lowQualScore : 00 2 0000 0 00 1 0 0000 0 444444 0 2222222 3333 0 0 0 0 000
lowQualScore : .. . .... . .. . . .... . ...... . ....... .... . . . . ...
lowQualScore : 66 0 9999 8 66 2 4 9999 8 000000 8 5555555 5555 4 8 8 4 777
consensus : TTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
Reference ( gi|77817 ) : TTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77818 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77820 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-T--ATCG-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77826 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAACC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77821 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TC-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77774 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-T--ATTG-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77815 : tTTTTCTCTAA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTC
gi|77828 : TTTTGTCTGA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAGCC-ACTTGGT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77832 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-C--ATCA-CTGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77831 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAACC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77816 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAACC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77836 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------GTA--T-AT-AT-C-AC---TTC
gi|77834 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-C--ATCG-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77777 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-T--ACCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TA-------A----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77779 : tTTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-T--ATCAACAGCA-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77840 : tTCTTCTCTGA--TA-CTG----CA-T--ACCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77844 : TTTTCTCTGA--AA-CTA----CA-T--ATCA-CAACC-ACTTGAT----ATT------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77843 : TTTTCTCCGA--AA-CTG----CA-T--TTTA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77822 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAGCC-ACTTG-T----A-T------T-TC-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77829 : TTTCCTCTAA--AA-CTG----CA-T--ACCA-CAGCT-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77823 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----AA-C--ATCA-CAGCC-ACTTGCT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77858 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAGCC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77854 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-T--ATCG-CAGCC-ACTTGAT----A-T------G-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TT
gi|77786 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-T--ACCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----A-AT-AT-C-AC---ATCAT
gi|77837 : tTTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-A--AACA-CAGCT-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77830 : TTTTCTCTAA--AC-CTG----CA-T--ATCA-CCGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCA
gi|77819 : TTTCCTCTGA--AA-CTG----CA-T--TTCG-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-CG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77791 : TTTTCTCAGC--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAGCC-ACCTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTC
gi|77865 : tTTTCCTTTGA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAGCC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-A-AC---TTCAT
gi|77862 : TTTTCTTTGA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAGCC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77861 : TTTTCTTTGA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAGCC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77792 : TTTTCTCTGA--AA-TTA----CA-T--ATCA-CAGCC-CCATGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77841 : tTTTACTCTGA--AA-CTG----CA-T--ATTA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-TT-AT-C-GC---TTCAT
gi|77793 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-T--ACCA-CAGCC-ACTT--T----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77869 : tTTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAGCC-AATTCAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77867 : TTTTCTCTGA--AA-CTT----CA-T--ATCA-CAGCC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77873 : TTTTGTCTGA--AA-CGG----CA-T--ATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-TT-AT-C-AC---TTTAT
gi|77787 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-A--ATCA-CATCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-GC---ATCAT
gi|77852 : tTTTCCTCCAA--GA-CTG----CA-T--ATCA-CAGCC-ATTTGAT----A-T------T-TA-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77783 : TTTTTTCTAA--AA-CTG----CG-T--ACCA-CTGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCA
gi|77875 : tTTCTTTCTGA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAGCC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77866 : TTTTCTCTGA--AG-CTG----CA-T--ATCA-CAGCC-ACTTGAT----ATT------T-TG-------G----T-GT-AT-A-AT---TTCAT
gi|77853 : TTTTCTCTGA--CA-CTG----CA-T--ATCA-AAGTC-ATTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-GT-C-AC---TTCAT
gi|77878 : TTTTCTCTGA--AA-CTA----CA-T--ATCA-CAGTC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77876 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAACC-ACTTGCT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-T-AC---ATCAT
gi|77798 : TTTTCTTTGA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAACC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-
gi|77835 : tTTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-C--ATTG-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-ATAAT-C-AC---T
gi|77801 : TTTTCTCTGA--AA-ATG----GA-T--ACCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TA-------G----T-AT-AT-T-AC---TTCA
gi|77800 : tTTTTCTCTGA--AA-CTT----CA-T--ACCA-CAGCC-ACTTAGT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AA-C-AC---TTCA
gi|77848 : tTTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAGCC-AATTGAC----A-T------T-GG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77880 : TTTTCTTTGA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAGCC-AATTGAT----A-T------T-GG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77870 : TTTTCTCTGA--AAACTG----CA-T--ATCG-CAGCC-ACTTGATATAAA-T------T-TG-------G----T-AT-AT-CAAC---TTCAT
gi|77885 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----CAAT--ATCA-CAGCC-ACTTTAT----A-T------T-TG-------A----T-AT-AT-C-GA---TTCAT
gi|77874 : TTTTCTCTGT--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAGCC-GATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77860 : TTTTCTCTAA--AA-CTG----CA-T--GCCA-TAGCT-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GC-AT-C-AC---TTCAT
gi|77825 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAACC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-
gi|77824 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAACC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-
gi|77849 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAGCC-AATTGAC----A--------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77887 : TTTTCTCTGA--AT-CTG----CA-T--ATCA-AAGTC-GTTTGAC----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77855 : TTTTCTCTGA--AA-CAG----CG-T--AACA-CAGTC-ACTTAAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77856 : TTTTTTCTGA--AA-CTG----CA-T--ATAA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TGGTACAT-G----T-AT-AT-C-AC---TACAT
gi|77871 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----CG-T--ATCA-CAGCT-GCTTGAT----A-T------T-TG-------GT---T-AT-AC-C-AT---TTTAT
gi|77879 : TTTTCTCTGA--AA-CTA----CA-T--A-CA-CAGCC-A-TTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77857 : TTGTTTCTGA--AA-CTC----CG-T--ACCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------A----T-AT-AT-T-AC---TTCAT
gi|77888 : TTTTCTCAGC--AA-CTG----CA-A--ATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-TT-TT-C-AC---TTCAT
gi|77890 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAGCC-AATTGAT----A-TTTCAAAT-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTTAT
gi|77889 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAGCC-AATTGAT----A-TTTCAAAT-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTTAT
gi|77864 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAACC-GATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-ACTAATTCAT
gi|77859 : TTTTAACTGA--AA-GTG----CA-T--ATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TGGTACATTG----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77805 : TTTCCTCTGA--AA-CTG----CA-C--ACCA-CAGCC-ACTTAAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AA-T-AC---T
gi|77863 : tTTTCTTCTAA--AAACTG----TG-T--ATTA-CAGTC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77882 : TTTTCTCTAA--AA-TGA----CG-T--ATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------TGTG-------G----T-AT-ATCC-AC---TTCAT
gi|77881 : TTTTCTCTAA--AA-TGA----CG-T--ATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------TGTG-------G----T-AT-ATCC-AC---TTCAT
gi|77795 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----TG-T--ATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------C-TT-------T----T-AT-AT-T-AC---TT
gi|77794 : tTTTTCTCTGA--AA-CTG----TG-T--ATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------C-TT-------T----T-AT-AT-T-AC---TT
gi|77776 : tTTTTCTCTGA--AAACTGGCAGCA-T---CCA-CTGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77806 : tTTTTCTTTAA--AA-CTA----CA-T--ACCA-TTGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AA-T-AC---TTAAT
gi|77902 : tTTTCTCTGA--AA-CTG----CA-T--ATCG-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77905 : TTTCTCTGA--AA-CTG----CT-T--ATCA-CAGCC-ACTTAGT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AC-C-AC---TTCAT
gi|77903 : TTTCTCTGA--AA-CTG----AA-C--ATCA-CAGCC-ACTTGCT----A-T------T-TG-------G----T-ATAAT-C-AC---TTCAT
gi|77910 : TTTCTCTGA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAGCCAATTTGAT----A-C------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77904 : TTTTTCTAAGCAG-CTG----CA-T--TTCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-C-AT---TTCAT
gi|77803 : TTTTTCCGA--AAACTG----CAAT--ATCG-CAAC--ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCA
gi|77915 : TTCTCTAA--AA-CTG----TG-T--ATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77778 : TTCCCTGA--AA-CTG----TG-C--ATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77916 : ttgTTCTCTGA--AA-CTG----CA-C--ATCA-CTGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G-------T-AT-C-AC---TTCAT
gi|77789 : TTCTCTAA--AA-CTG----TG-T--ATCA-CAGCC-ACTTGGT----A-T------T-TT-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77919 : ttgTTCTCTCA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-TGC----T-TG-------GTATAT-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77804 : TTTTCTGA--AA-CTG----CA-T--ACCA-CAACC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-A
gi|77917 : ttaTTCTCGGA--AA-CTG----CG-T--ATCA-CAACC-TCTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AC-C-AC---TTCAT
gi|77775 : TTCTCTGA--AA-CTG----CG-C--ATCA-CAGCC-ACTTAAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AC-C-GC---ATCAT
gi|77921 : ttgTTCTCTCA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-TGC----T-TG-------GTATAT-AT-AT-C-AT---TTCAT
gi|77920 : TTCTCTCA--AA-CTG----CA-T--ATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-TGC----T-TG-------GTATAT-AT-AT-C-AT---TTCAT
gi|77918 : TTCTCTAA--AAACTG----TG-T--ATTA-CAGTC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----TGAT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77922 : TTCTCTAC--AC-CTG----T--TGAATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77925 : TCTCTGA--AA-CTG----CA-T--CTCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------C-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TCCAT
gi|77923 : TCTCTAA--AA-CTG----TG-T--ATCAACAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77924 : TCTCTAA--AA-CTG----TG-T--ATCAACAGCC-ACTTGAT----A-T------T--G-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77926 : TCTCTGA--AA-CTA----CA-A--ATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-
gi|77928 : -CTG----TG-T--ATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-TC---TTCAT
Alignments
lowQualScore : 00 2 0000 00 0 1 0 0000 0 444444 0 2222222 3333 0 0 0 0 000
lowQualScore : .. . .... .. . . . .... . ...... . ....... .... . . . . ...
lowQualScore : 66 0 9999 66 8 2 4 8888 8 000000 8 5555555 5555 4 8 8 4 777
consensus : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
Reference ( family-209 ) : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77774 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATTG-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77775 : tTTCTCTGA--AA-CTG----C--G-CATCA-CAGCC-ACTTAAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AC-C-GC---ATCAT
gi|77776 : ttgTTTTCTCTGA--AAACTGGCAGC--A-T-CCA-CTGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77777 : tTTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TACCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TA-------A----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77778 : tTTCCCTGA--AA-CTG----T--G-CATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77779 : ttgTTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCAACAGCA-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77783 : tTTTTTTCTAA--AA-CTG----C--G-TACCA-CTGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCA
gi|77786 : tTTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TACCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----A-AT-AT-C-AC---ATCAT
gi|77787 : tTTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-AATCA-CATCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-GC---ATCAT
gi|77789 : tTTCTCTAA--AA-CTG----T--G-TATCA-CAGCC-ACTTGGT----A-T------T-TT-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77791 : ttgTTTTCTCAGC--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACCTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTC
gi|77792 : tTTTTCTCTGA--AA-TTA----C--A-TATCA-CAGCC-CCATGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77793 : tTTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TACCA-CAGCC-ACTT--T----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77794 : tTTTTCTCTGA--AA-CTG----T--G-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------C-TT-------T----T-AT-AT-T-AC---TT
gi|77795 : tTTTTCTCTGA--AA-CTG----T--G-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------C-TT-------T----T-AT-AT-T-AC---TT
gi|77798 : tTTTTCTTTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAACC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-
gi|77800 : tTTTTCTCTGA--AA-CTT----C--A-TACCA-CAGCC-ACTTAGT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AA-C-AC---TTCA
gi|77801 : tTTTTCTCTGA--AA-ATG----G--A-TACCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TA-------G----T-AT-AT-T-AC---TTCA
gi|77803 : tTTTTTCCGA--AAACTG----C--AATATCG-CAAC--ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCA
gi|77804 : TTTTCTGA--AA-CTG----C--A-TACCA-CAACC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-A
gi|77805 : ttaTTTCCTCTGA--AA-CTG----C--A-CACCA-CAGCC-ACTTAAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AA-T-AC---T
gi|77806 : tTTTTCTTTAA--AA-CTA----C--A-TACCA-TTGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AA-T-AC---TTAAT
gi|77815 : tTTTTCTCTAA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTC
gi|77816 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAACC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77817 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77818 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77819 : TTTCCTCTGA--AA-CTG----C--A-TTTCG-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-CG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77820 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCG-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77821 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TC-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77822 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTG-T----A-T------T-TC-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77823 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----A--A-CATCA-CAGCC-ACTTGCT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77824 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAACC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-
gi|77825 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAACC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-
gi|77826 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAACC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77828 : TTTTGTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGGT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77829 : TTTCCTCTAA--AA-CTG----C--A-TACCA-CAGCT-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77830 : TTTTCTCTAA--AC-CTG----C--A-TATCA-CCGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCA
gi|77831 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAACC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77832 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-CATCA-CTGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77834 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-CATCG-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77835 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-CATTG-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-ATAAT-C-AC---T
gi|77836 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------GTA--T-AT-AT-C-AC---TTC
gi|77837 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-AAACA-CAGCT-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77840 : TCTTCTCTGA--TA-CTG----C--A-TACCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77841 : TTTACTCTGA--AA-CTG----C--A-TATTA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-TT-AT-C-GC---TTCAT
gi|77843 : TTTTCTCCGA--AA-CTG----C--A-TTTTA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77844 : TTTTCTCTGA--AA-CTA----C--A-TATCA-CAACC-ACTTGAT----ATT------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77848 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAC----A-T------T-GG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77849 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAC----A--------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77852 : TTTCCTCCAA--GA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ATTTGAT----A-T------T-TA-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77853 : TTTTCTCTGA--CA-CTG----C--A-TATCA-AAGTC-ATTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-GT-C-AC---TTCAT
gi|77854 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCG-CAGCC-ACTTGAT----A-T------G-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TT
gi|77855 : TTTTCTCTGA--AA-CAG----C--G-TAACA-CAGTC-ACTTAAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77856 : TTTTTTCTGA--AA-CTG----C--A-TATAA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TGGTACAT-G----T-AT-AT-C-AC---TACAT
gi|77857 : TTGTTTCTGA--AA-CTC----C--G-TACCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------A----T-AT-AT-T-AC---TTCAT
gi|77858 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77859 : TTTTAACTGA--AA-GTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TGGTACATTG----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77860 : TTTTCTCTAA--AA-CTG----C--A-TGCCA-TAGCT-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GC-AT-C-AC---TTCAT
gi|77861 : TTTTCTTTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77862 : TTTTCTTTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77863 : TTTCTTCTAA--AAACTG----T--G-TATTA-CAGTC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77864 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAACC-GATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-ACTAATTCAT
gi|77865 : TTTCCTTTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-A-AC---TTCAT
gi|77866 : TTTTCTCTGA--AG-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----ATT------T-TG-------G----T-GT-AT-A-AT---TTCAT
gi|77867 : TTTTCTCTGA--AA-CTT----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77869 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTCAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77870 : TTTTCTCTGA--AAACTG----C--A-TATCG-CAGCC-ACTTGATATAAA-T------T-TG-------G----T-AT-AT-CAAC---TTCAT
gi|77871 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--G-TATCA-CAGCT-GCTTGAT----A-T------T-TG-------GT---T-AT-AC-C-AT---TTTAT
gi|77873 : TTTTGTCTGA--AA-CGG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-TT-AT-C-AC---TTTAT
gi|77874 : TTTTCTCTGT--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-GATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77875 : TTCTTTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77876 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAACC-ACTTGCT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-T-AC---ATCAT
gi|77878 : TTTTCTCTGA--AA-CTA----C--A-TATCA-CAGTC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77879 : TTTTCTCTGA--AA-CTA----C--A-TA-CA-CAGCC-A-TTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77880 : TTTTCTTTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAT----A-T------T-GG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77881 : TTTTCTCTAA--AA-TGA----C--G-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------TGTG-------G----T-AT-ATCC-AC---TTCAT
gi|77882 : TTTTCTCTAA--AA-TGA----C--G-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------TGTG-------G----T-AT-ATCC-AC---TTCAT
gi|77885 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--AATATCA-CAGCC-ACTTTAT----A-T------T-TG-------A----T-AT-AT-C-GA---TTCAT
gi|77887 : TTTTCTCTGA--AT-CTG----C--A-TATCA-AAGTC-GTTTGAC----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77888 : TTTTCTCAGC--AA-CTG----C--A-AATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-TT-TT-C-AC---TTCAT
gi|77889 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAT----A-TTTCAAAT-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTTAT
gi|77890 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAT----A-TTTCAAAT-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTTAT
gi|77902 : TTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCG-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77903 : TTTCTCTGA--AA-CTG----A--A-CATCA-CAGCC-ACTTGCT----A-T------T-TG-------G----T-ATAAT-C-AC---TTCAT
gi|77904 : TTTTTCTAAGCAG-CTG----C--A-TTTCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-C-AT---TTCAT
gi|77905 : TTTCTCTGA--AA-CTG----C--T-TATCA-CAGCC-ACTTAGT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AC-C-AC---TTCAT
gi|77910 : TTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCCAATTTGAT----A-C------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77915 : TTCTCTAA--AA-CTG----T--G-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77916 : TTCTCTGA--AA-CTG----C--A-CATCA-CTGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G-------T-AT-C-AC---TTCAT
gi|77917 : TTCTCGGA--AA-CTG----C--G-TATCA-CAACC-TCTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AC-C-AC---TTCAT
gi|77918 : TTCTCTAA--AAACTG----T--G-TATTA-CAGTC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----TGAT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77919 : TTCTCTCA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-TGC----T-TG-------GTATAT-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77920 : TTCTCTCA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-TGC----T-TG-------GTATAT-AT-AT-C-AT---TTCAT
gi|77921 : TTCTCTCA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-TGC----T-TG-------GTATAT-AT-AT-C-AT---TTCAT
gi|77922 : TTCTCTAC--AC-CTG----TTGA--ATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77923 : TCTCTAA--AA-CTG----T--G-TATCAACAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77924 : TCTCTAA--AA-CTG----T--G-TATCAACAGCC-ACTTGAT----A-T------T--G-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77925 : TCTCTGA--AA-CTG----C--A-TCTCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------C-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TCCAT
gi|77926 : TCTCTGA--AA-CTA----C--A-AATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-
gi|77928 : -CTG----T--G-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-TC---TTCAT
Alignments
lowQualScore : 00 2 0000 00 0 1 0 0000 0 444444 0 2222222 3333 0 0 0 0 000
lowQualScore : .. . .... .. . . . .... . ...... . ....... .... . . . . ...
lowQualScore : 66 0 9999 66 8 2 4 8888 8 000000 8 5555555 5555 4 8 8 4 777
consensus : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
Reference ( family-209 ) : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77774 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATTG-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77775 : tTTCTCTGA--AA-CTG----C--G-CATCA-CAGCC-ACTTAAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AC-C-GC---ATCAT
gi|77776 : ttgTTTTCTCTGA--AAACTGGCAGC--A-T-CCA-CTGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77777 : tTTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TACCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TA-------A----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77778 : tTTCCCTGA--AA-CTG----T--G-CATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77779 : ttgTTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCAACAGCA-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77783 : tTTTTTTCTAA--AA-CTG----C--G-TACCA-CTGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCA
gi|77786 : tTTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TACCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----A-AT-AT-C-AC---ATCAT
gi|77787 : tTTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-AATCA-CATCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-GC---ATCAT
gi|77789 : tTTCTCTAA--AA-CTG----T--G-TATCA-CAGCC-ACTTGGT----A-T------T-TT-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77791 : ttgTTTTCTCAGC--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACCTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTC
gi|77792 : tTTTTCTCTGA--AA-TTA----C--A-TATCA-CAGCC-CCATGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77793 : tTTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TACCA-CAGCC-ACTT--T----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77794 : tTTTTCTCTGA--AA-CTG----T--G-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------C-TT-------T----T-AT-AT-T-AC---TT
gi|77795 : tTTTTCTCTGA--AA-CTG----T--G-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------C-TT-------T----T-AT-AT-T-AC---TT
gi|77798 : tTTTTCTTTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAACC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-
gi|77800 : tTTTTCTCTGA--AA-CTT----C--A-TACCA-CAGCC-ACTTAGT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AA-C-AC---TTCA
gi|77801 : tTTTTCTCTGA--AA-ATG----G--A-TACCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TA-------G----T-AT-AT-T-AC---TTCA
gi|77803 : tTTTTTCCGA--AAACTG----C--AATATCG-CAAC--ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCA
gi|77804 : TTTTCTGA--AA-CTG----C--A-TACCA-CAACC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-A
gi|77805 : ttaTTTCCTCTGA--AA-CTG----C--A-CACCA-CAGCC-ACTTAAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AA-T-AC---T
gi|77806 : tTTTTCTTTAA--AA-CTA----C--A-TACCA-TTGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AA-T-AC---TTAAT
gi|77815 : tTTTTCTCTAA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTC
gi|77816 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAACC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77817 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77818 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77819 : TTTCCTCTGA--AA-CTG----C--A-TTTCG-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-CG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77820 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCG-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77821 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TC-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77822 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTG-T----A-T------T-TC-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77823 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----A--A-CATCA-CAGCC-ACTTGCT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77824 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAACC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-
gi|77825 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAACC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-
gi|77826 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAACC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77828 : TTTTGTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGGT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77829 : TTTCCTCTAA--AA-CTG----C--A-TACCA-CAGCT-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77830 : TTTTCTCTAA--AC-CTG----C--A-TATCA-CCGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCA
gi|77831 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAACC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77832 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-CATCA-CTGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77834 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-CATCG-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77835 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-CATTG-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-ATAAT-C-AC---T
gi|77836 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------GTA--T-AT-AT-C-AC---TTC
gi|77837 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-AAACA-CAGCT-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77840 : TCTTCTCTGA--TA-CTG----C--A-TACCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77841 : TTTACTCTGA--AA-CTG----C--A-TATTA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-TT-AT-C-GC---TTCAT
gi|77843 : TTTTCTCCGA--AA-CTG----C--A-TTTTA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77844 : TTTTCTCTGA--AA-CTA----C--A-TATCA-CAACC-ACTTGAT----ATT------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77848 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAC----A-T------T-GG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77849 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAC----A--------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77852 : TTTCCTCCAA--GA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ATTTGAT----A-T------T-TA-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77853 : TTTTCTCTGA--CA-CTG----C--A-TATCA-AAGTC-ATTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-GT-C-AC---TTCAT
gi|77854 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCG-CAGCC-ACTTGAT----A-T------G-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TT
gi|77855 : TTTTCTCTGA--AA-CAG----C--G-TAACA-CAGTC-ACTTAAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77856 : TTTTTTCTGA--AA-CTG----C--A-TATAA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TGGTACAT-G----T-AT-AT-C-AC---TACAT
gi|77857 : TTGTTTCTGA--AA-CTC----C--G-TACCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------A----T-AT-AT-T-AC---TTCAT
gi|77858 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77859 : TTTTAACTGA--AA-GTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TGGTACATTG----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77860 : TTTTCTCTAA--AA-CTG----C--A-TGCCA-TAGCT-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GC-AT-C-AC---TTCAT
gi|77861 : TTTTCTTTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77862 : TTTTCTTTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77863 : TTTCTTCTAA--AAACTG----T--G-TATTA-CAGTC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77864 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAACC-GATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-ACTAATTCAT
gi|77865 : TTTCCTTTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-A-AC---TTCAT
gi|77866 : TTTTCTCTGA--AG-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----ATT------T-TG-------G----T-GT-AT-A-AT---TTCAT
gi|77867 : TTTTCTCTGA--AA-CTT----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77869 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTCAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77870 : TTTTCTCTGA--AAACTG----C--A-TATCG-CAGCC-ACTTGATATAAA-T------T-TG-------G----T-AT-AT-CAAC---TTCAT
gi|77871 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--G-TATCA-CAGCT-GCTTGAT----A-T------T-TG-------GT---T-AT-AC-C-AT---TTTAT
gi|77873 : TTTTGTCTGA--AA-CGG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-TT-AT-C-AC---TTTAT
gi|77874 : TTTTCTCTGT--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-GATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77875 : TTCTTTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77876 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAACC-ACTTGCT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-T-AC---ATCAT
gi|77878 : TTTTCTCTGA--AA-CTA----C--A-TATCA-CAGTC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77879 : TTTTCTCTGA--AA-CTA----C--A-TA-CA-CAGCC-A-TTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77880 : TTTTCTTTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAT----A-T------T-GG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77881 : TTTTCTCTAA--AA-TGA----C--G-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------TGTG-------G----T-AT-ATCC-AC---TTCAT
gi|77882 : TTTTCTCTAA--AA-TGA----C--G-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------TGTG-------G----T-AT-ATCC-AC---TTCAT
gi|77885 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--AATATCA-CAGCC-ACTTTAT----A-T------T-TG-------A----T-AT-AT-C-GA---TTCAT
gi|77887 : TTTTCTCTGA--AT-CTG----C--A-TATCA-AAGTC-GTTTGAC----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77888 : TTTTCTCAGC--AA-CTG----C--A-AATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-TT-TT-C-AC---TTCAT
gi|77889 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAT----A-TTTCAAAT-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTTAT
gi|77890 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAT----A-TTTCAAAT-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTTAT
gi|77902 : TTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCG-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77903 : TTTCTCTGA--AA-CTG----A--A-CATCA-CAGCC-ACTTGCT----A-T------T-TG-------G----T-ATAAT-C-AC---TTCAT
gi|77904 : TTTTTCTAAGCAG-CTG----C--A-TTTCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-C-AT---TTCAT
gi|77905 : TTTCTCTGA--AA-CTG----C--T-TATCA-CAGCC-ACTTAGT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AC-C-AC---TTCAT
gi|77910 : TTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCCAATTTGAT----A-C------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77915 : TTCTCTAA--AA-CTG----T--G-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77916 : TTCTCTGA--AA-CTG----C--A-CATCA-CTGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G-------T-AT-C-AC---TTCAT
gi|77917 : TTCTCGGA--AA-CTG----C--G-TATCA-CAACC-TCTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AC-C-AC---TTCAT
gi|77918 : TTCTCTAA--AAACTG----T--G-TATTA-CAGTC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----TGAT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77919 : TTCTCTCA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-TGC----T-TG-------GTATAT-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77920 : TTCTCTCA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-TGC----T-TG-------GTATAT-AT-AT-C-AT---TTCAT
gi|77921 : TTCTCTCA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-TGC----T-TG-------GTATAT-AT-AT-C-AT---TTCAT
gi|77922 : TTCTCTAC--AC-CTG----TTGA--ATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77923 : TCTCTAA--AA-CTG----T--G-TATCAACAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77924 : TCTCTAA--AA-CTG----T--G-TATCAACAGCC-ACTTGAT----A-T------T--G-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77925 : TCTCTGA--AA-CTG----C--A-TCTCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------C-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TCCAT
gi|77926 : TCTCTGA--AA-CTA----C--A-AATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-
gi|77928 : -CTG----T--G-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-TC---TTCAT
blockSeqs : A A TTCAAA GTACATT TATA
blockSeqs : A A TTCAAA GTACAT TATA
blockSeqs : A A GC . TATA
blockSeqs : A . GC . TA
blockSeqs : A . GC . T
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons :
originalCons : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
finalCons : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
Alignments
lowQualScore : 00 2 0000 00 0 1 0 0000 0 444444 0 2222222 3333 0 0 0 0 000
lowQualScore : .. . .... .. . . . .... . ...... . ....... .... . . . . ...
lowQualScore : 66 0 9999 66 8 2 4 8888 8 000000 8 5555555 5555 4 8 8 4 777
consensus : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
Reference ( family-209 ) : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77774 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATTG-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77775 : tTTCTCTGA--AA-CTG----C--G-CATCA-CAGCC-ACTTAAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AC-C-GC---ATCAT
gi|77776 : ttgTTTTCTCTGA--AAACTGGCAGC--A-T-CCA-CTGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77777 : tTTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TACCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TA-------A----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77778 : tTTCCCTGA--AA-CTG----T--G-CATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77779 : ttgTTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCAACAGCA-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77783 : tTTTTTTCTAA--AA-CTG----C--G-TACCA-CTGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCA
gi|77786 : tTTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TACCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----A-AT-AT-C-AC---ATCAT
gi|77787 : tTTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-AATCA-CATCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-GC---ATCAT
gi|77789 : tTTCTCTAA--AA-CTG----T--G-TATCA-CAGCC-ACTTGGT----A-T------T-TT-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77791 : ttgTTTTCTCAGC--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACCTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTC
gi|77792 : tTTTTCTCTGA--AA-TTA----C--A-TATCA-CAGCC-CCATGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77793 : tTTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TACCA-CAGCC-ACTT--T----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77794 : tTTTTCTCTGA--AA-CTG----T--G-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------C-TT-------T----T-AT-AT-T-AC---TT
gi|77795 : tTTTTCTCTGA--AA-CTG----T--G-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------C-TT-------T----T-AT-AT-T-AC---TT
gi|77798 : tTTTTCTTTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAACC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-
gi|77800 : tTTTTCTCTGA--AA-CTT----C--A-TACCA-CAGCC-ACTTAGT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AA-C-AC---TTCA
gi|77801 : tTTTTCTCTGA--AA-ATG----G--A-TACCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TA-------G----T-AT-AT-T-AC---TTCA
gi|77803 : tTTTTTCCGA--AAACTG----C--AATATCG-CAAC--ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCA
gi|77804 : TTTTCTGA--AA-CTG----C--A-TACCA-CAACC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-A
gi|77805 : ttaTTTCCTCTGA--AA-CTG----C--A-CACCA-CAGCC-ACTTAAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AA-T-AC---T
gi|77806 : tTTTTCTTTAA--AA-CTA----C--A-TACCA-TTGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AA-T-AC---TTAAT
gi|77815 : tTTTTCTCTAA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTC
gi|77816 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAACC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77817 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77818 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77819 : TTTCCTCTGA--AA-CTG----C--A-TTTCG-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-CG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77820 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCG-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77821 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TC-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77822 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTG-T----A-T------T-TC-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77823 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----A--A-CATCA-CAGCC-ACTTGCT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77824 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAACC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-
gi|77825 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAACC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-
gi|77826 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAACC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77828 : TTTTGTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGGT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77829 : TTTCCTCTAA--AA-CTG----C--A-TACCA-CAGCT-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77830 : TTTTCTCTAA--AC-CTG----C--A-TATCA-CCGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCA
gi|77831 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAACC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77832 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-CATCA-CTGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77834 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-CATCG-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77835 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-CATTG-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-ATAAT-C-AC---T
gi|77836 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------GTA--T-AT-AT-C-AC---TTC
gi|77837 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-AAACA-CAGCT-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77840 : TCTTCTCTGA--TA-CTG----C--A-TACCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77841 : TTTACTCTGA--AA-CTG----C--A-TATTA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-TT-AT-C-GC---TTCAT
gi|77843 : TTTTCTCCGA--AA-CTG----C--A-TTTTA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77844 : TTTTCTCTGA--AA-CTA----C--A-TATCA-CAACC-ACTTGAT----ATT------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77848 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAC----A-T------T-GG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77849 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAC----A--------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77852 : TTTCCTCCAA--GA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ATTTGAT----A-T------T-TA-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77853 : TTTTCTCTGA--CA-CTG----C--A-TATCA-AAGTC-ATTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-GT-C-AC---TTCAT
gi|77854 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCG-CAGCC-ACTTGAT----A-T------G-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TT
gi|77855 : TTTTCTCTGA--AA-CAG----C--G-TAACA-CAGTC-ACTTAAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77856 : TTTTTTCTGA--AA-CTG----C--A-TATAA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TGGTACAT-G----T-AT-AT-C-AC---TACAT
gi|77857 : TTGTTTCTGA--AA-CTC----C--G-TACCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------A----T-AT-AT-T-AC---TTCAT
gi|77858 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77859 : TTTTAACTGA--AA-GTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TGGTACATTG----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77860 : TTTTCTCTAA--AA-CTG----C--A-TGCCA-TAGCT-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GC-AT-C-AC---TTCAT
gi|77861 : TTTTCTTTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77862 : TTTTCTTTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77863 : TTTCTTCTAA--AAACTG----T--G-TATTA-CAGTC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77864 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAACC-GATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-ACTAATTCAT
gi|77865 : TTTCCTTTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-A-AC---TTCAT
gi|77866 : TTTTCTCTGA--AG-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----ATT------T-TG-------G----T-GT-AT-A-AT---TTCAT
gi|77867 : TTTTCTCTGA--AA-CTT----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77869 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTCAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77870 : TTTTCTCTGA--AAACTG----C--A-TATCG-CAGCC-ACTTGATATAAA-T------T-TG-------G----T-AT-AT-CAAC---TTCAT
gi|77871 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--G-TATCA-CAGCT-GCTTGAT----A-T------T-TG-------GT---T-AT-AC-C-AT---TTTAT
gi|77873 : TTTTGTCTGA--AA-CGG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-TT-AT-C-AC---TTTAT
gi|77874 : TTTTCTCTGT--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-GATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77875 : TTCTTTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77876 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAACC-ACTTGCT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-T-AC---ATCAT
gi|77878 : TTTTCTCTGA--AA-CTA----C--A-TATCA-CAGTC-AATTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77879 : TTTTCTCTGA--AA-CTA----C--A-TA-CA-CAGCC-A-TTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77880 : TTTTCTTTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAT----A-T------T-GG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77881 : TTTTCTCTAA--AA-TGA----C--G-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------TGTG-------G----T-AT-ATCC-AC---TTCAT
gi|77882 : TTTTCTCTAA--AA-TGA----C--G-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------TGTG-------G----T-AT-ATCC-AC---TTCAT
gi|77885 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--AATATCA-CAGCC-ACTTTAT----A-T------T-TG-------A----T-AT-AT-C-GA---TTCAT
gi|77887 : TTTTCTCTGA--AT-CTG----C--A-TATCA-AAGTC-GTTTGAC----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77888 : TTTTCTCAGC--AA-CTG----C--A-AATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-TT-TT-C-AC---TTCAT
gi|77889 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAT----A-TTTCAAAT-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTTAT
gi|77890 : TTTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-AATTGAT----A-TTTCAAAT-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTTAT
gi|77902 : TTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCG-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77903 : TTTCTCTGA--AA-CTG----A--A-CATCA-CAGCC-ACTTGCT----A-T------T-TG-------G----T-ATAAT-C-AC---TTCAT
gi|77904 : TTTTTCTAAGCAG-CTG----C--A-TTTCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-GT-AT-C-AT---TTCAT
gi|77905 : TTTCTCTGA--AA-CTG----C--T-TATCA-CAGCC-ACTTAGT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AC-C-AC---TTCAT
gi|77910 : TTTCTCTGA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCCAATTTGAT----A-C------T-TG-------G----T-GT-AT-G-AC---TTCAT
gi|77915 : TTCTCTAA--AA-CTG----T--G-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77916 : TTCTCTGA--AA-CTG----C--A-CATCA-CTGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G-------T-AT-C-AC---TTCAT
gi|77917 : TTCTCGGA--AA-CTG----C--G-TATCA-CAACC-TCTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AC-C-AC---TTCAT
gi|77918 : TTCTCTAA--AAACTG----T--G-TATTA-CAGTC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----TGAT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77919 : TTCTCTCA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-TGC----T-TG-------GTATAT-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77920 : TTCTCTCA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-TGC----T-TG-------GTATAT-AT-AT-C-AT---TTCAT
gi|77921 : TTCTCTCA--AA-CTG----C--A-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-TGC----T-TG-------GTATAT-AT-AT-C-AT---TTCAT
gi|77922 : TTCTCTAC--AC-CTG----TTGA--ATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77923 : TCTCTAA--AA-CTG----T--G-TATCAACAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77924 : TCTCTAA--AA-CTG----T--G-TATCAACAGCC-ACTTGAT----A-T------T--G-------G----T-AT-AT-C-AC---TTCAT
gi|77925 : TCTCTGA--AA-CTG----C--A-TCTCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------C-TG-------G----T-AT-AT-C-AC---TCCAT
gi|77926 : TCTCTGA--AA-CTA----C--A-AATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-
gi|77928 : -CTG----T--G-TATCA-CAGCC-ACTTGAT----A-T------T-TG-------G----T-AT-AT-C-TC---TTCAT