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Reference ( gi|102883 )       :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TTAAG-G----T--C-A--T-A--C-G-C-AA-C-G-TTC--G--T--T---A---T--C--T----G----------T--A-T-------A--T-A--T-T----T-T--A-T---A-GA----A--C-T--A--T-T-C-T-T-AA-T--A---T-A-AA-A-TCA--T-A--G-T---A--------CC----C---T-----T-A--G----ATA-------T-T-C--T--TT----G----A---G---A-A-A-A---AA--T------CA-G-A---C--C---A------T-AT-T-T--C---C--T-G--T------G--T---T-TT--G-G-A-AA---------A---G--A----------------------T-A-A-----C-A----G-T----T-G-A-T-G-A-A-G--A--A---T------G-T--A------A--T----T-T---GT---A---C-A---A-----T--T--T-----G----T---C---A--T----A-C---T--T--G--AA--TT--C-TG--A-G-T-T--A--------CC---T--C-----T-C--T-T-T--G-A-AG---A------A--T--GC-AA--A---T----G-C----A----A------T--G--C---A---C--CT--G--------T---A--C-------G-------------------T--A--------T---A--C--------A------T---A---C-T--A---C-A------A-A--A----A-------CA-C---A----G--T----C--A-G--T-T----GT-T-G-T--A---T--A----A--T----T--A-T-------A--T-T----T-------------T-C-A--T-C----A------T-C--A--T-C--A---A----A--T-A--AT--T--C--T---------GA---A--GGGA----T--T-G--A-A----T-G-A--T--G--T----T--T--GC-GT--T-G--T-C--T--------G-----T--A----G---C----T--T--A---T---A--T-T-A-T----T----AT-C-------A-T---T-G--G-A----A----A--T---C--TT-C--A-A-T----T-T-T-G-G-------AG-A--TA-G-A--A---A-A-A-A--A---T-----T--T-------G-TGAA--A---------T-----G-T-A-C-AT-TG-C-GT-GTG-CCCT-TAA
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gi|102936                     : ttaaggccattacgcaacgttcgtttctgtatatatattatttagaactattttttaattataaaaatcattagtaccgcttaagatattcttggagaaaaatcagaccatattttcctagggtttgaaaagataaacagatgatgaaaaatatagatttgcaacattatccgagttacctctccttttggaggaaaagccaaatgaacttgcacctactgtatttcatactacaaaaacaatgtcagttcactgttgtaaattatatattcattcatcatcaaataattttgaagggatggaattgattttgcgtttcctgtaactgaagtccttcaatttttggagatgaaaaaatgtgaTTAAG-G----T--C-A--T-A--C-G-C-AA-C-G-TTC--GGTT--T---A---T--C--T----G----------T--A-T-------A--T----T-T----T-T--G-TTTAA-GA----A--C-CC-A--T-TTC-T-T-AAAT--A---T-A-AA-A-TCA--T-A--G-T---AG-------CC----C---T-----T-A--G----ATA-------T-T-C--T--TTT---G----ACG-A---A-A-A-A---AA--T------CA-G-A---CA-CGAAA------T-GT-T-C--C---CC-T-G--T------G--T---T-TT--G-G-A-AA-------------G--A----------------------T-A-AGC---T-A----G-T----T-G-A-T-G-A-A-G--A--A---T------G-T--A------A--T----T-T---GC---GG--C-A---A-----T--T--------A----T---C---A--T----G-CGGAT--T--G--AA--TT--C-TG--A-G-T-T--A--------CTCT-T--C-----T-C--T-T-G--G-G-AGCA-A------A--T--GC-AA--AATGT----G-C----AT---A------T--G--C---A---C---T--G--------T---C--CTG-----G-------------------T--G-----------------------------------G---C-T--G---C-T------A-A--G----A-------CA-C---T----G--C----G--A-G--C-T----GT-T-G-T--A---TT-G----A--T----T--A-T-------A--T-T----T-------------T-C-AA-T-C----ACAATGAT-CGAA--T-C--A---A----G--T-AG-AT--T--C--T---------TG---A--GGGA----TCTT-G--A-A----T-G-A--TTGA--T----G--T--GC-GT--TTG--TTC--T--------G-----C--A----A---C----T--C--T---T---A--T-T-A-T----G----AT-C-------A-TGCTT-G--G-G----A----AG-T---C--TT----A-A-T----T-T-T-G-G-------AG-A--TA-C-G--A---A-A-A-A--T---G-----T--T-------G-GAGA--A---------T-----G-T-A-C-AT-TG-C-GTAATGCCCCT-TAAa
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gi|103031                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -TT--G-G-A-AT---------------------------------------T-A-T-----C-A----G-A----T-G-A-T-G-A-C-A--G--A---T------G-T--A------A--T----T-T---GC---A---C-A---A-----T--T--A-----T----T---T---A--T----A-C---T--C--G--AG--TT--C-TT--A-G-T-T--A--------CC---T--C-----T-C--T-T-T--G-A-AG---A------A--A--GC-AA--A---T----A-T----A----A------T--G--C---A---C--CT--G--------T---A--C-------A-------------------T--A--------T---A--C--------A------T---A---C------------------------------------------------------------------------------------T--A----A--T----T--A-T-------A--G-T----T-------------T-C-A--T-C----A------T-C--A--T-C--A---A----A--T-A--AT--T--C--T---------GA---T--GCAA----T--T-G--A-G----T-G-A--T--C--T----G--T--GC-AT--T-T--C-C--T--------G-----T--A----A---C----T--C--T---C---A--T-T-A-G----T----AT-T-------G-T---T-G--G-A----A----G--T---C--TT-C--A-A-T----G-T-T-G-G-------AG-A--TA-G-A--A---A-A-A-A--A---A-----T--T-------G-TGAA--A---------T-----G-T-A-C-AT-TG-C-GT-ATG-CCCT-TAAtaa
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Reference ( family-181 )      :                                                                                                                                                                                                                                                         TTAAG-G----T--C-A--T-A--C-G-C-AA-C-G-TTC--G--T--T---A---T--C--T----G----------T--AT-------A--T-A--T-T----T-T--A-T---A-GA----A--C-T--A--T-T-C-T-T-AA-T--A---T-A-AA-A-TC-A--T-A--G-T---A--------CC----C---T-----T-A-G----ATA-------T-T-C--T--TT----G----A--G---A-A-A-A---AA--T------CA-G-A---C--C---A------T-A-T-T-T--C---C--T-G--T------G--T---T-TT--G-G-A-AAA---G--A----------------------T-A-A-----C---------A----G-T----T-G-A-T-G-A-A-G--A--A---T------G-T--A------A--T----T-T---G--C---A---C-AA---T---T---A-T-T---C-A--T-A--------C---T--T--G--AA--TT--C-TG--A-G-T-T--A--------C-C---T-C-----T-C--T-T-T---GG--A-G--AA--A---G-C-A-----A--A---T----G-C----A----A------T--G--C---A---C--CT--G--------T---A--C-------G-------------------T--A--------T-A---C--------A------T---A---C-T--A---C--A------A-A--A-A-----------C--A-C-T--G--T----C--A-G--T----T-GT-T-G-T--A---T-G----A---T--T-A-T-------A--T-----T-T-------------T-C-A--T-C----A------T-C--A--T-C--A---A----A--T-A--AT--T--C---T---------GA-A--GGGA----T--T-G--A-A----T-G-A--T--G--T----T--T--GC----GT--T---T--T-C--T--G--T-A---A---C-T--------C-T--T--A----T------T--A--T----T----AT-C-------AT---T-G--G---A----A----G-T--C--TT-C--A-A-T--T-T-T-G-G-------AG-A--TA-G-A--A---A-A-A-A--A---T-----T--T-------G-TGAA--A---------T-----G-T-A-C-AT-TG-C-GT-A-TG-CCCT-TAA
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gi|102992                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ggacacacgcaacgttcgttatctgtttatatatttttaaaaataaaaatcatagtacccacagattttctttgagaaaaaatctgactatattacctgggt----T----AT-C-------AT---T-G--G---A----A----G-T--C--TT-C--A-A-T--G-T-T-G-G-------AG-G--TA-A-A--A---A-A-A-A--A---tatcattggaagtcttcaatgttggaggtaaaaaaaaaat
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