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gi|86850 : TTAGT-AGT-CCC-C--T-A-CC-G--A--A--G-CA--ATC--G--AA--GGG-AC---TT----A-A---AG--TT-T-----GC-GC-------T--C-----C------G-T--C--T--GT--TG----GTC---TGT
gi|86851 : TTATT-AGC-CCT-C--T-A-CT-G--A--T--G-AA--GTC--A--AA--GGAGAC---TT----T-A---AA--TA-A-----GA-AC-------T--CT----T------A-T--T--T--GT--CT----GTC---CATC
gi|86852 : TTATC-AGT-CCC-G--T-A-TT-G--G--C--A-AA--GCC--C--TA--GGGGAC---TC----C-A---GG--TT-T-----GC-AC-------T--C-----T------G-T--C--C--AT--
gi|86853 : TTATT-AGT-CCC-A--A-A-CC-G--A--C--A-AA--TTTCAA--AA--GGGGAC---TT----T-ATAGGG--TT-T-----GC-AC----------C-----C------GCT--C--T--GT--CT----G
gi|86854 : TTATT-AGT-CCC-C--T-A-CC-G--GTTT--G-TA--ACC--G--GA--GGGGAC---TA----T-A---GC--TT-T-----CT-TC-------T--T-----T------G----C--T--GT--CT----GTC---TGTC
gi|86855 : TTATT-A-T-CCC-C--T-A-CC-G--A--C--G-AA--CTT--A--A-----GGAC---TT----T-A---G---TT-C-----GC-GA----------------C------G-T--C--C--GT--CC----GTC---C
gi|86856 : TTATT-AGT-CCC-C--T-A-CC-G--A--C--G-AA--GTC--A--AA--GG
gi|86857 : TTATT-AGT-CCC-C--T-A-CC-G--GTTT--G-TA--ACC--A--GA--GGGGAC---TA----T-A---GC--TT-T-----CT-TC-------T--T-----T------G-T--C--A--GT--CT----GTC---
gi|86858 : TTATT-AGT-CCC-C--T-A-CC-G--G--CTTG-TA--ACC--G--GA--GGGGAC---TA----T-A---GT--TT-T---------C-------T--T-----CTTTTGTG-T--C--T--GT--GT----GTC---TGTC
gi|86859 : TTATT-AG--CCC-C--T-A-CT-G--G--C--A-TG--GCT--G--AA--GGGGAA---TT----T-T---AT--TT-T-----AC-CC-------T--C-----G------G-T--C--T--GT--TT----GTC---CGT
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gi|86861 : TTATT-AAT-CCC-C--T-A-CC-G--GTTT--G-TA--ATC--G--GA--GGGGAC---TA----T-A---GC--TT-T---------C-------T--T-----CTTTTGTG-T--C--T--GT--CT----GTC---T
gi|86862 : TTATT-AGT-CCC-C--T-A-CC-G--GTTT--GTAA--ACC--G--GA--GGGGAC---TA----T-A---GC--TT-T---------C-------T--T-----C------T-T--TTGT--GT--CT----GTC---TGTC
gi|86863 : TCATT-AGT-CCC-C--T-A-CC-G--ATTT--G-TA--ACC--G--GA--GGGGGC---TA----T-A---GC--TT-T-----CT-TCTTTTGTTT--C-----T------G-T--C--T--GT--CT----GTC---TGTC
gi|86864 : TTGTT-AGT-CCC-C--T-A-CC-G--GTTT--G-TA--ACC--G--GA--GGGGAC---TA----T-A----G--CT-T-----GC--T-------T--CTTGTGT------G-T--C--T--GT--CT----GTC---TGTC
gi|86865 : TGTT-AGT-TCC-C--C-T-CC-G--A--C--G-AA--GTC--G--AAC-GGGGAC---TT----T-A---GT--TT-TT----GC-AC-------T--C-----T------G-T--C--C--GT--CC----GTC---TGTC
gi|86866 : TATT-AGT-CCC-C--T-A-CC-A--A--C--G-GA--GTC--A--AA--AGGGAC---TT----A-A---AG--AT-T-----TC-A
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gi|86871 : ATT-AGT-ACC-C--T-A-CC-GGAA--C--G-AA--GTC--GA-AA--GGGGAA---TT----T-A---GG--TT-T-----AC--T-------T--C-----C------G-T--C--C--AT--CC----ATC---AGTC
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gi|86875 : ATT-AGG-CCC-C--T-A-CC-G--A--C--G-AA--GTC--G--AA--GGGGAC---
gi|86876 : TT-AGT-CCC-C--T-A-CC-G--A--C--C-AA--GTC--G--AA--GGGGAC---TT----T-A---GG--TT-T-----GC-AC-------T--C-----C------G-T--C--T--GT--C
gi|86877 : TT-AGT-CCC-C--T----C-GTAA--C--G-AA--GTC--G--AA--GGGGAC---TT----T-A---GG--TT-T-----GC-AC-------T--C-----T------G-T--C--T--GT---C----GTC---CATC
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gi|86886 : -G--A--C--T-AA--GTC--G--AA--GGGGGC---TT----T-A---GG--TT-T-----GC-AC-------T--C-----C------G-T--C--C--AT--CC----GTC---TGTC
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Alignments
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lowQualScore : 3 6 6 77 6 6 6 77 66 44 2 00 44 66 44 777 5555 6 777 55 6 88888 6 5555555 99 666666666666 6 99 22 99 66 5555 6666
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Reference ( family-351 ) : TTATT-AGT-CCC-C--T-A-CC-G--A--C--G-AA--GTC--G--AA--GGGGAC---TT----T-A---GG--TT-T-----GC-AC-------T--C-----C------G-T--C--C--GT--CC----GTC---CGTC
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gi|86877 : TT-AGT-CCC-C--T----C-GTAA--C--G-AA--GTC--G--AA--GGGGAC---TT----T-A---GG--TT-T-----GC-AC-------T--C-----T------G-T--C--T--GT---C----GTC---CATC
gi|86878 : TT-AGT-CCC-C--T-A-CC-G--A--G--G-AA--GTC--G--AA--GGGGAC---TT----T-A---GG--TT-T-----GC-TG-------T--C-----C------G-T--C--A--GT--CA----GTC---
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gi|86881 : TT-AGT-CCC-C--T-A-CT-G--A--C--A-GA--GCC--AT-AA--GGGGA----------T-A---AG--TT-T-----GC-AC-------T--C-----C------G-
gi|86882 : T-AGT-CCC-T-------C-G--A--C--G-AA--GTCA-G--AA--GGGGAC---TT----T-A---GG--TT-T-----GC-AC-------T--C-----C------G-T--C--C--GT--CT----GTC---CGTC
gi|86883 : C-C--T-A-CCCG--A--C--G-AA--GTC--G--AC--AGTGGC---TT----G-AA--GG--GT-T-----GC-AC-------T--C-----C------G-T--C--CGAGT--CT----GTC---TGTC
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Reference ( family-351 ) : TTATT-AGT-CCC-C--T-A-CC-G--A--C--G-AA--GTC--G--AA--GGGGAC---TT----T-A---GG--TT-T-----GC-AC-------T--C-----C------G-T--C--C--GT--CC----GTC---CGTC
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