lowQualScore : 1 1111111111 11 2 11
lowQualScore : 3 1 0 0 0 0 0 0 111 0 00 00 0 0 0 2 5555 0 555 00 0 22222 000 0 0 22222222 0 0 00 1 11 0 1111 0 11111 111 11111 555 0 77777 4 77 7777777777 00 3333 1 0 2 555 11 1 0 111 22222 88 55 55
lowQualScore : . . . . . . . . ... . .. .. . . . . .... . ... .. . ..... ... . . ........ . . .. . .. . .... . ..... ... ..... ... . ..... . .. .......... .. .... . . . ... .. . . ... ..... .. .. ..
lowQualScore : 2 0 9 4 9 4 4 9 666 8 66 55 4 4 4 1 0000 8 888 66 4 00000 777 4 4 44444444 8 4 66 7 11 4 6666 4 11111 555 11111 777 6 22222 9 11 2222222222 11 2222 4 0 1 000 88 0 3 777 44444 99 88 99
consensus : AAA-AAT-C-T-T-GCG-A-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GCA-AGG--N-C-AN--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--CAAATGTTGCC----CATGGAGAGAGGAT-GAA--CC--ATATTGA--TTT-CA-A-GGTCAAGGGTCAAAGG---TCAAG-GT-CACTAT---T-----GATTAT-TGCCTAAA-NATT
Reference ( gi|130444 ) : AAA-AAT-C-T-T-GTG-A-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GCA-ATG--G-C-AT--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--TAAATGTTACC----TATGGAGAAAGGAT-AAA--CC--ATGCTGA--TTT-CA-A-GGTCAAGGGTCACAAG---TCAAG-GT-CACTAT---T-----GGGTAC-TGCCTAAA-AATT
gi|130463 : AAA-AAT-C-T-T-GTG-A-A-CA--CGA-T--AG-A-A-GCA-ATG--T-C-AT--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-C------TT-----C---C-----A--TAAATGTTACC----TATGGAGAGAGGAT-GAA--CC--ATATTAAT-TTT-CA-A-GGTCAAGGGTCA-AAA---TCAAG-AT-CACTAT---T-----GAGTAC-TGCCTAAA-AAT
gi|130450 : AAA-AAT-C-T-T-GTG-A-A-CA--CGA-T--AG-A-A-GCA-ATG--G-C-AT--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--TAAAT-TTACC----TATGGAGAGAGGAT-GAA--CC--ATATTGAT-TTT-CA-A-GTTCAAGGGTCA-AAG---TCAAG-ATACACTAT---T-----GAGTAC-TGCCTAAA-
gi|130445 : AAA-AAT-C-T-T-GTG-A-A-TA--TGA-T--AA-A-A-GCA-CTG--G-C-AT--T--C-A-----TCA---G-A-T--------G-A-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--AAAATGTTACC----TATGGAGAGAGAAT-GAA--CC--ATGTTGAT-TTT-CT-A-GGTCAAGGGTCAAAAG---TCAAG-GT-CACTAT---T-----GAGTAC-TGCCAAAA-AAT
gi|130465 : AAA-AAT-C-T-T-GTG-A-A-CA--CGA-T--AG-A-A-GCA-ATG--G-T-AT--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--TAAATGTTACC----TATGGAGAGA-GAT-GAA--CC--ATATTGA--TT
gi|130466 : AAA-AAT-C-T-T-GTT-A-A-CA--CGA-T--AG-A-A-GCA-ATG--G-C-AA--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--TAAATGTTACC----TATGGAGAGAGGAT--AA--CC--ATATTGA--TT
gi|130475 : AAA-AAT-C-T-T-GTG-A-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GCA--TG--G-C-AT--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-C--AA-C----C-CT-----C---C-----A--TAAATGTTACC----TATGGAGAGAGAAT-GAA--CT--ATATTAA--T
gi|130434 : AAA-AATTC-T-T-GTG-A---CA--CGA-T--AG-A-A-GCA-ATG--G-T-AT--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--TAAATGTTACC----TATGGAGAGA-GAT-GAA--CC--ATA-TGA--TT
gi|130433 : AAA-AAT-CATGT-GTG-A-A-CA--TGA-T--AG-A-A-CCA-ATG--G-C-AT--T--T-A-----TCG---G-A-G--------G-A-CCAT--T-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--CAAATGTTACC----TATGCAGAGAGGAT-GAA--TC--ATGTTGA--TT
gi|130449 : AAA-AAT-C-T-T-GTG-A-A-CA--TGA-T--AG-A-G-GCA-ATG--A-C-AT--T--C-A-----TTA---A-A-T--------A-A-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--TAAATGTTAAT----TATGGGGAGAAGAA-GAA--CC--ATATTGA--TT
gi|130435 : AAA-AAT-CCT-T-GTG-A-A-CA--AGA-T--AA-A-A-GAA-ACA--A-C-AT--T--C-A-----TCA---G-A-G--------A-A-TCAT--C-A--GA-C----C-TT-----C---C-----A--CAAATGTTGCC----CATGGAGAGAGAAT-GAATGCT--AT--TGAT-TTT-CA-A-TGTCAAG
gi|130430 : AAA-AAT-C-T-T-TTG-A-A-CG--TGA-T--AG-A-A-GCA-AGG--T-C-AA--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--CAAATATTGTC------------AAGG-------------------------------GTCAAAGATCA-GAG---TCAA--------TAT---T-----GATTAT-TGCCTAAA-TATTtattt
gi|130418 : aAAA-AAT-C-T-T-GTG-A-A-CA--CAA-T--AG-A-A-GCA-AAG--G-C-AA--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-CCTAGC-TT-----C---C-----A--CAAATGTTtt
gi|130448 : aaAAA-AAT-C-T-T-GCG-A-A-CA--TGA-T--CG-A-A-GCT-AGG--T-C-AG--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--G-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--CAAATATTgtcaaag
gi|130447 : AAA-AAT-C-T-T-GCG-A-A-CA--TGA-T--CG-A-A-GCT-AGG--T-C-AG--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--G-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--CAAATATTgtcaagggtcaaaagtttcagagtcagttttgattattactaaatatttt
gi|130400 : AAA-AAT-C-T-T-GCG-A-A-CG--TGG-T--AG-A-A-GCA-AAG--G-C-AA--T--C-A-----TCA---A-A-GGATCACTAG-A-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----C---A-----A--CAAATATTgtcaagggtcaaagttcagagtcagttttgattattacttaaatatttt
gi|130395 : aaAAATAAT-C-T-T-GTG-A-A-TG--TGA-C--AG-A-A-GGA-GGG--T-C-AA--T--C-A-----TCA---G-G-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----T---C-----A--CAAATATTGTC----AAGGGTCAAAGATT-GAAGTCA--ATATTGA--TTgtcaagggtcaaagagcagagtcagtattg
gi|130403 : aaaAAA-AAT-T-T-----G-A-A-CA--CAG-T--AG-A-A-GCA-AAGACG-C-AA--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--CAAATATTattgcctaaatatttt
gi|130398 : aAAA-AATTC-C-T-GCG-A-A-CG--TGA-T--AG-A-A-GCA-AGG--T-C-AA--T--T-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--TAA--AA-T----A-TT-----G---C---------AAATATTAC--------------------AAA--T---------A--TT--------GTCAAGGGTCA-ACG---ATAAGAGT-CAATAT---T-----GATTAT-TGCCTAAA-TATTgtcaagtgtcaaagttgttattgactattgcctaaatatttt
gi|130399 : aAAATAAT-C-T---GCG-A-A-TT--GGA-T--AG-A-A-GCA-AGG--T-C-AA--T--C-A-----T-A---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--CAAATATtt
gi|130413 : aaaAAA-TAT-C-T-T-GCG-A-A-CG--CGA-T--AT-A-A-GGA-AGG--T-C-AA--T--C-A-----TTA---G-A-G--------G-A-TCAT--T-A--AA-C----C-TT-----C---T-----A--CTATTATTA-------ATGGgtcaagggtcaaagatcaaagttgctattgattatgtgcctaaacat
gi|130456 : aaagAAA-AAT-C-T-T--TGAA-A-CA--TGA-T--AA-A-ATGCA-AGG--T-C-AA--T--C-A-----TC------A-A--------G-A-TCA---T-A--AA-C----C-TT-----C---A-----A--AAAACATTctcaa
gi|130506 : AA-ACT-A-T-T-GTG-A-A-TA--TGA-T--GG-G-A-GCA-GGG--G-C-AA--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--G-G--AA-C----T-TT-----T---C-----A--CAAACATTACC----gtcaagttcaaagatcaaagttcagtattaatttttgcctaaataattt
gi|130397 : -AAT-C-T-T-GGG-A-A--A--TGA-T--AG-A-T-GCA-AGG--T-C-AA--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--CAAATATTATC----AAGGGTCAAAGaagtttcaaagatcaaagtcactattgattattagctaaatatttt
gi|130412 : aaaaaatat-AAT-C-T-T-GCG-A-A-CG--TGG-T--AG-A-A-GCA-AGG--T-C-AA--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCGC--T-A--AA-C----C-TT-----C---C-----AG-TCAATATTAatcagagtcaatagtgattattgcctaattatttt
gi|130455 : aaaatat-AAT-C-T-T-GCG-A-A-CG--TTG-T--AG-A-A-GCA-AGG--T-C-AA--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-ATTCGC--T-A--AA-C----CTTT-----C---C-----AGGTCAATATTAttgattattgcctaaatatttt
gi|130522 : aatattAT-C-T-T-GTG-A-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GCA-ATG--A-C-AT--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--TAAATGTTATC----TATGGAGAGAGGAT-GAA--CC--ATGTTT---TTC-CA-A-GGTCAA-------AAG---TCTTG-GT-CACTAT---C-----GAGTAC-TGCCTAAA-ttttgattatgccctaaatatttt
gi|130529 : AC-C-T-T-GTG-A-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GCA-AGG--G-C-AT--T--C-A-----TCA---G-A-G--------A-A-TCAT--C-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--CAAATGTTACT----CATAGAGAGAGGAT-GAA--CC--CTATTGAT-TTT-CA-A-GGTCAAGGGTGAAAGG---TCAAG-GT-CACTAT---T-----GACTAT-TGCC--AA-AAT
gi|130534 : AT-C-T-T-GTG-A-G-CA--TGA-T--AG-A-A-GCA-ATG--A-C-AT--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-C----T-TT-----C---A-----A--TATTTGCTACG----TAT-------GGAC-GAA--CC--ATGTTGT--TTT-CA-A-GGTCAAGGATCAAAAG---TCAAG-GT-CATTAT---T-----GAGTAC-TGCCT
gi|130537 : AC-C-T-T-GTG-A-A-CA--AGA-T--AA-A-A-GCA-AGG--G-C-AT--T--C-A-----TCA---GGA-G--------G-A-TCAT--C-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--CAAATGTTGCC----CATGAAAAGAGGAT-GAC--CC---TATTGA--TTT-CA-A-GGTCAAGGATCAAATG---TCAAG-GT-CACTAT---T-----GGCTAT-TGCCCTAA-AATT
gi|130541 : AC-C-T-T-GTG-A-A-CA--AGA-T--AG-A-A-ACA-AGG--G-C-ATGAT--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TTAT--G-G--AA-C----A-TT-----C---C-----A--CAAATGTTGTT----CATGGAGAGAGGAT-GAA--CTTAATATTGA--TTT--------TCAAGGGTCAGAGG---TTAAG-GT-CACTAT---T-----G---ACTTGCTTAAA-AATTct
gi|130532 : AC-C-T-T-GTG-A-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GCA-AGG--G-T-AT--T--C-A-----TCA---G-A-G--------A-A-TCAT--C-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--CAAATGTTGCC----CATGGAGAGAGGAT-AAA--CT--CTATTGA--TTtt
gi|130538 : AC-C-T-T-GTG-A-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GCA-AGG--G-C-AT--T--C-A-----TCA---G-A-A--------G-A-TCAT--C-A--AA-C----C-TT-----C---T-----A--CAAATGTTGCC----CATGGAGAGTGGAT-GAA--CC--CTATTGA--TT
gi|130539 : AC-C-T-T-GTG-A-G-CA--AGA-T--AG-A-G-GCA-AGG--T-C-AT--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TAAT--T-G--AA-C----C-TT-----C---C-----A--CAAATGTTGCT----CATGGAGAGAGGATGAAA--TC---TAATGA--TTT--------TCAAGG-----------TCAAG-AT-CACTAT---T-----G---AC-T-----AA-AATT
gi|130542 : AC-C-T-T-GTA-A-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GCT-AGG--A-C-AT--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAT--C-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--CAAATGTTGCC----TATGGAGAGTGGAT-AAA--TC--CTATTGA--TTct
gi|130531 : AT-C-T-T-GTG-A-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GCA-AGG--G-C-AT--T--T-A-----TCG---G-A-G--------G-A-TCAT--C-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--CAAATGTTCCC----CATGGAGAAAGAGT-GAA--C
gi|130545 : AC-C-T-T-GTG-A-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GCA-AGG--G-T-AT--T--T-A-----TCA---G-A-G--------A-A-TCAT--G-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--CAAATGTTGCC----CATGGAGAGAGGAT-GAacttgatt
gi|130526 : AC-C-T-T-GTG-A-A-CA--CAA-T--AG-A-A-GCA-AGG--G-C-AT--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCGT--C-A--AT-C----C-TT-----C---C-----A--CAAATCTTGTC----CATGGAAAGAAGAT-GAG--TC--CTATTGAT-TTT-CA-ATGGCCAAtgtgtattgatt
gi|130530 : AT-C-T-T-GTT-A-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GCA-AGG--G-C-AA--T--C-A-----TCA---G-A-G--------GAA-TCAC--CAA--AA-C----C-TC-----C---C-----T--CAAATGTTGCC----CATGGAGTGATGAT-GGA--GC--CTATTGA--TTa
gi|130536 : AC-C-T-T-GTG-A-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GCA-AGG--G-C-AT--T--C-A-----TCA---G-A-A--------A-A-TCAT--C-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--CAAATGTTGCC----
gi|130525 : AT-C-T-T-GTG-A-A-CA--TGA-T--AG-A-A-ACA-AGG--A-C-AG--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAT--C-A--AA-C----C-TC-----C---C-----T--CAAATGTTGCT----CATGGTGTGAAGAT-GAA--GC--A
gi|130524 : AT-C-T-T-GTG-A-A-CA--TGA-T--AG-A-A-ACA-AGG--A-C-AG--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAT--C-A--AA-C----C-TC-----C---C-----T--CAAATGTTGTT----CATGGTGTGAAGAT-GAA--GC--Aaattcatt
gi|130528 : AC-C-T-T-GTG-A-A-TA--AGA-T--AG-A-A-GCA-AGG--G-C-AT--T--C-A-----TCA---G-A-C--------A-A-TTAT--C-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--AAAGTGTT------------------GAT-------C--ATG--GA---------------AAGGGTCAAACG---ACAAG-GT-CACTAT---T-----GATTAT-GGCTTAAA-aattcatt
gi|130390 : AT-C-T-T-GCG-A-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GCA-AGG--T-C-AA--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----C---T-----A--CAAATATTGTC-----------AAGGGTT-AAAGTCA--ATATTGA--TT
gi|130407 : aaagaattAT-C-T-T-GTG-A-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GCA-AGG--T-C-AA--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----C---T-----A--aatgcctaaatattt
gi|130406 : aaagaattAT-C-T-T-GCG-A-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GCA-AGG--T-C-AA--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----C---T-----A--ctactatt
gi|130513 : aaacaattAT-C-T-T-GCG-A-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GCA-AGG--T-C-AA--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----C---T-----A--ctactatt
gi|130411 : tAT-C-T-T-GCG-A-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GCA-AGA--T-C-AA--T--T-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--ctattaatggctcaaccagcgggtc
gi|130404 : aaagaattAT-C-T-T-GCG-A-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GCA-AGG--T-C-AA--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----C---ctattaatggctcaa
gi|130401 : aaagaattAT-C-T-T-TCG-A-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GCA-AGG--T-C-AA--T--C-A-----TCA---G-A-G--------A-A-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----C---T-----A--CAAATATT
gi|130544 : aaagaattAC-C-T-T-GTG-A-A-CA--AGA-T--GG-A-A-GCA-AGG--T-C-AT--T--T-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAT--C-A--AA-C----C-TC-----C---C-----A--CAAAgtta
gi|130408 : AT-C-T-T-GCG-A-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GCA-AGG--T-C-AA--T--G-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----C---T-----A--
gi|130509 : aaagaattAT-C-T-T-GCA-A-A-CG--TGA-T--AT-A-T-GCA-AGG--T-C-AG--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----C---A-----A--CAAATATTctactatt
gi|130389 : aattAT-C-T-T-GCG-A-A-CG--TTA-T--AT-A-A-GCA-AGG--T-C-AA--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----C---T-----A--CTAATATTgttaagggtcaaagatcagagtcaatattgattattgcctaaatatttt
gi|130396 : aaagaattAT-C-T-T-GCA-A-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GCA-AGG--T-C-AA--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-C----C-T----------------A--CAAATATTtttaagggtcaaagatgagggtcaatattgattaatgcctaaatatttt
gi|130391 : aaagaattAT-C-T-T-GCG-A-A-CA--GGA-T--AT-A-A-GCA-AGG--T-C-AA--T--C-A-----TCA---G-G-G--------G-A-TCAC--T-A--AA------C-TT-----C---T-----A--CAAATATTgtcaaggttcaaagatcagagtcaatcttgatttaaatggcctaaatgatttt
gi|130419 : aaagaattAT-C-T-T-GCG-A-A-CG--TGA-T--AT-A-G-ACA-AGG--G-C-AA--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-C----C-gtcaagggtcaaagatctcggagtcaatattgattaatgccttaatagttt
gi|130388 : aaagaattAT-C-T-T-GCG-A-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GCA-AGG--T-C-AA--T--C-A-----TCA---A-A-GTCAG----G-A-TCAC--T-A--AAAC----C-TT-----C---T-----A--CAAATATT
gi|130416 : aaagaattAT-C-T-T-GCG-A-A-CA--TGA----AT-A-A-GCA-AGG--T-C-AA--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA------C-TT-----C---T-----A--gttaagggtcaaagatcagagtcgatattgattaatgcctaaatatttt
gi|130415 : aaagaattAT-C-T---GCG-A-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GCA-AGG--T-C-AA--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA------C-TT-----C---T-----A--c
gi|130392 : aaagaattAT-C-T-T-GCG-A-A-TG--TGA-T--AT-A-A-GCT-AGG--T-C-AA--T--C-A-----TCA---G-G-G--------G-A-TCAC--T-A--AA------C-TT-----C---T-----A--CAAATATTc
gi|130420 : aaagaattAT-C-T-T-GCG-A-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GCA-AGG--T-CAAT--C--C-A-----TCA---G---G--------G-A-TCACTTT-A--AA-C----C-TT-----T---C-----A--gtcaagggtcaaagatcagagtcaataactcaataatgattaatgtctaaatatttt
gi|130405 : aaagaattAT-C-T---GCG-A-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GCACAGG--T-C-AA--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----C---T-----A--CTACTATTA-------ATGGctactatt
gi|130421 : aaagaattAT-C-T-T-GCG-A-A-CA--TGA-T--AT-A-G-CCA-AGG--T-C-AA--T--C-A-----TCA---C-A-G--------G-T-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----C---T-----A--gtcaa
gi|130394 : aaagaattAT-C-T-T-GCG-A-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GCA-AGT--T-C-AA--T--C-A-----TCA---G-G-G--------G-A-TCAC--G-A--A-------C-TT-----C---T-----A--CAAATATTctactatt
gi|130425 : aagaatattAT-C-T-T-GCG-A-A-CA--TGA-T--A-----------------------T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----C---T-----A--CTACTATTA-------ATGGgtcaagggtcaaatattagaatcaatattgattaatgcctaaatatttt
gi|130422 : aaagaattAT-C-T-T-GCG-A-A-CA--TGA-T--AT-A-G-CCA-AGG--T-CAAT--T--C-A-----TCA---C-A-G--------GTT-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----C---T-----A--ctcaaccagcggggtc
gi|130417 : aaagaattAT-C-T---GCG-A-A-CA--TGA----AT-A-A-GCA---G--GTC-AA--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-CTTA-C-TA-----C---T-----A--TTAATGctactatt
gi|130423 : aaagaattAT-C-T-TTGCG-A-A-CG--TGA-A--AT-A-A-GCA-AGG--T-C-AA-----C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--TAA--AA-T----C-TT-----C---T-----A--gctcaa
gi|130511 : aaagaattAT-C-T-TTGCG-A-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GGA-GAG--T-C-AA--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--A---------TT-----C---T-----AC-TACATATT
gi|130410 : ttAT-C-G-T-GCG-A-AACA--AGAAT--AT-A-A-GCA-AAG--GTC-AA--T--G-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-AATAA-C----C-TT-----C---T-----A--
gi|130409 : aaagaattAT-C-G-T-GCG-A-AACA--AGAAT--AT-A-A-GCA-AAG--GTC-AA--T--G-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-AATAA-C----C-TT-----C---T-----A--
gi|130414 : aaagaattAT-C-T-T-GCG-A-A-CGCTTGA-T--TA-ATA-GCA-AGG--T-C-AA--T--CTA-----TTA---G-A-G--------G-A-TCAT--T-A--AA-C----C-T
gi|130402 : aagaaattAT-C-T-T-GTG-ACG-TA--TGA-T--AC-G-A-GCC-AAG------AT--CAAC-A-----TCA---A-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA------C-TT-----C---TACAGAA--TAATTGTTActactattattagggctcaa
gi|130575 : aaagaattcT-C-T-T-GGG-A-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GCA-ATG--G-C-AT--T--C-AGCCATTCATGAG-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----CTTCC-----A--TAAATGTTACC----TATCGAGAGAGGAT-GAA--CC--ATATTGA--TTTTCA-A-GGTCAAGGGTCAAAAG---TCAAG-AT-CACTAT---T-----GAGTAC-TGCCTAAaggaggtccaaaagatcagagtcattattgattaatatcagcttaaatatttt
gi|130579 : T-C-T-T-GTG-A-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GCA-AAA--G-T-AT--T--C-A-----ATA---G-A-G--------G-A-TCAT--T-A--AA-C----A-TT-----C---C-----A--CAAATGTTGCT----CATGGAGAGCGGA---------------TGA--TTT-TATA-GGTC-----------------AAG-GT-CACTAT---T-----TATTAT-TGCCTAA
gi|130577 : T-C-T-T-GTG-A-A-CA--TGA-T--TG-A-A-GCA-ATG--A-C-AT--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-A----C-TT-----C---C-----A--CAAAttatctt
gi|130580 : T-C-T-T-GTG-A-A-CA--AGA-T--A--A-A-GCA-AGG--G-T-AT--T--C-A-----TCA---G-A-G--------A-A-TCAT--C-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--CAAATGTTGCC----att
gi|130589 : -C-T-T-GTG-A-A-CA--AGA-C--AG-A-A-GCA-AGG--G-A-AT--T--C-A-----TCA---G-A-A--------A-A-TCAT--C-A--AG-C----C-TT-----C---C-----A--CAAATGTTGCC----CATTGAGAGAGGGT-GAA--CC--CTATTGAT-TTT-CA-A-GTTCAAAG-------A---TCAAG-GT-CACTAT---T-----GACCAC-TGTTTAAA-AAT
gi|130587 : -C-T-T-GTG-A-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GCA-AGG--G-C-AT--T--C-A-----TCA---G-A-G--------A-A-TCAT--C-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--CAAATGTTGCC----CATGGctt
gi|130586 : -C-T-T-GCG-A-A-CA--TGA-T--AT-A-A-ACA-AGG--T-C-AA--T--C-A-----CCA---G-A-G--------G-A-TCAA--T-A--AA-C----C-TT-----C---tcactattgactactgactaaaattct
gi|130598 : -T-T-GTG-A-A-CA--TGA-T--GG-A-A-GCA-AGG--G-C-AT--T--C-A------CA---G-A-G--------G-A-TCAT--C-A--GA-C----C-TT-----TTGGC-----A---AAATGTTGCC----CATGGAGAGAGGAC-GAA--CC--CTATTGA--TTTTCA-A-GTTCAAGGGTCAAAGA---TCAGG-GT-CACTAT---T-----GACTAT-TGCCTAAA-AATtgctactattaatggctcaa
gi|130599 : -T-T-GTG-A-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GCA-AGG--G-C-AT--C--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAT--C-A--AA-C----C-TT-----A---C-----A--CAAATGTTGTC----CATGGAGCTAGCAT-GAA--C-----ACTTAATTTT-CA-A-GGTCTAGG-------G---TCAAG-GT-CACTATTAAT-----GACTAA-TGCCTAAA-AATctt
gi|130601 : -T-T-GTG-A-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GTA-AGG--G-C-AT--T--C-A-----TTA---G-A-G--------A-A-TCAT--C-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--CAAATGTTGCC----CATGGAGAGAGGAT-AAC--CT--AT--TGA--TTctt
gi|130600 : -T-T-GTG-A-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GCA-AGG--G-T-AT--T--C-A-----TCA---G-A-G--------A-A-TCAT--C-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--CAAATATTGCT----CATGGAGAGAGGAT-GAA--CC--
gi|130596 : -T-T-GTG-A-A-CA--GGA-T--AG-A-A-GCA-AGG--G-T-AT--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAT--C-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--CACATGTTGCC----CActatatatttt
gi|130607 : -T-GTG-A-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GCA-AGG--G-T-AT--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAT--C-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--AAAATGTTGCC----CATGAAGAGAGGAT-AAA--CC--TTATTGAT-TTT-CA-A-GGTGAAGGGTCAAAGG---TCAAG-GT-CACTAT---T-----GACTAT-TGCCTCTA-AATgg
gi|130612 : -T-GTG-A-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GCA-AGG--G-C-AT--T--C-A-----TTA---G-A-G--------G-A-TCAT--C-A--AA-C----C-CT-----C---C-----A--CAAATGTTGCCCATGCATGGAGAGAGGAT-AAA--CC--CTATTGAT-TTT-CA-A-GGTCActt
gi|130608 : -T-GTG-A-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GCA-AGG--G-T-AT--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAT--C-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--CAAATGTTGCC----CATGGAGAAAGTATGAAA--CCTAGTACTGA--TTccattgactatgtccctaaattttt
gi|130611 : -T-GTG-A-A-CA--AAA-T--AC-A-G-GCA-AGG--G-C-AT--T--T-A-----TTG---G-A-A--------G-A-TCAT--C-A--AA-C----T-TT-----C---C-----A--CAAATATTGCT----CAAGGTGAGAGGAT-GAA--TC--CTAATGA--TTT-TT-A---TTGAAAG------G---TCAAG-GT-CACTAT---T-----GACTAA-TGCCTAAA-AAT
gi|130514 : -T-GTG-A-A-CA--AGA-C--AG-A-A-GCA-AAG--G-C-AA--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-CCAC--T-A--CA-C----T-TC-----C---C-----A--CAAATATTATT----CAT----------T-GAA--C-------------TT-CC-A-GGTCTCGAGTCAAAGA---TCAAA-GT-CACTGT---T-----GATTAT-TGACCAActt
gi|130515 : tatac-T-GTG-A-A-CA--AGA-C--AG-A-A-GCA-A-G--G-C-AA--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-CCAC--T-A--CA-C----T-TC-----C---C-----A--CAAATATTATT----CAT----------T-GAA--C-------------TT-CC-A-GGTCTCGAGTC-CAAGA--TCAAA-GT-CACTGT---T-----GATTAT-TGACCAAcatttt
gi|130424 : tatac-A-A-CG--TGA-T--AATA-A-G-----G--GTC-AA--T--C-AGA---TCA---G-AAG--------G-A-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----catttt
gi|130618 : aagacattattctagacga-A-CA--TAA-TGTAG-A-A-GCA-AGG--T-C-AA--T--C-A-----TCA---G-A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--CAAATATTGTC----AAGGGTGAAAGaagggttaagatcagatcgccatattgattaagtctaatatttt
gi|130623 : A-T--AG-A-A-GCA-AGG--G-C-AT--T--C-A-----TCA---G-A-G----------A-TCAT--C-A--AA-C----C-TT-----C---C-----A--CAAATGTTGCC----CAT-GAGAGAGAAT-GAA--CC--ATATTGA--TTT--------TCAAGGGTCA-AAG---TCAAG-GT-CACTAT---C-----GACTAT-TGACTAAA-Aatcagagtcaatattgattattgcttaaatatttt
gi|130622 : A-T--AG-A-A-GCA-AGG--T-C-AA--T--C-AA----TCA---T-A-A--------G-A-TCAC--TAA--AA-C----C-TTAAATCC---C-----A--CAAATATTGTC---------AAAAGGG-----------------------T-CA-A-AGTCAGA------AAG---TCAA--------TAT---T-----GATTAT-TGCCTAAA-TATTtactt
gi|130625 : -T--AG-A-A-CCA-AGG--G-C-AA--T--C-A-----TCA---A-A-G--------G----CAC--T-A--AA-C----G-TT-----C---C-----A--CAGATATTGCT----CAT----------------------TGCT----TTT-CA-G-GGTCAA-------AAC---TCA---GT-CAC--T---T-----GATAAT-TGCCTAAA-ATTTtt
gi|130456 : T-CA-A-GTTCAAAGATCA-AAG---T------T-CAGTAT---T-----AATTTT-TGCCTAAATAATTt
gi|130448 : aaaaatctttgaaacatgataaaatgcaaggtcaatcatcaagatcataaaccttcaaaaaacattgGTCAAGGGTCAAAAGTT-TCAGA-GT-CAGTTT---T-----GATTAT-TA-CTAAA-TATTt
gi|130447 : aaaaatcttgcgaacatgatcgaagctaggtcagtcatcagaggatcacgaaaccttccacaaatattGTCAAGGGTCA-AAGT--TCAGA-GT-CAGTTT---T-----GATTAT-TACTTAAA-TATTtt
gi|130390 : aaaaatcttgcgaacatgatcgaagctaggtcagtcatcagaggatcacgaaaccttccacaaatattGTCAAGGGTTA-AAG---TCAA--------TAT---T-----GATTAA-TGCCTAAA-TATTtt
gi|130395 : aaagaattatcttgcgaacgtgatataagcaaggtcaatcatcagaggatcactaaaccttctacaaatattGTCAAGGGTCAAAGA---TTGAA-GT-CAATAT---T-----GATTAT-TGCCTAAA-TATTt
gi|130618 : aaaaaataatcttgtgaatgtgacagaaggagggtcaatcatcaggggatcactaaacctttcacaaatattGTCAAGGGTGAAAGA---TCAGA-GT-CAATAT---T-----GATTAT-TGCTTAAA-TATTtt
gi|130509 : acataatgtagaagcaaggtcaatcatcagaggatcactaaaccttccacaaatattGTTAAGGGTCAAAGA---TCAGA-GT-CAATAT---T-----GATTAT-TGCCTAAA-TATTtt
gi|130391 : aattatcttgcaaacgtgatatatgcaaggtcagtcatcagaggatcactaaaccttcaacaaatattGTCAAGGGTCA-AAGATCTCGGA-GT-CAATAT---T-----GATTAA-TGCCTTAA-tt
gi|130388 : aaagaattatcttgcgaacaggatataagcaaggtcaatcatcaggggatcactaaacttctacaaatattGTTAAGGGTCAAAGA---TCAGA-GT-CGATAT---T-----GATTAA-TGCCTAAA-TATTtagttt
gi|130399 : aaagaattatcttgcgaacgtgatataagcaaggtcaatcatcaaagtcaggatcactaaaaccttctacaaatattGTCAAGGGTCAAAGA---TCAAA-GT-TGCTAT---T-----GATTATGTGCCTAAA-CATtt
gi|130394 : aaaaaataatctgcgaattggatagaagcaaggtcaatcatagaggatcactaaaccttccacaaatatGTCAAGGGTCAAATA---TTAGA-AT-CAATAT---T-----GATTAA-TGCCTAAA-TATT
gi|130641 : aagaatattatcttgcgaacgtgatataagcaagttcaatcatcaggggatcacgaacttctacaaatattGTCAAGGGTCAAAGA---TCAAA-GT-TGCTAT---TTTTTATTTTAT-TGCCTAAA-TATTtt
gi|130397 : tccacaaatattTCAAGGGTCAAAGA---TCAGA-GT-CAATAG---T-----GATTAT-TGCCTAAtt
gi|130389 : aaaaaatataatcttgggaaatgatagatgcaaggtcaatcatcagaggatcactaaaccttccacaaatattaTTAAGGGTCAAAGA---TGAGG-GT-CAATAT---T-----GATTAA-TGCCTAAA-TATTttatttt
gi|130506 : aaagaattatcttgcgaacgttatataagcaaggtcaatcatcagaggatcactaaaccttctactaatatttCAAGTTTCAAAGA---TCAAA-GT-CACTAT---T-----GATTAT-TAGCTAAA-TATTtt
gi|130643 : aaactattgtgaatatgatgggagcaggggcaatcatcagaggatcacggaacttttcacaaacattacAATGGTCAAAGA---TGAGA-GT-CAATAT---T-----GATTAA-TGCCTAAA-TATTtt
gi|130403 : actgtG---TCAAA-GT-TGTTAT---T-----GACTAT-TGCCTAAA-TATTt
gi|130587 : aaaaaatttgaacacagtagaagcaaagacgcaatcatcagaggatcactaaaccttccacaaatattgtcaagtCATG-GT-CACTAT---T-----GACTAC-TGACTAAA-Att
1 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|130640 ): CACTAAACTTCTACAAAAATTGTCACAGGGTACAAACAATCACAAGTCATATTAATTAATGCCTAATATTTT
Alignments
lowQualScore : 111111
lowQualScore : 3 1 0 0 0 0 0 111 0 00 00 0 0 0 0 22222222 1 11 111 0 0 00 1111 0 11111111 0 0 00 2 11 0000 111 44444 333 222222 99999999 4 888888 2 0 0 7777 1111 3333 3333333 1 1111 111 111 11 1 1111 1 3
lowQualScore : . . . . . . . ... . .. .. . . . . ........ . .. ... . . .. .... . ........ . . .. . .. .... ... ..... ... ...... ........ . ...... . . . .... .... .... ....... . .... ... ... .. . .... . .
lowQualScore : 1 0 9 4 9 4 9 555 8 66 44 4 4 4 4 33333333 9 00 777 4 8 66 3333 4 55555555 8 4 66 1 11 9999 555 99999 999 555555 55555555 1 111111 2 8 8 0000 8888 0000 0000000 7 9999 555 555 22 7 8888 7 2
consensus : AAA-AAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGNC--AN--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--A-TATTGA-TTT-CAAGGTCAAGGGTCA-A-AGG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--TTAT-T----G-CCTAAATATT
Reference ( family-141 ) : AAA-AAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGNC--AN--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--A-TATTGA-TTT-CAAGGTCAAGGGTCA-A-AGG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--TTAT-T----G-CCTAAANATT
gi|130388 : AT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAAAGTCA-G--------G-A-TCAC--TAA--AAC----CTTC---TACAAATATTGTT----AAGGGTC-AAAGATCA-----G-AG--TCG-A-TATTGA-TT
gi|130388 : aaagaattGTTAAGGGTCA-A-AGA--T----C----AG------AGT-CG---ATA---T---TGA--TTAA-T----G-CCTAAATATTaatgcctaaatatttt
gi|130389 : aaagaattatcttgcgaacgtgatataagcaaggtcaatcatcaaagtcaggatcactaaaaccttctacaaatattAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TTA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACTAATATTTTT----AAGGGTC-AAAGATGAG----G-GT--CA--A-TATTGA-TTtt
gi|130389 : aaagaattTTAAGGGTCA-A-AGA--T----G----AG------GGT-CA---ATA---T---TGA--TTAA-T----G-CCTAAATATTaatgcctaaatatttt
gi|130390 : aaagaattatcttgcgaacgttatataagcaaggtcaatcatcagaggatcactaaaccttctactaatatttAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACAAATATTGTC--------------AAGGGTT----A-AAGTCA--A-TATTGA-TTtt
gi|130390 : aaagaattGTCA-A-GGG--T----T----AA------AGT-CA---ATA---T---TGA--TTAA-T----G-CCTAAATATTaatgcctaaatattt
gi|130391 : aaagaattatcttgcgaacgtgatataagcaaggtcaatcatcagaggatcactaaaccttctacaaatattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--GGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----G-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-----CTTC---TACAAATATTGTC----AAGGG---TCA-AAGATCTCGG-AG--TCA-A-TATTGA-TTt
gi|130391 : aaagaattGTCAAGGGTCA-A-AGATCT----C----GG------AGT-CA---ATA---T---TGA--TTAA-T----G-CCTTAATaatgccttaatagttt
gi|130392 : aaagaattatcttgcgaacaggatataagcaaggtcaatcatcaggggatcactaaacttctacaaatattAT-C-T-T-GCGA-A-TG--TGA-T--AT-A-A-GC-T-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----G-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-----CTTC---TACAAATATTGTC---------------AAGGGT-----------C--A-------------AAGATC-AGAGTCA-ATAAC--T----C----AA----------------TA---A---TGA--TTAA-T----G-TCTAAATATTgttt
gi|130394 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GTTC--AA--T-C-A--TCAG----G-G--------G-A-TCAC--G-A--A------CTTC---TACAAATATTGTC---------------AAGGGT----C-AA------A-TATT---------------AGAATCA-A----------------------------------TA---T---TGA--TTAA-T----G-CCTAAATATTtt
gi|130395 : aagaatattAAATAAT-C-T-T-GTGA-A-TG--TGA-C--AG-A-A-GG-A-G--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----G-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTT---CACAAATATTGTC----AAGGG---TCAAAGATT----G-AAGTCA--A-TATTGA-TTtt
gi|130395 : aaaGTCAAGGGTCA-A-AGA--T----T----GA------AGT-CA---ATA---T---TGA--TTAT-T----G-CCTAAATATTattgcctaaatatttt
gi|130396 : aaaaaataatcttgtgaatgtgacagaaggagggtcaatcatcaggggatcactaaacctttcacaaatattAT-C-T-T-GCAA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CT------ACAAATATTGTC----AA-GGTTCAAAGATCA-----G-AG--TCA-A-TCTTGA-TTT-AAAtt
gi|130397 : aaagaatt-AAT-C-T-T-GGGA-A--A--TGA-T--AG-A-T-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CACAAATATTATC---------------AAGGGT-----------C--A-------------AAGATC-AGAGTCA-A----------------------------------TA---G---TGA--TTAT-T----G-CCTAATTATTtggcctaaatgatttt
gi|130398 : aaaaaatatAAA-AATTC-C-T-GCGA-A-CG--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-T-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--TAA--AAT----ATT-----GCAAATATTAC----------------------------AA------A-TATT-----------GTCAAGGGTCA-A-CGA--T----A----AG------AGT-CA---ATA---T---TGA--TTAT-T----G-CCTAAATATTtt
gi|130399 : aAAATAAT-C-T---GCGA-A-TT--GGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--T-AG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CACAAATATtt
gi|130399 : aaaGTCAAGGGTCA-A-AGA--T----C----AA------AGT-TG---CTA---T---TGA--TTATGT----G-CCTAAACATgtcaagggtcaaagatcaaagttgctattgattatgtgcctaaacat
gi|130400 : aaaaaataatctgcgaattggatagaagcaaggtcaatcatagaggatcactaaaccttccacaaatatAAA-AAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGG-T--AG-A-A-GC-A-A--------AGGC--AA--T-C-A--TCAA----A-GGATCACTAG-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---AACAAATATTGTC----AAGGGTC-AAAGAGCA-----G-AG--TC--AGTATTG
gi|130401 : aaAT-C-T-T-TCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACAAATATTG
gi|130402 : aaagaattAT-C-T-T-GTGACG-TA--TGA-T--AC-G-A-GCCA-A--------GATC--AA----C-A--TCAA----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-----CTTC---TAC--------------------------AGAAT----A-A-----------TTG----T-TAAGG---AGGTCCAAA-AGA--T----C----AG------AGT-CA---TTA---T---TGA--TTAA-TATCAG-CTTAAATATTtta
gi|130403 : aaagaattcAAA-AAT-T-T-----GA-A-CA--CAG-T--AG-A-A-GC-A-A--------AGACGCAA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CACAAATATTGTC----tt
gi|130403 : aGTCA-A-GTG--T----C----AA------AGT-TG---TTA---T---TGA--CTAT-T----G-CCTAAATATTaagtgtcaaagttgttattgactattgcctaaatatttt
gi|130404 : aaaaaatttgaacacagtagaagcaaagacgcaatcatcagaggatcactaaaccttccacaaatattAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---tt
gi|130405 : aaagaattAT-C-T---GCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GC-ACA--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TAC
gi|130406 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACtactattaatgggtcaa
gi|130407 : aaacaattAT-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACtactatt
gi|130408 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-G-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACtactatt
gi|130409 : aaagaattAT-C-G-T-GCGA-AACA--AGAAT--AT-A-A-GC-A-AA-------GGTC--AA--T-G-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-AATAAC----CTTC---TAtactatt
gi|130410 : aaagaattAT-C-G-T-GCGA-AACA--AGAAT--AT-A-A-GC-A-AA-------GGTC--AA--T-G-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-AATAAC----CTTC---TA
gi|130411 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GATC--AA--T-T-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CAC
gi|130412 : aaagaatt-AAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGG-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCGC--T-A--AAC----CTTC---CAtattaatggctcaa
gi|130412 : aaaatat-CAAGGTCAATCATCA-G-AGGA-T----CGCTAAACCTTCCAGT-CAATATTA---T---TGA--TTAT-T----G-CCTAAATATTgtcaatattattgattattgcctaaatatttt
gi|130413 : aaaatataatcttgcgaacgtggtagaagAAA-TAT-C-T-T-GCGA-A-CG--CGA-T--AT-A-A-GG-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TTAG----A-G--------G-A-TCAT--T-A--AAC----CTTC---TACtt
gi|130414 : aaagAT-C-T-T-GCGA-A-CGCTTGA-T--TA-ATA-GC-A-A--------GGTC--AA--T-CTA--TTAG----A-G--------G-A-TCAT--T-A--AAC----CTtattattaatggctcaa
gi|130415 : aagaaattAT-C-T---GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-----CTTC---TACctactattattagggctcaa
gi|130416 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA----AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-----CTTC---TAC
gi|130417 : aaagaattAT-C-T---GCGA-A-CA--TGA----AT-A-A-GC-A----------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----TTAC---TAC
gi|130418 : aaagaattAAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-CA--CAA-T--AG-A-A-GC-A-A--------AGGC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AACCTAGCTTC---CACAAATGTTGTC----tattaatggctcaa
gi|130419 : aaAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-G-AC-A-A--------GGGC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----Caaag
gi|130420 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--TCC-A--TCAG------G--------G-A-TCACTTT-A--AAC----CTTT---CAC
gi|130421 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-G-CC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAC----A-G--------G-T-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACtactatt
gi|130422 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-G-CC-A-A--------GGTCA-AT--T-C-A--TCAC----A-G--------GTT-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACtactatt
gi|130423 : aaagaattAT-C-T-TTGCGA-A-CG--TGA-A--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA----C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--TAA--AAT----CTTC---TAtactatt
gi|130424 : aaagaattA-A-CG--TGA-T--AATA-A-G-------------GGTC--AA--T-C-AGATCAG----AAG--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTT-------AAGGGTT-----------A---AGATCAGATC---G-----CC--A-TATTGA-TT
gi|130425 : aagacattattctagacgaAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--A------------------------------T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACaagtctaatatttt
gi|130430 : aaagaattAAA-AAT-C-T-T-TTGA-A-CG--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CACAAATATTGTC---------------AAGGGT-----------C--A-------------AAGATC-AGAGTCA-A----------------------------------TA---T---TGA--TTAT-T----G-CCTAAATATTtactattaatggctcaaccagcggggtc
gi|130433 : aAAA-AAT-CATGT-GTGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-CC-A-A--------TGGC--AT--T-T-A--TCGG----A-G--------G-A-CCAT--T-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTACC----TATGC---AGAGAGGAT----G-AA--TC--A-TGTTGA-TTtt
gi|130434 : AAA-AATTC-T-T-GTGA---CA--CGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CATAAATGTTACC----TATGG---AGAGA-GAT----G-AA--CC--A-TA-TGA-TT
gi|130435 : AAA-AAT-CCT-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AA-A-A-GA-A-A--------CAAC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAT--C-A--GAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---AGAGAGAAT----G-AA--TG--C-TATTGATTTT-CAATGTCAAG
gi|130444 : AAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CATAAATGTTACC----TATGG---AGAAAGGAT----A-AA--CC--A-TGCTGA-TTT-CAAGGTCAAGGGTCA-C-AAG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGG--GTAC-T----G-CCTAAAAATTtattt
gi|130445 : AAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-TA--TGA-T--AA-A-A-GC-A-C--------TGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-T--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CAAAAATGTTACC----TATGG---AGAGAGAAT----G-AA--CC--A-TGTTGATTTT-CTAGGTCAAGGGTCA-A-AAG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--GTAC-T----G-CCAAAAAAT
gi|130447 : AAA-AAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--CG-A-A-GC-T-A--------GGTC--AG--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--G-A--AAC----CTTC---CACAAATATTGTC----
gi|130447 : GTCAAGGGTCA-A-AGT--T----C----AG------AGT-CA---GTT---T---TGA--TTAT-T----A-CTTAAATATTaagggtcaaagttcagagtcagttttgattattacttaaatatttt
gi|130448 : aaaaatcttgcgaacatgatcgaagctaggtcagtcatcagaggatcacgaaaccttccacaaatattAAA-AAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--CG-A-A-GC-T-A--------GGTC--AG--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--G-A--AAC----CTTC---CACAAATATTGTC----tt
gi|130448 : GTCAAGGGTCA-A-AAGTTT----C----AG------AGT-CA---GTT---T---TGA--TTAT-T----A--CTAAATATTaagggtcaaaagtttcagagtcagttttgattattactaaatatttt
gi|130449 : aaaaatcttgcgaacatgatcgaagctaggtcagtcatcagaggatcacgaaaccttccacaaatattAAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--AG-A-G-GC-A-A--------TGAC--AT--T-C-A--TTAA----A-T--------A-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CATAAATGTTAAT----TATGG---GGAGAAGAA----G-AA--CC--A-TATTGA-TTtt
gi|130450 : AAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-CA--CGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CATAAAT-TTACC----TATGG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--A-TATTGATTTT-CAAGTTCAAGGGTCA-A-A-G--T----C----AA------GATACA---CTA---T---TGA--GTAC-T----G-CCTAAA
gi|130455 : -AAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TTG-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-ATTCGC--T-A--AAC----CTTT---C
gi|130456 : aatattAAA-AAT-C-T-T-TGAA-A-CA--TGA-T--AA-A-ATGC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TC------A-A--------G-A-TCA---T-A--AAC----CTTC---AAAAAACATTGTC----caggtcaatattattttgattatgccctaaatatttt
gi|130456 : GTCAAGT-TCA-A-AGA--T----C----AA------AGTTCA---GTA---T---TAA--TTTT-T----G-CCTAAATaagttcaaagatcaaagttcagtattaatttttgcctaaataattt
gi|130463 : aaaaatctttgaaacatgataaaatgcaaggtcaatcatcaagatcataaaccttcaaaaaacattAAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-CA--CGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGTC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC-----TTC---CATAAATGTTACC----TATGG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--A-TATTAATTTT-CAAGGTCAAGGGTCA-A-A-A--T----C----AA------GAT-CA---CTA---T---TGA--GTAC-T----G-CCTAAAAATattt
gi|130465 : AAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-CA--CGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CATAAATGTTACC----TATGG---AGAGA-GAT----G-AA--CC--A-TATTGA-TT
gi|130466 : AAA-AAT-C-T-T-GTTA-A-CA--CGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGGC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CATAAATGTTACC----TATGG---AGAGAGGAT------AA--CC--A-TATTGA-TT
gi|130475 : AAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-T--------GG-C--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-C--AAC----CCTC---CATAAATGTTACC----TATGG---AGAGAGAAT----G-AA--CT--A-TATTAA-T
gi|130506 : AA-ACT-A-T-T-GTGA-A-TA--TGA-T--GG-G-A-GC-A-G--------GGGC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--G-G--AAC----TTTT---CACAAACATTACC--------A---AG------------------------------TTT-CA------AAGATCA-A-A-----------------------GT-CA---CTA---T---TGA--TTAT-T----A-GCTAAATATT
gi|130509 : AT-C-T-T-GCAA-A-CG--TGA-T--AT-A-T-GC-A-A--------GGTC--AG--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---AACAAATATTGTT---------------AAGGGT-----------C--A-------------AAGATC-AGAGTCA-A----------------------------------TA---T---TGA--TTAT-T----G-CCTAAATATTtt
gi|130511 : aattAT-C-T-TTGCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GG-A-G--------AGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--ATT----CTAC---TACATATtt
gi|130513 : ttAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACt
gi|130514 : t-T-GTGA-A-CA--AGA-C--AG-A-A-GC-A-A--------AGGC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-CCAC--T-A--CAC----TTCC---CACAAATATTATT----CAT-------------T----G-AA--C-------------TT-CCAGGTCTCGAGTCA-A-AGA--T----C----AA------AGT-CA---CTG---T---TGA--TTAT-T----GACC--AACATTtattaatggctcaaccagcgggtc
gi|130515 : tatac-T-GTGA-A-CA--AGA-C--AG-A-A-GC-A-A--------GG-C--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-CCAC--T-A--CAC----TTCC---CACAAATATTATT----CAT-------------T----G-AA--C-------------TT-CCAGGTCTCGAGTCC-A-AGA--T----C----AA------AGT-CA---CTG---T---TGA--TTAT-T----GACC--AACATTtt
gi|130522 : tatacAT-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGAC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CATAAATGTTATC----TATGG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--A-TGTT---TTT-C-----CAA-GGTCA-A-AAG--T----C----TT------GGT-CA---CTA---T---CGA--GTAC-T----G-CCTAAAtt
gi|130524 : AT-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-AC-A-A--------GGAC--AG--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTCC---CTCAAATGTTGTT----CATGG---TGTGAAGAT----G-AA--GC--A-AATTCA-TT
gi|130525 : AT-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-AC-A-A--------GGAC--AG--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTCC---CTCAAATGTTGCT----CATGG---TGTGAAGAT----G-AA--GC--A-AATTCA-TT
gi|130526 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--CAA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCGT--C-A--ATC----CTTC---CACAAATCTTGTC----CATGG---AAAGAAGAT----G-AG--TC--C-TATTGA-TTT------TCAATGGCCA-A-A
gi|130528 : AC-C-T-T-GTGA-A-TA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-C--------A-A-TTAT--C-A--AAC----CTTC---CAAAAGTGTTGAT----CATGG---AAAG-----------------------------------GGTCA--------A-ACG--A----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--TTAT-G----G-CTTAAA
gi|130529 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTACT----CATAG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--C-TATTGATTTT-CAAGGTCAAGGGTGA-A-AGG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--CTAT-T----G-CCAAAA
gi|130530 : AT-C-T-T-GTTA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------GAA-TCAC--CAA--AAC----CTCC---CTCAAATGTTGCC----CATGG---AGTGATGAT----G-GA--GC--C-TATTGA-TTt
gi|130531 : AT-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-T-A--TCGG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTCCC----CATGG---AGAAAGAGT----G-AA---C--A-C-TTGA-TT
gi|130532 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---AGAGAGGAT----A-AA--CT--C-TATTGA-TT
gi|130534 : AT-C-T-T-GTGA-G-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGAC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----TTTC---AATATTTGCTACG----TATGG---A-------C----G-AA--CC--A-TGTTGT-TTT-CAAGGTCAAGGATCA-A-AAG--T----C----AA------GGT-CA---TTA---T---TGA--GTAC-T----G-CCT
gi|130536 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-A--------A-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----
gi|130537 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AA-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAGG---A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGA---AAAGAGGAT----G-AC--CC----TATTGA-TTT-CAAGGTCAAGGATCA-A-ATG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGG--CTAT-T----G-CCCTAAAATT
gi|130538 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-A--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---TACAAATGTTGCC----CATGG---AGAGTGGAT----G-AA--CC--C-TATTGA-TTct
gi|130539 : AC-C-T-T-GTGA-G-CA--AGA-T--AG-A-G-GC-A-A--------GGTC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TAAT--T-G--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCT----CATGG---AGAGAGGAT----G-AA--AT--C-TAATGA-TTT------TC---------A-AGG--T----C----AA------GAT-CA---CTA---T---TGA--CTA
gi|130541 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-AC-A-A--------GGGC--ATGAT-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TTAT--G-G--AAC----ATTC---CACAAATGTTGTT----CATGG---AGAGAGGAT----G-AA--CTTAA-TATTGA-TTT------TCAAGGGTCA-G-AGG--T----T----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--C--T-T----G-CTTAAAAATTaaattct
gi|130542 : AC-C-T-T-GTAA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-T-A--------GGAC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----TATGG---AGAGTGGAT----A-AA--TC--C-TATTGA-TTtt
gi|130544 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--GG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AT--T-T-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTCC---CACAAA
gi|130545 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGT--AT--T-T-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAT--G-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---AGAGAGGAT----G-AT--GT--G-TATTGA-TT
gi|130575 : T-C-T-T-GGGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-ATGGCATTCAGCC--AT--T-C-A--TGAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTCTTCCATAAATGTTACC----TATCG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--A-TATTGA-TTTTCAAGGTCAAGGGTCA-A-AAG--T----C----AA------GAT-CA---CTA---T---TGA--GTAC-T----G-CCTAA
gi|130577 : T-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--TG-A-A-GC-A-A--------TGAC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAA----CTTC---CACAAA
gi|130579 : T-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------AAGT--AT--T-C-A--ATAG----A-G--------G-A-TCAT--T-A--AAC----ATTC---CACAAATGTTGCT----CATGG---AGAGCGGA--------------------TGA-TTT-TA---T------------AGG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TTA--TTAT-T----G-CCTAAatt
gi|130580 : T-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--A--A-A-GC-A-A--------GGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----ttatctt
gi|130586 : -C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-AC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--CCAG----A-G--------G-A-TCAA--T-A--AAC----CTTC---
gi|130587 : -C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---tgctactattaatggctcaa
gi|130587 : CA-A-ATG--TTGCCC----AT------GGT-CA---CTA---T---TGA--CTAC-T----G-ACTAAA-ATTtcactattgactactgactaaaattct
gi|130589 : cttgtgaacaagatagaagcaagggcattcatcagagaatcatcaaaccttcca-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-C--AG-A-A-GC-A-A--------GGGA--AT--T-C-A--TCAG----A-A--------A-A-TCAT--C-A--AGC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATTG---AGAGAGGGT----G-AA--CC--C-TATTGA-TTT------TCAA-GTTCA-A-AGA--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--CCAC-T----G-TTTAAAAATct
gi|130596 : -T-T-GTGA-A-CA--GGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACACATGTTGCC----CActt
gi|130598 : -T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--GG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A---CAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--GAC----CTTTTGGCA-AAATGTTGCC----CATGG---AGAGAGGAC----G-AA--CC--C-TATTGA-TTTTCAAGTTCAAGGGTCA-A-AGA--T----C----AG------GGT-CA---CTA---T---TGA--CTAT-T----G-CCTAAAAATgg
gi|130599 : -T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--C-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTA---CACAAATGTTGTC----CATGG---AGCTAGCAT----G-AA---C--A-C-TTAA-TTT------TCAA-GGTCT-A-GGG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---TTAATGA--CTAA-T----G-CCTAAAAATctt
gi|130600 : -T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATATTGCT----CATGG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--C-TATATA-TTT-ctt
gi|130601 : -T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GT-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TTAG----A-G--------A-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---AGAGAGGAT------AA--CC----TATTGA-TTt
gi|130607 : -T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CAAAAATGTTGCC----CATGA---AGAGAGGAT----A-AA--CC--T-TATTGATTTT-CAAGGTGAAGGGTCA-A-AGG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--CTAT-T----G-CCT
gi|130608 : -T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---AGAAAGTAT----GAAA--CCTAG-TACTGA-TTctaaatctt
gi|130611 : -T-GTGA-A-CA--AAA-T--AC-A-G-GC-A-A--------GGGC--AT--T-T-A--TTGG----A-A--------G-A-TCAT--C-A--AAC----TTTC---CACAAATATTGCT----CAAGG---TGAGAGGAT----G-AA--TC--C-TAATGA-TTT------TTA---TTGA-A-AGG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--CTAA-T----G-CCTAAAAAT
gi|130612 : -T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TTAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CCTC---CACAAATGTTGCCCATGCATGG---AGAGAGGAT----A-AA--CC--C-TATTGA-TTT------------------------T----C----AA------GGT-CA---CCA---T---TGA--CTATGT----C-CCTAAActt
gi|130618 : -A-CA--TAA-TGTAG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CACAAATATTGTC---------------AAGGGT----G-A---------------------AAGATC-AGAGTCA-A----------------------------------TA---T---TGA--TTAT-T----G-CTTAAATATTttttt
gi|130622 : A-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-CAA--TCAT----A-A--------G-A-TCAC--TAA--AAC----CTT-------AAAT----CC----CAC--------------------AA------A-TATTG----T-CAA----AAGGGTCA-A-A-G--T----CAG--AA------AGT-CA---ATA---T---TGA--TTAT-T----G-CCTAAATATTtt
gi|130623 : A-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-G----------A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CAT-G---AGAGAGAAT----G-AA--CC--A-TATTGA-TTT------TCAAGGGTCA-A-A-G--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---CGA--CTAT-T----G-ACTAAAtt
gi|130625 : -T--AG-A-A-CC-A-A--------GGGC--AA--T-C-A--TCAA----A-G--------G----CAC--T-A--AAC----GTTC---CACAGATATTGCT----C---------------------------------ATTGC-TTT------TC-AGGGTCA-A-AAC--T----C----A--------GT-CA---C-----T---TGA--TAAT-T----G-CCTAAA-ATTatactt
gi|130641 : GTCAAGGGTCA-A-AGA--T----C----AA------AGT-TG---CTATTTT---TTATTTTAT-T----G-CCTAAATATTtt
gi|130643 : tccacaaatattAATGGTCA-A-AGA--T----G----AG------AGT-CA---ATA---T---TGA--TTAA-T----G-CCTAAATATTtt
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|130640 ): CACTAAACTTCTACAAAAATTGTCACAGGGTACAAACAATCACAAGTCATATTAATTAATGCCTAATATTTT
Alignments
lowQualScore : 11111111 111111
lowQualScore : 3 1 0 0 0 0 0 111 0 00 00 0 0 0 0 22222222 1 11 111 0 0 00 1111 0 11111111 0 0 00 2 11 0000 111 55555 333 222222 00000000 4 777777 2 0 0 6666 1111 4444 3333333 1 1111 111 111 11 1 1111 0 11 0
lowQualScore : . . . . . . . ... . .. .. . . . . ........ . .. ... . . .. .... . ........ . . .. . .. .... ... ..... ... ...... ........ . ...... . . . .... .... .... ....... . .... ... ... .. . .... . .. .
lowQualScore : 1 0 9 4 9 4 9 555 8 66 44 4 4 4 4 33333333 9 00 777 4 8 66 3333 4 55555555 8 4 66 1 11 9999 555 11111 888 777777 11111111 0 111111 7 8 8 3333 8888 1111 2222222 7 9999 555 555 22 7 8888 9 22 7
consensus : AAA-AAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGNC--AN--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--A-TATTGA-TTT-CAAGGTCAAGGGTCA-A-AGG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--TTAT-T----G-C--CTAAATATT
Reference ( family-141 ) : AAA-AAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGNC--AN--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--A-TATTGA-TTT-CAAGGTCAAGGGTCA-A-AGG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--TTAT-T----G-C--CTAAATATT
gi|130388 : AT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAAAGTCA-G--------G-A-TCAC--TAA--AAC----CTTC---TACAAATATTGTT----AAGGGTC-AAAGATCA-----G-AG--TCG-A-TATTGA-TT
gi|130388 : aaagaattGTTAAGGGTCA-A-AGA--T----C----AG------AGT-CG---ATA---T---TGA--TTAA-T----G-C--CTAAATATTaatgcctaaatatttt
gi|130389 : aaagaattatcttgcgaacgtgatataagcaaggtcaatcatcaaagtcaggatcactaaaaccttctacaaatattAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TTA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACTAATATTTTT----AAGGGTC-AAAGATGAG----G-GT--CA--A-TATTGA-TTtt
gi|130389 : aaagaattTTAAGGGTCA-A-AGA--T----G----AG------GGT-CA---ATA---T---TGA--TTAA-T----G-C--CTAAATATTaatgcctaaatatttt
gi|130390 : aaagaattatcttgcgaacgttatataagcaaggtcaatcatcagaggatcactaaaccttctactaatatttAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACAAATATTGTC--------------AAGGGTT----A-AAGTCA--A-TATTGA-TTtt
gi|130390 : aaagaattGTCA-A-GGG--T----T----AA------AGT-CA---ATA---T---TGA--TTAA-T----G-C--CTAAATATTaatgcctaaatattt
gi|130391 : aaagaattatcttgcgaacgtgatataagcaaggtcaatcatcagaggatcactaaaccttctacaaatattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--GGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----G-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-----CTTC---TACAAATATTGTC----AAGGG---TCA-AAGATCTCGG-AG--TCA-A-TATTGA-TTt
gi|130391 : aaagaattGTCAAGGGTCA-A-AGA--T----CTC--GG------AGT-CA---ATA---T---TGA--TTAA-T----G-C--CTTAATAaatgccttaatagttt
gi|130392 : aaagaattatcttgcgaacaggatataagcaaggtcaatcatcaggggatcactaaacttctacaaatattAT-C-T-T-GCGA-A-TG--TGA-T--AT-A-A-GC-T-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----G-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-----CTTC---TACAAATATTGTC---------------AAGGGT-----------C--A-------------AAGATC-AGAGTCA-ATAAC--T----C----AA----------------TA---A---TGA--TTAA-T----G-T--CTAAATATTgttt
gi|130394 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GTTC--AA--T-C-A--TCAG----G-G--------G-A-TCAC--G-A--A------CTTC---TACAAATATTGTC---------------AAGGGT----C-AA------A-TATT---------------AGAATCA-A----------------------------------TA---T---TGA--TTAA-T----G-C--CTAAATATTtt
gi|130395 : aagaatattAAATAAT-C-T-T-GTGA-A-TG--TGA-C--AG-A-A-GG-A-G--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----G-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTT---CACAAATATTGTC----AAGGG---TCAAAGATT----G-AAGTCA--A-TATTGA-TTtt
gi|130395 : aaaGTCAAGGGTCA-A-AGA--T----T----GA------AGT-CA---ATA---T---TGA--TTAT-T----G-C--CTAAATATTattgcctaaatatttt
gi|130396 : aaaaaataatcttgtgaatgtgacagaaggagggtcaatcatcaggggatcactaaacctttcacaaatattAT-C-T-T-GCAA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CT------ACAAATATTGTC----AA-GGTTCAAAGATCA-----G-AG--TCA-A-TCTTGA-TTT-AAAtt
gi|130397 : aaagaatt-AAT-C-T-T-GGGA-A--A--TGA-T--AG-A-T-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CACAAATATTATC---------------AAGGGT-----------C--A-------------AAGATC-AGAGTCA-A----------------------------------TA---G---TGA--TTAT-T----G-C--CTAATTATTtggcctaaatgatttt
gi|130398 : aaaaaatatAAA-AATTC-C-T-GCGA-A-CG--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-T-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--TAA--AAT----ATT-----GCAAATATTAC----------------------------AA------A-TATT-----------GTCAAGGGTCA-A-CGA--T----A----AG------AGT-CA---ATA---T---TGA--TTAT-T----G-C--CTAAATATTtt
gi|130399 : aAAATAAT-C-T---GCGA-A-TT--GGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--T-AG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CACAAATATtt
gi|130399 : aaaGTCAAGGGTCA-A-AGA--T----C----AA------AGT-TG---CTA---T---TGA--TTATGT----G-C--CTAAACATgtcaagggtcaaagatcaaagttgctattgattatgtgcctaaacat
gi|130400 : aaaaaataatctgcgaattggatagaagcaaggtcaatcatagaggatcactaaaccttccacaaatatAAA-AAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGG-T--AG-A-A-GC-A-A--------AGGC--AA--T-C-A--TCAA----A-GGATCACTAG-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---AACAAATATTGTC----AAGGGTC-AAAGAGCA-----G-AG--TC--AGTATTG
gi|130401 : aaAT-C-T-T-TCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACAAATATTG
gi|130402 : aaagaattAT-C-T-T-GTGACG-TA--TGA-T--AC-G-A-GCCA-A--------GATC--AA----C-A--TCAA----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-----CTTC---TAC--------------------------AGAAT----A-A-----------TTG----T-TAAGG---AGGTCCAAA-AGA--T----C----AG------AGT-CA---TTA---T---TGA--TTAA-TATCAG-C--TTAAATATTtta
gi|130403 : aaagaattcAAA-AAT-T-T-----GA-A-CA--CAG-T--AG-A-A-GC-A-A--------AGACGCAA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CACAAATATTGTC----tt
gi|130403 : aGTCA-A-GTG--T----C----AA------AGT-TG---TTA---T---TGA--CTAT-T----G-C--CTAAATATTaagtgtcaaagttgttattgactattgcctaaatatttt
gi|130404 : aaaaaatttgaacacagtagaagcaaagacgcaatcatcagaggatcactaaaccttccacaaatattAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---tt
gi|130405 : aaagaattAT-C-T---GCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GC-ACA--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TAC
gi|130406 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACtactattaatgggtcaa
gi|130407 : aaacaattAT-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACtactatt
gi|130408 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-G-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACtactatt
gi|130409 : aaagaattAT-C-G-T-GCGA-AACA--AGAAT--AT-A-A-GC-A-AA-------GGTC--AA--T-G-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-AATAAC----CTTC---TAtactatt
gi|130410 : aaagaattAT-C-G-T-GCGA-AACA--AGAAT--AT-A-A-GC-A-AA-------GGTC--AA--T-G-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-AATAAC----CTTC---TA
gi|130411 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GATC--AA--T-T-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CAC
gi|130412 : aaagaatt-AAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGG-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCGC--T-A--AAC----CTTC---CAtattaatggctcaa
gi|130412 : aaaatat-CAAGGTCAATCATCA-G-AGGA-T----CGCTAAACCTTCCAGT-CAATATTA---T---TGA--TTAT-T----G-C--CTAAATATTgtcaatattattgattattgcctaaatatttt
gi|130413 : aaaatataatcttgcgaacgtggtagaagAAA-TAT-C-T-T-GCGA-A-CG--CGA-T--AT-A-A-GG-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TTAG----A-G--------G-A-TCAT--T-A--AAC----CTTC---TACtt
gi|130414 : aaagAT-C-T-T-GCGA-A-CGCTTGA-T--TA-ATA-GC-A-A--------GGTC--AA--T-CTA--TTAG----A-G--------G-A-TCAT--T-A--AAC----CTtattattaatggctcaa
gi|130415 : aagaaattAT-C-T---GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-----CTTC---TACctactattattagggctcaa
gi|130416 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA----AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-----CTTC---TAC
gi|130417 : aaagaattAT-C-T---GCGA-A-CA--TGA----AT-A-A-GC-A----------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----TTAC---TAC
gi|130418 : aaagaattAAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-CA--CAA-T--AG-A-A-GC-A-A--------AGGC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AACCTAGCTTC---CACAAATGTTGTC----tattaatggctcaa
gi|130419 : aaAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-G-AC-A-A--------GGGC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----Caaag
gi|130420 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--TCC-A--TCAG------G--------G-A-TCACTTT-A--AAC----CTTT---CAC
gi|130421 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-G-CC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAC----A-G--------G-T-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACtactatt
gi|130422 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-G-CC-A-A--------GGTCA-AT--T-C-A--TCAC----A-G--------GTT-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACtactatt
gi|130423 : aaagaattAT-C-T-TTGCGA-A-CG--TGA-A--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA----C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--TAA--AAT----CTTC---TAtactatt
gi|130424 : aaagaattA-A-CG--TGA-T--AATA-A-G-------------GGTC--AA--T-C-AGATCAG----AAG--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTT-------AAGGGTT-----------A---AGATCAGATC---G-----CC--A-TATTGA-TT
gi|130425 : aagacattattctagacgaAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--A------------------------------T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACaagtctaatatttt
gi|130430 : aaagaattAAA-AAT-C-T-T-TTGA-A-CG--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CACAAATATTGTC---------------AAGGGT-----------C--A-------------AAGATC-AGAGTCA-A----------------------------------TA---T---TGA--TTAT-T----G-C--CTAAATATTtactattaatggctcaaccagcggggtc
gi|130433 : aAAA-AAT-CATGT-GTGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-CC-A-A--------TGGC--AT--T-T-A--TCGG----A-G--------G-A-CCAT--T-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTACC----TATGC---AGAGAGGAT----G-AA--TC--A-TGTTGA-TTtt
gi|130434 : AAA-AATTC-T-T-GTGA---CA--CGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CATAAATGTTACC----TATGG---AGAGA-GAT----G-AA--CC--A-TA-TGA-TT
gi|130435 : AAA-AAT-CCT-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AA-A-A-GA-A-A--------CAAC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAT--C-A--GAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---AGAGAGAAT----G-AA--TG--C-TATTGATTTT-CAATGTCAAG
gi|130444 : AAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CATAAATGTTACC----TATGG---AGAAAGGAT----A-AA--CC--A-TGCTGA-TTT-CAAGGTCAAGGGTCA-C-AAG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGG--GTAC-T----G-C--CTAAAAATTtattt
gi|130445 : AAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-TA--TGA-T--AA-A-A-GC-A-C--------TGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-T--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CAAAAATGTTACC----TATGG---AGAGAGAAT----G-AA--CC--A-TGTTGATTTT-CTAGGTCAAGGGTCA-A-AAG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--GTAC-T----G-C--CAAAAAAT
gi|130447 : AAA-AAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--CG-A-A-GC-T-A--------GGTC--AG--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--G-A--AAC----CTTC---CACAAATATTGTC----AAGGG-------------------------------------T-CAAAGT------TCA-G-AG-----------------------T-CA---GTT---T---TGA--TTAT-T----A-C--TTAAATATT
gi|130448 : AAA-AAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--CG-A-A-GC-T-A--------GGTC--AG--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--G-A--AAC----CTTC---CACAAATATTGTC----tt
gi|130448 : GTCAAGGGTCA-A-AAGTTT----C----AG------AGT-CA---GTT---T---TGA--TTAT-T----A----CTAAATATTaagggtcaaaagtttcagagtcagttttgattattactaaatatttt
gi|130449 : aaaaatcttgcgaacatgatcgaagctaggtcagtcatcagaggatcacgaaaccttccacaaatattAAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--AG-A-G-GC-A-A--------TGAC--AT--T-C-A--TTAA----A-T--------A-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CATAAATGTTAAT----TATGG---GGAGAAGAA----G-AA--CC--A-TATTGA-TTtt
gi|130450 : AAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-CA--CGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CATAAAT-TTACC----TATGG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--A-TATTGATTTT-CAAGTTCAAGGGTCA-A-A-G--T----C----AA------GATACA---CTA---T---TGA--GTAC-T----G-C--CTAAA
gi|130455 : -AAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TTG-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-ATTCGC--T-A--AAC----CTTT---C
gi|130456 : aatattAAA-AAT-C-T-T-TGAA-A-CA--TGA-T--AA-A-ATGC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TC------A-A--------G-A-TCA---T-A--AAC----CTTC---AAAAAACATTGTC----caggtcaatattattttgattatgccctaaatatttt
gi|130456 : GTCAAGT-TCA-A-AGA--T----C----AA------AGTTCA---GTA---T---TAA--TTTT-T----G-C--CTAAATAaagttcaaagatcaaagttcagtattaatttttgcctaaataattt
gi|130463 : aaaaatctttgaaacatgataaaatgcaaggtcaatcatcaagatcataaaccttcaaaaaacattAAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-CA--CGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGTC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC-----TTC---CATAAATGTTACC----TATGG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--A-TATTAATTTT-CAAGGTCAAGGGTCA-A-A-A--T----C----AA------GAT-CA---CTA---T---TGA--GTAC-T----G-C--CTAAAAATattt
gi|130465 : AAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-CA--CGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CATAAATGTTACC----TATGG---AGAGA-GAT----G-AA--CC--A-TATTGA-TT
gi|130466 : AAA-AAT-C-T-T-GTTA-A-CA--CGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGGC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CATAAATGTTACC----TATGG---AGAGAGGAT------AA--CC--A-TATTGA-TT
gi|130475 : AAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-T--------GG-C--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-C--AAC----CCTC---CATAAATGTTACC----TATGG---AGAGAGAAT----G-AA--CT--A-TATTAA-T
gi|130506 : AA-ACT-A-T-T-GTGA-A-TA--TGA-T--GG-G-A-GC-A-G--------GGGC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--G-G--AAC----TTTT---CACAAACATTACC--------A---AG------------------------------TTT-CA------AAGATCA-A-A-----------------------GT-CA---CTA---T---TGA--TTAT-T----A-G--CTAAATATT
gi|130509 : AT-C-T-T-GCAA-A-CG--TGA-T--AT-A-T-GC-A-A--------GGTC--AG--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---AACAAATATTGTT---------------AAGGGT-----------C--A-------------AAGATC-AGAGTCA-A----------------------------------TA---T---TGA--TTAT-T----G-C--CTAAATATTtt
gi|130511 : aattAT-C-T-TTGCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GG-A-G--------AGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--ATT----CTAC---TACATATtt
gi|130513 : ttAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACt
gi|130514 : t-T-GTGA-A-CA--AGA-C--AG-A-A-GC-A-A--------AGGC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-CCAC--T-A--CAC----TTCC---CACAAATATTATT----CAT-------------T----G-AA--C-------------TT-CCAGGTCTCGAGTCA-A-AGA--T----C----AA------AGT-CA---CTG---T---TGA--TTAT-T----G-A--CCAAtattaatggctcaaccagcgggtc
gi|130515 : tatac-T-GTGA-A-CA--AGA-C--AG-A-A-GC-A-A--------GG-C--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-CCAC--T-A--CAC----TTCC---CACAAATATTATT----CAT-------------T----G-AA--C-------------TT-CCAGGTCTCGAGTCC-A-AGA--T----C----AA------AGT-CA---CTG---T---TGA--TTAT-T----G-A--CCAAcatttt
gi|130522 : tatacAT-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGAC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CATAAATGTTATC----TATGG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--A-TGTT---TTT-C-----CAA-GGTCA-A-AAG--T----C----TT------GGT-CA---CTA---T---CGA--GTAC-T----G-C--CTAAAcatttt
gi|130524 : AT-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-AC-A-A--------GGAC--AG--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTCC---CTCAAATGTTGTT----CATGG---TGTGAAGAT----G-AA--GC--A-AATTCA-TT
gi|130525 : AT-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-AC-A-A--------GGAC--AG--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTCC---CTCAAATGTTGCT----CATGG---TGTGAAGAT----G-AA--GC--A-AATTCA-TT
gi|130526 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--CAA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCGT--C-A--ATC----CTTC---CACAAATCTTGTC----CATGG---AAAGAAGAT----G-AG--TC--C-TATTGA-TTT------TCAATGGCCA-A-A
gi|130528 : AC-C-T-T-GTGA-A-TA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-C--------A-A-TTAT--C-A--AAC----CTTC---CAAAAGTGTTGAT----CATGG---AAAG-----------------------------------GGTCA--------A-ACG--A----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--TTAT-G----G-C--TTAAA
gi|130529 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTACT----CATAG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--C-TATTGATTTT-CAAGGTCAAGGGTGA-A-AGG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--CTAT-T----G-C--CAAAAT
gi|130530 : AT-C-T-T-GTTA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------GAA-TCAC--CAA--AAC----CTCC---CTCAAATGTTGCC----CATGG---AGTGATGAT----G-GA--GC--C-TATTGA-TT
gi|130531 : AT-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-T-A--TCGG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTCCC----CATGG---AGAAAGAGT----G-AA---C--A-C-TTGA-TT
gi|130532 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---AGAGAGGAT----A-AA--CT--C-TATTGA-TT
gi|130534 : AT-C-T-T-GTGA-G-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGAC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----TTTC---AATATTTGCTACG----TATGG---A-------C----G-AA--CC--A-TGTTGT-TTT-CAAGGTCAAGGATCA-A-AAG--T----C----AA------GGT-CA---TTA---T---TGA--GTAC-T----G-C--CT
gi|130536 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-A--------A-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----
gi|130537 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AA-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAGG---A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGA---AAAGAGGAT----G-AC--CC----TATTGA-TTT-CAAGGTCAAGGATCA-A-ATG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGG--CTAT-T----GCC--CTAAA-ATT
gi|130538 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-A--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---TACAAATGTTGCC----CATGG---AGAGTGGAT----G-AA--CC--C-TATTGA-TTct
gi|130539 : AC-C-T-T-GTGA-G-CA--AGA-T--AG-A-G-GC-A-A--------GGTC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TAAT--T-G--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCT----CATGG---AGAGAGGAT----G-AA--AT--C-TAATGA-TTT------TC---------A-AGG--T----C----AA------GAT-CA---CTA---T---TGA--CTA
gi|130541 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-AC-A-A--------GGGC--ATGAT-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TTAT--G-G--AAC----ATTC---CACAAATGTTGTT----CATGG---AGAGAGGAT----G-AA--CTTAA-TATTGA-TTT------TCAAGGGTCA-G-AGG--T----T----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--C--T-T----G-C--TTAAAAATTaaattct
gi|130542 : AC-C-T-T-GTAA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-T-A--------GGAC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----TATGG---AGAGTGGAT----A-AA--TC--C-TATTGA-TTtt
gi|130544 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--GG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AT--T-T-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTCC---CACAAA
gi|130545 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGT--AT--T-T-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAT--G-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---AGAGAGGAT----G-AT--GT--G-TATTGA-TT
gi|130575 : T-C-T-T-GGGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-ATGGCATTCAGCC--AT--T-C-A--TGAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTCTTCCATAAATGTTACC----TATCG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--A-TATTGA-TTTTCAAGGTCAAGGGTCA-A-AAG--T----C----AA------GAT-CA---CTA---T---TGA--GTAC-T----G-C--CTAA
gi|130577 : T-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--TG-A-A-GC-A-A--------TGAC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAA----CTTC---CACAAA
gi|130579 : T-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------AAGT--AT--T-C-A--ATAG----A-G--------G-A-TCAT--T-A--AAC----ATTC---CACAAATGTTGCT----CATGG---AGAGCGGA--------------------TGA-TTT-TA---T------------AGG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TTA--TTAT-T----G-C--CTAATTATatt
gi|130580 : T-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--A--A-A-GC-A-A--------GGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----ctt
gi|130586 : -C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-AC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--CCAG----A-G--------G-A-TCAA--T-A--AAC----CTTC---
gi|130587 : -C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---tgctactattaatggctcaa
gi|130587 : CA-A-ATG--TTGCCC----AT------GGT-CA---CTA---T---TGA--CTAC-T----G-A--CTAAA-ATTtcactattgactactgactaaaattct
gi|130589 : cttgtgaacaagatagaagcaagggcattcatcagagaatcatcaaaccttcca-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-C--AG-A-A-GC-A-A--------GGGA--AT--T-C-A--TCAG----A-A--------A-A-TCAT--C-A--AGC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATTG---AGAGAGGGT----G-AA--CC--C-TATTGA-TTT------TCAA-GTTCA-A-AGA--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--CCAC-T----G-T--TTAAAAATct
gi|130596 : -T-T-GTGA-A-CA--GGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACACATGTTGCC----CActt
gi|130598 : -T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--GG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A---CAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--GAC----CTTTTGGCA-AAATGTTGCC----CATGG---AGAGAGGAC----G-AA--CC--C-TATTGA-TTTTCAAGTTCAAGGGTCA-A-AGA--T----C----AG------GGT-CA---CTA---T---TGA--CTAT-T----G-C--CTAAAAATgg
gi|130599 : -T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--C-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTA---CACAAATGTTGTC----CATGG---AGCTAGCAT----G-AA---C--A-C-TTAA-TTT------TCAA-GGTCT-A-GGG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---TTAATGA--CTAA-T----G-C--CTAAAAATctt
gi|130600 : -T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATATTGCT----CATGG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--C-TATATA-TTT-ctt
gi|130601 : -T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GT-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TTAG----A-G--------A-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---AGAGAGGAT------AA--CC----TATTGA-TTt
gi|130607 : -T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CAAAAATGTTGCC----CATGA---AGAGAGGAT----A-AA--CC--T-TATTGATTTT-CAAGGTGAAGGGTCA-A-AGG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--CTAT-T----G-CCTCTAAATCTT
gi|130608 : -T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---AGAAAGTAT----GAAA--CCTAG-TACTGA-TT
gi|130611 : -T-GTGA-A-CA--AAA-T--AC-A-G-GC-A-A--------GGGC--AT--T-T-A--TTGG----A-A--------G-A-TCAT--C-A--AAC----TTTC---CACAAATATTGCT----CAAGG---TGAGAGGAT----G-AA--TC--C-TAATGA-TTT------TTA---TTGA-A-AGG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--CTAA-T----G-C--CTAAAAAT
gi|130612 : -T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TTAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CCTC---CACAAATGTTGCCCATGCATGG---AGAGAGGAT----A-AA--CC--C-TATTGA-TTT------------------------T----C----AA------GGT-CA---CCA---T---TGA--CTATGT----C-C--CTAAATTTTctt
gi|130618 : -A-CA--TAA-TGTAG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CACAAATATTGTC---------------AAGGGT----G-A---------------------AAGATC-AGAGTCA-A----------------------------------TA---T---TGA--TTAT-T----G-C--TTAAATATTt
gi|130622 : A-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-CAA--TCAT----A-A--------G-A-TCAC--TAA--AAC----CTT-------AAAT----CC----CAC--------------------AA------A-TATTG----T-CAA----AAGGGTCA-A-A-G--T----CAG--AA------AGT-CA---ATA---T---TGA--TTAT-T----G-C--CTAAATATTtt
gi|130623 : A-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-G----------A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CAT-G---AGAGAGAAT----G-AA--CC--A-TATTGA-TTT------TCAAGGGTCA-A-A-G--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---CGA--CTAT-T----G-A--CTAAAtt
gi|130625 : -T--AG-A-A-CC-A-A--------GGGC--AA--T-C-A--TCAA----A-G--------G----CAC--T-A--AAC----GTTC---CACAGATATTGCT----C---------------------------------ATTGC-TTT------TC-AGGGTCA-A-AAC--T----C----A--------GT-CA---C-----T---TGA--TAAT-T----G-C--CTAAA-ATTatactt
gi|130641 : GTCAAGGGTCA-A-AGA--T----C----AA------AGT-TG---CTATTTT---TTATTTTAT-T----G-C--CTAAATATTtt
gi|130643 : tccacaaatattAATGGTCA-A-AGA--T----G----AG------AGT-CA---ATA---T---TGA--TTAA-T----G-C--CTAAATATTtt
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|130640 ): CACTAAACTTCTACAAAAATTGTCACAGGGTACAAACAATCACAAGTCATATTAATTAATGCCTAATATTTT
Alignments
lowQualScore : 11111111 111111
lowQualScore : 3 1 0 0 0 0 0 111 0 00 00 0 0 0 0 22222222 1 11 111 0 0 00 1111 0 11111111 0 0 00 2 11 0000 111 55555 333 222222 00000000 4 777777 2 0 0 6666 1111 4444 3333333 1 1111 111 111 11 1 1111 0 11 0
lowQualScore : . . . . . . . ... . .. .. . . . . ........ . .. ... . . .. .... . ........ . . .. . .. .... ... ..... ... ...... ........ . ...... . . . .... .... .... ....... . .... ... ... .. . .... . .. .
lowQualScore : 1 0 9 4 9 4 9 555 8 66 44 4 4 4 4 33333333 9 00 777 4 8 66 3333 4 55555555 8 4 66 1 11 9999 555 11111 888 777777 11111111 0 111111 7 8 8 3333 8888 1111 2222222 7 9999 555 555 22 7 8888 9 22 7
consensus : AAA-AAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGNC--AN--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--A-TATTGA-TTT-CAAGGTCAAGGGTCA-A-AGG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--TTAT-T----G-C--CTAAATATT
Reference ( family-141 ) : AAA-AAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGNC--AN--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--A-TATTGA-TTT-CAAGGTCAAGGGTCA-A-AGG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--TTAT-T----G-C--CTAAATATT
gi|130388 : AT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAAAGTCA-G--------G-A-TCAC--TAA--AAC----CTTC---TACAAATATTGTT----AAGGGTC-AAAGATCA-----G-AG--TCG-A-TATTGA-TT
gi|130388 : aaagaattGTTAAGGGTCA-A-AGA--T----C----AG------AGT-CG---ATA---T---TGA--TTAA-T----G-C--CTAAATATTaatgcctaaatatttt
gi|130389 : aaagaattatcttgcgaacgtgatataagcaaggtcaatcatcaaagtcaggatcactaaaaccttctacaaatattAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TTA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACTAATATTTTT----AAGGGTC-AAAGATGAG----G-GT--CA--A-TATTGA-TTtt
gi|130389 : aaagaattTTAAGGGTCA-A-AGA--T----G----AG------GGT-CA---ATA---T---TGA--TTAA-T----G-C--CTAAATATTaatgcctaaatatttt
gi|130390 : aaagaattatcttgcgaacgttatataagcaaggtcaatcatcagaggatcactaaaccttctactaatatttAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACAAATATTGTC--------------AAGGGTT----A-AAGTCA--A-TATTGA-TTtt
gi|130390 : aaagaattGTCA-A-GGG--T----T----AA------AGT-CA---ATA---T---TGA--TTAA-T----G-C--CTAAATATTaatgcctaaatattt
gi|130391 : aaagaattatcttgcgaacgtgatataagcaaggtcaatcatcagaggatcactaaaccttctacaaatattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--GGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----G-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-----CTTC---TACAAATATTGTC----AAGGG---TCA-AAGATCTCGG-AG--TCA-A-TATTGA-TTt
gi|130391 : aaagaattGTCAAGGGTCA-A-AGA--T----CTC--GG------AGT-CA---ATA---T---TGA--TTAA-T----G-C--CTTAATAaatgccttaatagttt
gi|130392 : aaagaattatcttgcgaacaggatataagcaaggtcaatcatcaggggatcactaaacttctacaaatattAT-C-T-T-GCGA-A-TG--TGA-T--AT-A-A-GC-T-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----G-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-----CTTC---TACAAATATTGTC---------------AAGGGT-----------C--A-------------AAGATC-AGAGTCA-ATAAC--T----C----AA----------------TA---A---TGA--TTAA-T----G-T--CTAAATATTgttt
gi|130394 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GTTC--AA--T-C-A--TCAG----G-G--------G-A-TCAC--G-A--A------CTTC---TACAAATATTGTC---------------AAGGGT----C-AA------A-TATT---------------AGAATCA-A----------------------------------TA---T---TGA--TTAA-T----G-C--CTAAATATTtt
gi|130395 : aagaatattAAATAAT-C-T-T-GTGA-A-TG--TGA-C--AG-A-A-GG-A-G--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----G-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTT---CACAAATATTGTC----AAGGG---TCAAAGATT----G-AAGTCA--A-TATTGA-TTtt
gi|130395 : aaaGTCAAGGGTCA-A-AGA--T----T----GA------AGT-CA---ATA---T---TGA--TTAT-T----G-C--CTAAATATTattgcctaaatatttt
gi|130396 : aaaaaataatcttgtgaatgtgacagaaggagggtcaatcatcaggggatcactaaacctttcacaaatattAT-C-T-T-GCAA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CT------ACAAATATTGTC----AA-GGTTCAAAGATCA-----G-AG--TCA-A-TCTTGA-TTT-AAAtt
gi|130397 : aaagaatt-AAT-C-T-T-GGGA-A--A--TGA-T--AG-A-T-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CACAAATATTATC---------------AAGGGT-----------C--A-------------AAGATC-AGAGTCA-A----------------------------------TA---G---TGA--TTAT-T----G-C--CTAATTATTtggcctaaatgatttt
gi|130398 : aaaaaatatAAA-AATTC-C-T-GCGA-A-CG--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-T-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--TAA--AAT----ATT-----GCAAATATTAC----------------------------AA------A-TATT-----------GTCAAGGGTCA-A-CGA--T----A----AG------AGT-CA---ATA---T---TGA--TTAT-T----G-C--CTAAATATTtt
gi|130399 : aAAATAAT-C-T---GCGA-A-TT--GGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--T-AG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CACAAATATtt
gi|130399 : aaaGTCAAGGGTCA-A-AGA--T----C----AA------AGT-TG---CTA---T---TGA--TTATGT----G-C--CTAAACATgtcaagggtcaaagatcaaagttgctattgattatgtgcctaaacat
gi|130400 : aaaaaataatctgcgaattggatagaagcaaggtcaatcatagaggatcactaaaccttccacaaatatAAA-AAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGG-T--AG-A-A-GC-A-A--------AGGC--AA--T-C-A--TCAA----A-GGATCACTAG-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---AACAAATATTGTC----AAGGGTC-AAAGAGCA-----G-AG--TC--AGTATTG
gi|130401 : aaAT-C-T-T-TCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACAAATATTG
gi|130402 : aaagaattAT-C-T-T-GTGACG-TA--TGA-T--AC-G-A-GCCA-A--------GATC--AA----C-A--TCAA----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-----CTTC---TAC--------------------------AGAAT----A-A-----------TTG----T-TAAGG---AGGTCCAAA-AGA--T----C----AG------AGT-CA---TTA---T---TGA--TTAA-TATCAG-C--TTAAATATTtta
gi|130403 : aaagaattcAAA-AAT-T-T-----GA-A-CA--CAG-T--AG-A-A-GC-A-A--------AGACGCAA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CACAAATATTGTC----tt
gi|130403 : aGTCA-A-GTG--T----C----AA------AGT-TG---TTA---T---TGA--CTAT-T----G-C--CTAAATATTaagtgtcaaagttgttattgactattgcctaaatatttt
gi|130404 : aaaaaatttgaacacagtagaagcaaagacgcaatcatcagaggatcactaaaccttccacaaatattAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---tt
gi|130405 : aaagaattAT-C-T---GCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GC-ACA--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TAC
gi|130406 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACtactattaatgggtcaa
gi|130407 : aaacaattAT-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACtactatt
gi|130408 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-G-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACtactatt
gi|130409 : aaagaattAT-C-G-T-GCGA-AACA--AGAAT--AT-A-A-GC-A-AA-------GGTC--AA--T-G-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-AATAAC----CTTC---TAtactatt
gi|130410 : aaagaattAT-C-G-T-GCGA-AACA--AGAAT--AT-A-A-GC-A-AA-------GGTC--AA--T-G-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-AATAAC----CTTC---TA
gi|130411 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GATC--AA--T-T-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CAC
gi|130412 : aaagaatt-AAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGG-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCGC--T-A--AAC----CTTC---CAtattaatggctcaa
gi|130412 : aaaatat-CAAGGTCAATCATCA-G-AGGA-T----CGCTAAACCTTCCAGT-CAATATTA---T---TGA--TTAT-T----G-C--CTAAATATTgtcaatattattgattattgcctaaatatttt
gi|130413 : aaaatataatcttgcgaacgtggtagaagAAA-TAT-C-T-T-GCGA-A-CG--CGA-T--AT-A-A-GG-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TTAG----A-G--------G-A-TCAT--T-A--AAC----CTTC---TACtt
gi|130414 : aaagAT-C-T-T-GCGA-A-CGCTTGA-T--TA-ATA-GC-A-A--------GGTC--AA--T-CTA--TTAG----A-G--------G-A-TCAT--T-A--AAC----CTtattattaatggctcaa
gi|130415 : aagaaattAT-C-T---GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-----CTTC---TACctactattattagggctcaa
gi|130416 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA----AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-----CTTC---TAC
gi|130417 : aaagaattAT-C-T---GCGA-A-CA--TGA----AT-A-A-GC-A----------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----TTAC---TAC
gi|130418 : aaagaattAAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-CA--CAA-T--AG-A-A-GC-A-A--------AGGC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AACCTAGCTTC---CACAAATGTTGTC----tattaatggctcaa
gi|130419 : aaAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-G-AC-A-A--------GGGC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----Caaag
gi|130420 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--TCC-A--TCAG------G--------G-A-TCACTTT-A--AAC----CTTT---CAC
gi|130421 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-G-CC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAC----A-G--------G-T-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACtactatt
gi|130422 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-G-CC-A-A--------GGTCA-AT--T-C-A--TCAC----A-G--------GTT-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACtactatt
gi|130423 : aaagaattAT-C-T-TTGCGA-A-CG--TGA-A--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA----C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--TAA--AAT----CTTC---TAtactatt
gi|130424 : aaagaattA-A-CG--TGA-T--AATA-A-G-------------GGTC--AA--T-C-AGATCAG----AAG--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTT-------AAGGGTT-----------A---AGATCAGATC---G-----CC--A-TATTGA-TT
gi|130425 : aagacattattctagacgaAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--A------------------------------T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACaagtctaatatttt
gi|130430 : aaagaattAAA-AAT-C-T-T-TTGA-A-CG--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CACAAATATTGTC---------------AAGGGT-----------C--A-------------AAGATC-AGAGTCA-A----------------------------------TA---T---TGA--TTAT-T----G-C--CTAAATATTtactattaatggctcaaccagcggggtc
gi|130433 : aAAA-AAT-CATGT-GTGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-CC-A-A--------TGGC--AT--T-T-A--TCGG----A-G--------G-A-CCAT--T-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTACC----TATGC---AGAGAGGAT----G-AA--TC--A-TGTTGA-TTtt
gi|130434 : AAA-AATTC-T-T-GTGA---CA--CGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CATAAATGTTACC----TATGG---AGAGA-GAT----G-AA--CC--A-TA-TGA-TT
gi|130435 : AAA-AAT-CCT-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AA-A-A-GA-A-A--------CAAC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAT--C-A--GAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---AGAGAGAAT----G-AA--TG--C-TATTGATTTT-CAATGTCAAG
gi|130444 : AAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CATAAATGTTACC----TATGG---AGAAAGGAT----A-AA--CC--A-TGCTGA-TTT-CAAGGTCAAGGGTCA-C-AAG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGG--GTAC-T----G-C--CTAAAAATTtattt
gi|130445 : AAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-TA--TGA-T--AA-A-A-GC-A-C--------TGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-T--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CAAAAATGTTACC----TATGG---AGAGAGAAT----G-AA--CC--A-TGTTGATTTT-CTAGGTCAAGGGTCA-A-AAG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--GTAC-T----G-C--CAAAAAAT
gi|130447 : AAA-AAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--CG-A-A-GC-T-A--------GGTC--AG--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--G-A--AAC----CTTC---CACAAATATTGTC----AAGGG-------------------------------------T-CAAAGT------TCA-G-AG-----------------------T-CA---GTT---T---TGA--TTAT-T----A-C--TTAAATATT
gi|130448 : AAA-AAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--CG-A-A-GC-T-A--------GGTC--AG--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--G-A--AAC----CTTC---CACAAATATTGTC----tt
gi|130448 : GTCAAGGGTCA-A-AAGTTT----C----AG------AGT-CA---GTT---T---TGA--TTAT-T----A----CTAAATATTaagggtcaaaagtttcagagtcagttttgattattactaaatatttt
gi|130449 : aaaaatcttgcgaacatgatcgaagctaggtcagtcatcagaggatcacgaaaccttccacaaatattAAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--AG-A-G-GC-A-A--------TGAC--AT--T-C-A--TTAA----A-T--------A-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CATAAATGTTAAT----TATGG---GGAGAAGAA----G-AA--CC--A-TATTGA-TTtt
gi|130450 : AAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-CA--CGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CATAAAT-TTACC----TATGG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--A-TATTGATTTT-CAAGTTCAAGGGTCA-A-A-G--T----C----AA------GATACA---CTA---T---TGA--GTAC-T----G-C--CTAAA
gi|130455 : -AAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TTG-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-ATTCGC--T-A--AAC----CTTT---C
gi|130456 : aatattAAA-AAT-C-T-T-TGAA-A-CA--TGA-T--AA-A-ATGC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TC------A-A--------G-A-TCA---T-A--AAC----CTTC---AAAAAACATTGTC----caggtcaatattattttgattatgccctaaatatttt
gi|130456 : GTCAAGT-TCA-A-AGA--T----C----AA------AGTTCA---GTA---T---TAA--TTTT-T----G-C--CTAAATAaagttcaaagatcaaagttcagtattaatttttgcctaaataattt
gi|130463 : aaaaatctttgaaacatgataaaatgcaaggtcaatcatcaagatcataaaccttcaaaaaacattAAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-CA--CGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGTC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC-----TTC---CATAAATGTTACC----TATGG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--A-TATTAATTTT-CAAGGTCAAGGGTCA-A-A-A--T----C----AA------GAT-CA---CTA---T---TGA--GTAC-T----G-C--CTAAAAATattt
gi|130465 : AAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-CA--CGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CATAAATGTTACC----TATGG---AGAGA-GAT----G-AA--CC--A-TATTGA-TT
gi|130466 : AAA-AAT-C-T-T-GTTA-A-CA--CGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGGC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CATAAATGTTACC----TATGG---AGAGAGGAT------AA--CC--A-TATTGA-TT
gi|130475 : AAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-T--------GG-C--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-C--AAC----CCTC---CATAAATGTTACC----TATGG---AGAGAGAAT----G-AA--CT--A-TATTAA-T
gi|130506 : AA-ACT-A-T-T-GTGA-A-TA--TGA-T--GG-G-A-GC-A-G--------GGGC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--G-G--AAC----TTTT---CACAAACATTACC--------A---AG------------------------------TTT-CA------AAGATCA-A-A-----------------------GT-CA---CTA---T---TGA--TTAT-T----A-G--CTAAATATT
gi|130509 : AT-C-T-T-GCAA-A-CG--TGA-T--AT-A-T-GC-A-A--------GGTC--AG--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---AACAAATATTGTT---------------AAGGGT-----------C--A-------------AAGATC-AGAGTCA-A----------------------------------TA---T---TGA--TTAT-T----G-C--CTAAATATTtt
gi|130511 : aattAT-C-T-TTGCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GG-A-G--------AGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--ATT----CTAC---TACATATtt
gi|130513 : ttAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACt
gi|130514 : t-T-GTGA-A-CA--AGA-C--AG-A-A-GC-A-A--------AGGC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-CCAC--T-A--CAC----TTCC---CACAAATATTATT----CAT-------------T----G-AA--C-------------TT-CCAGGTCTCGAGTCA-A-AGA--T----C----AA------AGT-CA---CTG---T---TGA--TTAT-T----G-A--CCAAtattaatggctcaaccagcgggtc
gi|130515 : tatac-T-GTGA-A-CA--AGA-C--AG-A-A-GC-A-A--------GG-C--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-CCAC--T-A--CAC----TTCC---CACAAATATTATT----CAT-------------T----G-AA--C-------------TT-CCAGGTCTCGAGTCC-A-AGA--T----C----AA------AGT-CA---CTG---T---TGA--TTAT-T----G-A--CCAAcatttt
gi|130522 : tatacAT-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGAC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CATAAATGTTATC----TATGG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--A-TGTT---TTT-C-----CAA-GGTCA-A-AAG--T----C----TT------GGT-CA---CTA---T---CGA--GTAC-T----G-C--CTAAAcatttt
gi|130524 : AT-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-AC-A-A--------GGAC--AG--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTCC---CTCAAATGTTGTT----CATGG---TGTGAAGAT----G-AA--GC--A-AATTCA-TT
gi|130525 : AT-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-AC-A-A--------GGAC--AG--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTCC---CTCAAATGTTGCT----CATGG---TGTGAAGAT----G-AA--GC--A-AATTCA-TT
gi|130526 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--CAA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCGT--C-A--ATC----CTTC---CACAAATCTTGTC----CATGG---AAAGAAGAT----G-AG--TC--C-TATTGA-TTT------TCAATGGCCA-A-A
gi|130528 : AC-C-T-T-GTGA-A-TA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-C--------A-A-TTAT--C-A--AAC----CTTC---CAAAAGTGTTGAT----CATGG---AAAG-----------------------------------GGTCA--------A-ACG--A----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--TTAT-G----G-C--TTAAA
gi|130529 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTACT----CATAG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--C-TATTGATTTT-CAAGGTCAAGGGTGA-A-AGG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--CTAT-T----G-C--CAAAAT
gi|130530 : AT-C-T-T-GTTA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------GAA-TCAC--CAA--AAC----CTCC---CTCAAATGTTGCC----CATGG---AGTGATGAT----G-GA--GC--C-TATTGA-TT
gi|130531 : AT-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-T-A--TCGG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTCCC----CATGG---AGAAAGAGT----G-AA---C--A-C-TTGA-TT
gi|130532 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---AGAGAGGAT----A-AA--CT--C-TATTGA-TT
gi|130534 : AT-C-T-T-GTGA-G-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGAC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----TTTC---AATATTTGCTACG----TATGG---A-------C----G-AA--CC--A-TGTTGT-TTT-CAAGGTCAAGGATCA-A-AAG--T----C----AA------GGT-CA---TTA---T---TGA--GTAC-T----G-C--CT
gi|130536 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-A--------A-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----
gi|130537 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AA-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAGG---A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGA---AAAGAGGAT----G-AC--CC----TATTGA-TTT-CAAGGTCAAGGATCA-A-ATG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGG--CTAT-T----GCC--CTAAA-ATT
gi|130538 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-A--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---TACAAATGTTGCC----CATGG---AGAGTGGAT----G-AA--CC--C-TATTGA-TTct
gi|130539 : AC-C-T-T-GTGA-G-CA--AGA-T--AG-A-G-GC-A-A--------GGTC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TAAT--T-G--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCT----CATGG---AGAGAGGAT----G-AA--AT--C-TAATGA-TTT------TC---------A-AGG--T----C----AA------GAT-CA---CTA---T---TGA--CTA
gi|130541 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-AC-A-A--------GGGC--ATGAT-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TTAT--G-G--AAC----ATTC---CACAAATGTTGTT----CATGG---AGAGAGGAT----G-AA--CTTAA-TATTGA-TTT------TCAAGGGTCA-G-AGG--T----T----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--C--T-T----G-C--TTAAAAATTaaattct
gi|130542 : AC-C-T-T-GTAA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-T-A--------GGAC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----TATGG---AGAGTGGAT----A-AA--TC--C-TATTGA-TTtt
gi|130544 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--GG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AT--T-T-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTCC---CACAAA
gi|130545 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGT--AT--T-T-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAT--G-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---AGAGAGGAT----G-AT--GT--G-TATTGA-TT
gi|130575 : T-C-T-T-GGGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-ATGGCATTCAGCC--AT--T-C-A--TGAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTCTTCCATAAATGTTACC----TATCG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--A-TATTGA-TTTTCAAGGTCAAGGGTCA-A-AAG--T----C----AA------GAT-CA---CTA---T---TGA--GTAC-T----G-C--CTAA
gi|130577 : T-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--TG-A-A-GC-A-A--------TGAC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAA----CTTC---CACAAA
gi|130579 : T-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------AAGT--AT--T-C-A--ATAG----A-G--------G-A-TCAT--T-A--AAC----ATTC---CACAAATGTTGCT----CATGG---AGAGCGGA--------------------TGA-TTT-TA---T------------AGG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TTA--TTAT-T----G-C--CTAATTATatt
gi|130580 : T-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--A--A-A-GC-A-A--------GGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----ctt
gi|130586 : -C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-AC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--CCAG----A-G--------G-A-TCAA--T-A--AAC----CTTC---
gi|130587 : -C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---tgctactattaatggctcaa
gi|130587 : CA-A-ATG--TTGCCC----AT------GGT-CA---CTA---T---TGA--CTAC-T----G-A--CTAAA-ATTtcactattgactactgactaaaattct
gi|130589 : cttgtgaacaagatagaagcaagggcattcatcagagaatcatcaaaccttcca-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-C--AG-A-A-GC-A-A--------GGGA--AT--T-C-A--TCAG----A-A--------A-A-TCAT--C-A--AGC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATTG---AGAGAGGGT----G-AA--CC--C-TATTGA-TTT------TCAA-GTTCA-A-AGA--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--CCAC-T----G-T--TTAAAAATct
gi|130596 : -T-T-GTGA-A-CA--GGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACACATGTTGCC----CActt
gi|130598 : -T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--GG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A---CAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--GAC----CTTTTGGCA-AAATGTTGCC----CATGG---AGAGAGGAC----G-AA--CC--C-TATTGA-TTTTCAAGTTCAAGGGTCA-A-AGA--T----C----AG------GGT-CA---CTA---T---TGA--CTAT-T----G-C--CTAAAAATgg
gi|130599 : -T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--C-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTA---CACAAATGTTGTC----CATGG---AGCTAGCAT----G-AA---C--A-C-TTAA-TTT------TCAA-GGTCT-A-GGG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---TTAATGA--CTAA-T----G-C--CTAAAAATctt
gi|130600 : -T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATATTGCT----CATGG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--C-TATATA-TTT-ctt
gi|130601 : -T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GT-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TTAG----A-G--------A-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---AGAGAGGAT------AA--CC----TATTGA-TTt
gi|130607 : -T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CAAAAATGTTGCC----CATGA---AGAGAGGAT----A-AA--CC--T-TATTGATTTT-CAAGGTGAAGGGTCA-A-AGG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--CTAT-T----G-CCTCTAAATCTT
gi|130608 : -T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---AGAAAGTAT----GAAA--CCTAG-TACTGA-TT
gi|130611 : -T-GTGA-A-CA--AAA-T--AC-A-G-GC-A-A--------GGGC--AT--T-T-A--TTGG----A-A--------G-A-TCAT--C-A--AAC----TTTC---CACAAATATTGCT----CAAGG---TGAGAGGAT----G-AA--TC--C-TAATGA-TTT------TTA---TTGA-A-AGG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--CTAA-T----G-C--CTAAAAAT
gi|130612 : -T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TTAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CCTC---CACAAATGTTGCCCATGCATGG---AGAGAGGAT----A-AA--CC--C-TATTGA-TTT------------------------T----C----AA------GGT-CA---CCA---T---TGA--CTATGT----C-C--CTAAATTTTctt
gi|130618 : -A-CA--TAA-TGTAG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CACAAATATTGTC---------------AAGGGT----G-A---------------------AAGATC-AGAGTCA-A----------------------------------TA---T---TGA--TTAT-T----G-C--TTAAATATTt
gi|130622 : A-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-CAA--TCAT----A-A--------G-A-TCAC--TAA--AAC----CTT-------AAAT----CC----CAC--------------------AA------A-TATTG----T-CAA----AAGGGTCA-A-A-G--T----CAG--AA------AGT-CA---ATA---T---TGA--TTAT-T----G-C--CTAAATATTtt
gi|130623 : A-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-G----------A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CAT-G---AGAGAGAAT----G-AA--CC--A-TATTGA-TTT------TCAAGGGTCA-A-A-G--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---CGA--CTAT-T----G-A--CTAAAtt
gi|130625 : -T--AG-A-A-CC-A-A--------GGGC--AA--T-C-A--TCAA----A-G--------G----CAC--T-A--AAC----GTTC---CACAGATATTGCT----C---------------------------------ATTGC-TTT------TC-AGGGTCA-A-AAC--T----C----A--------GT-CA---C-----T---TGA--TAAT-T----G-C--CTAAA-ATTatactt
gi|130641 : GTCAAGGGTCA-A-AGA--T----C----AA------AGT-TG---CTATTTT---TTATTTTAT-T----G-C--CTAAATATTtt
gi|130643 : tccacaaatattAATGGTCA-A-AGA--T----G----AG------AGT-CA---ATA---T---TGA--TTAA-T----G-C--CTAAATATTtt
blockSeqs : T CTT TGGCATTC T TGA G GATCACTA A AT TTC CATGC TTC CTCGG GTCAA T TCAAGG A AGTT TGCC GCTA CCTTCCA A ATAT TTT TAA TT G ATCA CT
blockSeqs : . T A T A . . A AT TGG A TC CG GTCAA T TCAAGT A GGA . TC G T A . . . G . .
blockSeqs : . T A T A . . A . . A TC GA CTTAA T TAAGG A GA . AG A . A . . . . . .
blockSeqs : . G . T A . . A . . A . G CCTAG T CAAGG A GG . . A . A . . . . . .
blockSeqs : . T . T A . . . . . A . A TCAA T CAATG A GA . . A . A . . . . . .
blockSeqs : . T . T A . . . . . A . C TCAA T CAAGG A AC . . A . A . . . . . .
blockSeqs : . T . T A . . . . . T . G TCAG . CTAGG A GA . . A . C . . . . . .
blockSeqs : . T . T A . . . . . T . G CAA . CAAAG A GA . . A . T . . . . . .
blockSeqs : . T . T A . . . . . C . G CCA . CAAGT A GA . . A . T . . . . . .
blockSeqs : . T . T A . . . . . T . A TCA . CAAGG A GA . . G . C . . . . . .
blockSeqs : . G . G A . . . . . T . G CCA . CCAGG A TG . . G . C . . . . . .
blockSeqs : . T . T A . . . . . A . G TGC . CCAGG A AG . . A . G . . . . . .
blockSeqs : . T . T A . . . . . T . G CCA . CAAGG A AG . . G . G . . . . . .
blockSeqs : . T . A A . . . . . T . A CCA . CAAGG T GA . . A . C . . . . . .
blockSeqs : . C . T A . . . . . T . G CCA . CAAGG T GA . . G . G . . . . . .
blockSeqs : . T . T A . . . . . T . G CCA . CAAGG A GA . . A . C . . . . . .
blockSeqs : . T . T A . . . . . T . G CCA . AAGA A AG . . A . C . . . . . .
blockSeqs : . T . T A . . . . . T . G CCA . AAGA A CG . . G . C . . . . . .
blockSeqs : . T . T A . . . . . C . G CCA . AAGA A GG . . G . C . . . . . .
blockSeqs : . T . T A . . . . . C . G CTA . AAGA A AG . . G . C . . . . . .
blockSeqs : . A . T A . . . . . T . G CCA . CAA A TG . . G . C . . . . . .
blockSeqs : . A . T A . . . . . C . G GCA . CA A GG . . G . C . . . . . .
blockSeqs : . T . T A . . . . . C . G GCA . GG A GG . . G . T . . . . . .
blockSeqs : . T . T A . . . . . C . G TCC . TA A AG . . G . C . . . . . .
blockSeqs : . C . T A . . . . . C . G CCC . G A GG . . G . C . . . . . .
blockSeqs : T . T A . . . . . C . G GCC . C A TG . . G . C . . . . . .
blockSeqs : T . T A . . . . . C . G CTC . . A GA . . G . C . . . . . .
blockSeqs : T . T A . . . . . C . G CCA . . A GA . . G . C . . . . . .
blockSeqs : C . G A . . . . . C . G CCC . . A GG . . G . C . . . . . .
blockSeqs : T . G A . . . . . T . A ATC . . A GG . . G . C . . . . . .
blockSeqs : T . T A . . . . . C . G TCC . . A GG . . G . C . . . . . .
blockSeqs : T . T A . . . . . C . G GTG . . A AC . . G . C . . . . . .
blockSeqs : T . T A . . . . . C . G CCA . . . GA . . G . C . . . . . .
blockSeqs : T . T T . . . . . C . G CCC . . . GA . . A . C . . . . . .
blockSeqs : T . T A . . . . . T . G CCC . . . G . . G . C . . . . . .
blockSeqs : T . T A . . . . . C . A CCC . . . G . . A . A . . . . . .
blockSeqs : T . G A . . . . . T . G CCT . . A . . A . C . . . . . .
blockSeqs : T . G T . . . . . C . G TCC . . G . . . . C . . . . . .
blockSeqs : C . A T . . . . . C . G CCC . . G . . . . C . . . . . .
blockSeqs : A . G T . . . . . C . G CCA . . . . . . . A . . . . . .
blockSeqs : T . G T . . . . . C . G CA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . T T . . . . . C . G CA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . T G . . . . . C . A CA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . A G . . . . . C . G CA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . G T . . . . . C . A CA . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : C . T T . . . . . C . G CC . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . T A . . . . . C . G CA .
blockSeqs : T . T A . . . . . C . . CC .
blockSeqs : C . G T . . . . . C . . A .
blockSeqs : C . G T . . . . . C . . A .
blockSeqs : C . G A . . . . . C . . C .
blockSeqs : T . T T . . . . . . . . C .
blockSeqs : T . T A . . . . . . . . A .
blockSeqs : T . T G . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . G A . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . A A . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . A A . . . . . . . . . .
blockSeqs : A . A A . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . G T . . . . . . . . . .
blockSeqs : T . G G . . . . . . . . .
blockSeqs : T . G G . . . . . . .
blockSeqs : C . G T . . . . . .
blockSeqs : A . G T . . . . .
blockSeqs : A . G T . . . . .
blockSeqs : T . A A . . . . .
blockSeqs : A . G T . . . . .
blockSeqs : A . G T . . . . .
blockSeqs : T . G T . . . . .
blockSeqs : A . T T . . . . .
blockSeqs : A . G T . . . . .
blockSeqs : A . A T . . . . .
blockSeqs : A . T T . . . . .
blockSeqs : A . G T . . . . .
blockSeqs : A . C T . . . . .
blockSeqs : A . A T . . . . .
blockSeqs : A . G T . . . . .
blockSeqs : T . G T . . . . .
blockSeqs : T . T T . . . . .
blockSeqs : A . G T . . . . .
blockSeqs : A . G A . . . . .
blockSeqs : T . G T . . . . .
blockSeqs : A . G T . . . . .
blockSeqs : A . G T . . . . .
blockSeqs : G . G T . . . . .
blockSeqs : T . G T . . . . .
blockSeqs : A . G T . . . . .
blockSeqs : A . G T . . . . .
blockSeqs : A . G T . . . . .
blockSeqs : A . G T . . . . .
blockSeqs : A . T T . . . . .
blockSeqs : A . T T . . . . .
blockSeqs : A . G A . . . . .
blockSeqs : T . G A . . . . .
blockSeqs : . . T . . . . .
blockSeqs : . . A . . . .
blockSeqs : . . . . . . .
blockSeqCons : **** *** CCA***** CAAGG*
originalCons : AAA-AAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGNC--AN--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--A-TATTGA-TTT-CAAGGTCAAGGGTCA-A-AGG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--TTAT-T----G-C--CTAAATATT
finalCons : AAA-AAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGNC--AN--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---AGAGAGGAT----G-AACCA-----TATTGA-TTTCAAGG-TCAAGGGTCA-A-AGG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--TTAT-T----G-C--CTAAATATT
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|130640 ): CACTAAACTTCTACAAAAATTGTCACAGGGTACAAACAATCACAAGTCATATTAATTAATGCCTAATATTTT
Alignments
lowQualScore : 11111111 111111
lowQualScore : 3 1 0 0 0 0 0 111 0 00 00 0 0 0 0 22222222 1 11 111 0 0 00 1111 0 11111111 0 0 00 2 11 0000 111 55555 333 222222 00000000 4 777777 2 0 0 6666 1111 4444 3333333 1 1111 111 111 11 1 1111 0 11 0
lowQualScore : . . . . . . . ... . .. .. . . . . ........ . .. ... . . .. .... . ........ . . .. . .. .... ... ..... ... ...... ........ . ...... . . . .... .... .... ....... . .... ... ... .. . .... . .. .
lowQualScore : 1 0 9 4 9 4 9 555 8 66 44 4 4 4 4 33333333 9 00 777 4 8 66 3333 4 55555555 8 4 66 1 11 9999 555 11111 888 777777 11111111 0 111111 7 8 8 3333 8888 1111 2222222 7 9999 555 555 22 7 8888 9 22 7
consensus : AAA-AAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGNC--AN--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--A-TATTGA-TTT-CAAGGTCAAGGGTCA-A-AGG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--TTAT-T----G-C--CTAAATATT
Reference ( family-141 ) : AAA-AAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGNC--AN--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--A-TATTGA-TTT-CAAGGTCAAGGGTCA-A-AGG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--TTAT-T----G-C--CTAAATATT
gi|130388 : AT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAAAGTCA-G--------G-A-TCAC--TAA--AAC----CTTC---TACAAATATTGTT----AAGGGTC-AAAGATCA-----G-AG--TCG-A-TATTGA-TT
gi|130388 : aaagaattGTTAAGGGTCA-A-AGA--T----C----AG------AGT-CG---ATA---T---TGA--TTAA-T----G-C--CTAAATATTaatgcctaaatatttt
gi|130389 : aaagaattatcttgcgaacgtgatataagcaaggtcaatcatcaaagtcaggatcactaaaaccttctacaaatattAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TTA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACTAATATTTTT----AAGGGTC-AAAGATGAG----G-GT--CA--A-TATTGA-TTtt
gi|130389 : aaagaattTTAAGGGTCA-A-AGA--T----G----AG------GGT-CA---ATA---T---TGA--TTAA-T----G-C--CTAAATATTaatgcctaaatatttt
gi|130390 : aaagaattatcttgcgaacgttatataagcaaggtcaatcatcagaggatcactaaaccttctactaatatttAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACAAATATTGTC--------------AAGGGTT----A-AAGTCA--A-TATTGA-TTtt
gi|130390 : aaagaattGTCA-A-GGG--T----T----AA------AGT-CA---ATA---T---TGA--TTAA-T----G-C--CTAAATATTaatgcctaaatattt
gi|130391 : aaagaattatcttgcgaacgtgatataagcaaggtcaatcatcagaggatcactaaaccttctacaaatattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--GGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----G-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-----CTTC---TACAAATATTGTC----AAGGG---TCA-AAGATCTCGG-AG--TCA-A-TATTGA-TTt
gi|130391 : aaagaattGTCAAGGGTCA-A-AGA--T----CTC--GG------AGT-CA---ATA---T---TGA--TTAA-T----G-C--CTTAATAaatgccttaatagttt
gi|130392 : aaagaattatcttgcgaacaggatataagcaaggtcaatcatcaggggatcactaaacttctacaaatattAT-C-T-T-GCGA-A-TG--TGA-T--AT-A-A-GC-T-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----G-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-----CTTC---TACAAATATTGTC---------------AAGGGT-----------C--A-------------AAGATC-AGAGTCA-ATAAC--T----C----AA----------------TA---A---TGA--TTAA-T----G-T--CTAAATATTgttt
gi|130394 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GTTC--AA--T-C-A--TCAG----G-G--------G-A-TCAC--G-A--A------CTTC---TACAAATATTGTC---------------AAGGGT----C-AA------A-TATT---------------AGAATCA-A----------------------------------TA---T---TGA--TTAA-T----G-C--CTAAATATTtt
gi|130395 : aagaatattAAATAAT-C-T-T-GTGA-A-TG--TGA-C--AG-A-A-GG-A-G--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----G-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTT---CACAAATATTGTC----AAGGG---TCAAAGATT----G-AAGTCA--A-TATTGA-TTtt
gi|130395 : aaaGTCAAGGGTCA-A-AGA--T----T----GA------AGT-CA---ATA---T---TGA--TTAT-T----G-C--CTAAATATTattgcctaaatatttt
gi|130396 : aaaaaataatcttgtgaatgtgacagaaggagggtcaatcatcaggggatcactaaacctttcacaaatattAT-C-T-T-GCAA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CT------ACAAATATTGTC----AA-GGTTCAAAGATCA-----G-AG--TCA-A-TCTTGA-TTT-AAAtt
gi|130397 : aaagaatt-AAT-C-T-T-GGGA-A--A--TGA-T--AG-A-T-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CACAAATATTATC---------------AAGGGT-----------C--A-------------AAGATC-AGAGTCA-A----------------------------------TA---G---TGA--TTAT-T----G-C--CTAATTATTtggcctaaatgatttt
gi|130398 : aaaaaatatAAA-AATTC-C-T-GCGA-A-CG--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-T-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--TAA--AAT----ATT-----GCAAATATTAC----------------------------AA------A-TATT-----------GTCAAGGGTCA-A-CGA--T----A----AG------AGT-CA---ATA---T---TGA--TTAT-T----G-C--CTAAATATTtt
gi|130399 : aAAATAAT-C-T---GCGA-A-TT--GGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--T-AG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CACAAATATtt
gi|130399 : aaaGTCAAGGGTCA-A-AGA--T----C----AA------AGT-TG---CTA---T---TGA--TTATGT----G-C--CTAAACATgtcaagggtcaaagatcaaagttgctattgattatgtgcctaaacat
gi|130400 : aaaaaataatctgcgaattggatagaagcaaggtcaatcatagaggatcactaaaccttccacaaatatAAA-AAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGG-T--AG-A-A-GC-A-A--------AGGC--AA--T-C-A--TCAA----A-GGATCACTAG-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---AACAAATATTGTC----AAGGGTC-AAAGAGCA-----G-AG--TC--AGTATTG
gi|130401 : aaAT-C-T-T-TCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACAAATATTG
gi|130402 : aaagaattAT-C-T-T-GTGACG-TA--TGA-T--AC-G-A-GCCA-A--------GATC--AA----C-A--TCAA----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-----CTTC---TAC--------------------------AGAAT----A-A-----------TTG----T-TAAGG---AGGTCCAAA-AGA--T----C----AG------AGT-CA---TTA---T---TGA--TTAA-TATCAG-C--TTAAATATTtta
gi|130403 : aaagaattcAAA-AAT-T-T-----GA-A-CA--CAG-T--AG-A-A-GC-A-A--------AGACGCAA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CACAAATATTGTC----tt
gi|130403 : aGTCA-A-GTG--T----C----AA------AGT-TG---TTA---T---TGA--CTAT-T----G-C--CTAAATATTaagtgtcaaagttgttattgactattgcctaaatatttt
gi|130404 : aaaaaatttgaacacagtagaagcaaagacgcaatcatcagaggatcactaaaccttccacaaatattAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---tt
gi|130405 : aaagaattAT-C-T---GCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GC-ACA--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TAC
gi|130406 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACtactattaatgggtcaa
gi|130407 : aaacaattAT-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACtactatt
gi|130408 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-G-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACtactatt
gi|130409 : aaagaattAT-C-G-T-GCGA-AACA--AGAAT--AT-A-A-GC-A-AA-------GGTC--AA--T-G-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-AATAAC----CTTC---TAtactatt
gi|130410 : aaagaattAT-C-G-T-GCGA-AACA--AGAAT--AT-A-A-GC-A-AA-------GGTC--AA--T-G-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-AATAAC----CTTC---TA
gi|130411 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GATC--AA--T-T-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CAC
gi|130412 : aaagaatt-AAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGG-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCGC--T-A--AAC----CTTC---CAtattaatggctcaa
gi|130412 : aaaatat-CAAGGTCAATCATCA-G-AGGA-T----CGCTAAACCTTCCAGT-CAATATTA---T---TGA--TTAT-T----G-C--CTAAATATTgtcaatattattgattattgcctaaatatttt
gi|130413 : aaaatataatcttgcgaacgtggtagaagAAA-TAT-C-T-T-GCGA-A-CG--CGA-T--AT-A-A-GG-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TTAG----A-G--------G-A-TCAT--T-A--AAC----CTTC---TACtt
gi|130414 : aaagAT-C-T-T-GCGA-A-CGCTTGA-T--TA-ATA-GC-A-A--------GGTC--AA--T-CTA--TTAG----A-G--------G-A-TCAT--T-A--AAC----CTtattattaatggctcaa
gi|130415 : aagaaattAT-C-T---GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-----CTTC---TACctactattattagggctcaa
gi|130416 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA----AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AA-----CTTC---TAC
gi|130417 : aaagaattAT-C-T---GCGA-A-CA--TGA----AT-A-A-GC-A----------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----TTAC---TAC
gi|130418 : aaagaattAAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-CA--CAA-T--AG-A-A-GC-A-A--------AGGC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AACCTAGCTTC---CACAAATGTTGTC----tattaatggctcaa
gi|130419 : aaAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-G-AC-A-A--------GGGC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----Caaag
gi|130420 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--TCC-A--TCAG------G--------G-A-TCACTTT-A--AAC----CTTT---CAC
gi|130421 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-G-CC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAC----A-G--------G-T-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACtactatt
gi|130422 : aaagaattAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-G-CC-A-A--------GGTCA-AT--T-C-A--TCAC----A-G--------GTT-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACtactatt
gi|130423 : aaagaattAT-C-T-TTGCGA-A-CG--TGA-A--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA----C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--TAA--AAT----CTTC---TAtactatt
gi|130424 : aaagaattA-A-CG--TGA-T--AATA-A-G-------------GGTC--AA--T-C-AGATCAG----AAG--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTT-------AAGGGTT-----------A---AGATCAGATC---G-----CC--A-TATTGA-TT
gi|130425 : aagacattattctagacgaAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--A------------------------------T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACaagtctaatatttt
gi|130430 : aaagaattAAA-AAT-C-T-T-TTGA-A-CG--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CACAAATATTGTC---------------AAGGGT-----------C--A-------------AAGATC-AGAGTCA-A----------------------------------TA---T---TGA--TTAT-T----G-C--CTAAATATTtactattaatggctcaaccagcggggtc
gi|130433 : aAAA-AAT-CATGT-GTGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-CC-A-A--------TGGC--AT--T-T-A--TCGG----A-G--------G-A-CCAT--T-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTACC----TATGC---AGAGAGGAT----G-AA--TC--A-TGTTGA-TTtt
gi|130434 : AAA-AATTC-T-T-GTGA---CA--CGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CATAAATGTTACC----TATGG---AGAGA-GAT----G-AA--CC--A-TA-TGA-TT
gi|130435 : AAA-AAT-CCT-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AA-A-A-GA-A-A--------CAAC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAT--C-A--GAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---AGAGAGAAT----G-AA--TG--C-TATTGATTTT-CAATGTCAAG
gi|130444 : AAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CATAAATGTTACC----TATGG---AGAAAGGAT----A-AA--CC--A-TGCTGA-TTT-CAAGGTCAAGGGTCA-C-AAG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGG--GTAC-T----G-C--CTAAAAATTtattt
gi|130445 : AAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-TA--TGA-T--AA-A-A-GC-A-C--------TGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-T--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CAAAAATGTTACC----TATGG---AGAGAGAAT----G-AA--CC--A-TGTTGATTTT-CTAGGTCAAGGGTCA-A-AAG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--GTAC-T----G-C--CAAAAAAT
gi|130447 : AAA-AAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--CG-A-A-GC-T-A--------GGTC--AG--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--G-A--AAC----CTTC---CACAAATATTGTC----AAGGG-------------------------------------T-CAAAGT------TCA-G-AG-----------------------T-CA---GTT---T---TGA--TTAT-T----A-C--TTAAATATT
gi|130448 : AAA-AAT-C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--CG-A-A-GC-T-A--------GGTC--AG--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--G-A--AAC----CTTC---CACAAATATTGTC----tt
gi|130448 : GTCAAGGGTCA-A-AAGTTT----C----AG------AGT-CA---GTT---T---TGA--TTAT-T----A----CTAAATATTaagggtcaaaagtttcagagtcagttttgattattactaaatatttt
gi|130449 : aaaaatcttgcgaacatgatcgaagctaggtcagtcatcagaggatcacgaaaccttccacaaatattAAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--AG-A-G-GC-A-A--------TGAC--AT--T-C-A--TTAA----A-T--------A-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CATAAATGTTAAT----TATGG---GGAGAAGAA----G-AA--CC--A-TATTGA-TTtt
gi|130450 : AAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-CA--CGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CATAAAT-TTACC----TATGG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--A-TATTGATTTT-CAAGTTCAAGGGTCA-A-A-G--T----C----AA------GATACA---CTA---T---TGA--GTAC-T----G-C--CTAAA
gi|130455 : -AAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TTG-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-ATTCGC--T-A--AAC----CTTT---C
gi|130456 : aatattAAA-AAT-C-T-T-TGAA-A-CA--TGA-T--AA-A-ATGC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TC------A-A--------G-A-TCA---T-A--AAC----CTTC---AAAAAACATTGTC----caggtcaatattattttgattatgccctaaatatttt
gi|130456 : GTCAAGT-TCA-A-AGA--T----C----AA------AGTTCA---GTA---T---TAA--TTTT-T----G-C--CTAAATAaagttcaaagatcaaagttcagtattaatttttgcctaaataattt
gi|130463 : aaaaatctttgaaacatgataaaatgcaaggtcaatcatcaagatcataaaccttcaaaaaacattAAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-CA--CGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGTC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC-----TTC---CATAAATGTTACC----TATGG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--A-TATTAATTTT-CAAGGTCAAGGGTCA-A-A-A--T----C----AA------GAT-CA---CTA---T---TGA--GTAC-T----G-C--CTAAAAATattt
gi|130465 : AAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-CA--CGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CATAAATGTTACC----TATGG---AGAGA-GAT----G-AA--CC--A-TATTGA-TT
gi|130466 : AAA-AAT-C-T-T-GTTA-A-CA--CGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGGC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CATAAATGTTACC----TATGG---AGAGAGGAT------AA--CC--A-TATTGA-TT
gi|130475 : AAA-AAT-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-T--------GG-C--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-C--AAC----CCTC---CATAAATGTTACC----TATGG---AGAGAGAAT----G-AA--CT--A-TATTAA-T
gi|130506 : AA-ACT-A-T-T-GTGA-A-TA--TGA-T--GG-G-A-GC-A-G--------GGGC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--G-G--AAC----TTTT---CACAAACATTACC--------A---AG------------------------------TTT-CA------AAGATCA-A-A-----------------------GT-CA---CTA---T---TGA--TTAT-T----A-G--CTAAATATT
gi|130509 : AT-C-T-T-GCAA-A-CG--TGA-T--AT-A-T-GC-A-A--------GGTC--AG--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---AACAAATATTGTT---------------AAGGGT-----------C--A-------------AAGATC-AGAGTCA-A----------------------------------TA---T---TGA--TTAT-T----G-C--CTAAATATTtt
gi|130511 : aattAT-C-T-TTGCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GG-A-G--------AGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--ATT----CTAC---TACATATtt
gi|130513 : ttAT-C-T-T-GCGA-A-CG--TGA-T--AT-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---TACt
gi|130514 : t-T-GTGA-A-CA--AGA-C--AG-A-A-GC-A-A--------AGGC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-CCAC--T-A--CAC----TTCC---CACAAATATTATT----CAT-------------T----G-AA--C-------------TT-CCAGGTCTCGAGTCA-A-AGA--T----C----AA------AGT-CA---CTG---T---TGA--TTAT-T----G-A--CCAAtattaatggctcaaccagcgggtc
gi|130515 : tatac-T-GTGA-A-CA--AGA-C--AG-A-A-GC-A-A--------GG-C--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-CCAC--T-A--CAC----TTCC---CACAAATATTATT----CAT-------------T----G-AA--C-------------TT-CCAGGTCTCGAGTCC-A-AGA--T----C----AA------AGT-CA---CTG---T---TGA--TTAT-T----G-A--CCAAcatttt
gi|130522 : tatacAT-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGAC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CATAAATGTTATC----TATGG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--A-TGTT---TTT-C-----CAA-GGTCA-A-AAG--T----C----TT------GGT-CA---CTA---T---CGA--GTAC-T----G-C--CTAAAcatttt
gi|130524 : AT-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-AC-A-A--------GGAC--AG--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTCC---CTCAAATGTTGTT----CATGG---TGTGAAGAT----G-AA--GC--A-AATTCA-TT
gi|130525 : AT-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-AC-A-A--------GGAC--AG--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTCC---CTCAAATGTTGCT----CATGG---TGTGAAGAT----G-AA--GC--A-AATTCA-TT
gi|130526 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--CAA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCGT--C-A--ATC----CTTC---CACAAATCTTGTC----CATGG---AAAGAAGAT----G-AG--TC--C-TATTGA-TTT------TCAATGGCCA-A-A
gi|130528 : AC-C-T-T-GTGA-A-TA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-C--------A-A-TTAT--C-A--AAC----CTTC---CAAAAGTGTTGAT----CATGG---AAAG-----------------------------------GGTCA--------A-ACG--A----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--TTAT-G----G-C--TTAAA
gi|130529 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTACT----CATAG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--C-TATTGATTTT-CAAGGTCAAGGGTGA-A-AGG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--CTAT-T----G-C--CAAAAT
gi|130530 : AT-C-T-T-GTTA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------GAA-TCAC--CAA--AAC----CTCC---CTCAAATGTTGCC----CATGG---AGTGATGAT----G-GA--GC--C-TATTGA-TT
gi|130531 : AT-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-T-A--TCGG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTCCC----CATGG---AGAAAGAGT----G-AA---C--A-C-TTGA-TT
gi|130532 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---AGAGAGGAT----A-AA--CT--C-TATTGA-TT
gi|130534 : AT-C-T-T-GTGA-G-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------TGAC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----TTTC---AATATTTGCTACG----TATGG---A-------C----G-AA--CC--A-TGTTGT-TTT-CAAGGTCAAGGATCA-A-AAG--T----C----AA------GGT-CA---TTA---T---TGA--GTAC-T----G-C--CT
gi|130536 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-A--------A-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----
gi|130537 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AA-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAGG---A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGA---AAAGAGGAT----G-AC--CC----TATTGA-TTT-CAAGGTCAAGGATCA-A-ATG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGG--CTAT-T----GCC--CTAAA-ATT
gi|130538 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-A--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---TACAAATGTTGCC----CATGG---AGAGTGGAT----G-AA--CC--C-TATTGA-TTct
gi|130539 : AC-C-T-T-GTGA-G-CA--AGA-T--AG-A-G-GC-A-A--------GGTC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TAAT--T-G--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCT----CATGG---AGAGAGGAT----G-AA--AT--C-TAATGA-TTT------TC---------A-AGG--T----C----AA------GAT-CA---CTA---T---TGA--CTA
gi|130541 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-AC-A-A--------GGGC--ATGAT-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TTAT--G-G--AAC----ATTC---CACAAATGTTGTT----CATGG---AGAGAGGAT----G-AA--CTTAA-TATTGA-TTT------TCAAGGGTCA-G-AGG--T----T----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--C--T-T----G-C--TTAAAAATTaaattct
gi|130542 : AC-C-T-T-GTAA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-T-A--------GGAC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----TATGG---AGAGTGGAT----A-AA--TC--C-TATTGA-TTtt
gi|130544 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--GG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AT--T-T-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTCC---CACAAA
gi|130545 : AC-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGT--AT--T-T-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAT--G-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---AGAGAGGAT----G-AT--GT--G-TATTGA-TT
gi|130575 : T-C-T-T-GGGA-A-CA--TGA-T--AG-A-A-GC-A-ATGGCATTCAGCC--AT--T-C-A--TGAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTCTTCCATAAATGTTACC----TATCG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--A-TATTGA-TTTTCAAGGTCAAGGGTCA-A-AAG--T----C----AA------GAT-CA---CTA---T---TGA--GTAC-T----G-C--CTAA
gi|130577 : T-C-T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--TG-A-A-GC-A-A--------TGAC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAA----CTTC---CACAAA
gi|130579 : T-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------AAGT--AT--T-C-A--ATAG----A-G--------G-A-TCAT--T-A--AAC----ATTC---CACAAATGTTGCT----CATGG---AGAGCGGA--------------------TGA-TTT-TA---T------------AGG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TTA--TTAT-T----G-C--CTAATTATatt
gi|130580 : T-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--A--A-A-GC-A-A--------GGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----ctt
gi|130586 : -C-T-T-GCGA-A-CA--TGA-T--AT-A-A-AC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--CCAG----A-G--------G-A-TCAA--T-A--AAC----CTTC---
gi|130587 : -C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---tgctactattaatggctcaa
gi|130587 : CA-A-ATG--TTGCCC----AT------GGT-CA---CTA---T---TGA--CTAC-T----G-A--CTAAA-ATTtcactattgactactgactaaaattct
gi|130589 : cttgtgaacaagatagaagcaagggcattcatcagagaatcatcaaaccttcca-C-T-T-GTGA-A-CA--AGA-C--AG-A-A-GC-A-A--------GGGA--AT--T-C-A--TCAG----A-A--------A-A-TCAT--C-A--AGC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATTG---AGAGAGGGT----G-AA--CC--C-TATTGA-TTT------TCAA-GTTCA-A-AGA--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--CCAC-T----G-T--TTAAAAATct
gi|130596 : -T-T-GTGA-A-CA--GGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACACATGTTGCC----CActt
gi|130598 : -T-T-GTGA-A-CA--TGA-T--GG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A---CAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--GAC----CTTTTGGCA-AAATGTTGCC----CATGG---AGAGAGGAC----G-AA--CC--C-TATTGA-TTTTCAAGTTCAAGGGTCA-A-AGA--T----C----AG------GGT-CA---CTA---T---TGA--CTAT-T----G-C--CTAAAAATgg
gi|130599 : -T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--C-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTA---CACAAATGTTGTC----CATGG---AGCTAGCAT----G-AA---C--A-C-TTAA-TTT------TCAA-GGTCT-A-GGG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---TTAATGA--CTAA-T----G-C--CTAAAAATctt
gi|130600 : -T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------A-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATATTGCT----CATGG---AGAGAGGAT----G-AA--CC--C-TATATA-TTT-ctt
gi|130601 : -T-T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GT-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TTAG----A-G--------A-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---AGAGAGGAT------AA--CC----TATTGA-TTt
gi|130607 : -T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CAAAAATGTTGCC----CATGA---AGAGAGGAT----A-AA--CC--T-TATTGATTTT-CAAGGTGAAGGGTCA-A-AGG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--CTAT-T----G-CCTCTAAATCTT
gi|130608 : -T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGT--AT--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CATGG---AGAAAGTAT----GAAA--CCTAG-TACTGA-TT
gi|130611 : -T-GTGA-A-CA--AAA-T--AC-A-G-GC-A-A--------GGGC--AT--T-T-A--TTGG----A-A--------G-A-TCAT--C-A--AAC----TTTC---CACAAATATTGCT----CAAGG---TGAGAGGAT----G-AA--TC--C-TAATGA-TTT------TTA---TTGA-A-AGG--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---TGA--CTAA-T----G-C--CTAAAAAT
gi|130612 : -T-GTGA-A-CA--AGA-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TTAG----A-G--------G-A-TCAT--C-A--AAC----CCTC---CACAAATGTTGCCCATGCATGG---AGAGAGGAT----A-AA--CC--C-TATTGA-TTT------------------------T----C----AA------GGT-CA---CCA---T---TGA--CTATGT----C-C--CTAAATTTTctt
gi|130618 : -A-CA--TAA-TGTAG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-C-A--TCAG----A-G--------G-A-TCAC--T-A--AAC----CTTC---CACAAATATTGTC---------------AAGGGT----G-A---------------------AAGATC-AGAGTCA-A----------------------------------TA---T---TGA--TTAT-T----G-C--TTAAATATTt
gi|130622 : A-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGTC--AA--T-CAA--TCAT----A-A--------G-A-TCAC--TAA--AAC----CTT-------AAAT----CC----CAC--------------------AA------A-TATTG----T-CAA----AAGGGTCA-A-A-G--T----CAG--AA------AGT-CA---ATA---T---TGA--TTAT-T----G-C--CTAAATATTtt
gi|130623 : A-T--AG-A-A-GC-A-A--------GGGC--AT--T-C-A--TCAG----A-G----------A-TCAT--C-A--AAC----CTTC---CACAAATGTTGCC----CAT-G---AGAGAGAAT----G-AA--CC--A-TATTGA-TTT------TCAAGGGTCA-A-A-G--T----C----AA------GGT-CA---CTA---T---CGA--CTAT-T----G-A--CTAAAtt
gi|130625 : -T--AG-A-A-CC-A-A--------GGGC--AA--T-C-A--TCAA----A-G--------G----CAC--T-A--AAC----GTTC---CACAGATATTGCT----C---------------------------------ATTGC-TTT------TC-AGGGTCA-A-AAC--T----C----A--------GT-CA---C-----T---TGA--TAAT-T----G-C--CTAAA-ATTatactt
gi|130641 : GTCAAGGGTCA-A-AGA--T----C----AA------AGT-TG---CTATTTT---TTATTTTAT-T----G-C--CTAAATATTtt
gi|130643 : tccacaaatattAATGGTCA-A-AGA--T----G----AG------AGT-CA---ATA---T---TGA--TTAA-T----G-C--CTAAATATTtt
1 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|130640 ): CACTAAACTTCTACAAAAATTGTCACAGGGTACAAACAATCACAAGTCATATTAATTAATGCCTAATATTTT