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2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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gi|78832 : TAAC-GA-G--A-TG-G-----GAA---G----------------------------------------------CTTTC-G--A-T-TG-T-G--A---C-GT-CA--T-A-A-T-G--C-C----G--T---G-A----CG-C-A-----A--A-------A------A------C--------A-----T-------------cat
gi|78833 : TAAC-GA-G--A-TG-G-----G-A---C-C--TTT--C-GAC-T-T-GT-G-A----C-GT-CA-TAA-T--A-aac
gi|78833 : -CTTTC-G--ACT-TG-T-G--A---C-GT-CA--T-A-A-T-AA-C-T----G--T---G-A----CA-C-A-----A--A-------A------A------CATAAT---G-----T-------------C-A---A-G--C-A-T-----A---A-A-CATTTactgtgacacaaaaacataatgtcaagcataaacatttcat
gi|78834 : taacgagatgggacTAAC-GA-G--A-TG-A-----GAA---G-C--TTT--C-GA--T-T-GT-G-A----C-GT-CA----------------------------------------CA--T-T-A-T-G--C-T----G--T---G-A----CG-C-A-----A--AAACAT--A------A------C--------G-----T-------------C-A---A-A--C-A-T-----A---A-T-CATTTcat
gi|78835 : TAAC-GG-G--A-TG-G-----AAA---G-C--TTT--A-GA--T-T-GT-G-A----C-GT-CA-TAA-T--A-CTtcat
gi|78835 : -CTTTA-G--A-T-TG-T-G--A---C-GT-CA--T-A-A-T-A--C-T----G--T---G-A----TG-C-A-----A--A-------A------A------C--------A-----TAACGG--------C-A---A-G--C-A-T-----A---G-A-CATTgtgatgcaaaaacataacggcaagcatagacattgca
gi|78836 : taacgggatggaaagTAAC-GT-G--A-TG-G-----GAA---G-C--TTT--C-TA--T-T-GT-G-A----C-GT-CA-CAA-T--A-C---C-G------TG-T--------C-G--CA--T-A-A---A--C-------------------------------A--T-------A------A------C--------G-----T-------------C-A---A-G--C-A-T-----A---A-A-CATTTgca
gi|78837 : TAAA-GA-G--A-TG-G-----GAA---G-C--TTT--C-GA--T-T-GT-G-A----C-GT-CA-TAA-T--A-CTTTC-G--A-T-TG-T-G--A---C-GT-CA--T-A-A-T-A--C-T----G--T---G-A----TG-C-A-----A--A-------A------A------C--------G-----T-------------C-A---A-G--C-A-T-----A---A-A-CATTTcgt
gi|78838 : TAAA-GA-G--A-TG-G-----AAA---G-C--TTT--C-GA--T-T-GT-G-A----C-AT-TA-TAA-T--A-C------------TG-T-G--A---C-G--CA----A-A-T-A--C-------------------------------A--T-------A------A------C--------G-----T-------------C-A---A-A--C-A-T-----A---A-A-CATT
gi|78839 : TTC-G--A-T-TG-T-G--A---T-GT-CA--T-A-A-T-A--C-T----G--T---G-A----CG-C-A-----A--AAAACAT-A------A------C--------G-----T-------------C-A---A-G--C-A-T-----A---A-A-CATgca
gi|78840 : taacgagatggaacagcaTAAC-AAAG--A-TG-G-----GAA---G-C--TTT--C-GA--T-T-----------------------------------------TG-T-G--A---C-GT-CA--T-A-A-T-G--C-C----G--T---G-A----CG-C-A-----A--A-------AATAT--A------C--------G-----T-------------C-A---A-G--C-A-T-----A---G-A-CATTT
gi|78841 : -CTTTC-G--A-T-TG-T-G--A---C-GT-CA--T-A-A-T-G--C-C----G--T---G-A----CG-C-A-----A--A-------A------A------C--------A-----T-------------cat
gi|78842 : taacgagatggaaagTAAC-AA-G--A-TG-G-----GAA---G-C--TTT--T-GA--T-T-GT-G-A----C-GT-CA-TAA-T--aac
gi|78842 : -CTTTT-G--A-T-TG-T-G--A---C-GT-CA--T-A-A-T-G--C-C-------T---G-A----CG-C-A-----A--AACAT---A------A------C--------G-----T-------------C-A---A-G--C---T-----A---A-A-CATTTgcctgacgcaaaacataacgtcaagctaaacatttcat
gi|78843 : taacaagatgggaagTAACAGA-G--A-TG-G-----GAA---G-C--TTT--C-GA--T-T-GT-G-A----C-GT-CA-TAA-T--G-Ccat
gi|78843 : -CTTTC-G--A-T-TG-T-G--A---C-GT-CA--T-A-A-T-G--C-C----G--T-----A----CG-C-A-----A--A-------A------cgtacgcaaaacataac
gi|78844 : taacagagatgggaagTAAC-GA-G--A-TG-G-----AAA---G-A--TTT--C-GA--T-T-GT-G-A----T-GT-CA-TAA-A--A-C------------TG-T-G--A---C-G--CA----A-A-A-A--C-------------------------------A--T-------A------A------C--------G-----T-------------C-A---A-G--C-A-T-----A---A-cataac
gi|78845 : TAAC-GA-G--A-TG-G-----GAA---G-C--TTT--C-GA--T-T-GT-G-A----C--------AA------------------------------------CA--T-A-A-T-G--C-T----A--T---G-A----CG-C-A-----A--AAGCAT--A------A------C--------G-----C-------------C-A---A-G--C-A-T-----A---A-C-CA
gi|78846 : TAAC-GA-G--A-TG-G-----AAA---G-C--TTG--C-GA--T-------------------A-TA---------------------G-T-T--A---C-GT-TA--T-A-A-T-A--C-T----G--T---G-A----CG-C-A-----A--A-------A------G------CATAAA---G-----T-------------C-A---A-G--C-A-T-----A---A-A-CATTT
gi|78847 : TTTC-G--A-T-TG-T-T--A---C-CG-CA--T-A-A-T-A--C-T----G--T---G-A----CG-C-A-----A--AAACAT--A------A------C--------G-----T-------------C-A---A-G--C-A-T---------A-A-CATTcgt
gi|78848 : taacgagatggaaagTAAC-GA-G--A-TG-G-----GAA---GCC--TTT--C-GA--T-T-GT-G-A----CAGT-CA-CAA-T--G-C------------TG-T-G--A---C-GC-CA--A-A-A------------------------------C-A-----T--A-------T------A------C--------G-----TG------------C-A---A-A--C-A-T-----A---A-T-CATTTgca
gi|78849 : TAAC-GA-G--A-TG-G-----GAA-----C--TTT--C-GA--T-T-G
gi|78849 : --A-CTTTC-G--A-T-TG---G--A---C-GT-CA--T-A-A-T-G--C-C----G--T---G-A----CG-C-A-----A--A-------A------A------C--------gacgtcataatgccgtgacgcaaaaac
gi|78850 : taacgagatgggaTAAT-GA-G--A-TG-G-----AAA---G-C--TTT--C-GA--T-T-GT-G-A----C-AC-CC-TAA------------A--A-T-TG-T-G--A---C-A--CA--C-A-A-A-A--A-C----A--T--------------------------------A------A------C--------G-----T-------------C-A---A-G--C-A-T-----G---A-A-CAT
gi|78851 : TAAT-GA-G--A-TG-GC----AAA---G-C--TT---C-GA--T-T-GT-G-A----C-AC-C--TAA-A--A---TTC---------G-T-G--A---C----------------A--C---------------A----CA-C-A-----AC-AT------A------A------C--------G-----T-------------C-A---A-G--C-A-T-----G---A-gtcgt
gi|78852 : TAAC-GT-G--A-TG-G-----GAA---G-C--TTT-------------------------------------A-CT-------A-T-TG-T-G--A---C-GT-CA--C-A-A-T-A--C-C----G--T-----A----CG-C-A-----A--AAACAT--A------A------C--------G-----T-------------C-A---A-G--C-ATT-----ACCCA-A-CATTT
gi|78853 : TTC-G--A-T-TGAT-G--A---C-GT-CA--T-A-A-T-G--C-C----G--T---G-A----CG-C-A-----A--AAATACT-A------A------C--------GTTT--T-------------C-A---A-G--C-G-T-----A---G-A-CATTT
gi|78854 : taacaagataggaagccaTAAC-GA-G--A-TG-A-----AAA---G-C--TTT--T-GA--C-T-GT-G-A----C-A------AA-------------------------------------A--T-A-A-T-A--T-T----G--T---G-A----CA-C-A-----A--A-------A------A------C--------ATAACTT-------------C-A---A-G--C-A-T-----G---A-A-CGTTTcat
gi|78855 : TAAC-AA-G--A-TG-G-----GAA---G-C--TTT--T-GA--T-TCGT-G-A------GT-CA-TAA-T--G-C------------TG-T--------------------------------------T---G-A----CG-CAA-----A--A-------A------A------C--------A-----T-------------A-ACGGA-G--C-A-T-----A---A-ACCATTT
gi|78856 : TAAC-GA-G--A-AG-G-----AAA---G-C--TTT----GA--T-T-GT-A-A----C-GT-CA-Tcat
gi|78856 : TTT-G--A-T-TG-T-A--A---C-GT-CA--T-C-A-T-A--A-C----T--T---G-A----TG-C-A-----A--A-------A------A------CATAAT---G-----T-------------C-A---A-G--C-A-T-----A---A-T-CAATTcataacttgatgcaaaaacataatgtcaagcataatcaattcat
gi|78857 : taacgagaaggaaagcTAAC--A-G--A-TG-G-----GAA---GTC--TTT--C-GA--T-T-GT-G-A----C-GT-CA-TAA-T--cat
gi|78857 : -CTTTC-G--A-T-TG-T-G--A---C-GT-CA--T-A-A-T-G--A-T----A--T---G-A-----G-C-A-----A--A-------A------gatatgagcaaaacataa
gi|78858 : taacagatgggaagtTAACCGA-G--A-TG-G-----GAA---A-G--CTT--C-GA------GT-G----------------------------------T-TG-TTG--A---C-GT-C---T-A-A-T-A--C-T----G--T---G-A----AG-C-A-----A--A-------A------A------CGAAAC---G-----T-------------C-A---A-G--C-A-T-----A---A-A-CATTcataa
gi|78859 : TAAC-GA-G--A-TG-GA----GAA---G-C--TT---C-GA--T-T--T-G-A----C-------------------------------------A---G-GT-CA--T-A-A-T-G--C-C----A--T---G-A----CG-C-A-----A--ATATAT--A------A------C--------G-----T-------------C-A---A-G--C-A-T-----AG--A-A-CATTgca
gi|78860 : TAAC-GA----A-TG-G-----AAA---A-C--TTT--C-GA--T-T-GT-G-A----C-GT-CA-cat
gi|78860 : AA-A--A-CTTTC-G--A-T-TG-T-G--A---C-GT-CA--C-A-A-T-G--C-T----G--CACAG-A----CG-C-A-----ATTA-------ACATAT-A------C--------G-----T-------------C-A---A-G--C-A-T-----A---A-T-CATTTcaatgctgcacagacgcaattaacatatacgtcaagcataatcattt
gi|78861 : taacgaatggTAAC-GA-A--A-TG-G-----AAA---G-C--TTT--T--A--TAT-GT-G-A----C-GT-CA-TAA-T--A-CT----G-------G-T-G--A---C-A--CA--C---A-T-A--C-------------------------------A--T-------A------A------C--------G-----T-------------C-A---G-A--C-A-T-----AG--A-A-CATT
gi|78862 : TAAC-GA-AGCA-TG-GC----AAA---G-C--TTT--C-GA--T-T-GT-G-A----C-GT-CA-TAA-T--A-CTgcat
gi|78862 : -CTTTC-G--A-T-TG-T-G--A---C-GT-CA--T-A-A-T-A--C-T----G--T---G-A----CG-C-A-----A--A-------ACTAC--A------C--------G-----T-------------C-----A-G--C-A-T---------A-A-CATgtgacgcaaaactacacgtcagcataacat
gi|78863 : taacgaagcatggcaaagTAAC-GA-G--A-TG-G-----AAA---G-C--TTT--C-GA--T-T-GT-G-A----C-GT-CA-TA-------------------------------------------A-A-T-G--C-C----G--T---G-A----CGCC-A-----A--A-------A------A------C--------A-----T-------------
gi|78864 : TAAC-AA-G--A-TG-G-----GAT---G-C--TTT--C-GA--T-T-GT-G-T----C-GT-----------------------------------------T-CA--T-A-A-T-G--C-C----G--TG--G-A----CG-C-A-----A--A-------ATATT--A------C--------G-----T-------------C-A---A-G--C-A-TTG---A---G-A-CATCTaa
gi|78865 : TAAC-GT-GC-A-TG-G-----GAA---G-CC-TTT--C-TA--T-T-GT-G-A----C-GT-CA-CAA-T--A-CTc
gi|78865 : -CTTTC-T--A-T-TG-T-G--A---C-GT-CA--C-A-A-T-A--C-T----G--T---G-A----CG-C-A-----A--A-------ACAT---A------C--------G-----T-------------C-A---A-GGTC-G-T-----A---A-gtgacgcaaaacatacgtcaaggtcgtaa
gi|78866 : taacgtgcatgggaagcTTC-T--A-T-TG-T-GGAA---C-GT-CA--C-ATA-T-A--C-C----G--T---G-A----CG-C-A-----A--AAAACAATA------A------C--------G-----T-------------C-A---A-G--C---T-----A---A-A-CATTT
gi|78867 : taacgtgaaatggaaagcTAAC-GA-G--A-TG-G-----GAA---G-C--TTT--C-GA--T-T-GT-G-A----C-G--CACTAA-T--G-C---C-G------TA-C-G--------GG-CA----A-A---A--C-T----A--T------------------------A-------A------A------C--------G-----T-------------T-A---AGG--C-A-T-----A---AGA-CATTT
gi|78868 : TAAC-GG-G--A-TG-G-----GAA---A-C--TTT--C-GA--T-T-GT-G-A----C-GT-CA-TAA-T--A-CTGTC-G--A-
gi|78868 : --A-CTTTC-G--A-T-TG-T-G--A---C-GT-CA--T-A-A-T-A--C-T----G--TC--G-A-----G-C-A-----T--A-------A------A------C--------A-----T-------------gcataaacat
gi|78869 : taacgggatgggaaTAAC-TA-G--A-AG-G-----ATA---G-C--TTT--T-GA--T-T-GT-G-A----C-AT-CA-
gi|78869 : A-T--AGCTTTT-G--A-T-TG-T-G--A---C-AT-CA--A-A-A-T-A--G-A----A--T---G-A----CA-C-A-----C--A-------A------A------CATAAT---G-----T-------------C-A---A-G--C-G-T-----A---A-A-CATaaatagaatgacacacaaacataatgtcaagcgtaaacatgtc
gi|78870 : taactagaaggTAAC-GA-G--A-CT-G-----GAA---T-C--TT---C-GA--T-T-GT-G-ATCATC-AT-TA-TAA-T--A-CTT-----------G-T-G--A---C-GC-AA--T-A---T-A--T-------------------------A-----A--T-------A------A------C--------G-----T-------------C-A---A-G--C-A-T-----A---A-A-CATgtc
gi|78871 : TAAC-GA-G--A-TG-G-----GAA---G-C---TT--C-GAC-T-T-GT-G-A----C-GT-CATTAA-T----------G--G-C-CG-T-G--A---C-GC-CA--A-A-A-A-A--C-
gi|78872 : TAAC-AA-G--A-TG-G-----GCA---G-C--TGT--C-GA--TGT-TT-G-AT---C-GT-CA-TAA-ataac
gi|78873 : -T--A-TTTTG-G--A-T-TT-T-G--A---T-GT-CA--T-C-A-T-A--T-T----G--T---G-A----CG-C-A-----A--A-------A------A------C--------A-----TAACGTCATGCGCGC-A---A-G--T-A-T-----A---A-A-CATctgcacctgacgcaaaaaacataactaagcatcaaaattcat
gi|78874 : taacgagatattgtaaaagcTAAC-AA-T--A-TG-G-----AA------C--TTT--C-GA--T-T-GT-G-A----C-GT-CA-TAC-T--A-
gi|78874 : --A-CTTTC-G--A-T-TG-T-G--A---C-GT-CA--T-A-C-T-AAGCGC----G--T---G-A----CG-C-A-----AT-A-------A------A------T--------ATAAC-T-------------C-A---ATG--CGA-T---------A-A-CATTTagcgcgtgacgcaataaatataactcaatgcgataacatttgat
gi|78875 : taacaatatggaTAAC-GA-G--A-TG-G-----GAA---G-C--TAT--C-CA--T-T-GT-G-A----C-GT-CA-CA--T--A-CTTTC-G--A-T-TG-T-G--A---C-GT-CA--T-A-A-T-G--C-T----G--T---G-A----TG-C-A-----A--A-------A------gat
gi|78876 : --A---C-GT-CA--T-A-AAT-A--C-T-------T---G-A----CG-C-A-----A--A-------AAACAATA------C--------G-----T-------------CAA---A-G--C-A-T-----A---A-A-CATTTcaacaaacttc
gi|78878 : taacgaatgggaaaaaagctacgatttgtatgaTAAC-GG-G--A-TG-T-----GAA---A-C--TTT--C-GA--T-T-GT-G-A-------T-CA-TAA-T--A-CTGTC-G--
gi|78878 : --A-CTTTC-G--A-T-TG-T-G--A------T-CA--T-A-A-T-A--C-T----G--T----------CG-----------------------------------------------------------------G---A-G--C-A-T-----A---A-A-CATTTgagcataaacatttcgtaacaactatacaaaatt
gi|78879 : taacgggatgtgaaA-TAA-T--AGCTTTC-GG-A-T-TG-T-G--A---C-AT-CA--T-A-A-T-G--C-T----T--A---G-A----CG-CTA-----A--A-------A------A------T--------A-------------------C-A---A-C--C-A-C-----A---A-cgtaacaactatacaaaatt
gi|78880 : taaccgagTAAC-AA-G--A-TG-G-----AAA---G-C--TTT--C-GA--T-T-GT-G-A-------T-AA-TAA-T--g
gi|78881 : TAAC-AA-A--G-CA-G-----AAA---G-C--TTT--C-CA----T-GT-G-G----C-GT-CA-CAA-T--A-gtgaagataaaacatagaagtaagatgtcaacaacaaaca
gi|78881 : -CTTTC-C--A-T--G-T-G--G---C-GT-CA--C-A-A-T-A--G-A----A--T---G-A----AG-C-A-----A--A-------A------A------C--------A-----T-------------A-A---A-G--T-A-------A---A-G-CAgaatgaagcaaaaacataaagtaaagcaca
gi|78882 : taacaaagcagaaagTAAC-GA-G--A-TG-G-----AAA---A-C--TTT--C-AA--T-A-GT-G-A----C-GT-CA-TAA-T--C-CTca
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gi|78883 : -CTTTC-G--A-C-TT-T-G--A---C-GT-CA--T-A-A-T-A--C-T----G--T---G-A----TG-C-A-----A--A-------A------A------CATAAT---G-----T-------------C-----A-G--C---T-----A---A-G-CATTgtgatgcaaaaacataatgtcagctaagcatt
gi|78884 : agcgagatgggaaggAAC-GT-G--A-TG-G-----GAA---G-C--TTT--C-TA--T-T-GT-GTA----C-GT-CA-
gi|78884 : -CTTTC-T--A-T-TG-T-GT-A---C-GT-CA--C-A---T-A--C-C----G--T---G-A----CG-C-A-----A--C-------ACAT---A------A--------G-----T-------------C-A---A-G--C-A-T-----A---A-A-CAGTTcataccgtgacgcaacacataagtcaagcataaacagttttcgt
gi|78885 : aacgtgatgggaagAAT-GA-G--A-CG-G-----AAA---G-C--TTT--C-AA--T-T-AT-G-A----C-AT-CA-TAA-T--A-ttcgt
gi|78885 : -CTTTC-A--A-T-TA-T-G--A---C-AT-CA--T-A-A-T-A--G-A----A--T---G-A----GG-C-A-----A--A-------A------A------C--------GTAACAT-------------C-A---A-G--G-G-T-----A---A-A-CATTTgaatgaggcaaaaacgtaacatcaagggtaaacattt
gi|78886 : aatgagacggaaagAAC-GA-G--A-CG-G-----AAA---G-C--TTT--C-GA--T-T-GT-G-A----C-GT-CA-TAA-T--A-
gi|78886 : -CTTTC-G--A-T-TG-T-G--A---C-GT-CA--T-A-A-T-A--G-A----A--T---G-A----GG-C-AAATATA--A-------A------A------C--------G-----T-------------C-A---A-A--C-G-T-----gaatgaggcaaatataaaacgtcaaacgt
gi|78887 : aacgagacggaaagAAC-GA-G----TG-G-----GAAA--G-C--TTT--C-GATGT-T-GT-G-A----C-GT-CA-CAA---------TT-G--G-C-CGTT-G--A---C-GC-CA--A-A-A----------------------A----CA-C------------------A------A------C--------G-----T-------------C-A---A-A--C-A-T---------A-A-TATTT
gi|78888 : AAC-GA-T--T-TG-G-----AAA---G-C--TTT--C-AA--T-T-GT-G-A----C-GT-CA-TAA-T--A-CTTT
gi|78888 : -CTTTC-A--A-T-TG-T-G--A---C-GT-CA--T-A-A-T-A--C-T----T--T---G-A----CG-T-A-----A--A-------gacgtaaa
gi|78889 : aacgatttggaaagAAC-GT-G--AATG-G-----GAA---G-CC-TTT--CTGA--T-T-GT-G-A----C-GT-CA-AAA-C--A-C
gi|78889 : -CTTTCTG--A-T-TG-T-G--A---C-GT-CA--A-A-A-C-A--C-CAGGGG--T---G-A----CG-C-G-----A--AAAACAATA------A------C--------G-----T-------------C-A---A-GC-C-A-T-----C---A-A-CATcaggggtgacgcgaaaaacaataacgtcaagccatcaacatattat
gi|78890 : aacgtgaatgggaagc-T-TG-T-G--A---CTGT-CACCT-A-A-T-A--C-T----GC-T---G-A----CT-C-A-----A--A-------ACATA--A------C--------G-----T-------------C-A---A-G--C-A-CACATAA---A-A-CATTattat
gi|78891 : aacgcagatggagaagcatctgagAAC-GA-A--A-TG-GTCAGAAAA---G-C--TTT--C-AA--T-T-GTGG-A----C-GC-CA-TAA-gca
gi|78891 : -GT-CA-GAA-A--AGCTTTC-A--A-T-TG-T-GG-A---C-GC-CA--T-A-A-A-A----------------A-A----C----------A--T-------A------A------C--------G-----T-------------C-A---A-G--C-A-T-----A---A-A-CATTaaaacataacgtcaagcataaacattgca
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gi|78862 : -CTTTC-G--A-T-TG-T-G--A---C-GT-CA--T-A-A-T-A--C-T----G--T---G-A----CG-C-A-----A--A-------ACTAC--A------C--------G-----T-------------C-----A-G--C-A-T---------A-A-CATgtgacgcaaaactacacgtcagcataacat
gi|78863 : taacgaagcatggcaaagTAAC-GA-G--A-TG-G-----AAA---G-C--TTT--C-GA--T-T-GT-G-A----C-GT-CA-TA-------------------------------------------A-A-T-G--C-C----G--T---G-A----CGCC-A-----A--A-------A------A------C--------A-----T-------------
gi|78864 : TAAC-AA-G--A-TG-G-----GAT---G-C--TTT--C-GA--T-T-GT-G-T----C-GT-----------------------------------------T-CA--T-A-A-T-G--C-C----G--TG--G-A----CG-C-A-----A--A-------ATATT--A------C--------G-----T-------------C-A---A-G--C-A-TTG---A---G-A-CATCTaa
gi|78865 : TAAC-GT-GC-A-TG-G-----GAA---G-CC-TTT--C-TA--T-T-GT-G-A----C-GT-CA-CAA-T--A-CTc
gi|78865 : -CTTTC-T--A-T-TG-T-G--A---C-GT-CA--C-A-A-T-A--C-T----G--T---G-A----CG-C-A-----A--A-------ACAT---A------C--------G-----T-------------C-A---A-GGTC-G-T-----A---A-gtgacgcaaaacatacgtcaaggtcgtaa
gi|78866 : taacgtgcatgggaagcTTC-T--A-T-TG-T-GGAA---C-GT-CA--C-ATA-T-A--C-C----G--T---G-A----CG-C-A-----A--AAAACAATA------A------C--------G-----T-------------C-A---A-G--C---T-----A---A-A-CATTT
gi|78867 : taacgtgaaatggaaagcTAAC-GA-G--A-TG-G-----GAA---G-C--TTT--C-GA--T-T-GT-G-A----C-G--CACTAA-T--G-C---C-G------TA-C-G--------GG-CA----A-A---A--C-T----A--T------------------------A-------A------A------C--------G-----T-------------T-A---AGG--C-A-T-----A---AGA-CATTT
gi|78868 : TAAC-GG-G--A-TG-G-----GAA---A-C--TTT--C-GA--T-T-GT-G-A----C-GT-CA-TAA-T--A-CTGTC-G--A-
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gi|78869 : taacgggatgggaaTAAC-TA-G--A-AG-G-----ATA---G-C--TTT--T-GA--T-T-GT-G-A----C-AT-CA-
gi|78869 : A-T--AGCTTTT-G--A-T-TG-T-G--A---C-AT-CA--A-A-A-T-A--G-A----A--T---G-A----CA-C-A-----C--A-------A------A------CATAAT---G-----T-------------C-A---A-G--C-G-T-----A---A-A-CATaaatagaatgacacacaaacataatgtcaagcgtaaacatgtc
gi|78870 : taactagaaggTAAC-GA-G--A-CT-G-----GAA---T-C--TT---C-GA--T-T-GT-G-ATCATC-AT-TA-TAA-T--A-CTT-----------G-T-G--A---C-GC-AA--T-A---T-A--T-------------------------A-----A--T-------A------A------C--------G-----T-------------C-A---A-G--C-A-T-----A---A-A-CATgtc
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gi|78872 : TAAC-AA-G--A-TG-G-----GCA---G-C--TGT--C-GA--TGT-TT-G-AT---C-GT-CA-TAA-ataac
gi|78873 : -T--A-TTTTG-G--A-T-TT-T-G--A---T-GT-CA--T-C-A-T-A--T-T----G--T---G-A----CG-C-A-----A--A-------A------A------C--------A-----TAACGTCATGCGCGC-A---A-G--T-A-T-----A---A-A-CATctgcacctgacgcaaaaaacataactaagcatcaaaattcat
gi|78874 : taacgagatattgtaaaagcTAAC-AA-T--A-TG-G-----AA------C--TTT--C-GA--T-T-GT-G-A----C-GT-CA-TAC-T--A-
gi|78874 : --A-CTTTC-G--A-T-TG-T-G--A---C-GT-CA--T-A-C-T-AAGCGC----G--T---G-A----CG-C-A-----AT-A-------A------A------T--------ATAAC-T-------------C-A---ATG--CGA-T---------A-A-CATTTagcgcgtgacgcaataaatataactcaatgcgataacatttgat
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gi|78878 : taacgaatgggaaaaaagctacgatttgtatgaTAAC-GG-G--A-TG-T-----GAA---A-C--TTT--C-GA--T-T-GT-G-A-------T-CA-TAA-T--A-CTGTC-G--
gi|78878 : --A-CTTTC-G--A-T-TG-T-G--A------T-CA--T-A-A-T-A--C-T----G--T----------CG-----------------------------------------------------------------G---A-G--C-A-T-----A---A-A-CATTTgagcataaacatttcgtaacaactatacaaaatt
gi|78879 : taacgggatgtgaaA-TAA-T--AGCTTTC-GG-A-T-TG-T-G--A---C-AT-CA--T-A-A-T-G--C-T----T--A---G-A----CG-CTA-----A--A-------A------A------T--------A-------------------C-A---A-C--C-A-C-----A---A-cgtaacaactatacaaaatt
gi|78880 : taaccgagTAAC-AA-G--A-TG-G-----AAA---G-C--TTT--C-GA--T-T-GT-G-A-------T-AA-TAA-T--g
gi|78881 : TAAC-AA-A--G-CA-G-----AAA---G-C--TTT--C-CA----T-GT-G-G----C-GT-CA-CAA-T--A-gtgaagataaaacatagaagtaagatgtcaacaacaaaca
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gi|78882 : taacaaagcagaaagTAAC-GA-G--A-TG-G-----AAA---A-C--TTT--C-AA--T-A-GT-G-A----C-GT-CA-TAA-T--C-CTca
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gi|78883 : -CTTTC-G--A-C-TT-T-G--A---C-GT-CA--T-A-A-T-A--C-T----G--T---G-A----TG-C-A-----A--A-------A------A------CATAAT---G-----T-------------C-----A-G--C---T-----A---A-G-CATTgtgatgcaaaaacataatgtcagctaagcatt
gi|78884 : agcgagatgggaaggAAC-GT-G--A-TG-G-----GAA---G-C--TTT--C-TA--T-T-GT-GTA----C-GT-CA-
gi|78884 : -CTTTC-T--A-T-TG-T-GT-A---C-GT-CA--C-A---T-A--C-C----G--T---G-A----CG-C-A-----A--C-------ACAT---A------A--------G-----T-------------C-A---A-G--C-A-T-----A---A-A-CAGTTcataccgtgacgcaacacataagtcaagcataaacagttttcgt
gi|78885 : aacgtgatgggaagAAT-GA-G--A-CG-G-----AAA---G-C--TTT--C-AA--T-T-AT-G-A----C-AT-CA-TAA-T--A-ttcgt
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gi|78887 : aacgagacggaaagAAC-GA-G----TG-G-----GAAA--G-C--TTT--C-GATGT-T-GT-G-A----C-GT-CA-CAA---------TT-G--G-C-CGTT-G--A---C-GC-CA--A-A-A----------------------A----CA-C------------------A------A------C--------G-----T-------------C-A---A-A--C-A-T---------A-A-TATTT
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gi|78889 : -CTTTCTG--A-T-TG-T-G--A---C-GT-CA--A-A-A-C-A--C-CAGGGG--T---G-A----CG-C-G-----A--AAAACAATA------A------C--------G-----T-------------C-A---A-GC-C-A-T-----C---A-A-CATcaggggtgacgcgaaaaacaataacgtcaagccatcaacatattat
gi|78890 : aacgtgaatgggaagc-T-TG-T-G--A---CTGT-CACCT-A-A-T-A--C-T----GC-T---G-A----CT-C-A-----A--A-------ACATA--A------C--------G-----T-------------C-A---A-G--C-A-CACATAA---A-A-CATTattat
gi|78891 : aacgcagatggagaagcatctgagAAC-GA-A--A-TG-GTCAGAAAA---G-C--TTT--C-AA--T-T-GTGG-A----C-GC-CA-TAA-gca
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gi|78909 : ggaagc-CTTTT-C--A-T-TG-T-G--A---T-TT-CC--T-A-A-T-A--G-A----A--T---G-AATAATG-C-A-----A--A-------A------A------C--------A-----TATCAT--------C-A---A-G--T-G-T-----A---A-A-CATTTcat
gi|78910 : ag-CTCTC-G--A-T-TG-T-G--A---C-GT-CA--T-A-A-T-A--G-A----A--T---G-A----GG-T-A-----A--AAACAC--A------A------C--------G-----T-------------C-T---A-G--C-G-T-----A---A-A-CATTTcgt
gi|78911 : g-CTTTC-A--A-T-TG-T-G--A---C-GT-CA--T-A-A-A-A--C-T----GTTT---G-A----TG-C-A-----A--GACAT---A------A------C--------G-------------------C-A---A-G--C-A-T-----A---A-A-CATTTcgt
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Unaligned ( gi|78877 ): TAACGAATGGAAAGTTTCTCAATTGCTGCTCAAATAAACTGTGACGCAAGAAACCATAACGTCAGAACATAAACTTGCAT
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gi|78872 : TAAC-A----A-G--A-TG----G-----GC---A---G-C---T-G---T--C-G--A--TGT-T-T-G--AT---C-GT-CA--TA---A--C------T-------------------------------G-CA--C-C--T-G-ACG-CAA----A-----A-------A------A------C--------A-----TAAC--T--A---A-G--C-A-T-----C---A-A-AATTataac
gi|78873 : TAAC-G----A-G--A-TATTGTA-----AA---A---G-CTATT-T---T--G-G--A--T-T-T-T-G--A----T-GT-CA--TCA-TA---------T---T------G-----TG-ACG--CAAAAACA-TA--A-CG-T-C-ATG-C---------------------------G------C--------G-----------C--A---A-G--T-A-T-----A---A-A-CATcat
gi|78874 : TAAC-A----A-T--A-TG----G-----AA---------C---T-T---T--C-G--A--T-T-G-T-G--A----C-GT-CA--TAC-TAAGC------G---C------G-----TG-ACG-CAATA---A-
gi|78874 : ------T---T------G-----TG-ACG-TCATA---C-TAAGCGCG-T-G-ACG-C-A----AT----A-------A------A------T--------ATAAC-T-----C--A---ATG--CGA-T---------A-A-CATTTatataactcaatgcgataacatttgat
gi|78875 : taacaatatggaactttcgaTAAC-G----A-G--A-TG----G-----GA---A---G-C---T-A---T--C-C--A--T-T-G-T-G--A----C-GT-CA--C-A-TA--CTTTCGAT---T------G-----TG-ACG-TCATA---A-TG--C-TG-T-G-ATG-C-A----A-----A-------A------gat
gi|78876 : -ACG-TCATA---AATA--C-T--T-G-ACG-C-A----A-----A-------AAACAATA------C--------G-----T-----CA-A---A-G--C-A-T-----A---A-A-CATTTcaacaaacttc
gi|78878 : taacgaatgggaaaaaagctacgatttgtatgaTAAC-G----G-G--A-TG----T-----GA---A---A-C---T-T---T--C-G--A--T-T-G-T-G--A-------T-CA--TAA-TA--C------T---
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gi|78882 : TAAC-G----A-G--A-TG----G-----AA---A---A-C---T-T---T--C-A--A--T-A-G-T-G--A----C-GT-CA--TAA-TC--C------T---
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gi|78884 : AAC-G----T-G--A-TG----G-----GA---A---G-C---T-T---T--C-T--A--T-T-G-T-GT-A----C-GT-CA--CA-----------------------------------------------TA--C-CG-T-G-ACG-C-A----A-----C-------ACAT---A------A--------G-----T-----C--A---A-G--C-A-T-----A---A-A-CAGTT
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gi|78886 : AAC-G----A-G--A-CG----G-----AA---A---G-C---T-T---T--C-G--A--T-T-G-T-G--A----C-GT-CA--TAA-TA--------------------GAA---TG-A-G-GCA-A---A-TA--T-------------------A-----A-------A------A------C--------G-----T-----C--A---A-A--C-G-T-----
gi|78887 : AAC-G----A-G----TG----G-----GA---AA--G-C---T-T---T--C-G--ATGT-T-G-T-G--A----C-GT-CA--CAA------------T---T------GGCCGTTG-ACG-CCAAA---A--------------ACA-C--------------------A------A------C--------G-----T-----C--A---A-A--C-A-T---------A-A-TATTT
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gi|78889 : AAC-G----T-G--AATG----G-----GA---A---G-CC--T-T---T--CTG--A--T-T-G-T-G--A----C-GT-CA--AAA-CA--C------CAGGG------G-----TG-ACG-----------------CG-A-A-AAA-C-A----A-----T-------A------A------C--------G-----T-----C--A---A-GC-C-A-T-----C---A-A-CATaaa
gi|78890 : AAC-GC---A-G--A-TG----GA----GA---A---G-C---A-T---C--T-G--AG-T-T-G-T-G--A----CTGT-CACCTAA-TA--C------T---G------C-----TG-AC--TCAAA---A-CA--T---------------------------------A------A------C--------G-----T-----C--A---A-G--C-A-CACATAA---A-A-CATTattat
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gi|78898 : AC-G----A-G--A-TG----G-----AA---A---G-C---T-T---T--C-G--A--TCT-G-T-G--A----C-ATCCA--TAA-TA--C------G---T------G------G-ACG--CA-A---A--A--G-CA-T-G-ATA---A----G-----A-------A------C------C--------G-----T-----CTAA---A-GC-C-A-T-----A---A-A-aac
gi|78899 : AC-G----A-G--A-TG----G----------A---G-C-----T---T--C-G--A--T-T-G-TCG--A---------------------------------------G-----TG--CA-T--TA---A-TG--C----T-G-ACG-C-A----A-----A-------A------A------C--------A-----T-----
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gi|78911 : -C---T-T---T--C-A--A--T-T-G-T-G--A----C-GT-CA--TAA-AA--C------TG--T------T-----TG-ATG----CA---A------------G-AC---------A-----T-------A------A------C--------G-----------C--A---A-G--C-A-T-----A---A-A-CATTTcgt
gi|78912 : ------T---T------G-----TG-ACG-TCATA---A-TA--C-TG-T-G-ACG-T-A----ATC---ACTT----A------A------C--------G-----T-----C--A---G-A--C-A-T-----A---A-A-CATT
3 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|78877 ): TAACGAATGGAAAGTTTCTCAATTGCTGCTCAAATAAACTGTGACGCAAGAAACCATAACGTCAGAACATAAACTTGCAT
Unaligned ( gi|78881 ): TAACAAAGCAGAAAGCTTTCCATGTGGCGTCACAATAGAATGAAGCAAAAACATAAAGTAAAGCACA
Unaligned ( gi|78909 ): AGCTTTTCATTGTGATTTCCTAATAGAATGAATAATGCAAAAACATATCATCAAGTGTAAACATTTCGT