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lowQualScore                  :      .    . .  ..... ................ . . . .    ...     .  . .        .  .       ..    .......   ........... ...... .. . ............ .......  ...   ......     . . .   .....  . ..  ......   . .    ..  .. .           .                .         .      .                                  .                                                                                                 ..        ..                            .                   .     .            .                  
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Reference ( gi|17998 )        : CTCGG-ATAT-C-TC-----G--TA--T------A--T-T-T-T-TCTC--AGTCCC-ATTG-AGTTCGAG-AT-AACGAGG-CTTGA-------CTG----A-----GT---G--T--A-T---G---T----T-------AT---TTA--C---CAACA-A-A-AAC--GT-AC-A--TG------CAT-A-TTTC--TT--TGTTTGCAATTCTGATTACCAATTAATAATTATGATTACC-ATCTATCTAAATTTTTAATCAAATCAAAGACATTTTAGGGTAAAGAAATTTGAAGTTCCTTTCACTGGTTTGGAAATACTAATTGTTTTGTATTCTGTTTGTATTCTGTTTGTATTTGCGGACAGGATCACCCAGTTTC--ACTTACATAACAATATTATAATAGGATACAGTCCCTCC-TCATCATGGATCATCACTC-AACACGACGAAACAGAGTAAACGAAATAAGATAAGTT
gi|17997                      : CTCGG-ATAT-C-TC-----G--TA--T------A--T-T-T-T-TCTC--AGTCCC-ATTG-AGTTCGAG-AT-AACGAG--CTTGA-------CTG----A-----GT---G--T--A-T---G---T----T-------AT---TTA--C---CAACA-A-A-AAC--GT-AC-A--TG------CAT-A-TTTC--TT--TGTTTGCAATTCTGATTACCAATTAATAAT-ATGATTACC-ATCTAT-TAAATTTTTAATCAAATCAAAGACATTTTAGGGTAAAGAAATTTGAAGTTCCTTTCACTGGTTTGGAAATACTAATTGTTTTGTATTCTGTTTGTATTCTGTTTGTATTTGCGGACAGGATCACCCAGTTTC--ACTTACAT-ACAATATTATAATAGGATACAGTCCCTCC-TCATCATGGATCATCACTCAAACACGACGAAACAGAGTAAACGAAATAAGATAAGTT
gi|17999                      : CTCGG-ATAT-C-TC-----G--TA--T------A--T-T-T-T-TCTC--AGTCCC-ATTG-AGTTCGAG-AT-AACGAG--CTTGA-------CTG----A-----GT---G--T--A-T---G---T----T-------AT---TTA--C---CAACA-A-A-AAC--GT-AC-A--TG------CAT-A-TTTC--TT--TGTTTGCAATTCTGATTACCAATTAATAAT-ATGATTACC-ATCTAT-TAAATTTTTAATCAAATCAAAGACATTTTAGGGTGAAGAAATTTGAAGTTCCTTTCACTGGTTTGGAAATACTAATTGTTTTGTATTCTGTTTGTATTCTGTTTGTATTTGCGGACAGGATCACCCAGTTTC--ACTTACAT--CAATATTATAATAGGATACAGTCCCTCC-TCATCATGGATCATCACTCAAACACGACGAAACAGAGT-AACGAAATAAGATAAGTT
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gi|18018                      : CCCAG-ATAT-C-TCA----G--T-------------T-T-T-T-TCTC--GGTCCC-ATTG-AGTTTGAG-AT-AATGAGG-TTCGA-------CTGC---AT----GT---G--T--A-T---tatatt
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gi|18017                      : CTTGA-ATAT-T-TT-----G--GA--G------A--T-T-T-T-TCTT--GACCCC-AATG-AGTTTGAG-AT-AACCATG-TTTGA-------TTG----T-----AT---T--T--A-T---A---T----TCATTGAAAT---TTA------AAAAA-A-A-AAT--G--AC-A--TG------GA--A-TTTT--TT--TTTTTGCA
gi|18026                      : CTCGG-ATAT-T-TC-----A--AA--G------C--T-T-T-T-TCTC--AGTCCC-ATCG-AGTTCGAA-AT-AGTGAGA-ATTGA-------C-------------T---G--T--A-T---C---T----G-------AT---T--------------------C--GT-AT-G--TA------CAT-A-TTT
gi|18024                      : CTCGG-ATAT-C-TT-----G--AA--G------T--C-T-T-T-TCTC--AGTCCC-ATCG-AGAATGAG-AT-AACAAGG-TTTGA-------CTG----
gi|18029                      : CTCG--ATAT-C-TCTCTCGA--TG--T---------T-T-T-T-TCTC--AGTCCC-ATCG-AGTTCGAC-AT-AACAAGG-TTCGA-------CTG----
gi|18030                      : CTCAG-ATATTC-TC-----A--AA--T------A--T-T-T-T-TCTC--AGTCCC-AAGG-AGTTCAAG-AT-AA-GAGATTTTGA-------CTG----
gi|18031                      : CTCGG-ATAT-C-TC-----T--CA--A------G--T-T-TGT-TCTT--AGCCCA-ATCA-AGTTCGAG-AT-AACAAGG-TTAGA-------CTG----
gi|18047                      :  TCAG-ATAT-C-TC-----A--AA--T------A--T-T-T-T-TCTC--AATTCC-ATTA-AGTTCGAG-AT-AACGAGA-TTTGA-------CTG----
gi|18049                      :  TCGG-ATAT-C-TC-----A--AA--C------T--T-T-T-T-TCTT--GGTCCC-ATTG-AGTTCAAA-AT-AACGAGG-TTTGA-------C-------------T---G--T--A-T---G---T----T-------A
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gi|18050                      :  TTGG-ATAT-T-TC-----G--AA--G------C--T-T-T-T-TCTC--AGTCCC-ATCA-AGGTCGAG-AT-AACAAGG-TTCGA-------CTG----
gi|18066                      :   CGA-ATAT-C-TC-----G--AA--C------A--T-T-T-T-TCAT--GGTCCC-ATCG-AGTTCGAGAAT-AACGAGG-TTCTA-------CTGT---A-----GT---A--T--A-T---A----------------AT---TT-------CAGCA-A-ACAAC--G
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gi|18073                      :   CGG-ATAT-C-TC-----G---A--C------T--T-T-T-T-TCTT--GGTCCC-ATGG-AGTTCGAG-AT-AATGAGG-TTTGA-------CTG----
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gi|18067                      :   CGG-ATAT-C-TT-----G--AA--C------T--T-T-T-T-TCTT--AGTCCC-ATCA-AGTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CTG----
gi|18057                      :   CGG-ATAT-C-TC-----A--AA--C------T--T-T-T-T-TCTT--GGTCCC-ATCG-AGTTCGAG-AT-AACGAAG-TTTGA-------CTG----
gi|18072                      :   CGG-ATAT-C-TC-----A--AA--C------T--T-T-T-T-TCTT--GGTCCC-ATTG-AGTTCGAG-AT-ATCGAGG-TTCGA-------CTG----T-----AC---G--T--A-T---A---T----
gi|18068                      :   CGG-ATAT-C-TC-----G--GA---------ACTT-T-T-T-TCTT--GGTCCC-ATCG-AGTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------C-------------T---G--T--A-T---T---T----T-------GT---TT
gi|18074                      :   CGG-ATAT-C-TC-----A--AA--C------T--C-T-T-T-TCTC--GGTCCC-ATCG-AGTTTGAG-CT-AACGAGG-TTTGA-------CTGT---A-----GT---A-----A-TGAAG---T----T-------ATAACTTG--C---CAA
gi|18077                      :   CGG-ATAT-C-TC-----G--AA--C------T--T-T-C-T-TCTT--GGTCCC-ATCG-AGTTCGAG-AT-AATGAGG-TTCGA-------CTG----
gi|18060                      :   CGG-ATAT-C-TC-----A--AA--C------A--T-T-T-T-TCTC--GGTCCC-ACCG-AGTTCGAG-AT-AACGAAA-TTCGA-------CTG----T-----AC---A--T--AGT---T---T----T-------AT---TT
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gi|18078                      :   CGG-ATAT-C-TC-----G--AA--T------T--T-T-T-T-TCTT--GGTTCC-ATCA-AGTTTGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CTG----
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gi|18058                      :   CGG-ATAT-C-TC-----A--AA--G------A--T-T-T-T-TCTC--GATCTC-ATCG-AGTTTGAG-AT-AACAAGG-TTTGA-------T-------------T---G--T--A--------------T-------AT---TT---------GCG-A-A-AAA--GT-AA-A--TG------TAT-
gi|18089                      :   CAG-ATAT-C-TC-----G--AA--C------T--T-T-T-T-TATT--GGTCCC-ATTG-AGTTCGAG-AT-AAAGAGG-TTTGA-------CTG----
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gi|18094                      :   CGG-ATAT-C-TT-----G--AAG-T------T--T-T-T-T-TCTC--AGTTCC-ATCG-AGTTCGTG-AT-AATGAGG-TTTGA-------CTG----
gi|18081                      :   CGG-ATAT-C-TC-----G--AA--C------T--T-T-T-T-TCTT--GGTCAC-ATCA-AGTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CT-----------GT---A--T--A-----G---T----T-------AT---
gi|18101                      :   CAG-ATAT-C-TC-----G--AA--C------T--T-T-A-T-TCTT--GGTCCC-ATTG-AGTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CT-----------GT---T--T--A-T-------C----T-------GT---ATA--G---TAACT-A-T-AAT--TTGAC-A--TGAACTCTCAT-AGTTTC--TT--T
gi|18088                      :   CAG-ATAT-C-TC-----G--AA--C------T--T-T-T-T-TATT--GGTCCC-ATCG-AGTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CTG----
gi|18086                      :   CGG-ATAT-C-TC-----A--AA--C---------T-T-T-T-TCTT--GGTCCC-ATCA-AGTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CTG----
gi|18064                      :   CGG-ATAT-C-TG-----G--AA--C------T--T-T-T-T-TCTC--AGTCCC-ATCA-AGTTCAAG-AT-AACAAGG-TTCGA-------CTG----
gi|18105                      :   CGG-ATAT-T-TC-----A--AA--G------T--T-T-T-T-TCTT--GGTCTC-ATTG-AGTTCAAG-AT-AACGAGG-TTTGA-------CTG----
gi|18090                      :   CAG-ATAT-C-TC-----G--AA--C------T--T-T-T-T-TCTT--GGTCCC-ATCA-AATTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CT-----------GT---A--T--A-T---G---
gi|18059                      :   CGG-ATAT-C-TCAAAA-G--T-------------T-T-T-T-TCTC--TGTCCC-ATCG-AGTTCGAG-AT-AACGAGG-TTAGA-------CTG----
gi|18107                      :   CGG-ATAT-C-TC-----T--CG--T------G--T-T-T-T--CTC--TGTCTC-ATCG-AGTTCGAG-AT-AATGAGG-TTTGA-------C-------------T---G--T--A-T---G---T----
gi|18099                      :   CGG-ATAT-T-TC-----G--AA--G------T--T-T-T-T-TCTC--GGTTCC-ATTG-AGTTTGAG-AT-AATGAGG-TTCAA-------CTG----T-----AT---G--T--A-
gi|18109                      :   CGG-ATAT-C-TC-----T--AA--C------T--T-T-T-T-TCTT--GGTCCC-AT-A-AGTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------C-------------T---G--T--A-T---G---T----T-------CT---T
gi|18070                      :   CAG-ATAT-C-TT-----G--AA--T------T--T-T-T-TTTCTC--AGTCTC-ATTG-AGTTCAAG--T-AACGAGG--TTGA-------CT-----------GT---A--T--A-T---G---T----T-------
gi|18061                      :   CGG-ATAT-C-TC-----A--AA--C------A--T-T-T-T-TCTC--GGTCCC-ACCG-AGTTCGAG-ATAAACGAAA-TTCGA-------CTG----T-----AC---A--T--AGT---T---T----T-------AT---TT
gi|18082                      :   CGG-ATAT-C-TT-----G--AA--G------T--T-T-T-T-TCTC--TGTCCC-ATCG-AGTTCAAG-AT-AACTAGG-TTCGA-------CTGT---A-----GT---
gi|18102                      :   CGG-ATAT-C-TA-----G--AA--A------C--T-T-T-T-TCTT--AATCCC-ATCG-AGTTTGAG-AT-AACGATG-TTCGA-------ATGT---A-----CT---G--TCGA-T---A---T----T--------T---TTG--C---CTACG-ATG-AAC--G--ACAA--GG------CAT-A-T
gi|18080                      :   CAG-ATAT-C-TC-----A--TA--G------T--T-T-T-T-TCTT--GGTCCC-ATCG-AGTTTGAG-AT-AACAAGG-TTCAA-------CTG----
gi|18095                      :   CGG-ATAT-C-TT-----G--AA--C------T--T-T-T-T-TCTT--GGTCCC-ATCA-AGTTCGAG-AT-AACGAGA-TTCGA-------TTG----tactgtcgacttacc
gi|18108                      :   CGG-ATAT-C-TC-----G--AA--C------T--T-T-T-T-TATC--GGTCCC-ATCG-AGTTCGAG-AT-AATGAGG-TT
gi|18103                      :   CGG-ATAT-C-TC-----G--AA--C------T--T-T-T-T-TCTT--GGTCCC-ATCA-AGTTCGAG-AT----GAGG-TTTGA-------CTG----
gi|18098                      :   CGG-ATAT-C-TC-----A--AA--G------T--T-T-T-T-TCTC--AGTCCC-ATAG-AGTTTGAG-AT-AATGAAG-TTTGG-------TTG----
gi|18096                      :   CGG-ATAT-C-TC-----GATTA--T------T--T-T-T-T-TTTTTTGGTCCT-ATCA-AGTTCGAG-AT-AACGAAG-TTCGA-------CTGT---A-----GT-----------T---G---T----T-------AT---
gi|18054                      :   CAG-ATAT-C-TC-----G--AA--C------T--T-T-T-T-TCTT--GATCCC-ATCA-AGTTCGAG-AT-AACAAGG-TTCGA-------CTGTAT-A-----AT---A--T--ATT---G---G----T-------GT---TTA--
gi|18091                      :   CGG-ATAT-C-TC-----G--AA--C------T--T-T-T-T-TCTT--GGTCCC-ACCG-AGATCAAG-AT-AACAAGG-TTCGA-------CTG----
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gi|18106                      :   CGG-ATAT-T-TC-----A--AA--C------T--T-T-T-A-TCTT--GGTCCC-ATCA-AGTTCGAG-AT-AACAAGG-TTCGA-------CC-----------GT---G--T--A-TA--G----------------AT---TTA--CTTTCATCA-A-A-
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gi|18151                      :    GG-ATAT-C-TC-----G--AA--C------T--T-T-T-T-TCTT--GGTCCC-ATCG-AGTTCGAG-AT-AACGAGG-TTTGA-------CTG----
gi|18156                      :    GG-ATAT-C-TC-----G--AA--C------T--T-T-T-T-TCTT--GGTCCC-ATCA-AGTTCGAG-AT-AATGAGG-TTCGA-------CTG----
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gi|18154                      :    GG-ATAT-C-TC-----T--TA--C------T--T-T-T-T-TCTT--CGTCCC-ATCA-AGTTTGAG-AT-AACAAGG-TTCGA-------CTG----
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Reference ( family-166 )      : CTCGG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-CTC--GGTCCC-ATCGA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CTG-------G----T---G--T--A-T---G---T----T-------AT---TTA--C-----CAACA-A-A-AAC--GT-AC-A--TG------CAT-A-TTTC--TT--TGTTTGCAATTCTGATTACCAATTAATAAT-ATGATTACCA-TCTAT-TAAATTTTTAATCAAATCAAAGACATTTTAGGGTGAAGAAATTTGAAGTTCCTTTCACTGGTTTGGAAATACTAATTGTTTTGTATTCTGTTTGTATTCTGTTTGTATTTGCGGACAGGATCACCCAGTTTC--ACTTACAT--CAATATTATAATAGGATACAGTCCCTCC-TCATCATGGATCATCACTCAAACACGACGAAACAGAGTAAACGAAATAAGATAAGTT
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gi|18003                      : CTCGG-ATAT-C-TT----G-A--A--TA-----T--TTTTT-CTC--AGTCCC-ATCGA-GTTTGAG-AA-AACGAGG-TTTGA-------CTG-------------------------------------T-------AT---TT---------CAATA-C-A-GGCT-GC-AC-ATCTG------TAT-A-TGTC--TTAATTTTTGTAA
gi|18004                      : CCCGG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-CTC--GGTCCC-ATCGA-GTTCGAG-AT-AACGAAG-TTTGA-------CTG-------
gi|18005                      : CTCGG-ATAT-C-TC----G-A--A--TATTTGATAATTTTT-CTC--AGTCCC-TTTGA-GTTCGAG-AT-AATGAGG-TTTGA-------CTGT------A----T---T--T--T-T---G---T----T-------Atacttacaaatgtatacatttaggaagaacgcaacttttcactcaaacgtcttatacggagtttttaacaaaaaaaaaat
gi|18006                      : CTCGG-ATAT-C-TC----A-A--A--AAG----T--TTTTT-CTC--AGTCCC-ATCGA-GTCTGAG-AT-AACGAAG-TTTGA-------C--------------T---G--T--A-----G---T----TAC-----AT---TTA--A-----CAATA-
gi|18007                      : CTTGG-ATAT-C-TC----A-----------------TTTTT-CTC--AGTCCC-ATCAA-GTTCGAG-AT-AACGAGA-TTTGA-------CTG-------
gi|18008                      : CTCAG-ATAT-C-TC----A-A--A--T------A--TTTTT-CTC--AGTCCC-AAGGA-GTTCAAG-AT-AACGAGA-TTTGA-------CTG-------
gi|18009                      : CTTGG-ATAT-C-TA----G-A--A--T------T--TTTTT-CTT--AGTCCC-ATCAA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTTGA-------C--------------T---G--T--A-T---G---T----
gi|18010                      : CTCAG-ATAT-C-TT----G-G--A--A------G--TTTTT-CTC--AGTCCC-ATCGA-GTTCAAG-AT-AACGAGG-TTTGAGTTCCATTTG-------AC---T---G--T--A-T---ATATT----T-------AT---TTA--T-----CAa
gi|18011                      : CCCGG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-CTC--GGTCCC-ACCGA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CT--------G----T---A--C--T-T---G---T----T-------AT---T
gi|18012                      : CTTGG-ATAT-C-TC---------A--G------T--TTTTT-CTC--AATCAC-ATCGA-GTTCAAG-AT-AACAAGG-TTTGA-------C--------------T---G--T--A-TC--G---T----T-------AC---GTA--------AAATG-ATA-AA----T-AC-A--TG------CATGA-TTTA--TTA-TGT
gi|18013                      : CTCGGTATAT-C-TT----G-A--A--T------A--TTTTT-CTC--AGTCCCTATTGAAGTTCGAG-AT-AAAGAGG-TTTGA-------CTG-------
gi|18014                      : CCCAG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATCGA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------C--------------T---G--T--A-T---G---T----C-------A
gi|18015                      : CTTGG-ATAT-C-TC----A-A--A--T------A--TTTTT-TTC--CGTCTC-ACTGA-GTTGGAG-AT-AACGAGG-TTTGA-------CTG-------
gi|18016                      : CTTGG-ATAT-C-TC----A-A--A--T------A--TTTTT-CTC--AGTCCC-ATCAT-GTCTGAG-AT-AACGAGG-TTTGA-------CT--------G----T---A--T--A-T---A--------C-------AT---GTA--C-----C
gi|18017                      : CTTGA-ATAT-T-TT----G-G--A--G------A--TTTTT-CTT--GACCCC-AATGA-GTTTGAG-AT-AACCATG-TTTGA-------TTGT------A----T---T--T--A-T---A---T----TCATTGAAAT---TTA--------AAAAA-A-A-AAT--G--AC-A--TG------GA--A-TTTT--TT--TTTTTGCA
gi|18018                      : CCCAG-ATAT-C-TC---------A--G------T--TTTTT-CTC--GGTCCC-ATTGA-GTTTGAG-AT-AATGAGG-TTCGA-------CTGCAT----G----T---G--T--A-T---
gi|18019                      : CTCAG-ATAT-CCTC----A-A--A--G------T--TTTTT-CTC--AGTCCC-ATTGA-GTTTGAG-AT-AATGAGG-TTTGA-------CTG-------
gi|18020                      : CTTGG-ATAT-C-TC----A-A--A--C------C--TTTTT-CTC--GGTCCC-TTCCA-GTTTGAG-AT-AAAGAGG-TTTGA-------CT--------G----TACAG--G--A-T---G---T----T-------AT---TTA--A-----AAAAA-A-A-AAA--AT-GA-A-----------AT-A-TTTC--T
gi|18021                      : CTTGG-ATAT-C-TT----G-G--AAGT------T--TTTTT-CTC--AGTCCC-ATCAA-GTTCAAG-AT-AACGATG-TTTGA-------CT
gi|18022                      : CTCGA-ATAT-C-TC----G-A--A--C------A--TTTTT-CTT--ATTCCC-ACTGA-GTCTGAG-AT-AATGAGG-TTTGA-------CT
gi|18024                      : CTCGG-ATAT-C-TT----G-A--A--G------T--CTTTT-CTC--AGTCCC-ATCGA-GAATGAG-AT-AACAAGG-TTTGA-------CTG-------
gi|18025                      : CTTGG-ATAT-C-TC----GGA--A--G------A--TTTTT-CTC--AGTCCC-ATCAA-GTTCAAA-AT-AATGAGG-TTTGA-------CT--------G----T---A--T--A-T---
gi|18026                      : CTCGG-ATAT-T-TC----A-A--A--G------C--TTTTT-CTC--AGTCCC-ATCGA-GTTCGAA-AT-AGTGAGA-ATTGA-------C--------------T---G--T--A-T---C---T----G-------AT---T----------------------C--GT-AT-G--TA------CAT-A-TTTt
gi|18027                      : CTCAG-ATAT-C-TT----G-A--A--G------T--TCTAT-TTC--AGTCCC-ATTGA-GTTCAAG-AT-AACGAGG-TTTGA-------CT--------G----T---A--C--A-T---G---T----
gi|18028                      : CTCGG-ATAT-C-TT----G-A--A--T------C--TTTTA-CTT--GGTCCC-ATCGA-GTTTGAG-AT-AACGAGG-TTCAA-------CTG-------
gi|18029                      : CTCG--ATAT-C-TCTCTCG-A--T--G------T--TTTTT-CTC--AGTCCC-ATCGA-GTTCGAC-AT-AACAAGG-TTCGA-------CTG-------
gi|18030                      : CTCAG-ATATTC-TC----A-A--A--T------A--TTTTT-CTC--AGTCCC-AAGGA-GTTCAAG-AT-AA-GAGATTTTGA-------CTG-------
gi|18031                      : CTCGG-ATAT-C-TC----TCA--A--G------T--TTGTT-CTT--AGCCCA-ATCAA-GTTCGAG-AT-AACAAGG-TTAGA-------CTG-------
gi|18047                      :  TCAG-ATAT-C-TC----A-A--A--T------A--TTTTT-CTC--AATTCC-ATTAA-GTTCGAG-AT-AACGAGA-TTTGA-------CTG-------
gi|18049                      :  TCGG-ATAT-C-TC----A-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATTGA-GTTCAAA-AT-AACGAGG-TTTGA-------C--------------T---G--T--A-T---G---T----T-------A
gi|18050                      :  TTGG-ATAT-T-TC----G-A--A--G------C--TTTTT-CTC--AGTCCC-ATCAA-GGTCGAG-AT-AACAAGG-TTCGA-------CTG-------
gi|18051                      :  TCTG-ATAT-C-TC----G-A--GG-T------T--TTTTT-CTC--GGTCCC-ATCGA-GTTTGAG-AT-AACGAGG-TTTGA-------CT--------G----T---A--T----T---G---A----T-------AT---TTA--
gi|18054                      :   CAG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GATCCC-ATCAA-GTTCGAG-AT-AACAAGG-TTCGA-------CTG-------
gi|18057                      :   CGG-ATAT-C-TC----A-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATCGA-GTTCGAG-AT-AACGAAG-TTTGA-------CTG-------tataatatattggtgttta
gi|18058                      :   CGG-ATAT-C-TC----A-A--A--G------A--TTTTT-CTC--GATCTC-ATCGA-GTTTGAG-AT-AACAAGG-TTTGA-------T--------------T---G--T--A--------------T-------AT---TT-----------GCG-A-A-AAA--GT-AA-A--TG------TAT-
gi|18059                      :   CGG-ATAT-C-TC----A-A--A--AG-----T--TTTTT-CTC--TGTCCC-ATCGA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTAGA-------CTG-------
gi|18060                      :   CGG-ATAT-C-TC----A-A--A--C------A--TTTTT-CTC--GGTCCC-ACCGA-GTTCGAG-AT-AACGAAA-TTCGA-------CT--------G----T---A--C--A-T---AGTTT----T-------AT---TT
gi|18061                      :   CGG-ATAT-C-TC----A-A--A--C------A--TTTTT-CTC--GGTCCC-ACCGA-GTTCGAG-ATAAACGAAA-TTCGA-------CT--------G----T---A--C--A-T---AGTTT----T-------AT---TT
gi|18062                      :   CGG-ATAT-C-TC----A-A--A--C------T--TTTT--CTT--GGTCCC-ATTGA-GTTTTAG-AT-AACGAAG-TTTGA-------CTGT------A----T---G--T--A-T---
gi|18063                      :   CGG-ATAT-C-TT----G-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATCGA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------C--------------T---G--T--A-T-------T----T-------AT---
gi|18064                      :   CGG-ATAT-C-TG----G-A--A--C------T--TTTTT-CTC--AGTCCC-ATCAA-GTTCAAG-AT-AACAAGG-TTCGA-------CTG-------g
gi|18065                      :   CGG-ATAT-C-TC----A-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATTAA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CTG-------
gi|18066                      :   CGA-ATAT-C-TC----G-A--A--C------A--TTTTT-CAT--GGTCCC-ATCGA-GTTCGAGAAT-AACGAGG-TTCTA-------CTG-------T----A---G--T--A-T---A---T----A-------AT---TT---------CAGCA-A-ACAAC--Gtagttgaaattatccaac
gi|18067                      :   CGG-ATAT-C-TT----G-A--A--C------T--TTTTT-CTT--AGTCCC-ATCAA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CTG-------
gi|18068                      :   CGG-ATAT-C-TC----GGA--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATCGA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------C--------------T---G--T--A-T---T---T----T-------GT---TT
gi|18069                      :   CGG-ATTT-C-TC----G-A--C--G------T--ATTTT-CTT--GGTCCC-ATTGA-GTTCAAG-AT-AACAAGG-TTCGA-----------------G----T---G--T--A-T---A---T----T-------
gi|18070                      :   CAG-ATAT-C-TT----G-A--A--T------T--TTTTTTCTC--AGTCTC-ATTGA-GTTCAAG--T-AACGAGG-TT-GA-------CT--------G----T---A--T--A-T---G---T----T-------
gi|18071                      :   CGG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATCCG-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CTGTACATCTG----T---G--C--A-T---G---T----T-------TT---ATA--C-------AGA-A-A-AAC--
gi|18072                      :   CGG-ATAT-C-TC----A-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATTGA-GTTCGAG-AT-ATCGAGG-TTCGA-------CTGTAC----G----T---A--T--A-T---
gi|18073                      :   CGG-ATAT-C-TC----G-A-----C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATGGA-GTTCGAG-AT-AATGAGG-TTTGA-------CTG-------
gi|18074                      :   CGG-ATAT-C-TC----A-A--A--C------T--CTTTT-CTC--GGTCCC-ATCGA-GTTTGAG-CT-AACGAGG-TTTGA-------CTG-------T----A---G--TA-A-TGAAG---T----T-------ATAACTTG--C-----CAA
gi|18076                      :   CGG-ATAT-C-TC----G-A--A--T------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATCGA-GTTCGAG-AT-AATGAGG-TTCGA---------G-------G----T---A--T--A-T---A---T----
gi|18077                      :   CGG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTCTT-CTT--GGTCCC-ATCGA-GTTCGAG-AT-AATGAGG-TTCGA-------CTG-------atac
gi|18078                      :   CGG-ATAT-C-TC----G-A--A--T------T--TTTTT-CTT--GGTTCC-ATCAA-GTTTGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CTG-------
gi|18080                      :   CAG-ATAT-C-TC----A-T--A--G------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATCGA-GTTTGAG-AT-AACAAGG-TTCAA-------C--------------T---G--T--ACT---G---T----CG------AC---TTA--C-----C
gi|18081                      :   CGG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCAC-ATCAA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CT--------G----T---A--T--A-----G---T----T-------AT---
gi|18082                      :   CGG-ATAT-C-TT----G-A--A--G------T--TTTTT-CTC--TGTCCC-ATCGA-GTTCAAG-AT-AACTAGG-TTCGA-------CTG-------
gi|18083                      :   CGT-ATAT-C-TC----GGA--A--G------T--TTTTT-CCT--GGTTCC-ATTGA-GTTCAAG-AT-AACAAAG-TTTGA-------CTG-------ATTTTT---GATT--A-T---G---T----T-------AT---tagt
gi|18084                      :   CGG-ATAT-A-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-ATT--GGTCCC-ATCGA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTTGA-------CTG-------
gi|18085                      :   CGG-ATAT-C-TA----G-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATAAA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTTGA-------CCG-------T----A---G--T--A-T---A---A----T-------GC---TTT--CTCGGGCACCA-A-A-GACAAGTCAC-A--TT------CAT-
gi|18086                      :   CGG-ATAT-C-TC----A-A--A--C------T--TTTT--CTT--GGTCCC-ATCAA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CTG-------
gi|18088                      :   CAG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-ATT--GGTCCC-ATCGA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CTG-------
gi|18089                      :   CAG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-ATT--GGTCCC-ATTGA-GTTCGAG-AT-AAAGAGG-TTTGA-------CTG-------
gi|18090                      :   CAG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATCAA-ATTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CT--------G----T---A--T--A-T---G---
gi|18091                      :   CGG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ACCGA-GATCAAG-AT-AACAAGG-TTCGA-------CTG-------
gi|18093                      :   CGG-ATAT-C-TC----A-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATCAA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CTG-------------------------------------T-------AT---TTAGGT-----CAAC--A-T-AAT--TT-AT-A--TT------C-T-G-TTTC--T
gi|18094                      :   CGG-ATAT-C-TT----G-A--AG-T------T--TTTTT-CTC--AGTTCC-ATCGA-GTTCGTG-AT-AATGAGG-TTTGA-------CTG-------
gi|18095                      :   CGG-ATAT-C-TT----G-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATCAA-GTTCGAG-AT-AACGAGA-TTCGA-------TTG-------
gi|18096                      :   CGG-ATAT-C-TC----G-ATTA--T------T--TTTTT-TTTTTGGTCCT-ATCAA-GTTCGAG-AT-AACGAAG-TTCGA-------CTG-------T----A---G--T----T---G---T----T-------AT---
gi|18098                      :   CGG-ATAT-C-TC----A-A--A--G------T--TTTTT-CTC--AGTCCC-ATAGA-GTTTGAG-AT-AATGAAG-TTTGG-------TTG-------
gi|18099                      :   CGG-ATAT-T-TC----G-A--A--G------T--TTTTT-CTC--GGTTCC-ATTGA-GTTTGAG-AT-AATGAGG-TTCAA-------C--------------T---G--T--A-T---G---T----
gi|18100                      :   CGG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------G--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATCAA-GTTCGAA-AT-AACGAGa
gi|18101                      :   CAG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTATT-CTT--GGTCCC-ATTGA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CT--------G----T---T--T--A-T-------C----T-------GT---ATA--G-----TAACT-A-T-AAT--TTGAC-A--TGAACTCTCAT-AGTTTC--TT--T
gi|18102                      :   CGG-ATAT-C-TA----G-A--A--A------C--TTTTT-CTT--AATCCC-ATCGA-GTTTGAG-AT-AACGATG-TTCGA-------ATGTA-----C----T---G--TCGA-T---A---T----T--------T---TTG--C-----CTACG-ATG-AAC--G--ACAA--GG------CAT-A-T
gi|18103                      :   CGG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATCAA-GTTCGAG-AT----GAGG-TTTGA-------CTG-------
gi|18105                      :   CGG-ATAT-T-TC----A-A--A--G------T--TTTTT-CTT--GGTCTC-ATTGA-GTTCAAG-AT-AACGAGG-TTTGA-------CTG-------
gi|18106                      :   CGG-ATAT-T-TC----A-A--A--C------T--TTTAT-CTT--GGTCCC-ATCAA-GTTCGAG-AT-AACAAGG-TTCGA-------CC--------G----T---G--T--A-TA--G----------------AT---TTA--CTTT--CATCA-A-A-
gi|18107                      :   CGG-ATAT-C-TCTC--G--------------T--GTTTT-CTC--TGTCTC-ATCGA-GTTCGAG-AT-AATGAGG-TTTGA-------C--------------T---G--T--A-T---G---T----
gi|18108                      :   CGG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-ATC--GGTCCC-ATCGA-GTTCGAG-AT-AATGAGG-TT
gi|18109                      :   CGG-ATAT-C-TC----T-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-AT-AA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------C--------------T---G--T--A-T---G---T----T-------CT---T
gi|18151                      :    GG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATCGA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTTGA-------CTG-------
gi|18152                      :    GG-ATAT-C-TC----A-A--A--G------T--TTTTT-CTC--AGTCCC-ATCAA-GTTTGAG-AT-AACGAGG-TTTGA-------CTGTA-----G----T---A--C--A-T---G---TACAAT-------GT---ATA--T-----CAAC
gi|18153                      :    GG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATCAA-GTTCGAA-AT-AACAACG-TTCGA-------CTG-------
gi|18154                      :    GG-ATAT-C-TC----T-T--A--C------T--TTTTT-CTT--CGTCCC-ATCAA-GTTTGAG-AT-AACAAGG-TTCGA-------CTG-------
gi|18155                      :    GG-ATAA-A-TT----G-A--A--T------T--TTTTT-CTC--AGTCCC-ATCAA-GTTCAAG-AT-AACAATG-TTTGA-------CT--------G----T---A--T--A-T---A---T----
gi|18156                      :    GG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATCAA-GTTCGAG-AT-AATGAGG-TTCGA-------CTG-------acgattt
gi|18159                      :    GG-ATAT-C-TC----T-C--A--G------T--TTTTT-CTC--GGTCCC-ATTGA-GTTTGAG-AT-AACGAGG-TTCTA-------CTG-------
gi|18179                      :     G-ATAA-C-TC----G-A--A--T------A--TTTTC-CTC--TGTCCC-ATCGA-GTTCGAG-AT-AACAAGG-TTTGA-------CT--------G----T---A--T--G-T---G---A----G-------AA---TTA--C-----CACTA-A-A-CAT--GT-cataaatctacgttttac
gi|18180                      :     G-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTT--CTT--GGTCCC-ATCAA-GTTC-AG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CTGTA-----G----T---G--T--A-T---
gi|18181                      :     G-ATAT-C-TC----T-C--A--G------T--TTTTT-CTC--ATTCCA-ATTGA-GTTCAAG-AT-AACAAGA-ACTGA-------CTAT------A----T---A--T--A-T---G--------T-------A-----TA--C-----CAATATA-A-AAC--AT-CA-A--TT------CTT-A-TTGCAATA--T-TTTGCAAT
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Reference ( family-166 )      : CTCGG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-CTC--GGTCCC-ATCGA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CTG-------G----T---G--T--A-T---G---T----T-------AT---TTA--C-----CAACA-A-A-AAC--GT-AC-A--TG------CAT-A-TTTC--TT--TGTTTGCAATTCTGATTACCAATTAATAATTATGATTACC-ATCTATCTAAATTTTTAATCAAATCAAAGACATTTTAGGGTGAAGAAATTTGAAGTTCCTTTCACTGGTTTGGAAATACTAATTGTTTTGTATTCTGTTTGTATTCTGTTTGTATTTGCGGACAGGATCACCCAGTTTC--ACTTACAT-ACAATATTATAATAGGATACAGTCCCTCC-TCATCATGGATCATCACTCAAACACGACGAAACAGAGTAAACGAAATAAGATAAGTT
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gi|18009                      : CTTGG-ATAT-C-TA----G-A--A--T------T--TTTTT-CTT--AGTCCC-ATCAA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTTGA-------C--------------T---G--T--A-T---G---T----
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gi|18011                      : CCCGG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-CTC--GGTCCC-ACCGA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CT--------G----T---A--C--T-T---G---T----T-------AT---T
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gi|18013                      : CTCGGTATAT-C-TT----G-A--A--T------A--TTTTT-CTC--AGTCCCTATTGAAGTTCGAG-AT-AAAGAGG-TTTGA-------CTG-------
gi|18014                      : CCCAG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATCGA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------C--------------T---G--T--A-T---G---T----C-------A
gi|18015                      : CTTGG-ATAT-C-TC----A-A--A--T------A--TTTTT-TTC--CGTCTC-ACTGA-GTTGGAG-AT-AACGAGG-TTTGA-------CTG-------
gi|18016                      : CTTGG-ATAT-C-TC----A-A--A--T------A--TTTTT-CTC--AGTCCC-ATCAT-GTCTGAG-AT-AACGAGG-TTTGA-------CT--------G----T---A--T--A-T---A--------C-------AT---GTA--C-----C
gi|18017                      : CTTGA-ATAT-T-TT----G-G--A--G------A--TTTTT-CTT--GACCCC-AATGA-GTTTGAG-AT-AACCATG-TTTGA-------TTGT------A----T---T--T--A-T---A---T----TCATTGAAAT---TTA--------AAAAA-A-A-AAT--G--AC-A--TG------GA--A-TTTT--TT--TTTTTGCA
gi|18018                      : CCCAG-ATAT-C-TC---------A--G------T--TTTTT-CTC--GGTCCC-ATTGA-GTTTGAG-AT-AATGAGG-TTCGA-------CTGCAT----G----T---G--T--A-T---
gi|18019                      : CTCAG-ATAT-CCTC----A-A--A--G------T--TTTTT-CTC--AGTCCC-ATTGA-GTTTGAG-AT-AATGAGG-TTTGA-------CTG-------
gi|18020                      : CTTGG-ATAT-C-TC----A-A--A--C------C--TTTTT-CTC--GGTCCC-TTCCA-GTTTGAG-AT-AAAGAGG-TTTGA-------CT--------G----TACAG--G--A-T---G---T----T-------AT---TTA--A-----AAAAA-A-A-AAA--AT-GA-A-----------AT-A-TTTC--T
gi|18021                      : CTTGG-ATAT-C-TT----G-G--AAGT------T--TTTTT-CTC--AGTCCC-ATCAA-GTTCAAG-AT-AACGATG-TTTGA-------CT
gi|18022                      : CTCGA-ATAT-C-TC----G-A--A--C------A--TTTTT-CTT--ATTCCC-ACTGA-GTCTGAG-AT-AATGAGG-TTTGA-------CT
gi|18024                      : CTCGG-ATAT-C-TT----G-A--A--G------T--CTTTT-CTC--AGTCCC-ATCGA-GAATGAG-AT-AACAAGG-TTTGA-------CTG-------
gi|18025                      : CTTGG-ATAT-C-TC----GGA--A--G------A--TTTTT-CTC--AGTCCC-ATCAA-GTTCAAA-AT-AATGAGG-TTTGA-------CT--------G----T---A--T--A-T---
gi|18026                      : CTCGG-ATAT-T-TC----A-A--A--G------C--TTTTT-CTC--AGTCCC-ATCGA-GTTCGAA-AT-AGTGAGA-ATTGA-------C--------------T---G--T--A-T---C---T----G-------AT---T----------------------C--GT-AT-G--TA------CAT-A-TTTt
gi|18027                      : CTCAG-ATAT-C-TT----G-A--A--G------T--TCTAT-TTC--AGTCCC-ATTGA-GTTCAAG-AT-AACGAGG-TTTGA-------CT--------G----T---A--C--A-T---G---T----
gi|18028                      : CTCGG-ATAT-C-TT----G-A--A--T------C--TTTTA-CTT--GGTCCC-ATCGA-GTTTGAG-AT-AACGAGG-TTCAA-------CTG-------
gi|18029                      : CTCG--ATAT-C-TCTCTCG-A--T--G------T--TTTTT-CTC--AGTCCC-ATCGA-GTTCGAC-AT-AACAAGG-TTCGA-------CTG-------
gi|18030                      : CTCAG-ATATTC-TC----A-A--A--T------A--TTTTT-CTC--AGTCCC-AAGGA-GTTCAAG-AT-AA-GAGATTTTGA-------CTG-------
gi|18031                      : CTCGG-ATAT-C-TC----TCA--A--G------T--TTGTT-CTT--AGCCCA-ATCAA-GTTCGAG-AT-AACAAGG-TTAGA-------CTG-------
gi|18047                      :  TCAG-ATAT-C-TC----A-A--A--T------A--TTTTT-CTC--AATTCC-ATTAA-GTTCGAG-AT-AACGAGA-TTTGA-------CTG-------
gi|18049                      :  TCGG-ATAT-C-TC----A-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATTGA-GTTCAAA-AT-AACGAGG-TTTGA-------C--------------T---G--T--A-T---G---T----T-------A
gi|18050                      :  TTGG-ATAT-T-TC----G-A--A--G------C--TTTTT-CTC--AGTCCC-ATCAA-GGTCGAG-AT-AACAAGG-TTCGA-------CTG-------
gi|18051                      :  TCTG-ATAT-C-TC----G-A--GG-T------T--TTTTT-CTC--GGTCCC-ATCGA-GTTTGAG-AT-AACGAGG-TTTGA-------CT--------G----T---A--T----T---G---A----T-------AT---TTA--
gi|18054                      :   CAG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GATCCC-ATCAA-GTTCGAG-AT-AACAAGG-TTCGA-------CTG-------
gi|18057                      :   CGG-ATAT-C-TC----A-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATCGA-GTTCGAG-AT-AACGAAG-TTTGA-------CTG-------tataatatattggtgttta
gi|18058                      :   CGG-ATAT-C-TC----A-A--A--G------A--TTTTT-CTC--GATCTC-ATCGA-GTTTGAG-AT-AACAAGG-TTTGA-------T--------------T---G--T--A--------------T-------AT---TT-----------GCG-A-A-AAA--GT-AA-A--TG------TAT-
gi|18059                      :   CGG-ATAT-C-TC----A-A--A--AG-----T--TTTTT-CTC--TGTCCC-ATCGA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTAGA-------CTG-------
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gi|18064                      :   CGG-ATAT-C-TG----G-A--A--C------T--TTTTT-CTC--AGTCCC-ATCAA-GTTCAAG-AT-AACAAGG-TTCGA-------CTG-------g
gi|18065                      :   CGG-ATAT-C-TC----A-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATTAA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CTG-------
gi|18066                      :   CGA-ATAT-C-TC----G-A--A--C------A--TTTTT-CAT--GGTCCC-ATCGA-GTTCGAGAAT-AACGAGG-TTCTA-------CTG-------T----A---G--T--A-T---A---T----A-------AT---TT---------CAGCA-A-ACAAC--Gtagttgaaattatccaac
gi|18067                      :   CGG-ATAT-C-TT----G-A--A--C------T--TTTTT-CTT--AGTCCC-ATCAA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CTG-------
gi|18068                      :   CGG-ATAT-C-TC----GGA--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATCGA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------C--------------T---G--T--A-T---T---T----T-------GT---TT
gi|18069                      :   CGG-ATTT-C-TC----G-A--C--G------T--ATTTT-CTT--GGTCCC-ATTGA-GTTCAAG-AT-AACAAGG-TTCGA-----------------G----T---G--T--A-T---A---T----T-------
gi|18070                      :   CAG-ATAT-C-TT----G-A--A--T------T--TTTTTTCTC--AGTCTC-ATTGA-GTTCAAG--T-AACGAGG-TT-GA-------CT--------G----T---A--T--A-T---G---T----T-------
gi|18071                      :   CGG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATCCG-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CTGTACATCTG----T---G--C--A-T---G---T----T-------TT---ATA--C-------AGA-A-A-AAC--
gi|18072                      :   CGG-ATAT-C-TC----A-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATTGA-GTTCGAG-AT-ATCGAGG-TTCGA-------CTGTAC----G----T---A--T--A-T---
gi|18073                      :   CGG-ATAT-C-TC----G-A-----C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATGGA-GTTCGAG-AT-AATGAGG-TTTGA-------CTG-------
gi|18074                      :   CGG-ATAT-C-TC----A-A--A--C------T--CTTTT-CTC--GGTCCC-ATCGA-GTTTGAG-CT-AACGAGG-TTTGA-------CTG-------T----A---G--TA-A-TGAAG---T----T-------ATAACTTG--C-----CAA
gi|18076                      :   CGG-ATAT-C-TC----G-A--A--T------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATCGA-GTTCGAG-AT-AATGAGG-TTCGA---------G-------G----T---A--T--A-T---A---T----
gi|18077                      :   CGG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTCTT-CTT--GGTCCC-ATCGA-GTTCGAG-AT-AATGAGG-TTCGA-------CTG-------atac
gi|18078                      :   CGG-ATAT-C-TC----G-A--A--T------T--TTTTT-CTT--GGTTCC-ATCAA-GTTTGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CTG-------
gi|18080                      :   CAG-ATAT-C-TC----A-T--A--G------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATCGA-GTTTGAG-AT-AACAAGG-TTCAA-------C--------------T---G--T--ACT---G---T----CG------AC---TTA--C-----C
gi|18081                      :   CGG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCAC-ATCAA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CT--------G----T---A--T--A-----G---T----T-------AT---
gi|18082                      :   CGG-ATAT-C-TT----G-A--A--G------T--TTTTT-CTC--TGTCCC-ATCGA-GTTCAAG-AT-AACTAGG-TTCGA-------CTG-------
gi|18083                      :   CGT-ATAT-C-TC----GGA--A--G------T--TTTTT-CCT--GGTTCC-ATTGA-GTTCAAG-AT-AACAAAG-TTTGA-------CTG-------ATTTTT---GATT--A-T---G---T----T-------AT---tagt
gi|18084                      :   CGG-ATAT-A-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-ATT--GGTCCC-ATCGA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTTGA-------CTG-------
gi|18085                      :   CGG-ATAT-C-TA----G-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATAAA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTTGA-------CCG-------T----A---G--T--A-T---A---A----T-------GC---TTT--CTCGGGCACCA-A-A-GACAAGTCAC-A--TT------CAT-
gi|18086                      :   CGG-ATAT-C-TC----A-A--A--C------T--TTTT--CTT--GGTCCC-ATCAA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CTG-------
gi|18088                      :   CAG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-ATT--GGTCCC-ATCGA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CTG-------
gi|18089                      :   CAG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-ATT--GGTCCC-ATTGA-GTTCGAG-AT-AAAGAGG-TTTGA-------CTG-------
gi|18090                      :   CAG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATCAA-ATTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CT--------G----T---A--T--A-T---G---
gi|18091                      :   CGG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ACCGA-GATCAAG-AT-AACAAGG-TTCGA-------CTG-------
gi|18093                      :   CGG-ATAT-C-TC----A-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATCAA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CTG-------------------------------------T-------AT---TTAGGT-----CAAC--A-T-AAT--TT-AT-A--TT------C-T-G-TTTC--T
gi|18094                      :   CGG-ATAT-C-TT----G-A--AG-T------T--TTTTT-CTC--AGTTCC-ATCGA-GTTCGTG-AT-AATGAGG-TTTGA-------CTG-------
gi|18095                      :   CGG-ATAT-C-TT----G-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATCAA-GTTCGAG-AT-AACGAGA-TTCGA-------TTG-------
gi|18096                      :   CGG-ATAT-C-TC----G-ATTA--T------T--TTTTT-TTTTTGGTCCT-ATCAA-GTTCGAG-AT-AACGAAG-TTCGA-------CTG-------T----A---G--T----T---G---T----T-------AT---
gi|18098                      :   CGG-ATAT-C-TC----A-A--A--G------T--TTTTT-CTC--AGTCCC-ATAGA-GTTTGAG-AT-AATGAAG-TTTGG-------TTG-------
gi|18099                      :   CGG-ATAT-T-TC----G-A--A--G------T--TTTTT-CTC--GGTTCC-ATTGA-GTTTGAG-AT-AATGAGG-TTCAA-------C--------------T---G--T--A-T---G---T----
gi|18100                      :   CGG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------G--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATCAA-GTTCGAA-AT-AACGAGa
gi|18101                      :   CAG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTATT-CTT--GGTCCC-ATTGA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CT--------G----T---T--T--A-T-------C----T-------GT---ATA--G-----TAACT-A-T-AAT--TTGAC-A--TGAACTCTCAT-AGTTTC--TT--T
gi|18102                      :   CGG-ATAT-C-TA----G-A--A--A------C--TTTTT-CTT--AATCCC-ATCGA-GTTTGAG-AT-AACGATG-TTCGA-------ATGTA-----C----T---G--TCGA-T---A---T----T--------T---TTG--C-----CTACG-ATG-AAC--G--ACAA--GG------CAT-A-T
gi|18103                      :   CGG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATCAA-GTTCGAG-AT----GAGG-TTTGA-------CTG-------
gi|18105                      :   CGG-ATAT-T-TC----A-A--A--G------T--TTTTT-CTT--GGTCTC-ATTGA-GTTCAAG-AT-AACGAGG-TTTGA-------CTG-------
gi|18106                      :   CGG-ATAT-T-TC----A-A--A--C------T--TTTAT-CTT--GGTCCC-ATCAA-GTTCGAG-AT-AACAAGG-TTCGA-------CC--------G----T---G--T--A-TA--G----------------AT---TTA--CTTT--CATCA-A-A-
gi|18107                      :   CGG-ATAT-C-TCTC--G--------------T--GTTTT-CTC--TGTCTC-ATCGA-GTTCGAG-AT-AATGAGG-TTTGA-------C--------------T---G--T--A-T---G---T----
gi|18108                      :   CGG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-ATC--GGTCCC-ATCGA-GTTCGAG-AT-AATGAGG-TT
gi|18109                      :   CGG-ATAT-C-TC----T-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-AT-AA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------C--------------T---G--T--A-T---G---T----T-------CT---T
gi|18151                      :    GG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATCGA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTTGA-------CTG-------
gi|18152                      :    GG-ATAT-C-TC----A-A--A--G------T--TTTTT-CTC--AGTCCC-ATCAA-GTTTGAG-AT-AACGAGG-TTTGA-------CTGTA-----G----T---A--C--A-T---G---TACAAT-------GT---ATA--T-----CAAC
gi|18153                      :    GG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATCAA-GTTCGAA-AT-AACAACG-TTCGA-------CTG-------
gi|18154                      :    GG-ATAT-C-TC----T-T--A--C------T--TTTTT-CTT--CGTCCC-ATCAA-GTTTGAG-AT-AACAAGG-TTCGA-------CTG-------
gi|18155                      :    GG-ATAA-A-TT----G-A--A--T------T--TTTTT-CTC--AGTCCC-ATCAA-GTTCAAG-AT-AACAATG-TTTGA-------CT--------G----T---A--T--A-T---A---T----
gi|18156                      :    GG-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATCAA-GTTCGAG-AT-AATGAGG-TTCGA-------CTG-------acgattt
gi|18159                      :    GG-ATAT-C-TC----T-C--A--G------T--TTTTT-CTC--GGTCCC-ATTGA-GTTTGAG-AT-AACGAGG-TTCTA-------CTG-------
gi|18179                      :     G-ATAA-C-TC----G-A--A--T------A--TTTTC-CTC--TGTCCC-ATCGA-GTTCGAG-AT-AACAAGG-TTTGA-------CT--------G----T---A--T--G-T---G---A----G-------AA---TTA--C-----CACTA-A-A-CAT--GT-cataaatctacgttttac
gi|18180                      :     G-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTT--CTT--GGTCCC-ATCAA-GTTC-AG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CTGTA-----G----T---G--T--A-T---
gi|18181                      :     G-ATAT-C-TC----T-C--A--G------T--TTTTT-CTC--ATTCCA-ATTGA-GTTCAAG-AT-AACAAGA-ACTGA-------CTAT------A----T---A--T--A-T---G--------T-------A-----TA--C-----CAATATA-A-AAC--AT-CA-A--TT------CTT-A-TTGCAATA--T-TTTGCAAT
gi|18182                      :     G-ATAT-C-TC----G-A--A--C------T--TTTTT-CTT--GGTCCC-ATCAA-GTTCGAG-AT-AACGAGG-TTCGA-------CT--------G----T---A--T--A-T---A---T----
gi|18189                      :      -ATAT-T-TC----A-A--AG-T------T--TTTTT-CTC--AGTCCC-ATCGA-GTTCGAG-AT-AACAAGC-TTTGA-------CT--------G----T---A--T--T-T---G---G----T-------AT---
gi|18200                      :                             ------T--TATTT-CTC--AGTCCC-ATCGA-GTTCGAG-AT-ACCAAGC-TTCGA-------CTAT------G----T---G--T--attgt
gi|18201                      :                                   a--TTTTT-CTC--AGTCCC-ATTGA-GTTCGAG-AT-AACGAGA-TTTGA-------CTG-------