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Reference ( gi|122163 )       :       TGCTC-CGGG-T--A--T-GAG--T--T-T-G-T-G--T-C--TT-T-T--T--GT-AT---TT-G-A-T--AG-AA-T----TATA-A-C-T-AAA-T-G-TG-C---T-T--TG-T--TT-G-T-AAT----G--A--A--A-------T-C--T-G--C-AT-A--T-T-G--AT-ACG-A-T--G-AA-A--CA-----T-G-A-AT--TT-AA-C-G--AAA-A-TG-T-T-A--G-T-TTC-A-T-A-T-A-C-TTT--A-TC----AA--G--GT-TT---G-T-CAG--T-----TT-T---T-A---T--C--AA-G----G----TT--GT---------------------CC-AC-G-A-A--C-T-TT--A-C-GG-AC--AA-C-C-C--TCGTA
gi|122164                     :       TGCTC-CGGG-T--A--T-GAG--T--T-T-G-T-G--T-C--TT-T-T--T--GT-AT---TT-G-A-T--AG-AA-T----TATA-A-C-T-AAA-T-G-TG-C---T-T--TG-T--TT-G-T-AAT----G--A--A--AA------T-C--T-G--C-AT-A--T-T-G--AT-ACG-A-T--G-AA-A--CA-----T-G-A-AT--TT-AA-C-G--AAA-A-TG-T-T-A--G-T-TTC-A-T-A-T-A-C-TTT--A-TC----AA--G--GT-TT---G-T-CAG--T-----TT-T---T-A---T--C--AA-G----G----TT--GT---------------------C---C-G-A-A--C-T-TT--A-C-GG-AC--AA-C-C-C--TCGTA
gi|122161                     :       TGCTC-CGGG-T--A--T-GGG--T--C-T-G-T-G--T-A--TT-T-T--T--GT-AT---TT-A-A-T--AG-AA-T----TATA-A-C-T-AAA-T-G-TG-C---T-T--TG-T--TT-G-T-AAT----G--A--A--AA------T-T--T-G--C-AT-A--T-T-A--AT-AAG-A-T--G-AG-A--CA-----T-G-A-AT--TT-AA-C-G--AAA-A-TG-T-T-A--G-T-TTC-A-T-A-T-A-C-TTT--A-TC----AA--G--GT-TT---G-T-CAG--T-----TT-T---T-A---T--C--AA-G----G----TT--GT---------------------CC-AC-G-A-A--C-T-TT--A-C-GG-AC--AA-C-C-C--TCGTA
gi|122162                     :       TGCTC-CGGG-T--A--T-GAG--T--T-T-G-T-G--T-C--TT-T-T--T--GT-AT------G-A-T--AG-AAAT----TATA-A-C-T-AAA-T-G-TG-C---T-T--TG-T--TT-G-T-AAT----GA-A--A--A-------T-T--T-G--C-AT-A--T-T-A--AT-AAG-A-T--G-AA-A--CA-----T-G-A-A---TT-AA-C-G--AAA-A-TG-T-T-A--G-T-TTC-A-T-A-TAA-C-TTT--A-TC----AA--G--GT-TT---G-T-CAG--------TT-T---T-A---T--C--AA-G----G----TT--GT---------------------CC-AC-G-A-A--C-T-TT--A-C-GG-AC--AA-C-C-C--CCGTAtgt
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gi|122173                     : tttttgTGCTC-CGGA-T--A--T-GAG--T--T-T-G-T-G--T----TT-T-T--T--GT--T---TT-G-A-T--AG-AA-T----TATA-A-AAT-AAA---G-TG-CC--T-T--TG-T--TT-GGT-AA-----G--A--A--A-------T-T--T-AGCC-AT-A--T-T-A--AT-AAG-AAT--G-AA-A--CA-----T-G-A--T--TT-AATC-G--AAG-A-TG-T-T-A--G-T-T-C-A---A-T-A-C-T----A-TC----AA--G--GT-TT---G-T--AG--T-----TT-T---T-A---T--C--AA-G----G----TT--GT---------------------CC-AC-G---A--C-T-TT--A-C--G-AC--AA-CAC-C--TCGTA
gi|122147                     :       TGCTC-CTGA-T--A--T-GAG--T--T-T-G-T-G--T-C--TT-T-T--TTTGTTAT---TT-T---T--AG-AA-A----TATA-A-C-T-AAA-T-G-TG-T---T-T--TG-T--T--G-T-AAT----G--A--A--AAGTTGTAT-T--T-A----AT-A--T-T-TT-AT-AAA-A-T--A-AA-A--CA-----T-G-A-A---TT-AA-CGG--AAA-A-TG-T-T-A--G-T-TTC-A-T-A-T-A-C-TTT--A-TT----CATTG--TT-TT---G-T-CAG--------TT-T---T-A---T--C--AA-G----G----TT--GT---------------------CC-AC-C-A-A--C-T-TT--A-C-GG-ACA-AA-C-C-C--TCGTAtat
gi|122149                     : ttttagTGCTC-CGAA-T--A--T-GAG--T--T-T-G-T-G--T-CA-TT-T-T--T--GC-AT---TT-G-A-T--AG-AA-T----TATA-A-T-C-AAA-T-G-TG-C---T-T--TG-T--TT-G-T-AATG---G--A--A--A-------T-T--T-A--C-AT-A--T-T-G--AT-AAA-A-T--A-AA-A--CA-----T-G-A-AGAAGT-AA-C-G---AA-A-TG-G-T-A--G---TTC-A-T-A-T-A-C--TT--A-TC----AA--T--AT-TT---G-C-CA---------TT-T---T-A---T--C--AT-A----G----T----T---------------------CCAAC-T-A-A--C-T-TA--ACC-GG-AC--AA-C-C-C--TCGta
gi|122152                     : ttttagTGCTC-CGGG-T--A--T-GA------T-T-G-T-G--T-C--TT-T-T--TT-GT-ATAATTT-G-AGT--AG-AA-T----TA---A---T-AAACT-G-TG-C---TCT--TG-T--TT-G-T-AAT----G--AATA--A-------T----T-G--C-AT-A--T-T----AT-AAG-A-T--G-AA-A--CA-----T-G-A-AT--TT-AA-C-G--AAA-A-TG-TGT-A--GTT-TTC-A-T-G-T-A-C-TTTA-A-TC----AAG-G--GT-TT---G-T-CAG--T-----TT-T---T-A---T--C--AA-G----GT---TT--GTCAGTTTTTAATTCAGGTTGTCCC-AC-G-A-A--CAT-GT--A-C-GG-AC--AAGC-C-C--TCGTA
gi|122177                     : tttacaTGCTC-CTGG-T--A--T-GAG--T--T-T-G---GCTT-C--TT-T-TGTT--GT-AT---CT-ATA-T--AG-AA-T----TATATA-CCT-AAA-TTG-TG-C---T-TGTTG-T--AA-G-T-GAT----A--A--A--A-------T-T--T-G--C-AT-AG-T-T-A--AT-AAG-A-T--GTAA-A--CA-----T-G-A-AT--TTTAA-C-G--AAA-A-TG-T-T-A--G-T-TTC-A-T-A-T-A-C-TAT--A-TC----AA--G--GTGTTTTGG-T-CAG--A-----TT-T---T-T---T--C--AG-G----T----TT--GT---------------------CC-AC-G-A-A--C-T-TT--A-C-GA-TC--AATC-C-T--TCGTA
gi|122176                     :       TGCTC-CGG--T--A--T-GAG--TGCT-T-GCT-G--T-C--TT-TGT--T--G--AT---TT-G-A-TT-AG-AG-T----TATA-A-C-A-AAA-T-G-TG-C---T-T--TG-C--TT-G-T-AATGGAAG--A--A--A-------T-TAGT-G--A-A--A--T-T-A--CT-AAG-ATT--A-AA-A--CA-----T-G-ACAT--TA-AA-C-G--AAA-A-TG-T-TGA--G-T-TTC-A-T-A-T-A-C-TTT--A-TC----AA--G-----TT---GTT-CAG--G-----TT-T---T-A---T--C--AA-G----G----AT--G----------------------CC-AC-G-A-AACT-T-TT--A-C-GG-AC--AA-C-C-C--TCGTatat
gi|122178                     :       TGCTC-CGGG-T--A--T-GAG--T--T-T-G-T-T--T-C--TT-T-TT-T--GT-AT---TT-G-A-T--AG-AA-T----TATA-A-C-T-AAA-T-G-TG-C---T-T--TG-T--TT-G-T-AAT----GA-A--A--A-------T-T--T-G--C-AT-A--T-G-A--AT-AAG-A-T--A-AA-A--CA-----T-G-A-AT--TT-AA-C-G--AAA-A-Tgtat
gi|122154                     :       TGTTC-CGGA-T--A--T--AG--T--T-T-G-T-G--T-C--TA-T-T--T--TT-AT---TT-G-A-T--AG-AA-T----TAT--A-C-T-AAA-T-G-TG-C---T-T--T--T--TT-G-T-AAT----G--A--A--A-------A-T--T-G--C-AT-A--T-T----AT-AAA-A-T----AA-A--CA-----T-G-A-AT--TT-AA-A-GA-AAA-A-TG-G-T-A--G-T-TTC-A-T-ATT-A-C-TTT--A--C----AA--T--G--TT---G-T-C-----------------------T--C--AACA----G----CT--AT---------------------CC-GC-G--------------A-C-GA-AT---A-C-C-C--TCGTA
gi|122179                     : ttttagTGCTC-CG------A--T--AG--A--T-T-G-T-G--T-C--TT-TCT--T--GT-AT---TT-G-A-TT-AG-AA-TC---TGTA---C-T-AA--T-G-TG-C---T-----G-T--TT-G-T-AAT----G--A--A--AA------T-T--T-G--C-AT-A--T------AT-AAA-AAT--A-AA-A--CA-----CCG-A-GTA-TT-AA-C-G--AAACA-TG-T-C-G------TTG-A-T-A-T-A-C-TTT--A-TC----AA--T--GT-TT---T-T-CAG--T-----TT-T---T-A---T--C--AA-A----G----TTTGAT---------------------CC-AC-G-A-A--C---TT--A-C--G-AC--AA-C-C-ca
gi|122155                     :       TGCTC-CGA--T--A--TTGAG--T--T-T-G-T-G--T-T--CT-T-T--T---T-AT---TT---A-TTAAA-AA-A----TATA-A-C-T-AAA-T-G-TG-C---T-T--TG-T--TT-G-T-AAT----GA-A--A--A-------T-T--T-G--C-AT-A--T-T-A--AT-AAA-A-G--A-AA-A--CA-----T---A-AT--TT--A-C-G---AA-A-TG-T-T-ATTA-T-TTA-A-T-A-T-A-
gi|122180                     : ttttagTGCTC-CGGG-T--A--T--AG--T--T---G-T-G--T-C--TT-T-TT-T--GT-AT---TT-G-A-T--AG-AA-T----TATA-A-C-T-AAT-T-G-TG-C---T-T--TG-T--TT-G-T--AT----GA-A--A--A-------TAT--T-G--C-AT-A--T-T-aa
gi|122181                     :        GCTC-CGGG-CTCA--T-GAGGGT--T-T-G-TTG--T-C--TT-T-C--G--AT-AT---CT-G-ACT--AG-AG-TATACTAAA-A-C-T-ATA-T-G-TG-C---T-T--TG-T--TT-G-T-AAT----G--A--A--A-------A-T--T-G--C-AT-A--T-T-GGAGT-ATG-A-T--G-AA-A--CA-----T-G-A-AT--TT-AA-C-G--AAA-A-TG-T-TAA--G-T-TTC-A-T-A-T-A-CATTT--A-TC----AA--G--GT-TT---G-TCCAG---------T-T---T-A---T--C--AA-G----G----TT--GT----------------------C-AC-G-A-A--C-T-TT--A-C-GG-AC--AA-C-C-C--TCGTAa
gi|122182                     :                                                --TT-T-T--T--GT-AT---TT-G-A-TT-AG-AA-T----TATA-A-CATGAAA-T-G-TG-CC--T-T--TG-T--TT-G-T-AAT----G--A--A--AATT----T-T--T-G--C-AT-T--T-T-A--AT-AAA-AAT--A-AA-A--CA-----G-A-A-AT--TT-AA-C-G--AAA-A-TG-T-T-A--G-TATTCAA-T-A-T-A-C-TTT--ATTC----AA--G--GT-TT---G-T-CA------------T---T-A---TGAC--AA-G----G----TT--TC---------------------CT-AC-G-A-A--C-T-CTTAA-C-GG-AA--AA-C-CGCAATCGTAtgt
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gi|122143                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   T---G-T-TAC--T-----TT-TACAT-AA--T--T--AA-G----T----TT--GT---------------------CC-AC-G-A-A--C-T-TT--A-C-GG-AC--AA-C-C-C--TCGCAtat
gi|122197                     :                                                                                                                                                                       ttgccgtgctccgggtcaccatcccaagtttaataacgaagtcatacttgtaaatgcatataaaatggacaaaattttacactttataattcactatagtaaagttataaatatgctaataataaatatctataa--T-----TT-T---G-A---T--C--AAAG----G----TT--GT---------------------TC-AC-G-A----C-T-TT--A-C-GG-AC--AA---C-C--TCGTA
gi|122192                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       T-T---T-AAATT--T--AA-G----C----TT--GT---------------------CC-AC-G-A-A--C-T-GT--A-C-GG-AC--AA-C-C-C--TCGTAtgt
gi|122151                     :                                                                                                                                                                                                                                                                               attataaacatgctattaataaatatctatagttctactttta---T-A---T--T--AA-G----GC---TT--GT---------------------CC-AC-G-A-A--C-T-TT--A-C-GG-AC--AA-C-C-C--TCGTAta
gi|122198                     :                                                                                                                                                                  tttccgtgctccgggtcaccatcccaagtctaataacaaagtcatacttgtaattatagtgataaaatcggaccgaattttacattttataacccgcatatagtaaaggattataaacatgctaataataaatatctataacgctacttttatata-A---T--C--AA-G----G----TT--GT---------------------CC-AC-G-A-A--C-T-TT--A-C-GG-AT--AG-C-C-C--TCGTA
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gi|122153                     :                                                                                                                                                                  ttgctgtgctccgggtcaccatccgacgtctaataacgaaatcatacttgtaattataaatataaaatcggacaaaattttacatattataattcacatatagttagggattataaatatgttaacaataaatatctataacgctactttaatata-A---T--G--AA-G----GC---TT--GT---------------------CC-AC-G-A-A--C-T-TT--A-C-GG-AC--AA-C-C-C--TCGTAtgt
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gi|122187                     :                                                                                                                                                                                    ttttagtgctccaaatatgagttttgtgtatttctgtatttgatagaattatacctaaatgtgcttgtttgtaatgaaaatttgcatattaatacaataaaacatgaatttaaccatatactttatcgatgtttgtcagtttttatc--AG-G----G----TT--GT---------------------CC-GT-A-A-A--G-T-TT--G-T-GG-AC--AA-C-C-T--Tcgta
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Reference ( family-342 )      :                                                                                                                                                                 TGCTC-CGGG-T--A--T-GAG--T--T-T-G-T-G--T-C--TT-T-T--T--GT-AT---TT-G-A-T--AG-AA-T----TATA-A-C-T-AAA-T-G-TG-C---T-T--TG-T--TT-G-T-AAT----G--AA--A---T-T--T-G--C--AT-A-T-T--AAT-A-------AG-A-T--A-AA-A--CA-----TG-A-AT--TT-AA-C-G--AAA-A-TG-T-T-A--G-T-TTC-A-T-A-T-A-C-TTT--A-TC----AA--G--GT-TT---G-T-CAG--T-----TT-T---T-A---T--C--AA-G----G----TT--GT---------------------CC-AC-G-A-A--C-T-TT--A-C-GG-AC--AA-C-C-C--TCGTA
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gi|122142                     :  ttgccgcgctccgggtcattatcccaagtctaataacgaagtcatacttgtaattatacatataaaatcggacaaaattttacgttttataattcaaataaagcaaaggattataaatgtgctaataatagatatttctttaatgctacttttattaaaTGCTC-CGGA-T--A--C-GAG--T--T-T-G-T-G--T-C--TT-T-T--TT-GT-AT---T--G-A-T--AG-AA-T----TATA---C-T-AAA-T-G-TG-C---T-T--TG-T--TT-G-T-AAT----G--AA--A---T-T--T-G--C--AT-A-T-T--AAT-A-------A-------A-AA-A--CA-----TG-A-AT--TG-AA-C-G--AAA-A-TG-T-A-A--G-T-TTC-A-C-A-T-A-C-TTT--A-TC----AA--T--GC-TC---G-T-CAGT-T-----TT-T---T-A---T--C--AA-G----G----T----T---------------------CC-AC-A-A-A--C-T-TT--A-C-GG-AC--AA-C-C-C--TCGTAca
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gi|122144                     :                          ttgccgtgctccgggtcaccatcccaagtttaataacgaagtcatacttgtaaatgcatataaaatggacaaaattttacactttataattcactatagtaaagttataaatatgctaataataaatatctataaTGCTC-CAAA-T--A--T-GAG--T--T-TTG-T-G--T-A--TT-T-C--T--GT-AT---TT-G-A-T--AG-AA-T----TATA-C-C-T-AAA-T-G-TG-C-----T--TG-T--TT-G-T-AAT----GA-AA--A---T-T--T-G--C--AT-A-T-T--AAT-A-------CA-A-T--A-AA-A--CA-----TG-A-AT--TT-AA-C--------------------------C-A-T-A-T-A-C-TTT--A-TC----GA--T--GT-TT---G-T-CAG--T-----TT-T---T-A---T--C--AA-G----G----TT--GT---------------------CC-AT-G-A-A--C-T-TT--A-C-GG-AC--AA-C-C-C--TCGTA
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gi|122158                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             cgtgctccgggtcacccatcccacgtctaataacgaaagtcatacttttttaattataccataaaaaaagcggacaaaattttacattttataattcacattgtagttaaaaggattaaaat-A---T--T--AA-G----GC---TT--GT---------------------CC-AC-G-A-A--C-T-TT--A-C-GG-AC--AA-C-C-C--TCGTAtat
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gi|122161                     :                                                                                                                                                                gTGCTC-CGGG-T--A--T-GGG--T--C-T-G-T-G--T-A--TT-T-T--T--GT-AT---TT-A-A-T--AG-AA-T----TATA-A-C-T-AAA-T-G-TG-C---T-T--TG-T--TT-G-T-AAT----G--AA--AA--T-T--T-G--C--AT-A-T-T--AAT-A-------AG-A-T--G-AG-A--CA-----TG-A-AT--TT-AA-C-G--AAA-A-TG-T-T-A--G-T-TTC-A-T-A-T-A-C-TTT--A-TC----AA--G--GT-TT---G-T-CAG--T-----TT-T---T-A---T--C--AA-G----G----TT--GT---------------------CC-AC-G-A-A--C-T-TT--A-C-GG-AC--AA-C-C-C--TCGTA
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