lowQualScore : 1111111111 22222 111111111 444444444 3333333333333 11 111111 11111 22 1111111
lowQualScore : 3 22 11 33333 3 1 11 1 33 55555555 1 11 1 222 2 9999999 555 666 6666666666 33 00000 5 444 111111111 2 3 3 000000000 9999999999999 66 55 7 7 55 22 3 3 555555 3 3 3 7777 4 4 2 2 6 4444 7777 1 44 1 00000 22 66 333 1 11 1 5 111111 88888888888 2222222 4444444 0 0 33333333333 0 7777777 111 0 1 0 1 000 0 0 11 0 11 0 0 55
lowQualScore : . .. .. ..... . . .. . .. ........ . .. . ... . ....... ... ... .......... .. ..... . ... ......... . . . ......... ............. .. .. . . .. .. . . ...... . . . .... . . . . . .... .... . .. . ..... .. .. ... . .. . . ...... ........... ....... ....... . . ........... . ....... ... . . . . ... . . .. . .. . . ..
lowQualScore : 6 00 99 44444 9 3 88 3 22 11111111 3 88 3 333 6 0000000 888 999 8888888888 22 33333 0 444 444444444 9 3 6 999999999 9999999999999 11 55 3 3 00 33 6 6 555555 6 6 6 7777 0 2 1 1 3 5555 9999 9 55 9 88888 66 44 333 2 44 1 3 999999 00000000000 5555555 9999999 5 5 11111111111 5 7777777 999 5 0 5 5 999 5 5 77 5 77 5 5 66
consensus : AACTTC-TAT--CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---TG---C-TGA-C----T--ATA-----GC-G---TA---------CAT-AAG-CC-GTTATT------TC-ATTGGCTA--A-------T--TTTTCATC--AGAATT--ATC-GTTCT-T--TAG--CG-TG-AC------TGTATA-GA-TG-G----CAGTAC-AT-G-TGAC-C-GG----CA--A-TT-T--G-CA-A-G-GC--ATA--C---GG-CC--AA-GGGTTT------T-----------AT-------GG-------GG-AG-C-----------G-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
Reference ( gi|131350 ) : AACTTC-TAT--CAA--TCTG-----ATTAGA-A--TCA-GCT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---TG---C-TGA-C----T--ATA-----GC-G---TA---------CAT-AAG-CC-GTTATT------T--ATTGGCTA--A-------T--TTTTCATC--AGAATT--ATC-GTTCT-T--TAG--CG-TG-AC------TGTATA-GA-TG-G----CAGTAC-AT-G-TGAC-C-GG----CA--A-TT-T--G-CA-A-G-GC--ATA--C---GG-CC--AA-GGGTTT------T-----------AT-------GG-------GG-AG-C-----------G-G---C---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-AAAGATG
gi|131351 : AACTTC-TAT--CAA--TCTG-----ATTAGA-A--TCA-GCT--CCTT--------G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---TG---C-TGA-C----T--ATA-----GC-G---TA---------CAT-AAG-CC-GTTATT------TC-ATTGGCTAATA-------T--TTTTCATC--AGAATT--ATC-GTTCT-T--TAG--CG-TG-AC------TGTATA-GA-TGTG----CAGTAC-AT-G-TGAC-C-GG----CA--A-TT-T----CACA-G-GC--ATA--C---GG-CC--AA-GGG-TT------T-----------AT-------GT-------GG-AG-C-----------G-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-AAAGATG
gi|131352 : AACTTC-TAT--CAA--TCGG-----ATTAGA-A--T-A-GCT--CCTT------T-GTA--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---TG---C-TGA-C----TGAAGA-----GC-G---TA---------CAT-AAG-CC-GTTATT------TC-ATTGGCTA--A-------TATTTTTCATC--AGCATT--ATC-GTTCTGT--TAG--CG-TG-AC------TGTATA-GA-TG-G----CAGTAC-AT-G-TGAC-C-GG----CA--A-TT-T--G-CA-A-G-GC--ATAT-C---GG-CC--AA-GGG-TT------T-----------AT--------G-------GG-AG-C-----------G-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131353 : AACTTT-TAT--CAA---CTG-----ATTAGA-A--TCA-GCT--CCTT------T-G-A--TCCA-CTCA----T-TAGA-------TCGCT----G---C-T-A-CGCT-T--ATAAG---GC-G---TA---------CAT-AAG-CCCGTTATT------TTCATTGGCTA--AGAT----T--TTTTCATC--AGAATT--ATC-G-TCT-T--TAGC-CG-TG-AC------TGTATA-GA-TG-G----C-GTAT-AT-G-TGAC-CGGG----CA--A-TT-T--G-CA-ACG-GC--ATA--T---CG-CC--AA-GGG-TT------T-----------AT-------GG-------GG-AG-C-----------G-GA--T---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-CGCTG--G-GC--T--G-C-GAAGA
gi|131354 : AACTTC-TAT--CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CTTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CT-TATA-------TCGCT---TG---C-TGA-T----T--ATAATAGCGT-G---TA---------CAT-TAG-CC-GTTATT------TC-ATTGGCTA--A-------T--
gi|131355 : AACTTT-AGT--CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------A-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---at
gi|131356 : ACTTT-TAT--CAA---CTG-----ATT-GA-A--TCA-GCT--TCTT------T-G-A--TCCA-CTCA---CT-TAGAGA-----TCGCT----G---C-T-A-CGCTTT--ATA-----GC-G---TA---------CAT-AAG-CC-CGTATT------TC-ATTGGCTA--AGAT----T--TTTTCATC--AGAATT--ATC-G-TCT-T--TAGC-CG-TG-AC------TGTATA-GA-T--G----CAGTAT-ATCG-TGAC-CGGG----CA--ATTT-T--G-CA-ACG-GC--ATA--T---CG-CC--AA-GG--TT------T-----------AT-------GG-------GG-AG-C-----------G-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTG--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131358 : CTTCATTT--CAA--TCAG-----ATTAAA-A--TCA-GTT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTTG---GG-TAGA-------TCGCT---
gi|131360 : TTC-TAT--CA---TCTG-----ATTAGA-A--CCA-GCTT-CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---TGG--C-TGA-C----T--ATA-----GC-G---TA---------CAT-AAG-GC-GTTATT------TC-ATTAGCTAT-A-------T--TTTTCATC--AGAATT--ATCGGTTCT-T--TAG---G-TG-AC------TGTATA-GA-TG-G----CAGTACGATAG-TGAC-C-GG----CA--A-TT-T--G-CA-A-G-G---ATACTC---GG-CC-----GGG-TT------T-----------AT----------------GG-AG-C-----------G-G---TA--G---TGGG-ACCGA-A-AA-----C-ATT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131361 : TTC-TAT--CAAGATCTG-----ATAGAA-A--TCA-GGC--CTTT------T-G-A--TCCGACTC----CTGTAGAC------TCGCT---TGATGC-TGAAC----T--ATATATA-GCCG---TT---------AAT-AAG-CC-GTTATT------TC-ATTGGCTAT-A-------G--TTTTCATC--AGAATT--ATC-GTTCTGT--TAGCACG-TG-ACGCGTTATGCA-A-GACTG-GAACTTAGTAC-AT-GTTGACTC-GGCGTACA--A-TTAA--G-CA-A-G-GC--ATAATC---GG-CC--AAGGGGTTG------T-----------AT--------G-------GG-AG-CG----------G-G---C---AAGTT-GG-ACCGACATAA---C-C-CTT--G-GCTTTACG-C-GAAGATG
gi|131362 : TTC-CTT--CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------A-G-A--TCCG-CTCC---CT-TAGA-------TCACTA--CA---C-T-A-G----T--GTA-----GC-G---
gi|131363 : C-TATAGCAA--TCTG-----ATTA-A-A--TCA-GCT--CCTT------A-G-A--TTTG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---
gi|131365 : AC--CAA--TTTG-----ATTAAA-A--TCA-ACT--CATT------T-G-A--TCCG-CCCA---CT-TAGA-------TCGC----TA---CATTA-G----T--GTA-----GC-GATCTA---------CAC-GAG-CT-GTT
gi|131367 : AT--CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GAT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CA-TATA-------TC
gi|131366 : AT--CAA--TCTGTCGCCATTAAA-A--TCA-GCT--CCTTAGATGATAG-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---
gi|131368 : AT--CGA--TATG-----ATTAAA-A--TCA-GAT--CCTT------T-G-A--TCTG-CTCA---ATGTAGA-------TCAC----TG---C--AA-A----T--GTA-----GC----------------CAT-AA
gi|131369 : T--CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------T-A-A--TTCA-CTCA---TT-T-GA-------TCGCT---
gi|131371 : --CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------A-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---
gi|131373 : --CAA--TCTG-----ACTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------A-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---
gi|131375 : --CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------A-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TC
gi|131376 : --CAA--TCTG-----ATTAGA-A--TCG-GCT--CCTT------T-G-A--TCTG-CTAA---CT-TAAA-------TCGC
gi|131379 : --CAA--TTTA-----ATTAAA-A--TCA-GTT--CCTT------A-G-A--CCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---
gi|131378 : --CAA--TCTG-----ATTAAA-A--CCA-CAT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CG-TAGA-------TCGCT---
gi|131377 : --CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCGT------A-G-A--TCCG-CTCA---TT-TAGA-------TTGC
gi|131382 : --CAA--TTTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--TCTC------T-G-A--TCCA-CTCA---TT-TAGA-------TTGCT---
gi|131380 : --CAA--TCTG-----ATCAAA-A--TCA-GAT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CA-TAGA-------T
gi|131381 : --CAA--TCTG-----AAAAAA-AAATCA-GCT--CCTA------T-G-A--TCTG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCTACATG---C---A-C----T-------------G---TA---------CAT-A
gi|131374 : --CAA--TCTT-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCGT------A-G-A--TCCA-CTCA---CT-TTGA-------TCGC----TG---C---A-C----T--A
gi|131372 : --CAA--TCTG-----ATTAAACA--TCA-GCT--CCTT------T-G-A--ACAG-CTCG---TG-TAGA-------TCGCTA--CA---C-TAA------T--GTA-----GC-G---
gi|131384 : AA--TCTA-----ATTAAA-A--GTA-GAT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CG-TATA-------TCGC----TG-----TAA-C----A--ATA------------TA---------CGT-GAG-C
gi|131387 : TTAAA-A--TTAAGCTGCCCTT------T-G-AATCCCG-CTCAACACT-TGGAAT-----TCGCT---TG---C-TGC-T----T--AAATCAG-GCAG---TA---------CAT-AAGGCC-GTT-TTCCGTCAT--ATTGGCTA--AATATAACTA-TTTTCCTCGAAGAACTTAATCTGTTCT-TAGTAG--CGCTGCACAA----GGTATAAGA-TG-G----CAGCAC-GT-G-TGAC-C-GG----CA--A-CT-TTGG-CATG-G-GCTGATACTC---GG-TC--AA-GGCGTT------T-----------AT-------GG-------GG-AGAC-----------G-G---A---G---T-GGAACCGA-ATAA---CGC-CTTC-G-GC--TA-GCC-GAAGAT
gi|131388 : T------T-G-A--TTGG-TTCA---TT-TAAACATGTATTCGCT---TG---C-TGA------T--ATA-----GC-G---TAGATCTAGTACAT-AA--CC-GTTATT-------------------A-------T--ATTTAATC--AGAATT--ATC-GTTCT-T--TAG--CG-TG-AC------AGTATA-GA-TG-G----CAG--C-AC-G-TGAC-C-GA----CA--A-TT-T-----------GT--AT---C---GG-CC--AA-GGG-CT------T-----------AT-------GG-------GG-AG-C-----------G-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CCT--G-CT--TA-G-C-GAAAA
gi|131390 : ----T--ATA-----GC-G---TA---------CATTAAG-CC-GCTATC------TC-ATTGACTA--A-------TAATTTTCATC--TGAATT--ATC-GTTCT-T--TAA--CG-TG-AC------AGTATA-GA-TG-G----CAGAAC-GT-G-TGA--C-GA----CA--ATTT-T--G-TA-T-G-GC--ATAT-C---GG--C--AA-GGG-TT------T-----------AT--------A-------GG-AG-C-----------G-G---T---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-T-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131391 : --ATC-TTTCT-T--TAG--C------T------TGT---------------CAGTAC-GT-G-TGAC-C-GA----CA--A-TT-T--G-CA-T-G-GC--ATAT-C---GG-CC--AA-GGGTTT------------------AT-------GG-------GG-AG-C-----------G-G---TCA-G---T-GG-ACCGA-A-AA---T-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131392 : C-GTTCT-T--TAG--CG-TG-AC------TGTATA-GA-TG-G----CAGT
gi|131389 : -G-TGAC-C-GC----CATTG-TT-T--GACA-A-T-GC--ATAATC---GG-CG--AA-GGGTTT------T-----------AT-------GG-------GG-AG-C-----------G-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131397 : ttgctagcacagcggttcaccattagtttccctcgattggtaaacaatttttcaatctgtgaagtggggatttccattggtccggtcgcttaccgcaactcgcgcaatcgcaagaa-G-TGAC-C-GG----CA--T-TT-T--G-CA-ATGCGC--ATAT-C---GGTCC--AA-AGGGTT------T-----------AT-------GG-------GG-AG-C-----------G-G---A---G---T-GG-ACCG--A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131400 : -G-TGAC-C-GA----CA--A-TT-T--G-CA-T-G-GC--ATA--T---AA-GC--AA-AGGGTT------T-----------AT-------GG-------GG-AG-T-----------G-G---A---G---T-GA-CCCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131396 : -G-TGAC-C-GG----CT--T-TT-TT-G-CA-A-T-GC--ATAT-C---GG-CC--AA-GGGTT-------------------AT-------GG-------GA-GG-C-----------G-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131398 : -G-TGAC-C-GG----CA--T-TT-T--G-CA-A-T-CC--ATAT-C---GG-TCCAAA-GGGTTT------A-----------GT-------GG-------GGGAG-C-----------G-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-A----C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131399 : -G-TGAC-C-G-----CG--T-TT-T--G-CA-G-T-GC--ATT--C---GG-CC--AA-GGGGTT------T-----------A--------GG-------GG-AG-C-----------G-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---T-C-CCT--T-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131395 : -G-TGAC-C-GG----CA--T-TT-T--G-CA-A-T-GC--ATA--T---TG-GC--AA-GGG-TT------T-----------AT-------GGA------GA-AG-C-----------A-G---A---G---T--G-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAA
gi|131402 : -G-TGAC-CCGG----CG----TT-T--G-TA-G-T-GG--ATA--TCGGGG-CC--AA-GGGGTT------T-----------AT-------GG-------GG-AG-C-----------G-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA-----C-CTT--G-GCT-TA-G-C-GAAGATG
gi|131401 : -G-TGAC-C-GA----CA--A-TT-T--G-CA-A-G-GC--GTAT-C---GG-CC--AA-GGGTTT------
gi|131405 : -TT-T--G-T----G-GC--ATAATC---TG-CC--AA-GGGTTT------------------GT-------GG-------GG-AG-C-----------G-G---A---G---T-GG-ATCAA-A-AA---C-C-CTT--G-GT--GT-G-C-GAAGATGa
gi|131406 : -TT-T--T-CA-G-T-GC--ATA--C---TG-CT--CG-G-----------T-----------GT-------GG-------GG-AG---------------------------T-GG-ACCAA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--AA-G-C-GAAGATG
gi|131412 : G-CC--AA-GGGTTTACGGTTT-----------AT-------AG-------GG-AG-C-----------G-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131413 : G-CC--AA-GGGTTT------TCG---------GTC------GG-------GG-AG-C-----------G-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TT-G-C-GAAGATG
gi|131404 : G-CC--AA-GGGTTT------T------------C-------GGTCCACTCGG-AG-G-----------G-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131403 : atttgtgggcatttcgctaG-CC--AA-GGGTTT------T------------C-------GGTCCACTCGG-AG-G-----------G-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131416 : atttgtgggcatttcgctaG-CC--AA-GGGTTT------TCGGTTT-----AT-------GG-------G--AG-C-----------G-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TT-G-C---AGATG
gi|131418 : G-CC--AA-GAGTTT------T-----------CA-------GT-------CC-AG-T-----------G-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131414 : G-CC--AA-GGGTTT------T------------T-------GG-------AT-TT-T-----------G-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GT--TA-G-C-GAAGATG
gi|131417 : G-CC--AA-GGGTTG------CGAG--------AT-------GG-------GG----C-----------G-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GT--T--G-C-GAAGATG
gi|131419 : G-CC--AA-GGGTTG------T-----------TT-------GG-------TC-AG-CTCGCGCTCCCCG-G---A---G---C-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131419 : G-CC--AA-GGGTTT------TCG---------GTCCGCTCCGG-------GG-AG-C-----------GCG---A---G---C-TG-ACCAA-ACAA---C-C-CTT--G-GC--
gi|131422 : G-CC--AA-GGGTTT------TCGTCCACTTCCAC-------TA-------GG-AG-C-----------G-C---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-T-CTT--GCGC--TA-G-C-GAAGATGtagcgaagatg
gi|131421 : G-CA--AA-GGGTTT------------------AC-------GATC-----AA-AG-C-----------G-G---A---G---C-GG-ATCGT-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAAATG
gi|131429 : -CC--AA-GGGTTT------------------AT-------GG-------GG-AG-C-----------A-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CAT--G-GC--TA-G-C-
gi|131432 : C--AA-GGGTTT------C-----------C---------G-------GG-AG-T-----------G-G---A---G---T-GG-ACCAA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131409 : --AA-GG--TT------T-----------AT-------GT-------GG-AG---------------------------T-GG-AACGA-A-AA---C-C-CTC--G-GC--TA-G-C-AAAGATG
gi|131435 : cattccccatg--AA-GGGTTT------T------------C-------GG-------GG----C-----------G-A---A---G---T-GG-ACCGA-A-A----C-C-CTT--A-GG--TA-G-C-GAAGATG
gi|131434 : --AA-GG--TT------T-----------AT-------GA-------AG-AG-C-----------G-G---A---A-----AG-AACGG-A-AA---C-C-CTT--G-GT--TA-G-C-GAAGATG
gi|131408 : aTTT------T-----------AT-------GG-------GA-GG-C-----------A-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-T-CGT--G-AC--TA-G-C-GAAG
gi|131444 : catatcaccaTT------T-----------AT-------GG-------GG-AG-C-----------G-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGAT
gi|131447 : TT------T-----------AT-------GG----------AG-C-----------G-G---C---GG--T-GG-ACCGA-A-AA---C-T-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131437 : TT------T-----------AT-------GA-------GG-AG-T-----------G-A---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-A-C-GAAGATG
gi|131440 : ggTT------T-----------AT-------GA-------GG-AG-C-----------G-G---A---G---T-GG-ACCG--A-AA---C-C-CCT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131442 : gTT------T-----------AT-------GG-------GA-AG-C-----------A-G-------G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTCAAG-GC--TA-G-C-AAAGATG
gi|131446 : gTT------C-----------AT-------GG-------GG-AA-T-----------G-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CCT--G-GC--TA-G-T-GAAGATG
gi|131415 : TT------T-----------GT-------AG-------GG-AG-C-----------A-G---A---G---T-GA-ACCAA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131441 : gccaaggtctacttcaTT------T-----------AT-------GG-------AA-AG-C-----------G-G---A---A---T-GG-ATCGA-A-AA---C-C-CAT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131448 : gTT------T-----------AT-------GG-------CG-AG-C-----------G-GAGTCAGAG---T-GG-ACCGA-A-A----C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131439 : TT------T-----------AT-------GG-------GG-AG-G-----------A-G---A---A---T-GG-ACCAA-A-AA---C-C-TGT--G-AC--TA-G-C-AAAGAT
gi|131449 : ggTT------T-----------AT-------GG-------GG-A--C-----------G-G---A---G---C-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT----GC--TA-G-C-G
gi|131436 : TT------T-----------AG-------GG-------GG-AG-C-----------A-G---A---A---T-GG-ACCGA-A-CA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-A-GAAGA
gi|131445 : gagTT------T-----------CT-------GG-------GG-AG-C-----------T-G---A---G---T-GG-ATCGA-A-AA---T-A-CTT--T-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131452 : T------T-----------AT-------GT-------GG-AG-C-----------G-G---A---G---T-GG-ATCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131453 : T------T-----------AT-------GG-------GG-AG-C-----------G-A---A---G---T-GG-ACCAA-A-AT---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGA
gi|131438 : T------T-----------GT-------GG-------GG-AC-G-----------G-G---A---G---T-GG---CGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131454 : gga------T-----------AT-------GG-------GG-AG-C-----------A-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131455 : ------T-----------AT-------GG-------GG-AG-C-----------G-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TT-G-C-GAAGATG
gi|131456 : ------T-----------AT-------GG-------GG-AG-C-----------G-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT----GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131457 : ------T-----------AT-------GG-------GG-AG-C-----------G-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GT--TA-G-C-GAAGA
gi|131460 : -----------AT-------GG-------GG-AG-C-----------G-G---A---G---T-GG-ACCG--A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131459 : -----------AT-------GG-------GG-AG-C-----------G-G---A---G---T-GG-ACCG--A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131461 : -----------AT-------GG-------GG-AG-C-----------G-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AAAACC-C-TTT--G-GC--TA-G-CGAAAGATG
gi|131462 : T-------GG-------GT-AG-C-----------G-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131410 : T-------GG-------GG-AG-C-----------G-G---G---G---T-GC-ACCGA-A-AA---C-C-TTT--G-GC--TA-G-C-GAAGAT
gi|131463 : ccgcagagggag-------GG-------GG-AG-C-----------G-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-AAAGAT
gi|131464 : -------GG-------GG-AG-C-----------G-G---A---G---C-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131465 : -------GA-------GG-AG-C-----------A-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-AAAGATG
gi|131466 : -------GG-------GG-AG-C-----------G-GA--C---GG--T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GGAAATG
gi|131472 : G-------GG-AG-C-----------G-G---G---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131474 : G-------GG-AG-C-----------G-G---G---G---T-GCCACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGAT
gi|131473 : G-------GG-AG-C-----------G-G---A---G---C-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTTG-G-GCA-TA-G-C-GAAGATG
gi|131476 : -------GG-AG-C-----------G-G---A---G---T-GG-ACCTA-A-AC---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131477 : -------GG-AG-C-----------G-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---T-C-TTT--G-GC--TA-G-C-GTAGATG
gi|131481 : G-AG-C-----------G-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-T-CTT--G-GC--TA-G-C-GAAGATG
gi|131485 : -----------G-G---A---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TT-G-C-GAAGATG
gi|131404 : ---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAA-ATG
gi|131403 : atttgtggg---G---T-GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-C-GAA-ATGtcggaggggagtggaccgaaaacccttggctagcgaagatg
gi|131422 : atttgtggg---G---T-GG-AC-GA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--tcggaggggagtggaccgaaaacccttggctagcgaagatg
gi|131413 : G-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--ttccactaggagcgcagtggaccgaaaactcttgcgctagcgaagatg
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|131394 ): TGTGAGCCAGTTTTCGTGGCATAATCTGCCCAAGGTTTGTGGAGAGTGGAGTTGATGGAAAATACTCGGCTTGCGAAGA
Alignments
lowQualScore : 111111111111 11111 111111111 3333333333333 111111 222
lowQualScore : 3 11 11 33333 1 11 1 33 44444444 1 11 1 222 2 8888888 555 666 222222222222 33 99999 4 444 000000000 2 3 3 9999999 4444444444444 55 55 6 6 44 77 3 3 3 444444 3 3 3 7777 3 3 1 1 3 6666 5555 1 66 1 999 1 22 888 333 1 11 1 5 111111 77777777777 0 4444444 0 0 22222222222 222 11 0 222222 1 0 1 000 0 0 11 0 11 0 0 0
lowQualScore : . .. .. ..... . .. . .. ........ . .. . ... . ....... ... ... ............ .. ..... . ... ......... . . . ....... ............. .. .. . . .. .. . . . ...... . . . .... . . . . . .... .... . .. . ... . .. ... ... . .. . . ...... ........... . ....... . . ........... ... .. . ...... . . . ... . . .. . .. . . .
lowQualScore : 3 99 88 33333 3 88 3 11 77777777 2 77 2 222 5 8888888 666 555 444444444444 11 11111 7 111 777777777 7 1 3 5555555 6666666666666 55 00 7 7 66 99 3 3 3 222222 3 3 3 1111 6 8 9 9 8 0000 4444 8 11 8 000 8 55 444 222 2 44 1 3 999999 00000000000 6 9999999 5 5 55555555555 777 22 5 000000 0 5 0 999 5 5 88 5 88 5 5 5
consensus : AACTTC-TAT--CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---TG---C-T--GA-C----T--ATA-----GC-G---TA---------CAT-AAG-CC-GTTATTT-C-----ATTGGCTA--A-------T--TTTTCATC--AGAATT--ATC-GTTCT-T--TAG--C-G-TG-AC------TGTATA-GA-TG-G----CAGTAC-AT-G-TGAC-C-GG----CA--A-TT-T--G-CA-A-G-GC--ATA---C---GG-CC--AA-GGGTTT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
Reference ( family-223 ) : AACTTC-TAT--CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---TG---C-T--GA-C----T--ATA-----GC-G---TA---------CAT-AAG-CC-GTTATTT-C-----ATTGGCTA--A-------T--TTTTCATC--AGAATT--ATC-GTTCT-T--TAG--C-G-TG-AC------TGTATA-GA-TG-G----CAGTAC-AT-G-TGAC-C-GG----CA--A-TT-T--G-CA-A-G-GC--ATA---C---GG-CC--AA-GGGTTT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131350 : AACTTC-TAT--CAA--TCTG-----ATTAGA-A--TCA-GCT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---TG---C-T--GA-C----T--ATA-----GC-G---TA---------CAT-AAG-CC-GTTATTT-------ATTGGCTA--A-------T--TTTTCATC--AGAATT--ATC-GTTCT-T--TAG--C-G-TG-AC------TGTATA-GA-TG-G----CAGTAC-AT-G-TGAC-C-GG----CA--A-TT-T--G-CA-A-G-GC--ATA---C---GG-CC--AA-GGGTTT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---C--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CA-AAGATG
gi|131351 : AACTTC-TAT--CAA--TCTG-----ATTAGA-A--TCA-GCT--CCTT--------G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---TG---C-T--GA-C----T--ATA-----GC-G---TA---------CAT-AAG-CC-GTTATTT-C-----ATTGGCTAATA-------T--TTTTCATC--AGAATT--ATC-GTTCT-T--TAG--C-G-TG-AC------TGTATA-GA-TGTG----CAGTAC-AT-G-TGAC-C-GG----CA--A-TT-T----CACA-G-GC--ATA---C---GG-CC--AA-GGG-TT------T-----------AT-GT-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CA-AAGATG
gi|131352 : AACTTC-TAT--CAA--TCGG-----ATTAGA-A--T-A-GCT--CCTT------T-GTA--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---TG---C-T--GA-C----TGAAGA-----GC-G---TA---------CAT-AAG-CC-GTTATTT-C-----ATTGGCTA--A-------TATTTTTCATC--AGCATT--ATC-GTTCTGT--TAG--C-G-TG-AC------TGTATA-GA-TG-G----CAGTAC-AT-G-TGAC-C-GG----CA--A-TT-T--G-CA-A-G-GC--ATAT--C---GG-CC--AA-GGG-TT------T-----------AT--G-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131353 : AACTTT-TAT--CAA---CTG-----ATTAGA-A--TCA-GCT--CCTT------T-G-A--TCCA-CTCA----T-TAGA-------TCGCT----G---C-TACGC-T----T--ATAAG---GC-G---TA---------CAT-AAG-CCCGTTATTTTC-----ATTGGCTA--AGAT----T--TTTTCATC--AGAATT--ATC-G-TCT-T--TAGC-C-G-TG-AC------TGTATA-GA-TG-G----C-GTAT-AT-G-TGAC-CGGG----CA--A-TT-T--G-CA-ACG-GC--ATA---T---CG-CC--AA-GGG-TT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---AT-G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-CGCTG--G-GC--T--G-CG-AAGA
gi|131354 : AACTTC-TAT--CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CTTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CT-TATA-------TCGCT---TG---C-T--GA-T----T--ATAATAGCGT-G---TA---------CAT-TAG-CC-GTTATTT-C-----ATTGGCTA--A-------T--
gi|131355 : AACTTT-AGT--CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------A-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---at
gi|131356 : ACTTT-TAT--CAA---CTG-----ATTGAA----TCA-GCT--TCTT------T-G-A--TCCA-CTCA---CT-TAGAGA-----TCGCT----G---C-T---A-CGCTTT--ATA-----GC-G---TA---------CAT-AAG-CC-CGTATTT-C-----ATTGGCTA--AGAT----T--TTTTCATC--AGAATT--ATC-GT-CT-T--TAG--CCG-TG-AC------TGTATA-GA-TG------CAGTAT-ATCG-TGAC-C-GGG---CA--A-TT-TT-G-CA-ACG-GC--ATA---T---CG-CC--AA-GG--TT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTG--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131358 : CTTCATTT--CAA--TCAG-----ATTAAA-A--TCA-GTT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTTG---GG-TAGA-------TCGCT---
gi|131360 : TTC-TAT--CA---TCTG-----ATTAGA-A--CCA-GCTT-CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---TGG--C-T--GA-C----T--ATA-----GC-G---TA---------CAT-AAG-GC-GTTATTT-C-----ATTAGCTAT-A-------T--TTTTCATC--AGAATT--ATCGGTTCT-T--TAG----G-TG-AC------TGTATA-GA-TG-G----CAGTACGATAG-TGAC-C-GG----CA--A-TT-T--G-CA-A-G-G---ATACT-C---GG-CC-----GGG-TT------T-----------AT----------GG-AG-C-----------GGT--A--G-TG-----GG-ACCGA-A-AA-----C-ATT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131361 : TTC-TAT--CAAGATCTG-----ATAGAA-A--TCA-GGC--CTTT------T-G-A--TCCGACTC----CTGTAGAC------TCGCT---TGATGC-T--GAAC----T--ATATATA-GCCG---TT---------AAT-AAG-CC-GTTATTT-C-----ATTGGCTAT-A-------G--TTTTCATC--AGAATT--ATC-GTTCTGT--TAGCAC-G-TG-ACGCGTTATGCA-A-GACTG-GAACTTAGTAC-AT-GTTGACTC-GGCGTACA--A-TTAA--G-CA-A-G-GC--ATAAT-C---GG-CC--AAGGGGTTG------T-----------AT--G-------GG-AG-C-----------GGGCAA--GTT------GG-ACCGACATAA---C-C-CTT--G-GCTTTACG-CG-AAGATG
gi|131362 : TTC-CTT--CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------A-G-A--TCCG-CTCC---CT-TAGA-------TCACTA--CA---C-T---A-G----T--GTA-----GC-G---
gi|131363 : C-TATAGCAA--TCTG-----ATTAAA----TCA-GCT--CCTT------A-G-A--TTTG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---
gi|131365 : AC--CAA--TTTG-----ATTAAA-A--TCA-ACT--CATT------T-G-A--TCCG-CCCA---CT-TAGA-------TCGC----TA---CAT--TA-G----T--GTA-----GC-GATCTA---------CAC-GAG-CT-GTT
gi|131366 : AT--CAA--TCTGTCGCCATTAAA-A--TCA-GCT--CCTTAGATGATAG-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---
gi|131367 : AT--CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GAT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CA-TATA-------TC
gi|131368 : AT--CGA--TATG-----ATTAAA-A--TCA-GAT--CCTT------T-G-A--TCTG-CTCA---ATGTAGA-------TCAC----TG---C----AA-A----T--GTA-----GC----------------CAT-AA
gi|131369 : T--CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------T-A-A--TTCA-CTCA---TT-T-GA-------TCGCT---
gi|131371 : --CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------A-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---
gi|131372 : --CAA--TCTG-----ATTAAACA--TCA-GCT--CCTT------T-G-A--ACAG-CTCG---TG-TAGA-------TCGCTA--CA---C-T--AA------T--GTA-----GC-G---
gi|131373 : --CAA--TCTG-----ACTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------A-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---
gi|131374 : --CAA--TCTT-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCGT------A-G-A--TCCA-CTCA---CT-TTGA-------TCGC----TG---C-----A-C----T--A
gi|131375 : --CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------A-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TC
gi|131376 : --CAA--TCTG-----ATTAGA-A--TCG-GCT--CCTT------T-G-A--TCTG-CTAA---CT-TAAA-------TCGC
gi|131377 : --CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCGT------A-G-A--TCCG-CTCA---TT-TAGA-------TTGC
gi|131378 : --CAA--TCTG-----ATTAAA-A--CCA-CAT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CG-TAGA-------TCGCT---
gi|131379 : --CAA--TTTA-----ATTAAA-A--TCA-GTT--CCTT------A-G-A--CCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---
gi|131380 : --CAA--TCTG-----ATCAAA-A--TCA-GAT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CA-TAGA-------T
gi|131381 : --CAA--TCTG-----AAAAAA-AAATCA-GCT--CCTA------T-G-A--TCTG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCTACATG---C-----A-C----T-------------G---TA---------CAT-A
gi|131382 : --CAA--TTTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--TCTC------T-G-A--TCCA-CTCA---TT-TAGA-------TTGCT---
gi|131384 : AA--TCTA-----ATTAAA-A--GTA-GAT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CG-TATA-------TCGC----TG-----T--AA-C----A--ATA------------TA---------CGT-GAG-C
gi|131387 : TTAAA-A--TTAAGCTGCCCTT------T-G-AATCCCG-CTCAACACT-TGGAAT-----TCGCT---TG---C-T--GC-T----T--AAATCAG-GCAG---TA---------CAT-AAGGCC-GTT-TTC-CGTCATATTGGCTA--AATATAACTA-TTTTCCTCGAAGAACTTAATCTGTTCT-TAGTAG--C-GCTGCACAA----GGTATAAGA-TG-G----CAGCAC-GT-G-TGAC-C-GG----CA--A-CT-TTGG-CATG-G-GCTGATACT-C---GG-TC--AA-GGCGTT------T-----------AT-GG-------GG-AGAC-----------GG---A--G-T------GGAACCGA-ATAA---CGC-CTTC-G-GC--TA-GCCG-AAGAT
gi|131388 : T------T-G-A--TTGG-TTCA---TT-TAAACATGTATTCGCT---TG---C-T--GA------T--ATA-----GC-G---TAGATCTAGTACAT-AA--CC-GTTATT------------------A-------T--ATTTAATC--AGAATT--ATC-GTTCT-T--TAG--C-G-TG-AC------AGTATA-GA-TG-G----CAG--C-AC-G-TGAC-C-GA----CA--A-TT-T-----------GT--AT----C---GG-CC--AA-GGG-CT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CCT--G-CT--TA-G-CG-AAAA
gi|131389 : -G-TGAC-C-GC----CATTG-TT-T--GACA-A-T-GC--ATAAT-C---GG-CG--AA-GGGTTT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131390 : ttgctagcacagcggttcaccattagtttccctcgattggtaaacaatttttcaatctgtgaagtggggatttccattggtccggtcgcttaccgcaactcgcgcaatcgcaagaa----T--ATA-----GC-G---TA---------CATTAAG-CC-GCTATCT-C-----ATTGACTA--A-------TAATTTTCATC--TGAATT--ATC-GTTCT-T--TAA--C-G-TG-AC------AGTATA-GA-TG-G----CAGAAC-GT-G-TGA--C-GA----CA--ATTT-T--G-TA-T-G-GC--ATAT--C---GG--C--AA-GGG-TT------T-----------AT--A-------GG-AG-C-----------GG---T--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-T-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131391 : --ATC-TTTCT-T--TAG--C-------T------TGT---------------CAGTAC-GT-G-TGAC-C-GA----CA--A-TT-T--G-CA-T-G-GC--ATAT--C---GG-CC--AA-GGGTTT------------------AT-GG-------GG-AG-C-----------GGTC-A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---T-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131392 : C-GTTCT-T--TAG--C-G-TG-AC------TGTATA-GA-TG-G----CAGT
gi|131394 : T-G-TGAG-C-------CA--G-TT-T--T-CG-T-G-GC--ATAATCT---GC-CC--AA-GG--TT------T-----------GT-GG-------AG-AG-T-----------GG---A--G-T------TG-ATGGA-A-AA---T-A-CTC--G-GC--TT-G-CG-AAGA
gi|131395 : -G-TGAC-C-GG----CA--T-TT-T--G-CA-A-T-GC--ATA---T---TG-GC--AA-GGG-TT------T-----------AT-GGA------GA-AG-C-----------AG---A--G-T-------G-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AA
gi|131396 : -G-TGAC-C-GG----CT--T-TT-TT-G-CA-A-T-GC--ATAT--C---GG-CC--AA-GGGTT-------------------AT-GG-------GA-GG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131397 : -G-TGAC-C-GG----CA--T-TT-T--G-CA-ATGCGC--ATAT--C---GGTCC--AA-AGGGTT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCG--A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131398 : -G-TGAC-C-GG----CA--T-TT-T--G-CA-A-T-CC--ATAT--C---GG-TCCAAA-GGGTTT------A-----------GT-GG-------GGGAG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-A----C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131399 : -G-TGAC-C-G-----CG--T-TT-T--G-CA-G-T-GC--ATT---C---GG-CC--AA-GGGGTT------T-----------A--GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---T-C-CCT--T-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131400 : -G-TGAC-C-GA----CA--A-TT-T--G-CA-T-G-GC--ATA---T---AA-GC--AA-AGGGTT------T-----------AT-GG-------GG-AG-T-----------GG---A--G-T------GA-CCCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131401 : -G-TGAC-C-GA----CA--A-TT-T--G-CA-A-G-GC--GTAT--C---GG-CC--AA-GGGTTT------
gi|131402 : -G-TGAC-CCGG----CG----TT-T--G-TA-G-T-GG--ATA---TCGGGG-CC--AA-GGGGTT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA-----C-CTT--G-GCT-TA-G-CG-AAGATGa
gi|131403 : G---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AA-ATG
gi|131403 : atttgtgggG-CC--AA-GGGTTT------T------------C-GGTCCACTCGG-AG-G-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATGggaggggagtggaccgaaaacccttggctagcgaagatg
gi|131404 : atttgtgggcatttcgctaG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AA-ATG
gi|131404 : atttgtgggG-CC--AA-GGGTTT------T------------C-GGTCCACTCGG-AG-G-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATGggaggggagtggaccgaaaacccttggctagcgaagatg
gi|131405 : atttgtgggcatttcgcta-TT-T--G-T----G-GC--ATAAT-C---TG-CC--AA-GGGTTT------------------GT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ATCAA-A-AA---C-C-CTT--G-GT--GT-G-CG-AAGATG
gi|131406 : -----------GG---A--G-T------GG-ACCAA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--AA-G-CG-AAGATG
gi|131408 : ttttcagtgcatactgctcggtgtggTTT------T-----------AT-GG-------GA-GG-C-----------AG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-T-CGT--G-AC--TA-G-CG-AAG
gi|131409 : catatcacca--AA-GG--TT------T-----------AT-G--------------T-----------GG---A--G-T------GG-AACGA-A-AA---C-C-CTC--G-GC--TA-G-CA-AAGATG
gi|131410 : cattccccatgT-GG-------GG-AG-C-----------GG---G--G-T------GC-ACCGA-A-AA---C-C-TTT--G-GC--TA-G-CG-AAGAT
gi|131412 : ccgcagagggagG-CC--AA-GGGTTTACGGTTT-----------AT-AG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131413 : G-CC--AA-GGGTTT------TCG---------GTCGG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TT-G-CG-AAGATG
gi|131414 : G-CC--AA-GGGTTT------T------------T-GG-------AT-TT-T-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GT--TA-G-CG-AAGATG
gi|131415 : TT------T-----------GT-AG-------GG-AG-C-----------AG---A--G-T------GA-ACCAA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131416 : gccaaggtctacttcaG-CC--AA-GGGTTT------TCGGTTT-----AT-GG-------G--AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TT-G-C---AGATG
gi|131417 : G-CC--AA-GGGTTG------CGAG--------AT-GG-------GG----C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GT--T--G-CG-AAGATG
gi|131418 : G-CC--AA-GAGTTT------T-----------CA-GT-------CC-AG-T-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131419 : G-CC--AA-GGGTTG------T-----------TT-GG-------TC-AG-CTCGCGCTCCCCGG---A--G-C------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131421 : G-CA--AA-GGGTTT------------------AC-GATC-----AA-AG-C-----------GG---A--G-C------GG-ATCGT-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAAATG
gi|131422 : G-CC--AA-GGGTTT------TCGTCCACTTCCAC-TA-------GG-AG-C-----------GC---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-T-CTT--GCGC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131429 : -CC--AA-GGGTTT------------------AT-GG-------GG-AG-C-----------AG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CAT--G-GC--TA-G-C
gi|131432 : C--AA-GGGTTT------C-----------C---G-------GG-AG-T-----------GG---A--G-T------GG-ACCAA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131434 : --AA-GG--TT------T-----------AT-GA-------AG-AG-C-----------GG---A--A--------AG-AACGG-A-AA---C-C-CTT--G-GT--TA-G-CG-AAGATG
gi|131435 : a--AA-GGGTTT------T------------C-GG-------GG----C-----------GA---A--G-T------GG-ACCGA-A-A----C-C-CTT--A-GG--TA-G-CG-AAGATG
gi|131436 : TT------T-----------AG-GG-------GG-AG-C-----------AG---A--A-T------GG-ACCGA-A-CA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-AG-AAGA
gi|131437 : gagTT------T-----------AT-GA-------GG-AG-T-----------GA---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-A-CG-AAGATG
gi|131438 : ggT------T-----------GT-GG-------GG-AC-G-----------GG---A--G-T------GG---CGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131439 : ggaTT------T-----------AT-GG-------GG-AG-G-----------AG---A--A-T------GG-ACCAA-A-AA---C-C-TGT--G-AC--TA-G-CA-AAGAT
gi|131440 : ggTT------T-----------AT-GA-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCG--A-AA---C-C-CCT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131441 : gTT------T-----------AT-GG-------AA-AG-C-----------GG---A--A-T------GG-ATCGA-A-AA---C-C-CAT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131442 : gTT------T-----------AT-GG-------GA-AG-C-----------AG------G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTCAAG-GC--TA-G-CA-AAGATG
gi|131444 : gTT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGAT
gi|131445 : TT------T-----------CT-GG-------GG-AG-C-----------TG---A--G-T------GG-ATCGA-A-AA---T-A-CTT--T-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131446 : TT------C-----------AT-GG-------GG-AA-T-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CCT--G-GC--TA-G-TG-AAGATG
gi|131447 : TT------T-----------AT-GG----------AG-C-----------GGC--G--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-T-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131448 : TT------T-----------AT-GG-------CG-AG-C-----------GG---A--G-TCAGAGTGG-ACCGA-A-A----C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131449 : TT------T-----------AT-GG-------GG-A--C-----------GG---A--G-C------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT----GC--TA-G-CG-A
gi|131452 : T------T-----------AT-GT-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ATCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131453 : T------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GA---A--G-T------GG-ACCAA-A-AT---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGA
gi|131454 : ------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------AG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131455 : ------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TT-G-CG-AAGATG
gi|131456 : ------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT----GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131457 : ------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GT--TA-G-CG-AAGA
gi|131459 : -----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCG--A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131460 : -----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCG--A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131461 : -----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AAAACC-C-TTT--G-GC--TA-G-CGAAAGATG
gi|131462 : T-GG-------GT-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131463 : -GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CA-AAGAT
gi|131464 : -GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-C------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131465 : -GA-------GG-AG-C-----------AG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CA-AAGATG
gi|131466 : -GG-------GG-AG-C-----------GG---ACGG-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-GAAATG
gi|131472 : G-------GG-AG-C-----------GG---G--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131473 : G-------GG-AG-C-----------GG---A--G-C------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTTG-G-GCA-TA-G-CG-AAGATG
gi|131474 : G-------GG-AG-C-----------GG---G--G-T------GCCACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGAT
gi|131476 : -------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCTA-A-AC---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131477 : -------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---T-C-TTT--G-GC--TA-G-CG-TAGATG
gi|131481 : G-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-T-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131485 : -----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TT-G-CG-AAGATG
Alignments
lowQualScore : 111111111111 11111 111111111 3333333333333 111111 222
lowQualScore : 3 11 11 33333 1 11 1 33 44444444 1 11 1 222 2 8888888 555 666 222222222222 33 99999 4 444 000000000 2 3 3 9999999 4444444444444 55 55 6 6 44 77 3 3 3 444444 3 3 3 7777 3 3 1 1 3 6666 5555 1 66 1 999 1 22 888 333 1 11 1 5 111111 77777777777 0 4444444 0 0 22222222222 222 11 0 222222 1 0 1 000 0 0 11 0 11 0 0 0
lowQualScore : . .. .. ..... . .. . .. ........ . .. . ... . ....... ... ... ............ .. ..... . ... ......... . . . ....... ............. .. .. . . .. .. . . . ...... . . . .... . . . . . .... .... . .. . ... . .. ... ... . .. . . ...... ........... . ....... . . ........... ... .. . ...... . . . ... . . .. . .. . . .
lowQualScore : 3 99 88 33333 3 88 3 11 77777777 2 77 2 222 5 8888888 666 555 444444444444 11 11111 7 111 777777777 7 1 3 5555555 6666666666666 55 00 7 7 66 99 3 3 3 222222 3 3 3 1111 6 8 9 9 8 0000 4444 8 11 8 000 8 55 444 222 2 44 1 3 999999 00000000000 6 9999999 5 5 55555555555 777 22 5 000000 0 5 0 999 5 5 88 5 88 5 5 5
consensus : AACTTC-TAT--CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---TG---C-T--GA-C----T--ATA-----GC-G---TA---------CAT-AAG-CC-GTTATTT-C-----ATTGGCTA--A-------T--TTTTCATC--AGAATT--ATC-GTTCT-T--TAG--C-G-TG-AC------TGTATA-GA-TG-G----CAGTAC-AT-G-TGAC-C-GG----CA--A-TT-T--G-CA-A-G-GC--ATA---C---GG-CC--AA-GGGTTT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
Reference ( family-223 ) : AACTTC-TAT--CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---TG---C-T--GA-C----T--ATA-----GC-G---TA---------CAT-AAG-CC-GTTATTT-C-----ATTGGCTA--A-------T--TTTTCATC--AGAATT--ATC-GTTCT-T--TAG--C-G-TG-AC------TGTATA-GA-TG-G----CAGTAC-AT-G-TGAC-C-GG----CA--A-TT-T--G-CA-A-G-GC--ATA---C---GG-CC--AA-GGGTTT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131350 : AACTTC-TAT--CAA--TCTG-----ATTAGA-A--TCA-GCT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---TG---C-T--GA-C----T--ATA-----GC-G---TA---------CAT-AAG-CC-GTTATTT-------ATTGGCTA--A-------T--TTTTCATC--AGAATT--ATC-GTTCT-T--TAG--C-G-TG-AC------TGTATA-GA-TG-G----CAGTAC-AT-G-TGAC-C-GG----CA--A-TT-T--G-CA-A-G-GC--ATA---C---GG-CC--AA-GGGTTT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---C--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CA-AAGATG
gi|131351 : AACTTC-TAT--CAA--TCTG-----ATTAGA-A--TCA-GCT--CCTT--------G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---TG---C-T--GA-C----T--ATA-----GC-G---TA---------CAT-AAG-CC-GTTATTT-C-----ATTGGCTAATA-------T--TTTTCATC--AGAATT--ATC-GTTCT-T--TAG--C-G-TG-AC------TGTATA-GA-TGTG----CAGTAC-AT-G-TGAC-C-GG----CA--A-TT-T----CACA-G-GC--ATA---C---GG-CC--AA-GGG-TT------T-----------AT-GT-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CA-AAGATG
gi|131352 : AACTTC-TAT--CAA--TCGG-----ATTAGA-A--T-A-GCT--CCTT------T-GTA--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---TG---C-T--GA-C----TGAAGA-----GC-G---TA---------CAT-AAG-CC-GTTATTT-C-----ATTGGCTA--A-------TATTTTTCATC--AGCATT--ATC-GTTCTGT--TAG--C-G-TG-AC------TGTATA-GA-TG-G----CAGTAC-AT-G-TGAC-C-GG----CA--A-TT-T--G-CA-A-G-GC--ATAT--C---GG-CC--AA-GGG-TT------T-----------AT--G-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131353 : AACTTT-TAT--CAA---CTG-----ATTAGA-A--TCA-GCT--CCTT------T-G-A--TCCA-CTCA----T-TAGA-------TCGCT----G---C-TACGC-T----T--ATAAG---GC-G---TA---------CAT-AAG-CCCGTTATTTTC-----ATTGGCTA--AGAT----T--TTTTCATC--AGAATT--ATC-G-TCT-T--TAGC-C-G-TG-AC------TGTATA-GA-TG-G----C-GTAT-AT-G-TGAC-CGGG----CA--A-TT-T--G-CA-ACG-GC--ATA---T---CG-CC--AA-GGG-TT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---AT-G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-CGCTG--G-GC--T--G-CG-AAGA
gi|131354 : AACTTC-TAT--CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CTTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CT-TATA-------TCGCT---TG---C-T--GA-T----T--ATAATAGCGT-G---TA---------CAT-TAG-CC-GTTATTT-C-----ATTGGCTA--A-------T--
gi|131355 : AACTTT-AGT--CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------A-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---at
gi|131356 : ACTTT-TAT--CAA---CTG-----ATTGAA----TCA-GCT--TCTT------T-G-A--TCCA-CTCA---CT-TAGAGA-----TCGCT----G---C-T---A-CGCTTT--ATA-----GC-G---TA---------CAT-AAG-CC-CGTATTT-C-----ATTGGCTA--AGAT----T--TTTTCATC--AGAATT--ATC-GT-CT-T--TAG--CCG-TG-AC------TGTATA-GA-TG------CAGTAT-ATCG-TGAC-C-GGG---CA--A-TT-TT-G-CA-ACG-GC--ATA---T---CG-CC--AA-GG--TT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTG--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131358 : CTTCATTT--CAA--TCAG-----ATTAAA-A--TCA-GTT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTTG---GG-TAGA-------TCGCT---
gi|131360 : TTC-TAT--CA---TCTG-----ATTAGA-A--CCA-GCTT-CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---TGG--C-T--GA-C----T--ATA-----GC-G---TA---------CAT-AAG-GC-GTTATTT-C-----ATTAGCTAT-A-------T--TTTTCATC--AGAATT--ATCGGTTCT-T--TAG----G-TG-AC------TGTATA-GA-TG-G----CAGTACGATAG-TGAC-C-GG----CA--A-TT-T--G-CA-A-G-G---ATACT-C---GG-CC-----GGG-TT------T-----------AT----------GG-AG-C-----------GGT--A--G-TG-----GG-ACCGA-A-AA-----C-ATT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131361 : TTC-TAT--CAAGATCTG-----ATAGAA-A--TCA-GGC--CTTT------T-G-A--TCCGACTC----CTGTAGAC------TCGCT---TGATGC-T--GAAC----T--ATATATA-GCCG---TT---------AAT-AAG-CC-GTTATTT-C-----ATTGGCTAT-A-------G--TTTTCATC--AGAATT--ATC-GTTCTGT--TAGCAC-G-TG-ACGCGTTATGCA-A-GACTG-GAACTTAGTAC-AT-GTTGACTC-GGCGTACA--A-TTAA--G-CA-A-G-GC--ATAAT-C---GG-CC--AAGGGGTTG------T-----------AT--G-------GG-AG-C-----------GGGCAA--GTT------GG-ACCGACATAA---C-C-CTT--G-GCTTTACG-CG-AAGATG
gi|131362 : TTC-CTT--CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------A-G-A--TCCG-CTCC---CT-TAGA-------TCACTA--CA---C-T---A-G----T--GTA-----GC-G---
gi|131363 : C-TATAGCAA--TCTG-----ATTAAA----TCA-GCT--CCTT------A-G-A--TTTG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---
gi|131365 : AC--CAA--TTTG-----ATTAAA-A--TCA-ACT--CATT------T-G-A--TCCG-CCCA---CT-TAGA-------TCGC----TA---CAT--TA-G----T--GTA-----GC-GATCTA---------CAC-GAG-CT-GTT
gi|131366 : AT--CAA--TCTGTCGCCATTAAA-A--TCA-GCT--CCTTAGATGATAG-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---
gi|131367 : AT--CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GAT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CA-TATA-------TC
gi|131368 : AT--CGA--TATG-----ATTAAA-A--TCA-GAT--CCTT------T-G-A--TCTG-CTCA---ATGTAGA-------TCAC----TG---C----AA-A----T--GTA-----GC----------------CAT-AA
gi|131369 : T--CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------T-A-A--TTCA-CTCA---TT-T-GA-------TCGCT---
gi|131371 : --CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------A-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---
gi|131372 : --CAA--TCTG-----ATTAAACA--TCA-GCT--CCTT------T-G-A--ACAG-CTCG---TG-TAGA-------TCGCTA--CA---C-T--AA------T--GTA-----GC-G---
gi|131373 : --CAA--TCTG-----ACTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------A-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---
gi|131374 : --CAA--TCTT-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCGT------A-G-A--TCCA-CTCA---CT-TTGA-------TCGC----TG---C-----A-C----T--A
gi|131375 : --CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------A-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TC
gi|131376 : --CAA--TCTG-----ATTAGA-A--TCG-GCT--CCTT------T-G-A--TCTG-CTAA---CT-TAAA-------TCGC
gi|131377 : --CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCGT------A-G-A--TCCG-CTCA---TT-TAGA-------TTGC
gi|131378 : --CAA--TCTG-----ATTAAA-A--CCA-CAT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CG-TAGA-------TCGCT---
gi|131379 : --CAA--TTTA-----ATTAAA-A--TCA-GTT--CCTT------A-G-A--CCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---
gi|131380 : --CAA--TCTG-----ATCAAA-A--TCA-GAT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CA-TAGA-------T
gi|131381 : --CAA--TCTG-----AAAAAA-AAATCA-GCT--CCTA------T-G-A--TCTG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCTACATG---C-----A-C----T-------------G---TA---------CAT-A
gi|131382 : --CAA--TTTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--TCTC------T-G-A--TCCA-CTCA---TT-TAGA-------TTGCT---
gi|131384 : AA--TCTA-----ATTAAA-A--GTA-GAT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CG-TATA-------TCGC----TG-----T--AA-C----A--ATA------------TA---------CGT-GAG-C
gi|131387 : TTAAA-A--TTAAGCTGCCCTT------T-G-AATCCCG-CTCAACACT-TGGAAT-----TCGCT---TG---C-T--GC-T----T--AAATCAG-GCAG---TA---------CAT-AAGGCC-GTT-TTC-CGTCATATTGGCTA--AATATAACTA-TTTTCCTCGAAGAACTTAATCTGTTCT-TAGTAG--C-GCTGCACAA----GGTATAAGA-TG-G----CAGCAC-GT-G-TGAC-C-GG----CA--A-CT-TTGG-CATG-G-GCTGATACT-C---GG-TC--AA-GGCGTT------T-----------AT-GG-------GG-AGAC-----------GG---A--G-T------GGAACCGA-ATAA---CGC-CTTC-G-GC--TA-GCCG-AAGAT
gi|131388 : T------T-G-A--TTGG-TTCA---TT-TAAACATGTATTCGCT---TG---C-T--GA------T--ATA-----GC-G---TAGATCTAGTACAT-AA--CC-GTTATT------------------A-------T--ATTTAATC--AGAATT--ATC-GTTCT-T--TAG--C-G-TG-AC------AGTATA-GA-TG-G----CAG--C-AC-G-TGAC-C-GA----CA--A-TT-T-----------GT--AT----C---GG-CC--AA-GGG-CT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CCT--G-CT--TA-G-CG-AAAA
gi|131389 : -G-TGAC-C-GC----CATTG-TT-T--GACA-A-T-GC--ATAAT-C---GG-CG--AA-GGGTTT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131390 : ttgctagcacagcggttcaccattagtttccctcgattggtaaacaatttttcaatctgtgaagtggggatttccattggtccggtcgcttaccgcaactcgcgcaatcgcaagaa----T--ATA-----GC-G---TA---------CATTAAG-CC-GCTATCT-C-----ATTGACTA--A-------TAATTTTCATC--TGAATT--ATC-GTTCT-T--TAA--C-G-TG-AC------AGTATA-GA-TG-G----CAGAAC-GT-G-TGA--C-GA----CA--ATTT-T--G-TA-T-G-GC--ATAT--C---GG--C--AA-GGG-TT------T-----------AT--A-------GG-AG-C-----------GG---T--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-T-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131391 : --ATC-TTTCT-T--TAG--C-------T------TGT---------------CAGTAC-GT-G-TGAC-C-GA----CA--A-TT-T--G-CA-T-G-GC--ATAT--C---GG-CC--AA-GGGTTT------------------AT-GG-------GG-AG-C-----------GGTC-A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---T-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131392 : C-GTTCT-T--TAG--C-G-TG-AC------TGTATA-GA-TG-G----CAGT
gi|131394 : T-G-TGAG-C-------CA--G-TT-T--T-CG-T-G-GC--ATAATCT---GC-CC--AA-GG--TT------T-----------GT-GG-------AG-AG-T-----------GG---A--G-T------TG-ATGGA-A-AA---T-A-CTC--G-GC--TT-G-CG-AAGA
gi|131395 : -G-TGAC-C-GG----CA--T-TT-T--G-CA-A-T-GC--ATA---T---TG-GC--AA-GGG-TT------T-----------AT-GGA------GA-AG-C-----------AG---A--G-T-------G-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AA
gi|131396 : -G-TGAC-C-GG----CT--T-TT-TT-G-CA-A-T-GC--ATAT--C---GG-CC--AA-GGGTT-------------------AT-GG-------GA-GG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131397 : -G-TGAC-C-GG----CA--T-TT-T--G-CA-ATGCGC--ATAT--C---GGTCC--AA-AGGGTT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCG--A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131398 : -G-TGAC-C-GG----CA--T-TT-T--G-CA-A-T-CC--ATAT--C---GG-TCCAAA-GGGTTT------A-----------GT-GG-------GGGAG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-A----C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131399 : -G-TGAC-C-G-----CG--T-TT-T--G-CA-G-T-GC--ATT---C---GG-CC--AA-GGGGTT------T-----------A--GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---T-C-CCT--T-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131400 : -G-TGAC-C-GA----CA--A-TT-T--G-CA-T-G-GC--ATA---T---AA-GC--AA-AGGGTT------T-----------AT-GG-------GG-AG-T-----------GG---A--G-T------GA-CCCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131401 : -G-TGAC-C-GA----CA--A-TT-T--G-CA-A-G-GC--GTAT--C---GG-CC--AA-GGGTTT------
gi|131402 : -G-TGAC-CCGG----CG----TT-T--G-TA-G-T-GG--ATA---TCGGGG-CC--AA-GGGGTT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA-----C-CTT--G-GCT-TA-G-CG-AAGATGa
gi|131403 : G---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AA-ATG
gi|131403 : atttgtgggG-CC--AA-GGGTTT------T------------C-GGTCCACTCGG-AG-G-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATGggaggggagtggaccgaaaacccttggctagcgaagatg
gi|131404 : atttgtgggcatttcgctaG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AA-ATG
gi|131404 : atttgtgggG-CC--AA-GGGTTT------T------------C-GGTCCACTCGG-AG-G-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATGggaggggagtggaccgaaaacccttggctagcgaagatg
gi|131405 : atttgtgggcatttcgcta-TT-T--G-T----G-GC--ATAAT-C---TG-CC--AA-GGGTTT------------------GT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ATCAA-A-AA---C-C-CTT--G-GT--GT-G-CG-AAGATG
gi|131406 : -----------GG---A--G-T------GG-ACCAA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--AA-G-CG-AAGATG
gi|131408 : ttttcagtgcatactgctcggtgtggTTT------T-----------AT-GG-------GA-GG-C-----------AG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-T-CGT--G-AC--TA-G-CG-AAG
gi|131409 : catatcacca--AA-GG--TT------T-----------AT-G--------------T-----------GG---A--G-T------GG-AACGA-A-AA---C-C-CTC--G-GC--TA-G-CA-AAGATG
gi|131410 : cattccccatgT-GG-------GG-AG-C-----------GG---G--G-T------GC-ACCGA-A-AA---C-C-TTT--G-GC--TA-G-CG-AAGAT
gi|131412 : ccgcagagggagG-CC--AA-GGGTTTACGGTTT-----------AT-AG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131413 : G-CC--AA-GGGTTT------TCG---------GTCGG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TT-G-CG-AAGATG
gi|131414 : G-CC--AA-GGGTTT------T------------T-GG-------AT-TT-T-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GT--TA-G-CG-AAGATG
gi|131415 : TT------T-----------GT-AG-------GG-AG-C-----------AG---A--G-T------GA-ACCAA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131416 : gccaaggtctacttcaG-CC--AA-GGGTTT------TCGGTTT-----AT-GG-------G--AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TT-G-C---AGATG
gi|131417 : G-CC--AA-GGGTTG------CGAG--------AT-GG-------GG----C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GT--T--G-CG-AAGATG
gi|131418 : G-CC--AA-GAGTTT------T-----------CA-GT-------CC-AG-T-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131419 : G-CC--AA-GGGTTG------T-----------TT-GG-------TC-AG-CTCGCGCTCCCCGG---A--G-C------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131421 : G-CA--AA-GGGTTT------------------AC-GATC-----AA-AG-C-----------GG---A--G-C------GG-ATCGT-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAAATG
gi|131422 : G-CC--AA-GGGTTT------TCGTCCACTTCCAC-TA-------GG-AG-C-----------GC---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-T-CTT--GCGC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131429 : -CC--AA-GGGTTT------------------AT-GG-------GG-AG-C-----------AG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CAT--G-GC--TA-G-C
gi|131432 : C--AA-GGGTTT------C-----------C---G-------GG-AG-T-----------GG---A--G-T------GG-ACCAA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131434 : --AA-GG--TT------T-----------AT-GA-------AG-AG-C-----------GG---A--A--------AG-AACGG-A-AA---C-C-CTT--G-GT--TA-G-CG-AAGATG
gi|131435 : a--AA-GGGTTT------T------------C-GG-------GG----C-----------GA---A--G-T------GG-ACCGA-A-A----C-C-CTT--A-GG--TA-G-CG-AAGATG
gi|131436 : TT------T-----------AG-GG-------GG-AG-C-----------AG---A--A-T------GG-ACCGA-A-CA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-AG-AAGA
gi|131437 : gagTT------T-----------AT-GA-------GG-AG-T-----------GA---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-A-CG-AAGATG
gi|131438 : ggT------T-----------GT-GG-------GG-AC-G-----------GG---A--G-T------GG---CGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131439 : ggaTT------T-----------AT-GG-------GG-AG-G-----------AG---A--A-T------GG-ACCAA-A-AA---C-C-TGT--G-AC--TA-G-CA-AAGAT
gi|131440 : ggTT------T-----------AT-GA-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCG--A-AA---C-C-CCT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131441 : gTT------T-----------AT-GG-------AA-AG-C-----------GG---A--A-T------GG-ATCGA-A-AA---C-C-CAT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131442 : gTT------T-----------AT-GG-------GA-AG-C-----------AG------G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTCAAG-GC--TA-G-CA-AAGATG
gi|131444 : gTT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGAT
gi|131445 : TT------T-----------CT-GG-------GG-AG-C-----------TG---A--G-T------GG-ATCGA-A-AA---T-A-CTT--T-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131446 : TT------C-----------AT-GG-------GG-AA-T-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CCT--G-GC--TA-G-TG-AAGATG
gi|131447 : TT------T-----------AT-GG----------AG-C-----------GGC--G--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-T-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131448 : TT------T-----------AT-GG-------CG-AG-C-----------GG---A--G-TCAGAGTGG-ACCGA-A-A----C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131449 : TT------T-----------AT-GG-------GG-A--C-----------GG---A--G-C------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT----GC--TA-G-CG-A
gi|131452 : T------T-----------AT-GT-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ATCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131453 : T------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GA---A--G-T------GG-ACCAA-A-AT---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGA
gi|131454 : ------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------AG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131455 : ------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TT-G-CG-AAGATG
gi|131456 : ------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT----GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131457 : ------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GT--TA-G-CG-AAGA
gi|131459 : -----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCG--A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131460 : -----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCG--A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131461 : -----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AAAACC-C-TTT--G-GC--TA-G-CGAAAGATG
gi|131462 : T-GG-------GT-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131463 : -GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CA-AAGAT
gi|131464 : -GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-C------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131465 : -GA-------GG-AG-C-----------AG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CA-AAGATG
gi|131466 : -GG-------GG-AG-C-----------GG---ACGG-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-GAAATG
gi|131472 : G-------GG-AG-C-----------GG---G--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131473 : G-------GG-AG-C-----------GG---A--G-C------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTTG-G-GCA-TA-G-CG-AAGATG
gi|131474 : G-------GG-AG-C-----------GG---G--G-T------GCCACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGAT
gi|131476 : -------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCTA-A-AC---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131477 : -------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---T-C-TTT--G-GC--TA-G-CG-TAGATG
gi|131481 : G-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-T-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131485 : -----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TT-G-CG-AAGATG
blockSeqs : A AG GA TCGCC C AA A GC AGATGATA T AT A ACA G CATGTAT ACA ATG TACGCTT GA ATAGC C ATC GATCTAGTA T G C CGTCAT AATATAACTA GA TA G G AG CA C C C GCGTTA A C T AACT G C T T G CGTA TTG A TG A CA C TG ATC CGG T CA G T ACGGTT CGTCCACTTCC TCCACTC TCGCGCTCCCC GCA CG CAGAGT A T AA TT
blockSeqs : . . . . . . . T T . . . . G GA A G TACGCT . TATA A . . . . . TC AGATT . . T G . C . . . AA . . . . . A . . C G AT . T . AC . . CT . . . . G . CGGTTT TCCACTC . TC T G C T C T
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . AT A . TGAAC . TCAG . . . . . . C AGATT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . T . AC . . AT . . . . T . GAG TC . T . . . . G A
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . C . . ATTAG . AG . . . . . . C ATAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . TG . . CT . . . . T . CG A . C . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . . . . . TGAC . . . . . . . . C ATAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . AT . . AT . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . TGAC . . . . . . . . C ATAA . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . A . . AT . . . . G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . TGAT . . . . . . . . C TAT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . A . . T . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . TGAC . . . . . . . . C TAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . A . . T . . . . G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . . . . . . . . TAAC . . . . . . . . C AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . A . . T . . . . G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . . . . . TGCT . . . . . . . . . AT . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . T . . T . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . . . . . . TAG . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . A . . . T . . T . . . . G . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . AAA . . . . . . . . . . . . G . . . T . . T . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . TAA . . . . . . . . . . . T . . . A . . T . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . TGA . . . . . . . . . . . T . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . AC . . . . . . . . . T . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . . . AC . . . . . . . . . T . . . G . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . T . . . T . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . . A . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . A . . . G . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . A . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . T . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . T . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqCons : C****** ATAT*********
originalCons : AACTTC-TAT--CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---TG---C-T--GA-C----T--ATA-----GC-G---TA---------CAT-AAG-CC-GTTATTT-C-----ATTGGCTA--A-------T--TTTTCATC--AGAATT--ATC-GTTCT-T--TAG--C-G-TG-AC------TGTATA-GA-TG-G----CAGTAC-AT-G-TGAC-C-GG----CA--A-TT-T--G-CA-A-G-GC--ATA---C---GG-CC--AA-GGGTTT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
finalCons : AACTTC-TAT--CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---TG---C-T--GA-C----T--ATA-----GC-G---TA---------CAT-AAG-CC-GTTATTTC------ATTGGCTAATAT---------TTTTCATC--AGAATT--ATC-GTTCT-T--TAG--C-G-TG-AC------TGTATA-GA-TG-G----CAGTAC-AT-G-TGAC-C-GG----CA--A-TT-T--G-CA-A-G-GC--ATA---C---GG-CC--AA-GGGTTT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
Alignments
lowQualScore : 111111111111 2222222222222222 111111 111111 222
lowQualScore : 3 11 11 33333 1 11 1 33 44444444 1 11 1 222 2 8888888 555 666 222222222222 33 1111111111111111 444 2 3 3 9999999 3 111111 4 4 55 55 6 6 44 77 3 3 3 444444 3 3 3 7777 3 3 1 1 3 6666 5555 1 66 1 999 1 22 888 333 1 11 1 5 111111 77777777777 0 4444444 0 0 22222222222 222 11 0 222222 1 0 1 000 0 0 11 0 11 0 0 0
lowQualScore : . .. .. ..... . .. . .. ........ . .. . ... . ....... ... ... ............ .. ................ ... . . . ....... . ...... . . .. .. . . .. .. . . . ...... . . . .... . . . . . .... .... . .. . ... . .. ... ... . .. . . ...... ........... . ....... . . ........... ... .. . ...... . . . ... . . .. . .. . . .
lowQualScore : 3 99 88 33333 3 88 3 11 77777777 2 77 2 222 5 8888888 666 555 444444444444 11 5555555555555555 111 7 1 3 5555555 6 333333 0 0 55 00 7 7 66 99 3 3 3 222222 3 3 3 1111 6 8 9 9 8 0000 4444 8 11 8 000 8 55 444 222 2 44 1 3 999999 00000000000 6 9999999 5 5 55555555555 777 22 5 000000 0 5 0 999 5 5 88 5 88 5 5 5
consensus : AACTTC-TAT--CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---TG---C-T--GA-C----T--ATA-----GC---------G---TACAT-AAG-CC-GTTATTT-C-----ATTGGCTAA-TAT-----TTT-T-CATC--AGAATT--ATC-GTTCT-T--TAG--C-G-TG-AC------TGTATA-GA-TG-G----CAGTAC-AT-G-TGAC-C-GG----CA--A-TT-T--G-CA-A-G-GC--ATA---C---GG-CC--AA-GGGTTT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
Reference ( family-223 ) : AACTTC-TAT--CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---TG---C-T--GA-C----T--ATA-----GC---------G---TACAT-AAG-CC-GTTATTT-C-----ATTGGCTAA-TAT-----TTT-T-CATC--AGAATT--ATC-GTTCT-T--TAG--C-G-TG-AC------TGTATA-GA-TG-G----CAGTAC-AT-G-TGAC-C-GG----CA--A-TT-T--G-CA-A-G-GC--ATA---C---GG-CC--AA-GGGTTT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131350 : AACTTC-TAT--CAA--TCTG-----ATTAGA-A--TCA-GCT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---TG---C-T--GA-C----T--ATA-----GC---------G---TACAT-AAG-CC-GTTATTT-------ATTGGCTAA-T-------TTT-T-CATC--AGAATT--ATC-GTTCT-T--TAG--C-G-TG-AC------TGTATA-GA-TG-G----CAGTAC-AT-G-TGAC-C-GG----CA--A-TT-T--G-CA-A-G-GC--ATA---C---GG-CC--AA-GGGTTT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---C--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CA-AAGATG
gi|131351 : AACTTC-TAT--CAA--TCTG-----ATTAGA-A--TCA-GCT--CCTT--------G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---TG---C-T--GA-C----T--ATA-----GC---------G---TACAT-AAG-CC-GTTATTT-C-----ATTGGCTAA-TAT-----TTT-T-CATC--AGAATT--ATC-GTTCT-T--TAG--C-G-TG-AC------TGTATA-GA-TGTG----CAGTAC-AT-G-TGAC-C-GG----CA--A-TT-T----CACA-G-GC--ATA---C---GG-CC--AA-GGG-TT------T-----------AT-GT-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CA-AAGATG
gi|131352 : AACTTC-TAT--CAA--TCGG-----ATTAGA-A--T-A-GCT--CCTT------T-GTA--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---TG---C-T--GA-C----TGAAGA-----GC---------G---TACAT-AAG-CC-GTTATTT-C-----ATTGGCTAA-TAT-----TTT-T-CATC--AGCATT--ATC-GTTCTGT--TAG--C-G-TG-AC------TGTATA-GA-TG-G----CAGTAC-AT-G-TGAC-C-GG----CA--A-TT-T--G-CA-A-G-GC--ATAT--C---GG-CC--AA-GGG-TT------T-----------AT--G-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131353 : AACTTT-TAT--CAA---CTG-----ATTAGA-A--TCA-GCT--CCTT------T-G-A--TCCA-CTCA----T-TAGA-------TCGCT----G---C-TACGC-T----T--ATAAG---GC---------G---TACAT-AAG-CCCGTTATTTTC-----ATTGGCTAA-GAT-----TTTTT-CATC--AGAATT--ATC-G-TCT-T--TAGC-C-G-TG-AC------TGTATA-GA-TG-G----C-GTAT-AT-G-TGAC-CGGG----CA--A-TT-T--G-CA-ACG-GC--ATA---T---CG-CC--AA-GGG-TT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---AT-G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-CGCTG--G-GC--T--G-CG-AAGA
gi|131354 : AACTTC-TAT--CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CTTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CT-TATA-------TCGCT---TG---C-T--GA-T----T--ATAATAGCGT---------G---TACAT-TAG-CC-GTTATTT-C-----ATTGGCTAA-TAT-----
gi|131355 : AACTTT-AGT--CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------A-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---
gi|131356 : ACTTT-TAT--CAA---CTG-----ATTGAA----TCA-GCT--TCTT------T-G-A--TCCA-CTCA---CT-TAGAGA-----TCGCT----G---C-T---A-CGCTTT--ATA-----GC---------G---TACAT-AAG-CC-CGTATTT-C-----ATTGGCTAA-GAT-----TTT-TTCATC--AGAATT--ATC-GT-CT-T--TAG--CCG-TG-AC------TGTATA-GA-TG------CAGTAT-ATCG-TGAC-C-GGG---CA--A-TT-TT-G-CA-ACG-GC--ATA---T---CG-CC--AA-GG--TT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTG--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131358 : CTTCATTT--CAA--TCAG-----ATTAAA-A--TCA-GTT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTTG---GG-TAGA-------TCGCT---
gi|131360 : TTC-TAT--CA---TCTG-----ATTAGA-A--CCA-GCTT-CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---TGG--C-T--GA-C----T--ATA-----GC---------G---TACAT-AAG-GC-GTTATTT-C-----ATTAGCTA--TAT-----TTT-T-CATC--AGAATT--ATCGGTTCT-T--TAG----G-TG-AC------TGTATA-GA-TG-G----CAGTACGATAG-TGAC-C-GG----CA--A-TT-T--G-CA-A-G-G---ATACT-C---GG-CC-----GGG-TT------T-----------AT----------GG-AG-C-----------GGT--A--G-TG-----GG-ACCGA-A-AA-----C-ATT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131361 : TTC-TAT--CAAGATCTG-----ATAGAA-A--TCA-GGC--CTTT------T-G-A--TCCGACTC----CTGTAGAC------TCGCT---TGATGC-T--GAAC----T--ATATATA-GCC--------G---TTAAT-AAG-CC-GTTATTT-C-----ATTGGCTA--TAG-----TTT-T-CATC--AGAATT--ATC-GTTCTGT--TAGCAC-G-TG-ACGCGTTATGCA-A-GACTG-GAACTTAGTAC-AT-GTTGACTC-GGCGTACA--A-TTAA--G-CA-A-G-GC--ATAAT-C---GG-CC--AAGGGGTTG------T-----------AT--G-------GG-AG-C-----------GGGCAA--GTT------GG-ACCGACATAA---C-C-CTT--G-GCTTTACG-CG-AAGATG
gi|131362 : TTC-CTT--CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------A-G-A--TCCG-CTCC---CT-TAGA-------TCACTA--CA---C-T---A-G----T--GTA-----GC---------G---
gi|131363 : C-TATAGCAA--TCTG-----ATTAAA----TCA-GCT--CCTT------A-G-A--TTTG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---
gi|131365 : AC--CAA--TTTG-----ATTAAA-A--TCA-ACT--CATT------T-G-A--TCCG-CCCA---CT-TAGA-------TCGC----TA---CAT--TA-G----T--GTA-----GC---------GATCTACAC-GAG-CT-GTT
gi|131366 : AT--CAA--TCTGTCGCCATTAAA-A--TCA-GCT--CCTTAGATGATAG-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---
gi|131367 : AT--CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GAT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CA-TATA-------TC
gi|131368 : AT--CGA--TATG-----ATTAAA-A--TCA-GAT--CCTT------T-G-A--TCTG-CTCA---ATGTAGA-------TCAC----TG---C----AA-A----T--GTA-----GC---------------CAT-AA
gi|131369 : T--CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------T-A-A--TTCA-CTCA---TT-T-GA-------TCGCT---
gi|131371 : --CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------A-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---
gi|131372 : --CAA--TCTG-----ATTAAACA--TCA-GCT--CCTT------T-G-A--ACAG-CTCG---TG-TAGA-------TCGCTA--CA---C-T--AA------T--GTA-----GC---------G---
gi|131373 : --CAA--TCTG-----ACTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------A-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---
gi|131374 : --CAA--TCTT-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCGT------A-G-A--TCCA-CTCA---CT-TTGA-------TCGC----TG---C-----A-C----T--A
gi|131375 : --CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCTT------A-G-A--TCCG-CTCA---CT-TAGA-------TC
gi|131376 : --CAA--TCTG-----ATTAGA-A--TCG-GCT--CCTT------T-G-A--TCTG-CTAA---CT-TAAA-------TCGC
gi|131377 : --CAA--TCTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--CCGT------A-G-A--TCCG-CTCA---TT-TAGA-------TTGC
gi|131378 : --CAA--TCTG-----ATTAAA-A--CCA-CAT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CG-TAGA-------TCGCT---
gi|131379 : --CAA--TTTA-----ATTAAA-A--TCA-GTT--CCTT------A-G-A--CCCG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCT---
gi|131380 : --CAA--TCTG-----ATCAAA-A--TCA-GAT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CA-TAGA-------T
gi|131381 : --CAA--TCTG-----AAAAAA-AAATCA-GCT--CCTA------T-G-A--TCTG-CTCA---CT-TAGA-------TCGCTACATG---C-----A-C----T---------------------G---TACAT-A
gi|131382 : --CAA--TTTG-----ATTAAA-A--TCA-GCT--TCTC------T-G-A--TCCA-CTCA---TT-TAGA-------TTGCT---
gi|131384 : AA--TCTA-----ATTAAA-A--GTA-GAT--CCTT------T-G-A--TCCG-CTCA---CG-TATA-------TCGC----TG-----T--AA-C----A--ATA--------------------TACGT-GAG-C
gi|131387 : TTAAA-A--TTAAGCTGCCCTT------T-G-AATCCCG-CTCAACACT-TGGAAT-----TCGCT---TG---C-T--GC-T----T--AAATCAG-GCA--------G---TACAT-AAGGCC-GTT-TTC-CGTCATATTGGCTAAATATAACTATTT-T-CCTCGAAGAACTTAATCTGTTCT-TAGTAG--C-GCTGCACAA----GGTATAAGA-TG-G----CAGCAC-GT-G-TGAC-C-GG----CA--A-CT-TTGG-CATG-G-GCTGATACT-C---GG-TC--AA-GGCGTT------T-----------AT-GG-------GG-AGAC-----------GG---A--G-T------GGAACCGA-ATAA---CGC-CTTC-G-GC--TA-GCCG-AAGAT
gi|131388 : T------T-G-A--TTGG-TTCA---TT-TAAACATGTATTCGCT---TG---C-T--GA------T--ATA-----GCGTAGATCTAG---TACAT-AA--CC-GTTATT----------------A-TA-------TT-T-AATC--AGAATT--ATC-GTTCT-T--TAG--C-G-TG-AC------AGTATA-GA-TG-G----CAG--C-AC-G-TGAC-C-GA----CA--A-TT-T-----------GT--AT----C---GG-CC--AA-GGG-CT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CCT--G-CT--TA-G-CG-AAAA
gi|131389 : -G-TGAC-C-GC----CATTG-TT-T--GACA-A-T-GC--ATAAT-C---GG-CG--AA-GGGTTT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131390 : ttgctagcacagcggttcaccattagtttccctcgattggtaaacaatttttcaatctgtgaagtggggatttccattggtccggtcgcttaccgcaactcgcgcaatcgcaagaa----T--ATA-----GC---------G---TACATTAAG-CC-GCTATCT-C-----ATTGACTAA-TAA-----TTT-T-CATC--TGAATT--ATC-GTTCT-T--TAA--C-G-TG-AC------AGTATA-GA-TG-G----CAGAAC-GT-G-TGA--C-GA----CA--ATTT-T--G-TA-T-G-GC--ATAT--C---GG--C--AA-GGG-TT------T-----------AT--A-------GG-AG-C-----------GG---T--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-T-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131391 : --ATC-TTTCT-T--TAG--C-------T------TGT---------------CAGTAC-GT-G-TGAC-C-GA----CA--A-TT-T--G-CA-T-G-GC--ATAT--C---GG-CC--AA-GGGTTT------------------AT-GG-------GG-AG-C-----------GGTC-A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---T-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131392 : C-GTTCT-T--TAG--C-G-TG-AC------TGTATA-GA-TG-G----CAGT
gi|131394 : T-G-TGAG-C-------CA--G-TT-T--T-CG-T-G-GC--ATAATCT---GC-CC--AA-GG--TT------T-----------GT-GG-------AG-AG-T-----------GG---A--G-T------TG-ATGGA-A-AA---T-A-CTC--G-GC--TT-G-CG-AAGA
gi|131395 : -G-TGAC-C-GG----CA--T-TT-T--G-CA-A-T-GC--ATA---T---TG-GC--AA-GGG-TT------T-----------AT-GGA------GA-AG-C-----------AG---A--G-T-------G-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AA
gi|131396 : -G-TGAC-C-GG----CT--T-TT-TT-G-CA-A-T-GC--ATAT--C---GG-CC--AA-GGGTT-------------------AT-GG-------GA-GG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131397 : -G-TGAC-C-GG----CA--T-TT-T--G-CA-ATGCGC--ATAT--C---GGTCC--AA-AGGGTT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCG--A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131398 : -G-TGAC-C-GG----CA--T-TT-T--G-CA-A-T-CC--ATAT--C---GG-TCCAAA-GGGTTT------A-----------GT-GG-------GGGAG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-A----C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131399 : -G-TGAC-C-G-----CG--T-TT-T--G-CA-G-T-GC--ATT---C---GG-CC--AA-GGGGTT------T-----------A--GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---T-C-CCT--T-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131400 : -G-TGAC-C-GA----CA--A-TT-T--G-CA-T-G-GC--ATA---T---AA-GC--AA-AGGGTT------T-----------AT-GG-------GG-AG-T-----------GG---A--G-T------GA-CCCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131401 : -G-TGAC-C-GA----CA--A-TT-T--G-CA-A-G-GC--GTAT--C---GG-CC--AA-GGGTTT------
gi|131402 : -G-TGAC-CCGG----CG----TT-T--G-TA-G-T-GG--ATA---TCGGGG-CC--AA-GGGGTT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA-----C-CTT--G-GCT-TA-G-CG-AAGATGa
gi|131403 : G---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AA-ATG
gi|131403 : atttgtgggG-CC--AA-GGGTTT------T------------C-GGTCCACTCGG-AG-G-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATGggaggggagtggaccgaaaacccttggctagcgaagatg
gi|131404 : atttgtgggcatttcgctaG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AA-ATG
gi|131404 : atttgtgggG-CC--AA-GGGTTT------T------------C-GGTCCACTCGG-AG-G-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATGggaggggagtggaccgaaaacccttggctagcgaagatg
gi|131405 : atttgtgggcatttcgcta-TT-T--G-T----G-GC--ATAAT-C---TG-CC--AA-GGGTTT------------------GT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ATCAA-A-AA---C-C-CTT--G-GT--GT-G-CG-AAGATG
gi|131406 : -----------GG---A--G-T------GG-ACCAA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--AA-G-CG-AAGATG
gi|131408 : ttttcagtgcatactgctcggtgtggTTT------T-----------AT-GG-------GA-GG-C-----------AG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-T-CGT--G-AC--TA-G-CG-AAG
gi|131409 : catatcacca--AA-GG--TT------T-----------AT-G--------------T-----------GG---A--G-T------GG-AACGA-A-AA---C-C-CTC--G-GC--TA-G-CA-AAGATG
gi|131410 : cattccccatgT-GG-------GG-AG-C-----------GG---G--G-T------GC-ACCGA-A-AA---C-C-TTT--G-GC--TA-G-CG-AAGAT
gi|131412 : ccgcagagggagG-CC--AA-GGGTTTACGGTTT-----------AT-AG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131413 : G-CC--AA-GGGTTT------TCG---------GTCGG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TT-G-CG-AAGATG
gi|131414 : G-CC--AA-GGGTTT------T------------T-GG-------AT-TT-T-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GT--TA-G-CG-AAGATG
gi|131415 : TT------T-----------GT-AG-------GG-AG-C-----------AG---A--G-T------GA-ACCAA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131416 : gccaaggtctacttcaG-CC--AA-GGGTTT------TCGGTTT-----AT-GG-------G--AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TT-G-C---AGATG
gi|131417 : G-CC--AA-GGGTTG------CGAG--------AT-GG-------GG----C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GT--T--G-CG-AAGATG
gi|131418 : G-CC--AA-GAGTTT------T-----------CA-GT-------CC-AG-T-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131419 : G-CC--AA-GGGTTG------T-----------TT-GG-------TC-AG-CTCGCGCTCCCCGG---A--G-C------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131421 : G-CA--AA-GGGTTT------------------AC-GATC-----AA-AG-C-----------GG---A--G-C------GG-ATCGT-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAAATG
gi|131422 : G-CC--AA-GGGTTT------TCGTCCACTTCCAC-TA-------GG-AG-C-----------GC---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-T-CTT--GCGC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131429 : -CC--AA-GGGTTT------------------AT-GG-------GG-AG-C-----------AG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CAT--G-GC--TA-G-C
gi|131432 : C--AA-GGGTTT------C-----------C---G-------GG-AG-T-----------GG---A--G-T------GG-ACCAA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131434 : --AA-GG--TT------T-----------AT-GA-------AG-AG-C-----------GG---A--A--------AG-AACGG-A-AA---C-C-CTT--G-GT--TA-G-CG-AAGATG
gi|131435 : a--AA-GGGTTT------T------------C-GG-------GG----C-----------GA---A--G-T------GG-ACCGA-A-A----C-C-CTT--A-GG--TA-G-CG-AAGATG
gi|131436 : TT------T-----------AG-GG-------GG-AG-C-----------AG---A--A-T------GG-ACCGA-A-CA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-AG-AAGA
gi|131437 : gagTT------T-----------AT-GA-------GG-AG-T-----------GA---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-A-CG-AAGATG
gi|131438 : ggT------T-----------GT-GG-------GG-AC-G-----------GG---A--G-T------GG---CGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131439 : ggaTT------T-----------AT-GG-------GG-AG-G-----------AG---A--A-T------GG-ACCAA-A-AA---C-C-TGT--G-AC--TA-G-CA-AAGAT
gi|131440 : ggTT------T-----------AT-GA-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCG--A-AA---C-C-CCT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131441 : gTT------T-----------AT-GG-------AA-AG-C-----------GG---A--A-T------GG-ATCGA-A-AA---C-C-CAT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131442 : gTT------T-----------AT-GG-------GA-AG-C-----------AG------G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTCAAG-GC--TA-G-CA-AAGATG
gi|131444 : gTT------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGAT
gi|131445 : TT------T-----------CT-GG-------GG-AG-C-----------TG---A--G-T------GG-ATCGA-A-AA---T-A-CTT--T-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131446 : TT------C-----------AT-GG-------GG-AA-T-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CCT--G-GC--TA-G-TG-AAGATG
gi|131447 : TT------T-----------AT-GG----------AG-C-----------GGC--G--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-T-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131448 : TT------T-----------AT-GG-------CG-AG-C-----------GG---A--G-TCAGAGTGG-ACCGA-A-A----C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131449 : TT------T-----------AT-GG-------GG-A--C-----------GG---A--G-C------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT----GC--TA-G-CG-A
gi|131452 : T------T-----------AT-GT-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ATCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131453 : T------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GA---A--G-T------GG-ACCAA-A-AT---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGA
gi|131454 : ------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------AG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131455 : ------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TT-G-CG-AAGATG
gi|131456 : ------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT----GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131457 : ------T-----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GT--TA-G-CG-AAGA
gi|131459 : -----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCG--A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131460 : -----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCG--A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131461 : -----------AT-GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AAAACC-C-TTT--G-GC--TA-G-CGAAAGATG
gi|131462 : T-GG-------GT-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131463 : -GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CA-AAGAT
gi|131464 : -GG-------GG-AG-C-----------GG---A--G-C------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131465 : -GA-------GG-AG-C-----------AG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CA-AAGATG
gi|131466 : -GG-------GG-AG-C-----------GG---ACGG-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-GAAATG
gi|131472 : G-------GG-AG-C-----------GG---G--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131473 : G-------GG-AG-C-----------GG---A--G-C------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTTG-G-GCA-TA-G-CG-AAGATG
gi|131474 : G-------GG-AG-C-----------GG---G--G-T------GCCACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGAT
gi|131476 : -------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCTA-A-AC---C-C-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131477 : -------GG-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---T-C-TTT--G-GC--TA-G-CG-TAGATG
gi|131481 : G-AG-C-----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-T-CTT--G-GC--TA-G-CG-AAGATG
gi|131485 : -----------GG---A--G-T------GG-ACCGA-A-AA---C-C-CTT--G-GC--TT-G-CG-AAGATG