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Reference ( gi|101918 )       : TTAA---AG-A-G-G--T-T-C---T-A---GG-G----T--GA-G-G-TT-T----A------------------A-AG---T-GA----T-G-T--CAAT--TTTT----T----G--G---------G--A-A-G-T--G----------T-A---T---TT----T--------G----AT--T-T-C-T--A-C-AT--T-G-A-A--AGA-G-A-A-T----C-G---GG-AAA-T-TA-AA---AAAGA-AAA-----------AA------------T--C-T---G---G--T--TT-T--C----A------------------TG----C-T-TGT---TT--T--C--G--A-G-C---T--A-C------A-G-----T-G---TT-T-T----A---AA------C-A-T-GA--C--C--TT--TT-T-G----CA-C--T-T----A-AA-A--T-T--T--A---C-T---C----A---A-G-AT--T-T-A------T-T-C-----A-T--T-T-A------A-A-----CT--C-CA-T-T--A-GT-C-A-G-T------T----G-G--T--G-T--A--A-A-C-------AA-A-A-C-A--T--A---A-----G-G-A--A---T------A--C-A-G-A----------T-AA-A-T-------------C-A-----T-T-A------C-A----T--G-A----A------A-T-A-G--A--T-A-C----A-CA--A-T-----A-AT-G---TC-TT-C---T-T---------A-C---TA-T-A-C-A--G-------------------------A--T--A-T------A--------A-A-----A-------A-------A--A-------A-G-A--T--T--T-T---AA------T-A-----C--T-----T----G-T-A-A---T---G---G--A--A--A---T-A--A-A-T--AA-T--G---A--C---C--T-T-T-CT-G-C-A-C-T-T--G---A------T---A-T-A--C---A--G------------A---A-A-A-----A---C----T-C--A-T---A-AT-A-T-C-G---A----A---T-----TT-C-AG-A---G--T---T---------A--------A-A-A---A--A--T---------A-----C-A--T-T-------T-T--A-GG---A--G--T-G-A--TG-T------C-A--A--T--T--T-C-T--T--A-A----A-A--T-T-C--A--C--G--T---A------A--T-A--T--T---C---AG-A-G---T-C-T--T--G--T-C---T--C--A-A--A-A--T---T-T-----A------AA---A--TG-------G-CA--C--T-----T------T-------A---A--A-A-A--G--------T-A------G--A--G--G-A---T------T--T---C--------G--G--T------------C-A-A----A--TT-T-T--T---A-A---A-A----T-A--T-T----G-G---C--C---A----A---A---T-A--C-T---------G-A--T-TT---T--T-T------G----C--A-C-------A---G--A-A--T---T-TC--G-A--G-T-AA-A-----T-T-G-A--CAT-T--GG--A--C---T---T-TTTA---AA-G-A-A-T---A-------T------GT--A-T-T----C--TG---TT--T----G----G--A---A---A-A---A-----T--AC-C---TC---A-A--CA----A----A-A--T--A-A--T---------A-A--T----A-A--T-A---A----TA----T------T--T-----G-----G-A-C--T--A-----G--T-T-C-C---A--A-G-----T--C--T-C-----G--------T----C--TA--C--T-T--G--TA-TC--A-T----------T---A-----A------T----T----T--A--A-AA--CT-G----T-A--A-TA-T-A----C--G--A---A---T---A-GGAG--T--A------T-A-A------A-AA---TA-G-A-AG-G-T-A-T-A-TT--G---G----A--TGA----A----A-A--A-AG-AA-AC-T-------G-T--A-AA-A-T-C-AT--G------------C------------T----------T--TT----T---------G--------A-----TT---------G--A-T-C--A---A--T-CC-T-TCCGCCA
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gi|101921                     : TTAA---AG-A-G-G--T-T-C---T-A---GG-G----T--GA-G-G-CT-T----A------------------A-AG---T-GA----T-G-T--CAAT--TTTT----T----G--G------------A-A-G-T--G----------T-A---T---TT----TT-------G----AT--T-T-C-T--A-C-AT------A-A--AGA-G-A-A-T----T-G---GG-AAA-T-TA-AA---GAA-----------------AA------------T--T-T---G---GG-T--TT-T--C----A------------------TG----C-T-TGT---TT--T--C--A--A-G-C---T--A-C------A-G-----T-G---TT-T-TT---A---AA------C-A-T-GA--C--C--TT--TT-T-G----CA-C--T-T----A-AA----T-T--T--A---C-T---T----G---A-G-AT--T-T-A------T-C-C-----A-T--T-T-A------A-A-----CT--C-CA-T-T--C-GT-C-T-G-TG-----T----G-G--T--G-T--A--A-A-C-------AA-A-A-C-A--T--C---A-----G-G-A--A---T------A--T-A-G-A----------T-CA-A-T-------------A-A-----T-T-A------C-A----T--G-A----A------A-T-A-G--A--T-A-C----A-TA--A-T-----A-AT-G---TC-TT-C---T-T---------A-C---AA-T-A-C-A--G-------------------------A--T--A-T------A--------A-A-----A-------A-------A--A-------A---A--T--T--T------A------T-A-----C--T-----T----G-T-A-A---T---G---G--A--A------T-A--A-A-T--AA-T--G---A--C---C--T-T-T-CT-G-C-A-C-T-T--G---A------T---A-T-A--C---G--G------------A---A-A-A-----A---C----T-C--A-C---G-AT-A-T-G-A---G----A---T-----TT-C-AG-A---G--T---T---------A--------A-A-A---A--A--T---------A-----C-A--T-T-------T-T--A-GG---A--G--T-G-A--TG-T------C-A--A--T--T--T-C-T--T--A-A----A-A--T-T-C--A--C--G--T---A------A--T-A--T--T---C---AG-A-G---C-C-T--T--G--T-T---T--CA-A-A--A-A--T---T-T-----A------AA---A--TG-------G---------------------------------A--A-A-A--G--------T-A------G--A--G--G-T---T------T--T---C--------G--G--T------------C-A-A----AT-TT-T-T--T---A-A---A-A----T-A--T-T----G-G---C--C---A----A---A---T-A--C-T---------G-A--T-TT---T--T-T------G----C--A-C-------A---G--A-A--T---T-TC--G-A--G-T-AA-A-----T-T-G-A---AT-T--TG--A--C---T---T-TTTA---AA-G-A-A-T---A-------T------GT--A-T-T----C--TG---TT--T----G----G--A---A---A-A---A-----T--AC-C---TC---A-A--CA----A----A-AT-T--A-A--TA--------A-A--T----A-A--C-A---A----TA----T------T--T-----G-----A-A-C--T--A-----G--T-T-C-C---A--A-G-----T--C--T-C-----A--------T----C--TG--C--T-T--G--CA-TC--A-T----------T---A-----AT-----T----T----T--A--A-AA--CT-G----T-A--A-TA-T-A----C--G--A---A---T---A-GG-G--T--A------T---A------A-AA---TA-G-A-AG-G-T-A-T-A-TA--G---G----A--TG-----A----A-T--T-AG-AA-AC-T-------G-T--A-AA-A-T-C-AT--G------------C------------T----------T--TT----T---------G--------A-----TT---------A--A-T-C--A---A--T-CC-T-TCCGCCAttc
gi|101920                     : TTAA---AG-A-G-G--T-T-C---T-A---GG-G----T--GA-G-G-TT-T----G------------------A-AG---T-GA----T-G-T--CAAT--TTTT----A----G--G---------G--A-A-G-T--G----------T-A---T---TT----TT-------G----AT--T-T-C-T--A-C-AT--T-G-A-A--AGA-G-A-A-T----C-G---GG-AAA-T-TA-AA---CAG---AAA-----------AA------------T--T-G---G---G--T--TT-T--C----A------------------TG----C-T-TGT---TT--T--C--G--A-G-C---A--C-C------A-G-----T-G---TT-C-T----A---AA------C-A-T-GA--C--C--TT--TT-T-G----CA-C--T-T----A-AA-A--T-T--T--A---C-T---C----A---A-G-AT--T-T-A------T-T-C-----A-T--T-T-A------A-A-----CT--C-CA-T-T--C-GT-C-T-G-T------T----G-G--T--G-T--A--A-A-C-------AA-A-A-C-A--T--G---A-----G-G-A--A---T------A--C-A-A-A----------T-CA-A-T-------------C-A-----T-T-A------C-A----T--G-A----A------A-T-A-G--A--T-A-C----A-TA--A-T-----A-AT-G---TC-TT-C---T-T---------A-C---AA-T-A-C-A--G-------------------------A--T--A-T------A--------A-A-----A-------A-------A--A-------A-A----------T-T---AA------T-A-----C--TTGTACT----G-T-A-A---T---G---G--A--A--A---T-A--A-A-T--AA-T--G---A--C---C--T-T-T-TT-G-C-A-C-T-T--GA--A------T---A-T-A--C---T--G------------A---A-A-A-----A---C----T-C--A-T---G-AT-G-T-C-G---A----A---T-----TT-C-AG-A---G--T---T---------A--------A-A-A---A--A--T---------A-----C-A--T-T-------T-T--A-GG---A--G--T-G-A--TG-T------C-A--A--T--T--T-C-T--TA-A-A----A-A--T-T-C--A--C--G--T---A------A--T-G--T--T---C---AG-A-G-----C-T--T--G--T-C---T--C--A-A--A-T--C---T-T-----A------AA---A--TG-------G-AA--C--T-----T------T-------A---A--A-A-A--G--------T-A------C--A--G--G-A---T------T--T---C--------G--G--T------------C-A-A----A--TT-T-T--T---T-A---A-A----C-A--T-T----G-G---C--CA--A----A---A---T-A--C-T-------------------------------------------------------G--A-A--T---T-TC--G-A--G-T-AA-A-----T-T-G-A---AT-T--GG--A--C---T---T-TTTA---AA-G-A-A-T---A-------T------GT--ATT-T----C--TGT--TT--T----G----G--A---A---A-A---A-----T--AC-C---TC---A-A--CA----A----A-A--TC-A-A--TA--------A-A--T----A-A--C-A---A----TA----T------T--T-----G-----A-A-C--T--A-----G--T-T-C-C---A--A-G-----T--C--T-CA----A--------T----C--TA--C--T-T--G--TA-TC--A-T----------T---A-----AT-----T----T----T--A--A-AA--CT-G----T-A--A-TA-T-A----C--G--A---A---T---A-GGGG--T--T------G-A-A------A-AA---TA-G---AG-G-T-A-T-A-TT--G---G----A--TG-----A----A-A--T-GG-AA-AC-T-------G-T--A-AA-A-T-C-AT--G------------C------------T----------T--TT----T---------G--------A-----TT---------A--A-T-C--A---A--T-CC-T-TCCGCCA
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gi|101923                     : TTAA---AG-A-G-G--T-T-C---T-A---GG-G----T--GA-G-G-TT-T----A------------------A-AG---T-GA----T-G-T--CAAT--TTTT----TT---G--G---------G--A-A-G-T--G----------T-A---T---TT----TT-------G----AT--T-T-C-T--A-C-AG--T-G-A-A--AGA-G-A-A-T----C-G---GG-AAA-T-TA-AA---AA-GA-AAA-----------AT------------T--T-T---G---G--T--TT-T--C----A------------------TG----C-T-TGT---TT--T--TA-G--A-G-T---T--A-C------A-G-----T-G---TT-T-T----TTTTAA------C-A-T-GA--C--C--TT--TT-T-G----CA-C--T-T----A-AA-A--T-T--C--A---C-T---C----A---A-G-AT--T-T-A------T-T-C-----A-T--T-TTA------A-A-----CT--C-CA-T-T--C-GT-C-T-G-T------T----G-G--T--G-T--A--A-T-C-------AA-A-A-C-A--T--A---A-----G-G-A--A---T------A--C-A-A-A----------T-CA-A-T-------------C-C-----T-T-A------C-A----T--G-A----A------A-T-A-G--A--T-A-C----A-TA--A-T-----A-AT-G---TC-CT-C---T-T---------A-C---AA-T-A-C-A--G-------------------------A--T--A-T------A--------A-A-----A-------A-------A--A-------G-A-A--A--T--T-A---AA------T-A-----C--T-----T----A-A-A-A---T---G---G--A--A--A---T----A-A-T--AC-T--G---A--C---C--T-T-T-TT-G-C-A-C---T--G---A------T---A-T-A--C------G------------G---A-A-A-----A---C----T-C--A-T---G-AT-A-T-CGG---A----A---T-----TT-C-AA-G---T--T---T---------A--------A-A-AATTA--A--T---------A-----C-A--T-T-------T-T--A-GG---A--G--T-G-A--TG-T------C-A--A--T--T--T-C-T--T--A-A----A-A--T-T-C--A--C--G--T---A------A--T-A--T--T---C---AG-G-G---T-G-T--T--G--T-C---T--C--A-A--A-A------T-T-----A------AA---A--TG-------G-AA--C--------T------T-------G---A--A-A-A--G--------T-A------G--A--G--G-A---T------T--T---C--------G--G--T------------C-A-A----A--TT-T-T--TA--A-A---A-A----T-A--T-T----G-G---C--CA--A----A---A---T-A--C-G---------G-A--T-TT---T--T-T------G----C--A-C-------A---G--A-A--T---T-TT--G-A--G-T-AA-A-----T-T-G-A---AT-T--GG--A--C---T---T-TTTA---AA-GAA-A-T---A-------T------GT--A-T-T----C--TA---TT--T----G----GA-A---A---A-A---A-----T--AC-C---TC---A-A--CA----AT---A-A--T--A-A--TA--------A-A--T----A-A--C-A---A----TA----T------T--T-----G-----A-A-C--T--A-----G--T-T-C-C---A--A-G-----T--C--T-C-----A--------T----T--TA--C--T-T--G--TA-TA--A-T----------T---A-----AT-----T----T----T--A--A-AA--CT-G----T-A--A-TA-T-A----C--G--A---A---T---A-GGGG--T--A------T-A-G------A-AA---TA-G-A-AG-G-T-A-T-G-TT--G---G----G--TG-----A----A-A--T-AG-AA-AC-T-------G-T--ATAA-A-T-C-AT--G------------C------------T----------T--TT----T---------G--------A-----TC---------A--A-T-C--A---A--T--C-T-TCCGCCA
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gi|101927                     : TTAA---AG-A-G-G--T-T-C---T-A---GG-G----T--GA-G-G-TT-T----G------------------G-AG---T-GA----T-G-T--CAAT--TTTT----T----G--G---------G--A-A-G-T--G----------T-AG--T---TT----T--------G----AT--T-T-C-T--A-C-AT--T-G-A-A--AGA-A-A-A-A----C-G---GG-GAA-T-TA-AA---AAGAA-AAA-----------AA------------T----G---G---G--T--TT-T--C----A------------------TG----C-T-CGT---TT--T--C--G--A-G-C---T--A-C------A-G-----T-G---TA-T-T----A---AA------C-A-T-GA--C--T--TT--TT-T-G----CA-T--T-T----A-AA-A--T-T--T--A---C-T---CAATTA---A-G-AT--T-T-A------T-T-C-----A-T--T-T-G------A-A-----CC--C-CA-T-T--C-GT-C-T-G-T------T----C-G--T--G-T--A--A-A-C-------AA-A-A-C-A--T--A---A-----G-G-A--A---T------ATTT-A-A-G----------T-TA-A-T-------------C-A-----T-T-A------C-A----T--G-A----A------A-T-A-G--A--T-A-C----A-TA--A-T-----A-AT-G---TC-TT-C---T-T---------A-C---AA-T-A-C-A--G-------------------------A--T--A-T------A--------A-A-----A-------AAG-----A--A-------A-G-A-----T--T-T---AA------T-A-----C--T-----T----G-T-A-A---T---G---G--A--A--A---T-A--A-A-C--AA-T--G---A--T---C--T-T-T-CT-A-C-A-C-T-T--G---A------T---A-T-A--C---G--GA-----------A---A-A-A-----A---C----T-C--A-T---G-AT-A-T-T-G--------A---T-----TT-C-AG-A---G--T---T---------A--------AGA-A---A--A--T---------A-----C-T--T-T-------T-T--A-GG------G--T-G-A--TG-C------C-A--A--T--G--T-CTT--T--A-A----A-A--T-T-C--A--C--G--T---A------A--T-A--T--T---C---AG-A-G---T-C-T--T--G--T-C---T--C--A-A--A-A--T---T-T-----A------AA---A--TG-------G-CA--C--T-----T------TAG-----A---A--G-A-A--G--------T-A------G--A--G--G-A---T------T--T---C--------G--G--T------------C-A-AT---A--TT-T-T--A---A-A---T-A----T-C--T-T----G-G---T--CA--A----A---A---T-A--C-T---------G-A----TT---T--T-T------G----C--A-C-------A---G--A-A--T---G-TC--G-ACGA-T-AA-A-----T-T-G-A---AT-C--GG--A--C---T---T-TTTA---AA-G-A-A-T---A-------T------GT--A-T-T----C--TG---TT--T----G----G--AGAGG---A-A---A-----T--A--C---TC---A-A--CA----A----A-AT-T--G-A--T---------A---------A-A--T-AGC-A----TA----T------T--T-----G-----A-A-C--T--A-----G--T-T-C-C---A--A-G-----T--C--T-C-----A--------T----C--TA--C--T-T--G--TA-TC--A-T----------T---A-----AT-----T----T----T--A--A-AA--CT-G----C-A--A-TA-T-A----C--G--A---A---T---A-GGGG--T--A------T-A-G------A-AA---TT-G-A-AG-G-T-A-T-A-TT--G---G----A--TG-----A----A-A--T-AG-AA-AC-T-------G-T--A-AA-A-T-C-AT--G------------C------------T----------T--TT----T---------G--------A-----TT---------A--A-T-C--A---A--T-CC-T-TCCGCCA
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gi|102030                     :   AA---AG-A-G-G--T-T-A---T-A---GG-C----T--GA-T-A-TT-T----G------------------G-AG---T-GA----T-G-T--AAAT--TTTT----T----G--G---------A--A-A-G-T--G----------T-G---T---TT----TT-------G----AT--T-T-T-T--A-C-AT--T-G-A-A------G-A-A-T----T-G---GG-AAA-T----AG---AAAGA-AAA-----------AA------------T--G-G---G---G--T--TA-C--C----A------------------TG----C-T-TGT---TT--T--C--G--A-G-C---T--A-C------A-G-----T-G---TT-C-T----A---AT------T-A-T-GA--C--C--TT--TT-T-G----CA-C--T-T----A-AA-A--T-T--T--T---C-T---C----C---A-G-AT--T-T-A------G-TACTAGTAA-T--T-T-C------A-A-----CT--A-CA-T-T--C-CT-C-T-G-T------T----G-G--T--G-T--A--A-A-C-------AA-T-A-C-A--T--G---A-----T-G-A--A---T------A--A-A-A-A----------T-CA-G-C-------------C-A-----T-T-A------C-A----T--G-A----A------A-T-T-G--A--T-A-G----A-TA--A-T-----G-AT-A---TT-TT-C---T-T---------A-A---AA-T-A-T-A--G-------------------------A--T----T------A--------A-A-----A-------A-------A--A-------T-T-A--T--T--C-T---A-----------------------------G-T-A-A---T---A---A--A--A--T---T-A--A-A-T--AA-T--G---A--C---C--T-A-T-CT-G-C-T-T-T-T--A---A------T---A-T-A--C---A--G------------T---A-A-A-----A---C----T-
gi|102035                     :    A---AG-A-G-G--T-T-C---G-C---AC-C----T--GA-G-A-TT-T----G------------------G-AT---T-AA----T-G-T--CATT--TTTT----TTA--G--G---------A--A-A-G-T--G----------TTA---T---TT----C--------G----AT--C-T-C-T--A-C-AT--A-G-A-A--AGG-A-A-A-T----C-A---GC-AAA-T-CA-AA---AT-GA-AAA-----------AA------------TTGC-TAG-G---G--T--TG-T-------G------------------TG----T-A-TAT---TTA-T--T--G--A-G-C---T--A-C------A-------T-G---T--------------A------C-AGT-G--------------T-T------------T-T----A-AA----------------------C----A---T-G-ACC-T-T-A------T-TGC-----A-C--T-T-G------A-------------TA-T------GT-A-T-G-T------T----G-C--T--G-T--A--A-A-C-------AA-A-T-C-A--T--A---A-----------------------A--C---------------------A-T-------------C-A-----T-T-A------C-A----T--A-A----A------A-T-A-G--A--TAA-C----A-TA--A-T-----C-AT-G---TA-TT-C---T-T---------A-C---AT-T-A-C-A--G-------------------------A--T--A-T------G--------A-A-----A-------A-------C--A-------G-G----------T-T---AA------T-A-----A--T-----T----G-T-A-C---T-------G--A--A--A---T-A---------GA-T--G---A--C---A--T-T-T-TT-G-C-A-C-T-T--G---C------T---G-T-G--C------G------------A---A-A-A-----A---A----T-C--A-T---G-AT-A-T-C-G---A----A---T-----TT---AA-A---G--T---T---------A--------A-A-A---A--A--A---------C-----C-A--G-A-------T-T--G-GA---A--C--T-A-A--TG-T------C-A--A--T--T------T--T--A-A----A-ATTT-T-C--A--C--G--T---A------A--G-T--T--T---C---AA-A-AC--T-C-T--T--G--T-C---T--T--A-A--A-A--T---T-T-----A------AA---A--TG-------G-AA--G--T-----A------A-------A---A--A-A-A--A--------T-AAAGGGGG--A--G--G-G---T------G--G---T--------G--G--TGGTGGTGGATGAT-A-A----T--TT-T-T--T---A-A---A-A----TCA--T-T----A-G---C--C--------A---A---C-A--T-T---------G-A--C-TT---T--T-T------A----CA-A-C-------A---A--A-T--T---T-TC--A-G--A-A-AA-A-----T-T-A-A---AT-T--CG--A--CG--T---T-TTTA---AG-A-A-G-T---A--------------GT--G-T-T----C--TT---TT--T----G----A--G---A---A-A---C-----T--AT-A---TC---A-A--CC----A----ATT--T--A-A--TA--------A-A--T----T-A--C-A---T----TA----T------T--T-----T-----A-A-C--T--A-----G--T-T-T-C---A--A-G-----T--C--T-C-----A--------A----C--TA--C--T-T--G--TA-TC--A-T----------G---A-----AT-----T----T----T--A--A-AG--CT-G----A-A--A-TA-T-A----C--C--T---T---T---A-GGGG--T--A------T-A-G------A-AA---TA-G-A-GG-T-T-T-T-A-TT--G---G----A--TG-----A----A-A--G-AG-AA-AC-T-------G-T--A-AA-A-
gi|102040                     :         G-A-G-G--T-T-C---T-A---GG-G----T--GA-G-G-TT------A------------------A-AG---C-GA----T-G-T--CAAT--TTTT----T----G--G---------G--A-A-G-T--G----------T-A---T---TT----TT-------G----AT--T-T-C-T--A-C-AT--T-G-A-A--AGA-G-C-A-T----C-G---GG-AAA-T-TA-AG---A--GG-ACA-----------AA------------T--T-T---G---G--G--TT-T--C----A------------------TG----C-T-TGT---TT--T--C--G--A-T-C---T--A-C------A-G-----T-G---TT-T-T----A-----------C-A-T-GA--C--C--TT--TT-T-G----CA-C--T-T----A-AA-A--T-T--TT-A---C-G---C----A---A-A-AT--T-T-A------T-T-C-----A-T--T-T-A------A-A-----CT--C-TA-T-T--C-GT-C-T-G-T------T----G-G--T--G-T--A--A-A-C-------AA-A-A-C-A--T--A---A-----G-G-T--A---T------A--C-A-G-A----------T-CA-A-T-------------C-A-----T-T-A------CAA----T--A-A----A------A-T-A-G--A--T-A-C----A-TA--A-T-----G-AT-G---TC--T-C---T-T---------A-C---AA-T-A-C-A--G-------------------------A--T--A-T------T--------A-A-----A-------A-------A--A-------A-G-A-----T--T-T---AA------T-A-----C--T-----T----G-T-A-A---T---G---G--A--A--A---T-A--A-A-T--AA-T--G---A--C---C----T-T-CT-G-C-A-C-T-T--G---A------T---A-T-A--C---G--G------------A---A-A-A-----A---C----T-C--A-T---G-AT-A-T-C-G---A----A---T-----TT-C-AG-A---G--T---T------------------A-A-A---A--A--T---------A-----C-A--T-T-------T-T--A-GG---A--G--T-G-A--TG-T------A-A--A--T--T--T-C-T--T--A-A----A-A--T-T-C--A--C--G--T---A------A--T-A-----T---C---AG-A-G---T-C-A--T--G--T-C---T--T--A-A--A-A--T---T-T-----A------AA---A---G-------G-AG--C--T-----T------T-------A---A--A-A-A--G--------T-A------G--A--T--G-A---T------T--T---C--------G--A--T------------T-A-A----A--TT-T-T--T---A-A---A-A----T-A--T-T----G-G---T--CA--A----A---A---T-A--C-A---------G-AT-T-TT---T--T-T------G----C--A-C-------A---G--A-A--T---T-TC--G-A--G-T-AA-A-----T-T-G-A---AT-T---G--A--C---T---T-TTTA---AA-G-A-A-T---A-------T------GT--A-T-T----C--TG---TT--T----G----GA-A---A---A-A---A-----T--AC-C---TC---A-A--CA----A----A-AT-T--A-A--A---------A-A--T----A-A--CAA---A----TA----T------T--T-----G-----G-A-C--T--A-----G--T-T-C-C---A--A-G-----T--T--T-C-----A--------T----C--TA--C--G-T--G--TA-TC--A-T----------T---A-----AT-----T----T----T--A--A-AG--CT-G----T-A--A-TA-T-A----C--C--A---A---T---A-GGGG--T--T------T-A-A------A-AA---TA-G-A-AG-G-T-A-T-A-TT--G---G----A--TG-----A----A-A--T-AG-AA-GC-T-------G-T--A-AA-A-T-C-AT--G------------C------------T----------T--TT----T---------G--------A-----TT---------A--A-T-C--A---A--T-CC-T-TCCGACA
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Reference ( family-106 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTAA---AG-A-G-G--T-T-C---T-A---GG-G----T--GA-G-G--TT-T----G------------------A-AG---TG--A----T-G-T--CAA-T--TTTT----T----G--G---------G--A-A-G-T--G----------T-A--T--TT-TT-------G---A-T-T-T-C-T--A-CA-T--T-G-A-A--AGA-G-A-A-T----C-G---GG-AAA-T-TA-AA---AAAGA-AAA-----------AA------------TT--T---G---G--T--TT-T-C---A------------------TG----C-T-TGT---TT--T--C--G--A-G-C---T------A-C-----A-G-----TG---TT-T-T----A---AA------C-A-T-GA--C-C--T--T--TT-T-G----C-A-C--T-T----A-AA-A--T-T--T--A---C-T---C-AA----G-A-T--T-T-A------T-T-C-----A-T--T-T-A------A-A-----C-T--C-C-A----T-T--CGT-C-T-G-T------T-GG-T--G-T--A--A-A-C-------AA-A-A-C-A--T-A---A-----G-G-A--A-T------A-C----AA-A--T-----C-----A-A-------T-C----A-T-T-A------C-A----T--G-A----A------A-T-A-G--A------T--A-CA-TAA-T-----A-AT-G---TC-TT---C---T-T---------A-CAA-TA--C-A--G-------------------------A--T--A-T------A--------A-A-----A-------AA--A-A-------GA--T--TT-T---AAT--A-----C------T-----T----G-T-A-A---T---G---G--AA--A---TA--AA-T--AA-T--G---A--C---C-T-T-T--CT-G-C-A-C-T-T--G---A------T---A-T-A---CG--G------------A---A-A-A-------A---C----T-C----A-T---G--A-T-A-T-C----G---A----A---T---TT-C-AG-A---G--T---T---------A--A-A-A---A---A-T---------A-----C-A--T-T-------T-T--A-GG---A--G--T-G--A-T--G-T------C-A--A--T--T--T-CT--T--A-A----A-A--T--T-C-A--C--G--T---A------A--T-A--T--T---C---AG-A-G---T-C-T--T--G--T-C---T--C--A-A--A-A--T-T-T-----A------A-A--A--TG----G--AA-C--T-----T------T-------A------A--A-A--A--G--------T-A------G--A--G--G-A---T-T------T---C--------G--G--T------------C-A-A----A--TT-T-T-T---A--A---A-A----T-A--T-T----G-G----C-C--A-A--AA-T-A-C---T---------G-A--T-TT---T--T-T------G----C-A--C-------A---G--A-A---TT-T-C--G-A--G-T-A---A-A-T--T--G---A---A--T-T--GG--A--C---T---T-TTTA---AA-G-A-A-T---A-------T------GT--A-T-T----C--TG---TT--T----G----G--A-A---A---A---A-----T--AC-C-----TC--A-A---CAA---A--A-T-T-A---A--------T-A---A-A-T-A-A---C-A-A----TA--T------TT-----G-----AA----C-----T--A--G--T-T-C-C---A--A-G--------T--C--T-C-----A-T----CTA--CT-TG--T-A-TC--A-T-T---------------A----A---T-T---T---T-A--A-A--A--CT-G----T-A--A------TA-T-A----C--G--A---A---T---A-GGG-G--T-A------T-A--A------A-AA---TA-G-A-AG-G-T-A-T-A-TT--G---G--A-TG-A-A---A--T---A----G-A-A-A-C-T-------G-T--A-AA-A-T-C-AT--G------------C--------------T----------T--------TT-T-----------G--------A--------TT---------A--A-T-C--A--A--T-CC-T-TCCGCCA
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gi|102022                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TAA---AA-A-G-G--T-T-C---T-A---GG-G----T--GA-G-G--TT-T----A------------------A-AG---TG--A----T-G-T--CAA-T--TTTG---------G--G---------G--A-A-G-T--G----------T-A--T--TT-TT-------G---A-T-T-T-C-T--A-CA-T--T-G-A-A--AGA-G-C-A-T----C-G---GG-AA--T-TA-AA---TAG---AAA-----------AA------------TT--T---G---G--G--TT-T-C---A------------------TG----C-T-TGT---TT-----C--G--A---T---T------A-C-----A-G-----TG---CC-T-T----A---AA------C-A-T-GA--C-C--T--T--TT-T-G----C-A-C--T-T----A-AA-A--T-T--T--A---C-T---C-AA----G-A-T--T---A------T-T-C-----A-T--T-T-A------A-G-----C-T--C-C-A----T-T--CGT-C-T-G-T------T-GG-T--G-T--A--A-A-C-------AA-----C-A--T-A---A-----G-G-A--A-T------A-C----AA-AA-T-----C-----A-A-------T-C----A-T-T-A------C-A----T--G-A----A------A-T-A-G--A------T--A-CA-TAA-T-----A-AT-G---AC-TT---C---T-T---------A-CAA-TA--C-A--G-------------------------A--T--A-T------A--------A-A-----A-------AA--ATA--------------TT-T---AAT--G-----C------T-----T----G-T-A-A---T---G---T--AA--A---TA--AA-T--AA-T--G---A--C---C-T-T-T--CT-G-C-A-C-T-T--G---A------T-----T-A---CG--G------------A---A-A-A-------A---C----T-C----A-T---G--A-A-T-T-C----G---A----A---T---T--C-AG-A---G--T---T---------A--A-A-A---A---A-T---------A-----C-A--T-T-------T----A-GG---A--G--T-G--A-T--G-T------C-A--A--T--A--T-CT--T--A-A----A-A--T--T-T-A--C--T--T---G------A--T-A--T--T---C---AG-A-G---T-C-T--T--G--T-C---T--T--G-A--A-A--T-T-T-----A------A-A--A--TG----G--AA-C--T-----T------T-------A------A--A-A--C--G--------T-A------G--A--G--G-A---T-T----------C--------G--G--T------------T-A-T----A--TT-T-T-T---A--A---A------T-A--T-T----G-G----C-C--A-A--AA-T-A-C---T---------G-A--T-TT---T--T-T------G----C-A--C-------A---G--A-A---TT-T-C--G-A--G-T-A---A-A-T--T--G---A---A--T-T--AG--A--C---T---T-TTTA---AA-G-A---T---A-------T------GT--A-T-T----C--TG---TT--T----G----G--G-A---A---A---------T--AC-C-----TC--A-A---CAA---A--A-T-T-A---A--------T-A---A-A-T-A-A---C-A------TA--T------TT-----G-----GA----C-----T--A--G--T-T-C-C---A--A-G--------T--C--T-C-----A-T----CTA--CT-TG--T-A-TC--A-T-T---------------A----A---T-T---T---T-A--A-A--A--CT-G----T-A--A------TA-T-A----C--G--A---A---T---A-GGG-G--T-A------A-A--A------A-AA---TA-G-A-AG-G-T-A-T-A-TT--G---G--A-TG-A-A---A--T---A----G-A-A-A-C-T-------G-TA-A-AA-A-T-C-AT--G------------C--------------T----------T--------TT-T-----------G--------A--------TT---------A--A-T-T-----T--T-CC-C-TCCGCCA
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Reference ( family-106 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTAA---AG-A-G-G--T-T-C---T-A---GG-G----T--GA-G-G--TT-T----G------------------A-AG---TG--A----T-G-T--CAA-T--TTT-T----T----G--G---------G--A-A-G-T--G----------T-A--T--TT-TT-------G---A-T-T-T-C-T--A-CA-T--T-G-A-A--AGA-G-A-A-T----C-G---GG-AAA-T-T--A-----AAAA-A-G-A-AAAA-ATT-G----G-GT--TT-T-C---A------------------TG----C-----------T-TG----------------T---TT--T--C--G--A-G-C---T------A-C-----A-G-----TG---TT-T-T----A---AA------C-A-T-GA--C--C--TT--TT-T-G----C-A-C--T-T----A-AA-A--T-T--T--A---C-T---C-AA----G-AT--T-T-A------T-T-C-----A-T--T-T-A------AA-----C-T--C-C-A----T-T--CGT-C-T-G-T------T-GG--T--G-T--A--A-A-C-------AA-A-A-C-A--T-A---A-----G-G-A--A-T------A-C----AA-A--T-----C-----A-A-------T-C----A-T------T-A-C-A----T--G-A----A------A-T-A-G--A------T--A-CA-TAA-T-----A-AT-G---T-C-TT---C---T-T---------A-CAA-TA--C-A--G-------------------------A--T--A-T--------A--------A-A-----A-------AA--A-A-------GA--T--TT-T---AAT--A-----C------T-----T----G-T-A-A---T---G---G--AA--A---T-A--AAT--AA-T--G---A--C---C-T-T-T--CT-G-C-A-C-T-T--G---A------T---A-T-A---CG--G------------A---A-A-A-------A---C----T-C----A-T---G--A-T-A-T-C----G---A----A---T---TT-C-AG-A---G--T---T---------A--A-A-A---A---A-T---------A-----C-A--T-T-------T-T--A-GG---A--G--T-G--A-T--G-T------C-A--A--T--T--T-CT--T--A-A----A-A--T--T-C-A--C--G--T---A------A--T-A--T--T---C---AG-A-G---T-C-T--T--G--T-C---T--C--A-A--A-A--T-T-T-----A------A-A--A--TG----G--AA-C--T-----T------T-------A------A--A-A--A--G--------T-A------G--A--G--G-A---T-T------T---C--------G--G--T------------C-A-A----A--TT-T-T-T---A--A---A-A----T-A--T-T----G-G----C-C--A-A--AA-TA-C---T---------G-A--T-TT---T--T-T------G----C-A--C-------A---G--A-A---TT-T-C--G-A--G-T-A---A-A-T--T--G---A---A--T-T--GG--A--C---T---T-TTTA---AA-G-A-A-T---A-------T------GT--A-T-T----C--TG---TT--T----G----G--A-A---A---A---A-----T--AC-C-----TC--A-A---CAA---A--A-T-T-A---A--------T-A---A-A-T-A-A---C-A-A----TA--T------TT-----G-----AA----C-----T--A--G--T-T-C-C---A--A-G--------T--C--T-C-----A-T----CTA--CT-TG--T-A-TC--A-T-T---------------A----A---T-T---T---T-A--A-A--A--CT-G----T-A--A------TA-T-A----C--G--A---A---T---A-GGG-G--T-A------T-A--A------A-AA---TA-G-A-AG-G-T-A-T-A-TT--G---G--A-TG-A-A---A--T---A----G-A-A-A-C-T-------G-T--A-AA-A-T-C-AT--G------------C--------------T----------T--------TT-T-----------G--------A--------TT---------A--A-T-C--A--A--T-CC-T-TCCGCCA
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gi|102023                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TAA---CA-A-G-G--T-TTC---C-A---GG-G----T--GA-G-T--TT-T-----------------------A-AG---T---A----T-G-T--CAA-T--TTT-T----T----G--G---------G--A-A-G-T--G----------T-A--T--TT-T--------G---A-T-T-T-C-T--A-CA-T----G-A-A--AGA-G-A-A-T----C-G---GG-AA--T-T--A-----AAAG-A-A-G-AAAA-TTT-G----G-GTA-TT-T-C---A------------------TG----C-----------T-TG----------------T---TT--TT-C--G--A-G-C---T------A-C-----A-G-----TG---TT-T-T----A---AA------C-A-T-GA--C--C--TT--TT-T-G----C-A-C--G-T----ATAA-A--T-T--T--C---A-T---C-AAA---G-AT--T-T-A------T-C-C-----T-T--T-T-AG-----AA-----C-T--C-C-A----T-T--CGT-C-T-G-T------T-GG--T--G-T--A--A-A-C-------AA-A-A-C-A--T-A---A-----G-G-A--A-T------A-C----AA-A--T-----C-----A-A-------T-C----A-T------T-G-C-A----T--G-A----A------A-T-A-A--G------A--A-CA-TAA-T-----A-AT-GT--T-C-TT---C---T-T---------A-CAA-TA--C-A--G-------------------------A--T--A-TA-------A--------A-A-----A-------AA--A-A-------GA--T--TT------ATTAA-----C------T-----T----G-TAA-A---T---G---G--AA--A---T-A--AAT--AA-T--G---A--C---C-T-T-T--TT-G-C-A-C-T-T--G---A------T---A-T-A---TG--G----------------A-A-A-------A---C----T-C----A-T---G--A-T-A-T-C----G---A----A---T---TT-C-AG-A---GT-T---T---------A--A-A-G---AAT-A-T---------A-----C-A--T-T-------T-T--A-GA---AT-G--T-G--A-T--G-T------CAA--A--T--T--T-CT--T--A-A----A-A--T--T-C-A-----G--T---A------A--T-A--T--TC--C---AG-A-G---C-CTT--T--G--T-C---TC-C--A-A--ACA--T-T-T-----A------A-A--A--TG----G--AA-C--T-----T------T-------G------A--A-A--A--G--------T-A------A--G--A--G-A---T-T------T---C--------G--G--T------------CAA-A----A--TT-T-T-TTG-A--A---A-A----T-A--T-T----G-G----C-C--A-A--AA-TA-C---G---------G-A--T-TT---T--T-T------G----C-A--C-------A---G--A-A---TT-T-C--G-A--G-T-A---C-A----------------------------------T---T-TTTA---AA-G-A-A-A---A-------T-------T--A-T-T----T--CG---TT--T----G----G--A-A---A---A---A-----TG-AT-C-----TC--A------AA---A--A-T-T-A---A----------A---A-A-T-AGA---C-A-A----AA--T------TT-----G------A----C-----T--A--G--T-T-C-C---A--A-G--------T--C--T-C-----A-T----CTA--CTATG--T-A-TA--A---T---------------A----A-----T---T---T-A--A-A--A--CT-GT---T-A--A------TA-T-A----C--G--A---A---T---A-GGG-G--T-A------T-A--AC-----A-AA---TA-G-A-GG-T-T-ATT-A-CC--G---G--A-TG-A-A---A--T--------G-A-A-A-C-T-------C-TA-A-AA-A-T-C-AT--G------------C--------------T----------TTC------TT-C-----------A--------A--------TA---------A--A-T-C--A--A--TCCC-T-TCCGCCA
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Reference ( family-106 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTAA---AG-A-G-G--T-T-C---T-A---GG-G----T--GA-G-G--TT-T----G------------------A-AG---TG--A----T-G-T--CAA-T--TTT-T----T----G--G---------G--A-A-G-T--G----------T-A--T--TT-TT-------G---A-T-T-T-C-T--A-CA-T--T-G-A-A--AGA-G-A-A-T----C-G---GG-AAA-T-T----A-----AAAA-A-GAAAAANTT-G----G-GT-TTT-C---A------------------TG----C-----------T-TG----------------T---TT--T--C--G--A-G-C---T------A-C-----A-G-----TG---TT-T-T----A---AA------C-A-T-GA--C--C--TT--TT-T-G----C-A-C--T-T----A-AA-A--T-T--T--A---C-T---C-AA----G-AT--T-T-A------T-T-C-----A-T--T-T-A------AA-----C-T--C-C-A----T-T--CGT-C-T-G-T------T-GG--T--G-T--A--A-A-C-------AA-A-A-C-A--T-A---A-----G-G-A--A-T------A-C----AA-A--T-----C-----A-A-------T-C----A-T------T-A-C-A----T--G-A----A------A-T-A-G--A------T--A-CA-TAA-T-----A-AT-G---T-C-TT---C---T-T---------A-CAA-TA--C-A--G-------------------------A--T--A-T--------A--------A-A-----A-------AA--A-A-------GA--T--TT-T---AAT--A-----C------T-----T----G-T-A-A---T---G---G--AA--A---T-A--AAT--AA-T--G---A--C---C-T-T-T--CT-G-C-A-C-T-T--G---A------T---A-T-A---CG--G------------A---A-A-A-------A---C----T-C----A-T---G--A-T-A-T-C----G---A----A---T---TT-C-AG-A---G--T---T---------A--A-A-A---A---A-T---------A-----C-A--T-T-------T-T--A-GG---A--G--T-G--A-T--G-T------C-A--A--T--T--T-CT--T--A-A----A-A--T--T-C-A--C--G--T---A------A--T-A--T--T---C---AG-A-G---T-C-T--T--G--T-C---T--C--A-A--A-A--T-T-T-----A------A-A--A--TG----G--AA-C--T-----T------T-------A------A--A-A--A--G--------T-A------G--A--G--G-A---T-T------T---C--------G--G--T------------C-A-A----A--TT-T-T-T---A--A---A-A----T-A--T-T----G-G----C-C--A-A--AA-TA-C---T---------G-A--T-TT---T--T-T------G----C-A--C-------A---G--A-A---TT-T-C--G-A--G-T-A---A-A-T--T--G---A---A--T-T--GG--A--C---T---T-TTTA---AA-G-A-A-T---A-------T------GT--A-T-T----C--TG---TT--T----G----G--A-A---A---A---A-----T--AC-C-----TC--A-A---CAA---A--A-T-T-A---A--------T-A---A-A-T-A-A---C-A-A----TA--T------TT-----G-----AA----C-----T--A--G--T-T-C-C---A--A-G--------T--C--T-C-----A-T----CTA--CT-TG--T-A-TC--A-T-T---------------A----A---T-T---T---T-A--A-A--A--CT-G----T-A--A------TA-T-A----C--G--A---A---T---A-GGG-G--T-A------T-A--A------A-AA---TA-G-A-AG-G-T-A-T-A-TT--G---G--A-TG-A-A---A--T---A----G-A-A-A-C-T-------G-T--A-AA-A-T-C-AT--G------------C--------------T----------T--------TT-T-----------G--------A--------TT---------A--A-T-C--A--A--T-CC-T-TCCGCCA
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gi|102023                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TAA---CA-A-G-G--T-TTC---C-A---GG-G----T--GA-G-T--TT-T-----------------------A-AG---T---A----T-G-T--CAA-T--TTT-T----T----G--G---------G--A-A-G-T--G----------T-A--T--TT-T--------G---A-T-T-T-C-T--A-CA-T----G-A-A--AGA-G-A-A-T----C-G---GG-AA--T-T----A-----AAAG-A-AGAAAATTT-G----G-GTATTT-C---A------------------TG----C-----------T-TG----------------T---TT--TT-C--G--A-G-C---T------A-C-----A-G-----TG---TT-T-T----A---AA------C-A-T-GA--C--C--TT--TT-T-G----C-A-C--G-T----ATAA-A--T-T--T--C---A-T---C-AAA---G-AT--T-T-A------T-C-C-----T-T--T-T-AG-----AA-----C-T--C-C-A----T-T--CGT-C-T-G-T------T-GG--T--G-T--A--A-A-C-------AA-A-A-C-A--T-A---A-----G-G-A--A-T------A-C----AA-A--T-----C-----A-A-------T-C----A-T------T-G-C-A----T--G-A----A------A-T-A-A--G------A--A-CA-TAA-T-----A-AT-GT--T-C-TT---C---T-T---------A-CAA-TA--C-A--G-------------------------A--T--A-TA-------A--------A-A-----A-------AA--A-A-------GA--T--TT------ATTAA-----C------T-----T----G-TAA-A---T---G---G--AA--A---T-A--AAT--AA-T--G---A--C---C-T-T-T--TT-G-C-A-C-T-T--G---A------T---A-T-A---TG--G----------------A-A-A-------A---C----T-C----A-T---G--A-T-A-T-C----G---A----A---T---TT-C-AG-A---GT-T---T---------A--A-A-G---AAT-A-T---------A-----C-A--T-T-------T-T--A-GA---AT-G--T-G--A-T--G-T------CAA--A--T--T--T-CT--T--A-A----A-A--T--T-C-A-----G--T---A------A--T-A--T--TC--C---AG-A-G---C-CTT--T--G--T-C---TC-C--A-A--ACA--T-T-T-----A------A-A--A--TG----G--AA-C--T-----T------T-------G------A--A-A--A--G--------T-A------A--G--A--G-A---T-T------T---C--------G--G--T------------CAA-A----A--TT-T-T-TTG-A--A---A-A----T-A--T-T----G-G----C-C--A-A--AA-TA-C---G---------G-A--T-TT---T--T-T------G----C-A--C-------A---G--A-A---TT-T-C--G-A--G-T-A---C-A----------------------------------T---T-TTTA---AA-G-A-A-A---A-------T-------T--A-T-T----T--CG---TT--T----G----G--A-A---A---A---A-----TG-AT-C-----TC--A------AA---A--A-T-T-A---A----------A---A-A-T-AGA---C-A-A----AA--T------TT-----G------A----C-----T--A--G--T-T-C-C---A--A-G--------T--C--T-C-----A-T----CTA--CTATG--T-A-TA--A---T---------------A----A-----T---T---T-A--A-A--A--CT-GT---T-A--A------TA-T-A----C--G--A---A---T---A-GGG-G--T-A------T-A--AC-----A-AA---TA-G-A-GG-T-T-ATT-A-CC--G---G--A-TG-A-A---A--T--------G-A-A-A-C-T-------C-TA-A-AA-A-T-C-AT--G------------C--------------T----------TTC------TT-C-----------A--------A--------TA---------A--A-T-C--A--A--TCCC-T-TCCGCCA
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Reference ( family-106 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTAA---AG-A-G-G--T-T-C---T-A---GG-G----T--GA-G-G--TT-T----G------------------A-AG---TG--A----T-G-T--CAA-T--TTT-T----T----G--G---------G--A-A-G-T--G----------T-A--T--TT-TT-------G---A-T-T-T-C-T--A-CA-T--T-G-A-A--AGA-G-A-A-T----C-G---GG-AAA-T-T----A-----AAAA-A-GAAAAANTT-G----G-GT-TTT-C---A------------------TG----C-----------T-TG----------------T---TT--T--C--G--A-G-C---T------A-C-----A-G-----TG---TT-T-T----A---AA------C-A-T-GA--C--C--TT--TT-T-G----C-A-C--T-T----A-AA-A--T-T--T--A---C-T---C-AA----G-AT--T-T-A------T-T-C-----A-T--T-T-A------AA-----C-T--C-C-A----T-T--CGT-C-T-G-T------T-GG--T--G-T--A--A-A-C-------AA-A-A-C-A--T-A---A-----G-G-A--A-T------A-C----AA-A--T-----C-----A-A-------T-C----A-T------T-A-C-A----T--G-A----A------A-T-A-G--A------T--A-CA-TAA-T-----A-AT-G---T-C-TT---C---T-T---------A-CAA-TA--C-A--G-------------------------A--T--A-T--------A--------A-A-----A-------AA--A-A-------GA--T--TT-T---AAT--A-----C------T-----T----G-T-A-A---T---G---G--AA--A---T-A--AAT--AA-T--G---A--C---C-T-T-T--CT-G-C-A-C-T-T--G---A------T---A-T-A---CG--G------------A---A-A-A-------A---C----T-C----A-T---G--A-T-A-T-C----G---A----A---T---TT-C-AG-A---G--T---T---------A--A-A-A---A---A-T---------A-----C-A--T-T-------T-T--A-GG---A--G--T-G--A-T--G-T------C-A--A--T--T--T-CT--T--A-A----A-A--T--T-C-A--C--G--T---A------A--T-A--T--T---C---AG-A-G---T-C-T--T--G--T-C---T--C--A-A--A-A--T-T-T-----A------A-A--A--TG----G--AA-C--T-----T------T-------A------A--A-A--A--G--------T-A------G--A--G--G-A---T-T------T---C--------G--G--T------------C-A-A----A--TT-T-T-T---A--A---A-A----T-A--T-T----G-G----C-C--A-A--AA-TA-C---T---------G-A--T-TT---T--T-T------G----C-A--C-------A---G--A-A---TT-T-C--G-A--G-T-A---A-A-T--T--G---A---A--T-T--GG--A--C---T---T-TTTA---AA-G-A-A-T---A-------T------GT--A-T-T----C--TG---TT--T----G----G--A-A---A---A---A-----T--AC-C-----TC--A-A---CAA---A--A-T-T-A---A--------T-A---A-A-T-A-A---C-A-A----TA--T------TT-----G-----AA----C-----T--A--G--T-T-C-C---A--A-G--------T--C--T-C-----A-T----CTA--CT-TG--T-A-TC--A-T-T---------------A----A---T-T---T---T-A--A-A--A--CT-G----T-A--A------TA-T-A----C--G--A---A---T---A-GGG-G--T-A------T-A--A------A-AA---TA-G-A-AG-G-T-A-T-A-TT--G---G--A-TG-A-A---A--T---A----G-A-A-A-C-T-------G-T--A-AA-A-T-C-AT--G------------C--------------T----------T--------TT-T-----------G--------A--------TT---------A--A-T-C--A--A--T-CC-T-TCCGCCA
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gi|102023                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TAA---CA-A-G-G--T-TTC---C-A---GG-G----T--GA-G-T--TT-T-----------------------A-AG---T---A----T-G-T--CAA-T--TTT-T----T----G--G---------G--A-A-G-T--G----------T-A--T--TT-T--------G---A-T-T-T-C-T--A-CA-T----G-A-A--AGA-G-A-A-T----C-G---GG-AA--T-T----A-----AAAG-A-AGAAAATTT-G----G-GTATTT-C---A------------------TG----C-----------T-TG----------------T---TT--TT-C--G--A-G-C---T------A-C-----A-G-----TG---TT-T-T----A---AA------C-A-T-GA--C--C--TT--TT-T-G----C-A-C--G-T----ATAA-A--T-T--T--C---A-T---C-AAA---G-AT--T-T-A------T-C-C-----T-T--T-T-AG-----AA-----C-T--C-C-A----T-T--CGT-C-T-G-T------T-GG--T--G-T--A--A-A-C-------AA-A-A-C-A--T-A---A-----G-G-A--A-T------A-C----AA-A--T-----C-----A-A-------T-C----A-T------T-G-C-A----T--G-A----A------A-T-A-A--G------A--A-CA-TAA-T-----A-AT-GT--T-C-TT---C---T-T---------A-CAA-TA--C-A--G-------------------------A--T--A-TA-------A--------A-A-----A-------AA--A-A-------GA--T--TT------ATTAA-----C------T-----T----G-TAA-A---T---G---G--AA--A---T-A--AAT--AA-T--G---A--C---C-T-T-T--TT-G-C-A-C-T-T--G---A------T---A-T-A---TG--G----------------A-A-A-------A---C----T-C----A-T---G--A-T-A-T-C----G---A----A---T---TT-C-AG-A---GT-T---T---------A--A-A-G---AAT-A-T---------A-----C-A--T-T-------T-T--A-GA---AT-G--T-G--A-T--G-T------CAA--A--T--T--T-CT--T--A-A----A-A--T--T-C-A-----G--T---A------A--T-A--T--TC--C---AG-A-G---C-CTT--T--G--T-C---TC-C--A-A--ACA--T-T-T-----A------A-A--A--TG----G--AA-C--T-----T------T-------G------A--A-A--A--G--------T-A------A--G--A--G-A---T-T------T---C--------G--G--T------------CAA-A----A--TT-T-T-TTG-A--A---A-A----T-A--T-T----G-G----C-C--A-A--AA-TA-C---G---------G-A--T-TT---T--T-T------G----C-A--C-------A---G--A-A---TT-T-C--G-A--G-T-A---C-A----------------------------------T---T-TTTA---AA-G-A-A-A---A-------T-------T--A-T-T----T--CG---TT--T----G----G--A-A---A---A---A-----TG-AT-C-----TC--A------AA---A--A-T-T-A---A----------A---A-A-T-AGA---C-A-A----AA--T------TT-----G------A----C-----T--A--G--T-T-C-C---A--A-G--------T--C--T-C-----A-T----CTA--CTATG--T-A-TA--A---T---------------A----A-----T---T---T-A--A-A--A--CT-GT---T-A--A------TA-T-A----C--G--A---A---T---A-GGG-G--T-A------T-A--AC-----A-AA---TA-G-A-GG-T-T-ATT-A-CC--G---G--A-TG-A-A---A--T--------G-A-A-A-C-T-------C-TA-A-AA-A-T-C-AT--G------------C--------------T----------TTC------TT-C-----------A--------A--------TA---------A--A-T-C--A--A--TCCC-T-TCCGCCA
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Reference ( family-106 )      :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTAA---AG-A-G-G--T-T-C---T-A---GG-G----T--GA-G-G--TT-T----G------------------A-AG---TG--A----T-G-T--CAA-T--TTTT----T----G--G---------G--A-A-G-T--G----------T-A--T--TT-TT-------G---A-T-T-T-C-T--A-CA-T--T-G-A-A--AGA-G-A-A-T----C-G---GG-AAA-T-T----A-----AAAA-A-GAAAAANTT-G----G-GT-TTT-C---A------------------TG----C-----------T-TG----------------T---TT--T--C--G--A-G-C---T------A-C-----A-G-----TG---TT-T-T----A---AA------C-A-T-GA--C--C--TT--TT-T-G----C-A-C--T-T----A-AA-A--T-T--T--A---C-T---C-AA----G-AT--T-T-A------T-T-C-----A-T--T-T-A------A-A-----C-T--C-CA----T-T--CGT-C-T-G-T------T-GG--T--G-T--A--A-A-C-------AA-A-A-C-A--T-A---A-----G-G-A--A-T------A-C----AA-A--T-----C-----A-A-------T-C-A-T------T----A-C-A----T--G-A----A------A-T-A-G--A------T-A-CA-TAA-T-----A-AT-G---T-C-TT-C---T-T---------A-CAA-TA--C-A--G-------------------------A--T--A-T--------A--------A-A--A-------AA--A-A-------GA---T---T--T----AA-T-A----C------T-----T----G-T-A-A---T---G---G--AA--A---T-A--AAT--AA-T--G---A--C---C-T-T-T--CT-G-C-A-C-T-T--G---A------T---A-T-A---CG--G------------A---A-A-A-------A---C----T-C----A-T---G--A-T-A-T-C----G---A----A---T---TT-C-AG-A---G--T---T---------A--------A-A-A---A---A-T---------A-----C-A--T-T-------T-T--A-GG---A--G--T-G--A-T--G-T------C-A--A--T--T--T-CT--T--A-A----A-A--T--T-C-A--C--G--T---A------A--T-A--T--T---C---AG-A-G---T-C-T--T--G--T-C---T--C--A-A--A-A--T-T-T-----A------A-A--A--TG----G--AA-C--T-----T------T-------A------A--A-A--A--G--------T-A------G--A--G--G-A---T-T------T---C--------G--G--T------------C-A-A----A--TT-T-T-T---A--A---A-A----T-A--T-T----G-G----C-C--A-A--AA-TA-C---T---------G-A--T-TT---T--T-T------G----C-A--C-------A---G--A-A---TT-T-C--G-A--G-T-A---A-A-T--T--G---A---A--T-T--GG--A--C---T---T-TTTA---AA-G-A-A-T---A-------T------GT--A-T-T----C--TG---TT--T----G----G--A-A---A---A---A-----T--AC-C-----TC--A-A---CAA---A--A-T-T-A---A--------T-A---A-A-T-A-A---C-A-A----TA--T------TT-----G-----AA----C-----T--A--G--T-T-C-C---A--A-G-----T--C--T-C--------A-T----CTA--CT-TG--T-A-TC--A-T-T---------------A----A---T-T---T---T-A--A-A--A--CT-G----T-A--A------TA-T-A----C--G--A---A---T---A-GGG-G--T-A------T-A--A------A-AA---TA-G-A-AG-G-T-A-T-A-TT--G---G--A-TG-A-A---A--T---A----G-A-A-A-C-T-------G-T--A-AA-A-T-C-AT--G------------C--------------T----------T--------TT-T-----------G--------A--------TT---------A--A-T-C--A--A--T-CC-T-TCCGCCA
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gi|102022                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TAA---AA-A-G-G--T-T-C---T-A---GG-G----T--GA-G-G--TT-T----A------------------A-AG---TG--A----T-G-T--CAA-T--TTTG---------G--G---------G--A-A-G-T--G----------T-A--T--TT-TT-------G---A-T-T-T-C-T--A-CA-T--T-G-A-A--AGA-G-C-A-T----C-G---GG-AA--T-T----A-----AATA---GAAAAATTT-G----G-GT-TT--C---A------------------TG----C-----------T-TG----------------T---TT-----C--G--A---T---T------A-C-----A-G-----TG---CC-T-T----A---AA------C-A-T-GA--C--C--TT--TT-T-G----C-A-C--T-T----A-AA-A--T-T--T--A---C-T---C-AA----G-AT--T---A------T-T-C-----A-T--T-T-A------A-G-----C-T--C-CA----T-T--CGT-C-T-G-T------T-GG--T--G-T--A--A-A-C-------AA-----C-A--T-A---A-----G-G-A--A-T------A-C----AA-AA-T-----C-----A-A-------T-C-A-T------T----A-C-A----T--G-A----A------A-T-A-G--A------T-A-CA-TAA-T-----A-AT-G---A-C-TT-C---T-T---------A-CAA-TA--C-A--G-------------------------A--T--A-T--------A--------A-A--A-------AA--A---------TA---T---T--T----AA-T-G----C------T-----T----G-T-A-A---T---G---T--AA--A---T-A--AAT--AA-T--G---A--C---C-T-T-T--CT-G-C-A-C-T-T--G---A------T-----T-A---CG--G------------A---A-A-A-------A---C----T-C----A-T---G--A-A-T-T-C----G---A----A---T---T--C-AG-A---G--T---T---------A--------A-A-A---A---A-T---------A-----C-A--T-T-------T----A-GG---A--G--T-G--A-T--G-T------C-A--A--T--A--T-CT--T--A-A----A-A--T--T-T-A--C--T--T---G------A--T-A--T--T---C---AG-A-G---T-C-T--T--G--T-C---T--T--G-A--A-A--T-T-T-----A------A-A--A--TG----G--AA-C--T-----T------T-------A------A--A-A--C--G--------T-A------G--A--G--G-A---T-T----------C--------G--G--T------------T-A-T----A--TT-T-T-T---A--A---A------T-A--T-T----G-G----C-C--A-A--AA-TA-C---T---------G-A--T-TT---T--T-T------G----C-A--C-------A---G--A-A---TT-T-C--G-A--G-T-A---A-A-T--T--G---A---A--T-T--AG--A--C---T---T-TTTA---AA-G-A---T---A-------T------GT--A-T-T----C--TG---TT--T----G----G--G-A---A---A---------T--AC-C-----TC--A-A---CAA---A--A-T-T-A---A--------T-A---A-A-T-A-A---C-A------TA--T------TT-----G-----GA----C-----T--A--G--T-T-C-C---A--A-G-----T--C--T-C--------A-T----CTA--CT-TG--T-A-TC--A-T-T---------------A----A---T-T---T---T-A--A-A--A--CT-G----T-A--A------TA-T-A----C--G--A---A---T---A-GGG-G--T-A------A-A--A------A-AA---TA-G-A-AG-G-T-A-T-A-TT--G---G--A-TG-A-A---A--T---A----G-A-A-A-C-T-------G-TA-A-AA-A-T-C-AT--G------------C--------------T----------T--------TT-T-----------G--------A--------TT---------A--A-T-T-----T--T-CC-C-TCCGCCA
gi|102023                     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TAA---CA-A-G-G--T-TTC---C-A---GG-G----T--GA-G-T--TT-T-----------------------A-AG---T---A----T-G-T--CAA-T--TTTT----T----G--G---------G--A-A-G-T--G----------T-A--T--TT-T--------G---A-T-T-T-C-T--A-CA-T----G-A-A--AGA-G-A-A-T----C-G---GG-AA--T-T----A-----AAAG-A-AGAAAATTT-G----G-GTATTT-C---A------------------TG----C-----------T-TG----------------T---TT--TT-C--G--A-G-C---T------A-C-----A-G-----TG---TT-T-T----A---AA------C-A-T-GA--C--C--TT--TT-T-G----C-A-C--G-T----ATAA-A--T-T--T--C---A-T---C-AAA---G-AT--T-T-A------T-C-C-----T-T--T-T-AG-----A-A-----C-T--C-CA----T-T--CGT-C-T-G-T------T-GG--T--G-T--A--A-A-C-------AA-A-A-C-A--T-A---A-----G-G-A--A-T------A-C----AA-A--T-----C-----A-A-------T-C-A-T------T----G-C-A----T--G-A----A------A-T-A-A--G------A-A-CA-TAA-T-----A-AT-GT--T-C-TT-C---T-T---------A-CAA-TA--C-A--G-------------------------A--T--A-TA-------A--------A-A--A-------AA--A-A-------GA---T---T--T----AT-TAA----C------T-----T----G-TAA-A---T---G---G--AA--A---T-A--AAT--AA-T--G---A--C---C-T-T-T--TT-G-C-A-C-T-T--G---A------T---A-T-A---TG--G----------------A-A-A-------A---C----T-C----A-T---G--A-T-A-T-C----G---A----A---T---TT-C-AG-A---GT-T---T---------A--------A-A-G---AAT-A-T---------A-----C-A--T-T-------T-T--A-GA---AT-G--T-G--A-T--G-T------CAA--A--T--T--T-CT--T--A-A----A-A--T--T-C-A-----G--T---A------A--T-A--T--TC--C---AG-A-G---C-CTT--T--G--T-C---TC-C--A-A--ACA--T-T-T-----A------A-A--A--TG----G--AA-C--T-----T------T-------G------A--A-A--A--G--------T-A------A--G--A--G-A---T-T------T---C--------G--G--T------------CAA-A----A--TT-T-T-TTG-A--A---A-A----T-A--T-T----G-G----C-C--A-A--AA-TA-C---G---------G-A--T-TT---T--T-T------G----C-A--C-------A---G--A-A---TT-T-C--G-A--G-T-A---C-A----------------------------------T---T-TTTA---AA-G-A-A-A---A-------T-------T--A-T-T----T--CG---TT--T----G----G--A-A---A---A---A-----TG-AT-C-----TC--A------AA---A--A-T-T-A---A----------A---A-A-T-AGA---C-A-A----AA--T------TT-----G------A----C-----T--A--G--T-T-C-C---A--A-G-----T--C--T-C--------A-T----CTA--CTATG--T-A-TA--A---T---------------A----A-----T---T---T-A--A-A--A--CT-GT---T-A--A------TA-T-A----C--G--A---A---T---A-GGG-G--T-A------T-A--AC-----A-AA---TA-G-A-GG-T-T-ATT-A-CC--G---G--A-TG-A-A---A--T--------G-A-A-A-C-T-------C-TA-A-AA-A-T-C-AT--G------------C--------------T----------TTC------TT-C-----------A--------A--------TA---------A--A-T-C--A--A--TCCC-T-TCCGCCA
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