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Reference ( gi|78677 )        : TTAAGG--TT-G-----ATC---C---AC-C----C--T----CA-T----G----T-G-------A-T-GT---C-A-T----A------G--G--T-TT-T--T-------C---A--AA--AA-----T-CTT----T-A--T---T-T-------C---A--T-T----AA-A--C--TTT--G--C---A-C--A-T---G-A--T-A--GA--------A----A-T-ATA--T-----C-TT-----C---T---A-----A--A-GG-AA--TT-T-C-A-T-T--CA-C-T-G-G--A-T---------A----T--A------A-----C-----A--A--A-T---------A------A-T--TT---G------G----T-------A-A-A-C--T---T-----T--T-GA----T-A-G--TG--A-------A-A-------A-AA-------T-TAC----T--A-------T---TT--CT--C---A--T---A-T-AT-AATT--A------A----T---T---A-----A--T-T----A--T---A--------A--C------A-----AA--A----AT----ATAT-T---GT-C--A--AG---G----G-CA-A--T--A--A-CT-CC----T-A-----T---G--G---TG------G-C-A-----------A-T---T-C-CT---C--T--AC-C-T--T-A-G---G-T-G--TA-T-T-C---T--A-C--A---TT--G-----T--T-TTTCC----T----------A----------AT-A----------T----G-T-A-CA------T---T-AA------------AT-T--TG-A-----TA--TGC-A----T--A---T-T--T-----A-C-A-----AA-T-A-A-G-C-A----G-----TT--TT--T-T----T---A--------A--A--C---T-GC---T--A---A--C--AT-------T----T----A-A-----------A-A-TT-----T-G-T-C-A-TT--T-T--TA-----TTA---A-----T---TT-------T-A-----T------T-C-----A--A--T----T-C-T----G-T-T--C-----T------AC---G-A-----A--AA--T-T---A-T-T----C---AAA-AT---G-T--GC-G-A-T-T-T--T-C-TG-ATG--T-----A-A-----AC-C-T-AT--A-----T---------------T-T----C--TG--------------T------T---TT-TG-T---A---T----G---T-CT-G-----A-C-A--TC-T-T---AA------A-A-AA-----------G---G--TG-G-C--------A------A----TAT-A-C-A-C----A--T-T---T--CCT---G-T---C-A-T-AA-TT-GA-C---A--T---A-AT-T----T-A-A-CT-A---T-AA--A----TG--A-GT-AG-A---A-A-AAG-AAAGAAT
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gi|78695                      : TTAAGG--AT-------ATC---C---AC-C----C--TT---CA-T----G----T-GC------A-T-GT---C-A-TTT--A------G--G--T-TTGT--T-------C---A--AA--AA--------------------------AAAAAAAC---G--T-A----AA-A--C--TTT--G--C---A-CC-A-T---G-A--T-A--GA--------A----A-T-ATA--T-----C-TT-----C---A---A-----T--C-GG-AA--TT-T-T-A-T-T--CA-C-T-G-G--A-T---------A----T--G------A-----------A--A--A-T---------A------A-T--TT----------G----T-------A-A-A-C--T---T-----T--T-GA----T-A-G--TGAAA-------A-A-------A-AA-------C-TGC----T--A-------T---TT--CC--C---C--G---A-T-AG-GAT----------A----T---G---A-----T--T-T----A--T---A--------A--CGAA---A-----AA--A----AT-----TAT-T---GT-C--A--A----G----A-CA-A--A--A--A-CT--C----T-A-----T---A--G---TA------A-C-A-----------A-A---T--------------------------------T-G--TA-T-T-C---T--A-G--A---TT--G-----A--T-TTTTC----C----------A----------AT-A-------------------A-CA------T------A------------GT-T--TA-AAT---TA--TGC-A----C--A---T-T--A-----C-C-A-----AA-T-A-A-A-T-C----A-----TT--TT--T-C----T---A--------A--A--T---T--T---T--A---A--C--AT-------T----T----A-A-----------ATT-TT-----T-G-T-C-A-TT--T-T--TA-----GTT---A-----T---TT-------A-A-----TA-----T-A-----G--A--T----T-C-T----G-T-T--CT----T------AC---G-ATTTTT-------T-T---T-T-T----T---TAA-AT---G-T--GC-G-caa
gi|78698                      : TTAAAG--TA-G-----ATC---G---AT-C----C--T----CA-T----G----T-G-------A-T-GT---C-A-T----G------G--G--T-TT-T--A-------C---A--AA--AA-----T-CTT----T-A--T---C-A-------A---A--T-T----AA-A--C--TTT--A--C---G-C--A-T---A-A--T-G--AA--------A----A-T-ATA--T-----C-TT-----T---T---A-----A--A-GA-CA--TT-T-T-A-T-T--CA-C-T-G-G--A-T---------A--------------------------G--A--A-T---------A------A-----T---G------A----T-------A-C-A-C---------------------------G--TA--A-------A-A-------A-AAAAGCCTGT-TA-----G--A-------T---TT--TT--C---A--T---A-G-GT-A-----------------------------------------A--C---A--------A--T------A-----AA-------------ATGT-T---GT-C--A--AA---G----G-CA-A--T--A--A-CT-CC----T-G-----T---G--C---TG------G-G-A-----------T-T---T-C-CA---T--T--AC----------------T-G--TA-TAT-C---T--A-C--A---AT--GATACAT--G-TACCC----T----------A----------AT-ATCTTAT----T----C-T-A-CA------A---T-AA------------AT-T--T--------TT--TAC-A----T--ATTTT-T--T-----A-T-A-----AA-T-C-A-G---A----T-----TT--TT--T-T----T------------------------------------A--C--AT-------T-----------------------A-A-TT-----T-G-T-C-A-TT--T-T--AACAAGTTTA---AATCTTT---TT-------T-A-----T------T----------A--T----T-C-T----G-T-T--T-----A------AC---G---------------------------------AAA-AT---G-T--AT-G-A-T-A-T--T-C-TG-ATG--T--------------C-A-T-AT--A-----TA--------------C-T----C--T----------------------------------------------------T-G-----A-C-A--TA-T-T---TG------A-A-AA-----------T---G--CG-G-T--------A------A----AAT-A-C-A-C----A--T-T---TTATTT---G-T-------T-TA-TT-AA-T------T---A-AA-T----C-A-ATCT-A---T--A--C----TG--A-GT-GG-G---A-A-gggggagggggggggccgggtgggagagggggggggggattttctgcatgttaacctatacttctgtttttatgtctgacatcttttaaaaaaaggttggcaacataccacattttctttcataaatttaattaaattaaattattaaacttaaaaaaaaaa
gi|78700                      : TTAATG--TA-A-----ATT---G---AT-C----C--T----CA-T----G----T-G-------A-C-AT---C-A-T----A------G--G--T-TT-T--TG------C---A--AA--AA-----T-CTT----T-A--T-----------------A-------------------TT--G--C---G-C--A-T---G-A--T-A--GA--------AGT--A-T-ATG--T-----C-TTATAAAA---T---A-----A--A-GG-AA--TA-T-T-A-T-T--CA-T-T-G-G--A-T---------A----A--A------A-----T-----A--A--A-----------A------C-T--CT---G------G----T-------A-A-A-C--T---A-----T--T-AA----C-A-G--T-----------A-A-------A-AG-------T---C----T--G-------C---------------------------C-AATC--A------A----T---T---A-----T--T-T----A--T---AGT------A--CATTTGTA-----AA--A----AC----A----T---GC-C--A--AG---T----G-CA-A--T--A-----T-CT----T-A-----T---C--C---TG------T-T-A-----------T-T---T-C-CT---T--T--A---------------------------------T--A-C--A---AT--G-----A--G-TTCCC----T----------A----------AT-T----------T----C-C-A-AA------A---T-TA------------AT-C--TA-A------A--TAC-A----T--A---T-C--T-----A-T-A-----AA-T-T-A-G-C-A----G-----AT--TT--T-C----A---A--------A--A--C---T-GT---T--C---A--C--ATTAATTAAT----T----A-A-----------ACA-CT-----T-G-T-C-A-TT--T-T--AA-----CAAG--A-----T---CT-------T-A-----T------C-T-----A--C--T----T-T-T----A-T-C-------------------------------AA--TCT---A-T-T----TTAGAAA-AT---G-A--GT-T-A-T-T-T--T-C-TT-ATG--T-----T-G-----AC-C-C-AT--A-----C---------------T-T----C--CG--------------T------C---TT-CG-T---T---T----G---T-CT-A-----A-C-A--TCAT-A---AA------A-A-AA-----------G---A--TG-G-C--------A------A----AAT-A-C-A------A--T-G---T--CCT-----T---C-AGT-TG-TG-GG-T---T--A---A-AT-C----T-A-A-CT-A---T-TACCG----TG--A-G---G-A---A-A-
gi|78702                      : TTAAAG--TT-G-----ATC---CCCCAT-C----C--TAGTTCA-T----G----T-G-------A-TCGT---C-A-T----A------G--G--T-TT-A--T-------C---A--AA--AA-----A-TCT----T-A--T---T-T-------C---A--T-TT---AA-A--C--TTTT-G--C---C-CC-A-C---G-GATT-A--GATCAGGAATA----A-T-ATA--TATGGCT-TT-----C---TTA-A-----A--G-GG-AA--TT-T-C-A-T-T--CA-C-T-GCG--A-TGAA------A----T--A------A-----TTAAG-A--A--A-T---------A------A-A--TTATAG------A----T-------ATA-G-CGTT---TATAGAT--T-GG----T-A-G--TG--A-------A-A-------ATAA-------A-TAC----T--G-------T---TT--TC--C---AA-T---A-G-AT-AATTTAA------A----TGTTT---A-----A--C-T----C--T---AGA------A--T------A-----AA--A----AT----A-AT-TTA-GC-C--A--AGCGCG----A-CA-A--T--A--AACT-CCGTCAT-A-----G---G--G---TG------G-C-A-----------A-AA--T-C-CT---C--TTAAC-C-T--T-A-G---G---G--TA-T-TTC---A--A-CCAA---TT--G-----A--TATTTCT----T----------A----------TT-A----------T------T-A-TA------------AG------------AG-T--GT-A-----TAGATGCTA----TTTA---T-T--T-----A-C-A-----AAGT-A-A-G-C-A----G-----TT--TT--T-T----TCTAA--------A--A--C---T-GC---T--A---AG-CA-AT-------T----T----ATA-----------A-A-TT-----T-G-TCC-A-TT--T-
gi|78701                      : TTAAGG--TA-G-----ATC---G---AG-T----C--T-----------------T-G-------A-T----------------------------T-TT-T--G-------C---A--AA--AC-----T-CAT----T-AAAT---TAT-------C---AAAT-T----AG-A--C--TTT--G--C---A-C--A-T---G-A--T-A--GA--------A----A-T-ATG--T-----C-TT-----T---C---A-----A--A----AA--T------A-T-T--CA-C-T-G-C--A-TGGAATAATGA----T--A------A-----T-----AATA--A-T---------A------A-TAATT---G------G----T-------A-A-A-C--T---A-----T--T-GA----T-A-C--TG--A-------A-A-------A-AG-------T-TAA----T--A-------T---TT--TC--C---A--T---A------GATT--A---------------T---C-----G--T-T----A-------------------------G-----AA--A----AA----ATGT-T---GT-A--A--AG---G----G-CA-A--T--A--A-CT-CC----T-A-----A---T--A---TG------T-T-G-----------A-TTTAT-C-CT---T--T--AC-A-G--C-A-T---G-T-C--TA-T-T-A---T--A-C--A---AT--G-----T--T-TTCCC----T----------A----------AT-T----------T----C-C-A-AA------G---T--A------------AT-T-----------TA--TTC-A----T--A---T-T--T-----A-G-A-----AA-T-A-A-G-C-AC---G---------TC--T-T----A---A--------A--A--C---T-GT---T--C---A--T--AT-------CAAAAT----A-A-----------A-A-T----------T-C-A--T--T-T--TA-----ACA---AGGT--T---TT-------T-A-----T------A-T-----A--T--T----T-C-T----ATT-T--C-----T-----------G-A-----A--G-------------T----C---AAC-AT---A-C--AC-G------------------CG--T-----A----------C-T-------------------------------------TG--------------T------T---TT-T-------------------------------------TT-T-T---A-------A-A-AA-----------G---G--TG-G-C--------A------A----TAT-A-T-A-T----A--TAT---T--CTTTG-G-T---T-ATT-AA-TT-G-------------A-AT-T----G-A-A-CT-A---T--A--T----TG--A-GC-GG-A---A-A-gtgtagttat
gi|78688                      : TTAGGA--TT-------ATC---C---AC-C-------T----CA-T----G----T-G-------A-T-GT---T-A-T----A------G--G--T-TT-A--T-------A---A--AA--AA-----TACTT----T-A--T---T-T-------C---A--T-T----AACA--C--TTT--G--C---A-C--A-T---GCA--T----GA--------A----A-T-A-A--T-----C-TT-----C---C---------A--A-GG-AA--TT-T-C-A-T-T--CA-C-T-G-G--A-T---------A----T--C------A-----T-----A--G--A-T----------------A-T--TT---G------G----T---------A-A-C--T---T-----T--A-GA----C-AGG--TG--G-------A-A-------A-A
gi|78704                      : TTAAGG--TT-G-----ATC---G---AT-C----T--T----CA-T----G----T-G-------A-T-GT---C-A-T----A------G--G--C-TT-T--TG------C---A--AA--AAAAT--T-CTT----T----T---T-A-------C---A--T-T----AA-A--C--TTT--G--G---A-T--A-T---G-A--C-A--GA--------A----A-T-ATA--T-----C-TTAA---C-------A-----A--A-GT-AA--TT-T-T-A-T-T--CA-C-T-G-G--A-T---------A----T--A------A-----T-----A--A--A-C---------A------A-
gi|78705                      : TTAAGG--TA-G-----CCC---C---AC-C----C--T----CA-T----G----T-G-------A-T-GT---C-A-T----A------G--G--T-TT-T--T-------G---C--AA--AA-----T-CTT----T-A--T---T-T-------C---A--T-TA---AA-A--A--ATT--G--T---G-T--A-T---G-A--T-A--GA--------A----A-T-ACA--T-----C-TT-----G---T---G-----G--A-GT-AA--TT-T-C-A-T-T--CA----------A-T---------A----TG-A------A-----C--------A--A-T---------A------A-----------------------------A-A-A-A--T--------------------T-G-G--TT--A-------A-A-------G----------------------A-------T---TT--AT--G---A--T---A-T-CT-GAAT--A------A----T---C---T-----G--T-T----A-----------------------------------------T----ATCT-T---AT-C--A--AG---G----G-CA-A--T--A--A-CT-CC----A-A-----T---A--C---TG------G-C-A-----------T-T---T-C-CT---
gi|78703                      : TTAAGG--AG-G-----CTT---C---AT-C----C--T----CA-T----G----T-G-------A-T-GT---C-A-T----A------G--G--T-TT-T--T-------A---AGCAA--TA-----T-CTT----T-A--A---T-T-------G---A--T-T----AA-A--C--TTT--A--C---A-A--A-A---G-A--T-A--GA--------T----A-T-ATA--T-----C-TT-----T---A---A-----G--A-GG-AA--TT-T-T-A-T-T--CA-A-T-C-A--A-TACG------A----T--A------A-----T-----A--A--A-TCTGATGATAA------A-T--CT---G------G----TGATTCTAG-A-A-C--T---A-----TACT-GA----T-G-C--TG--G-------A-A-------A-AG-------C-TGA----T--A-------T---TTTCCA--C---A--T---A-C-AT-GATT--A------ATTCTT---T---A-----A--A-T----A--T---A--------A---------A-----GA--A----A-----ATGT-T---GT-C--A--AG---GGCATG-CA-A--T--A--A-CT-CC----T-A-----G---G--T---TA------G-T-A-----------T-T---T-T-TT---C--T--A----T--T-A------------TA------------A-A--A-------G-----A--T-TTCCC----T----------G----------AT-A----------T----C-A-ATCA------T---T-AGT-----------TT-T--TA-A-----TA--TG-------T--A---T-T--T-----G-T--------A-T-A-A----------------TT--CT--T-T----T---G--------A--
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gi|78707                      : TTAAGG--TA-T-----CTC---C---AT-C----T--T----AA-T----G----T-G-------A-C-AT---C-A-G----A------A--G--A-TT-T--T-------G---C--AA--AT-----T-CTT----T-A--T---T-T-------A---G--T-T----AA-A--C--TTG--G--T---G-C--A-T---G-A--T-A--GA--------A----A-T-ATA--T-----A-T----------T---A-----AGGA-GG-AT--TT-T-T-A-T-T--CA-G-T-G-A--A-T---------A----A--A------A-----T-----G--A--T-A---------A------A-T--TT---G------G----A-------A-A-A-C--TATAT-----A--T-AATTCTT-A-C--TG--A-------A-A-------A-CA-------T-TCA----T--A-------T---TT--C----------------T-AT-AAT-----------------------------------------------------------------------------------------T-T---GT-C--A--AG---G----G-CA-A--T--A--A-CT-CT----C-A-----T---A--C---TG------G-----------------T---G-T-GT---C--T--A-------------------G--TA---------C--A-C--A---AT--G-----A--T-TTCCC----G----------G----------AT-A----------T----C-C-A-CA------C---T-A-------------------TG-AAC---TA--TGC-A----T--A---T-T--T-----A-T-A----------A-A-G-C-A----G-----TT--T
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gi|78706                      : TTAAGG--TA-G-----CCC---C---AC-C----C--T----CA-T----G----T-G-------A-T-GT---C-A-T----A------A--G--T-TT-T--T-------G---C--AA--AA-----T-CTT----T-AT-T---T-T-------C---A--T-TA---AA-A--A--ATT--G--T---G-T--A-T---G-A--T-A--GA--------A----A-T-ACA--T-----C-TT-----G---T---G-----G--A-GT-AA--TT-T-C-A-T-T--CA----------A-T---------A----TG-A------A-----C--------A--A-T---------A------A-----------------------------A-A-A-A------------T--T-GG----T------T-----------A-A-------A-GA-------T-TAT----G--A-------T---AT--CT--G---A----------AT-AATC--T------G----T---T---A---------------------------------------------------------T----ATCT-T---AT-C--A--AG---G----G-C--A--T--A--A-CT-CC----A-A-----T---A--C---TG------G-C-A-----------T-T---T-C-CTTG-T--T--AC------T-A---------G--TA---T-C---C--A-CA-A---TT--A-----T--T-T-------------------------------C-A----------T----C-T-A-TA------T---T-CA------------A-----TG-A-----GC--AGC-A----A--A---T-T--T-----A-T------------------C-A---------------T--T-T----T---A--------A------------C---C--A---A--C--TT-------T----T----A-A----------------------T-G-T---A-TT--T-T--TG-----TC----A-----T---GC-------T-A-----T------T-T-----A--A--T----------------------------------------G-----A--AG--T-T---A-T-T-----------------------------T-T-T--TAT-TG-TTGA-T-----A-G-----AA-C-T-----------T---------------T-T--------G--------------C------T---TT-TG-T---A---T----G---T-CTGG-----A-C-A--TT-T-T---TA--------------------------------------------A------A----TAT------------A--T-T---T--TCT---A-T---G-A-C-TA-TT-AATC---AATT---A-AT-T----T-A----T-A---T-CA-----------A-GT-GG-A---A-A-ggatttaaaaatatgtgtgaacaacgttttaaaggcatattgtc
gi|78711                      : TTAAGG--TCAG-----CTCAATC---ATGC----C--T----CA-T----G----T-G-------A-T-GTC--C-G-T----A------G--G--T-AT-T--G-------C------AA--AA-----T-CTT----T-A--T---T-C-------A---A--T-C----AA-A--C--TTTCGG--T---A-C--A-T---G-AT-T-A--GA--------A----A-T-ATA--T-----C-TTG----T---T---AT----G--A-GA-AA--TT-T---A-T-T--CA-G-C-A-G--A-T---------T----A--A------A-----T-----A--A--A-A---------A------A-T--CT---G------AGCTCC-------A-C-A-T--T---A-----T--T-GA----T-A-C--TG----------A-A-------A-GT-------T-TA-----T--A-------T---TT--TC--C---A--T---A-G-AT---TT--A------A----
gi|78717                      : TTAAGG--TT-G-----ATC---C---GT-C----C--T----CA-T----G----G-G-------A-T-GC---C-A-T----A------C--G--T-TT-T--TTG-----C---A--AA--AT-----T-CTTG---C-A--T---T-A-------C---A--T-T----AA-A--C--TTT--G--C---A-C--aaaaatgttgaaacaacgttgtaaaggca
gi|78722                      :  TAAGG--AT-T-----ATC---C---CC-C----C--T----CA-T----G----T-G-------A-T-GT---C-A-T----A------G--G--T-TT-T--T-------C---A--AA--AA-----T-CTT----T-A--T---T-T-------C---A--T-T----AA-A--A--TGT--C--C---A-C--A-T---G-A--T-A--GA--------A----A-T-ATA--T-----C--T-----C---T---C-----A--A-GG-AA---T-T-C-A-T-T--CA-C-T-G-G--A-C---------A----T--A------A-----T-----A--A--A-T---------A------A-T--CT---G------G----T-------A-A-A-C--T---T-----T--T-GA----T-A-G--TG--A-------A-A-------A-A----------TGT----T--A-------T---TT--CC--C---A--T---A-G-AT-AATT---------A----T---T---A-----T--T-T----A--T---A--------A--CAAAAA-A-----AA--A----AT----AT-T-T---GT-C--A--AG---G----G-CA-A--T--A--A-CT--C----T-A-----T---G--G---TG------G-C-G-----------A-T---T-T-C----C--T--AC-C-T--T-A-G---G-T-G--TT-T-T-C---T--A-A--A---TT--G-----A--T-TTTCC----T----------AATACATAAT-AT-A----------T----G-C-A-CA------T---C-AA------------AT-C--C--A-----TG---GC-A----T--A---T-A--T-------C-A-----AA-T-A-A-G-C------G-----TT--TT--T-A----T---A--------A--A--C---T-GT---T---------C--AT-------T----A----A-A-----------A-A-AA-----T-T-T-C-A-TT--T-T---------------A-----T---TT-------T-A-----T------T-A-----A--A--T----T-C-T----G-T-T--C-----T------GT---A-A-----A--AA--A-T---A-T-T----C---AAA-AT---G-T--GC-G-A-T-T-T--T-C-TG-A
gi|78724                      :  TAAGG--TT-C-----ATC---C---CT-C----C--C----CA-T----A----TTGC------A-T-GTT--C-A-T----A------C--G--G-TT-T--T-------C---A--AACAGA-----T-CTT----T-A--T---T-T-------C---G--T-A----TA-A--C--TTT--G--C---A-C--A-T---GCA--T-A--GA--------A----A-T-ACAG-T-----C--------C---C---A-----A--A-GG-A---TT-T-C-A-TAT--CA-C-T-T-G--A-T---------AA---T--A------A-----------G--A--A-T---------AC-----A-T--TT---G------G----T-------A-A-A-C--C---T-----T--T-GAA---T-A-G--TG--A-------AGA-------A-AA-------T-TGC----T--A-------T---TTTCCC--C---A--TCGGA-T-AT-A-----------------T---T---A-----A--T-T----A--T---A--------A--CGAA---A-----AA--A----AT----ATAT-----GT-C--A--AG---G------CA-A--T--A--T-CT-CC----T-A-----T---G--G----G------C-C-A-----------T-T---T-C-CG---C--T--AC-C-T--T-A-G---G-T-G--C---------------------------------------------------------------------T-A----------T----GAC-A-CA------T---T-AA------------AT-T------------A--TGC-A----T--A---T-G--T-----A-C-A-----AA-T-A-G-GTC-A----G-----TT--TT--C-T--------A--------A--A--C---TCGC---T--A---A--CC-AA-------T----T----A-A-----------A-A-TT-----T-A-T-C-A-TT--T-----A-----TTA---------T---TT-------T-C-----T------T-C-----A--A--T----T-C-T----G-T-T--C-----T------A----A-A-----A--AA--T-T---A-T-T----C---AAA-AT---G-T--GC-A-A---T-T--T-C-TG-A-G--T-----A-A-----AC-C-T-AC--A-----C---------------T-T----C--TG---------------------T---TT-TG-TAA-A---T----G---TACT-A-----A-C-A--TC-TAA---AA------A-A-AA-----------G---G--TG-C-C--------A------A----CATGA-T-ACC----A--T-T---T--TCT---T-T---C-A-T-AA-TT-AA-C---G------A----T----C-A-A-C-----------------TG--A-GT-AG-A---A-A-AAG-AAAGCAT
gi|78723                      :  TAAGGATTT-A-----ATC---C---AC-C----CC-T----CA-T----G----T-G-------A-T-GT---C-A-T----A------G--G--T-TT-T--TT------C---A--AA--AA-----T-CTT----T-A--T---T-T-------TCA-A--T-T----AA-A--AAATGT--C--C---A-C--A-T---G-A--T-A--GA--------A----A-T-ATA--T-----C--T-----C---T---C-----A--A-GG-AA--AT-T-C-A-T-T--CA-C-TGG-G--A-C---------A----T--A------A-----T-----A--A--A-T---------A------A-T--CT---G------G----T-------A-A-A-CT-T---T-----T--T-GA----T-A-G--TG--A-------A-A-------A-AA-------A-TGT----T--A-------T---TT--CC--C---ATTT---A-G-AT-AATT--A------A----T---T---------A--T-T----A--T---A--------A--CAAAAA-A-----AA--A----AT----AT-T-T---GT-C--A--AG---G----G-CA-A--T--A--A-CT--C----T-A-----T---G--G---TG------G-C-G-----------A-T---T-T-CC---C--T--AC-C-T--T-A-G---G---G--TT-T-T-C---T--A-A--A---TT--G-----A--T-TTTCC----T----------AATACAATAATAT-A----------T----G-C-A-CA------T---C-AA------------AT-C--C--A-----TG---GC-A----T--A---TAT--A-----A-CAA-----AA-T-A-A-G-C-A----G-----TT--TT--T-A----T---A--------A--A--CT--T-GT---T---------C--AT-------TAAA-A----A-A-----------A-A-TT---------T-C-A-TT--T-T---------------A-----T---TT-------T-A-----T------T-A-----A--A--T----T-C-T----G-T-T--C-----T------GTA--A-A-----A--AA--A-T---A-T-T----C---AAACAT---G-T--GC-G-A-TAT-T--T-C-TG-A
gi|78725                      :  TAAGA--TA-G-----ATC---G---GT-T----T--T----CA-T----G----T-G-------A-T-GC---C-A-T----ACTATTAG--G--A-TT-T--TACTTTTAC---A--AAT-AA-----T-TTT----A-A--T---T-T-----------A--T-T----GA-A--C--TTT--A--A---A-C--A-T---G-A--T-A--GA--------A----A-C-AAT--T-----C-TT-----T---C---A-----A--A-GT-GA--TT-T-C-A-T-T--TA-C-T-G-A--A-T---------A----A--A------A-----T-----A--A--A-A---------A------C-T--CT---G------G----T-------A-T-C-C--T---A-----T--T-GG----T-A-G--TG--A-------A-A-------A-GG-------T---C----T--AAA-----T---TT--TC--C---A--T---A-T-AC-ATGC--A---------------T---A-----A--T-------------------------C------A-----AT--A----AT----AT---T---GT-C--A--AA---G----A-CA-G--T--A--A-CT-CA----T-G-----T---G--C---TG------G-T-A-----------A-T---T-C-CC---T--A--AC-C-G--T-A-T---G-T-G--TA-T-T-C---T--A-C--A---TT--G-----A--T-TTCCC----T----------A----------AT-A----------T----G-A-A-CA------T---T-TA------------AT-T--T---------A--TAC-A----T--A---T-T--T-----A-T-G-----TA-T-T-A-C-C-A----G-----TT--TT--T-C----A---A--------A--A--G---T-GT---T--G---A--T--AT-------T----T----A-A-----------A-A-TT-----T-G-T-T-A-TA--T-T--TA-----ATC---A-----T---TT-------T-------T------T-C-----AT-A--T----T-C-A----G-T-T--T-----T------AT---G-A-----A--AA--T---------------------------G-T--TC-G-A-T-T-T--T-C-TG-ATG--T-----T-G-----GC-C-T-AT--A-----C---------------T-T----T--TG--------------T------T---TC-TG-T---A---T----A---T-AT-A-----A-C-A--TC-T-T---TA------A-A-AA-----------G---A--TG-T-C--------A------A----CAT-A-C-A-C----A--T-T---T--TCT---T-T---T-G-T-TT-TT-GG-T------T---AGAT-T----A-A-A-CT-A---T-AA--A----TG--A-GT--G-A---A-A-A
gi|78726                      :  TAAGG--TA-G-----CTC---T---GT-A----T--T----CA-T----G----T-G-------A-T-GT---C-A-A----A------G--G--T-TT-T--T-------G---A--TA--AA-----T-TTT----T-A--T---T-T-------C---A--T-T----AA-A--A---TT--G--T---G-C--A-T---G-A--C-A--AA--------A----A-T-ATA----------TT-----T---T---G-----G--A-GG-AA--TT-T-T-G-T-T--CA-C-C-G-A--G-T---------A----T--A------A-----T-----A--ATGA-----------A------A-G--TT---G------G----T-------A-A-A-G--TG--T-----T--T-GA----T-A----------------------------------------------T--A-------T---TT----------A--T---A-T--C-AATT--G------A---------------------------------------------------------------------------ATGC-T---GT-C--A--AG---G----G-CA-A--T--A--A-CT-CC----T-A-----T---G--G---TA------A-T-------------A-T---T-T-CT---C--T--Atattaaaataaga
gi|78729                      :   AAGG--AT-T-----ATC---C---AC-C----C--T----CA-T----G----T-A-------A-T-GT---C-A-T----A------G--G--T-TT-T--T-------C---A--AT--AA-----T-CTT----T-A--T---T-T-------C---A--T-T----AA-A--C--TTT--G--C---A-C--A-T---G-A--T-A--GG--------A----A-T-ATA--T-----C-TT-----A---T---A-----A--A-GG-AA--TT-T-C-C-T-T--CA-C-T-G-G--A-T---------A----T--A------A-----T-----A--A--A-T---------A------A-T--CT---G------A----T-------A-A-A-C--T---T-----T--T-TA----T-T-G--TG--A-------A-T-------T-TT-------T-TTT----T--A-------T---TT--TC--T---A--T---A-G-AT-AATT--A------A----T---A---A-----T--T-T----A--T---G--------A--CG-----A-----AA--A----AA----ATAT-T---GT-C--A--AG---A----G-CA-A--T--A--A-CT-CC----T-A-----T---G--G---TG------G-C-A-----------A-T---T-C-CT---C--T--AC-C-T--A-A-G---G-T-G--TA-T-T-C---T--A-C--A---TT--G-----A--T-TATTC----T----------A----------AT-A----------T----G-C-A-CA------T------A------------AT-T--T---------A--TGC-A----T--A---C-T--T-----A-C-A-----AA-T-A-A-G-C-A----G-----TT--TT--T-C----T---A--------A--A--C---T-GT---C--A---A--C--AT-------T----T----A-A-----------A-A-TT-----T-G-T-C-A-TT--T-T--TA-----TTT---A-----T---TT-------T-A-----T------T-A-----A--A--T----T-C-T----G-T-T--C-----T------AC---G-A-----A--AA--T-T---A-T-T----C---AAA-AT---G-T--GC-G-A-T-T-T--T-A-TT-ATG--T-----T-A-----AC-C-T-AT--A-----C---------------T-T----C--TG--------------T------T---TT-TG-T---A---T----G---T-CT-G-----A-C-A--TC-T-T---AA------A-A-AA-----------G---G--TG-G-A--------A------A----CAT-A-C-A-C----A--T-T---T--TCT---T-T---C-G-T-AA-TC-AA-T------T---A-AT-T----G-A-A-CA-A---T-
gi|78730                      :   AAGG--AT-C-----ATC---T---CC-C----C--T----CA-T----G----T-A-------A-T-GT---C---T----A------G--G--T-TT-T--T-------C---A--AA--AAA----TACTT----T-A--T---T-T-------C---A--T-T----AA-A--AA-TGT--T--C---AGC--A-T---G-A--T-A--GA--------A----A-T-ATA--T-----C-TT-----C---T---C-----A--A-GG-AA---T-T-A-A-T-T--CA-C-TGG-G--A-T---------A----TGAG------A-----T-----A--G--A-T---------A------A-TGATT---G------G----T---------A-A-C--T---T-----T--TGGA----TAA-G--TG--A-------A-A-------A-AA----------AT----T--G-------TA--TT--CC--C---A--T---A-G-AA-AATT---------A----T---T---------A--T-T----A--A---A--------C--C------A-----AA--A----AA----ATAT-T---GC-C--A--A----G----G-C--A--T--A--A-CT-CC----T-A-----T---G--G---TG------G-C-G-----------A-T---TCC-CT---C--T--AC-C-T--T-A-G---G-T-G--TT-T-T-CTAAT--A-C--A---TT--GA----T--T-ATTCC----TA---------A----------AT-A----------T----G-C-A-CA------T---A-AA------------AT-------------TA--TGC-AT---T--A---T-T--T-----A---A-----AA-T-A-A-G-C-A----G-----TT-------------------------------------------C--A---T--C--AT-------T----TA---A-A-----------A-A-AT-----T-G-T-C-A--T--T-T--TA-----TTT---A-----T---TT-------T-A-----T------T-TATTCAA--A--T----T-G-T----G-T-T--C-----T-----------G-G-----G--AA--T-T---A-T-T----C---AAA-ATG--G-T--GC-G---T-T-T--T-C-T
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Reference ( family-219 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTAAGG--TT-G-----ATC---C---AC-C----C--T----CA-T----G----T-G-------A-T-GT---C-A----T--A------G--G--T-TT-T--T-------C---A--AA--AA-------T-C-TT----TA--T---T-TC---A--T-T----AA-A--C--T-TT--G--C---A-C--A-T---G-A--T-A--GA--------A----A-T-ATA--T-----C-TT---C---T---A-----A--A-----GG-AA--TT-T-C-A-T-T--CA-C-T-G-----------GA-T---A-T--A------AT-----A---AAT---------A------A-T------C-T---G------G----T-------A-A-A-C--T---T-----T--T-GA----T-A-G--T--G-A-------A-A-------A-AA----T-TGC------T--A-----T----TT--C----C--C---A--T-A--G----A-TA-A-T---T---A--A----TT---A-----A-TT--A-TA--------AC----G------A--AA--A-A---A----T------A-T-T---G-T-C--A--A---G---G----G-C--A-A--T--A--A-CT-CC----T-A-----T---G--G---TG------G-C-A-----------A-T---T-C-CT---C--T--AC-C-T--T-A-G---G-T-G--TA-T-TC---T--A-C--A--T---T-GA---T-----T-TT--CC----T----A----------AT-A----------T-G--C-------A----CA--T-T---AA------------ATT--TG-A-----T--A--TGC-A----TA---T-T--T-----A-C--------------A-----AA-T-A-A-G-C-A----G-----T-T--TTT----CT---A--A--A-C---T-------G---TTAA--C--AT----T-------T----A-A-----------A-A-TT-----T-G-T-----C-A---T-----------TT--T----------TA----T----TTA------T---TT---T-A-----T------T-C-----A--A--T----T-C--T----GT-T--C-T------AC---G-AA--AA-----T-T---A-T-T----CAAA-A-----T---G-T--GC-G-A-T-T-T--TC-TG-AT-G-T-T--AA--C---C------T----A------T--A---------------C-----T-T----C---TG--------------T------T---TT-TG-T---A---T----G---T-CT-G-----A-C-A--TC-T-T---AA------A-A-AA----------G---G--TG-G-C------AA--C------AT-A-C-A-CA-TTTTCT-TT---C-GTAA--T------T-A------A-T-TA---GA---T-TAAACT-A-T-AA--A----T-G--A-GT-AG-A--A-A-AAG-AAAGAAT
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Reference ( family-219 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                TTAAGG--TT-G-----ATC---C---AC-C----C--T----CA-T----G----T-G-------A-T-GT---C-A----T--A------G--G--T-TT-T--T-------C---A--AA--AA-------T-C-TT----TA--T---T-TC---A--T-T----AA-A--C--T-TT--G--C---A-C--A-T---G-A--T-A--GA--------A----A-T-ATA--T-----C-TT---C---T---A-----A--A-----GG-AA--TT-T-C-A-T-T--CA-C-T-G-----------GA-T---A-T--A------AT-----A---AAT---------A------A-T------C-T---G------G----T-------A-A-A-C--T---T-----T--T-GA----T-A-G--T--G-A-------A-A-------A-AA----T-TGC------T--A-----T----TT--C----C--C---A--T--A-G----A-TA-A-T---T---A--A----TT---A-----A-TT--A-TA--------AC----G------A--AA--A-A---A----T------A-T-T---G-T-C--A--A---G---G----G-C--A-A--T--A--A-C-TCC----T-A-----T---G-G---TG------G-C-A-----------A-T---T-C-CT---C--T--AC-C-T--T-A-G---G-T-G--TA-T-TC---T--A-C--A--T---T-GA---T-----T----TT--CC----T----------A----------A------------------T-A----------T-G--C-------A----CA--T-T----A--AA--T-T---T----A--T-G------C---A-----T--A---T-T--T-----A-C-A-----AA-T----------------A-A-G-C-A----G-----T-T--T-----TT----C-T---A--A--AC---T-------G--T---TAA--C--AT----T-------T----A-A-----------A-A-TT-----T-G-T-----C-A---T-----------TT--T----------TA----T----TTA------T---TT---T-A-----T------T-C-----A--A--T----T-C--T----GT-T--C-T------AC---G-AA--AA-----T-T---A-T-T----CAAA-A-----T---G-T--GC-G-A-T-T-T--TC-TG-AT-G-T-T--AA--C---C------T----A------T--A---------------C-----T-T----C---TG--------------T------T---TT-TG-T---A---T----G---T-CT-G-----A-C-A--TC-T-T---AA------A-A-AA----------G---G--T-G-G-C------AA--C------AT-A-C-A-CA-TTTTCT----TT---C-GTAA--T------T-A------A-T-TA---GA---T-TAAACT-A-T-AA--A----T-G--A-GT-AG--A--A-A-AAG-AAAGAAT
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gi|78817                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ---TG--------------T------TACCTT-TG-C---T---T----A---T-TT-G-------T-A--TC-T-T---TA------A-A-AA----------G---A--T-G-G-C------AA--C------AT-A-C-A-CA-TTTTC-----TT---C-ATAA--T------T-AT-----A-T-TA---GA---T-TAAACT-A-T-AA--A----T-G--A-GT--T--A--A-A-ATA-AAAGAA
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