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lowQualScore                  :                                    1111     22       1111                  1                         00000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000                                       1111                          1    
lowQualScore                  :                         2  1 666 1 1111 11  33 1 222 2222 11 222 1  3 2  1 0 111 888888888888888888  66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11111  777777777777777    1 44 1 111  3333 1 11 1     2  111 1      0    
lowQualScore                  :                         .  . ... . .... ..  .. . ... .... .. ... .  . .  . . ... ..................  ........................................................................................................ .....  ...............    . .. . ...  .... . .. .     .  ... .      .    
lowQualScore                  :                         2  1 000 0 7777 44  00 0 888 9999 44 888 0  1 1  0 9 888 666666666666666666  66666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 88888  444444444444444    0 11 0 888  1111 0 44 0     1  888 1      2    
consensus                     :               GAGGGGCTTG-TG-T---A-G----A--AAA-A-A---A----T--C---A-AG-A-CA-CCC---C---------C--------TA--------G---------------------G---------------------T----------A-----------T-------T--T----T-----T-N--C-T--AG-GG---------------GGTG-T-CT-T---GA---TT-T--T-TTTTT-CT---A-CACAAGCCCCT
Reference ( gi|8 )            :               GAGGGGCTTG-TG-T---A-G----A--AAC-A-A---A----T--C---A-AG-A-CA-CTC---C---------C--------TA--------G---------------------G---------------------T----------A-----------T-------T--T----C-----T-T--C-T--AG-GG---------------GGTG-T-CT-T---GA---TT-T--T-TTTTT-CT---A-CACAAGGCCCT
gi|17                         :               GAGGGGCTTG-TG-T---A-G----A--AAG-A-AATTA----T--C---A-AA-A-CA-CCC---C---------C--------C-----------------------------------------------------T----------A-----------C-------C--C----C------------------------------------------CT-T---GA---------T-GTTTT-CT---A-CACAAGCTCCT
gi|9                          :             cacAGGGGCTTG-TG-T---A-G----A--AA--A-A---A----T--C---A-AA-A-CA-CCT---C---------C--------TA------------------------------G---------------------TAAAA------A-----------T-------T--T----A----------C-T--AG-GG---------------AGTG-T-TT-T---AA----T-T--T-TTTTT-CT---A-CACA
gi|7                          :                AGGGGCTTG-TGGT---A-G----A--AA--------A----T--C---A-AA-A-C--CTA---CG--------T--------TAAAAATAATG---------------------T---------------------T----------A-----------T-------T--T----T-----T-A--C-T--AG-GG---------------GGTG-T-TT-T---GA----T-T--T-TTTTT-CT---A-CACAAGtgcaagcc
gi|6                          :                AGGGGCTTG-AG-T---A-G----A--AA--A-A---A-----------A-AA-A-CA-CTC---C---------C--------TA--------G---------------------AATAAAAAAAATACA-------C----------A-----------T-------T--T----T-----A-T--T-T---G-GG---------------GGT--T-CT-T---GA---TT-T--T-TTTCT-CT---A-CACAAGcc
gi|11                         :               cAGTGGCTTG-TG-T---A-GC---A--AAA-A-A---A----T--CC--A-AG-A-CA-ACC---C---------C--------TA--------A-------------------------------------------T----------AAAAT-------T-------T--T----A-----TAC--C-T-----GG---------------GGT--T-CT-T---TA---TT-T--C-TTTT--CT---A-CACAAGcc
gi|19                         :                AGGAGCTTG-TG-T---A-G----A--AA--A-A---A----T--C---A-AG-G------------------------------G--------G---------------------G---------------------T----------A--------------------------------------------G-GG---------------GGTG-T-CT-T---GA----T-T--A-TTTTT-CT---A-CACAAGCCTCTc
gi|19                         :               cAGAGGCTTG-TG-T---A-G----A--AAA-ATA---A----T--C---A-AG-A-CA-CCC---C---------C--------TA-------------------------------------------------------------------------------------------C-----C-C--C-------------------------------CT-T---GA---------T-TTTTT-CT---A-CACAAGCTCCTgt
gi|21                         :               cAGGGGCTTG-TG-T---A-GA---A--AAA-A-A---A----T--C---A-TG-A-CA-CCT---C---------C--------TA--------G---------------------G--------------------------------A-----------T-------T--T----T-----T-T--C-T--gt
gi|17                         :   acaggggctcgagAGGAGCTTG-TG-T---A-G----A--AA--A-C---A----T--C---A-AG-G------------------------------G--------G---------------------G---------------------T----------A-------------------------------------------GG-GG---------------GGTG-T-TT-T---GA---TAAT--T-TCTTT-CT---A-CACAAGCCCCT
gi|2                          :             cacAAGGGCTTG-AG-T---A-G----A--AA--A-A---A----T--A---A-AG-A-CA-CCCATACGGAAAAATAC--------TA--------A---------------------G---------------------TTATACATGTAA-----------T-------T--T----C-----C----C-T--AG-GG---------------GGTGTT-TT-T---GAATCTT-T--T-GTTTT-GTCAAA-CACAAGCCCCc
gi|22                         :                AGGGGCTTG-TG-TT--A-G----A--AAA-A-A---AA---T--C---A-AG-A-CACCTC---C---------C--------TA--------A---------------------A---------------------T----------A-----------gt
gi|13                         :               tAGGGGCTTG-TG-T---A-GAAA-A--AAA-A-A---A----T--G---A-TA-A-CA-CCC---C---------C--------TA--------GTAAAATTAAAAATA-------G---------------------T----------A-----------T-------T--T----T-----T-A--C-T--A--CG---------------GGTG-T-TT-T---Gg
gi|18                         :                AAGGGCTTG-CG-T---A-G----A--AA--------------------A-AG-A------------------------------A---------------------------------------------------------------A-----------T-------T--T----C-----G-T-------AG-GA---------------AAAA-T-CT-T---GA---TT-T--T-TT-TT-CT---G-CACAAGTCCg
gi|10                         :             cacAGGGGCTTGGTG-T---A-G----A--AAA-A-A---AAAA-C--C---A-AT---CA-CCG---C---------CAGAAATCATAAACT----G---------------------C---------------------T----------A-----------A-------T--T----T-----T-A--CGT--AG-GG---------------GGTG----------GA---TT-T--T-TTTTT-CT---atgt
gi|15                         :                 GGGACTTG-TG-T---A-GAAA-A--AAA-A-A---A----T--C---A-AA-A-CA-C-C---C---------C--------TA--------GTAAAA----------------A---------------------T----------A-----------------------------------A--C-T--A--GG---------------GGTG-T-TT-T---GA----T-T--T-TTTTT-CT---A-CACA
gi|5                          :                 GGGGCTTG-TG-T---A-GTAAAA--AATGA-A---A----T--C---A-A--A-CA-CCC---CA--------C--------TA--------G---------------------GTAAATAACTT-----------T----------A-----------T-------T--T----T-----T-A--C-T--A---G---------------GGTG-T-TT-T---GA---TT-T--T-TT
gi|2                          :                 GGGGCTTG-TG-TTTGACA----A--AAC-A-A---AAGATT--C---A-AA-AACA-CCC---C---------C--------TA--------G---------------------GGAAATTACATGTATAACTTAGT----------A-----------T-------T--T----T-----T-C--CGT--AT-GG---------------G-TG-T-CT-T---TA---------T-TTTTT-CT---A-CTCAA-GCCCTaactaaaccaagaca
gi|1                          :                aGGGGCTT--TG-T---A-G----ACAAAA-A-A---A----T--C---A-AACA-CA-TCC---C---------C--------TA------------------------------G---------------------T----------AAAATCAATGATT-------C--T----CATTA-T-T--A-T--AG-GGTGTTCTGTTTATAGAGGTG-T-TT-T---GA---TG-T--T-ATTTT-CT---C-AACAAGCCCCgt
gi|3                          :                  GGGCTTG-AG-T---A-G----A--AAA-A-A---A----T--A---A-AG-A-CA-C-C---C---------A--------TA--------G---------------------GAAAAATACAAGT---------T----------A-----------TACATGTATAGT----T-----T-C--C-T--AG-GG---------------GGTG-T-TT-T---GAT--TT-T--T-TTTTT-CA---A-CACAAGCCC
gi|3                          :                  GGGCTTG-TG-TTGAA-A----A--AAA-A-A---A----T--C---A-AA-A-CA-CCC---C---------C--------TA--------GGAAACTATACATGTATAACTTG---------------------T----------A-----------T-------T--T----T-----T-C--C-T--A--TG---------------GGTG-T-CT-T---TA------T--T-TTTTT-CT---A-CTCAAGCCC
gi|4                          :                  GGGCTGG-TG-T---A-G----A--AAA-A-A---AAT--T--C---A-A--A-CA---C---C---------C--------TA--------G---------------------T---------------------T----------A-----------A-------A--TAACAC-----T-T--------A-GG---------------GGTG-T-TT-T---
gi|23                         :                caGGGCTTG-TG-T---A-GAA--A--AAA-A-A---A----T--C---ATAG-A--A-CCC---C---------C--------TA--------tgacatttggtctacgactgcccttggggtgagggt
gi|20                         :            ttttttGGACTTG-TG-C---A-G----A--AAA-A-A---AA---T--C---A-AG-A-TT-TTT---C---------C--------TAC-------G---------------------A---------------------A----------A-----------T-------T--T----C-----T-T--T-T--
gi|20                         :     gggcttgcgtagaGGGCTTG-CG-T---A-G----A--AA--------------------A-AG-A------------------------------A---------------------------------------------------------------A-----------T-------T--T----C-----G-T-------AG-GA---------------AAAA-T-CT-T---GA---TT-T--T-TT-TT-CT---G-CACAAGTCCatg
gi|18                         :                  GGACTTG-TG-C---A-G----A--AAA-A-A---AA---T--C---A-AG-A-TT-TTT---C---------C--------TAC-------G---------------------A---------------------A----------A-----------T-------T--T----C-----T-T--T-T--atg
gi|14                         : cacaagggcttgcgtagaGGCTTG--G-T---A-G----A--AA--A-A---A----T--------AG-A-CA-CCT---C---------CAA------TA--------A---------------------G---------------------C----------A-----------T-------T--T----T-----T-A--T-T--AG-GG---------------GGTG-TTCT-T---GAA--TT-T--T-TTTTG-CT---A-CACAAGatgt
gi|7                          :                   GGCTTG-TG-T---A-G----A--AAA-A-AA--A----T--C---A-AA-A-CA-CCC---C---------C--------TA--------GTAAAAATA-------------A---------------------C----------A-----------T-------T--A----T-----T-T--T-T--AA-CG---------------TAGG-T-TT-T---GA------------TTTT-CT---ACCACAAGCCCCTc
gi|6                          :                   GGCTTG-TG-TAG-A-G----A--AAA-A-A---A----T--C---A-AG-A--A-CCC---C---------CAAA-----TA--------AAATGT----------------G---------------------T----------A-----------T-------T--T----TTTTTAT-T--C-T--AG-GG---------------AGTG-T-------------TT-T--T-TTTTT-CT---A-CTCAAGCCCCT
gi|9                          :                   cGCATG-TG-T---A-G----A--AAA-A-A---AA---T--T---A-AA-A-CA-CTC---C---------C--------TA--------G-------------------------------------------T----------AAA---------T-------T--T----T-----T-A--C-T--AG-GA---------------GGTG-T-TT-T---GA---------T-TTTTT-CT---A-CACAAGCCCCT
gi|14                         :                    GCTTG-TG-T---A-GC---A--AAA-A-A---AAT--T--C---A-AGAA-CA-CCC---C---------C--------TA---------------------------------------------------------------A-----------TAAAAA--T--G----C-----T-T--A-T--TG-GA---------------GGTG-T-CT------A---------T-TTTTT-CT---A-C-CAAGaagcc
gi|11                         :                  ggGCTTG-TG-T---A-G----A--AAAGA-A---A----T--A---A-AG-A--A-CCC---C-------------------A--------G---------------------G---------------------T----------A-----------TAAAA---T--T----T-----T-A--T-T--AG-GG---------------GTTG-T-CT-T---GG---AT-T--T-TTTTG-CT---A-CACAAG
gi|12                         :               agtggGCTTG-TG-T---A-G----A--AAA-A-T---A----T--TGCAA-AG-A-CA-C-C---C---------C--------TA--------A-------------------------------------------T----------A-----------A-------A--T----C-----T-T--A-TGTAG-GA---------------GGTG-TGCT-T---TA---TT-T--T---TTT-CT---A-CACAAG
gi|12                         :                    GCTTG-TG-T---A-G----A--AAA-A-A---A----T--A---A-AGCA-CA-CCT---C---------C--------TA--------C---------------------A---------------------TAAG-------A-----------T-------T--T----A-----T-T--------A-GG---------------GGTG-T-CT-TTGCAA------T--A-TTTTT-CT---A-CACAAGc
gi|16                         :                    gCTTG-TG-T---A-G----A--AAA-A-A---AC---T--C---A-AG-A-CA-C-C---C---------C--------TA--------A---------------------T---------------------A----------A-----------A-------T--T----T-----T-A--T-T--AC-GG---------------GGTG-T-CT-T---TA----T-T--T-CTTTT-CT---A-CACA
gi|5                          :                     CTTGGTT-T---A-GTT--A--AA--A-A---A----T--C---A-AA-A-CA-C-----C---------C--------TA--------GTAAAAATAAA-----------G---------------------TT---------A-----------T-------T--TA---C----------C-T--AGTGG---------------GGTG-T--T-T---GA---TT-TCAT-TTTTTACT---A-CACAAGCCCCgct
gi|15                         :                       TG-TG-T---A-G----A--AAA-A-A---AA---T--C---A-AA-A-CA-C-C---C---------C--------TA--------G---------------------T---------------------T----------A-----------T-------T--T----T-----T-A--C-T--AG-GG---------------G-TG-T-TT-T---GA---TT-T--T-TTTTTTCT---A-CACAAGTCCCaca
gi|16                         :                       TG-TG-T---A-G----A--AAAGA-A---A----T--A---A-AG-A-CA-CCC---C---------G--------TA--------A-------------------------------------------T----------AAAA--------T-------T--T----A-----T-T--------A-GG---------------GGTG-T-CT-T---GA---GT-T--T-T-TTT-CT---A-CACAAGG
gi|4                          :                           G-T---A-G----A--C-C-A-A---A----TGTC---A-AA-AACA-C-C---C---------C--------TA--------A---------------------G---------------------T----------G-----------T-------T--A----T-----T-TAAC-T--AG-GG-----------------TG-T--T-T---GA---AT-T--T-TTTTT-CT---A-CACCA-GCCCTt
gi|10                         :                             c---A-A----A--AAA-A-A---A----T--C----------CA-CCC---C---------C--------TA--------C---------------------G---------------------T----------AAAATTAGCAG-T-------T--TATGAT-----T-T--C-T---G-GC---------------GGTG-A-TT-G---GT---TT-T--T-TTTTT-CT---A-CACCAAGCCCgactgcccttggggtgagggt
gi|13                         :                                                                                                                                   ag---------------------T----------A-----------A-------T--T----T-----T-A--C-T--AG-GG---------------GGTG-T-TA-T---CA---TT-T--TTTTTTT-CT---A-CACAAGCCCCTct
gi|23                         :                                                                                                                                                     caaaacacccgtagtaaaaatactatttt-------T--T----T-----T-T--T-T--AG-GG---------------GGT--T-CTAT---GA---TT-T--T-TTTTT-CT---A-CACAAGCCCg
gi|1                          :                                                                                                                                                                                  -------T--T----T-----T-A--C-T--AG-GG---------------GATG-TGTT-T---GA---TT-T--T-TTTGT-CT---A-CA-AAGCCCC
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                  -----T-C--C-T--AG-GA---------------GGTG-T-CA-T---GA---T--T--T-TTTTT-CT---A-CACAAGCCCCTtcaatgattctcattattatagggtgttctgtttatagaggtgttttgatgttattttctcaacaagcccc
gi|22                         :                                                                                                                                                                                   acaggggctcgagagaaaaaa-T--T-T--AG-GGA--------------GGTG-T-CT-T---GA---TT-T--T-TTTTC-TA---A-CACAAGCCCCT
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                 ttaA---TT-T--C-TTTTT-CT---A-CGCAAGCCCg
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                    A---TT-T--C-TTTTT-CT---A-CGCAA-GCCCTttcgtaggaaaaatcttgattttttttctgcacaagtccatg





Alignments
lowQualScore                  :                                   11111     8888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888                        111111111111111                                            
lowQualScore                  :             2  1   999 55   9999  11111     0000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000000 44  88888 44 1  2  1   000000000000000 3 66 1 333 1 6666 1         333            
lowQualScore                  :             .  .   ... ..   ....  .....     ..................................................................................... ..  ..... .. .  .  .   ............... . .. . ... . .... .         ...            
lowQualScore                  :             0  9   000 22   8888  22222     6666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 11  77777 00 7  0  7   999999999999999 5 33 7 000 7 9999 8         333            
consensus                     :   GAGGGGCTTG-TG-TAG---A--AAA----AA-A---TCAAG-A-CACCC---C---------C--------TA--------G--------------G------------T-----A--T-------T--TT-----TA-C-TAGGG-GGT---------------G-T-CT-T---G-A---TT-TTTTTTTCT---ACACAAGCCCCT
Reference ( family-9632 )     :   GAGGGGCTTG-TG-TAG---A--AAA----AA-A---TCAAG-A-CACCC---C---------C--------TA--------G--------------G------------T-----A--T-------T--TT-----TN-C-TAGGG-GGT---------------G-T-CT-T---G-A---TT-TTTTTTTCT---ACACAAGCCCCT
gi|1                          :                                                                                                                           -------T--TT-----TA-C-TAGGG-GAT---------------G-TGTT-T---G-A---TT-TTTTTGTCT---ACA-AAGCCCC
gi|1                          :     GGGGCTT--TG-TAG---ACAAAA----AA-A---TCAAACA-CATCC---C---------C--------TA--------GTAAA----------A------------TCAATGA--T-------T--CTCATTATT-A-TAGGG-TGTTCTGTTTATAGAGGTG-T-TT-T---G-A---TG-TTATTTTCT---CAACAAGCCCCtcaatgattctcattattatagggtgttctgtttatagaggtgttttgatgttattttctcaacaagcccc
gi|10                         :    AGGGGCTTGGTG-TAG---A--AAA----AA-AAAACCAAT---CACCG---C---------CAGAAATCATAAACT----G--------------C------------T-----A--A-------T--TT-----TA-CGTAGGG-GGT---------------G----------G-A---TT-TTTTTTTCT---
gi|11                         :        GCTTG-TG-TAG---A--AAAG---AA-A---TAAAG-A--ACCC---C-------------------A--------G--------------G------------T-----A--TAAAA---T--TT-----TA-T-TAGGG-GTT---------------G-T-CT-T---G-G---AT-TTTTTTGCT---ACACAAGCCACT
gi|12                         :        GCTTG-TG-TAG---A--AAA----AA-A---TAAAGCA-CACCT---C---------C--------TA--------C--------------A------------TA----A--G-------A--TT-----TA-T-TA-GG-GGT---------------G-T-CT-TTGCA-A------TATTTTTCT---ACACAAGC
gi|13                         :    AGGGGCTTG-TG-TAGAAAA--AAA----AA-A---TGATA-A-CACCC---C---------C--------TA--------GTAAAATTAAAAATAG------------T-----A--T-------T--TT-----TA-C-TA-CG-GGT---------------G-T-TT-T---G-
gi|14                         :       GGCTTG--G-TAG---A--AAA----AA-----T--AG-A-CACCT---C---------CAA------TA--------A--------------G------------C-----A--T-------T--TT-----TA-T-TAGGG-GGT---------------GTT-CT-T---GAA---TT-TTTTTTGCT---ACACAAGCg
gi|15                         :           TG-TG-TAGA--A--AAA----AA-A---TCAAA-A-CA-CC---C---------C--------TA--------G--------------T------------T-----A--T-------T--TT-----TA-C-TA-GG-GGT---------------G-T-TT-T---G-AT--TT-TTTTTTTCT---ACACAAGTCCC
gi|16                         :         CTTG-TG-TAG---A--AAA----AA-AC--TCAAG-A-CA-CC---C---------C--------TA--------A--------------T------------A-----A--A-------T--TT-----TA-T-TACGG-GGT---------------G-T-CT-T---T-A----T-TTCTTTTCT---ACACA
gi|17                         :    AGGAGCTTG-TG-TAG---A--AAA----CA-----TCAAG-G-----------------------------G--------G--------------G------------T-----A--------------------------GGGG-GGT---------------G-T-TT-T---G-A---TAATTTCTTTCT---ACACAAGCCCCTgct
gi|18                         :   cacGGACTTG-TG-CAG---A--AAAA---AA-A---TCAAG--------------------------------------------------------------------------A--T-------T--TT-----TC-C-TACGA------------------------------A-A---TT-TCTTTTTCT---ACGCAAGCCCTTc
gi|19                         : cacAGGAGCTTG-TG-TAG---A--AAA----AA-----TCAAG-G-----------------------------G--------G--------------G------------T-----A---------------------------GGG-GGT---------------G-T-CT-T---G-A----T-TATTTTTCT---ACACAAGCCTCTatgt
gi|2                          :   cAAGGGCTTG-AG-TAG---A--AAA----AA-----TAAAG-A-CACCCATACGGAAAAATAC--------TA--------A--------------G------------TTATACA--TGTAA---T--TT-----CC-C-TAGGG-GGT---------------GTT-TT-T---G-AATCTT-TTGTTTTGTCAAACACAAGCCCCgt
gi|20                         :      GGACTTG-TG-CAG---A--AAAA---AA-A---TCAAG--------------------------------------------------------------------------A--T-------T--TT-----TC-C-TACGA------------------------------A-A---TT-TCTTTTTCT---ACGCAAGCCCgt
gi|21                         :    AGGGGCTTG-TG-TAGA--A--AAA----AA-A---TCATG-A-CACCT---C---------C--------TA--------G--------------G------------------A--T-------T--TT-----TT-C-Tatg
gi|22                         :                                                                                                                                   acaggggctcgag-TAGGGAGGT---------------G-T-CT-T---G-A---TT-TTTTTTCTA---ACACAAGCCCCT
gi|23                         :                                                                                                                      ttatt-------T--TT-----TT-T-TAGGG-GGT-----------------T-CTAT---G-A---TT-TTTTTTTCT---ACACAAGCCCg
gi|3                          :      GGGCTTG-AG-TAG---A--AAA----AA-A---TAAAG-A-CACCC---A------------------TA--------G--------------GAAAAATACAAGTT-----A--TACATGTATAGTT-----TC-C-TAGGG-GGT---------------G-T-TT-T---G-AT--TT-TTTTTTTCA---ACACAAGCCC
gi|4                          :               G-TAG---A--CCA----AATG---TCAAA-AACACCC---C------------------TA--------A--------------G------------T-----G--T-------TA-TT-----TAAC-TAGGG---T---------------G-T--T-T---G-A---AT-TTTTTTTCT---ACACCAGCCC
gi|5                          :   caGGGGCTTG-TG-TAGT--A--AAAAATGAA-A---TCAA--A-CACCC---CA--------C--------TA--------G--------------GTAAATAACTT--T-----A--T-------T--TT-----TA-C-TA--G-GGT---------------G-T-TT-T---G-A---TT-TTTTgactgcccttggggtgagggt
gi|6                          :       GGCTTG-TG-TAG---AGAAAA----AA-A---TCAAG-A--ACCC---C---------CAAA-----TA--------AAATGT---------G------------T-----A--T-------T--TTTTTTATT-C-TAGGG-AGT---------------G-T--------------TT-TTTTTTTCT---ACTCAAGCCCCTaactaaaccaagaca
gi|7                          :   cAGGGGCTTG-TGGTAG---A--AAA-----------TCAAA-A-CCTAC---G---------T--------TAAAAATAATG--------------T------------T-----A--T-------T--TT-----TA-C-TAGGG-GGT---------------G-T-TT-T---G-A---TT-T-TTTTTCT---ACACAAGCC
gi|8                          :   GAGGGGCTTG-TG-TAG---A--AAC----AA-A---TCAAG-A-CACTC---C---------C--------TA--------G--------------G------------T-----A--T-------T--TC-----TT-C-TAGGG-GGT---------------G-T-CT-T---G-A---TT-TTTTTTTCT---ACACAAGGCCCT
gi|9                          :        GCATG-TG-TAG---A--AAA----AA-AA--TTAAA-A-CACTC---C---------C--------TA--------G---------------------------T-----AAAT-------T--TT-----TA-C-TAGGA-GGT---------------G-T-TT-T---G-A---TT----TTTTCT---ACACAAGCCCCT





Alignments
lowQualScore                  :                                   11111             88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888               111111111111111                 1111                          
lowQualScore                  :             2  1   999 22   9999  11111 0   555  1  77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 44   4444  2  222222222222222    3 44 1 333 1 1111 1         333            
lowQualScore                  :             .  .   ... ..   ....  ..... .   ...  .  ............................................................................. ..   ....  .  ...............    . .. . ... . .... .         ...            
lowQualScore                  :             0  9   000 66   8888  22222 3   111  0  88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11   0000  0  666666666666666    5 11 7 000 7 3333 8         333            
consensus                     :   GAGGGGCTTG-TG-TAG---A--AAA----AA-A---TCAAG-A-CACCC---C---------C--------TA--------G--------------G------------T-----A--T-------T--TTTA-C-TAGGG---------------GGTG-T-CT-T---G-A---TT-TTTTTTTCT---ACACAAGCCCCT
Reference ( family-9632 )     :   GAGGGGCTTG-TG-TAG---A--AAA----AA-A---TCAAG-A-CACCC---C---------C--------TA--------G--------------G------------T-----A--T-------T--TTTA-C-TAGGG---------------GGTG-T-CT-T---G-A---TT-TTTTTTTCT---ACACAAGCCCCT
gi|1                          :                                                                                                                           -------T--TTTA-C-TAGGG---------------GATG-TGTT-T---G-A---TT-TTTTTGTCT---ACA-AAGCCCC
gi|1                          :     GGGGCTT--TG-TAG---ACAAAA----AA-A---TCAAACA-CATCC---C---------C--------TA--------GTAAAATCAAT----GATTCT-------C-----A--T-------T--ATTA---TAGGGTGTTCTGTTTATAGAGGTG-T-TT-T---G-A---TG-TTATTTTCT---CAACAAGCCCCtcaatgattctcattattatagggtgttctgtttatagaggtgttttgatgttattttctcaacaagcccc
gi|10                         :    AGGGGCTTGGTG-TAG---A--AAA----AA-AAAACCAAT---CACCG---C---------CAGAAATCATAAACT----G--------------C------------T-----A--A-------T--TTTA-CGTAGGG---------------GGTG----------G-A---TT-TTTTTTTCT---
gi|11                         :        GCTTG-TG-TAG---A--AAAG---AA-A---TAAAG-A--ACCC---C-------------------A--------G--------------G------------T-----A--TAAAA---T--TTTA-T-TAGGG---------------GTTG-T-CT-T---G-G---AT-TTTTTTGCT---ACACAAGCCACT
gi|12                         :        GCTTG-TG-TAG---A--AAA----AA-A---TAAAGCA-CACCT---C---------C--------TA--------C--------------A------------TA----A--G-------A--TTTA-T-TA-GG---------------GGTG-T-CT-TTGCA-A------TATTTTTCT---ACACAAGC
gi|13                         :    AGGGGCTTG-TG-TAGAAAA--AAA----AA-A---TGATA-A-CACCC---C---------C--------TA--------GTAAAATTAAAAATAG------------T-----A--T-------T--TTTA-C-TA-CG---------------GGTG-T-TT-T---G-
gi|14                         :       GGCTTG--G-TAG---A--AAA----AA-----T--AG-A-CACCT---C---------CAA------TA--------A--------------G------------C-----A--T-------T--TTTA-T-TAGGG---------------GGTGTT-CT-T---GAA---TT-TTTTTTGCT---ACACAAGCg
gi|15                         :           TG-TG-TAGA--A--AAA----AA-A---TCAAA-A-CA-CC---C---------C--------TA--------G--------------T------------T-----A--T-------T--TTTA-C-TA-GG---------------GGTG-T-TT-T---G-AT--TT-TTTTTTTCT---ACACAAGTCCC
gi|16                         :         CTTG-TG-TAG---A--AAA----AA-AC--TCAAG-A-CA-CC---C---------C--------TA--------A--------------T------------A-----A--A-------T--TTTA-T-TACGG---------------GGTG-T-CT-T---T-A----T-TTCTTTTCT---ACACA
gi|17                         :    AGGAGCTTG-TG-TAG---A--AAA----CA-----TCAAG-G-----------------------------G--------G--------------G------------T-----A---------------------GGGG---------------GGTG-T-TT-T---G-A---TAATTTCTTTCT---ACACAAGCCCCTgct
gi|18                         :   cacGGACTTG-TG-CAG---A--AAAA---AA-A---TCAAG--------------------------------------------------------------------------A--T-------T--TTTC-C-TACGA-----------------------------A-A---TT-TCTTTTTCT---ACGCAAGCCCTTc
gi|19                         : cacAGGAGCTTG-TG-TAG---A--AAA----AA-----TCAAG-G-----------------------------G--------G--------------G------------T-----A----------------------GGG---------------GGTG-T-CT-T---G-A----T-TATTTTTCT---ACACAAGCCTCTatgt
gi|2                          :   cAAGGGCTTG-AG-TAG---A--AAA----AA-----TAAAG-A-CACCCATACGGAAAAATAC--------TA--------A--------------G------------TTATACA--TGTAA---T--TTCC-C-TAGGG---------------GGTGTT-TT-T---G-AATCTT-TTGTTTTGTCAAACACAAGCCCCgt
gi|20                         :      GGACTTG-TG-CAG---A--AAAA---AA-A---TCAAG--------------------------------------------------------------------------A--T-------T--TTTC-C-TACGA-----------------------------A-A---TT-TCTTTTTCT---ACGCAAGCCCgt
gi|21                         :    AGGGGCTTG-TG-TAGA--A--AAA----AA-A---TCATG-A-CACCT---C---------C--------TA--------G--------------G------------------A--T-------T--TTTT-C-Tatg
gi|22                         :                                                                                                                              acaggggctcgag-TAGGGA--------------GGTG-T-CT-T---G-A---TT-TTTTTTCTA---ACACAAGCCCCT
gi|23                         :                                                                                                                   ttatt--T-------T--TTT----TAGGG---------------GGT--T-CTAT---G-A---TT-TTTTTTTCT---ACACAAGCCCg
gi|3                          :     tGGGCTTG-AG-TAG---A--AAA----AA-A---TAAAG-A-CACCC---A------------------TA--------G--------------GAAAAATACAAGTT-----A--TACATGTATAGTTTC-C-TAGGG---------------GGTG-T-TT-T---G-AT--TT-TTTTTTTCA---ACACAAGCCC
gi|4                          :               G-TAG---A--CCA----AATG---TCAAA-AACACCC---C------------------TA--------A--------------G------------T-----G--T-------TA-TTTAAC-TAGGG-----------------TG-T--T-T---G-A---AT-TTTTTTTCT---ACACCAGCCC
gi|5                          :   caGGGGCTTG-TG-TAGT--A--AAAAATGAA-A---TCAA--A-CACCC---CA--------C--------TA--------G--------------GTAAATAACTT--T-----A--T-------T--TTTA-C-TA--G---------------GGTG-T-TT-T---G-A---TT-TTTTgactgcccttggggtgagggt
gi|6                          :    AGGGGCTTG-AG-TAG---A--AAA----AA-A------AA-A-CACTC---C---------C--------TA--------G--------------AATAAAAAAAA--T-----A--CACA----T--TTTA-T-TTGGG---------------GGT--T-CT-T---G-A---TT-TTTTTCTCT---ACACAAGCCaactaaaccaagaca
gi|7                          :   cAGGGGCTTG-TGGTAG---A--AAA-----------TCAAA-A-CCTAC---G---------T--------TAAAAATAATG--------------T------------T-----A--T-------T--TTTA-C-TAGGG---------------GGTG-T-TT-T---G-A----T-TTTTTTTCT---ACACAAGCC
gi|8                          :   GAGGGGCTTG-TG-TAG---A--AAC----AA-A---TCAAG-A-CACTC---C---------C--------TA--------G--------------G------------T-----A--T-------T--TCTT-C-TAGGG---------------GGTG-T-CT-T---G-A---TT-TTTTTTTCT---ACACAAGGCCCT
gi|9                          :        GCATG-TG-TAG---A--AAA----AA-AA--TTAAA-A-CACTC---C---------C--------TA--------G---------------------------T-----AAAT-------T--TTTA-C-TAGGA---------------GGTG-T-TT-T---G-A-------TTTTTTCT---ACACAAGCCCCT





Alignments
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lowQualScore                  :             2  1   999 22   9999  11111 0   555  1  77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 44   4444  2  222222222222222    3 44 1 333 1 1111 1         333            
lowQualScore                  :             .  .   ... ..   ....  ..... .   ...  .  ............................................................................. ..   ....  .  ...............    . .. . ... . .... .         ...            
lowQualScore                  :             0  9   000 66   8888  22222 3   111  0  88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11   0000  0  666666666666666    5 11 7 000 7 3333 8         333            
consensus                     :   GAGGGGCTTG-TG-TAG---A--AAA----AA-A---TCAAG-A-CACCC---C---------C--------TA--------G--------------G------------T-----A--T-------T--TTTA-C-TAGGG---------------GGTG-T-CT-T---G-A---TT-TTTTTTTCT---ACACAAGCCCCT
Reference ( family-9632 )     :   GAGGGGCTTG-TG-TAG---A--AAA----AA-A---TCAAG-A-CACCC---C---------C--------TA--------G--------------G------------T-----A--T-------T--TTTA-C-TAGGG---------------GGTG-T-CT-T---G-A---TT-TTTTTTTCT---ACACAAGCCCCT
gi|1                          :                                                                                                                           -------T--TTTA-C-TAGGG---------------GATG-TGTT-T---G-A---TT-TTTTTGTCT---ACA-AAGCCCC
gi|1                          :     GGGGCTT--TG-TAG---ACAAAA----AA-A---TCAAACA-CATCC---C---------C--------TA--------GTAAAATCAAT----GATTCT-------C-----A--T-------T--ATTA---TAGGGTGTTCTGTTTATAGAGGTG-T-TT-T---G-A---TG-TTATTTTCT---CAACAAGCCCCtcaatgattctcattattatagggtgttctgtttatagaggtgttttgatgttattttctcaacaagcccc
gi|10                         :    AGGGGCTTGGTG-TAG---A--AAA----AA-AAAACCAAT---CACCG---C---------CAGAAATCATAAACT----G--------------C------------T-----A--A-------T--TTTA-CGTAGGG---------------GGTG----------G-A---TT-TTTTTTTCT---
gi|11                         :        GCTTG-TG-TAG---A--AAAG---AA-A---TAAAG-A--ACCC---C-------------------A--------G--------------G------------T-----A--TAAAA---T--TTTA-T-TAGGG---------------GTTG-T-CT-T---G-G---AT-TTTTTTGCT---ACACAAGCCACT
gi|12                         :        GCTTG-TG-TAG---A--AAA----AA-A---TAAAGCA-CACCT---C---------C--------TA--------C--------------A------------TA----A--G-------A--TTTA-T-TA-GG---------------GGTG-T-CT-TTGCA-A------TATTTTTCT---ACACAAGC
gi|13                         :    AGGGGCTTG-TG-TAGAAAA--AAA----AA-A---TGATA-A-CACCC---C---------C--------TA--------GTAAAATTAAAAATAG------------T-----A--T-------T--TTTA-C-TA-CG---------------GGTG-T-TT-T---G-
gi|14                         :       GGCTTG--G-TAG---A--AAA----AA-----T--AG-A-CACCT---C---------CAA------TA--------A--------------G------------C-----A--T-------T--TTTA-T-TAGGG---------------GGTGTT-CT-T---GAA---TT-TTTTTTGCT---ACACAAGCg
gi|15                         :           TG-TG-TAGA--A--AAA----AA-A---TCAAA-A-CA-CC---C---------C--------TA--------G--------------T------------T-----A--T-------T--TTTA-C-TA-GG---------------GGTG-T-TT-T---G-AT--TT-TTTTTTTCT---ACACAAGTCCC
gi|16                         :         CTTG-TG-TAG---A--AAA----AA-AC--TCAAG-A-CA-CC---C---------C--------TA--------A--------------T------------A-----A--A-------T--TTTA-T-TACGG---------------GGTG-T-CT-T---T-A----T-TTCTTTTCT---ACACA
gi|17                         :    AGGAGCTTG-TG-TAG---A--AAA----CA-----TCAAG-G-----------------------------G--------G--------------G------------T-----A---------------------GGGG---------------GGTG-T-TT-T---G-A---TAATTTCTTTCT---ACACAAGCCCCTgct
gi|18                         :   cacGGACTTG-TG-CAG---A--AAAA---AA-A---TCAAG--------------------------------------------------------------------------A--T-------T--TTTC-C-TACGA-----------------------------A-A---TT-TCTTTTTCT---ACGCAAGCCCTTc
gi|19                         : cacAGGAGCTTG-TG-TAG---A--AAA----AA-----TCAAG-G-----------------------------G--------G--------------G------------T-----A----------------------GGG---------------GGTG-T-CT-T---G-A----T-TATTTTTCT---ACACAAGCCTCTatgt
gi|2                          :   cAAGGGCTTG-AG-TAG---A--AAA----AA-----TAAAG-A-CACCCATACGGAAAAATAC--------TA--------A--------------G------------TTATACA--TGTAA---T--TTCC-C-TAGGG---------------GGTGTT-TT-T---G-AATCTT-TTGTTTTGTCAAACACAAGCCCCgt
gi|20                         :      GGACTTG-TG-CAG---A--AAAA---AA-A---TCAAG--------------------------------------------------------------------------A--T-------T--TTTC-C-TACGA-----------------------------A-A---TT-TCTTTTTCT---ACGCAAGCCCgt
gi|21                         :    AGGGGCTTG-TG-TAGA--A--AAA----AA-A---TCATG-A-CACCT---C---------C--------TA--------G--------------G------------------A--T-------T--TTTT-C-Tatg
gi|22                         :                                                                                                                              acaggggctcgag-TAGGGA--------------GGTG-T-CT-T---G-A---TT-TTTTTTCTA---ACACAAGCCCCT
gi|23                         :                                                                                                                   ttatt--T-------T--TTT----TAGGG---------------GGT--T-CTAT---G-A---TT-TTTTTTTCT---ACACAAGCCCg
gi|3                          :     tGGGCTTG-AG-TAG---A--AAA----AA-A---TAAAG-A-CACCC---A------------------TA--------G--------------GAAAAATACAAGTT-----A--TACATGTATAGTTTC-C-TAGGG---------------GGTG-T-TT-T---G-AT--TT-TTTTTTTCA---ACACAAGCCC
gi|4                          :               G-TAG---A--CCA----AATG---TCAAA-AACACCC---C------------------TA--------A--------------G------------T-----G--T-------TA-TTTAAC-TAGGG-----------------TG-T--T-T---G-A---AT-TTTTTTTCT---ACACCAGCCC
gi|5                          :   caGGGGCTTG-TG-TAGT--A--AAAAATGAA-A---TCAA--A-CACCC---CA--------C--------TA--------G--------------GTAAATAACTT--T-----A--T-------T--TTTA-C-TA--G---------------GGTG-T-TT-T---G-A---TT-TTTTgactgcccttggggtgagggt
gi|6                          :    AGGGGCTTG-AG-TAG---A--AAA----AA-A------AA-A-CACTC---C---------C--------TA--------G--------------AATAAAAAAAA--T-----A--CACA----T--TTTA-T-TTGGG---------------GGT--T-CT-T---G-A---TT-TTTTTCTCT---ACACAAGCCaactaaaccaagaca
gi|7                          :   cAGGGGCTTG-TGGTAG---A--AAA-----------TCAAA-A-CCTAC---G---------T--------TAAAAATAATG--------------T------------T-----A--T-------T--TTTA-C-TAGGG---------------GGTG-T-TT-T---G-A----T-TTTTTTTCT---ACACAAGCC
gi|8                          :   GAGGGGCTTG-TG-TAG---A--AAC----AA-A---TCAAG-A-CACTC---C---------C--------TA--------G--------------G------------T-----A--T-------T--TCTT-C-TAGGG---------------GGTG-T-CT-T---G-A---TT-TTTTTTTCT---ACACAAGGCCCT
gi|9                          :        GCATG-TG-TAG---A--AAA----AA-AA--TTAAA-A-CACTC---C---------C--------TA--------G---------------------------T-----AAAT-------T--TTTA-C-TAGGA---------------GGTG-T-TT-T---G-A-------TTTTTTCT---ACACAAGCCCCT


blockSeqs                     :             G  G   AAA .    AATG  AAAA      CA   C  ATACGGAAAAATACTAAGTTATACATGTAA                                                AG   ACG   G  TGTTCTGTTTATAGA    T T  A TGC A ATCT A         CAA
blockSeqs                     :             .  .   A   .    G     AC        AA   C  ATAGGAAAAATACAAGTTATACATGTA                                                   A    AAC   G  A                  T C  . .   . TT   .         .  
blockSeqs                     :             .  .   A   .    A     TG        A    C  CCTAGTAAAATTAAAAATAGTAT                                                       .    AT    G  .                  . C  . .   . TT   .         .  
blockSeqs                     :             .  .   T   .    A     AA        A    C  CCTAGAATAAAAAAAATACACA                                                        .    AT    G  .                  . T  . .   . T    .         .  
blockSeqs                     :             .  .   .   .    .     A         A    C  CCAGAAATCATAAACTGCTAA                                                         .    AC    C  .                  . C  . .   . T    .         .  
blockSeqs                     :             .  .   .   .    .     A         A    C  CACTAGGTAAATAACTTTAT                                                          .    AT    G  .                  . T  . .   . A    .         .  
blockSeqs                     :             .  .   .   .    .     A         A    C  GTTAAAAATAATGTTAT                                                             .    AC    C  .                  . C  . .   . T    .         .  
blockSeqs                     :             .  .   .   .    .     A         G    C  CAGGTATAAAA                                                                   .    AT    G  .                  . T  . .   . T    .         .  
blockSeqs                     :             .  .   .   .    .     A         G    C  CCAATAAGCAT                                                                   .    CC    G  .                  . C  . .   . T    .         .  
blockSeqs                     :             .  .   .   .    .     A         A    C  CCTACATAAG                                                                    .    CC    C  .                  . T  . .   . T    .         .  
blockSeqs                     :             .  .   .   .    .     A         A    C  CCTAGTAAAT                                                                    .    CC    G  .                  . C  . .   . T    .         .  
blockSeqs                     :             .  .   .   .    .     A         A    T  CCTAGTTAT                                                                     .    TC    G  .                  . C  . .   . T    .         .  
blockSeqs                     :             .  .   .   .    .     A         A    C  CCTAATAAA                                                                     .    CC    G  .                  . T  . .   . A    .         .  
blockSeqs                     :             .  .   .   .    .     A         A    C  CCTAGGTAT                                                                     .    AC    G  .                  . T  . .   . T    .         .  
blockSeqs                     :             .  .   .   .    .     A         A    .  CCTAGGAT                                                                      .    AT    G  .                  . C  . .   . T    .         .  
blockSeqs                     :             .  .   .   .    .     .         A    .  CTAAGTGT                                                                      .    AC    G  .                  . T  . .   . T    .         .  
blockSeqs                     :             .  .   .   .    .     .         A    .  GGGTA                                                                         .    TC    G  .                  . C  . .   . .    .         .  
blockSeqs                     :             .  .   .   .    .     .         .    .  GGGTA                                                                         .    AC    G  .                  . T  . .   . .    .         .  
blockSeqs                     :             .  .   .   .    .     .         .    .  AT                                                                            .    A     .  .                  . .  . .   . .    .         .  
blockSeqs                     :                .   .   .    .     .         .    .  AT                                                                            .    .     .  .                  . .  . .   . .    .         .  
blockSeqs                     :                                                                                                                                   .    .     .  .                  . .  . .   . .    .            
blockSeqs                     :                                                                                                                                   .    .     .  .                  . .  . .   .                   


blockSeqCons                  :                        **                   A**                                                                                                                      C*
originalCons                  :   GAGGGGCTTG-TG-TAG---A--AAA----AA-A---TCAAG-A-CACCC---C---------C--------TA--------G--------------G------------T-----A--T-------T--TTTA-C-TAGGG---------------GGTG-T-CT-T---G-A---TT-TTTTTTTCT---ACACAAGCCCCT
finalCons                     :   GAGGGGCTTG-TG-TAG---A--AAA----AA-A---TCAAGA--CACCC---C---------C--------TA--------G--------------G------------T-----A--T-------T--TTTA-C-TAGGG---------------GGTG-TC-T-T---G-A---TT-TTTTTTTCT---ACACAAGCCCCT





Alignments
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lowQualScore                  :             2  1   999 22   9999  11111 0   555  1  77777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777777 44   4444  2  222222222222222    3 44 1 333 1 1111 1         333            
lowQualScore                  :             .  .   ... ..   ....  ..... .   ...  .  ............................................................................. ..   ....  .  ...............    . .. . ... . .... .         ...            
lowQualScore                  :             0  9   000 66   8888  22222 3   111  0  88888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888888 11   0000  0  666666666666666    5 11 7 000 7 3333 8         333            
consensus                     :   GAGGGGCTTG-TG-TAG---A--AAA----AA-A---TCAAG-A-CACCC---C---------C--------TA--------G--------------G------------T-----A--T-------T--TTTA-C-TAGGG---------------GGTG-T-CT-T---G-A---TT-TTTTTTTCT---ACACAAGCCCCT
Reference ( family-9632 )     :   GAGGGGCTTG-TG-TAG---A--AAA----AA-A---TCAAG-A-CACCC---C---------C--------TA--------G--------------G------------T-----A--T-------T--TTTA-C-TAGGG---------------GGTG-T-CT-T---G-A---TT-TTTTTTTCT---ACACAAGCCCCT
gi|1                          :                                                                                                                           -------T--TTTA-C-TAGGG---------------GATG-TGTT-T---G-A---TT-TTTTTGTCT---ACA-AAGCCCC
gi|1                          :     GGGGCTT--TG-TAG---ACAAAA----AA-A---TCAAACA-CATCC---C---------C--------TA--------GTAAAATCAAT----GATTCT-------C-----A--T-------T--ATTA---TAGGGTGTTCTGTTTATAGAGGTG-T-TT-T---G-A---TG-TTATTTTCT---CAACAAGCCCCtcaatgattctcattattatagggtgttctgtttatagaggtgttttgatgttattttctcaacaagcccc
gi|10                         :    AGGGGCTTGGTG-TAG---A--AAA----AA-AAAACCAAT---CACCG---C---------CAGAAATCATAAACT----G--------------C------------T-----A--A-------T--TTTA-CGTAGGG---------------GGTG----------G-A---TT-TTTTTTTCT---
gi|11                         :        GCTTG-TG-TAG---A--AAAG---AA-A---TAAAG-A--ACCC---C-------------------A--------G--------------G------------T-----A--TAAAA---T--TTTA-T-TAGGG---------------GTTG-T-CT-T---G-G---AT-TTTTTTGCT---ACACAAGCCACT
gi|12                         :        GCTTG-TG-TAG---A--AAA----AA-A---TAAAGCA-CACCT---C---------C--------TA--------C--------------A------------TA----A--G-------A--TTTA-T-TA-GG---------------GGTG-T-CT-TTGCA-A------TATTTTTCT---ACACAAGC
gi|13                         :    AGGGGCTTG-TG-TAGAAAA--AAA----AA-A---TGATA-A-CACCC---C---------C--------TA--------GTAAAATTAAAAATAG------------T-----A--T-------T--TTTA-C-TA-CG---------------GGTG-T-TT-T---G-
gi|14                         :       GGCTTG--G-TAG---A--AAA----AA-----T--AG-A-CACCT---C---------CAA------TA--------A--------------G------------C-----A--T-------T--TTTA-T-TAGGG---------------GGTGTT-CT-T---GAA---TT-TTTTTTGCT---ACACAAGCg
gi|15                         :           TG-TG-TAGA--A--AAA----AA-A---TCAAA-A-CA-CC---C---------C--------TA--------G--------------T------------T-----A--T-------T--TTTA-C-TA-GG---------------GGTG-T-TT-T---G-AT--TT-TTTTTTTCT---ACACAAGTCCC
gi|16                         :         CTTG-TG-TAG---A--AAA----AA-AC--TCAAG-A-CA-CC---C---------C--------TA--------A--------------T------------A-----A--A-------T--TTTA-T-TACGG---------------GGTG-T-CT-T---T-A----T-TTCTTTTCT---ACACA
gi|17                         :    AGGAGCTTG-TG-TAG---A--AAA----CA-----TCAAG-G-----------------------------G--------G--------------G------------T-----A---------------------GGGG---------------GGTG-T-TT-T---G-A---TAATTTCTTTCT---ACACAAGCCCCTgct
gi|18                         :   cacGGACTTG-TG-CAG---A--AAAA---AA-A---TCAAG--------------------------------------------------------------------------A--T-------T--TTTC-C-TACGA-----------------------------A-A---TT-TCTTTTTCT---ACGCAAGCCCTTc
gi|19                         : cacAGGAGCTTG-TG-TAG---A--AAA----AA-----TCAAG-G-----------------------------G--------G--------------G------------T-----A----------------------GGG---------------GGTG-T-CT-T---G-A----T-TATTTTTCT---ACACAAGCCTCTatgt
gi|2                          :   cAAGGGCTTG-AG-TAG---A--AAA----AA-----TAAAG-A-CACCCATACGGAAAAATAC--------TA--------A--------------G------------TTATACA--TGTAA---T--TTCC-C-TAGGG---------------GGTGTT-TT-T---G-AATCTT-TTGTTTTGTCAAACACAAGCCCCgt
gi|20                         :      GGACTTG-TG-CAG---A--AAAA---AA-A---TCAAG--------------------------------------------------------------------------A--T-------T--TTTC-C-TACGA-----------------------------A-A---TT-TCTTTTTCT---ACGCAAGCCCgt
gi|21                         :    AGGGGCTTG-TG-TAGA--A--AAA----AA-A---TCATG-A-CACCT---C---------C--------TA--------G--------------G------------------A--T-------T--TTTT-C-Tatg
gi|22                         :                                                                                                                              acaggggctcgag-TAGGGA--------------GGTG-T-CT-T---G-A---TT-TTTTTTCTA---ACACAAGCCCCT
gi|23                         :                                                                                                                   ttatt--T-------T--TTT----TAGGG---------------GGT--T-CTAT---G-A---TT-TTTTTTTCT---ACACAAGCCCg
gi|3                          :     tGGGCTTG-AG-TAG---A--AAA----AA-A---TAAAG-A-CACCC---A------------------TA--------G--------------GAAAAATACAAGTT-----A--TACATGTATAGTTTC-C-TAGGG---------------GGTG-T-TT-T---G-AT--TT-TTTTTTTCA---ACACAAGCCC
gi|4                          :               G-TAG---A--CCA----AATG---TCAAA-AACACCC---C------------------TA--------A--------------G------------T-----G--T-------TA-TTTAAC-TAGGG-----------------TG-T--T-T---G-A---AT-TTTTTTTCT---ACACCAGCCC
gi|5                          :   caGGGGCTTG-TG-TAGT--A--AAAAATGAA-A---TCAA--A-CACCC---CA--------C--------TA--------G--------------GTAAATAACTT--T-----A--T-------T--TTTA-C-TA--G---------------GGTG-T-TT-T---G-A---TT-TTTTgactgcccttggggtgagggt
gi|6                          :    AGGGGCTTG-AG-TAG---A--AAA----AA-A------AA-A-CACTC---C---------C--------TA--------G--------------AATAAAAAAAA--T-----A--CACA----T--TTTA-T-TTGGG---------------GGT--T-CT-T---G-A---TT-TTTTTCTCT---ACACAAGCCaactaaaccaagaca
gi|7                          :   cAGGGGCTTG-TGGTAG---A--AAA-----------TCAAA-A-CCTAC---G---------T--------TAAAAATAATG--------------T------------T-----A--T-------T--TTTA-C-TAGGG---------------GGTG-T-TT-T---G-A----T-TTTTTTTCT---ACACAAGCC
gi|8                          :   GAGGGGCTTG-TG-TAG---A--AAC----AA-A---TCAAG-A-CACTC---C---------C--------TA--------G--------------G------------T-----A--T-------T--TCTT-C-TAGGG---------------GGTG-T-CT-T---G-A---TT-TTTTTTTCT---ACACAAGGCCCT
gi|9                          :        GCATG-TG-TAG---A--AAA----AA-AA--TTAAA-A-CACTC---C---------C--------TA--------G---------------------------T-----AAAT-------T--TTTA-C-TAGGA---------------GGTG-T-TT-T---G-A-------TTTTTTCT---ACACAAGCCCCT