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consensus                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T-TTN--CA--AAA---TGAC--------CTT--G--A-G----T-GAC--C-TT-TGNCT-GAA---AG-C-CA-T-TTG-C---C-T-G-T----TA----C----T----T--A-TT-T-G--T--G-N--G-ATA---TATG-A-TC---AATACT
Reference ( gi|104215 )       : AGTGACC-TT----GA----C-C-T-ATC--CA--AAA---TGAC--------ATT--G--A-G----T-AAC--T-TT-TGCCT-GAA---AA-C-CA-T-TTG-C---C-T-G-T----TA----C----T----T--A-TT-T-G--T--G-G--A-ATA---TATG-A-TC---AATACT
gi|104229                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T-TTC--CA--AAAA--TGAC--------CTT--G--A-G----T-AAC--T-TT-TGCCT-GAA---AA-C-CA-A-TAG-C---C-T-G-T----TA----C----T----T----TT-T-G--T--G-G--A-GTA---TATA-A-TC---AATACT
gi|104205                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T-TTC--AA--AAA---TGAC--------CTT--G--A-G----T-AAC--T-TT-AACCT-GAA---AC-C-CA-T-TTG-C---C-T-G-T----TA----C----T----T--A-TT-T-G--T--G-G--A-ATA---CATC-T-TC---AATAtgtt
gi|104209                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T-TTC--CA--AAA---TGAC--------TTT--A--A-G----T-AAC--T-TT-AGTCT-GAA---AA-C-TA-T-TTG-C---C-T-G-T----TA----T----A----T--A-TT-T-G--T--G-G--AGATA---TGTG-A-TC---AATAattgtt
gi|104224                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T-TTC--CG--AA----TGAC--------CTT--G--A-C----T-A-T--T-TT-TGCCT-GAA---AT-T-CA-T-TTG-C---C-T-G-T----TA----T----T----T--A-TT-T-G--T--G-G--A-ATA---TATG-A-TC---ATTACTgttgct
gi|104213                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T-TTA--AA--GAA---TGAC--------CTT--G--A-G----A-AAC--T-TT-TACCT-GAA---AC-C-CA-T-TTG-C---C-T-G-T----TA----C----T----T--A-TT-T-G--T--G-G--G-ATA---CATC-T-TC---AATACTtgtt
gi|104241                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T-TTT--CA--AA----TGAC--------ATT--G--A-G----C-AAC--T-TT-CGCCT-GAA---AT-T-CA-T-TAA-G---C-T-T-T----TA----C----T----T--A-TT-T-G--T--G-G--G-CTA---TATG-G-TC---AATACTtgtt
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gi|104208                     : AGTGACC-TT----GG----C-C-T-TTA--CA--AAA---AGAC--------TTT--C--A-G----T-CAC--C-TT-TGACT-GAA---AG-C-CA-T-TTG-C---T-T-G-T----TA----C----T----T--A-AT-T-G--T--GTG--A---A---TATG-A-TC---AATATTactgtt
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gi|104217                     : AGTGAAC-CT----GA----C-C-T-TTA--CA--AAA---TGAC--------CTT--G--A-G----T-AAA--T-TT-TTACT-AAA---AT-C-CA-T-TTG-C---C-T-C-T----TT----C----T----T--A-TT-T-A--T--TTG--A-A-A---TATG-A-TC---AATACTtctatt
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gi|104233                     : AGTAACC-TT----GA----T-C-T-TTA--CA--AAA---TTAC--------CTT--G--A-G----T-GAC--C-TT-TGCCT-GAA---AG-C-TA-T-TTG-C---C-T-G-T----TA----C----T----T--G-TC----------------ATA---AACA-A-TC---AACACTctgtt
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gi|104204                     : AGAGACC-TTAGTTGA----C-C-T--TCA-CA--AAA---TGAC--------CTT--T--A-G----T-CAC--C-TT-TGACT-AAA---AG-T-AA-T-TTG-C---T-T-G-T----TA----A----T----T--A-TT-T-A--T--G-T--G-ATA---TATG-A-TT---AATACtgtt
gi|104235                     : AGTGACC-TT----AA----C-C-T-TTA--TA--ATA---TGAC--------CTC--G--A-G----A-GAC--C-TT-TGTCT-GAC---AG-T-CA-T-TTG-C---C-T-A-T----TA----C----T----T--A-TA-T-G--T--G-T--G-ACA---TATA-T-CC---AATACatgtt
gi|104228                     : AGTGACC-TT----AT----C-C-T-TTT--CA--AAA---TGAC--------TAT--G--A-G----T-GAC--C-TT-TGCCT-GTA---AG-T-CA-T-TTG-C---C-A-A-T----TC----C----T----A--A-GT-T-G--T--G-C--A-AAA---TATC-A-TC---AGTACctgtt
gi|104256                     : AGTGACT-CT----AA----C-T-G-TTA--CA--TAA---TGAC--------TTT--G--T-C----T-GAC--C-TT-TGCCT-GTC---AG-C-CA-C-TTG-C---C-T-A-T----TC----C----T----T--A-TT-T-G--T--G-C--G-ACA---TATG-A-TC---AATACctatt
gi|104230                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T-TTA--CA--AAA---TGAC--------CTT--A--G-G----T-CAC--T-TT-TGACT-GAA---AG-T-CA-T-TTG-C---T-----T----TA----------------------T-G--C--G-G--T-ATATATTATG-A-CC---AATActgtt
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gi|104247                     : AGTGACT-TT----GA----C-C-T-TTA--CA--ATA---TGGC--------CTT--G--A-G----A-AAC--C-TT-TGTCT-GAT---AG-T-CA-T-TTG-C---C-T-C-T----TA----C----TTTAAT--A-TC-T-G--T--G------ATA---TATtctatt
gi|104210                     : AGTGACC-TT----GA----C-T-C-A----CA--AAA---TGAC---------TT--A--A-G----T-CAC--T-TT--GC-T-ATA---GA-T-GA-TGTTG-C---T-T-G-T----TA----A----T----T--AATT-T-A--T--G-C--G-ATA---TATG-A-TC---AATACT
gi|104259                     : AATGATC-TT----GA----C-C-T-TTA--CA--ACA---TGAT--------CTA--G--A-G----T-GGC--C-TT-TGCCT-GTT---AG-T-CA-T-TTG-T---C-T-A-T----TT----C----T----T--A-TA-T-G--T--G-C--A-ACA---TTTG-A-TC---AATAtg
gi|104211                     : AGTGACC-TC----AA----T-C-C-ATA--CAC-AAA---TGAC--------CTT--G--T-G----T-GAC--T-TT-TGCC---AAGTTAG-T-CA-T-TTG-----C-T-A-T----T----------T----T--G-TT-T-G--T--G-GC-G-ACA---TATG-A-TC---AATACtctgtt
gi|104219                     : AGTAACC-T-----GA----C-T-T--TA--CA--AAA---TGAC--------CTT--G--AGG----T-AA---T-TT-TA-CT-AAA---AT-C-CATT-TTG-C---C-T-C-T----TT----C----T----T--A-TTAT-T--T--T-G--A-AAA---TATG-A-TC---AATACTctg
gi|104254                     : AGTGAGC-TC----AT----C-G-T-TTA--CA--AAA---TGAA--------CTT--G--A-G----T-GAC--C-TT-TGCCT-GTT---AG-T-CA-T-TTG-C---C-T-G-T----TC----C----T----T--A-TC-T-G--T--T-T--A-ACA---TA---A-TC---AATACgtt
gi|104257                     : AGTTACC-TT----GA----C-C-T-TTA--CA--ACA---TGAC--------CCT--G--A-G----C-GACCTT-TT-TATCT-GAG---AG-T-CA-T-TTG-C---CTT-A-T----TA----C----T----T--A--T-A-G--T--G-------TA---TGTG-A-TT---AATctgtt
gi|104231                     : AGTGACC-CCC---AA----C-T-T-ATG--AA--AAA---TGGC--------CTT--G--A-G----T-GAC--C-TT-TGCCT-GTT---AG-T-GA-T-TTG-C---A-T-A-T----TC----C----T----T--G-TT-T-G--C--G------ACA---TATG-A-TT---AATAC
gi|104207                     : AGTGAC--TT----G-----C-C-T--TCA-CA--AAA---TGAC--------CTT--A--A-G----TCCAC--C-TT-TGACT--AA---TG-T-AA-T-TTG-C---T-T-G-T----TA----A----T----T--A-TT-TCA--T--G-G--G-ATA---TATGAA-TC---AATACTcagtt
gi|104262                     : AGTGACC-C-----AA----C-C-T-TTA--CA--AAA---TGAC--------CTT--G--T-G------GAC--C-TT-TGCCCAGTT---AG-T-CA-C-TTG-C---C-T-A-T----T-----C----T----T--G-TT-T-G--T--GAG--A-ACA---TATG-A-TCA--AATACtgtt
gi|104220                     : AGTGACC-TT----AA----C-C-T-TTT--CA--AAA---TGAC--------TAT--G--T-G----T-GAC--C-TT-TGTCT-GTT---AA-T-CA-T-TTG-C---A-A-A-T----TC----C----C----A--A-GT-T-G--T--G-C--A-AAA---TATC-A-TC---AGTACctg
gi|104264                     : AGTAGCC-TT----GA----T-C-T-CTG--AA--AAA---TGAC--------CTT--G--A-G----T-GAC--A-TT-AGTCT-GAA---AA-C-CA-T-TTA-C---C-C-G-C----AG----C----T----T--A-TA-T-A--T--A-GGTG-ATA---AATG-A-CC---ATTActgtt
gi|104251                     : AGTGACC-AT----GA----C-----ATC--CACAAAA---TGAC--------CTT--G--A-G----T-GAC--T-TT-TATCT-GAA---AG-T-CA-T-TTG-C---tctgtt
gi|104206                     : AGTGACC-TC----AA----C-C-T-TTA--AA--AAA---TGAC--------CTT--G--T-G----T-GAC--C-TT-CGCCA-GTT---GG-T-CA-T-TGG-C---C-T-A-T----TC----C----T----T--G-TT-T-G--T--G-T--G-ACT---TATG-A-TC---AATA
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gi|104258                     : AGTGACC-TT----GC----C-C-T--TA--CA--AAC---TGAC--------CTT--G--A-G----T-GAC--C-T---GTCT-GAA---TG-C-CA-T-TTA-C---C-T-G-T----TA----t
gi|104218                     : AGTGAAC-CT----GA----C-C-T-TTTA-CA--AAA---TGAC--------CTT--G--A-GGTAAT-AAT--T-TT-TA-CT-AAA---AT-CTCA-T-TTG-C---C-T-C-T----TT----T----TA---T--A-TA-T-T--T--G-A--A-A------ATG-A-TC---AATACT
gi|104263                     : AGTGACC-CT----GG----A-C-T-TTC--CA--AAA---TGAC--------GTT--G--A-A----T-GAC--C-TT-TGACT-GAA---AA-A-CA-T-tg
gi|104239                     : AGTTACC-TT----GA----C-A-T-GTA--CA--AAA---TGAC--------CTT--C--A-G----T-TAC--C-TT-----T-GAG---AG-C-AA-T-TTT-C---C-T-A-----------------T----T--A-TT-T-G--T--G-C--G-ATA---TGCG-A-TC---AAAACTatttg
gi|104232                     : AGTGACCCTT----GA----C-C-TCATC--AA--AAA---TGAC--------CTTT-A--A-G----T-CAC--C-TTGTGACT--AA---AA-G-GA-T-TTG-C---T-T-G-T-----A----A----T----C--A-TT-A-C--T--G------ATA---TATC-A-TC---AATACTtgtt
gi|104214                     : AGCGACC-TC----AA----C-T-T-TTA--CA--AAA---TGACCTAGTCAAGTT--G--T-G----T-GAC--C-TT-TGCCA-GTT---AG-T-CA-T-TTG-C---C-A-A-A----TC----C----T----T--G-TT-T-G--T--G-C--G-ACA---TACG-A-TC---AATACgtt
gi|104244                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T--TCA-CA--AAA---TCCC--------CTT--G--A-G----T-AGC--C-GT-TGGTT-GAA---AA-T-CA-T-TTG-C---T-T-ctgtt
gi|104200                     : AGTGACC-CC----AA----A-C-T-TTA--CT--AAA---TGAC--------CTT--G--T-A----T-GTC--C-GT-TGACA-GAT---AG-T-CA-C-TTG-C---C-A-A-A----TC----C----T----T--G-TT-T-G--T--G-C--A-ATA---TATG-A-TC---AATAC
gi|104255                     : AGTGACC-CT----GA----C-C---AT---------A---TGAC--------CTT--G--A-T----T-CAT--C-TT-TGACT-GAA---AG-C-CA-T-TTG-C---T-T-G-T----ctg
gi|104250                     : AGTGACC-TC----AA----C-C-T-TTA--CA--AAA---TGAC--------CTT--G--A-G----T-GAT--C-TT-TGCCT-GTT---AA-T-CA-T-
gi|104249                     : AGTGACC-TC----AA----C-C-T-TTA--CA--AAA---TGAC--------CTT--G--A-G----T-GAT--C-TT-TGCCT-GTT---AA-T-CA-T-acatgtatgaacaatacatgtt
gi|104248                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T-TTC--CA--AAA---TGAC--------CTT--G--A-G----A-GAC--C-TT-aatgtatgaacaatacatgtt
gi|104265                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T-TTC--CA--AAA---TGAC--------CTT--G--A-A----A-AAC--C-TT-gatccacaaat
gi|104252                     : AGTGACC-CT----GA----C-C-T-TTC--CA--AAA---TGAT--------CTT--G--A-G----A-GAC--C-TT-GGTCT-AAA---A
gi|104236                     : AGTAACC-TT----GA----T-A-T-TTC--CA--TAA---AGCC---------TTCCG--A-G----T-CAC--C-TT-TGAAT-GAT---CG-C-CA-T-TTG-C-------------------------T----T--A-TT-T-G--T--GTG--A-A-A---TATG-A-TA---AATACT
gi|104240                     : AGTGGCC-TC----AA----C-C-T-TAA--CA--AAA---TGAC--------CTT--G--A-G----T-TAC--C-AC-AGTTT-GAA---CT-C-C--T-TTG-C---C-T-G-TTATATA----C----T----T--A-TT-T-G--T--tatt
gi|104238                     : AGTAACC-TT----GA----T-A-T-TTC--CATTAAA-----GC--------CTTCCG--A-G----T-CAC--C-TT-TGAAT-GAT---CG-C-CA-T-TTG-C-------------------------T----T--A-TT-T-G--T--GTG--A-A-A---TATG-A-TA---AATACTta
gi|104237                     : AGTAACC-TT----GA----T-A-T-TTC--CATTAAA-----GC--------CTTCCG--A-G----T-CAC--C-TT-TGAAT-GAT---CG-C-CA-T-TTG-C-------------------------T----T--A-TT-T-G--T--GTG--A-A-A---TATG-A-TA---AATACT
gi|104253                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T-TTA--AA--AAA---TAAA--------CTT--G--A-G----A-GAT--C-TT-TGTAC-GAA---AG-T-CA-T-TTG-C---
gi|104202                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T-TTA--CA--AAA---TGAC--------CTT--G--A-A------AGC--T-TT-acaatgattaataattt
gi|104266                     : AGTGACC-TT----AA----C-C-T-TTA--CA--AAA---TGAC--------CTT--T--A-G----A-GAC--C-TT-GGTCC-GAA---A----CA-T-CAA-T---C-T-G-T----g
gi|104226                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T--TA--CA--AAA---TTTC--------CTT--G--A-G----T-GAC--C-TT-TGcgaaatatgatatctaacaatctttg
gi|104242                     : AGTGACCATT----G-------C-T-GTCATTA--AAA---TGAC--------CTT--A--A-G----T-TAC--C-TTGTG-AT-AAA---AG-TAGA-TGTTG-A---T-T-G-T----TA----A----T----T--A-TG-T-AC-T--G------ATA---TATG-A-TC---
gi|104260                     : AGTGACC-TTT---GAAG--CAC-T-TTG--CA--GAAAACTGAC--------CTT--ACTA-G----T-CAC--CAGT-TGACT-AAG---AA-C-TA-A-TTG-C---T-TTG-T----TA----A----T----T--G-TT-T------------A-CTA---TGTG-A-TC---AATAtagcttgtt
gi|104268                     :  GTGGCC-TT----GA----C-C-T-TTC--CA--AAA---TGAC--------CTT--A--A-G----T-ATT--T-TT-TGCCA-GAA---AA-C-CA-T-TTG-T---C-T-G-T----TA----C----T----T--A-TT-T-G--TG-G-G--G-ATA---TATG-A-TC---AATACT
gi|104267                     :  GTGGCC-TT----GA----C-C-T-TTC--CA--AAA---TGAC--------CTT--A--A-G----T-ATT--T-TT-TGCCA-GAA---AA-C-CA-T-TTG-T---C-T-G-T----TA----C----T----T--A-TT-T-G--TG-G-G--G-ATA---TATG-A-TC---AATACTtgtt
gi|104269                     :  GTGACC-TT----GA----C-C-T-TTC--CA--AAA---TGAC--------CTT--G--A-G----tgtt
gi|104271                     :   TGACC-TT----GA----C-C-T-TTC--AA--AAA---TGAC--------CTT--A--A-G----A-AAC--T-TT--ACCT-GAA---AC-C-CA-T-TTG-C---C-T-G-T----TA----A----T----T--A-TT-T-G--T--G-G--G-ATA---CATC-T-TC---AATACT
gi|104270                     :   TGACT-TT----GA----C-C-T-TTT--AA--AAA---TTAC--------CTT--G--A-G----T-AAC--T-TT-TACCT-GAA---AC-C-CA---ATG-G---C-T-G-T----TA----A----T----T--A-TT-T-G--T--G-G--G-ATA---CATC-A-TC---AATACTtat
gi|104283                     :   TGACC-TT----GA----C-----------A--AAA---TGAC--------CTT--C--A-G----A-CAC--C-TT-TGACT-GAA---AG-C-CA-T-TTG-C---T-T-G-T----TA----C----T----T--A-TT-C-A--T--G-C--A-ATA---TACG-G-TC---AGTACTtgtt
gi|104272                     :   TGACC-TT----GA----C-CTT-TTT--CA--AAA---AGAC--------CTT--G--A-G-------AC--T-TT-TACCT-GAA---AC-C-CA-TGTTG-C---C-T-G-T----TA----A----T----T--A-TT-T-G--T--G-G----ATA---T-CC-A-TCTT-AATACTagt
gi|104275                     :   TGACC-TC----AA----C-C-T-TTA--CA--AAA---TGAC--------CTT--G--T-G----A-AA-----TT-TGCCA-GTT---AG-T-CA-T-TTG-C---C-T-A-T----TC----C----T----T--G-TT-T-G--T--G-G--A-ACA---TATG-A-TC---AATACtgtt
gi|104284                     :   TGACC-TT----------C-A-T-A-----A--AAA---TGAC--------CTT--G--A-G----T-GAC--C-TT-TGTTT-GAA---AG-T-CA-AATTG-C---C-G-A-T----CA----C----T----T--A-TT-T-G--T--G-T--G-ACA---AATG-A-TC---AATACctgtt
gi|104273                     :   TGACC-TT----GA----C-T-T---CA-CA--AAA---TGAC--------CTT-----A-A----T-CAC--C-TT-TGACT-AAA---TG-T-AA-T-TTGAC---T-T-GTT----TA----A----T----T--A-TA-T-G------------ATA---TATGAA-AC---AATACTctgtt
gi|104286                     :   TGACC-TC----GA----C-----------A--AAA---TGAC--------CTT--G--A-G----T-TAT--C-TT-TGACT-GAA---Agtt
gi|104276                     :    GACC-TC----AG----C-C-T-TTA--CA--AAA---TGAC--------CTT--G--A-G----T-GAC--C-TT-AGCCT-GTC---AG-T-CA-T-TTG-C---C-T-A-T----T
gi|104277                     :     ACC-TT----GA----C-G-T--TCA-CA--AAA---TGAC--------CTA--A--A-G----T-CAC--C-TT-TGACT-AAA---AAGT-AA-T-TTG-C---T-T-G-T----TA----A----T----TTAA-TT-T-A--T--G-T--G-ATA---TATG-A-TC---AGTACT
gi|104278                     :       C-TT----GA----C-C-C-TTC--CA--AAA---TAAC--------CAC--G--A-G----T-TAC--C-TT-TGTCT-GAA---AA-C-CA-T-TTG-C---T-T-G-T----TAGTTCC----T----T----TT-T-G--T--G------ATA---AATG-A-TC---AATACtgt
gi|104280                     :        -TT----AG----C-C-T--TC--CA--AAA---TGAC--------CTT--G--A-G----T-AAC--T-TA-TGCCA-GAG---AA-C-CA-T-TTG-C---A-G-G-T----TA----C----T----T--A-TT-T-G--T--T-G-------------G-A-TC---AATACTatgtt
gi|104281                     :          T----GA----C-C-T--TT--AA--GAA---TGAC--------CTT--G--A-G----T-AGC--T-TT-TACCT-GAA---AT-C-CA-T-TTG-C---C-T-G-T----TA----C----T----T--A-TT-T-G--T--G-G--G-ATA---CATC-T-TC---AATACTtatt
gi|104285                     :          T----GA----C-C-T-TTA--CA--AAA---TGAC--------CTT--G--A-G----T-CAC--C-TT-TGACT-GAA---GG-C-CA-T-TTC-A---C-T-T-T----TA----A----T----T--A-TT-T-G--T--C-C--ATATA---T-TG-ATTC---AATAtgtt
gi|104282                     :          T----GA----C-C-T-TTA--CA--AAA---TGAT--------CTT--A--A-G----T-GAC--C-TT-TATTT--AA---AG-C-TA-T-TT
gi|104288                     :                A----C-C-T-TTA--CA--AAA---TGAC--------CTT--G--T-G----T-GAC--C-TT-TGCCA-GTT---AG-T-CA-T-TTG-C---C-T-A-T----TC----C----T----T--G-TT-T-G--T--G-C--G-ACA---TATG-A-TC---AATACttgtgtgatatgacaaatacctgtt
gi|104289                     :                              --CA--AAA---TGAC--------CTT--G--A-G----T-CAT--C-TT-CGACT------------CA-T-TTG-C---C-T-G-T----TA----A----T----C--A-TT-T-G--T--G-C--A-ATA---CATA-A-TC---AGTACctgtt
gi|104292                     :                                    aAA---TGAC--------TTG--G--A-G----C-TAC--T-TT--GTCT-GAA---AG-C-CA-T-CTG-C---C-C-G-T----TA----T----T----T--A-TT-T-G--T--G-T--G-ATG---TAGG-A-TC---AATACctgtt
gi|104291                     :                                     AA---TGAC--------CTT--G--A-G----T-GAT--C-AT-TGTCT-GAC---AG-T-TA-T-TTG-C---T-T-A-T----TA----C----T----T--A-TT-C-A--T--G-T--G-ATA---CATG-A-TC---AATACTctgt
gi|104290                     :                                     AG---TGAC--------CTT--T--A-G----T-CAC--C-TT-TGACT-GAA---AG-C-CA-A-TTG-C---C-T-C-TAA--TA----C----C----T--A-TT-T-G--T--G-T--G-ACA---TATG-A-TT---AACACTtgtt
gi|104287                     :                                           GAC--------CTT--G--A-T----T-GAC--C-TT-TGTCC-GAA---AA-T-TA-T-T-G-C---------T----TA---------T----T--A-TT-T-G--T--G-T--G-ATG---TATG-A-TA---AATGCtatt
gi|104293                     :                                       tgaccttgagagactgcT--G--A-G----T-TAC--A-TT-TGTCT-AAA---AA-C-TA-T-TTC-C---A-T-G-T----TA----C----T----T--G-TT-T-G--T--G-T--G-ATA---TATG-A-CC---AATActgtt
gi|104279                     :                                                         tgcccc-G----T-GAC--G-TT-TGTCT-GAA---AA-C-TA-T-TTG-T---T-C-A-T----GA----C----A----T--A-TT-T-T--T--G-T--G-ATA---TACG-A-TC---AATACTattgct

Unaligned ( gi|104274 ): TGACCTTGACCTTCACAAAAATGACCTAAGTCGCCTTGAACTAAAAAAGTAAGTTTGAGGCTGAACTTATTATTAGTGAATAATAGATCAAATACTTGTT
Unaligned ( gi|104246 ): AGTGAGCGTTGACCTTCACAAGAAGTGAGCCTTTAAGGGTCACCTTTGGAGGCTAAAAGTAGATGTGCTGGTTAAGTCAGTTTAAGTTGTATATGGATCAATACT

lowQualScore                  :          2  1111  1111 0 0  0 222 0 11   222  00 0   11111111 222 00 0 0000 33   11 0 0  2222  11   000 0 0 0 0 0 1  00 0 000 0 00000 1111  33333 111 11 2222 00 0 0  33 33 0   11111  0 0 1 0  222      
lowQualScore                  :          .  ....  .... . .  . ... . ..   ...  .. .   ........ ... .. . .... ..   .. . .  ....  ..   ... . . . . . .  .. . ... . ..... ....  ..... ... .. .... .. . .  .. .. .   .....  . . . .  ...      
lowQualScore                  :          0  4444  6666 4 4  9 222 4 66   222  66 4   55555555 999 66 4 9999 88   00 4 9  4444  55   888 5 5 9 9 9 4  66 5 888 5 99999 7777  33333 444 99 1111 77 5 5  55 66 5   33333  5 5 6 5  777      
consensus                     :   AGTGACC-TT----GA----C-C-TT-TA--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-TGN---CT--GAA---A-G-C-C-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----TAC----T---T--A----T--T-T-GT--G-CG-ATA-----TA-T-G-A-TC---AATACT
Reference ( family-283 )      :   AGTGACC-TT----GA----C-C-TT-TN--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-TGN---CT--GAA---A-G-C-C-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----TAC----T---T--A----T--T-T-GT--G-NG-ATA-----TA-T-G-A-TC---AATACT
gi|104199                     :   AGTGACC-TT----GA----C-C-TT-CA--C-A--AAA---TG--A-CTT--------T---A--A-G----T-CACC--T-T-TGA---CT--AAA---A-G-T-A-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----TAA----T---T--A----T--A-T-AT--G-TG-ATA-----TA-T-G-A-TC---AATACT
gi|104200                     :   AGTGACC-CC----AA----A-C-TT-TA--C-T--AAA---TG--A-CCT--------T---G--T-A----T-GTCC--G-T-TGA---CA--GAT---A-G-T-C-A-C-TT--G-C---C-A-A---A----TCC----T---T--G----T--T-T-GT--G-CA-ATA-----TA-T-G-A-TC---AATACtgtt
gi|104201                     :   AGTGACC-GT----GA----C-C-TT-CA--C-A--AAA---TG--A-TCT--------T---G--A-G----T-CACA--T-T-TGA---CT--AAA---A-G-T-A-A-T-TT--G-C---T-T-G---T----TAA----T---T--A----T--T-T-AT--T-TG-ATA-----TA-T-G-A-TC---AATACTctg
gi|104202                     :   AGTGACC-TT----GA----C-C-TT-TA--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A--------AAGC--T-T-TGtgtt
gi|104203                     :   AGTGTCC-TT----GA----C-C-TT-CA--T-A--AAA---TG--A-CCT---------------A-G----T-CACC--T-C-TGA---CT--AAA---A-G-T-A-A-T-TT--G-C---T-T-G---T----TAA----T---T--A----T--T-T-AT--G-TG-ATA-----TA-T-G-A-TC---AATACT
gi|104204                     :   AGAGACC-TTAGTTGA----C-C-TT-CA--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---T--A-G----T-CACC--T-T-TGA---CT--AAA---A-G-T-A-A-T-TT--G-C---T-T-G---T----TAA----T---T--A----T--T-T-AT--G-TG-ATA-----TA-T-G-A-TT---AATACtgtt
gi|104205                     :   AGTGACC-TT----GA----C-C-TT-TC--A-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-AACT--T-T-AAC---CT--GAA---A-C-C-C-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----TAC----T---T--A----T--T-T-GT--G-GA-ATA-----CA-T-C-T-TC---AATAatgtt
gi|104206                     :   AGTGACC-TC----AA----C-C-TT-TA--A-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--T-G----T-GACC--T-T-CGC---CA--GTT---G-G-T-C-A-T-TG--G-C---C-T-A---T----TCC----T---T--G----T--T-T-GT--G-TG-ACT-----TA-T-G-A-TC---AATAattgtt
gi|104207                     :   AGTGAC--TT----G-----C-C-TT-CA--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---A--A-G----TCCACC--T-T-TGA---CT---AA---T-G-T-A-A-T-TT--G-C---T-T-G---T----TAA----T---T--A----T--T-TCAT--G-GG-ATA-----TA-T-GAA-TC---AATACTtctgtt
gi|104208                     :   AGTGACC-TT----GG----C-C-TT-TA--C-A--AAA---AG--A-CTT--------T---C--A-G----T-CACC--T-T-TGA---CT--GAA---A-G-C-C-A-T-TT--G-C---T-T-G---T----TAC----T---T--A----A--T-T-GT--G-TG-A-A-----TA-T-G-A-TC---AATATTtgtt
gi|104209                     :   AGTGACC-TT----GA----C-C-TT-TC--C-A--AAA---TG--A-CTT--------T---A--A-G----T-AACT--T-T-AGT---CT--GAA---A-A-C-T-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----TAT----A---T--A----T--T-T-GTG-G-AG-ATA-----TG-T-G-A-TC---AATAt
gi|104210                     :   AGTGACC-TT----GA----C----T-CA--C-A--AAA---TG--A-C-T--------T---A--A-G----T-CAC---T-T-TG----CT--ATA---G-A-T-G-A-TGTT--G-C---T-T-G---T----TAA----T---T--AA---T--T-T-AT--G-CG-ATA-----TA-T-G-A-TC---AATACTgttgct
gi|104211                     :   AGTGACC-TC----AA----T-C-CA-TA--C-AC-AAA---TG--A-CCT--------T---G--T-G----T-GACT--T-T-TGC---C----AAGTTA-G-T-C-A-T-TT--G-----C-T-A---T----T------T---T--G----T--T-T-GTG-G-CG-ACA-----TA-T-G-A-TC---AATACtg
gi|104212                     :   AATGACC-TT----GG----C------TG--T-G--A------G--A-CCG--------T---A--A-G----T-CACC--T-T-TGT---CT--AAA---A-G-T-A-A-T-TT--G-T---T-T-G---T----TAA----T---T--A----T--T-T-AT--G-TG-ATA-----TA-T-G-A-TC---AATACTctg
gi|104213                     :   AGTGACC-TT----GA----C-C-TT-TA--A-A--GAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----A-AACT--T-T-TAC---CT--GAA---A-C-C-C-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----TAC----T---T--A----T--T-T-GT--G-GG-ATA-----CA-T-C-T-TC---AATACTt
gi|104214                     :   AGCGACC-TC----AA----C-T-TT-TA--C-A--AAA---TG--A-CCTAGTCAAGTT---G--T-G----T-GACC--T-T-TGC---CA--GTT---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---C-A-A---A----TCC----T---T--G----T--T-T-GT--G-CG-ACA-----TA-C-G-A-TC---AATACtgtt
gi|104215                     :   AGTGACC-TT----GA----C-C-TA-TC--C-A--AAA---TG--A-CAT--------T---G--A-G----T-AACT--T-T-TGC---CT--GAA---A-A-C-C-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----TAC----T---T--A----T--T-T-GT--G-GA-ATA-----TA-T-G-A-TC---AATACTctgtt
gi|104216                     :   AATGACC-TT----GA----C-C-TT-TG--G-A--AAA---TG--A-CTT--------T---A--A-G----T-AACC--C-T-TGA---CT--GAA---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---C-T-C---T----TAC----TTAAT--A----T--T-T-GT--G-GG-ATA-----TA-T-G-A-TC---AGAACT
gi|104217                     :   AGTGAAC-CT----GA----C-C-TT-TA--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-AAAT--T-T-TTA---CT--AAA---A-T-C-C-A-T-TT--G-C---C-T-C---T----TTC----T---T--A----T--T-T-AT--T-TG-AAA-----TA-T-G-A-TC---AATACTtgtt
gi|104218                     :   AGTGAAC-CT----GA----C-C-TT-TTA-C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-GGTAAT-AATT--T-T-T-A---CT--AAA---A-T-CTC-A-T-TT--G-C---C-T-C---T----T-T----T---T--A----T--A-T-AT--T-TG-A-A-----AA-T-G-A-TC---AATACTtgtt
gi|104219                     :   AGTAACC-T-----GA----C---TT-TA--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--AGG----T-AA----T-T-TTA---CT--AAA---A-T-C-C-ATT-TT--G-C---C-T-C---T----TTC----T---T--A----TTAT-T-TT--G-AA-A-A-----TA-T-G-A-TC---AATACTtg
gi|104220                     :   AGTGACC-TT----AA----C-C-TT-TT--C-A--AAA---TG--A-CTA--------T---G--T-G----T-GACC--T-T-TGT---CT--GTT---A-A-T-C-A-T-TT--G-C---A-A-A---T----TCC----C---A--A----G--T-T-GT--G-CA-AAA-----TA-T-C-A-TC---AGTACgtt
gi|104221                     :   AGTAACC-TT----GA----C-G-TT-TA--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-TGT---CT--GAG---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---C-T-A---T----CACAAGAT---T-------T--T-T-GT--G-TG-ATA-----TA-T-G-A-TC---AATActgtt
gi|104222                     :   AGTAACC-TT----GA----C-G-TT-TA--C-A--AAA---TG--A-CC---------T---G--A-G----T--ACC--T-T-TGT---CT--GAG---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---C-T-A---T----CAC-----------AAGATT--T-T-GT--G-TG-ATA-----TA-T---A-TC---AATAtctatt
gi|104223                     :   AGTGACC-TT----AATTAAC-C-TT-TA--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-TGA---CT--GAA---C-A-C-C-A-T-TT--G-C---T-A-T---T----TAC----T---T--A----A--T-T-GT--G-CA-ATA-----TA-T-G-A-TC---AATAtctatt
gi|104224                     :   AGTGACC-TT----GA----C-C-TT-TC--C-G--AA----TG--A-CCT--------T---G--A-C----T--ATT--T-T-TGC---CT--GAA---A-T-T-C-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----TAT----T---T--A----T--T-T-GT--G-GA-ATA-----TA-T-G-A-TC---ATTACTactgtt
gi|104225                     :   AGTGACC-TT----GA----C-C-TT-TA--T-A--AAA---TT--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-TGT---CT--GAA---A-G-T-T-A-T-TT--G-C---C-T-A---T----TAC----T---T--A----C---------------ATG-----TA-T-A-A-TC---AATACtgtt
gi|104226                     :   AGTGACC-TT----GA----C-C-TT--A--C-A--AAA---TT--T-CCT--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-TGctgtt
gi|104227                     :   AGAGACC-CT----TA----C-C-TT-TA--C-A--AAA---TG--T-CCT--------T---G--A-G----T-AACT--T-T-TGA---CT--AAA---A-T-C-C-A-T-TT--G-C---C-T-C---T----TTC----T---T--A----T--T-T-GT--C-TG---A-----TA-T-G-A-TC---AATACT
gi|104228                     :   AGTGACC-TT----AT----C-C-TT-TT--C-A--AAA---TG--A-CTA--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-TGC---CT--GTA---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---C-A-A---T----TCC----T---A--A----G--T-T-GT--G-CA-AAA-----TA-T-C-A-TC---AGTACtgtt
gi|104229                     :   AGTGACC-TT----GA----C-C-TT-TC--C-A--AAAA--TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-AACT--T-T-TGC---CT--GAA---A-A-C-C-A-A-TA--G-C---C-T-G---T----TAC----T---T-------T--T-T-GT--G-GA-GTA-----TA-T-A-A-TC---AATACTctatt
gi|104230                     :   AGTGACC-TT----GA----C-C-TT-TA--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---A--G-G----T-CACT--T-T-TGA---CT--GAA---A-G-T-C-A-T-TT--G-C-----------------------------------T--T-T-AT--G-CG-GTATATATTA-T-G-A-CC---AATAtgtt
gi|104231                     :   AGTGACC-CC----CA----A-C-TTATG--A-A--AAA---TG--G-CCT--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-TGC---CT--GTT---A-G-T-G-A-T-TT--G-C---A-T-A---T----TCC----T---T--G----T--T----T--G-CG-ACA-----TA-T-G-A-TT---AATAC
gi|104232                     :   AGTGACCCTT----GA----C-C-TCATC--A-A--AAA---TG--A-CCT--------TT--A--A-G----T-CACC--T-TGTGA---CT--AAA---A-G-G---A-T-TT--G-C---T-T-G---T-----AA----T---C--A----T--T-A-CT--G----ATA-----TA-T-C-A-TC---AATACTcagtt
gi|104233                     :   AGTAACC-TT----GA----T-C-TT-TA--C-A--AAA---TT--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-TGC---CT--GAA---A-G-C-T-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----TAC----T---T--G----T--C------------ATA-----AA-C-A-A-TC---AACACTgtt
gi|104234                     :   AGTGACC-TT----GA----C---TT-CA--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-AACT--T-T-TAC---CT--GAA---A-C-C-C-A-T-TT--G-----C-T-A---T----TAA----TA--T--A----T--TGT-GT--G-GG--TA-----CA-T-C-T-TC---AATACTtgtt
gi|104235                     :   AGTGACC-TT----AA----C-C-TT-TA--T-A--ATA---TG--A-CCT--------C---G--A-G----A-GACC--T-T-TGT---CT--GAC---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---C-T-A---T----TAC----T---T--A----T--A-T-GT--G-TG-ACA-----TA-T-A-T-CC---AATACtgtt
gi|104236                     :   AGTAACC-TT----GA----T-A-TT-TC--C-A--TAA---AG----CCT--------TCC-G--A-G----T-CACC--T-T-TGA---AT--GAT---C-G-C-C-A-T-TT--G-C-----------------------T---T--A----T--T-T-GT--G-TG-AAA-----TA-T-G-A-TA---AATACTctgtt
gi|104237                     :   AGTAACC-TT----GA----T-A-TT-TC--C-ATTAAA-------G-CCT--------TCC-G--A-G----T-CACC--T-T-TGA---AT--GAT---C-G-C-C-A-T-TT--G-C-----------------------T---T--A----T--T-T-GT--G-TG-AAA-----TA-T-G-A-TA---AATACTtatt
gi|104238                     :   AGTAACC-TT----GA----T-A-TT-TC--C-ATTAAA-------G-CCT--------TCC-G--A-G----T-CACC--T-T-TGA---AT--GAT---C-G-C-C-A-T-TT--G-C-----------------------T---T--A----T--T-T-GT--G-TG-AAA-----TA-T-G-A-TA---AATACT
gi|104239                     :   AGTTACC-TT----GA----C-A-TG-TA--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---C--A-G----T-TACC--T-T--------T--GAG---A-G-C-A-A-T-TT--T-C---C-T-A---------------T---T--A----T--T-T-GT--G-CG-ATA-----TG-C-G-A-TC---AAAACT
gi|104240                     :   AGTGGCC-TC----AA----C-C-TT-AA--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-TACC--A-C-AGT---TT--GAA---C-T-C-C---T-TT--G-C---C-T-G---TTATATAC----T---T--A----T--T-T-GT--tgtt
gi|104241                     :   AGTGACC-TT----GA----C-C-TT-TT--C-A--AA----TG--A-CAT--------T---G--A-G----C-AACT--T-T-CGC---CT--GAA---A-T-T-C-A-T-TA--A-G---C-T-T---T----TAC----T---T--A----T--T-T-GT--G-GG-CTA-----TA-T-G-G-TC---AATACTta
gi|104242                     :   AGTGACCATT----G-------C-TG-TCATT-A--AAA---TG--A-CCT--------T---A--A-G----T-TACC--T-TGTGA----T--AAA---A-G-TAG-A-TGTT--G-A---T-T-G---T----TAA----T---T--A---------T-GT--ACTG-ATA-----TA-T-G-A-TC---tgtt
gi|104243                     :   AGTGACC-TT----GG----T-C-TA--A--C-C--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-AACT--T-T-TGC---CC--GAA---A-T-T-C-A-T-TT--G-C---C-T-G---------------------------T--T-T-GT--G-GA-CTA-----TA-T-G-A-TC---AGTACTtagcttgtt
gi|104244                     :   AGTGACC-TT----GA----C-C-TT-CA--C-A--AAA---TC--C-CCT--------T---G--A-G----T-AGCC--G-T-TGG---TT--GAA---A-A-T-C-A-T-TT--G-C---T-T-tgt
gi|104245                     :   AGTGACCGTT----GA----C-C-TT-TC--A-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-TAAC--TGT-TAC---CT--GAA---A-ACC-C-A-T-TT--G-CGGGC-T-A---T----TAA----T---T--A----T--T-T-GT--G-GG-ATA-----CA-T-
gi|104246                     :   AGTGAGCGTT----GA----C-C-TT-CA--C-A--AGAAG-TG--AGCCT--------TTAAG--G-G----T-CACC--T-T-TGGAGGCT--AAA---A-G-T-AGA-T-GT--G-C---T-G-G---T----TAAG---T---C--AG---T--T-T-AA--G-TT-GTA-----TA-T-GGA-TC---AATACTtctggtcgagatacttgtt
gi|104247                     :   AGTGACT-TT----GA----C-C-TT-TA--C-A--ATA---TG--G-CCT--------T---G--A-G----A-AACC--T-T-TGT---CT--GAT---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---C-T-C---T----TAC----T---TTAA----T--A-T-CT--G-TG-ATA-----TA-T-
gi|104248                     :   AGTGACC-TT----GA----C-C-TT-TC--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----A-GACC--T-T-
gi|104249                     :   AGTGACC-TC----AA----C-C-TT-TA--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GATC--T-T-TGC---CT--Ggatccacaaat
gi|104250                     :   AGTGACC-TC----AA----C-C-TT-TA--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GATC--T-T-TGC---CT--Gttaatcataatgtatgaacaatacatgtt
gi|104251                     :   AGTGACC-AT----GA----C-A-TC-CA--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACT--T-T-TAT---CT--GAA---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---ttaatcatacatgtatgaacaatacatgtt
gi|104252                     :   AGTGACC-CT----GA----C-C-TT-TC--C-A--AAA---TG--A-TCT--------T---G--A-G----A-GACC--T-T-GGT---CT--AAA---A-
gi|104253                     :   AGTGACC-TT----GA----C-C-TT-TA--A-A--AAA---TA--A-ACT--------T---G--A-G----A-GATC--T-T-TGT---AC--GAA---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---
gi|104254                     :   AGTGAGC-TC----AT----C-G-TT-TA--C-A--AAA---TG--A-ACT--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-TGC---CT--GTT---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----TCC----T---T--A----T--C-T-GT--T-TA-ACA-----TA-----A-TC---AATACacaatgattaataattt
gi|104255                     :   AGTGACC-CT----GA----C-C-AT------------A---TG--A-CCT--------T---G--A-T----T-CATC--T-T-TGA---CT--GAA---A-G-C-C-A-T-TT--G-C---T-T-G---T----ctgtt
gi|104256                     :   AGTGACT-CT----AA----C-T-GT-TA--C-A--TAA---TG--A-CTT--------T---G--T-C----T-GACC--T-T-TGC---CT--GTC---A-G-C-C-A-C-TT--G-C---C-T-A---T----TCC----T---T--A----T--T-T-GT--G-CG-ACA-----TA-T-G-A-TC---AATAC
gi|104257                     :   AGTTACC-TT----GA----C-C-TT-TA--C-A--ACA---TG--A-CCC--------T---G--A-G----C-GACCTTT-T-TAT---CT--GAG---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---CTT-A---T----TAC----T---T--A-------T-A-GT--G-----TA-----TG-T-G-A-TT---AATctgtt
gi|104258                     :   AGTGACC-TT----G-----C-C-CT-TA--C-A--AAC---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACC------TGT---CT--GAA---T-G-C-C-A-T-TT--A-C---C-T-G---T----TA
gi|104259                     :   AATGATC-TT----GA----C-C-TT-TA--C-A--ACA---TG--A-TCT--------A---G--A-G----T-GGCC--T-T-TGC---CT--GTT---A-G-T-C-A-T-TT--G-T---C-T-A---T----TTC----T---T--A----T--A-T-GT--G-CA-ACA-----TT-T-G-A-TC---AATA
gi|104260                     :   AGTGACC-TTT---GAAG--CAC-TT-TG--C-A--GAAAACTG--A-CCT--------T---ACTA-G----T-CACCA-G-T-TGA---CT--AAG---A-A-C-T-A-A-TT--G-C---T-TTG---T----TAA----T---T--G----T--T-T-AC--------TA-----TG-T-G-A-TC---AATAtctgtt
gi|104261                     :            T----GA----A-C-CT-TC--A-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-AACT--T-T-TAC---CT--GAA---ACT-C-C-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----TAA----T---T--A----T--T-T-GTAGG-GA-ATA-----CA-T-----TCTTAAATACT
gi|104262                     : agAGTGACC-C-----AA----C-C-TT-TA--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--T-G------GACC--T-T-TGC---CCA-GTT---A-G-T-C-A-C-TT--G-C---C-T-A---T----T-C----T---T--G----T--T-T-GT--G-AGAACA-----TA-T-G-A-TCA--AATAC
gi|104263                     :   AGTGACC-CT----GG----A-C-TT-TC--C-A--AAA---TG--A-CGT--------T---G--A-A----T-GACC--T-T-TGA---CT--GAA---A-A-A-C-A-T-ctg
gi|104264                     :   AGTAGCC-TT----GA----T-C-TC-TG--A-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACA--T-T-AGT---CT--GAA---A-A-C-C-A-T-TT--A-C---C-C-G---C----AGC----T---T--A----T--A-T-ATAGG-TG-ATA-----AA-T-G-A-CC---ATTAatttg
gi|104265                     :   AGTGACC-TT----GA----C-C-TT-TC--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-A----A-AACC--T-T-tctgtt
gi|104266                     :   AGTGACC-TT----AA----C-C-TT-TA--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---T--A-G----A-GACC--T-T-GGT---CC--GAA---A-----C-A-T-CA--A-T---C-T-G---T----
gi|104267                     :    GTGGCC-TT----GA----C-C-TT-TC--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---A--A-G----T-ATTT--T-T-TGC---CA--GAA---A-A-C-C-A-T-TT--G-T---C-T-G---T----TAC----T---T--A----T--T-T-GTG-G-GG-ATA-----TA-T-G-A-TC---AATACTcgaaatatgatatctaacaatctttg
gi|104268                     :    GTGGCC-TT----GA----C-C-TT-TC--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---A--A-G----T-ATTT--T-T-TGC---CA--GAA---A-A-C-C-A-T-TT--G-T---C-T-G---T----TAC----T---T--A----T--T-T-GTG-G-GG-ATA-----TA-T-G-A-TC---AATACTtgtt
gi|104269                     :    GTGACC-TT----GA----C-C-TT-TC--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----tgtt
gi|104270                     :     TGACT-TT----GA----C-C-TT-TT--A-A--AAA---TT--A-CCT--------T---G--A-G----T-AACT--T-T-TAC---CT--GAA---A-C-C-C-A---AT--G-G---C-T-G---T----TAA----T---T--A----T--T-T-GT--G-GG-ATA-----CA-T-C-A-TC---AATACT
gi|104271                     :     TGACC-TT----GA----C-C-TT-TC--A-A--AAA---TG--A-CCT--------T---A--A-G------AAAC--T-T-TAC---CT--GAA---A-C-C-C-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----TAA----T---T--A----T--T-T-GT--G-GG-ATA-----CA-T-C-T-TC---AATACTtgtt
gi|104272                     :     TGACC-TT----GA----C-CTTT-TT--C-A--AAA---AG--A-CCT--------T---G--A--------GACT--T-T-TAC---CT--GAA---A-C-C-C-A-TGTT--G-C---C-T-G---T----TAA----T---T--A----T--T-T-GT--G--G-ATA-----T--C-C-A-TCTT-AATACTtat
gi|104273                     :     TGACC-TT----GA----C---TT-CA--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T------A-A----T-CACC--T-T-TGA---CT--AAA---T-G-T-A-A-T-TT--GAC---T-T-G---T-----------T---T--A----A--T-T-AT--A-TG-ATA-----TA-T-GAA-AC---AATACTtgtt
gi|104274                     :     TGACC-TT----GA----C-C-TT-CA--CAA--AAA---TG--A-CC---------T---A--A-G----T-CGCC--T-T-GAA---CTAAAAA---A-G-T-A-AGT-TTGAG-G---C-T-GAACT----TA-----T---T--A----T--T-A-GT--G-A--ATA------A-TAG-A-TCA--AATACTgtt
gi|104275                     :     TGACC-TC----AA----C-C-TT-TA--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G---------T-GAAA--T-T-TGC---CA--GTT---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---C-T-A---T----TCC----T---T--G----T--T-T-GT--G-GA-ACA-----TA-T-G-A-TC---AATACtgtt
gi|104276                     :      GACC-TC----AG----C-C-TT-TA--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-AGC---CT--GTC---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---C-T-A---T----Tctgtt
gi|104277                     :       ACC-TT----GA----C-G-TT-CA--C-A--AAA---TG--A-CCT--------A---A--A-G----T-CACC--T-T-TGA---CTA-AAA---A-G-T-A-A-T-TT--G-C---T-T-G---T----TAA----T---TTAA----T--T-T-AT--G-TG-ATA-----TA-T-G-A-TC---AGTACT
gi|104278                     :         C-TT----GA----C-C-CT-TC--C-A--AAA---TA--A-CCA--------C---G--A-G----T-TACC--T-T-TGT---CT--GAA---A-A-C-C-A-T-TT--G-C---T-T-G---T----TAG----T---TC-C----T--T-T-TT--G-TG-ATA-----AA-T-G-A-TC---AATACtgt
gi|104279                     :         C-CT----GA----C-C-TT-TA--C-A--AG------------------------------G----T-GACG--T-T-TGT---CT--GAA---A-A-C-T-A-T-TT--G-T---T-C-A---T----GAC----A---T--A----T--T-T-TT--G-TG-ATA-----TA-C-G-A-TC---AATACTatgtt
gi|104280                     :                        -C-CT-TC--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-AACT--T-A-TGC---CA--GAG---A-A-C-C-A-T-TT--G-C---A-G-G---T----TAC----T---T--A----T--T-T-GT----TG--------------G-A-TC---AATACTtgtt
gi|104281                     :        ttagT----GA----C-C-TT-TA----A--GAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-AGCT--T-T-TAC---CT--GAA---A-T-C-C-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----TAC----T---T--A----T--T-T-GT--G-GG-ATA-----CA-T-C-T-TC---AATACTtatt
gi|104282                     :            T----GA----C-C-TT-TA--C-A--AAA---TG--A-TCT--------T---A--A-G----T-GACC--T-T-TAT---TT---AA---A-G-C-T-A-T-T-----------------------------------------T--T-T-GT--G-TG---A-----TA-T-G-A-CA---AATACtgtt
gi|104283                     :            T----GA----C-C-TT-GA--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---C--A-G----A-CACC--T-T-TGA---CT--GAA---A-G-C-C-A-T-TT--G-C---T-T-G---T----TAC----T---T--A----T--T-C-AT--G-CA-ATA-----TA-C-G-G-TC---AGTACTctgtt
gi|104284                     :            T----GA----C-C-TT-CA--T-A--AAAA--TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-TGT---TT--GAA---A-G-T-CAA-A-TT--G-C---C-G-A---T----CAC----T---T--A----T--T-T-GT--G-TG-ACA-----AA-T-G-A-TC---AATACagt
gi|104285                     :            T----GA----C-C-TT-TA--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-CACC--T-T-TGA---CT--GAA---G-G-C-C-A-T-TT--C-A---C-T-T---T----TAA----T---T--A----T--T-T-GT----CC-ATA-----TATT-G-ATTC---AATActgtt
gi|104286                     :            T----GA----C-C-TC-GA--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-TATC--T-T-TGA---CT--GAA---A-
gi|104287                     :            T----GA----C-C-TT-GA--G-A--GAC---TGCGA-CCT--------T---G--A-T----T-GACC--T-T-TGT---CC--GAA---A-A-T-T-A---TT--G-C-----------T----TA-----T---T--A----T--T-T-GT--G-TG-ATG-----TA-T-G-A-TA---AATGC
gi|104288                     :                  A----C-C-TT-TA--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--T-G----T-GACC--T-T-TGC---CA--GTT---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---C-T-A---T----TCC----T---T--G----T--T-T-GT--G-CG-ACA-----TA-T-G-A-TC---AATACctgtt
gi|104289                     :                                --C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-CATC--T-T-CGA---CT--------------C-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----TAA----T---C--A----T--T-T-GT--G-CA-ATA-----CA-T-A-A-TC---AGTACctgtt
gi|104290                     :                                       aAG---TG--A-CCT--------T---T--A-G----T-CACC--T-T-TGA---CT--GAA---A-G-C-C-A-A-TT--G-C---C-T-C---TAA--TAC----C---T--A----T--T-T-GT--G-TG-ACA-----TA-T-G-A-TT---AACACTctgtt
gi|104291                     :                                        AA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GATC--A-T-TGT---CT--GAC---A-G-T-T-A-T-TT--G-C---T-T-A---T----TAC----T---T--A----T--T-C-AT--G-TG-ATA-----CA-T-G-A-TC---AATACTtatt
gi|104292                     :                                        AA---TG--A-CTT--------G---G--A-G----C-TAC---T-T-TGT---CT--GAA---A-G-C-C-A-T-CT--G-C---C-C-G---T----TAT----T---T--A----T--T-T-GT--G-TG-ATG-----TA-G-G-A-TC---AATACtgtt
gi|104293                     :                                          ---TG--C-CCC--------T---G--A-G----T-TACA--T-T-TGT---CT--AAA---A-A-C-T-A-T-TT--C-C---A-T-G---T----TAC----T---T--G----T--T-T-GT--G-TG-ATA-----TA-T-G-A-CC---AATActgt

lowQualScore                  :        2  1111  1111 0 0 11 0 0  0 22   111  00 0   11111111 222 00 0 0000 33   11 0 0 000 1  11   000 0 0 1 0 0 1  00 0 000 0 00000 1111 3333333 111 11 2222 00 0 0  33 88 0 0  11111  0 1 1 0  222      
lowQualScore                  :        .  ....  .... . . .. . .  . ..   ...  .. .   ........ ... .. . .... ..   .. . . ... .  ..   ... . . . . . .  .. . ... . ..... .... ....... ... .. .... .. . .  .. .. . .  .....  . . . .  ...      
lowQualScore                  :        0  4444  6666 4 4 11 4 4  9 33   666  66 4   55555555 999 66 4 9999 88   00 4 9 888 6  55   888 5 5 4 5 9 4  66 5 888 5 99999 7777 1111111 444 99 1111 77 5 5  55 22 5 5  33333  5 0 1 5  777      
consensus                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-T---GNCT--GAA---A-G-C-C-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----T-AC----T---T--A----T--T-T-GT--GC-G-A-TA-----TA-T-G-A-TC---AATACT
Reference ( family-283 )      : AGTGACC-TT----GA----C-C-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-T---GNCT--GAA---A-G-C-C-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----T-AC----T---T--A----T--T-T-GT--GC-G-A-TA-----TA-T-G-A-TC---AATACT
gi|104199                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T--T-C-AC-A--AAA---TG--A-CTT--------T---A--A-G----T-CACC--T-T-T---GACT--AAA---A-G-T-A-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----T-AA----T---T--A----T--A-T-AT--GT-G-A-TA-----TA-T-G-A-TC---AATACT
gi|104200                     : AGTGACC-CC----AA----A-C-T--T-T-AC-T--AAA---TG--A-CCT--------T---G--T-A----T-GTCC--G-T-T---GACA--GAT---A-G-T-C-A-C-TT--G-C---C-A-A---A----T-CC----T---T--G----T--T-T-GT--GC-A-A-TA-----TA-T-G-A-TC---AATACtgtt
gi|104201                     : AGTGACC-GT----GA----C-C-T--T-C-AC-A--AAA---TG--A-TCT--------T---G--A-G----T-CACA--T-T-T---GACT--AAA---A-G-T-A-A-T-TT--G-C---T-T-G---T----T-AA----T---T--A----T--T-T-AT--TT-G-A-TA-----TA-T-G-A-TC---AATACTctg
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gi|104203                     : AGTGTCC-TT----GA----C-C-T--T-C-AT-A--AAA---TG--A-CCT---------------A-G----T-CACC--T-C-T---GACT--AAA---A-G-T-A-A-T-TT--G-C---T-T-G---T----T-AA----T---T--A----T--T-T-AT--GT-G-A-TA-----TA-T-G-A-TC---AATACT
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gi|104209                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T--T-T-CC-A--AAA---TG--A-CTT--------T---A--A-G----T-AACT--T-T-A---GTCT--GAA---A-A-C-T-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----T-AT----A---T--A----T--T-T-GTG-GA-G-A-TA-----TG-T-G-A-TC---AATAt
gi|104210                     : AGTGACC-TT----GA----C------T-C-AC-A--AAA---TG--A-C-T--------T---A--A-G----T-CAC---T-T-T---G-CT--ATA---G-A-T-G-A-TGTT--G-C---T-T-G---T----T-AA----T---T--AA---T--T-T-AT--GC-G-A-TA-----TA-T-G-A-TC---AATACTgttgct
gi|104211                     : AGTGACC-TC----AA----T-C-C--A-T-AC-AC-AAA---TG--A-CCT--------T---G--T-G----T-GACT--T-T-T---GCC----AAGTTA-G-T-C-A-T-TT--G-----C-T-A---T----T-------T---T--G----T--T-T-GTG-GC-G-A-CA-----TA-T-G-A-TC---AATACtg
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gi|104217                     : AGTGAAC-CT----GA----C-C-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-AAAT--T-T-T---TACT--AAA---A-T-C-C-A-T-TT--G-C---C-T-C---T----T-TC----T---T--A----T--T-T-AT--TT-G-A-AA-----TA-T-G-A-TC---AATACTtgtt
gi|104218                     : AGTGAAC-CT----GA----C-C-T--T-TTAC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-GGTAAT-AATT--T-T-T----ACT--AAA---A-T-CTC-A-T-TT--G-C---C-T-C---T----T--T----T---T--A----T--A-T-AT--TT-G-A--A-----AA-T-G-A-TC---AATACTtgtt
gi|104219                     : AGTAACC-T-----GA----C---T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--AGG----T-AA----T-T-T---TACT--AAA---A-T-C-C-ATT-TT--G-C---C-T-C---T----T-TC----T---T--A----TTAT-T-TT--GA-A-A--A-----TA-T-G-A-TC---AATACTtg
gi|104220                     : AGTGACC-TT----AA----C-C-T--T-T-TC-A--AAA---TG--A-CTA--------T---G--T-G----T-GACC--T-T-T---GTCT--GTT---A-A-T-C-A-T-TT--G-C---A-A-A---T----T-CC----C---A--A----G--T-T-GT--GC-A-A-AA-----TA-T-C-A-TC---AGTACgtt
gi|104221                     : AGTAACC-TT----GA----C-G-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-T---GTCT--GAG---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---C-T-A---T----C-ACAAGAT---T-------T--T-T-GT--GT-G-A-TA-----TA-T-G-A-TC---AATActgtt
gi|104222                     : AGTAACC-TT----GA----C-G-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-CC---------T---G--A-G----T--ACC--T-T-T---GTCT--GAG---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---C-T-A---T----C-AC-----------AAGATT--T-T-GT--GT-G-A-TA-----TA-T---A-TC---AATAtctatt
gi|104223                     : AGTGACC-TT----AATTAAC-C-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-T---GACT--GAA---C-A-C-C-A-T-TT--G-C---T-A-T---T----T-AC----T---T--A----A--T-T-GT--GC-A-A-TA-----TA-T-G-A-TC---AATAtctatt
gi|104224                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T--T-T-CC-G--AA----TG--A-CCT--------T---G--A-C----T--ATT--T-T-T---GCCT--GAA---A-T-T-C-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----T-AT----T---T--A----T--T-T-GT--GG-A-A-TA-----TA-T-G-A-TC---ATTACTactgtt
gi|104225                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T--T-T-AT-A--AAA---TT--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-T---GTCT--GAA---A-G-T-T-A-T-TT--G-C---C-T-A---T----T-AC----T---T--A----C---------------A-TG-----TA-T-A-A-TC---AATACtgtt
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gi|104228                     : AGTGACC-TT----AT----C-C-T--T-T-TC-A--AAA---TG--A-CTA--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-T---GCCT--GTA---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---C-A-A---T----T-CC----T---A--A----G--T-T-GT--GC-A-A-AA-----TA-T-C-A-TC---AGTACtgtt
gi|104229                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T--T-T-CC-A--AAAA--TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-AACT--T-T-T---GCCT--GAA---A-A-C-C-A-A-TA--G-C---C-T-G---T----T-AC----T---T-------T--T-T-GT--GG-A-G-TA-----TA-T-A-A-TC---AATACTctatt
gi|104230                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---A--G-G----T-CACT--T-T-T---GACT--GAA---A-G-T-C-A-T-TT--G-C------------------------------------T--T-T-AT--GC-G-G-TATATATTA-T-G-A-CC---AATAtgtt
gi|104231                     : AGTGACC-CC----CA----A-C-T--TAT-GA-A--AAA---TG--G-CCT--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-T---GCCT--GTT---A-G-T-G-A-T-TT--G-C---A-T-A---T----T-CC----T---T--G----T--T----T--GC-G-A-CA-----TA-T-G-A-TT---AATAC
gi|104232                     : AGTGACCCTT----GA----C-C-TCAT-C-A--A--AAA---TG--A-CCT--------TT--A--A-G----T-CACC--T-TGT---GACT--AAA---A-G-G---A-T-TT--G-C---T-T-G---T------AA----T---C--A----T--T-A-CT--G----A-TA-----TA-T-C-A-TC---AATACTcagtt
gi|104233                     : AGTAACC-TT----GA----T-C-T--T-T-AC-A--AAA---TT--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-T---GCCT--GAA---A-G-C-T-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----T-AC----T---T--G----T--C------------A-TA-----AA-C-A-A-TC---AACACTgtt
gi|104234                     : AGTGACC-TT----GA----C---T--T-C-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-AACT--T-T-T---ACCT--GAA---A-C-C-C-A-T-TT--G-----C-T-A---T----T-AA----TA--T--A----T--TGT-GT--G--G-G-TA-----CA-T-C-T-TC---AATACTtgtt
gi|104235                     : AGTGACC-TT----AA----C-C-T--T-T-AT-A--ATA---TG--A-CCT--------C---G--A-G----A-GACC--T-T-T---GTCT--GAC---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---C-T-A---T----T-AC----T---T--A----T--A-T-GT--GT-G-A-CA-----TA-T-A-T-CC---AATACtgtt
gi|104236                     : AGTAACC-TT----GA----T-A-T--T-T-CC-A--TAA---AG----CCT--------TCC-G--A-G----T-CACC--T-T-T---GAAT--GAT---C-G-C-C-A-T-TT--G-C------------------------T---T--A----T--T-T-GT--GT-G-A-AA-----TA-T-G-A-TA---AATACTctgtt
gi|104237                     : AGTAACC-TT----GA----T-A-T--T-T-CC-ATTAAA-------G-CCT--------TCC-G--A-G----T-CACC--T-T-T---GAAT--GAT---C-G-C-C-A-T-TT--G-C------------------------T---T--A----T--T-T-GT--GT-G-A-AA-----TA-T-G-A-TA---AATACTtatt
gi|104238                     : AGTAACC-TT----GA----T-A-T--T-T-CC-ATTAAA-------G-CCT--------TCC-G--A-G----T-CACC--T-T-T---GAAT--GAT---C-G-C-C-A-T-TT--G-C------------------------T---T--A----T--T-T-GT--GT-G-A-AA-----TA-T-G-A-TA---AATACT
gi|104239                     : AGTTACC-TT----GA----C-A-T--G-T-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---C--A-G----T-TACC--T-T--------T--GAG---A-G-C-A-A-T-TT--T-C---C-T-A----------------T---T--A----T--T-T-GT--GC-G-A-TA-----TG-C-G-A-TC---AAAACT
gi|104240                     : AGTGGCC-TC----AA----C-C-T--T-A-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-TACC--A-C-A---GTTT--GAA---C-T-C-C---T-TT--G-C---C-T-G---TTATAT-AC----T---T--A----T--T-T-GT--tgtt
gi|104241                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T--T-T-TC-A--AA----TG--A-CAT--------T---G--A-G----C-AACT--T-T-C---GCCT--GAA---A-T-T-C-A-T-TA--A-G---C-T-T---T----T-AC----T---T--A----T--T-T-GT--GG-G-C-TA-----TA-T-G-G-TC---AATACTta
gi|104242                     : AGTGACCATT----G-------C-TG-T-C-ATTA--AAA---TG--A-CCT--------T---A--A-G----T-TACC--T-TGT---GA-T--AAA---A-G-TAG-A-TGTT--G-A---T-T-G---T----T-AA----T---T--A---------T-GT--ACTG-A-TA-----TA-T-G-A-TC---tgtt
gi|104243                     : AGTGACC-TT----GG----T-C-T--A---AC-C--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-AACT--T-T-T---GCCC--GAA---A-T-T-C-A-T-TT--G-C---C-T-G----------------------------T--T-T-GT--G--G-ACTA-----TA-T-G-A-TC---AGTACTtagcttgtt
gi|104244                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T--T-C-AC-A--AAA---TC--C-CCT--------T---G--A-G----T-AGCC--G-T-T---GGTT--GAA---A-A-T-C-A-T-TT--G-C---T-T-tgt
gi|104245                     : AGTGACCGTT----GA----C-C-T--T-T-CA-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-TAAC--TGT-T---ACCT--GAA---A-ACC-C-A-T-TT--G-CGGGC-T-A---T----T-AA----T---T--A----T--T-T-GT--GG-G-A-TA-----CA-T-
gi|104246                     : AGTGAGCGTT----GA----C-C-T--T-C-AC-AAGAAG---TG--AGCCT--------TTAAG--G-G----T-CACC--T-T-TGGAGGCT--AAA---A-G-TAG-A-T-GT--G-C---T-G-G---T----TAAG----T---C--AG---T--T-T-AA--GT-T-G-TA-----TA-TGG-A-TC---AATACTtctggtcgagatacttgtt
gi|104247                     : AGTGACT-TT----GA----C-C-T--T-T-AC-A--ATA---TG--G-CCT--------T---G--A-G----A-AACC--T-T-T---GTCT--GAT---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---C-T-C---T----T-AC----T---TTAA----T--A-T-CT--GT-G-A-TA-----TA-T-
gi|104248                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T--T-T-CC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----A-GACC--T-T-
gi|104249                     : AGTGACC-TC----AA----C-C-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GATC--T-T-T---GCCT--Ggatccacaaat
gi|104250                     : AGTGACC-TC----AA----C-C-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GATC--T-T-T---GCCT--Gttaatcataatgtatgaacaatacatgtt
gi|104251                     : AGTGACC-AT----GA----C-A-T--C-C-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACT--T-T-T---ATCT--GAA---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---ttaatcatacatgtatgaacaatacatgtt
gi|104252                     : AGTGACC-CT----GA----C-C-T--T-T-CC-A--AAA---TG--A-TCT--------T---G--A-G----A-GACC--T-T-G---GTCT--AAA---A-
gi|104253                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T--T-T-AA-A--AAA---TA--A-ACT--------T---G--A-G----A-GATC--T-T-T---GTAC--GAA---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---
gi|104254                     : AGTGAGC-TC----AT----C-G-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-ACT--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-T---GCCT--GTT---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----T-CC----T---T--A----T--C-T-GT--TT-A-A-CA-----TA-----A-TC---AATACacaatgattaataattt
gi|104255                     : AGTGACC-CT----GA----C-C-A--T-----------A---TG--A-CCT--------T---G--A-T----T-CATC--T-T-T---GACT--GAA---A-G-C-C-A-T-TT--G-C---T-T-G---T----ctgtt
gi|104256                     : AGTGACT-CT----AA----C-T-G--T-T-AC-A--TAA---TG--A-CTT--------T---G--T-C----T-GACC--T-T-T---GCCT--GTC---A-G-C-C-A-C-TT--G-C---C-T-A---T----T-CC----T---T--A----T--T-T-GT--GC-G-A-CA-----TA-T-G-A-TC---AATAC
gi|104257                     : AGTTACC-TT----GA----C-C-T--T-T-AC-A--ACA---TG--A-CCC--------T---G--A-G----C-GACCTTT-T-T---ATCT--GAG---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---CTT-A---T----T-AC----T---T--A-------T-A-GT--G------TA-----TG-T-G-A-TT---AATctgtt
gi|104258                     : AGTGACC-TT----G-----C-C-C--T-T-AC-A--AAC---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACC------T---GTCT--GAA---T-G-C-C-A-T-TT--A-C---C-T-G---T----T-A
gi|104259                     : AATGATC-TT----GA----C-C-T--T-T-AC-A--ACA---TG--A-TCT--------A---G--A-G----T-GGCC--T-T-T---GCCT--GTT---A-G-T-C-A-T-TT--G-T---C-T-A---T----T-TC----T---T--A----T--A-T-GT--GC-A-A-CA-----TT-T-G-A-TC---AATA
gi|104260                     : AGTGACC-TTT---GAAG--CAC-T--T-T-GC-A--GAAAACTG--A-CCT--------T---ACTA-G----T-CACCA-G-T-T---GACT--AAG---A-A-C-T-A-A-TT--G-C---T-TTG---T----T-AA----T---T--G----T--T-T-AC---------TA-----TG-T-G-A-TC---AATAtctgtt
gi|104261                     : AGTGA----------A----C-C-T--T-C-A--A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-AACT--T-T-T---ACCT--GAA---ACT-C-C-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----T-AA----T---T--A----T--T-T-GTAGGG-A-A-TA-----CA-T-----TCTTAAATACT
gi|104262                     : AGTGACC-C-----AA----C-C-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--T-G------GACC--T-T-T---GCCCA-GTT---A-G-T-C-A-C-TT--G-C---C-T-A---T----T--C----T---T--G----T--T-T-GT--GA-GAA-CA-----TA-T-G-A-TCA--AATAC
gi|104263                     : AGTGACC-CT----GG----A-C-T--T-T-CC-A--AAA---TG--A-CGT--------T---G--A-A----T-GACC--T-T-T---GACT--GAA---A-A-A-C-A-T-ctg
gi|104264                     : AGTAGCC-TT----GA----T-C-T--C-T-GA-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACA--T-T-A---GTCT--GAA---A-A-C-C-A-T-TT--A-C---C-C-G---C----A-GC----T---T--A----T--A-T-ATAGGT-G-A-TA-----AA-T-G-A-CC---ATTAatttg
gi|104265                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T--T-T-CC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-A----A-AACC--T-T-tctgtt
gi|104266                     : AGTGACC-TT----AA----C-C-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---T--A-G----A-GACC--T-T-G---GTCC--GAA---A-----C-A-T-CA--A-T---C-T-G---T----
gi|104267                     :  GTGGCC-TT----GA----C-C-T--T-T-CC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---A--A-G----T-ATTT--T-T-T---GCCA--GAA---A-A-C-C-A-T-TT--G-T---C-T-G---T----T-AC----T---T--A----T--T-T-GTG-GG-G-A-TA-----TA-T-G-A-TC---AATACTcgaaatatgatatctaacaatctttg
gi|104268                     :  GTGGCC-TT----GA----C-C-T--T-T-CC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---A--A-G----T-ATTT--T-T-T---GCCA--GAA---A-A-C-C-A-T-TT--G-T---C-T-G---T----T-AC----T---T--A----T--T-T-GTG-GG-G-A-TA-----TA-T-G-A-TC---AATACTtgtt
gi|104269                     :  GTGACC-TT----GA----C-C-T--T-T-CC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----tgtt
gi|104270                     :   TGACT-TT----GA----C-C-T--T-T-TA-A--AAA---TT--A-CCT--------T---G--A-G----T-AACT--T-T-T---ACCT--GAA---A-C-C-C-A---AT--G-G---C-T-G---T----T-AA----T---T--A----T--T-T-GT--GG-G-A-TA-----CA-T-C-A-TC---AATACT
gi|104271                     :   TGACC-TT----GA----C-C-T--T-T-CA-A--AAA---TG--A-CCT--------T---A--A-G------AAAC--T-T-T---ACCT--GAA---A-C-C-C-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----T-AA----T---T--A----T--T-T-GT--GG-G-A-TA-----CA-T-C-T-TC---AATACTtgtt
gi|104272                     :   TGACC-TT----GA----C-CTT--T-T-TC-A--AAA---AG--A-CCT--------T---G--A--------GACT--T-T-T---ACCT--GAA---A-C-C-C-A-TGTT--G-C---C-T-G---T----T-AA----T---T--A----T--T-T-GT--G--G-A-TA-----T--C-C-A-TCTT-AATACTtat
gi|104273                     :   TGACC-TT----GA----C---T--T-C-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T------A-A----T-CACC--T-T-T---GACT--AAA---T-G-T-A-A-T-TT--GAC---T-T-G---T------------T---T--A----A--T-T-AT--AT-G-A-TA-----TA-T-GAA-AC---AATACTtgtt
gi|104274                     :   TGACC-TT----GA----C-C-T--T-C-ACAA--AAA---TG--A-CC---------T---A--A-G----T-CGCC--T-T-G---AACTAAAAA---A-G-T-A-AGT-TTGAG-G---C-T-GAACT----T-A-----T---T--A----T--T-A-GT--G--A-A-TA------A-TAG-A-TCA--AATACTgtt
gi|104275                     :   TGACC-TC----AA----C-C-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G---------T-GAAA--T-T-T---GCCA--GTT---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---C-T-A---T----T-CC----T---T--G----T--T-T-GT--GG-A-A-CA-----TA-T-G-A-TC---AATACtgtt
gi|104276                     :    GACC-TC----AG----C-C-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-A---GCCT--GTC---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---C-T-A---T----T-ctgtt
gi|104277                     :     ACC-TT----GA----C-G-T--T-C-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------A---A--A-G----T-CACC--T-T-T---GACTA-AAA---A-G-T-A-A-T-TT--G-C---T-T-G---T----T-AA----T---TTAA----T--T-T-AT--GT-G-A-TA-----TA-T-G-A-TC---AGTACT
gi|104278                     :       C-TT----GA----C-C-C--T-T-CC-A--AAA---TA--A-CCA--------C---G--A-G----T-TACC--T-T-T---GTCT--GAA---A-A-C-C-A-T-TT--G-C---T-T-G---T----T-AG----T---TC-C----T--T-T-TT--GT-G-A-TA-----AA-T-G-A-TC---AATACtgt
gi|104279                     :       C-CT----GA----C-C-T--T-T-AC-A--A-----------------------------G-G----T-GACG--T-T-T---GTCT--GAA---A-A-C-T-A-T-TT--G-T---T-C-A---T----G-AC----A---T--A----T--T-T-TT--GT-G-A-TA-----TA-C-G-A-TC---AATACTatgtt
gi|104280                     :        -TT----AG----C-C-T--T-C--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-AACT--T-A-T---GCCA--GAG---A-A-C-C-A-T-TT--G-C---A-G-G---T----T-AC----T---T--A----T--T-T-GT---T-G---------------G-A-TC---AATACTtgtt
gi|104281                     :          T----GA----C-C-T--T-T-A--A--GAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-AGCT--T-T-T---ACCT--GAA---A-T-C-C-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----T-AC----T---T--A----T--T-T-GT--GG-G-A-TA-----CA-T-C-T-TC---AATACTtatt
gi|104282                     :          T----GA----C-C-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-TCT--------T---A--A-G----T-GACC--T-T-T---ATTT---AA---A-G-C-T-A-T-T------------------------------------------T--T-T-GT--GT-G----A-----TA-T-G-A-CA---AATACtgtt
gi|104283                     :          T----GA----C-C-T--T-G-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---C--A-G----A-CACC--T-T-T---GACT--GAA---A-G-C-C-A-T-TT--G-C---T-T-G---T----T-AC----T---T--A----T--T-C-AT--GC-A-A-TA-----TA-C-G-G-TC---AGTACTctgtt
gi|104284                     :          T----GA----C-C-T--T-C-AT-A--AAAA--TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-T---GTTT--GAA---A-G-T-CAA-A-TT--G-C---C-G-A---T----C-AC----T---T--A----T--T-T-GT--GT-G-A-CA-----AA-T-G-A-TC---AATACagt
gi|104285                     :          T----GA----C-C-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-CACC--T-T-T---GACT--GAA---G-G-C-C-A-T-TT--C-A---C-T-T---T----T-AA----T---T--A----T--T-T-GT---C-C-A-TA-----TATT-G-ATTC---AATActgtt
gi|104286                     :          T----GA----C-C-T--C-G-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-TATC--T-T-T---GACT--GAA---A-
gi|104287                     :          T----GA----C-C-T--T-G-AG-A--GAC---TGCGA-CCT--------T---G--A-T----T-GACC--T-T-T---GTCC--GAA---A-A-T-T-A---TT--G-C-----------T----T-A-----T---T--A----T--T-T-GT--GT-G-A-TG-----TA-T-G-A-TA---AATGC
gi|104288                     :                A----C-C-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--T-G----T-GACC--T-T-T---GCCA--GTT---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---C-T-A---T----T-CC----T---T--G----T--T-T-GT--GC-G-A-CA-----TA-T-G-A-TC---AATACctgtt
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gi|104290                     :                                       AG---TG--A-CCT--------T---T--A-G----T-CACC--T-T-T---GACT--GAA---A-G-C-C-A-A-TT--G-C---C-T-C---TAA--T-AC----C---T--A----T--T-T-GT--GT-G-A-CA-----TA-T-G-A-TT---AACACTctgtt
gi|104291                     :                                       AA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GATC--A-T-T---GTCT--GAC---A-G-T-T-A-T-TT--G-C---T-T-A---T----T-AC----T---T--A----T--T-C-AT--GT-G-A-TA-----CA-T-G-A-TC---AATACTtatt
gi|104292                     :                                       AA---TG--A-CTT--------G---G--A-G----C-TAC---T-T-T---GTCT--GAA---A-G-C-C-A-T-CT--G-C---C-C-G---T----T-AT----T---T--A----T--T-T-GT--GT-G-A-TG-----TA-G-G-A-TC---AATACtgtt
gi|104293                     :                                         ---TG--C-CCC--------T---G--A-G----T-TACA--T-T-T---GTCT--AAA---A-A-C-T-A-T-TT--C-C---A-T-G---T----T-AC----T---T--G----T--T-T-GT--GT-G-A-TA-----TA-T-G-A-CC---AATActgt

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lowQualScore                  :        .  ....  .... . . .. . .  . ..   ...  .. .   ........ ... .. . .... ..   .. . . ... .  ..   ... . . . . . .  .. . ... . ..... .... ....... ... .. .... .. . .  .. .. . .  .....  . . . .  ...      
lowQualScore                  :        0  4444  6666 4 4 11 4 4  9 33   666  66 4   55555555 999 66 4 9999 88   00 4 9 888 6  55   888 5 5 4 5 9 4  66 5 888 5 99999 7777 1111111 444 99 1111 77 5 5  55 22 5 5  33333  5 0 1 5  777      
consensus                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-T---GNCT--GAA---A-G-C-C-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----T-AC----T---T--A----T--T-T-GT--GC-G-A-TA-----TA-T-G-A-TC---AATACT
Reference ( family-283 )      : AGTGACC-TT----GA----C-C-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-T---GNCT--GAA---A-G-C-C-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----T-AC----T---T--A----T--T-T-GT--GC-G-A-TA-----TA-T-G-A-TC---AATACT
gi|104199                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T--T-C-AC-A--AAA---TG--A-CTT--------T---A--A-G----T-CACC--T-T-T---GACT--AAA---A-G-T-A-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----T-AA----T---T--A----T--A-T-AT--GT-G-A-TA-----TA-T-G-A-TC---AATACT
gi|104200                     : AGTGACC-CC----AA----A-C-T--T-T-AC-T--AAA---TG--A-CCT--------T---G--T-A----T-GTCC--G-T-T---GACA--GAT---A-G-T-C-A-C-TT--G-C---C-A-A---A----T-CC----T---T--G----T--T-T-GT--GC-A-A-TA-----TA-T-G-A-TC---AATACtgtt
gi|104201                     : AGTGACC-GT----GA----C-C-T--T-C-AC-A--AAA---TG--A-TCT--------T---G--A-G----T-CACA--T-T-T---GACT--AAA---A-G-T-A-A-T-TT--G-C---T-T-G---T----T-AA----T---T--A----T--T-T-AT--TT-G-A-TA-----TA-T-G-A-TC---AATACTctg
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gi|104203                     : AGTGTCC-TT----GA----C-C-T--T-C-AT-A--AAA---TG--A-CCT---------------A-G----T-CACC--T-C-T---GACT--AAA---A-G-T-A-A-T-TT--G-C---T-T-G---T----T-AA----T---T--A----T--T-T-AT--GT-G-A-TA-----TA-T-G-A-TC---AATACT
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gi|104209                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T--T-T-CC-A--AAA---TG--A-CTT--------T---A--A-G----T-AACT--T-T-A---GTCT--GAA---A-A-C-T-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----T-AT----A---T--A----T--T-T-GTG-GA-G-A-TA-----TG-T-G-A-TC---AATAt
gi|104210                     : AGTGACC-TT----GA----C------T-C-AC-A--AAA---TG--A-C-T--------T---A--A-G----T-CAC---T-T-T---G-CT--ATA---G-A-T-G-A-TGTT--G-C---T-T-G---T----T-AA----T---T--AA---T--T-T-AT--GC-G-A-TA-----TA-T-G-A-TC---AATACTgttgct
gi|104211                     : AGTGACC-TC----AA----T-C-C--A-T-AC-AC-AAA---TG--A-CCT--------T---G--T-G----T-GACT--T-T-T---GCC----AAGTTA-G-T-C-A-T-TT--G-----C-T-A---T----T-------T---T--G----T--T-T-GTG-GC-G-A-CA-----TA-T-G-A-TC---AATACtg
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gi|104222                     : AGTAACC-TT----GA----C-G-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-CC---------T---G--A-G----T--ACC--T-T-T---GTCT--GAG---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---C-T-A---T----C-AC-----------AAGATT--T-T-GT--GT-G-A-TA-----TA-T---A-TC---AATAtctatt
gi|104223                     : AGTGACC-TT----AATTAAC-C-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-T---GACT--GAA---C-A-C-C-A-T-TT--G-C---T-A-T---T----T-AC----T---T--A----A--T-T-GT--GC-A-A-TA-----TA-T-G-A-TC---AATAtctatt
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gi|104225                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T--T-T-AT-A--AAA---TT--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-T---GTCT--GAA---A-G-T-T-A-T-TT--G-C---C-T-A---T----T-AC----T---T--A----C---------------A-TG-----TA-T-A-A-TC---AATACtgtt
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gi|104240                     : AGTGGCC-TC----AA----C-C-T--T-A-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-TACC--A-C-A---GTTT--GAA---C-T-C-C---T-TT--G-C---C-T-G---TTATAT-AC----T---T--A----T--T-T-GT--tgtt
gi|104241                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T--T-T-TC-A--AA----TG--A-CAT--------T---G--A-G----C-AACT--T-T-C---GCCT--GAA---A-T-T-C-A-T-TA--A-G---C-T-T---T----T-AC----T---T--A----T--T-T-GT--GG-G-C-TA-----TA-T-G-G-TC---AATACTta
gi|104242                     : AGTGACCATT----G-------C-TG-T-C-ATTA--AAA---TG--A-CCT--------T---A--A-G----T-TACC--T-TGT---GA-T--AAA---A-G-TAG-A-TGTT--G-A---T-T-G---T----T-AA----T---T--A---------T-GT--ACTG-A-TA-----TA-T-G-A-TC---tgtt
gi|104243                     : AGTGACC-TT----GG----T-C-T--A---AC-C--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-AACT--T-T-T---GCCC--GAA---A-T-T-C-A-T-TT--G-C---C-T-G----------------------------T--T-T-GT--G--G-ACTA-----TA-T-G-A-TC---AGTACTtagcttgtt
gi|104244                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T--T-C-AC-A--AAA---TC--C-CCT--------T---G--A-G----T-AGCC--G-T-T---GGTT--GAA---A-A-T-C-A-T-TT--G-C---T-T-tgt
gi|104245                     : AGTGACCGTT----GA----C-C-T--T-T-CA-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-TAAC--TGT-T---ACCT--GAA---A-ACC-C-A-T-TT--G-CGGGC-T-A---T----T-AA----T---T--A----T--T-T-GT--GG-G-A-TA-----CA-T-
gi|104246                     : AGTGAGCGTT----GA----C-C-T--T-C-AC-AAGAAG---TG--AGCCT--------TTAAG--G-G----T-CACC--T-T-TGGAGGCT--AAA---A-G-TAG-A-T-GT--G-C---T-G-G---T----TAAG----T---C--AG---T--T-T-AA--GT-T-G-TA-----TA-TGG-A-TC---AATACTtctggtcgagatacttgtt
gi|104247                     : AGTGACT-TT----GA----C-C-T--T-T-AC-A--ATA---TG--G-CCT--------T---G--A-G----A-AACC--T-T-T---GTCT--GAT---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---C-T-C---T----T-AC----T---TTAA----T--A-T-CT--GT-G-A-TA-----TA-T-
gi|104248                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T--T-T-CC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----A-GACC--T-T-
gi|104249                     : AGTGACC-TC----AA----C-C-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GATC--T-T-T---GCCT--Ggatccacaaat
gi|104250                     : AGTGACC-TC----AA----C-C-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GATC--T-T-T---GCCT--Gttaatcataatgtatgaacaatacatgtt
gi|104251                     : AGTGACC-AT----GA----C-A-T--C-C-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACT--T-T-T---ATCT--GAA---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---ttaatcatacatgtatgaacaatacatgtt
gi|104252                     : AGTGACC-CT----GA----C-C-T--T-T-CC-A--AAA---TG--A-TCT--------T---G--A-G----A-GACC--T-T-G---GTCT--AAA---A-
gi|104253                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T--T-T-AA-A--AAA---TA--A-ACT--------T---G--A-G----A-GATC--T-T-T---GTAC--GAA---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---
gi|104254                     : AGTGAGC-TC----AT----C-G-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-ACT--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-T---GCCT--GTT---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----T-CC----T---T--A----T--C-T-GT--TT-A-A-CA-----TA-----A-TC---AATACacaatgattaataattt
gi|104255                     : AGTGACC-CT----GA----C-C-A--T-----------A---TG--A-CCT--------T---G--A-T----T-CATC--T-T-T---GACT--GAA---A-G-C-C-A-T-TT--G-C---T-T-G---T----ctgtt
gi|104256                     : AGTGACT-CT----AA----C-T-G--T-T-AC-A--TAA---TG--A-CTT--------T---G--T-C----T-GACC--T-T-T---GCCT--GTC---A-G-C-C-A-C-TT--G-C---C-T-A---T----T-CC----T---T--A----T--T-T-GT--GC-G-A-CA-----TA-T-G-A-TC---AATAC
gi|104257                     : AGTTACC-TT----GA----C-C-T--T-T-AC-A--ACA---TG--A-CCC--------T---G--A-G----C-GACCTTT-T-T---ATCT--GAG---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---CTT-A---T----T-AC----T---T--A-------T-A-GT--G------TA-----TG-T-G-A-TT---AATctgtt
gi|104258                     : AGTGACC-TT----G-----C-C-C--T-T-AC-A--AAC---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACC------T---GTCT--GAA---T-G-C-C-A-T-TT--A-C---C-T-G---T----T-A
gi|104259                     : AATGATC-TT----GA----C-C-T--T-T-AC-A--ACA---TG--A-TCT--------A---G--A-G----T-GGCC--T-T-T---GCCT--GTT---A-G-T-C-A-T-TT--G-T---C-T-A---T----T-TC----T---T--A----T--A-T-GT--GC-A-A-CA-----TT-T-G-A-TC---AATA
gi|104260                     : AGTGACC-TTT---GAAG--CAC-T--T-T-GC-A--GAAAACTG--A-CCT--------T---ACTA-G----T-CACCA-G-T-T---GACT--AAG---A-A-C-T-A-A-TT--G-C---T-TTG---T----T-AA----T---T--G----T--T-T-AC---------TA-----TG-T-G-A-TC---AATAtctgtt
gi|104261                     : AGTGA----------A----C-C-T--T-C-A--A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-AACT--T-T-T---ACCT--GAA---ACT-C-C-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----T-AA----T---T--A----T--T-T-GTAGGG-A-A-TA-----CA-T-----TCTTAAATACT
gi|104262                     : AGTGACC-C-----AA----C-C-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--T-G------GACC--T-T-T---GCCCA-GTT---A-G-T-C-A-C-TT--G-C---C-T-A---T----T--C----T---T--G----T--T-T-GT--GA-GAA-CA-----TA-T-G-A-TCA--AATAC
gi|104263                     : AGTGACC-CT----GG----A-C-T--T-T-CC-A--AAA---TG--A-CGT--------T---G--A-A----T-GACC--T-T-T---GACT--GAA---A-A-A-C-A-T-ctg
gi|104264                     : AGTAGCC-TT----GA----T-C-T--C-T-GA-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACA--T-T-A---GTCT--GAA---A-A-C-C-A-T-TT--A-C---C-C-G---C----A-GC----T---T--A----T--A-T-ATAGGT-G-A-TA-----AA-T-G-A-CC---ATTAatttg
gi|104265                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T--T-T-CC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-A----A-AACC--T-T-tctgtt
gi|104266                     : AGTGACC-TT----AA----C-C-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---T--A-G----A-GACC--T-T-G---GTCC--GAA---A-----C-A-T-CA--A-T---C-T-G---T----
gi|104267                     :  GTGGCC-TT----GA----C-C-T--T-T-CC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---A--A-G----T-ATTT--T-T-T---GCCA--GAA---A-A-C-C-A-T-TT--G-T---C-T-G---T----T-AC----T---T--A----T--T-T-GTG-GG-G-A-TA-----TA-T-G-A-TC---AATACTcgaaatatgatatctaacaatctttg
gi|104268                     :  GTGGCC-TT----GA----C-C-T--T-T-CC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---A--A-G----T-ATTT--T-T-T---GCCA--GAA---A-A-C-C-A-T-TT--G-T---C-T-G---T----T-AC----T---T--A----T--T-T-GTG-GG-G-A-TA-----TA-T-G-A-TC---AATACTtgtt
gi|104269                     :  GTGACC-TT----GA----C-C-T--T-T-CC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----tgtt
gi|104270                     :   TGACT-TT----GA----C-C-T--T-T-TA-A--AAA---TT--A-CCT--------T---G--A-G----T-AACT--T-T-T---ACCT--GAA---A-C-C-C-A---AT--G-G---C-T-G---T----T-AA----T---T--A----T--T-T-GT--GG-G-A-TA-----CA-T-C-A-TC---AATACT
gi|104271                     :   TGACC-TT----GA----C-C-T--T-T-CA-A--AAA---TG--A-CCT--------T---A--A-G------AAAC--T-T-T---ACCT--GAA---A-C-C-C-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----T-AA----T---T--A----T--T-T-GT--GG-G-A-TA-----CA-T-C-T-TC---AATACTtgtt
gi|104272                     :   TGACC-TT----GA----C-CTT--T-T-TC-A--AAA---AG--A-CCT--------T---G--A--------GACT--T-T-T---ACCT--GAA---A-C-C-C-A-TGTT--G-C---C-T-G---T----T-AA----T---T--A----T--T-T-GT--G--G-A-TA-----T--C-C-A-TCTT-AATACTtat
gi|104273                     :   TGACC-TT----GA----C---T--T-C-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T------A-A----T-CACC--T-T-T---GACT--AAA---T-G-T-A-A-T-TT--GAC---T-T-G---T------------T---T--A----A--T-T-AT--AT-G-A-TA-----TA-T-GAA-AC---AATACTtgtt
gi|104274                     :   TGACC-TT----GA----C-C-T--T-C-ACAA--AAA---TG--A-CC---------T---A--A-G----T-CGCC--T-T-G---AACTAAAAA---A-G-T-A-AGT-TTGAG-G---C-T-GAACT----T-A-----T---T--A----T--T-A-GT--G--A-A-TA------A-TAG-A-TCA--AATACTgtt
gi|104275                     :   TGACC-TC----AA----C-C-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G---------T-GAAA--T-T-T---GCCA--GTT---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---C-T-A---T----T-CC----T---T--G----T--T-T-GT--GG-A-A-CA-----TA-T-G-A-TC---AATACtgtt
gi|104276                     :    GACC-TC----AG----C-C-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-A---GCCT--GTC---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---C-T-A---T----T-ctgtt
gi|104277                     :     ACC-TT----GA----C-G-T--T-C-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------A---A--A-G----T-CACC--T-T-T---GACTA-AAA---A-G-T-A-A-T-TT--G-C---T-T-G---T----T-AA----T---TTAA----T--T-T-AT--GT-G-A-TA-----TA-T-G-A-TC---AGTACT
gi|104278                     :       C-TT----GA----C-C-C--T-T-CC-A--AAA---TA--A-CCA--------C---G--A-G----T-TACC--T-T-T---GTCT--GAA---A-A-C-C-A-T-TT--G-C---T-T-G---T----T-AG----T---TC-C----T--T-T-TT--GT-G-A-TA-----AA-T-G-A-TC---AATACtgt
gi|104279                     :       C-CT----GA----C-C-T--T-T-AC-A--A-----------------------------G-G----T-GACG--T-T-T---GTCT--GAA---A-A-C-T-A-T-TT--G-T---T-C-A---T----G-AC----A---T--A----T--T-T-TT--GT-G-A-TA-----TA-C-G-A-TC---AATACTatgtt
gi|104280                     :        -TT----AG----C-C-T--T-C--C-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-AACT--T-A-T---GCCA--GAG---A-A-C-C-A-T-TT--G-C---A-G-G---T----T-AC----T---T--A----T--T-T-GT---T-G---------------G-A-TC---AATACTtgtt
gi|104281                     :          T----GA----C-C-T--T-T-A--A--GAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-AGCT--T-T-T---ACCT--GAA---A-T-C-C-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----T-AC----T---T--A----T--T-T-GT--GG-G-A-TA-----CA-T-C-T-TC---AATACTtatt
gi|104282                     :          T----GA----C-C-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-TCT--------T---A--A-G----T-GACC--T-T-T---ATTT---AA---A-G-C-T-A-T-T------------------------------------------T--T-T-GT--GT-G----A-----TA-T-G-A-CA---AATACtgtt
gi|104283                     :          T----GA----C-C-T--T-G-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---C--A-G----A-CACC--T-T-T---GACT--GAA---A-G-C-C-A-T-TT--G-C---T-T-G---T----T-AC----T---T--A----T--T-C-AT--GC-A-A-TA-----TA-C-G-G-TC---AGTACTctgtt
gi|104284                     :          T----GA----C-C-T--T-C-AT-A--AAAA--TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-T---GTTT--GAA---A-G-T-CAA-A-TT--G-C---C-G-A---T----C-AC----T---T--A----T--T-T-GT--GT-G-A-CA-----AA-T-G-A-TC---AATACagt
gi|104285                     :          T----GA----C-C-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-CACC--T-T-T---GACT--GAA---G-G-C-C-A-T-TT--C-A---C-T-T---T----T-AA----T---T--A----T--T-T-GT---C-C-A-TA-----TATT-G-ATTC---AATActgtt
gi|104286                     :          T----GA----C-C-T--C-G-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-TATC--T-T-T---GACT--GAA---A-
gi|104287                     :          T----GA----C-C-T--T-G-AG-A--GAC---TGCGA-CCT--------T---G--A-T----T-GACC--T-T-T---GTCC--GAA---A-A-T-T-A---TT--G-C-----------T----T-A-----T---T--A----T--T-T-GT--GT-G-A-TG-----TA-T-G-A-TA---AATGC
gi|104288                     :                A----C-C-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--T-G----T-GACC--T-T-T---GCCA--GTT---A-G-T-C-A-T-TT--G-C---C-T-A---T----T-CC----T---T--G----T--T-T-GT--GC-G-A-CA-----TA-T-G-A-TC---AATACctgtt
gi|104289                     :                               -AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-CATC--T-T-C---GACT--------------C-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----T-AA----T---C--A----T--T-T-GT--GC-A-A-TA-----CA-T-A-A-TC---AGTACctgtt
gi|104290                     :                                       AG---TG--A-CCT--------T---T--A-G----T-CACC--T-T-T---GACT--GAA---A-G-C-C-A-A-TT--G-C---C-T-C---TAA--T-AC----C---T--A----T--T-T-GT--GT-G-A-CA-----TA-T-G-A-TT---AACACTctgtt
gi|104291                     :                                       AA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GATC--A-T-T---GTCT--GAC---A-G-T-T-A-T-TT--G-C---T-T-A---T----T-AC----T---T--A----T--T-C-AT--GT-G-A-TA-----CA-T-G-A-TC---AATACTtatt
gi|104292                     :                                       AA---TG--A-CTT--------G---G--A-G----C-TAC---T-T-T---GTCT--GAA---A-G-C-C-A-T-CT--G-C---C-C-G---T----T-AT----T---T--A----T--T-T-GT--GT-G-A-TG-----TA-G-G-A-TC---AATACtgtt
gi|104293                     :                                         ---TG--C-CCC--------T---G--A-G----T-TACA--T-T-T---GTCT--AAA---A-A-C-T-A-T-TT--C-C---A-T-G---T----T-AC----T---T--G----T--T-T-GT--GT-G-A-TA-----TA-T-G-A-CC---AATActgt


blockSeqs                     :        C  AGTT  TTAA     CA        TT   AAC         AGTCAAGT TAA           CC   TT         A  AA           T     G                   TATA ACAAGA  TAA TA AGAT         AG CT      TATAT    G A    TTA
blockSeqs                     :        A  T     AG       G         TT   A           .        CC            G    A          A  A            A     G                   AA   AAG     A   TA A            AG C       .        A A    TT 
blockSeqs                     :        G  .     .        .         AG   A           .        CC            C    .          A  A            A     G                   .    CC      .   C  G            G  T       .        . .    A  
blockSeqs                     :        G  .     .        .         C    .           .        CC            A    .          A  .            .     .                   .    AA      .   .  .            G  T       .        . .    A  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        T             C    .          C  .            .     .                   .    AA      .   .  .            G  T       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             C    .          C  .            .     .                   .    AA      .   .  .            G  G       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             A    .          A  .            .     .                   .    AC      .   .  .            .  T       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          A  .            .     .                   .    CC      .   .  .            .  G       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             C    .          T  .            .     .                   .    AA      .   .  .            .  T       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             A    .          C  .            .     .                   .    AC      .   .  .            .  A       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             C    .          T  .            .     .                   .    AT      .   .  .            .  C       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          C  .            .     .                   .    AA      .   .  .            .  C       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             C    .          C  .            .     .                   .    AA      .   .  .            .  T       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             A    .          C  .            .     .                   .    AC      .   .  .            .  G       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          A  .            .     .                   .    CC      .   .  .            .  C       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             A    .          A  .            .     .                   .    AC      .   .  .            .  G       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             A    .          A  .            .     .                   .    AC      .   .  .            .  G       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             A    .          A  .            .     .                   .    TC      .   .  .            .  T       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             A    .          T  .            .     .                   .    TC      .   .  .            .  T       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             A    .          T  .            .     .                   .    CC      .   .  .            .  A       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          T  .            .     .                   .    AC      .   .  .            .  C       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          A  .            .     .                   .    AC      .   .  .            .  T       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          C  .            .     .                   .    AT      .   .  .            .  T       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          T  .            .     .                   .    AC      .   .  .            .  C       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          A  .            .     .                   .    TC      .   .  .            .  G       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             A    .          C  .            .     .                   .    CC      .   .  .            .  T       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          C  .            .     .                   .    AC      .   .  .            .  C       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             A    .          A  .            .     .                   .    CC      .   .  .            .  G       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             C    .          C  .            .     .                   .    AA      .   .  .            .  C       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          A  .            .     .                   .    AC      .   .  .            .  C       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             C    .          C  .            .     .                   .    AA      .   .  .            .  T       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          C  .            .     .                   .    AC      .   .  .            .  T       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             A    .          T  .            .     .                   .    AC      .   .  .            .  T       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          A  .            .     .                   .    AC      .   .  .            .  T       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             C    .          A  .            .     .                   .    AA      .   .  .            .  C       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             C    .          A  .            .     .                   .    AA      .   .  .            .  G       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             C    .          T  .            .     .                   .    AC      .   .  .            .  G       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             T    .          C  .            .     .                   .    CC      .   .  .            .  T       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             T    .          A  .            .     .                   .    CC      .   .  .            .  T       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             A    .          C  .            .     .                   .    AC      .   .  .            .  T       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             T    .          G  .            .     .                   .    TC      .   .  .            .  C       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             A    .          C  .            .     .                   .    AA      .   .  .            .  C       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             A    .          G  .            .     .                   .    AA      .   .  .            .  G       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             T    .          T  .            .     .                   .    GC      .   .  .            .  A       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             C    .          C  .            .     .                   .    AC      .   .  .            .  T       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             A    .          C  .            .     .                   .    AC      .   .  .            .  G       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          T  .            .     .                   .    AA      .   .  .            .  G       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          T  .            .     .                   .    AA      .   .  .            .  G       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          T  .            .     .                   .    AA      .   .  .            .  G       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          C  .            .     .                   .    CC      .   .  .            .  T       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          A  .            .     .                   .    AA      .   .  .            .  G       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          C  .            .     .                   .    AG      .   .  .            .  T       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          T  .            .     .                   .    AC      .   .  .            .  T       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             C    .          T  .            .     .                   .    AC      .   .  .            .  T       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          C  .            .     .                   .    AC      .   .  .            .  T       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          A  .            .     .                   .    AC      .   .  .            .  G       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          C  .            .     .                   .    AC      .   .  .            .  T       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          C  .            .     .                   .    AA      .   .  .            .  C       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             C    .          A  .            .     .                   .    CC      .   .  .            .  T       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             A    .          T  .            .     .                   .    AA      .   .  .            .  C       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          T  .            .     .                   .    AC      .   .  .            .  T       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          C  .            .     .                   .    AC      .   .  .            .  C       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          C  .            .     .                   .    AT      .   .  .            .  C       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             A    .          C  .            .     .                   .    AC      .   .  .            .  T       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          C  .            .     .                   .    T       .   .  .            .  T       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             A    .          C  .            .     .                   .    C       .   .  .            .  T       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             A    .          A  .            .     .                   .    A       .   .  .            .  T       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             A    .          A  .            .     .                   .    A       .   .  .            .  .       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             A    .          C  .            .     .                   .    .       .   .  .            .  .       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          C  .            .     .                   .    .       .   .  .            .  .       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             C    .          A  .            .     .                   .    .       .   .  .            .  .       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             C    .          T  .            .     .                   .    .       .   .  .            .  .       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          T  .            .     .                   .    .       .   .  .            .  .       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          C  .            .     .                   .    .       .   .  .            .  .       .        . .    .  
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             C    .          C  .            .     .                   .    .       .   .  .            .  .       .        .         
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             T    .          T  .            .     .                   .    .       .   .  .            .  .       .        .         
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          A  .            .     .                   .    .       .   .  .            .                             
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             A    .          T  .            .     .                   .                                                              
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             A    .          A  .            .     .                   .                                                              
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             G    .          A  .            .     .                   .                                                              
blockSeqs                     :        .  .     .        .         .    .           .        .             C    .          T  .            .     .                   .                                                              
blockSeqs                     :           .     .        .         .    .           .        .             G    .          C  .            .     .                                                                                  
blockSeqs                     :           .     .        .         .    .           .        .             C    .          A  .            .     .                                                                                  
blockSeqs                     :           .     .        .         .    .           .        .             T    .          A  .            .     .                                                                                  
blockSeqs                     :           .     .        .         .    .           .        .             G    .          T  .            .     .                                                                                  
blockSeqs                     :           .     .        .         .    .           .        .             G    .          T  .                                                                                                     
blockSeqs                     :           .     .        .         .    .           .        .             C    .          T  .                                                                                                     
blockSeqs                     :           .     .        .         .    .           .        .             C    .          .  .                                                                                                     
blockSeqs                     :                 .        .         .    .           .        .             G    .          .  .                                                                                                     
blockSeqs                     :                                    .    .           .        .             T    .                                                                                                                   
blockSeqs                     :                                         .           .        .             T    .                                                                                                                   
blockSeqs                     :                                         .           .        .             .    .                                                                                                                   
blockSeqs                     :                                         .           .        .             .    .                                                                                                                   
blockSeqs                     :                                         .           .        .                                                                                                                                      


blockSeqCons                  : 
originalCons                  : AGTGACC-TT----GA----C-C-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-T---GNCT--GAA---A-G-C-C-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----T-AC----T---T--A----T--T-T-GT--GC-G-A-TA-----TA-T-G-A-TC---AATACT
finalCons                     : AGTGACC-TT----GA----C-C-T--T-T-AC-A--AAA---TG--A-CCT--------T---G--A-G----T-GACC--T-T-T---GNCT--GAA---A-G-C-C-A-T-TT--G-C---C-T-G---T----T-AC----T---T--A----T--T-T-GT--GC-G-A-TA-----TA-T-G-A-TC---AATACT