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lowQualScore                  :          .   . .. . .. .   .  . .  .. .. .. .. .. ..  ... ... ........ . .. . .. ..  ... ... .. .. .....   . ..... . .... . .... . . .... ....  .  . .  ..... .. . .     
lowQualScore                  :          4   8 66 6 88 6   1  6 6  22 33 55 77 11 33  999 222 99999999 5 88 5 22 55  111 444 88 88 88888   6 00000 5 6666 5 1111 5 5 2222 7777  9  3 7  55555 77 4 7     
consensus                     :      CTAACGCC-TC-G-G--T-CGA-CA-A-TGG-T--T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-G-C--A-T-TATTT
Reference ( gi|77613 )        :      CTAATGCC-TT-G-G--T-CAA-CA-A-TGG-T--T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-G-C--A-T-TATTT
gi|77572                      :      CTAACACC-TC-G-G--T-CAA-CA-A-TGG-TG-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---TCTT--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATTT
gi|77573                      :   cggCTAACACC-TC-G-G--T-CAA-CA-A-TGG-T--TGTT--T--C--TC---G---G--------G-GGGT-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TAT
gi|77577                      :   cggCTAAAGCC-TC-G-G--T-CTA-CA-A-TGA-T--T--T--T--C--TT---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G----A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATTT
gi|77603                      :   cggCTAACGCC-TC-G-G--T-CAA-CA-T-TGG-T--T--T--T--T--TG---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---TTAAT--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATTT
gi|77574                      :    gaCTAACACC-TC-G-G--T-CAA-CA-A-TGG-T--TGTT--T--C--TC---G---G--------G-GG-T-G--AC-AA---T---TC-T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATT
gi|77576                      :   cggCTAACGCC-TC-G-G--T-TAA--A-A-TGG-T--T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----TAC-T-----G-T--A-A-C----C-A-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATCT
gi|77578                      :   cggCTACTGCC-TC-A-G--T-CAA-CA-A-TGG-T--T--T--T--T--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAT-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----T----TT-TT-G-CT-G-T-C--A-T-TAATT
gi|77581                      :   cggCTAACGCC-TC-G-G--T-CAAACA-A---G-T--T--T--T--C--AA---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C--------C----TC-TT-G-CA-G-G-C--A-T-TATCT
gi|77579                      :   cggCTAACGCCGTC-GTG--T-CAA-CA-A-TGG-T--T--T--T--CC-TC---G---G--------G-G--TAG--AC-GAACTT---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-CG-A-T-TATT
gi|77580                      :   cggCTTACGCC-TC-G----T-CAA-CA-A-TGG-T--T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CACTT-----G-T--A-G-A----C-C-T----C----TC--T-G-CA-G-T-C----T-TATT
gi|77605                      :   cggCTAACGCC-TC-G-G--T-CAA-CA-A-TCG-T--T--T--T--CG-TC---G---GC-------G-G--T-GATAC-AA---T---T--T--CA----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TTCG-CA-T-C-A--A-T-TATTT
gi|77583                      :    ggCTAACGC--TC-G-G--T-CAA-CA-A-TGG-T--T--T--T--C--TC---G---G--------G-T--G-G--AC-AA---T---TA-T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-T
gi|77585                      :   cggCTAACACC-TC-A----T-CAA-CA-C-TGG-T--T--T--TT-C--TT---C---G--------G-G--T-G--AC-CA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----A-C-T----C----TC-TT-G-C--G-T-C--A-T-TATTTgagtcatgtat
gi|77607                      :   cggCTTACGCC-TC-G-G--T--GA-CA-A-TGT-T--T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--A--AA---T---T--T--T-----CAA-T-----G-T--GTA-C----C-C-T----C----AA-CT-A-CA-T-G-C--A-A-TATTT
gi|77606                      :    ggCTAA-GCC-TT-G-G--T-TGA-CA-A-TGT-T--T--T--T--C--TC---G---A--------G-G--T-A--GA-AA---C---T--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----T
gi|77614                      :    ggCTTATGCC-TC-G-G--T-CAA-AC-A-TGG-TTTT--T--T--C--TC---G---GACTATCGAG-G--T-G--AC-AA---T---T--C--C-----CCA-T-----A-TTAG-A-C----C-C-T----C----TC-GT-G-CA-
gi|77575                      :       TAACGCC-TT-G-G--T-CAA-CA-A-TGG-T--T--T--T--C--TC---G---G--------A-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--ACT-TAT
gi|77584                      :   cggtTAACGCC-TC-G-A--T-CAA-CA-A-TGGTT--T--T--T--C--TC---G---G--------G-GT-T-G--AC-AA---T---G--T--T-----CACGT-----G-T--A-A-C----T-C-T----C----TCTTT-GCCA-G-T-C--A-T-TATTT
gi|77615                      :   cggctAACGCC-TC-G-G--T-CAA-CA-A-TGG-T--T--T--T--C--TT---A---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATTT
gi|77616                      :        AACGCC-TC-G-G--T-CAA-AG-A-TGA-T--T--T--T--C--TC---G---G--------G-A--T-A--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATTT
gi|77591                      :        AACGCC-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TGT-T--T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---G--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----AA-CT-A-CA-T-G-C--A-A-TATT
gi|77589                      :     cggcACGCC-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TTG-T--T--T--TTTC--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAC-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----AA-CT-A-CA-T-G-C--A-A-TATTTat
gi|77610                      :    cggctACGCC-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TGG-T--T--T--T--C--TC---A---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----
gi|77593                      :      gctACGCC-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TGT-T--T--T--T--C--TC---G---G--------G-A--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----AA-CT-A-CA-T-G-C--A-A-TATTT
gi|77592                      :    cggctACGCC-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TGT-T--T--T--T--T--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----AA-CT-A-CA-T-G-C--A-A-TATTT
gi|77588                      :    cggctACGCC-TC-G----T-TGA-CA-A-TGT-T--T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAC-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----
gi|77596                      :    cggctACGCC-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TGG-T--T--T--T--C--GA---G---G--------G-G--T-G--A--AA---T---T--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----AA-CT-A-CA-T-G-C--A-A-TATTTaacgtcatgcaatatttat
gi|77608                      :    cggctACGTT-TT-G-G--T-TGA-CA-A-TGC-T--T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----attt
gi|77590                      :     ggctACGCC-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TGT-T--T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--------CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----
gi|77595                      :    cggctACGCC-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TGT-T--T--T--T--C--TC---G---G--------G-GA-T-G--AA-AA---T---T--T--G-----CAC-T-----G-T--T-A-C----T-C-T----C----
gi|77611                      :    cggctACGCT-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TGT-T--T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-TA---T---T--T--T-----CGA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----AA-CT-A-CA-T-G-C--A-A-TATTT
gi|77598                      :      gctACGCC-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TG--T--T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-CA---T---T--T--T-----CACGT-----G-T--T-A-C----C-
gi|77597                      :    cggctACGCC-CG-G-T--T-GAA-CA-A-TGT-T--T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--A--AA---T---T--T--T-----TAC-T-----G-T--T-A------C-C-T----C----TC-
gi|77618                      :    cggctACGCC-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TGC-T--T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-GA-AT-AAAT-T---T--T--C-----CA--T-----GTT--T-A-C----C-C-T----C----CC-CT-
gi|77609                      :         ACGCC-TCCG-G--T-TGA-CA-A-TG--T--T--T--T--C--TC---G---GC-------G-G--T-G--A--AA---T---T--T--C-----AAG-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----
gi|77622                      :       ggctGCC-TC-G-G--T-CAA-CA-AATGG-T--T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--TC-C-----CAC-T-----G-T----A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-G-C--A-T-TATT
gi|77623                      :           GTC-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TGT-T--T--T--T--C--TC---G---T--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAA-T-----T-T--T-A-C----C-C-T----C----AA-CT-A-CA-T-G-C--A-A-TATTT
gi|77621                      :           GCC-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TAT-T--T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-TA---C---T--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----A-C-T----C----
gi|77620                      :          cGCC-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TAT-T--T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-TA---C---T--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----A-C-T----C----
gi|77599                      :          cGCC-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TGT-T--T--T--TTTC--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CA
gi|77602                      :   cggctacgGCC-AC-G-G--A-CAA-CA-A-TGG-T--T--T--TT-C--AC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---C---T--T--CATGATCACAT-----G-T--T-A-C----C-C-
gi|77617                      :     cagctgcCC-TC-G-G--T-CAA-CA-A-TGG-T--T--T--T--C--TC---G---A--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-T--A-T-TATTT
gi|77624                      :         acaCC-TC-G-GCTT-CCA-CA-A-TGG-T--T--T-----C--TC---A---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----A-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-
gi|77586                      :             C-TC-G-G--TTCAA-TA-A-CGG-T--T--T--T--C--TC---G---G--------A-G--T-G--AC-AAA--TG--T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-A-T----C----TC-TT-G-CA-A-C-C--A-C-TATTT
gi|77625                      : cggctaaacgttC-TC-G-A--T--AA-CG-A-TGT-T--T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--------CAC-T-----G-TA-A-A-C----T-CAT----C----TC-TT---CA---G-T--A-T-TATTT
gi|77626                      :             C-TC-A-G--T-TGA-CA-A-TGG-T--T--T--T--C--TT---G---G--------G-T--T-G--AC-AG----------T--C-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----AC-TT-G-CA-
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gi|77630                      :                 -G-A--T-CAA-CA-A-TGG-T--T--T--T--C--AA---C---G--------G-G--T-G--AC-TA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-T----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-G-C--A-T-TATTT
gi|77633                      :                 -G-G--T-CAA-CA-A-TGG-T--T--T--T--C--AA---G---A--------G-G--T-G--AC-TA---T---T--T--C-----TAC-C-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-A-CA-G-G-T--A-T-TATTT
gi|77631                      :                 -G-G--T-CAA-CA-A-TGG-T--T--T--T--C--AA---G---T--------G-G--T-T--AC-TA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-C----C----TC-TT-G-CA-G-G-C--A-T-TGTTT
gi|77634                      :                 -G-G--T-CAA-CA-A-TG--T--T--T--T--C---A---G---G--------G-G--T----AC-TA---T---T--T--C-----CAC-T-------T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-G-C--A-T-TATTT
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gi|77636                      :                 -G-G--T-CAATCA-A-TGGAT--T--T--T--C--AA---G---G--------G-G--T-G--AC-TA---T---T--T--C-----CA--T-----G-T--A-A-C----C-C------C----TC-TT-G-CA-G-A-C--A-T-TACTT
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gi|77629                      :                c-G-G--T-CAA-CA---TGG-T--T--T--T--CAATT---G---G--------G-T--G-G--AC-TA---T---T--TT-C-----CAC-T-----G-T--A-G-A----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATTT
gi|77635                      :                 -G-G--T-CAG-CACA-TGG-T--T--T--T--C---CAAGG---G--------G-G--T-G--AT-TA---T---T--T--C-----AGC-------G-T--A-A-A----C-C-T----C----TC-TT-G-CG-G-G-C--ATT-TATT
gi|77638                      :                 -G-G--T-TGA-CA-A-TGG-T--T--T--T--T--TC---GAG-G--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----AA-CT-A-TA-T-G-C--A-A-TATTT
gi|77641                      :                 -G-G--T-TGA-CA-A-TGG-T--T--T--T-----TC---GAAGG--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAT-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----attt
gi|77640                      :                 -G-G--T-TGA-CA-A-TGC-T--T--T--T--C--TC-------G--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----CA---AC-T----CA-T-G-C--A-A-TATTT
gi|77637                      :                 -G-G--T-TGA-CA-A-TGA-T--T--T--T--C--GA---G---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--------CAC-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----CAACGTC-AT-G-CA-A-T-A--T-T-TATTTat
gi|77601                      :                 -G-G--T-TGA-CA-A-TGT-T--C--TATT--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---C--A--T-----CAC-T-----G-T--T-A-C----C-C-TCAAAC----TCATT-G-CA-
gi|77644                      :      cggctacacctcc-G--T-CAA-AA-A-TGG-T--T--T--T--C--TC---A---A--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-TGTACAG-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATTT
gi|77645                      :                   -G--T-CAG-CA-A-TGG-T--T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---G--T--C-----CAC-T-----G-C--A-A-C----C-C-T----C----TT-TT-G-CA-T-G-C--A-T-AATTT
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gi|77604                      :                   -G--T-TAA-CA-A-TG--T--T--T--T--C---A---A---G--------G-G--T-G--AT-A----T---T--T--C-----CACCT-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA---G-C--A-T-TACT
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gi|77646                      :                     --T-TAA-AA-A-TG-----T--T--T--T--TCAAAG---G--------G-G--T-G--AC-AT---T---T--C--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TT-TG-G-CA-G-G-CATA-T-TATT
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gi|77648                      :                                    G-T--T--T--T--C--AA---G---G--------T-G--T-G--AC-TA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----T-A-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATTT
gi|77650                      :                                                       ---G---G--------G-G--T-G--AC-TA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-CCTGGC-C-T----C----TC-TT-G-CA-T-G-C--A-T-TATTT
gi|77651                      :                                                           ---G--------G-G--T-G--AC-TA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-C-CA-T-G-C----T-TATTT
gi|77652                      :                                                               --------G-G--T-G--ACTAA---T---T--TTTC-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-GCC--A-TCTATT
3 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|77594 ): CGGCTACGCCTCGGTTCACAATGATTTTCTTGGGTTGAAAATTTTCATTGTTACCCTCAACTGCATGCAATATTT
Unaligned ( gi|77619 ): CGCCTCGGTGGACAATGTTTTTCTGGGGATGAAAATTTTCAATGTTACCCTCAACTTCATGCAGTATTTAT
Unaligned ( gi|77612 ): GCTACGCCTCGGTTGATAATGTTTTTCTTGTGGTGAAAATGTTCATTGTTACCCTCAACTACATGCAATATTT






Alignments
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lowQualScore                  :                         . .  . . .. .   .  . .  ... . .. .. .. ..  ... ... ........ . .. . .. ..  ... ... .. ........   . ..... . .... . .... . . .... ....  .  . .  ..... .. . .     
lowQualScore                  :                         7 7  2 5 77 5   6  5 5  888 5 44 77 99 11  888 111 88888888 5 77 5 22 99  000 444 77 88888888   5 99999 5 9999 5 1111 5 5 1111 1111  8  2 6  11111 66 3 7     
consensus                     :                  CTAACGC-C-TC-G-G--T-CGA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-G-C--A-T-TATTT
Reference ( family-310 )      :                  CTAACGC-C-TC-G-G--T-CGA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-G-C--A-T-TATTT
gi|77572                      :                  CTAACAC-C-TC-G-G--T-CAA-CA-A-TGG--TGT--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---TCTT--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATTT
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gi|77574                      :               cggCTAACAC-C-TC-G-G--T-CAA-CA-A-TGG--T-TGTT--T--C--TC---G---G--------G-GG-T-G--AC-AA---T---TC-T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATT
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gi|77576                      :              cggtCTAACGC-C-TC-G-G--T-TAA--A-A-TGG--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----TAC-T-----G-T--A-A-C----C-A-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATCT
gi|77577                      :               cggCTAAAGC-C-TC-G-G--T-CTA-CA-A-TGA--T-T--T--T--C--TT---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G----A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATTT
gi|77578                      :               cggCTACTGC-C-TC-A-G--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--T--T--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAT-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----T----TT-TT-G-CT-G-T-C--A-T-TAATT
gi|77579                      :               cggCTAACGC-CGTC-GTG--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--T--CC-TC---G---G--------G-G--TAG--AC-GAACTT---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-CG-A-T-TATT
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gi|77581                      :               cggCTAACGC-C-TC-G-G--T-CAAACA-A---G--T-T--T--T--C--AA---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C--------C----TC-TT-G-CA-G-G-C--A-T-TATCT
gi|77582                      :                  cggACGC-T-T--G-G--T-TGA-CA-A-TGT--T-T--T--TT-C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-
gi|77583                      :             cggctCTAACGC---TC-G-G--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-T--G-G--AC-AA---T---TA-T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-T
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gi|77598                      :                cggctACGC-C-TC-G-G--T-TGA-CA-A-T-G--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-CA---T---T--T--T-----CACGT-----G-T--T-A-C----C-
gi|77599                      :                  cggctGC-C-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TGT--T-T--T--TTTC--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CA
gi|77600                      :             cggctacgACGC---TC-G-T--T-TGA-CA-A-TGT--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---G--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----AA-CT-A-CA-T-G-C--A-A-TATTT
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gi|77602                      :                 cggctCGC-C-AC-G-G--A-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--TT-C--AC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---C---T--T--CATGATCACAT-----G-T--T-A-C----C-C-
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consensus                     :                  CTAACGC-C-TC-G-G--T-CGA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-G-C--A-T-TATTT
Reference ( family-310 )      :                  CTAACGC-C-TC-G-G--T-CGA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-G-C--A-T-TATTT
gi|77572                      :                  CTAACAC-C-TC-G-G--T-CAA-CA-A-TGG--TGT--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---TCTT--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATTT
gi|77573                      :               cggCTAACAC-C-TC-G-G--T-CAA-CA-A-TGG--T-TGTT--T--C--TC---G---G--------G-GGGT-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TAT
gi|77574                      :               cggCTAACAC-C-TC-G-G--T-CAA-CA-A-TGG--T-TGTT--T--C--TC---G---G--------G-GG-T-G--AC-AA---T---TC-T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATT
gi|77575                      :                cggTAACGC-C-TT-G-G--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--TC---G---G--------A-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--ACT-TAT
gi|77576                      :              cggtCTAACGC-C-TC-G-G--T-TAA--A-A-TGG--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----TAC-T-----G-T--A-A-C----C-A-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATCT
gi|77577                      :               cggCTAAAGC-C-TC-G-G--T-CTA-CA-A-TGA--T-T--T--T--C--TT---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G----A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATTT
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gi|77579                      :               cggCTAACGC-CGTC-GTG--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--T--CC-TC---G---G--------G-G--TAG--AC-GAACTT---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-CG-A-T-TATT
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gi|77582                      :                  cggACGC-T-T--G-G--T-TGA-CA-A-TGT--T-T--T--TT-C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-
gi|77583                      :             cggctCTAACGC---TC-G-G--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-T--G-G--AC-AA---T---TA-T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-T
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gi|77598                      :                cggctACGC-C-TC-G-G--T-TGA-CA-A-T-G--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-CA---T---T--T--T-----CACGT-----G-T--T-A-C----C-
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gi|77604                      :                              ga-G--T-TAA-CA-A-TG---T-T--T--T--C---A---A---G--------G-G--T-G--AT-A----T---T--T--C-----CACCT-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA---G-C--A-T-TACT
gi|77605                      : ggcgtaagccgcggagaCTAACGC-C-TC-G-G--T-CAA-CA-A-TCG--T-T--T--T--CG-TC---G---GC-------G-G--T-GATAC-AA---T---T--T--CA----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TTCG-CA-T-C-A--A-T-TATTT
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gi|77607                      :                ggCTTACGC-C-TC-G-G--T--GA-CA-A-TGT--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--A--AA---T---T--T--T-----CAA-T-----G-T--GTA-C----C-C-T----C----AA-CT-A-CA-T-G-C--A-A-TATTT
gi|77608                      :                   ggACGT-T-TT-G-G--T-TGA-CA-A-TGC--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----
gi|77609                      :                 ggctACGC-C-TCCG-G--T-TGA-CA-A-T-G--T-T--T--T--C--TC---G---GC-------G-G--T-G--A--AA---T---T--T--C-----AAG-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----
gi|77610                      :                 ggctACGC-C-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--TC---A---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----
gi|77611                      :                  gctACGC-T-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TGT--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-TA---T---T--T--T-----CGA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----AA-CT-A-CA-T-G-C--A-A-TATTT
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gi|77615                      :                    AACGC-C-TC-G-G--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--TT---A---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATTT
gi|77616                      :                    AACGC-C-TC-G-G--T-CAA-AG-A-TGA--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-A--T-A--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATTT
gi|77617                      :                     ACAC-C-TC-G-G--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--TC---G---A--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-T--A-T-TATTT
gi|77618                      :                     ACGC-C-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TGC--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-GA-AT-AAAT-T---T--T--C-----CA--T-----GTT--T-A-C----C-C-T----C----CC-CT-
gi|77619                      :                      CGC-C-TC-G-G--T-GGA-CA-A-TGT--T-T--T--T--C--TG---G---G--------G-A--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----CA---AC-TT---CA-T-G-C--A-G-TATTT
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gi|77621                      :                      CGC-C-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TAT--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-TA---C---T--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----A-C-T----C----
gi|77622                      :                       GC-C-TC-G-G--T-CAA-CA-AATGG--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--TC-C-----CAC-T-----G-T----A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-G-C--A-T-TATT
gi|77623                      :                       GT-C-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TGT--T-T--T--T--C--TC---G---T--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAA-T-----T-T--T-A-C----C-C-T----C----AA-CT-A-CA-T-G-C--A-A-TATTT
gi|77624                      :                        C-C-TC-G-GCTT-CCA-CA-A-TGG--T-T--T-----C--TC---A---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----A-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-
gi|77625                      :                         -C-TC-G-A--T--AA-CG-A-TGT--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--------CAC-T-----G-TA-A-A-C----T-CAT----C----TC-TT---CA---G-T--A-T-TATTT
gi|77626                      :                         -C-TC-A-G--T-TGA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--TT---G---G--------G-T--T-G--AC-AG----------T--C-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----AC-TT-G-CA-
gi|77627                      :                             C-G-A--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T---------C---AA--G--------G-G--T-G--AC-TA---T---T--T--C-----CAC-TTG---G-T--A-AAC----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-A-C--A-C-TATT
gi|77628                      :                              -G-G--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--T--CAATT---G---G--------G----T-G--AC-TA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-G-A----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-GTC-C--A-T-TATTT
gi|77629                      :                              -G-G--T-CAA-CA---TGG--T-T--T--T--CAATT---G---G--------G-T--G-G--AC-TA---T---T--TT-C-----CAC-T-----G-T--A-G-A----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATTT
gi|77630                      :                              -G-A--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--AA---C---G--------G-G--T-G--AC-TA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-T----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-G-C--A-T-TATTT
gi|77631                      :                              -G-G--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--AA---G---T--------G-G--T-T--AC-TA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-C----C----TC-TT-G-CA-G-G-C--A-T-TGTTT
gi|77632                      :                              -G-G--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T-----C--AA---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-G-C--A---TATTT
gi|77633                      :                              -G-G--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--AA---G---A--------G-G--T-G--AC-TA---T---T--T--C-----TAC-C-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-A-CA-G-G-T--A-T-TATTT
gi|77634                      :                              -G-G--T-CAA-CA-A-TG---T-T--T--T--C---A---G---G--------G-G--T----AC-TA---T---T--T--C-----CAC-T-------T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-G-C--A-T-TATTT
gi|77635                      :                              -G-G--T-CAG-CACA-TGG--T-T--T--T--C---CAAGG---G--------G-G--T-G--AT-TA---T---T--T--C-----AGC-------G-T--A-A-A----C-C-T----C----TC-TT-G-CG-G-G-C--ATT-TATT
gi|77636                      :                              -G-G--T-CAATCA-A-TGGA-T-T--T--T--C--AA---G---G--------G-G--T-G--AC-TA---T---T--T--C-----CA--T-----G-T--A-A-C----C-C------C----TC-TT-G-CA-G-A-C--A-T-TACTT
gi|77637                      :                              -G-G--T-TGA-CA-A-TGA--T-T--T--T--C--GA---G---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--------CAC-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----CAACGTC-AT-G-CA-A-T-A--T-T-TATTT
gi|77638                      :                              -G-G--T-TGA-CA-A-TGG--T-T--T--T--T--TC---GAG-G--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----AA-CT-A-TA-T-G-C--A-A-TATTT
gi|77639                      :                                        A-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--AA---G---G--------GCG--T-G--AC-TG---T---T--T--A-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CATG-G-C--A-T-TATTattt
gi|77640                      :                          ggta-G-G--T-TGA-CA-A-TGC--T-T--T--T--C--TC-------G--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----CA---AC-T----CA-T-G-C--A-A-TATTT
gi|77641                      :                              -G-G--T-TGA-CA-A-TGG--T-T--T--T-----TC---GAAGG--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAT-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----at
gi|77642                      :                                -G--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--T--CAATT----------------G-G--T-G--AC-TA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-G-A----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-GTC-C--A-T-TATTT
gi|77643                      :                                -G--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--AA---G---G--------G-G--T-G--AC-A--------T--T--C-----CAC-------G-T--A-A-C----CGC-T----C----TC-TT-G-CA---G-C--A-T-TATTT
gi|77644                      :                                -G--T-CAA-AA-A-TGG--T-T--T--T--C--TC---A---A--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-TGTACAG-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATTT
gi|77645                      :                                -G--T-CAG-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---G--T--C-----CAC-T-----G-C--A-A-C----C-C-T----C----TT-TT-G-CA-T-G-C--A-T-AATTT
gi|77646                      :                                           A-A-TG-----T--T--T--T--TCAAAG---G--------G-G--T-G--AC-AT---T---T--C--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TT-TG-G-CA-G-G-CATA-T-TATT
gi|77647                      :                             ttaaa--T-CAA-CA-T-TGG--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----TAC-T-----G-A--A-A-C----C-T-T----C----TC-AT-G-CA-G-T-C--A-T-TATTT
gi|77648                      :                                                 G--T-T--T--T--C--AA---G---G--------T-G--T-G--AC-TA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----T-A-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATTT
gi|77649                      :                                                 G--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-GG-T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-TA-A-A-C----C-C-T----C----TCTTT-G-CA-GTC-C--A-T-TATTT
gi|77650                      :                                                                    ---G---G--------G-G--T-G--AC-TA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-CCTGGC-C-T----C----TC-TT-G-CA-T-G-C--A-T-TATTT
gi|77651                      :                                                                        ---G--------G-G--T-G--AC-TA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-C-CA-T-G-C----T-TATTT
gi|77652                      :                                                                            --------G-G--T-G--ACTAA---T---T--TTTC-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-GCC--A-TCTATT


blockSeqs                     :                              C          A       GTT   GT    TT AA  AAG AAG ACTATCGA   GG   AT CT  ACT TAA C  CATGAT     T GTACA   TAG    CTGG     CAAA AACG  T  G    GTC   AT C
blockSeqs                     :                              C          A       GT    GT    TT AA  AAA AG  C          G    A  C   AT  G   A  TTC        G TG      GT     .        .    A     A  C    TGG   G  T
blockSeqs                     :                              .          T       GA    .     T  AA  .   A   C          T    .  C   A   .   .  CA         G .       AA     .        .    A     T  .    GTC   .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     T  C   .   .   .          A    .  C   .   .   .  CC         A .       AA     .        .    .     .  .    GTC   .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     T  G   .   .   .          G    .  C   .   .   .  TC         C .       A      .        .    .     .  .    GGC   .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  C          . .       A      .        .    .     .  .    GT    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  C          . .       A      .        .    .     .  .    GT    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       A     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  C          . .       A      .        .    .     .  .    GT    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  C          . .       A      .        .    .     .  .    GT    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  C          . .       A      .        .    .     .  .    GT    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  A   .   .   .  C          . .       A      .        .    .     .  .    GT    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  C          . .       A      .        .    .     .  .    GT    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       T     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  C          . .       A      .        .    .     .  .    GT    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  C          . .       T      .        .    .     .  .    GG    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  T          . .       A      .        .    .     .  .    GT    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  C          . .       A      .        .    .     .  .    GT    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  A   .   .   .  T          . .       A      .        .    .     .  .    AC    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       T     .     .  .   .   .   .          .    .  A   .   .   .  C          . .       A      .        .    .     .  .    GA    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  A   .   .   .  C          . .       T      .        .    .     .  .    TG    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       T     .     .  .   .   .   .          .    .  A   .   .   .  T          . .       T      .        .    .     .  .    TG    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       T     .     .  .   .   .   .          .    .  A   .   .   .  T          . .       T      .        .    .     .  .    TG    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       T     .     .  .   .   .   .          .    .  A   .   .   .  T          . .       T      .        .    .     .  .    TG    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       T     .     .  .   .   .   .          .    .  A   .   .   .  T          . .       T      .        .    .     .  .    TG    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       A     .     .  .   .   .   .          .    .  A   .   .   .  T          . .       T      .        .    .     .  .    TG    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       T     .     .  .   .   .   .          .    .  A   .   .   .  T          . .       T      .        .    .     .  .    TG    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  A   .   .   .  G          . .       T      .        .    .     .  .    GT    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       T     .     .  .   .   .   .          .    .  A   .   .   .  T          . .       T      .        .    .     .  .    TC    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  A   .   .   .  T          . .       T      .        .    .     .  .    TG    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       T     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  T          . .       T      .        .    .     .  .    TG    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       T     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  T          . .       T      .        .    .     .  .    TG    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       T     .     .  .   .   .   .          .    .  T   .   .   .  T          . .       T      .        .    .     .  .    GG    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  T          . .       T      .        .    .     .  .    GT    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  A   .   .   .  C          . .       A      .        .    .     .  .    GT    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  A   .   .   .  C          . .       A      .        .    .     .  .    GT    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       T     .     .  .   .   .   .          .    .  A   .   .   .  T          . .       A      .        .    .     .  .    TG    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       T     .     .  .   .   .   .          .    .  A   .   .   .  T          . .       T      .        .    .     .  .    GG    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       C     .     .  .   .   .   .          .    .  A   .   .   .  T          . .       T      .        .    .     .  .    TG    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  C          . .       T      .        .    .     .  .    GA    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  T          . .       T      .        .    .     .  .    GT    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       T     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  T          . .       T      .        .    .     .  .    GG    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       T     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  T          . .       T      .        .    .     .  .    GG    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  C          . .       A      .        .    .     .  .    GG    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  T   .   .   .  C          . .       A      .        .    .     .  .    GG    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       A     .     .  .   .   .   .          .    .  A   .   .   .  C          . .       A      .        .    .     .  .    GG    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  A   .   .   .  C          . .       A      .        .    .     .  .    GG    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       C     .     .  .   .   .   .          .    .  A   .   .   .  C          . .       T      .        .    .     .  .    GA    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       T     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  C          . .       T      .        .    .     .  .    AT    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       T     .     .  .   .   .   .          .    .  A   .   .   .  T          . .       T      .        .    .     .  .    TG    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       T     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  T          . .       T      .        .    .     .  .    TG    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  T          . .       T      .        .    .     .  .    GT    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       T     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  T          . .       A      .        .    .     .  .    TG    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  C          . .       T      .        .    .     .  .    GG    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       T     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  C          . .       A      .        .    .     .  .    GT    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  C          . .       A      .        .    .     .  .    GT    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  C          . .       A      .        .    .     .  .    TG    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  C          . .       A      .        .    .     .  .    TG    .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  C          . .       A      .        .    .     .  .    G     .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  C          . .       A      .        .    .     .  .    G     .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  C          . .       A      .        .    .     .  .    G     .  .
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  T   .   .   .  C          . .       A      .        .    .     .  .              
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  C          . .       A      .        .    .     .  .              
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  A   .   .   .  C          . .       A      .        .    .     .  .              
blockSeqs                     :                              .          .       A     .     .  .   .   .   .          .    .  A   .   .   .  T          . .       T      .        .    .     .  .              
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  A          . .       T      .        .    .     .  .              
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  A   .   .   .  T          . .       A      .        .    .     .                 
blockSeqs                     :                              .          .       C     .     .  .   .   .   .          .    .  A   .   .   .  T          . .       T      .        .    .     .                 
blockSeqs                     :                              .          .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  C          . .       T      .        .    .                       
blockSeqs                     :                                         .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  C          . .       A      .        .    .                       
blockSeqs                     :                                         .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  C          . .       A      .        .    .                       
blockSeqs                     :                                         .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  A   .   .   .  C          . .       A      .        .    .                       
blockSeqs                     :                                         .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  C          . .       A      .        .    .                       
blockSeqs                     :                                         .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  C          . .       A      .        .    .                       
blockSeqs                     :                                         .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  C          . .       A      .        .    .                       
blockSeqs                     :                                         .       G     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  C          . .       A      .        .    .                       
blockSeqs                     :                                                 .     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  C          . .       A      .        .    .                       
blockSeqs                     :                                                 .     .     .  .   .   .   .          .    .  C   .   .   .  C          . .       A      .        .    .                       
blockSeqs                     :                                                 .     .     .  .   .   .   .          .    .  .   .   .   .  .          . .       A      .                                     
blockSeqs                     :                                                                    .   .   .          .    .  .   .   .   .  .          . .       .      .                                     
blockSeqs                     :                                                                        .   .          .    .  .   .   .   .  .          . .       .      .                                     
blockSeqs                     :                                                                            .          .    .  .   .   .   .  .                                                                 


blockSeqCons                  :                                                                                                           **
originalCons                  :                  CTAACGC-C-TC-G-G--T-CGA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-G-C--A-T-TATTT
finalCons                     :                  CTAACGC-C-TC-G-G--T-CGA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-G-C--A-T-TATTT





Alignments
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lowQualScore                  :                         . .  . . .. .   .  . .  ... . .. .. .. ..  ... ... ........ . .. . .. ..  ... ... .. ........   . ..... . .... . .... . . .... ....  .  . .  ..... .. . .     
lowQualScore                  :                         7 7  2 5 77 5   6  5 5  888 5 44 77 99 11  888 111 88888888 5 77 5 22 99  000 444 77 88888888   5 99999 5 9999 5 1111 5 5 1111 1111  8  2 6  11111 66 3 7     
consensus                     :                  CTAACGC-C-TC-G-G--T-CGA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-G-C--A-T-TATTT
Reference ( family-310 )      :                  CTAACGC-C-TC-G-G--T-CGA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-G-C--A-T-TATTT
gi|77572                      :                  CTAACAC-C-TC-G-G--T-CAA-CA-A-TGG--TGT--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---TCTT--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATTT
gi|77573                      :               cggCTAACAC-C-TC-G-G--T-CAA-CA-A-TGG--T-TGTT--T--C--TC---G---G--------G-GGGT-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TAT
gi|77574                      :               cggCTAACAC-C-TC-G-G--T-CAA-CA-A-TGG--T-TGTT--T--C--TC---G---G--------G-GG-T-G--AC-AA---T---TC-T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATT
gi|77575                      :                cggTAACGC-C-TT-G-G--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--TC---G---G--------A-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--ACT-TAT
gi|77576                      :              cggtCTAACGC-C-TC-G-G--T-TAA--A-A-TGG--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----TAC-T-----G-T--A-A-C----C-A-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATCT
gi|77577                      :               cggCTAAAGC-C-TC-G-G--T-CTA-CA-A-TGA--T-T--T--T--C--TT---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G----A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATTT
gi|77578                      :               cggCTACTGC-C-TC-A-G--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--T--T--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAT-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----T----TT-TT-G-CT-G-T-C--A-T-TAATT
gi|77579                      :               cggCTAACGC-CGTC-GTG--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--T--CC-TC---G---G--------G-G--TAG--AC-GAACTT---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-CG-A-T-TATT
gi|77580                      :               cggCTTACGC-C-TC-G----T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CACTT-----G-T--A-G-A----C-C-T----C----TC--T-G-CA-G-T-C----T-TATT
gi|77581                      :               cggCTAACGC-C-TC-G-G--T-CAAACA-A---G--T-T--T--T--C--AA---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C--------C----TC-TT-G-CA-G-G-C--A-T-TATCT
gi|77582                      :                  cggACGC-T-T--G-G--T-TGA-CA-A-TGT--T-T--T--TT-C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-
gi|77583                      :             cggctCTAACGC---TC-G-G--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-T--G-G--AC-AA---T---TA-T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-T
gi|77584                      :                cggTAACGC-C-TC-G-A--T-CAA-CA-A-TGGT-T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-GT-T-G--AC-AA---T---G--T--T-----CACGT-----G-T--A-A-C----T-C-T----C----TCTTT-GCCA-G-T-C--A-T-TATTTgagtcatgtat
gi|77585                      :             cggctCTAACAC-C-TC-A----T-CAA-CA-C-TGG--T-T--T--TT-C--TT---C---G--------G-G--T-G--AC-CA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----A-C-T----C----TC-TT-G-C--G-T-C--A-T-TATTT
gi|77586                      :                 cggAACGTTC-TC-G-G--TTCAA-TA-A-CGG--T-T--T--T--C--TC---G---G--------A-G--T-G--AC-AAA--TG--T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-A-T----C----TC-TT-G-CA-A-C-C--A-C-TATTT
gi|77587                      :                   cggcta-C-TC-G----T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--------CAC-T-------T----A-C----C-C-T----C----TC-TTGG-CA-G-A-C--A-T-TATT
gi|77588                      :             cggctaagACGC-C-TC-G----T-TGA-CA-A-TGT--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAC-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----
gi|77589                      :                cggctACGC-C-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TTG--T-T--T--TTTC--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAC-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----AA-CT-A-CA-T-G-C--A-A-TATTTaacgtcatgcaatatttat
gi|77590                      :                cggctACGC-C-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TGT--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--------CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----
gi|77591                      :               cggctAACGC-C-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TGT--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---G--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----AA-CT-A-CA-T-G-C--A-A-TATT
gi|77592                      :                 cggcACGC-C-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TGT--T-T--T--T--T--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----AA-CT-A-CA-T-G-C--A-A-TATTTat
gi|77593                      :                cggctACGC-C-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TGT--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-A--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----AA-CT-A-CA-T-G-C--A-A-TATTT
gi|77594                      :                cggctACGC-C-TC-G-G--T-TCA-CA-A-TGA--T-T--T--T--C--TT---G---G--------G-T--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAT-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----AA-CT-G-CA-T-G-C--A-A-TATTT
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gi|77596                      :                cggctACGC-C-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--GA---G---G--------G-G--T-G--A--AA---T---T--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----AA-CT-A-CA-T-G-C--A-A-TATTT
gi|77597                      :                cggctACGC-C--C-G-G--T-TGAACA-A-TGT--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--A--AA---T---T--T--T-----TAC-T-----G-T--T-A------C-C-T----C----TC-attt
gi|77598                      :                cggctACGC-C-TC-G-G--T-TGA-CA-A-T-G--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-CA---T---T--T--T-----CACGT-----G-T--T-A-C----C-
gi|77599                      :                  cggctGC-C-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TGT--T-T--T--TTTC--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CA
gi|77600                      :             cggctacgACGC---TC-G-T--T-TGA-CA-A-TGT--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---G--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----AA-CT-A-CA-T-G-C--A-A-TATTT
gi|77601                      :               cggatcACAC-C-TCCG-G--T-TGA-CA-A-TGT--T-C--TATT--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---C--A--T-----CAC-T-----G-T--T-A-C----C-C-TCAAAC----TCATT-G-CA-
gi|77602                      :                 cggctCGC-C-AC-G-G--A-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--TT-C--AC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---C---T--T--CATGATCACAT-----G-T--T-A-C----C-C-
gi|77603                      :            cagctgCTAACGC-C-TC-G-G--T-CAA-CA-T-TGG--T-T--T--T--T--TG---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---TTAAT--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATTT
gi|77604                      :                              ga-G--T-TAA-CA-A-TG---T-T--T--T--C---A---A---G--------G-G--T-G--AT-A----T---T--T--C-----CACCT-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA---G-C--A-T-TACT
gi|77605                      : ggcgtaagccgcggagaCTAACGC-C-TC-G-G--T-CAA-CA-A-TCG--T-T--T--T--CG-TC---G---GC-------G-G--T-GATAC-AA---T---T--T--CA----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TTCG-CA-T-C-A--A-T-TATTT
gi|77606                      :                ggCTAA-GC-C-TT-G-G--T-TGA-CA-A-TGT--T-T--T--T--C--TC---G---A--------G-G--T-A--GA-AA---C---T--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----T
gi|77607                      :                ggCTTACGC-C-TC-G-G--T--GA-CA-A-TGT--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--A--AA---T---T--T--T-----CAA-T-----G-T--GTA-C----C-C-T----C----AA-CT-A-CA-T-G-C--A-A-TATTT
gi|77608                      :                   ggACGT-T-TT-G-G--T-TGA-CA-A-TGC--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----
gi|77609                      :                 ggctACGC-C-TCCG-G--T-TGA-CA-A-T-G--T-T--T--T--C--TC---G---GC-------G-G--T-G--A--AA---T---T--T--C-----AAG-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----
gi|77610                      :                 ggctACGC-C-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--TC---A---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----
gi|77611                      :                  gctACGC-T-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TGT--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-TA---T---T--T--T-----CGA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----AA-CT-A-CA-T-G-C--A-A-TATTT
gi|77612                      :                  gctACGC-C-TC-G-G--T-TGA-TA-A-TGT--T-T--T--T--C--TT---G---T--------G-G--T-G--AA-AA---T---G--T--T-----CAT-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----AA-CT-A-CA-T-G-C--A-A-TATTT
gi|77613                      :               gctCTAATGC-C-TT-G-G--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-G-C--A-T-TATTT
gi|77614                      :                  CTTATGC-C-TC-G-G--T-CAA-AC-A-TGGTTT-T--T--T--C--TC---G---GACTATCGAG-G--T-G--AC-AA---T---T--C--C-----CCA-T-----A-TTAG-A-C----C-C-T----C----TC-GT-G-CA-
gi|77615                      :                    AACGC-C-TC-G-G--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--TT---A---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATTT
gi|77616                      :                    AACGC-C-TC-G-G--T-CAA-AG-A-TGA--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-A--T-A--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATTT
gi|77617                      :                     ACAC-C-TC-G-G--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--TC---G---A--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-T--A-T-TATTT
gi|77618                      :                     ACGC-C-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TGC--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-GA-AT-AAAT-T---T--T--C-----CA--T-----GTT--T-A-C----C-C-T----C----CC-CT-
gi|77619                      :                      CGC-C-TC-G-G--T-GGA-CA-A-TGT--T-T--T--T--C--TG---G---G--------G-A--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----CA---AC-TT---CA-T-G-C--A-G-TATTT
gi|77620                      :                      CGC-C-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TAT--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-TA---C---T--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----A-C-T----C----at
gi|77621                      :                      CGC-C-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TAT--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-TA---C---T--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----A-C-T----C----
gi|77622                      :                       GC-C-TC-G-G--T-CAA-CA-AATGG--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--TC-C-----CAC-T-----G-T----A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-G-C--A-T-TATT
gi|77623                      :                       GT-C-TC-G-G--T-TGA-CA-A-TGT--T-T--T--T--C--TC---G---T--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAA-T-----T-T--T-A-C----C-C-T----C----AA-CT-A-CA-T-G-C--A-A-TATTT
gi|77624                      :                        C-C-TC-G-GCTT-CCA-CA-A-TGG--T-T--T-----C--TC---A---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----A-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-
gi|77625                      :                         -C-TC-G-A--T--AA-CG-A-TGT--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--------CAC-T-----G-TA-A-A-C----T-CAT----C----TC-TT---CA---G-T--A-T-TATTT
gi|77626                      :                         -C-TC-A-G--T-TGA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--TT---G---G--------G-T--T-G--AC-AG----------T--C-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----AC-TT-G-CA-
gi|77627                      :                             C-G-A--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T---------C---AA--G--------G-G--T-G--AC-TA---T---T--T--C-----CAC-TTG---G-T--A-AAC----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-A-C--A-C-TATT
gi|77628                      :                              -G-G--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--T--CAATT---G---G--------G----T-G--AC-TA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-G-A----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-GTC-C--A-T-TATTT
gi|77629                      :                              -G-G--T-CAA-CA---TGG--T-T--T--T--CAATT---G---G--------G-T--G-G--AC-TA---T---T--TT-C-----CAC-T-----G-T--A-G-A----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATTT
gi|77630                      :                              -G-A--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--AA---C---G--------G-G--T-G--AC-TA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-T----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-G-C--A-T-TATTT
gi|77631                      :                              -G-G--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--AA---G---T--------G-G--T-T--AC-TA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-C----C----TC-TT-G-CA-G-G-C--A-T-TGTTT
gi|77632                      :                              -G-G--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T-----C--AA---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-G-C--A---TATTT
gi|77633                      :                              -G-G--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--AA---G---A--------G-G--T-G--AC-TA---T---T--T--C-----TAC-C-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-A-CA-G-G-T--A-T-TATTT
gi|77634                      :                              -G-G--T-CAA-CA-A-TG---T-T--T--T--C---A---G---G--------G-G--T----AC-TA---T---T--T--C-----CAC-T-------T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-G-C--A-T-TATTT
gi|77635                      :                              -G-G--T-CAG-CACA-TGG--T-T--T--T--C---CAAGG---G--------G-G--T-G--AT-TA---T---T--T--C-----AGC-------G-T--A-A-A----C-C-T----C----TC-TT-G-CG-G-G-C--ATT-TATT
gi|77636                      :                              -G-G--T-CAATCA-A-TGGA-T-T--T--T--C--AA---G---G--------G-G--T-G--AC-TA---T---T--T--C-----CA--T-----G-T--A-A-C----C-C------C----TC-TT-G-CA-G-A-C--A-T-TACTT
gi|77637                      :                              -G-G--T-TGA-CA-A-TGA--T-T--T--T--C--GA---G---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--------CAC-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----CAACGTC-AT-G-CA-A-T-A--T-T-TATTT
gi|77638                      :                              -G-G--T-TGA-CA-A-TGG--T-T--T--T--T--TC---GAG-G--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----AA-CT-A-TA-T-G-C--A-A-TATTT
gi|77639                      :                                        A-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--AA---G---G--------GCG--T-G--AC-TG---T---T--T--A-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CATG-G-C--A-T-TATTattt
gi|77640                      :                          ggta-G-G--T-TGA-CA-A-TGC--T-T--T--T--C--TC-------G--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAA-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----CA---AC-T----CA-T-G-C--A-A-TATTT
gi|77641                      :                              -G-G--T-TGA-CA-A-TGG--T-T--T--T-----TC---GAAGG--------G-G--T-G--AA-AA---T---T--T--T-----CAT-T-----G-T--T-A-C----C-C-T----C----at
gi|77642                      :                                -G--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--T--CAATT----------------G-G--T-G--AC-TA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-G-A----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-GTC-C--A-T-TATTT
gi|77643                      :                                -G--T-CAA-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--AA---G---G--------G-G--T-G--AC-A--------T--T--C-----CAC-------G-T--A-A-C----CGC-T----C----TC-TT-G-CA---G-C--A-T-TATTT
gi|77644                      :                                -G--T-CAA-AA-A-TGG--T-T--T--T--C--TC---A---A--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-TGTACAG-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATTT
gi|77645                      :                                -G--T-CAG-CA-A-TGG--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AA-AA---T---G--T--C-----CAC-T-----G-C--A-A-C----C-C-T----C----TT-TT-G-CA-T-G-C--A-T-AATTT
gi|77646                      :                                           A-A-TG-----T--T--T--T--TCAAAG---G--------G-G--T-G--AC-AT---T---T--C--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TT-TG-G-CA-G-G-CATA-T-TATT
gi|77647                      :                             ttaaa--T-CAA-CA-T-TGG--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-G--T-G--AC-AA---T---T--T--C-----TAC-T-----G-A--A-A-C----C-T-T----C----TC-AT-G-CA-G-T-C--A-T-TATTT
gi|77648                      :                                                 G--T-T--T--T--C--AA---G---G--------T-G--T-G--AC-TA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----T-A-T----C----TC-TT-G-CA-G-T-C--A-T-TATTT
gi|77649                      :                                                 G--T-T--T--T--C--TC---G---G--------G-GG-T-G--AC-AA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-TA-A-A-C----C-C-T----C----TCTTT-G-CA-GTC-C--A-T-TATTT
gi|77650                      :                                                                    ---G---G--------G-G--T-G--AC-TA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-CCTGGC-C-T----C----TC-TT-G-CA-T-G-C--A-T-TATTT
gi|77651                      :                                                                        ---G--------G-G--T-G--AC-TA---T---T--T--C-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-C-CA-T-G-C----T-TATTT
gi|77652                      :                                                                            --------G-G--T-G--ACTAA---T---T--TTTC-----CAC-T-----G-T--A-A-C----C-C-T----C----TC-TT-G-CA-G-GCC--A-TCTATT