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gi|133218                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              -T---GACCC-AGTGG-TT-C---T---T--G-----AG--A--A-G-A---------T-T-T-TT-------AAAT--GA-CAC--T---A-C------C--C-TA-------TTTT--T---G-C-A-TTT--T-CGTG-A--T--T--A-TC-T--C-CC-C---TT---T-G-AA-G---GG-GGG-C-C-TG---G-T-CC----T--T-C-A-TTT----G-AA-C-AAA-CT-TG---A-ATCC-------A--C--T-TTACC-CAA-G-G-G----TA-----C---T-T---------------T-GA-A-TGA-AG--T--------------TTGG--T-T-A-C--A-AT-T--G--G-TCCA-A-C--AG-TTCT-T---T---A---G---a
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gi|133103                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tttcagct-TC-T--G--G-CCCA-G-T--GG-TTCT-T---G---A---G---AAG--aagatttttaaatgacccaccctatttttggcatttttcatgattatctcccctttgaattgaggcctggtcttcatttgaacaaaaattgagaaccccttcacccaaggatgatgttgtaccaagtttgttgaatttggccca
gi|133210                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   attataaatttcagctttt-TT-T--G--G-CTCA-G-T--GG-TTCT-T---G---A---G---AAaagatttttaaatgacaccacccctatttttgcattttcgtag
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Reference ( family-227 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TAT-AAAT--T-T-CAGC-T--TTT-C-T---GGCCC-A-GTGG-TT-C---T---T--G-----AG--A--A-G-A---A-G-A-T-T-T-T--T-------AAAT--G-A-C-ACC-A-C------C--CTA-------TTTT--T---G-C-A-TTT--T-CGTG-A--T--T--A-T-C-T---C-CC-C--TT---T-G-A-TG-G-GG-G-CC-TG---G-T-CC-T--T-C-A-TTT----G-AA-C-AAA-CT-TG---A-ATCC-------C--C-T-TCACC-CAA-G----------------G-ATG------A-T--T--T---G-T-A-C----CA-AG--T--------------TTGG--T-T-G-A--A-TT-T--G--G-CCCA-G-C--GG-TTCT-T---G---A---G---AAG--TCGAAA
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gi|133084                     :            tttaacccattgacttgaagtaaatgtttaactttgaaattgattagctgcaggaacgaccaaaaaaaaaaaagtcgggaaaagagcacacaggtaaaattaatatatataatataacccattaagacaattaaaatgccaaacaatttttttagtttcacatctttattaatcacttgatttggtagcttctggcccagagggtaatcaaattgatacaacctagagtcaaaaacattttcacaatcaatgaatacaatgaattttcttatgattttatttgattagacaaagttacatagaatgataagagggctcattgtcaacactgctcacctgattcacagtggcccctgctatttcttcactgaaaagattttttttatctttttatatacgagtgtttgtgtatgtatgtttatagttatatataattaatatacatatatatatatataatatatatattattatatatTAT-ATGT--T-T-CA-C-C--TTT-A-T---GGCCC-A-GTGG-TT-C---TTAAT--A-----AG--A--A-C-A---A-A-A-T-A-T-T--T-------ACAT--GTG-C-AC----C------C--TTG-------TTTT--G---G-C---CTT--T-CGTG-G--T--A--A-----------AC-C--TT-----------------G-CC----------CCAT--T-C-A-ATT------AA-G-AAA-AA-TG---A-ATCC-------C--A---TCACC-CAT-G----------------A-ATC------C-C--T--T---A-T-A-TGGAACA-AG-----------------CTGGTTT-T-G-AAGA-TT-T--G--G-TTCA-A-T--AG-TTCT-T---G---AT--G---AAG--ATGAAA
gi|133085                     :            tttaacccattgacttgaagtaaatgtttaactttgaaattgattagctgcaggaacgaccaaaaaaaaaaaagtcgggaaaagagcacacaggtaaaattaatatatataatataacccattaagacaattaaaatgccaaacaatttttttagtttcacatctttattaatcacttgatttggtagcttctggcccagagggtaatcaaattgatacaacctagagtcaaaaacattttcacaatcaatgaatacaatgaattttcttatgattttatttgattagacaaagttacatagaatgataagagggctcattgtcaacactgctcacctgattcacagtggcccctgctatttcttcactgaaaagattttttttatctttttatatacgagtgtttgtgtatgtatgtttatagttatatataattaatatacatatatatatatataatatatatattattatatatTAT-ATGT--T-T-CA-C-C--TTT-A-T---GGCCC-A-GTGG-TT-C---TTAAT--A-----AG--A--A-C-A---A-A-A-T-A-T-T--T-------ACAT--GTG-C-AC----C------C--TTG-------TTTT--G---G-C---CTT--T-CGTG-G--T--A--A-----------AC-C--TT-----------------G-CC----------CCAT--T-C-A-ATT------AA-G-AAA-AA-TG---A-ATCC-------C--A---TCACC-CAT-G----------------A-ATC------C-C--T--T---A-T-A-TGGAACA-AG-----------------CTGGTTT-T-G-AAGA-TT-T--G--G-TTCA-A-T--AG-TTCT-T---G---AT--G---AAG--ATGAAA
gi|133086                     :                                             tttaacccattgacttgaagtaaatgtttaactttgaaattgattagctgcaggaacgaccaaaaaaaaaaaagtcgggaaaagagcacacaggtaaaattaatatatataatataacccattaagacaattaaaatgccaaacaatttttttagtttcacatctttattaatcacttgatttggtagcttctggcccagagggtaatcaaattgatacaacctagagtcaaaaacattttcacaatcaatgaatacaatgaattttcttatgattttatttgattagacaaagttacatagaatgataagagggctcattgtcaacactgctcacctgattcacagtggcccctgctatttcttcactgaaaagattttttttatctttttatatacgagtgtttgtgtatgtatgtttatagttatatataattaatatacatatatatatatataatatatatattattatatatGCCC-A-GTGG-TT-C---T---T--ACCATAAG--A--A-C-A---A-A-A-T-A-T-T--T-------ACAT--G-A-T-GC--A-C------C--CT--------TTTT--T---G-C-C-TTT--T-CTTG-G--T--A--A-----------AC-C--TT-----------------G-CC----------CC-A--T-C-A-TTT----A-AA-T-AAA-AA-TG---A-ATCC-------C--C-A-TCACC-CAT-T----------------A-ATG------C-C--T--T---A-T-A-TGA--CA-AG--T--------------CTGG--T-T-G-A--A-AT-T--G--G-TTCA-A-T--AG-TTC--T---G---AT--G---AAG--ATGAAA
gi|133088                     : tttaacccattgacttgaagttaatgtttaactttgaaattgatagctgcagggacgaccaaaaaaaaaaagtcgggaaaagagcacacaggtaaattaatatatataatataacccatgtaaagacaattaaaatgcaaacaatttttagtttcacatcttttattaatcacttgatttggtagcttctggcccagaggtaatcaaatgatacaacctagagtcaaaaacattttcacaattcaatgaactacaatgaatttctatgatttatttgattagacaagttacactaagaatgaaataagaggctcattgtcaacactgctcacctgattcacagtggccctgctattcttcactggaaaagattttttttatcattttatatacgagtgtttgtgtatgtatgtatatagtatatatatataattatatatacatatatatatatatatatataataatatatattgttgcacctttaagtAT-ATAT--T-T-CAGC-T--TTT-C-T---GGTCC-A-GTGG-TT---------T--G-----AG--A--A-G-A-----------T-T-T--T-------AAAT--G-A---ACC-A-C------C--CTA-------TATT--T---G-C-A-TTT--T-CGTG-A--T--T--A-T-C-T---C-CC-C--TT---T-G-A-AG-T-GA-A-CC--G---C-T-CC-T--T-C-A-TTT----G-AA-C-AAA-CT-TG---A-ATCC-------C--C-T-TCACC-CAA-G----------------G-ATG------A-T--T--T---G-T-A-C----TA-AG--T--------------TTGG--T-T-GAA--A-TT-T--G--G-TCTA-G-T--GG-TTCT-G---G---A---G---AAG--
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Reference ( family-227 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TAT-AAAT--T-T-CAGC-T--TTT-C-T---GGCCC-A-GTGG-TT-C---T---T--G-----AG--A--A-G-A---A-G-A-T-T-T-T--T-------AAAT--G-A-C-ACC-A-C------C--CTA-------TTTT--T---G-C-A-TTT--T-CGTG-A--T--T--A-T-C-T---C-CC-C--TT---T-G-A-TG-G-GG-G-CC-TG---G-T-CC-T--T-C-A-TTT----G-AA-C-AAA-CT-TG---A-ATCC-------C--C-T-TCACC-CAA-G----------------G-ATG------A-T--T--T---G-T-A-C----CA-AG--T--------------TTGG--T-T-G-A--A-TT-T--G--G-CCCA-G-C--GG-TTCT-T---G---A---G---AAG--TCGAAA
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Reference ( family-227 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TAT-AAAT--T-T-CAGC-T--TTT-C-T---GGCCC-A-GTGG-TT-C---T---T--G-----AG--A--A-G-A---A-G-A-T-T-T-T--T-------AAAT--G-A-C-ACC-A-C------C--CTA-------TTTT--T---G-C-A-TTT--T-CGTG-A--T--T--A-T-C-T---C-CC-C--TT---T-G-A-TG-G-GG-G-CC-TG---G-T-CC-T--T-C-A-TTT----G-AA-C-AAA-CT-TG---A-ATCC-------C--C-T-TCACC-CAA-G----------------G-ATG------A-T--T--T---G-T-A-C----CA-AG--T--------------TTGG--T-T-G-A--A-TT-T--G--G-CCCA-G-C--GG-TTCT-T---G---A---G---AAG--TCGAAA
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