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Reference ( gi|55933 ) : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC---C-A-C-AT--T-C-G-T-T--T--C---C-GA--T--C--A--T-T----T--------T--G--C-C---G----T-T----A------T----A--AC---AA--A----T-CT-GC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG---T--CA-TTCCCC-T-TTGTTTT-ATTAT
gi|55934 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC---C-A-C-GT--T-C-G-T-T--T--C---C-GA--T--C--A--T-T----T--------T--G--C-C---G----T-T----A------T----A--AC---GA--A----T-CT-GC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GT-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ATGAG---T--TA-TT-CCC-T-TTGTTTA-AT
gi|55931 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC---C-A-C-GT--T-C-G-T-T--T--C---T-GA--T--C--A--T-T----T--------T--G--C-C---G----T-TTAAAA------T----A--AC---AA--A----C-CT-GC--------T--G--T-T-G--T-A-AT-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG---T--TA-TTCCCC-T-TTGTTTA-ATCATcgt
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gi|55947 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--A----G-GC---C-A-C-AT--T-T-G-T-T--T--CG--C-G---T--C--A--T-T----T--------T--G--C-C---G----T-T----A------T----A--AC---AA--A----T-CT-GC--------T--GT-T-T-G--T-A-AC--A-A--AT-G--C-C---------T-CTTA-CC--A-GT-ACGA----T--TA-TTCCCC-T-TTGTT
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gi|55943 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC---C-A-C-GT--T-T-G-T-T--T------C-GG--T--C--A--T-T----T--------TG-G--CGC---G----T-T----A------A----A--AC---GA--A----T-CT-GC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A--AT-GGCC-C-----TC--T-TTTA-CC--A-GTAACGAG---T--TA-TT-CCC-T-TTGTGTTAATTATcat
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gi|55952 : TACAG-T-CAG-CTC-T--T----G-T-----TAC----A-A--C----A-GC---C-A-C-GT----A-G-T-T--T--C---C-GA--T--C-----T-T----T--------T--G--C-C---GGCCGT-T----A------T----A--ACG--GA--A----T-CT-GC--------C--G----T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G----C-----TAT-T-TTTA-TC--G-GT-ACGAG---T---A-TT-CCC-T-TTGTTTA-ATCAT
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gi|55942 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-A-----TAC----A-A--C----G-GC---C-A-C-GT--T-C-A-T-T-----C---C-AA--T--C--A--T-T----T-----------A--C-C---A----T-T----A------T----A--AG---GA--A----T-CT-GC--------C--A--T-T-G--T-A-AC-AA-T--AT-G--C-A-----TA--T-TTTA-CC--G-AT-ATGAG---T--TA-TTACC----TTG-TTT-ATTcat
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gi|55961 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----A-T-----TAC----A-A--C----G-GC---C-A-C-GT--T-T-G-T-T--T--C---
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gi|55965 : ACAG-A-CAG-TTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC---C-A-C-GT--T-C-G-T-T--T--C---C-GA--T--C--A--T-T----T--------T--G--C-T---G----T-T----A------T----A--AC---GA--A----T-CT-GC--------C--G--T-T-G--T-A-A--GG-A--AT-G--C-C-----CA--T-TTTA-TC--A-GT-ACGAG---T--TA-TTCCCC-T-TTGTTTA-ATCAT
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gi|55968 : CAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC---C-A-C-GT--T-T-G-T-T--T--C---C-GG--T--C--A--T-T----T--------T--G--C-C---G----T-T----A------A----A--AC---GA--A----T-CT-GC--------T--G--T-T-G--T---AC-AA-A--AT-G--C-C-----T---C-TTTA-TC--A-GT-ACGAG---TTATA-TTCCCC-T-TTGTTTA-ATCATc
gi|55970 : CAG-T-CAG-CTC-T--C----A-T-----TAC----A-A--C----G-GC---C-A-C-GT--T-C-A-T-G--T--C---C-AA--T--A--A--T-T----T--------T--G--C-C---G----C-A----A------T----A--AC---GA--T----T-CT-GC--------C--A--T-T-G--T-A----GATT--AT-G--CAT-----TA--T-ATTA-CT--G-GT-ATGGA---A--TA-TTCCCT-TGTTATTCT-ATC
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gi|55972 : CAGAT-CAG-CTC-T--C----A-T-----TAC----A-AG-C----G-GC---C-A-G-TT--T-C-GTT-T--T--C---C-GAATT--C--C--C-T----T--------T--T--C-C---T----T-T----A------T----AACAC---AA--A----T-CT-GC--------C-------T-G--T-A-AC-GA-AAGAC-A--C-A-----CA--TATTTA-CC--G-TG-ACAAG---TTATA-TTCCCC-T-TTATT
gi|55975 : AG-T-CAG-CCT-T--CAGGCG-T-----TAC----A----C----G-GC---C-A-C-GT--T-C-G-T-T--TT-C---C-GA--T--C--A--T-T----C--------T--G--C-A---G----T-T----A------T----A--AC---AA--A----T-CT-GC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GGTA--AT-G--C-C-----TGATT-TTTA-CT--GTGT-ACGAG---T--TA-TTCCC
gi|55974 : AG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC---T-A-C-GT--T-T-G-T-T--T--C---C-GA--T--C--A----T----T--------T--G--C-T---G----T-TA---A------T----T--AC---GA--A----T-CT-GC--------A-------T-G--TAA-AC----A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GTAACTAG---T--TA-TTCCCC-T-TTGTagtgtgatcat
gi|55976 : AG-T-CAG-CTC-T--A----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC---C-A-CTGT--T-T-G-T-T--T--C---C-GG--T--C--A----T----T--------T--G--C-C---A----T-T----A------T----A--ACGG-AA--A----T-CT-----------C--GTTT-T-G--T-A-ACAGA-A--AT-G--CGC-----T---T-TTTA-CC--A-GT-TAGCG---T--TT-ATCCCC-C-TTGTTTataatca
gi|55977 : AG-T-CAG-CTC-T--C------TAAAAATAC----A-AAAC----GTGCT--C-ATC-TT--T-C-T-T-T--T--CGCCC-GAA-T--C--A--AAT----T--------T--G--C-C---A----T-T----A------T----A--AC---GA--A----T-C--GC--------C--G--T-A-G--T-A-AG-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTCA-CT-----T-ACAAA---T--AT-TTCCCC-T-TTGTTTA-ATAATagatcgt
gi|55973 : AG-T-CAG-CTC-T--C----GAT-----TAC----ACA--C----G-GC---CGA-C-ATGTTGT-G-T-T--TGCC---C-G---T--C--A--T-T----TGCTTGCTCT--G--CTC---G----T-TTA--A------A----A--AC---GA--A----T-AT-GC--------------T-T----T-A-AC-AA-C--AA-G--CTC-----TA--T-TT-A-CC--AAGT-ACGAG---T--TA-TTTCCT-T-TTG--TT-ATT
gi|55978 : G-T-CAAACTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----T-GC---C-A-G-GT--T-C-G-T-T--T--C---T-GA--T--C--A--T-T----T--------T--G--C-C---G----T-T----A------T----A--GC---AG--A----T-CT-GC--------T--G--C-T-G--T-A-AT-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTC-TG--G-GT-GTAGG---T--TA-TT--CC-T-TTGTTTA-ATCATaatcat
gi|55979 : G-T-CAG-CTC-T-------G-T-----TACC---A-A--T----G-GC---C-A-C-TT--T-C-G-T-T--T--C---C-AAA-T--C--A--T-C----T--------TATG--C-TT--G----T-T----A------T----A--TCGCGAA--C----T-CT-GC--------C--G--T-TTG--TTA-AC-GC-AT-AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CT--G-AT-ACGAG---T--TT-TTCCCC-T-TTG-TTT-ATT
gi|55980 : -T-CAGGCTC-T--C----G-T-----TAC----A-C--C----A-AC---C---C-GT--T-C-G-T-T--A--C---T-GA--T--C--A--T-TCATTT--------T--A--C-C---G----T-T----A------T----C--AC---GA--A----T-CT-GC--------C--G--T-G-G--T-A-GCAAA-A--AT-G--C-C-----AAC-T-TTTACCC--G-GT-AC--G---T--TA-TTCCCCTT-TTGTTTT--TTcat
gi|55981 : -CAG-CTC-T--C----A-T-----TAC----A-A--C----G-GC---C-A-C-GT--T-T-G-T-T--T--C---atca
gi|55982 : -CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC---C-A-C-GT--T-T-A-T-T--T--C---C-GA--T--C--A--T-T----T--------T--G--C-C---G----T-T----A------T----A--AC---AA--A----A-CT-GC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----AA--T-TTTA-CC--G-TT-ACGAG---T--TA-TTCCTC----TGTTTA-ATCAT
gi|55932 : TT-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-G----C-A-G-AT--T-C-G-T-T--
gi|55969 : tacagtcagctcttgttacaacagccacgttagtttccgatcattttgccggccgttatTT-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GCAGAC-A-G-AT--T-C-G-T-T------------A--T--C--A------------------C--G--G-CAAAA----T-G----A------TCGGAA--AC---GA--A----C-GTGGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-G--A--G--C-T-----TA--C-Ttgcctattttatcggtacgagttattcccctttgtttaatcat
gi|55939 : cTT-T--C----G-T-----TAC----A-A--C------GC---C-A-C-AT--T-C-A-T-T--A--T---C-AA--TGGC--A--A-A----C--------T--GA-T-C---G-----------G------A----A--AC---GA--A----T-GTGGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-G--Atgccttttttaccggtacgagttattcccctttgttttatc
gi|55946 : tacagtcagcTT-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-G----C-A-G-AT--T-C-G-T-T--tgcctattttaccagtacgagttattccctattgtttaatca
gi|55983 : tacagtcagctctcgttacttataacgtcgtttccaatcattttgccgttat-T-----TAC----A-A--C----G-GC---C-A-C-GT--T-C-G-T-T--T--A---T-GA--T--C--A--T-T----T--------T--G--C-C---G----T-T----ACATGTAT----A--AC---GA--A----T-CT-GC--------C--G--T-T-T--T-A-AC-AA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG---T--TA-TTCCCC-T-T--TTTT-Atgcctattttaacagtatgagatattcccctttgtttaatcat
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gi|55986 : --C---C-G---T--C--A--T-T----T-----------G--C-T---G----T-A----A-----------A--AC---GA--A----T-CT-GC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A-----G--C-C---------T-CTTA-CC--A-Gcat
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gi|55987 : --C--A--T-T----T--------T--G--C-C---G----T-T----A------T----A--AC---GA--T----T-CT-GC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----CA--T-TTTA-CC--A-GT-ACGAG---T--TG-TTCCCC-T-TTGTTTA-ATaaacggattat
gi|55988 : -CT-GC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A--AT-G--C-C-----TC--T-TTTA-CC--A-AT-ACGAG---T--TA-TTCCCC-T-TTGTTTA-ATC
gi|55989 : -A-AT-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACAAG---T--TA-TTCCCC-T-TTGTTTA-ATCAT
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Alignments
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lowQualScore : . . . . .. .... . ..... .... . .. .... . . ... . ..... . . . .. ... . .. . .. .. . .... ........ .. .. . . .... . .... ...... .. . .. .. .... . ........... .. . . .. . . . . .. . .. . ..... ... . . .. . . . .. ... . . . ... . ..
lowQualScore : 8 8 5 8 00 6666 7 33333 3333 7 88 3333 7 7 333 7 66666 7 7 7 77 999 5 99 7 77 00 7 5555 66666666 77 77 4 7 0000 7 9999 111111 00 7 00 00 9999 7 55555555555 77 7 7 00 4 4 4 4 77 7 66 1 77777 666 3 7 22 4 4 7 99 222 7 7 7 333 7 55
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Reference ( family-363 ) : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-TT-NATCAT
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gi|55954 : TACAG-T-TAG-CTC-T--G----T-T-----TAC----A-A--C----G-GT-C---A-C-----GTT-CG-T-AT--C---C-CA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TT--AC-G--A--A----T-CTAC--------C--A--T-T-G--T-A-AC-AA-T--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GA-TTGAG-T--A---G-TTTCCT-T-TTG---T-TT-ATTCAT
gi|55955 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT------C-GA--T-C--A--A-T----T--------T--G--C-T------T-T----A------TA--AC-G--G--A----T-CTGC--------C--A--T-T-G--T-A-AC--A-C--AT-G--C-C-----TA-----TTA-CCATG-GT-AT-AG-T--T---A-TTCCCA-T-TTG---T-TGAAATCAT
gi|55956 : TACAG----AG-CTC-T--C----G-A-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT------C-GG--T-C--ATCT-T----T--------C--G--C-C-G----T-T-----------TA--AC-G--ACCA----T-CTGC--------T--G--T-A-G--T-ACAA-AA-A--AT----C-C-----TC--TATTTA-CC--A-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-C-TTG-----TT-AATCAT
gi|55957 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----A-T-----TAC----A-A--C----C-GT-A---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---C-AA--T-C--G--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A-------------G--A--A----T-CTGC--------CATA--T-T-G--T-A-AT-GA----------C-CTTTTTTT--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-TT-GTTCAT
gi|55958 : TACAG-TTCAG-CTCGT--C----G-TC----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GT-----T-TT--C---CAGG--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------AA--AC-G--A--A----T-CTGCT-------T--G--TAT-G--T-ACAC-AA-A--AT-G--C-C---------T-CTTA-CC--A-GT-TAGAGCT--T---A-TTCCCT-T-TGA---T-TT-A
gi|55959 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-T--C----A-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---A-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-A----T-T----A------TA--AT-G--A--A----T-TTGC--------C--A--T-C-GCTT-A-AC-
gi|55960 : TACAG-T-CAG-CTC-TGCC----G-T-----TAC----A-G--CCACAG-GC-C---A-------GTT-CA-C-TT--C---CTAA--T-C--C--A-T----T--------T--GAAA-C-G----TCT----A------TA--AC-G--A--AT---T-CTGC--------T--A----T-G--T-------A-A--AT-G--------------------------------GAG-T--TATCA-TTCCCC-T-TTG---T-TT-AATCAT
gi|55961 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----A-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---
gi|55962 : T-G--C-C-----TA--T-TTTA-CT--G-GT-ACAGG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-TT-ATTCAT
gi|55963 : tacagccagcgctcattacagcggcatttaatttactggcaaattcTACAG-T-CAA-CTC-T--C----G-A-----TA-----A-A--C----C-GC-C---A-CCTTTTGTT-C----TT--C---T-GA-------A--T-T----T--------T--G--G-C-G----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-TTG
gi|55964 : TACAG-C-TGG-CTC-C--C----G-T-----TAC----A-A--TG---G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TG--C---C-AAC-T-C--T--T-T----A--------T--G--C-C---------------------A--A---------------------------------T-T-A--T-A-AC-GA-T--AT-G--C-C-----CA--T-TTTA-CC--
gi|55965 : ACAG-A-CAG-TTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-T-G----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-A--GG-A--AT-G--C-C-----CA--T-TTTA-TC--A-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-TT-AATCATctttgtttattcat
gi|55966 : ACTG-T-CA--CGT-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C-----C-----GTT-TG-T-TT--C---C-GAA-T-CT-A--T-T----T--------T--G--C---G----T------A------TT--AA-G--A---------TTGC-----------A--T-T-G--T-A-AT-GA-A--AT-G--C-C-----TA----TTTA-CT--G-G--AC-AA-T--T---A-TT-CCC-T-TTG-----TT-AATCAT
gi|55967 : ACAG---CTG-CTC-T--T----G-T-----TAC----A-A--C----G-G--C---A-T-----GCT-CA-T-TT--C---C-AA--T-C--A---------T--------T--GC-C-C-A----T-T----A------TA--AC-G-----A----T-CTG---------C--G----T-G--T-A-A--GA-A--AG-G--G-C-----TA--T-TTTA-CT----GT-ACG-T-T--T---A-TTCCCT-T-CTG---T-GT-AGTCA
gi|55968 : CAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---C-GG--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------AA--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T---AC-AA-A--AT-G--C-C-----T---C-TTTA-TC--A-GT-ACGAG-TTAT---A-TTCCCC-T-TTG---T-TT-AATCAT
gi|55969 : CAG-T-AAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-G----A------TA--AC-G--A--ATCTGT-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TT--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-TT-TATC
gi|55970 : CAG-T-CAG-CTC-T--C----A-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CA-T-GT--C---C-AA--T-A--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----C-A----A------TA--AC-G--A--T----T-CTGC--------C--A--T-T-G--T-A----GATT--AT-G--CAT-----TA--T-ATTA-CT--G-GT-ATGGA-A--T---A-TTCCCT-TGTTA---T-TC-TATCA
gi|55971 : CAG-T-TAA-CTC-T--G----T-T-----TAC----A-A--C----G-GT-C---A-C-----GTT-CG-TAAT--C---C-CA--T-CATA--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TT--AC-G--C--A----CACTAC--------C--A--T-T-G--T-A-AC-AA-T--AT-GC-C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GA-TTGAG-T--A---AGTTTCCT-T-TTG---T-TT-TAT
gi|55972 : CAGAT-CAG-CTC-T--C----A-T-----TAC----A-AG-C----G-GC-C---A-G-----TTT-CGTT-TT--C---C-GAATT-C--C--C-T----T--------T--T--C-C-T----T-T----A------TAACAC-A--A--A----T-CTGC--------C-------T-G--T-A-AC-GA-AAGAC-A--C-A-----CA--TATTTA-CC--G-TG-ACAAG-TTAT---A-TTCCCC-T-TTA---T-T
gi|55973 : AG-T-CAG-CTC-T--C----GAT-----TAC----ACA--C----G-GC-CGACA-T-----GTTGTG-T-TTGCC---C-G---T-C--A--T-T----TGCTTGCTCT--G--CTC-G----T-TTA--A------AA--AC-G--A--A----T-ATGC--------------T-T----T-A-AC-AA-C--AA-G--CTC-----TA--T-TT-A-CC--AAGT-ACGAG-T--T---A-TTTCCT-T-TTG---T-T
gi|55974 : AG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-T---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---C-GA--T-C--A----T----T--------T--G--C-T-G----T-TA---A------TT--AC-G--A--A----T-CTGC--------A-------T-G--TAA-AC----A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GTAACTAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-AT-AATCAattaaatcat
gi|55975 : AG-T-CAG-CCT-T--CAGGCG-T-----TAC----A----C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TTT-C---C-GA--T-C--A--T-T----C--------T--G--C-A-G----T-T----A------TA--AC-A--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GGTA--AT-G--C-C-----TGATT-TTTA-CT--GTGT-ACGAG-T--T---A-TTCCCA-----G---T-GT-GATCAT
gi|55976 : AG-T-CAG-CTC-T--A----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-CT----GTT-TG-T-TT--C---C-GG--T-C--A----T----T--------T--G--C-C-A----T-T----A------TA--AC-GGAA--A----T-CT----------C--GTTT-T-G--T-A-ACAGA-A--AT-G--CGC-----T---T-TTTA-CC--A-GT-TAGCG-T--T---T-ATCCCC-C-TTG---T-TTAGATCGT
gi|55977 : AG-T-CAG-CTC-T--C------TAAAAATAC----A-AAAC----GTGCTC---ATC-----TTT-CT-T-TT--CGCCC-GAA-T-C--A--AAT----T--------T--G--C-C-A----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-C-GC--------C--G--T-A-G--T-A-AG-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTCA-CT-----T-ACAAA-T--A---T-TTCCCC-T-TTG---T-TT-AATAAT
gi|55978 : G-T-CAAACTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----T-GC-C---A-G-----GTT-CG-T-TT--C---T-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--GC-A--G--A----T-CTGC--------T--G--C-T-G--T-A-AT-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTC-TG--G-GT-GTAGG-T--T---A-TT--CC-T-TTG---T-TT-AATCAT
gi|55979 : G-T-CAG-CTC-T-------G-T-----TACC---A-A--T----G-GC-C---A-C-----TTT-CG-T-TT--C---C-AAA-T-C--A--T-C----T--------TATG--C-TTG----T-T----A------TATCGC-G--A--AC---T-CTGC--------C--G--T-TTG--TTA-AC-GC-AT-AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CT--G-AT-ACGAG-T--T---T-TTCCCC-T-TTG---T-TT-ATTCAT
gi|55980 : -T-CAGGCTC-T--C----G-T-----TAC----A-C--C----A-AC-C-----C-----GTT-CG-T-TA--C---T-GA--T-C--A--T-TCATTT--------T--A--C-C-G----T-T----A------TC--AC-G--A--A----T-CTGC--------C--G--T-G-G--T-A-GCAAA-A--AT-G--C-C-----AAC-T-TTTACCC--G-GT-AC--G-T--T---A-TTCCCCTT-TTGTTTT-TT-AATCA
gi|55981 : -CAG-CTC-T--C----A-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---
gi|55982 : -CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TA-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-A--A--A----A-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----AA--T-TTTA-CC--G-TT-ACGAG-T--T---A-TTCCTC----TG---T-TT-AATCAT
gi|55983 : -T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--A---T-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----ACATGTATA--AC-G--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-T--T-A-AC-AA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TT----T-TT-AATCA
gi|55984 : G-N-TT--C---T-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------CA--AC-A--A--A----T-CTGA--------T--G--T-T-G--T-A-TC-GA-T--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GA-ACAAA-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-TT-ATTCAT
gi|55985 : --C---C-G---T-C--A--T-T----T-----------G--C-T-G----T-A----A-------A--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A-----G--C-C---------T-CTTA-CCA-G-AA-ACGGA-T--T---A-T
gi|55986 : --C---C-G---T-C--A--T-T----T-----------G--C-T-G----T-A----A-------A--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A-----G--C-C---------T-CTTA-CCA-G-AA-ACGGA-T--T---A-T
gi|55987 : -C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-G--A--T----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----CA--T-TTTA-CC--A-GT-ACGAG-T--T---G-TTCCCC-T-TTG---T-TT-AAT
gi|55988 : -CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A--AT-G--C-C-----TC--T-TTTA-CC--A-AT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-TT-AATCA
gi|55989 : -A-AT-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACAAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-TT-AATCAT
gi|55990 : --AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-C--T---A-TTACAC-T-TTG---T-TT-ATTCAT
gi|55991 : -----TN--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TT----T-TT-AATCA
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Alignments
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lowQualScore : . . . . .. .... . ..... .... . .. .... . . ... . ..... . . . .. ... . .. . .. .. . .... ........ .. .. . . .... . .... ...... .. . .. .. .... . ........... .. . . .. . . . . .. . .. . ..... ... . . .. . . . .. ... . . . ... . . .. .
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consensus : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
Reference ( family-363 ) : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55929 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----C-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---C-GG--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------AA--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A--AT-G--C-C-----TC--T-TTTA-CC--A-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55930 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---C-GG--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------AA--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A--AT-G--C-T-----TC--T-TTTA-TC--A-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55931 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---T-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-TTAAAA------TA--AC-A--A--A----C-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AT-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
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gi|55933 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----ATT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-A--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--C---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--T-ATTAT
gi|55934 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GT-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ATGAG-T--T---A-TT-CCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCGT
gi|55935 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---C-GG--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-A----T-T----A------AA--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A--AT-G--C-C-----TC--T-TTTA-CC--A-GT-ACAAG-T--T---A-TTCCCC---TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55936 : TACAG-T-CAG-CTC-T--T----G-TC----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---C-CA--TTC--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----G------TA--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AT-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CT--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCT-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55937 : TACAG-T-CAG-CTC-T--A----G-T-----TAC----A-A--C----A-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---T-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-A----T-T-----------TA--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-T--T-A-AT-GA-A--AT-G--C-C-----TG--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TAG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55938 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--T----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AT-G--A--A----T-CTGCCCGAGTGTC--G--T-T-G--C-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GA-ATGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--T-ATCAT
gi|55939 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----ATT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--G-T----T--------T--G--C-C-A----T-TG---A------TA--AT-G--A--A----T-GTGG--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--A-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCT-A-TTG---T-T-T--A-ATCA
gi|55940 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---C-GG--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-T-G----T-T----A------AA--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A--AT-G--C-C-----TC--T-TTTA-CC--A-GA-ACGAG-T--T---A-T
gi|55941 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-A-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CA-T-TT--C---C-AA--T-C--A--T-T----T--------T--A--C-C-A----T-T----A------TA--AG-G--A--A----T-CTGC--------C--A--T-T-G--T-A-AC-AA-T--AT-G--C-A-----TA--T-TTTA-CC--G-AT-ATGAG-T--T---A-TTCACC-T-TTG---T-T-T--A-TTCAT
gi|55942 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-A-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CA-T-T---C---C-AA--T-C--A--T-T----T-----------A--C-C-A----T-T----A------TA--AG-G--A--A----T-CTGC--------C--A--T-T-G--T-A-AC-AA-T--AT-G--C-A-----TA--T-TTTA-CC--G-AT-ATGAG-T--T---A-TTACC----TTG---T-T-T--A-TTCAT
gi|55943 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT------C-GG--T-C--A--T-T----T--------TG-G--CGC-G----T-T----A------AA--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A--AT-GGCC-C-----TC--T-TTTA-CC--A-GTAACGAG-T--T---A-TT-CCC-T-TTG---TGT-T--A-ATTAT
gi|55944 : TACAG-T-AAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GA-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--A-T----T--------T--G--C-G-G----T-T----A------TA--AC-G--C--A----T-CTGC--------C--G--T-T-A--T-A-AT-GA-A--AT-G--C-C-----TGTTT-TTTT-CT--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATC
gi|55945 : TACAG-T-CAG-CT--T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G--C-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---C-GG--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------AA--AC-G--A--A----T-CT-C--------T--G--T-T-G--T---AC-AA-A--ATGG--C-C-----T---C-TTTA-CC--A-GT-ACGAG-T--T---A--TCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55946 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TACTTATA-A--C----G------------------T-CG-T-TT--C---C-AA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-AC--A-GT-ATGAG-A--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55947 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--A----G-GC-C---A-C-----ATT-TG-T-TT--CG--C-G---T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-A--A--A----T-CTGC--------T--GT-T-T-G--T-A-AC--A-A--AT-G--C-C---------T-CTTA-CC--A-GT-ACGA--T--T---A-TTCCCC-T-TTG-----T-T--A-ATCAT
gi|55948 : TACAG---AAA-CTC-T--C----G-T------AC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T---------C-AG--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-G--A--G----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCT-T-
gi|55949 : TACAG-T-CAG-CTC-C--C----T-T-----TAC----A-A--T----T-GC-C---A-C-----ATT-C--T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T-------C-G----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-CTCC--------T--G----T-G--T-A-AC-AA-A--AT-G--C-C-----TA-----TTA-CC--A-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC---TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55950 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-C--C----G-AC-T---A-C-----ATT-CG-T-GT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-A----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-CTGT--------T--G--T-T-G--T-A-AC-GA-T--AT-G--C-C-----TT--T-TTTA-CC--C-GT-ACAAT-T--T---A-TTCCCC-T-ATC---T-T-T--A-TTCAT
gi|55951 : TACAA-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--T----G-GC-C---A-C-----GTT-AG-T-TT------------------------------------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--GC-G--A--A------CTGC--------C--G--T-T-G--A-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-AT-GCGAA-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55952 : TACAG-T-CAG-CTC-T--T----G-T-----TAC----A-A--C----A-GC-C---A-C-----GT--AG-T-TT--C---C-GA--T-C-----T-T----T--------T--G--C-C-GGCCGT-T----A------TA--ACGG--A--A----T-CTGC--------C--G----T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G----C-----TAT-T-TTTA-TC--G-GT-ACGAG----T---A-TT-CCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55953 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---T-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------CA--AC-A--A--A----T-CTGA--------T--G--T-T-G--T-A-TC-GA-T--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GA-ACG
gi|55954 : TACAG-T-TAG-CTC-T--G----T-T-----TAC----A-A--C----G-GT-C---A-C-----GTT-CG-T-AT--C---C-CA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TT--AC-G--A--A----T-CTAC--------C--A--T-T-G--T-A-AC-AA-T--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GA-TTGAG-T--A---G-TTTCCT-T-TTG---T-T-T--A-TTCAT
gi|55955 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT------C-GA--T-C--A--A-T----T--------T--G--C-T------T-T----A------TA--AC-G--G--A----T-CTGC--------C--A--T-T-G--T-A-AC--A-C--AT-G--C-C-----TA-----TTA-CCATG-GT-AT-AG-T--T---A-TTCCCA-T-TTG---T-T-GA-A-ATCAT
gi|55956 : TACAG----AG-CTC-T--C----G-A-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT------C-GG--T-C--ATCT-T----T--------C--G--C-C-G----T-T-----------TA--AC-G--ACCA----T-CTGC--------T--G--T-A-G--T-ACAA-AA-A--AT----C-C-----TC--TATTTA-CC--A-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-C-TTG-----T-T--A-ATCAT
gi|55957 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----A-T-----TAC----A-A--C----C-GT-A---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---C-AA--T-C--G--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A-------------G--A--A----T-CTGC--------CATA--T-T-G--T-A-AT-GA----------C-CTTTTTTT--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--G-TTCAT
gi|55958 : TACAG-TTCAG-CTCGT--C----G-TC----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GT-----T-TT--C---CAGG--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------AA--AC-G--A--A----T-CTGCT-------T--G--TAT-G--T-ACAC-AA-A--AT-G--C-C---------T-CTTA-CC--A-GT-TAGAGCT--T---A-TTCCCT-T-TGA---T-T-T--A-A
gi|55959 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-T--C----A-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---A-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-A----T-T----A------TA--AT-G--A--A----T-TTGC--------C--A--T-C-GCTT-A-AC-
gi|55960 : TACAG-T-CAG-CTC-TGCC----G-T-----TAC----A-G--CCACAG-GC-C---A-------GTT-CA-C-TT--C---CTAA--T-C--C--A-T----T--------T--GAAA-C-G----TCT----A------TA--AC-G--A--AT---T-CTGC--------T--A----T-G--T-------A-A--AT-G--------------------------------GAG-T--TATCA-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55961 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----A-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---
gi|55962 : T-G--C-C-----TA--T-TTTA-CT--G-GT-ACAGG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-TTCAT
gi|55963 : tacagccagcgctcattacagcggcatttaatttactggcaaattcTACAG-T-CAA-CTC-T--C----G-A-----TA-----A-A--C----C-GC-C---A-CCTTTTGTT-C----TT--C---T-GA-------A--T-T----T--------T--G--G-C-G----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-TTG
gi|55964 : TACAG-C-TGG-CTC-C--C----G-T-----TAC----A-A--TG---G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TG--C---C-AAC-T-C--T--T-T----A--------T--G--C-C---------------------A--A---------------------------------T-T-A--T-A-AC-GA-T--AT-G--C-C-----CA--T-TTTA----------------------------CCC-T-TTG---T-T-T--A-TTCAT
gi|55965 : ACAG-A-CAG-TTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-T-G----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-A--GG-A--AT-G--C-C-----CA--T-TTTA-TC--A-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55966 : ACTG-T-CA--CGT-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C-----C-----GTT-TG-T-TT--C---C-GAA-T-CT-A--T-T----T--------T--G--C---G----T------A------TT--AA-G--A---------TTGC-----------A--T-T-G--T-A-AT-GA-A--AT-G--C-C-----TA----TTTA-CT--G-G--AC-AA-T--T---A-TT-CCC-T-TTG-----T-T--A-ATCAT
gi|55967 : ACAG---CTG-CTC-T--T----G-T-----TAC----A-A--C----G-G--C---A-T-----GCT-CA-T-TT--C---C-AA--T-C--A---------T--------T--GC-C-C-A----T-T----A------TA--AC-G-----A----T-CTG---------C--G----T-G--T-A-A--GA-A--AG-G--G-C-----TA--T-TTTA-CT----GT-ACG-T-T--T---A-TTCCCT-T-CTG---T-G-T--A-GTCA
gi|55968 : CAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---C-GG--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------AA--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T---AC-AA-A--AT-G--C-C-----T---C-TTTA-TC--A-GT-ACGAG-TTAT---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55969 : CAG-T-AAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-G----A------TA--AC-G--A--ATCTGT-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TT--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--T-ATC
gi|55970 : CAG-T-CAG-CTC-T--C----A-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CA-T-GT--C---C-AA--T-A--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----C-A----A------TA--AC-G--A--T----T-CTGC--------C--A--T-T-G--T-A----GATT--AT-G--CAT-----TA--T-ATTA-CT--G-GT-ATGGA-A--T---A-TTCCCT-TGTTA---T-T-C--T-ATCA
gi|55971 : CAG-T-TAA-CTC-T--G----T-T-----TAC----A-A--C----G-GT-C---A-C-----GTT-CG-TAAT--C---C-CA--T-CATA--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TT--AC-G--C--A----CACTAC--------C--A--T-T-G--T-A-AC-AA-T--AT-GC-C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GA-TTGAG-T--A---AGTTTCCT-T-TTG---T-T-T--T-AT
gi|55972 : CAGAT-CAG-CTC-T--C----A-T-----TAC----A-AG-C----G-GC-C---A-G-----TTT-CGTT-TT--C---C-GAATT-C--C--C-T----T--------T--T--C-C-T----T-T----A------TAACAC-A--A--A----T-CTGC--------C-------T-G--T-A-AC-GA-AAGAC-A--C-A-----CA--TATTTA-CC--G-TG-ACAAG-TTAT---A-TTCCCC-T-TTA---T-T-
gi|55973 : AG-T-CAG-CTC-T--C----GAT-----TAC----ACA--C----G-GC-CGACA-T-----GTTGTG-T-TTGCC---C-G---T-C--A--T-T----TGCTTGCTCT--G--CTC-G----T-TTA--A------AA--AC-G--A--A----T-ATGC--------------T-T----T-A-AC-AA-C--AA-G--CTC-----TA--T-TT-A-CC--AAGT-ACGAG-T--T---A-TTTCCT-T-TTG---T-TATTAA-ATCAT
gi|55974 : AG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-T---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---C-GA--T-C--A----T----T--------T--G--C-T-G----T-TA---A------TT--AC-G--A--A----T-CTGC--------A-------T-G--TAA-AC----A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GTAACTAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-A-T--A-ATCA
gi|55975 : AG-T-CAG-CCT-T--CAGGCG-T-----TAC----A----C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TTT-C---C-GA--T-C--A--T-T----C--------T--G--C-A-G----T-T----A------TA--AC-A--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GGTA--AT-G--C-C-----TGATT-TTTA-CT--GTGT-ACGAG-T--T---A-TTCCCA-----G---T-G-T--G-ATCAT
gi|55976 : AG-T-CAG-CTC-T--A----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-CT----GTT-TG-T-TT--C---C-GG--T-C--A----T----T--------T--G--C-C-A----T-T----A------TA--AC-GGAA--A----T-CT----------C--GTTT-T-G--T-A-ACAGA-A--AT-G--CGC-----T---T-TTTA-CC--A-GT-TAGCG-T--T---T-ATCCCC-C-TTG---T-T-T--AGATCGT
gi|55977 : AG-T-CAG-CTC-T--C------TAAAAATAC----A-AAAC----GTGCTC---ATC-----TTT-CT-T-TT--CGCCC-GAA-T-C--A--AAT----T--------T--G--C-C-A----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-C-GC--------C--G--T-A-G--T-A-AG-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTCA-CT-----T-ACAAA-T--A---T-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATAAT
gi|55978 : G-T-CAAACTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----T-GC-C---A-G-----GTT-CG-T-TT--C---T-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--GC-A--G--A----T-CTGC--------T--G--C-T-G--T-A-AT-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTC-TG--G-GT-GTAGG-T--T---A-TT--CC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55979 : G-T-CAG-CTC-T-------G-T-----TACC---A-A--T----G-GC-C---A-C-----TTT-CG-T-TT--C---C-AAA-T-C--A--T-C----T--------TATG--C-TTG----T-T----A------TATCGC-G--A--AC---T-CTGC--------C--G--T-TTG--TTA-AC-GC-AT-AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CT--G-AT-ACGAG-T--T---T-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-TTCAT
gi|55980 : -T-CAGGCTC-T--C----G-T-----TAC----A-C--C----A-AC-C-----C-----GTT-CG-T-TA--C---T-GA--T-C--A--T-TCATTT--------T--A--C-C-G----T-T----A------TC--AC-G--A--A----T-CTGC--------C--G--T-G-G--T-A-GCAAA-A--AT-G--C-C-----AAC-T-TTTACCC--G-GT-AC--G-T--T---A-TTCCCCTT-TTGTTTT-T-T--A-ATCA
gi|55981 : -CAG-CTC-T--C----A-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---
gi|55982 : -CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TA-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-A--A--A----A-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----AA--T-TTTA-CC--G-TT-ACGAG-T--T---A-TTCCTC----TG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55983 : -T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--A---T-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----ACATGTATA--AC-G--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-T--T-A-AC-AA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TT----T-T-T--A-ATCA
gi|55984 : G-N-TT--C---T-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------CA--AC-A--A--A----T-CTGA--------T--G--T-T-G--T-A-TC-GA-T--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GA-ACAAA-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-TTCAT
gi|55985 : --C---C-G---T-C--A--T-T----T-----------G--C-T-G----T-A----A-------A--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A-----G--C-C---------T-CTTA-CCA-G-AA-ACGGA-T--T---A-T
gi|55986 : --C---C-G---T-C--A--T-T----T-----------G--C-T-G----T-A----A-------A--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A-----G--C-C---------T-CTTA-CCA-G-AA-ACGGA-T--T---A-T
gi|55987 : -C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-G--A--T----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----CA--T-TTTA-CC--A-GT-ACGAG-T--T---G-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-AT
gi|55988 : -CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A--AT-G--C-C-----TC--T-TTTA-CC--A-AT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCA
gi|55989 : -A-AT-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACAAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55990 : --AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-C--T---A-TTACAC-T-TTG---T-T-T--A-TTCAT
gi|55991 : -----TN--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TT----T-T-T--A-ATCA
gi|55992 : -----TA--T-TATA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-TTCA
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consensus : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
Reference ( family-363 ) : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55929 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----C-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---C-GG--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------AA--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A--AT-G--C-C-----TC--T-TTTA-CC--A-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55930 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---C-GG--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------AA--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A--AT-G--C-T-----TC--T-TTTA-TC--A-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55931 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---T-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-TTAAAA------TA--AC-A--A--A----C-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AT-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55932 : TACAG-T-CAG-CTC-T--T----G-T-----TAC----A-A--C----A-GC-C---A-C-----GTT-AG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-GGCCGT-T----A------TA--AC-G--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-TC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55933 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----ATT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-A--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--C---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--T-ATTAT
gi|55934 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GT-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ATGAG-T--T---A-TT-CCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCGT
gi|55935 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---C-GG--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-A----T-T----A------AA--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A--AT-G--C-C-----TC--T-TTTA-CC--A-GT-ACAAG-T--T---A-TTCCCC---TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55936 : TACAG-T-CAG-CTC-T--T----G-TC----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---C-CA--TTC--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----G------TA--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AT-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CT--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCT-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55937 : TACAG-T-CAG-CTC-T--A----G-T-----TAC----A-A--C----A-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---T-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-A----T-T-----------TA--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-T--T-A-AT-GA-A--AT-G--C-C-----TG--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TAG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55938 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--T----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AT-G--A--A----T-CTGCCCGAGTGTC--G--T-T-G--C-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GA-ATGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--T-ATCAT
gi|55939 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----ATT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--G-T----T--------T--G--C-C-A----T-TG---A------TA--AT-G--A--A----T-GTGG--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--A-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCT-A-TTG---T-T-T--A-ATCA
gi|55940 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---C-GG--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-T-G----T-T----A------AA--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A--AT-G--C-C-----TC--T-TTTA-CC--A-GA-ACGAG-T--T---A-T
gi|55941 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-A-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CA-T-TT--C---C-AA--T-C--A--T-T----T--------T--A--C-C-A----T-T----A------TA--AG-G--A--A----T-CTGC--------C--A--T-T-G--T-A-AC-AA-T--AT-G--C-A-----TA--T-TTTA-CC--G-AT-ATGAG-T--T---A-TTCACC-T-TTG---T-T-T--A-TTCAT
gi|55942 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-A-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CA-T-T---C---C-AA--T-C--A--T-T----T-----------A--C-C-A----T-T----A------TA--AG-G--A--A----T-CTGC--------C--A--T-T-G--T-A-AC-AA-T--AT-G--C-A-----TA--T-TTTA-CC--G-AT-ATGAG-T--T---A-TTACC----TTG---T-T-T--A-TTCAT
gi|55943 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT------C-GG--T-C--A--T-T----T--------TG-G--CGC-G----T-T----A------AA--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A--AT-GGCC-C-----TC--T-TTTA-CC--A-GTAACGAG-T--T---A-TT-CCC-T-TTG---TGT-T--A-ATTAT
gi|55944 : TACAG-T-AAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GA-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--A-T----T--------T--G--C-G-G----T-T----A------TA--AC-G--C--A----T-CTGC--------C--G--T-T-A--T-A-AT-GA-A--AT-G--C-C-----TGTTT-TTTT-CT--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATC
gi|55945 : TACAG-T-CAG-CT--T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G--C-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---C-GG--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------AA--AC-G--A--A----T-CT-C--------T--G--T-T-G--T---AC-AA-A--ATGG--C-C-----T---C-TTTA-CC--A-GT-ACGAG-T--T---A--TCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55946 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TACTTATA-A--C----G------------------T-CG-T-TT--C---C-AA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-AC--A-GT-ATGAG-A--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55947 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--A----G-GC-C---A-C-----ATT-TG-T-TT--CG--C-G---T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-A--A--A----T-CTGC--------T--GT-T-T-G--T-A-AC--A-A--AT-G--C-C---------T-CTTA-CC--A-GT-ACGA--T--T---A-TTCCCC-T-TTG-----T-T--A-ATCAT
gi|55948 : TACAG---AAA-CTC-T--C----G-T------AC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T---------C-AG--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-G--A--G----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCT-T-
gi|55949 : TACAG-T-CAG-CTC-C--C----T-T-----TAC----A-A--T----T-GC-C---A-C-----ATT-C--T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T-------C-G----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-CTCC--------T--G----T-G--T-A-AC-AA-A--AT-G--C-C-----TA-----TTA-CC--A-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC---TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55950 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-C--C----G-AC-T---A-C-----ATT-CG-T-GT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-A----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-CTGT--------T--G--T-T-G--T-A-AC-GA-T--AT-G--C-C-----TT--T-TTTA-CC--C-GT-ACAAT-T--T---A-TTCCCC-T-ATC---T-T-T--A-TTCAT
gi|55951 : TACAA-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--T----G-GC-C---A-C-----GTT-AG-T-TT------------------------------------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--GC-G--A--A------CTGC--------C--G--T-T-G--A-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-AT-GCGAA-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55952 : TACAG-T-CAG-CTC-T--T----G-T-----TAC----A-A--C----A-GC-C---A-C-----GT--AG-T-TT--C---C-GA--T-C-----T-T----T--------T--G--C-C-GGCCGT-T----A------TA--ACGG--A--A----T-CTGC--------C--G----T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G----C-----TAT-T-TTTA-TC--G-GT-ACGAG----T---A-TT-CCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55953 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---T-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------CA--AC-A--A--A----T-CTGA--------T--G--T-T-G--T-A-TC-GA-T--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GA-ACG
gi|55954 : TACAG-T-TAG-CTC-T--G----T-T-----TAC----A-A--C----G-GT-C---A-C-----GTT-CG-T-AT--C---C-CA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TT--AC-G--A--A----T-CTAC--------C--A--T-T-G--T-A-AC-AA-T--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GA-TTGAG-T--A---G-TTTCCT-T-TTG---T-T-T--A-TTCAT
gi|55955 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT------C-GA--T-C--A--A-T----T--------T--G--C-T------T-T----A------TA--AC-G--G--A----T-CTGC--------C--A--T-T-G--T-A-AC--A-C--AT-G--C-C-----TA-----TTA-CCATG-GT-AT-AG-T--T---A-TTCCCA-T-TTG---T-T-GA-A-ATCAT
gi|55956 : TACAG----AG-CTC-T--C----G-A-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT------C-GG--T-C--ATCT-T----T--------C--G--C-C-G----T-T-----------TA--AC-G--ACCA----T-CTGC--------T--G--T-A-G--T-ACAA-AA-A--AT----C-C-----TC--TATTTA-CC--A-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-C-TTG-----T-T--A-ATCAT
gi|55957 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----A-T-----TAC----A-A--C----C-GT-A---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---C-AA--T-C--G--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A-------------G--A--A----T-CTGC--------CATA--T-T-G--T-A-AT-GA----------C-CTTTTTTT--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--G-TTCAT
gi|55958 : TACAG-TTCAG-CTCGT--C----G-TC----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GT-----T-TT--C---CAGG--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------AA--AC-G--A--A----T-CTGCT-------T--G--TAT-G--T-ACAC-AA-A--AT-G--C-C---------T-CTTA-CC--A-GT-TAGAGCT--T---A-TTCCCT-T-TGA---T-T-T--A-A
gi|55959 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-T--C----A-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---A-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-A----T-T----A------TA--AT-G--A--A----T-TTGC--------C--A--T-C-GCTT-A-AC-
gi|55960 : TACAG-T-CAG-CTC-TGCC----G-T-----TAC----A-G--CCACAG-GC-C---A-------GTT-CA-C-TT--C---CTAA--T-C--C--A-T----T--------T--GAAA-C-G----TCT----A------TA--AC-G--A--AT---T-CTGC--------T--A----T-G--T-------A-A--AT-G--------------------------------GAG-T--TATCA-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55961 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----A-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---
gi|55962 : T-G--C-C-----TA--T-TTTA-CT--G-GT-ACAGG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-TTCAT
gi|55963 : tacagccagcgctcattacagcggcatttaatttactggcaaattcTACAG-T-CAA-CTC-T--C----G-A-----TA-----A-A--C----C-GC-C---A-CCTTTTGTT-C----TT--C---T-GA-------A--T-T----T--------T--G--G-C-G----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-TTG
gi|55964 : TACAG-C-TGG-CTC-C--C----G-T-----TAC----A-A--TG---G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TG--C---C-AAC-T-C--T--T-T----A--------T--G--C-C---------------------A--A---------------------------------T-T-A--T-A-AC-GA-T--AT-G--C-C-----CA--T-TTTA----------------------------CCC-T-TTG---T-T-T--A-TTCAT
gi|55965 : ACAG-A-CAG-TTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-T-G----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-A--GG-A--AT-G--C-C-----CA--T-TTTA-TC--A-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55966 : ACTG-T-CA--CGT-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C-----C-----GTT-TG-T-TT--C---C-GAA-T-CT-A--T-T----T--------T--G--C---G----T------A------TT--AA-G--A---------TTGC-----------A--T-T-G--T-A-AT-GA-A--AT-G--C-C-----TA----TTTA-CT--G-G--AC-AA-T--T---A-TT-CCC-T-TTG-----T-T--A-ATCAT
gi|55967 : ACAG---CTG-CTC-T--T----G-T-----TAC----A-A--C----G-G--C---A-T-----GCT-CA-T-TT--C---C-AA--T-C--A---------T--------T--GC-C-C-A----T-T----A------TA--AC-G-----A----T-CTG---------C--G----T-G--T-A-A--GA-A--AG-G--G-C-----TA--T-TTTA-CT----GT-ACG-T-T--T---A-TTCCCT-T-CTG---T-G-T--A-GTCA
gi|55968 : CAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---C-GG--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------AA--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T---AC-AA-A--AT-G--C-C-----T---C-TTTA-TC--A-GT-ACGAG-TTAT---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55969 : CAG-T-AAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-G----A------TA--AC-G--A--ATCTGT-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TT--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--T-ATC
gi|55970 : CAG-T-CAG-CTC-T--C----A-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CA-T-GT--C---C-AA--T-A--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----C-A----A------TA--AC-G--A--T----T-CTGC--------C--A--T-T-G--T-A----GATT--AT-G--CAT-----TA--T-ATTA-CT--G-GT-ATGGA-A--T---A-TTCCCT-TGTTA---T-T-C--T-ATCA
gi|55971 : CAG-T-TAA-CTC-T--G----T-T-----TAC----A-A--C----G-GT-C---A-C-----GTT-CG-TAAT--C---C-CA--T-CATA--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TT--AC-G--C--A----CACTAC--------C--A--T-T-G--T-A-AC-AA-T--AT-GC-C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GA-TTGAG-T--A---AGTTTCCT-T-TTG---T-T-T--T-AT
gi|55972 : CAGAT-CAG-CTC-T--C----A-T-----TAC----A-AG-C----G-GC-C---A-G-----TTT-CGTT-TT--C---C-GAATT-C--C--C-T----T--------T--T--C-C-T----T-T----A------TAACAC-A--A--A----T-CTGC--------C-------T-G--T-A-AC-GA-AAGAC-A--C-A-----CA--TATTTA-CC--G-TG-ACAAG-TTAT---A-TTCCCC-T-TTA---T-T-
gi|55973 : AG-T-CAG-CTC-T--C----GAT-----TAC----ACA--C----G-GC-CGACA-T-----GTTGTG-T-TTGCC---C-G---T-C--A--T-T----TGCTTGCTCT--G--CTC-G----T-TTA--A------AA--AC-G--A--A----T-ATGC--------------T-T----T-A-AC-AA-C--AA-G--CTC-----TA--T-TT-A-CC--AAGT-ACGAG-T--T---A-TTTCCT-T-TTG---T-TATTAA-ATCAT
gi|55974 : AG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-T---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---C-GA--T-C--A----T----T--------T--G--C-T-G----T-TA---A------TT--AC-G--A--A----T-CTGC--------A-------T-G--TAA-AC----A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GTAACTAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-A-T--A-ATCA
gi|55975 : AG-T-CAG-CCT-T--CAGGCG-T-----TAC----A----C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TTT-C---C-GA--T-C--A--T-T----C--------T--G--C-A-G----T-T----A------TA--AC-A--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GGTA--AT-G--C-C-----TGATT-TTTA-CT--GTGT-ACGAG-T--T---A-TTCCCA-----G---T-G-T--G-ATCAT
gi|55976 : AG-T-CAG-CTC-T--A----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-CT----GTT-TG-T-TT--C---C-GG--T-C--A----T----T--------T--G--C-C-A----T-T----A------TA--AC-GGAA--A----T-CT----------C--GTTT-T-G--T-A-ACAGA-A--AT-G--CGC-----T---T-TTTA-CC--A-GT-TAGCG-T--T---T-ATCCCC-C-TTG---T-T-T--AGATCGT
gi|55977 : AG-T-CAG-CTC-T--C------TAAAAATAC----A-AAAC----GTGCTC---ATC-----TTT-CT-T-TT--CGCCC-GAA-T-C--A--AAT----T--------T--G--C-C-A----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-C-GC--------C--G--T-A-G--T-A-AG-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTCA-CT-----T-ACAAA-T--A---T-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATAAT
gi|55978 : G-T-CAAACTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----T-GC-C---A-G-----GTT-CG-T-TT--C---T-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--GC-A--G--A----T-CTGC--------T--G--C-T-G--T-A-AT-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTC-TG--G-GT-GTAGG-T--T---A-TT--CC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55979 : G-T-CAG-CTC-T-------G-T-----TACC---A-A--T----G-GC-C---A-C-----TTT-CG-T-TT--C---C-AAA-T-C--A--T-C----T--------TATG--C-TTG----T-T----A------TATCGC-G--A--AC---T-CTGC--------C--G--T-TTG--TTA-AC-GC-AT-AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CT--G-AT-ACGAG-T--T---T-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-TTCAT
gi|55980 : -T-CAGGCTC-T--C----G-T-----TAC----A-C--C----A-AC-C-----C-----GTT-CG-T-TA--C---T-GA--T-C--A--T-TCATTT--------T--A--C-C-G----T-T----A------TC--AC-G--A--A----T-CTGC--------C--G--T-G-G--T-A-GCAAA-A--AT-G--C-C-----AAC-T-TTTACCC--G-GT-AC--G-T--T---A-TTCCCCTT-TTGTTTT-T-T--A-ATCA
gi|55981 : -CAG-CTC-T--C----A-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---
gi|55982 : -CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TA-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-A--A--A----A-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----AA--T-TTTA-CC--G-TT-ACGAG-T--T---A-TTCCTC----TG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55983 : -T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--A---T-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----ACATGTATA--AC-G--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-T--T-A-AC-AA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TT----T-T-T--A-ATCA
gi|55984 : G-N-TT--C---T-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------CA--AC-A--A--A----T-CTGA--------T--G--T-T-G--T-A-TC-GA-T--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GA-ACAAA-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-TTCAT
gi|55985 : --C---C-G---T-C--A--T-T----T-----------G--C-T-G----T-A----A-------A--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A-----G--C-C---------T-CTTA-CCA-G-AA-ACGGA-T--T---A-T
gi|55986 : --C---C-G---T-C--A--T-T----T-----------G--C-T-G----T-A----A-------A--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A-----G--C-C---------T-CTTA-CCA-G-AA-ACGGA-T--T---A-T
gi|55987 : -C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-G--A--T----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----CA--T-TTTA-CC--A-GT-ACGAG-T--T---G-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-AT
gi|55988 : -CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A--AT-G--C-C-----TC--T-TTTA-CC--A-AT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCA
gi|55989 : -A-AT-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACAAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55990 : --AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-C--T---A-TTACAC-T-TTG---T-T-T--A-TTCAT
gi|55991 : -----TN--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TT----T-T-T--A-ATCA
gi|55992 : -----TA--T-TATA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-TTCA
blockSeqs : A GC AGGC AAAAA TTAT AA CACA GAC CTTTT GC GCC A AT AT CATT GCTTGCTC AT AA G GCCG TAAA CATGTA AC TCTG CCGAGTGTC TT A C A T AG GC A TTTTT GTT A AT A A TA ATC TTT TA
blockSeqs : G . . C C G G . T T G T C T . . G C T GCCG TA . TC T CAT T T C A T T C T . GAT A A T A TA . . A
blockSeqs : . . . C . . . . . . . . A . . . . . . . G . . C TT . . . . . . . G . AT . A . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . A . . . T . . . . . . . . . AC . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . A . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . G . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . C . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . C . . . . . . . . . A . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . A . . . . . . . .
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blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
finalCons : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
Alignments
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lowQualScore : . . . . .. .... . ..... .... . .. .... . . ... . ..... . . . .. ... . .. . .. .. . .... ........ .. .. . . .... . .... ...... .. . .. .. .... . ........... .. . . .. . . . . .. . .. . ..... ... . . .. . . . .. ... . . . ... . . .. .
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consensus : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
Reference ( family-363 ) : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55929 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----C-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---C-GG--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------AA--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A--AT-G--C-C-----TC--T-TTTA-CC--A-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55930 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---C-GG--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------AA--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A--AT-G--C-T-----TC--T-TTTA-TC--A-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55931 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---T-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-TTAAAA------TA--AC-A--A--A----C-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AT-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55932 : TACAG-T-CAG-CTC-T--T----G-T-----TAC----A-A--C----A-GC-C---A-C-----GTT-AG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-GGCCGT-T----A------TA--AC-G--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-TC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55933 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----ATT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-A--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--C---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--T-ATTAT
gi|55934 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GT-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ATGAG-T--T---A-TT-CCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCGT
gi|55935 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---C-GG--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-A----T-T----A------AA--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A--AT-G--C-C-----TC--T-TTTA-CC--A-GT-ACAAG-T--T---A-TTCCCC---TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55936 : TACAG-T-CAG-CTC-T--T----G-TC----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---C-CA--TTC--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----G------TA--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AT-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CT--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCT-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55937 : TACAG-T-CAG-CTC-T--A----G-T-----TAC----A-A--C----A-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---T-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-A----T-T-----------TA--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-T--T-A-AT-GA-A--AT-G--C-C-----TG--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TAG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55938 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--T----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AT-G--A--A----T-CTGCCCGAGTGTC--G--T-T-G--C-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GA-ATGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--T-ATCAT
gi|55939 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----ATT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--G-T----T--------T--G--C-C-A----T-TG---A------TA--AT-G--A--A----T-GTGG--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--A-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCT-A-TTG---T-T-T--A-ATCA
gi|55940 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---C-GG--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-T-G----T-T----A------AA--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A--AT-G--C-C-----TC--T-TTTA-CC--A-GA-ACGAG-T--T---A-T
gi|55941 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-A-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CA-T-TT--C---C-AA--T-C--A--T-T----T--------T--A--C-C-A----T-T----A------TA--AG-G--A--A----T-CTGC--------C--A--T-T-G--T-A-AC-AA-T--AT-G--C-A-----TA--T-TTTA-CC--G-AT-ATGAG-T--T---A-TTCACC-T-TTG---T-T-T--A-TTCAT
gi|55942 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-A-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CA-T-T---C---C-AA--T-C--A--T-T----T-----------A--C-C-A----T-T----A------TA--AG-G--A--A----T-CTGC--------C--A--T-T-G--T-A-AC-AA-T--AT-G--C-A-----TA--T-TTTA-CC--G-AT-ATGAG-T--T---A-TTACC----TTG---T-T-T--A-TTCAT
gi|55943 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT------C-GG--T-C--A--T-T----T--------TG-G--CGC-G----T-T----A------AA--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A--AT-GGCC-C-----TC--T-TTTA-CC--A-GTAACGAG-T--T---A-TT-CCC-T-TTG---TGT-T--A-ATTAT
gi|55944 : TACAG-T-AAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GA-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--A-T----T--------T--G--C-G-G----T-T----A------TA--AC-G--C--A----T-CTGC--------C--G--T-T-A--T-A-AT-GA-A--AT-G--C-C-----TGTTT-TTTT-CT--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATC
gi|55945 : TACAG-T-CAG-CT--T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G--C-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---C-GG--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------AA--AC-G--A--A----T-CT-C--------T--G--T-T-G--T---AC-AA-A--ATGG--C-C-----T---C-TTTA-CC--A-GT-ACGAG-T--T---A--TCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55946 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TACTTATA-A--C----G------------------T-CG-T-TT--C---C-AA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-AC--A-GT-ATGAG-A--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55947 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--A----G-GC-C---A-C-----ATT-TG-T-TT--CG--C-G---T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-A--A--A----T-CTGC--------T--GT-T-T-G--T-A-AC--A-A--AT-G--C-C---------T-CTTA-CC--A-GT-ACGA--T--T---A-TTCCCC-T-TTG-----T-T--A-ATCAT
gi|55948 : TACAG---AAA-CTC-T--C----G-T------AC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T---------C-AG--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-G--A--G----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCT-T-
gi|55949 : TACAG-T-CAG-CTC-C--C----T-T-----TAC----A-A--T----T-GC-C---A-C-----ATT-C--T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T-------C-G----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-CTCC--------T--G----T-G--T-A-AC-AA-A--AT-G--C-C-----TA-----TTA-CC--A-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC---TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55950 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-C--C----G-AC-T---A-C-----ATT-CG-T-GT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-A----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-CTGT--------T--G--T-T-G--T-A-AC-GA-T--AT-G--C-C-----TT--T-TTTA-CC--C-GT-ACAAT-T--T---A-TTCCCC-T-ATC---T-T-T--A-TTCAT
gi|55951 : TACAA-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--T----G-GC-C---A-C-----GTT-AG-T-TT------------------------------------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--GC-G--A--A------CTGC--------C--G--T-T-G--A-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-AT-GCGAA-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55952 : TACAG-T-CAG-CTC-T--T----G-T-----TAC----A-A--C----A-GC-C---A-C-----GT--AG-T-TT--C---C-GA--T-C-----T-T----T--------T--G--C-C-GGCCGT-T----A------TA--ACGG--A--A----T-CTGC--------C--G----T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G----C-----TAT-T-TTTA-TC--G-GT-ACGAG----T---A-TT-CCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55953 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---T-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------CA--AC-A--A--A----T-CTGA--------T--G--T-T-G--T-A-TC-GA-T--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GA-ACG
gi|55954 : TACAG-T-TAG-CTC-T--G----T-T-----TAC----A-A--C----G-GT-C---A-C-----GTT-CG-T-AT--C---C-CA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TT--AC-G--A--A----T-CTAC--------C--A--T-T-G--T-A-AC-AA-T--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GA-TTGAG-T--A---G-TTTCCT-T-TTG---T-T-T--A-TTCAT
gi|55955 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT------C-GA--T-C--A--A-T----T--------T--G--C-T------T-T----A------TA--AC-G--G--A----T-CTGC--------C--A--T-T-G--T-A-AC--A-C--AT-G--C-C-----TA-----TTA-CCATG-GT-AT-AG-T--T---A-TTCCCA-T-TTG---T-T-GA-A-ATCAT
gi|55956 : TACAG----AG-CTC-T--C----G-A-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT------C-GG--T-C--ATCT-T----T--------C--G--C-C-G----T-T-----------TA--AC-G--ACCA----T-CTGC--------T--G--T-A-G--T-ACAA-AA-A--AT----C-C-----TC--TATTTA-CC--A-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-C-TTG-----T-T--A-ATCAT
gi|55957 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----A-T-----TAC----A-A--C----C-GT-A---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---C-AA--T-C--G--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A-------------G--A--A----T-CTGC--------CATA--T-T-G--T-A-AT-GA----------C-CTTTTTTT--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--G-TTCAT
gi|55958 : TACAG-TTCAG-CTCGT--C----G-TC----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GT-----T-TT--C---CAGG--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------AA--AC-G--A--A----T-CTGCT-------T--G--TAT-G--T-ACAC-AA-A--AT-G--C-C---------T-CTTA-CC--A-GT-TAGAGCT--T---A-TTCCCT-T-TGA---T-T-T--A-A
gi|55959 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-T--C----A-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---A-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-A----T-T----A------TA--AT-G--A--A----T-TTGC--------C--A--T-C-GCTT-A-AC-
gi|55960 : TACAG-T-CAG-CTC-TGCC----G-T-----TAC----A-G--CCACAG-GC-C---A-------GTT-CA-C-TT--C---CTAA--T-C--C--A-T----T--------T--GAAA-C-G----TCT----A------TA--AC-G--A--AT---T-CTGC--------T--A----T-G--T-------A-A--AT-G--------------------------------GAG-T--TATCA-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55961 : TACAG-T-CAG-CTC-T--C----A-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---
gi|55962 : T-G--C-C-----TA--T-TTTA-CT--G-GT-ACAGG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-TTCAT
gi|55963 : tacagccagcgctcattacagcggcatttaatttactggcaaattcTACAG-T-CAA-CTC-T--C----G-A-----TA-----A-A--C----C-GC-C---A-CCTTTTGTT-C----TT--C---T-GA-------A--T-T----T--------T--G--G-C-G----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-TTG
gi|55964 : TACAG-C-TGG-CTC-C--C----G-T-----TAC----A-A--TG---G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TG--C---C-AAC-T-C--T--T-T----A--------T--G--C-C---------------------A--A---------------------------------T-T-A--T-A-AC-GA-T--AT-G--C-C-----CA--T-TTTA----------------------------CCC-T-TTG---T-T-T--A-TTCAT
gi|55965 : ACAG-A-CAG-TTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-T-G----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-A--GG-A--AT-G--C-C-----CA--T-TTTA-TC--A-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55966 : ACTG-T-CA--CGT-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C-----C-----GTT-TG-T-TT--C---C-GAA-T-CT-A--T-T----T--------T--G--C---G----T------A------TT--AA-G--A---------TTGC-----------A--T-T-G--T-A-AT-GA-A--AT-G--C-C-----TA----TTTA-CT--G-G--AC-AA-T--T---A-TT-CCC-T-TTG-----T-T--A-ATCAT
gi|55967 : ACAG---CTG-CTC-T--T----G-T-----TAC----A-A--C----G-G--C---A-T-----GCT-CA-T-TT--C---C-AA--T-C--A---------T--------T--GC-C-C-A----T-T----A------TA--AC-G-----A----T-CTG---------C--G----T-G--T-A-A--GA-A--AG-G--G-C-----TA--T-TTTA-CT----GT-ACG-T-T--T---A-TTCCCT-T-CTG---T-G-T--A-GTCA
gi|55968 : CAG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---C-GG--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------AA--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T---AC-AA-A--AT-G--C-C-----T---C-TTTA-TC--A-GT-ACGAG-TTAT---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55969 : CAG-T-AAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-G----A------TA--AC-G--A--ATCTGT-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----TT--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--T-ATC
gi|55970 : CAG-T-CAG-CTC-T--C----A-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CA-T-GT--C---C-AA--T-A--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----C-A----A------TA--AC-G--A--T----T-CTGC--------C--A--T-T-G--T-A----GATT--AT-G--CAT-----TA--T-ATTA-CT--G-GT-ATGGA-A--T---A-TTCCCT-TGTTA---T-T-C--T-ATCA
gi|55971 : CAG-T-TAA-CTC-T--G----T-T-----TAC----A-A--C----G-GT-C---A-C-----GTT-CG-TAAT--C---C-CA--T-CATA--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TT--AC-G--C--A----CACTAC--------C--A--T-T-G--T-A-AC-AA-T--AT-GC-C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GA-TTGAG-T--A---AGTTTCCT-T-TTG---T-T-T--T-AT
gi|55972 : CAGAT-CAG-CTC-T--C----A-T-----TAC----A-AG-C----G-GC-C---A-G-----TTT-CGTT-TT--C---C-GAATT-C--C--C-T----T--------T--T--C-C-T----T-T----A------TAACAC-A--A--A----T-CTGC--------C-------T-G--T-A-AC-GA-AAGAC-A--C-A-----CA--TATTTA-CC--G-TG-ACAAG-TTAT---A-TTCCCC-T-TTA---T-T-
gi|55973 : AG-T-CAG-CTC-T--C----GAT-----TAC----ACA--C----G-GC-CGACA-T-----GTTGTG-T-TTGCC---C-G---T-C--A--T-T----TGCTTGCTCT--G--CTC-G----T-TTA--A------AA--AC-G--A--A----T-ATGC--------------T-T----T-A-AC-AA-C--AA-G--CTC-----TA--T-TT-A-CC--AAGT-ACGAG-T--T---A-TTTCCT-T-TTG---T-TATTAA-ATCAT
gi|55974 : AG-T-CAG-CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-T---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---C-GA--T-C--A----T----T--------T--G--C-T-G----T-TA---A------TT--AC-G--A--A----T-CTGC--------A-------T-G--TAA-AC----A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GTAACTAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-A-T--A-ATCA
gi|55975 : AG-T-CAG-CCT-T--CAGGCG-T-----TAC----A----C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TTT-C---C-GA--T-C--A--T-T----C--------T--G--C-A-G----T-T----A------TA--AC-A--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GGTA--AT-G--C-C-----TGATT-TTTA-CT--GTGT-ACGAG-T--T---A-TTCCCA-----G---T-G-T--G-ATCAT
gi|55976 : AG-T-CAG-CTC-T--A----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-CT----GTT-TG-T-TT--C---C-GG--T-C--A----T----T--------T--G--C-C-A----T-T----A------TA--AC-GGAA--A----T-CT----------C--GTTT-T-G--T-A-ACAGA-A--AT-G--CGC-----T---T-TTTA-CC--A-GT-TAGCG-T--T---T-ATCCCC-C-TTG---T-T-T--AGATCGT
gi|55977 : AG-T-CAG-CTC-T--C------TAAAAATAC----A-AAAC----GTGCTC---ATC-----TTT-CT-T-TT--CGCCC-GAA-T-C--A--AAT----T--------T--G--C-C-A----T-T----A------TA--AC-G--A--A----T-C-GC--------C--G--T-A-G--T-A-AG-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTCA-CT-----T-ACAAA-T--A---T-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATAAT
gi|55978 : G-T-CAAACTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----T-GC-C---A-G-----GTT-CG-T-TT--C---T-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--GC-A--G--A----T-CTGC--------T--G--C-T-G--T-A-AT-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTC-TG--G-GT-GTAGG-T--T---A-TT--CC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55979 : G-T-CAG-CTC-T-------G-T-----TACC---A-A--T----G-GC-C---A-C-----TTT-CG-T-TT--C---C-AAA-T-C--A--T-C----T--------TATG--C-TTG----T-T----A------TATCGC-G--A--AC---T-CTGC--------C--G--T-TTG--TTA-AC-GC-AT-AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CT--G-AT-ACGAG-T--T---T-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-TTCAT
gi|55980 : -T-CAGGCTC-T--C----G-T-----TAC----A-C--C----A-AC-C-----C-----GTT-CG-T-TA--C---T-GA--T-C--A--T-TCATTT--------T--A--C-C-G----T-T----A------TC--AC-G--A--A----T-CTGC--------C--G--T-G-G--T-A-GCAAA-A--AT-G--C-C-----AAC-T-TTTACCC--G-GT-AC--G-T--T---A-TTCCCCTT-TTGTTTT-T-T--A-ATCA
gi|55981 : -CAG-CTC-T--C----A-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TG-T-TT--C---
gi|55982 : -CTC-T--C----G-T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-TA-T-TT--C---C-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-A--A--A----A-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----AA--T-TTTA-CC--G-TT-ACGAG-T--T---A-TTCCTC----TG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55983 : -T-----TAC----A-A--C----G-GC-C---A-C-----GTT-CG-T-TT--A---T-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----ACATGTATA--AC-G--A--A----T-CTGC--------C--G--T-T-T--T-A-AC-AA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TT----T-T-T--A-ATCA
gi|55984 : G-N-TT--C---T-GA--T-C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------CA--AC-A--A--A----T-CTGA--------T--G--T-T-G--T-A-TC-GA-T--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GA-ACAAA-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-TTCAT
gi|55985 : --C---C-G---T-C--A--T-T----T-----------G--C-T-G----T-A----A-------A--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A-----G--C-C---------T-CTTA-CCA-G-AA-ACGGA-T--T---A-T
gi|55986 : --C---C-G---T-C--A--T-T----T-----------G--C-T-G----T-A----A-------A--AC-G--A--A----T-CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A-----G--C-C---------T-CTTA-CCA-G-AA-ACGGA-T--T---A-T
gi|55987 : -C--A--T-T----T--------T--G--C-C-G----T-T----A------TA--AC-G--A--T----T-CTGC--------C--G--T-T-G--T-A-AC-GA-A--AT-G--C-C-----CA--T-TTTA-CC--A-GT-ACGAG-T--T---G-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-AT
gi|55988 : -CTGC--------T--G--T-T-G--T-A-AC-AA-A--AT-G--C-C-----TC--T-TTTA-CC--A-AT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCA
gi|55989 : -A-AT-GA-A--AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACAAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-ATCAT
gi|55990 : --AT-G--C-C-----TA--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-C--T---A-TTACAC-T-TTG---T-T-T--A-TTCAT
gi|55991 : -----TN--T-TTTA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TT----T-T-T--A-ATCA
gi|55992 : -----TA--T-TATA-CC--G-GT-ACGAG-T--T---A-TTCCCC-T-TTG---T-T-T--A-TTCA