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Reference ( gi|88462 )        :              TTTAA-GATC-AAG-GTCA-AA--G--GT-TAA-G----GTC--AC--TGG-AGTCA-C----------------TT-GACC---TT----GA-T---AC----TAC---TTTGTAG
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gi|88497                      :                                       --GT-TAA-G----GTC--AT--TGA-AGTCA-C----------------TT-GACC---TT----GA-C---AC----TAA---CTTGTAG
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gi|88498                      :                                  ttttatgtT-CAA-G----GTC--AC--TGG-AGTCA-C----------------TT-GACC---TT----GA-C---AC----TAA---TT
gi|88499                      :                                          T-CAA-G----GGC--AC--TGG-AGTCA-C----------------AT-GACC---TT----GT-C---AT----TAA---TTTGT
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|88461 ): TTTTATGTTCATGATCAGATGTCAAGATGTAAACTTGATCTTGACACTAAGTTGTAG






Alignments
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lowQualScore                  :                . .. ...... ..  ..  . .    . ..    ..   ....     ..  .       ................  .    ...  ....  . ...  ....  ..       
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Reference ( family-341 )      :            TTTA-T--G------T--TC--AA-G-GTCAGA--GGTC--AAG----GTCAC--TG-GAGTCAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AC----TA-GTTTGTAG
gi|88431                      :            TTTA-T--G------T--TC--AA-G-ATCAGA--GGTT--AAG----GTCACACTG-GAGTCAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AC----AA-GTTTATAG
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gi|88433                      :           tTTTA-T--G------T--TC--AA-G-GTCAAA--GGTC--AAG----TTCAC--TG-GATTCAA----------------TT-GACC---TT----GA-T---AC----CG-ATTTGTAG
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gi|88442                      :           tTTTT-T--G------T--TC--AAAG-GTCAGA--AGTC--AATTTACGTCAT--TG-AAGTCAC----------------TT-AACC---TT----GA-T---AC----TA-CCTCGTAG
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gi|88446                      :           tTTTA-T--G------T--TC--AT-G-GTCAGA--GGTC--AAG----GTCAC--TG-GAGAATC----------------TT-GAAC---TT----GA-T---AC----TA-GTCTGTAG
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gi|88448                      :                                           tA--GGTC--AAA----GTAAC--AG-GAGTCAT----------------TT-GACC---TT----GA-C---AC----TA-GTTTGCA
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gi|88458                      :    tttcgtgaTTCA-T--G------T--TA--AA-A-GTCAGA--AG-A--AAT----GTTAA--TG-GAGTCAC----------------TT-GACT---TT----GA-A---AT----GA-ATTTGTAG
gi|88459                      :           tTTTA-A--G------T--TC--AT-G-ATCAGT--GGTG--AAG----TTTAC--TG-GAGTCCC----------------CT-GACT---TT----AA-T---AC----TA-GTTTGTAG
gi|88460                      :           tTCTA-T--G------A--CC--AA-G-GTCATT--AGTT--AGG----GTCAC--TG-GAGTAAC----------------CT-GATT---TT----AA-T---GC----TA--TTTCTA
gi|88461                      :           tTTTA-T--G------T--TC--AT-G-ATCAGA--TGTC--AAG----A------TG-TAA--AC----------------TT-GATC---TT----GA-C---AC----TA-AGTTGTAG
gi|88462                      :           tTTTA-A--G------A--TC--AA-G-GTCAAA--GGTT--AAG----GTCAC--TG-GAGTCAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AC----TA-CTTTGTAG
gi|88463                      :            TCTA-T--G------T--TG--AA-G-GTCATA--GGTC--AAG----GTCAC--TG-GAGTCCC----------------TA-GACC---CT----AA-T---AC----TA-ATTTGTAG
gi|88464                      :            TCTA-T--G------T--G---AA-G-GTCATACTGGTC--AAG----GTCAC--TG-GAGTCCC----------------TA-GACC---CT----AA-T---AC----TA-ATTT-TAG
gi|88465                      :            TTTA-T--A------CAATC--AC-G-ATTAAA--GGTC--AAG----GTCAC--AG-GACTCAT----------------TT-GATC---TT----GA-T---AC----TA-GTTTG
gi|88466                      :            TTTA-TCTG------T--TC--AA-G-TTCAAA--GGTC--A------GCCAT--TG-AAGTCAC----------------TTGGACC---TT----AA-T---AC----CA-A-TTGTAG
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gi|88468                      :            TTTA-T--G------A--TC--AA-G-GTCAAA--AGTC--AAG----GTCAC--AG-AAGTCAC----------------TT-GGTT---AT----AA-T---AC----TA-GTTTGTA
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gi|88475                      :             TTA-T--G------T--TC--AA-A-GTAAGT--AGTC--AGA----GTCTT--GG-GAGGCAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AT----TA-GTTTGTA
gi|88476                      :             TTA-T--G------T--TCTTAA-G-A-CAGG--GGTC--AAG----GTCAC--CC-AAGTAAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AT----GA-ATTTGTAG
gi|88477                      :             TTC-T--G------T--TCC-AA-G-ATCGGA--GGTC--AAG----GTCAC--TG-GAGTCAC----------------TT-GATA---TT----GG-T---AC----T
gi|88478                      :              TA-T--G------T--TC--AA-G-GTAAAA--GGTC--AAG----GTCAC--TC-GAGCTACTGGGAT----------TT-GACT---TT----G
gi|88479                      :              TA-T--G------T--TC--AA-G-GTAAGA--CGTC--AAG----GTCAA--TG-GAATCGC----------------TT-TACC---TT----AA-A---AC----TA-GTATGTAG
gi|88480                      :              TA-T--G------T--TC--AA-G-GTAAGA--CGTC--AAG----GTCAA--TG-GAATCGC----------------TT-TACC---TT----AA-A---AC----TA-GTATGTAG
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gi|88483                      :                     ------T--CC--AA-G-GTCAGA--TGTC--AAG----GTTAC--TG-AAGTCAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AC----AA-GTTT
gi|88484                      :                     ------T--CC--AA-G-GTCAGA--AGTC--AAG----GCCAC--TG-GAGTCAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---
gi|88485                      :                     ------T--TT--AA-A-ATCAAA--T-TC--AAA----GTCAC--TG-GGGTCAC----------------TT-GACC---TC----GA-C---AC----CA-ATT
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gi|88488                      :                            --TC--AA-G-GTGAAA--TGTC--AAG----GTTAC--TG-AAGTCAC----------------TT-GACC---TT----TA-T---AC----TA-CTTTG
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gi|88490                      :                               C--AA-G-GTCC-A--GGTC--AAC----GTCAC--TG-GGGTCAC----------------TT-GACC---TT----G--T---AC----TA--CTTGT
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gi|88495                      :                                             --GGTC--AAG----GTCAC--TG-GAGTTCC----------------TT-TACC---GT----GA-T---AC----TA--TTTGTAG
gi|88496                      :                                             --GATC--AAG----GTCAC--AG-GAACCAT----------------TT-AACC---TT----GA-T---AT----TA-ATTGGTA
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Alignments
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lowQualScore                  :                . .. ...... ..  ..  . .    . ..    ..   ....     ..  .       ................  .    ...  ....  . ...  ....  ..       
lowQualScore                  :                5 11 888888 77  22  7 7    4 88    88   2222     88  6       5555555555555555  2    000  8888  2 000  3333  33       
consensus                     :            TTTA-T--G------T--TC--AA-G-GTCAGA--GGTC--AAG----GTCAC--TG-GAGTCAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AC----TA-GTTTGTAG
Reference ( family-341 )      :            TTTA-T--G------T--TC--AA-G-GTCAGA--GGTC--AAG----GTCAC--TG-GAGTCAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AC----TA-GTTTGTAG
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gi|88440                      :           tTTTA-T--G------T--CC--AA-G-GTCAAA--GGTC--AAG----GTCAC--TATTAGTCAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AC----CA-ATTCGTAG
gi|88441                      :           tTTTC-T--G------T--TCC-AA-A-GTCAGA--AGTC--AAG----GTCTT--GG-GAGTCAC----------------TT-GACC---TT----GA-C---AC----AA-GTTTATA
gi|88442                      :           tTTTT-T--G------T--TC--AAAG-GTCAGA--AGTC--AATTTACGTCAT--TG-AAGTCAC----------------TT-AACC---TT----GA-T---AC----TA-CCTCGTAG
gi|88443                      :           tTTTA-T--GCACC--T--CC--AA-G-AT-AGG--GATC--AAG----GTCAT--TG-GAGTAAC----------------TT-GAAC---TTGTCAGA-T---AC----CA-ATTTGTAG
gi|88444                      :           tTTTA-T--G------T--TC--AA-G-GTCAAA--GGTC--AAG----TTAAC--------TC-C----------------TT-GATA---CT----AATT---AC----TA-ATTTGTAG
gi|88445                      :           tTTTA-T--G------G--TC--AT-G-GT--------TC--AAG----GTCAA---G-GAGT-AC----------------TTTGACC---TT----GA-C---AC----TA-GTTTATAG
gi|88446                      :           tTTTA-T--G------T--TC--AT-G-GTCAGA--GGTC--AAG----GTCAC--TG-GAGAATC----------------TT-GAAC---TT----GA-T---AC----TA-GTCTGTAG
gi|88447                      :           tTTTA-T--T------T--TC--AA-G-GACAAA--AGTT--GAG----GTCAA--TG-GAGTTAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AC----TA-ATT
gi|88448                      :                                           tA--GGTC--AAA----GTAAC--AG-GAGTCAT----------------TT-GACC---TT----GA-C---AC----TA-GTTTGCA
gi|88449                      : ttttatgagcaTTCA-T--G------T--TC--AT-G-GTTAGA--GGTC--AAG----TTCAC--CA-GAGTCAC----------------AT-GACC---TT----GG-T---AC----TA-GTTTGTAG
gi|88450                      :                              tC--AA-G-GTCAGA--GGTC--AAC----GTCAC--TG-GGGTCAC----------------TT-GACC---TT----GG-T---AC----TA-CTTTGT
gi|88451                      :   tttttttccTTTA-T--G------T--TCT-AA-A-GTCAGA--GGTT--AAG----GTCAT--TG-GAGTCAC----------------TT-TACC---TT----AA-T---AC----AA-GTTTAT
gi|88452                      :           tTTTA-T--G------T--TT--AA-G-ATCAAA--GATA--AAG----GTAAC--TG-AAG---------------------T-GACC---TT----GA-----AC----CA-ATTTGTAG
gi|88453                      :           tTTTA-T--G------T--TCT-AA-G-TTCAGA--GGTC--AAA----ATTAC--TA-GAGTCAC----------------GT-GACCTAATT----GA-T---AC----TT-ATTTGTAG
gi|88454                      :           tTTTA-T--G------T--TC--AA-G-GTTA----------AAG----GTCAC--TG-GAGTCAT----------------TT-GACC---AT----GA-T---AC----CA-ATTCATAG
gi|88455                      :           tTTTA-A--G------T--TG--AA-G-GTCAAA--TATC--AAG----GTCAC--TG-GAATCAC----------------AT-GACC---TT----AA-T---ACTAATTA-ATTTGTAG
gi|88456                      :           tTTTA-T--G------T--TC--AT-A-GTCAGA--GGTC--AAG----GTCAC--TG-AAGTCAC----------------TT-GA-----TTA---GA-C---AC----TA---TTATAG
gi|88457                      :                    t------T--CC--AA-G-GTCAGA--GGTC--TAG----CTCAA--TG-GAGTCAC----------------TT-GACC---AT----GA-T---CC----TA-GTTTATA
gi|88458                      :    tttcgtgaTTCA-T--G------T--TA--AA-A-GTCAGA--AG-A--AAT----GTTAA--TG-GAGTCAC----------------TT-GACT---TT----GA-A---AT----GA-ATTTGTAG
gi|88459                      :           tTTTA-A--G------T--TC--AT-G-ATCAGT--GGTG--AAG----TTTAC--TG-GAGTCCC----------------CT-GACT---TT----AA-T---AC----TA-GTTTGTAG
gi|88460                      :           tTCTA-T--G------A--CC--AA-G-GTCATT--AGTT--AGG----GTCAC--TG-GAGTAAC----------------CT-GATT---TT----AA-T---GC----TA--TTTCTA
gi|88461                      :           tTTTA-T--G------T--TC--AT-G-ATCAGA--TGTC--AAG----A------TG-TAA--AC----------------TT-GATC---TT----GA-C---AC----TA-AGTTGTAG
gi|88462                      :           tTTTA-A--G------A--TC--AA-G-GTCAAA--GGTT--AAG----GTCAC--TG-GAGTCAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AC----TA-CTTTGTAG
gi|88463                      :            TCTA-T--G------T--TG--AA-G-GTCATA--GGTC--AAG----GTCAC--TG-GAGTCCC----------------TA-GACC---CT----AA-T---AC----TA-ATTTGTAG
gi|88464                      :            TCTA-T--G------T--G---AA-G-GTCATACTGGTC--AAG----GTCAC--TG-GAGTCCC----------------TA-GACC---CT----AA-T---AC----TA-ATTT-TAG
gi|88465                      :            TTTA-T--A------CAATC--AC-G-ATTAAA--GGTC--AAG----GTCAC--AG-GACTCAT----------------TT-GATC---TT----GA-T---AC----TA-GTTTG
gi|88466                      :            TTTA-TCTG------T--TC--AA-G-TTCAAA--GGTC--A------GCCAT--TG-AAGTCAC----------------TTGGACC---TT----AA-T---AC----CA-A-TTGTAG
gi|88467                      :            TTTA-T--G------T--TCC-AA-G-GTCAGA--TGTC--AAG----GTCAC--TG-AAGTCAC----------------TT-AACC---TT----GA-T---AC----TT-ATTTTTAG
gi|88468                      :            TTTA-T--G------A--TC--AA-G-GTCAAA--AGTC--AAG----GTCAC--AG-AAGTCAC----------------TT-GGTT---AT----AA-T---AC----TA-GTTTGTA
gi|88469                      :            TTTA-T--GGAAGTTT--TC--AT-G-AT-AAA--GGTC--AAG----GTCAC--TC-GAGTAAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AT----TA-GCTTGTAG
gi|88470                      :            TTTA-T--G------T--TC--AA-G-GGCAAA--GGTATAAAG----GTCAC--AG-GAGTTAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AC----TA-ATTTGAAG
gi|88471                      :            TTTACT--G------T--TC--AA-G-GTCA----------AAG----GTCAC--TG-AATTCAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AT----CA-ATCT
gi|88472                      :            TTTACT--G------T--TC--AA-G-GTCA----------AAG----GTCAC--TG-GATTCAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AT----CA-ATCT
gi|88473                      :             TTA-T--A------T------GA-G-ATCAAA--TATT--CAG----GTCGC--TT-GAGTCAC----------------TT-GACA---TT----GA-T---AC----TA-GTTTGTAG
gi|88474                      :             TTA-T--G------T--TA--AG-G-GTTAAA--TATC--AAG----GTCAC--TG-AAGTCAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AC----TA-ATTTGTAG
gi|88475                      :             TTA-T--G------T--TC--AA-A-GTAAGT--AGTC--AGA----GTCTT--GG-GAGGCAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AT----TA-GTTTGTA
gi|88476                      :             TTA-T--G------T--TCTTAA-G-A-CAGG--GGTC--AAG----GTCAC--CC-AAGTAAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AT----GA-ATTTGTAG
gi|88477                      :             TTC-T--G------T--TCC-AA-G-ATCGGA--GGTC--AAG----GTCAC--TG-GAGTCAC----------------TT-GATA---TT----GG-T---AC----T
gi|88478                      :              TA-T--G------T--TC--AA-G-GTAAAA--GGTC--AAG----GTCAC--TC-GAGCTACTGGGAT----------TT-GACT---TT----G
gi|88479                      :              TA-T--G------T--TC--AA-G-GTAAGA--CGTC--AAG----GTCAA--TG-GAATCGC----------------TT-TACC---TT----AA-A---AC----TA-GTATGTAG
gi|88480                      :              TA-T--G------T--TC--AA-G-GTAAGA--CGTC--AAG----GTCAA--TG-GAATCGC----------------TT-TACC---TT----AA-A---AC----TA-GTATGTAG
gi|88481                      :                -T--G------A--TC--AA-G-GTCAAA--GGCC--AAG----GTCAC--TG-GAGTTAG----------------TT-GACC---TT----TT-T---AC----AA-GTTTGAAG
gi|88482                      :                     ------T--TT--AT-G-ATCAGA--GGTC--AAG----GTCAC--AG-GACTCAC----------------TT-GACC---TT----GA-C---AC----TA-ATTTGTAG
gi|88483                      :                     ------T--CC--AA-G-GTCAGA--TGTC--AAG----GTTAC--TG-AAGTCAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AC----AA-GTTT
gi|88484                      :                     ------T--CC--AA-G-GTCAGA--AGTC--AAG----GCCAC--TG-GAGTCAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---
gi|88485                      :                     ------T--TT--AA-A-ATCAAA--T-TC--AAA----GTCAC--TG-GGGTCAC----------------TT-GACC---TC----GA-C---AC----CA-ATT
gi|88486                      :                            --TC--AA-G-GTCAAA--GGTT--AAG----GTCAC--TG-GAGTCAC----------------TT-GACC---TT----GATT---AC----TA--CTTGTAG
gi|88487                      :                            --TC--AA-GCGTCAGC--GGTC--AAG----GTCAC--TG-GAGTTAC----------------TT-GGCC---TT----GA-T---AA----CAGGTTTGTAG
gi|88488                      :                            --TC--AA-G-GTGAAA--TGTC--AAG----GTTAC--TG-AAGTCAC----------------TT-GACC---TT----TA-T---AC----TA-CTTTG
gi|88489                      :                            --TC--AA-C-ATCAGA--GTTC--AAG----GTCAC--TG-GAGTT----------------------ACC---TT----GA-T---AC----AA-GTTTGAAG
gi|88490                      :                               C--AA-G-GTCC-A--GGTC--AAC----GTCAC--TG-GGGTCAC----------------TT-GACC---TT----G--T---AC----TA--CTTGT
gi|88491                      :                                --AA-G-GTCAAA--TATC--AAG----GTCAC--TG-GAATCAC----------------AT-GACC---TT----AA-TCTAAT----TA-ATTTGTAG
gi|88492                      :                                           GA--GTTC--AAA----GTCAC--TG-AAGTCAT----------------TT-GACC---TT----GA-C---TC----TA-GTTTAT
gi|88493                      :                                            A--GGTC--AAG----GTCAC--TG-AAGTCAT----------------TT-GACC---TT----GA-T---AA----AA-GTTTATAG
gi|88494                      :                                             --GATT--AAG----GTCAC--TG-GAGTCAC----------------TT-GATC---TT----GA-T---AC----AA-GTTTATAG
gi|88495                      :                                             --GGTC--AAG----GTCAC--TG-GAGTTCC----------------TT-TACC---GT----GA-T---AC----TA--TTTGTAG
gi|88496                      :                                             --GATC--AAG----GTCAC--AG-GAACCAT----------------TT-AACC---TT----GA-T---AT----TA-ATTGGTA
gi|88497                      :                                                GTT--AAG----GTCAT--TG-AAGTCAC----------------TT-GACC---TT----GA-C---AC----TA-ACTTGTAG
gi|88498                      :                                                 TC--AAG----GTCAC--TG-GAGTCAC----------------TT-GACC---TT----GA-C---AC----TA-ATT
gi|88499                      :                                                 TC--AAG----GGCAC--TG-GAGTCAC----------------AT-GACC---TT----GT-C---AT----TA-ATTTGT


blockSeqs                     :                A CT GAAGTT AA  TT                      TTAC                 AGGTAACTTTAGCAAC  T    TAA  GTCA  T CTA  TAAT  GG
blockSeqs                     :                C .  CACC   G   T                       .                    TGGGAT            G    .    A     T .    .     C 
blockSeqs                     :                C .  .      .   C                       .                    .                 .    .    .     . .    .     A 
blockSeqs                     :                . .  .      .   T                       .                    .                 .    .    .     . .    .     A 
blockSeqs                     :                . .  .      .   C                       .                    .                 .    .    .     . .    .     A 
blockSeqs                     :                . .  .      .   T                       .                    .                 .    .    .     . .    .     A 
blockSeqs                     :                . .  .      .   T                       .                    .                 .    .    .     . .    .     A 
blockSeqs                     :                . .  .      .   C                       .                    .                 .    .    .     . .    .     A 
blockSeqs                     :                . .  .      .   C                       .                    .                 .    .    .     . .    .     A 
blockSeqs                     :                . .  .      .   .                       .                    .                 .    .    .     . .    .     G 
blockSeqs                     :                . .  .      .   .                       .                    .                 .    .    .     . .    .     C 
blockSeqs                     :                . .  .      .   .                       .                    .                 .    .    .     . .    .     A 
blockSeqs                     :                . .  .      .   .                       .                    .                 .    .    .     . .    .     A 
blockSeqs                     :                . .  .      .   .                       .                    .                 .    .    .     . .    .     G 
blockSeqs                     :                . .  .      .   .                       .                    .                 .    .    .     . .    .     G 
blockSeqs                     :                . .  .      .   .                       .                    .                 .    .    .     . .    .     A 
blockSeqs                     :                . .  .      .   .                       .                    .                 .    .    .     . .    .     G 
blockSeqs                     :                . .  .      .   .                       .                    .                 .    .    .     . .    .     G 
blockSeqs                     :                . .  .      .   .                       .                    .                 .    .    .     . .    .     C 
blockSeqs                     :                . .  .      .   .                       .                    .                 .    .    .     . .    .     G 
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blockSeqs                     :                . .  .      .   .                       .                    .                 .    .    .     . .    .     A 
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blockSeqs                     :                . .  .      .   .                       .                    .                 .    .    .     . .    .     A 
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blockSeqs                     :                . .  .      .   .                       .                    .                 .    .    .     . .    .     A 
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blockSeqs                     :                . .  .      .   .                       .                    .                 .    .    .     . .    .     A 
blockSeqs                     :                . .  .      .   .                       .                    .                 .    .    .     . .    .     A 
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blockSeqs                     :                . .  .      .   .                       .                    .                 .    .    .     . .    .     G 
blockSeqs                     :                . .  .      .   .                       .                    .                 .    .    .     . .    .     A 
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blockSeqs                     :                                                        .                    .                 .    .    .                    


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finalCons                     :            TTTA-T--G------T--TC--AA-G-GTCAGA--GGTC--AAG----GTCAC--TG-GAGTCAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AC----TA-GTTTGTAG





Alignments
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lowQualScore                  :                . .. ...... ..  ..  . .    . ..    ..   ....     ..  .       ................  .    ...  ....  . ...  ....  ..       
lowQualScore                  :                5 11 888888 77  22  7 7    4 88    88   2222     88  6       5555555555555555  2    000  8888  2 000  3333  33       
consensus                     :            TTTA-T--G------T--TC--AA-G-GTCAGA--GGTC--AAG----GTCAC--TG-GAGTCAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AC----TA-GTTTGTAG
Reference ( family-341 )      :            TTTA-T--G------T--TC--AA-G-GTCAGA--GGTC--AAG----GTCAC--TG-GAGTCAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AC----TA-GTTTGTAG
gi|88431                      :            TTTA-T--G------T--TC--AA-G-ATCAGA--GGTT--AAG----GTCACACTG-GAGTCAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AC----AA-GTTTATAG
gi|88432                      :           tTTTA-T--G------TG-TC--AA-G-GTCTGA-----------------CAG--TG-GAATCAT----------------TT-GACC---TT----AG-T---AC----TA-CTTTGTAG
gi|88433                      :           tTTTA-T--G------T--TC--AA-G-GTCAAA--GGTC--AAG----TTCAC--TG-GATTCAA----------------TT-GACC---TT----GA-T---AC----CG-ATTTGTAG
gi|88434                      :           tTTTA-T--G------T--TC--AT-G-GCCAGA--GGTC--AAG----GTCAC--TT-GAGTAAC----------------TT-GACC---TT----GA-C---A
gi|88435                      :           tTTTA-T--G------T--TCT-AA-A-GTCAG---GGCC--AAG----GTCAC--AG-GAGTAAC----------------TT-GACA---TT----GA-T---AC----CA-ATAAGTAG
gi|88436                      :           tTTTC-T--G------T--TCC-AA-G-GTCAGA--GGTC--AAG----GTCAC--TG-GAGTCAC----------------TT-GATC---TT----GA-T---AC----AA-ATTT
gi|88437                      :           tTTTA-T--G------T--TCT-AA-A-GTCAGG--GGCC--AAG----GTCAC--TG-CAGTAAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AT----GA-ATTTGTAG
gi|88438                      :           tTTTAAT--G------T--TC--AA-G-GTGAAA--TATC--AAG----GTCAC--TG-GATTAAC----------------TT-GACC---TT----AA-T---AC----TA-ATTTGTAG
gi|88439                      :            TCTA-T---------T--CC--AA-G-GTCCGA--TGTC--AAG----GTCAC--TG-GAGTCACAGGTAACTTTAGCAACTT-GACC---TT----GA-C---AC----TA-ATCTGTAG
gi|88440                      :           tTTTA-T--G------T--CC--AA-G-GTCAAA--GGTC--AAG----GTCAC--TATTAGTCAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AC----CA-ATTCGTAG
gi|88441                      :           tTTTC-T--G------T--TCC-AA-A-GTCAGA--AGTC--AAG----GTCTT--GG-GAGTCAC----------------TT-GACC---TT----GA-C---AC----AA-GTTTATA
gi|88442                      :           tTTTT-T--G------T--TC--AAAG-GTCAGA--AGTC--AATTTACGTCAT--TG-AAGTCAC----------------TT-AACC---TT----GA-T---AC----TA-CCTCGTAG
gi|88443                      :           tTTTA-T--GCACC--T--CC--AA-G-AT-AGG--GATC--AAG----GTCAT--TG-GAGTAAC----------------TT-GAAC---TTGTCAGA-T---AC----CA-ATTTGTAG
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gi|88445                      :           tTTTA-T--G------G--TC--AT-G-GT--------TC--AAG----GTCAA---G-GAGT-AC----------------TTTGACC---TT----GA-C---AC----TA-GTTTATAG
gi|88446                      :           tTTTA-T--G------T--TC--AT-G-GTCAGA--GGTC--AAG----GTCAC--TG-GAGAATC----------------TT-GAAC---TT----GA-T---AC----TA-GTCTGTAG
gi|88447                      :           tTTTA-T--T------T--TC--AA-G-GACAAA--AGTT--GAG----GTCAA--TG-GAGTTAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AC----TA-ATT
gi|88448                      :                                           tA--GGTC--AAA----GTAAC--AG-GAGTCAT----------------TT-GACC---TT----GA-C---AC----TA-GTTTGCA
gi|88449                      : ttttatgagcaTTCA-T--G------T--TC--AT-G-GTTAGA--GGTC--AAG----TTCAC--CA-GAGTCAC----------------AT-GACC---TT----GG-T---AC----TA-GTTTGTAG
gi|88450                      :                              tC--AA-G-GTCAGA--GGTC--AAC----GTCAC--TG-GGGTCAC----------------TT-GACC---TT----GG-T---AC----TA-CTTTGT
gi|88451                      :   tttttttccTTTA-T--G------T--TCT-AA-A-GTCAGA--GGTT--AAG----GTCAT--TG-GAGTCAC----------------TT-TACC---TT----AA-T---AC----AA-GTTTAT
gi|88452                      :           tTTTA-T--G------T--TT--AA-G-ATCAAA--GATA--AAG----GTAAC--TG-AAG---------------------T-GACC---TT----GA-----AC----CA-ATTTGTAG
gi|88453                      :           tTTTA-T--G------T--TCT-AA-G-TTCAGA--GGTC--AAA----ATTAC--TA-GAGTCAC----------------GT-GACCTAATT----GA-T---AC----TT-ATTTGTAG
gi|88454                      :           tTTTA-T--G------T--TC--AA-G-GTTA----------AAG----GTCAC--TG-GAGTCAT----------------TT-GACC---AT----GA-T---AC----CA-ATTCATAG
gi|88455                      :           tTTTA-A--G------T--TG--AA-G-GTCAAA--TATC--AAG----GTCAC--TG-GAATCAC----------------AT-GACC---TT----AA-T---ACTAATTA-ATTTGTAG
gi|88456                      :           tTTTA-T--G------T--TC--AT-A-GTCAGA--GGTC--AAG----GTCAC--TG-AAGTCAC----------------TT-GA-----TTA---GA-C---AC----TA---TTATAG
gi|88457                      :                    t------T--CC--AA-G-GTCAGA--GGTC--TAG----CTCAA--TG-GAGTCAC----------------TT-GACC---AT----GA-T---CC----TA-GTTTATA
gi|88458                      :    tttcgtgaTTCA-T--G------T--TA--AA-A-GTCAGA--AG-A--AAT----GTTAA--TG-GAGTCAC----------------TT-GACT---TT----GA-A---AT----GA-ATTTGTAG
gi|88459                      :           tTTTA-A--G------T--TC--AT-G-ATCAGT--GGTG--AAG----TTTAC--TG-GAGTCCC----------------CT-GACT---TT----AA-T---AC----TA-GTTTGTAG
gi|88460                      :           tTCTA-T--G------A--CC--AA-G-GTCATT--AGTT--AGG----GTCAC--TG-GAGTAAC----------------CT-GATT---TT----AA-T---GC----TA--TTTCTA
gi|88461                      :           tTTTA-T--G------T--TC--AT-G-ATCAGA--TGTC--AAG----A------TG-TAA--AC----------------TT-GATC---TT----GA-C---AC----TA-AGTTGTAG
gi|88462                      :           tTTTA-A--G------A--TC--AA-G-GTCAAA--GGTT--AAG----GTCAC--TG-GAGTCAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AC----TA-CTTTGTAG
gi|88463                      :            TCTA-T--G------T--TG--AA-G-GTCATA--GGTC--AAG----GTCAC--TG-GAGTCCC----------------TA-GACC---CT----AA-T---AC----TA-ATTTGTAG
gi|88464                      :            TCTA-T--G------T--G---AA-G-GTCATACTGGTC--AAG----GTCAC--TG-GAGTCCC----------------TA-GACC---CT----AA-T---AC----TA-ATTT-TAG
gi|88465                      :            TTTA-T--A------CAATC--AC-G-ATTAAA--GGTC--AAG----GTCAC--AG-GACTCAT----------------TT-GATC---TT----GA-T---AC----TA-GTTTG
gi|88466                      :            TTTA-TCTG------T--TC--AA-G-TTCAAA--GGTC--A------GCCAT--TG-AAGTCAC----------------TTGGACC---TT----AA-T---AC----CA-A-TTGTAG
gi|88467                      :            TTTA-T--G------T--TCC-AA-G-GTCAGA--TGTC--AAG----GTCAC--TG-AAGTCAC----------------TT-AACC---TT----GA-T---AC----TT-ATTTTTAG
gi|88468                      :            TTTA-T--G------A--TC--AA-G-GTCAAA--AGTC--AAG----GTCAC--AG-AAGTCAC----------------TT-GGTT---AT----AA-T---AC----TA-GTTTGTA
gi|88469                      :            TTTA-T--GGAAGTTT--TC--AT-G-AT-AAA--GGTC--AAG----GTCAC--TC-GAGTAAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AT----TA-GCTTGTAG
gi|88470                      :            TTTA-T--G------T--TC--AA-G-GGCAAA--GGTATAAAG----GTCAC--AG-GAGTTAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AC----TA-ATTTGAAG
gi|88471                      :            TTTACT--G------T--TC--AA-G-GTCA----------AAG----GTCAC--TG-AATTCAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AT----CA-ATCT
gi|88472                      :            TTTACT--G------T--TC--AA-G-GTCA----------AAG----GTCAC--TG-GATTCAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AT----CA-ATCT
gi|88473                      :             TTA-T--A------T------GA-G-ATCAAA--TATT--CAG----GTCGC--TT-GAGTCAC----------------TT-GACA---TT----GA-T---AC----TA-GTTTGTAG
gi|88474                      :             TTA-T--G------T--TA--AG-G-GTTAAA--TATC--AAG----GTCAC--TG-AAGTCAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AC----TA-ATTTGTAG
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gi|88476                      :             TTA-T--G------T--TCTTAA-G-A-CAGG--GGTC--AAG----GTCAC--CC-AAGTAAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AT----GA-ATTTGTAG
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gi|88478                      :              TA-T--G------T--TC--AA-G-GTAAAA--GGTC--AAG----GTCAC--TC-GAGCTACTGGGAT----------TT-GACT---TT----G
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gi|88483                      :                     ------T--CC--AA-G-GTCAGA--TGTC--AAG----GTTAC--TG-AAGTCAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---AC----AA-GTTT
gi|88484                      :                     ------T--CC--AA-G-GTCAGA--AGTC--AAG----GCCAC--TG-GAGTCAC----------------TT-GACC---TT----GA-T---
gi|88485                      :                     ------T--TT--AA-A-ATCAAA--T-TC--AAA----GTCAC--TG-GGGTCAC----------------TT-GACC---TC----GA-C---AC----CA-ATT
gi|88486                      :                            --TC--AA-G-GTCAAA--GGTT--AAG----GTCAC--TG-GAGTCAC----------------TT-GACC---TT----GATT---AC----TA--CTTGTAG
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gi|88488                      :                            --TC--AA-G-GTGAAA--TGTC--AAG----GTTAC--TG-AAGTCAC----------------TT-GACC---TT----TA-T---AC----TA-CTTTG
gi|88489                      :                            --TC--AA-C-ATCAGA--GTTC--AAG----GTCAC--TG-GAGTT----------------------ACC---TT----GA-T---AC----AA-GTTTGAAG
gi|88490                      :                               C--AA-G-GTCC-A--GGTC--AAC----GTCAC--TG-GGGTCAC----------------TT-GACC---TT----G--T---AC----TA--CTTGT
gi|88491                      :                                --AA-G-GTCAAA--TATC--AAG----GTCAC--TG-GAATCAC----------------AT-GACC---TT----AA-TCTAAT----TA-ATTTGTAG
gi|88492                      :                                           GA--GTTC--AAA----GTCAC--TG-AAGTCAT----------------TT-GACC---TT----GA-C---TC----TA-GTTTAT
gi|88493                      :                                            A--GGTC--AAG----GTCAC--TG-AAGTCAT----------------TT-GACC---TT----GA-T---AA----AA-GTTTATAG
gi|88494                      :                                             --GATT--AAG----GTCAC--TG-GAGTCAC----------------TT-GATC---TT----GA-T---AC----AA-GTTTATAG
gi|88495                      :                                             --GGTC--AAG----GTCAC--TG-GAGTTCC----------------TT-TACC---GT----GA-T---AC----TA--TTTGTAG
gi|88496                      :                                             --GATC--AAG----GTCAC--AG-GAACCAT----------------TT-AACC---TT----GA-T---AT----TA-ATTGGTA
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gi|88499                      :                                                 TC--AAG----GGCAC--TG-GAGTCAC----------------AT-GACC---TT----GT-C---AT----TA-ATTTGT