lowQualScore : 11 00 0 11 0 11 0 11 1 0 11 0 0 33 11 0 0 1 1 0 11 222 0 333 0 0 0 0 1 00 0 11 22 0 0 11 0 0 4
lowQualScore : .. .. . .. . .. . .. . . .. . . .. .. . . . . . .. ... . ... . . . . . .. . .. .. . . .. . . .
lowQualScore : 88 66 4 00 4 44 4 88 2 4 00 4 4 00 11 8 4 6 6 4 44 888 4 000 8 4 4 4 2 66 4 00 33 4 4 00 4 8 1
consensus : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
Reference ( gi|119544 ) : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119546 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119548 : CGTCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119555 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119556 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-CCGC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119559 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--A-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119562 : CATCTT--C--G-C--A-G--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-GAGCC
gi|119540 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119538 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119593 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119585 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119583 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119573 : CATCTT--C--G-T--A-A--ACCA-AGTG--C-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGA-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119553 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-CAG
gi|119550 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119606 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119584 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119609 : CATCTT--C--A-C--A-A--GCCA-AGTG--G-C-CGA--TT-C-GCA-T--T-A-C-TTC-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCTAAAGCC
gi|119542 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-CGT-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-ATT--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119612 : CATCTT--C--G-G--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-CGT-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-A--T-TTT-AAGCC
gi|119560 : CATCTT--T--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-T-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T---CCCCTTGG-CAA-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGC
gi|119621 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--
gi|119623 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---CC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119545 : CATCTT--C--A-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119614 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-G-C-T-CA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119616 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TA-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--T--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119630 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-G-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119629 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-G-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119634 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119610 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-A-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119574 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119586 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119635 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-A-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119617 : CATCAT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119601 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCTA-AGTG--T-C--GA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCC-TTGG-C-A-G-A-T--T-A--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGC
gi|119611 : CATCTT--C--A-C--A-A--GCCA-AGTGG-T-C-CGA--TTTC-GCA-T--T-A-C-TTC-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCTAAAGCC
gi|119577 : CATCTCG-C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-T-CGA--TT-C-GC--T--T-A-T-T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-T-T-AAGCC
gi|119594 : CATCTT--C--A-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCTTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119603 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCTTTGA-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119587 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--GA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119647 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-C--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119551 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-C-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119566 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119651 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTA--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119632 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-G-C-T-CA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGT
gi|119642 : CATCTT--C--T-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-TGG-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119653 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--T--C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-A
gi|119582 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CAA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-C-TCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-GG
gi|119659 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-G-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-A--A--G-T-C--G-
gi|119590 : CATCTT--CTCG-C--A----GCCA-AGTG--T-T-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---T--T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A----T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAG
gi|119636 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CAA--TT-T-GC--T--T-A-C-G-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-ACTT-TC
gi|119592 : CATCTT--C--G-CG-A-A--GCCATAGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG---A-G-A-T--T-T--AG-G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGC
gi|119595 : CATCTT--C--G-C--G-AC-GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AAAAATC-T-T-ACCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCTAAAGCC
gi|119655 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C--C--T--A-A-A-C-T-G-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--GCAGTT-TCT-AAGCC
gi|119649 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CAA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TT-T-C-ACCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119638 : CATATT--C--G-C--A-A---CCA-AGTG------CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AG-T-TCT-AAGC
gi|119613 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-T-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-G-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119657 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-TCC-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGGCC-A-G-A-T--T-T--ACGG-G-T--G-AGTT-TC
gi|119619 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-T-GC--T--T-A-CAT-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119626 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CTA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCTTTGG-C-A-A-G-T--T-T--AG-G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119565 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119622 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTGG-T-C-CGA--TT-C-GCTTT--T-A-CTT-C-T-CA---T------CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-CA-G-AGTT-TCT-TAGCC
gi|119620 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-T-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119604 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GCT-T--T-A-CAT-C-T-AAT--TC-T-A-CCCCTTGGAC-A-G-A-T--T-T--A--G-TAC--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119641 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--TTC-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119575 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-T--C--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-TAC-CCCCT--G-C-A-G-A-T--T-T--AGGG-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119561 : CATCTT--C--G-C--A----GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TCTT-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119591 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-T-C-T-C-T-CA---TC-T---CCCTTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-T--G-
gi|119543 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-T-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119539 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-T-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119648 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA----------------TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCC-TTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119654 : CAT-TT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T-----G-T-C--G-
gi|119567 : CATCTT--C--G-C--G-A--GC-A-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119563 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTGAAT-C-CGA--TT-C-GC--TCTT-A-C-T-C-T-AA---TT-T-A-CCCCTTG--C-A-G-A-T--T-TT-A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAG
gi|119637 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-T-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-T-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119568 : CATCTT--C----C--G-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119570 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-T-CGA--TT-C-GC--T--T-A---T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-C-C--
gi|119569 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-T-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-C-C--
gi|119541 : CATCTT--C--A-C--T-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-T-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119624 : CATCTT--C--G-C--GTA--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-A-A---T--T-ATC-T-C-T-AA---TC-T-A-CCC--TGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119627 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-GGTG--T-C-CGA--TT-C-GCA-T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-T-ATT--T-T--A--G-T-C--G-CGT
gi|119597 : CATCTTT-C--G-CTGA-C--GCCA-AGTG--TTC-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AAAAATC-T-A-CCCCT-GG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAG
gi|119596 : CATCTT--C--GGC--G-AC-GCCA-AGTGA-T-C-CGA--TT-C-GCA-T--T-A-C-T-C-T-AAAA-TC-T-A-CCC-TTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAG
gi|119660 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-TGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-G-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-T-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119618 : CATCTT--C--G-C--A-AAAGCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-T-GC--T--T-A-C-T-C-TAAA---TC-T-C-CCCTT--G-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119645 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T---CGA--TT-C-GC--CTAT-A-C-T-C-T-AA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119643 : CATCTTTCC--G-C--A-G----CA-AGTG--TTC-CGA--TT-C-GC--T--TTA-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A----T-T--A--G-T-CAGG-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119607 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--GACATT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TA-C-T-ACCCTTGG-C-A-G-ATT--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-
gi|119628 : CATCTT--C--G-C--G-A--AGCA-AGTG--T-CACGA--TT-C-GCA-T--T-A-C-T-C-T-TAA--TC-T-C-CCCTTTG--C-A-G-A-T--T-T--A--GTT-C--G-AGTTGTCT-
gi|119639 : CATCTTT-C--G-C--G-A--GCAA-GATG--T-T-CGAA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-G-CCCCTT-G-C-A-GAA-TTGT-T--AG-G-T-C--G-AGTT-TCT-AA
gi|119691 : ATTTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-TGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119692 : ATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-T-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119698 : ATCTT--T--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC---C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119699 : ATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-C-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-TGTT-TC
gi|119693 : ATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C-CAA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-TACCACTT-G-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-T--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119697 : ATCTT--C--G----G-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-TAT-CTCCTTGG-C-A-G-A-T--TATTAA--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119700 : ATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C-C----------------T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119702 : TCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTAG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119705 : TCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-T-CGA--TT-C-GC--T--TAA-C-G-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-ACG-A-T--T-T--A--G-T-C--G-A-TT-TCTAAAGCC
gi|119704 : TCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C-CGA--TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-T-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
Alignments
lowQualScore : 11 00 0 11 0 11 0 11 1 11 0 0 0 33 11 0 0 1 1 0 11 222 0 222 0 0 0 0 1 00 0 00 22 0 0 00 0 0 4
lowQualScore : .. .. . .. . .. . .. . .. . . . .. .. . . . . . .. ... . ... . . . . . .. . .. .. . . .. . . .
lowQualScore : 88 55 4 00 4 44 4 88 2 00 4 4 4 00 11 8 4 6 6 4 33 888 4 888 8 4 4 4 2 55 4 99 33 4 4 99 4 7 0
consensus : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
Reference ( family-191 ) : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119538 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119539 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-T-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119540 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119541 : CATCTT--C--A-C--T-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-T-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119542 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-CGT-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-ATT--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119543 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-T-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119544 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119545 : CATCTT--C--A-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119546 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119548 : CGTCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119550 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119551 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-C-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119553 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-CAG
gi|119555 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119556 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-CCGC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119559 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--A-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119560 : CATCTT--T--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-T--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T---CCCCTTGG-CAA-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGC
gi|119561 : CATCTT--C--G-C--A----GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TCTT-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119562 : CATCTT--C--G-C--A-G--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-GAGCC
gi|119563 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTGAAT-C--CGA-TT-C-GC--TCTT-A-C-T-C-T-AA---TT-T-A-CCCCTTG--C-A-G-A-T--T-TT-A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAG
gi|119565 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119566 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119567 : CATCTT--C--G-C--G-A--GC-A-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119568 : CATCTT--C----C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119569 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-T--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-C-C--
gi|119570 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-T--CGA-TT-C-GC--T--T-A---T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-C-C--
gi|119573 : CATCTT--C--G-T--A-A--ACCA-AGTG--C-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGA-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119574 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119575 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-T--C--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-TAC-CCCCT--G-C-A-G-A-T--T-T--AGGG-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119577 : CATCTCG-C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-T--CGA-TT-C-GC--T--T-A-T-T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-T-T-AAGCC
gi|119582 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CAA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-C-TCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-GG
gi|119583 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119584 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119585 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119586 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119587 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C---GA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119590 : CATCTT--CTCG-C--A----GCCA-AGTG--T-T--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---T--T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A----T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAG
gi|119591 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-T-C-T-C-T-CA---TC-T---CCCTTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-T--G-
gi|119592 : CATCTT--C--G-CG-A-A--GCCATAGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG---A-G-A-T--T-T--AG-G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGC
gi|119593 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119594 : CATCTT--C--A-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCTTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119595 : CATCTT--C--G-C--G-AC-GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AAAAATC-T-T-ACCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCTAAAGCC
gi|119596 : CATCTT--C--GGC--G-AC-GCCA-AGTGA-T-C--CGA-TT-C-GCA-T--T-A-C-T-C-T-AAAA-TC-T-A-CCC-TTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAG
gi|119597 : CATCTTT-C--G-CTGA-C--GCCA-AGTG--TTC--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AAAAATC-T-A-CCCCT-GG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAG
gi|119601 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCTA-AGTG--T-C---GA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCC-TTGG-C-A-G-A-T--T-A--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGC
gi|119603 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCTTTGA-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119604 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GCT-T--T-A-CAT-C-T-AAT--TC-T-A-CCCCTTGGAC-A-G-A-T--T-T--A--G-TAC--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119606 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119607 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-CGAC-A-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TA-C-T-ACCCTTGG-C-A-G-ATT--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-
gi|119609 : CATCTT--C--A-C--A-A--GCCA-AGTG--G-C--CGA-TT-C-GCA-T--T-A-C-TTC-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCTAAAGCC
gi|119610 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-A--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119611 : CATCTT--C--A-C--A-A--GCCA-AGTGG-T-C--CGA-TTTC-GCA-T--T-A-C-TTC-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCTAAAGCC
gi|119612 : CATCTT--C--G-G--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-CGT-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-A--T-TTT-AAGCC
gi|119613 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-T-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-G-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119614 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-G-C-T-CA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119616 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TA-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--T--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119617 : CATCAT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119618 : CATCTT--C--G-C--A-AAAGCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-T-GC--T--T-A-C-T-C-TAAA---TC-T-C-CCCTT--G-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119619 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-T-GC--T--T-A-CAT-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119620 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-T-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119621 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--
gi|119622 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTGG-T-C--CGA-TT-C-GCTTT--T-A-CTT-C-T-CA---T------CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-CA-G-AGTT-TCT-TAGCC
gi|119623 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---CC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119624 : CATCTT--C--G-C--GTA--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-A-A---T--T-ATC-T-C-T-AA---TC-T-A-CCC--TGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119626 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CTA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCTTTGG-C-A-A-G-T--T-T--AG-G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119627 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-GGTG--T-C--CGA-TT-C-GCA-T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-T-ATT--T-T--A--G-T-C--G-CGT
gi|119628 : CATCTT--C--G-C--G-A--AGCA-AGTG--T-CA-CGA-TT-C-GCA-T--T-A-C-T-C-T-TAA--TC-T-C-CCCTTTG--C-A-G-A-T--T-T--A--GTT-C--G-AGTTGTCT-
gi|119629 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-G-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119630 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-G-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119632 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-G-C-T-CA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGT
gi|119634 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119635 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-A-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119636 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CAA-TT-T-GC--T--T-A-C-G-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-ACTT-TC
gi|119637 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-T-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-T-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119638 : CATATT--C--G-C--A-A---CCA-AGTG-------CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AG-T-TCT-AAGC
gi|119639 : CATCTTT-C--G-C--G-A--GCAA-GATG--T-T--CGAATT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-G-CCCCTT-G-C-A-GAA-TTGT-T--AG-G-T-C--G-AGTT-TCT-AA
gi|119641 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--TTC--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119642 : CATCTT--C--T-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-TGG-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119643 : CATCTTTCC--G-C--A-G----CA-AGTG--TTC--CGA-TT-C-GC--T--TTA-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A----T-T--A--G-T-CAGG-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119645 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T----CGA-TT-C-GC--CTAT-A-C-T-C-T-AA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119647 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-C--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119648 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA----------------TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCC-TTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119649 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CAA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TT-T-C-ACCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119651 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTA--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119653 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-T--C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-A
gi|119654 : CAT-TT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T-----G-T-C--G-
gi|119655 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C--C--T--A-A-A-C-T-G-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--GCAGTT-TCT-AAGCC
gi|119657 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-TCC-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGGCC-A-G-A-T--T-T--ACGG-G-T--G-AGTT-TC
gi|119659 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-G-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-A--A--G-T-C--G-
gi|119660 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-TGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-G-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-T-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119691 : ATTTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--TGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119692 : ATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-T--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119693 : ATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CAA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-TACCACTT-G-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-T--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119697 : ATCTT--C--G----G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-TAT-CTCCTTGG-C-A-G-A-T--TATTAA--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119698 : ATCTT--T--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC---C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119699 : ATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-C-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-TGTT-TC
gi|119700 : ATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--C---------------T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119702 : TCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTAG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119704 : TCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-T-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119705 : TCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-T--CGA-TT-C-GC--T--TAA-C-G-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-ACG-A-T--T-T--A--G-T-C--G-A-TT-TCTAAAGCC
Alignments
lowQualScore : 11 00 0 11 0 11 0 11 1 11 0 0 0 33 11 0 0 1 1 0 11 222 0 222 0 0 0 0 1 00 0 00 22 0 0 00 0 0 4
lowQualScore : .. .. . .. . .. . .. . .. . . . .. .. . . . . . .. ... . ... . . . . . .. . .. .. . . .. . . .
lowQualScore : 88 55 4 00 4 44 4 88 2 00 4 4 4 00 11 8 4 6 6 4 33 888 4 888 8 4 4 4 2 55 4 99 33 4 4 99 4 7 0
consensus : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
Reference ( family-191 ) : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119538 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119539 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-T-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119540 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119541 : CATCTT--C--A-C--T-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-T-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119542 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-CGT-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-ATT--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119543 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-T-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119544 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119545 : CATCTT--C--A-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119546 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119548 : CGTCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119550 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119551 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-C-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119553 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-CAG
gi|119555 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119556 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-CCGC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119559 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--A-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119560 : CATCTT--T--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-T--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T---CCCCTTGG-CAA-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGC
gi|119561 : CATCTT--C--G-C--A----GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TCTT-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119562 : CATCTT--C--G-C--A-G--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-GAGCC
gi|119563 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTGAAT-C--CGA-TT-C-GC--TCTT-A-C-T-C-T-AA---TT-T-A-CCCCTTG--C-A-G-A-T--T-TT-A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAG
gi|119565 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119566 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119567 : CATCTT--C--G-C--G-A--GC-A-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119568 : CATCTT--C----C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119569 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-T--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-C-C--
gi|119570 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-T--CGA-TT-C-GC--T--T-A---T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-C-C--
gi|119573 : CATCTT--C--G-T--A-A--ACCA-AGTG--C-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGA-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119574 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119575 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-T--C--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-TAC-CCCCT--G-C-A-G-A-T--T-T--AGGG-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119577 : CATCTCG-C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-T--CGA-TT-C-GC--T--T-A-T-T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-T-T-AAGCC
gi|119582 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CAA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-C-TCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-GG
gi|119583 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119584 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119585 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119586 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119587 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C---GA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119590 : CATCTT--CTCG-C--A----GCCA-AGTG--T-T--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---T--T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A----T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAG
gi|119591 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-T-C-T-C-T-CA---TC-T---CCCTTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-T--G-
gi|119592 : CATCTT--C--G-CG-A-A--GCCATAGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG---A-G-A-T--T-T--AG-G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGC
gi|119593 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119594 : CATCTT--C--A-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCTTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119595 : CATCTT--C--G-C--G-AC-GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AAAAATC-T-T-ACCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCTAAAGCC
gi|119596 : CATCTT--C--GGC--G-AC-GCCA-AGTGA-T-C--CGA-TT-C-GCA-T--T-A-C-T-C-T-AAAA-TC-T-A-CCC-TTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAG
gi|119597 : CATCTTT-C--G-CTGA-C--GCCA-AGTG--TTC--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AAAAATC-T-A-CCCCT-GG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAG
gi|119601 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCTA-AGTG--T-C---GA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCC-TTGG-C-A-G-A-T--T-A--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGC
gi|119603 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCTTTGA-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119604 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GCT-T--T-A-CAT-C-T-AAT--TC-T-A-CCCCTTGGAC-A-G-A-T--T-T--A--G-TAC--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119606 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119607 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-CGAC-A-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TA-C-T-ACCCTTGG-C-A-G-ATT--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-
gi|119609 : CATCTT--C--A-C--A-A--GCCA-AGTG--G-C--CGA-TT-C-GCA-T--T-A-C-TTC-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCTAAAGCC
gi|119610 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-A--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119611 : CATCTT--C--A-C--A-A--GCCA-AGTGG-T-C--CGA-TTTC-GCA-T--T-A-C-TTC-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCTAAAGCC
gi|119612 : CATCTT--C--G-G--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-CGT-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-A--T-TTT-AAGCC
gi|119613 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-T-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-G-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119614 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-G-C-T-CA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119616 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TA-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--T--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119617 : CATCAT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119618 : CATCTT--C--G-C--A-AAAGCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-T-GC--T--T-A-C-T-C-TAAA---TC-T-C-CCCTT--G-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119619 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-T-GC--T--T-A-CAT-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119620 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-T-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119621 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--
gi|119622 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTGG-T-C--CGA-TT-C-GCTTT--T-A-CTT-C-T-CA---T------CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-CA-G-AGTT-TCT-TAGCC
gi|119623 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---CC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119624 : CATCTT--C--G-C--GTA--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-A-A---T--T-ATC-T-C-T-AA---TC-T-A-CCC--TGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119626 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CTA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCTTTGG-C-A-A-G-T--T-T--AG-G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119627 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-GGTG--T-C--CGA-TT-C-GCA-T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-T-ATT--T-T--A--G-T-C--G-CGT
gi|119628 : CATCTT--C--G-C--G-A--AGCA-AGTG--T-CA-CGA-TT-C-GCA-T--T-A-C-T-C-T-TAA--TC-T-C-CCCTTTG--C-A-G-A-T--T-T--A--GTT-C--G-AGTTGTCT-
gi|119629 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-G-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119630 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-G-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119632 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-G-C-T-CA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGT
gi|119634 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119635 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-A-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119636 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CAA-TT-T-GC--T--T-A-C-G-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-ACTT-TC
gi|119637 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-T-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-T-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119638 : CATATT--C--G-C--A-A---CCA-AGTG-------CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AG-T-TCT-AAGC
gi|119639 : CATCTTT-C--G-C--G-A--GCAA-GATG--T-T--CGAATT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-G-CCCCTT-G-C-A-GAA-TTGT-T--AG-G-T-C--G-AGTT-TCT-AA
gi|119641 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--TTC--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119642 : CATCTT--C--T-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-TGG-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119643 : CATCTTTCC--G-C--A-G----CA-AGTG--TTC--CGA-TT-C-GC--T--TTA-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A----T-T--A--G-T-CAGG-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119645 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T----CGA-TT-C-GC--CTAT-A-C-T-C-T-AA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119647 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-C--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119648 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA----------------TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCC-TTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119649 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CAA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TT-T-C-ACCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119651 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTA--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119653 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-T--C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-A
gi|119654 : CAT-TT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T-----G-T-C--G-
gi|119655 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C--C--T--A-A-A-C-T-G-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--GCAGTT-TCT-AAGCC
gi|119657 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-TCC-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGGCC-A-G-A-T--T-T--ACGG-G-T--G-AGTT-TC
gi|119659 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-G-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-A--A--G-T-C--G-
gi|119660 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-TGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-G-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-T-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119691 : ATTTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--TGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119692 : ATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-T--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119693 : ATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CAA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-TACCACTT-G-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-T--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119697 : ATCTT--C--G----G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-TAT-CTCCTTGG-C-A-G-A-T--TATTAA--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119698 : ATCTT--T--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC---C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119699 : ATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-C-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-TGTT-TC
gi|119700 : ATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--C---------------T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119702 : TCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTAG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119704 : TCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-T-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119705 : TCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-T--CGA-TT-C-GC--T--TAA-C-G-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-ACG-A-T--T-T--A--G-T-C--G-A-TT-TCTAAAGCC
blockSeqs : TC AA AA T TT CT G T AA AAA AC T GG A
blockSeqs : G C A T A TA A T A AAA TA T CG A
blockSeqs : T C G T T . A G A AA AT T G A
blockSeqs : T . G . A . T C A T A . G A
blockSeqs : . . . . A . . . A A A . G .
blockSeqs : . . . . A . . . A . A . . .
blockSeqs : . . . . A . . . C . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . T . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . A . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . C . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . T . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . T . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . G . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . A . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . C . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . C . . . .
blockSeqCons :
originalCons : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
finalCons : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
Alignments
lowQualScore : 11 00 0 11 0 11 0 11 1 11 0 0 0 33 11 0 0 1 1 0 11 222 0 222 0 0 0 0 1 00 0 00 22 0 0 00 0 0 4
lowQualScore : .. .. . .. . .. . .. . .. . . . .. .. . . . . . .. ... . ... . . . . . .. . .. .. . . .. . . .
lowQualScore : 88 55 4 00 4 44 4 88 2 00 4 4 4 00 11 8 4 6 6 4 33 888 4 888 8 4 4 4 2 55 4 99 33 4 4 99 4 7 0
consensus : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
Reference ( family-191 ) : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119538 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119539 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-T-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119540 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119541 : CATCTT--C--A-C--T-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-T-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119542 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-CGT-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-ATT--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119543 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-T-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119544 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119545 : CATCTT--C--A-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119546 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119548 : CGTCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119550 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119551 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-C-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119553 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-CAG
gi|119555 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119556 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-CCGC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119559 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--A-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119560 : CATCTT--T--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-T--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T---CCCCTTGG-CAA-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGC
gi|119561 : CATCTT--C--G-C--A----GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TCTT-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119562 : CATCTT--C--G-C--A-G--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-GAGCC
gi|119563 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTGAAT-C--CGA-TT-C-GC--TCTT-A-C-T-C-T-AA---TT-T-A-CCCCTTG--C-A-G-A-T--T-TT-A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAG
gi|119565 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119566 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119567 : CATCTT--C--G-C--G-A--GC-A-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119568 : CATCTT--C----C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119569 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-T--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-C-C--
gi|119570 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-T--CGA-TT-C-GC--T--T-A---T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-C-C--
gi|119573 : CATCTT--C--G-T--A-A--ACCA-AGTG--C-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGA-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119574 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119575 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-T--C--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-TAC-CCCCT--G-C-A-G-A-T--T-T--AGGG-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119577 : CATCTCG-C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-T--CGA-TT-C-GC--T--T-A-T-T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-T-T-AAGCC
gi|119582 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CAA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-C-TCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-GG
gi|119583 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119584 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119585 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119586 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119587 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C---GA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119590 : CATCTT--CTCG-C--A----GCCA-AGTG--T-T--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---T--T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A----T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAG
gi|119591 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-T-C-T-C-T-CA---TC-T---CCCTTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-T--G-
gi|119592 : CATCTT--C--G-CG-A-A--GCCATAGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG---A-G-A-T--T-T--AG-G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGC
gi|119593 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119594 : CATCTT--C--A-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCTTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119595 : CATCTT--C--G-C--G-AC-GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AAAAATC-T-T-ACCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCTAAAGCC
gi|119596 : CATCTT--C--GGC--G-AC-GCCA-AGTGA-T-C--CGA-TT-C-GCA-T--T-A-C-T-C-T-AAAA-TC-T-A-CCC-TTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAG
gi|119597 : CATCTTT-C--G-CTGA-C--GCCA-AGTG--TTC--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AAAAATC-T-A-CCCCT-GG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAG
gi|119601 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCTA-AGTG--T-C---GA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCC-TTGG-C-A-G-A-T--T-A--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGC
gi|119603 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCTTTGA-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119604 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GCT-T--T-A-CAT-C-T-AAT--TC-T-A-CCCCTTGGAC-A-G-A-T--T-T--A--G-TAC--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119606 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119607 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-CGAC-A-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TA-C-T-ACCCTTGG-C-A-G-ATT--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-
gi|119609 : CATCTT--C--A-C--A-A--GCCA-AGTG--G-C--CGA-TT-C-GCA-T--T-A-C-TTC-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCTAAAGCC
gi|119610 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-A--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119611 : CATCTT--C--A-C--A-A--GCCA-AGTGG-T-C--CGA-TTTC-GCA-T--T-A-C-TTC-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCTAAAGCC
gi|119612 : CATCTT--C--G-G--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-CGT-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-A--T-TTT-AAGCC
gi|119613 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-T-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-G-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119614 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-G-C-T-CA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119616 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TA-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--T--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119617 : CATCAT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119618 : CATCTT--C--G-C--A-AAAGCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-T-GC--T--T-A-C-T-C-TAAA---TC-T-C-CCCTT--G-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119619 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-T-GC--T--T-A-CAT-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119620 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-T-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119621 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--
gi|119622 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTGG-T-C--CGA-TT-C-GCTTT--T-A-CTT-C-T-CA---T------CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-CA-G-AGTT-TCT-TAGCC
gi|119623 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---CC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119624 : CATCTT--C--G-C--GTA--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-A-A---T--T-ATC-T-C-T-AA---TC-T-A-CCC--TGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119626 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CTA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCTTTGG-C-A-A-G-T--T-T--AG-G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119627 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-GGTG--T-C--CGA-TT-C-GCA-T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-T-ATT--T-T--A--G-T-C--G-CGT
gi|119628 : CATCTT--C--G-C--G-A--AGCA-AGTG--T-CA-CGA-TT-C-GCA-T--T-A-C-T-C-T-TAA--TC-T-C-CCCTTTG--C-A-G-A-T--T-T--A--GTT-C--G-AGTTGTCT-
gi|119629 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-G-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119630 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-G-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119632 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-G-C-T-CA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGT
gi|119634 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119635 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-A-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119636 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CAA-TT-T-GC--T--T-A-C-G-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-ACTT-TC
gi|119637 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-T-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-T-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119638 : CATATT--C--G-C--A-A---CCA-AGTG-------CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AG-T-TCT-AAGC
gi|119639 : CATCTTT-C--G-C--G-A--GCAA-GATG--T-T--CGAATT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-G-CCCCTT-G-C-A-GAA-TTGT-T--AG-G-T-C--G-AGTT-TCT-AA
gi|119641 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--TTC--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119642 : CATCTT--C--T-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-TGG-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119643 : CATCTTTCC--G-C--A-G----CA-AGTG--TTC--CGA-TT-C-GC--T--TTA-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A----T-T--A--G-T-CAGG-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119645 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T----CGA-TT-C-GC--CTAT-A-C-T-C-T-AA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119647 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-C--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119648 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA----------------TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCC-TTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119649 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CAA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TT-T-C-ACCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119651 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTA--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119653 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-T--C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-A
gi|119654 : CAT-TT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T---CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T-----G-T-C--G-
gi|119655 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C--C--T--A-A-A-C-T-G-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--GCAGTT-TCT-AAGCC
gi|119657 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-TCC-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGGCC-A-G-A-T--T-T--ACGG-G-T--G-AGTT-TC
gi|119659 : CATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-G-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-A--A--G-T-C--G-
gi|119660 : CATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-TGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-G-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-T-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119691 : ATTTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--TGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119692 : ATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-T--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-G-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119693 : ATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--CAA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-TACCACTT-G-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-T--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119697 : ATCTT--C--G----G-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-TAT-CTCCTTGG-C-A-G-A-T--TATTAA--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119698 : ATCTT--T--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC---C-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-AGTT-TC
gi|119699 : ATCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-C-G-A-T--T-T--A--G-G-C--G-TGTT-TC
gi|119700 : ATCTT--C--G-C--G-A--GCCA-AGTG--T-C--C---------------T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-A-CCCCTTGG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119702 : TCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTAG-C-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-AGTT-TCT-AAGCC
gi|119704 : TCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-C--CGA-TT-C-GC--T--T-A-C-T-C-T-AA---TC-T-C-CCCCTTGG-T-A-G-A-T--T-T--A--G-T-C--G-
gi|119705 : TCTT--C--G-C--A-A--GCCA-AGTG--T-T--CGA-TT-C-GC--T--TAA-C-G-C-T-CA---TC-T-C-CCCCTTGG-C-ACG-A-T--T-T--A--G-T-C--G-A-TT-TCTAAAGCC