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Reference ( gi|38260 )        :                                                                           TATTTAA-GC-A--A----T---A----T-T-A--T-G--A-T---T-T---A-----T-T--G--A-A-A--G-A---T--G-T--A--G---T-C--T---C--A--------T-A----A---C--T--G---C-A--A--C------G--G---T---G---T--G--T---G-C--A----T--------A--C------------A--A--A-------T---T------G--A---A-T---A-A---C-G------C-G-------C--G----T-T----A-----G---C-G---------C----------G---T-T-A----T--A----AA----A-------------A--A----T---T--------------T-G-T----T-----T-G-C-A--C--A---C----A---C----------C---G------T--T---G----C--A-G----T---A-T-G----A--G-A---C--T--A-C-A---T-C--T-T--T---C--A-A-------T-A-A---A-------T---C-A--T-A-A--T-T---T--A-T----T--G--C---T------------T---------A----T--A-TT-T----A---C----A----T-----T-C--TT-A--G------A---A----A--A--T-G--C----A--T--TTG---T--T-----T--G-T---G-------C--T---T-T--T-A--T-T---A---T-A-----T-A---T-G-T-T---TT-A-----A----A-C-------T--T---T-CC---G---C-T-C--AA---T-CC-T-T-T---G--GG----G-A-----A------GT-A-----GC----G--G--T---T-C----A--T-GG--A-A-C---A-G--C----C-A-T--T---A-------G---G-T-A--A---------------G--T--A--A--T-----TA---------TT--AC----G---T-----C---A-C-----A-A--T-G-A---A-A-T--G-T---A-C-A---C-----C--A-AA--T----A--A----G----A--T-A---C-----A---GC-------AA----T-G--T--G---A-CA---T-T-----T----A---C--G-C---AC------T---C-A--T---G-A-T-G---T-C-------A----T-A---TC-G-T------G--------C-A--C---G--------------A-C---AA--AA-A---G-G--A-G-T-G-C--A---AA---T---------T----A-A--AA---AA-A-A-----A-A-------T------T-A----A-T--A-C-CCC------A-A-----G-----T-A-------T------TT-A-A--T-A--A----------TT--TT-T-T--------C-TT------G----AA-A-------AT--A----A-A---A--CA-------------TC--A-A-A---TT-GT--C-------A--A-C-A---G--T--TTT---A---T---A-----C-A--T-TTT-C---A-------A--C----------T---AAA-A-CA---GT-T---C-A--T-A--T--A----T-T-----TT--A-C---A-T-A---T-T---T------T---A-A--A-A--C-C--C------TGT--A----A-G-T---A----G--TT---C-T----T-G---T--A-TTC-A---T-------AC------C-C-----C----A--A--ACCA------A-AC-TT-T--G-G-T-G-----A---T----T-----C--G-G----T----C-T--TT-GC-A-G-T--TA-T-A---AG-C-A---C-A-TAT-CA--T-C--A--A-ATAGATT
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gi|38350                      :                                                                           tATATAA-GC-A--A----TTAAA----A-T-A--T-G--A-G---T-T---A-----TCT--G--A-A-A--G-A---T--G-T--AA-G---T-C--T---C--A--------T-A----AAA-C--T--G---C-A--A--C------G--G---T---GGGGT--G--T---G-C--A----A--------A--C------------A--A--T-------T---T------T--C---A-TG--A-A---C-G------C-G----------A----C-T----A-----A---C-G---------C----------GCGGT-T-A----T--T----CA----A---------------------T---T--------------T-G-T----A-----T-G-C-A--C--A---C----A---C----------C---G------T--T---G----C--A-G----T------------------------T--A------------T-T--TAAGC--A-A-------TGA-A---A-------T---T-A--T-G-A--T-T---T--A-T----T--G--C---ttacaattcttagaaatgcatttgtttgtgctttattgtatatgttttaaactttccgctcaatccatttggggaagtagcggttctcatgggaagcca
gi|38276                      :                                                                            ATATAA-GC-A--A----T---AAA--T-T-A--T-G--A-T---T-T---A-----T-T--G--A-A-A--G-A---T--G-T--A--G---T-C--T---C--A--------T-A----A---C--T--G---C-A--A--C------G--G---T---G---T--G--T---G-C--A----A--------A--CT-----------A--A--A-------T---T------T--C---A-T---A-A---C-G------C-G-------C---------T----AAC---G---C-G---------C----------G---T-T-A----T--------T----C-------------A--A----T---T--------------T-G-T----A-----T-G-C-A--C--A---C----A---C----------C---G------T--T---G----C--A-GT---T---A-T-G----A--G-A---CTAT--A-C-A---T-C--T-T--T---C--A-A-------T-A-A---A-------T---C-A--T-A-A--T-T---C--A-T----T--G--C---T------------T---------A----A--A-Tttacattcttagaaaatgcattgttttgtgcttttattgtatatgttttaaacttttccgctcaatcctctttgggaagtgcggttcatggaacatccattaggtaagttcaatgttacgtcacaataatttaatttacttgttacaagcaatttga
gi|38289                      :                                                                           tATATAA-GC-A--A----T---AAA--T-T-A--T-G--A-T---T-T---A-----T-T--G--A-A-A--G-A---T--G-T--A--G---T-C--T---C--A--------T-A--------C--T--G---C-A--A--C------G--G---T---G---T--G--T---G-C--A----A--------A--C------------A--A--ATT-----T---T------T--T---A-T---A-A---C-G------C-G-------C---------T----AAC---G---C-G---------C----------G---T-T-A----T--------T----C-------------A--A----T---T--------------T-G-T----A-----T-G-C-A--C--A---C----A---C----------C---G------T--T---G----C--A-GT---T---A-T-G----A--G-A---C--T--A-C-A---T-C--T-T--T---C--A-A-------T-A-A---A-------T---C-A--T-A-A--------T--A-T----T--G--C---T------------TAA-------A----T--A-TT-T----A---ttacattcttagaaattttttttttttgcttttttttgtatatgttttaaactttccgctc
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gi|38314                      :                                                                            ATTTAA-GC-A--A----TGA-A----T-T-A--T-G--A-T---T-T---A-----T-T--G--A-A-A--G-A---T--G-T--ATAG---T-C--T---C--A--------T-A----A---C--T--G---C-A--A--C------G--G---T---G---T--G--T---G-C--A----T--------A--C------------A--A--A-------T---T------G--A---A-T---A-A---C-G------C-G-------C--G----T-T----A-----G---C-G---------C----------G---T-T-A----T--G----AA----A---------------------T---T--------------TAG-T----T-----T-G-C-A--C--A---C----A---C----------C---G------T--T---G----C--A-G----TT--A-T-G----A--G-A---C--T--A-C-A---T-C--T-T--T---C--A-A-------T-A-A---A-------T---C-A--T-A-A--T-T---T--A-T----T--G--C---T------------T---------A----T--A-T
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gi|38297                      :                                                                            ATTTAA-GC-A--A----TGA-A----T-T-A--T-A--------T-T---A-----T-T--G--A-A-A--G-A---T--G-T--A--G---T-C--T---C--A--------T-A----A---C--T--G---C-A--A--C------G--T---T---G---T-----T---G-C--A-------------A--C------------A--A--A-------T---T------G--A---A-T---A-A---C-G------C-G-------C--G----T-T----A-----G---C-G------------------------T-T-A----T--G----AA----A-------------A-------T---T--------------T-G-T----T-----T-G-C-A--C--A---C----A---C----------C----------T--T---G----C--A-G----TT--A-T-G----A--G-A---C--T--A-C-A---T-C--T-T--T---C--A-A-------T-A-A---A-------T---C-A--T-A-A--T-T---T--A-T----T--G--C---T------------T---------A----T--A-T
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gi|38318                      :                                                                            ATTTAA-GC-A--A----TGA-A----T-T-AAAT-G--A-T---T-T---A-----T-T--GGGA-A-AC-G-A---T--G-T--A--G---T-C--T---C--AG-------T-A----A---C--T--G---C-A--A--C------G--G---TC--G---T--G--TT--G-C--A----T--------A--C------------A--A--A-------T---T------G--A---A-T---A-----C-G------C-G-------C--G----T-T----A-----G---CTG---------C----------G---T-T------T--AT---GA----A-------------A--A----T---T--------------T-G-T----T-----T---C-AAAC--AG--C----A---C----------C---G------T--T---G----C--CTG----T---A-T-AT---AT-G-A---C--T--A-C-A---T-C--T-T--TT--C--A-AG------T-A-A---A-------T---C-A--T-A-AA-TAT---G--A-T----T--G--C---T------------T---------A----T--A-TT-T----A---C----A----T-----T-C--TTAA--G------A---A----A--A--T-G--C----A--T--TTG---T--T-----T--G-TG--G-------C--TC--T-T--T-A--T-T---G---T-A-----TAA---T-G-T-T---TT-A-----A----
gi|38318                      :                                                                            ATATAA-GC-A--A----TCATA----T-TTA--T-G--A-T---T-T---AC----T-T--G--A-A-AA-G-A---T--G-T--A--G---T-C--A---T--A--------T-AT---A---CA-G--G---C-A--A--C------G--G---T---GC--T--G--TTT-G-A--A-------------A--C------------A--A--A-------T---T------TT-C---A-T---A-A-----A------C-G-------CA-G----C-T----A-----A---C-G---------C----------G---CGT-A----T--T----CA----A---------------------T---T--------------T-G-T----A-----T-G-C-AA-C--A---CG---A---C----------C---G------T--T---G----C--A-G----TT--ACT-G----A--G-A---C--T--A-C-A---T-CG-T-T--TCC-C--A-A-------T-A-A---A-------T---C-ATTT-A-A--T-T---C--A-T----T--G--C---T------------T---------A----A--A-T
gi|38293                      :                                                                            ATATAA-GC-A--A----TGA-A----T-T-A--T-G--A-T---T-T---A-----T-T--G--A-A-G--A-G---T----T--A--G---T-C--T---C--A--------T-A----A---C--T--G---C-A--A--C------G------T---G---T--G--T---G-C--A----A--------A--C------------A--A--A-------T---T------TT-C---A-T---A-A---C-G------C-G-------C---------T----A-----A---C-G---------C----------G---CGT-A----T--T----CA----A-------------------------T--------------T-G-T----TGTA--T-G-C-A--C--A---C----A---C----------C---G------T--T---G----C--A-G----TT--A-T-G----G--A-G---T--T--A-C-A---T-C--T-T--T---C--A-A-------T-A-A---A-------T---C-A--T-A-A--T-T---TC-A-T----T--G--C---T------------T---------A----A--A----T----A---A----A----C-----T-CAATT-A---------A---G----A--A--TGG--CTAAGA--T--TAG---T--T-----T--G-G---G-------G--TTTGT-T--T-A----T---A---T-A-----T-A---T-G-C-T---TT-ttacattcttaagaaaatgcatttgtttgtggctctttattgtataatgttttaa
gi|38348                      :                                                                            ATTAAA-GT-G-------T---A----T-T-A--T-G--A-T---T-T---A-----T-T--G--A-A-A--G-A---T--G-T--A--G---T-C--T---C--A--------TCA----A---C--T--G---C-A--A--C------G--G---T---G---T--G--T---G-C--A----T--------A--C------------A--A--A-------T---T------G--A---T-A---A-A---C-G------C-G-------C--G----T-T----AC----G---C-G---------C----------G---T-T-A----T--G----AA----A-------------A-------T---T--------------T-G-T----T-----T-G-C-A--C--A---C----A---C----------C---G------T--T---G----C--A------T---A-T-G----A--G-A---C--T--A-C-A---T-C----T--T---C--A-A-------T-A-A---AC------T---C-A--T-A-A--T-T---T--A-T----T--G--C---T------------
gi|38312                      :                                                                            ATTTAA-GC-A--A----TGAAA----T-T-A--T-G--A-T---T-T---A-----T-T--G--C-A-A--G-A---T--G-T--A--G---T-C--T---C--A--------T-A----A---C--T--G---C-A--A--C------G--GT--T---G---T--G--T---G-C--A----A--------A--C------------AT-A--A-------T---T------G--A---A-T---A-A---C-G------C-G-------C--G----T-T----A-----GC--C-GC--------C----------G---T-T-A----T-------GA----A-------------A--A----T---T--------------T-G-T----T-----T-G-C-A--C--A---C----A---C----------C---G------T--T---G----C--ATGT---T---A-T-G----A--G-A---C--CTAA-C-A---T-C--T-T--C---C--A-A-------T-A-A---A-------T-----A--T-A-A--T-T---T--A-T----T--G--C---T------------T---------A----T--A-Tgtacat
gi|38312                      :                                                                            ATATAA-GC-A--A----T---AAA--T-T-A--T----A-T---T-T---A-----T-T--G--G-A-A--G-A---T--G-TTAG--G---T-C--T---C--A--------T-A----A---CA-T--G---C-A--A--C------G--G---T---G---T--G--T---G-C--A----A--------A--C------------A--A--A-------T---T------TT-C---A-T---A-A---C-G--------G-------C--GG---C-T----AAC---G---C-G---------C----------G---T-T-A----T--T----CA----A---------------------T---TA-------------T-G-T----T-----T-G-C-A--C--A---C----AA--C----------C---G------T--T---G----C--A-G----TT--A-T-G----A--G-A---C--T--A-C-A---T-C--T-T--G---C--A-A-------T-A-A---A-------T---C-A--T-A-A--T-T---TC-A-T----T--G--C---T------------T---------A----A--A-T
gi|38292                      :                                                                            ATATAA-GC-A--A----T---AA---T-T-A--T-G--A-T---T-T---A-----T-TTTG--A-A----G-A---T--G-T--A--G---T-C--T---C--A--------T-A----A---C--T--G---C-A--A--C------G--G---T---G---T--G--T---G-C--A----A--------AA-C------------A--A--A-------T---T---------------TTCAA-A---T-G------C-G-------C--G----T-T----A------------------------------------T-T-C--------------------------------A--A----T---T--------------T-G-T----A-----T-G-C-A--C--A---CC---A---C----------C---G------T--T---G----C--A-G----TT--A-T-G----A--G-A---C--T--A-C-A---T-C--T-T--T---C--A-A-------T-A-A---A-------T---C-A--T-A-A--T-T---C--A-T----T--G--C---T------------T---------AAG--T--A-TT-T----
gi|38282                      :                                                                            ATATAA-GT-A--A----TGA-A----T-T-A--T-A--A-T---T-T---T-----T-T--G--A-A-A--G-T---T--G-T--A--G---T-T--T---C--A--------T-A----T---C--T--G---C-A--A--C------G--G---T---G---A--T--T---G-C--A-------------AGCC------------A--A--T-------T---T------T--C---A-T---A-A---C-A------C-A-------C---------T----A-----G---T-G---------CGA--------G---T-T-A----T--A----TA----C-------------A--A----T---T--------------T-G-C----A-----T-G-C-A--C--A---C----C---T----------T---G------T--T---A----C--A-G----TA--A-T-G----A--G-A---C--A--G-C-A---T-C--T-T--TTA-C--A-A---------A-A---A-------A---A-A--T---A--T-T---C--T-T----T--G--C---T------------T---------A----T--A-T
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gi|38298                      :                                                                            ATATAA-GC-G--A----T---AA---T-T-A--T-G--A-T---T-T---A-----T-T--G--A-A-A--G-A---T--A-T--AG-G---T-C--T---C--A--------T-A----A---C-----G---C-A--A--CG-----G--G---T---G---T--G--T---G-CA-A----A--------A--C------------A--A--A-------T---T------T------T-T---A-A---C-G------C-G-------C---------T----A-----C---C-GCAT------C----------G---T-T-A----T--------T----C-------------A--A----T---T--------------T-G-T----T-----TAG-C-A--C--A---C--------C----------C---G------T--T---G----C--A-GT---T---A-T-G----A--G-A------T--A-C-A---T-C--T-T--T---C--A-A-------T-A-A---A-------T---C-A--T-A-A--T-T---C--A-T----T--G--C---T------------T---------A----A--A-T
gi|38296                      :                                                                            ATATAA-TC-A--A----T---A----AAT-A--T-G--A-T---T-----A-----T-T--G--A-A----G-A---T--G-T--A--G---T-C--T---C--A--------T-A----AA--C--T--G---C-A--A--C------A--G---T---G---T--G--T---G-C--A-------------A--C------------A--A--A-------T---T------TTTC---A-T---A-A-----A------C-G-------C--G----C-T----A-----A---C-G---------C----------GC--T-T-A----T--T----CA----A---------------------T---T--------------T-G-T----A-----T-G-C-A--C--A---C----A---C----------C---G------T------G----C--A-G----T---A-T-G----A--G-A---C--T--A-C-A-----C--T-T--T---C--A-A-------T---A---A-------T---C-A--T-A-A--T-T---C--A-T----T--G--C---T------------T---------AAT--T--A-TC-T----A---G----A----T-----aattgtcaagtagaatataattttttcttcattcattggaattctaaa
gi|38307                      :                                                                            ATTTAA-TC-A--A----TGA-A----T-C-A--T-C--A-T---T-T---A-----C-T--G--A-A-A--G-A---T--G-T--A--G---T-C--T---C--A--------T-A----A---C--T--G---C-A--A--C------G--A---T---G---T--G--T---G-C--A----T--------A--C------------A--A--A-------T---T------G--A---A-T---A-T---T-A-------------------A----T-T----A-----G---C-G---------C----------G---G-T-A----T-------GA----A-------------A--A----T---T--------------T-G-T----T-----T-G-C-A--C--A---C----A---C----------C---G------T--T---G----C--A-GT---T---A-T-A----A--G-A---C--T--A-C-A---T-C--T-T--T---C--A-G-------T-A-A---A-------T---G-A--C-A-A--T-T---C--A-T----T--G--C---T------------T---------A----T--A-T
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gi|38317                      :                                                                           tATATAA-GC-A--A----T---AAA--T-T-A--T-G--A-T---T-T---A-----T-T--G--A-A----G-A---T--G-T--A--G---T-C--T---C--A----------A----A---C--G--G---C-A-----C------G--G---T---G---T--A--T---G-C--A----A--------A--C------------A--A--A-------T---TTT----G--C---A-T---A-----C-G------C-G-------C-------T-T----AAACC-G---C-G---------C----------G---T-T-A----T--T----CA----G-------------A-------T---T--------------T-G-A----TA----T-G-C-A--C--A---C----A---C----------CC--G------T--T---GG---C--A-G----TT--A-T-G----A--G-A---CA-T--A-C-A---T-C--T-T--T---C--A-AA------T-A-A---A-------T---C-A--T-A-A--T-T---C--ATT----T--G--C---T------------T---------A----
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gi|38319                      :                                                                            ATTTAA-GT-A--A----TGA-A----T-T-A--T-G--A-A---T-T---A-----T-T--G--A-A-A--G-A---T--G-T--A--G---T-C--T---C--A--------T-A----A---C--T--G---C-A--A--C------G--G---T---G---T--G--T---G-C--A----T--------A--C------------A--A--A-------T---T------G--A---A-T---A-A---T-G------C-G-------C--G----T-T----A-----G---C-G---------C----------G---T-T------T--T----GA----A-------------A--T----T---T--------------T-T-T----T-----T-G-C-A--G--A---C----A---C----------C---G------T--T---G----C--A-GT---T---A-T-G----A--G-A---C--T--A-T-A---T-A--T-T--T---C--
gi|38341                      :                                                                            ATTTAA-GC-A--A----TGA-A----T-T----T-G--A-T---T-T---A-----T-T--GG-A-A-A--G-A---T--G-T--A--G---T-C--T---C--A--------T-A----A---C--T--G---CGA--A--C------G--G---T---G---T--G--T---G-C--A----T--------A--C------------A--A--A-------T---T------G--A---A-T---A-A-----A------C------------------------------G---C-G---------C----------G---T-T-A----T--G----AA----A-------------A-----------T--------------T-G-T----T-----T-G-C----C--A---C----A---C----------C---G------T--T---G----C--G-GT---T---A-T-G----A--G-A---C--T--A-C-AT--T-C--T-T--T---C--A-A-------A-A-A---A-------C---C-A--T-A-ATTT-T---T--A-T----T--G--C---T------------T---------A----
gi|38313                      :                                                                            ATATAA-GC-A--A----TTAAA----A-T-A--T-G--A-G---T-T---A-----TCT--G--A-A-A--G-A---T--G-T--AA-G---T-C--T---C--A--------T-A----AAA-C--T--G---C-A--A--C------G--G---T---GGGGT--G--T---G-C--A----A--------A--C------------A--A--T-------T---T------T--C---A-TG--A-A---C-G------C-G----------A----C-T----A-----A---C-G---------C----------GCGGT-T-A----T--T----CA----A---------------------T---T--------------T-G-T----A-----T-G-C-A--C--A---C----A---C----------C---G------T--T---G----C--A-G----T------------------------T--A------------T-T--TAAGC--A-A-------TGA-A---A-------T---T-A--T-G-A--T-T---T--A-T----T--G--C---
gi|38305                      :                                                                            ATATAA-GC-AC-A----T---AAA--T-T-A--C-T--A-CCTCT-T---A-----T-T--G--A-A-A--G-A---T----T--A--G---TTC--T---C--A--------T-A----A---C--TAAG---C-A--A--C------G--G---T---G---T--G--T---G-C--A-------------A--C------------A--A--A-------T---T---------------TTC-A-A---C-A------C-G-------C---------T----A-----A---C-GGA-------C----------G---T-T-A----T--C----AA----A---------------------T---T--------------T-A-T----A-----T-G-C-A--C--G---CC---A---C----------CC--G------T--T---G----T--A-G----TT--A-T-GCG--A--G-A---C--T--ATC-A---T-C--T-T--T---C--A-A-------T-A-A---A-------T---C-A--T---A--T-T---C--A------T--G--C---T------------T---------AAAGGT--A-CT-T----A---C---------T-----A-C--CT---------------A----C--A--T-G--C----------------------------G-T---G-------T--T---T-T--G-A--T-T---T---C-A-----C-AG--T-G-T-T---TT-A-----
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gi|38316                      :                                                                            ATATAA-GC-A--A----TGA-A----T-T-A--T-G--A-T---T-T---A-----T-T--G--A-A-A--G-A---T--G-T--A--G---T-C--T---C--A--------T-A----A---C--T--G---C-A--A--C------G--GTCCT---G---T-----T---G-C--A----A--------A--A------------A--A--A-------T---TTTTGTCG--C---T-A---A-A---C-G------C-G-------C--G----C-T--------------C-G----------------------------A----T--C----TC----A-------------C--A----T---T--------------T-G-TA---T-----C-G-C-A--C------C----A---C----------C---GC-----C--T---G----C--A-GTT--T---ATT-G----A--G-A---CT-T--A-C-A---T-CCTT-T--C---C--A-A-------T-ACA---A-------T---C-A--T-A-AC-T-T---C--A-T----T--G--C---T------------TAA-------A----T--G-TA-T----A---C----AAAT-C-----T-C--TT-----------A---A----A--C--T-T--C----A--T--Tgtatacaaatctcttaaacttcatt
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gi|38320                      :                                                                            ATATAA-GT-A--A----TGA-A----T-T-A--T-A--A-T---T-T---T-----T-T--G--A-A-A--G-T---T--G-T--A--G---T-T--T---C--A--------T-A----T---C--T--G---C-A--A--C------G--G---T---G---A--T--T---G-C--A-------------AGCC------------A--A--T-------T---T------T--C---A-T---A-A---C-A------C-A-------C---------T----A-----G---T-G---------CGA--------G---T-T-A----T--A----TA----C-------------A--A----T---T--------------T-G-C----A-----T-G-C-A--C--A---C----C---T----------T---G------T--T---A----C--A-G----TA--A-T-G----A--G-A---C--A--G-C-A---T-C--T-T--TTA-C--A-A---------A-A---A-------A---A-A--T---A--T-T---C--T-T----T--G--C---T------------T---------A----T--A-T
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gi|38369                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                               --A--A-------T---T------A--A---G-C---A-A---C-GATGAATT-G-------C--G----T-TT---A-----G---C-G---------C----------G---T-T-A----T--T----GA----A-------------A-------T---T--------------T-G-T----GA----T-G-C-A--C--A---C----A---T----------C---G------T--T---G----C--A-G----TT--A-T-G----A--GTA---C--T--A-C-A---T-C--T-T--T---C--A-A-------T-A-A---A-------T---C-A--T-A-A--T-T------A-T----T--G--C---T------------T---------A----T--A-TT-T----A---C----AA---T-----T-C--CT-A--G------A---A----A--A--T-G--C----AAAT--TTG---T--T-----TT-G-T---GG------C--T---T-T--T-A--T-T---G---T-A-----T-A---T-G-T-T---A--A-----A----A-C-------T--T---T-CC---GG--C-T-C--AA---T-CC-T-T-T---G--GG------A-----A------GG-A-----GC----G-----T---T-C----A--T-GG--A-A-C---A-G--C----C-A-T--T---A-------G---G-T-A--A---------------G--T--A--A--T-----TG---------T---AT----G---T-----C---A-C-----A----T-G-A---A-A-T--G-T---A-C-A---C-----G--A-AA--A----A--A----G----A--T-A---C-----AA--GC-------AA----T-G--C--G---A-CA---T-T-----T----A---C--G-C---AC------T---C-A--T---G-A-T-G---T-C-------A----TTA---TC-G-T------A--------C-A--C---G--------------A-C---AA--AA-A---G-G--A-G-T-G-CC-A---AA---A---------T----A-A--AA---AACG-A-----A-A-------T------T-A----A-T--A-T-CCC------A-A-----GC----T-A-------T------TT-A-A--T-T--T----------TT--TT-T-T--------C-TT------G----AA-A-------AT--A----A-A---A--AAA------------TC--A-A-A---AT-GT--C-------A--A-C-A---G--T--TTT---A-------A-----C-A--T-TTTTC---A-------A--CC---------T---AAA-A-CA---GT-T---C-A--T-A--T--A------T-----TT--A-CA--A-T-A---T-T---T------T---A-A--A-A--C-C--C------TGT--A----A-G-T---A----G--TT---C-T----T-G---T--A-TTC-A---T-------A-------C-C-----C----A--A--ACCA------A-ACTTT-T--G-G-T-G-----A---T----T-----C--G-GT---T----C-T--TT-GC-A-G-T--TA-CAA---AG-C-A---C---TAT-CA--T-CA-A--A-ATAGATT
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gi|38271                      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             tt-T---A-A---C-G------C-G-------C--G----T-T----A------------------------------------T-T-C--------------------------------A--A----T---T--------------T-G-T----A-----T-G-C-A--C--A---C----A---C----------C---G------T--T---G----C--A-G----TT--A-T-G----C--G-A---C--C--A-C-G---T-C--T-T--T---C--A-A-------T-A-A---A-------T---A-A--T-A-A--T-T---C--A-T----T--G--C---T------------T---------A----A--A-Taatcataattcattgctcatattttacattcttagaaaatgtatttgtttgttgcttttattgtatatgatttaaactttccgctcaatctttggggaagtagtggttcacggaccagccattaggtaagtaattgttgcgtcacaatgaaatgtacaggaaaaaagatagagcaattatgacatttacgcgcacatgatgtcgtacacgacaaaaaggagtgcaaaatgaaaaaacaatttaataacccatgtatttaattaattttttcttgaaaattaaaacatcaaattgtcaaccgttttatacattttcaacctaaaacagttcatacatttacatattttaaaaccctgtaagtagttcttgtattcataccacaaaccaactttggtgattcggtctttgcagttataagcacatatcatcaaaaata
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Reference ( family-218 )      :                                                                                                                                                                                                               TATTTAA-GCA--A-TGA--A-T-T---A------T-G--A--T---T-T-A-----T-T--G--A-A-A--GA---T--G-T-A--G-T-CT-C--A--------T-AA---C--T--G---C-A-A--C---GG---T-G-T-G--T---G-C--A----T--A-C--A--AA---T---T--G--A--A-T--AA--C-G------C-G-------C--G--------T-T----A----G---C-G--C---G-T-T----A-T-N-----AA--A-----A----T--T-----------------T-G-T--------------T--T-G-C----A--C--A---C---A---C----------C-G------T--T--G----C--A-G--T----T--A-T-G---A----G-A---C--T--A-CA-T-----C-TT--T-C--A-A-------T-AA---A-------T---C-A-T-A-A--T-T-C--A-T----T--G--C-----T------------T-------A----T--ATT-T----A---C-A----T-----T-C--T----T-A--G------AA----A-A--T-G--C----A--T--TT-G---T--T-----T--G-T---G-------C--T---T--TT-A--T-T--G-T-A--T-A---T-G-T-T---TT-AA----A-C-------T-T---T-CC---G---C-T-C--AA---T-CC-T-T-T---G--GG----GA-----A------GT-A-----GC-G--G--T----T-C----A-T--GG--A-A-C---A-G--C----C--A-T--T-A-------G---GT-A--A---------------G-T--A--A-T-----T---------G--TT--A-C----G---T-----C---A-C-----A-A--T-G-A---A-A-T--G-T-----A-C-A----CG-----AA--A-A-A--A-------G----A--T-A---C-----A---GC-------AA----T--G-T--G---A-CA---T-T-----T---A---C--G-C---AC------T---C-A--T---G-A-T-G---TC-------A--T-----A-T--C-G-----T------A---C-A--C---G--------------A-C---AA--AA-A---G-G--A-G-T-G-C--A---AA---T---------T----A-A--AA---AA-A-A-----A-A-------T---T----A---------A-T-A--A--C--C-----------CA-A-G-T-A-------T------TTA-A--T-A----A----------T-T--TT-T-T--------C-T-----------------------T------G----AA-A-------A-T--A----A-A---A--CA-------------TC--A-A-A---TT-GT--C-------A--A-C-A---G--T--TTT---A---T---A-----C-A--T-TTT-C---A-------A--C----------T---AAA-ACA---G-T-T---CA--T-A--T--A----T-T-----TT--A-C---A-T-A---T-T---T------T---A-A--A-A--C-C--C------TGT--A----A-G-T---A----G--T-T---C-T----T-G---T--A-TT-C-A---T-------AC------C-C-----C-----A--A--A-CC-A--------A--C-TT-T--GG-T-G-----A---T----T-----C---G-G----T----C-T--TT-GC-A-G-T--TA-T-A---AG-C-A---C-A-TAT-CA--T-C--A--A-ATAGATT
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Reference ( family-218 )      :                                                                                                                                                                                                               TATTTAA-GCA--A-TGA--A-T-T---A------T-G--A--T---T-T-A-----T-T--G--A-A-A--GA---T--G-T-A--G-T-CT-C--A--------T-AA---C--T--G---C-A-A--C---GG---T-G-T-G--T---G-C--A----T--A-C--A--AA---T---T--G--A--A-T--AA--C-G------C-G-------C--G--------T-T----A----G---C-G--C---G--T-T--A-T-----G---AA--A-----A----T--T-----------------T-G-T--------------T--T-G-C----A--C--A---C---A---C----------C-G------T--T--G----C--A-G--T----T--A-T-G--A----G-A----C-T--A-CA-T-----C-TT--T-C--A-A-------T-AA---A-------T---C-A-TA-A--T-T---T--A--T----T--G--C---T------------T---------A----T--ATT-T----A---C-A----T-----T-C--T----T-A--G------AA----A-A--T-G--C----A--T--TT-G---T--T-----T--G--T---G--C--T---T--TT-A--T-T--G-T-A--T-A---T-G-T-T---TT-A--A----AC-------T-T---T-CC---G---C-T-C--AA---T-CC-T-T-T---G--GG----G-A-----A------GT-A-----GC-G--G--T----T-C----AT--GG--A-A-C---A-G--C----C--A-T--T-A-------G---G---T-A--A---------------G-T--A--A-T-----T---------G--TT--A-C----G---T-----C---A-C-----A-A--TG-A---A-A-T--G-T-----A-C-A----CG-----AA--A-A-A--A-------G----A--T-A---C-----A---GC-------AA----T--G-T--G---A--CA---T-T-----T---A---C--G-C---AC------T---C-A--T---G-A-T-G---TC-------A--T-----A-T--C-G-----T------A---C-A--C---G--------------A-C---AA--AA-A---G-G--A-G-T-G-C--A---AA---T---------T----A-A--AA---AA-A-A-----A-A-------T---T----A---------A-T-A--A--C--C-----------CA-A-G-T-A-------T------TTA-A--T-A----A----------T-T--TT-T-T--------C-T-----------------------T------G----AA-A-------A-T--A----A-A---A--CA-------------TC--A-A-A---TT-GT--C-------A--A-C-A---G--T--TTT---A---T---A-----C-A--T-TTT-C---A-------A--C----------T---AAA-ACA---G-T-T---CA--T-A--T--A----T-T-----TT--A-C---A-T-A---T-T---T------T---A-A--A-A--C-C--C------TGT--A----A-G-T---A----G--T-T---C-T----T-G---T--A-TT-C-A---T-------AC------C-C-----C-----A--A--A-CC-A--------A--C-TT-T--GG-T-G-----A---T----T-----C---G-G----T----C-T--TT-GC-A-G-T--TA-T-A---AG-C-A---C-A-TAT-CA--T-C--A--A-ATAGATT
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gi|38272                      : tatttaagcaatgaattattatttattgaaagacgtggtcgcataactgcaacggtgtgtgcatacaaattgaataacgcgcgttaaaataatttattgtttatatttacattagtagtaaaagtattcgtttgtgcttttattgtatatgttttaaatttcccgcccaatcctttggggaagtagcggttcatggaacagccattTACTTAA-GCA--A-TGA--A-T-T---A------T-G--A--T---T-T-A-----T-T--G--A-A-A--GA---T----T-A------TT-C--A--------T-AAA--C--T--G---C-A-A------GG-----G-T-G--T---G-C--A----T--A-C--A--AA---T------G--A--A-T--AA--C-G------C-G-------C-----------T-T----A----G---C-G--C------T-T--A-T-----G---AA--A-----A----T--T-----------------T-G-T--------------T--T-G-C-------C--A---C---A---C-------------------------G----C--A-G--T----T--A-T-T--G----G-A----C-T--A-CC-T-----C-TT--T-C--A-A-------T-AA---------------T-A-TA----T-T---T--A--T-------G--C---T------------T---------A----T--ATT-T----A---C-A----T-----T-C--T----T-A---------AA----A-A--T-G--C----A--T--T--G---T--T-----T--G--T---G--C--T---T--TT-A--T-T--G-T-A--T-A---T-G-T-T---TT-A--A----AC-------T-T---T-CC---G---C-T-C--AA---T-CC-T-T---------G----G-G-----A------GT-A-----GC-G--G--T----T-C----AT--TT--A-A-C---A-G--C----C--T-G--T-A-------G-------T-A------------------G-T--A----T-----T---------G--TT--A-C----G---T-----C---A-------A-A--TG-A---A---T----T-----A-C-A----GG-----AA--A-A-A------------------------C---------GC-------A-----T--G-T----------A---C-T-----T------------C---GC------T---C-GATT---G-A-T-G---TC-------A--T-----A----C-G-----T------A---C-A--C---G--------------A-C---AA--AA-G---G-G------T-G-C--A---AA---T---------T----A-A--AA---AA-A-A------------------------------------T-A--------C-----------CA-G-----A-------T------TTA-AG-T-A----A----------T-T--TT-T----------C-T-----------------------T------G----AA-A-------A-T--A----ACA---A--CA-------------T-----------TT-GT--C-------A--A-C-----G--T--TTT-------T---A-----C----T-TTT-C---A-------C--C----------T---AAA-A-------T-T---AA--T-A--T--A----T-T---------A-C---A-T-A---T-T---T------T---ACA--A-A--C-C--C------TGT--A----A-G-T---A----G--T-T---C-T----------T--A-TT-C-----T--------C------C-C-----C-----A--A--A--C-A--------A--C--T-T--GG-T-G-----A---T----T---------G-G----T----C----TT-GC-A---T--TA-T-A---GG---A---C-G-TAT-CA--T-C--A--A-ATA
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gi|38301                      :                                                                                                                                                                                                                ATTTAA-GCA--A-TGA--A-TGT---A------T-G--A--T---T-TTA-----T-T--G--A-A----GA---T--G-T-A--G-T--T-C--A--------T-AA---C--T--G---C-A-A--C---GG---T-G-TTG--T---G-C--A----T--A-C--A--AA---T---T--G--A--A-T--AA--C-G------C-G-------C--G--------T-T----A----G---C-G--C---GTTT-T--A-T-----G-------A-----A----T--T-----------------TGG-T--------------T--T-G-C----A--C--A---C---A---CCG--------C-G------T--T--G----C--A-GT-T----T--A-TGG--A----G-AT---C-T--A-CA-T-----C-TT--T-C--A-A-------T-AA---AG------T---C-A-TA-A--T-T---T--A--T----T--G--C---T------------T---------A----T--AT
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gi|38305                      :                                                                                                       atttaagcaatgattactgatttattgaaagatgtagtctgcaacaactcaacggtgtgtgcatacaaattgaaataaacgcgctttagcattggatatccggttgTTTAA-GCA----TGA--A-T-----A------T-G--A--T---T-T-A-----T-T--G--A-A-A--GA---T--GAT-A--G-T-CT-CGCA--------T-AA---C--T--A---C-A-A--C---GGG--T-GGC-G--T---G-C--A----T--A-T--A--AA---T---T--T--G--A-T--AA--C-G------T-C-------C--G--------T-T----A----G---C-G--T---G--T------T-----G---AA--A-----A----T--T-----------------T-G----------------T--T-G-C----A--C--A---C---A---C----------C-G------T--T--G----CTTA-G--T----T--A-T-G--A----GAA----C-T--A--A-T-----C-TT--T-C--A-A-------T-AAGAGG-------T---A-G-TA-A--T-T---T--A--TG---T--G--C---T------------T---------A----T--AT
gi|38305                      :                                                                                                                                                                                                                ATATAA-GCAC-A-TAA--A-T-T---A------C-T--A--CCTCT-T-A-----T-T--G--A-A-A--GA---T----T-A--G-TTCT-C--A--------T-AA---C--TAAG---C-A-A--C---GG---T-G-T-G--T---G-C--A-------A-C--A--AA---T---T----------TTCAA--C-A------C-G-------C-------------T----A----A---C-GGAC---G--T-T--A-T-----C---AA--A----------T--T-----------------T-A-T--------------A--T-G-C----A--C--G---CC--A---C----------CCG------T--T--G----T--A-G--T----T--A-T-GCGA----G-A----C-T--ATCA-T-----C-TT--T-C--A-A-------T-AA---A-------T---C-A-T--A--T-T---C--A-------T--G--C---T------------T---------AAAGGT--ACT-T----A---C------T-----A-C--C----T------------A----C-A--T-G--C-----------------------------G--T---G--T--T---T--TG-A--T-T--T-C-A--C-AG--T-G-T-T---TT-A--ggtacttactacctacatgcgtgttttgatttcacagtgtttta
gi|38307                      :                                                                                                                                                                                                                ATTTAA-TCA--A-TGA--A-T-C---A------T-C--A--T---T-T-A-----C-T--G--A-A-A--GA---T--G-T-A--G-T-CT-C--A--------T-AA---C--T--G---C-A-A--C---GA---T-G-T-G--T---G-C--A----T--A-C--A--AA---T---T--G--A--A-T--AT--T-A-------------------A--------T-T----A----G---C-G--C---G--G-T--A-T-----G---AA--A-----A----T--T-----------------T-G-T--------------T--T-G-C----A--C--A---C---A---C----------C-G------T--T--G----C--A-G--T----T--A-T-A--A----G-A----C-T--A-CA-T-----C-TT--T-C--A-G-------T-AA---A-------T---G-A-CA-A--T-T---C--A--T----T--G--C---T------------T---------A----T--AT
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Reference ( family-218 )      :                                                                                                                                                                                                               TATTTAA-GCA--A-TGA--A-T-T---A------T-G--A--T---T-T-A-----T-T--G--A-A-A--GA---T--G-T-A--G-T-CT-C--A--------T-AA---C--T--G---C-A-A--C---GG---T-G-T-G--T---G-C--A----T--A-C--A--AA---T---T--G--A--A-T--AA--C-G------C-G-------C--G--------T-T----A----G---C-G--C---G--T-T--A-T-----G---AA--A-----A----T--T-----------------T-G-T--------------T--T-G-C----A--C--A---C---A---C----------C-G------T--T--G----C--A-G--T----T--A-T-G--A----G-A----C-T--A-CA-T-----C-TT--T-C--A-A-------T-AA---A-------T---C-A-TA-A--T-T---T--A--T----T--G--C---T------------T---------A----T--ATT-T----A---C-A----T-----T-C--T----T-A--G------AA----A-A--T-G--C----A--T--TT-G---T--T-----T--G--T---G--C--T---T--TT-A--T-T--G-T-A--T-A---T-G-T-T---TT-A--A----AC-------T-T---T-CC---G---C-T-C--AA---T-CC-T-T-T---G--GG----G-A-----A------GT-A-----GC-G--G--T----T-C----AT--GG--A-A-C---A-G--C----C--A-T--T-A-------G---G---T-A--A---------------G-T--A--A-T-----T---------G--TT--A-C----G---T-----C---A-C-----A-A--TG-A---A-A-T--G-T-----A-C-A----CG-----AA--A-A-A--A-------G----A--T-A---C-----A---GC-------AA----T--G-T--G---A--CA---T-T-----T---A---C--G-C---AC------T---C-A--T---G-A-T-G---TC-------A--T-----A-T--C-G-----T------A---C-A--C---G--------------A-C---AA--AA-A---G-G--A-G-T-G-C--A---AA---T---------T----A-A--AA---AA-A-A-----A-A-------T---T----A---------A-T-A--A--C--C-----------CA-A-G-T-A-------T------TTA-A--T-A----A----------T-T--TT-T-T--------C-T-----------------------T------G----AA-A-------A-T--A----A-A---A--CA-------------TC--A-A-A---TT-GT--C-------A--A-C-A---G--T--TTT---A---T---A-----C-A--T-TTT-C---A-------A--C----------T---AAA-ACA---G-T-T---CA--T-A--T--A----T-T-----TT--A-C---A-T-A---T-T---T------T---A-A--A-A--C-C--C------TGT--A----A-G-T---A----G--T-T---C-T----T-G---T--A-TT-C-A---T-------AC------C-C-----C-----A--A--A-CC-A--------A--C-TT-T--GG-T-G-----A---T----T-----C---G-G----T----C-T--TT-GC-A-G-T--TA-T-A---AG-C-A---C-A-TAT-CA--T-C--A--A-ATAGATT
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gi|38305                      :                                                                                                                                                                                                                ATATAA-GCAC-A-TAA--A-T-T---A------C-T--A--CCTCT-T-A-----T-T--G--A-A-A--GA---T----T-A--G-TTCT-C--A--------T-AA---C--TAAG---C-A-A--C---GG---T-G-T-G--T---G-C--A-------A-C--A--AA---T---T----------TTCAA--C-A------C-G-------C-------------T----A----A---C-GGAC---G--T-T--A-T-----C---AA--A----------T--T-----------------T-A-T--------------A--T-G-C----A--C--G---CC--A---C----------CCG------T--T--G----T--A-G--T----T--A-T-GCGA----G-A----C-T--ATCA-T-----C-TT--T-C--A-A-------T-AA---A-------T---C-A-T--A--T-T---C--A-------T--G--C---T------------T---------AAAGGT--ACT-T----A---C------T-----A-C--C----T------------A----C-A--T-G--C-----------------------------G--T---G--T--T---T--TG-A--T-T--T-C-A--C-AG--T-G-T-T---TT-A--ggtacttactacctacatgcgtgttttgatttcacagtgtttta
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Reference ( family-218 )      :                                                                                                                                                                                                               TATTTAA-GCA--A-TGA--A-T-T---A------T-G--A--T---T-T-A-----T-T--G--A-A-A--GA---T--G-T-A--G-T-CT-C--A--------T-AA---C--T--G---C-A-A--C---GG---T-G-T-G--T---G-C--A----T--A-C--A--AA---T---T--G--A--A-T--AA--C-G------C-G-------C--G--------T-T----A----G---C-G--C---G--T-T--A-T-----G---AA--A-----A----T--T-----------------T-G-T--------------T--T-G-C----A--C--A---C---A---C----------C-G------T--T--G----C--A-G--T----T--A-T-G--A----G-A----C-T--A-CA-T-----C-TT--T-C--A-A-------T-AA---A-------T---C-A-TA-A--T-T---T--A--T----T--G--C---T------------T---------A----T--ATT-T----A---C-A----T-----T-C--T----T-A--G------AA----A-A--T-G--C----A--T--TT-G---T--T-----T--G--T---G--C--T---T--TT-A--T-T--G-T-A--T-A---T-G-T-T---TT-AA----AC-------T-T---T-CC---G---C-T-C--AA---T-CC-T-T-T---G--GG----GA-----A------GT-A-----GC-G--G--T----T-C----A-T--GG--A-A-C---A-G--C----C--A-T--T-A-------G---G---T-A--A---------------G-T--A--A-T-----T---------G--TT--A-C----G---T-----C---A-C-----A-A--TG-A---A-A-T--G-T-----A-C-A----CG-----AA--A-A-A--A-------G----A--T-A---C-----A---GC-------AA----T--G-T--G---A--CA---T-T-----T---A---C--G-C---AC--T------C-A--T---G-A-T-G---TC-------A--T-----A-T--C-G-----T------A---C-A--C---G--------------A-C---AA--AA-A---G-G--A-G-T-G-C--A---AA---T---------T----A-A--AA---AA-A-A-----A-A-------T---T----A---------A-T-A--A--C--C-CA--------A-G-T-A-----------T---T-T---A-AT-TAA-----TT-T----------T-T----T--------C-TT------G----AA-A-------A-T--A----A-A---A--CA-------------TC--A-A-A---TT-GT--C-------A--A-C-A---G--T--TTT---A---T---A-----C-A--T-TTT-C----A-------A-C--C---------T-A--AA-ACA---G-T-T---CA--T-A--T--A----T-T-----TT--A-C---A-T-A---T-T---T------T---A-A--A-A--C-C--C------TGT--A----A-G-T---A----G--T-T---C-T----T-G---T--A-TT-C-A---T-------AC------C-C-----C-----A--A--A-CC-A--------A--C-TT-T--GG-T-G-----A---T----T-----C---G-G----T----C-T--TT-GC-A-G-T--TA-T-A---AG-C-A---C-A-TAT-CA--T-C--A--A-ATAGATT
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gi|38305                      :                                                                                                       atttaagcaatgattactgatttattgaaagatgtagtctgcaacaactcaacggtgtgtgcatacaaattgaaataaacgcgctttagcattggatatccggttgTTTAA-GCA----TGA--A-T-----A------T-G--A--T---T-T-A-----T-T--G--A-A-A--GA---T--GAT-A--G-T-CT-CGCA--------T-AA---C--T--A---C-A-A--C---GGG--T-GGC-G--T---G-C--A----T--A-T--A--AA---T---T--T--G--A-T--AA--C-G------T-C-------C--G--------T-T----A----G---C-G--T---G--T------T-----G---AA--A-----A----T--T-----------------T-G----------------T--T-G-C----A--C--A---C---A---C----------C-G------T--T--G----CTTA-G--T----T--A-T-G--A----GAA----C-T--A--A-T-----C-TT--T-C--A-A-------T-AAGAGG-------T---A-G-TA-A--T-T---T--A--TG---T--G--C---T------------T---------A----T--AT
gi|38305                      :                                                                                                                                                                                                                ATATAA-GCAC-A-TAA--A-T-T---A------C-T--A--CCTCT-T-A-----T-T--G--A-A-A--GA---T----T-A--G-TTCT-C--A--------T-AA---C--TAAG---C-A-A--C---GG---T-G-T-G--T---G-C--A-------A-C--A--AA---T---T----------TTCAA--C-A------C-G-------C-------------T----A----A---C-GGAC---G--T-T--A-T-----C---AA--A----------T--T-----------------T-A-T--------------A--T-G-C----A--C--G---CC--A---C----------CCG------T--T--G----T--A-G--T----T--A-T-GCGA----G-A----C-T--ATCA-T-----C-TT--T-C--A-A-------T-AA---A-------T---C-A-T--A--T-T---C--A-------T--G--C---T------------T---------AAAGGT--ACT-T----A---C------T-----A-C--C----T------------A----C-A--T-G--C-----------------------------G--T---G--T--T---T--TG-A--T-T--T-C-A--C-AG--T-G-T-T---TT-Aggtacttactacctacatgcgtgttttgatttcacagtgtttta
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