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gi|23                         :  ctggGTTG-AAAAA---CACA--AGCAATTGACGTTTAA--AAAT--G---CAT-------TA-----AA--TAT---A-A----------AATAA-------T-CTTTCCTATAAGCAA-AT-------TATT--GAC-A-TT-AA---T-A-G--T---T-accgt
gi|1                          :       TTGAGAAACGGTCACA--GGCACTTAGCGTTTAG--ATAT--ATTACAT--GCATGTG-----CAACTTC---A-ATACTCTGGCCAAGAA-A-ATA-T-CTCCCAT-TAAAAAA-AAACCCTAATATCCGGAC-ACACGAA---T-ACG--T---A-TTTT-----TACCA------------GA------GAAAAATATTAAATTAG-A-----------------T-AT-GCTA-AAACCGCTCA-------------C--AGTGAACTGT--GTCGG-AAACAATTTTACTGACATTTTTTGCTTTTGGA-ACAGTA-CAT-------TT-------------GGGGGGG-GG---C-
gi|6                          :            ttggcagtACA--GTCATTA-----TTAGCTAAATGGA---CATTGGCAT------------TTT---A-A----------AAAAATA-AT-----TTCCAT-TAAAGAATAA-------TAG---GAC-A-AC-AA---T-A-AA-T---C-TATT------GACACCCATTGTATTTG-------CAG-------------G-A-----------------T-AT-GTTT-AACA-GTAA--------------CTATGTC--CTAT--GTCG--AAAC-----ACCTGA-ATTT---G-TTCG-AA-ACATGA-TTT-------AGGC---------GGAGGGGGGTGG---TTCAACTTCGTCAT----CAAT-AAGCT-TA---TTTAT--CTT--GACC-----AAGATT-ACACC---TATTATCGTTGA-G----TAAT-CTA-GCTATT--CAAA----CTTGT-AGCCAAC--TC------------AACTGTTCGTG-CT-ATG-TAACCA--TAAC-ATGTAT----GA----A-------AT--------------------T----------------------CTGCG------AGT-CAGATGATTCAGGTA-ATAC-------AAGT------ACAG-----GTTTTTTT-TC---AAG--AAGTCA---T-ACTATC---AGTTATT--------A-------------T----------ACCACTAT-ATATGAACACA----GC-TA-AGTAC-----CATATAT--ATG-ATTT-----TGT---GAACAGAAGAGAAACAA---ATATTTAG--GGA-ATCG-----A-T---C---TTGGATC------ATTAT-TGA------TCCAT--GT----------TTGATC-T-TA----------TCTACTTC---AG--CT-AG-TTTT--------------GCA-----CATAATA---------AATAA--AAAAT-GTATAAG-ATAACATTTATT---ATAAGATTTA-C-TT---AATA--TTT----TATAT----AAT--TTTAA-A--------------TTTGTTGA---TACCT-AGCTATGGC-AATCTTATGAAGTT--TCA-CAAG-G-TTAGATCC-TT------------------------TAGATAATtgcgggccggtccaaatcagtattcagtttgatattgtcgctcatcatgcgtctggtataccagcaacgatataattcttgtcgacactcttctcaagctttgaacggtatcctacgctctgctctccccaaccttgtcagaccatctcaaactgttagctaggttacatggaacaatgtaaaaccccaatcatttaattaccagtgagtacggtaaatacacctaccagctgtttgacaggttattttttacaacctggtcaagtttggcaacattttaccgatttataaactaacttatatgacagctacctaagctcaattatatattgacagtttttttgtgtcgaaacagaagagaaacaaaattgaggcgaatacactcaaagttattttagttgggcttctcagtcttcttcttcttactcttaccctgaaaccctgagtttttctcaatccctctagcatttactacaacatactccccacataaaatggttaagtcctctccaataagtcaggtctttcgaagattatcattaagtccttgtgtttaccgacacttgtgaaa
gi|4                          :                                             caggttcagaa--GCAT-TG-----CA--TTTT--A-A----------AAAAATA-ATA-TGCTTCCAT-TAAAGAA-AC-------TAATAGGAC-A-AC-AA---A-A-AAAT---C-TATT------GACACCCATGTTTTT-G-------CAG-------------G-A-----------------T-ATTGTTT-AAAAAGTATA-------------CTA-GTC--CTAT--GTTCG-AA-------CACTGA-ATTTT--GCTTCGAAAGACA-TA-TTT-------ATTT---------GGGGGGGGG-GGGT-T-CAACTTG-T---------ATCAAAGC-TA---TTTAT--CTCTG-ACCAA--GAAATAT-ATATCG---TTGAT-GTG-AAG----T--C---A-GCTATT-CCAAA--AC-TTGT-AG--AAC--TC------------AACTGTTC--GGCT-AG--TA--CATTAAAC-ATGTATTTT-GA----A-----C-AT--------------------TT-------------A----C--CTGCGGTCAGATGT-CAGGTAA-------T-ACAC-------C-GT---T-ACCAGG-----TTTTTTT-TA----AG--AAG-CTGCAT-AC-ATT---A--------------A-------------T----------A--GAT-TATTATATCAATATATGACACG-AG--CAG---TACATAT--ATAGATTT-----TGT-G-AAACAGAAGAGAAC-AA---ATATTTAG--GGAAATCT-----G-TATCC---TTGGA-C--------------AC------TTATTGAT----------CC--TT-T-T------------TGATTCTT------CTACA-TTCT-----A----GCTAGT-TTTGCTACAATA---TATCAAGATAAAAAAAAT-GTATAAGTAC---ATTTATCTATGTAAGATTTA-C-T-----AAA--TTT----T-TAT----AACTTTTAAGTAT-----A------TTTGG-TG----TACTCTAGCA-TGGC-AATCTTATGA--TT--TCA-CAA----TTAGAT-C-TTTAAGATATATCATAAGTTGTCTCGAAGATAATCA--TAAG-T-C--------T------G----TCTTAC-GACAAA---------------TGTG-AAACCCAGTC
gi|5                          :                                                                                                                    ggaGAA-AC-------TATT--GAC-G-AC-AACATT-A-G--T---T-TATT-----TACC---------------------GAA-------------G-AAT---------------T-AT-ATT---AGATATG-------------------GTG--CC---TATCGGGAAAC-----CACTGA-ATCTT--GCTTCGGAA-A-AGTAATTT-------TTTTCGGGGGTGGGGGGGGGGG-GG---T-TATCTTC-GTCA--GTCAAT-AA-GC-TA---TTTATT-CTCTGGACCAGA-GAAA-TT-ATACAACCGTTTAT-ATTGAAG----T--TCCTA-GCTATTTCCAAA---CCTTGT-A---GAC--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CT-AGG-TA--CATGTAAC-ATGCAA----GA----A-----C-AT--------------------TT-------------AATTACA-CAGCG------AGTACAG-TAA-------A-GCGC-------CCGT---TTAACAGGGTTT---TTTTT-AA---TGG--AAG-CT---T-GC-AAC---ATTAATAGTTTT---A-------------T----------ACCACT-T-TTATGACAACA----GC-CT-AG--C-----TGCATATT-ATA-ATTT-----TGTTG-AA-CAGAAGAGAAA-AA---ATATTTAG--GGATATCC-----G-TATCC---TTGGA-CTACTA-G-TATATAAC-A--TTTCAT--AT----------CC--TT-T-TGATCCTTTTT-TTAACTCCTGAAA--CTGAG-TTTTCT-CAA----TTTAGTATTTGCTACAATA---TCCCAGAAT----AAAAT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TT---AAGATTTTT----T-TAT----AAC--TT-AG-AT-----AG-----TTTTGTTGA---AAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCA-TAA--GTTTAGAT-C-TT------------------------AAGATAATCA--TAAG-T-C--------T-----------TCTTAC-GACAAATCTTAAGAT-AGTTTTGTGAAAACCCAG
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AC-----GACTGA-ATATT--GCCTCGAAA-ATAATA-TTTGTTGTCTTTTT------------------------T-CAACTTCCTCCG--TT-AAT-AAC--------TCTAT--CTCTGATGCAGA-GAAATTT-GGACTTCGTTTCA-------CG----T--TCCTC-GCCATTTCCAAC--ACCGTCT-C---GAC--TCTTTAAATACG--AAATGTTC--A-CT-AGA-TA--T---------TGCGA----GA----A-----C-AT--------------------TT-------------A----
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG-GG-----TAACTGCATCCA--T-CAAT-AAGG-----------T--CTCTGAACCAGA-GAAATTA-GTTCACCGTTTCAT-GTTGAAG----T--TACTA-ACTATTTTCAAAACACCTTGC-A---GAC--TCT-------GG--AACATTTC--G-TT-AGA-TA--CGTGTAAC-GTCTAA----CA----AAATTTC-AT--------------------TTAACTCCGTTGACAA----TA-CAGCA------AGTTCAG-CAG-------A-ACAC-------TCGT---ATA
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CGTTTCAT-ATTGAAG----T--TCTT-----ATTTCCAAA--ACCTTGT-A---GAC--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CT-AGG-TA--CATGTAAC-ATGTAATCTTGA----A-----C-AT--------------------TT-------------------A-CAGCG------AGTGCAG-TAA-------A-ACGC-------CCGT---TTAACAGGG---GTTTTTTTAAA---TAG--AAG-CT---T-GC-AACATTA--------------A-------------TAGTTTTATAAA--ACT-T-TTATGACACCA----GC-CT-AG--C-----TACATAT--ATA-ATTT-----TGTTG-AAACAAAGAGAAAA-AA---ATATTTAG--GGATATCC-----A-TATCC---TTGGA-CTAATA-A-TATGTAAC-A--TTTCAT--AT----------CC--TT-T-TGATCCTTTTTTTTAACTCCTGAAA--C--AG-TTTTCT-TAA----TTTAG------------TA---TCCCAGAAT----AAAAT-GG-TAAGCA-------TATC---GTAAGATTTATC-TT---AAGA--TTT----T-TAT----AAC--CTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGG---AAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCA-TAA--G-TTAGAT-C-TT------------------------AAGATAATCA--TAAG-T-C--------T------G----TCTTAC-GACAAATCTTAAGAT-AGTTTTGTG-AAACCCAG
gi|1                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          tacacTACG----C--TCT---GCTCTCCCCAA----CCTTGTCA---GACCATCT-------CA--AACTGTTA--G-CT-AGGTTA--CATGGAACAATGTAA----AACCCCAAT---C-AT--------------------TT-------------AAT--TACCAGTG------AGTACGG-TAA-------ATACACCTACCAGCTGT---TTGACAGG--TTATTTTTTA-CAACCTGGTCAAG-TT---TGGC-AAC---ATTTT----------ACCGATTTATAAACT----------A--ACT-T-ATATGACAGCT----AC-CTAAG--CTCAATTATATATTGACA-GTTTTTTTGTGTCG-AAACAGAAGAGAAA-CA---AAATTGAGGCGAATACACTCAAAGTTATTTTAGTTGGG-C------T-TCT----C-AGTCTTCTT--CT----------TC--TTAC-TC----------TTA--CCCTGAAACCCTGAGTTTTTCT-CAATCCCTCTAGCATTTACTACAACATACTCCCCACAT----AAAATGGT-TAAG
gi|13                         :                                                                                                                         ttggcagtttgagaaacggtcacaggcacttagcgtttagatatattacatgcatgtgcaacttcaatactctggccaagaaaatatctcccattaaaaaaaaaccctaatatccggacacacgaatacgtatttttaccagagaaaaatattaaattagatatgctaaaaccgctcacagtgaactgtgtcggaaacaattttactgacattttttgcttttggaacagtacatttgggggggggctgcgggccggtccaaatcagtattcagtttgatattgtcgctcatcatgcgtctggtataccagcaacgatataattcttgtcgacactcttctcaagctttgaacggtatccTTGT-AGA-AAA--TCT-------TA--AAATTTCT--G-AT-A----A--CAT-TAAC--TGTGT----TG----A-----C-A------------------------------------A----TA-TAGCG------GATGGAG-TCG-------A-ACAC-------CCAT---TCAACA-------TCTTTTT-TA---TGG--AAG-CT---T-GC-AAC---ATTTATATTTTTAT-A-------------C----------A--ACT-T-TTATGACAGCA----GC-CT-AC--G-----TACA----------------------G-AAACAGAA--GAAA-AAT--ATATTTAG--GGATATC--------TA--C---T---A--------G-TATATAAC-A--AATCAT--GT----------TC--TT-T-Ttcctctccaataagtcaggtctttcgaagattatcattaagtccttgtgtttaccgacacttgtgaaa
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       --------------------TT-------------A----CA-CAGCG------AGTACAG-TAA-------A-TCAC-------CCGT---TTAACAGGGTTT------TT-AA---TGG--AAG-CT---T-GC-AAC---ATTAATAGTTTTAT-A-------------C----------A--ACT-T-TTATGACAACA----AG-CT-AG--C-----AACA-AT--ATA-ATTT-----TGTTG-AAACAGAAA-GAAA-AA---ATATTTAG--GGATATCC-----G-TATCC---TTGGA-CTAACTAG-TA-ATAACCA--TTTCAT--ATTCCTTTTGATCC--TT-T-TT----------TTAACTC-TGAAA--CTGAG-TTTTC--CAA----TTTAGTATTTGCTACAATA---TCCCAGAAT----AAAAT-GA-TAAGCAT-AAACTTATC---GTAAGATTTATCTTT---AAGA--TTT----T-TAT----AGC--TTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGA---AAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCA-TAA--G-TTAGAT-CTTT------------------------AAGATAATCA--TAAG-T-C--------T------G----TCTTAC-GACAAATCTTAAGAT-AGTTTTGTG-AAAACCga
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tatcatcatttaaAA-------A-ACAC-------CCGT---TTAACAGTGT--GTTTTTTT-TA---TGG--AAG-CT---T-GC-AAC---ACTAATAGTTTTAT-A-------------C----------A--ACT-T-TTATGACAATA----GC-CT-AG--C-----TACATAT--ATA-ATTT-----TGTTG-AAAg
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -ATTT-----TGTTTTAAACAGAATAGAAA-TG---ATATTCAG--GGACATTA-----A-TACTC---TTGGA-CTTCTA-G-TATATA-C-A--TTT---------------------------------------TAAC--ATGAAA--TTAAG-TCATCT-CAA----TTTAGCATTTATTACAATA---TCCCAGAAT-----AGAT-TT-CAAA-ATGCAA-TTATC---ATCAAATATA
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AAACAAA-AACGGACATTTAC--GGATATC--------------------A--------G-TATAAAGC-A--ATTTAT--AT----------CA--T-----A----------TTGA-TCCCGAAA--CTGGG-ATTTCA-AAA----TTTACAATTTGTTATTATA---TCCAAGAAT----AAAAA-GT-CAAGCATGCCACTTATC---GTAATATTTGTT-TT-----------C----T-TAT----ATC--TCAAG-AT-----AT-----TTCTG-TGA---AAC---AACAGTGGC-GATCTTGTGA--TT-GTCA-TAG--G-TCAGAT-C-TT------------------------AAGATAATCA--TAAGAT-C--------T------G----TTTTCT-GAGAAACCTTAAAAT-AGACTTGT
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tTAAC-A--CTTTG---AT----------CC--TT-TCTA------------AATCCCCGAAA--CTACA-TTATCT-CAG----TTTAGCATTTATTACGATT---GACCAGAAT----GAATT-GT-TAAGGATGAAACTTATC---GTAAGATTTGTC-AT---AAGA--TTT----T-TATACAGAAC--TAAAT-ATATCTAAGGGCATTTTTG-TGA---AGC---ACCAGTGACAAATCTTATGA--GT-GTCA-TAA--G-CCAGAT-C-TT------------------------A--ATA-------AAG-TCC--------T------G----TCGTAT-GACGAATTCTAAGAT-ACTTTTGTG-AAACACAGCC
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         tactggtacatttttgcgttccaggAGAT-CT-TAAG-ATAA------TC---GTAAG-TCTGTC-TT---ACGA--C---------AA----ATC--TTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGA---AAC---
gi|5                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ttttataacttaagatagttttgtgaaacagcagtggcaatcttatgtttgtcacaagttCACAAAACT-ATC---TTAAGATTTGTC-GTAAGAAGA--CTTATGAT-TAT------C--TTAAG-AT------------CT------A---AAC-----TTATGAC-AATCATAAGA--TT-GCCACT----G-CT--GT-T-TC------------------------AACAAAACTATCTAAG-T-TA-------TAAAAAAA----TCTTAA-GATAAATCTTACGATAAGTTTTATG-
gi|2                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         gaaactattgacgacaacattagtttatttaccgaagaattatattagatatggtgcctatcgggaaaccactgaatcttgcttcggaaaagtaatttttttcgggggtgggggggggggggttatcttcgtcagtcaataagctatttattctctggaccagagaaattatacaaccgtttatattgaagttcctagctatttccaaaccttgtagactctcaaactgttcgctaggtacatgtaacatgcaagaacatttaattacacagcgagtacagtaaagcgcccgtttaacagggttttttttaatggaagcttgcaacattaatagttttataccacttttatgacaacagcctagctgcatattataattttgttgaacagaagagaaaaaatatttagggatatccgtatccttggactactagtatataacatttcatatccttttgatcctttttttaactcctgaaactgagttttctcaatttagtatttgctacaatatcccagaataaaatgttaagCACAAAACT-ATC---TTAAGATTTGTC-GT---AAGA--C---------A-----GAC--TTATG-AT-----TA-----TCTTT-AGATCTAAC-----TTATGAC-AATCATAAGA--TT-GCCA-CTGCTG-TT---T-C-AC------------------------AAAACTATCT--TAAG-T-TA-------T------AAAAATCTTAA-GATAAATCTTACGATAAGTTTTATG-aaaacccag
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttggagttggaaaccataggcacttggcgtttagaaatacatgcatgtagactacatttgataaaaaaaattatcttcctttaaagaaagtattaacagttatatttacaggaaaattacaattacaatatagatatgctttaaattctaagtggcctgtgtcgtaaccactgaattgcttcgaacaggacgatttggggggaggtcaacttcgtcatagtcataaactatacaatctattcctctgacctcaaaaattagtaactcggtcttgtcaatgggagtatcctatgctattatcaaaactctttagctctcacaaactttcgcccaggtacagacatgcacaaattaattacatagtgaatacagtaaaacatgcgtgtattaacatgttttttatatggaagcttgcaacattaatagttttaatacaacttttatgacagcagtgtagctacatatataatttagttgaaacagaagaaaaaaaatatttagagatatcagtatccttggactactagtatacaacacttcatattcttttgatcctttttttaattcctgaaactgagtttttttcgatttagaatttactacaatatcccaaaataaattgttaagTT----T-TAT----AAC--TTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGA---AAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGT--TT-GTCA-CAA--G-TTAGAT-C-TT------------------------AAGATAATCG--TAAG-T-C--------T------G----TCTTAC-GACAAATCTTAAGAT-AGTTTTGTG-AAACaaacccagcc
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               G-AT-----AA-----TTTTA-TGA---AAC---AACAGTGAT-AATATTATGA--TT-GTCA-TAA--GATT--AT-C-GT------------------------AAGAT
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              tG-AT-----AA-----TTTTA-TGA---AAC---AACAGTGAT-AACATTATGA--TTGGTCA-TAA--GATT--AT-C-GT------------------------AAGATctgtttgattacattagagaaaccctgcc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ggtG-----TTTTG-TGA---AAC---AACAGTGGC-AATCTTATGG--TT-GCCG-TAA--G-TCAAAC-C-TT------------------------AAGATAATCA--TAAG-T-C--------T------G----TCTTGC-GACAAATCTTAAGAT-AGTTTTGTG-GAACCCAGCCctgtttgattacattagaggaaaccctgccct
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ATCTTATGA--TT-ATCT-TAA--GATCTGA--C-CT------------------------ATGACAATCA--CAAGAT-CGCCACTGTT------G----TTTCACAGAAATATCTTGAGAT-A
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          taaacaaaaacggacatttacggatatcagtataaagcaatttatatcatattgatcccgaaactgggatttcaaaatttacaatttgttattatatccaagaataaaaagtcaagcatgccacttatcgtaatatttgttttctta----TCTTAT-GACAAATCTTACGATAAGTTTctgttttctgagaaaccttaaaatagacttgt
2 sequences could not be aligned to this particular reference sequence:
Unaligned ( gi|17 ): TAAAGGACATTTTGAAATACTAATTTTAAATTAATATGACCAATAAGGTCGCAACATTTTTTTTTTATAATGGAAGTTTTGCAAACATTCATATTTTTATACAAGTTAACATACCTGCAGCTCAGCTACATAC
Unaligned ( gi|25 ): ATACATTTTTTTTGGGGGGGGGGGGGGCATCCATAAATATATGTCTACTAACCAGCAGGAGAAAGTT






Alignments
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gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ctggAAA-AACGGA-CATTTAC--GGATATC-------------------------------AGTATAAAGC-AATTTAT--AT----------CAT------A----------TTGA-TCCCGAAA--CTGGG-ATTTCA-AAA----TTTACA-A--TTTGTTATTATA---TCCAAGAAT----AAAAA-GT-CAAGCATGCCACTTATC---GTAATATTTGTT-TT--------CT-TAT----ATC--TCAAG-AT-----AT-----TTCTG-TGAAAC---AACAGTGGC-GATCTTGTGA--TT-GTCATAG-G-TCAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAGAT-CTGTTTT-CTGAGAAACCTTAAAATAGACT---------TGT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           taaacTTGT-AG---A-AAATCT-------TA--AAATTTCT--G-AT-A----A--CAT-TAAC--TGTGT----TG-----A-----C-A------------------------------------A----TAT-AGCGG------ATGGAG-TCG-------A-ACACCC-------AT---TCAACA-------TCTTTTTTA---T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CATTT-ATAT-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATGACAGCAGCCTA-C--GT-----ACA----------------------G-AAACAGAAGA-AAA-AT---A-TATTTAG--GGATATCT-------------------ACT-A-------GTATATAAC-AAATCAT--GT----------TCTT-T--T
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG---------GG--T--AACTGCA----TCCAT---CAAT-AAGG------------T--C-----T-CTGA---ACCA----GAGA------AATT--AGT--TCAC-C-G---TT-TCA-T-G--TTGA--A--GT-TACTA-ACTAT---TTTCAAAACACCTTGC-AG---A-C--TCT-------GG--AACATTTC--G-TT-AGAT-A--CGTGTAACG-TCTAA----CA-----AAATTTC-AT--------------------TTAACTCCGTTGACAA----TAC-AGCAA------GTTCAG-CAG-------A-ACACTC-------GT---ATAga
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      AC-----GACTGA-ATATT--GCCTCGAAA-ATAATA-TTTGTTGTCTTTTT-------------------------------T-CAACTTCC----TCCGT--T-AAT-AA--CT-------CTAT--C-----T-CTGA---TGCA----GAGA------AATT--TGG--ACTT-C-G---TT-TCA-C-------------GT-TCCTC-GCCAT---TTCCAAC--ACCGTCT-CG---A-C--TCTTTAAATACG--AAATGTTC--A-CT-AGAT-A--T---------TGCGA----GA-----A-----C-AT--------------------TT-------------A----
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        -ATTTT-----GTTTTAAACAGAATAGAAA-TG---A-TATTCAG--GGACATTA-----A-TACTC---TTGGACTTC--T---AGTATATA-------CAT-----------------------T----------TTAAC--ATGAAA--TTAAG-TCATCT-CAA----TTTAGC-A--TTTATTACAATA---TCCCAGAAT-----AGAT-TT-CAAA-ATGCAA-TTATC---ATCAAATATA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TTTTTTTTA---TAATGG--AAGTTTTG-CA-AACATTC-ATAT-TT-TTA-TA---CAAGT-TAACATACCTGCAGCTCA-G--CT-----ACATA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taaaggacattttgaaatactaattttaaattaatatgaccaataaggtcgcaacattTTT-TAT----AAC--TTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGT--TT-GTCACAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCGTAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           G-----TTTTG-TGAAAC---AACAGTGGC-AATCTTATGG--TT-GCCGTAA-G-TCAAAC-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-GCGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-GAACCCAGCC
gi|2                          :                          AGTTG-GAAAC---CATA--GGCACTTGGCGTTTAG--AAAT--A---CAT--GCATGTAGACTACA--TTTGATAA----------AAAAA-A-TTAT-CTTCCTT-TAAAGAA-AG--------------------TATT-----A-AC-AG---T-----TA------TATTTA-CA------------G-GAA-------------AA-----------------TTAC-AATT-ACAATATAGATATGCTTTAAATTCTAAGTGGC-CTGTGTCGT-AA-C-----CACTGA-ATT----GCTTCG--A-ACAGGA-CGA-------TTT------------GGGGGGA---------GG--T-CAACTTC-----GTCATAGTCA-T-AAA-CTATACAATCTATTCC-----T-CTG----ACCT----CAAA------AATT--AGT--AACT-C-GGTCTTGTCAAT-G----GG--A--GTATCCTATGCTAT---TATCAAA--ACTCTTT-AG-----C--TCT-------CACAAACT-TTC--G-CCCAGGT-A--CA---GACA-TGCAC----AA-----A-----TTAA--------------------TT-------------A----CAT-AGTGA------ATACAG-TAA-------A-ACATGC-------GTGTATTAACA-----TGTTTTTTATA---T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CATTA-ATAG-TT-TTAATA---CAACT-T-TTATGACAGCAGTGTA-G--CT-----ACATAT--ATA-ATTTA-----GTTG-AAACAGAAGAAAAA-AA---A-TATTTAG--AGATATCA-----G-TATCC---TTGGACT-AC-T---AGTATACAAC-ACTTCAT--ATTCTTTTGAT-CCTT-T--TT----------TTAATTCCTGAAA--CTGAG-TTTTTTTCGA----TTTAGA-A--TTTACTACAATA---TCCCAAAAT----AAATT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--TTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TAAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAGCCct
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttggAA-------A-ACACCC-------GT---TTAACAGTG--TGTTTTTTTTA---T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CACTA-ATAG-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATGACAATAGCCTA-G--CT-----ACATAT--ATA-ATTTT-----GTTG-AAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 G-AT-----AA-----TTTTA-TGAAAC---AACAGTGAT-AACATTATGA--TTGGTCATAA-GATT--AT-C-GTAAGAT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ggtG-AT-----AA-----TTTTA-TGAAAC---AACAGTGAT-AATATTATGA--TT-GTCATAA-GATT--AT-C-GTAAGATctgtttgattacattagaggaaaccctgccct
gi|23                         :                          tGTTG-AAAAA---CACA--AGCAATTGACGTTTAA--AAAT-----------GCAT------TAAA--TAT---AA----------AATAA------T-CTTTCCTATAAGCAA-AT--------------------TATT--GACA-TT-AA---TA-G--Tctgtttgattacattagagaaaccctgcc
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         -AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TCAGAT-C-ATAAGA------------T-CTGTTTT-CTGAGAAACCTTAAACTAGGTC---------GGTG-AAAt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -TTT-------TTTTGG-------GGGGGGGGG---------GG--G-CA----------TCC-------AT-AAA--TAT-----ATGT--C-----TACT-A---ACCAGCAGGAGA------AAGT--T
gi|3                          :                    atacatAGTTG-GAAAC---CACA--GGCACTAGGCGTTTAG--AAAT--A---CAT--GCATG-----TACA--TTT---AA----------AAAAA-A-ATAT-CTTTCAT-TAAAGAA-AG--------------------TATT--GACA-AC-AA---TA-G--TT------TATTTAACA------------G-GAA-------------GA-----------------T-AT-GTTT-AAAACGTAAA-------------CTAAGTG-C-CATTGTCGG-AAAC-----CACTGA-ATTTT--GCTTCGGAA-ACAGTA-TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG---------GG--C-CAACTTC-----TCCTT--CCAAT-AAAGTTAT-----TTAT--C-----T-TTGG---ACCA----GTGA------AAAT--TGT--ACCA-C-G---TT-TTA-T-G--TTTA--C--GT-TCCTG-GCTAT---TTCCAAA--ACCTTGT-AA---A-C--TCT-------CA--AACTTTTC--G-CT-AGGT-A--CATGTAACA-TGCAA----GA-----A-----C-AT--------------------TT-------------A----CAC-AGCGC------GTACAG-TAA-------A-ACACCC-------GT---TTAACAGGGTTTGTTTTTTTTA---T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CA-----------------A---TAACT-T-TTATGACAACAGCCTA-G--CT-----ACATAT--ATA-ATTTT-----GTTG-AAACAGAAAAGAAA-AA---A-TATTTAG--GGATATCC-----G-TATCC---TTGGAC----------GTATATAAC-ATTTCAT--AT----------CCTT-T--TA----------TTAACTCCTGAAA--CTAAG-TTTTCT-CAA----TTTAGC-A--TTTGCTACAATA---TCCCAGAAT----AAAAT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--TTGAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAGCC
gi|4                          :                                                                             --GCAT------TGCA--TTTT--AA----------AAAAATA-ATATGCTTCCAT-TAAAGAA-AC--------------------TAATAGGACA-AC-AA---AA-AAATC------TATT-GACACCCATGTTTTT-G-CAG-------------GA-----------------T-ATTGTTT-AAAAAGTATA-------------CTA-GT--C-CTATGTTCG-AA-------CACTGA-ATTTT--GCTTCGAAAGACA-TA-TTT-------ATTT---------GGGGGGGGG---------GGGTT-CAACTTG-----T---------ATCAAAGCTAT-----TTAT--C-----T-CTG----ACCA-----AGA------AA----TAT--ATAT-C-G---TT-G-A-T-G--T-GA--A--GT-C---A-GCTAT---T-CCAAA--AC-TTGT-AG---AAC--TC------------AACTGTTC--GGCT-AG-T-A--CATTAAACA-TGTATTTT-GA-----A-----C-AT--------------------TT-------------A----C-C-TGCGGTCAGATGT-CAGGTAA-------T-ACACC--------GT---T-ACCAGG-----TTTTTTTTA-------AG--AAGCT--G-CATA-CATTA-ATAGATTATTA-TAT--CAA---T-ATATGACACGAGC--A-G---T-----ACATAT--ATAGATTTT-----GT-G-AAACAGAAGAGAAC-AA---A-TATTTAG--GGAAATCT-----G-TATCC---TTGG-------------------AC-ACTT-ATTGAT----------CCTT-T--T---------------------------TGAT-TCTTCTACAT----TCTAGCTAGTTTTGCTACAATA---TATCAAGATAAAAAAAAT-GTATAAGTAC---ATTTATCTATGTAAGATTTA-C-T--AAA--TTTT-TAT----AACTTTTAAGTAT-----A------TTTGG-TG-TACTCTAGCA-TGGC-AATCTTATGA--TT--TCACAA---TTAGAT-CTTTAAGATATATCATAAG-T--TGTCTCGAAGAT-AATCATAAGTCTGTCTTACGACAAATGTG-AAACCCAGTC
gi|5                          :                                                                                                                                       ggaGAA-AC--------------------TATT--GACG-AC-AACATTA-G--TT------TATTTACC---------------GAA-------------GAAT---------------T-AT-ATT---AGATATG-------------------GTG-C-C--TATCGGGAAAC-----CACTGA-ATCTT--GCTTCGGAA-A-AGTAATTT-------TTTTCGGGGGTGGGGGGGGGGG---------GG--T-TATCTTC-----GTCAG--TCAAT-AA-GCTAT-----TTATT-C-----T-CTGG---ACCA----GAGA------AA-T--TAT--ACAA-CCG---TT-T-A-T-A--TTGA--A--GT-TCCTA-GCTAT---TTCCAAA---CCTTGT-AG---A-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CT-AGGT-A--CATGTAACA-TGCAA----GA-----A-----C-AT--------------------TT-------------AATTACAC-AGCGA------GTACAG-TAA-------A-GCGCCC-------GT---TTAACAGGG--T-TTTTTTTAA---T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CATTA-ATAG-TT-TTA-TA---CCACT-T-TTATGACAACAGCCTA-G--CT-----GCATATT-ATA-ATTTT-----GTTG-AA-CAGAAGAGAAA-AA---A-TATTTAG--GGATATCC-----G-TATCC---TTGGACT-AC-T---AGTATATAAC-ATTTCAT--AT----------CCTT-T--TGATCCTTTTT-TTAACTCCTGAAA--CTGAG-TTTTCT-CAA----TTTAGT-A--TTTGCTACAATA---TCCCAGAAT----AAAAT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGATTTTTT-TAT----AAC--TT-AG-AT-----AG-----TTTTGTTGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-GTTTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CT-TCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTGAAAACCCAG
gi|6                          :                                                          TTAGCTAAATGGA---CATTGGCAT------T------TT---AA----------AAAAATA-AT----TTCCAT-TAAAGAATAA--------------------TAG---GACA-AC-AA---TA-AA-TC------TATT-GACACCCATTGTATTTG-CAG-------------GA-----------------T-AT-GTTT-AACA-GTA-A-------------CTATGT--C-CTATGTCG--AAAC-----ACCTGA-ATTT---G-TTCG-AA-ACATGA-TTT-------AGGC---------GGAGGGGGGT--------GG--TTCAACTTC-----GTCA---TCAAT-AAGCTTAT-----TTAT--C-----T-T--G---ACCA-----AGA---------T----T--ACAC-C-----TA-TTA-TCG--TTGAGTA--AT---CTA-GCTAT---T--CAAA----CTTGT-AGCCAA-C--TC------------AACTGTTCGTG-CT-ATGT-AACCA--TAACA-TGTAT----GA-----A-------AT--------------------T---------------------C-TGCGA------GT-CAGATGATTCAGGTA-ATACAA-------GT------ACAG-----GTTTTTTTTC---A---AG--AAGTC-------A-TACTA-TCAG-TTATTA-TA---CCACTAT-ATATGAACACAGCTAA-GTACC-----ATATAT--ATG-ATTTT-----GT---GAACAGAAGAGAAACAA---A-TATTTAG--GGA-ATCG-----A-T---C---TTGGATC-A--T-----TAT-TGA----TCCAT--G-------------TT-TGATC----------TTATCTACTTCAG--CT-AG-TTTT--------------GC-A-------CATAATA---------AATAA--AAAAT-GTATAAG-ATAACATTTATT---ATAAGATTTA-C-TTAATA--TTTTATAT----AAT--TT-----T-----AA-----ATTTGTTGATACCT-AGCTATGGC-AATCTTATGAAGTT--TCACAAGG-TTAGATCC-TTTAGATA-AT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           caggttcagaaacagtcattaT--ACAC-C-G---TT-TCA-T-A--TTGA--A--GT-TCTTA-----T---TTCCAAA--ACCTTGT-AG---A-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CT-AGGT-A--CATGTAACA-TGTAATCTTGA-----A-----C-AT--------------------TT-------------A----CA---GCGA------GTGCAG-TAA-------A-ACGCCC-------GT---TTAACAGGG---GTTTTTTTAAA--T---AG--AAGCTT-G-CA-A-CATTA-ATAG-TT-TTA-TA---AAACT-T-TTATGACACCAGCCTA-G--CT-----ACATAT--ATA-ATTTT-----GTTG-AAACA-AAGAGAAA-AA---AATATTTAG--GGATATCC-----A-TATCC---TTGGACT-AA-T---AATATGTAAC-ATTTCAT--AT----------CCTT-T--TGATCCTTTTTTTTAACTCCTGAAA--C--AG-TTTTCT-TAA----TTTAG---------------TA---TCCCAGAAT----AAAAT-GG-TAAGCATA-------TC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--CTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGGAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAG
gi|8                          :                          AGTTG-GAAAC---CATATAGGCACTTAGCGTT-AG--AAAT--A---CAT--GCATATAGCCTACA--TCT---GAT---------AAAAA-ATATAT-CTTCCAC-TAAAGAA-AAC-------------------TATT--GAC---C-AA---CA-G--TCAGCATGTATT--ACG------------A-GAA-------------GAATGCATTGAATTTAGAGT-AT-GTTTTAAAACGT-----------------CAAATG-C-CTGTGTCGT-AAAA-----CACTGA-AATTT--GCTTCAAAA-ACAGTG-CAT-------TTGA---------GGGGGAGGG---------GG-------------------AG--TCAA---------------------C-----T-CTGA---ACCA----GAGA------AAAT--TGT--ACAT-C-G---TT-TCA-T-G--TTGA--A--GT-TCCTA-GTTAT---TTCCAAA--ACCTTGT-TG---T-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CC-AGGT-A--CATGTAACA-TGCAC----AA-----A-----C-ATTATACATGTATAATATTTAATT-------------A----CAC-AGTGA------ATACAG-TAA-------A-ACACGC-------GT---GTAACAGG-------TTTTTTA---T---GG--AAGCTT-G-AA-A-CATTA-ATAG-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATGGCATCAGTCTA-A--CT-----ACATAT--ATA-ATCTA-----GGTG-AAATAGAAG
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Reference ( family-839 )      :                          AGTTG-GAAAC---CACA--GGCACTTGGCGTTTAG--AAAT--A---CAT--GCATGTA-----CA--TTT---A-A----------AAAAA-A-ATA-T-CTTCCAT-TAAAGAA-AN--------------------TATT--GACA-AC-AA---TA-G--TC------TATTTGACA------------G-GAA------------------GA-----------------TAT-GTTT-AAAACG-T-A-A-CTAAGTG-C-CTGT-GTCGGAAAC-----CACTGA-ATTTT--GCTTCGGAA-ACAGTA-TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG---------GG--T-C-AACT---TC-TCCA-T--TCAATAAAGCTAT-----TTAT--C-----T-CTGG---ACCA----GAGA------AANT--TGT--A-CA-C-CGTTTCAT--G--TTGA--A--GT-TCCTA-GCTAT---TTCCAAA--ACCTTGT-AG---A-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CT-AGGT-A--CATGTAACA-TGCAN----GA-----A-----C-AT--------------------TT-------------A----CAC-AGCGA------GTACAG-TAA-------A-ACACCC-------GT---TTAACAGGG--TGTTTTTTTTA---T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CATTA-ATAG-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATG-ACAGCAGCCTA-G--CT-----ACATAT--ATA-ATTTT-----GTTG-AAACAGAAGAGAAA-AA---A-TATTTAG--GGATATCC-----G-TATCC---TTGGACT-A--T---AGTATATAAC-ACTTCAT--AT----------CCTT-T--TN----------TTAACTCCTGAAA--CTGAG-TTTTCT-CAA----TTTAGC-A--TTTGCTACAATA---TCCCAGAAT----AAAAT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--TTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAGCC
gi|1                          :                            TTGAGAAACGGTCACA--GGCACTTAGCGTTTAG--ATAT--ATTACAT--GCATGTG-----CAACTTC---A-ATACTCTGGCCAAGAA-A-ATA-T-CTCCCAT-TAAAAAA-AAACCCTAA-------------TATCCGGACACACGAA---TACG--TA------TTTTTACCA------------GAGAAAAATATTAAATTA-----GA-----------------TAT-GCTA-AAACCGCT-C-A-C--AGTG-AACTGT-GTCGGAAACAATTTTACTGACATTTTTTGCTTTTGGA-ACAGTA-CAT-------TT-----------GGGGGGGGGCTGCGGGCCGG--T-CCAAATCAGTA-TTCAGT--TTGATATTGTCGC-----TCAT--CATGCGT-CTGGTATACCA----GCAACGATATAATTCTTGTCGA-CA-CTCTTCTCAA--GCTTTGA--ACGGTATCCTACGCTCTGCTCTCCCCA--ACCTTGTCAG---A-CCATCT-------CA--AACTGTTA--G-CT-AGGTTA--CATGGAACAATGTAA----AACCCCAAT----C-AT--------------------TT-------------AAT--TACCAGTGA------GTACGG-TAA-------ATACACCTACCAGCTGT---TTGACAGGT--TATTTTTTACAACCT---GGTCAAGTTT-GGCA-A-CATTTTACCG-AT-TTA-TAAACTAACT-T-ATATG-ACAGCTACCTAAG--CTCAATTATATATTGACA-GTTTTTTTGTGTCG-AAACAGAAGAGAAA-CA---A-AATTGAGGCGAATACACTCAAAGTTATTTTAGTTGGGCT----TCTCAGT---------CTTCTT--CT----------TCTTAC--TC----------TTA--CCCTGAAACCCTGAGTTTTTCT-CAATCCCTCTAGC-A--TTTACTACAACATACTCCCCACAT----AAAATGGT-TAAG
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttggcagtTAAC-ACTTTG---AT----------CCTT-T---C----------TAAATCCCCGAAA--CTACA-TTATCT-CAG----TTTAGC-A--TTTATTACGATT---GACCAGAAT----GAATT-GT-TAAGGATGAAACTTATC---GTAAGATTTGTC-ATAAGA--TTTT-TATACAGAAC--TAAAT-ATATCTAAGGGCATTTTTG-TGAAGC---ACCAGTGACAAATCTTATGA--GT-GTCATAA-G-CCAGAT-C-TTA--ATA------AAG-TCCTGTCGT-ATGACGAATTCTAAGATACTTT---------TGTG-AAACACAGCCtcctctccaataagtcaggtctttcgaagattatcattaagtccttgtgtttaccgacacttgtgaaa
gi|11                         : tactggtacatttttgcgttccaggAGTTG-GAAAC---CACA--GGCACTTGGCGTTTAG--AAAT--A---CAT--GCAT--------CA--TTT---TTA----------AAAAA-A-ATAAT-CTTCCAT-TAAAGAA-ACTATAGACAACAGTAGTAAACTATT--GACA-CC-AA---TA-G--TT------TATTTG-CA------------G-CA--------------------------------------TAT-GTTT-AAAACG-TAA-A-CTAAGTG-T-CTAT-GTCGGAAAC-----CACTGA-ATTTT--GCTTTGGAA-ACAGTA---A-------TTGG---------GGGGGGGGG---------GG--TCC-AGCT---TC-GTCA-G--TCAATAAAGCTAT-----TTAT--C-----T-CTGG---ACCA----GAGA------AAAT--TAT--A-CA-C-CGT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ctggAAA-AACGGA-CATTTAC--GGATATC-------------------------------AGTATAAAGC-AATTTAT--AT----------CAT------A----------TTGA-TCCCGAAA--CTGGG-ATTTCA-AAA----TTTACA-A--TTTGTTATTATA---TCCAAGAAT----AAAAA-GT-CAAGCATGCCACTTATC---GTAATATTTGTT-TT--------CT-TAT----ATC--TCAAG-AT-----AT-----TTCTG-TGAAAC---AACAGTGGC-GATCTTGTGA--TT-GTCATAG-G-TCAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAGAT-CTGTTTT-CTGAGAAACCTTAAAATAGACT---------TGT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    taaacTTGT-AG---A-AAATCT-------TA--AAATTTCT--G-AT-A----A--CAT-TAAC--TGTGT----TG-----A-----C-A------------------------------------A----TAT-AGCGG------ATGGAG-TCG-------A-ACACCC-------AT---TCAACA-------TCTTTTTTA---T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CATTT-ATAT-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATG-ACAGCAGCCTA-C--GT-----ACA----------------------G-AAACAGAAGA-AAA-AT---A-TATTTAG--GGATATCT-------------------AC-----T---AGTATATAAC-AAATCAT--GT----------TCTT-T--T
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG---------GG--T---AACT---GCATCCA-T---CAATAAGG------------T--C-----T-CTGA---ACCA----GAGA------AATT--AGT--T-CA-C-CGTTTCAT--G--TTGA--A--GT-TACTA-ACTAT---TTTCAAAACACCTTGC-AG---A-C--TCT-------GG--AACATTTC--G-TT-AGAT-A--CGTGTAACG-TCTAA----CA-----AAATTTC-AT--------------------TTAACTCCGTTGACAA----TAC-AGCAA------GTTCAG-CAG-------A-ACACTC-------GT---ATAga
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AC-----GACTGA-ATATT--GCCTCGAAA-ATAATA-TTTGTTGTCTTTTT-------------------------------T-C-AACT---TCCTCCG-T--T-AATAA--CT-------CTAT--C-----T-CTGA---TGCA----GAGA------AATT--TGG--A-CT-T-CGTTTCAC--------------GT-TCCTC-GCCAT---TTCCAAC--ACCGTCT-CG---A-C--TCTTTAAATACG--AAATGTTC--A-CT-AGAT-A--T---------TGCGA----GA-----A-----C-AT--------------------TT-------------A----
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -ATTTT-----GTTTTAAACAGAATAGAAA-TG---A-TATTCAG--GGACATTA-----A-TACTC---TTGGACTTC--T---AGTATATA-------CAT-----------------------T----------TTAAC--ATGAAA--TTAAG-TCATCT-CAA----TTTAGC-A--TTTATTACAATA---TCCCAGAAT-----AGAT-TT-CAAA-ATGCAA-TTATC---ATCAAATATA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTTTTTTA---TAATGG--AAGTTTTG-CA-AACATTC-ATAT-TT-TTA-TA---CAAGT-TAACATA-CCTGCAGCTCA-G--CT-----ACATA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taaaggacattttgaaatactaattttaaattaatatgaccaataaggtcgcaacattTTT-TAT----AAC--TTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGT--TT-GTCACAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCGTAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G-----TTTTG-TGAAAC---AACAGTGGC-AATCTTATGG--TT-GCCGTAA-G-TCAAAC-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-GCGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-GAACCCAGCC
gi|2                          :                          AGTTG-GAAAC---CATA--GGCACTTGGCGTTTAG--AAAT--A---CAT--GCATGTAGACTACA--TTTGATA-A----------AAAAA-A-TTA-T-CTTCCTT-TAAAGAA-AG--------------------TATT-----A-AC-AG---T-----TA------TATTT-ACA------------G-GAAAATTACAATTACAATATAGA-----------------TAT-GCTT-TAAAT--T-----CTAAGTGGC-CTGT-GTCGTAA-C-----CACTGA-ATT----GCTTCG--A-ACAGGA-CGA-------TTT------------GGGGGGA---------GG--T-C-AACT---TC-GTCA-TAGTCA-TAAA-CTATACAATCTATTCC-----T-CTG----ACCT----CAAA------AATT--AGT--AACT-C-GGTCTTGTCAA--TGGG--A--GTATCCTATGCTAT---TATCAAA--ACTCTTT-AG-----C--TCT-------CACAAACT-TTC--G-CCCAGGT-A--CA---GACA-TGCAC----AA-----A-----TTAA--------------------TT-------------A----CAT-AGTGA------ATACAG-TAA-------A-ACATGC-------GTGTATTAACA-----TGTTTTTTATA---T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CATTA-ATAG-TT-TTAATA---CAACT-T-TTATG-ACAGCAGTGTA-G--CT-----ACATAT--ATA-ATTTA-----GTTG-AAACAGAAGAAAAA-AA---A-TATTTAG--AGATATCA-----G-TATCC---TTGGACT-AC-T---AGTATACAAC-ACTTCAT--ATTCTTTTGAT-CCTT-T--TT----------TTAATTCCTGAAA--CTGAG-TTTTTTTCGA----TTTAGA-A--TTTACTACAATA---TCCCAAAAT----AAATT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--TTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TAAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAGCCct
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttggAA-------A-ACACCC-------GT---TTAACAGTG--TGTTTTTTTTA---T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CACTA-ATAG-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATG-ACAATAGCCTA-G--CT-----ACATAT--ATA-ATTTT-----GTTG-AAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           G-AT-----AA-----TTTTA-TGAAAC---AACAGTGAT-AACATTATGA--TTGGTCATAA-GATT--AT-C-GTAAGAT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ggtG-AT-----AA-----TTTTA-TGAAAC---AACAGTGAT-AATATTATGA--TT-GTCATAA-GATT--AT-C-GTAAGATctgtttgattacattagaggaaaccctgccct
gi|23                         :                          tGTTG-AAAAA---CACA--AGCAATTGACGTTTAA--AAAT--G---CAT-------TA-----AA--TAT---A-A----------AATAA-------T-CTTTCCTATAAGCAA-AT--------------------TATT--GACA-TT-AA---TA-G--Tctgtttgattacattagagaaaccctgcc
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TCAGAT-C-ATAAGA------------T-CTGTTTT-CTGAGAAACCTTAAACTAGGTC---------GGTG-AAAt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG---------GG--G-G-G-----------CA-T--CC-ATAAA--TAT-----ATGT--C-----TACT-A---ACCAGCAGGAGA------AAGT--T
gi|3                          :                    atacatAGTTG-GAAAC---CACA--GGCACTAGGCGTTTAG--AAAT--A---CAT--GCATGTA-----CA--TTT---A-A----------AAAAA-A-ATA-T-CTTTCAT-TAAAGAA-AG--------------------TATT--GACA-AC-AA---TA-G--TT------TATTTAACA------------G-GAA------------------GA-----------------TAT-GTTT-AAAACG-T-A-AACTAAGTG-C-CATT-GTCGGAAAC-----CACTGA-ATTTT--GCTTCGGAA-ACAGTA-TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG---------GG--C-C-AACT---TC-TCCT-T--CCAATAAAGTTAT-----TTAT--C-----T-TTGG---ACCA----GTGA------AAAT--TGT--A-CC-A-CGTTTTAT--G--TTTA--C--GT-TCCTG-GCTAT---TTCCAAA--ACCTTGT-AA---A-C--TCT-------CA--AACTTTTC--G-CT-AGGT-A--CATGTAACA-TGCAA----GA-----A-----C-AT--------------------TT-------------A----CAC-AGCGC------GTACAG-TAA-------A-ACACCC-------GT---TTAACAGGGTTTGTTTTTTTTA---T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CA-----------------A---TAACT-T-TTATG-ACAACAGCCTA-G--CT-----ACATAT--ATA-ATTTT-----GTTG-AAACAGAAAAGAAA-AA---A-TATTTAG--GGATATCC-----G-TATCC---TTGGAC----------GTATATAAC-ATTTCAT--AT----------CCTT-T--TA----------TTAACTCCTGAAA--CTAAG-TTTTCT-CAA----TTTAGC-A--TTTGCTACAATA---TCCCAGAAT----AAAAT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--TTGAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAGCC
gi|4                          :                                                                             --GCAT-TG-----CA--TTTT--A-A----------AAAAATA-ATA-TGCTTCCAT-TAAAGAA-AC--------------------TAATAGGACA-AC-AA---AA-AAATC------TATT-GACACCCATGTTTTT-G-CAG------------------GA-----------------TATTGTTT-AAAAAG-T-ATA-CTA-GT--C-CTAT-GTTCGAA-------CACTGA-ATTTT--GCTTCGAAAGACA-TA-TTT-------ATTT---------GGGGGGGGG---------GGGTT-C-AACT---TG-T--A-T--C----AAAGCTAT-----TTAT--C-----T-CTG----ACCA-----AGA------AA----TAT--A-TA-T-CGTTG-AT--G--T-GA--A--GT-C---A-GCTAT---T-CCAAA--AC-TTGT-AG---AAC--TC------------AACTGTTC--GGCT-AG-T-A--CATTAAACA-TGTATTTT-GA-----A-----C-AT--------------------TT-------------A----C-C-TGCGGTCAGATGT-CAGGTAA-------T-ACACC--------GT---T-ACCAGG-----TTTTTTTTA-------AG--AAGCT--G-CATA-CATTA-ATAGATTATTA-TAT--CAA---T-ATATG-ACACGAGC--A-G---T-----ACATAT--ATAGATTTT-----GT-G-AAACAGAAGAGAAC-AA---A-TATTTAG--GGAAATCT-----G-TATCC---TTGG-------------------AC-ACTT-ATTGAT----------CCTT-T--T---------------------------TGAT-TCTTCTACAT----TCTAGCTAGTTTTGCTACAATA---TATCAAGATAAAAAAAAT-GTATAAGTAC---ATTTATCTATGTAAGATTTA-C-T--AAA--TTTT-TAT----AACTTTTAAGTAT-----A------TTTGG-TG-TACTCTAGCA-TGGC-AATCTTATGA--TT--TCACAA---TTAGAT-CTTTAAGATATATCATAAG-T--TGTCTCGAAGAT-AATCATAAGTCTGTCTTACGACAAATGTG-AAACCCAGTC
gi|5                          :                                                                                                                                         ggaGAA-AC--------------------TATT--GACG-AC-AACATTA-G--TT------TATTTACC---------------GAA------------------GAAT---------------TAT-ATT---AGATA-T-G-------GTG-C-CTATCG--GGAAAC-----CACTGA-ATCTT--GCTTCGGAA-A-AGTAATTT-------TTTTCGGGGGTGGGGGGGGGGG---------GG--T-T-ATCT---TC-GTCA-G--TCAATAA-GCTAT-----TTATT-C-----T-CTGG---ACCA----GAGA------AA-T--TAT--A-CAAC-CGTTT-AT--A--TTGA--A--GT-TCCTA-GCTAT---TTCCAAA---CCTTGT-AG---A-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CT-AGGT-A--CATGTAACA-TGCAA----GA-----A-----C-AT--------------------TT-------------AATTACAC-AGCGA------GTACAG-TAA-------A-GCGCCC-------GT---TTAACAGGG--T-TTTTTTTAA---T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CATTA-ATAG-TT-TTA-TA---CCACT-T-TTATG-ACAACAGCCTA-G--CT-----GCATATT-ATA-ATTTT-----GTTG-AA-CAGAAGAGAAA-AA---A-TATTTAG--GGATATCC-----G-TATCC---TTGGACT-AC-T---AGTATATAAC-ATTTCAT--AT----------CCTT-T--TGATCCTTTTT-TTAACTCCTGAAA--CTGAG-TTTTCT-CAA----TTTAGT-A--TTTGCTACAATA---TCCCAGAAT----AAAAT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGATTTTTT-TAT----AAC--TT-AG-AT-----AG-----TTTTGTTGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-GTTTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CT-TCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTGAAAACCCAG
gi|6                          :                                                          TTAGCTAAATGGA---CATTGGCAT------------TTT---A-A----------AAAAATA-AT-----TTCCAT-TAAAGAATAA--------------------TAG---GACA-AC-AA---TA-AA-TC------TATT-GACACCCATTGTATTTG-CAG------------------GA-----------------TAT-GTTT-AACA-G-T-A-A-CTATGT--C-CTAT-GTCG-AAAC-----ACCTGA-ATTT---G-TTCG-AA-ACATGA-TTT-------AGGC---------GGAGGGGGGT--------GG--TTC-AACT---TC-GTCA----TCAATAAGCTTAT-----TTAT--C-----T-T--G---ACCA-----AGA---------T----T--A-CA-C-C-TATTATC-G--TTGAGTA--AT---CTA-GCTAT---T--CAAA----CTTGT-AGCCAA-C--TC------------AACTGTTCGTG-CT-ATGT-AACCA--TAACA-TGTAT----GA-----A-------AT--------------------T---------------------C-TGCGA------GT-CAGATGATTCAGGTA-ATACAA-------GT------ACAG-----GTTTTTTTTC---A---AG--AAGTC-------A-TACTA-TCAG-TTATTA-TA---CCACTAT-ATATGAACA-CAGCTAA-GTACC-----ATATAT--ATG-ATTTT-----GT---GAACAGAAGAGAAACAA---A-TATTTAG--GGA-ATCG-----A-T---C---TTGGATC-A--T-----TAT-TGA----TCCAT--G-------------TT-TGATC----------TTATCTACTTCAG--CT-AG-TTTT--------------GC-A-------CATAATA---------AATAA--AAAAT-GTATAAG-ATAACATTTATT---ATAAGATTTA-C-TTAATA--TTTTATAT----AAT--TT-----T-----AA-----ATTTGTTGATACCT-AGCTATGGC-AATCTTATGAAGTT--TCACAAGG-TTAGATCC-TTTAGATA-AT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       caggttcagaaacagtcattaT--A-CA-C-CGTTTCAT--A--TTGA--A--GT-TCTTA-----T---TTCCAAA--ACCTTGT-AG---A-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CT-AGGT-A--CATGTAACA-TGTAATCTTGA-----A-----C-AT--------------------TT-------------A----CA---GCGA------GTGCAG-TAA-------A-ACGCCC-------GT---TTAACAGGG---GTTTTTTTAAA--T---AG--AAGCTT-G-CA-A-CATTA-ATAG-TT-TTA-TA---AAACT-T-TTATG-ACACCAGCCTA-G--CT-----ACATAT--ATA-ATTTT-----GTTG-AAACA-AAGAGAAA-AA---AATATTTAG--GGATATCC-----A-TATCC---TTGGACT-AA-T---AATATGTAAC-ATTTCAT--AT----------CCTT-T--TGATCCTTTTTTTTAACTCCTGAAA--C--AG-TTTTCT-TAA----TTTAG---------------TA---TCCCAGAAT----AAAAT-GG-TAAGCATA-------TC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--CTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGGAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAG
gi|8                          :                          AGTTG-GAAAC---CATATAGGCACTTAGCGTT-AG--AAAT--A---CAT--GCATATAGCCTACA--TCT---G-AT---------AAAAA-ATATA-T-CTTCCAC-TAAAGAA-AAC-------------------TATT--GAC---C-AA---CA-G--TCAGCATGTATT--ACG------------A-GAA------------------GAATGCATTGAATTTAGAGTAT-GTTTTAAAACG-T------CAAATG-C-CTGT-GTCGTAAAA-----CACTGA-AATTT--GCTTCAAAA-ACAGTG-CAT-------TTGA---------GGGGGAGGG---------GG-------------------A-G--TCAA--------------------C-----T-CTGA---ACCA----GAGA------AAAT--TGT--A-CA-T-CGTTTCAT--G--TTGA--A--GT-TCCTA-GTTAT---TTCCAAA--ACCTTGT-TG---T-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CC-AGGT-A--CATGTAACA-TGCAC----AA-----A-----C-ATTATACATGTATAATATTTAATT-------------A----CAC-AGTGA------ATACAG-TAA-------A-ACACGC-------GT---GTAACAGG-------TTTTTTA---T---GG--AAGCTT-G-AA-A-CATTA-ATAG-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATG-GCATCAGTCTA-A--CT-----ACATAT--ATA-ATCTA-----GGTG-AAATAGAAG
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Reference ( family-839 )      :                          AGTTG-GAAAC---CACA--GGCACTTGGCGTTTAG--AAAT--A---CAT--GCATGTA-----CA--TTT---A-A----------AAAAA-A-ATA-T-CTTCCAT-TAAAGAA-AN--------------------TATT--GACA-AC-AA---TA-G--TC------TATTTGACA------------G-GAA------------------GA-----------------TAT-GTTT-AAAACG-T-A-A-CTAAGTG-C-CTGT-GTCGGAAAC-----CACTGA-ATTTT--GCTTCGGAA-ACAGTA-TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG---------GG--T-C-AACT---TC-TTCA-T--TCAATAAAGCTAT-----TTAT--C-----T-CTGG---ACCA----GAGA------AANT--TGT--A-CA-C-CGTTTCAT--G--TTGA--A--GT-TCCTA-GCTAT---TTCCAAA--ACCTTGT-AG---A-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CT-AGGT-A--CATGTAACA-TGCAN----GA-----A-----C-AT--------------------TT-------------A----CAC-AGCGA------GTACAG-TAA-------A-ACACCC-------GT---TTAACAGGG--TGTTTTTTTTA---T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CATTA-ATAG-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATG-ACAGCAGCCTA-G--CT-----ACATAT--ATA-ATTTT-----GTTG-AAACAGAAGAGAAA-AA---A-TATTTAG--GGATATCC-----G-TATCC---TTGGACT-A--T---AGTATATAAC-ACTTCAT--AT----------CCTT-T--TN----------TTAACTCCTGAAA--CTGAG-TTTTCT-CAA----TTTAGC-A--TTTGCTACAATA---TCCCAGAAT----AAAAT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--TTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAGCC
gi|1                          :                            TTGAGAAACGGTCACA--GGCACTTAGCGTTTAG--ATAT--ATTACAT--GCATGTG-----CAACTTC---A-ATACTCTGGCCAAGAA-A-ATA-T-CTCCCAT-TAAAAAA-AAACCCTAA-------------TATCCGGACACACGAA---TACG--TA------TTTTTACCA------------GAGAAAAATATTAAATTA-----GA-----------------TAT-GCTA-AAACCGCT-C-A-C--AGTG-AACTGT-GTCGGAAACAATTTTACTGACATTTTTTGCTTTTGGA-ACAGTA-CAT-------TT-----------GGGGGGGGGCTGCGGGCCGG--T-CCAAATCAGTA-TTCAGT--TTGATATTGTCGC-----TCAT--CATGCGT-CTGGTATACCA----GCAACGATATAATTCTTGTCGA-CA-CTCTTCTCAA--GCTTTGA--ACGGTATCCTACGCTCTGCTCTCCCCA--ACCTTGTCAG---A-CCATCT-------CA--AACTGTTA--G-CT-AGGTTA--CATGGAACAATGTAA----AACCCCAAT----C-AT--------------------TT-------------AAT--TACCAGTGA------GTACGG-TAA-------ATACACCTACCAGCTGT---TTGACAGGT--TATTTTTTACAACCT---GGTCAAGTTT-GGCA-A-CATTTTACCG-AT-TTA-TAAACTAACT-T-ATATG-ACAGCTACCTAAG--CTCAATTATATATTGACA-GTTTTTTTGTGTCG-AAACAGAAGAGAAA-CA---A-AATTGAGGCGAATACACTCAAAGTTATTTTAGTTGGGCT----TCTCAGT---------CTTCTT--CT----------TCTTAC--TC----------TTA--CCCTGAAACCCTGAGTTTTTCT-CAATCCCTCTAGC-A--TTTACTACAACATACTCCCCACAT----AAAATGGT-TAAG
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ttggcagtTAAC-ACTTTG---AT----------CCTT-T---C----------TAAATCCCCGAAA--CTACA-TTATCT-CAG----TTTAGC-A--TTTATTACGATT---GACCAGAAT----GAATT-GT-TAAGGATGAAACTTATC---GTAAGATTTGTC-ATAAGA--TTTT-TATACAGAAC--TAAAT-ATATCTAAGGGCATTTTTG-TGAAGC---ACCAGTGACAAATCTTATGA--GT-GTCATAA-G-CCAGAT-C-TTA--ATA------AAG-TCCTGTCGT-ATGACGAATTCTAAGATACTTT---------TGTG-AAACACAGCCtcctctccaataagtcaggtctttcgaagattatcattaagtccttgtgtttaccgacacttgtgaaa
gi|11                         : tactggtacatttttgcgttccaggAGTTG-GAAAC---CACA--GGCACTTGGCGTTTAG--AAAT--A---CAT--GCAT--------CA--TTT---TTA----------AAAAA-A-ATAAT-CTTCCAT-TAAAGAA-ACTATAGACAACAGTAGTAAACTATT--GACA-CC-AA---TA-G--TT------TATTTG-CA------------G-CA--------------------------------------TAT-GTTT-AAAACG-TAA-A-CTAAGTG-T-CTAT-GTCGGAAAC-----CACTGA-ATTTT--GCTTTGGAA-ACAGTA---A-------TTGG---------GGGGGGGGG---------GG--TCC-AGCT---TC-GTCA-G--TCAATAAAGCTAT-----TTAT--C-----T-CTGG---ACCA----GAGA------AAAT--TAT--A-CA-C-CGT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ctggAAA-AACGGA-CATTTAC--GGATATC-------------------------------AGTATAAAGC-AATTTAT--AT----------CAT------A----------TTGA-TCCCGAAA--CTGGG-ATTTCA-AAA----TTTACA-A--TTTGTTATTATA---TCCAAGAAT----AAAAA-GT-CAAGCATGCCACTTATC---GTAATATTTGTT-TT--------CT-TAT----ATC--TCAAG-AT-----AT-----TTCTG-TGAAAC---AACAGTGGC-GATCTTGTGA--TT-GTCATAG-G-TCAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAGAT-CTGTTTT-CTGAGAAACCTTAAAATAGACT---------TGT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    taaacTTGT-AG---A-AAATCT-------TA--AAATTTCT--G-AT-A----A--CAT-TAAC--TGTGT----TG-----A-----C-A------------------------------------A----TAT-AGCGG------ATGGAG-TCG-------A-ACACCC-------AT---TCAACA-------TCTTTTTTA---T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CATTT-ATAT-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATG-ACAGCAGCCTA-C--GT-----ACA----------------------G-AAACAGAAGA-AAA-AT---A-TATTTAG--GGATATCT-------------------AC-----T---AGTATATAAC-AAATCAT--GT----------TCTT-T--T
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG---------GG--T---AACT---GCATCCA-T---CAATAAGG------------T--C-----T-CTGA---ACCA----GAGA------AATT--AGT--T-CA-C-CGTTTCAT--G--TTGA--A--GT-TACTA-ACTAT---TTTCAAAACACCTTGC-AG---A-C--TCT-------GG--AACATTTC--G-TT-AGAT-A--CGTGTAACG-TCTAA----CA-----AAATTTC-AT--------------------TTAACTCCGTTGACAA----TAC-AGCAA------GTTCAG-CAG-------A-ACACTC-------GT---ATAga
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AC-----GACTGA-ATATT--GCCTCGAAA-ATAATA-TTTGTTGTCTTTTT-------------------------------T-C-AACT---TC-CTCC-G--TTAATAA--CT-------CTAT--C-----T-CTGA---TGCA----GAGA------AATT--TGG--A-CT-T-CGTTTCAC--------------GT-TCCTC-GCCAT---TTCCAAC--ACCGTCT-CG---A-C--TCTTTAAATACG--AAATGTTC--A-CT-AGAT-A--T---------TGCGA----GA-----A-----C-AT--------------------TT-------------A----
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -ATTTT-----GTTTTAAACAGAATAGAAA-TG---A-TATTCAG--GGACATTA-----A-TACTC---TTGGACTTC--T---AGTATATA-------CAT-----------------------T----------TTAAC--ATGAAA--TTAAG-TCATCT-CAA----TTTAGC-A--TTTATTACAATA---TCCCAGAAT-----AGAT-TT-CAAA-ATGCAA-TTATC---ATCAAATATA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TTTTTTTTA---TAATGG--AAGTTTTG-CA-AACATTC-ATAT-TT-TTA-TA---CAAGT-TAACATA-CCTGCAGCTCA-G--CT-----ACATA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taaaggacattttgaaatactaattttaaattaatatgaccaataaggtcgcaacattTTT-TAT----AAC--TTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGT--TT-GTCACAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCGTAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G-----TTTTG-TGAAAC---AACAGTGGC-AATCTTATGG--TT-GCCGTAA-G-TCAAAC-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-GCGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-GAACCCAGCC
gi|2                          :                          AGTTG-GAAAC---CATA--GGCACTTGGCGTTTAG--AAAT--A---CAT--GCATGTAGACTACA--TTTGATA-A----------AAAAA-A-TTA-T-CTTCCTT-TAAAGAA-AG--------------------TATT-----A-AC-AG---T-----TA------TATTT-ACA------------G-GAAAATTACAATTACAATATAGA-----------------TAT-GCTT-TAAAT--T-----CTAAGTGGC-CTGT-GTCGTAA-C-----CACTGA-ATT----GCTTCG--A-ACAGGA-CGA-------TTT------------GGGGGGA---------GG--T-C-AACT---TC-GTCA-TAGTCA-TAAA-CTATACAATCTATTCC-----T-CTG----ACCT----CAAA------AATT--AGT--AACT-C-GGTCTTGTCAA--TGGG--A--GTATCCTATGCTAT---TATCAAA--ACTCTTT-AG-----C--TCT-------CACAAACT-TTC--G-CCCAGGT-A--CA---GACA-TGCAC----AA-----A-----TTAA--------------------TT-------------A----CAT-AGTGA------ATACAG-TAA-------A-ACATGC-------GTGTATTAACA-----TGTTTTTTATA---T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CATTA-ATAG-TT-TTAATA---CAACT-T-TTATG-ACAGCAGTGTA-G--CT-----ACATAT--ATA-ATTTA-----GTTG-AAACAGAAGAAAAA-AA---A-TATTTAG--AGATATCA-----G-TATCC---TTGGACT-AC-T---AGTATACAAC-ACTTCAT--ATTCTTTTGAT-CCTT-T--TT----------TTAATTCCTGAAA--CTGAG-TTTTTTTCGA----TTTAGA-A--TTTACTACAATA---TCCCAAAAT----AAATT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--TTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TAAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAGCCct
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ttggAA-------A-ACACCC-------GT---TTAACAGTG--TGTTTTTTTTA---T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CACTA-ATAG-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATG-ACAATAGCCTA-G--CT-----ACATAT--ATA-ATTTT-----GTTG-AAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           G-AT-----AA-----TTTTA-TGAAAC---AACAGTGAT-AACATTATGA--TTGGTCATAA-GATT--AT-C-GTAAGAT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ggtG-AT-----AA-----TTTTA-TGAAAC---AACAGTGAT-AATATTATGA--TT-GTCATAA-GATT--AT-C-GTAAGATctgtttgattacattagaggaaaccctgccct
gi|23                         :                          tGTTG-AAAAA---CACA--AGCAATTGACGTTTAA--AAAT--G---CAT-------TA-----AA--TAT---A-A----------AATAA-------T-CTTTCCTATAAGCAA-AT--------------------TATT--GACA-TT-AA---TA-G--Tctgtttgattacattagagaaaccctgcc
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TCAGAT-C-ATAAGA------------T-CTGTTTT-CTGAGAAACCTTAAACTAGGTC---------GGTG-AAAt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG---------GG--G-G-G-----------CA-T--CC-ATAAA--TAT-----ATGT--C-----TACT-A---ACCAGCAGGAGA------AAGT--T
gi|3                          :                    atacatAGTTG-GAAAC---CACA--GGCACTAGGCGTTTAG--AAAT--A---CAT--GCATGTA-----CA--TTT---A-A----------AAAAA-A-ATA-T-CTTTCAT-TAAAGAA-AG--------------------TATT--GACA-AC-AA---TA-G--TT------TATTTAACA------------G-GAA------------------GA-----------------TAT-GTTT-AAAACG-T-A-AACTAAGTG-C-CATT-GTCGGAAAC-----CACTGA-ATTTT--GCTTCGGAA-ACAGTA-TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG---------GG--C-C-AACT---TC-TCCT-T--CCAATAAAGTTAT-----TTAT--C-----T-TTGG---ACCA----GTGA------AAAT--TGT--A-CC-A-CGTTTTAT--G--TTTA--C--GT-TCCTG-GCTAT---TTCCAAA--ACCTTGT-AA---A-C--TCT-------CA--AACTTTTC--G-CT-AGGT-A--CATGTAACA-TGCAA----GA-----A-----C-AT--------------------TT-------------A----CAC-AGCGC------GTACAG-TAA-------A-ACACCC-------GT---TTAACAGGGTTTGTTTTTTTTA---T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CA-----------------A---TAACT-T-TTATG-ACAACAGCCTA-G--CT-----ACATAT--ATA-ATTTT-----GTTG-AAACAGAAAAGAAA-AA---A-TATTTAG--GGATATCC-----G-TATCC---TTGGAC----------GTATATAAC-ATTTCAT--AT----------CCTT-T--TA----------TTAACTCCTGAAA--CTAAG-TTTTCT-CAA----TTTAGC-A--TTTGCTACAATA---TCCCAGAAT----AAAAT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--TTGAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAGCC
gi|4                          :                                                                             --GCAT-TG-----CA--TTTT--A-A----------AAAAATA-ATA-TGCTTCCAT-TAAAGAA-AC--------------------TAATAGGACA-AC-AA---AA-AAATC------TATT-GACACCCATGTTTTT-G-CAG------------------GA-----------------TATTGTTT-AAAAAG-T-ATA-CTA-GT--C-CTAT-GTTCGAA-------CACTGA-ATTTT--GCTTCGAAAGACA-TA-TTT-------ATTT---------GGGGGGGGG---------GGGTT-C-AACT---TG-T--A-T--C----AAAGCTAT-----TTAT--C-----T-CTG----ACCA-----AGA------AA----TAT--A-TA-T-CGTTG-AT--G--T-GA--A--GT-C---A-GCTAT---T-CCAAA--AC-TTGT-AG---AAC--TC------------AACTGTTC--GGCT-AG-T-A--CATTAAACA-TGTATTTT-GA-----A-----C-AT--------------------TT-------------A----C-C-TGCGGTCAGATGT-CAGGTAA-------T-ACACC--------GT---T-ACCAGG-----TTTTTTTTA-------AG--AAGCT--G-CATA-CATTA-ATAGATTATTA-TAT--CAA---T-ATATG-ACACGAGC--A-G---T-----ACATAT--ATAGATTTT-----GT-G-AAACAGAAGAGAAC-AA---A-TATTTAG--GGAAATCT-----G-TATCC---TTGG-------------------AC-ACTT-ATTGAT----------CCTT-T--T---------------------------TGAT-TCTTCTACAT----TCTAGCTAGTTTTGCTACAATA---TATCAAGATAAAAAAAAT-GTATAAGTAC---ATTTATCTATGTAAGATTTA-C-T--AAA--TTTT-TAT----AACTTTTAAGTAT-----A------TTTGG-TG-TACTCTAGCA-TGGC-AATCTTATGA--TT--TCACAA---TTAGAT-CTTTAAGATATATCATAAG-T--TGTCTCGAAGAT-AATCATAAGTCTGTCTTACGACAAATGTG-AAACCCAGTC
gi|5                          :                                                                                                                                         ggaGAA-AC--------------------TATT--GACG-AC-AACATTA-G--TT------TATTTACC---------------GAA------------------GAAT---------------TAT-ATT---AGATA-T-G-------GTG-C-CTATCG--GGAAAC-----CACTGA-ATCTT--GCTTCGGAA-A-AGTAATTT-------TTTTCGGGGGTGGGGGGGGGGG---------GG--T-T-ATCT---TC-GTCA-G--TCAATAA-GCTAT-----TTATT-C-----T-CTGG---ACCA----GAGA------AA-T--TAT--A-CAAC-CGTTT-AT--A--TTGA--A--GT-TCCTA-GCTAT---TTCCAAA---CCTTGT-AG---A-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CT-AGGT-A--CATGTAACA-TGCAA----GA-----A-----C-AT--------------------TT-------------AATTACAC-AGCGA------GTACAG-TAA-------A-GCGCCC-------GT---TTAACAGGG--T-TTTTTTTAA---T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CATTA-ATAG-TT-TTA-TA---CCACT-T-TTATG-ACAACAGCCTA-G--CT-----GCATATT-ATA-ATTTT-----GTTG-AA-CAGAAGAGAAA-AA---A-TATTTAG--GGATATCC-----G-TATCC---TTGGACT-AC-T---AGTATATAAC-ATTTCAT--AT----------CCTT-T--TGATCCTTTTT-TTAACTCCTGAAA--CTGAG-TTTTCT-CAA----TTTAGT-A--TTTGCTACAATA---TCCCAGAAT----AAAAT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGATTTTTT-TAT----AAC--TT-AG-AT-----AG-----TTTTGTTGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-GTTTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CT-TCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTGAAAACCCAG
gi|6                          :                                                          TTAGCTAAATGGA---CATTGGCAT------------TTT---A-A----------AAAAATA-AT-----TTCCAT-TAAAGAATAA--------------------TAG---GACA-AC-AA---TA-AA-TC------TATT-GACACCCATTGTATTTG-CAG------------------GA-----------------TAT-GTTT-AACA-G-T-A-A-CTATGT--C-CTAT-GTCG-AAAC-----ACCTGA-ATTT---G-TTCG-AA-ACATGA-TTT-------AGGC---------GGAGGGGGGT--------GG--TTC-AACT---TC-GTCA----TCAATAAGCTTAT-----TTAT--C-----T-T--G---ACCA-----AGA---------T----T--A-CA-C-C-TATTATC-G--TTGAGTA--AT---CTA-GCTAT---T--CAAA----CTTGT-AGCCAA-C--TC------------AACTGTTCGTG-CT-ATGT-AACCA--TAACA-TGTAT----GA-----A-------AT--------------------T---------------------C-TGCGA------GT-CAGATGATTCAGGTA-ATACAA-------GT------ACAG-----GTTTTTTTTC---A---AG--AAGTC-------A-TACTA-TCAG-TTATTA-TA---CCACTAT-ATATGAACA-CAGCTAA-GTACC-----ATATAT--ATG-ATTTT-----GT---GAACAGAAGAGAAACAA---A-TATTTAG--GGA-ATCG-----A-T---C---TTGGATC-A--T-----TAT-TGA----TCCAT--G-------------TT-TGATC----------TTATCTACTTCAG--CT-AG-TTTT--------------GC-A-------CATAATA---------AATAA--AAAAT-GTATAAG-ATAACATTTATT---ATAAGATTTA-C-TTAATA--TTTTATAT----AAT--TT-----T-----AA-----ATTTGTTGATACCT-AGCTATGGC-AATCTTATGAAGTT--TCACAAGG-TTAGATCC-TTTAGATA-AT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       caggttcagaaacagtcattaT--A-CA-C-CGTTTCAT--A--TTGA--A--GT-TCTTA-----T---TTCCAAA--ACCTTGT-AG---A-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CT-AGGT-A--CATGTAACA-TGTAATCTTGA-----A-----C-AT--------------------TT-------------A----CA---GCGA------GTGCAG-TAA-------A-ACGCCC-------GT---TTAACAGGG---GTTTTTTTAAA--T---AG--AAGCTT-G-CA-A-CATTA-ATAG-TT-TTA-TA---AAACT-T-TTATG-ACACCAGCCTA-G--CT-----ACATAT--ATA-ATTTT-----GTTG-AAACA-AAGAGAAA-AA---AATATTTAG--GGATATCC-----A-TATCC---TTGGACT-AA-T---AATATGTAAC-ATTTCAT--AT----------CCTT-T--TGATCCTTTTTTTTAACTCCTGAAA--C--AG-TTTTCT-TAA----TTTAG---------------TA---TCCCAGAAT----AAAAT-GG-TAAGCATA-------TC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--CTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGGAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAG
gi|8                          :                          AGTTG-GAAAC---CATATAGGCACTTAGCGTT-AG--AAAT--A---CAT--GCATATAGCCTACA--TCT---G-AT---------AAAAA-ATATA-T-CTTCCAC-TAAAGAA-AAC-------------------TATT--GAC---C-AA---CA-G--TCAGCATGTATT--ACG------------A-GAA------------------GAATGCATTGAATTTAGAGTAT-GTTTTAAAACG-T------CAAATG-C-CTGT-GTCGTAAAA-----CACTGA-AATTT--GCTTCAAAA-ACAGTG-CAT-------TTGA---------GGGGGAGGG---------GG-------------------A-G--TCAA--------------------C-----T-CTGA---ACCA----GAGA------AAAT--TGT--A-CA-T-CGTTTCAT--G--TTGA--A--GT-TCCTA-GTTAT---TTCCAAA--ACCTTGT-TG---T-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CC-AGGT-A--CATGTAACA-TGCAC----AA-----A-----C-ATTATACATGTATAATATTTAATT-------------A----CAC-AGTGA------ATACAG-TAA-------A-ACACGC-------GT---GTAACAGG-------TTTTTTA---T---GG--AAGCTT-G-AA-A-CATTA-ATAG-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATG-GCATCAGTCTA-A--CT-----ACATAT--ATA-ATCTA-----GGTG-AAATAGAAG
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Reference ( family-839 )      :                          AGTTG-GAAAC---CACA--GGCACTTGGCGTTTAG--AAAT--A---CAT--GCATGTA-----CA--TTT---A-A----------AAAAA-A-ATA-T-CTTCCAT-TAAAGAA-AN--------------------TATT--GACA-AC-AA---TA-G--TC------TATTTGACA------------G-GAA------------------GA-----------------TAT-GTTT-AAAACG-T-A-A-CTAAGTG-C-CTGT-GTCGGAAAC-----CACTGA-ATTTT--GCTTCGGAA-ACAGTA-TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG---------GG--T-CAACTT-CNTCAT--TCA-----ATAAAGCTAT-----TTAT--C-----T-CTGG---ACCA----GAGA------AANT--TGT--A-CA-C-CGTTTCAT--G--TTGA--A--GT-TCCTA-GCTAT---TTCCAAA--ACCTTGT-AG---A-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CT-AGG-TA--CATGTAAC-ATGCAN----GA----A-----C-AT--------------------TT-------------A----CA-CAGCGA------GTACAG-TAA-------A-ACAC-------CCGT---TTAACAGGG--TGTTTTTTTTA---T---GG--AAGCTT-GCA-A-CA-TTAATAG-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATG-ACAGCAGCCT-AG--C-----TACATAT--ATA-ATTT-----TGTTG-AAACAGAAGAGAAA-AA---A-TATTTAG--GGATATCC-----G-TATCC---TTGGACT-A--T---AGTATATAAC-ACTTCAT--AT----------CCTT-T--TN----------TTAACTCCTGAAA--CTGAG-TTTTCT-CAA----TTTAGC-A--TTTGCTACAATA---TCCCAGAAT----AAAAT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--TTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAGCC
gi|1                          :                            TTGAGAAACGGTCACA--GGCACTTAGCGTTTAG--ATAT--ATTACAT--GCATGTG-----CAACTTC---A-ATACTCTGGCCAAGAA-A-ATA-T-CTCCCAT-TAAAAAA-AAACCCTAA-------------TATCCGGACACACGAA---TACG--TA------TTTTTACCA------------GAGAAAAATATTAAATTA-----GA-----------------TAT-GCTA-AAACCGCT-C-A-C--AGTG-AACTGT-GTCGGAAACAATTTTACTGACATTTTTTGCTTTTGGA-ACAGTA-CAT-------TT-----------GGGGGGGGGCTGCGGGCCGG--T-CCAAAT-CAGTAT--TCAGTTTGATATTGTCGC-----TCAT--CATGCGT-CTGGTATACCA----GCAACGATATAATTCTTGTCGA-CA-CTCTTCTCAA--GCTTTGA--ACGGTATCCTACGCTCTGCTCTCCCCA--ACCTTGTCAG---A-CCATCT-------CA--AACTGTTA--G-CT-AGGTTA--CATGGAACAATGTAA----AACCCCAAT---C-AT--------------------TT-------------AAT--TACCAGTGA------GTACGG-TAA-------ATACACCTACCAGCTGT---TTGACAGGT--TATTTTTTACAACCT---GGTCAAGTTTGGCA-A-CATTTTACCG-AT-TTA-TAAACTAACT-T-ATATG-ACAGCTACCTAAG--CTCAATTATATATTGACA-GTTTTTTTGTGTCG-AAACAGAAGAGAAA-CA---A-AATTGAGGCGAATACACTCAAAGTTATTTTAGTTGGGCT----TCTCAGT---------CTTCTT--CT----------TCTTAC--TC----------TTA--CCCTGAAACCCTGAGTTTTTCT-CAATCCCTCTAGC-A--TTTACTACAACATACTCCCCACAT----AAAATGGT-TAAG
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttggcagtTAAC-ACTTTG---AT----------CCTT-T---C----------TAAATCCCCGAAA--CTACA-TTATCT-CAG----TTTAGC-A--TTTATTACGATT---GACCAGAAT----GAATT-GT-TAAGGATGAAACTTATC---GTAAGATTTGTC-ATAAGA--TTTT-TATACAGAAC--TAAAT-ATATCTAAGGGCATTTTTG-TGAAGC---ACCAGTGACAAATCTTATGA--GT-GTCATAA-G-CCAGAT-C-TTA--ATA------AAG-TCCTGTCGT-ATGACGAATTCTAAGATACTTT---------TGTG-AAACACAGCCtcctctccaataagtcaggtctttcgaagattatcattaagtccttgtgtttaccgacacttgtgaaa
gi|11                         : tactggtacatttttgcgttccaggAGTTG-GAAAC---CACA--GGCACTTGGCGTTTAG--AAAT--A---CAT--GCAT--------CA--TTT---TTA----------AAAAA-A-ATAAT-CTTCCAT-TAAAGAA-ACTATAGACAACAGTAGTAAACTATT--GACA-CC-AA---TA-G--TT------TATTTG-CA------------G-CA--------------------------------------TAT-GTTT-AAAACG-TAA-A-CTAAGTG-T-CTAT-GTCGGAAAC-----CACTGA-ATTTT--GCTTTGGAA-ACAGTA---A-------TTGG---------GGGGGGGGG---------GG--TCCAGCTT-CGTCAG--TCA-----ATAAAGCTAT-----TTAT--C-----T-CTGG---ACCA----GAGA------AAAT--TAT--A-CA-C-CGT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ctggAAA-AACGGA-CATTTAC--GGATATC-------------------------------AGTATAAAGC-AATTTAT--AT----------CAT------A----------TTGA-TCCCGAAA--CTGGG-ATTTCA-AAA----TTTACA-A--TTTGTTATTATA---TCCAAGAAT----AAAAA-GT-CAAGCATGCCACTTATC---GTAATATTTGTT-TT--------CT-TAT----ATC--TCAAG-AT-----AT-----TTCTG-TGAAAC---AACAGTGGC-GATCTTGTGA--TT-GTCATAG-G-TCAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAGAT-CTGTTTT-CTGAGAAACCTTAAAATAGACT---------TGT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    taaacTTGT-AG---A-AAATCT-------TA--AAATTTCT--G-AT-A----A--CAT-TAAC--TGTGT----TG----A-----C-A------------------------------------A----TA-TAGCGG------ATGGAG-TCG-------A-ACAC-------CCAT---TCAACA-------TCTTTTTTA---T---GG--AAGCTT-GCA-A-CA-TTTATAT-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATG-ACAGCAGCCT-AC--G-----TACA----------------------G-AAACAGAAGA-AAA-AT---A-TATTTAG--GGATATCT-------------------AC-----T---AGTATATAAC-AAATCAT--GT----------TCTT-T--T
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG---------GG--T--AACTG-CATCCA--TCA-----ATAAGG------------T--C-----T-CTGA---ACCA----GAGA------AATT--AGT--T-CA-C-CGTTTCAT--G--TTGA--A--GT-TACTA-ACTAT---TTTCAAAACACCTTGC-AG---A-C--TCT-------GG--AACATTTC--G-TT-AGA-TA--CGTGTAAC-GTCTAA----CA----AAATTTC-AT--------------------TTAACTCCGTTGACAA----TA-CAGCAA------GTTCAG-CAG-------A-ACAC-------TCGT---ATAga
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AC-----GACTGA-ATATT--GCCTCGAAA-ATAATA-TTTGTTGTCTTTTT-------------------------------T-CAACTT-CCTCCG--TTA-----ATAA--CT-------CTAT--C-----T-CTGA---TGCA----GAGA------AATT--TGG--A-CT-T-CGTTTCAC--------------GT-TCCTC-GCCAT---TTCCAAC--ACCGTCT-CG---A-C--TCTTTAAATACG--AAATGTTC--A-CT-AGA-TA--T---------TGCGA----GA----A-----C-AT--------------------TT-------------A----
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -ATTT-----TGTTTTAAACAGAATAGAAA-TG---A-TATTCAG--GGACATTA-----A-TACTC---TTGGACTTC--T---AGTATATA-------CAT-----------------------T----------TTAAC--ATGAAA--TTAAG-TCATCT-CAA----TTTAGC-A--TTTATTACAATA---TCCCAGAAT-----AGAT-TT-CAAA-ATGCAA-TTATC---ATCAAATATA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTTA---TAATGG--AAGTTTTGCA-AACA-TTCATAT-TT-TTA-TA---CAAGT-TAACATA-CCTGCAGCTC-AG--C-----TACATA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           taaaggacattttgaaatactaattttaaattaatatgaccaataaggtcgcaacattTTT-TAT----AAC--TTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGT--TT-GTCACAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCGTAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   G-----TTTTG-TGAAAC---AACAGTGGC-AATCTTATGG--TT-GCCGTAA-G-TCAAAC-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-GCGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-GAACCCAGCC
gi|2                          :                          AGTTG-GAAAC---CATA--GGCACTTGGCGTTTAG--AAAT--A---CAT--GCATGTAGACTACA--TTTGATA-A----------AAAAA-A-TTA-T-CTTCCTT-TAAAGAA-AG--------------------TATT-----A-AC-AG---T-----TA------TATTT-ACA------------G-GAAAATTACAATTACAATATAGA-----------------TAT-GCTT-TAAAT--T-----CTAAGTGGC-CTGT-GTCGTAA-C-----CACTGA-ATT----GCTTCG--A-ACAGGA-CGA-------TTT------------GGGGGGA---------GG--T-CAACTT-CGTCATAGTCA------TAAA-CTATACAATCTATTCC-----T-CTG----ACCT----CAAA------AATT--AGT--AACT-C-GGTCTTGTCAA--TGGG--A--GTATCCTATGCTAT---TATCAAA--ACTCTTT-AG-----C--TCT-------CACAAACT-TTC--G-CCCAGG-TA--CA---GAC-ATGCAC----AA----A-----TTAA--------------------TT-------------A----CA-TAGTGA------ATACAG-TAA-------A-ACAT-------GCGTGTATTAACA-----TGTTTTTTATA---T---GG--AAGCTT-GCA-A-CA-TTAATAG-TT-TTAATA---CAACT-T-TTATG-ACAGCAGTGT-AG--C-----TACATAT--ATA-ATTT-----AGTTG-AAACAGAAGAAAAA-AA---A-TATTTAG--AGATATCA-----G-TATCC---TTGGACT-AC-T---AGTATACAAC-ACTTCAT--ATTCTTTTGAT-CCTT-T--TT----------TTAATTCCTGAAA--CTGAG-TTTTTTTCGA----TTTAGA-A--TTTACTACAATA---TCCCAAAAT----AAATT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--TTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TAAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAGCCct
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttggAA-------A-ACAC-------CCGT---TTAACAGTG--TGTTTTTTTTA---T---GG--AAGCTT-GCA-A-CA-CTAATAG-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATG-ACAATAGCCT-AG--C-----TACATAT--ATA-ATTT-----TGTTG-AAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         G-AT-----AA-----TTTTA-TGAAAC---AACAGTGAT-AACATTATGA--TTGGTCATAA-GATT--AT-C-GTAAGAT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ggtG-AT-----AA-----TTTTA-TGAAAC---AACAGTGAT-AATATTATGA--TT-GTCATAA-GATT--AT-C-GTAAGATctgtttgattacattagaggaaaccctgccct
gi|23                         :                          tGTTG-AAAAA---CACA--AGCAATTGACGTTTAA--AAAT--G---CAT-------TA-----AA--TAT---A-A----------AATAA-------T-CTTTCCTATAAGCAA-AT--------------------TATT--GACA-TT-AA---TA-G--Tctgtttgattacattagagaaaccctgcc
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TCAGAT-C-ATAAGA------------T-CTGTTTT-CTGAGAAACCTTAAACTAGGTC---------GGTG-AAAt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG---------GG-----------GGGCAT--CC------ATAAA--TAT-----ATGT--C-----TACT-A---ACCAGCAGGAGA------AAGT--T
gi|3                          :                    atacatAGTTG-GAAAC---CACA--GGCACTAGGCGTTTAG--AAAT--A---CAT--GCATGTA-----CA--TTT---A-A----------AAAAA-A-ATA-T-CTTTCAT-TAAAGAA-AG--------------------TATT--GACA-AC-AA---TA-G--TT------TATTTAACA------------G-GAA------------------GA-----------------TAT-GTTT-AAAACG-T-A-AACTAAGTG-C-CATT-GTCGGAAAC-----CACTGA-ATTTT--GCTTCGGAA-ACAGTA-TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG---------GG--C-CAACTT-CTCCTT--CCA-----ATAAAGTTAT-----TTAT--C-----T-TTGG---ACCA----GTGA------AAAT--TGT--A-CC-A-CGTTTTAT--G--TTTA--C--GT-TCCTG-GCTAT---TTCCAAA--ACCTTGT-AA---A-C--TCT-------CA--AACTTTTC--G-CT-AGG-TA--CATGTAAC-ATGCAA----GA----A-----C-AT--------------------TT-------------A----CA-CAGCGC------GTACAG-TAA-------A-ACAC-------CCGT---TTAACAGGGTTTGTTTTTTTTA---T---GG--AAGCTT-GCA-A-CA-----------------A---TAACT-T-TTATG-ACAACAGCCT-AG--C-----TACATAT--ATA-ATTT-----TGTTG-AAACAGAAAAGAAA-AA---A-TATTTAG--GGATATCC-----G-TATCC---TTGGAC----------GTATATAAC-ATTTCAT--AT----------CCTT-T--TA----------TTAACTCCTGAAA--CTAAG-TTTTCT-CAA----TTTAGC-A--TTTGCTACAATA---TCCCAGAAT----AAAAT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--TTGAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAGCC
gi|4                          :                                                                             --GCAT-TG-----CA--TTTT--A-A----------AAAAATA-ATA-TGCTTCCAT-TAAAGAA-AC--------------------TAATAGGACA-AC-AA---AA-AAATC------TATT-GACACCCATGTTTTT-G-CAG------------------GA-----------------TATTGTTT-AAAAAG-T-ATA-CTA-GT--C-CTAT-GTTCGAA-------CACTGA-ATTTT--GCTTCGAAAGACA-TA-TTT-------ATTT---------GGGGGGGGG---------GGGTT-CAACTTGTATCA--------------AAGCTAT-----TTAT--C-----T-CTG----ACCA-----AGA------AA----TAT--A-TA-T-CGTTG-AT--G--T-GA--A--GT-C---A-GCTAT---T-CCAAA--AC-TTGT-AG---AAC--TC------------AACTGTTC--GGCT-AG--TA--CATTAAAC-ATGTATTTT-GA----A-----C-AT--------------------TT-------------A----C--CTGCGGTCAGATGT-CAGGTAA-------T-ACAC-------C-GT---T-ACCAGG-----TTTTTTTTA-------AG--AAGCT--GCATA-CA-TTAATAGATTATTA-TAT--CAA---T-ATATG-ACACGAGC---AG--------TACATAT--ATAGATTT-----TGT-G-AAACAGAAGAGAAC-AA---A-TATTTAG--GGAAATCT-----G-TATCC---TTGG-------------------AC-ACTT-ATTGAT----------CCTT-T--T---------------------------TGAT-TCTTCTACAT----TCTAGCTAGTTTTGCTACAATA---TATCAAGATAAAAAAAAT-GTATAAGTAC---ATTTATCTATGTAAGATTTA-C-T--AAA--TTTT-TAT----AACTTTTAAGTAT-----A------TTTGG-TG-TACTCTAGCA-TGGC-AATCTTATGA--TT--TCACAA---TTAGAT-CTTTAAGATATATCATAAG-T--TGTCTCGAAGAT-AATCATAAGTCTGTCTTACGACAAATGTG-AAACCCAGTC
gi|5                          :                                                                                                                                         ggaGAA-AC--------------------TATT--GACG-AC-AACATTA-G--TT------TATTTACC---------------GAA------------------GAAT---------------TAT-ATT---AGATA-T-G-------GTG-C-CTATCG--GGAAAC-----CACTGA-ATCTT--GCTTCGGAA-A-AGTAATTT-------TTTTCGGGGGTGGGGGGGGGGG---------GG--T-TATCTT-CGTCAG--TCA-----ATAA-GCTAT-----TTATT-C-----T-CTGG---ACCA----GAGA------AA-T--TAT--A-CAAC-CGTTT-AT--A--TTGA--A--GT-TCCTA-GCTAT---TTCCAAA---CCTTGT-AG---A-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CT-AGG-TA--CATGTAAC-ATGCAA----GA----A-----C-AT--------------------TT-------------AATTACA-CAGCGA------GTACAG-TAA-------A-GCGC-------CCGT---TTAACAGGG--T-TTTTTTTAA---T---GG--AAGCTT-GCA-A-CA-TTAATAG-TT-TTA-TA---CCACT-T-TTATG-ACAACAGCCT-AG--C-----TGCATATT-ATA-ATTT-----TGTTG-AA-CAGAAGAGAAA-AA---A-TATTTAG--GGATATCC-----G-TATCC---TTGGACT-AC-T---AGTATATAAC-ATTTCAT--AT----------CCTT-T--TGATCCTTTTT-TTAACTCCTGAAA--CTGAG-TTTTCT-CAA----TTTAGT-A--TTTGCTACAATA---TCCCAGAAT----AAAAT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGATTTTTT-TAT----AAC--TT-AG-AT-----AG-----TTTTGTTGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-GTTTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CT-TCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTGAAAACCCAG
gi|6                          :                                                          TTAGCTAAATGGA---CATTGGCAT------------TTT---A-A----------AAAAATA-AT-----TTCCAT-TAAAGAATAA--------------------TAG---GACA-AC-AA---TA-AA-TC------TATT-GACACCCATTGTATTTG-CAG------------------GA-----------------TAT-GTTT-AACA-G-T-A-A-CTATGT--C-CTAT-GTCG-AAAC-----ACCTGA-ATTT---G-TTCG-AA-ACATGA-TTT-------AGGC---------GGAGGGGGGT--------GG--TTCAACTT-CGTCA---TCA-----ATAAGCTTAT-----TTAT--C-----T-T--G---ACCA-----AGA---------T----T--A-CA-C-C-TATTATC-G--TTGAGTA--AT---CTA-GCTAT---T--CAAA----CTTGT-AGCCAA-C--TC------------AACTGTTCGTG-CT-ATG-TAACCA--TAAC-ATGTAT----GA----A-------AT--------------------T----------------------CTGCGA------GT-CAGATGATTCAGGTA-ATAC-------AAGT------ACAG-----GTTTTTTTTC---A---AG--AAGTC------A-TA-CTATCAG-TTATTA-TA---CCACTAT-ATATGAACA-CAGCTA-AGTAC-----CATATAT--ATG-ATTT-----TGT---GAACAGAAGAGAAACAA---A-TATTTAG--GGA-ATCG-----A-T---C---TTGGATC-A--T-----TAT-TGA----TCCAT--G-------------TT-TGATC----------TTATCTACTTCAG--CT-AG-TTTT--------------GC-A-------CATAATA---------AATAA--AAAAT-GTATAAG-ATAACATTTATT---ATAAGATTTA-C-TTAATA--TTTTATAT----AAT--TT-----T-----AA-----ATTTGTTGATACCT-AGCTATGGC-AATCTTATGAAGTT--TCACAAGG-TTAGATCC-TTTAGATA-AT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       caggttcagaaacagtcattaT--A-CA-C-CGTTTCAT--A--TTGA--A--GT-TCTTA-----T---TTCCAAA--ACCTTGT-AG---A-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CT-AGG-TA--CATGTAAC-ATGTAATCTTGA----A-----C-AT--------------------TT-------------A----CA---GCGA------GTGCAG-TAA-------A-ACGC-------CCGT---TTAACAGGG---GTTTTTTTAAA--T---AG--AAGCTT-GCA-A-CA-TTAATAG-TT-TTA-TA---AAACT-T-TTATG-ACACCAGCCT-AG--C-----TACATAT--ATA-ATTT-----TGTTG-AAACA-AAGAGAAA-AA---AATATTTAG--GGATATCC-----A-TATCC---TTGGACT-AA-T---AATATGTAAC-ATTTCAT--AT----------CCTT-T--TGATCCTTTTTTTTAACTCCTGAAA--C--AG-TTTTCT-TAA----TTTAG---------------TA---TCCCAGAAT----AAAAT-GG-TAAGCATA-------TC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--CTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGGAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAG
gi|8                          :                          AGTTG-GAAAC---CATATAGGCACTTAGCGTT-AG--AAAT--A---CAT--GCATATAGCCTACA--TCT---G-AT---------AAAAA-ATATA-T-CTTCCAC-TAAAGAA-AAC-------------------TATT--GAC---C-AA---CA-G--TCAGCATGTATT--ACG------------A-GAA------------------GAATGCATTGAATTTAGAGTAT-GTTTTAAAACG-T------CAAATG-C-CTGT-GTCGTAAAA-----CACTGA-AATTT--GCTTCAAAA-ACAGTG-CAT-------TTGA---------GGGGGAGGG---------GG---------------AG--TCA-----A--------------------C-----T-CTGA---ACCA----GAGA------AAAT--TGT--A-CA-T-CGTTTCAT--G--TTGA--A--GT-TCCTA-GTTAT---TTCCAAA--ACCTTGT-TG---T-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CC-AGG-TA--CATGTAAC-ATGCAC----AA----A-----C-ATTATACATGTATAATATTTAATT-------------A----CA-CAGTGA------ATACAG-TAA-------A-ACAC-------GCGT---GTAACAGG-------TTTTTTA---T---GG--AAGCTT-GAA-A-CA-TTAATAG-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATG-GCATCAGTCT-AA--C-----TACATAT--ATA-ATCT-----AGGTG-AAATAGAAG
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Reference ( family-839 )      :                          AGTTG-GAAAC---CACA--GGCACTTGGCGTTTAG--AAAT--A---CAT--GCATGTA-----CA--TTT---A-A----------AAAAA-A-ATA-T-CTTCCAT-TAAAGAA-AN--------------------TATT--GACA-AC-AA---TA-G--TC------TATTTGACA------------G-GAA------------------GA-----------------TAT-GTTT-AAAACG-T-A-A-CTAAGTG-C-CTGT-GTCGGAAAC-----CACTGA-ATTTT--GCTTCGGAA-ACAGTA-TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG---------GG--T-C-AACTTCGTCAN--TCA-----ATAAAGCTAT-----TTAT--C-----T-CTGG---ACCA----GAGA------AANT--TGT--A-CA-C-CGTTTCAT--G--TTGA--A--GT-TCCTA-GCTAT---TTCCAAA--ACCTTGT-AG---A-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CT-AGG-TA--CATGTAAC-ATGCAN----GA----A-----C-AT--------------------TT-------------A----CA-CAGCGA------GTACAG-TAA-------A-ACAC-------CCGT---TTAACAGGG--TGTTTTTTTTA---T---GG--AAGCTT-GCA-A-CA-TTAATAG-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATG-ACAGCAGCCT-AG--C-----TACATAT--ATA-ATTT-----TGTTG-AAACAGAAGAGAAA-AA---A-TATTTAG--GGATATCC-----G-TATCC---TTGGACT-A--T---AGTATATAAC-ACTTCAT--AT----------CCTT-T--TN----------TTAACTCCTGAAA--CTGAG-TTTTCT-CAA----TTTAGC-A--TTTGCTACAATA---TCCCAGAAT----AAAAT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--TTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAGCC
gi|1                          :                            TTGAGAAACGGTCACA--GGCACTTAGCGTTTAG--ATAT--ATTACAT--GCATGTG-----CAACTTC---A-ATACTCTGGCCAAGAA-A-ATA-T-CTCCCAT-TAAAAAA-AAACCCTAA-------------TATCCGGACACACGAA---TACG--TA------TTTTTACCA------------GAGAAAAATATTAAATTA-----GA-----------------TAT-GCTA-AAACCGCT-C-A-C--AGTG-AACTGT-GTCGGAAACAATTTTACTGACATTTTTTGCTTTTGGA-ACAGTA-CAT-------TT-----------GGGGGGGGGCTGCGGGCCGG--T-CCAAATCAGT-AT--TCAGTTTGATATTGTCGC-----TCAT--CATGCGT-CTGGTATACCA----GCAACGATATAATTCTTGTCGA-CA-CTCTTCTCAA--GCTTTGA--ACGGTATCCTACGCTCTGCTCTCCCCA--ACCTTGTCAG---A-CCATCT-------CA--AACTGTTA--G-CT-AGGTTA--CATGGAACAATGTAA----AACCCCAAT---C-AT--------------------TT-------------AAT--TACCAGTGA------GTACGG-TAA-------ATACACCTACCAGCTGT---TTGACAGGT--TATTTTTTACAACCT---GGTCAAGTTTGGCA-A-CATTTTACCG-AT-TTA-TAAACTAACT-T-ATATG-ACAGCTACCTAAG--CTCAATTATATATTGACA-GTTTTTTTGTGTCG-AAACAGAAGAGAAA-CA---A-AATTGAGGCGAATACACTCAAAGTTATTTTAGTTGGGCT----TCTCAGT---------CTTCTT--CT----------TCTTAC--TC----------TTA--CCCTGAAACCCTGAGTTTTTCT-CAATCCCTCTAGC-A--TTTACTACAACATACTCCCCACAT----AAAATGGT-TAAG
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ttggcagtTAAC-ACTTTG---AT----------CCTT-T---C----------TAAATCCCCGAAA--CTACA-TTATCT-CAG----TTTAGC-A--TTTATTACGATT---GACCAGAAT----GAATT-GT-TAAGGATGAAACTTATC---GTAAGATTTGTC-ATAAGA--TTTT-TATACAGAAC--TAAAT-ATATCTAAGGGCATTTTTG-TGAAGC---ACCAGTGACAAATCTTATGA--GT-GTCATAA-G-CCAGAT-C-TTA--ATA------AAG-TCCTGTCGT-ATGACGAATTCTAAGATACTTT---------TGTG-AAACACAGCCtcctctccaataagtcaggtctttcgaagattatcattaagtccttgtgtttaccgacacttgtgaaa
gi|11                         : tactggtacatttttgcgttccaggAGTTG-GAAAC---CACA--GGCACTTGGCGTTTAG--AAAT--A---CAT--GCAT--------CA--TTT---TTA----------AAAAA-A-ATAAT-CTTCCAT-TAAAGAA-ACTATAGACAACAGTAGTAAACTATT--GACA-CC-AA---TA-G--TT------TATTTG-CA------------G-CA--------------------------------------TAT-GTTT-AAAACG-TAA-A-CTAAGTG-T-CTAT-GTCGGAAAC-----CACTGA-ATTTT--GCTTTGGAA-ACAGTA---A-------TTGG---------GGGGGGGGG---------GG--TCC-AGCTTCGTCAG--TCA-----ATAAAGCTAT-----TTAT--C-----T-CTGG---ACCA----GAGA------AAAT--TAT--A-CA-C-CGT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ctggAAA-AACGGA-CATTTAC--GGATATC-------------------------------AGTATAAAGC-AATTTAT--AT----------CAT------A----------TTGA-TCCCGAAA--CTGGG-ATTTCA-AAA----TTTACA-A--TTTGTTATTATA---TCCAAGAAT----AAAAA-GT-CAAGCATGCCACTTATC---GTAATATTTGTT-TT--------CT-TAT----ATC--TCAAG-AT-----AT-----TTCTG-TGAAAC---AACAGTGGC-GATCTTGTGA--TT-GTCATAG-G-TCAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAGAT-CTGTTTT-CTGAGAAACCTTAAAATAGACT---------TGT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    taaacTTGT-AG---A-AAATCT-------TA--AAATTTCT--G-AT-A----A--CAT-TAAC--TGTGT----TG----A-----C-A------------------------------------A----TA-TAGCGG------ATGGAG-TCG-------A-ACAC-------CCAT---TCAACA-------TCTTTTTTA---T---GG--AAGCTT-GCA-A-CA-TTTATAT-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATG-ACAGCAGCCT-AC--G-----TACA----------------------G-AAACAGAAGA-AAA-AT---A-TATTTAG--GGATATCT-------------------AC-----T---AGTATATAAC-AAATCAT--GT----------TCTT-T--T
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG---------GG--T---AACTGCATCCA--TCA-----ATAAGG------------T--C-----T-CTGA---ACCA----GAGA------AATT--AGT--T-CA-C-CGTTTCAT--G--TTGA--A--GT-TACTA-ACTAT---TTTCAAAACACCTTGC-AG---A-C--TCT-------GG--AACATTTC--G-TT-AGA-TA--CGTGTAAC-GTCTAA----CA----AAATTTC-AT--------------------TTAACTCCGTTGACAA----TA-CAGCAA------GTTCAG-CAG-------A-ACAC-------TCGT---ATAga
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AC-----GACTGA-ATATT--GCCTCGAAA-ATAATA-TTTGTTGTCTTTTT-------------------------------T-C-AACTTCCTCCG--TTA-----ATAA--CT-------CTAT--C-----T-CTGA---TGCA----GAGA------AATT--TGG--A-CT-T-CGTTTCAC--------------GT-TCCTC-GCCAT---TTCCAAC--ACCGTCT-CG---A-C--TCTTTAAATACG--AAATGTTC--A-CT-AGA-TA--T---------TGCGA----GA----A-----C-AT--------------------TT-------------A----
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                -ATTT-----TGTTTTAAACAGAATAGAAA-TG---A-TATTCAG--GGACATTA-----A-TACTC---TTGGACTTC--T---AGTATATA-------CAT-----------------------T----------TTAAC--ATGAAA--TTAAG-TCATCT-CAA----TTTAGC-A--TTTATTACAATA---TCCCAGAAT-----AGAT-TT-CAAA-ATGCAA-TTATC---ATCAAATATA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTTA---TAATGG--AAGTTTTGCA-AACA-TTCATAT-TT-TTA-TA---CAAGT-TAACATA-CCTGCAGCTC-AG--C-----TACATA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           taaaggacattttgaaatactaattttaaattaatatgaccaataaggtcgcaacattTTT-TAT----AAC--TTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGT--TT-GTCACAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCGTAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   G-----TTTTG-TGAAAC---AACAGTGGC-AATCTTATGG--TT-GCCGTAA-G-TCAAAC-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-GCGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-GAACCCAGCC
gi|2                          :                          AGTTG-GAAAC---CATA--GGCACTTGGCGTTTAG--AAAT--A---CAT--GCATGTAGACTACA--TTTGATA-A----------AAAAA-A-TTA-T-CTTCCTT-TAAAGAA-AG--------------------TATT-----A-AC-AG---T-----TA------TATTT-ACA------------G-GAAAATTACAATTACAATATAGA-----------------TAT-GCTT-TAAAT--T-----CTAAGTGGC-CTGT-GTCGTAA-C-----CACTGA-ATT----GCTTCG--A-ACAGGA-CGA-------TTT------------GGGGGGA---------GG--T-C-AACTTCGTCATAGTCA------TAAA-CTATACAATCTATTCC-----T-CTG----ACCT----CAAA------AATT--AGT--AACT-C-GGTCTTGTCAA--TGGG--A--GTATCCTATGCTAT---TATCAAA--ACTCTTT-AG-----C--TCT-------CACAAACT-TTC--G-CCCAGG-TA--CA---GAC-ATGCAC----AA----A-----TTAA--------------------TT-------------A----CA-TAGTGA------ATACAG-TAA-------A-ACAT-------GCGTGTATTAACA-----TGTTTTTTATA---T---GG--AAGCTT-GCA-A-CA-TTAATAG-TT-TTAATA---CAACT-T-TTATG-ACAGCAGTGT-AG--C-----TACATAT--ATA-ATTT-----AGTTG-AAACAGAAGAAAAA-AA---A-TATTTAG--AGATATCA-----G-TATCC---TTGGACT-AC-T---AGTATACAAC-ACTTCAT--ATTCTTTTGAT-CCTT-T--TT----------TTAATTCCTGAAA--CTGAG-TTTTTTTCGA----TTTAGA-A--TTTACTACAATA---TCCCAAAAT----AAATT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--TTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TAAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAGCCct
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttggAA-------A-ACAC-------CCGT---TTAACAGTG--TGTTTTTTTTA---T---GG--AAGCTT-GCA-A-CA-CTAATAG-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATG-ACAATAGCCT-AG--C-----TACATAT--ATA-ATTT-----TGTTG-AAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         G-AT-----AA-----TTTTA-TGAAAC---AACAGTGAT-AACATTATGA--TTGGTCATAA-GATT--AT-C-GTAAGAT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ggtG-AT-----AA-----TTTTA-TGAAAC---AACAGTGAT-AATATTATGA--TT-GTCATAA-GATT--AT-C-GTAAGATctgtttgattacattagaggaaaccctgccct
gi|23                         :                          tGTTG-AAAAA---CACA--AGCAATTGACGTTTAA--AAAT--G---CAT-------TA-----AA--TAT---A-A----------AATAA-------T-CTTTCCTATAAGCAA-AT--------------------TATT--GACA-TT-AA---TA-G--Tctgtttgattacattagagaaaccctgcc
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TCAGAT-C-ATAAGA------------T-CTGTTTT-CTGAGAAACCTTAAACTAGGTC---------GGTG-AAAt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG---------GG-----------GGGCA---TCC-----ATAAA--TAT-----ATGT--C-----TACT-A---ACCAGCAGGAGA------AAGT--T
gi|3                          :                    atacatAGTTG-GAAAC---CACA--GGCACTAGGCGTTTAG--AAAT--A---CAT--GCATGTA-----CA--TTT---A-A----------AAAAA-A-ATA-T-CTTTCAT-TAAAGAA-AG--------------------TATT--GACA-AC-AA---TA-G--TT------TATTTAACA------------G-GAA------------------GA-----------------TAT-GTTT-AAAACG-T-A-AACTAAGTG-C-CATT-GTCGGAAAC-----CACTGA-ATTTT--GCTTCGGAA-ACAGTA-TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG---------GG--C-C-AACTTCTCCTT--CCA-----ATAAAGTTAT-----TTAT--C-----T-TTGG---ACCA----GTGA------AAAT--TGT--A-CC-A-CGTTTTAT--G--TTTA--C--GT-TCCTG-GCTAT---TTCCAAA--ACCTTGT-AA---A-C--TCT-------CA--AACTTTTC--G-CT-AGG-TA--CATGTAAC-ATGCAA----GA----A-----C-AT--------------------TT-------------A----CA-CAGCGC------GTACAG-TAA-------A-ACAC-------CCGT---TTAACAGGGTTTGTTTTTTTTA---T---GG--AAGCTT-GCA-A-CA-----------------A---TAACT-T-TTATG-ACAACAGCCT-AG--C-----TACATAT--ATA-ATTT-----TGTTG-AAACAGAAAAGAAA-AA---A-TATTTAG--GGATATCC-----G-TATCC---TTGGAC----------GTATATAAC-ATTTCAT--AT----------CCTT-T--TA----------TTAACTCCTGAAA--CTAAG-TTTTCT-CAA----TTTAGC-A--TTTGCTACAATA---TCCCAGAAT----AAAAT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--TTGAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAGCC
gi|4                          :                                                                             --GCAT-TG-----CA--TTTT--A-A----------AAAAATA-ATA-TGCTTCCAT-TAAAGAA-AC--------------------TAATAGGACA-AC-AA---AA-AAATC------TATT-GACACCCATGTTTTT-G-CAG------------------GA-----------------TATTGTTT-AAAAAG-T-ATA-CTA-GT--C-CTAT-GTTCGAA-------CACTGA-ATTTT--GCTTCGAAAGACA-TA-TTT-------ATTT---------GGGGGGGGG---------GGGTT-C-AACTT-GT--A--TCA-----A---AGCTAT-----TTAT--C-----T-CTG----ACCA-----AGA------AA----TAT--A-TA-T-CGTTG-AT--G--T-GA--A--GT-C---A-GCTAT---T-CCAAA--AC-TTGT-AG---AAC--TC------------AACTGTTC--GGCT-AG--TA--CATTAAAC-ATGTATTTT-GA----A-----C-AT--------------------TT-------------A----C--CTGCGGTCAGATGT-CAGGTAA-------T-ACAC-------C-GT---T-ACCAGG-----TTTTTTTTA-------AG--AAGCT--GCATA-CA-TTAATAGATTATTA-TAT--CAA---T-ATATG-ACACGAGC---AG--------TACATAT--ATAGATTT-----TGT-G-AAACAGAAGAGAAC-AA---A-TATTTAG--GGAAATCT-----G-TATCC---TTGG-------------------AC-ACTT-ATTGAT----------CCTT-T--T---------------------------TGAT-TCTTCTACAT----TCTAGCTAGTTTTGCTACAATA---TATCAAGATAAAAAAAAT-GTATAAGTAC---ATTTATCTATGTAAGATTTA-C-T--AAA--TTTT-TAT----AACTTTTAAGTAT-----A------TTTGG-TG-TACTCTAGCA-TGGC-AATCTTATGA--TT--TCACAA---TTAGAT-CTTTAAGATATATCATAAG-T--TGTCTCGAAGAT-AATCATAAGTCTGTCTTACGACAAATGTG-AAACCCAGTC
gi|5                          :                                                                                                                                         ggaGAA-AC--------------------TATT--GACG-AC-AACATTA-G--TT------TATTTACC---------------GAA------------------GAAT---------------TAT-ATT---AGATA-T-G-------GTG-C-CTATCG--GGAAAC-----CACTGA-ATCTT--GCTTCGGAA-A-AGTAATTT-------TTTTCGGGGGTGGGGGGGGGGG---------GG--T-T-ATCTTCGTCAG--TCA-----ATAA-GCTAT-----TTATT-C-----T-CTGG---ACCA----GAGA------AA-T--TAT--A-CAAC-CGTTT-AT--A--TTGA--A--GT-TCCTA-GCTAT---TTCCAAA---CCTTGT-AG---A-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CT-AGG-TA--CATGTAAC-ATGCAA----GA----A-----C-AT--------------------TT-------------AATTACA-CAGCGA------GTACAG-TAA-------A-GCGC-------CCGT---TTAACAGGG--T-TTTTTTTAA---T---GG--AAGCTT-GCA-A-CA-TTAATAG-TT-TTA-TA---CCACT-T-TTATG-ACAACAGCCT-AG--C-----TGCATATT-ATA-ATTT-----TGTTG-AA-CAGAAGAGAAA-AA---A-TATTTAG--GGATATCC-----G-TATCC---TTGGACT-AC-T---AGTATATAAC-ATTTCAT--AT----------CCTT-T--TGATCCTTTTT-TTAACTCCTGAAA--CTGAG-TTTTCT-CAA----TTTAGT-A--TTTGCTACAATA---TCCCAGAAT----AAAAT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGATTTTTT-TAT----AAC--TT-AG-AT-----AG-----TTTTGTTGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-GTTTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CT-TCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTGAAAACCCAG
gi|6                          :                                                          TTAGCTAAATGGA---CATTGGCAT------------TTT---A-A----------AAAAATA-AT-----TTCCAT-TAAAGAATAA--------------------TAG---GACA-AC-AA---TA-AA-TC------TATT-GACACCCATTGTATTTG-CAG------------------GA-----------------TAT-GTTT-AACA-G-T-A-A-CTATGT--C-CTAT-GTCG-AAAC-----ACCTGA-ATTT---G-TTCG-AA-ACATGA-TTT-------AGGC---------GGAGGGGGGT--------GG--TTC-AACTTCGTCA---TCA-----ATAAGCTTAT-----TTAT--C-----T-T--G---ACCA-----AGA---------T----T--A-CA-C-C-TATTATC-G--TTGAGTA--AT---CTA-GCTAT---T--CAAA----CTTGT-AGCCAA-C--TC------------AACTGTTCGTG-CT-ATG-TAACCA--TAAC-ATGTAT----GA----A-------AT--------------------T----------------------CTGCGA------GT-CAGATGATTCAGGTA-ATAC-------AAGT------ACAG-----GTTTTTTTTC---A---AG--AAGTC------A-TA-CTATCAG-TTATTA-TA---CCACTAT-ATATGAACA-CAGCTA-AGTAC-----CATATAT--ATG-ATTT-----TGT---GAACAGAAGAGAAACAA---A-TATTTAG--GGA-ATCG-----A-T---C---TTGGATC-A--T-----TAT-TGA----TCCAT--G-------------TT-TGATC----------TTATCTACTTCAG--CT-AG-TTTT--------------GC-A-------CATAATA---------AATAA--AAAAT-GTATAAG-ATAACATTTATT---ATAAGATTTA-C-TTAATA--TTTTATAT----AAT--TT-----T-----AA-----ATTTGTTGATACCT-AGCTATGGC-AATCTTATGAAGTT--TCACAAGG-TTAGATCC-TTTAGATA-AT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       caggttcagaaacagtcattaT--A-CA-C-CGTTTCAT--A--TTGA--A--GT-TCTTA-----T---TTCCAAA--ACCTTGT-AG---A-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CT-AGG-TA--CATGTAAC-ATGTAATCTTGA----A-----C-AT--------------------TT-------------A----CA---GCGA------GTGCAG-TAA-------A-ACGC-------CCGT---TTAACAGGG---GTTTTTTTAAA--T---AG--AAGCTT-GCA-A-CA-TTAATAG-TT-TTA-TA---AAACT-T-TTATG-ACACCAGCCT-AG--C-----TACATAT--ATA-ATTT-----TGTTG-AAACA-AAGAGAAA-AA---AATATTTAG--GGATATCC-----A-TATCC---TTGGACT-AA-T---AATATGTAAC-ATTTCAT--AT----------CCTT-T--TGATCCTTTTTTTTAACTCCTGAAA--C--AG-TTTTCT-TAA----TTTAG---------------TA---TCCCAGAAT----AAAAT-GG-TAAGCATA-------TC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--CTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGGAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAG
gi|8                          :                          AGTTG-GAAAC---CATATAGGCACTTAGCGTT-AG--AAAT--A---CAT--GCATATAGCCTACA--TCT---G-AT---------AAAAA-ATATA-T-CTTCCAC-TAAAGAA-AAC-------------------TATT--GAC---C-AA---CA-G--TCAGCATGTATT--ACG------------A-GAA------------------GAATGCATTGAATTTAGAGTAT-GTTTTAAAACG-T------CAAATG-C-CTGT-GTCGTAAAA-----CACTGA-AATTT--GCTTCAAAA-ACAGTG-CAT-------TTGA---------GGGGGAGGG---------GG---------------AG--TCA-----A--------------------C-----T-CTGA---ACCA----GAGA------AAAT--TGT--A-CA-T-CGTTTCAT--G--TTGA--A--GT-TCCTA-GTTAT---TTCCAAA--ACCTTGT-TG---T-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CC-AGG-TA--CATGTAAC-ATGCAC----AA----A-----C-ATTATACATGTATAATATTTAATT-------------A----CA-CAGTGA------ATACAG-TAA-------A-ACAC-------GCGT---GTAACAGG-------TTTTTTA---T---GG--AAGCTT-GAA-A-CA-TTAATAG-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATG-GCATCAGTCT-AA--C-----TACATAT--ATA-ATCT-----AGGTG-AAATAGAAG
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Reference ( family-839 )      :                          AGTTG-GAAAC---CACA--GGCACTTGGCGTTTAG--AAAT--A---CAT--GCATGTA-----CA--TTT---A-A----------AAAAA-A-ATA-T-CTTCCAT-TAAAGAA-AN--------------------TATT--GACA-AC-AA---TA-G--TC------TATTTGACA------------G-GAA------------------GA-----------------TAT-GTTT-AAAACG-T-A-A-CTAAGTG-C-CTGT-GTCGGAAAC-----CACTGA-ATTTT--GCTTCGGAA-ACAGTA-TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG---------GG--T-C-AACTTCGT---CA--GTC-AATAAAGCTAT-----TTAT--C-----T-CTGG---ACCA----GAGA------AANT--TGT--A-CA-C-CGTTTCAT--G--TTGA--A--GT-TCCTA-GCTAT---TTCCAAA--ACCTTGT-AG---A-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CT-AGGT-A--CATGTAACA-TGCAN----GA-----A-----C-AT--------------------TT-------------A----CAC-AGCGA------GTACAG-TAA-------A-ACACCC-------GT---TTAACAGGG--TGTTTTTTTTA---T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CATTA-ATAG-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATG-ACAGCAGCCTA-G--CT-----ACATAT--ATA-ATTTT-----GTTG-AAACAGAAGAGAAA-AA---A-TATTTAG--GGATATCC-----G-TATCC---TTGGACT-A--T---AGTATATAAC-ACTTCAT--AT----------CCTT-T--TN----------TTAACTCCTGAAA--CTGAG-TTTTCT-CAA----TTTAGC-A--TTTGCTACAATA---TCCCAGAAT----AAAAT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--TTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAGCC
gi|1                          :                            TTGAGAAACGGTCACA--GGCACTTAGCGTTTAG--ATAT--ATTACAT--GCATGTG-----CAACTTC---A-ATACTCTGGCCAAGAA-A-ATA-T-CTCCCAT-TAAAAAA-AAACCCTAA-------------TATCCGGACACACGAA---TACG--TA------TTTTTACCA------------GAGAAAAATATTAAATTA-----GA-----------------TAT-GCTA-AAACCGCT-C-A-C--AGTG-AACTGT-GTCGGAAACAATTTTACTGACATTTTTTGCTTTTGGA-ACAGTA-CAT-------TT-----------GGGGGGGGGCTGCGGGCCGG--T-CCAAATCAGTATTCA--GTTTGATATTGTCGC-----TCAT--CATGCGT-CTGGTATACCA----GCAACGATATAATTCTTGTCGA-CA-CTCTTCTCAA--GCTTTGA--ACGGTATCCTACGCTCTGCTCTCCCCA--ACCTTGTCAG---A-CCATCT-------CA--AACTGTTA--G-CT-AGGTTA--CATGGAACAATGTAA----AACCCCAAT----C-AT--------------------TT-------------AAT--TACCAGTGA------GTACGG-TAA-------ATACACCTACCAGCTGT---TTGACAGGT--TATTTTTTACAACCT---GGTCAAGTTT-GGCA-A-CATTTTACCG-AT-TTA-TAAACTAACT-T-ATATG-ACAGCTACCTAAG--CTCAATTATATATTGACA-GTTTTTTTGTGTCG-AAACAGAAGAGAAA-CA---A-AATTGAGGCGAATACACTCAAAGTTATTTTAGTTGGGCT----TCTCAGT---------CTTCTT--CT----------TCTTAC--TC----------TTA--CCCTGAAACCCTGAGTTTTTCT-CAATCCCTCTAGC-A--TTTACTACAACATACTCCCCACAT----AAAATGGT-TAAG
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttggcagtTAAC-ACTTTG---AT----------CCTT-T---C----------TAAATCCCCGAAA--CTACA-TTATCT-CAG----TTTAGC-A--TTTATTACGATT---GACCAGAAT----GAATT-GT-TAAGGATGAAACTTATC---GTAAGATTTGTC-ATAAGA--TTTT-TATACAGAAC--TAAAT-ATATCTAAGGGCATTTTTG-TGAAGC---ACCAGTGACAAATCTTATGA--GT-GTCATAA-G-CCAGAT-C-TTA--ATA------AAG-TCCTGTCGT-ATGACGAATTCTAAGATACTTT---------TGTG-AAACACAGCCtcctctccaataagtcaggtctttcgaagattatcattaagtccttgtgtttaccgacacttgtgaaa
gi|11                         : tactggtacatttttgcgttccaggAGTTG-GAAAC---CACA--GGCACTTGGCGTTTAG--AAAT--A---CAT--GCAT--------CA--TTT---TTA----------AAAAA-A-ATAAT-CTTCCAT-TAAAGAA-ACTATAGACAACAGTAGTAAACTATT--GACA-CC-AA---TA-G--TT------TATTTG-CA------------G-CA--------------------------------------TAT-GTTT-AAAACG-TAA-A-CTAAGTG-T-CTAT-GTCGGAAAC-----CACTGA-ATTTT--GCTTTGGAA-ACAGTA---A-------TTGG---------GGGGGGGGG---------GG--TCC-AGCTTCGT---CA--GTC-AATAAAGCTAT-----TTAT--C-----T-CTGG---ACCA----GAGA------AAAT--TAT--A-CA-C-CGT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ctggAAA-AACGGA-CATTTAC--GGATATC-------------------------------AGTATAAAGC-AATTTAT--AT----------CAT------A----------TTGA-TCCCGAAA--CTGGG-ATTTCA-AAA----TTTACA-A--TTTGTTATTATA---TCCAAGAAT----AAAAA-GT-CAAGCATGCCACTTATC---GTAATATTTGTT-TT--------CT-TAT----ATC--TCAAG-AT-----AT-----TTCTG-TGAAAC---AACAGTGGC-GATCTTGTGA--TT-GTCATAG-G-TCAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAGAT-CTGTTTT-CTGAGAAACCTTAAAATAGACT---------TGT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taaacTTGT-AG---A-AAATCT-------TA--AAATTTCT--G-AT-A----A--CAT-TAAC--TGTGT----TG-----A-----C-A------------------------------------A----TAT-AGCGG------ATGGAG-TCG-------A-ACACCC-------AT---TCAACA-------TCTTTTTTA---T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CATTT-ATAT-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATG-ACAGCAGCCTA-C--GT-----ACA----------------------G-AAACAGAAGA-AAA-AT---A-TATTTAG--GGATATCT-------------------AC-----T---AGTATATAAC-AAATCAT--GT----------TCTT-T--T
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG---------GG--T---AACTGCAT---CC--ATC-AATAAGG------------T--C-----T-CTGA---ACCA----GAGA------AATT--AGT--T-CA-C-CGTTTCAT--G--TTGA--A--GT-TACTA-ACTAT---TTTCAAAACACCTTGC-AG---A-C--TCT-------GG--AACATTTC--G-TT-AGAT-A--CGTGTAACG-TCTAA----CA-----AAATTTC-AT--------------------TTAACTCCGTTGACAA----TAC-AGCAA------GTTCAG-CAG-------A-ACACTC-------GT---ATAga
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AC-----GACTGA-ATATT--GCCTCGAAA-ATAATA-TTTGTTGTCTTTTT-------------------------------T-C-AACTTCCT---CC--GTT-AATAA--CT-------CTAT--C-----T-CTGA---TGCA----GAGA------AATT--TGG--A-CT-T-CGTTTCAC--------------GT-TCCTC-GCCAT---TTCCAAC--ACCGTCT-CG---A-C--TCTTTAAATACG--AAATGTTC--A-CT-AGAT-A--T---------TGCGA----GA-----A-----C-AT--------------------TT-------------A----
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -ATTTT-----GTTTTAAACAGAATAGAAA-TG---A-TATTCAG--GGACATTA-----A-TACTC---TTGGACTTC--T---AGTATATA-------CAT-----------------------T----------TTAAC--ATGAAA--TTAAG-TCATCT-CAA----TTTAGC-A--TTTATTACAATA---TCCCAGAAT-----AGAT-TT-CAAA-ATGCAA-TTATC---ATCAAATATA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTTA---TAATGG--AAGTTTTG-CA-AACATTC-ATAT-TT-TTA-TA---CAAGT-TAACATA-CCTGCAGCTCA-G--CT-----ACATA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            taaaggacattttgaaatactaattttaaattaatatgaccaataaggtcgcaacattTTT-TAT----AAC--TTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGT--TT-GTCACAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCGTAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    G-----TTTTG-TGAAAC---AACAGTGGC-AATCTTATGG--TT-GCCGTAA-G-TCAAAC-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-GCGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-GAACCCAGCC
gi|2                          :                          AGTTG-GAAAC---CATA--GGCACTTGGCGTTTAG--AAAT--A---CAT--GCATGTAGACTACA--TTTGATA-A----------AAAAA-A-TTA-T-CTTCCTT-TAAAGAA-AG--------------------TATT-----A-AC-AG---T-----TA------TATTT-ACA------------G-GAAAATTACAATTACAATATAGA-----------------TAT-GCTT-TAAAT--T-----CTAAGTGGC-CTGT-GTCGTAA-C-----CACTGA-ATT----GCTTCG--A-ACAGGA-CGA-------TTT------------GGGGGGA---------GG--T-C-AACTTCGT---CATAGTC-A-TAAA-CTATACAATCTATTCC-----T-CTG----ACCT----CAAA------AATT--AGT--AACT-C-GGTCTTGTCAA--TGGG--A--GTATCCTATGCTAT---TATCAAA--ACTCTTT-AG-----C--TCT-------CACAAACT-TTC--G-CCCAGGT-A--CA---GACA-TGCAC----AA-----A-----TTAA--------------------TT-------------A----CAT-AGTGA------ATACAG-TAA-------A-ACATGC-------GTGTATTAACA-----TGTTTTTTATA---T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CATTA-ATAG-TT-TTAATA---CAACT-T-TTATG-ACAGCAGTGTA-G--CT-----ACATAT--ATA-ATTTA-----GTTG-AAACAGAAGAAAAA-AA---A-TATTTAG--AGATATCA-----G-TATCC---TTGGACT-AC-T---AGTATACAAC-ACTTCAT--ATTCTTTTGAT-CCTT-T--TT----------TTAATTCCTGAAA--CTGAG-TTTTTTTCGA----TTTAGA-A--TTTACTACAATA---TCCCAAAAT----AAATT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--TTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TAAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAGCCct
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttggAA-------A-ACACCC-------GT---TTAACAGTG--TGTTTTTTTTA---T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CACTA-ATAG-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATG-ACAATAGCCTA-G--CT-----ACATAT--ATA-ATTTT-----GTTG-AAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          G-AT-----AA-----TTTTA-TGAAAC---AACAGTGAT-AACATTATGA--TTGGTCATAA-GATT--AT-C-GTAAGAT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ggtG-AT-----AA-----TTTTA-TGAAAC---AACAGTGAT-AATATTATGA--TT-GTCATAA-GATT--AT-C-GTAAGATctgtttgattacattagaggaaaccctgccct
gi|23                         :                          tGTTG-AAAAA---CACA--AGCAATTGACGTTTAA--AAAT--G---CAT-------TA-----AA--TAT---A-A----------AATAA-------T-CTTTCCTATAAGCAA-AT--------------------TATT--GACA-TT-AA---TA-G--Tctgtttgattacattagagaaaccctgcc
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TCAGAT-C-ATAAGA------------T-CTGTTTT-CTGAGAAACCTTAAACTAGGTC---------GGTG-AAAt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG---------GG-----------GGG---CA---TC-CATAAA--TAT-----ATGT--C-----TACT-A---ACCAGCAGGAGA------AAGT--T
gi|3                          :                    atacatAGTTG-GAAAC---CACA--GGCACTAGGCGTTTAG--AAAT--A---CAT--GCATGTA-----CA--TTT---A-A----------AAAAA-A-ATA-T-CTTTCAT-TAAAGAA-AG--------------------TATT--GACA-AC-AA---TA-G--TT------TATTTAACA------------G-GAA------------------GA-----------------TAT-GTTT-AAAACG-T-A-AACTAAGTG-C-CATT-GTCGGAAAC-----CACTGA-ATTTT--GCTTCGGAA-ACAGTA-TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG---------GG--C-C-AACTTCTC---CT--TCC-AATAAAGTTAT-----TTAT--C-----T-TTGG---ACCA----GTGA------AAAT--TGT--A-CC-A-CGTTTTAT--G--TTTA--C--GT-TCCTG-GCTAT---TTCCAAA--ACCTTGT-AA---A-C--TCT-------CA--AACTTTTC--G-CT-AGGT-A--CATGTAACA-TGCAA----GA-----A-----C-AT--------------------TT-------------A----CAC-AGCGC------GTACAG-TAA-------A-ACACCC-------GT---TTAACAGGGTTTGTTTTTTTTA---T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CA-----------------A---TAACT-T-TTATG-ACAACAGCCTA-G--CT-----ACATAT--ATA-ATTTT-----GTTG-AAACAGAAAAGAAA-AA---A-TATTTAG--GGATATCC-----G-TATCC---TTGGAC----------GTATATAAC-ATTTCAT--AT----------CCTT-T--TA----------TTAACTCCTGAAA--CTAAG-TTTTCT-CAA----TTTAGC-A--TTTGCTACAATA---TCCCAGAAT----AAAAT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--TTGAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAGCC
gi|4                          :                                                                             --GCAT-TG-----CA--TTTT--A-A----------AAAAATA-ATA-TGCTTCCAT-TAAAGAA-AC--------------------TAATAGGACA-AC-AA---AA-AAATC------TATT-GACACCCATGTTTTT-G-CAG------------------GA-----------------TATTGTTT-AAAAAG-T-ATA-CTA-GT--C-CTAT-GTTCGAA-------CACTGA-ATTTT--GCTTCGAAAGACA-TA-TTT-------ATTT---------GGGGGGGGG---------GGGTT-C-AACTT-GT-------ATC-AA---AGCTAT-----TTAT--C-----T-CTG----ACCA-----AGA------AA----TAT--A-TA-T-CGTTG-AT--G--T-GA--A--GT-C---A-GCTAT---T-CCAAA--AC-TTGT-AG---AAC--TC------------AACTGTTC--GGCT-AG-T-A--CATTAAACA-TGTATTTT-GA-----A-----C-AT--------------------TT-------------A----C-C-TGCGGTCAGATGT-CAGGTAA-------T-ACACC--------GT---T-ACCAGG-----TTTTTTTTA-------AG--AAGCT--G-CATA-CATTA-ATAGATTATTA-TAT--CAA---T-ATATG-ACACGAGC--A-G---T-----ACATAT--ATAGATTTT-----GT-G-AAACAGAAGAGAAC-AA---A-TATTTAG--GGAAATCT-----G-TATCC---TTGG-------------------AC-ACTT-ATTGAT----------CCTT-T--T---------------------------TGAT-TCTTCTACAT----TCTAGCTAGTTTTGCTACAATA---TATCAAGATAAAAAAAAT-GTATAAGTAC---ATTTATCTATGTAAGATTTA-C-T--AAA--TTTT-TAT----AACTTTTAAGTAT-----A------TTTGG-TG-TACTCTAGCA-TGGC-AATCTTATGA--TT--TCACAA---TTAGAT-CTTTAAGATATATCATAAG-T--TGTCTCGAAGAT-AATCATAAGTCTGTCTTACGACAAATGTG-AAACCCAGTC
gi|5                          :                                                                                                                                         ggaGAA-AC--------------------TATT--GACG-AC-AACATTA-G--TT------TATTTACC---------------GAA------------------GAAT---------------TAT-ATT---AGATA-T-G-------GTG-C-CTATCG--GGAAAC-----CACTGA-ATCTT--GCTTCGGAA-A-AGTAATTT-------TTTTCGGGGGTGGGGGGGGGGG---------GG--T-T-ATCTTCGT---CA--GTC-AATAA-GCTAT-----TTATT-C-----T-CTGG---ACCA----GAGA------AA-T--TAT--A-CAAC-CGTTT-AT--A--TTGA--A--GT-TCCTA-GCTAT---TTCCAAA---CCTTGT-AG---A-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CT-AGGT-A--CATGTAACA-TGCAA----GA-----A-----C-AT--------------------TT-------------AATTACAC-AGCGA------GTACAG-TAA-------A-GCGCCC-------GT---TTAACAGGG--T-TTTTTTTAA---T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CATTA-ATAG-TT-TTA-TA---CCACT-T-TTATG-ACAACAGCCTA-G--CT-----GCATATT-ATA-ATTTT-----GTTG-AA-CAGAAGAGAAA-AA---A-TATTTAG--GGATATCC-----G-TATCC---TTGGACT-AC-T---AGTATATAAC-ATTTCAT--AT----------CCTT-T--TGATCCTTTTT-TTAACTCCTGAAA--CTGAG-TTTTCT-CAA----TTTAGT-A--TTTGCTACAATA---TCCCAGAAT----AAAAT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGATTTTTT-TAT----AAC--TT-AG-AT-----AG-----TTTTGTTGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-GTTTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CT-TCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTGAAAACCCAG
gi|6                          :                                                          TTAGCTAAATGGA---CATTGGCAT------------TTT---A-A----------AAAAATA-AT-----TTCCAT-TAAAGAATAA--------------------TAG---GACA-AC-AA---TA-AA-TC------TATT-GACACCCATTGTATTTG-CAG------------------GA-----------------TAT-GTTT-AACA-G-T-A-A-CTATGT--C-CTAT-GTCG-AAAC-----ACCTGA-ATTT---G-TTCG-AA-ACATGA-TTT-------AGGC---------GGAGGGGGGT--------GG--TTC-AACTTCGT---CA---TC-AATAAGCTTAT-----TTAT--C-----T-T--G---ACCA-----AGA---------T----T--A-CA-C-C-TATTATC-G--TTGAGTA--AT---CTA-GCTAT---T--CAAA----CTTGT-AGCCAA-C--TC------------AACTGTTCGTG-CT-ATGT-AACCA--TAACA-TGTAT----GA-----A-------AT--------------------T---------------------C-TGCGA------GT-CAGATGATTCAGGTA-ATACAA-------GT------ACAG-----GTTTTTTTTC---A---AG--AAGTC-------A-TACTA-TCAG-TTATTA-TA---CCACTAT-ATATGAACA-CAGCTAA-GTACC-----ATATAT--ATG-ATTTT-----GT---GAACAGAAGAGAAACAA---A-TATTTAG--GGA-ATCG-----A-T---C---TTGGATC-A--T-----TAT-TGA----TCCAT--G-------------TT-TGATC----------TTATCTACTTCAG--CT-AG-TTTT--------------GC-A-------CATAATA---------AATAA--AAAAT-GTATAAG-ATAACATTTATT---ATAAGATTTA-C-TTAATA--TTTTATAT----AAT--TT-----T-----AA-----ATTTGTTGATACCT-AGCTATGGC-AATCTTATGAAGTT--TCACAAGG-TTAGATCC-TTTAGATA-AT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      caggttcagaaacagtcattaT--A-CA-C-CGTTTCAT--A--TTGA--A--GT-TCTTA-----T---TTCCAAA--ACCTTGT-AG---A-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CT-AGGT-A--CATGTAACA-TGTAATCTTGA-----A-----C-AT--------------------TT-------------A----CA---GCGA------GTGCAG-TAA-------A-ACGCCC-------GT---TTAACAGGG---GTTTTTTTAAA--T---AG--AAGCTT-G-CA-A-CATTA-ATAG-TT-TTA-TA---AAACT-T-TTATG-ACACCAGCCTA-G--CT-----ACATAT--ATA-ATTTT-----GTTG-AAACA-AAGAGAAA-AA---AATATTTAG--GGATATCC-----A-TATCC---TTGGACT-AA-T---AATATGTAAC-ATTTCAT--AT----------CCTT-T--TGATCCTTTTTTTTAACTCCTGAAA--C--AG-TTTTCT-TAA----TTTAG---------------TA---TCCCAGAAT----AAAAT-GG-TAAGCATA-------TC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--CTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGGAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAG
gi|8                          :                          AGTTG-GAAAC---CATATAGGCACTTAGCGTT-AG--AAAT--A---CAT--GCATATAGCCTACA--TCT---G-AT---------AAAAA-ATATA-T-CTTCCAC-TAAAGAA-AAC-------------------TATT--GAC---C-AA---CA-G--TCAGCATGTATT--ACG------------A-GAA------------------GAATGCATTGAATTTAGAGTAT-GTTTTAAAACG-T------CAAATG-C-CTGT-GTCGTAAAA-----CACTGA-AATTT--GCTTCAAAA-ACAGTG-CAT-------TTGA---------GGGGGAGGG---------GG------------------A--GTC-AA--------------------C-----T-CTGA---ACCA----GAGA------AAAT--TGT--A-CA-T-CGTTTCAT--G--TTGA--A--GT-TCCTA-GTTAT---TTCCAAA--ACCTTGT-TG---T-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CC-AGGT-A--CATGTAACA-TGCAC----AA-----A-----C-ATTATACATGTATAATATTTAATT-------------A----CAC-AGTGA------ATACAG-TAA-------A-ACACGC-------GT---GTAACAGG-------TTTTTTA---T---GG--AAGCTT-G-AA-A-CATTA-ATAG-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATG-GCATCAGTCTA-A--CT-----ACATAT--ATA-ATCTA-----GGTG-AAATAGAAG
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Reference ( family-839 )      :                          AGTTG-GAAAC---CACA--GGCACTTGGCGTTTAG--AAAT--A---CAT--GCATGTA-----CA--TTT---A-A----------AAAAA-A-ATA-T-CTTCCAT-TAAAGAA-AN--------------------TATT--GACA-AC-AA---TA-G--TC------TATTTGACA------------G-GAA------------------GA-----------------TAT-GTTT-AAAACG-T-A-A-CTAAGTG-C-CTGT-GTCGGAAAC-----CACTGA-ATTTT--GCTTCGGAA-ACAGTA-TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG---------GG--T-C-AACTTCGT---CA--GTC-AATAAAGCTAT-----TTAT--C-----T-CTGG---ACCA----GAGA------AANT--TGT--A-CA-C-CGTTTCAT--G--TTGA--A--GT-TCCTA-GCTAT---TTCCAAA--ACCTTGT-AG---A-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CT-AGGT-A--CATGTAACA-TGCAN----GA-----A-----C-AT--------------------TT-------------A----CAC-AGCGA------GTACAG-TAA-------A-ACACCC-------GT---TTAACAGGG--TGTTTTTTTTA---T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CATTA-ATAG-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATG-ACAGCAGCCTA-G--CT-----ACATAT--ATA-ATTTT-----GTTG-AAACAGAAGAGAAA-AA---A-TATTTAG--GGATATCC-----G-TATCC---TTGGACT-A--T---AGTATATAAC-ACTTCAT--AT----------CCTT-T--TN----------TTAACTCCTGAAA--CTGAG-TTTTCT-CAA----TTTAGC-A--TTTGCTACAATA---TCCCAGAAT----AAAAT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--TTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAGCC
gi|1                          :                            TTGAGAAACGGTCACA--GGCACTTAGCGTTTAG--ATAT--ATTACAT--GCATGTG-----CAACTTC---A-ATACTCTGGCCAAGAA-A-ATA-T-CTCCCAT-TAAAAAA-AAACCCTAA-------------TATCCGGACACACGAA---TACG--TA------TTTTTACCA------------GAGAAAAATATTAAATTA-----GA-----------------TAT-GCTA-AAACCGCT-C-A-C--AGTG-AACTGT-GTCGGAAACAATTTTACTGACATTTTTTGCTTTTGGA-ACAGTA-CAT-------TT-----------GGGGGGGGGCTGCGGGCCGG--T-CCAAATCAGTATTCA--GTTTGATATTGTCGC-----TCAT--CATGCGT-CTGGTATACCA----GCAACGATATAATTCTTGTCGA-CA-CTCTTCTCAA--GCTTTGA--ACGGTATCCTACGCTCTGCTCTCCCCA--ACCTTGTCAG---A-CCATCT-------CA--AACTGTTA--G-CT-AGGTTA--CATGGAACAATGTAA----AACCCCAAT----C-AT--------------------TT-------------AAT--TACCAGTGA------GTACGG-TAA-------ATACACCTACCAGCTGT---TTGACAGGT--TATTTTTTACAACCT---GGTCAAGTTT-GGCA-A-CATTTTACCG-AT-TTA-TAAACTAACT-T-ATATG-ACAGCTACCTAAG--CTCAATTATATATTGACA-GTTTTTTTGTGTCG-AAACAGAAGAGAAA-CA---A-AATTGAGGCGAATACACTCAAAGTTATTTTAGTTGGGCT----TCTCAGT---------CTTCTT--CT----------TCTTAC--TC----------TTA--CCCTGAAACCCTGAGTTTTTCT-CAATCCCTCTAGC-A--TTTACTACAACATACTCCCCACAT----AAAATGGT-TAAG
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ttggcagtTAAC-ACTTTG---AT----------CCTT-T---C----------TAAATCCCCGAAA--CTACA-TTATCT-CAG----TTTAGC-A--TTTATTACGATT---GACCAGAAT----GAATT-GT-TAAGGATGAAACTTATC---GTAAGATTTGTC-ATAAGA--TTTT-TATACAGAAC--TAAAT-ATATCTAAGGGCATTTTTG-TGAAGC---ACCAGTGACAAATCTTATGA--GT-GTCATAA-G-CCAGAT-C-TTA--ATA------AAG-TCCTGTCGT-ATGACGAATTCTAAGATACTTT---------TGTG-AAACACAGCCtcctctccaataagtcaggtctttcgaagattatcattaagtccttgtgtttaccgacacttgtgaaa
gi|11                         : tactggtacatttttgcgttccaggAGTTG-GAAAC---CACA--GGCACTTGGCGTTTAG--AAAT--A---CAT--GCAT--------CA--TTT---TTA----------AAAAA-A-ATAAT-CTTCCAT-TAAAGAA-ACTATAGACAACAGTAGTAAACTATT--GACA-CC-AA---TA-G--TT------TATTTG-CA------------G-CA--------------------------------------TAT-GTTT-AAAACG-TAA-A-CTAAGTG-T-CTAT-GTCGGAAAC-----CACTGA-ATTTT--GCTTTGGAA-ACAGTA---A-------TTGG---------GGGGGGGGG---------GG--TCC-AGCTTCGT---CA--GTC-AATAAAGCTAT-----TTAT--C-----T-CTGG---ACCA----GAGA------AAAT--TAT--A-CA-C-CGT
gi|12                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ctggAAA-AACGGA-CATTTAC--GGATATC-------------------------------AGTATAAAGC-AATTTAT--AT----------CAT------A----------TTGA-TCCCGAAA--CTGGG-ATTTCA-AAA----TTTACA-A--TTTGTTATTATA---TCCAAGAAT----AAAAA-GT-CAAGCATGCCACTTATC---GTAATATTTGTT-TT--------CT-TAT----ATC--TCAAG-AT-----AT-----TTCTG-TGAAAC---AACAGTGGC-GATCTTGTGA--TT-GTCATAG-G-TCAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAGAT-CTGTTTT-CTGAGAAACCTTAAAATAGACT---------TGT
gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   taaacTTGT-AG---A-AAATCT-------TA--AAATTTCT--G-AT-A----A--CAT-TAAC--TGTGT----TG-----A-----C-A------------------------------------A----TAT-AGCGG------ATGGAG-TCG-------A-ACACCC-------AT---TCAACA-------TCTTTTTTA---T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CATTT-ATAT-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATG-ACAGCAGCCTA-C--GT-----ACA----------------------G-AAACAGAAGA-AAA-AT---A-TATTTAG--GGATATCT-------------------AC-----T---AGTATATAAC-AAATCAT--GT----------TCTT-T--T
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG---------GG--T---AACTGCAT---CC--ATC-AATAAGG------------T--C-----T-CTGA---ACCA----GAGA------AATT--AGT--T-CA-C-CGTTTCAT--G--TTGA--A--GT-TACTA-ACTAT---TTTCAAAACACCTTGC-AG---A-C--TCT-------GG--AACATTTC--G-TT-AGAT-A--CGTGTAACG-TCTAA----CA-----AAATTTC-AT--------------------TTAACTCCGTTGACAA----TAC-AGCAA------GTTCAG-CAG-------A-ACACTC-------GT---ATAga
gi|15                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AC-----GACTGA-ATATT--GCCTCGAAA-ATAATA-TTTGTTGTCTTTTT-------------------------------T-C-AACTTCCT---CC--GTT-AATAA--CT-------CTAT--C-----T-CTGA---TGCA----GAGA------AATT--TGG--A-CT-T-CGTTTCAC--------------GT-TCCTC-GCCAT---TTCCAAC--ACCGTCT-CG---A-C--TCTTTAAATACG--AAATGTTC--A-CT-AGAT-A--T---------TGCGA----GA-----A-----C-AT--------------------TT-------------A----
gi|16                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 -ATTTT-----GTTTTAAACAGAATAGAAA-TG---A-TATTCAG--GGACATTA-----A-TACTC---TTGGACTTC--T---AGTATATA-------CAT-----------------------T----------TTAAC--ATGAAA--TTAAG-TCATCT-CAA----TTTAGC-A--TTTATTACAATA---TCCCAGAAT-----AGAT-TT-CAAA-ATGCAA-TTATC---ATCAAATATA
gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TTTTTTTTA---TAATGG--AAGTTTTG-CA-AACATTC-ATAT-TT-TTA-TA---CAAGT-TAACATA-CCTGCAGCTCA-G--CT-----ACATA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            taaaggacattttgaaatactaattttaaattaatatgaccaataaggtcgcaacattTTT-TAT----AAC--TTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGT--TT-GTCACAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCGTAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    G-----TTTTG-TGAAAC---AACAGTGGC-AATCTTATGG--TT-GCCGTAA-G-TCAAAC-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-GCGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-GAACCCAGCC
gi|2                          :                          AGTTG-GAAAC---CATA--GGCACTTGGCGTTTAG--AAAT--A---CAT--GCATGTAGACTACA--TTTGATA-A----------AAAAA-A-TTA-T-CTTCCTT-TAAAGAA-AG--------------------TATT-----A-AC-AG---T-----TA------TATTT-ACA------------G-GAAAATTACAATTACAATATAGA-----------------TAT-GCTT-TAAAT--T-----CTAAGTGGC-CTGT-GTCGTAA-C-----CACTGA-ATT----GCTTCG--A-ACAGGA-CGA-------TTT------------GGGGGGA---------GG--T-C-AACTTCGT---CATAGTC-A-TAAA-CTATACAATCTATTCC-----T-CTG----ACCT----CAAA------AATT--AGT--AACT-C-GGTCTTGTCAA--TGGG--A--GTATCCTATGCTAT---TATCAAA--ACTCTTT-AG-----C--TCT-------CACAAACT-TTC--G-CCCAGGT-A--CA---GACA-TGCAC----AA-----A-----TTAA--------------------TT-------------A----CAT-AGTGA------ATACAG-TAA-------A-ACATGC-------GTGTATTAACA-----TGTTTTTTATA---T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CATTA-ATAG-TT-TTAATA---CAACT-T-TTATG-ACAGCAGTGTA-G--CT-----ACATAT--ATA-ATTTA-----GTTG-AAACAGAAGAAAAA-AA---A-TATTTAG--AGATATCA-----G-TATCC---TTGGACT-AC-T---AGTATACAAC-ACTTCAT--ATTCTTTTGAT-CCTT-T--TT----------TTAATTCCTGAAA--CTGAG-TTTTTTTCGA----TTTAGA-A--TTTACTACAATA---TCCCAAAAT----AAATT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--TTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TAAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAGCCct
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ttggAA-------A-ACACCC-------GT---TTAACAGTG--TGTTTTTTTTA---T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CACTA-ATAG-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATG-ACAATAGCCTA-G--CT-----ACATAT--ATA-ATTTT-----GTTG-AAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          G-AT-----AA-----TTTTA-TGAAAC---AACAGTGAT-AACATTATGA--TTGGTCATAA-GATT--AT-C-GTAAGAT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ggtG-AT-----AA-----TTTTA-TGAAAC---AACAGTGAT-AATATTATGA--TT-GTCATAA-GATT--AT-C-GTAAGATctgtttgattacattagaggaaaccctgccct
gi|23                         :                          tGTTG-AAAAA---CACA--AGCAATTGACGTTTAA--AAAT--G---CAT-------TA-----AA--TAT---A-A----------AATAA-------T-CTTTCCTATAAGCAA-AT--------------------TATT--GACA-TT-AA---TA-G--Tctgtttgattacattagagaaaccctgcc
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  -AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TCAGAT-C-ATAAGA------------T-CTGTTTT-CTGAGAAACCTTAAACTAGGTC---------GGTG-AAAt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       -TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG---------GG-----------GGG---CA---TC-CATAAA--TAT-----ATGT--C-----TACT-A---ACCAGCAGGAGA------AAGT--T
gi|3                          :                    atacatAGTTG-GAAAC---CACA--GGCACTAGGCGTTTAG--AAAT--A---CAT--GCATGTA-----CA--TTT---A-A----------AAAAA-A-ATA-T-CTTTCAT-TAAAGAA-AG--------------------TATT--GACA-AC-AA---TA-G--TT------TATTTAACA------------G-GAA------------------GA-----------------TAT-GTTT-AAAACG-T-A-AACTAAGTG-C-CATT-GTCGGAAAC-----CACTGA-ATTTT--GCTTCGGAA-ACAGTA-TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG---------GG--C-C-AACTTCTC---CT--TCC-AATAAAGTTAT-----TTAT--C-----T-TTGG---ACCA----GTGA------AAAT--TGT--A-CC-A-CGTTTTAT--G--TTTA--C--GT-TCCTG-GCTAT---TTCCAAA--ACCTTGT-AA---A-C--TCT-------CA--AACTTTTC--G-CT-AGGT-A--CATGTAACA-TGCAA----GA-----A-----C-AT--------------------TT-------------A----CAC-AGCGC------GTACAG-TAA-------A-ACACCC-------GT---TTAACAGGGTTTGTTTTTTTTA---T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CA-----------------A---TAACT-T-TTATG-ACAACAGCCTA-G--CT-----ACATAT--ATA-ATTTT-----GTTG-AAACAGAAAAGAAA-AA---A-TATTTAG--GGATATCC-----G-TATCC---TTGGAC----------GTATATAAC-ATTTCAT--AT----------CCTT-T--TA----------TTAACTCCTGAAA--CTAAG-TTTTCT-CAA----TTTAGC-A--TTTGCTACAATA---TCCCAGAAT----AAAAT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--TTGAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAGCC
gi|4                          :                                                                             --GCAT-TG-----CA--TTTT--A-A----------AAAAATA-ATA-TGCTTCCAT-TAAAGAA-AC--------------------TAATAGGACA-AC-AA---AA-AAATC------TATT-GACACCCATGTTTTT-G-CAG------------------GA-----------------TATTGTTT-AAAAAG-T-ATA-CTA-GT--C-CTAT-GTTCGAA-------CACTGA-ATTTT--GCTTCGAAAGACA-TA-TTT-------ATTT---------GGGGGGGGG---------GGGTT-C-AACTT-GT-------ATC-AA---AGCTAT-----TTAT--C-----T-CTG----ACCA-----AGA------AA----TAT--A-TA-T-CGTTG-AT--G--T-GA--A--GT-C---A-GCTAT---T-CCAAA--AC-TTGT-AG---AAC--TC------------AACTGTTC--GGCT-AG-T-A--CATTAAACA-TGTATTTT-GA-----A-----C-AT--------------------TT-------------A----C-C-TGCGGTCAGATGT-CAGGTAA-------T-ACACC--------GT---T-ACCAGG-----TTTTTTTTA-------AG--AAGCT--G-CATA-CATTA-ATAGATTATTA-TAT--CAA---T-ATATG-ACACGAGC--A-G---T-----ACATAT--ATAGATTTT-----GT-G-AAACAGAAGAGAAC-AA---A-TATTTAG--GGAAATCT-----G-TATCC---TTGG-------------------AC-ACTT-ATTGAT----------CCTT-T--T---------------------------TGAT-TCTTCTACAT----TCTAGCTAGTTTTGCTACAATA---TATCAAGATAAAAAAAAT-GTATAAGTAC---ATTTATCTATGTAAGATTTA-C-T--AAA--TTTT-TAT----AACTTTTAAGTAT-----A------TTTGG-TG-TACTCTAGCA-TGGC-AATCTTATGA--TT--TCACAA---TTAGAT-CTTTAAGATATATCATAAG-T--TGTCTCGAAGAT-AATCATAAGTCTGTCTTACGACAAATGTG-AAACCCAGTC
gi|5                          :                                                                                                                                         ggaGAA-AC--------------------TATT--GACG-AC-AACATTA-G--TT------TATTTACC---------------GAA------------------GAAT---------------TAT-ATT---AGATA-T-G-------GTG-C-CTATCG--GGAAAC-----CACTGA-ATCTT--GCTTCGGAA-A-AGTAATTT-------TTTTCGGGGGTGGGGGGGGGGG---------GG--T-T-ATCTTCGT---CA--GTC-AATAA-GCTAT-----TTATT-C-----T-CTGG---ACCA----GAGA------AA-T--TAT--A-CAAC-CGTTT-AT--A--TTGA--A--GT-TCCTA-GCTAT---TTCCAAA---CCTTGT-AG---A-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CT-AGGT-A--CATGTAACA-TGCAA----GA-----A-----C-AT--------------------TT-------------AATTACAC-AGCGA------GTACAG-TAA-------A-GCGCCC-------GT---TTAACAGGG--T-TTTTTTTAA---T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CATTA-ATAG-TT-TTA-TA---CCACT-T-TTATG-ACAACAGCCTA-G--CT-----GCATATT-ATA-ATTTT-----GTTG-AA-CAGAAGAGAAA-AA---A-TATTTAG--GGATATCC-----G-TATCC---TTGGACT-AC-T---AGTATATAAC-ATTTCAT--AT----------CCTT-T--TGATCCTTTTT-TTAACTCCTGAAA--CTGAG-TTTTCT-CAA----TTTAGT-A--TTTGCTACAATA---TCCCAGAAT----AAAAT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGATTTTTT-TAT----AAC--TT-AG-AT-----AG-----TTTTGTTGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-GTTTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CT-TCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTGAAAACCCAG
gi|6                          :                                                          TTAGCTAAATGGA---CATTGGCAT------------TTT---A-A----------AAAAATA-AT-----TTCCAT-TAAAGAATAA--------------------TAG---GACA-AC-AA---TA-AA-TC------TATT-GACACCCATTGTATTTG-CAG------------------GA-----------------TAT-GTTT-AACA-G-T-A-A-CTATGT--C-CTAT-GTCG-AAAC-----ACCTGA-ATTT---G-TTCG-AA-ACATGA-TTT-------AGGC---------GGAGGGGGGT--------GG--TTC-AACTTCGT---CA---TC-AATAAGCTTAT-----TTAT--C-----T-T--G---ACCA-----AGA---------T----T--A-CA-C-C-TATTATC-G--TTGAGTA--AT---CTA-GCTAT---T--CAAA----CTTGT-AGCCAA-C--TC------------AACTGTTCGTG-CT-ATGT-AACCA--TAACA-TGTAT----GA-----A-------AT--------------------T---------------------C-TGCGA------GT-CAGATGATTCAGGTA-ATACAA-------GT------ACAG-----GTTTTTTTTC---A---AG--AAGTC-------A-TACTA-TCAG-TTATTA-TA---CCACTAT-ATATGAACA-CAGCTAA-GTACC-----ATATAT--ATG-ATTTT-----GT---GAACAGAAGAGAAACAA---A-TATTTAG--GGA-ATCG-----A-T---C---TTGGATC-A--T-----TAT-TGA----TCCAT--G-------------TT-TGATC----------TTATCTACTTCAG--CT-AG-TTTT--------------GC-A-------CATAATA---------AATAA--AAAAT-GTATAAG-ATAACATTTATT---ATAAGATTTA-C-TTAATA--TTTTATAT----AAT--TT-----T-----AA-----ATTTGTTGATACCT-AGCTATGGC-AATCTTATGAAGTT--TCACAAGG-TTAGATCC-TTTAGATA-AT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      caggttcagaaacagtcattaT--A-CA-C-CGTTTCAT--A--TTGA--A--GT-TCTTA-----T---TTCCAAA--ACCTTGT-AG---A-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CT-AGGT-A--CATGTAACA-TGTAATCTTGA-----A-----C-AT--------------------TT-------------A----CA---GCGA------GTGCAG-TAA-------A-ACGCCC-------GT---TTAACAGGG---GTTTTTTTAAA--T---AG--AAGCTT-G-CA-A-CATTA-ATAG-TT-TTA-TA---AAACT-T-TTATG-ACACCAGCCTA-G--CT-----ACATAT--ATA-ATTTT-----GTTG-AAACA-AAGAGAAA-AA---AATATTTAG--GGATATCC-----A-TATCC---TTGGACT-AA-T---AATATGTAAC-ATTTCAT--AT----------CCTT-T--TGATCCTTTTTTTTAACTCCTGAAA--C--AG-TTTTCT-TAA----TTTAG---------------TA---TCCCAGAAT----AAAAT-GG-TAAGCATA-------TC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--CTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGGAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAG
gi|8                          :                          AGTTG-GAAAC---CATATAGGCACTTAGCGTT-AG--AAAT--A---CAT--GCATATAGCCTACA--TCT---G-AT---------AAAAA-ATATA-T-CTTCCAC-TAAAGAA-AAC-------------------TATT--GAC---C-AA---CA-G--TCAGCATGTATT--ACG------------A-GAA------------------GAATGCATTGAATTTAGAGTAT-GTTTTAAAACG-T------CAAATG-C-CTGT-GTCGTAAAA-----CACTGA-AATTT--GCTTCAAAA-ACAGTG-CAT-------TTGA---------GGGGGAGGG---------GG------------------A--GTC-AA--------------------C-----T-CTGA---ACCA----GAGA------AAAT--TGT--A-CA-T-CGTTTCAT--G--TTGA--A--GT-TCCTA-GTTAT---TTCCAAA--ACCTTGT-TG---T-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CC-AGGT-A--CATGTAACA-TGCAC----AA-----A-----C-ATTATACATGTATAATATTTAATT-------------A----CAC-AGTGA------ATACAG-TAA-------A-ACACGC-------GT---GTAACAGG-------TTTTTTA---T---GG--AAGCTT-G-AA-A-CATTA-ATAG-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATG-GCATCAGTCTA-A--CT-----ACATAT--ATA-ATCTA-----GGTG-AAATAGAAG
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ctgg--------------------TT-------------A----CAC-AGCGA------GTACAG-TAA-------A-TCACCC-------GT---TTAACAGGG--T----TTTTAA---T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CATTA-ATAG-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATG-ACAACAAGCTA-G--CA-----ACA-AT--ATA-ATTTT-----GTTG-AAACAGAA-AGAAA-AA---A-TATTTAG--GGATATCC-----G-TATCC---TTGGACT-AACT---AGTA-ATAACCATTTCAT--ATTCCTTTTGATCCTT-T--TT----------TTAACTC-TGAAA--CTGAG-TTTTC--CAA----TTTAGT-A--TTTGCTACAATA---TCCCAGAAT----AAAAT-GA-TAAGCAT-AAACTTATC---GTAAGATTTATCTTTAAGA--TTTT-TAT----AGC--TTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-CTTTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAAACC


blockSeqs                     :                               .     .      TA                CT    GGA      TG    GTAGACTACATTTGATAA                  TA   AA G       A       T CTATAGACAACAGTAGTAAAC    AG    .  .  CAT  GTCAGCATG       TACAGGAAAATTACAATTACAATATAGA                                  T   TT    CG  AAA   T A  GGC   A C    G  A .          .     .       G  G      A   TTTTCGGGGGTGG                GGGTTC                C  CATAG     .     ACTATACAATC    TC .     A   G       GCAGG   .       A T    .  A  AC      C  CAA      GTA    A     T     .   T     ACA      .  CCAAC      TTAAATACG      T   GT G  C    . AC  TG     .    CAAACATTATACATGTATAATATTTAATTA                                   .     TCAGAT  G   G   TTCAGGT .      .        GTA       GGTTTG         TAAT     .       T .  T A     .    A  A   A  T       A A     A   G       . TA  .          T    G     .      T T              C  CGG A       .        AA           .        TAACT         A    CAT     ATCCTTTTGATCCTTTTTT                   TC       .   A  .      T   .        CT GT            .           AAAA     .  A    C  GCC       TAT          T T      TT    A   .      TT  A  T  .      .         T      TCT         .          AG  G       G A      C T        T        A .       G                      TACGACAAA    A
blockSeqs                     :                               .     .      .                 .     A        .     ATAGCCTACATCTGAT                    TA   A  .       .       . AC                       .     .  .  .    AAATC           ACGAGAAGAATGCATTGAATTTAGAG                                    .   T     CG  AAA   T A  GT    G .    T  A .          .     .       A  .      .   GTTGTCTTTTT                  TGGTTC                C  CAG       .     AGCTATT        T  .     .   A       G       .       T A    .  .  C       C  CG       A      .     .     .   T     A        .  AAAA       CACA           T   .  .  .    . .   TG     .    ACAAAATTTCATTTAACTCCGTTGACAA                                     .     .       T   A   .       .      .        .         TGTG           AT       .       . .  . .     .    .  A   .  .       . .     .   G       . .   .          .    .     .      T .              .  .   .       .        AG           .        TTCT          A    AC      ATTCCTTTTGATCCTTTTT                   TT       .   G  .      A   .        C  .             .           AA       .  A    C  GCA       .            T .      .     .   .      .   A  .  .      .         T      CT          .          .   .       . A      . T        .        . .       .                      .            .
blockSeqs                     :                               .     .      .                 .     A        .     GTACATTTAA                          AT   A  .       .       . G                        .     .  .  .    AATC            GACACCCATTGTATTTGCAGGA                                        .   T     AG  ATA   T A  GC    T .    G  A .          .     .       G  .      .   TTGG                         GGTCC                 C  CCA       .     AGTTATT        .  .     .   A       G       .       T T    .  .  C       T  G        A      .     .     .   A     A        .  AAC        TA             G   .  .  .    . .   TT     .    AGAACATTTAATTA                                                   .     .       A   .   .       .      .        .         GGT            T        .       . .  . .     .    .  .   .  .       . .     .   G       . .   .          .    .     .      T .              .  .   .       .        CG           .        TACT          A    AA      ATTCTTTTGATCCTTTTT                    CT       .   A  .      .   .        A  .             .           .        .  .    C  AAA       .            T .      .     .   .      .   A  .  .      .         .      .           .          .   .       . T      . .        .        . .       .                      .            .
blockSeqs                     :                               .     .      .                 .     G        .     TGCATTTTAA                          A    A  .       .       . T                        .     .  .  .    GTT             GACACCCATGTTTTTGCAGGA                                         .   T     TA  AA    T T  GC    A .    G  A .          .     .       A  .      .   TTTT                         GGTC                  C  CCG       .     AGCTATT        .  .     .   A       G       .       T A    .  .  T       T  G        C      .     .     .   T     A        .  AC         GG             T   .  .  .    . .   TG     .    ATCTTGAACATTTA                                                   .     .       A   .   .       .      .        .         GGG            T        .       . .  . .     .    .  .   .  .       . .     .   A       . .   .          .    .     .      T .              .  .   .       .        TG           .        TACT          A    AA      ATCCTTTTGATCCTTTTT                    CT       .   G  .      .   .        C  .             .           .        .  .    T  AAA       .            T .      .     .   .      .   G  .  .      .         .      .           .          .   .       . .      . .        .        . .       .                      .            .
blockSeqs                     :                               .     .      .                 .     A        .     TAAATATAA                           A    A  .       .       . G                        .     .  .  .    GTT             TAACAGGAAGA                                                   .   T     CG  G     T A  GC    A .    G  A .          .     .       G  .      .   TTTT                         GGCC                  G  CTT       .     GCTTATT        .  .     .   G       C       .       G T    .  .  C       T  G        A      .     .     .   T     A        .  AC         CA             G   .  .  .    . .   TG     .    TTTTGAACATTTA                                                    .     .       A   .   .       .      .        .         GGT            T        .       . .  . .     .    .  .   .  .       . .     .   A       . .   .          .    .     .      T .              .  .   .       .        CG           .        TAAT          A    AC      TGATCCTTTT                            CT       .   A  .      .   .        A  .             .           .        .  .    C  AAA       .            T .      .     .   .      .   A  .  .      .         .      .           .          .   .       . .      . .        .        . .       .                      .            .
blockSeqs                     :                                                              .     A        .     CATTTTTA                            A    .  .       .       . C                        .     .  .  .    GTT             TACCGAAGAAT                                                   .   T     T   .     C .  C     A .    T  A .          .     .       A  .      .   TTTT                         GGTT                  C  CAG       .     GCTATT         .  .     .   G       G       .       A T    .  .  A       C  A        A      .     .     .   T     A        .  AC         CA             G   .  .  .    . .   TG     .    CAAATTAATTA                                                      .     .       G   .   .       .      .        .         TG             T        .       . .  . .     .    .  .   .  .       . .     .   C       . .   .          .    .     .      T .              .  .   .       .        GA           .        CAT           A    AT      ATCCTTTTA                             CT       .   G  .      .   .        C  .             .           .        .  .    C  AAC       .            T .      .     .   .      .   A  .  .      .         .      .           .          .   .       . .      . .        .        . .       .                      .            .
blockSeqs                     :                                                                             .     TTTAA                               .    .  .       .       . C                        .     .  .  .    TA              TGCAGCA                                                       .   .     G   .     . .  C     G .    .  . .          .     .       .  .      .   ATTT                         GGT                   C  CA        .     ATATA          .  .     .   G       G       .       A T    .  .  T       C  A        A      .     .     .   T     A        .  AC         CA             G   .  .  .    . .   T      .    AGAACATTTA                                                       .     .       A   .   .       .      .        .         G              T        .       . .  . .     .    .  .   .  .       . .     .   A       . .   .          .    .     .      T .              .  .   .       .        CA           .        T             G    AC      ATCCTTTC                              CT       .   G  .      .   .        T  .             .           .        .  .    C  AA        .            . .      .     .   .      .   A  .  .      .         .      .           .          .   .       . .      . .        .        . .       .                      .            .
blockSeqs                     :                                                                                                                                               . A                        .     .  .  .                                                                                                                           . .          .     .       .  .      .   AGGC                         TC                    C  CA        .     CTC            .  .     .   A       G       .       . T    .  .  C       .  G        A      .     .     .   .     .        .  AC         CA             G   .  .  .    . .   .      .    AGAACATTTA                                                       .     .       A   .   .       .      .        .         G              A        .       . .  . .     .    .  .   .  .       . .     .   C       . .   .          .    .     .      T .              .  .   .       .        CG           .        .             A    AT      GTTTGATC                              T        .   G  .      .   .        C  .             .           .        .  .    .  A         .            . .      .     .   .      .   .  .  .      .         .      .           .          .   .       . .      . .        .        . .       .                      .            .
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Reference ( family-839 )      :                                AGTTG-GAAAC---CACA--GGCACTTGGCGTTTAG--AAAT--A---CAT--GCAT------TACA--TTT---AA----------AAAAA-A-ATAT-CTTCCAT-TAAAGAA-AN--------------------TATT--GACA-AC-AA---TA-G--TC------TATTTGACA------------G-GAA------------------GA-----------------TAT-GTTT-AAAACG-T-A-A-CTAAGTG-C-CTGT-GTCGGAAAC-----CACTGA-ATTTT--GCTTCGGAA-ACAGTA-TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG---------GG--T-C-AACTTCGT---CA--GTC-AATAAAGCTAT-----TTAT--C-----T-CTGG---ACCA----GAGA------AANT--TGT--A-CA-C-CGTTTCAT--G--TTGA--A--GT-TCCTA-GCTAT---TTCCAAA--ACCTTGT-AG---A-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CT-AGGT-A--CATGTAACA-TGCAN----GA-----A-----C-AT--------------------TT-------------A----CAC-AGCGA------GTACAG-TAA-------A-ACACCC-------GT---TTAACAG-G----GTTTTTTTTA-----T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CATTA-ATAG-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATG-ACAGCAGCCTA-G--CT-----ACATAT--ATA-ATTTT-----GTTG-AAACAGAAGAGAAA-AA---A-TATTTAGG-GATATCCGTATCCTTGGACT-A--TAGTATA-TAA-CACTTCATA-TCCTTTTGATCC-TT--TT-TT--AACTCCTGAAA--CTGAG-TTTTCT-CAA----TTTAGC-A--TTTGCTACAATA---TCCCAGAAT----AAAAT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--TTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAGCC
gi|1                          :                                  TTGAGAAACGGTCACA--GGCACTTAGCGTTTAG--ATAT--ATTACAT--GCATG-----TGCAACTTC---AATACTCTGGCCAAGAA-A-ATAT-CTCCCAT-TAAAAAA-AAACCCTAA-------------TATCCGGACACACGAA---TACG--TA------TTTTTACCA------------GAGAAAAATATTAAATTA-----GA-----------------TAT-GCTA-AAACCGCT-C-A-C--AGTG-AACTGT-GTCGGAAACAATTTTACTGACATTTTTTGCTTTTGGA-ACAGTA-CAT-------TT-----------GGGGGGGGGCTGCGGGCCGG--T-CCAAATCAGTATTCA--GTTTGATATTGTCGC-----TCAT--CATGCGT-CTGGTATACCA----GCAACGATATAATTCTTGTCGA-CA-CTCTTCTCAA--GCTTTGA--ACGGTATCCTACGCTCTGCTCTCCCCA--ACCTTGTCAG---A-CCATCT-------CA--AACTGTTA--G-CT-AGGTTA--CATGGAACAATGTAA----AACCCCAAT----C-AT--------------------TT-------------AAT--TACCAGTGA------GTACGG-TAA-------ATACACCTACCAGCTGT---TTGACAG-G----TTATTTTTTACAACCT---GGTCAAGTTT-GGCA-A-CATTTTACCG-AT-TTA-TAAACTAACT-T-ATATG-ACAGCTACCTAAG--CTCAATTATATATTGACA-GTTTTTTTGTGTCG-AAACAGAAGAGAAA-CA---A-AATTGAGGCGA-----ATACACTCAAAGT----TATTTTAGTTG-GGCTTCTCA-GTCTTCTTCTTC-TTACTC-TT--A--CCCTGAAACCCTGAGTTTTTCT-CAATCCCTCTAGC-A--TTTACTACAACATACTCCCCACAT----AAAATGGT-TAAG
gi|10                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ttggcagtTTTGATCC-TT--TC-TA--AATCCCCGAAA--CTACA-TTATCT-CAG----TTTAGC-A--TTTATTACGATT---GACCAGAAT----GAATT-GT-TAAGGATGAAACTTATC---GTAAGATTTGTC-ATAAGA--TTTT-TATACAGAAC--TAAAT-ATATCTAAGGGCATTTTTG-TGAAGC---ACCAGTGACAAATCTTATGA--GT-GTCATAA-G-CCAGAT-C-TTA--ATA------AAG-TCCTGTCGT-ATGACGAATTCTAAGATACTTT---------TGTG-AAACACAGCCtcctctccaataagtcaggtctttcgaagattatcattaagtccttgtgtttaccgacacttgtgaaa
gi|11                         : tactggtacatttttgcgttccaggtaacacAGTTG-GAAAC---CACA--GGCACTTGGCGTTTAG--AAAT--A---CAT--GCAT------CATT--TTT---AA----------AAAAA-A-TAAT-CTTCCAT-TAAAGAA-ACTATAGACAACAGTAGTAAACTATT--GACA-CC-AA---TA-G--TT------TATTTG-CA------------G-CA--------------------------------------TAT-GTTT-AAAACG-TAA-A-CTAAGTG-T-CTAT-GTCGGAAAC-----CACTGA-ATTTT--GCTTTGGAA-ACAGTA---A-------TTGG---------GGGGGGGGG---------GG--TCC-AGCTTCGT---CA--GTC-AATAAAGCTAT-----TTAT--C-----T-CTGG---ACCA----GAGA------AAAT--TAT--A-CA-C-CGT
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gi|13                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       taaacTTGT-AG---A-AAATCT-------TA--AAATTTCT--G-AT-A----A--CAT-TAAC--TGTGT----TG-----A-----C-A------------------------------------A----TAT-AGCGG------ATGGAG-TCG-------A-ACACCC-------AT---TCAACA--------TCTTTTTTA-----T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CATTT-ATAT-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATG-ACAGCAGCCTA-C--GT-----ACA----------------------G-AAACAGAAGA-AAA-AT---A-TATTTAGG-GATATCT----------ACT-A----GTATA-TAA-CAAATCATG-TTCTTTTGA
gi|14                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG---------GG--T---AACTGCAT---CC--ATC-AATAAGG------------T--C-----T-CTGA---ACCA----GAGA------AATT--AGT--T-CA-C-CGTTTCAT--G--TTGA--A--GT-TACTA-ACTAT---TTTCAAAACACCTTGC-AG---A-C--TCT-------GG--AACATTTC--G-TT-AGAT-A--CGTGTAACG-TCTAA----CA-----AAATTTC-AT--------------------TTAACTCCGTTGACAA----TAC-AGCAA------GTTCAG-CAG-------A-ACACTC-------GT---ATA
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gi|17                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TTTTTTTTA-----TAATGG--AAGTTTTG-CA-AACATTC-ATAT-TT-TTA-TA---CAAGT-TAACATA-CCTGCAGCTCA-G--CT-----ACATA
gi|18                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             taaaggacattttgaaatactaattttaaattaatatgaccaataaggtcgcaacattTTT-TAT----AAC--TTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGT--TT-GTCACAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCGTAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACc
gi|19                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     G-----TTTTG-TGAAAC---AACAGTGGC-AATCTTATGG--TT-GCCGTAA-G-TCAAAC-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-GCGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-GAACCCAGCC
gi|2                          :                                AGTTG-GAAAC---CATA--GGCACTTGGCGTTTAG--AAAT--A---CAT--GCATGTAGACTACA--TTTGATAA----------AAAAA-A-TTAT-CTTCCTT-TAAAGAA-AG--------------------TATT-----A-AC-AG---T-----TA------TATTT-ACA------------G-GAAAATTACAATTACAATATAGA-----------------TAT-GCTT-TAAAT--T-----CTAAGTGGC-CTGT-GTCGTAA-C-----CACTGA-ATT----GCTTCG--A-ACAGGA-CGA-------TTT------------GGGGGGA---------GG--T-C-AACTTCGT---CATAGTC-A-TAAA-CTATACAATCTATTCC-----T-CTG----ACCT----CAAA------AATT--AGT--AACT-C-GGTCTTGTCAA--TGGG--A--GTATCCTATGCTAT---TATCAAA--ACTCTTT-AG-----C--TCT-------CACAAACT-TTC--G-CCCAGGT-A--CA---GACA-TGCAC----AA-----A-----TTAA--------------------TT-------------A----CAT-AGTGA------ATACAG-TAA-------A-ACATGC-------GTGTATTAACAT-G-----TTTTTTATA-----T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CATTA-ATAG-TT-TTAATA---CAACT-T-TTATG-ACAGCAGTGTA-G--CT-----ACATAT--ATA-ATTTA-----GTTG-AAACAGAAGAAAAA-AA---A-TATTTAGA-GATATCAGTATCCTTGGACT-AC-TAGTATA-CAA-CACTTCATA-TTCTTTTGATCC-TT--TT-TTT-AATTCCTGAAA--CTGAG-TTTTTTTCGA----TTTAGA-A--TTTACTACAATA---TCCCAAAAT----AAATT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--TTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TAAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAGCCct
gi|20                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ttggAA-------A-ACACCC-------GT---TTAACAGTGT---GTTTTTTTTA-----T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CACTA-ATAG-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATG-ACAATAGCCTA-G--CT-----ACATAT--ATA-ATTTT-----GTTG-AAA
gi|21                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           G-AT-----AA-----TTTTA-TGAAAC---AACAGTGAT-AACATTATGA--TTGGTCATAA-GATT--AT-C-GTAAGAT
gi|22                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ggtG-AT-----AA-----TTTTA-TGAAAC---AACAGTGAT-AATATTATGA--TT-GTCATAA-GATT--AT-C-GTAAGATctgtttgattacattagaggaaaccctgccct
gi|23                         :                                tGTTG-AAAAA---CACA--AGCAATTGACGTTTAA--AAAT-----------GCAT------TAAA--TAT---AA----------AATAA------T-CTTTCCTATAAGCAA-AT--------------------TATT--GACA-TT-AA---TA-G--Tctgtttgattacattagagaaaccctgcc
gi|24                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   -AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TCAGAT-C-ATAAGA------------T-CTGTTTT-CTGAGAAACCTTAAACTAGGTC---------GGTG-AAAt
gi|25                         :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           -TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG---------GG-----------GGG---CA---TC-CATAAA--TAT-----ATGT--C-----TACT-A---ACCAGCAGGAGA------AAGT--T
gi|3                          :                          atacatAGTTG-GAAAC---CACA--GGCACTAGGCGTTTAG--AAAT--A---CAT--GCATG-----TACA--TTT---AA----------AAAAA-A-ATAT-CTTTCAT-TAAAGAA-AG--------------------TATT--GACA-AC-AA---TA-G--TT------TATTTAACA------------G-GAA------------------GA-----------------TAT-GTTT-AAAACG-T-A-AACTAAGTG-C-CATT-GTCGGAAAC-----CACTGA-ATTTT--GCTTCGGAA-ACAGTA-TTT-------TTTT---------GGGGGGGGG---------GG--C-C-AACTTCTC---CT--TCC-AATAAAGTTAT-----TTAT--C-----T-TTGG---ACCA----GTGA------AAAT--TGT--A-CC-A-CGTTTTAT--G--TTTA--C--GT-TCCTG-GCTAT---TTCCAAA--ACCTTGT-AA---A-C--TCT-------CA--AACTTTTC--G-CT-AGGT-A--CATGTAACA-TGCAA----GA-----A-----C-AT--------------------TT-------------A----CAC-AGCGC------GTACAG-TAA-------A-ACACCC-------GT---TTAACAG-GGTTTGTTTTTTTTA-----T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CA-----------------A---TAACT-T-TTATG-ACAACAGCCTA-G--CT-----ACATAT--ATA-ATTTT-----GTTG-AAACAGAAAAGAAA-AA---A-TATTTAGG-GATATCCGTATCCTTGGAC-------GTATA-TAA-CATTTCATA-TCCTTTTA------------TT--AACTCCTGAAA--CTAAG-TTTTCT-CAA----TTTAGC-A--TTTGCTACAATA---TCCCAGAAT----AAAAT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--TTGAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAGCC
gi|4                          :                                                                                   --GCAT------TGCA--TTTT--AA----------AAAAATA-ATATGCTTCCAT-TAAAGAA-AC--------------------TAATAGGACA-AC-AA---AA-AAATC------TATT-GACACCCATGTTTTT-G-CAG------------------GA-----------------TATTGTTT-AAAAAG-T-ATA-CTA-GT--C-CTAT-GTTCGAA-------CACTGA-ATTTT--GCTTCGAAAGACA-TA-TTT-------ATTT---------GGGGGGGGG---------GGGTT-C-AACTT-GT-------ATC-AA---AGCTAT-----TTAT--C-----T-CTG----ACCA-----AGA------AA----TAT--A-TA-T-CGTTG-AT--G--T-GA--A--GT-C---A-GCTAT---T-CCAAA--AC-TTGT-AG---AAC--TC------------AACTGTTC--GGCT-AG-T-A--CATTAAACA-TGTATTTT-GA-----A-----C-AT--------------------TT-------------A----C-C-TGCGGTCAGATGT-CAGGTAA-------T-ACACC--------GT---T--ACCA-G----GTTTTTTTTA---------AG--AAGCT--G-CATA-CATTA-ATAGATTATTA-TAT--CAA---T-ATATG-ACACGAGC--A-G---T-----ACATAT--ATAGATTTT-----GT-G-AAACAGAAGAGAAC-AA---A-TATTTAGG-GAAATCTGTATCCTTGG-----------------A-CACTT-A--------TTGATCC-TT--TT-------------------TGAT-TCTTCTACAT----TCTAGCTAGTTTTGCTACAATA---TATCAAGATAAAAAAAAT-GTATAAGTAC---ATTTATCTATGTAAGATTTA-C-T--AAA--TTTT-TAT----AACTTTTAAGTAT-----A------TTTGG-TG-TACTCTAGCA-TGGC-AATCTTATGA--TT--TCACAA---TTAGAT-CTTTAAGATATATCATAAG-T--TGTCTCGAAGAT-AATCATAAGTCTGTCTTACGACAAATGTG-AAACCCAGTC
gi|5                          :                                                                                                                                             ggaGAA-AC--------------------TATT--GACG-AC-AACATTA-G--TT------TATTTACC---------------GAA------------------GAAT---------------TAT-ATT---AGATA-T-G-------GTG-C-CTATCG--GGAAAC-----CACTGA-ATCTT--GCTTCGGAA-A-AGTAATTT-------TTTTCGGGGGTGGGGGGGGGGG---------GG--T-T-ATCTTCGT---CA--GTC-AATAA-GCTAT-----TTATT-C-----T-CTGG---ACCA----GAGA------AA-T--TAT--A-CAAC-CGTTT-AT--A--TTGA--A--GT-TCCTA-GCTAT---TTCCAAA---CCTTGT-AG---A-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CT-AGGT-A--CATGTAACA-TGCAA----GA-----A-----C-AT--------------------TT-------------AATTACAC-AGCGA------GTACAG-TAA-------A-GCGCCC-------GT---TTAACAG-G----GTTTTTTTTAA----T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CATTA-ATAG-TT-TTA-TA---CCACT-T-TTATG-ACAACAGCCTA-G--CT-----GCATATT-ATA-ATTTT-----GTTG-AA-CAGAAGAGAAA-AA---A-TATTTAGG-GATATCCGTATCCTTGGACT-AC-TAGTATA-TAA-CATTTCATA-TCCTTTTGATCC-TT--TTTTT--AACTCCTGAAA--CTGAG-TTTTCT-CAA----TTTAGT-A--TTTGCTACAATA---TCCCAGAAT----AAAAT-GT-TAAGCATAAAACTTATC---GTAAGATTTATC-TTAAGATTTTTT-TAT----AAC--TT-AG-AT-----AG-----TTTTGTTGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-GTTTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CT-TCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTGAAAACCCAG
gi|6                          :                                                                TTAGCTAAATGGA---CATTGGCAT------T------TT---AA----------AAAAATA-AT----TTCCAT-TAAAGAATAA--------------------TAG---GACA-AC-AA---TA-AA-TC------TATT-GACACCCATTGTATTTG-CAG------------------GA-----------------TAT-GTTT-AACA-G-T-A-A-CTATGT--C-CTAT-GTCG-AAAC-----ACCTGA-ATTT---G-TTCG-AA-ACATGA-TTT-------AGGC---------GGAGGGGGGT--------GG--TTC-AACTTCGT---CA---TC-AATAAGCTTAT-----TTAT--C-----T-T--G---ACCA-----AGA---------T----T--A-CA-C-C-TATTATC-G--TTGAGTA--AT---CTA-GCTAT---T--CAAA----CTTGT-AGCCAA-C--TC------------AACTGTTCGTG-CT-ATGT-AACCA--TAACA-TGTAT----GA-----A-------AT--------------------T---------------------C-TGCGA------GT-CAGATGATTCAGGTA-ATACAA-------GT------ACAG-G----TTTTTTTTCA---------AG--AAGTC-------A-TACTA-TCAG-TTATTA-TA---CCACTAT-ATATGAACA-CAGCTAA-GTACC-----ATATAT--ATG-ATTTT-----GT---GAACAGAAGAGAAACAA---A-TATTTAGG-GA-ATCGAT---CTTGGATC-A--T--TAT--TGA----TCCATG-----TTTGATCT-TA--TC-T----ACTTC---AG--CT-AG-TTTT--------------GC-A-------CATAATA---------AATAA--AAAAT-GTATAAG-ATAACATTTATT---ATAAGATTTA-C-TTAATA--TTTTATAT----AAT--TT-----T-----AA-----ATTTGTTGATACCT-AGCTATGGC-AATCTTATGAAGTT--TCACAAGG-TTAGATCC-TTTAGATA-AT
gi|7                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          caggttcagaaacagtcattaT--A-CA-C-CGTTTCAT--A--TTGA--A--GT-TCTTA-----T---TTCCAAA--ACCTTGT-AG---A-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CT-AGGT-A--CATGTAACA-TGTAATCTTGA-----A-----C-AT--------------------TT-------------A----CA---GCGA------GTGCAG-TAA-------A-ACGCCC-------GT---TTAACAG-G----GGTTTTTTTAAA---T---AG--AAGCTT-G-CA-A-CATTA-ATAG-TT-TTA-TA---AAACT-T-TTATG-ACACCAGCCTA-G--CT-----ACATAT--ATA-ATTTT-----GTTG-AAACA-AAGAGAAA-AA---AATATTTAGG-GATATCCATATCCTTGGACT-AA-TAATATG-TAA-CATTTCATA-TCCTTTTGATCC-TT--TT-TTTTAACTCCTGAAA--C--AG-TTTTCT-TAA----TTTAG---------------TA---TCCCAGAAT----AAAAT-GG-TAAGCATA-------TC---GTAAGATTTATC-TTAAGA--TTTT-TAT----AAC--CTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGGAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-C-TTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAACCCAG
gi|8                          :                                AGTTG-GAAAC---CATATAGGCACTTAGCGTT-AG--AAAT--A---CAT--GCATATAGCCTACA--TCT---GAT---------AAAAA-ATATAT-CTTCCAC-TAAAGAA-AAC-------------------TATT--GAC---C-AA---CA-G--TCAGCATGTATT--ACG------------A-GAA------------------GAATGCATTGAATTTAGAGTAT-GTTTTAAAACG-T------CAAATG-C-CTGT-GTCGTAAAA-----CACTGA-AATTT--GCTTCAAAA-ACAGTG-CAT-------TTGA---------GGGGGAGGG---------GG------------------A--GTC-AA--------------------C-----T-CTGA---ACCA----GAGA------AAAT--TGT--A-CA-T-CGTTTCAT--G--TTGA--A--GT-TCCTA-GTTAT---TTCCAAA--ACCTTGT-TG---T-C--TCT-------CA--AACTGTTC--G-CC-AGGT-A--CATGTAACA-TGCAC----AA-----A-----C-ATTATACATGTATAATATTTAATT-------------A----CAC-AGTGA------ATACAG-TAA-------A-ACACGC-------GT---GTAACAG-G-------TTTTTTA-----T---GG--AAGCTT-G-AA-A-CATTA-ATAG-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATG-GCATCAGTCTA-A--CT-----ACATAT--ATA-ATCTA-----GGTG-AAATAGAAG
gi|9                          :                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ctgg--------------------TT-------------A----CAC-AGCGA------GTACAG-TAA-------A-TCACCC-------GT---TTAACAG-G----GTTTTTA--A-----T---GG--AAGCTT-G-CA-A-CATTA-ATAG-TT-TTA-TA---CAACT-T-TTATG-ACAACAAGCTA-G--CA-----ACA-AT--ATA-ATTTT-----GTTG-AAACAGAA-AGAAA-AA---A-TATTTAGG-GATATCCGTATCCTTGGACT-AACTAGTA-A-TAACCATTTCATATTCCTTTTGATCCTTT--TT-TT--AACT-CTGAAA--CTGAG-TTTTC--CAA----TTTAGT-A--TTTGCTACAATA---TCCCAGAAT----AAAAT-GA-TAAGCAT-AAACTTATC---GTAAGATTTATCTTTAAGA--TTTT-TAT----AGC--TTAAG-AT-----AG-----TTTTG-TGAAAC---AGCAGTGGC-AATCTTATGA--TT-GTCATAA-G-TTAGAT-CTTTAAGATA-ATCATAAG-T-CTGTCTT-ACGACAAATCTTAAGATAGTTT---------TGTG-AAAACC