lowQualScore : 3333333333333333333333333333333333 11 222222 111111111 1 1 1 11 111 1 2 2 1 1 2 11 2 2 1 2 4 4 2 2 2222 1 1 2
lowQualScore : 111111 0 5555 00 00 44 5555555555555555555555555555555555 555555 0 0 55 0 888 44 0 0 0 0 111 0 0000 00 77 0 000 222222 888 444444444 0 3 11111111 1111 1 222222 2222 4444 444 1 22 22 333 555 3 55 44 44 3 7 7 3 6 3 7 7 33 999 3 0 3 6 7 6 3 3 7 3 44 3 6 3 3 7 0 0 7 3 6 7 4444 3 7 7 3 3 7
lowQualScore : ...... . .... .. .. .. .................................. ...... . . .. . ... .. . . . . ... . .... .. .. . ... ...... ... ......... . . ........ .... . ...... .... .... ... . .. .. ... ... . .. .. .. . . . . . . . . .. ... . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . .... . . . . . .
lowQualScore : 222222 4 9999 66 66 44 8888888888888888888888888888888888 666666 4 4 99 4 555 11 8 4 4 1 666 4 9999 66 22 4 777 888888 222 888888888 4 1 66666666 8888 9 555555 0000 3333 666 7 66 88 555 666 1 11 66 11 7 3 3 3 7 3 3 3 33 000 3 7 7 7 3 7 3 3 3 3 00 7 7 3 7 3 0 0 3 3 7 3 0000 3 3 3 3 3 3
consensus : TTTCACGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC--G--TG----G---C--G-----NG----AG--C------G-G-GG-CT-CGAA-CNCAC-GA-CCT-CC-CGATC-G-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-TA---ACC--ACTGAG---C---C-ACC-GCGACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--AT-TTCGACGATCATTGATCCTTCACTGACTGATAAATGCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAG-CCTGTCGGAAATGGAAA-CATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACATAAACGAGAAAGGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGGCCCATATGCTCAGT-TTAATG-GAGATTTTGGGCTA-ATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTATCCACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAATCCAGCTTAATACAATTCCATGCC-AACAT-ATCGTCATCTTGGAACAAAGAATTAGGAAAATGCAAGTATT-CGACATTAATATTAGAATA-TAAAAATTCTCGGCGC-TTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATC-TATCTGTCATTGAGTTGTTTTCAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCC-TTTTTATCAATGATTTTATCTTCA-GACTGTTGACGCTGGAATCGCATT-CCTGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGAGGACGCCTATGTATAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAGTTCCGGATGGAAAGTG-AAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTGTTTACATGTTGATGAATTTATCACACACGACTGTTAGTACA-AGTTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACT-GAGGCATAGGGTCACATTTTGGGAGCAAAGTTT
Reference ( gi|4947 ) : TTTCACGTCTTA------GG-TTTG---GC--GC--GG-TC--A--TG----G---C--A-----AT----AG--C------G-G-GA-CT-CGAA-TTCAC-TA-CCT-CC-CGGTT-G-CGAA-G----C--GAA-CGC-T---C-CA---ACT--ACTGAG---G---T-ACC-GCCACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--AT-TTCGACGATCATTGATCCTTCACTGACTGATAAATGCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAG-CCTGTCGGAAATGGAAA-CATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACATAAACGAGAAAGGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGCGCCATATGCTCAGT-TTAATG-GAGATCTTGGGCTATATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTATCCACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAATCCAGC-TAATACAATTCCATGCC-AACAT-ATCGTCATCTTGGAACAAAGAATTAGGAAAATGCAAGTATTCCGACATTAATATTAGAATATTAAAAATTCTC-GCGC-TTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATCTTATCTGTCATTGAGTTGTTTTCAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCCTTTTTTATCAATGATTTTATCTTCAGGACTGTTGACGCTGGAATCGCATTCCCTGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGA-GACGCCTATGTATAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAGTTCCGAATGGAAAGTG-AAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTGTTTACATGTTGATGAATTTATCACACACGACTGTTAGTACA-AGTTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACTGGAGGCATAGGGTCACATTTTGGGAGCAAAGTTT
gi|4948 : TTTCACGTCTTA------GG-TTTG---GC--GC--GG-TC--A--TG----G---C--A-----ATT---AG--C------G-G-GA-CT-CGAA-TTCAC-TA-CCT-CC--GGTT-G-CGAA-G----C--GAA-CGC-T---C-CA---ACT--ACTGAG---G---T-ACC-GCCACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--AT-TTCGACGATCATTGATCCTTCACTGACTGATAAATGCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAG-CCTGTCG-AAATGGAAA-CATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACATAAACGAGAA-GGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGCGCCATATGCTCA---TTAATG-GAGATCTTGGGCTATATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTATCCACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAA-CCAGC-TAATACAATTCCATGCC-AACAT-ATCGTCATCTTGGAACAAAGAATTAGGAAAATGCAAGTATTCCGACATTAATATT-GAATATTAAAAATTCTC-GCGCTTTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATCTTATCTGTCATTGAGTTGTTTTCAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCC-TTTTTATCAATGATTTTATCTTCA-GACTGTTGACGCTGGAATCGCATTCCCTGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGA-GACGCCTATG--TAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAGTT-CGAATGGAAAGTG-AAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTGTTTACATGTTGATGAA-TTATCACACACGACTGTTAGTACA-AGTTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACTGGAGGCATAGGGTCACATTTTGGGAGCAAAGTTT
gi|4949 : TTTCACGTCTTA------GG-TTTG---GC--GC--GG-TC--A--TG----G---C--A-----AT----AG--C------G-G-GA-CT-CGAA-TTCAC-TA-CCT-CC-CGGTT-G-CGAA-G----C--GAA-CGC-T---C-CA---ACT--ACTGAG---G---T-ACC-GCCACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--ATATTCGACGATCATTGATCC-TCACTGACTGATAAATGCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAG-CCTGTCGGAAATGGAAA-CATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACA-AAACGAGAAAGGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGGCCCATATGCTCAGTATTAATG-AGGATTTTGGGCTA-ATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTAT-CACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAATCCAGCTTAATACAATTCCATGCC-AACATAATCGTCATCTTGGAAC-AAGAATTAGGAAAATGCAAGTATT-CGACATTAATATTAGAATA-TAAAAATTCTCGGCGC-TTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATC-TATCTGTCATTGAGTTGTTTTCAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCC-TTTTTATCAATGATTTTATCTTCA-GACTGTTGACGCTGG-ATCGCATT-CCTGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGAGGACGCCTATGTATAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAGTTCCG-ATGGAAAGTG-AAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTGTTTACATGTTGATGAATTTATCACACACGACTGTTAGTACA-GATTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACT-GAGGCATAGGGTCACATATTGGGAGCAAAGTTT
gi|4950 : TTTCACGTCTTA------GG-TTTG---GC--GC--GG-TC--A--TG----G---C--A-----AT----AG--C------G-G--A-CT-CGAA-TTCAC-TA-CCT-CC-CGGTT-G-CGAA-G----C--GAA-CGC-T---C-CA---ACT--ACTGAG---G---T-ACC-GCCACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--AT-TTCGACGAT-ATTGATCCTTCACTGACTGATAAA-GCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAGGCCTGTCGGAAATGGAAAACATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACATAAACGAGAAAGGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGGCCCATATGCTCAGT-TTAATGAGAGATTTTGGGCTA-ATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTATCCACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAATCCAGCTTAATACAATTCCATGCCAAACAT-ATCGTCATCTTGGAACAAAGAATTAGGAAAATGCAAGTATT-CGACATTAATATTA-AATA-TAAAAATTCTCGGCGC-TTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATC-TATCTGTCATTGAGTTG-TTTCAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCC-TTTTTATCAATGATTTTATCTTCA-GACTGTTGACGCTGGAATCGCATT-CCTGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGAGGACGCCTATGTATAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAAGTC--GATGGAAAGTGAAAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTG-TTACATGTTGATGAATTTATCACACACGACTGTTAGTACAGAGTTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACT-GAGGCATAGGGTCACA-TTTGGGAGCAAAGTTT
gi|4951 : TTTCACGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC--A--TA----G---C--A-----TA----AG--C------G-G-GG-CT-CGAA-CTCAG-GA-CTC-CC-CGGTT-G-CGAA-G----C--GAA-CTC-T---C-TA---ACC--GCTGAG---C---T-ACC-GCTACC--------G----G-T
gi|4953 : TTTTACGCCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC--A--TG----C---C--A-----CG----AG--C------A-G-GT-CT-CGAA-CTCAC-GA-CCT-CC-C-GTT-GACGAA-G----C--GAA-CAC-T---C-CA---GCC--ACTGAG---A---T-ACC-GCGACC--------G----G-TC
gi|4954 : TTTAACGTTTTA------GG-TTTG---GT--GC--GG-CC--A--TG----A---C--A-----CG----AG--C------G-G-G--TT-CGAA-CTCAC-GA-CCT-TC-CGGTT-G-CGAA-G----A--GAA-CGC-T---C-TA---ACC--ACTGAG---C---T-ACT-GCGACC--------G----G-T
gi|4952 : TTTCACGTCTTG------GG-TTTG---AC--GC--GA-CC--A--TG----G---C--A-----CG----AG--C------T-G-GG-CT-CGAA-CTCAC-GA-CCT-CC-CGGTT-G-CGAA-G----C--GAA-AGC-T---C-TA---ACC--ACTGAGCATGAGCT-ACC-ATGACC--------G----G-T
gi|4956 : TTTCATGTCGTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CT--A--TG----C---T--A-----CG----AG--C------G-G-GG-CT-CGAG-CTCAC-GA-TCT-TC-CGAAT-G-CGTA-G----C--GAA-CGC-T---C-TA---ACC--ACTGAG---A---T-ACC-GCGACC--------G----G-TTA------A----A----
gi|4957 : TTTCATGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--AG-CC--A--TG----C---T--A-----CG----AG--C------G-G-GG-CT-CAAA-CTCAC-AA-CCT-CC-CGGTT-G-CGAA-G----C--GAA-AGC-T---C-TA---TCT--ACTGAG---C---T-ATC-GC
gi|4955 : TTTCACGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC--GAGTG----C---C--G-----AG----CA--C------G-G-GG-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCT-CC-CGATC-A-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-T----ACC--ACTGAG---C---C-ACC-GCGACC--------G----G-TTA------A----A----AA---AAA-A
gi|4961 : TTTCACGTCT-A------AG-TTTG---AT--GT--GG-TC--A--TG----A---C--A-----TG----AG--C------G-G-GG-TT-CGAA-TTCAC-GA-CCT-CC-CAATT-G-CGAA-A----C--GAA-CGC-T---C-TA---TCC--ACTGAG---C---T-ACT-G
gi|4959 : TTTCACGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC--GGGTG----C---C--G-----AT----CA--C------G-G-AG-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCT-CC-CGATC-A-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-T----ACC--GCTGAG---C---C-ACC-G-CACC--------G----G-TCG------A----A----AA---CAA-
gi|4960 : TTTAACGTCTTG------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC--G--TT----C---C--G-----AG----CA--C------G-G-GG-CT-CGAA-CTCAC-GA-CCT-CC-CGATC-A-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-T----ACC--ACTGAG---T---C-ACC-GCGACT--------G----G-TCG------A----ATTTCAA---AAA-AA--G--A---
gi|4966 : TTTC-TGTCTTA------GG-GTTG---AA--GC--GG-CC--A--CG----G---C--A-----AG----AG--C------G-T-GG-CT-CGAA-CTCAC-CA-CC------GGTT-A-CGAA-G----C--GAA-CGT-T---C-TA---ACC--ACTGAG---C---T-ACA-GCGACC--------G----G-
gi|4962 : TTTCACGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC--G--GGT---G---C--A-----G-----AG--CAC----G-G-GA-CT-CGAA-CGCAC-GG-CCT-CC-CTATC-A-CGAG-G----C--GAA-AGC-T---C-T----ACC--ACTGAG---C---C-ATC-GCGGCA--------G----G-TAA------A----A----AAGGTAAA-AA--A--AGGGTAGTTG-A-C
gi|4969 : TTTCACGTCTTA------GG-TTGG---AC--GC--GG-CG--A--TA----A---C--A-----CA----AG--C------G-G-GG-TT-TGAA-CTCAG-GA-CCT-TC-CGGTT-G-CAAA-A----C--GAA-CGC-T---C-T----ACC--ACTGAG---T---T-ACC-GCGCCC--------G----A-T
gi|4958 : TTTAACGTCTTA------GG-TTTG---AT--AC--GG-CC--G--TG----T---C--ATG---AT----A----------A-G-GG-CT-CGAA-CTCAC-GA-CAT-CC-CGGCC-G-CGAA-GCACAC--AAA-CGC-T---C-TA---ACC--ACTGAG---C---T-ACC-GCGACC--------A----G-T
gi|4965 : TTTCACGTTTTA------GA-TTTA---CC--GC--GG-CC--A--TG----A---C--A-----G------G--A------G-G-GA-CT-TGAA-CTCCC-GA-CCT-CC-CGTTT-A-CGAA-G----T--GAA-CGC-T---C-TA---ACC--ACTGAG---C---T-A
gi|4964 : TTTCATGTCTTG------GG-TTCA---AT--GC--AG-CC--A--TG----C---C--A-----CG----AG--C------T-G-GG-CT-CAAA-CTCAT-GA-CCT-CC-CGGTT-G-CGAA-G----C--GAA-TGA-T---C-TA---ACC--ACTGAG---C---T-ATT-GCGACC--------A----G-CC
gi|4972 : TTTAACGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC--G---A----G---C--A---------------C------G-G-GG-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCT-CC-CGATC-A-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-T----ACC--ACTGAG---C---C-ACC-GCGACC--------G----G-TCA------
gi|4967 : TTTCACGTCTTA------GG-TTTG---AC--TC--GG-CT--A--TG----G---C--AC----GT----GA--T------G-G-G--CT-TTAA-CTCAC-GA-CCT-CC-TGATT-G-CGAG-G----C--AAA-CGT-T---A-TA---ACC--ACTAAG---C---T-ACCGGAGAAC--------A----G-CCA------A----A----AA---CAATAA--A--A-------------AAG-A--AT-T
gi|4974 : TTTCACGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC--G---------------A-----AC----A---C------G-G-GG-CT-TGAA-CGCAC-GA-CCT-CC-CGATC-A-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-T----ACC--ACTGAG---C---C-ACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4975 : TTTAACGTCTTA------GG-TTCG---CC--GC--GG-CC--GGGTG----C---C--A-----GC----A---C------G-G-GG-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCT-CC-CGATC-A-CGAG-G----C--GAG-CGC-T---C-T----ACC--ATTGAG---T---C-ACC-GCAACC--------G--------A------A----C----AC---AGA-AG--G--A---TAGATG-
gi|4978 : TTTAACATCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC--G---A----G---C--A---------------C------G-G-GG-CT-CGAA-CTCAC-GA-CCT-CC-CGATC-A-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-T----ACC--ACTGAG---C---C-ACC-GCGACC--------G----T-TCA------C----A----A
gi|4985 : TTCCACGTCTTG------GG-TT-G---TC--GC--GA-CT--A--TG----T---C--A-----CA----AG--A------G-G-GG-CT-CGAA-TTTAC-GA-CCT-CC-CTGTT-G-CCAA-G----C--GAA-TGT-T---C-AA---ACA--ATTGAG---G---T-ACC-TCGACA--------G----G-TTA------G----A----
gi|4976 : TTTCACGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC--G--TGT---G---CCGA-----GC----A---C------G-G-GG-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCT-CC-CGATC-A-CGGG-G----C--GAG-AGC-T---A-TA---CCA--ACTGAG---C---C-ACC-GCGACC--------G----GTTCA------G----ATGT-AA---ATG-AA--A--A---
gi|4970 : TTGCACGTCTTG------GG-TTTG---AC--GC--GA-CC--A--TA----C---C--A-----CC----AG--C------A-A--A-CT-CGAA-CTCAC-GA-TCT-CC-CGGTT-A-TGGA-G----C--GAA-TGC-T---T-CA---ACC--ACTGAG---
gi|4994 : TTTCACGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC--A--GT----C---C--A-----AG----TG--T------G-G-GG-CT-CGAA-CTCAC-AA-CCT-CC-CGATC-A-CGAG-A----C--AAG-AGC-T---C-T----ACC--ACTGTG---A---C-ACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4984 : TTTCACGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC--G---A----G---C--A---------------C------G-G-GG-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCT-CC-CGATC-A-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-T----ACC--ACTGAG---C---C-ACC-GCGACC--------G----
gi|4973 : TTTCACTTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC--GAGTG----T---C--G-----AG----CA--C------G-G-GG-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCT-CC-CGATC-A-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-T----ACC--ACTTAG---C---C-ACC-GCGACC--------G----G-TGA------A----A----A
gi|4977 : TTTCACGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CCGGG--TG----C---C--G-----AG----CA--C------G-G-GG-CT-TGAA-CGCAC-GA-CCT-CC-CGATC-A-CGGG-G----C--GAG-AGC-T---C-T----ACC--ACTGAG---C---C-ACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4968 : TTTCACGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CCGAG--TG----C---C--G-----AG----CA--C------A-G-GG-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCT-CC-CGATC-A-CAAG-G----C--GAG-AGC-T---C-T----ACC--ACTGAG---C---C-ACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4979 : TTTCACGTCTTA------GG-TTTG---AC--AC--GG-CC--GAGTG----C---C--G-----AG----CA--C------G-G-GG-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCT-CC-CGATT-A-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-T----ACC--ACTGAG---C---C-ACT-GCGACC--------G----A-T
gi|4983 : TTTCACGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CCGAG--TG----C---C--G-----AG----CA--C------G-G-GG-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCT-CC-CGATC-A-CGAG-G----C--GAG-AGA-T---C-T----ACA--ACTGAG---T---C-ACC-GCGACC--------G----GATTA------A----A----
gi|4981 : TTTTACGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--AA-TC--A--TG----G---C--ACGGGCACG---AG--C------T-G-GG-CT-CGAA-CTCAC-GA-CCT-AC-CGGTT-A-C----------------TGC-T---C-T----ACT--ACTGAG---C---T-ACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4992 : TTTCACGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC--G--TGT---G---CCGA-----GC----A---C------G-G-GG-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCT-TC-CGATC-A-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-TA---CCA--ACTGAG---C---C-ACC-GC
gi|5008 : TTTTATGCCTTG------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC--T--TT----G---C--T-----CG----AG--C------G-G-GG-CT-CAAA-ATCGC-AA-CCT-CT-TGGTT-A-CGAA-G----C--GAA-CGC-T---C-T----ACC--AATGAG---C---T-ACC-GTAACC--------A----G-TGA------A----
gi|4986 : TTTAACATCTTT------GG-TTTA---AC--GC--GG-CC--A--TG----G---C--T-----TA----AG--C------G-G-TG-CT-TGAA-CTCGCATAACCT-CC-TCGTT-G-CGAT-G----C--GAA-CGC-T---C-TA---ACT--GCTGAA---C---T-ACC-GAGACC--------A----G-T
gi|4997 : TTTCACGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-C-------G----G------A-----GTGCCGAG--CAT----G-G-GG-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCT-CC-CCATC-A-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-C---------ACTAAG---C---C-ACC-GCGACC--------G----GTTCA------A----A----TA---ATA-AA--T--A---TA
gi|4996 : TTTCACGTCTTA------GG-TTTG---AT--GC--GG-CC--G---G----G---T--G-----CTG---AG--CAT----G-G-GG-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCT-CC-TGATC-A-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-T----ACC--ACTGAG---C---C-ACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4988 : TTTAACGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC------G----GTC-C--A-----AG----CA--C------G-G-GG-CT-CGAA-CTTAC-GA-CCT-CC-CGCTC-A-TGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-T----ACC--ACTAAG---C---C-ACC-GTGACC--------G----G-TCA------G----A----
gi|4989 : TTTAACGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC-----TG----GTGCC--G-----AG----CA--C------G-G-GG-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCT-CC-CGATC-A-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-TA---TC---ACTGAA---C---C-ACC-GCGACC--------G----G-TC
gi|5017 : TTTCATGTCTTA------GG-TTTT---AC--AC--AG-CC--A--TGTATGG---C--A-----CA----AG--C------G-G-GG-CT-TTAA-CTCAT-GG-CCT-AC-CGGTT-G-GGGA-G----C--GAA-CGC-T---C-TA---GCC--ACAGAG---C---T-ACC-A--ACT--------G----G-TCA------
gi|4995 : TTTCACGTTTTA------GG-TTTG---ACTCGCCGGG-TG--C--TGA---G---C--A---------------C------A-G-GG-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCT-CC-CGATC-A-CGAG-G----C--GAG-AGG-T---C-T----ACC--ACTGAG---C---C-ACC-GCGACC--------G----G-TT-------G----A----AA---ATG-GC--A--A---CAAGTG-A-CGA--A--AT-TT
gi|4982 : TTTCACGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC--GGGTG----C---C--G-----AG----CA--C------A-G-GG-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCT-CC-CGATC-A-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-TA---CCA--ACTGAG---C---C-ACC-GCGACT---------------TCA------A----
gi|4980 : TTTTACGTCTTA------GG-TTTG---AT--GC--GG-CC--G--GGT---G---C--G-----AG----CA--C------A-G-GG-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCT-CC-CGATC-A-CGAG-G----C--GAG-AAC-T---C-T----ACC--ACTGAG---C---C-ACC-GCGACC--------G----G-TC
gi|5003 : TTTCACGTCTTA------GG-ATTG---AC--GC--GC-CC--G--TGT---G---CCGA-----GC----A---C------G-G-GG-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCT-TC-CGATC-A-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-TA---CCA--ACTGAG---T---C-ACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4990 : TTTCACGTCTTA------GG-TTTG---GC--GC--GT-TC--GACTGCCGAG---C--------AC----GG--C------G-G-----T-CGAA-CGCGC-GA-CCT-CC-CGATC-A-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-T----ACC--ACTGAG---C---C-ACC-GCGACG--------G----A-TCT------T----A----GA---AAT-AT--A--A----AGG-----CAA--A--AT----AACAAACATTGATC
gi|4998 : TTTAACGTCTTA------GG-TTGG---AC--GC--GG-CC--GGGTG----C---C--G-----AG----CA--C------G-G-GG-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCT-CC-CGATC-A-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-T----ACC--ACTGAG---C---C-ACC-GCGACC--------GTGA-G-TGA------T----A----AA---AA
gi|5001 : TTTAACGTCTTA------GG-TTTG---AC--GA--TT-CC--AGGTG----C---C--G-----AG----CA--C------G-G-GG-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCT-CC-CGATC-A-CGAG-G----C--GAG-AAC-T---C-TA---CCA--ACTGAG---G---C-ACC-G-CGTC--------T----T-TTA------A----T----TA---AAA-GA--G--A----AGGCG-A-CGAG-G--AT----AACGAACAGTGATC
gi|4999 : TTTAACGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-TC--G--AGT---G---C--G-----AG----CA--C------G-G-GA-CT-CGAA-CTCAA-AA-CCT-TC-CGATC-A-CGAA-G----C--GAG-AGC-T---C-CGGCTACC--ACTGAG---
gi|5000 : TTTAACGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CCGGG--TG----C---C--G-----AG----CA--C------G-G-GG-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCT-CT-CGATC-A-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-T----ACC--ACTGAG---C---C-ACT-GCGACC--------G----G-T
gi|5004 : TTTCACGTCTTA------GGTTTTG---AC--GA--GG-CCGGG--TG----C---C--G-----------AG--CAT----G-G-GG-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCT-CC-AGATC-A-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-T----ACC--ACTGAG---C---C-ACC-ACGACC--------G----G----------A----A----GA---GAA-GA--A--A---TAG
gi|4991 : TTTCACGCCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-TT--G--GGT---G---C--G-----AG----CA--C------G-G-G--CT-CGAA---CAC-GA-CCT-CC-CGATC-A-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-T----ACC--ACTGAG---C---C-ACT-GCGAAC--------G----G-TCT------A----A----A
gi|5023 : TTTCTCATCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC--A--TA----G---T--A-----CG----AG--C------G-G-GG-TT-CGAA-CTCAC-GA-CCT-AC-CGA-T-A-CGAA-G----C--GAG-AGC-T---C-TA---TC---ACTGAA---C---C-ACC-GC
gi|5015 : TTTCACGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC---G-CCGGG--TG----C---C--A-----AC----A---C------G-G-GC-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCT-CC-C-ATC-A-C-AA-G----C--GAG-AGC-T---C-T----ACC--ACTGAG---C---C-ACC-GCGACC--------G----G-TC
gi|5024 : TTTTACGTCTTA------AG-TTTG---AT--GC--GG-TC--A--TG----G---C--A-----CG----AG--C------G-A-GG-TT-CAAA-CTCGC-GA-CCT-CC-CGGTT-G-CGAG-G----C--
gi|5009 : TTTCACGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC--G--CGT---G---C--A-----G-----AGCAC------G-G-GG-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCG-TT-CGATC-A-CGAG-G----C--AAG-AGC-T---C-T----GCC--ACTGAG---G---C-ACC-GCGACC--------G----A-T
gi|5006 : TTTTACGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC--G--TT----C---C--G-----AG----CA--C------G-G-GG-CT-CGAA-CTCAC-GA-C---TC-CGATC-A-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-T----ACC--ACTGAG---C---T-ACC-GCGACC--------
gi|4963 : TTTCACGTCTAA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC--G--GGT---G---CCGA-----AC----A---C------G-G-GG-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCT-CC-CGAAC-A-CGAG-G----C--GAG-AGG-T---C-TA---CCA--ACTGAG---C---C-ACC-GCGACC--------G----G-T
gi|5005 : TTTCACGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CCGGG--TG----C---C--G-----AG----CA--C------G-G-GG-CT-CGAA-CGCGC-GA-CTT-CC-CAATC-A-CAAA-G----C--GAG-AGC-T---C-T----ACC--ACTGAG---T---C-ATC-ACGACC--------G----G-TC
gi|5013 : TTTCACGTCTAA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC--GAGTG----C---C--G-----A------G--CAT----G-G-GG-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCT-CC-CGATC-A-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-T----ACC--ACTAAG---C---C-ACC-GAAACCTACTGATGG----G-TCA------A----A----AA---TAA-GA--
gi|5007 : TTTAACGTCGTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC--GGGTG----C---C--G-----A------G--CAT----G-G-GG-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCT-CC-CGATC-A-TGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-TA---CCA--ACTGAG---C---C-ACC-GCAACC--------G----G-TC
gi|5010 : TTTCACGTCTTA------GG-TTAG---AC--GC--AGCTG--AG-TG----C---C--G-----AG----CA--C------G-G-GG-CT-CGAA-CACAC-GA-CCT-CC-CGGTC-A-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-T----ACC--ACTGAA---C---C-ACT-GCAACC--------G----G-T
gi|5011 : TTTCAAGTCTTA------TG-TTTG---AC--GC--GG-CC--GGGTG----C---C--G-----AG----CA--C------G-G-GG-CT-CGAA-CGCAC-AA-CCT-CC-CGATC-G-CAAG-G----C--GAG-AGC-T---C-T----ACC--ACTGAG---C---C-ACC-GCGCCC--------G----G-T
gi|5012 : TTTAACGTCTTA------GG-TTTG---AT--GC--GG-CC--AGGTG----C---C--G-----AG----CA--C------G-G-GG-CT-CGAA--CCAC-AA-CCT-CC-TGATCAG-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-T----ACC--ACTGAG---C---C-ACC-GTGACT--------G----G-TCA------
gi|5016 : TTTAACGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--AG-CC--G--TT----C---C--A-----AG----AA--C------G-G-GG-TT-CGAA-CTGAC-GA-CCT-CC-TGATC-A-CGAG-A----C--AAG-AGC-T---A-T----ACC--ACTGAG---C---C-ACC-GCGACC--------G----G-TC
gi|5002 : TTTCATGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC--G--GGT---G---C--G-----------AG--C------ACG-GA-CG-CAAA-CGTAC-GA-CCT-CC-CGATC-A-CGAG-G----C--AAA-AGC-T---C-T----ACC--ACTGAG---C---C-ACC-GCGACC--------G----G-T
gi|5014 : TTTTACGTCTTA------G---TTG---AC--GC--GG-CT--G--TGCGA-G---C--A---------------C------G-G-GG-CTTCGAA-CGCAC-GA-CCT-CC-CGATC-A-CGAG-G----C--GAA--GC-T---C-T----ACC--ACTGAG---C---C-ACC-GCGACC--------G----G-T
gi|5021 : TTTCACGTCTTA------AG-TTTG---AC--AT--GA-CCGGG--TG----C---C--G-----AG----CA--C------G-G-GG-CT-CGAA-CGCAC-GC-CCT-CC-CAATC-A-CGAG-G----C--GAT-AGC-T---C-T----ACC--ACTGAG---C---C-ACC-GCGACC--------G----G-TCC------AGGCGA----TA---GAA-AA--A--G---TA---A-A-AAAG-A--AT-
gi|5022 : TTTCACGTCTTA------GG-TTTG---AC--AC--AG-CCGGA--TG----C---C--G-----AG----CA--C------G-G-GG-CT-CGAA-CGCAT-GA-CCT-CC-CGCTC-A-CGAG-G----CCAGAG-CTC-T---CTCT---ACC--ACTGAG---C---C-ACC-GTGACC--------G----G-T
gi|5025 : TTTCACGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CCGGG--TG----C---C--G-----AG----CA--C------G-G-GG-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCT-CC-CGATC-A-CGAG-G----C--GA-------------G---ACC--ACTGA--------------GCCACA--------G----G-TTA------A----
gi|5018 : TTTAACGTCTTA------GT-TTTG---TC--GC--AG-CC--G--GGT---G---CCGA-----AC----A---C------G-G-G--CC-CGAA-CGCAC-GA-CCT-CC-CGATC-A-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-T----ACC--ACTGAG---C---C-ACC-GCGATC--------G----G-TGACTGTCTA----T----AA---AAT-AT--A--A---T-GGTA-A-CAGT-A--GT-TT
gi|5020 : TTTCACGTCTTA------GG-TTGG---AC--GC--GG-CC-------------------------------G--T------G-G-GA-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCT-CC-AGACC-A-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-T----ACC--ACTGAG---C---C-AAC-GCGACC--------G----G-T
gi|5019 : TTTCACGTCTT-------GG-TTTGACCGC--GC--GG-----G--TT----G---CCGA-----AC----A---C------G-G-G--CT-CGAA-CGCAC-GAACCT-CC-CGATC-A-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-TA---AC---ACTGAG---C---C-ACT-GCAACC--------G----G-TGA------A----
gi|5113 : TTTACGTCTGA------TG-TTTG---AC--CA--AG-CT--A--TG----A---C--A-----TT----GG--C------A-G-GA-CT-CCAA-CTCAC-GA-CCT-CT-AGGTT-A-CAAA-G----C--GAA-CGC-TCTAC-CA---CCTGCACTAAG---C---T-ATC-GCTACC--------G----G-TCA------A----G----AA---AGA-AA--G--G---TAAGAGCA-CATG-A--TT-TT
gi|5114 : TTTACGTCTGA------GG-TTTG---AC--GT--GG-TC--A--TG----G---C--T-----CG----AG--C------G-G-GA-CT-CAAA-CTTAC-AA-CCT-TC-CAGTA-A-CAAA-G----C--GAA-CGC-T---C-TA---AC---ACTGAG---C---T-ACT-GCGGCA--------G----G-TCT------A----A----
gi|5119 : TTTACGACTTA------GA-TTTG---AC--GC------------TG----G---T--A-----CG----AG--C------G-G-AG-CT-CGCA-CTCAC-GA-CCT-CC-CAGTT-A-TGAG-G----C--GAA-CGC-T---C-T----ACC--ACTGAG---C---C-ACC-GCGACC--------G----G-TTA------A----
gi|5116 : TTTACGTCGTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC--T--TG----A---C--A-----CT----TA--C------G-G-GG-CC-TTAA-CTCAC-AA-CCT-CC-TGGTT-G-CGAAGG----C--GAAGTGC-T---C-TA---ACA--ACTGAA---GC--T-ACC-GCGTCC--------GAATTG-ACA------T----A----AACC-AAA-AACTA--A---TA
gi|5118 : TTCCCGTCTTA------GA-TTTG---GC--GC--GG-CC--A--TA----G---C--A-----GG----AG--TTT----G-G-CA-TA-C--A-CTCAC-AA-AC---C-CGATT-G-GAAA-G----C--GAA-TGC-T---C-TA---ACT--ACTGAG---C---A-ACC-GCAACC--------G----G-TGA------A----A----TA---A
gi|5117 : TTTACGTCCTA------GA-TTTA---AC--TC--GG-GT--T--TG----G---T--A-----CG----AA--C------A-T-GG-CT-TGAA-CTCAC-AA-CCT-TC-CTGTT-G-CGAA-G----C--GAG-TGC-T---T-T----ACC--ACTGAG---C---TCATC-GCGACC--------G----G-TCA------A----T----AA---AAA-
gi|5146 : TCACGTCTTC------GG-TTTG---AC--GC--AG-CC--A--TG----C---T--A-----CG----AG--T------G-G-GT-CT-CGAA-TTCAC-GA-CCTACCGCGGTT-G-AGAA-G----C--GAA-CGC-G---C-TA---ACC--ACTTAG---C---T-ACC-GCGACC--------G----G-T
gi|5147 : TTACATCTCA------GG-CTTG---CC--GT--GG-CC--A--TG----T---A--A-----AG----AG--C------G-G-GA-TT-CGAA-CTCAC-AA-CCT-CC-CGGTT-G-CGAA-A----C--AAA-TGA-T---C-T----ACC--ACTGAA---C---T-ACC-ACGACC--------G----G-TC
gi|5145 : TTACGTCGTA------GG-TTTG---AC--GT--AC-CC--A--TG----G---C--A-----GG----AA--C------A-G-GA-CT-CGAG-CTCAC-GA-CTT-CC-CAGTT-A-CAAA-G----C--GAA-CGCAT---T------ACC--ACTGAG---A---T-ACC-GCAATC--------G----G-TC
gi|5149 : TTACGTCT-A------AG-TTTA---AC--GC--GG-TC--A--AT----G---T--A-----CG----AG--C------G-G-GG-CT-CGAA-CTTGC-AA-TCT-CC-CGGTT-A-CGTA-G----C--GAA-CGC-T---C-TA---ACG--ACTGAG---C---T-ATT-GCGAC
gi|5157 : CACGACTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC--A--TG----C---C--A-----CT----AG--C------A-G-GG-TT-CGAA-CTCAC-GA-CTC-TG-TGGTT-G-CAAA-A----C--GAA-TGC-T---C-TA---ACT--AC
gi|5160 : ACGTCTTAAATGTAGG-TTTG---AC--GC--GG-CC--A--TG----G---C--G-----CG----AA--C------G-G-GG-CT-TGAA-CTCAC-TA-CCT-CC-CGTTT-G-CGAA-T----C--GAA-CGT-T---T-TA---ATC--ACTGAG---C---T-ATC-GCGACC--------G----G-T
gi|5161 : ACATCTTA------GG-TTTG---AC--AC--GG-CA--A--TA----G---C--A-----CG----GG--C------A-G-GA-CT-CGAA-CTCAG-TA-CCT-CC-CGGTG-G-CGAA-G----G--GAA-TGC-T---C-T----ACC--ACTGAG---C---T-ACC-ATGACC--------
gi|5162 : ACGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC-----CG----G---T--A-----CCG---AG--CAC----G-G-GG-CT-CGTA-CTCAC-GA-CCT-CC-CGATC-A-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-T----ACC--ACTGAA---C---C-ACC-GCGACC--------G----GTTC----------------------AAC-AC--A--A---TAGGAA-AGCAAA-ATTAT-TTC-ACAATC
gi|5164 : ACGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-TC--A--AG----G---C--------AT----AG--TTCTCTGG-G-GATCT-CACA---CAC-GA-CC--CC-CGGTT-A-CAAA-G----C--GAA-CGC-T---C-T----ACC--ACAGAG---T---T-ATC-GCAAAC--------G----G-TTG------G----A----AT---AAT-AA--ATTA---TAAGAA-A-TAAGCA--AT-
gi|5163 : ACGTCTCA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC--G--CT----C---C--A-----AG----CA--C------G-G-GG-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCT-CC-CGATC-A-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-T----ACC--ACTGAG---C---C-ACC-GTGACC--------G----G-TC
gi|5176 : CGTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GT-TC--A--TG----G---C--A-----TG----AA--C------T-G-GG-TT-CGAA-CTCAC-GA-CCT-CA-TGGTT-A-CAAA-A----C--AAA---C-T---C-CA---
gi|5181 : GTCTTA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CC--A--GGT---G---C--A-----G-----AGCAC------G-G-GG-CT-CGAA-CGCAC-GA-CCT-TC-CGATC-A-CGAG-G----C--GAG-AGC-T---C-TA---AC---ACTGAG---C---C-ACC-GCGACC--------G----G-TCA------
gi|5187 : TCTAA------GG-TTTG---AC--GC--GG-CCCAA--TG----G---C--A-----CG----AG--C------A-GTGG-CT-CGAACTTCAC-GA-CCT-CC--GGTT-G-CGAA------C--GAA-CGC-T---C-CA---ACC--ACTGAG---C---T-ACC-GCGACC--------G----A-TAA------A----
gi|5192 : CCTA------TG-TTTG---AC--GC--CG-CC--A--TG----G---C--A-----CA----GG--C------A-G-GG-CT-CAAA-CTCAC-AA-CGT-TC-CGGTT-G-CAAA-G----C--GAA-TGC-T---C-T----ACC--ACTGAG---C---T-ACC-GCGACC--------G----A-TC
gi|5203 : A------GG-TTTG---AC--GC--AG-CC--A--TG----G---C--A-----CG----AG--C------A-A-GG-CT-CGAA-TTCAC-GA-CCT-CC-CGGTT-G-CAAA-G----C--GAA-CGC-T---C-TA---ACC--ACTGAG---C---T-ACC-ACGACC--------A----G-TCA------G----G----AA---
gi|5209 : G-TTTG---AC--AC--GG-TC--A--TG----G---C--A-----CA----AG--T------G-G-GA-CT-CAAA-TTCAC-AA-CCT-TT-CTGTT-G-CGAA-A----C--GAA-CAC-----C-CT---ACC--ACTGAT---C---T-ACC-GCGACC--------G----G-
gi|5212 : -TTCG---GC--GC--AG-TC--A--TG----T---C--A-----CG----AG--C------G-G-GG-CT-TGAA-CTCAC-GA-TCT-CC-CGGTA-G-CGAA-G----C--GAA-TGC-T---C-TA---GCC--ACTGAG---C---T-ACC-GCAACC--------G----G-TAA------A----T----GA---AAA-TG--A--A---TA
gi|5213 : -TTTG---AC--GT--GG-CC--A--TG----T---C--A-----AG----AG--C------G-G-GG-CT-CAAA-CTCAC-GA-CCT-CC-TTGTT-C-CGAG-G----C--AAA-CGC-T---C-TA---ACC--ACTGAG---C---T-ACC-GCGACC--------A----G-TGA------A----A----
Alignments
lowQualScore : 11111111111111111 1111 1 1 1 1 2 1 1 1 2 2 1 1 2 1 1 2 1 111 1 1 2
lowQualScore : 111111 0 000 111111 0 33333333333333333 222 11111 22 22 0 0 22 00 0 0 0 11 0 111 22 9999 000 111111 0 0 0 11111111 1111 1 222222 2222 4444 444 1 22 22 333 333 2 33 44 3 1 3 3 0 2 0 3 3 55 2 0 0 0 2 3 5 0 0 3 0 55 0 5 0 0 3 0 0 3 0 5 3 333 0 3 3 0 0 3
lowQualScore : ...... . ... ...... . ................. ... ..... .. .. . . .. .. . . . .. . ... .. .... ... ...... . . . ........ .... . ...... .... .... ... . .. .. ... ... . .. .. . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . .. . . . . . . . . . . . ... . . . . . .
lowQualScore : 222222 4 777 222222 4 44444444444444444 444 00000 88 77 4 4 22 55 4 4 4 22 4 111 22 4444 777 222222 4 4 4 66666666 8888 9 555555 0000 2222 555 6 55 66 333 999 9 99 22 1 7 2 2 0 5 0 2 2 00 5 0 0 0 5 2 5 0 0 2 0 88 0 0 0 0 2 0 0 2 0 0 2 888 0 2 2 0 0 2
consensus : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--TG----GC-GN-GA--G-----C--G--G-GGCT-CGAACN-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-GCG-AGGCG---AGA-GCTCTA---AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--AT-TTCGACGATCATTGATCCTTCACTGACTGATAAATGCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAG-CCTGTCGGAAATGGAAA-CATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACATAAACGAGAAAGGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGNNCCATATGCTCAGT-TTAATG-GAGATCTTGGGCTATATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTATCCACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAATCCAGCTTAATACAATTCCATGCCAA-CAT-ATCGTCATCTTGGAACAAAGAATTAGGAAAATGCAAGTATTCCGACATTAATATTAGAATATTAAAAATTCTCGGCGC-TTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATCTTATCTGTCATTGAGTTGTTTTCAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCC-TTTTTATCAATGATTTTATCTTCA-GACTGTTGACGCTGGAATCGCATTCCCTGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGAGGACGCCTATGTATAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAGTTCCGGATGGAAAGTG-AAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTGTTTACATGTTGATGAATTTATCACACACGACTGTTAGTACA-AGTTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACTGGAGGCATAGGGTCACATTTTGGGAGCAAAGTTT
Reference ( family-131 ) : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--TG----GC-GN-GA--G-----C--G--G-GGCT-CGAACN-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-GCG-AGGCG---AGA-GCTCTA---AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--AT-TTCGACGATCATTGATCCTTCACTGACTGATAAATGCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAG-CCTGTCGGAAATGGAAA-CATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACATAAACGAGAAAGGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGGCCCATATGCTCAGT-TTAATG-GAGATTTTGGGCTA-ATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTATCCACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAATCCAGCTTAATACAATTCCATGCCAA-CAT-ATCGTCATCTTGGAACAAAGAATTAGGAAAATGCAAGTATT-CGACATTAATATTAGAATA-TAAAAATTCTCGGCGC-TTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATC-TATCTGTCATTGAGTTGTTTTCAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCC-TTTTTATCAATGATTTTATCTTCA-GACTGTTGACGCTGGAATCGCATT-CCTGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGAGGACGCCTATGTATAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAGTTCCGGATGGAAAGTG-AAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTGTTTACATGTTGATGAATTTATCACACACGACTGTTAGTACA-AGTTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACT-GAGGCATAGGGTCACATTTTGGGAGCAAAGTTT
gi|4947 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GGC---GC------GGT-C--A--TG----GC-AA-TA--G-----C--G--G-GACT-CGAATT-CAC--TA-CCT-CC-CGGTT-GCG-AAGCG---AAC-GCTCCA---AC---TAC------TG-AGG-TACC-GCCACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--AT-TTCGACGATCATTGATCCTTCACTGACTGATAAATGCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAG-CCTGTCGGAAATGGAAA-CATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACATAAACGAGAAAGGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGCGCCATATGCTCAGT-TTAATG-GAGATCTTGGGCTATATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTATCCACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAATCCAGC-TAATACAATTCCATGCCAA-CAT-ATCGTCATCTTGGAACAAAGAATTAGGAAAATGCAAGTATTCCGACATTAATATTAGAATATTAAAAATTCTC-GCGC-TTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATCTTATCTGTCATTGAGTTGTTTTCAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCCTTTTTTATCAATGATTTTATCTTCAGGACTGTTGACGCTGGAATCGCATTCCCTGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGA-GACGCCTATGTATAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAGTTCCGAATGGAAAGTG-AAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTGTTTACATGTTGATGAATTTATCACACACGACTGTTAGTACA-AGTTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACTGGAGGCATAGGGTCACATTTTGGGAGCAAAGTTT
gi|4948 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GGC---GC------GGT-C--A--TG----GCAAT-TA--G-----C--G--G-GACT-CGAATT-CAC--TA-CCT--C-CGGTT-GCG-AAGCG---AAC-GCTCCA---AC---TAC------TG-AGG-TACC-GCCACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--AT-TTCGACGATCATTGATCCTTCACTGACTGATAAATGCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAG-CCTGTC-GAAATGGAAA-CATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACATAAACGAG-AAGGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGCGCCATATGCTCA---TTAATG-GAGATCTTGGGCTATATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTATCCACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAA-CCAGC-TAATACAATTCCATGCCAA-CAT-ATCGTCATCTTGGAACAAAGAATTAGGAAAATGCAAGTATTCCGACATTAATATT-GAATATTAAAAATTCTC-GCGCTTTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATCTTATCTGTCATTGAGTTGTTTTCAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCC-TTTTTATCAATGATTTTATCTTCA-GACTGTTGACGCTGGAATCGCATTCCCTGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGA-GACGCCTATG--TAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAGTT-CGAATGGAAAGTG-AAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTGTTTACATGTTGATGAA-TTATCACACACGACTGTTAGTACA-AGTTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACTGGAGGCATAGGGTCACATTTTGGGAGCAAAGTTT
gi|4949 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GGC---GC------GGT-C--A--TG----GC-AA-TA--G-----C--G--G-GACT-CGAATT-CAC--TA-CCT-CC-CGGTT-GCG-AAGCG---AAC-GCTCCA---AC---TAC------TG-AGG-TACC-GCCACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--ATATTCGACGATCATTGATCCT-CACTGACTGATAAATGCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAG-CCTGTCGGAAATGGAAA-CATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACA-AAACGAGAAAGGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGGCCCATATGCTCAGTATTAATG-AGGATTTTGGGCTA-ATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTATC-ACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAATCCAGCTTAATACAATTCCATGCCAA-CATAATCGTCATCTTGGAAC-AAGAATTAGGAAAATGCAAGTATT-CGACATTAATATTAGAATA-TAAAAATTCTCGGCGC-TTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATC-TATCTGTCATTGAGTTGTTTTCAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCC-TTTTTATCAATGATTTTATCTTCA-GACTGTTGACGCTGG-ATCGCATT-CCTGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGAGGACGCCTATGTATAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAGTTCC-GATGGAAAGTG-AAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTGTTTACATGTTGATGAATTTATCACACACGACTGTTAGTACA-GATTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACT-GAGGCATAGGGTCACATATTGGGAGCAAAGTTT
gi|4950 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GGC---GC------GGT-C--A--TG----GC-AA-TA--G-----C--G--G-A-CT-CGAATT-CAC--TA-CCT-CC-CGGTT-GCG-AAGCG---AAC-GCTCCA---AC---TAC------TG-AGG-TACC-GCCACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--AT-TTCGACGAT-ATTGATCCTTCACTGACTGATAAA-GCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAGGCCTGTCGGAAATGGAAAACATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACATAAACGAGAAAGGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGGCCCATATGCTCAGT-TTAATGAGAGATTTTGGGCTA-ATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTATCCACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAATCCAGCTTAATACAATTCCATGCCAAACAT-ATCGTCATCTTGGAACAAAGAATTAGGAAAATGCAAGTATT-CGACATTAATATTA-AATA-TAAAAATTCTCGGCGC-TTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATC-TATCTGTCATTGAGTTGTTT-CAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCC-TTTTTATCAATGATTTTATCTTCA-GACTGTTGACGCTGGAATCGCATT-CCTGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGAGGACGCCTATGTATAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAAGTC--GATGGAAAGTGAAAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTG-TTACATGTTGATGAATTTATCACACACGACTGTTAGTACAGAGTTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACT-GAGGCATAGGGTCACA-TTTGGGAGCAAAGTTT
gi|4951 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--A--TA----GC-AT-AA--G-----C--G--G-GGCT-CGAACT-CAG--GA-CTC-CC-CGGTT-GCG-AAGCG---AAC-TCTCTA---AC---CGC------TG-AGC-TACC-GCTACC--------G----G-T
gi|4952 : TTTCACGTCTTG------GGTTT-GAC---GC------GAC-C--A--TG----GC-AC-GA--G-----C--T--G-GGCT-CGAACT-CAC--GA-CCT-CC-CGGTT-GCG-AAGCG---AAA-GCTCTA---AC---CACTGAGCATG-AGC-TACC-ATGACC--------G----G-T
gi|4953 : TTTTACGCCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--A--TG----CC-AC-GA--G-----C--A--G-GTCT-CGAACT-CAC--GA-CCT-CC-CGTTG-ACG-AAGCG---AAC-ACTCCA---GC---CAC------TG-AGA-TACC-GCGACC--------G----G-TC
gi|4954 : TTTAACGTTTTA------GGTTT-GGT---GC------GGC-C--A--TG----AC-AC-GA--G-----C--G--G-G-TT-CGAACT-CAC--GA-CCT-TC-CGGTT-GCG-AAGAG---AAC-GCTCTA---AC---CAC------TG-AGC-TACT-GCGACC--------G----G-T
gi|4955 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GAGTG----CC-GA-GC--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TTA------A----A----AA---AAA-A
gi|4956 : TTTCATGTCGTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-T--A--TG----CT-AC-GA--G-----C--G--G-GGCT-CGAGCT-CAC--GA-TCT-TC-CGAAT-GCG-TAGCG---AAC-GCTCTA---AC---CAC------TG-AGA-TACC-GCGACC--------G----G-TTA------A----A----
gi|4957 : TTTCATGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------AGC-C--A--TG----CT-AC-GA--G-----C--G--G-GGCT-CAAACT-CAC--AA-CCT-CC-CGGTT-GCG-AAGCG---AAA-GCTCTA---TC---TAC------TG-AGC-TATC-GC
gi|4958 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAT---AC------GGC-C--G--TG----TC-AT-GA--T-----A--A--G-GGCT-CGAACT-CAC--GA-CAT-CC-CGGCC-GCG-AAGCACACAAACGCTCTA---AC---CAC------TG-AGC-TACC-GCGACC--------A----G-T
gi|4959 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-TC--A-----C--G--G-AGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CGC------TG-AGC-CACC-GC-ACC--------G----G-TCG------A----A----AA---CAA-
gi|4960 : TTTAACGTCTTG------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--TT----CC-GA-GC--A-----C--G--G-GGCT-CGAACT-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGT-CACC-GCGACT--------G----G-TCG------A----ATTTCAA---AAA-AA--G--A---
gi|4961 : TTTCACGTCT-A------AGTTT-GAT---GT------GGT-C--A--TG----AC-AT-GA--G-----C--G--G-GGTT-CGAATT-CAC--GA-CCT-CC-CAATT-GCG-AAACG---AAC-GCTCTA---TC---CAC------TG-AGC-TACT-G
gi|4962 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G---G----GT-GCAGA--G-----CACG--G-GACT-CGAACG-CAC--GG-CCT-CC-CTATC-ACG-AGGCG---AAA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CATC-GCGGCA--------G----G-TAA------A----A----AAGGTAAA-AA--A--AGGGTAGTTG-A-C
gi|4963 : TTTCACGTCTAA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-AC--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGAAC-ACG-AGGCG---AGA-GGTCTA---CC---AAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4964 : TTTCATGTCTTG------GGTTC-AAT---GC------AGC-C--A--TG----CC-AC-GA--G-----C--T--G-GGCT-CAAACT-CAT--GA-CCT-CC-CGGTT-GCG-AAGCG---AAT-GATCTA---AC---CAC------TG-AGC-TATT-GCGACC--------A----G-CC
gi|4965 : TTTCACGTTTTA------GATTT-ACC---GC------GGC-C--A--TG----AC-AG-GA--G-----------G-GACT-TGAACT-CCC--GA-CCT-CC-CGTTT-ACG-AAGTG---AAC-GCTCTA---AC---CAC------TG-AGC-TA
gi|4966 : TTTC-TGTCTTA------GGGTT-GAA---GC------GGC-C--A--CG----GC-AA-GA--G-----C--G--T-GGCT-CGAACT-CAC--CA------C-CGGTT-ACG-AAGCG---AAC-GTTCTA---AC---CAC------TG-AGC-TACA-GCGACC--------G----G-
gi|4967 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---TC------GGC-T--A--TG----GC-AC-GT--G-----A--T--G-GGCT-TTAACT-CAC--GA-CCT-CC-TGATT-GCG-AGGCA---AAC-GTTATA---AC---CAC------TA-AGC-TACCGGAGAAC--------A----G-CCA------A----A----AA---CAATAA--A--A-------------AAG-A--AT-T
gi|4968 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GAGTG----CC-GA-GC--A-----C--A--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACA-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4969 : TTTCACGTCTTA------GGTTG-GAC---GC------GGC-G--A--TA----AC-AC-AA--G-----C--G--G-GGTT-TGAACT-CAG--GA-CCT-TC-CGGTT-GCA-AAACG---AAC-GCTCT----AC---CAC------TG-AGT-TACC-GCGCCC--------G----A-T
gi|4970 : TTGCACGTCTTG------GGTTT-GAC---GC------GAC-C--A--TA----CC-AC-CA--G-----C--A--A-A-CT-CGAACT-CAC--GA-TCT-CC-CGGTT-ATG-GAGCG---AAT-GCTTCA---AC---CAC------TG-AG
gi|4972 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G------------A-GC--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TCA------
gi|4973 : TTTCACTTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GAGTG----TC-GA-GC--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TT-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TGA------A----A----A
gi|4974 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G------------A-AC--A-----C--G--G-GGCT-TGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4975 : TTTAACGTCTTA------GGTTC-GCC---GC------GGC-C--G---G----GT-GC-CA--G-----CACG--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGC-GCTCT----AC---CAT------TG-AGT-CACC-GCAACC--------G--------A------A----C----AC---AGA-AG--G--A---TAGATG-
gi|4976 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--TGT---GCCGA-GC--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-GGGCG---AGA-GCTATA---CC---AAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----GTTCA------G----ATGT-AA---ATG-AA--A--A---
gi|4977 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-GC--A-----C--G--G-GGCT-TGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-GGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4978 : TTTAACATCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G------------A-GC--A-----C--G--G-GGCT-CGAACT-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----T-TCA------C----A----A
gi|4979 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---AC------GGC-C--GAGTG----CC-GA-GC--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATT-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACT-GCGACC--------G----A-T
gi|4980 : TTTTACGTCTTA------GGTTT-GAT---GC------GGC-C--G---G----GT-GC-GA--G-----C--ACAG-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-ACTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TC
gi|4981 : TTTTACGTCTTA------GGTTT-GAC---GCAATCATGGCAC--G---G----GC-AC-GA--G-----C--T--G-GGCT-CGAACT-CAC--GA-CCT-AC-CGGTT-ACT-------------GCTCT----AC---TAC------TG-AGC-TACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4982 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-GC--A-----C--A--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCTA---CC---AAC------TG-AGC-CACC-GCGACT---------------TCA------A----
gi|4983 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GAGTG----CC-GA-GC--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GATCT----AC---AAC------TG-AGT-CACC-GCGACC--------G----GATTA------A----A----
gi|4984 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G------------A-GC--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----
gi|4985 : TTCCACGTCTTG------GGTT--GTC---GC------GAC-T--A--TG----TC-AC-AA--G-----A--G--G-GGCT-CGAATT-TAC--GA-CCT-CC-CTGTT-GCC-AAGCG---AAT-GTTCAA---AC---AAT------TG-AGG-TACC-TCGACA--------G----G-TTA------G----A----
gi|4986 : TTTAACATCTTT------GGTTT-AAC---GC------GGC-C--A--TG----GC-TT-AA--G-----C--G--G-TGCT-TGAACT-CGCATAA-CCT-CC-TCGTT-GCG-ATGCG---AAC-GCTCTA---AC---TGC------TG-AAC-TACC-GAGACC--------A----G-T
gi|4988 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--GT----CC-AA-GC--A-----C--G--G-GGCT-CGAACT-TAC--GA-CCT-CC-CGCTC-ATG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TA-AGC-CACC-GTGACC--------G----G-TCA------G----A----
gi|4989 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-CTGG--TG----CC-GA-GC--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AT---CAC------TG-AAC-CACC-GCGACC--------G----G-TC
gi|4990 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GGC---GC------GTT-C--GACTG----CC-GA-GC--A-----C--G--G-CGGT-CGAACG-CGC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACG--------G----A-TCT------T----A----GA---AAT-AT--A--A----AGG-----CAA--A--AT----AACAAACATTGATC
gi|4991 : TTTCACGCCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGT-T--G---G----GT-GC-GA--G-----C--AC-G-GGCT-CGAAC---AC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACT-GCGAAC--------G----G-TCT------A----A----A
gi|4992 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--TGT---GCCGA-GC--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-TC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCTA---CC---AAC------TG-AGC-CACC-GC
gi|4994 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-CA-G--T-----CC-AA-GT--G-----T--G--G-GGCT-CGAACT-CAC--AA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGACA---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-TGA-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4995 : TTTCACGTTTTA------GGTTT-GAC---TC------G-C-C--G---G----GT-GCTGA--G-----C--ACAG-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GGTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TT-------G----A----AA---ATG-GC--A--A---CAAGTG-A-CGA--A--AT-TT
gi|4996 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAT---GC------GGC-C--G---G----GT-GCTGA--G-----CATG--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-TGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4997 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-G--GAGTG----CC-GA-GC--A-----T--G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CCATC-ACG-AGGCG---AGA-GCT-------C---CAC------TA-AGC-CACC-GCGACC--------G----GTTCA------A----A----TA---ATA-AA--T--A---TA
gi|4998 : TTTAACGTCTTA------GGTTG-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-GC--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------GTGA-G-TGA------T----A----AA---AA
gi|4999 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGT-C--G--AGT---GC-GA-GC--A-----C--G--G-GACT-CGAACT-CAA--AA-CCT-TC-CGATC-ACG-AAGCG---AGA-GCTCCGGCTAC---CAC------TG-AG
gi|5000 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-GC--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CT-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACT-GCGACC--------G----G-T
gi|5001 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAC---GA------TTC-CAGG--TG----CC-GA-GC--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-ACTCTA---CC---AAC------TG-AGG-CACC-GCG-TC--------T----T-TTA------A----T----TA---AAA-GA--G--A----AGGCG-A-CGAG-G--AT----AACGAACAGTGATC
gi|5002 : TTTCATGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G---G----GT-GC-GA--G-----C--AC-G-GACG-CAAACG-TAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCA---AAA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|5003 : TTTCACGTCTTA------GGATT-GAC---GC------GCC-C--G--TGT---GCCGA-GC--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-TC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCTA---CC---AAC------TG-AGT-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|5004 : TTTCACGTCTTA------GGTTTTGAC---GA------GGC-C--G---G----GT-GCCGA--G-----CATG--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-AGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-ACGACC--------G----G----------A----A----GA---GAA-GA--A--A---TAG
gi|5005 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-GC--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CGC--GA-CTT-CC-CAATC-ACA-AAGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGT-CATC-ACGACC--------G----G-TC
gi|5006 : TTTTACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--TT----CC-GA-GC--A-----C--G--G-GGCT-CGAACT-CAC--GA-C---TC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-TACC-GCGACC--------
gi|5007 : TTTAACGTCGTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G---G----GT-GCCGA--G-----CATG--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ATG-AGGCG---AGA-GCTCTA---CC---AAC------TG-AGC-CACC-GCAACC--------G----G-TC
gi|5008 : TTTTATGCCTTG------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--T--TT----GC-TC-GA--G-----C--G--G-GGCT-CAAAAT-CGC--AA-CCT-CT-TGGTT-ACG-AAGCG---AAC-GCTCT----AC---CAA------TG-AGC-TACC-GTAACC--------A----G-TGA------A----
gi|5009 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--CGT---GCAGA-GC--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCG-TT-CGATC-ACG-AGGCA---AGA-GCTCT----GC---CAC------TG-AGG-CACC-GCGACC--------G----A-T
gi|5010 : TTTCACGTCTTA------GGTTA-GAC---GC------AGC-T--GAGTG----CC-GA-GC--A-----C--G--G-GGCT-CGAACA-CAC--GA-CCT-CC-CGGTC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AAC-CACT-GCAACC--------G----G-T
gi|5011 : TTTCAAGTCTTA------TGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-GC--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CAC--AA-CCT-CC-CGATC-GCA-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGCCC--------G----G-T
gi|5012 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAT---GC------GGC-CAGG--TG----CC-GA-GC--A-----C--G--G-GGCT-CGAAC--CAC--AA-CCT-CC-TGATCAGCG-AGGCG---AGA-GCTCTA----C---CAC------TG-AGC-CACC-GTGACT--------G----G-TCA------
gi|5013 : TTTCACGTCTAA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GAGTG----CC-GA-GC--A-----T--G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TA-AGC-CACC-GAAACCTACTGATGG----G-TCA------A----A----AA---TAA-GA--
gi|5014 : TTTTACGTCTTA------G--TT-GAC---GC------GGC-T--G--TG-----C-GA-GC--A-----C--G--G-GGCTTCGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---A-A-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|5015 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC-------GC-C--G---G----GT-GC-CAACA-----C--G--G-GCCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-C-ATC-AC--AAGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TC
gi|5016 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------AGC-C--G--TT----CC-AA-GA--A-----C--G--G-GGTT-CGAACT-GAC--GA-CCT-CC-TGATC-ACG-AGACA---AGA-GCTAT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TC
gi|5017 : TTTCATGTCTTA------GGTTT-TAC---AC------AGC-C--A--TGTATGGC-AC-AA--G-----C--G--G-GGCT-TTAACT-CAT--GG-CCT-AC-CGGTT-GGG-GAGCG---AAC-GCTCTA---GC---CAC------AG-AGC-TAC---CAACT--------G----G-TCA------
gi|5018 : TTTAACGTCTTA------GTTTT-GTC---GC------AGC-C--G---G----GT-GCCGA--A-----C--AC-G-GGCC-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGATC--------G----G-TGACTGTCTA----T----AA---AAT-AT--A--A---T-GGTA-A-CAGT-A--GT-TT
gi|5019 : TTTCACGTCTT-------GGTTT-GACCGCGC------GG-----G--TT----GC--C-GA--A-----C--AC-G-GGCT-CGAACG-CAC--GAACCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCTA---A----CAC------TG-AGC-CACT-GCAACC--------G----G-TGA------A----
gi|5020 : TTTCACGTCTTA------GGTTG-GAC---GC------GGC-C--G--TG----G-----------------------GACT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-AGACC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CAAC-GCGACC--------G----G-T
gi|5021 : TTTCACGTCTTA------AGTTT-GAC---AT------GAC-C--GGGTG----CC-GA-GC--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GC-CCT-CC-CAATC-ACG-AGGCG---ATA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TCC------AGGCGA----TA---GAA-AA--A--G---TA---A-A-AAAG-A--AT-
gi|5022 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---AC------AGC-C--GGATG----CC-GA-GC--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CAT--GA-CCT-CC-CGCTC-ACG-AGGCC---AGA-GCTCTCTCTAC---CAC------TG-AGC-CACC-GTGACC--------G----G-T
gi|5023 : TTTCTCATCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--A--TA----GT-AC-GA--G-----C--G--G-GGTT-CGAACT-CAC--GA-CCT-AC-CGAT--ACG-AAGCG---AGA-GCTCT----AT---CAC------TG-AAC-CACC-GC
gi|5024 : TTTTACGTCTTA------AGTTT-GAT---GC------GGT-C--A--TG----GC-AC-GA--G-----C--G--A-GGTT-CAAACT-CGC--GA-CCT-CC-CGGTT-GCG-AGGC
gi|5025 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-GC--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AG-----------AC---CAC------TG-AGC-CAC
gi|5113 : TTTACGTCTGA------TGTTT-GAC---CA------AGC-T--A--TG----AC-AT-TG--G-----C--A--G-GACT-CCAACT-CAC--GA-CCT-CT-AGGTT-ACA-AAGCG---AAC-GCTCTACC-ACCTGCAC------TA-AGC-TATC-GCTACC--------G----G-TCA------A----G----AA---AGA-AA--G--G---TAAGAGCA-CATG-A--TT-TTaggttaa
gi|5114 : TTTACGTCTGA------GGTTT-GAC---GT------GGT-C--A--TG----GC-TC-GA--G-----C--G--G-GACT-CAAACT-TAC--AA-CCT-TC-CAGTA-ACA-AAGCG---AAC-GCTCTA---A----CAC------TG-AGC-TACT-GCGGCA--------G----G-TCT------A----A----
gi|5116 : TTTACGTCGTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--T--TG----AC-AC-TT--A-----C--G--G-GGCC-TTAACT-CAC--AA-CCT-CC-TGGTT-GCGAAGGCGA--AGT-GCTCTA---AC---AAC------TGAAGC-TACC-GCGTCC--------GAATTG-ACA------T----A----AACC-AAA-AACTA--A---TA
gi|5117 : TTTACGTCCTA------GATTT-AAC---TC------GGG-T--T--TG----GT-AC-GA--A-----C--A--T-GGCT-TGAACT-CAC--AA-CCT-TC-CTGTT-GCG-AAGCG---AGT-GCTTTA----C---CAC------TG-AGCTCATC-GCGACC--------G----G-TCA------A----T----AA---AAA-
gi|5118 : TTCCCGTCTTA------GATTT-GGC---GC------GGC-C--A--TA----GC-AG-GA--G-----T--T--T-GGCA-TACACT-CAC--AA-AC---C-CGATT-GGA-AAGCG---AAT-GCTCTA---AC---TAC------TG-AGC-AACC-GCAACC--------G----G-TGA------A----A----TA---A
gi|5119 : TTTACGACTTA------GATTT-GAC---GC----------------TG----GT-AC-GA--G-----C--G--G-AGCT-CGCACT-CAC--GA-CCT-CC-CAGTT-ATG-AGGCG---AAC-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TTA------A----
gi|5145 : TTACGTCGTA------GGTTT-GAC---GT------ACC-C--A--TG----GC-AG-GA--A-----C--A--G-GACT-CGAGCT-CAC--GA-CTT-CC-CAGTT-ACA-AAGCG---AAC-GCATT----AC---CAC------TG-AGA-TACC-GCAATC--------G----G-TC
gi|5146 : TCACGTCTTC------GGTTT-GAC---GC------AGC-C--A--TG----CT-AC-GA--G-----T--G--G-GTCT-CGAATT-CAC--GA-CCTACCGCGGTT-GAG-AAGCG---AAC-GCGCTA---AC---CAC------TT-AGC-TACC-GCGACC--------G----G-T
gi|5147 : TTACATCTCA------GGCTT-GCC---GT------GGC-C--A--TG----TA-AA-GA--G-----C--G--G-GATT-CGAACT-CAC--AA-CCT-CC-CGGTT-GCG-AAACA---AAT-GATCT----AC---CAC------TG-AAC-TACC-ACGACC--------G----G-TC
gi|5149 : TTACGTCT-A------AGTTT-AAC---GC------GGT-C--A--AT----GT-AC-GA--G-----C--G--G-GGCT-CGAACT-TGC--AA-TCT-CC-CGGTT-ACG-TAGCG---AAC-GCTCTA---AC---GAC------TG-AGC-TATT-GCGAC
gi|5157 : CACGACTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--A--TG----CC-AC-TA--G-----C--A--G-GGTT-CGAACT-CAC--GA-CTC-TG-TGGTT-GCA-AAACG---AAT-GCTCTA---AC---TAC------
gi|5160 : ACGTCTTAAATGTAGGTTT-GAC---GC------GGC-C--A--TG----GC-GC-GA--A-----C--G--G-GGCT-TGAACT-CAC--TA-CCT-CC-CGTTT-GCG-AATCG---AAC-GTTTTA---AT---CAC------TG-AGC-TATC-GCGACC--------G----G-T
gi|5161 : ACATCTTA------GGTTT-GAC---AC------GGC-A--A--TA----GC-AC-GG--G-----C--A--G-GACT-CGAACT-CAG--TA-CCT-CC-CGGTG-GCG-AAGGG---AAT-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-TACC-ATGACC--------
gi|5162 : ACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-CCGG--TA----CC-GA-GC--A-----C--G--G-GGCT-CGTACT-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AAC-CACC-GCGACC--------G----GTTC----------------------AAC-AC--A--A---TAGGAA-AGCAAA-ATTAT-TTC-ACAATC
gi|5163 : ACGTCTCA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--CT----CC-AA-GC--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GTGACC--------G----G-TC
gi|5164 : ACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGT-C--A--AG----GC-AT--A--GTTCTCT--G--G-GGAT-CTCACA-CAC--GA-CC--CC-CGGTT-ACA-AAGCG---AAC-GCTCT----AC---CAC------AG-AGT-TATC-GCAAAC--------G----G-TTG------G----A----AT---AAT-AA--ATTA---TAAGAA-A-TAAGCA--AT-
gi|5176 : CGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GTT-C--A--TG----GC-AT-GA--A-----C--T--G-GGTT-CGAACT-CAC--GA-CCT-C
gi|5181 : GTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-CAGG--TG----CA-GA-GC--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-TC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCTA---A----CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TCA------atggttacaaaacaaactcca
gi|5187 : TCTAA------GGTTT-GAC---GC------GGC-CCAA--TG----GC-AC-GA--G-----C--A--GTGGCT-CGAACTTCAC--GA-CCT-CC--GGTT-GCG-AA-CG---AAC-GCTCCA---AC---CAC------TG-AGC-TACC-GCGACC--------G----A-TAA------A----
gi|5192 : CCTA------TGTTT-GAC---GC------CGC-C--A--TG----GC-AC-AG--G-----C--A--G-GGCT-CAAACT-CAC--AA-CGT-TC-CGGTT-GCA-AAGCG---AAT-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-TACC-GCGACC--------G----A-TC
gi|5203 : A------GGTTT-GAC---GC------AGC-C--A--TG----GC-AC-GA--G-----C--A--A-GGCT-CGAATT-CAC--GA-CCT-CC-CGGTT-GCA-AAGCG---AAC-GCTCTA---AC---CAC------TG-AGC-TACC-ACGACC--------A----G-TCA------G----G----AA---
gi|5209 : GTTT-GAC---AC------GGT-C--A--TG----GC-AC-AA--G-----T--G--G-GACT-CAAATT-CAC--AA-CCT-TT-CTGTT-GCG-AAACG---AAC-ACCCT----AC---CAC------TG-ATC-TACC-GCGACC--------G----G-
gi|5212 : TTC-GGC---GC------AGT-C--A--TG----TC-AC-GA--G-----C--G--G-GGCT-TGAACT-CAC--GA-TCT-CC-CGGTA-GCG-AAGCG---AAT-GCTCTA---GC---CAC------TG-AGC-TACC-GCAACC--------G----G-TAA------A----T----GA---AAA-TG--A--A---TA
gi|5213 : TTT-GAC---GT------GGC-C--A--TG----TC-AA-GA--G-----C--G--G-GGCT-CAAACT-CAC--GA-CCT-CC-TTGTT-CCG-AGGCA---AAC-GCTCTA---AC---CAC------TG-AGC-TACC-GCGACC--------A----G-TGA------A----A----
Alignments
lowQualScore : 111111111111 1111 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111 1 1 1
lowQualScore : 111111 0 000 111111 0 333333333333 5555 2222 11111 22 22 0 0 22 00 0 0 0 11 0 111 22 9999 000 111111 0 0 0 11111111 1111 1 222222 2222 4444 444 1 22 22 333 333 2 33 44 3 1 3 3 0 2 0 3 3 22 2 0 0 5 2 3 66 0 0 3 5 55 5 5 0 5 3 0 0 3 5 5 3 333 0 3 3 0 5 3
lowQualScore : ...... . ... ...... . ............ .... .... ..... .. .. . . .. .. . . . .. . ... .. .... ... ...... . . . ........ .... . ...... .... .... ... . .. .. ... ... . .. .. . . . . . . . . . .. . . . . . . .. . . . . .. . . . . . . . . . . . ... . . . . . .
lowQualScore : 222222 4 777 222222 4 111111111111 0000 8888 00000 88 77 4 4 22 55 4 4 4 22 4 111 22 4444 777 222222 4 4 4 66666666 8888 9 555555 0000 2222 555 6 55 66 333 999 9 99 22 1 7 2 2 0 5 0 2 2 00 5 0 0 5 5 2 55 0 0 2 0 88 5 0 0 5 2 0 0 2 0 0 2 888 0 2 2 0 0 2
consensus : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--TG----GC-GN-G-A--G-----C--G--G-GGCT-CGAACN-CACG--A-CCT-CC-CGATC-GCG-AGGCG---AGA-GCTCTA---AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--AT-TTCGACGATCATTGATCCTTCACTGACTGATAAATGCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAG-CCTGTCGGAAATGGAAA-CATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACATAAACGAGAAAGGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGNNCCATATGCTCAGT-TTAATG-GAGATCTTGGGCTATATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTATCCACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAATCCAGCTTAATACAATTCCATGCC-AACAT-ATCGTCATCTTGGAACAAAGAATTAGGAAAATGCAAGTATTCCGACATTAATATTAGAATATTAAAAATTCTCGGCGC-TTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATCTTATCTGTCATTGAGTTGTTTTCAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCC-TTTTTATCAATGATTTTATCTTCA-GACTGTTGACGCTGGAATCGCATTCCCTGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGAGGACGCCTATGTATAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAGTTCCGGATGGAAAGTG-AAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTGTTTACATGTTGATGAATTTATCACACACGACTGTTAGTACA-AGTTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACTGGAGGCATAGGGTCACATTTTGGGAGCAAAGTTT
Reference ( family-131 ) : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--TG----GC-GN-G-A--G-----C--G--G-GGCT-CGAACN-CACG--A-CCT-CC-CGATC-GCG-AGGCG---AGA-GCTCTA---AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--AT-TTCGACGATCATTGATCCTTCACTGACTGATAAATGCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAG-CCTGTCGGAAATGGAAA-CATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACATAAACGAGAAAGGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGNNCCATATGCTCAGT-TTAATG-GAGATCTTGGGCTATATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTATCCACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAATCCAGCTTAATACAATTCCATGCC-AACAT-ATCGTCATCTTGGAACAAAGAATTAGGAAAATGCAAGTATTCCGACATTAATATTAGAATATTAAAAATTCTCGGCGC-TTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATCTTATCTGTCATTGAGTTGTTTTCAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCC-TTTTTATCAATGATTTTATCTTCA-GACTGTTGACGCTGGAATCGCATTCCCTGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGAGGACGCCTATGTATAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAGTTCCGGATGGAAAGTG-AAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTGTTTACATGTTGATGAATTTATCACACACGACTGTTAGTACA-AGTTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACTGGAGGCATAGGGTCACATTTTGGGAGCAAAGTTT
gi|4947 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GGC---GC------GGT-C--A--TG----GC-AA-T-A--G-----C--G--G-GACT-CGAATT-CACT--A-CCT-CC-CGGTT-GCG-AAGCG---AAC-GCTCCA---AC---TAC------TG-AGG-TACC-GCCACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--AT-TTCGACGATCATTGATCCTTCACTGACTGATAAATGCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAG-CCTGTCGGAAATGGAAA-CATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACATAAACGAGAAAGGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGCGCCATATGCTCAGT-TTAATG-GAGATCTTGGGCTATATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTATCCACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAATCCAGC-TAATACAATTCCATGCC-AACAT-ATCGTCATCTTGGAACAAAGAATTAGGAAAATGCAAGTATTCCGACATTAATATTAGAATATTAAAAATTCTC-GCGC-TTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATCTTATCTGTCATTGAGTTGTTTTCAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCCTTTTTTATCAATGATTTTATCTTCAGGACTGTTGACGCTGGAATCGCATTCCCTGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGA-GACGCCTATGTATAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAGTTCCGAATGGAAAGTG-AAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTGTTTACATGTTGATGAATTTATCACACACGACTGTTAGTACA-AGTTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACTGGAGGCATAGGGTCACATTTTGGGAGCAAAGTTT
gi|4948 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GGC---GC------GGT-C--A--TG----GC-AA-TTA--G-----C--G--G-GACT-CGAATT-CACT--A-CCT-CC--GGTT-GCG-AAGCG---AAC-GCTCCA---AC---TAC------TG-AGG-TACC-GCCACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--AT-TTCGACGATCATTGATCCTTCACTGACTGATAAATGCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAG-CCTGTCG-AAATGGAAA-CATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACATAAACGAGAA-GGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGCGCCATATGCTCA---TTAATG-GAGATCTTGGGCTATATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTATCCACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAA-CCAGCT-AATACAATTCCATGCC-AACAT-ATCGTCATCTTGGAACAAAGAATTAGGAAAATGCAAGTATTCCGACATTAATATT-GAATATTAAAAATTCTC-GCGCTTTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATCTTATCTGTCATTGAGTTGTTTTCAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCC-TTTTTATCAATGATTTTATCTTCA-GACTGTTGACGCTGGAATCGCATTCCCTGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGA-GACGCCTATG--TAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAGTT-CGAATGGAAAGTG-AAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTGTTTACATGTTGATGAA-TTATCACACACGACTGTTAGTACA-AGTTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACTGGAGGCATAGGGTCACATTTTGGGAGCAAAGTTT
gi|4949 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GGC---GC------GGT-C--A--TG----GC-AA-T-A--G-----C--G--G-GACT-CGAATT-CACT--A-CCT-CC-CGGTT-GCG-AAGCG---AAC-GCTCCA---AC---TAC------TG-AGG-TACC-GCCACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--ATATTCGACGATCATTGATCC-TCACTGACTGATAAATGCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAG-CCTGTCGGAAATGGAAA-CATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACA-AAACGAGAAAGGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGGCCCATATGCTCAGTATTAATG-AGGATTTTGGGCTA-ATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTAT-CACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAATCCAGCTTAATACAATTCCATGCC-AACATAATCGTCATCTTGGAAC-AAGAATTAGGAAAATGCAAGTATT-CGACATTAATATTAGAATA-TAAAAATTCTCGGCGC-TTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATC-TATCTGTCATTGAGTTGTTTTCAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCC-TTTTTATCAATGATTTTATCTTCA-GACTGTTGACGCTGG-ATCGCATT-CCTGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGAGGACGCCTATGTATAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAGTTCC-GATGGAAAGTG-AAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTGTTTACATGTTGATGAATTTATCACACACGACTGTTAGTACA-GATTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACT-GAGGCATAGGGTCACATATTGGGAGCAAAGTTT
gi|4950 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GGC---GC------GGT-C--A--TG----GC-AA-T-A--G-----C--G--G-A-CT-CGAATT-CACT--A-CCT-CC-CGGTT-GCG-AAGCG---AAC-GCTCCA---AC---TAC------TG-AGG-TACC-GCCACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--AT-TTCGACGAT-ATTGATCCTTCACTGACTGATAAA-GCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAGGCCTGTCGGAAATGGAAAACATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACATAAACGAGAAAGGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGGCCCATATGCTCAGT-TTAATGAGAGATTTTGGGCTA-ATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTATCCACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAATCCAGCTTAATACAATTCCATGCCAAACAT-ATCGTCATCTTGGAACAAAGAATTAGGAAAATGCAAGTATT-CGACATTAATATTA-AATA-TAAAAATTCTCGGCGC-TTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATC-TATCTGTCATTGAGTTG-TTTCAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCC-TTTTTATCAATGATTTTATCTTCA-GACTGTTGACGCTGGAATCGCATT-CCTGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGAGGACGCCTATGTATAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAAGTC--GATGGAAAGTGAAAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTG-TTACATGTTGATGAATTTATCACACACGACTGTTAGTACAGAGTTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACT-GAGGCATAGGGTCACA-TTTGGGAGCAAAGTTT
gi|4951 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--A--TA----GC-AT-A-A--G-----C--G--G-GGCT-CGAACT-CAGG--A-CTC-CC-CGGTT-GCG-AAGCG---AAC-TCTCTA---AC---CGC------TG-AGC-TACC-GCTACC--------G----G-T
gi|4952 : TTTCACGTCTTG------GGTTT-GAC---GC------GAC-C--A--TG----GC-AC-G-A--G-----C--T--G-GGCT-CGAACT-CACG--A-CCT-CC-CGGTT-GCG-AAGCG---AAA-GCTCTA---AC---CACTGAGCATG-AGC-TACC-ATGACC--------G----G-T
gi|4953 : TTTTACGCCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--A--TG----CC-AC-G-A--G-----C--A--G-GTCT-CGAACT-CACG--A-CCT-CC-CGTTG-ACG-AAGCG---AAC-ACTCCA---GC---CAC------TG-AGA-TACC-GCGACC--------G----G-TC
gi|4954 : TTTAACGTTTTA------GGTTT-GGT---GC------GGC-C--A--TG----AC-AC-G-A--G-----C--G--G-G-TT-CGAACT-CACG--A-CCT-TC-CGGTT-GCG-AAGAG---AAC-GCTCTA---AC---CAC------TG-AGC-TACT-GCGACC--------G----G-T
gi|4955 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GAGTG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TTA------A----A----AA---AAA-A
gi|4956 : TTTCATGTCGTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-T--A--TG----CT-AC-G-A--G-----C--G--G-GGCT-CGAGCT-CACG--A-TCT-TC-CGAAT-GCG-TAGCG---AAC-GCTCTA---AC---CAC------TG-AGA-TACC-GCGACC--------G----G-TTA------A----A----
gi|4957 : TTTCATGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------AGC-C--A--TG----CT-AC-G-A--G-----C--G--G-GGCT-CAAACT-CACA--A-CCT-CC-CGGTT-GCG-AAGCG---AAA-GCTCTA---TC---TAC------TG-AGC-TATC-GC
gi|4958 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAT---AC------GGC-C--G--TG----TC-AT-G-A--T-----A--A--G-GGCT-CGAACT-CACG--A-CAT-CC-CGGCC-GCG-AAGCACACAAACGCTCTA---AC---CAC------TG-AGC-TACC-GCGACC--------A----G-T
gi|4959 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-T-C--A-----C--G--G-AGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CGC------TG-AGC-CACC-GC-ACC--------G----G-TCG------A----A----AA---CAA-
gi|4960 : TTTAACGTCTTG------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--TT----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACT-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGT-CACC-GCGACT--------G----G-TCG------A----ATTTCAA---AAA-AA--G--A---
gi|4961 : TTTCACGTCT-A------AGTTT-GAT---GT------GGT-C--A--TG----AC-AT-G-A--G-----C--G--G-GGTT-CGAATT-CACG--A-CCT-CC-CAATT-GCG-AAACG---AAC-GCTCTA---TC---CAC------TG-AGC-TACT-G
gi|4962 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G---G----GT-GCAG-A--G-----CACG--G-GACT-CGAACG-CACG--G-CCT-CC-CTATC-ACG-AGGCG---AAA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CATC-GCGGCA--------G----G-TAA------A----A----AAGGTAAA-AA--A--AGGGTAGTTG-A-C
gi|4963 : TTTCACGTCTAA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-A-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGAAC-ACG-AGGCG---AGA-GGTCTA---CC---AAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4964 : TTTCATGTCTTG------GGTTC-AAT---GC------AGC-C--A--TG----CC-AC-G-A--G-----C--T--G-GGCT-CAAACT-CATG--A-CCT-CC-CGGTT-GCG-AAGCG---AAT-GATCTA---AC---CAC------TG-AGC-TATT-GCGACC--------A----G-CC
gi|4965 : TTTCACGTTTTA------GATTT-ACC---GC------GGC-C--A--TG----AC-AG-G-A--G-----------G-GACT-TGAACT-CCCG--A-CCT-CC-CGTTT-ACG-AAGTG---AAC-GCTCTA---AC---CAC------TG-AGC-TA
gi|4966 : TTTC-TGTCTTA------GGGTT-GAA---GC------GGC-C--A--CG----GC-AA-G-A--G-----C--G--T-GGCT-CGAACT-CACC--A------C-CGGTT-ACG-AAGCG---AAC-GTTCTA---AC---CAC------TG-AGC-TACA-GCGACC--------G----G-
gi|4967 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---TC------GGC-T--A--TG----GC-AC-G-T--G-----A--T--G-GGCT-TTAACT-CACG--A-CCT-CC-TGATT-GCG-AGGCA---AAC-GTTATA---AC---CAC------TA-AGC-TACCGGAGAAC--------A----G-CCA------A----A----AA---CAATAA--A--A-------------AAG-A--AT-T
gi|4968 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GAGTG----CC-GA-G-C--A-----C--A--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACA-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4969 : TTTCACGTCTTA------GGTTG-GAC---GC------GGC-G--A--TA----AC-AC-A-A--G-----C--G--G-GGTT-TGAACT-CAGG--A-CCT-TC-CGGTT-GCA-AAACG---AAC-GCTCT----AC---CAC------TG-AGT-TACC-GCGCCC--------G----A-T
gi|4970 : TTGCACGTCTTG------GGTTT-GAC---GC------GAC-C--A--TA----CC-AC-C-A--G-----C--A--A-A-CT-CGAACT-CACG--A-TCT-CC-CGGTT-ATG-GAGCG---AAT-GCTTCA---AC---CAC------TG-AG
gi|4972 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G------------A-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TCA------
gi|4973 : TTTCACTTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GAGTG----TC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TT-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TGA------A----A----A
gi|4974 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G------------A-A-C--A-----C--G--G-GGCT-TGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4975 : TTTAACGTCTTA------GGTTC-GCC---GC------GGC-C--G---G----GT-GC-C-A--G-----CACG--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGC-GCTCT----AC---CAT------TG-AGT-CACC-GCAACC--------G--------A------A----C----AC---AGA-AG--G--A---TAGATG-
gi|4976 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--TGT---GCCGA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-GGGCG---AGA-GCTATA---CC---AAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----GTTCA------G----ATGT-AA---ATG-AA--A--A---
gi|4977 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-TGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-GGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4978 : TTTAACATCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G------------A-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACT-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----T-TCA------C----A----A
gi|4979 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---AC------GGC-C--GAGTG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATT-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACT-GCGACC--------G----A-T
gi|4980 : TTTTACGTCTTA------GGTTT-GAT---GC------GGC-C--G---G----GT-GC-G-A--G-----C--ACAG-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-ACTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TC
gi|4981 : TTTTACGTCTTA------GGTTT-GAC---GCAATCATGGCAC--G---G----GC-AC-G-A--G-----C--T--G-GGCT-CGAACT-CACG--A-CCT-AC-CGGTT-ACT-------------GCTCT----AC---TAC------TG-AGC-TACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4982 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-G-C--A-----C--A--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCTA---CC---AAC------TG-AGC-CACC-GCGACT---------------TCA------A----
gi|4983 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GAGTG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GATCT----AC---AAC------TG-AGT-CACC-GCGACC--------G----GATTA------A----A----
gi|4984 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G------------A-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----
gi|4985 : TTCCACGTCTTG------GGTT--GTC---GC------GAC-T--A--TG----TC-AC-A-A--G-----A--G--G-GGCT-CGAATT-TACG--A-CCT-CC-CTGTT-GCC-AAGCG---AAT-GTTCAA---AC---AAT------TG-AGG-TACC-TCGACA--------G----G-TTA------G----A----
gi|4986 : TTTAACATCTTT------GGTTT-AAC---GC------GGC-C--A--TG----GC-TT-A-A--G-----C--G--G-TGCT-TGAACT-CGCATAA-CCT-CC-TCGTT-GCG-ATGCG---AAC-GCTCTA---AC---TGC------TG-AAC-TACC-GAGACC--------A----G-T
gi|4988 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--GT----CC-AA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACT-TACG--A-CCT-CC-CGCTC-ATG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TA-AGC-CACC-GTGACC--------G----G-TCA------G----A----
gi|4989 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-CTGG--TG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AT---CAC------TG-AAC-CACC-GCGACC--------G----G-TC
gi|4990 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GGC---GC------GTT-C--GACTG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-CGGT-CGAACG-CGCG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACG--------G----A-TCT------T----A----GA---AAT-AT--A--A----AGG-----CAA--A--AT----AACAAACATTGATC
gi|4991 : TTTCACGCCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGT-T--G---G----GT-GC-G-A--G-----C--AC-G-GGCT-CGAAC---ACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACT-GCGAAC--------G----G-TCT------A----A----A
gi|4992 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--TGT---GCCGA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-TC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCTA---CC---AAC------TG-AGC-CACC-GC
gi|4994 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-CA-G--T-----CC-AA-G-T--G-----T--G--G-GGCT-CGAACT-CACA--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGACA---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-TGA-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4995 : TTTCACGTTTTA------GGTTT-GAC---TC------G-C-C--G---G----GT-GCTG-A--G-----C--ACAG-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GGTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TT-------G----A----AA---ATG-GC--A--A---CAAGTG-A-CGA--A--AT-TT
gi|4996 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAT---GC------GGC-C--G---G----GT-GCTG-A--G-----CATG--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-TGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4997 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-G--GAGTG----CC-GA-G-C--A-----T--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CCATC-ACG-AGGCG---AGA-GCT-------C---CAC------TA-AGC-CACC-GCGACC--------G----GTTCA------A----A----TA---ATA-AA--T--A---TA
gi|4998 : TTTAACGTCTTA------GGTTG-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------GTGA-G-TGA------T----A----AA---AA
gi|4999 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGT-C--G--AGT---GC-GA-G-C--A-----C--G--G-GACT-CGAACT-CAAA--A-CCT-TC-CGATC-ACG-AAGCG---AGA-GCTCCGGCTAC---CAC------TG-AG
gi|5000 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CT-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACT-GCGACC--------G----G-T
gi|5001 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAC---GA------TTC-CAGG--TG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-ACTCTA---CC---AAC------TG-AGG-CACC-GCG-TC--------T----T-TTA------A----T----TA---AAA-GA--G--A----AGGCG-A-CGAG-G--AT----AACGAACAGTGATC
gi|5002 : TTTCATGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G---G----GT-GC-G-A--G-----C--AC-G-GACG-CAAACG-TACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCA---AAA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|5003 : TTTCACGTCTTA------GGATT-GAC---GC------GCC-C--G--TGT---GCCGA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-TC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCTA---CC---AAC------TG-AGT-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|5004 : TTTCACGTCTTA------GGTTTTGAC---GA------GGC-C--G---G----GT-GCCG-A--G-----CATG--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-AGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-ACGACC--------G----G----------A----A----GA---GAA-GA--A--A---TAG
gi|5005 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CGCG--A-CTT-CC-CAATC-ACA-AAGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGT-CATC-ACGACC--------G----G-TC
gi|5006 : TTTTACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--TT----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACT-CACG--A-C---TC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-TACC-GCGACC--------
gi|5007 : TTTAACGTCGTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G---G----GT-GCCG-A--G-----CATG--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ATG-AGGCG---AGA-GCTCTA---CC---AAC------TG-AGC-CACC-GCAACC--------G----G-TC
gi|5008 : TTTTATGCCTTG------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--T--TT----GC-TC-G-A--G-----C--G--G-GGCT-CAAAAT-CGCA--A-CCT-CT-TGGTT-ACG-AAGCG---AAC-GCTCT----AC---CAA------TG-AGC-TACC-GTAACC--------A----G-TGA------A----
gi|5009 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--CGT---GCAGA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCG-TT-CGATC-ACG-AGGCA---AGA-GCTCT----GC---CAC------TG-AGG-CACC-GCGACC--------G----A-T
gi|5010 : TTTCACGTCTTA------GGTTA-GAC---GC------AGC-T--GAGTG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACA-CACG--A-CCT-CC-CGGTC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AAC-CACT-GCAACC--------G----G-T
gi|5011 : TTTCAAGTCTTA------TGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACA--A-CCT-CC-CGATC-GCA-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGCCC--------G----G-T
gi|5012 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAT---GC------GGC-CAGG--TG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAAC--CACA--A-CCT-CC-TGATCAGCG-AGGCG---AGA-GCTCTA----C---CAC------TG-AGC-CACC-GTGACT--------G----G-TCA------
gi|5013 : TTTCACGTCTAA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GAGTG----CC-GA-G-C--A-----T--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TA-AGC-CACC-GAAACCTACTGATGG----G-TCA------A----A----AA---TAA-GA--
gi|5014 : TTTTACGTCTTA------G--TT-GAC---GC------GGC-T--G--TG-----C-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCTTCGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---A-A-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|5015 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC-------GC-C--G---G----GT-GC-C-AACA-----C--G--G-GCCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-C-ATC-AC--AAGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TC
gi|5016 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------AGC-C--G--TT----CC-AA-G-A--A-----C--G--G-GGTT-CGAACT-GACG--A-CCT-CC-TGATC-ACG-AGACA---AGA-GCTAT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TC
gi|5017 : TTTCATGTCTTA------GGTTT-TAC---AC------AGC-C--A--TGTATGGC-AC-A-A--G-----C--G--G-GGCT-TTAACT-CATG--G-CCT-AC-CGGTT-GGG-GAGCG---AAC-GCTCTA---GC---CAC------AG-AGC-TAC---CAACT--------G----G-TCA------
gi|5018 : TTTAACGTCTTA------GTTTT-GTC---GC------AGC-C--G---G----GT-GCCG-A--A-----C--AC-G-GGCC-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGATC--------G----G-TGACTGTCTA----T----AA---AAT-AT--A--A---T-GGTA-A-CAGT-A--GT-TT
gi|5019 : TTTCACGTCTT-------GGTTT-GACCGCGC------GG-----G--TT----GC--C-G-A--A-----C--AC-G-GGCT-CGAACG-CACG--AACCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCTA---A----CAC------TG-AGC-CACT-GCAACC--------G----G-TGA------A----
gi|5020 : TTTCACGTCTTA------GGTTG-GAC---GC------GGC-C--G--TG----G------------------------GACT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-AGACC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CAAC-GCGACC--------G----G-T
gi|5021 : TTTCACGTCTTA------AGTTT-GAC---AT------GAC-C--GGGTG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--C-CCT-CC-CAATC-ACG-AGGCG---ATA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TCC------AGGCGA----TA---GAA-AA--A--G---TA---A-A-AAAG-A--AT-
gi|5022 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---AC------AGC-C--GGATG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CATG--A-CCT-CC-CGCTC-ACG-AGGCC---AGA-GCTCTCTCTAC---CAC------TG-AGC-CACC-GTGACC--------G----G-T
gi|5023 : TTTCTCATCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--A--TA----GT-AC-G-A--G-----C--G--G-GGTT-CGAACT-CACG--A-CCT-AC-CGAT--ACG-AAGCG---AGA-GCTCT----AT---CAC------TG-AAC-CACC-GC
gi|5024 : TTTTACGTCTTA------AGTTT-GAT---GC------GGT-C--A--TG----GC-AC-G-A--G-----C--G--A-GGTT-CAAACT-CGCG--A-CCT-CC-CGGTT-GCG-AGGC
gi|5025 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AG-----------AC---CAC------TG-AGC-CAC
gi|5113 : TTTACGTCTGA------TGTTT-GAC---CA------AGC-T--A--TG----AC-AT-T-G--G-----C--A--G-GACT-CCAACT-CACG--A-CCT-CT-AGGTT-ACA-AAGCG---AAC-GCTCTACC-ACCTGCAC------TA-AGC-TATC-GCTACC--------G----G-TCA------A----G----AA---AGA-AA--G--G---TAAGAGCA-CATG-A--TT-TTaggttaa
gi|5114 : TTTACGTCTGA------GGTTT-GAC---GT------GGT-C--A--TG----GC-TC-G-A--G-----C--G--G-GACT-CAAACT-TACA--A-CCT-TC-CAGTA-ACA-AAGCG---AAC-GCTCTA---A----CAC------TG-AGC-TACT-GCGGCA--------G----G-TCT------A----A----
gi|5116 : TTTACGTCGTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--T--TG----AC-AC-T-T--A-----C--G--G-GGCC-TTAACT-CACA--A-CCT-CC-TGGTT-GCGAAGGCGA--AGT-GCTCTA---AC---AAC------TGAAGC-TACC-GCGTCC--------GAATTG-ACA------T----A----AACC-AAA-AACTA--A---TA
gi|5117 : TTTACGTCCTA------GATTT-AAC---TC------GGG-T--T--TG----GT-AC-G-A--A-----C--A--T-GGCT-TGAACT-CACA--A-CCT-TC-CTGTT-GCG-AAGCG---AGT-GCTTTA----C---CAC------TG-AGCTCATC-GCGACC--------G----G-TCA------A----T----AA---AAA-
gi|5118 : TTCCCGTCTTA------GATTT-GGC---GC------GGC-C--A--TA----GC-AG-G-A--G-----T--T--T-GGCA-TACACT-CACA--A-AC---C-CGATT-GGA-AAGCG---AAT-GCTCTA---AC---TAC------TG-AGC-AACC-GCAACC--------G----G-TGA------A----A----TA---A
gi|5119 : TTTACGACTTA------GATTT-GAC---GC----------------TG----GT-AC-G-A--G-----C--G--G-AGCT-CGCACT-CACG--A-CCT-CC-CAGTT-ATG-AGGCG---AAC-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TTA------A----
gi|5145 : TTACGTCGTA------GGTTT-GAC---GT------ACC-C--A--TG----GC-AG-G-A--A-----C--A--G-GACT-CGAGCT-CACG--A-CTT-CC-CAGTT-ACA-AAGCG---AAC-GCATT----AC---CAC------TG-AGA-TACC-GCAATC--------G----G-TC
gi|5146 : TCACGTCTTC------GGTTT-GAC---GC------AGC-C--A--TG----CT-AC-G-A--G-----T--G--G-GTCT-CGAATT-CACG--A-CCTACCGCGGTT-GAG-AAGCG---AAC-GCGCTA---AC---CAC------TT-AGC-TACC-GCGACC--------G----G-T
gi|5147 : TTACATCTCA------GGCTT-GCC---GT------GGC-C--A--TG----TA-AA-G-A--G-----C--G--G-GATT-CGAACT-CACA--A-CCT-CC-CGGTT-GCG-AAACA---AAT-GATCT----AC---CAC------TG-AAC-TACC-ACGACC--------G----G-TC
gi|5149 : TTACGTCT-A------AGTTT-AAC---GC------GGT-C--A--AT----GT-AC-G-A--G-----C--G--G-GGCT-CGAACT-TGCA--A-TCT-CC-CGGTT-ACG-TAGCG---AAC-GCTCTA---AC---GAC------TG-AGC-TATT-GCGAC
gi|5157 : CACGACTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--A--TG----CC-AC-T-A--G-----C--A--G-GGTT-CGAACT-CACG--A-CTC-TG-TGGTT-GCA-AAACG---AAT-GCTCTA---AC---TAC------
gi|5160 : ACGTCTTAAATGTAGGTTT-GAC---GC------GGC-C--A--TG----GC-GC-G-A--A-----C--G--G-GGCT-TGAACT-CACT--A-CCT-CC-CGTTT-GCG-AATCG---AAC-GTTTTA---AT---CAC------TG-AGC-TATC-GCGACC--------G----G-T
gi|5161 : ACATCTTA------GGTTT-GAC---AC------GGC-A--A--TA----GC-AC-G-G--G-----C--A--G-GACT-CGAACT-CAGT--A-CCT-CC-CGGTG-GCG-AAGGG---AAT-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-TACC-ATGACC--------
gi|5162 : ACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-CCGG--TA----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGTACT-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AAC-CACC-GCGACC--------G----GTTC----------------------AAC-AC--A--A---TAGGAA-AGCAAA-ATTAT-TTC-ACAATC
gi|5163 : ACGTCTCA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--CT----CC-AA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GTGACC--------G----G-TC
gi|5164 : ACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGT-C--A--AG----GC-AT---A--GTTCTCT--G--G-GGAT-CTCACA-CACG--A-CC--CC-CGGTT-ACA-AAGCG---AAC-GCTCT----AC---CAC------AG-AGT-TATC-GCAAAC--------G----G-TTG------G----A----AT---AAT-AA--ATTA---TAAGAA-A-TAAGCA--AT-
gi|5176 : CGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GTT-C--A--TG----GC-AT-G-A--A-----C--T--G-GGTT-CGAACT-CACG--A-CCT-C
gi|5181 : GTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-CAGG--TG----CA-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-TC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCTA---A----CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TCA------atggttacaaaacaaactcca
gi|5187 : TCTAA------GGTTT-GAC---GC------GGC-CCAA--TG----GC-AC-G-A--G-----C--A--GTGGCT-CGAACTTCACG--A-CCT-CC--GGTT-GCG-AA-CG---AAC-GCTCCA---AC---CAC------TG-AGC-TACC-GCGACC--------G----A-TAA------A----
gi|5192 : CCTA------TGTTT-GAC---GC------CGC-C--A--TG----GC-AC-A-G--G-----C--A--G-GGCT-CAAACT-CACA--A-CGT-TC-CGGTT-GCA-AAGCG---AAT-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-TACC-GCGACC--------G----A-TC
gi|5203 : A------GGTTT-GAC---GC------AGC-C--A--TG----GC-AC-G-A--G-----C--A--A-GGCT-CGAATT-CACG--A-CCT-CC-CGGTT-GCA-AAGCG---AAC-GCTCTA---AC---CAC------TG-AGC-TACC-ACGACC--------A----G-TCA------G----G----AA---
gi|5209 : GTTT-GAC---AC------GGT-C--A--TG----GC-AC-A-A--G-----T--G--G-GACT-CAAATT-CACA--A-CCT-TT-CTGTT-GCG-AAACG---AAC-ACCCT----AC---CAC------TG-ATC-TACC-GCGACC--------G----G-
gi|5212 : TTC-GGC---GC------AGT-C--A--TG----TC-AC-G-A--G-----C--G--G-GGCT-TGAACT-CACG--A-TCT-CC-CGGTA-GCG-AAGCG---AAT-GCTCTA---GC---CAC------TG-AGC-TACC-GCAACC--------G----G-TAA------A----T----GA---AAA-TG--A--A---TA
gi|5213 : TTT-GAC---GT------GGC-C--A--TG----TC-AA-G-A--G-----C--G--G-GGCT-CAAACT-CACG--A-CCT-CC-TTGTT-CCG-AGGCA---AAC-GCTCTA---AC---CAC------TG-AGC-TACC-GCGACC--------A----G-TGA------A----A----
Alignments
lowQualScore : 111111111111 1111 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 111 1 1 1
lowQualScore : 111111 0 000 111111 0 333333333333 5555 2222 11111 22 22 0 0 22 00 0 0 0 11 0 111 22 9999 000 111111 0 0 0 11111111 1111 1 222222 2222 4444 444 1 22 22 333 333 2 33 44 3 1 3 3 0 2 0 3 3 22 2 0 0 5 2 3 66 0 0 3 5 55 5 5 0 5 3 0 0 3 5 5 3 333 0 3 3 0 5 3
lowQualScore : ...... . ... ...... . ............ .... .... ..... .. .. . . .. .. . . . .. . ... .. .... ... ...... . . . ........ .... . ...... .... .... ... . .. .. ... ... . .. .. . . . . . . . . . .. . . . . . . .. . . . . .. . . . . . . . . . . . ... . . . . . .
lowQualScore : 222222 4 777 222222 4 111111111111 0000 8888 00000 88 77 4 4 22 55 4 4 4 22 4 111 22 4444 777 222222 4 4 4 66666666 8888 9 555555 0000 2222 555 6 55 66 333 999 9 99 22 1 7 2 2 0 5 0 2 2 00 5 0 0 5 5 2 55 0 0 2 0 88 5 0 0 5 2 0 0 2 0 0 2 888 0 2 2 0 0 2
consensus : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--TG----GC-GN-G-A--G-----C--G--G-GGCT-CGAACN-CACG--A-CCT-CC-CGATC-GCG-AGGCG---AGA-GCTCTA---AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--AT-TTCGACGATCATTGATCCTTCACTGACTGATAAATGCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAG-CCTGTCGGAAATGGAAA-CATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACATAAACGAGAAAGGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGNNCCATATGCTCAGT-TTAATG-GAGATCTTGGGCTATATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTATCCACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAATCCAGCTTAATACAATTCCATGCC-AACAT-ATCGTCATCTTGGAACAAAGAATTAGGAAAATGCAAGTATTCCGACATTAATATTAGAATATTAAAAATTCTCGGCGC-TTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATCTTATCTGTCATTGAGTTGTTTTCAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCC-TTTTTATCAATGATTTTATCTTCA-GACTGTTGACGCTGGAATCGCATTCCCTGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGAGGACGCCTATGTATAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAGTTCCGGATGGAAAGTG-AAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTGTTTACATGTTGATGAATTTATCACACACGACTGTTAGTACA-AGTTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACTGGAGGCATAGGGTCACATTTTGGGAGCAAAGTTT
Reference ( family-131 ) : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--TG----GC-GN-G-A--G-----C--G--G-GGCT-CGAACN-CACG--A-CCT-CC-CGATC-GCG-AGGCG---AGA-GCTCTA---AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--AT-TTCGACGATCATTGATCCTTCACTGACTGATAAATGCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAG-CCTGTCGGAAATGGAAA-CATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACATAAACGAGAAAGGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGNNCCATATGCTCAGT-TTAATG-GAGATCTTGGGCTATATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTATCCACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAATCCAGCTTAATACAATTCCATGCC-AACAT-ATCGTCATCTTGGAACAAAGAATTAGGAAAATGCAAGTATTCCGACATTAATATTAGAATATTAAAAATTCTCGGCGC-TTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATCTTATCTGTCATTGAGTTGTTTTCAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCC-TTTTTATCAATGATTTTATCTTCA-GACTGTTGACGCTGGAATCGCATTCCCTGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGAGGACGCCTATGTATAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAGTTCCGGATGGAAAGTG-AAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTGTTTACATGTTGATGAATTTATCACACACGACTGTTAGTACA-AGTTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACTGGAGGCATAGGGTCACATTTTGGGAGCAAAGTTT
gi|4947 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GGC---GC------GGT-C--A--TG----GC-AA-T-A--G-----C--G--G-GACT-CGAATT-CACT--A-CCT-CC-CGGTT-GCG-AAGCG---AAC-GCTCCA---AC---TAC------TG-AGG-TACC-GCCACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--AT-TTCGACGATCATTGATCCTTCACTGACTGATAAATGCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAG-CCTGTCGGAAATGGAAA-CATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACATAAACGAGAAAGGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGCGCCATATGCTCAGT-TTAATG-GAGATCTTGGGCTATATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTATCCACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAATCCAGC-TAATACAATTCCATGCC-AACAT-ATCGTCATCTTGGAACAAAGAATTAGGAAAATGCAAGTATTCCGACATTAATATTAGAATATTAAAAATTCTC-GCGC-TTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATCTTATCTGTCATTGAGTTGTTTTCAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCCTTTTTTATCAATGATTTTATCTTCAGGACTGTTGACGCTGGAATCGCATTCCCTGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGA-GACGCCTATGTATAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAGTTCCGAATGGAAAGTG-AAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTGTTTACATGTTGATGAATTTATCACACACGACTGTTAGTACA-AGTTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACTGGAGGCATAGGGTCACATTTTGGGAGCAAAGTTT
gi|4948 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GGC---GC------GGT-C--A--TG----GC-AA-TTA--G-----C--G--G-GACT-CGAATT-CACT--A-CCT-CC--GGTT-GCG-AAGCG---AAC-GCTCCA---AC---TAC------TG-AGG-TACC-GCCACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--AT-TTCGACGATCATTGATCCTTCACTGACTGATAAATGCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAG-CCTGTCG-AAATGGAAA-CATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACATAAACGAGAA-GGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGCGCCATATGCTCA---TTAATG-GAGATCTTGGGCTATATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTATCCACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAA-CCAGCT-AATACAATTCCATGCC-AACAT-ATCGTCATCTTGGAACAAAGAATTAGGAAAATGCAAGTATTCCGACATTAATATT-GAATATTAAAAATTCTC-GCGCTTTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATCTTATCTGTCATTGAGTTGTTTTCAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCC-TTTTTATCAATGATTTTATCTTCA-GACTGTTGACGCTGGAATCGCATTCCCTGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGA-GACGCCTATG--TAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAGTT-CGAATGGAAAGTG-AAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTGTTTACATGTTGATGAA-TTATCACACACGACTGTTAGTACA-AGTTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACTGGAGGCATAGGGTCACATTTTGGGAGCAAAGTTT
gi|4949 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GGC---GC------GGT-C--A--TG----GC-AA-T-A--G-----C--G--G-GACT-CGAATT-CACT--A-CCT-CC-CGGTT-GCG-AAGCG---AAC-GCTCCA---AC---TAC------TG-AGG-TACC-GCCACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--ATATTCGACGATCATTGATCC-TCACTGACTGATAAATGCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAG-CCTGTCGGAAATGGAAA-CATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACA-AAACGAGAAAGGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGGCCCATATGCTCAGTATTAATG-AGGATTTTGGGCTA-ATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTAT-CACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAATCCAGCTTAATACAATTCCATGCC-AACATAATCGTCATCTTGGAAC-AAGAATTAGGAAAATGCAAGTATT-CGACATTAATATTAGAATA-TAAAAATTCTCGGCGC-TTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATC-TATCTGTCATTGAGTTGTTTTCAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCC-TTTTTATCAATGATTTTATCTTCA-GACTGTTGACGCTGG-ATCGCATT-CCTGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGAGGACGCCTATGTATAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAGTTCC-GATGGAAAGTG-AAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTGTTTACATGTTGATGAATTTATCACACACGACTGTTAGTACA-GATTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACT-GAGGCATAGGGTCACATATTGGGAGCAAAGTTT
gi|4950 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GGC---GC------GGT-C--A--TG----GC-AA-T-A--G-----C--G--G-A-CT-CGAATT-CACT--A-CCT-CC-CGGTT-GCG-AAGCG---AAC-GCTCCA---AC---TAC------TG-AGG-TACC-GCCACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--AT-TTCGACGAT-ATTGATCCTTCACTGACTGATAAA-GCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAGGCCTGTCGGAAATGGAAAACATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACATAAACGAGAAAGGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGGCCCATATGCTCAGT-TTAATGAGAGATTTTGGGCTA-ATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTATCCACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAATCCAGCTTAATACAATTCCATGCCAAACAT-ATCGTCATCTTGGAACAAAGAATTAGGAAAATGCAAGTATT-CGACATTAATATTA-AATA-TAAAAATTCTCGGCGC-TTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATC-TATCTGTCATTGAGTTG-TTTCAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCC-TTTTTATCAATGATTTTATCTTCA-GACTGTTGACGCTGGAATCGCATT-CCTGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGAGGACGCCTATGTATAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAAGTC--GATGGAAAGTGAAAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTG-TTACATGTTGATGAATTTATCACACACGACTGTTAGTACAGAGTTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACT-GAGGCATAGGGTCACA-TTTGGGAGCAAAGTTT
gi|4951 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--A--TA----GC-AT-A-A--G-----C--G--G-GGCT-CGAACT-CAGG--A-CTC-CC-CGGTT-GCG-AAGCG---AAC-TCTCTA---AC---CGC------TG-AGC-TACC-GCTACC--------G----G-T
gi|4952 : TTTCACGTCTTG------GGTTT-GAC---GC------GAC-C--A--TG----GC-AC-G-A--G-----C--T--G-GGCT-CGAACT-CACG--A-CCT-CC-CGGTT-GCG-AAGCG---AAA-GCTCTA---AC---CACTGAGCATG-AGC-TACC-ATGACC--------G----G-T
gi|4953 : TTTTACGCCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--A--TG----CC-AC-G-A--G-----C--A--G-GTCT-CGAACT-CACG--A-CCT-CC-CGTTG-ACG-AAGCG---AAC-ACTCCA---GC---CAC------TG-AGA-TACC-GCGACC--------G----G-TC
gi|4954 : TTTAACGTTTTA------GGTTT-GGT---GC------GGC-C--A--TG----AC-AC-G-A--G-----C--G--G-G-TT-CGAACT-CACG--A-CCT-TC-CGGTT-GCG-AAGAG---AAC-GCTCTA---AC---CAC------TG-AGC-TACT-GCGACC--------G----G-T
gi|4955 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GAGTG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TTA------A----A----AA---AAA-A
gi|4956 : TTTCATGTCGTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-T--A--TG----CT-AC-G-A--G-----C--G--G-GGCT-CGAGCT-CACG--A-TCT-TC-CGAAT-GCG-TAGCG---AAC-GCTCTA---AC---CAC------TG-AGA-TACC-GCGACC--------G----G-TTA------A----A----
gi|4957 : TTTCATGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------AGC-C--A--TG----CT-AC-G-A--G-----C--G--G-GGCT-CAAACT-CACA--A-CCT-CC-CGGTT-GCG-AAGCG---AAA-GCTCTA---TC---TAC------TG-AGC-TATC-GC
gi|4958 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAT---AC------GGC-C--G--TG----TC-AT-G-A--T-----A--A--G-GGCT-CGAACT-CACG--A-CAT-CC-CGGCC-GCG-AAGCACACAAACGCTCTA---AC---CAC------TG-AGC-TACC-GCGACC--------A----G-T
gi|4959 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-T-C--A-----C--G--G-AGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CGC------TG-AGC-CACC-GC-ACC--------G----G-TCG------A----A----AA---CAA-
gi|4960 : TTTAACGTCTTG------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--TT----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACT-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGT-CACC-GCGACT--------G----G-TCG------A----ATTTCAA---AAA-AA--G--A---
gi|4961 : TTTCACGTCT-A------AGTTT-GAT---GT------GGT-C--A--TG----AC-AT-G-A--G-----C--G--G-GGTT-CGAATT-CACG--A-CCT-CC-CAATT-GCG-AAACG---AAC-GCTCTA---TC---CAC------TG-AGC-TACT-G
gi|4962 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G---G----GT-GCAG-A--G-----CACG--G-GACT-CGAACG-CACG--G-CCT-CC-CTATC-ACG-AGGCG---AAA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CATC-GCGGCA--------G----G-TAA------A----A----AAGGTAAA-AA--A--AGGGTAGTTG-A-C
gi|4963 : TTTCACGTCTAA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-A-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGAAC-ACG-AGGCG---AGA-GGTCTA---CC---AAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4964 : TTTCATGTCTTG------GGTTC-AAT---GC------AGC-C--A--TG----CC-AC-G-A--G-----C--T--G-GGCT-CAAACT-CATG--A-CCT-CC-CGGTT-GCG-AAGCG---AAT-GATCTA---AC---CAC------TG-AGC-TATT-GCGACC--------A----G-CC
gi|4965 : TTTCACGTTTTA------GATTT-ACC---GC------GGC-C--A--TG----AC-AG-G-A--G-----------G-GACT-TGAACT-CCCG--A-CCT-CC-CGTTT-ACG-AAGTG---AAC-GCTCTA---AC---CAC------TG-AGC-TA
gi|4966 : TTTC-TGTCTTA------GGGTT-GAA---GC------GGC-C--A--CG----GC-AA-G-A--G-----C--G--T-GGCT-CGAACT-CACC--A------C-CGGTT-ACG-AAGCG---AAC-GTTCTA---AC---CAC------TG-AGC-TACA-GCGACC--------G----G-
gi|4967 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---TC------GGC-T--A--TG----GC-AC-G-T--G-----A--T--G-GGCT-TTAACT-CACG--A-CCT-CC-TGATT-GCG-AGGCA---AAC-GTTATA---AC---CAC------TA-AGC-TACCGGAGAAC--------A----G-CCA------A----A----AA---CAATAA--A--A-------------AAG-A--AT-T
gi|4968 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GAGTG----CC-GA-G-C--A-----C--A--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACA-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4969 : TTTCACGTCTTA------GGTTG-GAC---GC------GGC-G--A--TA----AC-AC-A-A--G-----C--G--G-GGTT-TGAACT-CAGG--A-CCT-TC-CGGTT-GCA-AAACG---AAC-GCTCT----AC---CAC------TG-AGT-TACC-GCGCCC--------G----A-T
gi|4970 : TTGCACGTCTTG------GGTTT-GAC---GC------GAC-C--A--TA----CC-AC-C-A--G-----C--A--A-A-CT-CGAACT-CACG--A-TCT-CC-CGGTT-ATG-GAGCG---AAT-GCTTCA---AC---CAC------TG-AG
gi|4972 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G------------A-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TCA------
gi|4973 : TTTCACTTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GAGTG----TC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TT-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TGA------A----A----A
gi|4974 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G------------A-A-C--A-----C--G--G-GGCT-TGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4975 : TTTAACGTCTTA------GGTTC-GCC---GC------GGC-C--G---G----GT-GC-C-A--G-----CACG--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGC-GCTCT----AC---CAT------TG-AGT-CACC-GCAACC--------G--------A------A----C----AC---AGA-AG--G--A---TAGATG-
gi|4976 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--TGT---GCCGA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-GGGCG---AGA-GCTATA---CC---AAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----GTTCA------G----ATGT-AA---ATG-AA--A--A---
gi|4977 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-TGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-GGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4978 : TTTAACATCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G------------A-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACT-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----T-TCA------C----A----A
gi|4979 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---AC------GGC-C--GAGTG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATT-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACT-GCGACC--------G----A-T
gi|4980 : TTTTACGTCTTA------GGTTT-GAT---GC------GGC-C--G---G----GT-GC-G-A--G-----C--ACAG-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-ACTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TC
gi|4981 : TTTTACGTCTTA------GGTTT-GAC---GCAATCATGGCAC--G---G----GC-AC-G-A--G-----C--T--G-GGCT-CGAACT-CACG--A-CCT-AC-CGGTT-ACT-------------GCTCT----AC---TAC------TG-AGC-TACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4982 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-G-C--A-----C--A--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCTA---CC---AAC------TG-AGC-CACC-GCGACT---------------TCA------A----
gi|4983 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GAGTG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GATCT----AC---AAC------TG-AGT-CACC-GCGACC--------G----GATTA------A----A----
gi|4984 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G------------A-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----
gi|4985 : TTCCACGTCTTG------GGTT--GTC---GC------GAC-T--A--TG----TC-AC-A-A--G-----A--G--G-GGCT-CGAATT-TACG--A-CCT-CC-CTGTT-GCC-AAGCG---AAT-GTTCAA---AC---AAT------TG-AGG-TACC-TCGACA--------G----G-TTA------G----A----
gi|4986 : TTTAACATCTTT------GGTTT-AAC---GC------GGC-C--A--TG----GC-TT-A-A--G-----C--G--G-TGCT-TGAACT-CGCATAA-CCT-CC-TCGTT-GCG-ATGCG---AAC-GCTCTA---AC---TGC------TG-AAC-TACC-GAGACC--------A----G-T
gi|4988 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--GT----CC-AA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACT-TACG--A-CCT-CC-CGCTC-ATG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TA-AGC-CACC-GTGACC--------G----G-TCA------G----A----
gi|4989 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-CTGG--TG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AT---CAC------TG-AAC-CACC-GCGACC--------G----G-TC
gi|4990 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GGC---GC------GTT-C--GACTG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-CGGT-CGAACG-CGCG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACG--------G----A-TCT------T----A----GA---AAT-AT--A--A----AGG-----CAA--A--AT----AACAAACATTGATC
gi|4991 : TTTCACGCCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGT-T--G---G----GT-GC-G-A--G-----C--AC-G-GGCT-CGAAC---ACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACT-GCGAAC--------G----G-TCT------A----A----A
gi|4992 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--TGT---GCCGA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-TC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCTA---CC---AAC------TG-AGC-CACC-GC
gi|4994 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-CA-G--T-----CC-AA-G-T--G-----T--G--G-GGCT-CGAACT-CACA--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGACA---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-TGA-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4995 : TTTCACGTTTTA------GGTTT-GAC---TC------G-C-C--G---G----GT-GCTG-A--G-----C--ACAG-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GGTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TT-------G----A----AA---ATG-GC--A--A---CAAGTG-A-CGA--A--AT-TT
gi|4996 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAT---GC------GGC-C--G---G----GT-GCTG-A--G-----CATG--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-TGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4997 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-G--GAGTG----CC-GA-G-C--A-----T--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CCATC-ACG-AGGCG---AGA-GCT-------C---CAC------TA-AGC-CACC-GCGACC--------G----GTTCA------A----A----TA---ATA-AA--T--A---TA
gi|4998 : TTTAACGTCTTA------GGTTG-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------GTGA-G-TGA------T----A----AA---AA
gi|4999 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGT-C--G--AGT---GC-GA-G-C--A-----C--G--G-GACT-CGAACT-CAAA--A-CCT-TC-CGATC-ACG-AAGCG---AGA-GCTCCGGCTAC---CAC------TG-AG
gi|5000 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CT-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACT-GCGACC--------G----G-T
gi|5001 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAC---GA------TTC-CAGG--TG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-ACTCTA---CC---AAC------TG-AGG-CACC-GCG-TC--------T----T-TTA------A----T----TA---AAA-GA--G--A----AGGCG-A-CGAG-G--AT----AACGAACAGTGATC
gi|5002 : TTTCATGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G---G----GT-GC-G-A--G-----C--AC-G-GACG-CAAACG-TACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCA---AAA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|5003 : TTTCACGTCTTA------GGATT-GAC---GC------GCC-C--G--TGT---GCCGA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-TC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCTA---CC---AAC------TG-AGT-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|5004 : TTTCACGTCTTA------GGTTTTGAC---GA------GGC-C--G---G----GT-GCCG-A--G-----CATG--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-AGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-ACGACC--------G----G----------A----A----GA---GAA-GA--A--A---TAG
gi|5005 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CGCG--A-CTT-CC-CAATC-ACA-AAGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGT-CATC-ACGACC--------G----G-TC
gi|5006 : TTTTACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--TT----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACT-CACG--A-C---TC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-TACC-GCGACC--------
gi|5007 : TTTAACGTCGTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G---G----GT-GCCG-A--G-----CATG--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ATG-AGGCG---AGA-GCTCTA---CC---AAC------TG-AGC-CACC-GCAACC--------G----G-TC
gi|5008 : TTTTATGCCTTG------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--T--TT----GC-TC-G-A--G-----C--G--G-GGCT-CAAAAT-CGCA--A-CCT-CT-TGGTT-ACG-AAGCG---AAC-GCTCT----AC---CAA------TG-AGC-TACC-GTAACC--------A----G-TGA------A----
gi|5009 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--CGT---GCAGA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCG-TT-CGATC-ACG-AGGCA---AGA-GCTCT----GC---CAC------TG-AGG-CACC-GCGACC--------G----A-T
gi|5010 : TTTCACGTCTTA------GGTTA-GAC---GC------AGC-T--GAGTG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACA-CACG--A-CCT-CC-CGGTC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AAC-CACT-GCAACC--------G----G-T
gi|5011 : TTTCAAGTCTTA------TGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACA--A-CCT-CC-CGATC-GCA-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGCCC--------G----G-T
gi|5012 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAT---GC------GGC-CAGG--TG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAAC--CACA--A-CCT-CC-TGATCAGCG-AGGCG---AGA-GCTCTA----C---CAC------TG-AGC-CACC-GTGACT--------G----G-TCA------
gi|5013 : TTTCACGTCTAA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GAGTG----CC-GA-G-C--A-----T--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TA-AGC-CACC-GAAACCTACTGATGG----G-TCA------A----A----AA---TAA-GA--
gi|5014 : TTTTACGTCTTA------G--TT-GAC---GC------GGC-T--G--TG-----C-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCTTCGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---A-A-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|5015 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC-------GC-C--G---G----GT-GC-C-AACA-----C--G--G-GCCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-C-ATC-AC--AAGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TC
gi|5016 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------AGC-C--G--TT----CC-AA-G-A--A-----C--G--G-GGTT-CGAACT-GACG--A-CCT-CC-TGATC-ACG-AGACA---AGA-GCTAT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TC
gi|5017 : TTTCATGTCTTA------GGTTT-TAC---AC------AGC-C--A--TGTATGGC-AC-A-A--G-----C--G--G-GGCT-TTAACT-CATG--G-CCT-AC-CGGTT-GGG-GAGCG---AAC-GCTCTA---GC---CAC------AG-AGC-TAC---CAACT--------G----G-TCA------
gi|5018 : TTTAACGTCTTA------GTTTT-GTC---GC------AGC-C--G---G----GT-GCCG-A--A-----C--AC-G-GGCC-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGATC--------G----G-TGACTGTCTA----T----AA---AAT-AT--A--A---T-GGTA-A-CAGT-A--GT-TT
gi|5019 : TTTCACGTCTT-------GGTTT-GACCGCGC------GG-----G--TT----GC--C-G-A--A-----C--AC-G-GGCT-CGAACG-CACG--AACCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCTA---A----CAC------TG-AGC-CACT-GCAACC--------G----G-TGA------A----
gi|5020 : TTTCACGTCTTA------GGTTG-GAC---GC------GGC-C--G--TG----G------------------------GACT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-AGACC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CAAC-GCGACC--------G----G-T
gi|5021 : TTTCACGTCTTA------AGTTT-GAC---AT------GAC-C--GGGTG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--C-CCT-CC-CAATC-ACG-AGGCG---ATA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TCC------AGGCGA----TA---GAA-AA--A--G---TA---A-A-AAAG-A--AT-
gi|5022 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---AC------AGC-C--GGATG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CATG--A-CCT-CC-CGCTC-ACG-AGGCC---AGA-GCTCTCTCTAC---CAC------TG-AGC-CACC-GTGACC--------G----G-T
gi|5023 : TTTCTCATCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--A--TA----GT-AC-G-A--G-----C--G--G-GGTT-CGAACT-CACG--A-CCT-AC-CGAT--ACG-AAGCG---AGA-GCTCT----AT---CAC------TG-AAC-CACC-GC
gi|5024 : TTTTACGTCTTA------AGTTT-GAT---GC------GGT-C--A--TG----GC-AC-G-A--G-----C--G--A-GGTT-CAAACT-CGCG--A-CCT-CC-CGGTT-GCG-AGGC
gi|5025 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AG-----------AC---CAC------TG-AGC-CAC
gi|5113 : TTTACGTCTGA------TGTTT-GAC---CA------AGC-T--A--TG----AC-AT-T-G--G-----C--A--G-GACT-CCAACT-CACG--A-CCT-CT-AGGTT-ACA-AAGCG---AAC-GCTCTACC-ACCTGCAC------TA-AGC-TATC-GCTACC--------G----G-TCA------A----G----AA---AGA-AA--G--G---TAAGAGCA-CATG-A--TT-TTaggttaa
gi|5114 : TTTACGTCTGA------GGTTT-GAC---GT------GGT-C--A--TG----GC-TC-G-A--G-----C--G--G-GACT-CAAACT-TACA--A-CCT-TC-CAGTA-ACA-AAGCG---AAC-GCTCTA---A----CAC------TG-AGC-TACT-GCGGCA--------G----G-TCT------A----A----
gi|5116 : TTTACGTCGTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--T--TG----AC-AC-T-T--A-----C--G--G-GGCC-TTAACT-CACA--A-CCT-CC-TGGTT-GCGAAGGCGA--AGT-GCTCTA---AC---AAC------TGAAGC-TACC-GCGTCC--------GAATTG-ACA------T----A----AACC-AAA-AACTA--A---TA
gi|5117 : TTTACGTCCTA------GATTT-AAC---TC------GGG-T--T--TG----GT-AC-G-A--A-----C--A--T-GGCT-TGAACT-CACA--A-CCT-TC-CTGTT-GCG-AAGCG---AGT-GCTTTA----C---CAC------TG-AGCTCATC-GCGACC--------G----G-TCA------A----T----AA---AAA-
gi|5118 : TTCCCGTCTTA------GATTT-GGC---GC------GGC-C--A--TA----GC-AG-G-A--G-----T--T--T-GGCA-TACACT-CACA--A-AC---C-CGATT-GGA-AAGCG---AAT-GCTCTA---AC---TAC------TG-AGC-AACC-GCAACC--------G----G-TGA------A----A----TA---A
gi|5119 : TTTACGACTTA------GATTT-GAC---GC----------------TG----GT-AC-G-A--G-----C--G--G-AGCT-CGCACT-CACG--A-CCT-CC-CAGTT-ATG-AGGCG---AAC-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TTA------A----
gi|5145 : TTACGTCGTA------GGTTT-GAC---GT------ACC-C--A--TG----GC-AG-G-A--A-----C--A--G-GACT-CGAGCT-CACG--A-CTT-CC-CAGTT-ACA-AAGCG---AAC-GCATT----AC---CAC------TG-AGA-TACC-GCAATC--------G----G-TC
gi|5146 : TCACGTCTTC------GGTTT-GAC---GC------AGC-C--A--TG----CT-AC-G-A--G-----T--G--G-GTCT-CGAATT-CACG--A-CCTACCGCGGTT-GAG-AAGCG---AAC-GCGCTA---AC---CAC------TT-AGC-TACC-GCGACC--------G----G-T
gi|5147 : TTACATCTCA------GGCTT-GCC---GT------GGC-C--A--TG----TA-AA-G-A--G-----C--G--G-GATT-CGAACT-CACA--A-CCT-CC-CGGTT-GCG-AAACA---AAT-GATCT----AC---CAC------TG-AAC-TACC-ACGACC--------G----G-TC
gi|5149 : TTACGTCT-A------AGTTT-AAC---GC------GGT-C--A--AT----GT-AC-G-A--G-----C--G--G-GGCT-CGAACT-TGCA--A-TCT-CC-CGGTT-ACG-TAGCG---AAC-GCTCTA---AC---GAC------TG-AGC-TATT-GCGAC
gi|5157 : CACGACTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--A--TG----CC-AC-T-A--G-----C--A--G-GGTT-CGAACT-CACG--A-CTC-TG-TGGTT-GCA-AAACG---AAT-GCTCTA---AC---TAC------
gi|5160 : ACGTCTTAAATGTAGGTTT-GAC---GC------GGC-C--A--TG----GC-GC-G-A--A-----C--G--G-GGCT-TGAACT-CACT--A-CCT-CC-CGTTT-GCG-AATCG---AAC-GTTTTA---AT---CAC------TG-AGC-TATC-GCGACC--------G----G-T
gi|5161 : ACATCTTA------GGTTT-GAC---AC------GGC-A--A--TA----GC-AC-G-G--G-----C--A--G-GACT-CGAACT-CAGT--A-CCT-CC-CGGTG-GCG-AAGGG---AAT-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-TACC-ATGACC--------
gi|5162 : ACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-CCGG--TA----CC-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGTACT-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AAC-CACC-GCGACC--------G----GTTC----------------------AAC-AC--A--A---TAGGAA-AGCAAA-ATTAT-TTC-ACAATC
gi|5163 : ACGTCTCA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--CT----CC-AA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GTGACC--------G----G-TC
gi|5164 : ACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGT-C--A--AG----GC-AT---A--GTTCTCT--G--G-GGAT-CTCACA-CACG--A-CC--CC-CGGTT-ACA-AAGCG---AAC-GCTCT----AC---CAC------AG-AGT-TATC-GCAAAC--------G----G-TTG------G----A----AT---AAT-AA--ATTA---TAAGAA-A-TAAGCA--AT-
gi|5176 : CGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GTT-C--A--TG----GC-AT-G-A--A-----C--T--G-GGTT-CGAACT-CACG--A-CCT-C
gi|5181 : GTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-CAGG--TG----CA-GA-G-C--A-----C--G--G-GGCT-CGAACG-CACG--A-CCT-TC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-GCTCTA---A----CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TCA------atggttacaaaacaaactcca
gi|5187 : TCTAA------GGTTT-GAC---GC------GGC-CCAA--TG----GC-AC-G-A--G-----C--A--GTGGCT-CGAACTTCACG--A-CCT-CC--GGTT-GCG-AA-CG---AAC-GCTCCA---AC---CAC------TG-AGC-TACC-GCGACC--------G----A-TAA------A----
gi|5192 : CCTA------TGTTT-GAC---GC------CGC-C--A--TG----GC-AC-A-G--G-----C--A--G-GGCT-CAAACT-CACA--A-CGT-TC-CGGTT-GCA-AAGCG---AAT-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-TACC-GCGACC--------G----A-TC
gi|5203 : A------GGTTT-GAC---GC------AGC-C--A--TG----GC-AC-G-A--G-----C--A--A-GGCT-CGAATT-CACG--A-CCT-CC-CGGTT-GCA-AAGCG---AAC-GCTCTA---AC---CAC------TG-AGC-TACC-ACGACC--------A----G-TCA------G----G----AA---
gi|5209 : GTTT-GAC---AC------GGT-C--A--TG----GC-AC-A-A--G-----T--G--G-GACT-CAAATT-CACA--A-CCT-TT-CTGTT-GCG-AAACG---AAC-ACCCT----AC---CAC------TG-ATC-TACC-GCGACC--------G----G-
gi|5212 : TTC-GGC---GC------AGT-C--A--TG----TC-AC-G-A--G-----C--G--G-GGCT-TGAACT-CACG--A-TCT-CC-CGGTA-GCG-AAGCG---AAT-GCTCTA---GC---CAC------TG-AGC-TACC-GCAACC--------G----G-TAA------A----T----GA---AAA-TG--A--A---TA
gi|5213 : TTT-GAC---GT------GGC-C--A--TG----TC-AA-G-A--G-----C--G--G-GGCT-CAAACT-CACG--A-CCT-CC-TTGTT-CCG-AGGCA---AAC-GCTCTA---AC---CAC------TG-AGC-TACC-GCGACC--------A----G-TGA------A----A----
blockSeqs : AATGTA AATCAT ATGTATGG GCA AAC TTCTC AC CA TT AG CAC AC GGCT TGAGCA TACTGATG AATT T CTGTCT GGCG TTTC GGT T CT TT GGG AGC G GC TT A G T T G G A T A CG G A A T C T TT A A A C AG T G T T T . . A C G T CG A T T G G T
blockSeqs : . . GAGTGC CGA TA . AC CA T G A C CTCT . . TGA A . . TGT CC . . . . TG . G . . G T T . G . T A GC G . . . C T TT . . A . G . G . . T . . A . G T CC . T T . . T
blockSeqs : . . GGGTGC CGA A . AT C T G . C ACC . . . T . . . . . . . . TG . G . . G . . . . . . . GC . . . . . . T . . . . A . . . . . . . . . . . C . . . . . .
blockSeqs : . . GGGTGC GCT A . AT C T G . C A . . . T . . . . . . . . TG . G . . A
blockSeqs : . . GAGTGC GCT A . AT C T G . C A . . . . . . . . . . . . TG . G . . A
blockSeqs : . . GAGTGT CGA A . . C T G . A A . . . . . . . . . . . . TG . G . . .
blockSeqs : . . GGGTGC GCC A . . . T A . C A . . . . . . . . . . . . TG . T . .
blockSeqs : . . GAGTGC GCC A . . . T G . C A . . . . . . . . . . . . CG . G . .
blockSeqs : . . GGGTGC AGA C . . . G A . A A . . . . . . . . . . . . TA . G . .
blockSeqs : . . GAGTGC GCC A . . . T G . C A . . . . . . . . . . . . AA . A . .
blockSeqs : . . TGGTGC AA A . . . T G . A A . . . . . . . . . . . . AA . . . .
blockSeqs : . . GACTGC AA A . . . T G . A A . . . . . . . . . . . . A . . . .
blockSeqs : . . GAGTGC AA C . . . G A . A A . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . GGGTGC AT C . . . T A . C A . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . GGGTGC AC A . . . T G . A A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . AGGTGC AC A . . . G A . A A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . GGGTGC AC C . . . G A . T A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . GAGTGC GA A . . . T G . C A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . GGGTGC AC A . . . T A . C A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . AGGTGC AC A . . . T A . C A . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . GAGTGC AT T . . . T G . A A . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . GGGTGC GA C . . . G A . C A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . GGATGC GA A . . . T G . T A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . GGGTGC AT A . . . T A . A A . . . . . . . . .
blockSeqs : . . CGGTAC GA C . . . G A . A A . . . . . . . .
blockSeqs : . . AGGTGC AC C . . . G A . A A . . . . . . . .
blockSeqs : . . CAATGG AG C . . . G A . C A . . . . . . . .
blockSeqs : . . GTGTG AA A . . . G A . A A . . . . . . .
blockSeqs : . . GTGTG AC C . . . G A . A A . . . . . . .
blockSeqs : . . GAGTG GA C . . . G A . A A . . . . . . .
blockSeqs : . . GTGTG AC C . . . T A . A A . . . . . . .
blockSeqs : . . GCGTG AC C . . . G A . A A . . . . . . .
blockSeqs : . . ATGG GA A . . . G A . A A . . . . . . .
blockSeqs : . . ATGG GC A . . . T A . A A . . . . . . .
blockSeqs : . . ATGG GA C . . . G A . A A . . . . . . .
blockSeqs : . . ATAG GA C . . . G A . T A . . . . . . .
blockSeqs : . . ATGG GC C . . . G A . C A . . . . . .
blockSeqs : . . ATGC AC A . . . T G . A A . . . . . .
blockSeqs : . . ATGA GA A . . . T G . A A . . . . . .
blockSeqs : . . ATGC GA C . . . T A . A A . . . . . .
blockSeqs : . . ATGC AC C . . . G A . A A . . . . . .
blockSeqs : . . GTGT TT C . . . G A . A A . . . . .
blockSeqs : . . GTTC AA A . . . G A . A A . . . . .
blockSeqs : . . ATGA GA C . . . T A . A A . . . . .
blockSeqs : . . ATGC GA T . . . G A . A . . . . . .
blockSeqs : . . ATGA GC A . . . G A . A . . . . .
blockSeqs : . . ACGG AA A . . . G A . A . . . . .
blockSeqs : . . ATGG GA C . . . G A . A . . . . .
blockSeqs : . . ATAA GA C . . . T A . A . . . . .
blockSeqs : . . ATAC GA C . . . G A . A . . . . .
blockSeqs : . . ATGT GA C . . . G A . A . . . . .
blockSeqs : . . ATGG GA C . . . G A . A . . . . .
blockSeqs : . . GGTC GC A . . . G A . A . . . . .
blockSeqs : . . AGTC GA C . . . G A . A . . . . .
blockSeqs : . . GTTC GA A . . . G A . A . . . . .
blockSeqs : . . TTTG TC C . . . T A . A . . . . .
blockSeqs : . . GTTC GA C . . . G A . C . . . . .
blockSeqs : . . GTTG GA A . . . T A . A . . . . .
blockSeqs : . . GTGG GA A . . . G A . A . . . . .
blockSeqs : . . ATAG GA C . . . A A . A . . . . .
blockSeqs : . . ATGG GA C . . . G A . A . . . . .
blockSeqs : . . ATGA GC C . . . G G . A . . . . .
blockSeqs : . . ATGG AA C . . . G A . A . . . . .
blockSeqs : . . TTGA AC C . . . G A . A . . . . .
blockSeqs : . . TTGG GA C . . . T A . A . . . . .
blockSeqs : . . ATAG GA A . . . T A . C . . . . .
blockSeqs : . . ATGG AC A . . . G G . A . . . . .
blockSeqs : . . ATGC AC A . . . G A . A . . . . .
blockSeqs : . . ATGT GA A . . . G A . A . . . . .
blockSeqs : . . AATG AT C . . . G A . A . . . . .
blockSeqs : . . ATGC TC C . . . G A . A . . . . .
blockSeqs : . . ATGG AC A . . . T A . A . . . . .
blockSeqs : . . ATAG AC A . . . T A . C . . . . .
blockSeqs : . . GCTC AG C . . . G G . C . . . . .
blockSeqs : . . AAGG AC G . . . T A . T . . . . .
blockSeqs : . . ATGG AG A . . . T A . T . . . . .
blockSeqs : . . ATGG AC T . . . T A . T . . . . .
blockSeqs : . . ATGG AA A . . . T G . C . . . . .
blockSeqs : . . ATGG AC A . . . T G . C . . . . .
blockSeqs : . . ATGT AC A . . . T G . C . . . . .
blockSeqs : . . ATGT GC A . . . T A . T . . . . .
blockSeqs : . . GGG AC A . . . T A . C . . . . .
blockSeqs : . . GGG GA A . . . T G . T . . . . .
blockSeqs : . . GGG AA A . . . T G . C . . . . .
blockSeqs : . . GGG AT A . . . T A . T . . . .
blockSeqs : . . GGG AT A . . . T G . A . . .
blockSeqs : . . GGG GA G . . . T G . A . . .
blockSeqs : . . GGG AC C . . . T G . C . .
blockSeqs : . . GGG AC C . . . G A . A . .
blockSeqs : . . GGG AC A . . . A A . C . .
blockSeqs : . . GGG AC A . . . T A . T . .
blockSeqs : . . GTG AC C . . . G A . C . .
blockSeqs : . . GGG AA A . . . T G . C . .
blockSeqs : . . GGG A G . . . T G . T . .
blockSeqs : . . TGG A A . . . T G . C . .
blockSeqs : . . G A A . . . T G . . . .
blockSeqs : . G A A . . . T G . . . .
blockSeqs : . G C A . . . . C
blockSeqs : . G . . . . . .
blockSeqCons : ****
originalCons : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--TG----GC-GN-G-A--G-----C--G--G-GGCT-CGAACN-CACG--A-CCT-CC-CGATC-GCG-AGGCG---AGA-GCTCTA---AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--AT-TTCGACGATCATTGATCCTTCACTGACTGATAAATGCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAG-CCTGTCGGAAATGGAAA-CATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACATAAACGAGAAAGGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGNNCCATATGCTCAGT-TTAATG-GAGATCTTGGGCTATATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTATCCACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAATCCAGCTTAATACAATTCCATGCC-AACAT-ATCGTCATCTTGGAACAAAGAATTAGGAAAATGCAAGTATTCCGACATTAATATTAGAATATTAAAAATTCTCGGCGC-TTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATCTTATCTGTCATTGAGTTGTTTTCAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCC-TTTTTATCAATGATTTTATCTTCA-GACTGTTGACGCTGGAATCGCATTCCCTGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGAGGACGCCTATGTATAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAGTTCCGGATGGAAAGTG-AAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTGTTTACATGTTGATGAATTTATCACACACGACTGTTAGTACA-AGTTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACTGGAGGCATAGGGTCACATTTTGGGAGCAAAGTTT
finalCons : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--TG----GC-GN-G-A--G-----C--G--G-GGCT-CGAACN-CACG--A-CCT-CC-CGATC-GCG-AGGCG---AGA-GCTCT----AC---CAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--AT-TTCGACGATCATTGATCCTTCACTGACTGATAAATGCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAG-CCTGTCGGAAATGGAAA-CATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACATAAACGAGAAAGGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGNNCCATATGCTCAGT-TTAATG-GAGATCTTGGGCTATATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTATCCACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAATCCAGCTTAATACAATTCCATGCC-AACAT-ATCGTCATCTTGGAACAAAGAATTAGGAAAATGCAAGTATTCCGACATTAATATTAGAATATTAAAAATTCTCGGCGC-TTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATCTTATCTGTCATTGAGTTGTTTTCAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCC-TTTTTATCAATGATTTTATCTTCA-GACTGTTGACGCTGGAATCGCATTCCCTGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGAGGACGCCTATGTATAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAGTTCCGGATGGAAAGTG-AAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTGTTTACATGTTGATGAATTTATCACACACGACTGTTAGTACA-AGTTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACTGGAGGCATAGGGTCACATTTTGGGAGCAAAGTTT
Alignments
lowQualScore : 111111111111 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1111 1 1 1
lowQualScore : 111111 0 000 111111 0 333333333333 5555 2222 33333 22 0 0 22 00 0 0 0 11 0 111 22 0000 0 0000 0 6 4 111111 2 111111 0 0 0 11111111 1111 1 222222 2222 4444 444 1 22 22 333 333 2 33 44 3 1 3 3 0 2 0 3 3 22 2 0 0 5 2 3 66 0 0 3 55 55 66 5 0 66 3 0 0 3 2 2 5 3 1111 0 3 3 0 5 3
lowQualScore : ...... . ... ...... . ............ .... .... ..... .. . . .. .. . . . .. . ... .. .... . .... . . . ...... . ...... . . . ........ .... . ...... .... .... ... . .. .. ... ... . .. .. . . . . . . . . . .. . . . . . . .. . . . .. .. .. . . .. . . . . . . . . .... . . . . . .
lowQualScore : 222222 4 777 222222 4 111111111111 0000 8888 88888 77 4 4 22 55 4 4 4 22 4 111 22 9999 4 9999 4 9 1 222222 9 222222 4 4 4 66666666 8888 9 555555 0000 2222 555 6 55 66 333 999 9 99 22 1 7 2 2 0 5 0 2 2 00 5 0 0 5 5 2 55 0 0 2 00 88 55 0 0 55 2 0 0 2 5 5 0 2 8888 0 2 2 0 0 2
consensus : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--TG----GC-GN-G-A--GC-----G--G-GGCT-CGAACN-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-GCG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--AT-TTCGACGATCATTGATCCTTCACTGACTGATAAATGCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAG-CCTGTCGGAAATGGAAA-CATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACATAAACGAGAAAGGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGNNCCATATGCTCAGT-TTAATG-GAGATCTTGGGCTATATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTATCCACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAATCCAGCTTAATACAATTCCATGCC-AACATA-TCGTCATCTTGGAACAAAGAATTAGGAAAATGCAAGTATTCCGACATTAATATTAGAATATTAAAAATTCTCGGCGC-TTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATCTTATCTGTCATTGAGTTGTTTTCAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCC-TTTTTATCAATGATTTTATCTTCA-GACTGTTGACGCTGGAATCGCATTCCCTGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGAGGACGCCTATGTATAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAGTTCCGAATGGAAAGTG-AAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTGTTTACATGTTGATGAATTTATCACACACGACTGTTAGTACA-AGTTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACTGGAGGCATAGGGTCACATTTTGGGAGCAAAGTTT
Reference ( family-131 ) : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--TG----GC-GN-G-A--GC-----G--G-GGCT-CGAACN-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-GCG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--AT-TTCGACGATCATTGATCCTTCACTGACTGATAAATGCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAG-CCTGTCGGAAATGGAAA-CATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACATAAACGAGAAAGGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGNNCCATATGCTCAGT-TTAATG-GAGATCTTGGGCTATATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTATCCACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAATCCAGCTTAATACAATTCCATGCC-AACATA-TCGTCATCTTGGAACAAAGAATTAGGAAAATGCAAGTATTCCGACATTAATATTAGAATATTAAAAATTCTCGGCGC-TTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATCTTATCTGTCATTGAGTTGTTTTCAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCC-TTTTTATCAATGATTTTATCTTCA-GACTGTTGACGCTGGAATCGCATTCCCTGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGAGGACGCCTATGTATAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAGTTCCGGATGGAAAGTG-AAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTGTTTACATGTTGATGAATTTATCACACACGACTGTTAGTACA-AGTTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACTGGAGGCATAGGGTCACATTTTGGGAGCAAAGTTT
gi|4947 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GGC---GC------GGT-C--A--TG----GC-AA-T-A--GC-----G--G-GACT-CGAATT-CAC--TA-CCT-CC-CGGTT-GCG-AAGCG---AAC-G----C-T----C-C-AAC------T-AC------TG-AGG-TACC-GCCACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--AT-TTCGACGATCATTGATCCTTCACTGACTGATAAATGCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAG-CCTGTCGGAAATGGAAA-CATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACATAAACGAGAAAGGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGCGCCATATGCTCAGT-TTAATG-GAGATCTTGGGCTATATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTATCCACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAATCCAGC-TAATACAATTCCATGCC-AACATA-TCGTCATCTTGGAACAAAGAATTAGGAAAATGCAAGTATTCCGACATTAATATTAGAATATTAAAAATTCTC-GCGC-TTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATCTTATCTGTCATTGAGTTGTTTTCAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCCTTTTTTATCAATGATTTTATCTTCAGGACTGTTGACGCTGGAATCGCATTCCCTGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGA-GACGCCTATGTATAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAGTTCCGAATGGAAAGTG-AAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTGTTTACATGTTGATGAATTTATCACACACGACTGTTAGTACA-AGTTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACTGGAGGCATAGGGTCACATTTTGGGAGCAAAGTTT
gi|4948 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GGC---GC------GGT-C--A--TG----GC-AA-TTA--GC-----G--G-GACT-CGAATT-CAC--TA-CCT-CC--GGTT-GCG-AAGCG---AAC-G----C-T----C-C-AAC------T-AC------TG-AGG-TACC-GCCACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--AT-TTCGACGATCATTGATCCTTCACTGACTGATAAATGCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAG-CCTGTCG-AAATGGAAA-CATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACATAAACGAGAA-GGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGCGCCATATGCTCA---TTAATG-GAGATCTTGGGCTATATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTATCCACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAA-CCAGCT-AATACAATTCCATGCC-AACATA-TCGTCATCTTGGAACAAAGAATTAGGAAAATGCAAGTATTCCGACATTAATATT-GAATATTAAAAATTCTC-GCGCTTTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATCTTATCTGTCATTGAGTTGTTTTCAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCC-TTTTTATCAATGATTTTATCTTCA-GACTGTTGACGCTGGAATCGCATTCCCTGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGA-GACGCCTATG--TAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAGTT-CGAATGGAAAGTG-AAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTGTTTACATGTTGATGAA-TTATCACACACGACTGTTAGTACA-AGTTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACTGGAGGCATAGGGTCACATTTTGGGAGCAAAGTTT
gi|4949 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GGC---GC------GGT-C--A--TG----GC-AA-T-A--GC-----G--G-GACT-CGAATT-CAC--TA-CCT-CC-CGGTT-GCG-AAGCG---AAC-G----C-T----C-C-AAC------T-AC------TG-AGG-TACC-GCCACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--ATATTCGACGATCATTGATCCT-CACTGACTGATAAATGCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAG-CCTGTCGGAAATGGAAA-CATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACA-AAACGAGAAAGGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGGCCCATATGCTCAGTATTAATG-AGGATTTTGGGCTA-ATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTATC-ACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAATCCAGCTTAATACAATTCCATGCC-AACATAATCGTCATCTTGGAACAA-GAATTAGGAAAATGCAAGTATTC-GACATTAATATTAGAATAT-AAAAATTCTCGGCGC-TTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATCT-ATCTGTCATTGAGTTGTTTTCAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCC-TTTTTATCAATGATTTTATCTTCA-GACTGTTGACGCTGGA-TCGCATTCC-TGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGAGGACGCCTATGTATAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAGTTCCG-ATGGAAAGTG-AAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTGTTTACATGTTGATGAATTTATCACACACGACTGTTAGTACA-GATTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACT-GAGGCATAGGGTCACATATTGGGAGCAAAGTTT
gi|4950 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GGC---GC------GGT-C--A--TG----GC-AA-T-A--GC-----G--G-A-CT-CGAATT-CAC--TA-CCT-CC-CGGTT-GCG-AAGCG---AAC-G----C-T----C-C-AAC------T-AC------TG-AGG-TACC-GCCACC--------G----G-TCA------A----A----AA---AAA-AA--A--A---TAGGTG-A-CAAG-A--AT-TTCGACGAT-ATTGATCCTTCACTGACTGATAAA-GCCACTATTTTCTAAAATAGACGCGTTCAATCGAGGCCTGTCGGAAATGGAAAACATCATGGCGCACTCGCTTTCACACCACATCCATTCCAAATACGTTGTTAATGTACATAAACGAGAAAGGGTAATGCCATATGCCTTTTGAGAGTGATACACTTGGATACTTTCAGGCCCATATGCTCAGT-TTAATGAGAGATTTTGGGCTA-ATGAAGTCGTTATTGACAACTACACAGTGATGTACTGCTCACAAACTCACTTCTATCCACCCAGTGCGCATACTCCAATGACAGTGAATCCAGCTTAATACAATTCCATGCCAAACATA-TCGTCATCTTGGAACAAAGAATTAGGAAAATGCAAGTATT-CGACATTAATATTA-AATA-TAAAAATTCTCGGCGC-TTTTATATAATTTGTAAGTTATGTTACATATGTCTCTGGTTATATC-TATCTGTCATTGAGTTG-TTTCAGTTACCAATTATCACTGAGATTGATCACTTTTCATTATCACCC-TTTTTATCAATGATTTTATCTTCA-GACTGTTGACGCTGGAATCGCATT-CCTGCAAGAAAAATTTGCAAAACTCGAGAGGACGCCTATGTATAATTGTAATGGTGACTGGAGCTACAAGTC--GATGGAAAGTGAAAGCATCCCGAAAGTTTTATGTGTGAGAAACCTTGGGTTTCATCGGGGGCGTTG-TTACATGTTGATGAATTTATCACACACGACTGTTAGTACAGAGTTGTATGTATGGCTTTCTATTTATTTTCAATGACAACATGTTGCATTTTTATTTCTACGCCATTCCATACT-GAGGCATAGGGTCACA-TTTGGGAGCAAAGTTT
gi|4951 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--A--TA----GC-AT-A-A--GC-----G--G-GGCT-CGAACT-CAG--GA-CTC-CC-CGGTT-GCG-AAGCG---AAC-T----C-T----C-TAA-C------C-GC------TG-AGC-TACC-GCTACC--------G----G-T
gi|4952 : TTTCACGTCTTG------GGTTT-GAC---GC------GAC-C--A--TG----GC-AC-G-A--GC-----T--G-GGCT-CGAACT-CAC--GA-CCT-CC-CGGTT-GCG-AAGCG---AAA-G----C-T----C-TAA-C------C-ACTGAGCATG-AGC-TACC-ATGACC--------G----G-T
gi|4953 : TTTTACGCCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--A--TG----CC-AC-G-A--GC-----A--G-GTCT-CGAACT-CAC--GA-CCT-CC-CGTTG-ACG-AAGCG---AAC-A----C-T----C-C-AGC------C-AC------TG-AGA-TACC-GCGACC--------G----G-TC
gi|4954 : TTTAACGTTTTA------GGTTT-GGT---GC------GGC-C--A--TG----AC-AC-G-A--GC-----G--G-G-TT-CGAACT-CAC--GA-CCT-TC-CGGTT-GCG-AAGAG---AAC-G----C-T----C-TAA-C------C-AC------TG-AGC-TACT-GCGACC--------G----G-T
gi|4955 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GAGTG----CC-GA-G-C--AC-----G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TTA------A----A----AA---AAA-A
gi|4956 : TTTCATGTCGTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-T--A--TG----CT-AC-G-A--GC-----G--G-GGCT-CGAGCT-CAC--GA-TCT-TC-CGAAT-GCG-TAGCG---AAC-G----C-T----C-TAA-C------C-AC------TG-AGA-TACC-GCGACC--------G----G-TTA------A----A----
gi|4957 : TTTCATGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------AGC-C--A--TG----CT-AC-G-A--GC-----G--G-GGCT-CAAACT-CAC--AA-CCT-CC-CGGTT-GCG-AAGCG---AAA-G----C-T----C-T-ATC------T-AC------TG-AGC-TATC-GC
gi|4958 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAT---AC------GGC-C--G--TG----TC-AT-G-A--TA-----A--G-GGCT-CGAACT-CAC--GA-CAT-CC-CGGCC-GCG-AAGCACACAAACG----C-T----C-TAA-C------C-AC------TG-AGC-TACC-GCGACC--------A----G-T
gi|4959 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-T-C--AC-----G--G-AGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-GC------TG-AGC-CACC-GC-ACC--------G----G-TCG------A----A----AA---CAA-
gi|4960 : TTTAACGTCTTG------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--TT----CC-GA-G-C--AC-----G--G-GGCT-CGAACT-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGT-CACC-GCGACT--------G----G-TCG------A----ATTTCAA---AAA-AA--G--A---
gi|4961 : TTTCACGTCT-A------AGTTT-GAT---GT------GGT-C--A--TG----AC-AT-G-A--GC-----G--G-GGTT-CGAATT-CAC--GA-CCT-CC-CAATT-GCG-AAACG---AAC-G----C-T----C-T-ATC------C-AC------TG-AGC-TACT-G
gi|4962 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G---G----GT-GCAG-A--GCAC---G--G-GACT-CGAACG-CAC--GG-CCT-CC-CTATC-ACG-AGGCG---AAA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CATC-GCGGCA--------G----G-TAA------A----A----AAGGTAAA-AA--A--AGGGTAGTTG-A-C
gi|4963 : TTTCACGTCTAA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-A-C--AC-----G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGAAC-ACG-AGGCG---AGA-G----G-T----C-T-A-C------CAAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4964 : TTTCATGTCTTG------GGTTC-AAT---GC------AGC-C--A--TG----CC-AC-G-A--GC-----T--G-GGCT-CAAACT-CAT--GA-CCT-CC-CGGTT-GCG-AAGCG---AAT-G----A-T----C-TAA-C------C-AC------TG-AGC-TATT-GCGACC--------A----G-CC
gi|4965 : TTTCACGTTTTA------GATTT-ACC---GC------GGC-C--A--TG----AC-AG-G-A--G---------G-GACT-TGAACT-CCC--GA-CCT-CC-CGTTT-ACG-AAGTG---AAC-G----C-T----C-TAA-C------C-AC------TG-AGC-TA
gi|4966 : TTTC-TGTCTTA------GGGTT-GAA---GC------GGC-C--A--CG----GC-AA-G-A--GC-----G--T-GGCT-CGAACT-CAC--CA------C-CGGTT-ACG-AAGCG---AAC-G----T-T----C-TAA-C------C-AC------TG-AGC-TACA-GCGACC--------G----G-
gi|4967 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---TC------GGC-T--A--TG----GC-AC-G-T--GA-----T--G-GGCT-TTAACT-CAC--GA-CCT-CC-TGATT-GCG-AGGCA---AAC-G----T-T----A-TAA-C------C-AC------TA-AGC-TACCGGAGAAC--------A----G-CCA------A----A----AA---CAATAA--A--A-------------AAG-A--AT-T
gi|4968 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GAGTG----CC-GA-G-C--AC-----A--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACA-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4969 : TTTCACGTCTTA------GGTTG-GAC---GC------GGC-G--A--TA----AC-AC-A-A--GC-----G--G-GGTT-TGAACT-CAG--GA-CCT-TC-CGGTT-GCA-AAACG---AAC-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGT-TACC-GCGCCC--------G----A-T
gi|4970 : TTGCACGTCTTG------GGTTT-GAC---GC------GAC-C--A--TA----CC-AC-C-A--GC--------A-AACT-CGAACT-CAC--GA-TCT-CC-CGGTT-ATG-GAGCG---AAT-G----CTT----C-A-A-C------C-AC------TG-AG
gi|4972 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G------------A-G-C--AC-----G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TCA------
gi|4973 : TTTCACTTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GAGTG----TC-GA-G-C--AC-----G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TT-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TGA------A----A----A
gi|4974 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G------------A-A-C--AC-----G--G-GGCT-TGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4975 : TTTAACGTCTTA------GGTTC-GCC---GC------GGC-C--G---G----GT-GC-C-A--GCAC---G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGC-G----C-T----C-T-A-C------C-AT------TG-AGT-CACC-GCAACC--------G--------A------A----C----AC---AGA-AG--G--A---TAGATG-
gi|4976 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--TGT---GCCGA-G-C--AC-----G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-GGGCG---AGA-G----C-T----A-T-A-C------CAAC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----GTTCA------G----ATGT-AA---ATG-AA--A--A---
gi|4977 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-G-C--AC-----G--G-GGCT-TGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-GGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4978 : TTTAACATCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G------------A-G-C--AC-----G--G-GGCT-CGAACT-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----T-TCA------C----A----A
gi|4979 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---AC------GGC-C--GAGTG----CC-GA-G-C--AC-----G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATT-ACG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CACT-GCGACC--------G----A-T
gi|4980 : TTTTACGTCTTA------GGTTT-GAT---GC------GGC-C--G---G----GT-GC-G-A--GC-----ACAG-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-A----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TC
gi|4981 : TTTTACGTCTTA------GGTTT-GAC---GCAATCATGGCAC--G---G----GC-AC-G-A--GC-----T--G-GGCT-CGAACT-CAC--GA-CCT-AC-CGGTT-ACT-------------G----C-T----C-T-A-C------T-AC------TG-AGC-TACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4982 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-G-C--AC-----A--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------CAAC------TG-AGC-CACC-GCGACT---------------TCA------A----
gi|4983 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GAGTG----CC-GA-G-C--AC-----G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-G----A-T----C-T-A-C------A-AC------TG-AGT-CACC-GCGACC--------G----GATTA------A----A----
gi|4984 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G------------A-G-C--AC-----G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----
gi|4985 : TTCCACGTCTTG------GGTT--GTC---GC------GAC-T--A--TG----TC-AC-A-A--GA-----G--G-GGCT-CGAATT-TAC--GA-CCT-CC-CTGTT-GCC-AAGCG---AAT-G----T-T----CAA-A-C------A-AT------TG-AGG-TACC-TCGACA--------G----G-TTA------G----A----
gi|4986 : TTTAACATCTTT------GGTTT-AAC---GC------GGC-C--A--TG----GC-TT-A-A--GC-----G--G-TGCT-TGAACT-CGCATAA-CCT-CC-TCGTT-GCG-ATGCG---AAC-G----C-T----C-TAA-C------T-GC------TG-AAC-TACC-GAGACC--------A----G-T
gi|4988 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--GT----CC-AA-G-C--AC-----G--G-GGCT-CGAACT-TAC--GA-CCT-CC-CGCTC-ATG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TA-AGC-CACC-GTGACC--------G----G-TCA------G----A----
gi|4989 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-CTGG--TG----CC-GA-G-C--AC-----G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-T------C-AC------TG-AAC-CACC-GCGACC--------G----G-TC
gi|4990 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GGC---GC------GTT-C--GACTG----CC-GA-G-C--AC-----G--G-CGGT-CGAACG-CGC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CACC-GCGACG--------G----A-TCT------T----A----GA---AAT-AT--A--A----AGG-----CAA--A--AT----AACAAACATTGATC
gi|4991 : TTTCACGCCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGT-T--G---G----GT-GC-G-A--GC-----AC-G-GGCT-CGAAC---AC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CACT-GCGAAC--------G----G-TCT------A----A----A
gi|4992 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--TGT---GCCGA-G-C--AC-----G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-TC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------CAAC------TG-AGC-CACC-GC
gi|4994 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-CA-G--T-----CC-AA-G-T--GT-----G--G-GGCT-CGAACT-CAC--AA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGACA---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-TGA-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4995 : TTTCACGTTTTA------GGTTT-GAC---TC------G-C-C--G---G----GT-GCTG-A--GC-----ACAG-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-G----G-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TT-------G----A----AA---ATG-GC--A--A---CAAGTG-A-CGA--A--AT-TT
gi|4996 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAT---GC------GGC-C--G---G----GT-GCTG-A--GCAT---G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-TGATC-ACG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|4997 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-G--GAGTG----CC-GA-G-C--AT-----G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CCATC-ACG-AGGCG---AGA-G----C-T----------C------C-AC------TA-AGC-CACC-GCGACC--------G----GTTCA------A----A----TA---ATA-AA--T--A---TA
gi|4998 : TTTAACGTCTTA------GGTTG-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-G-C--AC-----G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------GTGA-G-TGA------T----A----AA---AA
gi|4999 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGT-C--G--AGT---GC-GA-G-C--AC-----G--G-GACT-CGAACT-CAA--AA-CCT-TC-CGATC-ACG-AAGCG---AGA-G----C-TCCGGC-T-A-C------C-AC------TG-AG
gi|5000 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-G-C--AC-----G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CT-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CACT-GCGACC--------G----G-T
gi|5001 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAC---GA------TTC-CAGG--TG----CC-GA-G-C--AC-----G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-A----C-T----C-T-A-C------CAAC------TG-AGG-CACC-GCG-TC--------T----T-TTA------A----T----TA---AAA-GA--G--A----AGGCG-A-CGAG-G--AT----AACGAACAGTGATC
gi|5002 : TTTCATGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G---G----GT-GC-G-A--GC-----AC-G-GACG-CAAACG-TAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCA---AAA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|5003 : TTTCACGTCTTA------GGATT-GAC---GC------GCC-C--G--TGT---GCCGA-G-C--AC-----G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-TC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------CAAC------TG-AGT-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|5004 : TTTCACGTCTTA------GGTTTTGAC---GA------GGC-C--G---G----GT-GCCG-A--GCAT---G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-AGATC-ACG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CACC-ACGACC--------G----G----------A----A----GA---GAA-GA--A--A---TAG
gi|5005 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-G-C--AC-----G--G-GGCT-CGAACG-CGC--GA-CTT-CC-CAATC-ACA-AAGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGT-CATC-ACGACC--------G----G-TC
gi|5006 : TTTTACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--TT----CC-GA-G-C--AC-----G--G-GGCT-CGAACT-CAC--GA-C---TC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-TACC-GCGACC--------
gi|5007 : TTTAACGTCGTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G---G----GT-GCCG-A--GCAT---G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ATG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------CAAC------TG-AGC-CACC-GCAACC--------G----G-TC
gi|5008 : TTTTATGCCTTG------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--T--TT----GC-TC-G-A--GC-----G--G-GGCT-CAAAAT-CGC--AA-CCT-CT-TGGTT-ACG-AAGCG---AAC-G----C-T----C-T-A-C------C-AA------TG-AGC-TACC-GTAACC--------A----G-TGA------A----
gi|5009 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--CGT---GCAGA-G-C--AC-----G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCG-TT-CGATC-ACG-AGGCA---AGA-G----C-T----C-T-G-C------C-AC------TG-AGG-CACC-GCGACC--------G----A-T
gi|5010 : TTTCACGTCTTA------GGTTA-GAC---GC------AGC-T--GAGTG----CC-GA-G-C--AC-----G--G-GGCT-CGAACA-CAC--GA-CCT-CC-CGGTC-ACG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AAC-CACT-GCAACC--------G----G-T
gi|5011 : TTTCAAGTCTTA------TGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-G-C--AC-----G--G-GGCT-CGAACG-CAC--AA-CCT-CC-CGATC-GCA-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CACC-GCGCCC--------G----G-T
gi|5012 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAT---GC------GGC-CAGG--TG----CC-GA-G-C--AC-----G--G-GGCT-CGAAC--CAC--AA-CCT-CC-TGATCAGCG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CACC-GTGACT--------G----G-TCA------
gi|5013 : TTTCACGTCTAA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GAGTG----CC-GA-G-C--AT-----G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TA-AGC-CACC-GAAACCTACTGATGG----G-TCA------A----A----AA---TAA-GA--
gi|5014 : TTTTACGTCTTA------G--TT-GAC---GC------GGC-T--G--TG-----C-GA-G-C--AC-----G--G-GGCTTCGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---A-A-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-T
gi|5015 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC-------GC-C--G---G----GT-GC-C-AACAC-----G--G-GCCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-C-ATC-AC--AAGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TC
gi|5016 : TTTAACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------AGC-C--G--TT----CC-AA-G-A--AC-----G--G-GGTT-CGAACT-GAC--GA-CCT-CC-TGATC-ACG-AGACA---AGA-G----C-T----A-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TC
gi|5017 : TTTCATGTCTTA------GGTTT-TAC---AC------AGC-C--A--TGTATGGC-AC-A-A--GC-----G--G-GGCT-TTAACT-CAT--GG-CCT-AC-CGGTT-GGG-GAGCG---AAC-G----C-T----C-T-AGC------C-AC------AG-AGC-TAC---CAACT--------G----G-TCA------
gi|5018 : TTTAACGTCTTA------GTTTT-GTC---GC------AGC-C--G---G----GT-GCCG-A--AC-----AC-G-GGCC-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CACC-GCGATC--------G----G-TGACTGTCTA----T----AA---AAT-AT--A--A---T-GGTA-A-CAGT-A--GT-TT
gi|5019 : TTTCACGTCTT-------GGTTT-GACCGCGC------GG-----G--TT----GC--C-G-A--AC-----AC-G-GGCT-CGAACG-CAC--GAACCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-A------C-AC------TG-AGC-CACT-GCAACC--------G----G-TGA------A----
gi|5020 : TTTCACGTCTTA------GGTTG-GAC---GC------GGC-C--G--TG----G----------------------GACT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-AGACC-ACG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CAAC-GCGACC--------G----G-T
gi|5021 : TTTCACGTCTTA------AGTTT-GAC---AT------GAC-C--GGGTG----CC-GA-G-C--AC-----G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GC-CCT-CC-CAATC-ACG-AGGCG---ATA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TCC------AGGCGA----TA---GAA-AA--A--G---TA---A-A-AAAG-A--AT-
gi|5022 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---AC------AGC-C--GGATG----CC-GA-G-C--AC-----G--G-GGCT-CGAACG-CAT--GA-CCT-CC-CGCTC-ACG-AGGCC---AGA-GCTCTC-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CACC-GTGACC--------G----G-T
gi|5023 : TTTCTCATCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--A--TA----GT-AC-G-A--GC-----G--G-GGTT-CGAACT-CAC--GA-CCT-AC-CGAT--ACG-AAGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-T------C-AC------TG-AAC-CACC-GC
gi|5024 : TTTTACGTCTTA------AGTTT-GAT---GC------GGT-C--A--TG----GC-AC-G-A--GC-----G--A-GGTT-CAAACT-CGC--GA-CCT-CC-CGGTT-GCG-AGGC
gi|5025 : TTTCACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--GGGTG----CC-GA-G-C--AC-----G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AG------------------A-C------C-AC------TG-AGC-CAC
gi|5113 : TTTACGTCTGA------TGTTT-GAC---CA------AGC-T--A--TG----AC-AT-T-G--GC-----A--G-GACT-CCAACT-CAC--GA-CCT-CT-AGGTT-ACA-AAGCG---AAC-G----C-T----C-T-A-CCACCTGC-AC------TA-AGC-TATC-GCTACC--------G----G-TCA------A----G----AA---AGA-AA--G--G---TAAGAGCA-CATG-A--TT-TTaggttaa
gi|5114 : TTTACGTCTGA------GGTTT-GAC---GT------GGT-C--A--TG----GC-TC-G-A--GC-----G--G-GACT-CAAACT-TAC--AA-CCT-TC-CAGTA-ACA-AAGCG---AAC-G----C-T----C-T-A-A------C-AC------TG-AGC-TACT-GCGGCA--------G----G-TCT------A----A----
gi|5116 : TTTACGTCGTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--T--TG----AC-AC-T-T--AC-----G--G-GGCC-TTAACT-CAC--AA-CCT-CC-TGGTT-GCGAAGGCGA--AGT-G----C-T----C-TAA-C------A-AC------TGAAGC-TACC-GCGTCC--------GAATTG-ACA------T----A----AACC-AAA-AACTA--A---TA
gi|5117 : TTTACGTCCTA------GATTT-AAC---TC------GGG-T--T--TG----GT-AC-G-A--AC-----A--T-GGCT-TGAACT-CAC--AA-CCT-TC-CTGTT-GCG-AAGCG---AGT-G----C-T----T-T-A-C------C-AC------TG-AGCTCATC-GCGACC--------G----G-TCA------A----T----AA---AAA-
gi|5118 : TTCCCGTCTTA------GATTT-GGC---GC------GGC-C--A--TA----GC-AG-G-A--GT-----T--T-GGCA-TACACT-CAC--AA-A---CC-CGATT-GGA-AAGCG---AAT-G----C-T----C-TAA-C------T-AC------TG-AGC-AACC-GCAACC--------G----G-TGA------A----A----TA---A
gi|5119 : TTTACGACTTA------GATTT-GAC---GC----------------TG----GT-AC-G-A--GC-----G--G-AGCT-CGCACT-CAC--GA-CCT-CC-CAGTT-ATG-AGGCG---AAC-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TTA------A----
gi|5145 : TTACGTCGTA------GGTTT-GAC---GT------ACC-C--A--TG----GC-AG-G-A--AC-----A--G-GACT-CGAGCT-CAC--GA-CTT-CC-CAGTT-ACA-AAGCG---AAC-G----C-A----T-T-A-C------C-AC------TG-AGA-TACC-GCAATC--------G----G-TC
gi|5146 : TCACGTCTTC------GGTTT-GAC---GC------AGC-C--A--TG----CT-AC-G-A--GT-----G--G-GTCT-CGAATT-CAC--GA-CCTACCGCGGTT-GAG-AAGCG---AAC-G----C-G----C-TAA-C------C-AC------TT-AGC-TACC-GCGACC--------G----G-T
gi|5147 : TTACATCTCA------GGCTT-GCC---GT------GGC-C--A--TG----TA-AA-G-A--GC-----G--G-GATT-CGAACT-CAC--AA-CCT-CC-CGGTT-GCG-AAACA---AAT-G----A-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AAC-TACC-ACGACC--------G----G-TC
gi|5149 : TTACGTCT-A------AGTTT-AAC---GC------GGT-C--A--AT----GT-AC-G-A--GC-----G--G-GGCT-CGAACT-TGC--AA-TCT-CC-CGGTT-ACG-TAGCG---AAC-G----C-T----C-TAA-C------G-AC------TG-AGC-TATT-GCGAC
gi|5157 : CACGACTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--A--TG----CC-AC-T-A--GC-----A--G-GGTT-CGAACT-CAC--GA-CTC-TG-TGGTT-GCA-AAACG---AAT-G----C-T----C-T-A-
gi|5160 : ACGTCTTAAATGTAGGTTT-GAC---GC------GGC-C--A--TG----GC-GC-G-A--AC-----G--G-GGCT-TGAACT-CAC--TA-CCT-CC-CGTTT-GCG-AATCG---AAC-G----T-T----T-TAA-T------C-AC------TG-AGC-TATC-GCGACC--------G----G-Tactac
gi|5161 : ACATCTTA------GGTTT-GAC---AC------GGC-A--A--TA----GC-AC-G-G--GC-----A--G-GACT-CGAACT-CAG--TA-CCT-CC-CGGTG-GCG-AAGGG---AAT-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-TACC-ATGACC--------
gi|5162 : ACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-CCGG--TA----CC-GA-G-C--AC-----G--G-GGCT-CGTACT-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AAC-CACC-GCGACC--------G----GTTC----------------------AAC-AC--A--A---TAGGAA-AGCAAA-ATTAT-TTC-ACAATC
gi|5163 : ACGTCTCA------GGTTT-GAC---GC------GGC-C--G--CT----CC-AA-G-C--AC-----G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-CC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-CACC-GTGACC--------G----G-TC
gi|5164 : ACGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGT-C--A--AG----GC-AT---A--GTTCTCTG--G-GGAT-CTCACA-CAC--GA-CC--CC-CGGTT-ACA-AAGCG---AAC-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------AG-AGT-TATC-GCAAAC--------G----G-TTG------G----A----AT---AAT-AA--ATTA---TAAGAA-A-TAAGCA--AT-
gi|5176 : CGTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GTT-C--A--TG----GC-AT-G-A--AC-----T--G-GGTT-CGAACT-CAC--GA-CCT-C
gi|5181 : GTCTTA------GGTTT-GAC---GC------GGC-CAGG--TG----CA-GA-G-C--AC-----G--G-GGCT-CGAACG-CAC--GA-CCT-TC-CGATC-ACG-AGGCG---AGA-G----C-T----C-T-A-A------C-AC------TG-AGC-CACC-GCGACC--------G----G-TCA------atggttacaaaacaaactcca
gi|5187 : TCTAA------GGTTT-GAC---GC------GGC-CCAA--TG----GC-AC-G-A--GC-----A--GTGGCT-CGAACTTCAC--GA-CCT-CC--GGTT-GCG-AA-CG---AAC-G----C-T----C-C-AAC------C-AC------TG-AGC-TACC-GCGACC--------G----A-TAA------A----
gi|5192 : CCTA------TGTTT-GAC---GC------CGC-C--A--TG----GC-AC-A-G--GC-----A--G-GGCT-CAAACT-CAC--AA-CGT-TC-CGGTT-GCA-AAGCG---AAT-G----C-T----C-T-A-C------C-AC------TG-AGC-TACC-GCGACC--------G----A-TC
gi|5203 : A------GGTTT-GAC---GC------AGC-C--A--TG----GC-AC-G-A--GC-----A--A-GGCT-CGAATT-CAC--GA-CCT-CC-CGGTT-GCA-AAGCG---AAC-G----C-T----C-TAA-C------C-AC------TG-AGC-TACC-ACGACC--------A----G-TCA------G----G----AA---
gi|5209 : GTTT-GAC---AC------GGT-C--A--TG----GC-AC-A-A--GT-----G--G-GACT-CAAATT-CAC--AA-CCT-TT-CTGTT-GCG-AAACG---AAC-A----C-C----C-T-A-C------C-AC------TG-ATC-TACC-GCGACC--------G----G-
gi|5212 : TTC-GGC---GC------AGT-C--A--TG----TC-AC-G-A--GC-----G--G-GGCT-TGAACT-CAC--GA-TCT-CC-CGGTA-GCG-AAGCG---AAT-G----C-T----C-T-AGC------C-AC------TG-AGC-TACC-GCAACC--------G----G-TAA------A----T----GA---AAA-TG--A--A---TA
gi|5213 : TTT-GAC---GT------GGC-C--A--TG----TC-AA-G-A--GC-----G--G-GGCT-CAAACT-CAC--GA-CCT-CC-TTGTT-CCG-AGGCA---AAC-G----C-T----C-TAA-C------C-AC------TG-AGC-TACC-GCGACC--------A----G-TGA------A----A----