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Reference ( gi|3 )            :                                TATTCGCTTCTCACTGTATCGTGCGTCCCA-TTGTATCGTGCTACTTTTATTTCC-GTCGTTTACG-CA-CGTGCAACGC-TTCCTTTGC-GGCAGG--TTATCTTTTA--AATTAAA-ACAGGAAATCA---TGTTGTTGGGC-CAGA-CAATATAATTTGAATTAAAGTTT-ATGC-TATTGGTAAG-TTTCTGC-AAA-T-AAA-TTCAA-ATAATGCAGAA-TCTGAATATTTCT--AA-AATACAT--ACC-AA-C--AAGAATTTAGAATG-------------GGCTA----ATTT---CAA-TTCC-AATG-TTTTGTAAGCGTTTC-CAAA-ATTTC---CTCAAGTAATT-TTCACCGTTAAAAA-TC-TTAATAAAATGTCGACAGATACGGA-GAATAATATGGAA-CGCCAG-AATGGTAAAACATGGTAAAATATTTTC-A-TGAAAACTTTAATTTGA-TTTG---G-TTT--TAT--------------TT-CGATTTCAAAGTCATATATAATAAACA-ATGAA-CATAA-ATTCAGATTTTTAAAGCATATTAATGGTCATTCTTTCATTAAAGATAAGAATTCTCGGTGTCTGAATGTG--AACAAATGTGGGAAAACAATATTTTTGGTATTAAAAA-TCATTCATTT--A-TTATTCTTA-TTCACA-GCGTAAAAATTGA-ACAACGCATCAATCATGCATGCAGAATTCTCCGTGTAATTTTACA-A-AAATTATCTA-TT-TGT-ATTTAAAGCAGATCAAAATGTAAAAAG-AAAGGCAA
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GGAA-ATCCAG-ATTGGTAAAAC-TGAATAAATATTTTC-A-TGAAAACTTTAATTTTA-TTTG---G-TTT--TATCCCAAGGTTTTTACTT-CAATTTCAAAGTCATAT--AATAAACA-ATGCA-CATAA-ATTTATCTATTTTAAGCATATTAATCTTCATTCTTTCATTAAAGATAAGAAATATCGGTGTTTCAATGTG--AGCAAATGTAGGAAAACAA--------------------CATTAATTT--A-CTATTCTTA-TTCACA-GCGTAAAAATTAA-GCAACGCATCAATCATACA--------------TGTAATATAACACA-AAATTGTGTATTT-TGT-ATTAAAAGCACGTTAAAG-GTAAAAAG-AAAGGCAAtc
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8 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
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Reference ( family-9076 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     NACTCGCTTCTCACTGTATCGTGCGTCCCA-TTGTATCGTGCTANTTTTATTT-CCGTCGTTTACG-C-ATGTGCAACGC-TTCCTTTG-CGGCAGG--TTATTTTTNAAA-TTAAAACATGAAATCA---TGTTGTTGGGT-CAGA-CAATATAATTTGAATTAAAGTTTAT-GC-TATTGGTAAG-TTTCTGCAAAATA-ACTTC-AAATAATGCAG-AATTTGA-ATATTTCT--AAAA-ATACGCCAA-CCAAGAATTTAGAATAATATATATTATTTGGCTAATTTCAA-TTC-CAATN-TTTTGGAATCGTTTC-CAAA-ATTTC---CTCNAGTCATT-TTCACCGTT-AAAAATC-TTAAT-A-AATGTCGACAGATACGGAGAANAATATGG-AACGCCAG-AATGGTAAAACATGANTAAATATTTT-CA-TGAAAACTTTAATTTG-ATTT-G---GTTT--TA-T--------------TTCGATTTCAAAGTCATATATAATAAACA-ATGAA-CATAA-ATTTAGATNTTTNAAGCATATTAATNNTCATTCTTTCATTAAAGATAAGAANTNTCGGTGTCTGAATGTG--AGCAAATGTAGGAAAACAATATTTTTGGTATTAAAAA-TCATTCATTT--A-CTATTCTTA-TTCACA-GCGTAAAAATTGA-GCAACGCATCAATCATGCATGCCGAATTCTCCGTGTAATNTTACA-A-AAATTATNTA-TT-TGT-ATTTAAAGCAGGTCAAAG-GTAAAAAG-AAAGGCAA
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gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tATTCGCTTCTCACTGTATCGTGCGTCCCA-TTGTATCGTGCTACTTTTATTT-CCGTCGTTTACG-C-ACGTGCAACGC-TTCCTTTG-CGGCAGG--TTATCTTTTAAA-TTAAAACAGGAAATCA---TGTTGTTGGGC-CAGA-CAATATAATTTGAATTAAAGTTTAT-GC-TATTGGTAAG-TTTCTGC-AAATA-AATTC-AAATAATGCAG-AATCTGA-ATATTTCT--AAAATACATACCAA--CAAGAATTTAGAATG-------------GGCTAATTTCAA-TTC-CAATG-TTTTGTAAGCGTTTC-CAAA-ATTTC---CTCAAGTAATT-TTCACCGTT-AAAAATC-TTAATAA-AATGTCGACAGATACGGAGAATAATATGG-AACGCCAG-AATGGTAAAACATGGTAAAATATTTT-CA-TGAAAACTTTAATTTG-ATTT-G---GTTT--TA-T--------------TTCGATTTCAAAGTCATATATAATAAACA-ATGAA-CATAA-ATTCAGATTTTTAAAGCATATTAATGGTCATTCTTTCATTAAAGATAAGAATTCTCGGTGTCTGAATGTG--AACAAATGTGGGAAAACAATATTTTTGGTATTAAAAA-TCATTCATTT--A-TTATTCTTA-TTCACA-GCGTAAAAATTGA-ACAACGCATCAATCATGCATGCAGAATTCTCCGTGTAATTTTACA-A-AAATTATCTA-TT-TGT-ATTTAAAGCAGATCAAAATGTAAAAAG-AAAGGCAAgcgt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   tGG-AAATCCAG-ATTGGTAAAAC-TGAATAAATATTTT-CA-TGAAAACTTTAATTTT-ATTT-G---GTTT--TA-TCCCAAGGTTTTTACTTCAATTTCAAAGTCATAT--AATAAACA-ATGCA-CATAA-ATTTATCTATTTTAAGCATATTAATCTTCATTCTTTCATTAAAGATAAGAAATATCGGTGTTTCAATGTG--AGCAAATGTAGGAAAACAA--------------------CATTAATTT--A-CTATTCTTA-TTCACA-GCGTAAAAATTAA-GCAACGCATCAATCATACA--------------TGTAATATAACACA-AAATTGTGTATTT-TGT-ATTAAAAGCACGTTAAAG-GTAAAAAG-AAAGGCAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -CATAATCTTTAGATATTTTAAGCATATTAATCTTCATTCTTTCAATAAAGATAAGAAATATCGGTGTCTGAATGTG--AGCAAATGTAGGAAAGCA-TATTTTTGGTATTAAAAA-TAATTCACTT--A-CTATTCTTA-TTCACA-GCGTAAAAATTGA-GCAACGCATCAATCATACATGCTGAAATCTCGGTGTAATATTACATG-AAATTATCTA-TT-TGT-ATTTAAATCAGGTCAAAG-GTAAAAAG-AAATGCAAgcatcgggtaagagttaaagaaaatatcgaattttgtctctattgccgctctatagattggtttgatgacatagcacaatacaatgaaacgctccaattttagcaaacgcgaagcaaacgaagtcacagaccatgtttttcacgaatttaaagagaaaaaaattaattgtttttaatgattccattgggaaatcggtgtactttttaaagataacaaatataactcaaacagttagtgtattggcatgtgtttattgaaagcatttagctagcacgatgcagtgagacaccgggc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ACTCGCTTCTCGCTGCATCGTGCTTCCCA-TTGTATCGTGCTAATTTTATTT-CCGTCGAATACG-C-ATGTTCAACAC-TTCCTTTG-CGGCAGG--TAATTTTTGCAA-TTAAAACATGACATCA---TGTTGCTGGGT-CAGA-CGATAAAATTTGAATTAAAGTTTAT-GC-TATTGGCAAG-TTTCTGCAAAATA-ACTTC-AAATTATGCAG-AATTTGATTTTTTTCT--AAAT-ATACACGAA-CCAAGAATTGAGAATAATATACATTATTTGGCTTATTCCAA-TTC-CAATC-TT----AA---------AAC-ATTTC---TTCCAGTC-CT-TTCATTGTT-AAGAATC-TGATT-T-AGTGCCGACAGATACTGAGGAATATATGG-AACACCAG-AATGGTAAAAT-TGAATAAATATTTT-CA-TGAAAAC-TGAATTTG-TTTT-G---GTTT--TA-T--------------TTCGATTTCAAAGTCATGTGTAATAAAgcgtctggtaagatttaaagaaaatatcgaattatattgctaattgcggtctatagattgatttaatgacgttgcatggtatgttaagtacattggaattcttcaatttcaacaaacgcgaagcaaacgaagttgcaaaccatgtttttcacgaatttaaagagaaaaaaattaattgtttttattcaatctgttttagaaaatggtgtactttaataacacattaaaggttagtgtattagaatgtttttacagaaagcatttaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCGCTTCTCACTTT-------GTCCCA-TTGTATCGTGCTAGTTTTATTT-CCGTCGATTACG-C-ATATGCGACAC-TTCCTTTG-CGGCAGT--TTATTTTTGCAA-TTAAAACATGAAATCA---CGTTCTTGGGT-CAGA-TAATATAATTTGAATTAAAGTTTAT-GC-TATTGGTAAG-TTTCTGC-AAATA-ACTTC-AAATAATGCAG-AATTTTA-TTTTTTCA--AAAA-ATACACCAA-CCAAGAGTTTAGAATAATATACATTATTTGG------TTAA-TTC-CAATC-CTTTAGAATCGTTTC-CAAA-ATTTC---CTC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taG-AACGCCAG-TATGGTA---------------TTTT-TA-TGAAAACTTTTATTTG-ATTT-AATTGTTTTATA-T--------------TTCGATTTAAAAGTCATATtgagaatctgatttcgtgtcgaacgccagtatggtatttttatgaaaacttttatttgatttaattgttttatatttcgatttaaaagtcatat
gi|8                          : tatcgcttctcactttgtcccattgtatcgtgctagttttatttccgtcgattacgcatatgcgacacttcctttgcggcagtttatttttgcaattaaaacatgaaatcacgttcttgggtcagataatataatttgaattaaagtttatgctattggtaagtttctgcaaataacttcaaataatgcagaattttattttttcaaaaaatacaccaaccaagagtttagaataatatacattatttggttaattccaatcctttagaatcgtttccaaaatttcctctgagaatctgatttcgtgtcACTCGCTTCTCACTGTATCGTGCGTCCCA-TTGTATCGTGATATTTTTATTT-CCGTCGTTTACG-C-ATGTGCAACAC-TTCCTTTG-CGGCAAG--TTACTTTAGGAA-TTAAAACATGAAATCA---TGTTGTTGGGT-CAGA-CAAAATAATTTGAATTA--GTTTAAAGC-TATTGGTAAG-TTTCTGCAAAATA-ACTTC-AAATAATGCAG-AATTTGA-ATATTTCT--AAAA-ATACACCAA-CCAAGAATTTAGAATAATATATATTATTTGGCTAATTTCAA-TTC-CAATT-TTTTGGAATCGTTTC-CAAA-ATTTC---CTCCAGTCATT-TTCACCGTT-AAAATTC-TT-------ATTT-----GATACGGAGAAAAATATGG-AA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -A-AAAT-ATATA-TT-TGT-AATTGAAGCTGGTTAAAG-ATAAGAAG-AAAGGCAA
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|13 ): TAGGCCAATTTTACATGTAAATGATAAAACCGAGAACAACAAATTTAATTGCATGACATTGTATCTTATTAGTGTCTTGAGAAATAGTATAGTTTATTAACATAACATTTAAATATAGCACGACTAAAGGCATTATTACTGTTTTTATTGAAAGCATTTAACTACACGATACAGAC
Unaligned ( gi|15 ): GTTTTTATTGAGTCCGTTAAGAAAATGGTGTACTTTTTGAACATAACAAATATAACACAAAATATTGGTGTATTATTGAAAGCATTTAACTAGCACGATATGGTGAGCCACCGGGCTACATTTTGTTGTTTTTGCACCAAAAGAAAAAAAAATCAAATTCTGC
Unaligned ( gi|16 ): TTGTATTTATTAAGTGTCTGAGAAAATAGTATAGTTATTAACATAACATTTTATATATATAGAAAACAAAGGCATTATACTGTTTTTATTGAAAGCATTTAACTAGCCGTAGACGGCACTGAATTGAAGCAC
Unaligned ( gi|20 ): TATACAATTTATTTTGTACGTAAATTTGAGCTATTTCTAGAAGAAAGAAACACATCATCAAATTGTCGCAGAT
Unaligned ( gi|21 ): GGCCTACCTGCTGTCAGGACAATAAAAATCAGGTCCT
Unaligned ( gi|22 ): GGCCTACCTGCTGTCAGGACAATAAAAATCAGGTCCT






Alignments
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Reference ( family-9076 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     NACTCGCTTCTCACTGTATCGTGCGTCCCA-TTGTATCGTGCTANTTTTATTT-CCGTCGTTTACG-C-ACGTGCAACGC-TTCCTTTG-CGGCAGG--TTATTTTTGGAA-TTAAAACATGAAATCA---TGTTGTTGGGT-CAGA-CAATATAATTTGAATTAAAGTTTAT-GC-TATTGGTAAG-TTTCTGCAAAATA-ACTTC-AAATAATGCAG-AATTTGA-ATATTTCT--AAAA-ATACACCAA-CCAAGAATTTAGAATAATATACATTATTTGGCTAATTTCAA-TTC-CAATG-TTTTGGAATCGTTTC-CAAA-ATTTC---CTCNAGTCATT-TTCACCGTT-AAAAATC-TTAATAAAATGTCGACAGATACGGAGAAAAATATGG-AACGCCAG-AATGGTAAAACATGANTAAATATTTT-CA-TGAAAACTTTAATTTG-ATTT-G---GTTT--TA-T--------------TTCGATTTCAAAGTCATATATAATAAACA-ATGAA-CATAA-ATTTAGATTTTTAAAGCATATTAATGGTCATTCTTTCATTAAAGATAAGAATTCTCGGTGTCTGAATGTG--AGCAAATGTAGGAAAACAATATTTTTGGTATTAAAAA-TCATTCATTT--A-CTATTCTTA-TTCACA-GCGTAAAAATTGA-GCAACGCATCAATCATGCATGCNGAATTCTCCGTGTAATTTTACA-A-AAATTATCTA-TT-TGT-ATTTAAAGCAGGTCAAAG-GTAAAAAG-AAAGGCAA
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gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atttaaagaaaatatcgaattatgtcgctgtttgcgctctgtagattgatgtgatgacgTCCAACTTC-CAATGCTTTTGGAATCGTTTTTCAAACATTCCTGTCTCCAATCATTGTTCACCGTT-AAAAATCGTTATTATGATGCCtcttcactagacttca
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GTTCCA-TTGTATCGTGCTAtc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                atttaaagaaaatatcgattatgtcgctgttgcgctctgtagattgtgtgatgacgTCGCTTCTCACTGTATCGTGCGTCCCAGTTGTATCGTGCTCATTTTATTT-CCGTCGTTTACGGC-ACGTGCAACGC-TTCCTTTG-CGGCAGG--TTACTTT--AAA-TTAAAACAGGAAATCA---TGTTGTTGGGCACAGAACAATATAATTTGAATTAAAGTTTAT-GCGTATTGGTAAGATTTCTGCAAATTA-AATTC-AAATAATGCAG-AATCTGA-ATATTTCT--AAAA-ATACACCAA-ACAAGAATTTAGAAT-------------TGGCTAATTTCAA-TTC-CAATG-TTTTGTAAGCGTTTC--AAA-ATTTC---CTCAAGTAATT-TTCACCGTT-AAAA-TC-TTAATAAAATGTCGACAGATACGGAGAATA-TATGG-AACGCCAGAAATGGT-AAACATG-GTAAATATTTT-CATTGAAAACTTTAATTTG-ATTT-G---GTTT--TA-T--------------TTCGATTTCAAAGTCAAATATAATAAACATATGAAGCATAA-ATTCAGATTTTTAAAGCATATT-ATGGTCATTCTTTCATTAAAGATAAGCATTCTCGGTGTCTGAATGT---AACAAATGTGGGAAAACAATATTTTTGGTATTAAAAATTCAGTTAATT--ATTTATTCTTA-TTCACAGGCGT--AAATTGA-ACAACGCATCAATCATGCATGCAGAATTCT-CGTGTAATTTTACA-A-AAATTATCTA-TT-TGT-ATTTAAAGCAGATCAAAT-GTATAAAG-AAAGGCAAtcttc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tATTCGCTTCTCACTGTATCGTGCGTCCCA-TTGTATCGTGCTACTTTTATTT-CCGTCGTTTACG-C-ACGTGCAACGC-TTCCTTTG-CGGCAGG--TTATCTTTTAAA-TTAAAACAGGAAATCA---TGTTGTTGGGC-CAGA-CAATATAATTTGAATTAAAGTTTAT-GC-TATTGGTAAG-TTTCTGC-AAATA-AATTC-AAATAATGCAG-AATCTGA-ATATTTCT--AAAATACATACCAA--CAAGAATTTAGAATG-------------GGCTAATTTCAA-TTC-CAATG-TTTTGTAAGCGTTTC-CAAA-ATTTC---CTCAAGTAATT-TTCACCGTT-AAAAATC-TTAATAAAATGTCGACAGATACGGAGAATAATATGG-AACGCCAG-AATGGTAAAACATGGTAAAATATTTT-CA-TGAAAACTTTAATTTG-ATTT-G---GTTT--TA-T--------------TTCGATTTCAAAGTCATATATAATAAACA-ATGAA-CATAA-ATTCAGATTTTTAAAGCATATTAATGGTCATTCTTTCATTAAAGATAAGAATTCTCGGTGTCTGAATGTG--AACAAATGTGGGAAAACAATATTTTTGGTATTAAAAA-TCATTCATTT--A-TTATTCTTA-TTCACA-GCGTAAAAATTGA-ACAACGCATCAATCATGCATGCAGAATTCTCCGTGTAATTTTACA-A-AAATTATCTA-TT-TGT-ATTTAAAGCAGATCAAAATGTAAAAAG-AAAGGCAAgcgt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tGG-AAATCCAG-ATTGGTAAAAC-TGAATAAATATTTT-CA-TGAAAACTTTAATTTT-ATTT-G---GTTT--TA-TCCCAAGGTTTTTACTTCAATTTCAAAGTCATAT--AATAAACA-ATGCA-CATAA-ATTTATCTATTTTAAGCATATTAATCTTCATTCTTTCATTAAAGATAAGAAATATCGGTGTTTCAATGTG--AGCAAATGTAGGAAAACAA--------------------CATTAATTT--A-CTATTCTTA-TTCACA-GCGTAAAAATTAA-GCAACGCATCAATCATACA--------------TGTAATATAACACA-AAATTGTGTATTT-TGT-ATTAAAAGCACGTTAAAG-GTAAAAAG-AAAGGCAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -CATAATCTTTAGATATTTTAAGCATATTAATCTTCATTCTTTCAATAAAGATAAGAAATATCGGTGTCTGAATGTG--AGCAAATGTAGGAAAGCA-TATTTTTGGTATTAAAAA-TAATTCACTT--A-CTATTCTTA-TTCACA-GCGTAAAAATTGA-GCAACGCATCAATCATACATGCTGAAATCTCGGTGTAATATTACATG-AAATTATCTA-TT-TGT-ATTTAAATCAGGTCAAAG-GTAAAAAG-AAATGCAAgcatcgggtaagagttaaagaaaatatcgaattttgtctctattgccgctctatagattggtttgatgacatagcacaatacaatgaaacgctccaattttagcaaacgcgaagcaaacgaagtcacagaccatgtttttcacgaatttaaagagaaaaaaattaattgtttttaatgattccattgggaaatcggtgtactttttaaagataacaaatataactcaaacagttagtgtattggcatgtgtttattgaaagcatttagctagcacgatgcagtgagacaccgggc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ACTCGCTTCTCGCTGCATCGTGCTTCCCA-TTGTATCGTGCTAATTTTATTT-CCGTCGAATACG-C-ATGTTCAACAC-TTCCTTTG-CGGCAGG--TAATTTTTGCAA-TTAAAACATGACATCA---TGTTGCTGGGT-CAGA-CGATAAAATTTGAATTAAAGTTTAT-GC-TATTGGCAAG-TTTCTGCAAAATA-ACTTC-AAATTATGCAG-AATTTGATTTTTTTCT--AAAT-ATACACGAA-CCAAGAATTGAGAATAATATACATTATTTGGCTTATTCCAA-TTC-CAATC-TT----AA---------AAC-ATTTC---TTCCAGTC-CT-TTCATTGTT-AAGAATC--TGATTTAGTGCCGACAGATACTGAGGAATATATGG-AACACCAG-AATGGTAAAAT-TGAATAAATATTTT-CA-TGAAAAC-TGAATTTG-TTTT-G---GTTT--TA-T--------------TTCGATTTCAAAGTCATGTGTAATAAAgcgtctggtaagatttaaagaaaatatcgaattatattgctaattgcggtctatagattgatttaatgacgttgcatggtatgttaagtacattggaattcttcaatttcaacaaacgcgaagcaaacgaagttgcaaaccatgtttttcacgaatttaaagagaaaaaaattaattgtttttattcaatctgttttagaaaatggtgtactttaataacacattaaaggttagtgtattagaatgtttttacagaaagcatttaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCGCTTCTCACTTT-------GTCCCA-TTGTATCGTGCTAGTTTTATTT-CCGTCGATTACG-C-ATATGCGACAC-TTCCTTTG-CGGCAGT--TTATTTTTGCAA-TTAAAACATGAAATCA---CGTTCTTGGGT-CAGA-TAATATAATTTGAATTAAAGTTTAT-GC-TATTGGTAAG-TTTCTGC-AAATA-ACTTC-AAATAATGCAG-AATTTTA-TTTTTTCA--AAAA-ATACACCAA-CCAAGAGTTTAGAATAATATACATTATTTGGTTAATTCCAA-TCC--------TTTAGAATCGTTTC-CAAA-ATTTC---CTC
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gi|8                          : tatcgcttctcactttgtcccattgtatcgtgctagttttatttccgtcgattacgcatatgcgacacttcctttgcggcagtttatttttgcaattaaaacatgaaatcacgttcttgggtcagataatataatttgaattaaagtttatgctattggtaagtttctgcaaataacttcaaataatgcagaattttattttttcaaaaaatacaccaaccaagagtttagaataatatacattatttggttaattccaatcctttagaatcgtttccaaaatttcctctgagaatctgatttcgtgtcACTCGCTTCTCACTGTATCGTGCGTCCCA-TTGTATCGTGATATTTTTATTT-CCGTCGTTTACG-C-ATGTGCAACAC-TTCCTTTG-CGGCAAG--TTACTTTAGGAA-TTAAAACATGAAATCA---TGTTGTTGGGT-CAGA-CAAAATAATTTGAATTA--GTTTAAAGC-TATTGGTAAG-TTTCTGCAAAATA-ACTTC-AAATAATGCAG-AATTTGA-ATATTTCT--AAAA-ATACACCAA-CCAAGAATTTAGAATAATATATATTATTTGGCTAATTTCAA-TTC-CAATT-TTTTGGAATCGTTTC-CAAA-ATTTC---CTCCAGTCATT-TTCACCGTT-AAAATTC-TT------ATTT-----GATACGGAGAAAAATATGG-AA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -A-AAAT-ATATA-TT-TGT-AATTGAAGCTGGTTAAAG-ATAAGAAG-AAAGGCAA
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|13 ): TAGGCCAATTTTACATGTAAATGATAAAACCGAGAACAACAAATTTAATTGCATGACATTGTATCTTATTAGTGTCTTGAGAAATAGTATAGTTTATTAACATAACATTTAAATATAGCACGACTAAAGGCATTATTACTGTTTTTATTGAAAGCATTTAACTACACGATACAGAC
Unaligned ( gi|15 ): GTTTTTATTGAGTCCGTTAAGAAAATGGTGTACTTTTTGAACATAACAAATATAACACAAAATATTGGTGTATTATTGAAAGCATTTAACTAGCACGATATGGTGAGCCACCGGGCTACATTTTGTTGTTTTTGCACCAAAAGAAAAAAAAATCAAATTCTGC
Unaligned ( gi|16 ): TTGTATTTATTAAGTGTCTGAGAAAATAGTATAGTTATTAACATAACATTTTATATATATAGAAAACAAAGGCATTATACTGTTTTTATTGAAAGCATTTAACTAGCCGTAGACGGCACTGAATTGAAGCAC
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Reference ( family-9076 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     NACTCGCTTCTCACTGTATCGTGCGTCCCA-TTGTATCGTGCTANTTTTATTT-CCGTCGTTTACG-C-ACGTGCAACGC-TTCCTTTG-CGGCAGG--TTATTTTTGGAA-TTAAAACATGAAATCA---TGTTGTTGGGT-CAGA-CAATATAATTTGAATTAAAGTTTAT-GC-TATTGGTAAG-TTTCTGCAAAATA-ACTTC-AAATAATGCAG-AATTTGA-ATATTTCT--AAAA-ATACACCAA-CCAAGAATTTAGAATAATATACATTATTTGGCTAATTCCAA-TTC-CAATG-TTTTGGAATCGTTTC-CAAA-ATTTC---CTCNAGTCATT-TTCACCGTT-AAAAATC-TTAATAAAATGTCGACAGATACGGAGAAAAATATGG-AACGCCAG-AATGGTAAAACATGANTAAATATTTT-CA-TGAAAACTTTAATTTG-ATTT-G---GTTT--TA-T--------------TTCGATTTCAAAGTCATATATAATAAACA-ATGAA-CATAA-ATTTAGATTTTTAAAGCATATTAATGGTCATTCTTTCATTAAAGATAAGAATTCTCGGTGTCTGAATGTG--AGCAAATGTAGGAAAACAATATTTTTGGTATTAAAAA-TCATTCATTT--A-CTATTCTTA-TTCACA-GCGTAAAAATTGA-GCAACGCATCAATCATGCATGCNGAATTCTCCGTGTAATTTTACA-A-AAATTATCTA-TT-TGT-ATTTAAAGCAGGTCAAAG-GTAAAAAG-AAAGGCAA
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gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tGG-AAATCCAG-ATTGGTAAAAC-TGAATAAATATTTT-CA-TGAAAACTTTAATTTT-ATTT-G---GTTT--TA-TCCCAAGGTTTTTACTTCAATTTCAAAGTCATAT--AATAAACA-ATGCA-CATAA-ATTTATCTATTTTAAGCATATTAATCTTCATTCTTTCATTAAAGATAAGAAATATCGGTGTTTCAATGTG--AGCAAATGTAGGAAAACAA--------------------CATTAATTT--A-CTATTCTTA-TTCACA-GCGTAAAAATTAA-GCAACGCATCAATCATACA--------------TGTAATATAACACA-AAATTGTGTATTT-TGT-ATTAAAAGCACGTTAAAG-GTAAAAAG-AAAGGCAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -CATAATCTTTAGATATTTTAAGCATATTAATCTTCATTCTTTCAATAAAGATAAGAAATATCGGTGTCTGAATGTG--AGCAAATGTAGGAAAGCA-TATTTTTGGTATTAAAAA-TAATTCACTT--A-CTATTCTTA-TTCACA-GCGTAAAAATTGA-GCAACGCATCAATCATACATGCTGAAATCTCGGTGTAATATTACATG-AAATTATCTA-TT-TGT-ATTTAAATCAGGTCAAAG-GTAAAAAG-AAATGCAAgcatcgggtaagagttaaagaaaatatcgaattttgtctctattgccgctctatagattggtttgatgacatagcacaatacaatgaaacgctccaattttagcaaacgcgaagcaaacgaagtcacagaccatgtttttcacgaatttaaagagaaaaaaattaattgtttttaatgattccattgggaaatcggtgtactttttaaagataacaaatataactcaaacagttagtgtattggcatgtgtttattgaaagcatttagctagcacgatgcagtgagacaccgggc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ACTCGCTTCTCGCTGCATCGTGCTTCCCA-TTGTATCGTGCTAATTTTATTT-CCGTCGAATACG-C-ATGTTCAACAC-TTCCTTTG-CGGCAGG--TAATTTTTGCAA-TTAAAACATGACATCA---TGTTGCTGGGT-CAGA-CGATAAAATTTGAATTAAAGTTTAT-GC-TATTGGCAAG-TTTCTGCAAAATA-ACTTC-AAATTATGCAG-AATTTGATTTTTTTCT--AAAT-ATACACGAA-CCAAGAATTGAGAATAATATACATTATTTGGCTTATTCCAA-TTC-CAATC-TT----AA---------AAC-ATTTC---TTCCAGTC-CT-TTCATTGTT-AAGAATC--TGATTTAGTGCCGACAGATACTGAGGAATATATGG-AACACCAG-AATGGTAAAAT-TGAATAAATATTTT-CA-TGAAAAC-TGAATTTG-TTTT-G---GTTT--TA-T--------------TTCGATTTCAAAGTCATGTGTAATAAAgcgtctggtaagatttaaagaaaatatcgaattatattgctaattgcggtctatagattgatttaatgacgttgcatggtatgttaagtacattggaattcttcaatttcaacaaacgcgaagcaaacgaagttgcaaaccatgtttttcacgaatttaaagagaaaaaaattaattgtttttattcaatctgttttagaaaatggtgtactttaataacacattaaaggttagtgtattagaatgtttttacagaaagcatttaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCGCTTCTCACTTT-------GTCCCA-TTGTATCGTGCTAGTTTTATTT-CCGTCGATTACG-C-ATATGCGACAC-TTCCTTTG-CGGCAGT--TTATTTTTGCAA-TTAAAACATGAAATCA---CGTTCTTGGGT-CAGA-TAATATAATTTGAATTAAAGTTTAT-GC-TATTGGTAAG-TTTCTGC-AAATA-ACTTC-AAATAATGCAG-AATTTTA-TTTTTTCA--AAAA-ATACACCAA-CCAAGAGTTTAGAATAATATACATTATTTGGTTAATTCCAA-TCC--------TTTAGAATCGTTTC-CAAA-ATTTC---CTC
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7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
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Unaligned ( gi|13 ): TAGGCCAATTTTACATGTAAATGATAAAACCGAGAACAACAAATTTAATTGCATGACATTGTATCTTATTAGTGTCTTGAGAAATAGTATAGTTTATTAACATAACATTTAAATATAGCACGACTAAAGGCATTATTACTGTTTTTATTGAAAGCATTTAACTACACGATACAGAC
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Reference ( family-9076 )     :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     NACTCGCTTCTCACTGTATCGTGCGTCCCA-TTGTATCGTGCTANTTTTATTT-CCGTCGTTTACG-C-ACGTGCAACGC-TTCCTTTG-CGGCAGG--TTATTTTTGGAA-TTAAAACATGAAATCA---TGTTGTTGGGT-CAGA-CAATATAATTTGAATTAAAGTTTAT-GC-TATTGGTAAG-TTTCTGCAAAATA-ACTTC-AAATAATGCAG-AATTTGA-ATATTTCT--AAAA-ATACACCAA-CCAAGAATTTAGAATAATATACATTATTTGGCTAATTCCAA-TTC-CAATG-TTTTGGAATCGTTTC-CAAA-ATTTC---CTCNAGTCATT-TTCACCGTT-AAAAATC-TTAATAAAATGTCGACAGATACGGAGAAAAATATGG-AACGCCAG-AATGGTAAAAC-TGAATAAATATTTT-CA-TGAAAACTTTAATTTG-ATTT-G---GTTT--TA-T--------------TTCGATTTCAAAGTCATATATAATAAACA-ATGAA-CATAA-ATTTAGATTTTTAAAGCATATTAATGGTCATTCTTTCATTAAAGATAAGAATTCTCGGTGTCTGAATGTG--AGCAAATGTAGGAAAACAATATTTTTGGTATTAAAAA-TCATTCATTT--A-CTATTCTTA-TTCACA-GCGTAAAAATTGA-GCAACGCATCAATCATGCATGCNGAATTCTCCGTGTAATTTTACA-A-AAATTATCTA-TT-TGT-ATTTAAAGCAGGTCAAAG-GTAAAAAG-AAAGGCAA
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gi|14                         :                                                                                                                               atacaatggaactcttcagtttcagcaaaatcaaagcaaacgaagttgcagaccatgattttcacgaatttaaagagaattttttttattgagttcgttgcgacaattgtgtactgtttaaacataataaatataacacaaaaggttagcgtatcagaatgttttttattgaaagcatttacatgtCGCTTCTCACTGTATCGTGCGTCCCA-TTGTATCGTGCTATTTTAATTT-CTGTCGTTTACG-T-ATATGCAGCGC-TTCCTTTG-CGGCATG--TTACTTTAAGAA-TTAAATCATGAAACCC---TGTGGTTGGGT-CAGA-CAACA-----------------TAT-GC-TATTGATAAG-TTTCTGCAAAATA-ACTTC-AAATAATGcgggc
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GTTCCA-TTGTATCGTGCTA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           atttaaagaaaatatcgaattatgtcgctgtttgcgctctgtagattgatgtgatgacgTCCAACTTC-CAATGCTTTTGGAATCGTTTTTCAAACATTCCTGTCTCCAATCATTGTTCACCGTT-AAAAATCGTTATTATGATGCCtcttcactagacttca
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             GTTCCA-TTGTATCGTGCTAtc
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                atttaaagaaaatatcgattatgtcgctgttgcgctctgtagattgtgtgatgacgTCGCTTCTCACTGTATCGTGCGTCCCAGTTGTATCGTGCTCATTTTATTT-CCGTCGTTTACGGC-ACGTGCAACGC-TTCCTTTG-CGGCAGG--TTACTTT--AAA-TTAAAACAGGAAATCA---TGTTGTTGGGCACAGAACAATATAATTTGAATTAAAGTTTAT-GCGTATTGGTAAGATTTCTGCAAATTA-AATTC-AAATAATGCAG-AATCTGA-ATATTTCT--AAAA-ATACACCAA-ACAAGAATTTAGAAT-------------TGGCTAATTTCAA-TTC-CAATG-TTTTGTAAGCGTTTC--AAA-ATTTC---CTCAAGTAATT-TTCACCGTT-AAAA-TC-TTAATAAAATGTCGACAGATACGGAG-AATATATGG-AACGCCAGAAATGGTAAACA-TG-GTAAATATTTT-CATTGAAAACTTTAATTTG-ATTT-G---GTTT--TA-T--------------TTCGATTTCAAAGTCAAATATAATAAACATATGAAGCATAA-ATTCAGATTTTTAAAGCATATT-ATGGTCATTCTTTCATTAAAGATAAGCATTCTCGGTGTCTGAATGT---AACAAATGTGGGAAAACAATATTTTTGGTATTAAAAATTCAGTTAATT--ATTTATTCTTA-TTCACAGGCGT--AAATTGA-ACAACGCATCAATCATGCATGCAGAATTCT-CGTGTAATTTTACA-A-AAATTATCTA-TT-TGT-ATTTAAAGCAGATCAAAT-GTATAAAG-AAAGGCAAtcttc
gi|3                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     tATTCGCTTCTCACTGTATCGTGCGTCCCA-TTGTATCGTGCTACTTTTATTT-CCGTCGTTTACG-C-ACGTGCAACGC-TTCCTTTG-CGGCAGG--TTATCTTTTAAA-TTAAAACAGGAAATCA---TGTTGTTGGGC-CAGA-CAATATAATTTGAATTAAAGTTTAT-GC-TATTGGTAAG-TTTCTGC-AAATA-AATTC-AAATAATGCAG-AATCTGA-ATATTTCT--AAAATACATACCAA--CAAGAATTTAGAATG-------------GGCTAATTTCAA-TTC-CAATG-TTTTGTAAGCGTTTC-CAAA-ATTTC---CTCAAGTAATT-TTCACCGTT-AAAAATC-TTAATAAAATGTCGACAGATACGGAGAATAATATGG-AACGCCAG-AATGGTAAAACATGGTAAAATATTTT-CA-TGAAAACTTTAATTTG-ATTT-G---GTTT--TA-T--------------TTCGATTTCAAAGTCATATATAATAAACA-ATGAA-CATAA-ATTCAGATTTTTAAAGCATATTAATGGTCATTCTTTCATTAAAGATAAGAATTCTCGGTGTCTGAATGTG--AACAAATGTGGGAAAACAATATTTTTGGTATTAAAAA-TCATTCATTT--A-TTATTCTTA-TTCACA-GCGTAAAAATTGA-ACAACGCATCAATCATGCATGCAGAATTCTCCGTGTAATTTTACA-A-AAATTATCTA-TT-TGT-ATTTAAAGCAGATCAAAATGTAAAAAG-AAAGGCAAgcgt
gi|4                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  tGG-AAATCCAG-ATTGGTAAAAC-TGAATAAATATTTT-CA-TGAAAACTTTAATTTT-ATTT-G---GTTT--TA-TCCCAAGGTTTTTACTTCAATTTCAAAGTCATAT--AATAAACA-ATGCA-CATAA-ATTTATCTATTTTAAGCATATTAATCTTCATTCTTTCATTAAAGATAAGAAATATCGGTGTTTCAATGTG--AGCAAATGTAGGAAAACAA--------------------CATTAATTT--A-CTATTCTTA-TTCACA-GCGTAAAAATTAA-GCAACGCATCAATCATACA--------------TGTAATATAACACA-AAATTGTGTATTT-TGT-ATTAAAAGCACGTTAAAG-GTAAAAAG-AAAGGCAA
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -CATAATCTTTAGATATTTTAAGCATATTAATCTTCATTCTTTCAATAAAGATAAGAAATATCGGTGTCTGAATGTG--AGCAAATGTAGGAAAGCA-TATTTTTGGTATTAAAAA-TAATTCACTT--A-CTATTCTTA-TTCACA-GCGTAAAAATTGA-GCAACGCATCAATCATACATGCTGAAATCTCGGTGTAATATTACATG-AAATTATCTA-TT-TGT-ATTTAAATCAGGTCAAAG-GTAAAAAG-AAATGCAAgcatcgggtaagagttaaagaaaatatcgaattttgtctctattgccgctctatagattggtttgatgacatagcacaatacaatgaaacgctccaattttagcaaacgcgaagcaaacgaagtcacagaccatgtttttcacgaatttaaagagaaaaaaattaattgtttttaatgattccattgggaaatcggtgtactttttaaagataacaaatataactcaaacagttagtgtattggcatgtgtttattgaaagcatttagctagcacgatgcagtgagacaccgggc
gi|6                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ACTCGCTTCTCGCTGCATCGTGCTTCCCA-TTGTATCGTGCTAATTTTATTT-CCGTCGAATACG-C-ATGTTCAACAC-TTCCTTTG-CGGCAGG--TAATTTTTGCAA-TTAAAACATGACATCA---TGTTGCTGGGT-CAGA-CGATAAAATTTGAATTAAAGTTTAT-GC-TATTGGCAAG-TTTCTGCAAAATA-ACTTC-AAATTATGCAG-AATTTGATTTTTTTCT--AAAT-ATACACGAA-CCAAGAATTGAGAATAATATACATTATTTGGCTTATTCCAA-TTC-CAATC-TT----AA---------AAC-ATTTC---TTCCAGTC-CT-TTCATTGTT-AAGAATC--TGATTTAGTGCCGACAGATACTGAGGAATATATGG-AACACCAG-AATGGTAAAAT-TGAATAAATATTTT-CA-TGAAAAC-TGAATTTG-TTTT-G---GTTT--TA-T--------------TTCGATTTCAAAGTCATGTGTAATAAAgcgtctggtaagatttaaagaaaatatcgaattatattgctaattgcggtctatagattgatttaatgacgttgcatggtatgttaagtacattggaattcttcaatttcaacaaacgcgaagcaaacgaagttgcaaaccatgtttttcacgaatttaaagagaaaaaaattaattgtttttattcaatctgttttagaaaatggtgtactttaataacacattaaaggttagtgtattagaatgtttttacagaaagcatttaa
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCGCTTCTCACTTT-------GTCCCA-TTGTATCGTGCTAGTTTTATTT-CCGTCGATTACG-C-ATATGCGACAC-TTCCTTTG-CGGCAGT--TTATTTTTGCAA-TTAAAACATGAAATCA---CGTTCTTGGGT-CAGA-TAATATAATTTGAATTAAAGTTTAT-GC-TATTGGTAAG-TTTCTGC-AAATA-ACTTC-AAATAATGCAG-AATTTTA-TTTTTTCA--AAAA-ATACACCAA-CCAAGAGTTTAGAATAATATACATTATTTGGTTAATTCCAA-TCC--------TTTAGAATCGTTTC-CAAA-ATTTC---CTC
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  taG-AACGCCAG-TATGGTA---------------TTTT-TA-TGAAAACTTTTATTTG-ATTT-AATTGTTTTATA-T--------------TTCGATTTAAAAGTCATATtgagaatctgatttcgtgtcgaacgccagtatggtatttttatgaaaacttttatttgatttaattgttttatatttcgatttaaaagtcatat
gi|8                          : tatcgcttctcactttgtcccattgtatcgtgctagttttatttccgtcgattacgcatatgcgacacttcctttgcggcagtttatttttgcaattaaaacatgaaatcacgttcttgggtcagataatataatttgaattaaagtttatgctattggtaagtttctgcaaataacttcaaataatgcagaattttattttttcaaaaaatacaccaaccaagagtttagaataatatacattatttggttaattccaatcctttagaatcgtttccaaaatttcctctgagaatctgatttcgtgtcACTCGCTTCTCACTGTATCGTGCGTCCCA-TTGTATCGTGATATTTTTATTT-CCGTCGTTTACG-C-ATGTGCAACAC-TTCCTTTG-CGGCAAG--TTACTTTAGGAA-TTAAAACATGAAATCA---TGTTGTTGGGT-CAGA-CAAAATAATTTGAATTA--GTTTAAAGC-TATTGGTAAG-TTTCTGCAAAATA-ACTTC-AAATAATGCAG-AATTTGA-ATATTTCT--AAAA-ATACACCAA-CCAAGAATTTAGAATAATATATATTATTTGGCTAATTTCAA-TTC-CAATT-TTTTGGAATCGTTTC-CAAA-ATTTC---CTCCAGTCATT-TTCACCGTT-AAAATTC-TT------ATTT-----GATACGGAGAAAAATATGG-AA
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -A-AAAT-ATATA-TT-TGT-AATTGAAGCTGGTTAAAG-ATAAGAAG-AAAGGCAA
7 sequences could not be aligned to this reference sequence:
Unaligned ( gi|10 ): ATGTAAAGAAAATATCAAATTACGTCGCTGTTTGCGGTCTGTAGATTGATTTGATGACGTAGCAGGATACAATGGAACTCTTCAGTTTCAGCAAACGCAAAGCAAACGAAGTTGCAGACCATGATTTTCACGAATTTAAAGAGAAAAATTTAGGCCTAATTGTTTTTATTGAGTCCTTTGAGAAAATTGTGTACTTTTTTAACATAATAAATATAACACAAAAGGTTAGTGTATTAGAATGTTTTCATTGAAAGCATTTAAGTAGCACAATACATTGAGACACCG
Unaligned ( gi|13 ): TAGGCCAATTTTACATGTAAATGATAAAACCGAGAACAACAAATTTAATTGCATGACATTGTATCTTATTAGTGTCTTGAGAAATAGTATAGTTTATTAACATAACATTTAAATATAGCACGACTAAAGGCATTATTACTGTTTTTATTGAAAGCATTTAACTACACGATACAGAC
Unaligned ( gi|15 ): GTTTTTATTGAGTCCGTTAAGAAAATGGTGTACTTTTTGAACATAACAAATATAACACAAAATATTGGTGTATTATTGAAAGCATTTAACTAGCACGATATGGTGAGCCACCGGGCTACATTTTGTTGTTTTTGCACCAAAAGAAAAAAAAATCAAATTCTGC
Unaligned ( gi|16 ): TTGTATTTATTAAGTGTCTGAGAAAATAGTATAGTTATTAACATAACATTTTATATATATAGAAAACAAAGGCATTATACTGTTTTTATTGAAAGCATTTAACTAGCCGTAGACGGCACTGAATTGAAGCAC
Unaligned ( gi|20 ): TATACAATTTATTTTGTACGTAAATTTGAGCTATTTCTAGAAGAAAGAAACACATCATCAAATTGTCGCAGAT
Unaligned ( gi|21 ): GGCCTACCTGCTGTCAGGACAATAAAAATCAGGTCCT
Unaligned ( gi|22 ): GGCCTACCTGCTGTCAGGACAATAAAAATCAGGTCCT