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Reference ( gi|22574 )        : TATAGGTTTACTTAT-A-G-A---C-T-T--T--G--T-A-T-GG--G-A-A--AA--T-A-----T---G-A-C-G-A--C---C---GA--G---T---T-T---------T----T-T-G-G-C--G--------CG--T--A-AACGG-A----C----C----G---A--G-CTT--G-C--G--A----G----GT-C------CG--T--T--C--G-C--G-AC-AA-AAAA
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gi|22617                      :      taaaggTTAT-A-G-A---C-T-T--TTGA--T-A-T-GG--G-A-A--A---T-A-----T---G-T-C-G-A--C---C---TC--G---T---T-T---------T----T-T-G-T-C--G--------CG-------AACGG-A----CCTCGC----A---A--G-CT-----C--G--A----------T-C------CG--TG-T--A--C-C--G-CC-AA-AAAA
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gi|22628                      :      taaaggTTAT-A-G-A---CGT-T--T--T--T-A-T-GG--G-A-A--AA--T-A-----T---G-A-C-G-A--C---C---TC--G---T---T-T---------T----T-T-GTN-C--GTTTTTTGTCG--C--G-ATCGG-A----C----C----G---A--G-CTT--G-C--A--------------------------------C--G-C--G-CC-AA-AAAAca
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gi|22587                      :                                     TATA-GGTT-----AC-AG-A---C-T-T--T--G--T-A-T-GG--G-A-A--AA--T-A-----T---G-A-C-G-A--C---C---AA---G---C---T-T-T---------T-T-G-G-C--G--------C--G-T--A-AAC----GG-A----C----TG---A--G-CTTG-C--G--
gi|22588                      :                                     TATA-GGTT-----AT-AG-A---C-T-T--T--G--T-A-T-GG--G-A-A--AA--T-A-----T---G-A-C-G-A--C---C---GA---G---T---T-T-T---------T-T-G-G-C--G--------C--G-T--G-CA-----------------------A--G-CTCG----------------GT-C------CG--A--T--C--G-C--G-ACAA-AAAA
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gi|22591                      :                                     TATA-GGTTT---TA---G-A---C-T-T--T--G--T-A-T-GG--G-A-A--AA--T-A-----T-------------------------------------------------T-T-G-A-C--G--------C--G-T--A-CAC----GG-A----C----CG---A--G-CTTG-C--T--A----G---GT-C------CG--T--T--C--G-CT-G-ACAA-AAAA
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gi|22596                      :                                     TATA-GGTT-----AT-AG-A---C-T-T--T--G--T-A-TTGG--G-AGA--AA--T-A-----T---G-A-C-G-A--C---C---AAAA-G---T---T-T-T---------T-T-G-G-C--G--------------------------G-----------CA---A--G-CTCG----------------GT-C------CG--T--T--C--G-CTGG-ACAA-AAA
gi|22597                      :                                     TATA-GGTT-----AT-AG-A---C-T-T--T--G--T-A-T-GG--A-A-------------------------------C---C---GA---G---T---T-T-T---------T-TTG-G-C--A--------C--A-C--A-CAC----GG-A----C----CG---A--G-CTTG-C--G--A----G---GT-C------CG--T--T--C--
gi|22598                      :                                     TATA-G--TC---TAT-AG-A---A-T-TA-T--G--T-A-TAGG--G-A-A--AA--C-AGCTCAT---G-A-C-G-A--C---C---GA---GT--T---T-T-T---------T-T-G-G-C--GA-------C--GAT--ATCAC----TG-A----C----CG---A--G-CTTGTT--G--A----G---GT-C------C---T--T--C--G-CG-G-ACAA-AAAA
gi|22599                      :                                              T---TAT-AG-A---C-T-T--T--A--T-A-T-GG--G-G-A--AA--T-----------------------------------------------T---------T-T-G-G-C--G--------C--G-T--T-GAT----GG-A----C----CG---A--G-CTTG-A--G--A----G---AT-C------CG--T--C--C--G-C--G-ACAA-AAA
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gi|22614                      :                                              T---TAT-AG-A---C-T-T--TT-G--T-A-T-GG--A-A-A--AA--T-A-----T---G-A-C-G-A--C---C---TC---G---T---T-T-T---------T-T-G-T-C--G--------C--G------AAC----GG-A----C--------------CTCG-C--A--AACTCG---GT-C------CG--TG-TA-C--G-C--G-CCAA-AAAA
gi|22614                      :                                                                                                                                 agg---T---T-T-T---------T-T-G-G-C--G--------C--G-T--A-CAC----GG-A----C----CG---A--G-TTTG-C--G--A----G---GT-C------CG--T--T--C--G-C--G-ACAA-AAAA
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gi|22615                      :                                                                                                                                 agg---T---T-T-T---------T-T-G-G-C--G--------C--G-T--A-CAC----GG-A----C----CG---A--G-CTTG-C--G--A----G---GT--------CG--T--T--C--G-C--G-ACAA-AAAA
gi|22616                      :       aggttataggactttgtatggaaaaatatgacgacctcgT---TAC-AT-A---C-T-T--TT-G--T-A-T-GG--A-A-A--AA--T-A-----T---G-A-G-G-A--C---C---TC---GGTTT---T-T-T---------T-T-G-T-C--G--------C--G------AAC----GG-A----C----CT---C--G-CAAG-C--T--C----G---GT-C------CG--T--TTAC--G-C--G-CCAA-AAAA
gi|22616                      :                                                                                                                                 agg---T---T-T-T---------T-T-G-G-C--G--------C--G-T--A-AAC----GG-A----C----CG---A--G-CTTG-C--G--A----G---GT-C------CG--T--T--C--G-C--G-ACAA-AAAA
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gi|22617                      :                                                                                                                                 agg---T---T-T-T---------T-T-G-G-C--G-----------G-T--A-CAC----GG-A----T----CG---A--G-CTTG-C--G--A----G---GT-C------CG--T--T--C--G-C--G-ACAA-AAAA
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Reference ( family-312 )      :                                     TATA-GGTTT---TAT-AG-A---C-T-T--T--G--T-A-T-GG--G-A-A--AA--T-A-----T---G-A-C-G-A--C---C-----------GA---G---T---T-T-T---------T-T-G-G--C--G--C--G-T-A-C--AC----GG-A----C----CG---A--G-CTTG-C--G--A----G---GT-C------CG--T--T--C--G-C--G-ACAA-AAAA
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gi|22613                      :                                      ATA-GGTT-----AT-AG-A---C-T-T--T--G--T-A-T-GG--G-A-A--AA--T-A-----T---G-A-C-G-A--C---C-----------TC---G---G---T-T-T---------T-T-G-T--C--G--C--G-----G--AC----GG-ATCTCT----CA---A--G-CTC-------------G---GT-C------CA--T--CAAC--G-C--G-CCAA-AA
gi|22614                      :                                              T---TAT-AG-A---C-T-T--TT-G--T-A-T-GG--A-A-A--AA--T-A-----T---G-A-C-G-A--C---C-----------TC---G---T---T-T-T---------T-T-G-T--C--G--C--G---A----AC----GG-A----C--------------CTCG-C--A--AACTCG---GT-C------CG--TG-TA-C--G-C--G-CCAA-AAAA
gi|22614                      :                                                                                                                                         agg---T---T-T-T---------T-T-G-G--C--G--C--G-T-A-C--AC----GG-A----C----CG---A--G-TTTG-C--G--A----G---GT-C------CG--T--T--C--G-C--G-ACAA-AAAA
gi|22615                      :       aggttatagacttttgtatggaaaaatatgacgacctcgT---TAT-AGGA---C-T-T--T--G--T-A-T-GG--A-A-A--AA--T-A-----T---G-A-C-G-A--C---C-----------TC---G---T---T-T-T---------T-T-G-T--C--G--C--G-A-A-C---------G-A----C----CT---C--G-CAAG-C--T--C----G---GT-C------CG--TG-TA-C--G-C--G-CCAA-AAAA
gi|22615                      :                                                                                                                                         agg---T---T-T-T---------T-T-G-G--C--G--C--G-T-A-C--AC----GG-A----C----CG---A--G-CTTG-C--G--A----G---GT--------CG--T--T--C--G-C--G-ACAA-AAAA
gi|22616                      :       aggttataggactttgtatggaaaaatatgacgacctcgT---TAC-AT-A---C-T-T--TT-G--T-A-T-GG--A-A-A--AA--T-A-----T---G-A-G-G-A--C---C-----------TC---GGTTT---T-T-T---------T-T-G-T--C--G--C--G---A----AC----GG-A----C----CT---C--G-CAAG-C--T--C----G---GT-C------CG--T--TTAC--G-C--G-CCAA-AAAA
gi|22616                      :                                                                                                                                         agg---T---T-T-T---------T-T-G-G--C--G--C--G-T-A-A--AC----GG-A----C----CG---A--G-CTTG-C--G--A----G---GT-C------CG--T--T--C--G-C--G-ACAA-AAAA
gi|22617                      :    aggttacatacttttgtatggaaaaatatgaggacctcggttT---TAT-AG-A---C-T-T--TTGA--T-A-T-GG--G-A-A--A---T-A-----T---G-T-C-G-A--C---C-----------TC---G---T---T-T-T---------T-T-G-T--C--G--C--G---A----AC----GG-A----CCTCGCA---A--G-CT---C--G--A---------T-C------CG--TG-T--A--C-C--G-CCAA-AAAA
gi|22617                      :                                                                                                                                         agg---T---T-T-T---------T-T-G-G--C--G-----G-T-A-C--AC----GG-A----T----CG---A--G-CTTG-C--G--A----G---GT-C------CG--T--T--C--G-C--G-ACAA-AAAA
gi|22618                      :       aggttatagacttttgatatgggaaatatgtcgacctcgT---TAT-AG-A---C-T-T--TTTG--T-C-T-GG--A-A-A--AA--T-A-----T---G-A-C-G-A--C---C-----------TC---G-------T-T-T---------T-T-G-T--C--G--C----T-A----AC----GG-A----C----CT---C--G-CAAG-C--T--C----G---GT-C------CG--TA-TA-C--G-C--G-CCAA-AAAA
gi|22618                      :                                                                                                                                         agg---T---T-T-T---------T-T-G-G--C--G--C--G-T-A-T--AC----GG-A----C----CG---A--G-CTTG-C--G--A----G---GT-C------CG--T--T--A--G-C--G-ACAA-AAA
gi|22619                      :      aggttatagactttttgtctggaaaaatatgacgacctcgT---TAT-AG-C---C-T-T--TT-G--T-A-T-GG--A-A-A--AA--T-A-----T---G-A-C-G-A--C---C-----------TC---G---T---T-T-T---------T-T-G-T--C--G--C--G---A----AT----GG-A----C----CT---C--G-CAAG-C--T--C----G---GT-C------CG--TG-TA-C--G-C--G-CCAA-AAAA
gi|22619                      :                                                                                                                                         agg---T---T-T-T---------T-T-G-G--C--G--C--G-T-A-C--AC----GG-A----C----CG---A--G-CTTG-C--G--A----G---GT-C------CA--T--T--C--G-C--G-ACAA-AAAA
gi|22620                      :       aggttatagccttttgtatggaaaaatatgacgacctcgT---TAT-AG-A---C-T-T--TT-G--T-A-T-GG--A-A-A--AA--T-A-----T---G-A-C-G-A--C---C-----------GA---G---T---T-T-T---------T-T---G--C--G--C--G-T-A-C--AT----GG-A----C----CG---A--G-CTTG-C--G--A----G---GT--------CG--T--T--C--G-C--G-ACAA-AAAA
gi|22621                      :                                           aggT---TAT-AG-A---C-T-T--TT-G--T-A-T-GG--A-A-A--AA--T-A-----T---G-A-C-G-A--C---C-----------TC---G---T---T-G-T---------T-T-G-
gi|22622                      :                                           aggT---TAT-AG-A---C-T-T--TT-G--T-A-T-GG--A-A-A--AA--T-A-----T---G-A-C------CT--C-----------GT---T---T---T-T-T---------T-T-G-T--C--G--------------GC----CA-A---------CG---A--C-CTCG-C--A--AGCTCG---GT-C------TG--TG-TA-C--G-C--G-CCAA-GAAA
gi|22622                      :                                                                                                                                         agg---T---T-T-C---------T-T-G-G--C--G--C--G-T-A-C--AC----AG-A----C----CG---A--G-CTTG-C--G--A----G---GT--------CG--T--T--G--GCC--G-ACAA-AAAA
gi|22623                      :        aggttatagacttttgtatggaaaaatatgacctcgttT---TAT-AG-A---C-T-T--TT-G--T-A-T-GG--A-A-A--AA--C-A-----T---G-A-C-G-A--C---C-----------TC---G---T---T-T-T---------T-T-G-T--C--G--T--G---A----AC----GG-A----C----CT---C--G-CAAG-C--T--C----G---GT-C------CG--TG-TA-C--G-C--G-CCAA-AAAA
gi|22623                      :                                                                                                                                         agg---T---T-T-T---------T-T-G-G--C--G--C--G-T-A-C--AC----GG-A----C----CG---A--G-CTTG-C--G--A----G---GT-C------CG--T--T--C--A-C--G-ACAA-AAAA
gi|22624                      :       aggttatagacttttgtatggaaaaacatgacgacctcgT---TAT-AG-A---C-T-T--T--T--T-A-T-GG--G-G-A--AA--T-G-----T---G-A-C-G-A--C---C-----------TC---GT--T---T-T-T---------T-T-G-T--T--G--C--G---A----AC----GG-A----C--------------CTCG-C--A--A----G---CT-C------GG--T--
gi|22625                      :                                           aggT---TAT-AG-A---C-T-G--T--G--T-A-T-GG--G-A-A--AA--T-A-----T---G-A-C-G-A--CCTTC-----------G----G---T---T-T-TA--------T-T-G-T--C--G--C--G-A-A-C--GCCATAGG-A----C----C---------TTCG-C--A--AGCTCG---GT-C------CG--T--A--C--G-CGTG-CCAA-AAAA
gi|22626                      :                                           aggT---TAT-AT-A---C-T-T--T--G--T-A-T-GG--G-G-A--AA--T-A-----T---G-A-C-G-A--C---C-----------TA---G---T---T-T-T---------T-T-G-T--T--G--C--G-----G--AC----GG-A----C--------------CTCG-C--A--A----G---TT-C------GG--T--C--C--G-C--
gi|22627                      :                                           agcT---TAT-AG-A-----T-T--T--G--TTA-TCGG--A-A-A--AA--T-A-----T---G-A-C-G-A--C---C-----------TC---G---T---C-T-C---------T-T-T-GTTC--G--C--G-A-A-C---------G-A----CCTCGCA---A--G-CTCG-C--------------GT-C------CG--TG-TA-C--G-C--G-ACCA-AAAA
gi|22627                      :                                                                                                                                             agg---T-T-T---------T-T-G-GT-C--G--C--G-T-A-C--AC----GG-A----CG---CG---A--G-CTTG-C--G--A----G---GT--------CG--T--T--C--G-C--GAACAA-AGA
gi|22628                      :     aggttatagatttgttatcggaaaaatatgacgacctcgtcT---TAT-AG-A---CGT-T--T--T--T-A-T-GG--G-A-A--AA--T-A-----T---G-A-C-G-A--C---CTCGTTTTTTGTNC---G---T---T-T-T---------T-T-G-T--C--G--C--G---A-T---C----GG-A----C----CG---A--G-CTTG-C--A-------------------------------C--G-C--G-CCAA-AAAA
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gi|22630                      :                                     aggA-GGTTG---TAT-A------C-T-T--TT-G--T-A-T-GG--A-A-A--AA--T-A-----T---G-A-C-G-A--C---C-----------TC---G---T---T-T-T---------T-T-G-T--CA-G--C--G---A----AC----GG-A----C----CT---A--G-CAAG-C--T--C----G---GT-C------CG--TG-TA-C--G-C--G-TCAA-A
gi|22630                      :                                                                                                                                                      -T---------T-T-G-A--C--G--C--G-T-A-C--AC----GG-A----C----CG---A--G-CTTG-C--T--A----G---GT-C------CG--T--T--C--G-CT-G-ACAA-AAAA
gi|22631                      : aggttgtatacttttgtatggaaaaatatgacgacctcgA-GGTTA---TA--AG-A---C-T-T--TT-G--T-A-T-GG--A-A-A--AA--T-A-----T---G-A-C-A-A--C---C-----------TC---G---------T-T---------T-T-G-T--C--G--C--G-A-A-C---------G-A----C----C
gi|22631                      :                                                                                                                                                                                              ----GG-A----C----CG---A--G-CTTG-C--AC-A----G---GT--------CG--T--T--C--G-C--G-ACAA-AAtgtgcaagctcggtcc
gi|22632                      :      aggttataagacttttgtatggaaaaatatgacaacctcgT---TAT-AG-A---C-T-TATT--G--T-A-T-GG--A-A-A--AAA-T-A-----T---G-A-T-G-AA-C---C-----------TC---G---G---T-T-T---------T-T-G-T--CCAG--C--G---A----AC----GG-A----C----CG---A--G-CTTG-C--
gi|22633                      :                                          aggTT---TAT-A--A---C-T-T--T--GGGT-A-T-GG--G-G-ATAAA--T-A-----T---G-AAC-G-A--C---C-----------GA---G---T---T-T-T---------T-T-G-G--CG-G--C--G-A-A-T--AC----GG-A---------CGAGAA--G-CGTG-C--G--A----G---GT-C------CG--TCAT--CAGA-C--G-ACAA-AAAA
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gi|22636                      :                                           aggT---TAT-AG-A---C-T-T--TT-G--T-A-T-GG--A-A-A--AA--T-A-----T---G-A-C-G-A--C---T-----------CG---T---T---T-T-T---------T-T-G-
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gi|22638                      :                                           aggT---TAT-AG-A---T-T-T--T--GA-T-A-T-GG----A-A--AA--T-A-----T---G-A---G-A------C-----------GA---G---T---T-T-T---------T-T-G-G-----G--C--G-C-A-tattggcaaccagaccaaattt
gi|22639                      :                                           aggT---TAT-AG-A---T-T-T--T--G--T-A-T-TG--G-A-A--AA--T-A-----T---G-A-C-G-A--C---C-----------TC---G---T---T-T-T---------T-T-G-
gi|22640                      :                                            ggT---TAT--G-A---C-T-T--T--G--T-ATT-GG--A-A-A--AA--T-ATT---T---G-A-C-G-A--C---CCT---------TC---G---T---T-T-A---------T-T-G-T--C--G--C--G---A-A--AC----GG------------G---A--C-CTCG-C--A--AGCTCG---GT-C------CG--TG-TA-C--G-C--G-CCAA-AAA
gi|22640                      :                                                                                                                                               g---T-T-T---------T-T-G-G--C--G--C--G-T-A-C--AC----GG-A----C----CG---A--G-CTTG-C--G--A----G---GTCC------CGT-T--T--C--G-C--G-ACAA-TAAA
gi|22641                      :      gttatgactttgtattggaaaaatatttgacgacccttcgT---TAT-AG-A---C-T-T--T--G--T-A-T-GG--G-A-A--AA--T-A-----T---G-A-C-G-A--C---C-----------AA---GT--T---T-T-T---------T-T-G-G--C--G--T--G-T-A-CAGAT----GG-A----C----TG---A--G-CTGG-C--G--A----G---GT-T------AG--T--T--C--G-C--G-ACAA-AAAA
gi|22642                      :                                              T---TAT-AG-A---C-T-T--T--G--T-A-T-GG--G-A-A--AA--T-T-----T---G-A-C-G-A--C---C-----------GA---G---A---A-T-T---------T-T-G-G--T--G--C--A-T-A-G--AC----AG-A----C----CG---A--G-CTTG-C--G--A----G---GT-C------CG--T--T--C--G-C--A-ACAA-AAAA
gi|22643                      :                                              T---TAT-AG-G---T-T-T----------A-T-AA--G-A-A--AA--TGA-----C---G-A---G-A--C---C-----------GA---G---T---T-T-T---------T-T-G-G--C--G--C--G-T-A-G--AC----GG-A----C----CG---T--G-CT
gi|22644                      :                                               ---TAT-AT-A---C-T-T--T--G--T-A-T-GG--GAA-A--AA--T-A-----T-----A-C-G-A--C---C-----------AAGAGG---T---TGT-T---------T-T-G-G--C--G--CGGG-T-A-CA-AC----GG-A----C----CG---A--GCCTTG-C-----A----G---GT-C------CG--T--C--T--G-C--G-
gi|22645                      :                                                        -A---C-T-T--T--G--T-T-T-GG--G-A-A--AA--T-A-----T---G-A-C-T-A--C---C-----------AA---G---TACAT-TGTATATGCATAT-T-G-G--C--A--C--G-T-A-G--AC----GG-A----C----CG---A--T-CTTG-C--A--A----A---GC-C------CT--T--C--C--G-C--G-ACAA-TAA
gi|22646                      :                                                              -T-T--T--G--T------G--G-A-A--AA--T-T-----T---T-A-C-GGA--C---C-----------A--------T---T-T-T---------T-T-G-G--C--G--C--G-T-A-C--AC-----G-A----C----CG---A--G--TTG-C--G--
gi|22647                      :                                                                -T--T--G--T-A-T-GG--G-A-A--AA--T-AG----T---G-A-C-G-A--A---C-----------GA---T---T---T-T-G---------T-T-GTG--C--G--C--G-T-A-C--AC----GG-A----C----CC---AAGG-ACTG-C--GGCA----GCGCGA-C------C------T--C--G-CT-G-ACAA-AAA
gi|22648                      :                                                                                         --AA--T-A-----T---G-A-C-G-G--C---C-----------GA---G---T---A-T-T---------T-T-G-G--C--T--C--G-T-A-G--AC----GG-A----C----CG---A--G-CTTG-C--G--T----G---GT-C------CG--T--C--C--G-A--G-