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Reference ( gi|76587 ) : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
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gi|76673 : AT-C-A-AA-G-C-C-T--T------C--T--C---A-TC--C-T---T-G--G--T--T-CG--AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-A-C-CC-TA--G-T-T--AAAG--A---TTTT
gi|76685 : T-C-A-AA-G-C-G-A--T------A--T--TG--C-CC--T-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--AAT-A--------T-A-G-C-GC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76686 : T-C-A-AA-G-C-G-A--T------A--T--T---G-CC--T-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-GC-AG--G-T-T--AAA
gi|76684 : T-C-ATAA-G-C-T-C--TT-----G--T--T---C-CC--T-T-----G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-TAA--------T-AGG-C-CC-AG--G-T-TAAAAAG--T---TTTT
gi|76691 : -C-A-AA-G-C-G-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AGT-GTT-T--AAAG--T---TTT
gi|76690 : -C-A-AA-G-C-T-C--T------A--T--T---C-CC--C-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CT-AG--A-T-T--AAGA--T---TTT
gi|76692 : -A-AG-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AA--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76694 : -A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-A--G--TTGT-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T---G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76693 : -A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CCA-T-T---T-G--C--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A----------A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76695 : -A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CCGCT-T---T-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CA-AGCCG-T-TA-AAAG--T---TTT
gi|76696 : -AA-G-C-T-C--TG-----A--TC-T---C-CC--C-T---T-G--G--T--T-C---AA-ATTA--G--A-T-A--------T-G-----CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76698 : -C-T-C--T------G--T--C---C-CC--C-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G---TC-AG--G-T-T--CAAG--T---TTTT
gi|76697 : -C--T------A--T--C---C-CC--T-T---T-G--G--T--T-A---AA-A--T--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-TG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76699 : gtt--T--T---C-CC--T-T---T-A--G--T--T-C---AA-T--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTT
gi|76701 : C--T-T---T-A--G--T--T-G---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAA--T---TTTT
Alignments
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lowQualScore : . . . . . . . .. ...... .. .. ... . .. . ... . .. .. .. . ... . .. .. .. . . ........ . . . . . .. . . .. .. ...
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Reference ( family-241 ) : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76577 : ATAT-C-A-AA-G-C-T-C--T------G--T--C---C-CC--C-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76578 : ATAT-C-A-AA-G-C-T-C--T------G--T--C---C-CC--C-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-TG-AAAG--T---TTT
gi|76579 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CT--T-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-AT-------T-A-G---CC-AG--G-T-T--AAAA--T---TTTT
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gi|76591 : ATAT-T-A-AA-----C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-A--G--T--T-C---AA-A-----G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-C--AAAG--T---TTTT
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gi|76653 : ATATTC-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CT--TAT---T-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G---CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76654 : ATAT-C-A-AA-G-C-C--------------T--T---T-CC--T-T---T-G--C--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CCTAT--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76655 : ATAT-C-A-AA-G-CTC-C--T------G--T--T---C-CC--T-T---G-G--T--T--T-C---AA-A--A--GA-A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-
gi|76656 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--C---C-CT--C-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------A-A-A-CTCC-AG--G-T-T--
gi|76657 : ATAT-C-A-A--G-C-C-C--T------G--T--T---C-CT--G-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-ATACACATGT-A-G-A-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTTtttgaaaat
gi|76659 : ATAT-C-A-AA-A-G-C-C--T------A--T--TT--C-CC--T-TAGTT-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-C-C-CC-GA--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76660 : ATAT-C-A-AA-A-G-C-C--T------A--T--T---C-TC--T-T---A-T--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-TC-AG--G-T-T--AAAG--T---TCTT
gi|76662 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--TTAAGCTA--T--C---C-CT--C-T---T-T--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-TAA--------A-A-A-T-CC-AG--G-T-T--TGAA--T---TTTT
gi|76663 : ATAT-C-A-AA-G-C-T-C--T------A--A--T---C-CC--C-T---T-A--T--T--T-C---AA-A--T--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AA--G-T-A--AGAG--T---TT
gi|76664 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--TTAAG--A--TA-T---C-CC--TCT---T-T--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------A-A-A-CTCC-AG--G-T-T--TGAA--T---TT
gi|76667 : TAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-A--G--T--T-C---GA-A--A--G--A-T-A--------TAA-G-C-CC-AG--G-T-T--AAGA--T---TTTT
gi|76669 : TAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-A--G--T--T-CA--AA-A--A--G--A-T-A--------G-A-G-C-CC-AG--G-T-C--AAAG--T---TTTT
gi|76671 : TAT-C-A-AA-T-A-C-C--T------A--T--C---C-CT--C-T---T-G--G--T--T-T---AA-A--A--C--A-T-A--------A-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76673 : AT-C-A-AA-G-C-C-T--T------C--T--C---A-TC--C-T---T-G--G--T--T-CG--AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-A-C-CC-TA--G-T-T--AAAG--A---TTTT
gi|76675 : AT-C-A-AA-G-C-T-C--T------G--T--C---C-CC--CCT---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A----------A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAGGAT---TTT
gi|76676 : AT-C-A-AA-AAC-C-C--T------A--T--T---C-CT--T-T---T-A--G--T--T-C---AA-T--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--T-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76677 : AC-C-A-AA-A-C-T-C--T------G--T--C---C-CC--C-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--AAGA--A-T-A--------T-A-G---AC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76678 : AT-C-A-AA-G-C-C-C--TT-----A--T--T---G-CC--C-T---T-G--C--T--T-T---GA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-TAGAAGG--T---TTTT
gi|76679 : AT-C-T-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---CTCC--C-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T---G-CACC-AG--G-TGT--AAAG--T---TTT
gi|76680 : AT-C-A-AA-G-C-C-C--T------G--T--A---C-C-----T---T-G--G--T--T-CA--AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G---CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TCTT
gi|76682 : AT-C-A-AA-G-C-C-T--T------C--T--C---A-TC--C-T---T-G--G--T--T-C---GA-A--A--G--A-T-A--------T-A-A-C-CC-TA--G-T-T--AAAG--T---
gi|76684 : T-C-ATAA-G-C-T-C--TT-----G--T--T---C-CC--T-T-----G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-TAA--------T-AGG-C-CC-AG--G-T-TAAAAAG--T---TTTT
gi|76685 : T-C-A-AA-G-C-G-A--T------A--T--TG--C-CC--T-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--AAT-A--------T-A-G-C-GC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76686 : T-C-A-AA-G-C-G-A--T------A--T--T---G-CC--T-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-GC-AG--G-T-T--AAA
gi|76690 : -C-A-AA-G-C-T-C--T------A--T--T---C-CC--C-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CT-AG--A-T-T--AAGA--T---TTT
gi|76691 : -C-A-AA-G-C-G-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AGT-GTT-T--AAAG--T---TTT
gi|76692 : -A-AG-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AA--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76693 : -A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CCA-T-T---T-G--C--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A----------A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76694 : -A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-A--G--TTGT-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T---G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76695 : -A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CCGCT-T---T-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CA-AGCCG-T-TA-AAAG--T---TTT
gi|76696 : -AA-G-C-T-C--TG-----A--TC-T---C-CC--C-T---T-G--G--T--T-C---AA-ATTA--G--A-T-A--------T-G-----CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76697 : -C--T------A--T--C---C-CC--T-T---T-G--G--T--T-A---AA-A--T--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-TG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76698 : gtt-C-T-C--T------G--T--C---C-CC--C-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G---TC-AG--G-T-T--CAAG--T---TTTT
gi|76699 : --T--T---C-CC--T-T---T-A--G--T--T-C---AA-T--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTT
gi|76701 : C--T-T---T-A--G--T--T-G---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAA--T---TTTT
Alignments
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lowQualScore : . . . . . . . .. ...... .. .. ... . .. . ... . .. .. .. . ... . .. .. .. . . ........ . . . . . .. . . .. .. ...
lowQualScore : 1 4 4 1 2 4 8 66 333333 66 44 555 4 77 2 777 2 66 66 00 4 555 4 66 22 88 8 8 88888888 4 8 8 2 8 55 4 4 77 00 666
consensus : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
Reference ( family-241 ) : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76577 : ATAT-C-A-AA-G-C-T-C--T------G--T--C---C-CC--C-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76578 : ATAT-C-A-AA-G-C-T-C--T------G--T--C---C-CC--C-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-TG-AAAG--T---TTT
gi|76579 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CT--T-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-AT-------T-A-G---CC-AG--G-T-T--AAAA--T---TTTT
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gi|76583 : ATAG-C-A-AA-G-C-T-C--T---------T--T---C-CC--C-C---T-T--G--T--T-C---AA-A--AA-G--A-T-A--------C-A-G-C-CC-AT--G-T-T--AAAG--T---TTT
gi|76584 : ATAT-C-A-CA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-A---T-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AT--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76585 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T---------C--T-T---T-G--C--T--T-C---GA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76586 : ATAT-C-A-C--G-C-C-C--T------A--T--T---C-C---T-A---T-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76587 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76588 : ATAT-C-A-AA-G-C-T-C--C------G--T--C---G-CC--T-T-----G--G--T--T-C---AA-A--A--G--G-T-A--------T-A-G-A-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76589 : ATAT-C-A-CA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-C---T-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-GC-AA--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76590 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--G--T---C-CC--T-T---T-A--G--T--T-C----A-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-A---G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76591 : ATAT-T-A-AA-----C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-A--G--T--T-C---AA-A-----G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-C--AAAG--T---TTTT
gi|76592 : ATATGC-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-C---T-T---T-A--G--A--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--ATAG--T---TTTT
gi|76593 : ATAT-C-A-AA-C-C-T-C--T------G--T--C---C-CC--C-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AATG--T---TTTT
gi|76594 : ATAT-C-A-AA-G-C-T-A--T------T--T--T---C-CC--C-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-C-G-A-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76595 : ATAC-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76596 : ATAC-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76597 : ATAT-T-A-AA-G-C-T-C--T------A--A--T---C-CC--C-T---T-A--G--T--T-T---AA-A--T--G--A-T-A--------T-A-G-T-CC-AA--G-T-A--AGAG--T---TTTT
gi|76598 : ATAT-C-A-AAAG-C-T-C--T------G--T--C---C-CC--T-T-----G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--TAAA--T---TTTT
gi|76599 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-AGT------T-A-G---CC-AGT-G-T-TA-AAAG--T---TTT
gi|76600 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G---CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
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gi|76602 : ATAT-C-A-AAAG-C-TTC--T------G--T--C---C-CC--C-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--GT-A-T-A--------G-A-G-C-CC-AG--GTT-T--AAAG--T---TTTT
gi|76603 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CTATT-T---T-A--G--T--T-C---AA-A--AA-G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76604 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CT--T-T---T-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--ATT-A--------T-A-GTT-CC-AG--T-T-T--AAAGA-T---TTTT
gi|76607 : ATAT-C-A-AA-G-C-CTC--T------A--T--A---C-CC--T-T---T----G--C--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-G-G-C-CCAAG--G-T-T--ATAG--T---TTTT
gi|76608 : ATAT-T-C-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--C-T---T-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76609 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------G--C--C---C-CA--C-T---T-G--A--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-A-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76610 : ATAT-A-A-AA-G-C-T-C--T------G--C--T---C-CC--T-T-----G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TT
gi|76611 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-C---T-T---T-G--C--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76612 : ATAT-C-A-AA-G-C-T-C--T------G--TCCT---C-CC--T-T---G-G--T--T--T-C---AA-A--A--G--A---A--------C-A-G-T-CC-AT--G-T-T--AAAG--TA--TTTT
gi|76614 : ATAT-C-A-AAAG-C-T-C--T------G--T--C---C-CC--T-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--AT-G--A-T-A--------T-A-GCC-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76615 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AGC-GTT-T--AAAG--T---TTT
gi|76616 : ATAT-C-A-AA-GCC-C-C--C------A--T--T-----TC--T-T---T-G--C--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76617 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CT--T-T---TTA--G--T--T-C---AA-T--A--G--A-T-A--------T-A-T-C-CC-AG--GTT-T--AAAG--T---TTTT
gi|76619 : ATAT-C-A-AA-G-C-C----T------A--T--T---C-CC--T-T---T-C--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76620 : ATAT-C-A-AA-G-C-T-C--T------G--T--C---C-CC--T-T-----G--G--T----A---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--GTT-T--AAAG--T---TTTT
gi|76621 : ATAT-C-A-A--G-C-C-TCTT------A--T--C---C-CT--T-T---T-G--C--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76622 : ATAT-C-A-AA-G-C-T-C--T------G--T--C---C-CC--C-T---T-G--G--T--T-T---AA-A--A--A--A-T-A--------T-A-G-C-CC-GG------T--AAAG--T---TTTT
gi|76623 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T---------T--T---C-CT--T-T---T-G--C--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T---AAG--T---TTTT
gi|76624 : ATAT-C-A-AAAG-C-C-C--T------A--T--T---C-CT--T-T---T-A--G--T--T-C---AA-T--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-TTAAAAG--T---TTTTt
gi|76625 : ATAT-C-A-AA-G-C-T-C--T------G-----T---C-CC--C-T---T-G--G--T--T-TTA-AA-A--A--A--A-T-A--------T-A-G-C-CC--G--G-T-----AAG--T---TTTT
gi|76626 : ATATTC-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CT--T-T---T-A--G--T--T-TTTAAA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AGT-G-T-TA-AAAG--T---TTT
gi|76628 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--C------A--T--C---C-CC--C-T---T-G--A--T--C-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--TGGGTTTT
gi|76630 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--A-T---T-G--C--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--TA--TTTT
gi|76631 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------AATT--C---C-CC--T-T---T-A--G--T--T-C---AA-A--AA-G--A-T-A--------T-A-A-C-CC-AG--G-T-TA-AAAG--T---TTTt
gi|76632 : ATAT-C-A-A--G-C-C-C--T------A--T--TTTCC-CC--T-T---T-A--G--T--T-C---AATA--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76634 : ATAT-T-A-AA-G-C-T-C--T------T--T--T---C-CC--C-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-G--------C-A-G-C-CC-AT--G-T-T--A
gi|76635 : ATAT-A-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--C---C-CT--C-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--T--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T---AAG--T---TTT
gi|76636 : ATATGT-A-AA-A-C-T-C--T------A--T--C---C-TT--C-T---T-T--G--T--T-C---AA-A--T--G--A-T----------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
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gi|76638 : ATAC-C-A-AA-A-C-C-C--T------A--T--C---C-CT--T-T---TTG--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-T-AC-AG--T-T-T--AACA--T---TTTT
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Reference ( family-241 ) : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
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gi|76585 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T---------C--T-T---T-G--C--T--T-C---GA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76586 : ATAT-C-A-C--G-C-C-C--T------A--T--T---C-C---T-A---T-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76587 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76588 : ATAT-C-A-AA-G-C-T-C--C------G--T--C---G-CC--T-T-----G--G--T--T-C---AA-A--A--G--G-T-A--------T-A-G-A-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76589 : ATAT-C-A-CA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-C---T-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-GC-AA--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76590 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--G--T---C-CC--T-T---T-A--G--T--T-C----A-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-A---G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76591 : ATAT-T-A-AA-----C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-A--G--T--T-C---AA-A-----G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-C--AAAG--T---TTTT
gi|76592 : ATATGC-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-C---T-T---T-A--G--A--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--ATAG--T---TTTT
gi|76593 : ATAT-C-A-AA-C-C-T-C--T------G--T--C---C-CC--C-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AATG--T---TTTT
gi|76594 : ATAT-C-A-AA-G-C-T-A--T------T--T--T---C-CC--C-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-C-G-A-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76595 : ATAC-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76596 : ATAC-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76597 : ATAT-T-A-AA-G-C-T-C--T------A--A--T---C-CC--C-T---T-A--G--T--T-T---AA-A--T--G--A-T-A--------T-A-G-T-CC-AA--G-T-A--AGAG--T---TTTT
gi|76598 : ATAT-C-A-AAAG-C-T-C--T------G--T--C---C-CC--T-T-----G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--TAAA--T---TTTT
gi|76599 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-AGT------T-A-G---CC-AGT-G-T-TA-AAAG--T---TTT
gi|76600 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G---CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76601 : ATAT-C-A-AA-GGC-C-C--T------A--T--T---C-CT--T-T---T-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76602 : ATAT-C-A-AAAG-C-TTC--T------G--T--C---C-CC--C-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--GT-A-T-A--------G-A-G-C-CC-AG--GTT-T--AAAG--T---TTTT
gi|76603 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CTATT-T---T-A--G--T--T-C---AA-A--AA-G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76604 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CT--T-T---T-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--ATT-A--------T-A-GTT-CC-AG--T-T-T--AAAGA-T---TTTT
gi|76607 : ATAT-C-A-AA-G-C-CTC--T------A--T--A---C-CC--T-T---T----G--C--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-G-G-C-CCAAG--G-T-T--ATAG--T---TTTT
gi|76608 : ATAT-T-C-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--C-T---T-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76609 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------G--C--C---C-CA--C-T---T-G--A--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-A-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76610 : ATAT-A-A-AA-G-C-T-C--T------G--C--T---C-CC--T-T-----G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TT
gi|76611 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-C---T-T---T-G--C--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76612 : ATAT-C-A-AA-G-C-T-C--T------G--TCCT---C-CC--T-T---G-G--T--T--T-C---AA-A--A--G--A---A--------C-A-G-T-CC-AT--G-T-T--AAAG--TA--TTTT
gi|76614 : ATAT-C-A-AAAG-C-T-C--T------G--T--C---C-CC--T-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--AT-G--A-T-A--------T-A-GCC-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76615 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AGC-GTT-T--AAAG--T---TTT
gi|76616 : ATAT-C-A-AA-GCC-C-C--C------A--T--T-----TC--T-T---T-G--C--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76617 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CT--T-T---TTA--G--T--T-C---AA-T--A--G--A-T-A--------T-A-T-C-CC-AG--GTT-T--AAAG--T---TTTT
gi|76619 : ATAT-C-A-AA-G-C-C----T------A--T--T---C-CC--T-T---T-C--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76620 : ATAT-C-A-AA-G-C-T-C--T------G--T--C---C-CC--T-T-----G--G--T----A---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--GTT-T--AAAG--T---TTTT
gi|76621 : ATAT-C-A-A--G-C-C-TCTT------A--T--C---C-CT--T-T---T-G--C--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76622 : ATAT-C-A-AA-G-C-T-C--T------G--T--C---C-CC--C-T---T-G--G--T--T-T---AA-A--A--A--A-T-A--------T-A-G-C-CC-GG------T--AAAG--T---TTTT
gi|76623 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T---------T--T---C-CT--T-T---T-G--C--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T---AAG--T---TTTT
gi|76624 : ATAT-C-A-AAAG-C-C-C--T------A--T--T---C-CT--T-T---T-A--G--T--T-C---AA-T--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-TTAAAAG--T---TTTTt
gi|76625 : ATAT-C-A-AA-G-C-T-C--T------G-----T---C-CC--C-T---T-G--G--T--T-TTA-AA-A--A--A--A-T-A--------T-A-G-C-CC--G--G-T-----AAG--T---TTTT
gi|76626 : ATATTC-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CT--T-T---T-A--G--T--T-TTTAAA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AGT-G-T-TA-AAAG--T---TTT
gi|76628 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--C------A--T--C---C-CC--C-T---T-G--A--T--C-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--TGGGTTTT
gi|76630 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--A-T---T-G--C--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--TA--TTTT
gi|76631 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------AATT--C---C-CC--T-T---T-A--G--T--T-C---AA-A--AA-G--A-T-A--------T-A-A-C-CC-AG--G-T-TA-AAAG--T---TTTt
gi|76632 : ATAT-C-A-A--G-C-C-C--T------A--T--TTTCC-CC--T-T---T-A--G--T--T-C---AATA--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76634 : ATAT-T-A-AA-G-C-T-C--T------T--T--T---C-CC--C-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-G--------C-A-G-C-CC-AT--G-T-T--A
gi|76635 : ATAT-A-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--C---C-CT--C-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--T--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T---AAG--T---TTT
gi|76636 : ATATGT-A-AA-A-C-T-C--T------A--T--C---C-TT--C-T---T-T--G--T--T-C---AA-A--T--G--A-T----------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76637 : ATAC-C-A-AA-A-C-C-C--C------A--T--C---C-CT--T-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-T-GC-AG--T-T-T--AACA--T---TTT
gi|76638 : ATAC-C-A-AA-A-C-C-C--T------A--T--C---C-CT--T-T---TTG--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-T-AC-AG--T-T-T--AACA--T---TTTT
gi|76640 : ATAT-C-A-A--G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---TTA--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G---CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76641 : ATATTC-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CCC-T-T---T-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G---CC-AG--G-T-T--TAAG--T---TTTT
gi|76642 : ATATTC-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CCC-T-T---T-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G---CC-AG--G-T-T--TAAG--T---TTTT
gi|76643 : ATATTC-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CCC-T-T---T-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G---CC-AG--G-T-T--TAAG--T---TTTT
gi|76645 : ATAT-C-A-AG-C-T-C-T--T------G--T--C---C-CC--C-T---T-G--G--T--TTC---AA-A--A--GGAA-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--T-G-T--AAAG--T---TTTT
gi|76646 : ATAT-C-A-AAAG-C-C-C--G------A--T--T---C-CC--T-T---T-TACG--T--T-A---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TT
gi|76647 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-C--GCCT--T-C---AA-A--A--G--A-T-AC-------T-AGG-C-CC-AGC-G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76648 : ATAG-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--T-T-T--AAAG--T---GTTT
gi|76649 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T---------T--T---C-CC--T-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--GA-A-T-A--------T-A-T-A-CC-AG--GTT-T--AAAG--T---TTTT
gi|76650 : ATAT-T-G-AA-G-C-C-C--T------G--T--T---C-CT--C-T---T-C--A--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--GAAT--T---TTTT
gi|76652 : ATAT---A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-G--C--TC-T-C---AA-A--G--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76653 : ATATTC-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CT--TAT---T-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G---CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76654 : ATAT-C-A-AA-G-C-C--------------T--T---T-CC--T-T---T-G--C--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CCTAT--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76655 : ATAT-C-A-AA-G-CTC-C--T------G--T--T---C-CC--T-T---G-G--T--T--T-C---AA-A--A--GA-A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-
gi|76656 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--C---C-CT--C-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------A-A-A-CTCC-AG--G-T-T--
gi|76657 : ATAT-C-A-A--G-C-C-C--T------G--T--T---C-CT--G-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-ATACACATGT-A-G-A-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTTtttgaaaat
gi|76659 : ATAT-C-A-AA-A-G-C-C--T------A--T--TT--C-CC--T-TAGTT-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-C-C-CC-GA--G-T-T--AAAG--T---TTTT
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gi|76662 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--TTAAGCTA--T--C---C-CT--C-T---T-T--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-TAA--------A-A-A-T-CC-AG--G-T-T--TGAA--T---TTTT
gi|76663 : ATAT-C-A-AA-G-C-T-C--T------A--A--T---C-CC--C-T---T-A--T--T--T-C---AA-A--T--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AA--G-T-A--AGAG--T---TT
gi|76664 : ATAT-C-A-AA-G-C-C-C--TTAAG--A--TA-T---C-CC--TCT---T-T--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------A-A-A-CTCC-AG--G-T-T--TGAA--T---TT
gi|76667 : TAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-A--G--T--T-C---GA-A--A--G--A-T-A--------TAA-G-C-CC-AG--G-T-T--AAGA--T---TTTT
gi|76669 : TAT-C-A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-A--G--T--T-CA--AA-A--A--G--A-T-A--------G-A-G-C-CC-AG--G-T-C--AAAG--T---TTTT
gi|76671 : TAT-C-A-AA-T-A-C-C--T------A--T--C---C-CT--C-T---T-G--G--T--T-T---AA-A--A--C--A-T-A--------A-A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76673 : AT-C-A-AA-G-C-C-T--T------C--T--C---A-TC--C-T---T-G--G--T--T-CG--AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-A-C-CC-TA--G-T-T--AAAG--A---TTTT
gi|76675 : AT-C-A-AA-G-C-T-C--T------G--T--C---C-CC--CCT---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A----------A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAGGAT---TTT
gi|76676 : AT-C-A-AA-AAC-C-C--T------A--T--T---C-CT--T-T---T-A--G--T--T-C---AA-T--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--T-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76677 : AC-C-A-AA-A-C-T-C--T------G--T--C---C-CC--C-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--AAGA--A-T-A--------T-A-G---AC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76678 : AT-C-A-AA-G-C-C-C--TT-----A--T--T---G-CC--C-T---T-G--C--T--T-T---GA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AG--G-T-TAGAAGG--T---TTTT
gi|76679 : AT-C-T-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---CTCC--C-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T---G-CACC-AG--G-TGT--AAAG--T---TTT
gi|76680 : AT-C-A-AA-G-C-C-C--T------G--T--A---C-C-----T---T-G--G--T--T-CA--AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G---CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TCTT
gi|76682 : AT-C-A-AA-G-C-C-T--T------C--T--C---A-TC--C-T---T-G--G--T--T-C---GA-A--A--G--A-T-A--------T-A-A-C-CC-TA--G-T-T--AAAG--T---
gi|76684 : T-C-ATAA-G-C-T-C--TT-----G--T--T---C-CC--T-T-----G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-TAA--------T-AGG-C-CC-AG--G-T-TAAAAAG--T---TTTT
gi|76685 : T-C-A-AA-G-C-G-A--T------A--T--TG--C-CC--T-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--AAT-A--------T-A-G-C-GC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76686 : T-C-A-AA-G-C-G-A--T------A--T--T---G-CC--T-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-GC-AG--G-T-T--AAA
gi|76690 : -C-A-AA-G-C-T-C--T------A--T--T---C-CC--C-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CT-AG--A-T-T--AAGA--T---TTT
gi|76691 : -C-A-AA-G-C-G-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-G--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AGT-GTT-T--AAAG--T---TTT
gi|76692 : -A-AG-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-A--G--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T-A-G-C-CC-AA--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76693 : -A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CCA-T-T---T-G--C--T--T-C---AA-A--A--G--A-T-A----------A-G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
gi|76694 : -A-AA-G-C-C-C--T------A--T--T---C-CC--T-T---T-A--G--TTGT-C---AA-A--A--G--A-T-A--------T---G-C-CC-AG--G-T-T--AAAG--T---TTTT
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