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lowQualScore                  :                     ..      .   ...  ...   .  .  . .. .. . ..  ..  . .  . .. . ...  .. ... ... ...   .. ...... ...............................    . . . ................... .. .  . ..  . . . .... ... ..... ... ... .  .. ... . ........ ............ . . ..... . .. .... .....  ... .. .  .  .   ... ....  ... . ... .  . . . .   
lowQualScore                  :                     88      8   333  888   5  5  5 33 11 9 55  66  4 4  9 66 4 666  77 111 000 666   22 777777 0000000000000000000000000000000    9 3 4 4444444444444444444 66 4  4 44  8 8 4 9999 999 00000 777 777 2  44 333 4 99999999 222222222222 4 4 66666 8 00 9999 77777  444 00 9  4  3   000 1111  888 5 444 5  5 0 5 5   
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Reference ( gi|31259 )        :                 AACATTAAATTG-TTC-G-TA---CAG-GT-GA-G-TC--A-T--GA--GG-C-CC-A--C-A---GG--C--TT-A-TA--TCT--T------GC----TA---C------A----G-T-TA---GATA-G-A-T----G---T-A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C-A----A-A-T-----T---T---T-GT--T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-A-C-G--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31261                      :                 AACATTAAATTG-TTC-G-TA---CAG-GT-GA-G-CCG-A-T--GA--GG-C-CC-A--C-----GG--C--TT-A-TA--TCT--T------GA----TA---C------A----G-T-TA---GATA-G-A-T----G---T-A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C-A----A-ATT-----T---T---T-GTA-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-A-C-G--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31260                      :                 AACATTAAATTG-TTC-G-TA---CAG--T-GA-G-CC--A-T--GA--G--C-CC-A--C-A---GG--C--TT-A-TA--TCT--T------GA----TA---C------A----G-T-TA---GATA-G-A-T----G---T-A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C-A----A-A-T-----T---T---T-GT--T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG--TT-A-C-G--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31262                      :                 AACATTAAATTG-TTC-G-TA---AAG-GT-GA-G-CC--A-T--GA--GG-C-CC-A--C-A---GG--C--TT-A-TA--TCT--T------GA----TA---C------A----G-T-TA---GATA-G-A-T----G---T-A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-A-A----A-A-A-----T---T---T-GT--T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-A-C-
gi|31264                      :                 AACATTAAATTG-TTC-G-TA---CAGCGT-GA-G-CC--A-T--GA--GG-C-CC-A--C-A---GG--C--TT-A-TA--TCC--T-------C----TATA-C------A----G-T-TA---GATA-G-A-T----G---T-A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT------T-A--------C------------A-T-G-----T-C-------T---A-A----A--A-AA-TG-TTT-A-C-G--A----T-A---A-AG-A-G-T-TA
gi|31267                      :                 AACATTAAATTG-TCC-G-TA---CAG-GT-CA-G-CC--ATT--GA--GG-C-CC-A--C-A----G--C--TT-A-TA--TCT--T------G-----TA---C------AG---G-T-TA---GATA-G-A------G---T-A-G-T----A--A-AT-T--AA-ACC-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---C-AC---A--ACAA-TG-TTT-T-C-G---G---T-A---A-AG-A-G-T-TAatga
gi|31283                      :                 AACATTAA--TG-TTC-G-TA---CAC-GC-TA----C--A-T--GA--GG-C-C-------A---GG--C--TT-A-TA--TCT--T------GA----TA---C------A----G-T-TA---GATA-G-A-T----G---T-A-G-TAA--A--A-AC-T--AA-A-C-A----A-A-T-----T---T---T-GT--T-ATT-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T----------A--A-AA-TG-TTT-A-C-G--AG---T-A--------A-G-T-TAT
gi|31268                      :                 AACACTAAATCA-TTC-A-TA---CAG-GT-AA-G-CC--A-T--AA--GG-C-CC-A--C-A---GG--T--TT-A-TA--TCT--T------G--------------------------------------A-T----C---T-A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-A-A-A--------T------------A-T-G-----T-T--T----T---A-AC---A--A-AA-TA-TTT-T-C-A--AG---T-A---A-AG-A-G-T-AAT
gi|31254                      :                 AAAATTAAATTG-TCC-G-TA---CAG-GT-TA-G-CC--A-T--GA--G----CC-A------------------------TGT--T------GAA---TA---C------A----G-T-TA---AGTA-G-A-T----G---T-A-G-T-ATAA--A-AC-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA--G-TTT-T-C-G--AG---TAA---A-AG-A-G-T-
gi|31265                      :                 AACACTAAATCG-TCT-G-TA---CAG-GT-GA-G-CC--A-T--TA--GG-C-CT-G--T-A---GA--C--CT-T-TA--T-----------GA----TA---C------G----G-T-TC---GATA-G-A-C----C---T-A-G-C-A--A--A-AC-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-A-A-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TC-TTT-T-C-A--TT---T-A---A-CG-A-G-T-TATagaatattgat
gi|31263                      :                 AACAC--AATCA-TCT-G-TA---CAG-GT-GA-G-CC--A-T--TA--GG-C-CT-G--C-A---GG--C--CT-T-TA-------T------GA----TA---C------G----G-T-TT---GATA-G-A-C----C---T-A-G-C----A--A-AT-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-A-T-A--------C------------A-T-ACATGTT-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T-C-A--TT---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31250                      :                 AACAC-AAATCA-TCT-G-TA---CAG-GT-GA-G-CC--A-T--TATAGG-C-CT-G--C-A---GG--C--CT-T-TA--T-----------GA----TA---C------G----G-T-TT---GATA-G-A-C----CC--T-A-G-C-A--A--A-AT-T--AA-AAC-A----A-C-A-----T---T---T-GT--T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T-C-A--TT---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31237                      : aaaaaattaaaattgcAACA--AAATTGATTC---TC---CAG-GC-TA-G-CG--A-T--GA--AG-C-CC-A--C-A---GGGCC--TT---T---TCT--T------GA----TAT--C------A----A-T-C----GATA-G-A-T----C---T-T-G-A-T--A--A-AC-T--TA-A-C-A----A-G-T-----T---T---T-GT--T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---T-AC---A--A-AA-TA-TTT-A-C-C--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31244                      :           ccaaaaAACA--AAATTGATTC-T-CG---CAG-GC--A-G-CC--A-T--GA--AG-C-CC-A--C-A---GGG-C--TT--------TT--T------GA----TA---T------A----A-C-T----GATA-G-A-T----C---T-T-G-A-T--A--A-AC-T--GA-A-C-A----A-G-T-----T---T-----GT--T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---T-AC---A--A-AA-TA-TTT-A-C-C--AG---T-----A-AG-A-G-T-Ttgat
gi|31251                      :           ccaaaaAACA--AAATTGATTC---TC---CAG-G---A-G-CC--A-T--GA--AG-C-CC-A--C-A---GGGCC--TT---T---TCT--T------GA----TAT--C------A----A-T-TA----ATA-C-A-C----T---C-G-A-T----T--A-AC-T--GA-A-C-A----A-G-T-----T---T---T-GT--T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---T-AC---A--A-AA-TA-TTT-A-C-C--AG---T-A---A-AG-A-GCT-TATttga
gi|31266                      :              aaaAACACTAAATCG-TCT-G-TA---CAG-GT-GA-G-CC--A-T--TA--GG-C-CT-G--T-A---GA--C--CT-T-TA-------T------GA----TA---C------G----GTT-TC---GATA-GAA-C----C---T-A-G-C----A--A-AC-T--AA-A-C------A-A-C-----T---T---T-GT--T-A---A---------------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC------A-AA-TC-TTT-T-C-A--TT---T-A---A-CG-A-G-T-TATtgat
gi|31242                      :                 AACACAAAATTGATTC---TC---CAG-GC-TA-G-GA--A-T--GA--AG-C-CC-G--C-G---GGGCC--TT---T---TCT--T------GA----TA-----------------T-TAATCGATA-G-A-T----C---T-T-G-A-T--A--A-AC-T--GA-A-C-A----C-G-T-----T---T---T-GC--T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---T-AC---A--A-AA-CA-TTT-A-C-C--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31238                      :             ccatAACA--AAATTG-ATT-A-TC---AAA-GC-TA-G-CC--A-T--GA--AG-C-CC-A--T-AT--GA--C--CT-T-T---TCG--T------GA----TAT--C------A----A-T-C----GATA-G-A-T----C---T-T-G-A-T--A--A-AC-A--GA-A-C-A----A-G-T-----T---T---T-GT--T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---T-AC---A--A-AA-TA-TTT-A-T-C--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TATtgat
gi|31253                      :           ccaaaaAAAACTAAATCG-TCT-G-TA---CAG-GT-GA-G-CC--A-T--GA--GG-C-CC-A--A-G---AG--C--CA-A-TT--TCT--T------GA----CA---T------G----G-T-TC---AAAA-G-A-TC---C---T-G-G-T-A--A--ACCC-T-----A-C-A----T-A-T-----T---T---T-GT--T-A-T-A--------G------------A-T-G-----C-A--T----T---T-AC---A--A-AA-TA-TTT-tgat
gi|31270                      :                 AACACTAAATTG-TCT-G-CG---CAT-GT-GA-G-CC--A-T--GA--TG-C-CC-A--T-G---GG--C--AT-A-TT--TTT--T------GA----TA---T------T----G-T-AA---TATA-G-A-T----C---T-C-A-C-A--A--A-GT-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-C-A-A--------T------------A-T-G-----T-C--T----T---ctcataaaaaagataattga
gi|31243                      :                 AACA--AAATTGATTC---TC---CAG-GC-TA-G-CC--A-T--GA--AG-C-CC-A--C-A---GGGCC--TT---T---TCT--T------GA----TAT--C------A----A-T-GA----AGA-G-C-T----C---T-A---T----A--A-AC-T---G-A-C-A----A-G-T-----T---T---T-GT--T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----------AC---A--A-AA-TA--TT-A-C-C--AG---T-AAG-A-AG-A-G-T-TAT
gi|31239                      :           ccaaaaAACA--AAATTG-ATT-A-TC---AAA-GC-TA-G-CC--A-T--GA--AG-C-CC-A--T-AT--GA--C--CT-T-T---TCG--T------GA----TAT--C------A----A-T-C----GATA-G-A-T----C---T-T-G-A-T--A--A-AC-A--GA-A-C-A----A-G-T-----T---T---T-GT--T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---T-AC------A-AA-TA-TTT-A-C-A--AG---T-C---A-AG-A-G-T-TATtgat
gi|31240                      :           ccaaaaAACA--AAATTGATTC---TC---CAG-GC-TA-G-CC--A-T--GA--AG-C-CC-A--C-A---GGGCC--TT---T---TCT--C------GA----TAT--C------A----A-T-CA---AA-A-G-A-T----C---T-T-G-A-T--A--A-AC-T--GA-A-C-A----A-G-T-----T---T---T-GT--T--------------C------------A-T-A-----T-C--T----T------CTTTT--A-AA-TA--TT-A-C-GCCAG---T-A---A-AG-A-G-T-TAtgat
gi|31249                      :           ccaaaaAACA--AAATT--TTC-G--ATCTCCG-GT--A-G-CC--A-TC-GA--AG-C-CC-A--C-A---GGGCC--TT-T-TA--T----T------GT----TATATC------A----A-T-T----GATA-G-A-T----C---T-T-GAT-A--A--C-AC-T--GA-A-C-A----A-G-T-----TGGTT---T-GT--T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-T--T----T---ctgat
gi|31247                      :              aaaaACACAAAATCGATTC-C-TC---CAG-GT-GA-G-CC--A-G--GA--GG-TGCT-A--C-G---GC--C--TT-T-TC--T-T--T------GA----TA-----------------T-CA---AATGCG-A-T----ACCTT-G-A-A-A--A--A-AT-G--AA-A-C-A----C-T-T-----T---T---T-GT--T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---C-AC---A--A-AA-AA-TTT-A-C-G--AG---T-A---A-AG-A-G-T-T
gi|31248                      :               aagACACAAAATCGACTC---TC---CAG-GTTGA-G-CC--A-TC-GA--GG-C-CCTG--T-G---GG--C--CT-T-TT--TCT--TT-----GA----TAT--C------A----A-T-T----GATA-G-A-C----C---T-T-GAT-A--A--A-TG-A--AA-A-C-A----C-A-G-----T---C---T-TT--T-T-C-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---C-AC---A--A-AA-TA-TTT-A-C-G---G---A-A---A-AG-A-G-T-T
gi|31294                      :                 aagATTGAATCA-TCC-G-TA---CAG-GT-GA-G-CC--A-T--GA--GG-C-CC-A--C-A---GG--C--TT-A-TA--TCC--T------GCATGATA---T------G----G-T-TA---GAAA-G-A-T----T---T-A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-A-T-ATATACATGT------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-A-T-G--AA---T-A---
gi|31273                      :                    ACTAAATTG-TCT-G-TG---CAG-AT-GA-G-CC--A-T--GA--GG-C-CC-A--T-G---GG--C--GT-A-TT--TTT--T------GA----TA---T------T----G-T------AATA-T-A-T----A---T-C-A-C-ACGA--A-AT-T--GA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-C-A-A--------A------------A-T-G-----T-T--T----T---A-AC---A--G-AA-TA-TCT-ACC-G--AG---T-ATACA-AG-A-A-T-TATgtgatatt
gi|31255                      :                      TAGATCT-TCC-G-TT---C-G-AT-TA-G-CC--A-T--GA--GG-C-CC-A--C-AG--GG--C--TT---TT--TCT--TA-----AT----TT---T------A----A-T-C----GATA-G-A-T----C---T-T-G-A-T--A--A-AC-T--GA-A-C-A----A-G-T-----T---T---T-GT--T-C-TAA--------C------------A-T-G-------C--T----T---T-AC---A--A-AA-TA-TTT-A-C-C--AG---T-C---A-AG-A-G-T-T
gi|31285                      :             aagcaacgagAAATTG-TTC-GTTA---CAG-TT-GA-G-CC--A-T--GA---G-C-CC-A--C-A---GG--C--TC-A-TA--TCT--T------GA----TA---C------A----G-T-TA---GATA-G-A-T----G---T-ATG-T-A--A--A-AC-T--AACA-C-A----A-A-T-----T---T---T-TT--T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTA-A-C----AG---T-A---A-AG-A-G-T-TATctttgat
gi|31287                      :                       AAATTG-TCC-G-TA---CAG-GT-GA-G-CC--A-T--GA--GG-C-CC-A--C-A---GG--C--TT-A-TA--TCT--T------GA----TA---C------A----G-T--------------------------------A--A--A-AC-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T-T-G--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31286                      :                       AAATCG-TTC-G-TA---CAG-GT--A-G-CC--A-T--AA--GG-C-CC-A--T-G---GG--G--TT-A-TA--T-T--T------GA----TA---C------A------T-TA---GATA-G-A-C----C---T-A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GA--T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T-C-G--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31291                      :                       AAATTG-TCC-G-TA---CAG-GT-GA-G-CC--A-C--AA--GG-C-CT-G--C-A---GG--C--CT-A-TA--TCT--T------GA----TA---C------G----G-T-AA---GATA-G-A-T----T---T-A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C-A----A-T-T-----T---T---T-GT--T-T-T-A--------T------------A-T-A-----T-C--T----T---A-AG---A--A-AA-
gi|31288                      :                       AAATTG-TCC-G-TA---CAG-GT-GA-G-CC--A-T--GA--GG-C-C--A--C-A---GG--C--TTTA-TA--TCT--T---------------------------------------------A-T----A---C-A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C-A----A-CTT-----T---T---T-GT--T-A---A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---T-AC---A--A-AA-TGTTTT-T-T-G--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TATgagtta
gi|31289                      :                       AAATTG-TCC-G-TA---CAG-GT-GA-G-CC--A-T--GA--GG---CC-A--C-A---GG--C--TT-A-TA--TCT--T---------------------------------------------A-T----A---C-A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C-A----A-CTT-----T---T---T-GT------T-A--------C------------A-T-G-----T-T--T----T-----AC---A--A-AA-TGTTTT-T-T-G--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31284                      :                       AAATTG-TCCTA-TA---CAG-GT-GA-G-CC--A----GA--GA-C-CC-A--C-A---GG--A--CT-A-TA--TCT--TTT----GA----TA---C------A----ACT-TA---GATA-GCA-T----G---T-A-G-TTA--A--A-AA-T--AA-A---A----A-T-T-----T---T---T-GTCTT-A-T----------T------------A-TTG-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-ATT-A-C-G--AG---T-A---A-AG-A-G-TGTAT
gi|31290                      :                      aAAATCG-TTC-A-TATA-CAG-GT-GA-G-AC--A-T--GA--GG-C-TT-A--C-A---TG--C--CT-A-TA--TCT--T------GA----TA---C------G----G-A-TA---GATA-G-A-T----C---T----------A--A-AC-T--AA-A-C-AACTCA-G-T-----T---T---T-GT--T-C-A-A--------T------------A-T-G-----T-C--CTAAGT---A-AC---C--A-AA-TG-TTT-T-C-G--AG---T-A---A-AG-A-G-T-Tcga
gi|31245                      :                       AAATTGATTC-T-CG---CCA-GT-TA-G-CC--A-T--GA--AG-C-CC-A--C-A---GGGTC--TT-T-TT--TCT--T------GA----TAT--C------A--------TC---GATA-T-A-T----TCT-T-G-A-T-A--A--A--C-T--GA-A-C-A----A-AGT-----T---T---T-GC--T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---TTAC---A--A-A--TA-TTT-A-C-C--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31272                      :           ccaaaaaagcaaAAATCG-ATC-T-CC---CAG-GC-TA-G-CC--A-T--GA--GG-C-CT-G--C-G---GT--C--TA-A-TA--TCT--T------GA----TA---T------C----G-T-AC---AATA-A-A-TC---A---C-G-A-T----A--A-AC-TG-AA-A-C----------T-----T---T---T-GT--T-T-T-A--------C------------A-T-C-----T-C--T----A---A-AC------A-AA-TA-TTT-A-C-C--AG---G-A---A-AA-AGG-T-TATtgat
gi|31293                      :                    acagAATCG-TTT-G-TA---CAG-GT-GA-G-CC--A-T--GA--GG-C-CC-A--C-A---TG--C--TT-A-TA--TCT--T------GA----TA---T------C----G-T-CA---GATA-A-A-T----C---T-A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-A-T-G--------T------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T-C-G--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TATtgat
gi|31292                      :                        AATTG-TC----TA----AG-GT-GA-G--C--A-T--GA--GG-G-CC-A--C-A---GG--C--TTGA-TA--TCT---------GA----TA---C------A----G-TGTA---GATA-G-A-T----A---A-A-G-TTA--A--A-AC-T--AA-A----------A-C-----T---T---T-GT--T-AGT-------------------------T-G-----T-C--T----TT--A-AC---A--A-AG-TA-TTTTA-CCG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-T
gi|31274                      :                       aaactG-TCT-G-TA---CAG-GT-GA-G-CC--A-T--GG--GG-C-CC-A--C-A---GG--C--AT-A-T---TCT--T------GA----TA---T------G----G-T-TT---GACA-G-A-T----A---T-A-A-T-A--A--A-AT-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-A-T-A--------TGTGTCTTAACAAA-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T-C-G--AG---A-A---A-AG-A-G-T-TATtgaatattga
gi|31306                      :                             caaagccga---CAG-GT-GA-G-CC--A-G--GA--GG-C-CC-A--C-A---GG--C--TT-A-TA--TCT--T------GA----TA---C------A----A-T-TA---GATA-G-A-T----G---T-A-A-T-A--A--A-AT-T--AA-A-C-A----A-C-TTTAAAT---T---T-GT--T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T-C-G--AG---T-A---A-AG-A-T-T-TAT
gi|31307                      :                                      ---CAG-GT-GA-G-CC--A-G--GA--GG-C-CC-A--C-A---GG--C--TT-A-TA--TCT--T------GA----TA---C------A----A-T-TA---GATA-G-A-T----G---T-A-----A--A--A-AT-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---TAAAT-TT--T-T-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T-C-G--AG---T-A---A-AG-A-T-T-TAT
gi|31305                      :                                      ---CAG-GT-GA-G-CC--A-T--GA--GG-T-GC-G--C-A---GG--C--CT-A-TA--TCT--T------CA----TC---C------A----G-C-TA---GATA-A-A-T----G---T-A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-C-A-A--------T------------A-T-G-----T-T--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-GTT-T-C-G--AA---T-A---A-AG-A-G-T-TA
gi|31303                      :                                      ---CAG-GT-GA-G-CC--A-T--GA--GG-C-CC-G--C-A---GG--C--AT-A-TA--TCT--T------GA----TT---C------A----G-C-TA---GATA-A-A-T----G---T-C-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-C-A-A--------T------------A-T-G-----T-C--T----T----------T--A-AA-TG-TTT-T-T-G--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TA
gi|31311                      :                                      ---CAG-GT-GA-G-CC--A-T--GA--GG-G-CC-G--T-C---GA--C--CT-A-TA--TCT--T------GA----TA---T------T----G-T-TA---GATA-G-A-T----C---T-A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C-A----T-C-T-----T---T---T-GT--T-A-T-A--------T------------A-T-C-----T-T--T----TTAAA-AC---A--A-AA-TG-TTT-T-C-A--AG---T-A---G-AG-A-G-T-TAT
gi|31298                      :                                      ---CAG-GT-GA-G-CC--A-T--TA--GG-C-CT-G--C-A---GG--C--CT-T-TA--T-----------GA----TA---C------G----G-T-TT---GATA-G-A-C----C---T-A-G-C-A--A--A-AT-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T-C-A--TT---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31296                      :                                      ---CAG-GT-GA-G-CC--A-T--TA--GG-C-CT-G--C-A---GG--C--CT-T-TA--T-----------GA----TA---C------G----G-T-TT---GATA-G-A-C----C---T-A-G-C-A--A--A-AT-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T-C-A--TT---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31299                      :                                      ---CAG-GT-GA-G-CC--A-T--GA--GG-C-C--A--C-A---GG--C--TTTA-TA--TCT--T---------------------------------------------A-T----A---C-A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---TTGT--T-A---A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A--C---A--A-AA-TG-TTT-T-T-G--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31316                      :                                      ---CAG-GT-GA-G-TC--A-T--GA--GG-C-CC-A--C-A---TG--C--AT-A-TA--TCT--T------GA----TA---T------G----G-T-TT---GACA-G-A-T----G---T-A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-
gi|31308                      :                                      ---CAA-GT-GA-G-CC--A-C--AT--GG-C-C--G--C-G---GG--G--CC-A-TA--TCT--T------GA----TA---C------G----G-T--A---AATA-G-A-T----T---T-A-G-TTA--A--A-AC-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-A-T-AA-------T------------A-T-A-----T-C--T----T---A-G----A--A-AA-TG-TTT-T-C-G--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TATtcattttttt
gi|31314                      :                                      ---CAG-GT-GA-G-CC--A-T--GA--GG-T-CT-G--C-----GC--C--TT-A-TT--TCT--T------GA----TA---T------G----G-T-TA---AATA-G-A-T----C---T-A-A-T-A--G--A-AA-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-AT--T-A-A-A--------T------------A-T-A-----A-A--T----A---C-AC---A--A-AA-TG-TTT-T-C-G--AG---T-A---A-AG-A-
gi|31297                      :                                      ---CAG-GT-GA----C--AAT--TA--GG-C-CT-G--C-A---GG--C--CT-T-TA--T-----------GA----TA---T-----------G-T-TT---GATA-G-A-C----C---T-A-G-C-A--A--A--T-T--AA-A-C-A----A---C-----T---T---T-GT--T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T-C-A--TT---T-A---A-AGAA-G-T-TAT
gi|31313                      :                                      ---CAG-GT-GA-G-CC--A-T--GA--GG-C-CC-T--T-G---GG------T-G-TA--TCT--T------------TA---CCATCATA----A-T-T-----ATA-G-A-T----C---T-C-A-C-A--A--A-AT-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-C-A-A--------A------------A-T-G-----T-C--T----C---A-AC---A--G-AA-TA-TTA-A-C-G--AG---T-A---A-AA-A-A-T-TAT
gi|31281                      :                                      ---CAG-GC-TA-G-CC--A-T--GA--GG-C-CC-G--C-C---GG--T--GT-A-AA--TCT--T------TA----TA---T------C----G-T-AC---AATA-G-A-T--------T-ACG-A-A--G--A-AC-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GC--T-C-T-A--------C------------A-T-C-----T-C--T----T---A-CC---A--A-AA-TA-TTT-A-C-C--AG---G-A---A-AA-A-G-T-TATcaat
gi|31271                      :                         aaaatcgactctc---CAG-GC-AA-G-CC--A-T--GA--GG-C-CT-G--T-G---GA--C--TT-T-TT--CTT--T------GA----TAT--C------A----A-T-C----GATA-G-A-C----C---T-T-G-A-T--A--A-AT-G--AA-A-C-A----C-T-T-----A---T---T-GT--T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---C-AC---A--A-AA-TA-CTT-A-C-G--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TATtgat
gi|31280                      :                       ataaaatcgactttt---CAG-GC-GA-G-CC--A-T--GA--GG-C-CT-G--T-G---GA--C--CT-T-TT--CTT--T------GA----TAT--C------A----A-T-C----GATA-G-A-C----C---T-T-G-A-T--A--A-AT-G--AA-A-C-A----C-T-T-----T---T---T-GT--T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---C-AC---A--A-AT-TA-TTT-A-C-G--AA---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31275                      :                         aaaatcgactctc---CAG-GC-TA-G-CC--A-T--GA--GG-C-CC-G--C-T---GG--T--TA-A-AA--TTT--T------GA----TAT--C------A----A-A-TA----ATA-A-A-TC---A---C-G-A-T----A--A-AC-T--GA-A-C-A----A-G-T-----T---T---T-GT--T-C-T-A--------C------------A-T-T-----T-C--T----T---A-GC---A--A-AA-TA-TTT-A-C-C--AA---G-A---A-AA-A-G-T-TAT
gi|31300                      :                         aaaatcgactctc---CAG-GT-GA-G-CC--A-T--GA--GG-C-CC-T--T-G---GG--C--GT-A-T----------------------------------------T-TA---TATA-G-A-T----C---T-C-A-C-G--A--A-AT-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-C-A-A--------A------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--G-AA-CA-TTA-A-T-G--AG---T-A---A-AA-A-A-T-TATtga
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gi|31301                      :                                      ---CAG-GT-GA-G-CC--A-T--GA--GG-C-CC-T--T-G---GG--C--GT-A-T----------------------------------------T-TA---TATA-G-A-T----C---T-C-A-C-G--A--A-AT-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-C-A-A--------A------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--G-AA-CA-TTA-A-T-G--AG---T-A---A-A--A-A-T-TAT
gi|31257                      :                                      ---CAG-GC-TA-G-CC--A-T--GA--GG-C-CC-G--C-A---GG--T--CT-A-AA--TCT--T------GA----TA---T------C----G-T-AC---AATA-A-A-TC---A---C-G-A-T----A--C-AC-T--AA-T-T-A----A-G-T-----T---T---T-GT--T-C-T-A--------C------------A-T-C-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AT-TA-TTT-A-C-C--AG---G-A---A-AA-T-G-C-TAT
gi|31309                      :                      aaaaaaatcgactctt---CAG-GT-AA---CC--A-T--GA--GG-C-CC-T--T-G---GG--C--GT-A-T---TTTAAT------AT----CA---T------A----A-T-TA-----TA-G-AAT----C---T-C-A-C-A--A--A-AT-T--AG-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-T-A-A--------A------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--G-AA-TA-TTA-A-C-G--AG---T-A---A-AA-A-A-T-TATtgat
gi|31302                      :                                      ---CAG-GT-GA-G-CC--A-T--GA--GG-C-CC-T--T-G---GG--C--GT-A-T----------------------------------------T-TA---TA-A-G-A-T----C---T-C-A-C-G--A--A-AT-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-C-A-A--------A------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--G-AA-CA-TTA-A-T-G--AG---T-A---A-AA-A-A-T-TATcaat
gi|31304                      :                                      ---CAG-GT-GA-G-CC--A-T--GA--GG-T-CC-A--A-G---GG--G--CA-A-TT--TCT--T------GA----CA---T------G----G-T-TC---GAAA-G-A-T----T---T-AGG-T-A--A--G-A--T--CA-A-C-A----T-A-T-----T---T---T-GC--T-A-A-A--------T------------A-T-G-----T-C--G----T---T-AC---A--A-AT-TA-TTT-G-C-C--AT---T-A---A-AG-A-G-A-TA
gi|31312                      :                                      ---CAG-GT-GA-G-CC--A-T--GA--GA-C-CT-G--T-G---GG--C-----A-TA--TTT--T------TT----TA---A------ATATCG-T-AA---TATA-G-A-T----C---T-C-A-C-T--A--A-AT-T--GA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--TCA-T----------T------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AT---A--AGAA-TA-TTT-A-T-G--AG---A-A---ATAA-A-A-T-TAT
gi|31310                      :                                      ---CAG-GT-AA-G-CC--A-T--GA--GG-C-CC-T--T-G---GG--C--GT-A-T---TTTAAT------AT----CA---T------A----A-T-T-----ATG-A-A-T----C---T-C-A-C-A--A--A-AT-T--AG-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-T-A-A--------A------------A-T-G-----T-C--T----T-----AC---A--G-AA-TA-TTA-A-C-G--AG---T-T---A-AA-A-A-T-TAT
gi|31258                      :                                      ---CAG-GC-TA-GCTT--A-T--GA--GG-T-CC-G--C-A---GG--T--AT-A-AA--TCT--T------GA----TA---T------C----G-T-AAC--AATA-A-A-T--------C-A-G-C-G--ATAA-AC-T--GA-A-T-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-C-T-A--------C------------A-T-C-----G-C--T----T---A-AC---AAGA-AA-TA-TTT-A-C-C--AG---G-A---A-Acaat
gi|31282                      :                      aaaaaaatcgaatctc---CAG-GC-TATG-CC--A-T--GA--GG-C-CC-G--C-----GG--T--CT-A-AA--TCT--T------GA----TA---T------C----G-T-AC---AATA-A-A-TC---A---C-G-A-T-A--A--A--C-T--GA-A---A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-C-T-A--------C------------A-T---------C--T----T---A-AC---A--A-AA-TA--TT-A-C-C--AG-----G---A-AG-A---T-TATatgctactgat
gi|31279                      :                           aaaagactctc---CAG-GC-TA-G-TC--A-C--GA--GG-C-CC-G--C-C---GA--T--CT-A-CA--TCT--T------GA----TA---T------C----G-T-AC---AATA-T-A-TC---A---C-G-A-T-T--A--A-AC-TGAAA-A-C-A----ACA-T-----T---T---T-GT--G-A-C-A--------T------------A---A-----C-T--T----T---A-ACCAAG--A-AA-TA-GTT-A-C-tgat
gi|31317                      :                             aaaatcgactcttAG-GT-GA-G-CC--A-T--AA--GG-C-CC-G--C-G---GG--C--CT-A-TA--TCT--T------AA----TA---C------A----G-T-TG---GATA-G-A-T----T---T-T-G-T-T--A--A-AC-T--TA-A-C-A----A-A-T-----T---T---T-AT--T-C-A-A--------T------------A-T-G-----T-T--T----T---A-AC--------AA-TG-TTT-T-T-C--AG---T-G---A-AG-A-G-T-TATca
gi|31319                      :                                          AG-GT-GA-G-TC--A-T--TA--GG-C-CT-G--C-A---GC--C--TC---TA--T-----------GA----TAA--C------G----G-T-TC---GATA-G-A-C----C---T-A-G-C-A--A--A-AC-T--AA-A-C-A----A-C-G-----T---T---T-GT--T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T-C-A--TT---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31318                      :                                          AG-GT-GA-G-CC--A-T--GA--GG-C-CC-A--A-A---GG--C--AT-A-TA--TCT--T------GA----TA---T------G----G-T-TT---GACA-G-A-T----C---T-A-G-C-A--A--A-AC-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-A-C-A--------
gi|31295                      :                                          AG-GT-GA-G-TCCCA-T--GA--GG-C-CC-GGGC-ATGCAG--C--CT-A-CA--TCT--T------GA----TA---C------G----G-T-CA---GATC-G-A-T----T---TTA-G---A--A--A-AC-T--AA-A-C-G----C-C-T-----T---T---T-GT--G-A-T-A--------T------------G-T-GTT---T-T--T----T---A-AG---A--A-AA-TG-TTT-T-C-G--AGCAAT-A---A-AG-A-G-T-TATt
gi|31241                      :                                        ctAG-GC-TA-G--C--A-T--GA--GA-C-CC-A--C-G---GC--C--TT---T---TCT--T------GA----TAAT-C------A----A-T-C----GATA-G-A-T----C---T-T-GAT-A--A--A-AC-T--GA-A-C-A----A-G-T-----T---T-----GT--T-C-T-A--------A------------C-T-G-----T-C--T----T---T-AC---AC-A-AA-TA-TTT-A-C-C--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31276                      :                  ccaaaaaacaaaaaatcgactccaAG-GC-TA-G-TC--A-T--GA--GG-C-CCGA--C-----GG--T--CT-A-AA--TCT--TTAAATCG-----TA---C------A----A-T-AG---AATACG-A-T-------------------A--A-AC-T--GA-A-C-A----A-C-G-----T---T---T-GC--T-C-T-A--------C------------A-T-C-----T-C--T----T---G-CC---A--A-AA-TA-TTT-A-C-C--AG---G-A---A-AA-A-G-T-TATtgat
gi|31320                      :                           aaaatcgactctccaAG-GT-GA-G-CC--A-T--GA--GG-C-CC-A--A-G---GG--C--GT-ATTT--TTT--T------AA----TA---T------C----G-T-AA---TACA-G-A-T----C---T-T-G-C-G--A--A-GT-TC-AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-C-A-A--------T------------A-T-G-----T-C--T----C---A-AC---A--G-AA-TA-Ttgat
gi|31326                      :                                                 A-G-TC--A-T--GA--G--C-CC-A--C-A---GG-----TT-A-TA--TCT--T-------CATA-TA---C------A----G-T-TA---GATA-G-A-T----G---T-A-G-T-A--A--A-AC----AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-A-T-A--------C------------AGT-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA--G-TTT-T-C-G--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31327                      :                                                 A-G-CC--A-T--GA--GG-C-CC-A--T-G---GG--C--CT-T-TA--TCT--T------GA----TA---C------G----G-T-TA---GATA-A-A-A----C---T-A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-T-A----A-C-A-----T---T---T-GT--T-T-T-A--------T------------A-T-G-----T-T--T----T---A-A----A--A-AT-TG-CTT-T-T-G--AG---T-A---A-AG-A-A-T-TATgga
gi|31325                      :                                                 A-G-CC--A-T--TA--GG-C-CT-G--C-A---GG--CCTTT-A-TA--T------------------A---C------G----G-T-TT---GATA-G-A-C----C---T-A-G-C-A--A--A-AT-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T--T--T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T-C-A--TT---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31331                      :                                                 A-G-TC--A-T--GA--GG-C-CC-A--A-A---GG--C--CT-G-TA--TCT--T------GA----CA---C------G----G-T-TA---GATA-G-A-T----C---T-A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-CT--T-
gi|31329                      :                                                 A-G-CC--A-TTTAA--GG-C-CC-G--T-G---GG-----TT-A-TAATTTT--T------GA----TA---C-----------G-T------AATA-GGA-C----C---T-A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-CCA----A-A-C-----T---T---T-GTA-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----TAT--T----T---A-AC---A--A-AAATG-TTT-T-C-G--AG---T-A---A-AG-A-G-T-Tc
gi|31322                      :                                                 A-G-CC--A-T--GA--GG-C-CC-A--CGG---GG--C--TT---T---TCT--T------GA----TA-----------------T-TAATCGATA-G-A-T----C---T-T-GAT-AG-A--A-AC-T--GA-A-C-A----A-G-------T---T---T-GT--T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---T-AC---A--G-AA-TA-TTG-A-C-C--AG---T-C---A-AG-A-G-T-ttga
gi|31324                      :                                                tA-G-CC--A-T--GT--GG-C-CC-A--C-AT--GG--C--TT-T-T---TCT--T------------TAT--C-------------T-TAATCGATA-T-A-T----C---T-T-G-A-T--A--A-AC-T--GA-A-C-A----A-G-T-----T---T---T-GT--T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---T-AC------A-AA-TA-TTT-A-C-A--AG---T-C---A-AG-A-G-T-TATctggtatcgat
gi|31323                      :                                                  -G-CC--A-T--AA--GG-C-CT-G--T-G---GG--G--TT-A-TA--TTT--T------GA----TA---C------G----G-T-AA---GATA-G-A-C--------T-A-T-G-A--A--G-GC-T--AACA-C-T----A-G-T-----T---T---T-GT--G-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-CA-T----T---A-A----A--A-AA-TG-TTT-T-C-G--AG---T-A---A-AG-A-G-T-Ttgat
gi|31277                      :                                                    tgC--A-T--GA--GGTC-CC-G--C-A---GG-----TT-A-AA--TCT--T------GA----TA---T------C----G-A-CA----ATA-G-A-C----A---C-G-A-T-A--A--A-AC-T--GA-A-C-A----C-A-T-----T---T---T-GT--TTC-T-A--------C------------A-T-------C-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TA-TTT-A-C-C--AG---A-A---A-AA-ATG-C-TAT
gi|31334                      :                                aaaatcgactcttccatgctagC--G-T--GA--AG-C-CC-A--A-G---GG--C--CA-A-TT--TCT--T------GA----TA---T------G----G-T-TC---ATCA-G-A-T----T---C-A-G-G-T--A--A-TC-G--CA-A-C-A----T-A-T-----T---T---T-GT--T-A-T-A--------T------------G-T-G-----T-C--T----T---T-AC---A--A-AG-TA-TTT-A-C-tgat
gi|31335                      :                                                       --A-T--GA--GG-C-CC-A--C-A---GG--T--CT-A-AA--TAT--T------GA----TA---T------C----G-TATA----ATA-A-A-TC---A---C-G-A-T----A--A-AC-T--TA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-C-T-A--------C------------A-T-C-----A-T--T----T---A-AC---A--A-AA-TA-TTT-A-C-A--AG---G-A---T-AA-A-G-T-TATcatataagaaataattga
gi|31336                      :                                                                      -CC-A--C-A---GG--C--AC-A-TA--TCT--T------GA----TA---T------G----G-G-TT---GACA-G-A-T----C---T-A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-A-T-A--------T------------A-T-G-----T-T--T----T---A-ACA--A--A-AA-TC-TTT-A------AG---T-A---A-tgat
gi|31338                      :                                                                                                 --TCT--T------GA----TA---C------G----A-T-TA---AATA-G-A-T----C---T-A-G-T-A--T--A-AC-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-C-A-A--------T------------G-T-G-----T-C--T----T---A-AT---G--A-AA-TA-TTT-T-C-G--AT---T-A---A-AC-A-T-T-TAT
gi|31340                      :                                                                                                                                            ---GATA-G-A-C----C---T-A-G-C-A--A--A-AC-T--AA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--A-T-T-T--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-C-C-G--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TGTtaat
gi|31330                      :                                                                                                                                              tcATA-G-A-T----C---T-C-A-C-G--A--A-AT-T--AA-A-C-A----A-C-T-----G---T---T-GT--T-C-A-A--------T------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--G-AA-TA-TTT-A-C-A--AA---T-A---C-AG-A-T-T-TAT
gi|31342                      :                                                                                                                     aaccatgaacatgtttttttaaatcaaaat-G-A-T----A---T-G-G-TTA--A--A-AC-T--AA-A-T-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TA-TTT-T-C-G--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TATcaat
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gi|31341                      :                                                                                                                                     agggcagatcttttcttgatgtcaaatgaaagctcgt--A--A-AC-T--GA-A-C-A----A-C-T-----T---T---T-GT--T-C-T-A--------C------------A-T-A-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TA-TTT-A-C-C--AG---G-A---A-AA-A-G-T-TATtg
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1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|31252 ): AAAAAAAAATCACTCTTCAGGCTAGATACAATGAGGCCCCCGCAGGTCTAAATCTTGAAGTATCGTCATATATATATCACGATACATCTATTAAGTTTTGATCTACCATCCTTAACATAAATATTTCCCAGGAAAATGCTATCGAT






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Reference ( family-265 )      :                             AACACTAAATCG---TCC-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--GC-G-G------G--C-----CT-ATA--TCTT--G----A--T---A--C---GG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--C----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-N-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-N--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31237                      :                             AACA--AAATTGA--TTC--T-C--CA-G-GC-TA-G---CG-A-T--G-A--AG-C-C-C--ACAG-G------G--C-----CT-TT---TCTT--G----A--T---AT-C---AA-T----C-----G--AT-A-G-A--T--C----TT-G-A-T--A--A-AC-T--TA-A-C--A-AG----T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---T-AC---A--A-AA-TA-TTT-A--CC--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31238                      :                                                         ccaaaaA-G---CC-A-T--G-A--AG-C-C-C--AT-ATG------A--C-----CT-TT---TCGT--G----A--T---AT-C---AA-T----C-----G--AT-A-G-A--T--C----TT-G-A-T--A--A-AC-A--GA-A-C--A-AG----T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---T-AC---A--A-AA-TA-TTT-A--TC--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TATtgat
gi|31239                      :                                   ccaaaaaacaaaattgattatcaaagctA-G---CC-A-T--G-A--AG-C-C-C--AT-ATG------A--C-----CT-TT---TCGT--G----A--T---AT-C---AA-T----C-----G--AT-A-G-A--T--C----TT-G-A-T--A--A-AC-A--GA-A-C--A-AG----T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---T-AC------A-AA-TA-TTT-A--CA--AG---T-C---A-AG-A-G-T-TATtgat
gi|31240                      : ccaaaaaacaaaattgattatcaaagctAACA--AAATTGA--TTC--T-C--CA-G-GC-TA-G---CC-A-T--G-A--AG-C-C-C--ACAG-G------G--C-----CT--TT--TCTC--G----A--T---AT-C---AA-T----CA----A--A--A-G-A--T--C----TT-G-A-T--A--A-AC-T--GA-A-C--A-AG----T-----T---T---TGT-T--------------C------------A-T-A-----T-C--T----T------CTTTT--A-AA-TA--TT-A--CGCCAG---T-A---A-AG-A-G-T-TAtgat
gi|31241                      :                       ccaaaaAACAAAAAATCGAC-TCC-A------A-G-GC-TA-G---C--A-T--G-A--GA-C-C-C--AC-G-G---------C-----CT-TT---TCTT--G----A--T---AATC---AA-T----C-----G--AT-A-G-A--T--C----TT-GAT-A--A--A-AC-T--GA-A-C--A-AG----T-----T---T----GT-T-C-T-A--------A------------C-T-G-----T-C--T----T---T-AC---AC-A-AA-TA-TTT-A--CC--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TATctgat
gi|31242                      :                       ccaaaaAACACAAAATTGA--TTC--T-C--CA-G-GC-TA-G---GA-A-T--G-A--AG-C-C-C--GC-G-G------GG-C-----CT-TT---TCTT--G----A--T---A---------T----TAATC-G--AT-A-G-A--T--C----TT-G-A-T--A--A-AC-T--GA-A-C--A-CG----T-----T---T---TGC-T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---T-AC---A--A-AA-CA-TTT-A--CC--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TATtgat
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gi|31252                      :                                aaaAAATCA---CTC-TT----CA-G-GC-TA-GATACA-A-T--G-A--GG-C-C-CCCGC-A-G------G--T-----CT-AAA--TCTT--G----AAGT---A--T---CG-TCA--TA----T--AT-A-T-A--T--CA---CG-A-T-A--C--A-TC-T---A-T-T--A-AG----T-----T---T---TGA-T-C-T-AC-------C------------A-T-------C-C--T----T---A-AC---AT-A-AA-TA-TTT-C--CC--AG---G-A---A-AA-T-G-C-TATtgat
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gi|31257                      :                               aaaaAAATCG---ACT-CT-T--CA-G-GC-TA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--GC-A-G------G--T-----CT-AAA--TCTT--G----A--T---A--T---CG-T----AC----A--AT-A-A-A--T--C----AC-G-A-T--A--C-AC-T--AA-T-T--A-AG----T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-C-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AT-TA-TTT-A--CC--AG---G-A---A-AA-T-G-C-TATattgat
gi|31258                      :                               aaaaAAATCGAA-TC---T-C--CA-G-GC-TA-G---CTTA-T--G-A--GG-T-C-C--GC-A-G------G--T-----AT-AAA--TCTT--G----A--T---A--T---CG-T----AAC---A--AT-A-A-A--T--C-----A-G-C-G--ATAA-AC-T--GA-A-T--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-C-----G-C--T----T---A-AC---AAGA-AA-TA-TTT-A--CC--AG---G-A---A-Atgat
gi|31259                      :                         aaaaAACATTAAATTG---TTC-GT-A--CA-G-GT-GA-G---TC-A-T--G-A--GG-C-C-C--AC-A-G------G--C-----TT-ATA--TCTT--G----C--T---A--C---AG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--G----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AA----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-A--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TATatgctactgat
gi|31260                      :                             AACATTAAATTG---TTC-GT-A--CA-G--T-GA-G---CC-A-T--G-A--G--C-C-C--AC-A-G------G--C-----TT-ATA--TCTT--G----A--T---A--C---AG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--G----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AA----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG--TT-A--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31261                      :                             AACATTAAATTG---TTC-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CCGA-T--G-A--GG-C-C-C--AC---G------G--C-----TT-ATA--TCTT--G----A--T---A--C---AG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--G----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-CA-A-AT----T-----T---T---TGTAT-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-A--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31262                      :                             AACATTAAATTG---TTC-GT-A--AA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--AC-A-G------G--C-----TT-ATA--TCTT--G----A--T---A--C---AG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--G----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-A--A-AA----A-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-A--C
gi|31263                      :                             AACAC--AATCA---TCT-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--T-A--GG-C-C-T--GC-A-G------G--C-----CT-TTA-----T--G----A--T---A--C---GG-T----TT----G--AT-A-G-A--C--C----TA-G-C----A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-ACATGTT-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CA--TT---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31264                      :                             AACATTAAATTG---TTC-GT-A--CA-GCGT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--AC-A-G------G--C-----TT-ATA--TCCT--CT---A--T---A--C---AG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--G----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-----T-A--------C------------A-T-G-----T-C-------T---A-A----A--A-AA-TG-TTT-A--CG--A----T-A---A-AG-A-G-T-TA
gi|31265                      :                             AACACTAAATCG---TCT-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--T-A--GG-C-C-T--GT-A-G------A--C-----CT-TTA--T-----G----A--T---A--C---GG-T----TC----G--AT-A-G-A--C--C----TA-G-C-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-A-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TC-TTT-T--CA--TT---T-A---A-CG-A-G-T-TATatga
gi|31266                      :                             AACACTAAATCG---TCT-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--T-A--GG-C-C-T--GT-A-G------A--C-----CT-TTA-----T--G----A--T---A--C---GGTT----TC----G--AT-A-GAA--C--C----TA-G-C----A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----------T---T---TGT-----T-A--------A------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC------A-AA-TC-TTT-T--CA--TT---T-A---A-CG-A-G-T-TAT
gi|31267                      :                             AACATTAAATTG---TCC-GT-A--CA-G-GT-CA-G---CC-ATT--G-A--GG-C-C-C--AC---A------G--C-----TT-ATA--TCTT--G-------T---A--CA--GG-T----TA----G--AT-A-G-A-----G----TA-G-T----A--A-AT-T--AA-ACC--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---C-AC---A--ACAA-TG-TTT-T--CG---G---T-A---A-AG-A-G-T-TA
gi|31268                      :                             AACACTAAATCA---TTC-AT-A--CA-G-GT-AA-G---CC-A-T--A-A--GG-C-C-C--AC-A-G------G--T-----TT-ATA--TCTT-------------------------------------------G-A--T--C----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-A-A--------T------------A-T-G-----T-T--T----T---A-AC---A--A-AA-TA-TTT-T--CA--AG---T-A---A-AG-A-G-T-AAT
gi|31270                      :                             AACACTAAATTG---TCT-GC-G--CA-T-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--TG-C-C-C--AT-G-G------G--C-----AT-ATT--TTTT--G----A--T---A--T---TG-T----AA----T--AT-A-G-A--T--C----TC-A-C-A--A--A-GT-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-A-A--------T------------A-T-G-----T-C--T----T---
gi|31271                      :                                   AAATCG---ACT-TT-T--CA-G-GC-AA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-T--GT-G-G------A--C-----TT-TTT--CTTT--G----A--T---AT-C---AA-T----C-----G--AT-A-G-A--C--C----TT-G-A-T--A--A-AT-G--AA-A-C----AC----T-----TA--T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---C-AC---A--A-AA-TA-CTT-A--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31272                      :                                ataAAATCGATCTCC-------CA-G-GC-TA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-T--GC-G-G------T--C-----TA-ATA--TCTT--G----A--T---A--T---CG-T----AC----A--AT-A-A-A--T--C----AC-G-A-T--A--A-AC-T--GA------A-AC----T-----T---T---TGT-T-T-T-A--------C------------A-T-C-----T-C--T----A---A-AC------A-AA-TA-TTT-A--CC--AG---G-A---A-AA-AGG-T-TAT
gi|31273                      :                            acagACTAAATTG---TCT-GT-G--CA-G-AT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--AT-G-G------G--C-----GT-ATT--TTTT--G----A--T---A--T---TG-T----AA----T--AT-A-T-A--T--C----AC-A-C-G--A--A-AT-T--GA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-A-A--------A------------A-T-G-----T-T--T----T---A-AC---A--G-AA-TA-TCTAC--CG--AG---T-ATACA-AG-A-A-T-TATtgat
gi|31274                      :                                        G---TCT-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-G--GG-C-C-C--AC-A-G------G--C-----AT-AT---TCTT--G----A--T---A--T---GG-T----TT----G--AC-A-G-A--T--A----TA-A-T-A--A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------TGTGTCTTAACAAA-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CG--AG---A-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31275                      :                          caaagccgaAAATCG---ACT-CT-C--CA-G-GC-TA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--GC-T-G------G--T-----TA-AAA--TTTT--G----A--T---AT-C---AA-A----TA-------AT-A-A-A--T--C----AC-G-A-T--A--A-AC-T--GA-A-C--A-AG----T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-T-----T-C--T----T---A-GC---A--A-AA-TA-TTT-A--CC--AA---G-A---A-AA-A-G-T-TAT
gi|31276                      :                                  aAAATCG---ACT-CT-C--CAAG-GC-TA-G---TC-A-T--G-A--GG-C-C-C--GA-C-G------G--T-----CT-AAA--TCTT--T----A--A---A--T---CG-TACAATA----GA-AT-ACG-A--T-----------------A--A-AC-T--GA-A-C--A-AC----G-----T---T---TGC-T-C-T-A--------C------------A-T-C-----T-C--T----T---G-CC---A--A-AA-TA-TTT-A--CC--AG---G-A---A-AA-A-G-T-TATtga
gi|31277                      :                                                                     aC-A-T--G-A--GGTC-C-C--GC-A-G------G--T------T-AAA--TCTT--G----A--T---A--T---CG-A----CA-------AT-A-G-A--C--A----CG-A-T-A--A--A-AC-T--GA-A-C--A-CA----T-----T---T---TGT-T-TCT-A--------C------------A-T-------C-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TA-TTT-A--CC--AG---A-A---A-AA-ATG-C-TATtgat
gi|31278                      :                                         aaaatcgactcttccatgctagA-G---CC-A-T----A--GG-G-C-C--GC-C-G---------T-----CT-AAA--TTTT--A----A--T---A--T---CG-T----AC----A--AT-A-A-A--T--C----AC-G-A-T--A--A-AC-T--GA-A-C--A-ACT---T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-AT----T-C--T----T---A-ACA--A--A-AA-TA-TTT-A--CC--AG---G-A---A-AA-A-G-T-TATtgat
gi|31279                      :               aaaatctgctctccggggctAAATCG---ACT-CT-T--CA-G-GC-TA-G---TC-A-C--G-A--GG-C-C-C--GC-C-G------A--T-----CT-ACA--TCTT--G----A--T---A--T---CG-T----AC----A--AT-A-T-A--T--CA---CG-A-T-T--A--A-AC-TGAAA-A-C--A-ACA---T-----T---T---TGT-----G-A--------C------------A-T-A-----A-CT-T----T---A-AC---C--A-Attgat
gi|31280                      :                                  aAAATCG---ACT-CT-C--CA-G-GC-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-T--GT-G-G------A--C-----CT-TTT--CTTT--G----A--T---AT-C---AA-T----C-----G--AT-A-G-A--C--C----TT-G-A-T--A--A-AT-G--AA-A-C--A-CT----T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---C-AC---A--A-AT-TA-TTT-A--CG--AA---T-A---A-AG-A-G-T-TATgaaatagttacca
gi|31281                      :                                  aAAATCG---ACT-CT-C--CA-G-GC-TA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--GC-C-G------G--T-----GT-AAA--TCTT--T----A--T---A--T---CG-T----AC----A--AT-A-G-A--T-------TACG-A-A--G--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGC-T-C-T-A--------C------------A-T-C-----T-C--T----T---A-CC---A--A-AA-TA-TTT-A--CC--AG---G-A---A-AA-A-G-T-TAT
gi|31282                      :                                                   a--CA-G-GC-TATG---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--GC---G------G--T-----CT-AAA--TCTT--G----A--T---A--T---CG-T----AC----A--AT-A-A-A--T--C----AC-G-A-T--A--A-AC-T--GA-A----A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A---------T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TA-TTA-C--CA--GG---------A-AG-A---T-TATtgat
gi|31283                      :                  aaaagactctcAACATTAA--TG---TTC-GT-A--CA-C-GC-TA------C-A-T--G-A--GG-C-C-------A-G------G--C-----TT-ATA--TCTT--G----A--T---A--C---AG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--G----TA-G-TAA--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AA----T-----T---T---TGT-TAT-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T----------A--A-AA-TG-TTT-A--CG--AG---T-A--------A-G-T-TATtgat
gi|31284                      :                                   AAATTG---TCCTAT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A----G-A--GA-C-C-C--AC-A-G------G--A-----CT-ATA--TCTTTTG----A--T---A--C---AACT----TA----G--AT-A-GCA--T--G----TA-G-TTA--A--A-AA-T--AA-A----A-AT----T-----T---T---TGT-C-T-T-A--------TT-----------A-TTG-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-ATT-A--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-TGTAT
gi|31285                      :                                  aAAATTG---TTC-GTTA--CA-G-TT-GA-G---CC-A-T--G-A--G--C-C-C--AC-A-G------G--C-----TC-ATA--TCTT--G----A--T---A--C---AG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--G----TATG-T-A--A--A-AC-T--AACA-C--A-AA----T-----T---T---TTT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTA-A--C---AG---T-A---A-AG-A-G-T-TATcga
gi|31286                      :                                   AAATCG---TTC-GT-A--CA-G-GT--A-G---CC-A-T--A-A--GG-C-C-C--AT-G-G------G--G-----TT-ATA--T-TT--G----A--T---A--C---A--T----TA----G--AT-A-G-A--C--C----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGA-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31287                      :                                   AAATTG---TCC-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--AC-A-G------G--C-----TT-ATA--TCTT--G----A--T---A--C---------------------------------------A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--TG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31288                      :                                   AAATTG---TCC-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG---C-C--AC-A-G------G--CT----TT-ATA--TCTT-------A--T---A--C---------------------------------------A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-ACT---T-----T---T---TGT-T-A---A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---T-AC---A--A-AA-TGTTTT-T--TG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31289                      :                                   AAATTG---TCC-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG---C-C--AC-A-G------G--C-----TT-ATA--TCTT-------A--T---A--C---------------------------------------A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---T-T-G-T-T-A--------C------------A-T-G-----T-T--T----T-----AC---A--A-AA-TGTTTT-T--TG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31290                      :                                   AAATCG---TTC-AT-ATACA-G-GT-GA-G---AC-A-T--G-A--GG-C-T-T--AC-A-T------G--C-----CT-ATA--TCTT--G----A--T---A--C---GG-A----TA----G--AT-A-G-A--T--C----T---------A--A-AC-T--AA-A-C--A-ACTCAGT-----T---T---TGT-T-C-A-A--------T------------A-T-G-----T-C--CTAAGT---A-AC---C--A-AA-TG-TTT-T--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-T
gi|31291                      :                                   AAATTG---TCC-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-C--A-A--GG-C-C-T--GC-A-G------G--C-----CT-ATA--TCTT--G----A--T---A--C---GG-T----AA----G--AT-A-G-A--T--T----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AT----T-----T---T---TGT-T-T-T-A--------T------------A-T-A-----T-C--T----T---A-AG---A--A-AA-
gi|31292                      :                                ACTAA-TTG---TC---T-A---A-G-GT-GA-G---C--A-T--G-A--GG-G-C-C--AC-A-G------G--C-----TTGATA--TCT---G----A--T---A--C---AG-TG---TA----G--AT-A-G-A--T--A----AA-G-TTA--A--A-AC-T--AA-A------AC----T-----T---T----GT-T-AGT-------------------------T-G-----T-C--T----TT--A-AC---A--A-AG-TA-TTT-TACCG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-Tgagtta
gi|31293                      :                                  aaAATCG---TTT-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--AC-A-T------G--C-----TT-ATA--TCTT--G----A--T---A--T---CG-T----CA----G--AT-A-A-A--T--C----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-G--------T------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TATtgaatattga
gi|31294                      :                                ATTGAATCA---TCC-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--AC-A-G------G--C-----TT-ATA--TCCT--GCATGA--T---A--T---GG-T----TA----G--AA-A-G-A--T--T----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-ATATACATGT------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-A--TG--AA---T-A---
gi|31295                      :                                                       A-G-GT-GA-GTC-CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--G--G-GCATGCAG--C-----CT-ACA--TCTT--G----A--T---A--C---GG-T----CA----G--AT-C-G-AT-T--T----TA-G---A--A--A-AC-T--AA-A-C--G-CC----T-----T---T---TGT-G-A-T-A--------T------------G-T-GTT---T-T--T----T---A-AG---A--A-AA-TG-TTT-T--CG--AGCAAT-A---A-AG-A-G-T-TATgtgatatt
gi|31296                      :                                                  ct--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--T-A--GG-C-C-T--GC-A-G------G--C-----CT-TTA--T-----G----A--T---A--C---GG-T----TT----G--AT-A-G-A--C--C----TA-G-C-A--A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CA--TT---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31297                      :                                                    --CA-G-GT-GA-----CA-A-T--T-A--GG-C-C-T--GC-A-G------G--C-----CT-TTA--T-----G----A--T---A--T---GT-T----T-----G--AT-A-G-A--C--C----TA-G-C-A--A--A--T-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T----GT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CA--TT---T-A---A-AGAA-G-T-TAT
gi|31298                      :                                                    --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--T-A--GG-C-C-T--GC-A-G------G--C-----CT-TTA--T-----G----A--T---A--C---GG-T----TT----G--AT-A-G-A--C--C----TA-G-C-A--A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CA--TT---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31299                      :                                                    --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG---C-C--AC-A-G------G--CT----TT-ATA--TCTT-------A--T---A--C---------------------------------------A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-ACT---T-----T---T---TGT-T-A---A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T-----AC---A--A-AA-TG-TTT-T--TG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31300                      :                                                    --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--TT-G-G------G--C-----GT-AT-------------------------------T----TA----T--AT-A-G-A--T--C----TC-A-C-G--A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-A-A--------A------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--G-AA-CA-TTA-A--TG--AG---T-A---A-AA-A-A-T-TAT
gi|31301                      :                                                    --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--TT-G-G------G--C-----GT-AT-------------------------------T----TA----T--AT-A-G-A--T--C----TC-A-C-G--A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-A-A--------A------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--G-AA-CA-TTA-A--TG--AG---T-A---A-A--A-A-T-TAT
gi|31302                      :                                                    --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--TT-G-G------G--C-----GT-AT-----TT-------A--T---A--------------------------A-G-A--T--C----TC-A-C-G--A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-A-A--------A------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--G-AA-CA-TTA-A--TG--AG---T-A---A-AA-A-A-T-TAT
gi|31303                      :                                                    --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--GC-A-G------G--C-----AT-ATA--TCTT--G----A--T---T--C---AG-C----TA----G--AT-A-A-A--T--G----TC-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-A-A--------T------------A-T-G-----T-C--T----T----------T--A-AA-TG-TTT-T--TG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TA
gi|31304                      :                                                    --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-T-C-C--AA-G-G------G--G-----CA-ATT--TCTT--G----A--C---A--T---GG-T----TC----G--AA-A-G-A--T--T----TAGG-T-A--A--G-A--T--CA-A-C--A-TA----T-----T---T---TGC-T-A-A-A--------T------------A-T-G-----T-C--G----T---T-AC---A--A-AT-TA-TTT-G--CC--AT---T-A---A-AG-A-G-A-TA
gi|31305                      :                                                    --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-T-G-C--GC-A-G------G--C-----CT-ATA--TCTT--C----A--T---C--C---AG-C----TA----G--AT-A-A-A--T--G----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-A-A--------T------------A-T-G-----T-T--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-GTT-T--CG--AA---T-A---A-AG-A-G-T-TA
gi|31306                      :                                                    --CA-G-GT-GA-G---CC-A-G--G-A--GG-C-C-C--AC-A-G------G--C-----TT-ATA--TCTT--G----A--T---A--C---AA-T----TA----G--AT-A-G-A--T--G----TA-A-T-A--A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----TTTAAAT---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CG--AG---T-A---A-AG-A-T-T-TAT
gi|31307                      :                                                    --CA-G-GT-GA-G---CC-A-G--G-A--GG-C-C-C--AC-A-G------G--C-----TT-ATA--TCTT--G----A--T---A--C---AA-T----TA----G--AT-A-G-A--T--G----TA-----A--A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---TAAATTT-T-T-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CG--AG---T-A---A-AG-A-T-T-TAT
gi|31308                      :                                                    --CA-A-GT-GA-G---CC-A-C--A-T--GG-C-C----GC-G-G------G--G-----CC-ATA--TCTT--G----A--T---A--C---GG-T-----A----A--AT-A-G-A--T--T----TA-G-TTA--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-TAA--------T------------A-T-A-----T-C--T----T---A-G----A--A-AA-TG-TTT-T--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31309                      :                                                    --CA-G-GT-AA-----CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--TT-G-G------G--C--------GTA--TTTT--A----A--TATCA--T---AA-T----T--------AT-A-GAA--T--C----TC-A-C-A--A--A-AT-T--AG-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-T-A-A--------A------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--G-AA-TA-TTA-A--CG--AG---T-A---A-AA-A-A-T-TAT
gi|31310                      :                                                    --CA-G-GT-AA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--TT-G-G------G--C--------GTA--TTTT--A----A--T---A--TCATAA-T----TA--------T-G-A-A--T--C----TC-A-C-A--A--A-AT-T--AG-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-T-A-A--------A------------A-T-G-----T-C--T----T-----AC---A--G-AA-TA-TTA-A--CG--AG---T-T---A-AA-A-A-T-TATcaat
gi|31311                      :                                                    --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-G-C-C--GT-C-G------A--C-----CT-ATA--TCTT--G----A--T---A--T---TG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--C----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-TC----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------T------------A-T-C-----T-T--T----TTAAA-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CA--AG---T-A---G-AG-A-G-T-TATcaat
gi|31312                      :                                                    --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GA-C-C-T--GT-G-G------G--C-----AT-ATT--TTTTTAA----A--T---A--T---CG-T----AA----T--AT-A-G-A--T--C----TC-A-C-T--A--A-AT-T--GA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-A-T--------T------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AT---A--AGAA-TA-TTT-A--TG--AG---A-A---ATAA-A-A-T-TAT
gi|31313                      :                                                    --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--TT-G-G------G---------T-GTA--TCTT----------T---A--C---CA-TCA--TA----ATTAT-A-G-A--T--C----TC-A-C-A--A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-A-A--------A------------A-T-G-----T-C--T----C---A-AC---A--G-AA-TA-TTA-A--CG--AG---T-A---A-AA-A-A-T-TAT
gi|31314                      :                                                    --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-T-C-T--GC-G-----------C-----CTTATT--TCTT--G----A--T---A--T---GG-T----TA----A--AT-A-G-A--T--C----TA-A-T-A--G--A-AA-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TAT-T-A-A-A--------T------------A-T-A-----A-A--T----A---C-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CG--AG---T-A---A-AG-A-caat
gi|31315                      :                                                    --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GC-C-C-T--GT-G-G------G-----------AT-----TT--A----A----------------T----TA----G--AT-A-A-A--T--C----TA-C-G-A--A--A-GC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---C---TGT-T-C-A-A--------T------------A-T-G-----T-T--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-ATT-T--CA--AG---T-A---A-TG-A-G-T-TAT
gi|31316                      :                                                    --CA-G-GT-GA-G---TC-A-T--G-A--GG-C-C-C--AC-A-T------G--C-----AT-ATA--TCTT--G----A--T---A--T---GG-T----TT----G--AC-A-G-A--T--G----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-T------------C------------A-T-T-----T-T--T----T---
gi|31317                      :                                                       A-G-GT-GA-G---CC-A-T--A-A--GG-C-C-C--GC-G-G------G--C-----CT-ATA--TCTT--A----A--T---A--C---AG-T----TG----G--AT-A-G-A--T--T----TT-G-T-T--A--A-AC-T--TA-A-C--A-AA----T-----T---T---TAT-T-C-A-A--------T------------A-T-G-----T-T--T----T---A-AC--------AA-TG-TTT-T--TC--AG---T-G---A-AG-A-G-T-TATt
gi|31318                      :                                                       A-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--AA-A-G------G--C-----AT-ATA--TCTT--G----A--T---A--T---GG-T----TT----G--AC-A-G-A--T--C----TA-G-C-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-----T-A--------C------------A-T-
gi|31319                      :                                                       A-G-GT-GA-G---TC-A-T--T-A--GG-C-C-T--GC-A-G---------C-----CT-CTA--T-----G----A--T---AA-C---GG-T----TC----G--AT-A-G-A--C--C----TA-G-C-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----G-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CA--TT---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31320                      :                                                       A-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--AA-G-G------G--C-----GT-ATT--TTTTT-A----A--T---A--T---CG-T----AA----T--AC-A-G-A--T--C----TT-G-C-G--A--A-GT-TC-AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-A-A--------T------------A-T-G-----T-C--T----C---A-AC---A--G-AA-TA-T
gi|31322                      :                                                               A-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--AC-G-G------G--G-----CT--TT--TCTT--G----A--T---A---------T----TAATC-G--AT-A-G-A--T--C----TT-GAT-AG-A--A-AC-T--GA-A-C--A-A-----G-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---T-AC---A--G-AA-TA-TTG-A--CC--AG---T-C---A-AG-A-G-T-
gi|31323                      :                                                               t-G---CC-A-T--A-A--GG-C-C-T--GT-G-G------G--G-----TT-ATA--TTTT--G----A--T---A--C---GG-T----AA----G--AT-A-G-A-----C----TA-T-G-A--A--G-GC-T--AACA-C--T-AG----T-----T---T---TGT-G-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-CA-T----T---A-A----A--A-AA-TG-TTT-T--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-Tctggtatcgat
gi|31324                      :                                                             tgA-G---CC-A-T--G-T--GG-C-C-C--AC-ATG------G--CTTTTTCT-TTA--TCTT--A----A--T------C---G----------------AT-A-T-A--T--C----TT-G-A-T--A--A-AC-T--GA-A-C--A-AG----T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---T-AC------A-AA-TA-TTT-A--CA--AG---T-C---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31325                      :                                                               A-G---CC-A-T--T-A--GG-C-C-T--GC-A-G------G--C-----CT-TTA--T----------A--T---A--C---GG-T----TT----G--AT-A-G-A--C--C----TA-G-C-A--A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---T-T-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CA--TT---T-A---A-AG-A-G-T-TATtgat
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gi|31327                      :                                                               A-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--AT-G-G------G--C-----CT-TTA--TCTT--G----A--T---A--C---GG-T----TA----G--AT-A-A-A--A--C----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-T--A-AC----A-----T---T---TGT-T-T-T-A--------T------------A-T-G-----T-T--T----T---A-A----A--A-AT-TG-CTT-T--TG--AG---T-A---A-AG-A-A-T-TATgga
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Reference ( family-265 )      :                             AACACTAAATCG---TCC-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--GC-G-G------G--C-----CT-ATA--TCTT--G----A--T---A--C---GG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--C----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-N-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-N--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
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gi|31241                      :                       ccaaaaAACAAAAAATCGAC-TCC-A------A-G-GC-TA-G---C--A-T--G-A--GA-C-C-C--AC-G-G---------C-----CT-TT---TCTT--G----A--T---AATC---AA-T----C-----G--AT-A-G-A--T--C----TT-GAT-A--A--A-AC-T--GA-A-C--A-AG----T-----T---T----GT-T-C-T-A--------A------------C-T-G-----T-C--T----T---T-AC---AC-A-AA-TA-TTT-A--CC--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TATctgat
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gi|31243                      :                         ccatAACA--AAATTGA--TTC--T-C--CA-G-GC-TA-G---CC-A-T--G-A--AG-C-C-C--ACAG-G------G--C-----CT--TT--TCTT--G----A--T---A--T---CA-A----TG----A--AG-A-G-C--T--C----TA---T----A--A-AC-T---G-A-C--A-AG----T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----------AC---A--A-AA-TA--TT-A--CC--AG---T-AAG-A-AG-A-G-T-TATtgat
gi|31244                      :                       ccaaaaAACA--AAATTGA--TTC-TC-G--CA-G-GC--A-G---CC-A-T--G-A--AG-C-C-C--AC-A-G------G--G-----CT------TTTT--G----A--T---A--T---AA-C----T-----G--AT-A-G-A--T--C----TT-G-A-T--A--A-AC-T--GA-A-C--A-AG----T-----T---T----GT-T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---T-AC---A--A-AA-TA-TTT-A--CC--AG---T-----A-AG-A-G-T-Ttgat
gi|31245                      :                                                    ccaaaa-GT-TA-G---CC-A-T--G-A--AG-C-C-C--AC-A-G------GGTC-----TT-TTT--TCTT--G----A--T---A--T---CA-T----C-----G--AT-A-T-A--TT-C----TT-G-A-T--A--A-AC-T--GA-A-C--A-AAG---T-----T---T---TGC-T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---TTAC---A--A-A--TA-TTT-A--CC--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TATttga
gi|31246                      :                            ccaaaaaagcaaaaattgattctcgcca-G-GT-G--G---CC-A-T--GGA--GG-T-GAT--GT-G-G------GG-C-----CT-TT---TCTT--T----A--T---A---------T----CAAACCG--AT-A-G-AACC--C----TT-G-A-C--A--A-AT-G--AA-A-C--A-ACT---T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A---G-----T-CTTT----T---T-CC---A--A-AA-TATTTT-A--CGT-AG---T-----A-AG-A-G-T-TATtgat
gi|31247                      :        caaaaaactcgacttttccaagACACAAAATCGAT-TCC--T-C--CA-G-GT-GA-G---CC-A-G--G-A--GG-TGC-T--AC-G-G---------C-----CT-TTT--CTTT--G----A--T---A---------T----CA----A--AT-GCG-A--TACC----TT-G-A-A--A--A-AA-TG-AA-A-C--A-CT----T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---C-AC---A--A-AA-AA-TTT-A--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-T
gi|31248                      :                           aagACACAAAATCG---ACT-CT-C--CA-G-GTTGA-G---CC-A-TC-G-A--GG-C-C-CT-GT-G-G------G--C-----CT-TTT--TCTTT-G----A--T---AT-C---AA-T----T-----G--AT-A-G-A--C--C----TT-GAT-A--A--A-TG-A--AA-A-C--ACAG----T-----C---T---T-T-T-T-C-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---C-AC---A--A-AA-TA-TTT-A--CG---G---A-A---A-AG-A-G-T-T
gi|31249                      :                                                     aag-G-GT--A-G---CC-A-TC-G-A--AG-C-C-C--ACAG-G------G--C-----CT-TT---TATT--GTT--A--T---AT-C---AA-T----T-----G--AT-A-G-A--T--C----TT-GAT-A--A--C-AC-T--GA-A-C--A-AG----T-----TGGTT---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-T--T----T---
gi|31250                      :      aaaaaacaaaattttcgatctccAACAC-AAATCA---TCT-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--T-ATAGG-C-C-T--GC-A-G------G--C-----CT-TTA--T-----G----A--T---A--C---GG-T----TT----G--AT-A-G-A--C--CC---TA-G-C-A--A--A-AT-T--AA-AAC--A-AC----A-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CA--TT---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31251                      :             aaaaaattaaaattgcAACA--AAATTGA--TTC--T-C--CA-G-G---A-G---CC-A-T--G-A--AG-C-C-C--ACAG-G------G--C-----CT-TT---TCTT--G----A--T---AT-C---AA-T----TA-------AT-A-C-AC-T--C----GA-T-T-A--A-----C-T--GA-A-C--A-AG----T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---T-AC---A--A-AA-TA-TTT-A--CC--AG---T-A---A-AG-A-GCT-TAT
gi|31252                      :                                aaaAAATCA---CTC-TT----CA-G-GC-TA-GATACA-A-T--G-A--GG-C-C-CCCGC-A-G------G--T-----CT-AAA--TCTT--G----AAGT---A--T---CG-TCA--TA----T--AT-A-T-A--T--CA---CG-A-T-A--C--A-TC-T---A-T-T--A-AG----T-----T---T---TGA-T-C-T-AC-------C------------A-T-------C-C--T----T---A-AC---AT-A-AA-TA-TTT-C--CC--AG---G-A---A-AA-T-G-C-TATtgat
gi|31253                      :                       aaaaaaAAAACTAAATCG---TCT-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--AA-G-A------G--C-----CA-ATT--TCTT--G----A--C---A--T---GG-T----TC----A--AA-A-G-A--TC-C----TG-G-T-A--A--ACCC-T--AC-A-T--A-------T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------G------------A-T-G-----C-A--T----T---T-AC---A--A-AA-TA-TTT-C--TC--A----T-A---A-AA-A-cgat
gi|31254                      :                             AAAATTAAATTG---TCC-GT-A--CA-G-GT-TA-G---CC-A-T--G-A--G------------------------C-----C----A--TGTT--G----AA-T---A--C---AG-T----TA----A--GT-A-G-A--T--G----TA-G-T-ATAA--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA--G-TTT-T--CG--AG---TAA---A-AG-A-G-T-agataattga
gi|31255                      :                                  TAGATCT---TCC-GT-T--C--G-AT-TA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--AC-A-G------G--G-----CT-TTT--TCTT--A----A--T-----------T-T----TAATC-G--AT-A-G-A--T--C----TT-G-A-T--A--A-AC-T--GA-A-C--A-AG----T-----T---T---TGT-T-C-TAA--------C------------A-T-G-------C--T----T---T-AC---A--A-AA-TA-TTT-A--CC--AG---T-C---A-AG-A-G-T-Tagaatattgat
gi|31256                      :                         aagcaacgagAAATCG---ACT-CT-T--CA-G-GC-TA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--GC-A-G------G--T-----CT-AAA--TCTT--G----A--T---A--T---CG-T----AC----A--AT-A-A-A--T--CACGATA-G-----------AC-T--GA-A-C--A-AC----A-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-T-----T-T--T----T---A-AC---A--A-AA-TA-TTT-A--CC--AG---G-A---A-A--A-A-T-TActttgat
gi|31257                      :                               aaaaAAATCG---ACT-CT-T--CA-G-GC-TA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--GC-A-G------G--T-----CT-AAA--TCTT--G----A--T---A--T---CG-T----AC----A--AT-A-A-A--T--C----AC-G-A-T--A--C-AC-T--AA-T-T--A-AG----T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-C-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AT-TA-TTT-A--CC--AG---G-A---A-AA-T-G-C-TATattgat
gi|31258                      :                               aaaaAAATCGAA-TC---T-C--CA-G-GC-TA-G---CTTA-T--G-A--GG-T-C-C--GC-A-G------G--T-----AT-AAA--TCTT--G----A--T---A--T---CG-T----AAC---A--AT-A-A-A--T--C-----A-G-C-G--ATAA-AC-T--GA-A-T--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-C-----G-C--T----T---A-AC---AAGA-AA-TA-TTT-A--CC--AG---G-A---A-Atgat
gi|31259                      :                         aaaaAACATTAAATTG---TTC-GT-A--CA-G-GT-GA-G---TC-A-T--G-A--GG-C-C-C--AC-A-G------G--C-----TT-ATA--TCTT--G----C--T---A--C---AG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--G----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AA----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-A--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TATatgctactgat
gi|31260                      :                             AACATTAAATTG---TTC-GT-A--CA-G--T-GA-G---CC-A-T--G-A--G--C-C-C--AC-A-G------G--C-----TT-ATA--TCTT--G----A--T---A--C---AG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--G----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AA----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG--TT-A--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31261                      :                             AACATTAAATTG---TTC-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CCGA-T--G-A--GG-C-C-C--AC---G------G--C-----TT-ATA--TCTT--G----A--T---A--C---AG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--G----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-CA-A-AT----T-----T---T---TGTAT-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-A--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31262                      :                             AACATTAAATTG---TTC-GT-A--AA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--AC-A-G------G--C-----TT-ATA--TCTT--G----A--T---A--C---AG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--G----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-A--A-AA----A-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-A--C
gi|31263                      :                             AACAC--AATCA---TCT-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--T-A--GG-C-C-T--GC-A-G------G--C-----CT-TTA-----T--G----A--T---A--C---GG-T----TT----G--AT-A-G-A--C--C----TA-G-C----A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-ACATGTT-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CA--TT---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31264                      :                             AACATTAAATTG---TTC-GT-A--CA-GCGT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--AC-A-G------G--C-----TT-ATA--TCCT--CT---A--T---A--C---AG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--G----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-----T-A--------C------------A-T-G-----T-C-------T---A-A----A--A-AA-TG-TTT-A--CG--A----T-A---A-AG-A-G-T-TA
gi|31265                      :                             AACACTAAATCG---TCT-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--T-A--GG-C-C-T--GT-A-G------A--C-----CT-TTA--T-----G----A--T---A--C---GG-T----TC----G--AT-A-G-A--C--C----TA-G-C-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-A-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TC-TTT-T--CA--TT---T-A---A-CG-A-G-T-TATatga
gi|31266                      :                             AACACTAAATCG---TCT-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--T-A--GG-C-C-T--GT-A-G------A--C-----CT-TTA-----T--G----A--T---A--C---GGTT----TC----G--AT-A-GAA--C--C----TA-G-C----A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----------T---T---TGT-----T-A--------A------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC------A-AA-TC-TTT-T--CA--TT---T-A---A-CG-A-G-T-TAT
gi|31267                      :                             AACATTAAATTG---TCC-GT-A--CA-G-GT-CA-G---CC-ATT--G-A--GG-C-C-C--AC---A------G--C-----TT-ATA--TCTT--G-------T---A--CA--GG-T----TA----G--AT-A-G-A-----G----TA-G-T----A--A-AT-T--AA-ACC--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---C-AC---A--ACAA-TG-TTT-T--CG---G---T-A---A-AG-A-G-T-TA
gi|31268                      :                             AACACTAAATCA---TTC-AT-A--CA-G-GT-AA-G---CC-A-T--A-A--GG-C-C-C--AC-A-G------G--T-----TT-ATA--TCTT-------------------------------------------G-A--T--C----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-A-A--------T------------A-T-G-----T-T--T----T---A-AC---A--A-AA-TA-TTT-T--CA--AG---T-A---A-AG-A-G-T-AAT
gi|31270                      :                             AACACTAAATTG---TCT-GC-G--CA-T-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--TG-C-C-C--AT-G-G------G--C-----AT-ATT--TTTT--G----A--T---A--T---TG-T----AA----T--AT-A-G-A--T--C----TC-A-C-A--A--A-GT-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-A-A--------T------------A-T-G-----T-C--T----T---
gi|31271                      :                                   AAATCG---ACT-TT-T--CA-G-GC-AA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-T--GT-G-G------A--C-----TT-TTT--CTTT--G----A--T---AT-C---AA-T----C-----G--AT-A-G-A--C--C----TT-G-A-T--A--A-AT-G--AA-A-C----AC----T-----TA--T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---C-AC---A--A-AA-TA-CTT-A--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31272                      :                                ataAAATCGATCTCC-------CA-G-GC-TA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-T--GC-G-G------T--C-----TA-ATA--TCTT--G----A--T---A--T---CG-T----AC----A--AT-A-A-A--T--C----AC-G-A-T--A--A-AC-T--GA------A-AC----T-----T---T---TGT-T-T-T-A--------C------------A-T-C-----T-C--T----A---A-AC------A-AA-TA-TTT-A--CC--AG---G-A---A-AA-AGG-T-TAT
gi|31273                      :                            acagACTAAATTG---TCT-GT-G--CA-G-AT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--AT-G-G------G--C-----GT-ATT--TTTT--G----A--T---A--T---TG-T----AA----T--AT-A-T-A--T--C----AC-A-C-G--A--A-AT-T--GA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-A-A--------A------------A-T-G-----T-T--T----T---A-AC---A--G-AA-TA-TCTAC--CG--AG---T-ATACA-AG-A-A-T-TATtgat
gi|31274                      :                                        G---TCT-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-G--GG-C-C-C--AC-A-G------G--C-----AT-AT---TCTT--G----A--T---A--T---GG-T----TT----G--AC-A-G-A--T--A----TA-A-T-A--A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------TGTGTCTTAACAAA-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CG--AG---A-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31275                      :                          caaagccgaAAATCG---ACT-CT-C--CA-G-GC-TA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--GC-T-G------G--T-----TA-AAA--TTTT--G----A--T---AT-C---AA-A----TA-------AT-A-A-A--T--C----AC-G-A-T--A--A-AC-T--GA-A-C--A-AG----T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-T-----T-C--T----T---A-GC---A--A-AA-TA-TTT-A--CC--AA---G-A---A-AA-A-G-T-TAT
gi|31276                      :                                  aAAATCG---ACT-CT-C--CAAG-GC-TA-G---TC-A-T--G-A--GG-C-C-C--GA-C-G------G--T-----CT-AAA--TCTT--T----A--A---A--T---CG-TACAATA----GA-AT-ACG-A--T-----------------A--A-AC-T--GA-A-C--A-AC----G-----T---T---TGC-T-C-T-A--------C------------A-T-C-----T-C--T----T---G-CC---A--A-AA-TA-TTT-A--CC--AG---G-A---A-AA-A-G-T-TATtga
gi|31277                      :                                                                     aC-A-T--G-A--GGTC-C-C--GC-A-G------G--T------T-AAA--TCTT--G----A--T---A--T---CG-A----CA-------AT-A-G-A--C--A----CG-A-T-A--A--A-AC-T--GA-A-C--A-CA----T-----T---T---TGT-T-TCT-A--------C------------A-T-------C-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TA-TTT-A--CC--AG---A-A---A-AA-ATG-C-TATtgat
gi|31278                      :                                         aaaatcgactcttccatgctagA-G---CC-A-T----A--GG-G-C-C--GC-C-G---------T-----CT-AAA--TTTT--A----A--T---A--T---CG-T----AC----A--AT-A-A-A--T--C----AC-G-A-T--A--A-AC-T--GA-A-C--A-ACT---T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-AT----T-C--T----T---A-ACA--A--A-AA-TA-TTT-A--CC--AG---G-A---A-AA-A-G-T-TATtgat
gi|31279                      :               aaaatctgctctccggggctAAATCG---ACT-CT-T--CA-G-GC-TA-G---TC-A-C--G-A--GG-C-C-C--GC-C-G------A--T-----CT-ACA--TCTT--G----A--T---A--T---CG-T----AC----A--AT-A-T-A--T--CA---CG-A-T-T--A--A-AC-TGAAA-A-C--A-ACA---T-----T---T---TGT-----G-A--------C------------A-T-A-----A-CT-T----T---A-AC---C--A-Attgat
gi|31280                      :                                  aAAATCG---ACT-CT-C--CA-G-GC-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-T--GT-G-G------A--C-----CT-TTT--CTTT--G----A--T---AT-C---AA-T----C-----G--AT-A-G-A--C--C----TT-G-A-T--A--A-AT-G--AA-A-C--A-CT----T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---C-AC---A--A-AT-TA-TTT-A--CG--AA---T-A---A-AG-A-G-T-TATgaaatagttacca
gi|31281                      :                                  aAAATCG---ACT-CT-C--CA-G-GC-TA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--GC-C-G------G--T-----GT-AAA--TCTT--T----A--T---A--T---CG-T----AC----A--AT-A-G-A--T-------TACG-A-A--G--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGC-T-C-T-A--------C------------A-T-C-----T-C--T----T---A-CC---A--A-AA-TA-TTT-A--CC--AG---G-A---A-AA-A-G-T-TAT
gi|31282                      :                                                   a--CA-G-GC-TATG---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--GC---G------G--T-----CT-AAA--TCTT--G----A--T---A--T---CG-T----AC----A--AT-A-A-A--T--C----AC-G-A-T--A--A-AC-T--GA-A----A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A---------T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TA-TTA-C--CA--GG---------A-AG-A---T-TATtgat
gi|31283                      :                  aaaagactctcAACATTAA--TG---TTC-GT-A--CA-C-GC-TA------C-A-T--G-A--GG-C-C-------A-G------G--C-----TT-ATA--TCTT--G----A--T---A--C---AG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--G----TA-G-TAA--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AA----T-----T---T---TGT-TAT-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T----------A--A-AA-TG-TTT-A--CG--AG---T-A--------A-G-T-TATtgat
gi|31284                      :                                   AAATTG---TCCTAT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A----G-A--GA-C-C-C--AC-A-G------G--A-----CT-ATA--TCTTTTG----A--T---A--C---AACT----TA----G--AT-A-GCA--T--G----TA-G-TTA--A--A-AA-T--AA-A----A-AT----T-----T---T---TGT-C-T-T-A--------TT-----------A-TTG-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-ATT-A--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-TGTAT
gi|31285                      :                                  aAAATTG---TTC-GTTA--CA-G-TT-GA-G---CC-A-T--G-A--G--C-C-C--AC-A-G------G--C-----TC-ATA--TCTT--G----A--T---A--C---AG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--G----TATG-T-A--A--A-AC-T--AACA-C--A-AA----T-----T---T---TTT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTA-A--C---AG---T-A---A-AG-A-G-T-TATcga
gi|31286                      :                                   AAATCG---TTC-GT-A--CA-G-GT--A-G---CC-A-T--A-A--GG-C-C-C--AT-G-G------G--G-----TT-ATA--T-TT--G----A--T---A--C---A--T----TA----G--AT-A-G-A--C--C----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGA-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31287                      :                                   AAATTG---TCC-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--AC-A-G------G--C-----TT-ATA--TCTT--G----A--T---A--C---------------------------------------A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--TG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31288                      :                                   AAATTG---TCC-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG---C-C--AC-A-G------G--CT----TT-ATA--TCTT-------A--T---A--C---------------------------------------A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-ACT---T-----T---T---TGT-T-A---A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---T-AC---A--A-AA-TGTTTT-T--TG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31289                      :                                   AAATTG---TCC-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG---C-C--AC-A-G------G--C-----TT-ATA--TCTT-------A--T---A--C---------------------------------------A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---T-T-G-T-T-A--------C------------A-T-G-----T-T--T----T-----AC---A--A-AA-TGTTTT-T--TG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
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gi|31291                      :                                   AAATTG---TCC-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-C--A-A--GG-C-C-T--GC-A-G------G--C-----CT-ATA--TCTT--G----A--T---A--C---GG-T----AA----G--AT-A-G-A--T--T----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AT----T-----T---T---TGT-T-T-T-A--------T------------A-T-A-----T-C--T----T---A-AG---A--A-AA-
gi|31292                      :                                ACTAA-TTG---TC---T-A---A-G-GT-GA-G---C--A-T--G-A--GG-G-C-C--AC-A-G------G--C-----TTGATA--TCT---G----A--T---A--C---AG-TG---TA----G--AT-A-G-A--T--A----AA-G-TTA--A--A-AC-T--AA-A------AC----T-----T---T----GT-T-AGT-------------------------T-G-----T-C--T----TT--A-AC---A--A-AG-TA-TTT-TACCG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-Tgagtta
gi|31293                      :                                  aaAATCG---TTT-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--AC-A-T------G--C-----TT-ATA--TCTT--G----A--T---A--T---CG-T----CA----G--AT-A-A-A--T--C----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-G--------T------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TATtgaatattga
gi|31294                      :                                ATTGAATCA---TCC-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--AC-A-G------G--C-----TT-ATA--TCCT--GCATGA--T---A--T---GG-T----TA----G--AA-A-G-A--T--T----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-ATATACATGT------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-A--TG--AA---T-A---
gi|31295                      :                                                       A-G-GT-GA-GTC-CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--G--G-GCATGCAG--C-----CT-ACA--TCTT--G----A--T---A--C---GG-T----CA----G--AT-C-G-AT-T--T----TA-G---A--A--A-AC-T--AA-A-C--G-CC----T-----T---T---TGT-G-A-T-A--------T------------G-T-GTT---T-T--T----T---A-AG---A--A-AA-TG-TTT-T--CG--AGCAAT-A---A-AG-A-G-T-TATgtgatatt
gi|31296                      :                                                  ct--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--T-A--GG-C-C-T--GC-A-G------G--C-----CT-TTA--T-----G----A--T---A--C---GG-T----TT----G--AT-A-G-A--C--C----TA-G-C-A--A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CA--TT---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31297                      :                                                    --CA-G-GT-GA-----CA-A-T--T-A--GG-C-C-T--GC-A-G------G--C-----CT-TTA--T-----G----A--T---A--T---GT-T----T-----G--AT-A-G-A--C--C----TA-G-C-A--A--A--T-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T----GT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CA--TT---T-A---A-AGAA-G-T-TAT
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gi|31301                      :                                                    --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--TT-G-G------G--C-----GT-AT-------------------------------T----TA----T--AT-A-G-A--T--C----TC-A-C-G--A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-A-A--------A------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--G-AA-CA-TTA-A--TG--AG---T-A---A-A--A-A-T-TAT
gi|31302                      :                                                    --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--TT-G-G------G--C-----GT-AT-----TT-------A--T---A--------------------------A-G-A--T--C----TC-A-C-G--A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-A-A--------A------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--G-AA-CA-TTA-A--TG--AG---T-A---A-AA-A-A-T-TAT
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gi|31306                      :                                                    --CA-G-GT-GA-G---CC-A-G--G-A--GG-C-C-C--AC-A-G------G--C-----TT-ATA--TCTT--G----A--T---A--C---AA-T----TA----G--AT-A-G-A--T--G----TA-A-T-A--A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----TTTAAAT---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CG--AG---T-A---A-AG-A-T-T-TAT
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gi|31309                      :                                                    --CA-G-GT-AA-----CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--TT-G-G------G--C--------GTA--TTTT--A----A--TATCA--T---AA-T----T--------AT-A-GAA--T--C----TC-A-C-A--A--A-AT-T--AG-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-T-A-A--------A------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--G-AA-TA-TTA-A--CG--AG---T-A---A-AA-A-A-T-TAT
gi|31310                      :                                                    --CA-G-GT-AA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--TT-G-G------G--C--------GTA--TTTT--A----A--T---A--TCATAA-T----TA--------T-G-A-A--T--C----TC-A-C-A--A--A-AT-T--AG-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-T-A-A--------A------------A-T-G-----T-C--T----T-----AC---A--G-AA-TA-TTA-A--CG--AG---T-T---A-AA-A-A-T-TATcaat
gi|31311                      :                                                    --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-G-C-C--GT-C-G------A--C-----CT-ATA--TCTT--G----A--T---A--T---TG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--C----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-TC----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------T------------A-T-C-----T-T--T----TTAAA-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CA--AG---T-A---G-AG-A-G-T-TATcaat
gi|31312                      :                                                    --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GA-C-C-T--GT-G-G------G--C-----AT-ATT--TTTTTAA----A--T---A--T---CG-T----AA----T--AT-A-G-A--T--C----TC-A-C-T--A--A-AT-T--GA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-A-T--------T------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AT---A--AGAA-TA-TTT-A--TG--AG---A-A---ATAA-A-A-T-TAT
gi|31313                      :                                                    --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--TT-G-G------G---------T-GTA--TCTT----------T---A--C---CA-TCA--TA----ATTAT-A-G-A--T--C----TC-A-C-A--A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-A-A--------A------------A-T-G-----T-C--T----C---A-AC---A--G-AA-TA-TTA-A--CG--AG---T-A---A-AA-A-A-T-TAT
gi|31314                      :                                                    --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-T-C-T--GC-G-----------C-----CTTATT--TCTT--G----A--T---A--T---GG-T----TA----A--AT-A-G-A--T--C----TA-A-T-A--G--A-AA-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TAT-T-A-A-A--------T------------A-T-A-----A-A--T----A---C-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CG--AG---T-A---A-AG-A-caat
gi|31315                      :                                                    --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GC-C-C-T--GT-G-G------G-----------AT-----TT--A----A----------------T----TA----G--AT-A-A-A--T--C----TA-C-G-A--A--A-GC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---C---TGT-T-C-A-A--------T------------A-T-G-----T-T--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-ATT-T--CA--AG---T-A---A-TG-A-G-T-TAT
gi|31316                      :                                                    --CA-G-GT-GA-G---TC-A-T--G-A--GG-C-C-C--AC-A-T------G--C-----AT-ATA--TCTT--G----A--T---A--T---GG-T----TT----G--AC-A-G-A--T--G----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-T------------C------------A-T-T-----T-T--T----T---
gi|31317                      :                                                       A-G-GT-GA-G---CC-A-T--A-A--GG-C-C-C--GC-G-G------G--C-----CT-ATA--TCTT--A----A--T---A--C---AG-T----TG----G--AT-A-G-A--T--T----TT-G-T-T--A--A-AC-T--TA-A-C--A-AA----T-----T---T---TAT-T-C-A-A--------T------------A-T-G-----T-T--T----T---A-AC--------AA-TG-TTT-T--TC--AG---T-G---A-AG-A-G-T-TATt
gi|31318                      :                                                       A-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--AA-A-G------G--C-----AT-ATA--TCTT--G----A--T---A--T---GG-T----TT----G--AC-A-G-A--T--C----TA-G-C-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-----T-A--------C------------A-T-
gi|31319                      :                                                       A-G-GT-GA-G---TC-A-T--T-A--GG-C-C-T--GC-A-G---------C-----CT-CTA--T-----G----A--T---AA-C---GG-T----TC----G--AT-A-G-A--C--C----TA-G-C-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----G-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CA--TT---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31320                      :                                                       A-G-GT-GA-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--AA-G-G------G--C-----GT-ATT--TTTTT-A----A--T---A--T---CG-T----AA----T--AC-A-G-A--T--C----TT-G-C-G--A--A-GT-TC-AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-A-A--------T------------A-T-G-----T-C--T----C---A-AC---A--G-AA-TA-T
gi|31322                      :                                                               A-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--AC-G-G------G--G-----CT--TT--TCTT--G----A--T---A---------T----TAATC-G--AT-A-G-A--T--C----TT-GAT-AG-A--A-AC-T--GA-A-C--A-A-----G-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---T-AC---A--G-AA-TA-TTG-A--CC--AG---T-C---A-AG-A-G-T-
gi|31323                      :                                                               t-G---CC-A-T--A-A--GG-C-C-T--GT-G-G------G--G-----TT-ATA--TTTT--G----A--T---A--C---GG-T----AA----G--AT-A-G-A-----C----TA-T-G-A--A--G-GC-T--AACA-C--T-AG----T-----T---T---TGT-G-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-CA-T----T---A-A----A--A-AA-TG-TTT-T--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-Tctggtatcgat
gi|31324                      :                                                             tgA-G---CC-A-T--G-T--GG-C-C-C--AC-ATG------G--CTTTTTCT-TTA--TCTT--A----A--T------C---G----------------AT-A-T-A--T--C----TT-G-A-T--A--A-AC-T--GA-A-C--A-AG----T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---T-AC------A-AA-TA-TTT-A--CA--AG---T-C---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31325                      :                                                               A-G---CC-A-T--T-A--GG-C-C-T--GC-A-G------G--C-----CT-TTA--T----------A--T---A--C---GG-T----TT----G--AT-A-G-A--C--C----TA-G-C-A--A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---T-T-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CA--TT---T-A---A-AG-A-G-T-TATtgat
gi|31326                      :                                                               A-G---TC-A-T--G-A--G--C-C-C--AC-A-G------G--T------T-ATA--TCTT--C----A--T---ATAC---AG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--G----TA-G-T-A--A--A-AC----AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------AGT-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA--G-TTT-T--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31327                      :                                                               A-G---CC-A-T--G-A--GG-C-C-C--AT-G-G------G--C-----CT-TTA--TCTT--G----A--T---A--C---GG-T----TA----G--AT-A-A-A--A--C----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-T--A-AC----A-----T---T---TGT-T-T-T-A--------T------------A-T-G-----T-T--T----T---A-A----A--A-AT-TG-CTT-T--TG--AG---T-A---A-AG-A-A-T-TATgga
gi|31329                      :                                                               A-G---CC-A-TTTA-A--GG-C-C-C--GT-G-G------G--T------T-ATAATTTTT--G----A--T---A--C---G-------TA-------AT-A-GGA--C--C----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-CCAA-AC----T-----T---T----GTAT-A-T-A--------C------------A-T-G-----TAT--T----T---A-AC---A--A-AAATG-TTT-T--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-T
gi|31330                      :                                                                                                                                                                 --AT-A-G-A--T--C----TC-A-C-G--A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----T-----G---T---TGT-T-C-A-A--------T------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--G-AA-TA-TTT-A--CA--AA---T-A---C-AG-A-T-T-TATttga
gi|31331                      :                                 aaccatgaacatgtttttttaaatcaaaatA-G---TC-A-T--G-A--GG-C-C-C--AA-A-G------G--C-----CT-GTA--TCTT--G----A--C---A--C---GG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--C----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TCT-T-caat
gi|31334                      :                                                                      C-G-T--G-A--AG-C-C-C--AA-G-G------G--C-----CA-ATT--TCTT--G----A--T---A--T---GG-T----TC----A--TC-A-G-A--T--T----CA-G-G-T--A--A-TC-G--CA-A-C--A-TA----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------T------------G-T-G-----T-C--T----T---T-AC---A--A-AG-TA-TTT-A--Cc
gi|31335                      :                                                                       -A-T--G-A--GG-C-C-C--AC-A-G------G--T-----CT-AAA--TATT--G----A--T---A--T---CG-TA---TA-------AT-A-A-A--T--C----AC-G-A-T--A--A-AC-T--TA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-C-----A-T--T----T---A-AC---A--A-AA-TA-TTT-A--CA--AG---G-A---T-AA-A-G-T-TATcatataagaaataattga
gi|31336                      :                                                                                      -C-C--AC-A-G------G--C-----AC-ATA--TCTT--G----A--T---A--T---GG-G----TT----G--AC-A-G-A--T--C----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------T------------A-T-G-----T-T--T----T---A-AC---A--A-AA--A-TCT-T--TA--AG---T-A---A-tgat
gi|31337                      :                                                                                                                       --TCTT--G----A--T-----------G-T----CA----A--ATGA-A-A--G--C----TC-G-TTA--A--A-ACGT--AA-T-T--A-------T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------T------------A-T-T-----T-A--T----T---A--C---A--A-AA-TA-TTT-T--CA--GG---A-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31338                      :                                                                                                          agggcagatcttt--TCTT--G----A--T---A--C---GA-T----TA----A--AT-A-G-A--T--C----TA-G-T-A--T--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-A-A--------T------------G-T-G-----T-C--T----T---A-AT---G--A-AA-TA-TTT-T--CG--AT---T-A---A-AC-A-T-T-TATtg
gi|31340                      :                                                                                                                                                            ----G--AT-A-G-A--C--C----TA-G-C-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-A-T-T-T--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-C--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TGTtaat
gi|31341                      :                                                                                                                                                                                           tc--A--A-AC-T--GA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-A-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TA-TTT-A--CC--AG---G-A---A-AA-A-G-T-TAT
gi|31342                      :                                                                                                        caataaatcacgatA--TCTT--G----A--T---A--T---GG-T----TA-----------------------------------A--A-AC-T--AA-A-T--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TA-TTT-T--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TATtgat


blockSeqs                     :                                 AA      ATC   TA ATA             ATA      TT             CCG AT  CATGCA GT TTTTTC GA AAT    TT CATG        TCGTACAATAGA                 A AC AC ACGA AC TATA           GA            TCAG       GGT         TC    TATACATG GTGTCTTAACAA     CATGT   TT      TAAA   TTT AG       T   TAC  GCC        TAC
blockSeqs                     :                                 CA      AC    A  TA              TC       C              TG  AT  .      G  TT     TA T      TA TT          CCATCATAATT                  C C  T  C    AT ATAG           G             G          A           AT    C        T                TT      T       TT     A   C        T   AC   GT         AG 
blockSeqs                     :                                 CA      AT    T  C               .        C              A   AG  .      G  TT     T  T      T  T           TCGTCATAT                    A T  C  A    AG ATA            C             T          .           AG    .        .                T       A       TA     .   T        T   A    C          .  
blockSeqs                     :                                 CA      AA    C  C               .        .              A   AG  .      .  C      T  T      T  .           TCATAATTA                    G .  .  A    T  ATA            .             T          .           C     .        .                .       .       T      .   .        .   A    A          .  
blockSeqs                     :                                 CT      A     G  C               .        .              A   AG  .      .  C      T  T      .  .           TACAGTTAG                    . .  .  .    T  ATA            .             A          .           C     .        .                .       .       T      .   .        .   A    C          .  
blockSeqs                     :                                 TT      A     T  G               .        .              A   AG  .      .  C      T  T      .  .           TCAATCAA                     . .  .  .    T  TAA            .             T          .           C     .        .                .       .       T      .   .        .   A    C          .  
blockSeqs                     :                                 TT      A     G  C               .        .              G   AT  .      .  C      T  A      .  .           ATCAATCG                     . .  .  .    T  TTA            .             T          .           C     .        .                .       .       T      .   .        .   A    C          .  
blockSeqs                     :                                 TT      A     G  C               .        .              A   G   .      .  C      T  A      .  .           TCAAACCG                     . .  .  .    T  TTA            .             .          .           C     .        .                .       .       T      .   .        .   A    C          .  
blockSeqs                     :                                 TT      A     G  A               .        .              A   G   .      .  C      T  T      .  .           TTTAATCG                     . .  .  .    A  TTA            .             .          .           C     .        .                .       .       T      .   .        .   A    C          .  
blockSeqs                     :                                 TT      .     C  C               .        .              A   A   .      .  C      T  A      .  .           TCGTAACA                     . .  .  .    T  TTA            .             .          .           C     .        .                .       .       C      .   .        .   A    G          .  
blockSeqs                     :                                 TT      .     C  A               .        .              G   A   .      .  T      T  T      .  .           CGGTTTCG                     . .  .  .    T  AT             .             .          .           C     .        .                .       .       C      .   .        .   A    G          .  
blockSeqs                     :                                 CT      .     G  A               .        .              A   G   .      .  C      T  A      .  .           CAGGTTAG                     . .  .  .    T  AT             .             .          .           C     .        .                .       .       A      .   .        .   A    A          .  
blockSeqs                     :                                 CT      .     G  T               .        .              A   G   .      .  C      T  A      .  .           CAACTTAG                     . .  .  .    T  AT             .             .          .           T     .        .                .       .       T      .   .        .   A    C          .  
blockSeqs                     :                                 TT      .     G  T               .        .              G   G   .      .  C      A  A      .  .           CAGTGTAG                     . .  .  .    T  AT             .             .          .           A     .        .                .       .       A      .   .        .   T    C          .  
blockSeqs                     :                                 CT      .     G  T               .        .              A   A   .      .  C      A  A      .  .           ACGGTTCG                     . .  .  .    T  AT             .             .          .           A     .        .                .       .       T      .   .        .   A    C          .  
blockSeqs                     :                                 CT      .     G  C               .        .              A   A   .      .  C      T  A      .  .           TCAATCG                      . .  .  .    A  AT             .             .          .           C     .        .                .       .       A      .   .        .   C    G          .  
blockSeqs                     :                                 CT      .     G  A               .        .              A   G   .      .  C      A  A      .  .           TCAATCG                      . .  .  .    A  AC             .             .          .           C     .        .                .       .       T      .   .        .   C    C          .  
blockSeqs                     :                                 TT      .     G  A               .        .              G   A   .      .  C      A  A      .  .           TTAATCG                      . .  .  .    G  AA             .             .          .           A     .        .                .       .       A      .   .        .   T    C          .  
blockSeqs                     :                                 CT      .     G  A               .        .              G   A   .      .  C      A  A      .  .           TCAATGA                      . .  .  .    G  CA             .             .          .           A     .        .                .       .       A      .   .        .   A    C          .  
blockSeqs                     :                                 TT      .     G  A               .        .              G   A   .      .  C      A  A      .  .           TCAATTG                      . .  .  .    A  TA             .             .          .           C     .        .                .       .       A      .   .        .   A    C          .  
blockSeqs                     :                                 C       .     A  A               .        .              A   A   .      .  C      A  A      .  .           TCAATTG                      . .  .  .    T  TA             .             .          .           C     .        .                .       .       A      .   .        .   A    G          .  
blockSeqs                     :                                 C       .     G  A               .        .              A   A   .      .  C      A  A      .  .           CGGTTTG                      . .  .  .    A  TA             .             .          .           C     .        .                .       .       A      .   .        .   A    G          .  
blockSeqs                     :                                 .       .     T  A               .        .              A   A   .      .  C      A  A      .  .           TCAATTA                      . .  .  .    C  AT             .             .          .           C     .        .                .       .       A      .   .        .   A    G          .  
blockSeqs                     :                                 .       .     G  A               .        .              A   A   .      .  A      T  A      .  .           TGGTTCA                      . .  .  .    A  AT             .             .          .           A     .        .                .       .       A      .   .        .   A    A          .  
blockSeqs                     :                                 .       .     G  A               .        .              G   A   .      .  T      A  T      .  .           CAGTTAA                      . .  .  .    A  CG             .             .          .           A     .        .                .       .       A      .   .        .   A    G          .  
blockSeqs                     :                                 .       .     C  A               .        .              A   A   .      .  T      T  T      .  .           TCGTACA                      . .  .  .    A  TA             .             .          .           A     .        .                .       .       A      .   .        .   A    A          .  
blockSeqs                     :                                         .     C  G               .        .              G   A   .      .  T      T  A      .  .           TCGTACA                      . .  .  .    A  TA             .             .          .           A     .        .                .       .       A      .   .        .   T    A          .  
blockSeqs                     :                                         .     C  T               .        .              G   A   .      .  T      A  T      .  .           CAGTTAG                      . .  .  .    A  TA             .             .          .           A     .        .                .       .       A      .   .        .   A    G          .  
blockSeqs                     :                                         .     C  G               .        .              A   A   .      .  C      A  A      .  .           CAGTTAG                      . .  .  .    A  TA             .             .          .           A     .        .                .       .       C      .   .        .   T    A          .  
blockSeqs                     :                                         .     C  A               .        .              A   G   .      .  T      A  A      .  .           CAGTTAG                      . .  .  .    A  TA             .             .          .           A     .        .                .       .       A      .   .        .   T    G          .  
blockSeqs                     :                                         .     G  C               .        .              A   G   .      .  C      T  A      .  .           CAGTTAG                      . .  .  .    A  CA             .             .          .           A     .        .                .       .       C      .   .        .   T    C          .  
blockSeqs                     :                                         .     G  C               .        .              G   G   .      .  C      A  A      .  .           CGGTTTG                      . .  .  .    A  TA             .             .          .           C     .        .                .       .       A      .   .        .   T    G          .  
blockSeqs                     :                                         .     G  T               .        .              G   G   .      .  T      A  A      .  .           CAGTTAG                      . .  .  .    A  CA             .             .          .           C     .        .                .       .       A      .   .        .   A    G          .  
blockSeqs                     :                                         .     G  C               .        .              A   A   .      .  T      A  T      .  .           CGGTTCG                      . .  .  .    A  AT             .             .          .           T     .        .                .       .       A      .   .        .   A    C          .  
blockSeqs                     :                                         .     G  C               .        .              A   T   .      .  A      A  A      .  .           TTGTAAT                      . .  .  .    C  AT             .             .          .           C     .        .                .       .       A      .   .        .   T    C          .  
blockSeqs                     :                                         .     G  A               .        .              G   C   .      .  T      A  A      .  .           TCAATCG                      . .  .  .    T  CG             .             .          .           A     .        .                .       .       G      .   .        .   A    C          .  
blockSeqs                     :                                         .     A  A               .        .              G   A   .      .  T      A  A      .  .           TCGTACA                      . .  .  .    C  TA             .             .          .           C     .        .                .       .       A      .   .        .   A    C          .  
blockSeqs                     :                                         .     G  A               .        .              G   C   .      .  G      A  A      .  .           TTGTAAT                      . .  .  .    C  AT             .             .          .           C     .        .                .       .       A      .   .        .   A    G          .  
blockSeqs                     :                                         .     G  A               .        .              G   C   .      .  A      A  A      .  .           TGGTTTG                      . .  .  .    A  TA             .             .          .           C     .        .                .       .       A      .   .        .   A    C          .  
blockSeqs                     :                                         .     G  A               .        .              G   G   .      .  T      T  A      .  .           TCAAATA                      . .  .  .    C  AT             .             .          .           C     .        .                .       .       C      .   .        .   A    A          .  
blockSeqs                     :                                         .     .  A               .        .              G   C   .      .  C      A  A      .  .           TCGTACA                      . .  .  .    G  TT             .             .          .           C     .        .                .       .       A      .   .        .   A    G          .  
blockSeqs                     :                                         .     .  A               .        .              G   A   .      .  C      A  A      .  .           TCGTACA                      . .  .  .    C  AT             .             .          .           C     .        .                .       .       A      .   .        .   C    G          .  
blockSeqs                     :                                         .     .  A               .        .              G   A   .      .  C      A  A      .  .           TCAATCG                      . .  .  .    G  AA             .             .          .           T     .        .                .       .       A      .   .        .   A    G          .  
blockSeqs                     :                                         .     .  A               .        .              A   A   .      .  C      A  A      .  .           TCGTACA                      . .  .  .    T  AT             .             .          .           A     .        .                .       .       A      .   .        .   A    G          .  
blockSeqs                     :                                         .     .  A               .        .              A   G   .      .  G      A  A      .  .           TCGTACA                      . .  .  .    C  TA             .             .          .           A     .        .                .       .       A      .   .        .   A    G          .  
blockSeqs                     :                                         .     .  .               .        .              A   A   .      .  C      A  A      .  .           CAGTTAG                      . .  .  .    A  TA             .             .          .           A     .        .                .       .       A      .   .        .   T    G          .  
blockSeqs                     :                                         .     .  .               .        .              A   A   .      .  T      A  A      .  .           CAGTTAG                      . .  .  .    A  TA             .             .          .           A     .        .                .       .       T      .   .        .   T    G          .  
blockSeqs                     :                                         .     .  .               .        .              A   A   .      .  C      A  A      .  .           CGGATAG                      . .  .  .    A  TA             .             .          .           T     .        .                .       .       A      .   .        .   T    G          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              A   A   .      .  T      A  A      .  .           CGGTAAG                      . .  .  .    A  TA             .             .          .           C     .        .                .       .       A      .   .        .   T    G          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              A   A   .      .  T      A  A      .  .           TCGTCAG                      . .  .  .    A  TA             .             .          .           T     .        .                .       .       A      .   .        .   T    G          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              G   A   .      .  T      A  A      .  .           TGGTTAG                      . .  .  .    A  TA             .             .          .           A     .        .                .       .       A      .   .        .   T    G          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              A   A   .      .  T      A  A      .  .           CGGTCAG                      . .  .  .    A  TA             .             .          .           A     .        .                .       .       A      .   .        .   A    A          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              A   A   .      .  C      A  A      .  .           CGGTTTG                      . .  .  .    A  CA             .             .          .           A     .        .                .       .       A      .   .        .   T    A          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              A   G   .      .  C      A  A      .  .           CGGTTTG                      . .  .  .    A  CA             .             .          .           A     .        .                .       .       A      .   .        .   T    A          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              G   A   .      .  T      T  T      .  .           CAGCTAG                      . .  .  .    A  CA             .             .          .           A     .        .                .       .       A      .   .        .   T    G          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              G   A   .      .  T      T  A      .  .           TGGTTCG                      . .  .  .    A  TA             .             .          .           A     .        .                .       .       A      .   .        .   T    G          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              G   A   .      .  T      T  A      .  .           CAGCTAG                      . .  .  .    A  CG             .             .          .           A     .        .                .       .       A      .   .        .   T    G          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              G   A   .      .  C      A  A      .  .           CAATTAG                      . .  .  .    A  CG             .             .          .           C     .        .                .       .       A      .   .        .   A    G          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              A   G   .      .  C      A  A      .  .           CAATTAG                      . .  .  .    A  CG             .             .          .           C     .        .                .       .       T      .   .        .   A    G          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              T   G   .      .  C      A  A      .  .           TTGTTAG                      . .  .  .    A  TA             .             .          .           C     .        .                .       .       A      .   .        .   A    C          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              T   G   .      .  C      A  A      .  .           TCGTAAT                      . .  .  .    C  TA             .             .          .           C     .        .                .       .       A      .   .        .   T    G          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              T   A   .      .  G      A  A      .  .           TGGTTAA                      . .  .  .    C  TA             .             .          .           A     .        .                .       .       A      .   .        .   G    G          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              G   G   .      .  G      A  T      .  .           TGGTTTG                      . .  .  .    C  TA             .             .          .           C     .        .                .       .       A      .   .        .   T    G          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              A   A   .      .  G      A  A      .  .           CAGTTGG                      . .  .  .    C  CA             .             .          .           A     .        .                .       .       A      .   .        .   T    G          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              G   A   .      .  A      A  T      .  .           TGGTTTG                      . .  .  .    A  CA             .             .          .           T     .        .                .       .       A      .   .        .   T    G          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              A   A   .      .  C      A  A      .  .           TCGTAAT                      . .  .  .    A  TA             .             .          .           A     .        .                .       .       A      .   .        .   T    G          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              A   G   .      .  C      A  A      .  .           TTAATCG                      . .  .  .    A  CT             .             .          .           T     .        .                .       .       C      .   .        .   A    A          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              G   G   .      .  T      G  A      .  .           CGGTAAG                      . .  .  .    A  CA             .             .          .           T     .        .                .       .       A      .   .        .   A    G          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              T   G   .      .  T      G  A      .  .           CGGTTTG                      . .  .  .    C  TA             .             .          .           A     .        .                .       .       A      .   .        .   T    G          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              T   C   .      .  C      A  T      .  .           CGGTTAG                      . .  .  .    C  GA             .             .          .           C     .        .                .       .       A      .   .        .   A    G          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              G   G   .      .  C      A  T      .  .           CGGTTAG                      . .  .  .    A  TA             .             .          .           C     .        .                .       .       A      .   .        .   A    A          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              G   G   .      .  A      G  A      .  .           TGGTTCA                      . .  .  .    C  TT             .             .          .           A     .        .                .       .       T      .   .        .   T    C          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              T   G   .      .  C      A  A      .  .           TCGTATA                      . .  .  .    C  CA             .             .          .           C     .        .                .       .       A      .   .        .   T    A          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              G   G   .      .  A      A  A      .  .           TGGGTTG                      . .  .  .    A  CA             .             .          .           T     .        .                .       .       T      .   .        .   T    C          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              G   A   .      .  C      A  A      .  .           CGATTAA                      . .  .  .    A  CG             .             .          .           C     .        .                .       .       A      .   .        .   T    G          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              A   G   .      .  A      A  A      .  .           TAACTG                       . .  .  .    A  GA             .             .          .           A     .        .                .       .       A      .   .        .   A    A          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              G   A   .      .  C      C  A      .  .           TCATCG                       . .  .  .    T  AT             .             .          .           C     .        .                .       .       A      .   .        .   T    A          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              A   A   .      .  G      A  T      .  .           TCGACA                       . .  .  .    A  CA             .             .          .           C     .        .                .       .       A      .   .        .   A    G          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              G   G   .      .  C      A  A      .  .           CATTAG                       . .  .  .    A  TA             .             .          .           A     .        .                .       .       A      .   .        .   T    G          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              A   G   .      .  T      T  A      .  .           TGTTTG                       . .  .  .    T  TA             .             .          .           C     .        .                .       .       T      .   .        .   T    G          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              A   G   .      .  C      T  A      .  .           CGGTAA                       . .  .  .    T  TA             .             .          .           A     .        .                .       .       A      .   .        .   T    A          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              G   A   .      .  C      A  .      .  .           TGGTTA                       . .  .  .    A  CG             .             .          .           A     .        .                .       .       A      .   .        .   T    A          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              A   A   .      .  C      T  .      .  .           TAATT                        . .  .  .    T  TA             .             .          .           T     .        .                .       .       A      .   .        .   A    A          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              G   G   .      .  C      A  .      .  .           GTCAA                        . .  .  .    A  GT             .             .          .           A     .        .                .       .       A      .   .        .   A    A          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              A   G   .      .  C      G  .      .  .           TCAA                         . .  .  .    A  AT             .             .          .           C     .        .                .       .       A      .   .        .   A    G          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              A   A   .      .  A      A  .      .  .           TTAT                         . .  .  .    A  TA             .             .          .           A     .        .                .       .       A      .   .        .   T    G          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              G   G   .      .  .      A  .      .  .           TTAT                         . .  .  .    A  TA             .             .          .           C     .        .                .       .       A      .   .        .   T    C          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              A   A   .      .  .      A  .      .  .           TTAG                         . .  .  .    C  CA             .             .          .           A     .        .                .       .       .      .   .        .   T    G          .  
blockSeqs                     :                                                                  .        .              A   A   .      .  .      .  .      .  .           CGTA                         . .  .  .    A  T              .             .          .           C     .        .                .       .       .      .   .        .   C    .          .  
blockSeqs                     :                                                                           .              A   .   .      .  .      .  .      .  .           CG                           . .  .  .    A  C              .             .          .           C     .        .                .       .       .      .   .        .   A                  
blockSeqs                     :                                                                           .              A   .   .      .  .      .  .      .  .           C                            . .  .  .    C  C              .             .          .           T     .        .                .       .       .      .   .        .   T                  
blockSeqs                     :                                                                           .              .   .   .      .  .      .  .      .  .           C                            . .  .  .    A  T              .             .          .           C     .        .                .       .       .      .   .        .                      
blockSeqs                     :                                                                                          .   .   .      .  .      .  .      .  .           C                            . .  .  .    C  A              .             .          .           A     .        .                .       .       .      .   .                               
blockSeqs                     :                                                                                                                      .      .  .           C                            . .  .  .    A  A              .             .          .           .     .        .                .       .       .      .   .                               
blockSeqs                     :                                                                                                                             .  .           .                            . .  .  .    A  .              .             .          .           .     .        .                .       .                                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                             .  .           .                            . .  .  .    .  .              .             .          .           .     .        .                .       .                                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                         . .  .  .    .  .              .             .          .           .     .        .                .       .                                                  
blockSeqs                     :                                                                                                                                                                         . .  .  .    .  .              .             .          .           .     .        .                                                                           
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Reference ( family-265 )      :                                            AACACTAAATCG---TCC-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--GA--GG-C-CC--G--CA---GG--C-----CT-ATA--TCT----T--G-A--T---A--C---GG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--C----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-N-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-N--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
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gi|31254                      :                                            AAAATTAAATTG---TCC-GT-A--CA-G-GT-TA-G---CC-A-T--GA--G--------------------C-----C----A--TGT----T--G-AA-T---A--C---AG-T----TA----A--GT-A-G-A--T--G----TA-G-T-ATAA--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA--G-TTT-T--CG--AG---TAA---A-AG-A-G-T-agataattga
gi|31255                      :                                                 TAGATCT---TCC-GT-T--C--G-AT-TA-G---CC-A-T--GA--GG-C-CC--A--CA---GG--G-----CT-TTT--TCT----T--A-A--T-----------T-T----TAATC-G--AT-A-G-A--T--C----TT-G-A-T--A--A-AC-T--GA-A-C--A-AG----T-----T---T---TGT-T-C-TAA--------C------------A-T-G-------C--T----T---T-AC---A--A-AA-TA-TTT-A--CC--AG---T-C---A-AG-A-G-T-Tagaatattgat
gi|31256                      :                                        aagcaacgagAAATCG---ACT-CT-T--CA-G-GC-TA-G---CC-A-T--GA--GG-C-CC--G--CA---GG--T-----CT-AAA--TCT----T--G-A--T---A--T---CG-T----AC----A--AT-A-A-A--T--CACGATA-G-----------AC-T--GA-A-C--A-AC----A-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-T-----T-T--T----T---A-AC---A--A-AA-TA-TTT-A--CC--AG---G-A---A-A--A-A-T-TActttgat
gi|31257                      :                                              aaaaAAATCG---ACT-CT-T--CA-G-GC-TA-G---CC-A-T--GA--GG-C-CC--G--CA---GG--T-----CT-AAA--TCT----T--G-A--T---A--T---CG-T----AC----A--AT-A-A-A--T--C----AC-G-A-T--A--C-AC-T--AA-T-T--A-AG----T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-C-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AT-TA-TTT-A--CC--AG---G-A---A-AA-T-G-C-TATattgat
gi|31258                      :                                              aaaaAAATCGAA-TC---T-C--CA-G-GC-TA-G---CTTA-T--GA--GG-T-CC--G--CA---GG--T-----AT-AAA--TCT----T--G-A--T---A--T---CG-T----AAC---A--AT-A-A-A--T--C-----A-G-C-G--ATAA-AC-T--GA-A-T--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-C-----G-C--T----T---A-AC---AAGA-AA-TA-TTT-A--CC--AG---G-A---A-Atgat
gi|31259                      :                                        aaaaAACATTAAATTG---TTC-GT-A--CA-G-GT-GA-G---TC-A-T--GA--GG-C-CC--A--CA---GG--C-----TT-ATA--TCT----T--G-C--T---A--C---AG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--G----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AA----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-A--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TATatgctactgat
gi|31260                      :                                            AACATTAAATTG---TTC-GT-A--CA-G--T-GA-G---CC-A-T--GA--G--C-CC--A--CA---GG--C-----TT-ATA--TCT----T--G-A--T---A--C---AG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--G----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AA----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG--TT-A--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31261                      :                                            AACATTAAATTG---TTC-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CCGA-T--GA--GG-C-CC--A--C----GG--C-----TT-ATA--TCT----T--G-A--T---A--C---AG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--G----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-CA-A-AT----T-----T---T---TGTAT-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-A--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31262                      :                                            AACATTAAATTG---TTC-GT-A--AA-G-GT-GA-G---CC-A-T--GA--GG-C-CC--A--CA---GG--C-----TT-ATA--TCT----T--G-A--T---A--C---AG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--G----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-A--A-AA----A-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-A--C
gi|31263                      :                                            AACAC--AATCA---TCT-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--TA--GG-C-CT--G--CA---GG--C-----CT-TTA---------T--G-A--T---A--C---GG-T----TT----G--AT-A-G-A--C--C----TA-G-C----A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-ACATGTT-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CA--TT---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31264                      :                                            AACATTAAATTG---TTC-GT-A--CA-GCGT-GA-G---CC-A-T--GA--GG-C-CC--A--CA---GG--C-----TT-ATA--TCC----T--CTA--T---A--C---AG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--G----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-----T-A--------C------------A-T-G-----T-C-------T---A-A----A--A-AA-TG-TTT-A--CG--A----T-A---A-AG-A-G-T-TA
gi|31265                      :                                            AACACTAAATCG---TCT-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--TA--GG-C-CT--G--TA---GA--C-----CT-TTA--T---------G-A--T---A--C---GG-T----TC----G--AT-A-G-A--C--C----TA-G-C-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-A-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TC-TTT-T--CA--TT---T-A---A-CG-A-G-T-TATatga
gi|31266                      :                                            AACACTAAATCG---TCT-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--TA--GG-C-CT--G--TA---GA--C-----CT-TTA---------T--G-A--T---A--C---GGTT----TC----G--AT-A-GAA--C--C----TA-G-C----A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----------T---T---TGT-----T-A--------A------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC------A-AA-TC-TTT-T--CA--TT---T-A---A-CG-A-G-T-TAT
gi|31267                      :                                            AACATTAAATTG---TCC-GT-A--CA-G-GT-CA-G---CC-ATT--GA--GG-C-CC--A--CA----G--C-----TT-ATA--TCT----T--G----T---A--CA--GG-T----TA----G--AT-A-G-A-----G----TA-G-T----A--A-AT-T--AA-ACC--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---C-AC---A--ACAA-TG-TTT-T--CG---G---T-A---A-AG-A-G-T-TA
gi|31268                      :                                            AACACTAAATCA---TTC-AT-A--CA-G-GT-AA-G---CC-A-T--AA--GG-C-CC--A--CA---GG--T-----TT-ATA--TCT----T----------------------------------------G-A--T--C----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-A-A--------T------------A-T-G-----T-T--T----T---A-AC---A--A-AA-TA-TTT-T--CA--AG---T-A---A-AG-A-G-T-AAT
gi|31270                      :                                            AACACTAAATTG---TCT-GC-G--CA-T-GT-GA-G---CC-A-T--GA--TG-C-CC--A--TG---GG--C-----AT-ATT--TTT----T--G-A--T---A--T---TG-T----AA----T--AT-A-G-A--T--C----TC-A-C-A--A--A-GT-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-A-A--------T------------A-T-G-----T-C--T----T---
gi|31271                      :                                                  AAATCG---ACT-TT-T--CA-G-GC-AA-G---CC-A-T--GA--GG-C-CT--G--TG---GA--C-----TT-TTT--CTT----T--G-A--T---AT-C---AA-T----C-----G--AT-A-G-A--C--C----TT-G-A-T--A--A-AT-G--AA-A-C----AC----T-----TA--T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---C-AC---A--A-AA-TA-CTT-A--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31272                      :                                               ataAAATCGATCTCC-------CA-G-GC-TA-G---CC-A-T--GA--GG-C-CT--G--C----GG--T-----CTAATA--TCT----T--G-A--T---A--T---CG-T----AC----A--AT-A-A-A--T--C----AC-G-A-T--A--A-AC-T--GA------A-AC----T-----T---T---TGT-T-T-T-A--------C------------A-T-C-----T-C--T----A---A-AC------A-AA-TA-TTT-A--CC--AG---G-A---A-AA-AGG-T-TAT
gi|31273                      :                                           acagACTAAATTG---TCT-GT-G--CA-G-AT-GA-G---CC-A-T--GA--GG-C-CC--A--TG---GG--C-----GT-ATT--TTT----T--G-A--T---A--T---TG-T----AA----T--AT-A-T-A--T--C----AC-A-C-G--A--A-AT-T--GA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-A-A--------A------------A-T-G-----T-T--T----T---A-AC---A--G-AA-TA-TCTAC--CG--AG---T-ATACA-AG-A-A-T-TATtgat
gi|31274                      :                                                       G---TCT-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--GG--GG-C-CC--A--CA---GG--C-----AT-AT---TCT----T--G-A--T---A--T---GG-T----TT----G--AC-A-G-A--T--A----TA-A-T-A--A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------TGTGTCTTAACAAA-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CG--AG---A-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31275                      :                                         caaagccgaAAATCG---ACT-CT-C--CA-G-GC-TA-G---CC-A-T--GA--GG-C-CC--G--CT---GG--T-----TA-AAA--TTT----T--G-A--T---AT-C---AA-A----TA-------AT-A-A-A--T--C----AC-G-A-T--A--A-AC-T--GA-A-C--A-AG----T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-T-----T-C--T----T---A-GC---A--A-AA-TA-TTT-A--CC--AA---G-A---A-AA-A-G-T-TAT
gi|31276                      :                                                 aAAATCG---ACT-CT-C--CAAG-GC-TA-G---TC-A-T--GA--GG-C-CC--G--AC---GG--T-----CT-AAA--TCT----T--T-A--A---A--T---CG-TACAATA----GA-AT-ACG-A--T-----------------A--A-AC-T--GA-A-C--A-AC----G-----T---T---TGC-T-C-T-A--------C------------A-T-C-----T-C--T----T---G-CC---A--A-AA-TA-TTT-A--CC--AG---G-A---A-AA-A-G-T-TATtga
gi|31277                      :                                                                                    aC-A-T--GA--GGTC-CC--G--CA---GG--T------T-AAA--TCT----T--G-A--T---A--T---CG-A----CA-------AT-A-G-A--C--A----CG-A-T-A--A--A-AC-T--GA-A-C--A-CA----T-----T---T---TGT-T-TCT-A--------C------------A-T-------C-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TA-TTT-A--CC--AG---A-A---A-AA-ATG-C-TATtgat
gi|31278                      :                                                        aaaatcgactcttccatgctagA-G---CC-A-T---A--GG-G-CC--G--CC---G---T-----CT-AAA--TTT----T--A-A--T---A--T---CG-T----AC----A--AT-A-A-A--T--C----AC-G-A-T--A--A-AC-T--GA-A-C--A-ACT---T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-AT----T-C--T----T---A-ACA--A--A-AA-TA-TTT-A--CC--AG---G-A---A-AA-A-G-T-TATtgat
gi|31279                      :                              aaaatctgctctccggggctAAATCG---ACT-CT-T--CA-G-GC-TA-G---TC-A-C--GA--GG-C-CC--G--CC---GA--T-----CT-ACA--TCT----T--G-A--T---A--T---CG-T----AC----A--AT-A-T-A--T--CA---CG-A-T-T--A--A-AC-TGAAA-A-C--A-ACA---T-----T---T---TGT-----G-A--------C------------A-T-A-----A-CT-T----T---A-AC---C--A-Attgat
gi|31280                      :                                                 aAAATCG---ACT-CT-C--CA-G-GC-GA-G---CC-A-T--GA--GG-C-CT--G--TG---GA--C-----CT-TTT--CTT----T--G-A--T---AT-C---AA-T----C-----G--AT-A-G-A--C--C----TT-G-A-T--A--A-AT-G--AA-A-C--A-CT----T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---C-AC---A--A-AT-TA-TTT-A--CG--AA---T-A---A-AG-A-G-T-TATgaaatagttacca
gi|31281                      :                                                 aAAATCG---ACT-CT-C--CA-G-GC-TA-G---CC-A-T--GA--GG-C-CC--G--CC---GG--T-----GT-AAA--TCT----T--T-A--T---A--T---CG-T----AC----A--AT-A-G-A--T-------TACG-A-A--G--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGC-T-C-T-A--------C------------A-T-C-----T-C--T----T---A-CC---A--A-AA-TA-TTT-A--CC--AG---G-A---A-AA-A-G-T-TAT
gi|31282                      :                                                                  a--CA-G-GC-TATG---CC-A-T--GA--GG-C-CC--G--C----GG--T-----CT-AAA--TCT----T--G-A--T---A--T---CG-T----AC----A--AT-A-A-A--T--C----AC-G-A-T--A--A-AC-T--GA-A----A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A---------T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TA-TTA-C--CA--GG---------A-AG-A---T-TATtgat
gi|31283                      :                                 aaaagactctcAACATTAA--TG---TTC-GT-A--CA-C-GC-TA------C-A-T--GA--GG-C-C-------A---GG--C-----TT-ATA--TCT----T--G-A--T---A--C---AG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--G----TA-G-TAA--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AA----T-----T---T---TGT-TAT-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T----------A--A-AA-TG-TTT-A--CG--AG---T-A--------A-G-T-TATtgat
gi|31284                      :                                                  AAATTG---TCCTAT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A----GA--GA-C-CC--A--CA---GG--A-----CT-ATA--TCT----TTTG-A--T---A--C---AACT----TA----G--AT-A-GCA--T--G----TA-G-TTA--A--A-AA-T--AA-A----A-AT----T-----T---T---TGT-C-T-T-A--------TT-----------A-TTG-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-ATT-A--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-TGTAT
gi|31285                      :                                                 aAAATTG---TTC-GTTA--CA-G-TT-GA-G---CC-A-T--GA--G--C-CC--A--CA---GG--C-----TC-ATA--TCT----T--G-A--T---A--C---AG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--G----TATG-T-A--A--A-AC-T--AACA-C--A-AA----T-----T---T---TTT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTA-A--C---AG---T-A---A-AG-A-G-T-TATcga
gi|31286                      :                                                  AAATCG---TTC-GT-A--CA-G-GT--A-G---CC-A-T--AA--GG-C-CC--A--TG---GG--G-----TT-ATA--T-T----T--G-A--T---A--C---A--T----TA----G--AT-A-G-A--C--C----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGA-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31287                      :                                                  AAATTG---TCC-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--GA--GG-C-CC--A--CA---GG--C-----TT-ATA--TCT----T--G-A--T---A--C---------------------------------------A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--TG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31288                      :                                                  AAATTG---TCC-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--GA--GG---CC--A--CA---GG--CT----TT-ATA--TCT----T----A--T---A--C---------------------------------------A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-ACT---T-----T---T---TGT-T-A---A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---T-AC---A--A-AA-TGTTTT-T--TG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31289                      :                                                  AAATTG---TCC-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--GA--GG---CC--A--CA---GG--C-----TT-ATA--TCT----T----A--T---A--C---------------------------------------A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---T-T-G-T-T-A--------C------------A-T-G-----T-T--T----T-----AC---A--A-AA-TGTTTT-T--TG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31290                      :                                                  AAATCG---TTC-AT-ATACA-G-GT-GA-G---AC-A-T--GA--GG-C-TT--A--CA---TG--C-----CT-ATA--TCT----T--G-A--T---A--C---GG-A----TA----G--AT-A-G-A--T--C----T---------A--A-AC-T--AA-A-C--A-ACTCAGT-----T---T---TGT-T-C-A-A--------T------------A-T-G-----T-C--CTAAGT---A-AC---C--A-AA-TG-TTT-T--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-T
gi|31291                      :                                                  AAATTG---TCC-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-C--AA--GG-C-CT--G--CA---GG--C-----CT-ATA--TCT----T--G-A--T---A--C---GG-T----AA----G--AT-A-G-A--T--T----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AT----T-----T---T---TGT-T-T-T-A--------T------------A-T-A-----T-C--T----T---A-AG---A--A-AA-
gi|31292                      :                                               ACTAA-TTG---TC---T-A---A-G-GT-GA-G---C--A-T--GA--GG-G-CC--A--CA---GG--C-----TTGATA--TCT-------G-A--T---A--C---AG-TG---TA----G--AT-A-G-A--T--A----AA-G-TTA--A--A-AC-T--AA-A------AC----T-----T---T----GT-T-AGT-------------------------T-G-----T-C--T----TT--A-AC---A--A-AG-TA-TTT-TACCG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-Tgagtta
gi|31293                      :                                                 aaAATCG---TTT-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--GA--GG-C-CC--A--CA---TG--C-----TT-ATA--TCT----T--G-A--T---A--T---CG-T----CA----G--AT-A-A-A--T--C----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-G--------T------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TATtgaatattga
gi|31294                      :                                               ATTGAATCA---TCC-GT-A--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--GA--GG-C-CC--A--CA---GG--C-----TT-ATA--TCCTGCAT--G-A--T---A--T---GG-T----TA----G--AA-A-G-A--T--T----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-ATATACATGT------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-A--TG--AA---T-A---
gi|31295                      :                                                                      A-G-GT-GA-GTC-CC-A-T--GA--GG-C-CC--GGGCATGCAG--C-----CT-ACA--TCT----T--G-A--T---A--C---GG-T----CA----G--AT-C-G-AT-T--T----TA-G---A--A--A-AC-T--AA-A-C--G-CC----T-----T---T---TGT-G-A-T-A--------T------------G-T-GTT---T-T--T----T---A-AG---A--A-AA-TG-TTT-T--CG--AGCAAT-A---A-AG-A-G-T-TATgtgatatt
gi|31296                      :                                                                 ct--CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--TA--GG-C-CT--G--CA---GG--C-----CT-TTA--T---------G-A--T---A--C---GG-T----TT----G--AT-A-G-A--C--C----TA-G-C-A--A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CA--TT---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31297                      :                                                                   --CA-G-GT-GA-----CA-A-T--TA--GG-C-CT--G--CA---GG--C-----CT-TTA--T---------G-A--T---A--T---GT-T----T-----G--AT-A-G-A--C--C----TA-G-C-A--A--A--T-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T----GT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CA--TT---T-A---A-AGAA-G-T-TAT
gi|31298                      :                                                                   --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--TA--GG-C-CT--G--CA---GG--C-----CT-TTA--T---------G-A--T---A--C---GG-T----TT----G--AT-A-G-A--C--C----TA-G-C-A--A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CA--TT---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31299                      :                                                                   --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--GA--GG---CC--A--CA---GG--CT----TT-ATA--TCT----T----A--T---A--C---------------------------------------A-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-ACT---T-----T---T---TGT-T-A---A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T-----AC---A--A-AA-TG-TTT-T--TG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31300                      :                                                                   --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--GA--GG-C-CC--T--TG---GG--C-----GT-AT--------------------------------T----TA----T--AT-A-G-A--T--C----TC-A-C-G--A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-A-A--------A------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--G-AA-CA-TTA-A--TG--AG---T-A---A-AA-A-A-T-TAT
gi|31301                      :                                                                   --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--GA--GG-C-CC--T--TG---GG--C-----GT-AT--------------------------------T----TA----T--AT-A-G-A--T--C----TC-A-C-G--A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-A-A--------A------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--G-AA-CA-TTA-A--TG--AG---T-A---A-A--A-A-T-TAT
gi|31302                      :                                                                   --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--GA--GG-C-CC--T--TG---GG--C-----GT-AT-----T----T----A--T---A--------------------------A-G-A--T--C----TC-A-C-G--A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-A-A--------A------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--G-AA-CA-TTA-A--TG--AG---T-A---A-AA-A-A-T-TAT
gi|31303                      :                                                                   --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--GA--GG-C-CC--G--CA---GG--C-----AT-ATA--TCT----T--G-A--T---T--C---AG-C----TA----G--AT-A-A-A--T--G----TC-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-A-A--------T------------A-T-G-----T-C--T----T----------T--A-AA-TG-TTT-T--TG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TA
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gi|31305                      :                                                                   --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--GA--GG-T-GC--G--CA---GG--C-----CT-ATA--TCT----T--C-A--T---C--C---AG-C----TA----G--AT-A-A-A--T--G----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-A-A--------T------------A-T-G-----T-T--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-GTT-T--CG--AA---T-A---A-AG-A-G-T-TA
gi|31306                      :                                                                   --CA-G-GT-GA-G---CC-A-G--GA--GG-C-CC--A--CA---GG--C-----TT-ATA--TCT----T--G-A--T---A--C---AA-T----TA----G--AT-A-G-A--T--G----TA-A-T-A--A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----TTTAAAT---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CG--AG---T-A---A-AG-A-T-T-TAT
gi|31307                      :                                                                   --CA-G-GT-GA-G---CC-A-G--GA--GG-C-CC--A--CA---GG--C-----TT-ATA--TCT----T--G-A--T---A--C---AA-T----TA----G--AT-A-G-A--T--G----TA-----A--A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---TAAATTT-T-T-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CG--AG---T-A---A-AG-A-T-T-TAT
gi|31308                      :                                                                   --CA-A-GT-GA-G---CC-A-C--AT--GG-C-C---G--CG---GG--G-----CC-ATA--TCT----T--G-A--T---A--C---GG------TA----A--AT-A-G-A--T--T----TA-GTT-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-TAA--------T------------A-T-A-----T-C--T----T---A-G----A--A-AA-TG-TTT-T--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31309                      :                                                                   --CA-G-GT-AA-----CC-A-T--GA--GG-C-CC--T--TG---GG--C--------GTA--TTT----T--A-A--TATCA--T---AA-T----T--------AT-A-GAA--T--C----TC-A-C-A--A--A-AT-T--AG-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-T-A-A--------A------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--G-AA-TA-TTA-A--CG--AG---T-A---A-AA-A-A-T-TAT
gi|31310                      :                                                                   --CA-G-GT-AA-G---CC-A-T--GA--GG-C-CC--T--TG---GG--C--------GTA--TTT----T--A-A--T---A--TCATAA-T----TA--------T-G-A-A--T--C----TC-A-C-A--A--A-AT-T--AG-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-T-A-A--------A------------A-T-G-----T-C--T----T-----AC---A--G-AA-TA-TTA-A--CG--AG---T-T---A-AA-A-A-T-TATcaat
gi|31311                      :                                                                   --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--GA--GG-G-CC--G--TC---GA--C-----CT-ATA--TCT----T--G-A--T---A--T---TG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--C----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-TC----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------T------------A-T-C-----T-T--T----TTAAA-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CA--AG---T-A---G-AG-A-G-T-TATcaat
gi|31312                      :                                                                   --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--GA--GA-C-CT--G--TG---GG--C-----AT-ATT--TTT----TTAA-A--T---A--T---CG-T----AA----T--AT-A-G-A--T--C----TC-A-C-T--A--A-AT-T--GA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-A-T--------T------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AT---A--AGAA-TA-TTT-A--TG--AG---A-A---ATAA-A-A-T-TAT
gi|31313                      :                                                                   --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--GA--GG-C-CC--T--TG---GG---------T-GTA--TCT----T-------T---A--C---CA-TCA--TA----ATTAT-A-G-A--T--C----TC-A-C-A--A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-A-A--------A------------A-T-G-----T-C--T----C---A-AC---A--G-AA-TA-TTA-A--CG--AG---T-A---A-AA-A-A-T-TAT
gi|31314                      :                                                                   --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--GA--GG-T-CT--G--C-----G--C-----CTTATT--TCT----T--G-A--T---A--T---GG-T----TA----A--AT-A-G-A--T--C----TA-A-T-A--G--A-AA-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TAT-T-A-A-A--------T------------A-T-A-----A-A--T----A---C-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CG--AG---T-A---A-AG-A-caat
gi|31315                      :                                                                   --CA-G-GT-GA-G---CC-A-T--GA--GC-C-CT--G--TG---GG-----------AT-----T----T--A-A----------------T----TA----G--AT-A-A-A--T--C----TA-C-G-A--A--A-GC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---C---TGT-T-C-A-A--------T------------A-T-G-----T-T--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-ATT-T--CA--AG---T-A---A-TG-A-G-T-TAT
gi|31316                      :                                                                   --CA-G-GT-GA-G---TC-A-T--GA--GG-C-CC--A--CA---TG--C-----AT-ATA--TCT----T--G-A--T---A--T---GG-T----TT----G--AC-A-G-A--T--G----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-T------------C------------A-T-T-----T-T--T----T---
gi|31317                      :                                                                      A-G-GT-GA-G---CC-A-T--AA--GG-C-CC--G--CG---GG--C-----CT-ATA--TCT----T--A-A--T---A--C---AG-T----TG----G--AT-A-G-A--T--T----TT-G-T-T--A--A-AC-T--TA-A-C--A-AA----T-----T---T---TAT-T-C-A-A--------T------------A-T-G-----T-T--T----T---A-AC--------AA-TG-TTT-T--TC--AG---T-G---A-AG-A-G-T-TATt
gi|31318                      :                                                                      A-G-GT-GA-G---CC-A-T--GA--GG-C-CC--A--AA---GG--C-----AT-ATA--TCT----T--G-A--T---A--T---GG-T----TT----G--AC-A-G-A--T--C----TA-G-C-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-----T-A--------C------------A-T-
gi|31319                      :                                                                      A-G-GT-GA-G---TC-A-T--TA--GG-C-CT--G--CA---G---C-----CT-CTA--T---------G-A--T---AA-C---GG-T----TC----G--AT-A-G-A--C--C----TA-G-C-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----G-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CA--TT---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31320                      :                                                                      A-G-GT-GA-G---CC-A-T--GA--GG-C-CC--A--AG---GG--C-----GT-ATT--TTT----TT-A-A--T---A--T---CG-T----AA----T--AC-A-G-A--T--C----TT-G-C-G--A--A-GT-TC-AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-A-A--------T------------A-T-G-----T-C--T----C---A-AC---A--G-AA-TA-T
gi|31322                      :                                                                              A-G---CC-A-T--GA--GG-C-CC--A--CG---GG--G-----CT--TT--TCT----T--G-A--T---A---------T----TAATC-G--AT-A-G-A--T--C----TT-GAT-AG-A--A-AC-T--GA-A-C--A-A-----G-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---T-AC---A--G-AA-TA-TTG-A--CC--AG---T-C---A-AG-A-G-T-
gi|31323                      :                                                                              t-G---CC-A-T--AA--GG-C-CT--G--TG---GG--G-----TT-ATA--TTT----T--G-A--T---A--C---GG-T----AA----G--AT-A-G-A-----C----TA-T-G-A--A--G-GC-T--AACA-C--T-AG----T-----T---T---TGT-G-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-CA-T----T---A-A----A--A-AA-TG-TTT-T--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-Tctggtatcgat
gi|31324                      :                                                                            tgA-G---CC-A-T--GT--GG-C-CC--A--CAT--GG--CTTTTTCT-TTA--TCT----T--A-A--T------C---G----------------AT-A-T-A--T--C----TT-G-A-T--A--A-AC-T--GA-A-C--A-AG----T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---T-AC------A-AA-TA-TTT-A--CA--AG---T-C---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31325                      :                                                                              A-G---CC-A-T--TA--GG-C-CT--G--CA---GG--C-----CT-TTA--T-----------A--T---A--C---GG-T----TT----G--AT-A-G-A--C--C----TA-G-C-A--A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---T-T-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-T--CA--TT---T-A---A-AG-A-G-T-TATtgat
gi|31326                      :                                                                              A-G---TC-A-T--GA--G--C-CC--A--CA---GG--T------T-ATA--TCT----T--C-A--T---ATAC---AG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--G----TA-G-T-A--A--A-AC----AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------AGT-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA--G-TTT-T--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31327                      :                                                                              A-G---CC-A-T--GA--GG-C-CC--A--TG---GG--C-----CT-TTA--TCT----T--G-A--T---A--C---GG-T----TA----G--AT-A-A-A--A--C----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-T--A-AC----A-----T---T---TGT-T-T-T-A--------T------------A-T-G-----T-T--T----T---A-A----A--A-AT-TG-CTT-T--TG--AG---T-A---A-AG-A-A-T-TATgga
gi|31329                      :                                                                              A-G---CC-A-TTTAA--GG-C-CC--G--TG---GG--T------T-ATAATTTT----T--G-A--T---A--C---G-------TA-------AT-A-GGA--C--C----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-CCAA-AC----T-----T---T----GTAT-A-T-A--------C------------A-T-G-----TAT--T----T---A-AC---A--A-AAATG-TTT-T--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-T
gi|31330                      :                                                                                                                                                                            --AT-A-G-A--T--C----TC-A-C-G--A--A-AT-T--AA-A-C--A-AC----T-----G---T---TGT-T-C-A-A--------T------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--G-AA-TA-TTT-A--CA--AA---T-A---C-AG-A-T-T-TATttga
gi|31331                      :                                                aaccatgaacatgtttttttaaatcaaaatA-G---TC-A-T--GA--GG-C-CC--A--AA---GG--C-----CT-GTA--TCT----T--G-A--C---A--C---GG-T----TA----G--AT-A-G-A--T--C----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TCT-T-caat
gi|31334                      :                                                                                     C-G-T--GA--AG-C-CC--A--AG---GG--C-----CA-ATT--TCT----T--G-A--T---A--T---GG-T----TC----A--TC-A-G-A--T--T----CA-G-G-T--A--A-TC-G--CA-A-C--A-TA----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------T------------G-T-G-----T-C--T----T---T-AC---A--A-AG-TA-TTT-A--Cc
gi|31335                      :                                                                                      -A-T--GA--GG-C-CC--A--CA---GG--T-----CT-AAA--TAT----T--G-A--T---A--T---CG-TA---TA-------AT-A-A-A--T--C----AC-G-A-T--A--A-AC-T--TA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-C-----A-T--T----T---A-AC---A--A-AA-TA-TTT-A--CA--AG---G-A---T-AA-A-G-T-TATcatataagaaataattga
gi|31336                      :                                                                                                    -CC--A--CA---GG--C-----AC-ATA--TCT----T--G-A--T---A--T---GG-G----TT----G--AC-A-G-A--T--C----TA-G-T-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------T------------A-T-G-----T-T--T----T---A-AC---A--A-AA--A-TCT-T--TA--AG---T-A---A-tgat
gi|31337                      :                                                                                                       --G--CA---GA--T-----CT-TT---TCT----T--G-A--T-----------G-T----CA----A--ATGA-A-A--G--C----TC-G-TTA--A--A-ACGT--AA-T-T--A-------T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------T------------A-T-T-----T-A--T----T---A--C---A--A-AA-TA-TTT-T--CA--GG---A-A---A-AG-A-G-T-TAT
gi|31338                      :                                                                                                                              agg--TCT----T--G-A--T---A--C---GA-T----TA----A--AT-A-G-A--T--C----TA-G-T-A--T--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-A-A--------T------------G-T-G-----T-C--T----T---A-AT---G--A-AA-TA-TTT-T--CG--AT---T-A---A-AC-A-T-T-TATtg
gi|31340                      :                                                                                                                                                                       ----G--AT-A-G-A--C--C----TA-G-C-A--A--A-AC-T--AA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-A-T-T-T--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TG-TTT-C--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TGTtaat
gi|31341                      :                                                                                                                                                                                                      tc--A--A-AC-T--GA-A-C--A-AC----T-----T---T---TGT-T-C-T-A--------C------------A-T-A-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TA-TTT-A--CC--AG---G-A---A-AA-A-G-T-TAT
gi|31342                      :                                                                                                                  caataaatcacgatA--TCT----T--G-A--T---A--T---GG-T----TA-----------------------------------A--A-AC-T--AA-A-T--A-AC----T-----T---T---TGT-T-A-T-A--------C------------A-T-G-----T-C--T----T---A-AC---A--A-AA-TA-TTT-T--CG--AG---T-A---A-AG-A-G-T-TATtgat