lowQualScore : 111
lowQualScore : 11 00 0 0 6666 0 11 1111111 1 00 0 0 1 0 0 333 0000 0 333 000 11 0 444 666 0 11111 5 0 0 11111 0 00 00 11 00
lowQualScore : .. .. . . .... . .. ....... . .. . . . . . ... .... . ... ... .. . ... ... . ..... . . . ..... . .. .. .. ..
lowQualScore : 11 99 7 6 8888 6 11 3333333 6 66 8 4 2 4 4 333 9999 4 333 777 00 4 333 444 4 00000 1 4 4 00000 4 66 66 00 66
consensus : AAATT--TTT--G-A-GTCTTN---A-TGT--GAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-G-CACT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TCAACCTTA
Reference ( gi|122269 ) : AAATT--TTT--G-A-GTCTTT---A-TGT--GAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-A-CACT---T--T-TCTCTG--TA--GC-T-----GTA-TA-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TCAACCTTA
gi|122265 : AAATT--ATT--G-A-GTCTTT---A-TGT--GAAAA-------A-G--A-T-A-T-T-T---C----A-TT-G-CACT---T--T-TCTCTG--CA--AT-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TCAACTTTA
gi|122263 : AAATT--AAT--A-A-GTCTTT---A-TGT--GAAAT-------A-G--A-T-A-T-T-C---C----G-TT-G-CAAT---T--T-TCTCTG--CA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TCAACCTTA
gi|122267 : AAATT--ATT--G-A-GTCTTT---A-TGT--GAAAT-------A-G--A-T---C-T-TT--C----G-TT-G-TACT---C--T-TCTCTG--CA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GCCACT--TC--ATA--TTAACCTTA
gi|122268 : AAATT--ATT--G-A-GTCTTT---A-TGT--GAAAT-------A-G--A-C-A-T-T-T---C----G-TT-A-CACT---T--T-TTTCTG--CA--AC-T-----GCA-TA-TCG-----C-A--GTCACT--TG--ATG--CTAACCTTA
gi|122271 : AAATT--ATT--A-A-GTCTTT---C-TGT--GAA-T-------A-T--A-T-A-T-T-TT-------G-TT-A-CACT---T--T-TCTCTG--CA--AC-T-----GCA-CA-TCA-----C-A--GCCACT--TA--ATA--TCAACCTTA
gi|122264 : AAATT--GCT--T-A-ATCTTT---A-TGT--GAAAT-------A-G--A-T-A-T-T-G---C----G-TT-G-CATT---T--T-TCTCTG--CA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TCAATCTTA
gi|122282 : AAATT--TTT--G-A-GTCTTA---A-TGT--GAAAT-------A------T---T-T-TT--C----G-TC-G-CACT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122277 : AAATT--TT---G-A-GTCTTA---A-TGT--GAAAT-------A-A--A-T-ATT-T-TT--C----G-TT-G-CACT---T--T-TCTTTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122274 : AAATG--TTT--T-A-GTCTTA---A-TGT--GAAAT-------A-G--A-T-A-T-T-TT--T----G-TT-G-TACT---T--T-TCTCAA--CA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----T-A--GCCATT--TG--ATA--TCAACC
gi|122278 : AAATT--TTG--G-A-GTCTTA---A-TGT--GAAAT-------A-A--T-T-A-T-T-TTT-C----G-TT-G-CACT---T--T-TCTTTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122266 : AAATT--GAT--T-A-TTCTTT---A-TGT--GAAAT-------A-G--A-T-A-T-T-T---C----G-TT-G-CAAC---A--T-TCTCTG--CA--AT-T-----GTA-TA-TCA-----C-A--GCCACA--TG--ATA--TCAACCTTA
gi|122279 : AAATT--TTG--G-A-GTCTTC---A-TGT--GAAAT-------A-A--A-T-ATT-T-TT--C----G-TT-G-CACTAAAT--C-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GGCAAT--TG--ATA--T
gi|122270 : AAATT--ATT--T-A-GTCTCT---A-TGT--GAAAC-------A-G--A-T-A-T-T-G---C----G-TT-G-CATT---T--T-TCTTTG--CA--AC-T-----GTT-TA-TCA-----C-A--GCCGCA--TG--ATA--TCAACTTTA
gi|122286 : AAATT--TTTTCA-A-GTCTTA---A-TGT--GAAGT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--T----G-TT-G-CACT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----TCA-TA-TCA-----C-A--GCCATG--TG--ATA--T
gi|122273 : AAATTAATTT--T-A-GTCTTT---A-TGT--GAA-T-------A-G--A-T-A-T-T-T---C----G-AT-G-CACT---T--T-TCTCTG--CA--ACTT-----GCT-TA-TCA-----C-A--GCCTCT--TGA-ATA--TCAACCTTA
gi|122280 : AAATT--TTG--G-A-GTCTTC---A-TGT--GAAAT-------A-A--A-T-ATT-T-TT--C----G-TT-G-CACT---TAAA-TCTCTC--TG--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GGCAAT--TG--ATA--T
gi|122275 : AAATT--ATT--G-G-GTCTCT---A-TGT--GAAAC-------A-G--A-T-A-T-T-TT--G----A-T--G-CACT---T--T-TTTCTA--CA--AC-T-----GCT-TA-TCA-----C-G--GTCACT--TG--ATA--CCCACCTTA
gi|122295 : AAATT--TTG--G-A-GTCTTA---A-TGT--GAA-T-------A-A----T-A-T-T-TT--C----G-TC-G-C--T---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ACA--T
gi|122296 : AAATT--TTG--G-A-GTCTTA---A-TGT--GA--T-------A-A----T-A-T-T-TT--C----G-TC-G-C--T---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ACA--T
gi|122272 : AAATT--ATT--T-A-GTCTCT---A-TGT--GAAAT-------T-G--A-T-A-T-T-T---C----G-AT-G-CACT---C--T-TCT--G--CA--AC-T-----GCT-TA-TCA-----C-G--GCCACT--TG--ATA--TCCACCTTA
gi|122276 : AAATT--ATT--G-G-GTCTCT---A-TGT--GAAAG-------A-G--A-T-A-T-T-T---C----G-AT-G-CACT---C--T-TCT--G--CA--AC-T-----GCT-CA-TCA-----C-G--GTCACT--TG--ATA--TCCATCTTA
gi|122281 : AAATT--ATG--G-A-GTCTTA---A-TGT--GATTT-------A-G--A-T-A-T-T-TT-------A-TT-G-CACT---T--T-TCTCTG--CA--AC-T-----GCA-TA-CCA-----C-A--GCCAAT--TG--AAA--T--ACCCTA
gi|122283 : AAATT--ATT--G-A-GTCTTT---A-TGT--GA--T-------A-A--A-G-A-TAT-TT--C----G-TT-G-CACT---T--T-TCTCTG--CA--GT-T-----GCA-TA-T
gi|122289 : AAATT--ATT--G-A-GTCTTT---A-TGC----AAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT-------G-TT-G-CACT---T--T-T-TCAG--CA--AC-T-----GCA-TA-TTG-----C-A--GCCACC--T
gi|122291 : AAATT--TTG--T-A-CTCTTT---A-TGT--GAAAT-------A-G--A-T-A-C-T-T-----------------CT---C--T-TC-------A--AC-T-----GTA-TA-TCATCGATC-ACTGCCACT--TG--ATG--TCAACCTTA
gi|122301 : AATT--TTT--G-A-GTCTTT---A-TGT--GAAAT-------A-G--A-T-A-T-T-TT--T----G-TC-G-CACT---T--T-CCCCTG--TA--AA-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GCCACT--TG--AGA--TCAACCGTA
gi|122303 : AATT--TTT--G-A-GTCGTA---T-TGT--GGAAT-------C-A--A-T-A-T-T-TT-------G-TC-A-CATT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GTG-TA-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TC
gi|122302 : AATT--TTT--G-A-GTCGTA---T-TGT--GGAAT-------C-A--A-T-A-T-T-TT-------G-TC-A-CATT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GTG-TA-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TC
gi|122304 : AATT--ATT--G-A-GTCTTT---A-T-------------------------------TT--C----G-TT-G-CACT---T--T-TCGCTG--CA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--TTCACT--TG--ATA--TCAACCTTA
gi|122326 : ATT--TTT--G-AAGTCT-----A-TGT--AAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-A-CACT---T--T-TCTCTG--CA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--ACCACT--TGGTATA--TCA
gi|122285 : tATT--TTG--G-A-GTCTTC---A-TGT--AAAAT-------A-A--A-T-A-T-G-TT--C----G-TC-A-CACT---T--T-ACTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TTA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122328 : aaatATT--TTG--G-A-GTTTTA---A-GGT--GAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-A-CATT---T--T-TCTTTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--ACCACT--TG--ATA--T
gi|122321 : tATT--TTG--G-A-GTCGTA---A-TGT--AAAAT-------A-G--G-T-A-T-T-TT--C----G-TT-A-CACT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TTA-----C-A--GCCACT--TG--ATA----GACCTT
gi|122324 : tATT--TTG--G-A-GTCTTA---A-TGT--CAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-A-CACT---T--T-TCTCTA--AA--AC-T-----GCA-TG-CCA-----T-A--GCTACT--TG--ATA--T
gi|122338 : tATT--TTG--G-A-GTCTTA---A-TGT--GAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TTT-C----G-TC-G-CACT---T--T-TCTCTG--AA--AT-T-----GCA-TA-TCA-----CAA--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122309 : ATT--TTT--G-A-GTCTTA---A-TGT--GGAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TA--T----G-CC-A-CACT---T--T-TCTCTG--TT--AC-T-----GCA-TA-TCA-----A-A--GACATT--TG--ATA--T
gi|122322 : ATT--TTG--G-A-GTCTTA---A-TGT--GAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-T----CACT---T--T-TCTCTG--AC--AC-T-----GCA-TA-TCA-----A-A--GTCATT--TG--ATA--T
gi|122308 : tATT--TTT--G-A-GTCTTG---A-TGT--GGAAT-------C-A--A-T-A-T-T-TT--C----A-TC-A-C-CT---TG-T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCG-CA-TCA-----C-A--GCCACT--TA--ATA--T
gi|122305 : ATA--TTT--G-A-GTCATA---A-TAT--GGAAT-------C-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-G-TACT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCG-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122336 : aatATT--TT-------GTCTTA---A-TGT--GAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TTT-C----G-TC-G-CACT---T--T-TCTCTG--AA--AC-C-----GCA-TA-TCA-----C-A--TCCAAT--TG--ATA--T
gi|122310 : ATT--TTT----A-GTCAGA---A-TGT--GAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--T----G-TT-G-CACT---T--T-CCTTTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122320 : ATT--TTG--G-A-GTCTTA---A-TGT--AAAAT-------G-A--A-T-A-T-T-TG--T----G-TT-A-CAAT---T--T-TCTCCG--AA--AC-T-----GCA-TT-TTA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122311 : tATT--TTT--T-A-GTCATA---A-TGT--GAAAT----------------A-T-T-TT--C----G-TT-G-CACT---T--T-TCTCTG--CA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GCTGCTAATG--AGA--TCAA
gi|122332 : ATT--TTC--G-A-GTCTTG---A-T-----AAATCTTTTTTA-G--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-G-CACT---A--T-TCTCTC--AA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122287 : tATT--TAG--G-A-GCCTTA---T-TGC--GAAAT-------A----------T-T-TT--C----T-TT-G-CACT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--ACCACT--TG--ATA--T
gi|122329 : aacttT--TTT--GCA-GTCTTTTTAA-TGT--AAAAT-------G-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-A-CACT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--ACCACT--TG--CTA--T
gi|122325 : taT--TTT--G-A-GTCTTA---A-TGT--GAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TTT-C----G-TT-G-CTTC---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----ATA-TA-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122331 : taT--TTT--G-A-GTCTTG---A-TGT--GGACT-------C-A--A-T-A-T-T-TT--C----A-TC-G-CACT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GAA-CA-TCA-----C-A--GCCACT--TG--CTA--T
gi|122299 : taT--TTG--G-A-GTATTG---A-TGG--AAAAT-------A-T--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-A-CACT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----ACA-TA-TCA-----C-A--ACCACT--TG--ATA--T
gi|122330 : aatagT--TTT--G-A-GTCTTG---A-TGT--GGAAT-------C-A--A-T-A-T-T-TT--C----A-TC-G-CA-----T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GAA-CA-TCA-----C-A--GCCACT--TG--CTA--T
gi|122306 : taT--TTT--C-A-GTCTTT---T-TGT--GAAAT-------G-A--G-C-A-T-AATT--C----GCTCTG-CACC---T--TGTCTTTGCCTC--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATAACTAAAACTTA
gi|122339 : aatta--TTT--G-A-GTCTTA---A-TGT--GAAAT-------T-A--A-T-A-T-T-TT--TTCGAG-TC-AGCAC----T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-TATTCA-----C-A--CCCAAT--TG--AT
gi|122343 : aTT--G-A-GTTTCT---G-TGT--GAAAT-------A-T--A-T-A-T-T-TT--G----G-TC-A-CACT---T--T-CCCCTG--CA--AC-A-----TCA-TA-TCA-----C-A--ACCACT--TG--ATA--TTTACCTTA
gi|122342 : TT--C-A-GTCTTA---A-TGT--GAAAT-------A-ATAA-TTA-T-T-TT--C----G-TC-G-CACT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----ACA-TA-TCA-----C-A--GTCAAT--TG--ATA--T
gi|122345 : TT--T-A-GTCTTA---A-TGT--GAAGT-------AGA--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-G-CATT---T--T-TCTCTG--AA--AA-T-----GCA-TA-CCA-----C-A--GGTACT--TG--CTA--
gi|122347 : TT--T-A-GTCTTA---A-TGT--GAAGT-------AGA--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-G-CATT---T--T-TCTCTG---A--AA-T-----GCA-TA-CCA-----C-A--GGTACT--TG--CTA--
gi|122346 : TT--T-A-GTCTTA---A-TGT--GAAGT-------AGA--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-G-CATT---T--T-TCTCTG---A--AA-T-----GCA-TA-CCA-----C-A--GGTACT--TG--CTA--
gi|122344 : TT--T-A-GTCTTA---A-TGT--AGAAT-------T-A--A-T-A-T-G-TT--C----G-TC-G-CACT---T--T-TCTCTG--AA--AC-A-----GCG-TA-ACA-----C-A--GTCACT--TA--ATA--T
gi|122351 : -A-GTCCTA---A-TAT--GAAAT-------A-T--A-T-A-T-T-T---C----G-TC-A-TACT---T--T-TCTCTG--AA--GC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122356 : -GTCCTT---C-CGTCCGAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-G-CACT---T--T-TCTATG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----T-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122357 : -GCCTTG---A-TGT--GAAAT-------ATA--A-T-T-T-T-TT--C----G-TC-G-CACT---T--T-T-TCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C----GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122358 : -GTCTTT-----T-C--AAAAC-------A-A--A-T-A-A-T-TT--C----G-TT-G-CATT---T--T-TCTCTG--AA--AA-T-----GGA-TA-CCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122353 : -GTCTCT---G-TCT--GAAAC-------A-G--A-T-A-T-T-TA--T----G-TT-G-CATT---T--T-TCTCAGA-TA---C-T-----ACA-TA-CCA-----C-A--GCCACT--TA--ATA--T
gi|122362 : TCTTT---A-TGT--GAAAT-------A-G--A-T-A-T-T-TT--C----A-AC-A-CACT---T--T-TCTCTT--CA--AC-T-----GTGTTA-TCA-----T-A--GCCACT--TG--ATA--TCAA
gi|122341 : TCTTA---A-TGT--AAAAT-------A-G--G-T-A-T-T-TTT-C----G-TC-A-CACT---T--T-TCTCTG--TA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GCCGAT--TG--ATA--T
gi|122360 : tttaggtaTCTTT---C-CGTCCAAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-G-CACT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--ACCGAT--TG--ATA--T
gi|122349 : TCTTT---A-TGT--GAAAT-------A-G--A-T-A-T-T-T----------------------------CTCTT--AA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GCCACT--TG--AGA--TCAACCTTA
gi|122359 : ttacTCTCT---AATGT--GAAAC-------G-A----T-A-T-T-T---C----G-CT-G-CAAT---T--T-TCTCTG--AACTGC-TTTTCTGT--TA-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T-AGCCTTA
gi|122365 : TCT---A-TCC--AAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT-------G-TT-G-CATT---A--T-TTTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-CCA-----C-A--ACCACT--TG--ATA--T
gi|122368 : ---A-TCT--GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-CC-A-CACT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCG-TA-TCA-----C-A--GCTGCT--TG--ATA--T
gi|122367 : ---A-TGT--GGAAT-------C-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-G-CAC----T--T-TCTTTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCG-----C-A--GCCATT--TG--ATA---CAA
gi|122319 : -TGT--GAAAT-------A-G--A-T-A-T-T-T---C----G-TT-G-CACT---T--T-TTTCTG--CA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TCAACCCTA
gi|122372 : ttatcagtgttctagGT--GAAAT-------A-A--A-A-T-T-T-TT--C----G-TC-A--ACT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----TCA-TA-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122376 : T--GAAAA-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-G-CACT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122375 : T--GAAAG-------A-A--A-T-A-T-T-TT--T----G-TC-A-CATT---T--T-TCTCAG--CA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GCCACC--TG--ATA--T
gi|122377 : T--GAAAC-------T-A--A-T-A-T-T-----C----G-TC-G-CACT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122378 : T--GAAAC-------T-A--A-T-A-T-T-----C----G-TC-G-CACT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GCCACT--TG---TA--T
gi|122386 : --GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-G-CACT---T--T-TCTCTA--AA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122387 : --GAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-G-CACT---T--T-TTTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TAA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122395 : --GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-A-CACT---T--T-TCTCTG--AA--AA-T-----GCA-TA-TAA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122398 : --GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--T----G-TC-G-CACT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122397 : --GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--T----G-TC-G-CACT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122383 : --GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TTTTC----G-TC-G-TACT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122394 : --GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--T----G-TT-A-CATT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-CCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122400 : --GAAAT-------T-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-G-CACT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--ACCAAT--TG--ATA--T
gi|122403 : --GAAAC-------A-G--A-T-A-T-T-TT--C----A-TC-A-CACT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-CA-TCA-----C-T--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122392 : --GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-G-CACT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-CA-TTG-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122379 : --GAAAC-------G-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-G-CATT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-CCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122384 : --GAAAC-------A-G--A-T-A-A-T-TT--C----G-TC-G-CACT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122404 : --GAAAA-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-G-CACT---T--C-TTTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122389 : --GAGAC-------A-A--A-T-A-T-T-----C----G-TC-G-CACT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCG-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122396 : --GAAAC-------A------T-A-T-T-TA--C----G-TC-G-CACT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122391 : --GAAAC-------A-A--AAT-A-T-T-TT--C----G-TT-G-CACT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--ACCAAT--TG--ATA--T
gi|122390 : --GAAAC-------A-A--AAT-A-T-T-TT--C----G-TT-G-CACT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--ACCAAT--TG--ATA--T
gi|122399 : --GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TA--C----G-TT-G-CACT---A--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-CA-TCA-----C-T--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122401 : --GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-T---C----G-TC-G-CACT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCA-----C-A--G-CAAT--TG--A
gi|122407 : AAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-G-CATT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-AA-TCA-----C-A--TCCACT--TG--ATA--T
gi|122408 : AAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-G-CATT---T--T-TCTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-CCA-----C-A--GCCACT--TT--AT
gi|122413 : -------A-A--A-T-A-T-T-----C----G-TC-G-CACT---T--T--CTCTG--AA--AC-T-----GCA-TA-TCG-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
Alignments
lowQualScore : 11 00 0 0 0 2222 1111111 1 00 0 0 0 0 0 333 0000 0 0 1111 0 0 00 0 0 1111111 0 11111 0 00 00 11 00
lowQualScore : .. .. . . . .... ....... . .. . . . . . ... .... . . .... . . .. . . ....... . ..... . .. .. .. ..
lowQualScore : 00 99 7 6 6 2222 3333333 6 66 8 4 8 4 4 333 9999 4 8 6666 4 4 55 4 4 3333333 4 00000 4 66 66 00 66
consensus : AAATT--TTT--G-A-GTCT-TN---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TCAACCTTA
Reference ( family-206 ) : AAATT--TTT--G-A-GTCT-TN---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TCAACCTTA
gi|122263 : AAATT--AAT--A-A-GTCT-TT---ATGTGAAAT-------A-G--A-T-A-T-T-C---C----G-TT-GCAAT----T-T-TCTCTGCA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TCAACCTTA
gi|122264 : AAATT--GCT--T-A-ATCT-TT---ATGTGAAAT-------A-G--A-T-A-T-T-G---C----G-TT-GCATT----T-T-TCTCTGCA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TCAATCTTA
gi|122265 : AAATT--ATT--G-A-GTCT-TT---ATGTGAAAA-------A-G--A-T-A-T-T-T---C----A-TT-GCACT----T-T-TCTCTGCA--AT-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TCAACTTTA
gi|122266 : AAATT--GAT--T-A-TTCT-TT---ATGTGAAAT-------A-G--A-T-A-T-T-T---C----G-TT-GCAAC----A-T-TCTCTGCA--AT-TGTA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACA--TG--ATA--TCAACCTTA
gi|122267 : AAATT--ATT--G-A-GTCT-TT---ATGTGAAAT-------A-G--A-T---C-T-TT--C----G-TT-GTACT----C-T-TCTCTGCA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TC--ATA--TTAACCTTA
gi|122268 : AAATT--ATT--G-A-GTCT-TT---ATGTGAAAT-------A-G--A-C-A-T-T-T---C----G-TT-ACACT----T-T-TTTCTGCA--AC-TGCA-T-------A-TCG-----C-A--GTCACT--TG--ATG--CTAACCTTA
gi|122269 : AAATT--TTT--G-A-GTCT-TT---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-ACACT----T-T-TCTCTGTA--GC-TGTA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TCAACCTTA
gi|122270 : AAATT--ATT--T-A-GTCT-CT---ATGTGAAAC-------A-G--A-T-A-T-T-G---C----G-TT-GCATT----T-T-TCTTTGCA--AC-TGTT-T-------A-TCA-----C-A--GCCGCA--TG--ATA--TCAACTTTA
gi|122271 : AAATT--ATT--A-A-GTCT-TT---CTGTGAA-T-------A-T--A-T-A-T-T-TT-------G-TT-ACACT----T-T-TCTCTGCA--AC-TGCA-C-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TA--ATA--TCAACCTTA
gi|122272 : AAATT--ATT--T-A-GTCT-CT---ATGTGAAAT-------T-G--A-T-A-T-T-T---C----G-AT-GCACT----C-T-TCT--GCA--AC-TGCT-T-------A-TCA-----C-G--GCCACT--TG--ATA--TCCACCTTA
gi|122273 : AAATTAATTT--T-A-GTCT-TT---ATGTGAA-T-------A-G--A-T-A-T-T-T---C----G-AT-GCACT----T-T-TCTCTGCA--ACTTGCT-T-------A-TCA-----C-A--GCCTCT--TGA-ATA--TCAACCTTA
gi|122274 : AAATG--TTT--T-A-GTCT-TA---ATGTGAAAT-------A-G--A-T-A-T-T-TT--T----G-TT-GTACT----T-T-TCTCAACA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----T-A--GCCATT--TG--ATA--TCAACC
gi|122275 : AAATT--ATT--G-G-GTCT-CT---ATGTGAAAC-------A-G--A-T-A-T-T-TT--G----A-T--GCACT----T-T-TTTCTACA--AC-TGCT-T-------A-TCA-----C-G--GTCACT--TG--ATA--CCCACCTTA
gi|122276 : AAATT--ATT--G-G-GTCT-CT---ATGTGAAAG-------A-G--A-T-A-T-T-T---C----G-AT-GCACT----C-T-TCT--GCA--AC-TGCT-C-------A-TCA-----C-G--GTCACT--TG--ATA--TCCATCTTA
gi|122277 : AAATT--TT---G-A-GTCT-TA---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TTT-C----G-TT-GCACT----T-T-TCTTTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122278 : AAATT--TTG--G-A-GTCT-TA---ATGTGAAAT-------A-A--T-T-A-T-T-TTT-C----G-TT-GCACT----T-T-TCTTTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122279 : AAATT--TTG--G-A-GTCT-TC---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-ATT-T-TT--C----G-TT-GCACTAAA-T-C-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GGCAAT--TG--ATA--T
gi|122280 : AAATT--TTG--G-A-GTCT-TC---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-ATT-T-TT--C----G-TT-GCACTTAAAT-C-TCTCTG----AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GGCAAT--TG--ATA--T
gi|122281 : AAATT--ATG--G-A-GTCT-TA---ATGTGATTT-------A-G--A-T-A-T-T-TT-------A-TT-GCACT----T-T-TCTCTGCA--AC-TGCA-T-------A-CCA-----C-A--GCCAAT--TG--AAA--T--ACCCTA
gi|122282 : AAATT--TTT--G-A-GTCT-TA---ATGTGAAAT-------A------T---T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122283 : AAATT--ATT--G-A-GTCT-TT---ATGTGA--T-------A-A--A-G-A-TAT-TT--C----G-TT-GCACT----T-T-TCTCTGCA--GT-TGCA-T-------A-T
gi|122285 : ATT--TTG--G-A-GTCT-TC---ATGTAAAAT-------A-A--A-T-A-T-G-TT--C----G-TC-ACACT----T-T-ACTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TTA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122286 : aaatAAATT--TTTTCA-A-GTCT-TA---ATGTGAAGT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--T----G-TT-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TTCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCATG--TG--ATA--T
gi|122287 : ATT--TAG--G-A-GCCT-TA---TTGCGAAAT-------A----------T-T-TT--C----T-TT-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--ACCACT--TG--ATA--T
gi|122289 : aacttAAATT--ATT--G-A-GTCT-TT---ATGC--AAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT-------G-TT-GCACT----T-T-T-TCAGCA--AC-TGCA-T-------A-TTG-----C-A--GCCACC--T
gi|122291 : AAATT--TTG--T-A-CTCT-TT---ATGTGAAAT-------A-G--A-T-A-C-T-T----------------CT----C-T-TC-----A--AC-TGTA-T-------A-TCATCGATC-ACTGCCACT--TG--ATG--TCAACCTTA
gi|122295 : AAATT--TTG--G-A-GTCT-TA---ATGTGAA-T-------A-A----T-A-T-T-TT--C----G-TC-GC--T----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ACA--T
gi|122296 : AAATT--TTG--G-A-GTCT-TA---ATGTGA--T-------A-A----T-A-T-T-TT--C----G-TC-GC--T----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ACA--T
gi|122299 : T--TTG--G-A-GTAT-TG---ATGGAAAAT-------A-T--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-ACACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TACA-T-------A-TCA-----C-A--ACCACT--TG--ATA--T
gi|122301 : aatagAATT--TTT--G-A-GTCT-TT---ATGTGAAAT-------A-G--A-T-A-T-T-TT--T----G-TC-GCACT----T-T-CCCCTGTA--AA-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--AGA--TCAACCGTA
gi|122302 : AATT--TTT--G-A-GTCG-TA---TTGTGGAAT-------C-A--A-T-A-T-T-TT-------G-TC-ACATT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGTG-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TC
gi|122303 : AATT--TTT--G-A-GTCG-TA---TTGTGGAAT-------C-A--A-T-A-T-T-TT-------G-TC-ACATT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGTG-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TC
gi|122304 : AATT--ATT--G-A-GTCT-TT---AT-----------------------------TT--C----G-TT-GCACT----T-T-TCGCTGCA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--TTCACT--TG--ATA--TCAACCTTA
gi|122305 : ATA--TTT--G-A-GTCA-TA---ATATGGAAT-------C-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-GTACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCG-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122306 : aatT--TTT--C-A-GTCT-TT---TTGTGAAAT-------G-A--G-C-A-T-AATT--C----GCTCTGCACC----T-TGTCTTTGCCTCAC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATAACTAAAACTTA
gi|122308 : aattaATT--TTT--G-A-GTCT-TG---ATGTGGAAT-------C-A--A-T-A-T-T-TT--C----A-TC-AC-CT----TGT-TCTCTGAA--AC-TGCG-C-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TA--ATA--T
gi|122309 : ATT--TTT--G-A-GTCT-TA---ATGTGGAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TA--T----G-CC-ACACT----T-T-TCTCTGTT--AC-TGCA-T-------A-TCA-----A-A--GACATT--TG--ATA--T
gi|122310 : ATT--TTT----A-GTCA-GA---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--T----G-TT-GCACT----T-T-CCTTTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122311 : ATT--TTT--T-A-GTCA-TA---ATGTGAAAT----------------A-T-T-TT--C----G-TT-GCACT----T-T-TCTCTGCA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCTGCTAATG--AGA--TCAA
gi|122319 : -GTTC-TA---GTGTGAAAT-------A-G--A-T-A-T-T-T---C----G-TT-GCACT----T-T-TTTCTGCA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TCAACCCTA
gi|122320 : ttatcagtATT--TTG--G-A-GTCT-TA---ATGTAAAAT-------G-A--A-T-A-T-T-TG--T----G-TT-ACAAT----T-T-TCTCCGAA--AC-TGCA-T-------T-TTA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122321 : tATT--TTG--G-A-GTCG-TA---ATGTAAAAT-------A-G--G-T-A-T-T-TT--C----G-TT-ACACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TTA-----C-A--GCCACT--TG--ATA----GACCTT
gi|122322 : tATT--TTG--G-A-GTCT-TA---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-T---CACT----T-T-TCTCTGAC--AC-TGCA-T-------A-TCA-----A-A--GTCATT--TG--ATA--T
gi|122324 : tATT--TTG--G-A-GTCT-TA---ATGTCAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-ACACT----T-T-TCTCTAAA--AC-TGCA-T-------G-CCA-----T-A--GCTACT--TG--ATA--T
gi|122325 : tT--TTT--G-A-GTCT-TA---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TTT-C----G-TT-GCTTC----T-T-TCTCTGAA--AC-TATA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122326 : taATT--TTT--G-AAGTCT------ATGTAAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-ACACT----T-T-TCTCTGCA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--ACCACT--TGGTATA--TCA
gi|122328 : tATT--TTG--G-A-GTTT-TA---AGGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-ACATT----T-T-TCTTTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--ACCACT--TG--ATA--T
gi|122329 : tT--TTT--GCA-GTCT-TTTTAATGTAAAAT-------G-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-ACACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--ACCACT--TG--CTA--T
gi|122330 : taT--TTT--G-A-GTCT-TG---ATGTGGAAT-------C-A--A-T-A-T-T-TT--C----A-TC-GCA------T-T-TCTCTGAA--AC-TGAA-C-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--CTA--T
gi|122331 : taT--TTT--G-A-GTCT-TG---ATGTGGACT-------C-A--A-T-A-T-T-TT--C----A-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGAA-C-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--CTA--T
gi|122332 : taATT--TTC--G-A-GTCT-TG---AT---AAATCTTTTTTA-G--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----A-T-TCTCTCAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122336 : tATT--TT-------GTCT-TA---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TTT-C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-CGCA-T-------A-TCA-----C-A--TCCAAT--TG--ATA--T
gi|122338 : ATT--TTG--G-A-GTCT-TA---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TTT-C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AT-TGCA-T-------A-TCA-----CAA--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122339 : --TTT--G-A-GTCT-TA---ATGTGAAAT-------T-A--A-T-A-T-T-TT--TTCGAG-TCAGCAC-----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------ATTCA-----C-A--CCCAAT--TG--AT
gi|122341 : aTCT-TA---ATGTAAAAT-------A-G--G-T-A-T-T-TTT-C----G-TC-ACACT----T-T-TCTCTGTA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCGAT--TG--ATA--T
gi|122342 : tttaggtaTT--C-A-GTCT-TA---ATGTGAAAT-------A-ATAA-TTA-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TACA-T-------A-TCA-----C-A--GTCAAT--TG--ATA--T
gi|122343 : TT--G-A-GTTT-CT---GTGTGAAAT-------A-T--A-T-A-T-T-TT--G----G-TC-ACACT----T-T-CCCCTGCA--AC-ATCA-T-------A-TCA-----C-A--ACCACT--TG--ATA--TTTACCTTA
gi|122344 : TT--T-A-GTCT-TA---ATGTAGAAT-------T-A--A-T-A-T-G-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-AGCG-T-------A-ACA-----C-A--GTCACT--TA--ATA--T
gi|122345 : TT--T-A-GTCT-TA---ATGTGAAGT-------AGA--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCATT----T-T-TCTCTGAA--AA-TGCA-T-------A-CCA-----C-A--GGTACT--TG--CTA--
gi|122346 : TT--T-A-GTCT-TA---ATGTGAAGT-------AGA--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCATT----T-T-TCTCTGAA--A--TGCA-T-------A-CCA-----C-A--GGTACT--TG--CTA--
gi|122347 : TT--T-A-GTCT-TA---ATGTGAAGT-------AGA--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCATT----T-T-TCTCTGAA--A--TGCA-T-------A-CCA-----C-A--GGTACT--TG--CTA--
gi|122349 : TCT-TT---ATGTGAAAT-------A-G--A-T-A----------------------------T-T-TCTCTTAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--AGA--TCAACCTTA
gi|122351 : ttac-A-GTCC-TA---ATATGAAAT-------A-T--A-T-A-T-T-T---C----G-TC-ATACT----T-T-TCTCTGAA--GC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122353 : -GTCT-CT---GTCTGAAAC-------A-G--A-T-A-T-T-TA--T----G-TT-GCATT----T-T-TCTCAGAT--AC-TACA-T-------A-CCA-----C-A--GCCACT--TA--ATA--T
gi|122356 : GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTATGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----T-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122357 : gtccttccgtcc-GCCT-TG---ATGTGAAAT-------ATA--A-T-T-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-T-TCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C----GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122358 : AAAC-------A-A--A-T-A-A-T-TT--C----G-TT-GCATT----T-T-TCTCTGAA--AA-TGGA-T-------A-CCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122359 : gtcttttcaTCTCTA---ATGTGAAAC-------G-A----T-A-T-T-T---C----G-CT-GCAAT----T-T-TCTCTGAA---C-TGCT-TTTCTGTTA-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T-AGCCTTA
gi|122360 : AAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--ACCGAT--TG--ATA--T
gi|122362 : tctttccgtccaTCT-TT---ATGTGAAAT-------A-G--A-T-A-T-T-TT--C----A-AC-ACACT----T-T-TCTCTTCA--AC-TGTGTT-------A-TCA-----T-A--GCCACT--TG--ATA--TCAA
gi|122365 : AAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT-------G-TT-GCATT----A-T-TTTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-CCA-----C-A--ACCACT--TG--ATA--T
gi|122367 : tctatcca---ATGTGGAAT-------C-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-GCACT----T-T--CTTTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCG-----C-A--GCCATT--TG--ATA---CAA
gi|122368 : ---ATCTGAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-CC-ACACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCG-T-------A-TCA-----C-A--GCTGCT--TG--ATA--T
gi|122372 : GTGAAAT-------A-A--A-A-T-T-T-TT--C----G-TC-A-ACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TTCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122375 : TGAAAG-------A-A--A-T-A-T-T-TT--T----G-TC-ACATT----T-T-TCTCAGCA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACC--TG--ATA--T
gi|122376 : TGAAAA-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122377 : TGAAAC-------T-A--A-T-A-T-T-----C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122378 : TGAAAC-------T-A--A-T-A-T-T-----C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG---TA--T
gi|122379 : GAAAC-------G-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-GCATT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-CCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122383 : GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TTTTC----G-TC-GTACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122384 : GAAAC-------A-G--A-T-A-A-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122386 : GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTAAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122387 : GAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TTTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TAA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122389 : GAGAC-------A-A--A-T-A-T-T-----C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCG-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122390 : GAAAC-------A-A--AAT-A-T-T-TT--C----G-TT-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--ACCAAT--TG--ATA--T
gi|122391 : GAAAC-------A-A--AAT-A-T-T-TT--C----G-TT-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--ACCAAT--TG--ATA--T
gi|122392 : GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-C-------A-TTG-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122394 : GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--T----G-TT-ACATT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-CCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122395 : GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-ACACT----T-T-TCTCTGAA--AA-TGCA-T-------A-TAA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122396 : GAAAC-------A------T-A-T-T-TA--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122397 : GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--T----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122398 : GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--T----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122399 : GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TA--C----G-TT-GCACT----A-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-C-------A-TCA-----C-T--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122400 : GAAAT-------T-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--ACCAAT--TG--ATA--T
gi|122401 : GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-T---C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--G-CAAT--TG--A
gi|122403 : GAAAC-------A-G--A-T-A-T-T-TT--C----A-TC-ACACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-C-------A-TCA-----C-T--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122404 : GAAAA-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-C-TTTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122407 : AAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-GCATT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-A-------A-TCA-----C-A--TCCACT--TG--ATA--T
gi|122408 : AAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-GCATT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-CCA-----C-A--GCCACT--TT--AT
gi|122413 : -------A-A--A-T-A-T-T-----C----G-TC-GCACT----T-T--CTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCG-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
Alignments
lowQualScore : 11 00 0 0 0 2222 1111111 1 00 0 0 0 0 0 333 0000 0 0 1111 0 0 00 0 0 1111111 0 11111 0 00 00 11 00
lowQualScore : .. .. . . . .... ....... . .. . . . . . ... .... . . .... . . .. . . ....... . ..... . .. .. .. ..
lowQualScore : 00 99 7 6 6 2222 3333333 6 66 8 4 8 4 4 333 9999 4 8 6666 4 4 55 4 4 3333333 4 00000 4 66 66 00 66
consensus : AAATT--TTT--G-A-GTCT-TN---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TCAACCTTA
Reference ( family-206 ) : AAATT--TTT--G-A-GTCT-TN---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TCAACCTTA
gi|122263 : AAATT--AAT--A-A-GTCT-TT---ATGTGAAAT-------A-G--A-T-A-T-T-C---C----G-TT-GCAAT----T-T-TCTCTGCA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TCAACCTTA
gi|122264 : AAATT--GCT--T-A-ATCT-TT---ATGTGAAAT-------A-G--A-T-A-T-T-G---C----G-TT-GCATT----T-T-TCTCTGCA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TCAATCTTA
gi|122265 : AAATT--ATT--G-A-GTCT-TT---ATGTGAAAA-------A-G--A-T-A-T-T-T---C----A-TT-GCACT----T-T-TCTCTGCA--AT-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TCAACTTTA
gi|122266 : AAATT--GAT--T-A-TTCT-TT---ATGTGAAAT-------A-G--A-T-A-T-T-T---C----G-TT-GCAAC----A-T-TCTCTGCA--AT-TGTA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACA--TG--ATA--TCAACCTTA
gi|122267 : AAATT--ATT--G-A-GTCT-TT---ATGTGAAAT-------A-G--A-T---C-T-TT--C----G-TT-GTACT----C-T-TCTCTGCA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TC--ATA--TTAACCTTA
gi|122268 : AAATT--ATT--G-A-GTCT-TT---ATGTGAAAT-------A-G--A-C-A-T-T-T---C----G-TT-ACACT----T-T-TTTCTGCA--AC-TGCA-T-------A-TCG-----C-A--GTCACT--TG--ATG--CTAACCTTA
gi|122269 : AAATT--TTT--G-A-GTCT-TT---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-ACACT----T-T-TCTCTGTA--GC-TGTA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TCAACCTTA
gi|122270 : AAATT--ATT--T-A-GTCT-CT---ATGTGAAAC-------A-G--A-T-A-T-T-G---C----G-TT-GCATT----T-T-TCTTTGCA--AC-TGTT-T-------A-TCA-----C-A--GCCGCA--TG--ATA--TCAACTTTA
gi|122271 : AAATT--ATT--A-A-GTCT-TT---CTGTGAA-T-------A-T--A-T-A-T-T-TT-------G-TT-ACACT----T-T-TCTCTGCA--AC-TGCA-C-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TA--ATA--TCAACCTTA
gi|122272 : AAATT--ATT--T-A-GTCT-CT---ATGTGAAAT-------T-G--A-T-A-T-T-T---C----G-AT-GCACT----C-T-TCT--GCA--AC-TGCT-T-------A-TCA-----C-G--GCCACT--TG--ATA--TCCACCTTA
gi|122273 : AAATTAATTT--T-A-GTCT-TT---ATGTGAA-T-------A-G--A-T-A-T-T-T---C----G-AT-GCACT----T-T-TCTCTGCA--ACTTGCT-T-------A-TCA-----C-A--GCCTCT--TGA-ATA--TCAACCTTA
gi|122274 : AAATG--TTT--T-A-GTCT-TA---ATGTGAAAT-------A-G--A-T-A-T-T-TT--T----G-TT-GTACT----T-T-TCTCAACA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----T-A--GCCATT--TG--ATA--TCAACC
gi|122275 : AAATT--ATT--G-G-GTCT-CT---ATGTGAAAC-------A-G--A-T-A-T-T-TT--G----A-T--GCACT----T-T-TTTCTACA--AC-TGCT-T-------A-TCA-----C-G--GTCACT--TG--ATA--CCCACCTTA
gi|122276 : AAATT--ATT--G-G-GTCT-CT---ATGTGAAAG-------A-G--A-T-A-T-T-T---C----G-AT-GCACT----C-T-TCT--GCA--AC-TGCT-C-------A-TCA-----C-G--GTCACT--TG--ATA--TCCATCTTA
gi|122277 : AAATT--TT---G-A-GTCT-TA---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TTT-C----G-TT-GCACT----T-T-TCTTTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122278 : AAATT--TTG--G-A-GTCT-TA---ATGTGAAAT-------A-A--T-T-A-T-T-TTT-C----G-TT-GCACT----T-T-TCTTTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122279 : AAATT--TTG--G-A-GTCT-TC---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-ATT-T-TT--C----G-TT-GCACTAAA-T-C-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GGCAAT--TG--ATA--T
gi|122280 : AAATT--TTG--G-A-GTCT-TC---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-ATT-T-TT--C----G-TT-GCACTTAAAT-C-TCTCTG----AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GGCAAT--TG--ATA--T
gi|122281 : AAATT--ATG--G-A-GTCT-TA---ATGTGATTT-------A-G--A-T-A-T-T-TT-------A-TT-GCACT----T-T-TCTCTGCA--AC-TGCA-T-------A-CCA-----C-A--GCCAAT--TG--AAA--T--ACCCTA
gi|122282 : AAATT--TTT--G-A-GTCT-TA---ATGTGAAAT-------A------T---T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122283 : AAATT--ATT--G-A-GTCT-TT---ATGTGA--T-------A-A--A-G-A-TAT-TT--C----G-TT-GCACT----T-T-TCTCTGCA--GT-TGCA-T-------A-T
gi|122285 : ATT--TTG--G-A-GTCT-TC---ATGTAAAAT-------A-A--A-T-A-T-G-TT--C----G-TC-ACACT----T-T-ACTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TTA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122286 : aaatAAATT--TTTTCA-A-GTCT-TA---ATGTGAAGT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--T----G-TT-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TTCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCATG--TG--ATA--T
gi|122287 : ATT--TAG--G-A-GCCT-TA---TTGCGAAAT-------A----------T-T-TT--C----T-TT-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--ACCACT--TG--ATA--T
gi|122289 : aacttAAATT--ATT--G-A-GTCT-TT---ATGC--AAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT-------G-TT-GCACT----T-T-T-TCAGCA--AC-TGCA-T-------A-TTG-----C-A--GCCACC--T
gi|122291 : AAATT--TTG--T-A-CTCT-TT---ATGTGAAAT-------A-G--A-T-A-C-T-T----------------CT----C-T-TC-----A--AC-TGTA-T-------A-TCATCGATC-ACTGCCACT--TG--ATG--TCAACCTTA
gi|122295 : AAATT--TTG--G-A-GTCT-TA---ATGTGAA-T-------A-A----T-A-T-T-TT--C----G-TC-GC--T----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ACA--T
gi|122296 : AAATT--TTG--G-A-GTCT-TA---ATGTGA--T-------A-A----T-A-T-T-TT--C----G-TC-GC--T----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ACA--T
gi|122299 : T--TTG--G-A-GTAT-TG---ATGGAAAAT-------A-T--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-ACACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TACA-T-------A-TCA-----C-A--ACCACT--TG--ATA--T
gi|122301 : aatagAATT--TTT--G-A-GTCT-TT---ATGTGAAAT-------A-G--A-T-A-T-T-TT--T----G-TC-GCACT----T-T-CCCCTGTA--AA-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--AGA--TCAACCGTA
gi|122302 : AATT--TTT--G-A-GTCG-TA---TTGTGGAAT-------C-A--A-T-A-T-T-TT-------G-TC-ACATT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGTG-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TC
gi|122303 : AATT--TTT--G-A-GTCG-TA---TTGTGGAAT-------C-A--A-T-A-T-T-TT-------G-TC-ACATT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGTG-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TC
gi|122304 : AATT--ATT--G-A-GTCT-TT---AT-----------------------------TT--C----G-TT-GCACT----T-T-TCGCTGCA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--TTCACT--TG--ATA--TCAACCTTA
gi|122305 : ATA--TTT--G-A-GTCA-TA---ATATGGAAT-------C-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-GTACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCG-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122306 : aatT--TTT--C-A-GTCT-TT---TTGTGAAAT-------G-A--G-C-A-T-AATT--C----GCTCTGCACC----T-TGTCTTTGCCTCAC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATAACTAAAACTTA
gi|122308 : aattaATT--TTT--G-A-GTCT-TG---ATGTGGAAT-------C-A--A-T-A-T-T-TT--C----A-TC-AC-CT----TGT-TCTCTGAA--AC-TGCG-C-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TA--ATA--T
gi|122309 : ATT--TTT--G-A-GTCT-TA---ATGTGGAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TA--T----G-CC-ACACT----T-T-TCTCTGTT--AC-TGCA-T-------A-TCA-----A-A--GACATT--TG--ATA--T
gi|122310 : ATT--TTT----A-GTCA-GA---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--T----G-TT-GCACT----T-T-CCTTTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122311 : ATT--TTT--T-A-GTCA-TA---ATGTGAAAT----------------A-T-T-TT--C----G-TT-GCACT----T-T-TCTCTGCA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCTGCTAATG--AGA--TCAA
gi|122319 : -GTTC-TA---GTGTGAAAT-------A-G--A-T-A-T-T-T---C----G-TT-GCACT----T-T-TTTCTGCA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TCAACCCTA
gi|122320 : ttatcagtATT--TTG--G-A-GTCT-TA---ATGTAAAAT-------G-A--A-T-A-T-T-TG--T----G-TT-ACAAT----T-T-TCTCCGAA--AC-TGCA-T-------T-TTA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122321 : tATT--TTG--G-A-GTCG-TA---ATGTAAAAT-------A-G--G-T-A-T-T-TT--C----G-TT-ACACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TTA-----C-A--GCCACT--TG--ATA----GACCTT
gi|122322 : tATT--TTG--G-A-GTCT-TA---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-T---CACT----T-T-TCTCTGAC--AC-TGCA-T-------A-TCA-----A-A--GTCATT--TG--ATA--T
gi|122324 : tATT--TTG--G-A-GTCT-TA---ATGTCAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-ACACT----T-T-TCTCTAAA--AC-TGCA-T-------G-CCA-----T-A--GCTACT--TG--ATA--T
gi|122325 : tT--TTT--G-A-GTCT-TA---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TTT-C----G-TT-GCTTC----T-T-TCTCTGAA--AC-TATA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122326 : taATT--TTT--G-AAGTCT------ATGTAAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-ACACT----T-T-TCTCTGCA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--ACCACT--TGGTATA--TCA
gi|122328 : tATT--TTG--G-A-GTTT-TA---AGGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-ACATT----T-T-TCTTTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--ACCACT--TG--ATA--T
gi|122329 : tT--TTT--GCA-GTCT-TTTTAATGTAAAAT-------G-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-ACACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--ACCACT--TG--CTA--T
gi|122330 : taT--TTT--G-A-GTCT-TG---ATGTGGAAT-------C-A--A-T-A-T-T-TT--C----A-TC-GCA------T-T-TCTCTGAA--AC-TGAA-C-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--CTA--T
gi|122331 : taT--TTT--G-A-GTCT-TG---ATGTGGACT-------C-A--A-T-A-T-T-TT--C----A-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGAA-C-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--CTA--T
gi|122332 : taATT--TTC--G-A-GTCT-TG---AT---AAATCTTTTTTA-G--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----A-T-TCTCTCAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122336 : tATT--TT-------GTCT-TA---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TTT-C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-CGCA-T-------A-TCA-----C-A--TCCAAT--TG--ATA--T
gi|122338 : ATT--TTG--G-A-GTCT-TA---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TTT-C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AT-TGCA-T-------A-TCA-----CAA--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122339 : --TTT--G-A-GTCT-TA---ATGTGAAAT-------T-A--A-T-A-T-T-TT--TTCGAG-TCAGCAC-----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------ATTCA-----C-A--CCCAAT--TG--AT
gi|122341 : aTCT-TA---ATGTAAAAT-------A-G--G-T-A-T-T-TTT-C----G-TC-ACACT----T-T-TCTCTGTA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCGAT--TG--ATA--T
gi|122342 : tttaggtaTT--C-A-GTCT-TA---ATGTGAAAT-------A-ATAA-TTA-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TACA-T-------A-TCA-----C-A--GTCAAT--TG--ATA--T
gi|122343 : TT--G-A-GTTT-CT---GTGTGAAAT-------A-T--A-T-A-T-T-TT--G----G-TC-ACACT----T-T-CCCCTGCA--AC-ATCA-T-------A-TCA-----C-A--ACCACT--TG--ATA--TTTACCTTA
gi|122344 : TT--T-A-GTCT-TA---ATGTAGAAT-------T-A--A-T-A-T-G-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-AGCG-T-------A-ACA-----C-A--GTCACT--TA--ATA--T
gi|122345 : TT--T-A-GTCT-TA---ATGTGAAGT-------AGA--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCATT----T-T-TCTCTGAA--AA-TGCA-T-------A-CCA-----C-A--GGTACT--TG--CTA--
gi|122346 : TT--T-A-GTCT-TA---ATGTGAAGT-------AGA--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCATT----T-T-TCTCTGAA--A--TGCA-T-------A-CCA-----C-A--GGTACT--TG--CTA--
gi|122347 : TT--T-A-GTCT-TA---ATGTGAAGT-------AGA--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCATT----T-T-TCTCTGAA--A--TGCA-T-------A-CCA-----C-A--GGTACT--TG--CTA--
gi|122349 : TCT-TT---ATGTGAAAT-------A-G--A-T-A----------------------------T-T-TCTCTTAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--AGA--TCAACCTTA
gi|122351 : ttac-A-GTCC-TA---ATATGAAAT-------A-T--A-T-A-T-T-T---C----G-TC-ATACT----T-T-TCTCTGAA--GC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122353 : -GTCT-CT---GTCTGAAAC-------A-G--A-T-A-T-T-TA--T----G-TT-GCATT----T-T-TCTCAGAT--AC-TACA-T-------A-CCA-----C-A--GCCACT--TA--ATA--T
gi|122356 : GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTATGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----T-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122357 : gtccttccgtcc-GCCT-TG---ATGTGAAAT-------ATA--A-T-T-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-T-TCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C----GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122358 : AAAC-------A-A--A-T-A-A-T-TT--C----G-TT-GCATT----T-T-TCTCTGAA--AA-TGGA-T-------A-CCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122359 : gtcttttcaTCTCTA---ATGTGAAAC-------G-A----T-A-T-T-T---C----G-CT-GCAAT----T-T-TCTCTGAA---C-TGCT-TTTCTGTTA-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T-AGCCTTA
gi|122360 : AAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--ACCGAT--TG--ATA--T
gi|122362 : tctttccgtccaTCT-TT---ATGTGAAAT-------A-G--A-T-A-T-T-TT--C----A-AC-ACACT----T-T-TCTCTTCA--AC-TGTGTT-------A-TCA-----T-A--GCCACT--TG--ATA--TCAA
gi|122365 : AAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT-------G-TT-GCATT----A-T-TTTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-CCA-----C-A--ACCACT--TG--ATA--T
gi|122367 : tctatcca---ATGTGGAAT-------C-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-GCACT----T-T--CTTTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCG-----C-A--GCCATT--TG--ATA---CAA
gi|122368 : ---ATCTGAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-CC-ACACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCG-T-------A-TCA-----C-A--GCTGCT--TG--ATA--T
gi|122372 : GTGAAAT-------A-A--A-A-T-T-T-TT--C----G-TC-A-ACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TTCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122375 : TGAAAG-------A-A--A-T-A-T-T-TT--T----G-TC-ACATT----T-T-TCTCAGCA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACC--TG--ATA--T
gi|122376 : TGAAAA-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122377 : TGAAAC-------T-A--A-T-A-T-T-----C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122378 : TGAAAC-------T-A--A-T-A-T-T-----C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG---TA--T
gi|122379 : GAAAC-------G-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-GCATT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-CCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122383 : GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TTTTC----G-TC-GTACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122384 : GAAAC-------A-G--A-T-A-A-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122386 : GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTAAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122387 : GAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TTTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TAA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122389 : GAGAC-------A-A--A-T-A-T-T-----C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCG-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122390 : GAAAC-------A-A--AAT-A-T-T-TT--C----G-TT-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--ACCAAT--TG--ATA--T
gi|122391 : GAAAC-------A-A--AAT-A-T-T-TT--C----G-TT-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--ACCAAT--TG--ATA--T
gi|122392 : GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-C-------A-TTG-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122394 : GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--T----G-TT-ACATT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-CCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122395 : GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-ACACT----T-T-TCTCTGAA--AA-TGCA-T-------A-TAA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122396 : GAAAC-------A------T-A-T-T-TA--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122397 : GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--T----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122398 : GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--T----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122399 : GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TA--C----G-TT-GCACT----A-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-C-------A-TCA-----C-T--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122400 : GAAAT-------T-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--ACCAAT--TG--ATA--T
gi|122401 : GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-T---C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--G-CAAT--TG--A
gi|122403 : GAAAC-------A-G--A-T-A-T-T-TT--C----A-TC-ACACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-C-------A-TCA-----C-T--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122404 : GAAAA-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-C-TTTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122407 : AAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-GCATT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-A-------A-TCA-----C-A--TCCACT--TG--ATA--T
gi|122408 : AAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-GCATT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-CCA-----C-A--GCCACT--TT--AT
gi|122413 : -------A-A--A-T-A-T-T-----C----G-TC-GCACT----T-T--CTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCG-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
blockSeqs : AA TTTA CTTTTTT G TTT TAAA TTCTGTT TCGAT
blockSeqs : . T . G TT AAA . .
blockSeqs : . T . G TT . . .
blockSeqs : . T . T TT . . .
blockSeqs : . T . . TT . . .
blockSeqs : . T . . TT . . .
blockSeqs : . T . . TT . . .
blockSeqs : . T . . T . . .
blockSeqs : . T . . T . . .
blockSeqs : . T . . T . . .
blockSeqs : . T . . T . . .
blockSeqs : . A . . T . . .
blockSeqs : . T . . T . . .
blockSeqs : . T . . T . . .
blockSeqs : . A . . T . . .
blockSeqs : . A . . T . . .
blockSeqs : . C . . T . . .
blockSeqs : . C . . T . . .
blockSeqs : . A . . T . . .
blockSeqs : . A . . T . . .
blockSeqs : . T . . T . . .
blockSeqs : . C . . T . . .
blockSeqs : . A . . T . . .
blockSeqs : . A . . T . . .
blockSeqs : . T . . T . . .
blockSeqs : . T . . T . . .
blockSeqs : . A . . T . . .
blockSeqs : . A . . T . . .
blockSeqs : . G . . T . . .
blockSeqs : . T . . T . . .
blockSeqs : . A . . T . . .
blockSeqs : . A . . A . . .
blockSeqs : . T . . T . . .
blockSeqs : . A . . T . . .
blockSeqs : . T . . G . . .
blockSeqs : . G . . T . . .
blockSeqs : . A . . T . . .
blockSeqs : . A . . T . . .
blockSeqs : . A . . T . . .
blockSeqs : . A . . T . . .
blockSeqs : . A . . T . . .
blockSeqs : . A . . T . . .
blockSeqs : . A . . T . . .
blockSeqs : . A . . T . . .
blockSeqs : . A . . T . . .
blockSeqs : . A . . T . . .
blockSeqs : . G . . T . . .
blockSeqs : . G . . T . . .
blockSeqs : . G . . T . . .
blockSeqs : . A . . T . . .
blockSeqs : . A . . T . . .
blockSeqs : . A . . A . . .
blockSeqs : A . . T . . .
blockSeqs : A . . T . . .
blockSeqs : T . . T . . .
blockSeqs : A . . T . . .
blockSeqs : A . . T . . .
blockSeqs : A . . T . . .
blockSeqs : A . . T . . .
blockSeqs : T . . T . . .
blockSeqs : A . . T . . .
blockSeqs : T . . T . . .
blockSeqs : G . . T . . .
blockSeqs : A . . T . . .
blockSeqs : T . . T . . .
blockSeqs : . . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . A . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . A . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . T . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqs : . . . . .
blockSeqCons : T**
originalCons : AAATT--TTT--G-A-GTCT-TN---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TCAACCTTA
finalCons : AAATT--TTT--G-A-GTCT-TN---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TCAACCTTA
Alignments
lowQualScore : 11 00 0 0 0 2222 1111111 1 00 0 0 0 0 0 333 0000 0 0 1111 0 0 00 0 0 1111111 0 11111 0 00 00 11 00
lowQualScore : .. .. . . . .... ....... . .. . . . . . ... .... . . .... . . .. . . ....... . ..... . .. .. .. ..
lowQualScore : 00 99 7 6 6 2222 3333333 6 66 8 4 8 4 4 333 9999 4 8 6666 4 4 55 4 4 3333333 4 00000 4 66 66 00 66
consensus : AAATT--TTT--G-A-GTCT-TN---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TCAACCTTA
Reference ( family-206 ) : AAATT--TTT--G-A-GTCT-TN---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TCAACCTTA
gi|122263 : AAATT--AAT--A-A-GTCT-TT---ATGTGAAAT-------A-G--A-T-A-T-T-C---C----G-TT-GCAAT----T-T-TCTCTGCA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TCAACCTTA
gi|122264 : AAATT--GCT--T-A-ATCT-TT---ATGTGAAAT-------A-G--A-T-A-T-T-G---C----G-TT-GCATT----T-T-TCTCTGCA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TCAATCTTA
gi|122265 : AAATT--ATT--G-A-GTCT-TT---ATGTGAAAA-------A-G--A-T-A-T-T-T---C----A-TT-GCACT----T-T-TCTCTGCA--AT-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TCAACTTTA
gi|122266 : AAATT--GAT--T-A-TTCT-TT---ATGTGAAAT-------A-G--A-T-A-T-T-T---C----G-TT-GCAAC----A-T-TCTCTGCA--AT-TGTA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACA--TG--ATA--TCAACCTTA
gi|122267 : AAATT--ATT--G-A-GTCT-TT---ATGTGAAAT-------A-G--A-T---C-T-TT--C----G-TT-GTACT----C-T-TCTCTGCA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TC--ATA--TTAACCTTA
gi|122268 : AAATT--ATT--G-A-GTCT-TT---ATGTGAAAT-------A-G--A-C-A-T-T-T---C----G-TT-ACACT----T-T-TTTCTGCA--AC-TGCA-T-------A-TCG-----C-A--GTCACT--TG--ATG--CTAACCTTA
gi|122269 : AAATT--TTT--G-A-GTCT-TT---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-ACACT----T-T-TCTCTGTA--GC-TGTA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TCAACCTTA
gi|122270 : AAATT--ATT--T-A-GTCT-CT---ATGTGAAAC-------A-G--A-T-A-T-T-G---C----G-TT-GCATT----T-T-TCTTTGCA--AC-TGTT-T-------A-TCA-----C-A--GCCGCA--TG--ATA--TCAACTTTA
gi|122271 : AAATT--ATT--A-A-GTCT-TT---CTGTGAA-T-------A-T--A-T-A-T-T-TT-------G-TT-ACACT----T-T-TCTCTGCA--AC-TGCA-C-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TA--ATA--TCAACCTTA
gi|122272 : AAATT--ATT--T-A-GTCT-CT---ATGTGAAAT-------T-G--A-T-A-T-T-T---C----G-AT-GCACT----C-T-TCT--GCA--AC-TGCT-T-------A-TCA-----C-G--GCCACT--TG--ATA--TCCACCTTA
gi|122273 : AAATTAATTT--T-A-GTCT-TT---ATGTGAA-T-------A-G--A-T-A-T-T-T---C----G-AT-GCACT----T-T-TCTCTGCA--ACTTGCT-T-------A-TCA-----C-A--GCCTCT--TGA-ATA--TCAACCTTA
gi|122274 : AAATG--TTT--T-A-GTCT-TA---ATGTGAAAT-------A-G--A-T-A-T-T-TT--T----G-TT-GTACT----T-T-TCTCAACA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----T-A--GCCATT--TG--ATA--TCAACC
gi|122275 : AAATT--ATT--G-G-GTCT-CT---ATGTGAAAC-------A-G--A-T-A-T-T-TT--G----A-T--GCACT----T-T-TTTCTACA--AC-TGCT-T-------A-TCA-----C-G--GTCACT--TG--ATA--CCCACCTTA
gi|122276 : AAATT--ATT--G-G-GTCT-CT---ATGTGAAAG-------A-G--A-T-A-T-T-T---C----G-AT-GCACT----C-T-TCT--GCA--AC-TGCT-C-------A-TCA-----C-G--GTCACT--TG--ATA--TCCATCTTA
gi|122277 : AAATT--TT---G-A-GTCT-TA---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TTT-C----G-TT-GCACT----T-T-TCTTTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122278 : AAATT--TTG--G-A-GTCT-TA---ATGTGAAAT-------A-A--T-T-A-T-T-TTT-C----G-TT-GCACT----T-T-TCTTTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122279 : AAATT--TTG--G-A-GTCT-TC---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-ATT-T-TT--C----G-TT-GCACTAAA-T-C-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GGCAAT--TG--ATA--T
gi|122280 : AAATT--TTG--G-A-GTCT-TC---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-ATT-T-TT--C----G-TT-GCACTTAAAT-C-TCTCTG----AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GGCAAT--TG--ATA--T
gi|122281 : AAATT--ATG--G-A-GTCT-TA---ATGTGATTT-------A-G--A-T-A-T-T-TT-------A-TT-GCACT----T-T-TCTCTGCA--AC-TGCA-T-------A-CCA-----C-A--GCCAAT--TG--AAA--T--ACCCTA
gi|122282 : AAATT--TTT--G-A-GTCT-TA---ATGTGAAAT-------A------T---T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122283 : AAATT--ATT--G-A-GTCT-TT---ATGTGA--T-------A-A--A-G-A-TAT-TT--C----G-TT-GCACT----T-T-TCTCTGCA--GT-TGCA-T-------A-T
gi|122285 : ATT--TTG--G-A-GTCT-TC---ATGTAAAAT-------A-A--A-T-A-T-G-TT--C----G-TC-ACACT----T-T-ACTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TTA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122286 : aaatAAATT--TTTTCA-A-GTCT-TA---ATGTGAAGT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--T----G-TT-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TTCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCATG--TG--ATA--T
gi|122287 : ATT--TAG--G-A-GCCT-TA---TTGCGAAAT-------A----------T-T-TT--C----T-TT-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--ACCACT--TG--ATA--T
gi|122289 : aacttAAATT--ATT--G-A-GTCT-TT---ATGC--AAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT-------G-TT-GCACT----T-T-T-TCAGCA--AC-TGCA-T-------A-TTG-----C-A--GCCACC--T
gi|122291 : AAATT--TTG--T-A-CTCT-TT---ATGTGAAAT-------A-G--A-T-A-C-T-T----------------CT----C-T-TC-----A--AC-TGTA-T-------A-TCATCGATC-ACTGCCACT--TG--ATG--TCAACCTTA
gi|122295 : AAATT--TTG--G-A-GTCT-TA---ATGTGAA-T-------A-A----T-A-T-T-TT--C----G-TC-GC--T----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ACA--T
gi|122296 : AAATT--TTG--G-A-GTCT-TA---ATGTGA--T-------A-A----T-A-T-T-TT--C----G-TC-GC--T----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ACA--T
gi|122299 : T--TTG--G-A-GTAT-TG---ATGGAAAAT-------A-T--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-ACACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TACA-T-------A-TCA-----C-A--ACCACT--TG--ATA--T
gi|122301 : aatagAATT--TTT--G-A-GTCT-TT---ATGTGAAAT-------A-G--A-T-A-T-T-TT--T----G-TC-GCACT----T-T-CCCCTGTA--AA-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--AGA--TCAACCGTA
gi|122302 : AATT--TTT--G-A-GTCG-TA---TTGTGGAAT-------C-A--A-T-A-T-T-TT-------G-TC-ACATT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGTG-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TC
gi|122303 : AATT--TTT--G-A-GTCG-TA---TTGTGGAAT-------C-A--A-T-A-T-T-TT-------G-TC-ACATT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGTG-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TC
gi|122304 : AATT--ATT--G-A-GTCT-TT---AT-----------------------------TT--C----G-TT-GCACT----T-T-TCGCTGCA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--TTCACT--TG--ATA--TCAACCTTA
gi|122305 : ATA--TTT--G-A-GTCA-TA---ATATGGAAT-------C-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-GTACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCG-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122306 : aatT--TTT--C-A-GTCT-TT---TTGTGAAAT-------G-A--G-C-A-T-AATT--C----GCTCTGCACC----T-TGTCTTTGCCTCAC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATAACTAAAACTTA
gi|122308 : aattaATT--TTT--G-A-GTCT-TG---ATGTGGAAT-------C-A--A-T-A-T-T-TT--C----A-TC-AC-CT----TGT-TCTCTGAA--AC-TGCG-C-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TA--ATA--T
gi|122309 : ATT--TTT--G-A-GTCT-TA---ATGTGGAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TA--T----G-CC-ACACT----T-T-TCTCTGTT--AC-TGCA-T-------A-TCA-----A-A--GACATT--TG--ATA--T
gi|122310 : ATT--TTT----A-GTCA-GA---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--T----G-TT-GCACT----T-T-CCTTTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122311 : ATT--TTT--T-A-GTCA-TA---ATGTGAAAT----------------A-T-T-TT--C----G-TT-GCACT----T-T-TCTCTGCA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCTGCTAATG--AGA--TCAA
gi|122319 : -GTTC-TA---GTGTGAAAT-------A-G--A-T-A-T-T-T---C----G-TT-GCACT----T-T-TTTCTGCA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--TCAACCCTA
gi|122320 : ttatcagtATT--TTG--G-A-GTCT-TA---ATGTAAAAT-------G-A--A-T-A-T-T-TG--T----G-TT-ACAAT----T-T-TCTCCGAA--AC-TGCA-T-------T-TTA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122321 : tATT--TTG--G-A-GTCG-TA---ATGTAAAAT-------A-G--G-T-A-T-T-TT--C----G-TT-ACACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TTA-----C-A--GCCACT--TG--ATA----GACCTT
gi|122322 : tATT--TTG--G-A-GTCT-TA---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-T---CACT----T-T-TCTCTGAC--AC-TGCA-T-------A-TCA-----A-A--GTCATT--TG--ATA--T
gi|122324 : tATT--TTG--G-A-GTCT-TA---ATGTCAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-ACACT----T-T-TCTCTAAA--AC-TGCA-T-------G-CCA-----T-A--GCTACT--TG--ATA--T
gi|122325 : tT--TTT--G-A-GTCT-TA---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TTT-C----G-TT-GCTTC----T-T-TCTCTGAA--AC-TATA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122326 : taATT--TTT--G-AAGTCT------ATGTAAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-ACACT----T-T-TCTCTGCA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--ACCACT--TGGTATA--TCA
gi|122328 : tATT--TTG--G-A-GTTT-TA---AGGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-ACATT----T-T-TCTTTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--ACCACT--TG--ATA--T
gi|122329 : tT--TTT--GCA-GTCT-TTTTAATGTAAAAT-------G-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-ACACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--ACCACT--TG--CTA--T
gi|122330 : taT--TTT--G-A-GTCT-TG---ATGTGGAAT-------C-A--A-T-A-T-T-TT--C----A-TC-GCA------T-T-TCTCTGAA--AC-TGAA-C-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--CTA--T
gi|122331 : taT--TTT--G-A-GTCT-TG---ATGTGGACT-------C-A--A-T-A-T-T-TT--C----A-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGAA-C-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--CTA--T
gi|122332 : taATT--TTC--G-A-GTCT-TG---AT---AAATCTTTTTTA-G--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----A-T-TCTCTCAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122336 : tATT--TT-------GTCT-TA---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TTT-C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-CGCA-T-------A-TCA-----C-A--TCCAAT--TG--ATA--T
gi|122338 : ATT--TTG--G-A-GTCT-TA---ATGTGAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TTT-C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AT-TGCA-T-------A-TCA-----CAA--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122339 : --TTT--G-A-GTCT-TA---ATGTGAAAT-------T-A--A-T-A-T-T-TT--TTCGAG-TCAGCAC-----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------ATTCA-----C-A--CCCAAT--TG--AT
gi|122341 : aTCT-TA---ATGTAAAAT-------A-G--G-T-A-T-T-TTT-C----G-TC-ACACT----T-T-TCTCTGTA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCGAT--TG--ATA--T
gi|122342 : tttaggtaTT--C-A-GTCT-TA---ATGTGAAAT-------A-ATAA-TTA-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TACA-T-------A-TCA-----C-A--GTCAAT--TG--ATA--T
gi|122343 : TT--G-A-GTTT-CT---GTGTGAAAT-------A-T--A-T-A-T-T-TT--G----G-TC-ACACT----T-T-CCCCTGCA--AC-ATCA-T-------A-TCA-----C-A--ACCACT--TG--ATA--TTTACCTTA
gi|122344 : TT--T-A-GTCT-TA---ATGTAGAAT-------T-A--A-T-A-T-G-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-AGCG-T-------A-ACA-----C-A--GTCACT--TA--ATA--T
gi|122345 : TT--T-A-GTCT-TA---ATGTGAAGT-------AGA--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCATT----T-T-TCTCTGAA--AA-TGCA-T-------A-CCA-----C-A--GGTACT--TG--CTA--
gi|122346 : TT--T-A-GTCT-TA---ATGTGAAGT-------AGA--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCATT----T-T-TCTCTGAA--A--TGCA-T-------A-CCA-----C-A--GGTACT--TG--CTA--
gi|122347 : TT--T-A-GTCT-TA---ATGTGAAGT-------AGA--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCATT----T-T-TCTCTGAA--A--TGCA-T-------A-CCA-----C-A--GGTACT--TG--CTA--
gi|122349 : TCT-TT---ATGTGAAAT-------A-G--A-T-A----------------------------T-T-TCTCTTAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--AGA--TCAACCTTA
gi|122351 : ttac-A-GTCC-TA---ATATGAAAT-------A-T--A-T-A-T-T-T---C----G-TC-ATACT----T-T-TCTCTGAA--GC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122353 : -GTCT-CT---GTCTGAAAC-------A-G--A-T-A-T-T-TA--T----G-TT-GCATT----T-T-TCTCAGAT--AC-TACA-T-------A-CCA-----C-A--GCCACT--TA--ATA--T
gi|122356 : GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTATGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----T-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122357 : gtccttccgtcc-GCCT-TG---ATGTGAAAT-------ATA--A-T-T-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-T-TCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C----GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122358 : AAAC-------A-A--A-T-A-A-T-TT--C----G-TT-GCATT----T-T-TCTCTGAA--AA-TGGA-T-------A-CCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122359 : gtcttttcaTCTCTA---ATGTGAAAC-------G-A----T-A-T-T-T---C----G-CT-GCAAT----T-T-TCTCTGAA---C-TGCT-TTTCTGTTA-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T-AGCCTTA
gi|122360 : AAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--ACCGAT--TG--ATA--T
gi|122362 : tctttccgtccaTCT-TT---ATGTGAAAT-------A-G--A-T-A-T-T-TT--C----A-AC-ACACT----T-T-TCTCTTCA--AC-TGTGTT-------A-TCA-----T-A--GCCACT--TG--ATA--TCAA
gi|122365 : AAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT-------G-TT-GCATT----A-T-TTTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-CCA-----C-A--ACCACT--TG--ATA--T
gi|122367 : tctatcca---ATGTGGAAT-------C-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-GCACT----T-T--CTTTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCG-----C-A--GCCATT--TG--ATA---CAA
gi|122368 : ---ATCTGAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-CC-ACACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCG-T-------A-TCA-----C-A--GCTGCT--TG--ATA--T
gi|122372 : GTGAAAT-------A-A--A-A-T-T-T-TT--C----G-TC-A-ACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TTCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122375 : TGAAAG-------A-A--A-T-A-T-T-TT--T----G-TC-ACATT----T-T-TCTCAGCA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACC--TG--ATA--T
gi|122376 : TGAAAA-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122377 : TGAAAC-------T-A--A-T-A-T-T-----C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122378 : TGAAAC-------T-A--A-T-A-T-T-----C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG---TA--T
gi|122379 : GAAAC-------G-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-GCATT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-CCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122383 : GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TTTTC----G-TC-GTACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122384 : GAAAC-------A-G--A-T-A-A-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122386 : GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTAAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122387 : GAAAT-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TTTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TAA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122389 : GAGAC-------A-A--A-T-A-T-T-----C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCG-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122390 : GAAAC-------A-A--AAT-A-T-T-TT--C----G-TT-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--ACCAAT--TG--ATA--T
gi|122391 : GAAAC-------A-A--AAT-A-T-T-TT--C----G-TT-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--ACCAAT--TG--ATA--T
gi|122392 : GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-C-------A-TTG-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122394 : GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--T----G-TT-ACATT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-CCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122395 : GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-ACACT----T-T-TCTCTGAA--AA-TGCA-T-------A-TAA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122396 : GAAAC-------A------T-A-T-T-TA--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122397 : GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--T----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122398 : GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--T----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122399 : GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TA--C----G-TT-GCACT----A-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-C-------A-TCA-----C-T--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122400 : GAAAT-------T-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--ACCAAT--TG--ATA--T
gi|122401 : GAAAC-------A-A--A-T-A-T-T-T---C----G-TC-GCACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--G-CAAT--TG--A
gi|122403 : GAAAC-------A-G--A-T-A-T-T-TT--C----A-TC-ACACT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-C-------A-TCA-----C-T--GCCACT--TG--ATA--T
gi|122404 : GAAAA-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TC-GCACT----T-C-TTTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCA-----C-A--GCCAAT--TG--ATA--T
gi|122407 : AAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-GCATT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-A-------A-TCA-----C-A--TCCACT--TG--ATA--T
gi|122408 : AAAC-------A-A--A-T-A-T-T-TT--C----G-TT-GCATT----T-T-TCTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-CCA-----C-A--GCCACT--TT--AT
gi|122413 : -------A-A--A-T-A-T-T-----C----G-TC-GCACT----T-T--CTCTGAA--AC-TGCA-T-------A-TCG-----C-A--GCCACT--TG--ATA--T