--GTTT---T-T--A-G-------------A-----A-AG--C--A-AA--A-----T-----T
gi|63905 : -C-T--T-CG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-A-T----T--------C-TATGAA----C-GC---------CACAA----G-----A-CA-AA--A---T--G--A--T-C---G--A--TT--CC--T---T----A----------T-------------T-----G-T------G-A---CGTG------T-C--A-G---T------T--G-----A-----CT-T-AA--A-----T-----T-C---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G----A-C---T-T--TG----A--CA-G---T-TT----TA-T-T-TGTTAT
gi|63906 : -T--A---CA-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-TAC--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--AG--TG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--A--T-AA--A-----T-----TCC---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TATTAT
gi|63907 : -T--A---AG-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-TAC--A----C-AT---------CAC-A----G-----A-C--AT--A---T--G--A--T-C---G--A--AG--CG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-AC--C--G------T-C--G-G---T------T--G-----A-AG--C--TAAA--A-----T-----TCT---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-G--A-C-----T--TA----A--CA-TA--T-TG----T--T-T-TGTTAT
gi|63908 : -T--A---AG-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-TAC--AA---C-ATT--------CAC-A----G-----A-C--TA--T---T--G--A--T-C---G--A--AG--CG--T---T----A----------T-------------T-----ATT------G-A---T--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AA--A-----
gi|63909 : -T--A---CA-T------------------------AA--C-A-G-T----T--------C-TAC--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--GG--CG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-
gi|63910 : -T--A---AG-T------------------------CG--C-A-G-T----T--------T-TAC--A----C-GA---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--T--A--T-C---G--A--AG--CG--C---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-TG--C--T-AA--A-----C-----T-T---T-A-C--------AA-------A-----------G-A-A--A-C---TAT--TAC---A--CA-T---T-TG----T--T-T-TGT
gi|63911 : -T--A---AG-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-TAT--A----C-TT---------GGC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---A--A--AA--TG--C---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--A------T-C--A-G---T------T--G-----A-
gi|63912 : -T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-T-C--A----C-AT---------CAC-A----G-----A-C--AT--A---T--G--A--T-C---G--A--AG--CGT-T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--G-G----------T--G-----A-AG--C--T-AA--G-----TCACAGTTC---T-A-C---------A-----C-A-----------T-
gi|63913 : -T------------------------TA--C-A-A-T----T--------C-TAT--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--TC------T---T---------------T-------------T-----G-T------G-A---C--GT-----T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AA--A-----T-----TCC---T-ACC--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C-----T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-
gi|63914 : -T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-TAC--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--AA--TG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---T--G------T-C--A-G----------------------------------A-----T-----TTC---T-C-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C---C-T--TG----A--AA-T---T-TG----T--T-T-TGTTAT
gi|63915 : -A-G-T----T--------C-TAT--GATTCC-GT---------CAT-AACAGG-----A-C--AA--A---TA-G--A--T-TTCTG--A--TTAGCG--T---T----T----------G-------------T-----A-G------A-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--T--T-AA--A-----T-----T-C---T-A-C--------GGTGTATC-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----T--TA-T---C-AT----T--T-T-TG
gi|63916 : --------C-TAT--G----C-TA---------CCC-G----G-----A-C--AA--A---T--T--A--T-C---G--A--AA--TG--T---T----A----------T-------------T-----T-T------G-A---C--G------T-T--G-T---T------T--G-----A-AT--C--A-AA--A-----T-----TCA---T-A-C--------GG-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--
gi|63917 : --A----C-GT---------CCC-AC---G-----A-C--AA------T--G--A--T-C---G--A--AG--TG--T---T----A----------T-------------TTA---A-T------G-A---C--G------T-T--G-T---T------T--G-----A-AG--C--A-AA--A-----T-----TC------A-T--------GG-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--AA-T---T-TG----T--T-T-TGTTAT
gi|63918 : T---------CAT-A----G-----A-A--CC--A---T--G-----T-C---A--A--GT---G--C---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AA--A-----T-----CCC---T-A-C--------GG-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TA----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TGATAT
gi|63919 : AC-A----G-----A-C--AA--T---T--G--A--T-C---G--A--TC--C---T---T----A----------T-------------TCC---G-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------TT-G-----A-AG--C--T-AA--A-----T-----TTCAGCT-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--GA-T---T-TA----T--T-T-
gi|63920 : -A----G-----A-CT-AA--A---T--G--A--T-C---G--A--AG--TG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--T--T-AA--A-----T-----TCC---T-A----------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TATTAT
gi|63921 : -A----G-----A-C--AA------T--G--A--T-C---G--A--TT--CC--T---T----A----------T-------------T-----G-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T--A--A-----T-----TCC---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-------A--T-T-TGTTAT
gi|63922 : -A----G-----A-CTAAA--A---T--G--AA-T-C---G--A--AGATTG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------GGA---C--G------T-C--AAG---T------T--G-----A-AG--T--T-AA--A-----T-----TCC---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--ACC---T-T--TG----A--CA-T---TATG----T--T-T-TATTAT
gi|63923 : -A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--TT--CC--T---T----A----------T-------------T-----G-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--------A-AG--C--T-AA--------T-----TCCA--T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TATTTTT--T-T-TGTTAT
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gi|63903 : TGAA-C-T--T-CGAT--A---CA-T------------------------CA--C-A-A-T----T--------C-TAT--AA---C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--A-------C---G--A--TT--CAATT---T----A----------T-------------T-----A-T------GTA---T--A------TAC--A-G---G------T--GTTAATA-AG--------A--A-----T-----CTC---T-A-----------A-----A-T-----------T-G-A--A-C---G-T--TG----AGTCAGT---T-TA----T--T-T-T
gi|63904 : A-C-T--T-TG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------G-TAC--A----C-GT---------CAC-G----G-----G-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--AG--TG--T---T----A----------T-------------A-----A-T------G-A---C--GTTT---T-T--A-G-------------A-----A-AG--C--A-AA--A-----T-----T
gi|63905 : -C-T--T-CG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-A-T----T--------C-TATGAA----C-GC---------CACAA----G-----A-CA-AA--A---T--G--A--T-C---G--A--TT--CC--T---T----A----------T-------------T-----G-T------G-A---CGTG------T-C--A-G---T------T--G-----A-----CT-T-AA--A-----T-----T-C---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G----A-C---T-T--TG----A--CA-G---T-TT----TA-T-T-TGTTAT
gi|63906 : -T--A---CA-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-TAC--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--AG--TG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--A--T-AA--A-----T-----TCC---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TATTAT
gi|63907 : -T--A---AG-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-TAC--A----C-AT---------CAC-A----G-----A-C--AT--A---T--G--A--T-C---G--A--AG--CG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-AC--C--G------T-C--G-G---T------T--G-----A-AG--C--TAAA--A-----T-----TCT---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-G--A-C-----T--TA----A--CA-TA--T-TG----T--T-T-TGTTAT
gi|63908 : -T--A---AG-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-TAC--AA---C-ATT--------CAC-A----G-----A-C--TA--T---T--G--A--T-C---G--A--AG--CG--T---T----A----------T-------------T-----ATT------G-A---T--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AA--A-----
gi|63909 : -T--A---CA-T------------------------AA--C-A-G-T----T--------C-TAC--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--GG--CG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-
gi|63910 : -T--A---AG-T------------------------CG--C-A-G-T----T--------T-TAC--A----C-GA---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--T--A--T-C---G--A--AG--CG--C---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-TG--C--T-AA--A-----C-----T-T---T-A-C--------AA-------A-----------G-A-A--A-C---TAT--TAC---A--CA-T---T-TG----T--T-T-TGT
gi|63911 : -T--A---AG-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-TAT--A----C-TT---------GGC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---A--A--AA--TG--C---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--A------T-C--A-G---T------T--G-----A-
gi|63912 : -T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-T-C--A----C-AT---------CAC-A----G-----A-C--AT--A---T--G--A--T-C---G--A--AG--CGT-T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--G-G----------T--G-----A-AG--C--T-AA--G-----TCACAGTTC---T-A-C---------A-----C-A-----------T-
gi|63913 : -T------------------------TA--C-A-A-T----T--------C-TAT--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--TC------T---T---------------T-------------T-----G-T------G-A---C--GT-----T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AA--A-----T-----TCC---T-ACC--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C-----T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-
gi|63914 : -T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-TAC--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--AA--TG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---T--G------T-C--A-G----------------------------------A-----T-----TTC---T-C-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C---C-T--TG----A--AA-T---T-TG----T--T-T-TGTTAT
gi|63915 : -A-G-T----T--------C-TAT--GATTCC-GT---------CAT-AACAGG-----A-C--AA--A---TA-G--A--T-TTCTG--A--TTAGCG--T---T----T----------G-------------T-----A-G------A-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--T--T-AA--A-----T-----T-C---T-A-C--------GGTGTATC-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----T--TA-T---C-AT----T--T-T-TG
gi|63916 : --------C-TAT--G----C-TA---------CCC-G----G-----A-C--AA--A---T--T--A--T-C---G--A--AA--TG--T---T----A----------T-------------T-----T-T------G-A---C--G------T-T--G-T---T------T--G-----A-AT--C--A-AA--A-----T-----TCA---T-A-C--------GG-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--
gi|63917 : --A----C-GT---------CCC-AC---G-----A-C--AA------T--G--A--T-C---G--A--AG--TG--T---T----A----------T-------------TTA---A-T------G-A---C--G------T-T--G-T---T------T--G-----A-AG--C--A-AA--A-----T-----TC------A-T--------GG-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--AA-T---T-TG----T--T-T-TGTTAT
gi|63918 : T---------CAT-A----G-----A-A--CC--A---T--G-----T-C---A--A--GT---G--C---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AA--A-----T-----CCC---T-A-C--------GG-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TA----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TGATAT
gi|63919 : AC-A----G-----A-C--AA--T---T--G--A--T-C---G--A--TC--C---T---T----A----------T-------------TCC---G-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------TT-G-----A-AG--C--T-AA--A-----T-----TTCAGCT-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--GA-T---T-TA----T--T-T-
gi|63920 : -A----G-----A-CT-AA--A---T--G--A--T-C---G--A--AG--TG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--T--T-AA--A-----T-----TCC---T-A----------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TATTAT
gi|63921 : -A----G-----A-C--AA------T--G--A--T-C---G--A--TT--CC--T---T----A----------T-------------T-----G-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T--A--A-----T-----TCC---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-------A--T-T-TGTTAT
gi|63922 : -A----G-----A-CTAAA--A---T--G--AA-T-C---G--A--AGATTG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------GGA---C--G------T-C--AAG---T------T--G-----A-AG--T--T-AA--A-----T-----TCC---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--ACC---T-T--TG----A--CA-T---TATG----T--T-T-TATTAT
gi|63923 : -A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--TT--CC--T---T----A----------T-------------T-----G-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--------A-AG--C--T-AA--------T-----TCCA--T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TATTTTT--T-T-TGTTAT
gi|63924 : --T---T----A----------T-------------T-----G-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------TT-G-----A-AG--C--T-AA--A-----T-----TCC---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TA----T--T-T-TGTTAT
blockSeqs : AA TA TAC T CTGACACAATTCTTAACGTCACAG AC C T A AAAA GTTCACAG TC ATTC C AAGTAATGT A ACAG GGAAG TA GGT GG CA AA TCT GG TTTT AT GAC CTCG AAAATATGCA TTCCGAAGAGCGG TGTCG GTCTTG C AAA GT TCTGAA T TTT GACTAG AG TTAAT GT AA AT ACAAT CACAG ACT ACATCACA TGTAT AATAATCAAAG A AT GGT TG TCAT GT T TAA TTTT TA
blockSeqs : . . . A T . T T A AAAA T GA A C T A C G A A T CA G G A TTAG T . C AT . TT . T C G TTT A T . T GA T T . . CACAG AGC G G . T . T . C . T A T A
blockSeqs : . . . G . . . . . A . . A . . . . . A . C CA T . . AGAT . . . T . TA . G . . A . C . T . . . . . CACAG A . T . . . . . . . G . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . A CA A . . TTT . . . . . CC . . . . T . . . T . . . . . A A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . G . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . CA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . AA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . GT . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TC . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . AG . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TT . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . TT . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons : ******
originalCons : ACTGAA-C-T--T-CG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-TAT--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--NN--CG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AA--A-----T-----TCC---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TGTTAT
finalCons : ACTGAA-C-T--T-CG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-TAT--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--NN--CG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AA--A-----T-----TCC---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TGTTAT
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Reference ( family-368 ) : ACTGAA-C-T--T-CG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-TAT--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--NN--CG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AA--A-----T-----TCC---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TGTTAT
gi|63863 : ACTGAA-C-T--T-CG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-A-T----T--------C-TAT--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--TT--CC--T---T----A----------T-------------T-----G-T------G-A---C--GTCTGAAT-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AA--A-----T-----TCC---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-A---T-T--TG----A--CA-T---T-TA----T--T-T-
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gi|63904 : A-C-T--T-TG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------G-TAC--A----C-GT---------CAC-G----G-----G-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--AG--TG--T---T----A----------T-------------A-----A-T------G-A---C--GTTT---T-T--A-G-------------A-----A-AG--C--A-AA--A-----T-----T
gi|63905 : -C-T--T-CG-T--A---CG-T------------------------CA--C-A-A-T----T--------C-TATGAA----C-GC---------CACAA----G-----A-CA-AA--A---T--G--A--T-C---G--A--TT--CC--T---T----A----------T-------------T-----G-T------G-A---CGTG------T-C--A-G---T------T--G-----A-----CT-T-AA--A-----T-----T-C---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G----A-C---T-T--TG----A--CA-G---T-TT----TA-T-T-TGTTAT
gi|63906 : -T--A---CA-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-TAC--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--AG--TG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--A--T-AA--A-----T-----TCC---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TATTAT
gi|63907 : -T--A---AG-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-TAC--A----C-AT---------CAC-A----G-----A-C--AT--A---T--G--A--T-C---G--A--AG--CG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-AC--C--G------T-C--G-G---T------T--G-----A-AG--C--TAAA--A-----T-----TCT---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-G--A-C-----T--TA----A--CA-TA--T-TG----T--T-T-TGTTAT
gi|63908 : -T--A---AG-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-TAC--AA---C-ATT--------CAC-A----G-----A-C--TA--T---T--G--A--T-C---G--A--AG--CG--T---T----A----------T-------------T-----ATT------G-A---T--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AA--A-----
gi|63909 : -T--A---CA-T------------------------AA--C-A-G-T----T--------C-TAC--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--GG--CG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-
gi|63910 : -T--A---AG-T------------------------CG--C-A-G-T----T--------T-TAC--A----C-GA---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--T--A--T-C---G--A--AG--CG--C---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-TG--C--T-AA--A-----C-----T-T---T-A-C--------AA-------A-----------G-A-A--A-C---TAT--TAC---A--CA-T---T-TG----T--T-T-TGT
gi|63911 : -T--A---AG-T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-TAT--A----C-TT---------GGC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---A--A--AA--TG--C---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--A------T-C--A-G---T------T--G-----A-
gi|63912 : -T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-T-C--A----C-AT---------CAC-A----G-----A-C--AT--A---T--G--A--T-C---G--A--AG--CGT-T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--G-G----------T--G-----A-AG--C--T-AA--G-----TCACAGTTC---T-A-C---------A-----C-A-----------T-
gi|63913 : -T------------------------TA--C-A-A-T----T--------C-TAT--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--TC------T---T---------------T-------------T-----G-T------G-A---C--GT-----T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AA--A-----T-----TCC---T-ACC--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C-----T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-
gi|63914 : -T------------------------CA--C-A-G-T----T--------C-TAC--A----C-GT---------CAC-A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--AA--TG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---T--G------T-C--A-G----------------------------------A-----T-----TTC---T-C-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C---C-T--TG----A--AA-T---T-TG----T--T-T-TGTTAT
gi|63915 : -A-G-T----T--------C-TAT--GATTCC-GT---------CAT-AACAGG-----A-C--AA--A---TA-G--A--T-TTCTG--A--TTAGCG--T---T----T----------G-------------T-----A-G------A-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--T--T-AA--A-----T-----T-C---T-A-C--------GGTGTATC-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----T--TA-T---C-AT----T--T-T-TG
gi|63916 : --------C-TAT--G----C-TA---------CCC-G----G-----A-C--AA--A---T--T--A--T-C---G--A--AA--TG--T---T----A----------T-------------T-----T-T------G-A---C--G------T-T--G-T---T------T--G-----A-AT--C--A-AA--A-----T-----TCA---T-A-C--------GG-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--
gi|63917 : --A----C-GT---------CCC-AC---G-----A-C--AA------T--G--A--T-C---G--A--AG--TG--T---T----A----------T-------------TTA---A-T------G-A---C--G------T-T--G-T---T------T--G-----A-AG--C--A-AA--A-----T-----TC------A-T--------GG-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--AA-T---T-TG----T--T-T-TGTTAT
gi|63918 : T---------CAT-A----G-----A-A--CC--A---T--G-----T-C---A--A--GT---G--C---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T-AA--A-----T-----CCC---T-A-C--------GG-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TA----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TGATAT
gi|63919 : AC-A----G-----A-C--AA--T---T--G--A--T-C---G--A--TC--C---T---T----A----------T-------------TCC---G-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------TT-G-----A-AG--C--T-AA--A-----T-----TTCAGCT-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--GA-T---T-TA----T--T-T-
gi|63920 : -A----G-----A-CT-AA--A---T--G--A--T-C---G--A--AG--TG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--T--T-AA--A-----T-----TCC---T-A----------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TG----T--T-T-TATTAT
gi|63921 : -A----G-----A-C--AA------T--G--A--T-C---G--A--TT--CC--T---T----A----------T-------------T-----G-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--G-----A-AG--C--T--A--A-----T-----TCC---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-------A--T-T-TGTTAT
gi|63922 : -A----G-----A-CTAAA--A---T--G--AA-T-C---G--A--AGATTG--T---T----A----------T-------------T-----A-T------GGA---C--G------T-C--AAG---T------T--G-----A-AG--T--T-AA--A-----T-----TCC---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--ACC---T-T--TG----A--CA-T---TATG----T--T-T-TATTAT
gi|63923 : -A----G-----A-C--AA--A---T--G--A--T-C---G--A--TT--CC--T---T----A----------T-------------T-----G-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------T--------A-AG--C--T-AA--------T-----TCCA--T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TATTTTT--T-T-TGTTAT
gi|63924 : --T---T----A----------T-------------T-----G-T------G-A---C--G------T-C--A-G---T------TT-G-----A-AG--C--T-AA--A-----T-----TCC---T-A-C--------GA-----C-A-----------T-G-A--A-C---T-T--TG----A--CA-T---T-TA----T--T-T-TGTTAT