lowQualScore : 4 55555 777 4 4 1 1 222222 33333 11 222 2 33333 44 2 22 22 777777777777777777777777 2 2 2 333 33 1 2 44 2 22222 2 2 1 1 1 1 555555555555555 1 1 2 11111 1 3333 1 111 1111 1 2222 111 1 111 11 99999999999999999999 2222222 1 1 11 666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666666 1 111 1 1111 1 111 11 11111 11 11 1 11 44444444444444444444444444 1 22222222222222 11111 33333333333333333333333 1111 1111111111 11111111 11111111111 1111 11111111 33
lowQualScore : 0 00000 000 0 6 0 5 5 999999 77777 88 111 0 66666 33 2 0 3 33 77 222222222222222222222222 0 4 0 0 555 55 2 5 0 77 0 2 2 00000 0 0 6 5 5 5 3 666666666666666 0 0 0 88888 0 1111 0 000 4444 0 1111 0 3 000 7 0 6 666 2 00 77777777777777777777 1111111 3 3 4 88 2 444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444444 3 999 7 3 3 0 8 1111 3 88 0 0 111 2 99 8 0 66666 0 3 11 3 55 1 0 8 0 11 11111111111111111111111111 3 99 6 00000000000000 4 4 44444 2 3 22222222222222222222222 77 5 8888 5 2 2 1111 4444444444 3 3 3 44 88 3 2 2 22222222 2 2 2 33 2 444 44444444444 3 0000 3 55 3 3 22222222 3 3 44 3 3 1 3 3 5 8 33
lowQualScore : . ..... ... . . . . . ...... ..... .. ... . ..... .. . . . .. .. ........................ . . . . ... .. . . . .. . . . ..... . . . . . . . ............... . . . ..... . .... . ... .... . .... . . ... . . . ... . .. .................... ....... . . . .. . ........................................................................ . ... . . . . . .... . .. . . ... . .. . . ..... . . .. . .. . . . . .. .......................... . .. . .............. . . ..... . . ....................... .. . .... . . . .... .......... . . . .. .. . . . ........ . . . .. . ... ........... . .... . .. . . ........ . . .. . . . . . . . ..
lowQualScore : 0 00000 000 0 0 0 5 0 000000 00000 00 000 0 00000 00 5 0 0 00 55 000000000000000000000000 0 0 0 0 000 55 5 5 0 55 0 5 5 55555 0 0 0 0 5 5 3 777777777777777 0 0 0 55555 0 2222 0 000 8888 0 2222 8 2 222 0 0 5 222 5 22 44444444444444444444 7777777 3 3 0 33 5 555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555555 3 000 3 2 2 0 0 8888 2 88 8 0 000 5 00 0 8 00000 8 8 00 8 66 0 6 0 8 00 44444444444444444444444444 3 22 7 44444444444444 0 0 66666 8 6 88888888888888888888888 33 7 9999 7 7 7 0000 9999999999 3 3 3 22 55 1 7 7 33333333 7 5 5 44 5 444 66666666666 6 0000 6 00 3 3 11111111 1 1 22 1 1 7 2 6 7 0 88
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACTATGCCTCAGCATGTTATTGGC-AGATTGTTTTTTTAAAATTCCTC-CACATATATCTCCGTTATTGAAAGAAGGAAAACCTTATTTAANTTTGGGGGGACTATAGGCGTTTANGATCACATGTGGACATAAAAGACAAAGACTTAACATTGTGT-GGGGATNTTCCAGCTTGCCGTGTGNTANTGTTTGAACACAACATATTANTTATATATNGAAGNCTGTCGNGTTTGCAACCTTTTTGACGTAATTGTCTAACCCGTACATAGCTATAAAAACTTAGCCCCNACNCGAANCTATAGGTGTCCGGCATACAGTAGCTGATTTAGAGGGGGCAGCCCCCCCCCCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGATAGGGCGATTTGTAAAAGCTTGACA-GCGCCGTTCC-T-T-AC--GC-AA-C-GCGCC---T-TT-GCC---GCTAAT-ACATAATAA-T--GT-AA----ATAATT-TTCATTTT-TCGCTT--NTAAGGGTGAATGCAA-GTT--TN-T--N-AAA-----G-GTGTTAACGC-GAN-A-CGCGCTGT-TT-CGTNA--AGGNTTTNGGATGCGGNGGGT--G-C-AGG-TGGG-GTGGTGTTGT---TAT-TTGA-AA--GTAC--GCAAC--TT--ACGAAGCG-CACCTTCGCTCA-AACATTTTTTTTTCTCTTTTATTAAAAT-TCAAA-TATATCACA-C-ATGCCATAT-ATC-AATACATAC-T-CGCTC--A-AACA---T-GATAAAC--ATTTACTAGTAACTTTTAA-CTGCTGAC--GCGA------AG---AT--GC-G------CTG-GG--TAA-AGT-----TG-GA---GGCG-GA-CATATA-A-G-GACANT-TT----GGNNNAAAA---AG-----TG--G-G----CGGACATA-TA-GTGCAGGCGGA-CATA----TA-------AG-GACAGTTT-GG-TCC-A--AAA--TT-GG-GCGG-ACATT--------TAG-TGCA-G-GC--GGA-CA---TATA-------AG--GACAGTTT-GG--T-CC-AA--AATTGG-GCGGAC-ATT--------TA-G-T--GC-AGGCGGAC-ATATAAGG-ACA-GGC-GGAC-ATATAAG
Reference ( gi|2 ) : TGCTACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACTATGCCTCA-CATGTTAT-GGCTAGATTGTTTT---AAAATTCCTCACATATATATCTCCGTTA-TGAAAGAAGGAAAACCTTAT--AAATTTGGGGGGACTA-AA--GTTTAAGATCACATGTGGACATAAAAGA-AAAGCCT--ACATTGTGTGGGGGATGTTCCAGCTTG-CGTGTGAT-TTGTTTGA--ACAGC-TA-TAAT--TA-A-GAAAACTTGT-GAGTTTGC-ATC-TTTTGA---AATTGT-TAACCTCTACA-AGCTAT--AAACTTA-CCCCCACCC-AACATATA-GTGTCTGG-ATACAGTGGCTGATTTAGAGGGGGCAGCCGCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGATAGGGCGATTTGTAAAAGCTTGACA-GCGC-GTTCC-T-T-AC--GC-AA-C-GCGCC---T-TT-GC----GCTAAT-ACATAATAA-T--GT-AA----ATAATT-TTCATTTT-TCGCTT--CTAAGGGTGAATGCAA-GTT--TG-T--A-AAA-----GCGTGTTAACGC-AAG-A-CGCGCTGT-TT-TGTTA--AGGGTTTG------GGGGGGT--G-C-AGG-TGGG-GTAGTGTTG----CAT-TTGA-AA--GTA---GCAAC--T---ACGAAGCG-CACCTTCGCTCA-AACATTTTTTTTTCTCTTTTATTAAAAT-TCAAA-TATATCACA-C-ATGCCATAT-ATC-AATACATAC-T-CGCTC--A-AACA---T-GATAAAC--ATTTACTAGTAACTTTTAA-CTGCTGAC--GCGA------AG---AT--GC-G------CTG-GG--TAA-AGT-----TG-GA---GGCG-GA-CATATA-A-G-GACACT-TT----GGAAAAAAA---AG-----TG--G-G----CGGACATA-TA-GTGCAGGCGGA-CATA----TA-------AG-GACAGTTT-GG-TCC-A--AAA--TT-GG-GCGG-ACATT--------TAG-TGCA-G-GC--GGA-CA---TATA-------AG--GACAGTTT-GG--T-CC-AA--AATTGG-GCGGAC-ATT--------TA-G-T--GC-AGGCGGAC-ATATAAGG-ACA-GGC-GGA--ATATAAGACTC
gi|1 : GTACTATGCCTCAGCATGTTATTGGC-AGATTGTTTTTTTAAAATTCCTC-CACATATATCTCCGTTATTGAAAGAAGG-AAACCTTAT--AAA-TTGGGGGGACTA-AAGCGTTTAAGATCACATGTGGACATAAAAGA-AAAG-CT--ACATTGTGT-GGGGATTTTCCAGCTTG-CGTGTGCT-TTGTTTGA--ACA---TATTAATTATA-A-TGAAAC-TGT-GAGTTTGCAATCTTTTTGA---AATTG--TAACCTCT-CA-AGCTATA-AAACTTA-CCCCCACAC-AAACTATAGGTGTCTGG-ATACAGTAGCTGATTTAGAGGGGGCAGCCCCCCCCCCCC
gi|8 : tatcgctgtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncAGGAAAAC-TTATTTAATTTTGGGGGGACTATAG--GTTTAC-ATCA---GTAGACATAAAAGACAAAGACTTAACATTGTG--AGGGATGTTCCAGCTTGCCGTGTGATAGTATTTGAACACAACATA-TATT--TATATGAAAGACTGTCGTGTTTGC-ACC-TTTTGACGTAATTGTCTAACCCGTACATAGCTATAAAAACTTAGCCCCAACCCGAACTTATA-GTGTCCGGCATACAGTnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggatagggcgattgtaaagcttgacatgcgccgccttgacgcaaacagcgcctgttgcgctaatacataataatgtcaaataattttcattttcgcttctaagggtgaatgcaatgtttattgataaaggtgttaacgcgaaatcgcgctgttttgtgaagggttttggtaggtggcaggtgggtagtgttgttatttgaaagtacccaactttagcgaagcgccaccttcgccaacacttttttcttctttattaaaattcaaatctatcacacatccatatgatcgaatacatacttcgcttcgaaacacattgataaacattactagtaacttttaactgctgacgcgaagatgcgctggagttaaagttgagaggggcgacatataggacactcttggaaaaaagtgggtcggacatattagtgcaggcggacagagtaagacgttggttccaaaaattgggcggacatttgtgcagggcggggacagcgtataagttcgtttggtccaaaattgggcggacatttagttgcgaggcggacacataaggaacatggcggaacatataaggac
gi|1 : GGATAGGGCGATT-GTAAA-GCTTGACATGCGCCG--CC-T-TGAC--GC-AAACAGCGCC---TGTT-GC----GCTAAT-ACATAATAA-T--GTCAA----ATAATT-TTCA-TTT-TCGCTT--CTAAGGGTGAATGCAATGTT--TA-TTGATAAA-----G-GTGTTAACGC-GAA-ATCGCGCTGT-TT-TGTGA--AGGGTTTT------GGTAGGTG-G-C-AGG-T-GG-GTAGTGTTGT---TAT-TTGA-AA--GTAC--CCAAC--TTTAGCGAAGCGCCACCTTCGCC---AACA--CTTTTTTCTTCTTTATTAAAAT-TCAAA-TCTATCACA-C-AT-CCATATGATCGAATACATACTT-CGCTTCGA-AACACATT-GATAAAC--A-TTACTAGTAACTTTTAA-CTGCTGAC--GCGA------AG---AT--GC-G------CTG-GAGTTAA-AGT-----TGAGA---GGGGCGA-CATAT--A-G-GACACTCTT----GG--AAAAA---AG-----TG--G-GT---CGGACATATTA-GTGCAGGCGGA-CAGAG---TA-------A--GAC-GTTG-GT-TCCAA--AAA--TT-GG-GCGG-ACATT--------T-G-TGCAGG-GCGGGGA-CAGCGTATA-------AG--TTC-GTTT-GG--T-CC-AA--AATTGG-GCGGAC-ATT--------TA-GTT--GCGAGGCGGAC-ACATAAGGAACATGGC-GGAACATATAAG
gi|5 : tatcgctgtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtactatgcctcagcatgttattggcagattgtttttttaaaattcctccacatatatctccgttattgaaagaaggaaaccttataaattggggggactaaagcgtttaagatcacatgtggacataaaagaaaagctacattgtgtggggattttccagcttgcgtgtgctttgtttgaacatattaattataatgaaactgtgagtttgcaatctttttgaaattgtaacctctcaagctataaaacttacccccacacaaactataggtgtctggatacagtagctgatttagagggggcagccccccccccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCGATTTGTAAAAGCTTGTCA-GCGCCGTTTA-TCT-AC--GC-AA-C-GCGCCATTT-TT-GCC---GCTAATGAC-TAATAAAT--GT-AATCAGATAATTATTCACTTTCTCACTT--GTAAGGGTGAATGCAA-GTTCATGTT--T-AAA-----G-GTGGTAACGCGAAGAA-CGCACTGTATT-TGTTAGGAGGTTTTGGGATGCGGGGGGTCGG-CGAGG-AGGGCGTGGTGGTGTGTCCGT-ATGATAA--TTA---ACAACTAT---ACGCAGCC-CACCTTCGCTCACAACAgac
gi|10 : cgatCTGGACA-GCGCCGTTCCCT-T-ATCTGCCAA-CTGCGCC---T-TTTGCCCAAGCTAAT-ACAAAATAA-T--GT-AA----AGAATT-T--ATTTT-TGGCTTTGCTAA-GGTGAATGCAA-TTT--
gi|1 : C-AG-C-GCGAT---T-TC-GC----GTTAAC-ACCT--TTA-TCAAT-AA----ACA--T-TGCATTCA-CC-CTT--AGAAGCGAAAATGAAA-ATTA-TT-T--G-ACATTATTATGTATTAGCGC-AAC-A-GGCGCTGT-TTGCGTCA--AGGaattgagtaaa
gi|3 : tatcgctgtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtactatgcctcagcatgttattggcagattgtttttttaaaattcctccacatatatctccgttattgaaagaaggaaaccttataaattggggggactaaagcgtttaagatcacatgtggacataaaagaaaagctacattgtgtggggattttccagcttgcgtgtgctttgtttgaacatattaattataatgaaactgtgagtttgcaatctttttgaaattgtaacctctcaagctataaaacttacccccacacaaactataggtgtctggatacagtagctgatttagagggggcagccccccccccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggatagggcgattgtaaagcttgacatgcgccgGGT--GGC-AGGATGGG-GT---GTTC----TATATTGA-AATAGTATTAGCAAC--TTA-ACGAAGCG-CACTCTCGCTCA-AACATTTTTTTT-CTCTTTT-TTAAAAT-TCAAAATATATCACATC-ATGCCATAT-ATA-ATTACATAC-T-CGCTCT-A-AACA---T-GA-AAAC--ATTTACTAGTAACATGTGATCTGC-GACTTGCGA------AGTTCATTTGCTG------CTGTGG--TAA-AGT-----GG-AA---GGCG--A-CATATA-----GACACT-TT----G-AAAAAAA---AG-----TGT-GCG----CGAACATA-TA--TGCAGGC-GA-CATA----TA-------AG-GACAGTTT-GG-TCC-A--AAA--TT-GG-GC-G-ACATTG-------CAG--GCA---GC--GAA-CA---TATA-------AG--GACAGTTT-GG--T-CCAAA--AATTGG-GCGGA--ATT--------TA---T--GC-AGGCGGAC-ATAT-AGT-GCA-GGC-ttttgtgaagggttttggtaggtggcaggtgggtagtgttgttatttgaaagtacccaactttagcgaagcgccaccttcgccaacacttttttcttctttattaaaattcaaatctatcacacatccatatgatcgaatacatacttcgcttcgaaacacattgataaacattactagtaacttttaactgctgacgcgaagatgcgctggagttaaagttgagaggggcgacatataggacactcttggaaaaaagtgggtcggacatattagtgcaggcggacagagtaagacgttggttccaaaaattgggcggacatttgtgcagggcggggacagcgtataagttcgtttggtccaaaattgggcggacatttagttgcgaggcggacacataaggaacatggcggaacatataaggac
gi|16 : TTTTTTTTTCTCTTTTATTAAAAT-TCAAA-TATATCACA-C-ATACCATAT-AT
gi|15 : TTTTCTTTCTCTTTTATTAAAATGTCAAA-TATATCACA-CAATGCCATAT-ATC-AA
gi|6 : AAA-TATATAAC------GCCATA--A-C-AATACATAC-TTCG-TC--A-A-CA---TCGATAA-C--ATTTACTA--------TAA-CT-----C--GCGA------AG---AT--GT-G------TTG-AG--TAA-AGT-----TG-GACAGGGC--GA-TATATA-A-G-GACAGT-TT----GGTCAAAA-----------T---T-G----CGGACATA-TA-GTGCA-GCGGA--ATA----TA-------AG-GACAG-TT-GG-TCC-A--AAAATTT-GG-GCGG-ACATT--------TAG-TGCA-GAGC--GGA-CA---TATA-----------GACAGTTT-GG--T-CC-AA--A---GG-GCGGACAATT--------TA-G-T--GC-AGGC-GAT-A-ATAAGG-ACA-GGCAGGA--
gi|9 : -T-CGCTC--ACAACA---T-GATATAC--ATTTACTGCTAACTTTATT-CTGCTGAC---CGA------AG---AT---C-G--------GAGG--TAAGAGTGGTCTTGAGG---GGCG-GATCATATA-T-G-ACCACT-TT----GG-AAAAAA---AG-----TG--GAG----CGGACATA-TAGGTGCAGGC-GA-CA-A----TA-------AG-GACAGTTTGGG-GCC-AATAAA--TT-GG-GCGG-ACATT--------at
gi|7 : --A-AACA---C-AATGAGCTGACTCACTG--AAATTTTAA-TGGCAGGC--G-GACATTGTAG---A---GC-GACAAGTTTG-GG--AAA-AA---------AG---GGCG-GA-CATATA-G-T-GACACT-TTTGGGGGGGGGGGG---AA-----TG--G-G----CG-ACATACTA-GTGCAGGAGGA-CATAATTATA-------GGCGACATTTT-GG-TCC-A--AAAATTT-GG-GCGGGACATT--------TAG-TGCA-G-GT--GGA-CA---TAT--------AGTCGACAGTTT-TGATT-CC-AA--AAT--G-GCGGAC-ATT--------TA-G-TGCGC-AGGCGGAC-ATATAAGG-AC
gi|4 : G-GG--AAA-AAA-----TG-G-----GCG-GA-CATATA-G-T-GACACT-TT----GGGGGGGGG---GGGGGAATG--G-G----CGGACATA-TA-GTGCAGGAGGA-CATAA---TA-------GC-GACATTTT-GG-TCC-A--AAA--TTTGG-GCGG-ACATT--------TAG-TGCA-G-GT--GGA-CA---TATA-------GC--GACAGTTTTGA--T-CC-AA--AATTGG-GCGGAC-ATT--------TA-G-T--GC-AGGCGGACAATATAAGG-AC
gi|11 : gcactgaatagtcgaactattcaatgactaaacacatggatgacgcactgaaattttaatggcaggcggacatatagcgacagtttg-----TG-CA---GGCG-CA-CATATA-A-C-GGCAAT-TT----GGTTTCAAA---AT-----TG--G-G----CGAAGATT-TA-GTATAGGCGGA-CATA----TAGTGCAGGAG-GACA
gi|14 : aaaccgggtggatatatag-----TG-CA---GGCG-GA-CATATA-A-G-GACAGT-TT----G-ATTCAAC---AT-----TC--G-G----TGGACATT-TA-GTGCAGGCGGA-CATA----cataaggac
gi|13 : g-----TG-CA---GGCG-GA-CATATA-GCG-GACAT---------------AA---AG-----TGCAG-G----CGGACATA-AA-G
gi|12 : gacagtttggtccaaaaataggcggatatttagA---GATG-GA-CATACAGA-GCGACAGT-TT----GGTCCAAAATTTGG-----TA--G-GAATTCATACGTA-TA-GTGCAGGCGGA-CAAA----TA-------AG-GA
gi|13 : tgcgggcatataagac-GACAGT-TT----GGTCCAAAA---A------TA--G-G----CGGATATT-TA-GTGCAGGCGGA-CATA----TA----------------------------------------GCGG-ACATA--------AAG-TGCA-G-GC--GGA-CA---TA-A-------AG--
gi|11 : AA---AC-----CG--G-G----TGGATATA-TA-GTGCAGGCGCA-CATA----TA-------AC-GGCAATTT-GGTTTC-A--AAA--TT-GG-GCGA-AGATT--------TAG-TATA-G-GC--GGA-CA---TATAGTGCAGGAG--GACA
gi|17 : --G-G----CGGACATA-TA-GTGCAGGCGGA-CATA----TA-------AG-Gcataaggac
gi|12 : gtgga-G----CGGGCATA-TA-AGACAGATGGA-CATA----CAG------AGCGACAGTTT-GG-TCC-A--AAA--TT-TG-GTAG-GAATTCATACGTATAG-TGCA-G-GC--GGA-CA---AATA-------AG--GAga
gi|14 : t-GTGCAGGCGGA-CATA----TA-------AG-GACAGTTT-GA-TTC-A--ACA--TT-CG-GTGG-ACATT--------TAG-TGCA-G-GC--GGA-CA---TA
gi|9 : GGCGGATCATA----TA-------TG-ACCACTTT-GG-AAA-A--AAA--GT-GGAGCGG-ACATA--------TAGGTGCA-G-GC--G-A-CA----ATA-------AG--GACAGTTT-GG--GGCC-AATAAATTGG-GCGGAC-ATT--------
gi|13 : tcgctcacaacatgatatacatttactgctaactttattctgctgaccgaagatcggaggtaagagtggtcttgagg-GACAGTTT-GG-TCC-A--AAA--AT-AG-GCGG-ATATT--------TAG-TGCA-G-GC--GGA-CA---TATA----------------------------------------GCGGAC-ATA--------AA-G-T--GC-AGGCGGAC-ATA-AAG
gi|11 : --AAA--CC-GG-GTGG-ATATA--------TAG-TGCA-G-GC--GCA-CA---TATA-------AC--GGCAATTT-GGT-T-TC-AA--AATTGG-GCGAAG-ATT--------TA-G-T--AT-AGGCGGAC-ATAT-AGT-GCA-GGA-GGAC-ACATAAG
gi|17 : G-GCGG-ACATA--------TAG-TGCA-G-GC--GGA-CA---TATA-------AG--Ggac
gi|12 : gtgga-GCGG-GCATA--------TAA-GACA-G-AT--GGA-CA---TACAG------AGC-GACAGTTT-GG--T-CC-AA--AATTTG-GTAGGA-ATTCATACGTATA-G-T--GC-AGGCGGAC-AAATAAGG-Aga
gi|14 : tG-TGCA-G-GC--GGA-CA---TATA-------AG--GACAGTTT-GA--T-TC-AA--CATTCG-GTGGAC-ATT--------TA-G-T--GC-AGGCGGAC-ATA
gi|9 : -G-GC--GGATCA---TATA-------TG--ACCACTTT-GG--A-AA-AA--AAGTGGAGCGGAC-ATA--------TAGG-T--GC-AGGC-GAC-A-ATAAGG-ACA-G
gi|17 : tcgctcacaacatgatatacatttactgctaactttattctgctgaccgaagatcggaggtaagagtggtcttgaggG-GCGGAC-ATA--------TA-G-T--GC-AGGCGGAC-ATATAAGG-tttggggccaataaattgggcggacatt
gi|14 : gtgga-G-T--GC-AGGCGGAC-ATATAAGG-ACA-Gga
gi|17 : -G-T--GG-AGGCGGAC-ATAT-AGT-GCA-GGC-GGAC-ATATAAGtttgattcaacattcggtggacatttagtgcaggcggacata
Alignments
lowQualScore : 1 1 2 222 2 1 22 333333 2 1 33 1 11 22 11111 333333333 11 1 2 3333 333 22 2 2 2 11 2 2 1 11111 11 1 1 2 11111 1 3333 1 1 1 2222 1 1 111 1 333333333 1 22222 1 11 5555555 2222 1 1 11 222222 1 1 11 3333 333333 1 1 1 11 11111 1 111111 111 1111111 111111 3333333333333333333 1111 111 1111111 1111 11111111 1111 11 1
lowQualScore : 5 5 0 111 0 5 7 6 22 88 000000 77 6 3 5 00 7 3 1 33 1 44 88888 7 444444444 11 77 3 3 1 0000 777 22 77 7 3 7 7 3 1 1 3 44 33 0 3 0 7 7 0 2 3 22222 33 0 0 0 88888 0 2222 0 3 0 0 1111 0 3 0 3 444 2 0 999999999 3 33333 3 6 1 88 1 1 8888888 3333 0 0 22 2 555555 0 0 33 3333 111111 0 2 0 7 0 0 8 6 777 1 6 8 6 55 6 11111 1 99 1 0 6 7 99 666666 000 888 5 8888888 000000 5 2222222222222222222 5 5 88 1 5 0000 999 8888888 4 4 8 3 1 3 5555 3 6 3 3 44 99 3 3 55555555 3 3 55 666 3 1111 4 00 4 66 4 4 66 4 4 1 5 6 8 0 8
lowQualScore : . . . ... . . . . .. .. ...... .. . . . .. . . . .. . .. ..... . ......... .. .. . . . .... ... .. .. . . . . . . . . .. .. . . . . . . . . ..... .. . . . ..... . .... . . . . .... . . . . ... . . ......... . ..... . . . .. . . ....... .... . . .. . ...... . . .. .... ...... . . . . . . . . ... . . . . .. . ..... . .. . . . . .. ...... ... ... . ....... ...... . ................... . . .. . . .... ... ....... . . . . . . .... . . . . .. .. . . ........ . . .. ... . .... . .. . .. . . .. . . . . . . . .
lowQualScore : 0 5 0 555 0 5 3 7 77 33 777777 77 7 3 3 77 3 3 0 33 0 77 77777 3 777777777 77 77 3 3 0 3333 000 33 33 3 7 3 3 3 0 0 3 77 33 7 3 0 3 3 0 5 2 00000 88 0 0 0 55555 0 5555 0 2 0 0 2222 0 2 0 2 888 5 0 777777777 3 77777 3 0 0 33 0 0 3333333 8888 0 0 55 5 555555 0 0 88 0000 888888 0 5 0 0 8 8 0 7 555 0 7 0 0 88 7 88888 7 22 7 8 7 5 22 444444 000 000 7 1111111 888888 0 2222222222222222222 0 0 55 0 0 6666 444 9999999 0 0 0 6 4 6 0000 6 7 6 6 66 22 3 3 44444444 6 6 00 444 6 8888 4 66 4 22 4 4 11 4 4 9 0 7 0 0 8
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACTATGCCTCAGCATGTTATTGGCTAGATTGTTTTTTTAAAATTCCTCACACATATATCTCCGTTATTGAAAGAAGGAAAACCTTAT-TAAATTTGGGGGGACTA-AGG--TTTAAGATCACATGTGGACATAAAAGA-AAAG-CT--ACATTGTGTGGGG-ATGTTCCAGCTTGCCGTGTGAT-TTGTTTGAACA-AACATAT-AATTATA-ATGAAAGACT-GT-GAGTTTGCA-CCCTTTTGA---AATTGT-TAACCTCTACA-AGCTATAAAAACTTA-CCCCCACCC-AACNTATAGGTGTCCGG-ATACAGTGGCTGATTTAGAGGGGGCAGCCGCCCCCCCCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGATAGGGCGATTTGTAAAAGCTTGACA-GCGCCGTTCC-T-T-AC--GC-AA-C-GCGCC---T-TT-GCC---GCTAAT-ACATAAT-AATGT-AA----ATAATT-TTCA-TTTTTCGCTT--CTAAGGGTGAATGCAA-GTTT---NTT---AAAG-GTGTTAACGCGA--AA-CGCGCTGT-TTTGTTA--AGGGTTTGGG------GGGGT--GGC-AGG-TGGG-GTGGTGTTGC---TAT-TTGA-AA--GTAC--GCAACT-T--A-CGAAGCGC-ACCTTCGCTCA-AACATTTTTTTTTCTCTTTTATTAAAAT-TC-AAATATATCACA-C-ATGCCATAT-ATC-AATACATACTTCGCTC--A-AACA---T-GATAAAC--ATTTACTAGTAACTTTTAA-CTGCTGAC--GCGA------AG---A--TGC-G------CTG-GG--TAA-AG-----TT----G-G-A---GGCG-GA-CATATAGGGACACT-TT----GGGGAAAAAA-G-----TGG-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-GGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-TAAG--GACAGTTT-GG--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGCGGAC-ATATAAGG-ACA-GGC-GG-ACATATAAG
Reference ( family-8199 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACTATGCCTCAGCATGTTATTGGC-AGATTGTTTTTTTAAAATTCCTC-CACATATATCTCCGTTATTGAAAGAAGGAAAACCTTATTTAANTTTGGGGGGACTATAGGCGTTTANGATCACATGTGGACATAAAAGACAAAGACTTAACATTGTGTGGGG-ATNTTCCAGCTTGCCGTGTGNTANTGTTTGAACACAACATATTANTTATATATNGAAGNCT-GTCGNGTTTGCAACCTTTTTGACGTAATTGTCTAACCCGTACATAGCTATAAAAACTTAGCCCCNACNCGAANCTATAGGTGTCCGGCATACAGTAGCTGATTTAGAGGGGGCAGCC-CCCCCCCCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGATAGGGCGATTTGTAAAAGCTTGACA-GCGCCGTTCC-T-T-AC--GC-AA-C-GCGCC---T-TT-GCC---GCTAAT-ACATAAT-AATGT-AA----ATAATT-TTCA-TTTTTCGCTT--NTAAGGGTGAATGCAA-GTTT---NTN---AAAG-GTGTTAACGCGA--NA-CGCGCTGT-TTCGTNA--AGGNTTTNGGATGCGGNGGGT--G-C-AGG-TGGG-GTGGTGTTGT---TAT-TTGA-AA--GTAC--GCAACT-T--A-CGAAGCGC-ACCTTCGCTCA-AACATTTTTTTTTCTCTTTTATTAAAAT-TC-AAATATATCACA-C-ATGCCATAT-ATC-AATACATACT-CGCTC--A-AACA---T-GATAAAC--ATTTACTAGTAACTTTTAA-CTGCTGAC--GCGA------AG---A--TGC-G------CTG-GG--TAA-AG-----TT----G-G-A---GGCG-GA-CATATAAGGACANT-TT----GGNNNAAAAA-G-----TGG-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-GGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-TAAG--GACAGTTT-GG--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGCGGAC-ATATAAGG-ACA-GGC-GG-ACATATAAG
gi|1 : GTACTATGCCTCAGCATGTTATTGGC-AGATTGTTTTTTTAAAATTCCTC-CACATATATCTCCGTTATTGAAAGAAGG-AAACCTTA--TAAA-TTGGGGGGACTA-AAGCGTTTAAGATCACATGTGGACATAAAAGA-AAAG-CT--ACATTGTGTGGGG-ATTTTCCAGCTTG-CGTGTGCT-TTGTTTG-----AACATATTAATTATA-ATGAAA--CT-GT-GAGTTTGCAATCTTTTTGA---AATTG--TAACCTCT-CA-AGCTAT-AAAACTTA-CCCCCACAC-AAACTATAGGTGTCTGG-ATACAGTAGCTGATTTAGAGGGGGCAGCC-CCCCCCCCCC
gi|1 : tatcgctgtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncGGATAGGGCGATT-GTAAA-GCTTGACATGCGCCG--CC-T-TGAC--GC-AAACAGCGCC---TGTT-GC----GCTAAT-ACATAAT-AATGTCAA----ATAATT-TTCA-TTTT-CGCTT--CTAAGGGTGAATGCAATGTTT---ATTGATAAAG-GTGTTAACGCGA--AATCGCGCTGT-TTTGTGA--AGGGTTTTGG------TAGGT--GGC-AGG-TGGG--TAGTGTTGT---TAT-TTGA-AA--GTAC--CCAACT-TTAG-CGAAGCGCCACCTTCGCC---AACACTTTTTT--CTTCTTTATTAAAAT-TC-AAATCTATCACA-C-AT-CCATATGATCGAATACATACTTCGCTTCGA-AACACATT-GATAAAC--ATT-ACTAGTAACTTTTAA-CTGCTGAC--GCGA------AG---A--TGC-G------CTG-GAGTTAA-AG-----TT----GAG-A---GGGGCGA-CATAT-AGGACACTCTT----GG--AAAAAA-G-----TGG-GTCGGACATATTA-GTGCAGGCGGACA-GAG---TA-A--GAC-GTTG-GTTCCAA--AAA--TT-GGGCGG-ACATT--------T-GTGCAGG-GCGGGGACAGCGTA-TAAG--TTC-GTTT-GG--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAGTT--GCGAGGCGGAC-ACATAAGGAACATGGC-GGAACATATAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggatagggcgattgtaaagcttgacatgcgccgccttgacgcaaacagcgcctgttgcgctaatacataataatgtcaaataattttcattttcgcttctaagggtgaatgcaatgtttattgataaaggtgttaacgcgaaatcgcgctgttttgtgaagggttttggtaggtggcaggtgggtagtgttgttatttgaaagtacccaactttagcgaagcgccaccttcgccaacacttttttcttctttattaaaattcaaatctatcacacatccatatgatcgaatacatacttcgcttcgaaacacattgataaacattactagtaacttttaactgctgacgcgaagatgcgctggagttaaagttgagaggggcgacatataggacactcttggaaaaaagtgggtcggacatattagtgcaggcggacagagtaagacgttggttccaaaaattgggcggacatttgtgcagggcggggacagcgtataagttcgtttggtccaaaattgggcggacatttagttgcgaggcggacacataaggaacatggcggaacatataaggac
gi|10 : tatcgctgtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtactatgcctcagcatgttattggcagattgtttttttaaaattcctccacatatatctccgttattgaaagaaggaaaccttataaattggggggactaaagcgtttaagatcacatgtggacataaaagaaaagctacattgtgtggggattttccagcttgcgtgtgctttgtttgaacatattaattataatgaaactgtgagtttgcaatctttttgaaattgtaacctctcaagctataaaacttacccccacacaaactataggtgtctggatacagtagctgatttagagggggcagccccccccccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTGGACA-GCGCCGTTCCCT-T-ATCTGCCAA-CTGCGCC---T-TTTGCCCAAGCTAAT-ACAAAAT-AATGT-AA----AGAATT-T--A-TTTTTGGCTTTGCTAA-GGTGAATGCAA-TTTgac
gi|11 : --AAA--CC-GGGTGG-ATATA--------TAGTGCA-G-GC--GCACA---TA-TAAC--GGCAATTT-GGT-TTC-AAAATT-GGGCGAAG-ATTTAG-T--AT-AGGCGGAC-ATAT-AGT-GCA-GGA-GG-ACACATAAGaattgagtaaa
gi|12 : -G-CGGGCATA-TA-AGACAGATGGACA-TA----CAGAGCGACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-TGGTAG-GAATTCATACGTATAGTGCA-G-GC--GGACA---AA-TAAG--GAgac
gi|13 : t-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--AT-AGGCGG-ATATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-TA------------------------------GCGGAC-ATAAAG-T--GC-AGGCGGAC-ATA-AAG
gi|14 : -GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GATTC-A--ACA--TT-CGGTGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-
gi|15 : TTTTCTTTCTCTTTTATTAAAATGTC-AAATATATCACA-CAATGCCATAT-ATC-AA
gi|16 : TTTTTTTTTCTCTTTTATTAAAAT-TC-AAATATATCACA-C-ATACCATAT-AT
gi|17 : G-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-G
gi|2 : gtggaGTACTATGCCTCA-CATGTTAT-GGCTAGATTGTTTT---AAAATTCCTCACATATATATCTCCGTTAT-GAAAGAAGGAAAACCTTAT--AAATTTGGGGGGACTAAAG---TTTAAGATCACATGTGGACATAAAAGA-AAAGCCT--ACATTGTGTGGGGGATGTTCCAGCTTGC-GTGTGAT-TTGTTTGAACA--GC-TAT-AATTA-----AGAAAACTTGT-GAGTTTGCATC--TTTTGA---AATTGT-TAACCTCTACA-AGCTATAAA--CTTA-CCCCCACCC-AACATATAG-TGTCTGG-ATACAGTGGCTGATTTAGAGGGGGCAGCCGCCCCCCCCCCga
gi|2 : tgctacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGATAGGGCGATTTGTAAAAGCTTGACA-GCGC-GTTCC-T-T-AC--GC-AA-C-GCGCC---T-TT-GC----GCTAAT-ACATAAT-AATGT-AA----ATAATT-TTCA-TTTTTCGCTT--CTAAGGGTGAATGCAA-GTTT---GTA---AAAGCGTGTTAACGCAA--GA-CGCGCTGT-TTTGTTA--AGGGTTTGGG------GGGGT--G-C-AGG-TGGG-GTAGTGTTGC----AT-TTGA-AA--GTA---GCAACT----A-CGAAGCGC-ACCTTCGCTCA-AACATTTTTTTTTCTCTTTTATTAAAAT-TC-AAATATATCACA-C-ATGCCATAT-ATC-AATACATACT-CGCTC--A-AACA---T-GATAAAC--ATTTACTAGTAACTTTTAA-CTGCTGAC--GCGA------AG---A--TGC-G------CTG-GG--TAA-AG-----TT----G-G-A---GGCG-GA-CATATAAGGACACT-TT----GGAAAAAAAA-G-----TGG-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-GGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-TAAG--GACAGTTT-GG--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGCGGAC-ATATAAGG-ACA-GGC-GG-A-ATATAAGccccccccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggatagggcgatttgtaaaagcttgacagcgcgttccttacgcaacgcgcctttgcgctaatacataataatgtaaataattttcatttttcgcttctaagggtgaatgcaagtttgtaaaagcgtgttaacgcaagacgcgctgttttgttaagggtttgggggggtgcaggtggggtagtgttgcatttgaaagtagcaactacgaagcgcaccttcgctcaaacatttttttttctcttttattaaaattcaaatatatcacacatgccatatatcaatacatactcgctcaaacatgataaacatttactagtaacttttaactgctgacgcgaagatgcgctgggtaaagttggaggcggacatataaggacactttggaaaaaaaagtgggcggacatatagtgcaggcggacatataaggacagtttggtccaaaattgggcggacatttagtgcaggcggacatataaggacagtttggtccaaaattgggcggacatttagtgcaggcggacatataaggacaggcggaatataagactc
gi|3 : tgctacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtactatgcctcacatgttatggctagattgttttaaaattcctcacatatatatctccgttatgaaagaaggaaaaccttataaatttggggggactaaagtttaagatcacatgtggacataaaagaaaagcctacattgtgtgggggatgttccagcttgcgtgtgatttgtttgaacagctataattaagaaaacttgtgagtttgcatcttttgaaattgttaacctctacaagctataaacttacccccacccaacatatagtgtctggatacagtggctgatttagagggggcagccgccccccccccccccccccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGT--GGC-AGGATGGG-GTG---TT-C---TATATTGA-AATAGTATTAGCAACT-T--AACGAAGCGC-ACTCTCGCTCA-AACA-TTTTTTTTCTCTTTT-TTAAAAT-TCAAAATATATCACATC-ATGCCATAT-ATA-ATTACATACT-CGCTCT-A-AACA---T-GA-AAAC--ATTTACTAGTAACATGTGATCTGC-GACTTGCGA------AGTTCATTTGCTG------CTGTGG--TAA-AG-----TG----G-A-A---GGC--GA-CATATA--GACACT-TT----GAAAAAAAAGTG-----TGC-G-CGAACATA-TA--TGCAGGC-GACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-GGGC-G-ACATTG-------CAG-GCA---GC--GAACA---TA-TAAG--GACAGTTT-GG--TCCAAAAATT-GGGCGGA--ATTTA--T--GC-AGGCGGAC-ATAT-AGT-GCA-GGC-actc
gi|4 : GA------TG---A--CGC-A------CTG------AA-AT-----TTTAATG-GCA---GGCG-GA-CATATAGCGACAGT-TT----GGGGAAAAAA-------TGG-G-CGGACATA-TA-GTG-------ACACTT----TG-GG-GGGGGGGG-GG-------GAA--T--GGGCGG-ACATA--------TAGTGCA-G-GA--GGACA---TAATAGC--GACATTTT-GG--TCC-AAAATTTGGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGTGGAC-ATATAGCG-ACA-G
gi|4 : gcactgaatagtcgaactattcaatgactaaacacatgG-GG--AAA-AA-----AT----G-G------GCG-GA-CATATAGTGACACT-TT----GGGGGGGGGG-GGGGAATGG-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGAGGACA-TAA---TA-GC-GACATTTT-GGTCC-A--AAA--TTTGGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GT--GGACA---TA-TAGC--GACAGTTTTGA--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGCGGACAATATAAGG-ACttttgatccaaaattgggcggacatttagtgcaggcggacaatataaggac
gi|5 : gcactgaatagtcgaactattcaatgactaaacacatggatgacgcactgaaattttaatggcaggcggacatatagcgacagtttgCGATTTGTAAAAGCTTGTCA-GCGCCGTTTA-TCT-AC--GC-AA-C-GCGCCATTT-TT-GCC---GCTAATGAC-TAATAAATGT-AATCAGATAATTATTCACTTTCTCACTT--GTAAGGGTGAATGCAA-GTTCATGTTT---AAAG-GTGGTAACGCGAAGAA-CGCACTGTATTTGTTAGGAGGTTTTGGGATGCGGGGGGTCGG-CGAGG-AGGGCGTGGTGGTGTGTCCGT-ATGATAA--TTA---ACAACTAT--A-CGCAGCCC-ACCTTCGCTCACAACA
gi|6 : cgat-AAATATATAAC------GCCATA--A-C-AATACATACTTCG-TC--A-A-CA---TCGATAA-C--ATTTACTA--------TAA-CT-----C--GCGA------AG---A--TGT-G------TTG-AG--TAA-AG-----TT----G-G-ACAGGGCG--A-TATATAAGGACAGT-TT----GGTC--AAAA-T-----T---G-CGGACATA-TA-GTGCA-GCGGA-A-TA----TA-AG-GACAG-TT-GGTCC-A--AAAATTT-GGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-GAGC--GGACA---TA-TA----GACAGTTT-GG--TCC-AAA----GGGCGGACAATTTAG-T--GC-AGGC-GAT-A-ATAAGG-ACA-GGCAGG-AAAT
gi|7 : --A-AACA---C-AATGAGCTGACTCACTG--AAATTTTAA-TGGCAGGC--G-GACATTGTAG---A---GC-GACAAGTTTG-GG--AAA-AA-------------A-G---GGCG-GA-CATATAGTGACACT-TTTGGGGGGGGGGGGA-A-----TGG-G-CG-ACATACTA-GTGCAGGAGGACA-TAATTATA-GGCGACATTTT-GGTCC-A--AAAATTT-GGGCGGGACATT--------TAGTGCA-G-GT--GGACA---TA-T-AGTCGACAGTTT-TGATTCC-AAAAT---GGCGGAC-ATTTAG-TGCGC-AGGCGGAC-ATATAAGG-AC
gi|8 : AGGAAAAC-TTATTTAATTTTGGGGGGACTATAGG--TTTAC-ATCA---GTAGACATAAAAGACAAAGACTTAACATTGTG-AGGG-ATGTTCCAGCTTGCCGTGTGATAGTATTTGAACACAACATAT--ATT-TATATGAAAGACT-GTCGTGTTTGCA--CCTTTTGACGTAATTGTCTAACCCGTACATAGCTATAAAAACTTAGCCCCAACCCGAACTTATA-GTGTCCGGCATACAGT
gi|9 : T-CGCTC--ACAACA---T-GATATAC--ATTTACTGCTAACTTTATT-CTGCTGAC---CGA------AG---A--T-C-G--------GAGG--TAAGAGTGGTCTT----GAG-G---GGCG-GATCATATATGACCACT-TT----GG-AAAAAAA-G-----TGGAG-CGGACATA-TAGGTGCAGGC-GACA--A----TA-AG-GACAGTTTGGGGCC-AATAAA--TT-GGGCGG-ACATT--------
Alignments
lowQualScore : 1 1 1 222 1 1 2 22 1 11 1 222222 1 2 1 44444 22 11 1 3333 222 22 1 1 1 2 1 1 1 11111 11 1 1 2 11111 1 3333 1 1 1 2222 1 1 11 1 2222222222 1 11111 1 11 333333 1 1 1 11 222222 1 1 11 3333 333333 1 1 1 11 11111 1 111111 111 1111111 111111 3333333333333333333 1111 1111111 1111 11111111 1111 11 1
lowQualScore : 5 5 5 111 5 5 7 6 3 00 3 0 88 6 6 3 666666 7 3 3 3 33333 7 22 7 99 3 2222 333 00 7 3 7 7 3 3 1 3 0 3 5 7 7 0 2 3 22222 33 0 0 0 88888 0 2222 0 3 0 0 1111 0 3 0 3 33 2 0 5555555555 3 88888 3 88 888888 0 2 0 0 22 2 111111 0 0 33 3333 111111 0 2 0 66 0 8 6 777 1 6 8 0 55 6 11111 1 99 1 0 6 7 99 666666 000 888 5 8888888 000000 5 2222222222222222222 5 5 99 0000 3 0 8888888 4 4 8 3 3 5555 3 6 3 3 44 99 3 3 55555555 3 3 55 666 3 1111 4 00 4 66 4 4 66 4 4 1 5 6 8 0 8
lowQualScore : . . . ... . . . . . .. . . .. . . . ...... . . . . ..... . .. . .. . .... ... .. . . . . . . . . . . . . . . . . ..... .. . . . ..... . .... . . . . .... . . . . .. . . .......... . ..... . .. ...... . . . . .. . ...... . . .. .... ...... . . . .. . . . ... . . . . .. . ..... . .. . . . . .. ...... ... ... . ....... ...... . ................... . . .. .... . . ....... . . . . . .... . . . . .. .. . . ........ . . .. ... . .... . .. . .. . . .. . . . . . . . .
lowQualScore : 0 5 5 555 5 5 3 7 7 77 3 7 33 7 7 3 000000 3 3 3 3 77777 3 77 3 00 3 7777 333 77 3 3 3 3 3 3 0 3 7 3 0 3 3 0 5 2 00000 88 0 0 0 55555 0 5555 0 2 0 0 2222 0 2 0 2 88 5 0 8888888888 3 77777 3 33 333333 0 5 0 0 55 5 000000 0 0 88 0000 888888 0 5 0 44 8 0 7 555 0 7 0 6 88 7 88888 7 22 7 8 7 5 22 444444 000 000 7 1111111 888888 0 2222222222222222222 0 0 00 6666 4 9 9999999 0 0 0 6 6 0000 6 7 6 6 66 22 3 3 44444444 6 6 00 444 6 8888 4 66 4 22 4 4 11 4 4 9 0 7 0 0 8
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACTATGCCTCAGCATGTTATTGGCTAGATTGTTTTTTTAAAATTCCTCACACATATATCTCCGTTATTGAAAGAAGGAAAACCTTAT-AAATTT-GGGGGGACTA-AAG--TTTAAGATCACATGTGGACATAAAAGA-AAAG-C-T--ACATTGTGTGGGG-ATGTTCCAGCTTGC-GTGTGAT-TTGTTTGAACA-G-CATATAATTAT-ATGAAAG-CTGT-GAGTTTGCA-TCCTTTTGA---AATTGT-TAACCTCTACA-AGCTATAAAAACTTA-CCCCCACCC-AACNTATA-GTGTCCGG-ATACAGTGGCTGATTTAGAGGGGGCAGCCGCCCCCCCCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGATAGGGCGATTTGTAAAAGCTTGACA-GCGCCGTTCC-T-T-AC--GC-AA-C-GCGCC---T-TT-GCC---GCTAAT-ACATAAT-AATGT-AA----ATAATT-TTCA-TTTTTCGCTT--CTAAGGGTGAATGCAA-GTTC---GTT---AAAG-GTGTTAACGCGA--AA-CGCGCTGT-TTTGTTA--AGGGTTTG------GGGGGGT-GGC-AGG-TGGG-GTGGTGTTG---CTAT-TTGA-AA--GTAC--GCAACT-T--A-CGAAGCGC-ACCTTCGCTCA-AACATTTTTTTTTCTCTTTTATTAAAAT-TCAAA-TATATCACA-C-ATGCCATAT-ATC-AATACATACTTCGCTC--A-AACA---T-GATAAAC--ATTTACTAGTAACTTTTAA-CTGCTGAC--GCGA------AG---AT--GC-G------CTG-GG--TAA-AGT-----T----G-G-A---GGCG-GA-CATATAGGGACACTTT----GGGGAAAAAA-G-----TGG-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-GGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-TAAG--GACAGTTT-GG--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGCGGAC-ATATAAGG-ACA-GGC-GG-ACATATAAG
Reference ( family-8199 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACTATGCCTCAGCATGTTATTGGCTAGATTGTTTTTTTAAAATTCCTCACACATATATCTCCGTTATTGAAAGAAGGAAAACCTTATTAAATTT-GGGGGGACTA-AGG--TTTAAGATCACATGTGGACATAAAAGA-AAAG-C-T--ACATTGTGTGGGG-ATGTTCCAGCTTGCCGTGTGAT-TTGTTTGAACA-AACATATAATTATAATGAAAGACTGT-GAGTTTGCA-CCCTTTTGA---AATTGT-TAACCTCTACA-AGCTATAAAAACTTA-CCCCCACCC-AACNTATAGGTGTCCGG-ATACAGTGGCTGATTTAGAGGGGGCAGCCGCCCCCCCCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGATAGGGCGATTTGTAAAAGCTTGACA-GCGCCGTTCC-T-T-AC--GC-AA-C-GCGCC---T-TT-GCC---GCTAAT-ACATAAT-AATGT-AA----ATAATT-TTCA-TTTTTCGCTT--CTAAGGGTGAATGCAA-GTTT---NTT---AAAG-GTGTTAACGCGA--AA-CGCGCTGT-TTTGTTA--AGGGTTTG------GGGGGGT-GGC-AGG-TGGG-GTGGTGTTG---CTAT-TTGA-AA--GTAC--GCAACT-T--A-CGAAGCGC-ACCTTCGCTCA-AACATTTTTTTTTCTCTTTTATTAAAAT-TCAAA-TATATCACA-C-ATGCCATAT-ATC-AATACATACTTCGCTC--A-AACA---T-GATAAAC--ATTTACTAGTAACTTTTAA-CTGCTGAC--GCGA------AG---AT--GC-G------CTG-GG--TAA-AGT-----T----G-G-A---GGCG-GA-CATATAGGGACACTTT----GGGGAAAAAA-G-----TGG-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-GGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-TAAG--GACAGTTT-GG--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGCGGAC-ATATAAGG-ACA-GGC-GG-ACATATAAG
gi|1 : GTACTATGCCTCAGCATGTTATTGGC-AGATTGTTTTTTTAAAATTCCTC-CACATATATCTCCGTTATTGAAAGAAGGAAA-CCTTAT-AAATT--GGGGGGACTA-AAGCGTTTAAGATCACATGTGGACATAAAAGA-AAAG-C-T--ACATTGTGTGGGG-ATTTTCCAGCTTGC-GTGTGCT-TTGTTTGAACA---TAT-TAATTATAATGAAA--CTGT-GAGTTTGCAATCTTTTTGA---AATTGT--AACCTCT-CA-AGCTATAAAA-CTTA-CCCCCACAC-AAACTATAGGTGTCTGG-ATACAGTAGCTGATTTAGAGGGGGCAGCC-CCCCCCCCCC
gi|1 : tatcgctgtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncGGATAGGGCGATT-GTAAA-GCTTGACATGCGCCG--CC-T-TGAC--GC-AAACAGCGCC---TGTT-GC----GCTAAT-ACATAAT-AATGTCAA----ATAATT-TTCA-TTTT-CGCTT--CTAAGGGTGAATGCAATGTTT---ATTGATAAAG-GTGTTAACGCGA--AATCGCGCTGT-TTTGTGA--AGGGTTTT------GGTAGGT-GGC-AGG-TGGG--TAGTGTTG---TTAT-TTGA-AA--GTAC--CCAACT-TTAG-CGAAGCGCCACCTTCGCC---AACACTTTTTT--CTTCTTTATTAAAAT-TCAAA-TCTATCACA-C-AT-CCATATGATCGAATACATACTTCGCTTCGA-AACACATT-GATAAAC--ATT-ACTAGTAACTTTTAA-CTGCTGAC--GCGA------AG---AT--GC-G------CTG-GAGTTAA-AGT-----T----GAG-A---GGGGCGA-CATATA-GGACACTCT-----TGGAAAAAA-G-----TGG-GTCGGACATATTA-GTGCAGGCGGACA-GAG---TA-A--GAC-GTTG-GTTCCAA--AAA--TT-GGGCGG-ACATT--------T-GTGCAGG-GCGGGGACAGCGTA-TAAG--TTC-GTTT-GG--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAGTT--GCGAGGCGGAC-ACATAAGGAACATGGC-GGAACATATAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggatagggcgattgtaaagcttgacatgcgccgccttgacgcaaacagcgcctgttgcgctaatacataataatgtcaaataattttcattttcgcttctaagggtgaatgcaatgtttattgataaaggtgttaacgcgaaatcgcgctgttttgtgaagggttttggtaggtggcaggtgggtagtgttgttatttgaaagtacccaactttagcgaagcgccaccttcgccaacacttttttcttctttattaaaattcaaatctatcacacatccatatgatcgaatacatacttcgcttcgaaacacattgataaacattactagtaacttttaactgctgacgcgaagatgcgctggagttaaagttgagaggggcgacatataggacactcttggaaaaaagtgggtcggacatattagtgcaggcggacagagtaagacgttggttccaaaaattgggcggacatttgtgcagggcggggacagcgtataagttcgtttggtccaaaattgggcggacatttagttgcgaggcggacacataaggaacatggcggaacatataaggac
gi|10 : tatcgctgtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtactatgcctcagcatgttattggcagattgtttttttaaaattcctccacatatatctccgttattgaaagaaggaaaccttataaattggggggactaaagcgtttaagatcacatgtggacataaaagaaaagctacattgtgtggggattttccagcttgcgtgtgctttgtttgaacatattaattataatgaaactgtgagtttgcaatctttttgaaattgtaacctctcaagctataaaacttacccccacacaaactataggtgtctggatacagtagctgatttagagggggcagccccccccccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTGGACA-GCGCCGTTCCCT-T-ATCTGCCAA-CTGCGCC---T-TTTGCCCAAGCTAAT-ACAAAAT-AATGT-AA----AGAATT-T--A-TTTTTGGCTTTGCTAA-GGTGAATGCAA-TTTA---ATT---GAgac
gi|11 : --AAA--CC-GGGTGG-ATATA--------TAGTGCA-G-GC--GCACA---TA-TAAC--GGCAATTT-GGT-TTC-AAAATT-GGGCGAAG-ATTTAG-T--AT-AGGCGGAC-ATAT-AGT-GCA-GGA-GG-ACACATAAGgtaaa
gi|12 : -G-CGGGCATA-TA-AGACAGATGGACA-TA----CAGAGCGACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-TGGTAG-GAATTCATACGTATAGTGCA-G-GC--GGACA---AA-TAAG--GAgac
gi|13 : t-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--AT-AGGCGG-ATATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-TA------------------------------GCGGAC-ATAAAG-T--GC-AGGCGGAC-ATA-AAG
gi|14 : -GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GATTC-A--ACA--TT-CGGTGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-
gi|15 : TTTTCTTTCTCTTTTATTAAAATGTCAAA-TATATCACA-CAATGCCATAT-ATC-AA
gi|16 : TTTTTTTTTCTCTTTTATTAAAAT-TCAAA-TATATCACA-C-ATACCATAT-AT
gi|17 : G-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-G
gi|2 : gtggaGTACTATGCCTCA-CATGTTAT-GGCTAGATTGTTTT---AAAATTCCTCACATATATATCTCCGTTAT-GAAAGAAGGAAAACCTTAT-AAATTT-GGGGGGACTA-AAG--TTTAAGATCACATGTGGACATAAAAGA-AAAG-CCT--ACATTGTGTGGGGGATGTTCCAGCTTGC-GTGTGAT-TTGTTTGAACA-G-C-TATAATTA--A-GAAAACTTGT-GAGTTTGCA-TC-TTTTGA---AATTGT-TAACCTCTACA-AGCTAT--AAACTTA-CCCCCACCC-AACATATA-GTGTCTGG-ATACAGTGGCTGATTTAGAGGGGGCAGCCGCCCCCCCCCCga
gi|2 : tgctacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGATAGGGCGATTTGTAAAAGCTTGACA-GCGC-GTTCC-T-T-AC--GC-AA-C-GCGCC---T-TT-GC----GCTAAT-ACATAAT-AATGT-AA----ATAATT-TTCA-TTTTTCGCTT--CTAAGGGTGAATGCAA-GTTT---GTA---AAAGCGTGTTAACGCAA--GA-CGCGCTGT-TTTGTTA--AGGGTTTG------GGGGGGT-G-C-AGG-TGGG-GTAGTGTTG---C-AT-TTGA-AA--GTA---GCAACT----A-CGAAGCGC-ACCTTCGCTCA-AACATTTTTTTTTCTCTTTTATTAAAAT-TCAAA-TATATCACA-C-ATGCCATAT-ATC-AATACATACT-CGCTC--A-AACA---T-GATAAAC--ATTTACTAGTAACTTTTAA-CTGCTGAC--GCGA------AG---AT--GC-G------CTG-GG--TAA-AGT-----T----G-G-A---GGCG-GA-CATATAAGGACACTTT----GGAAAAAAAA-G-----TGG-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-GGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-TAAG--GACAGTTT-GG--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGCGGAC-ATATAAGG-ACA-GGC-GG-A-ATATAAGccccccccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggatagggcgatttgtaaaagcttgacagcgcgttccttacgcaacgcgcctttgcgctaatacataataatgtaaataattttcatttttcgcttctaagggtgaatgcaagtttgtaaaagcgtgttaacgcaagacgcgctgttttgttaagggtttgggggggtgcaggtggggtagtgttgcatttgaaagtagcaactacgaagcgcaccttcgctcaaacatttttttttctcttttattaaaattcaaatatatcacacatgccatatatcaatacatactcgctcaaacatgataaacatttactagtaacttttaactgctgacgcgaagatgcgctgggtaaagttggaggcggacatataaggacactttggaaaaaaaagtgggcggacatatagtgcaggcggacatataaggacagtttggtccaaaattgggcggacatttagtgcaggcggacatataaggacagtttggtccaaaattgggcggacatttagtgcaggcggacatataaggacaggcggaatataagactc
gi|3 : tgctacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtactatgcctcacatgttatggctagattgttttaaaattcctcacatatatatctccgttatgaaagaaggaaaaccttataaatttggggggactaaagtttaagatcacatgtggacataaaagaaaagcctacattgtgtgggggatgttccagcttgcgtgtgatttgtttgaacagctataattaagaaaacttgtgagtttgcatcttttgaaattgttaacctctacaagctataaacttacccccacccaacatatagtgtctggatacagtggctgatttagagggggcagccgccccccccccccccccccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGT-GGC-AGGATGGG-GTG---TT----CTATATTGA-AATAGTATTAGCAACT-T--AACGAAGCGC-ACTCTCGCTCA-AACATTTTTTTT-CTCTTTT-TTAAAAT-TCAAAATATATCACATC-ATGCCATAT-ATA-ATTACATACT-CGCTCT-A-AACA---T-GA-AAAC--ATTTACTAGTAACATGTGATCTGC-GACTTGCGA------AGTTCATTTGCTG------CTGTGG--TAA-AGT-----G----G-A-A---GGCG--A-CATATAG--ACACTTT----GAAAAAAAAGTG-----TGC-G-CGAACATA-TA--TGCAGGCG-ACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-GGGC-G-ACATTG-------CAG-GCA---GC--GAACA---TA-TAAG--GACAGTTT-GG--TCCAAAAATT-GGGCGGA--ATTTA--T--GC-AGGCGGAC-ATAT-AGT-GCA-GGC-actc
gi|4 : GA------TG---AC--GC-A------CTG------AA-ATT-----TTAATG-GCA---GGCG-GA-CATATAGCGACAGTTT----GGGGAAAAAA-------TGG-G-CGGACATA-TA-GTG-------ACACTT----TG-GG-GGGGGGGG-GG-------GAA--T--GGGCGG-ACATA--------TAGTGCA-G-GA--GGACA---TAATAGC--GACATTTT-GG--TCC-AAAATTTGGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGTGGAC-ATATAGCG-ACA-G
gi|4 : gcactgaatagtcgaactattcaatgactaaacacatgG-GG--AAA-AAA-----T----G-G------GCG-GA-CATATAGTGACACTTT----GGGGGGGGGG-GGGGAATGG-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGAGGACA-TAA---TA-GC-GACATTTT-GGTCC-A--AAA--TTTGGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GT--GGACA---TA-TAGC--GACAGTTTTGA--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGCGGACAATATAAGG-ACttttgatccaaaattgggcggacatttagtgcaggcggacaatataaggac
gi|5 : gcactgaatagtcgaactattcaatgactaaacacatggatgacgcactgaaattttaatggcaggcggacatatagcgacagtttgCGATTTGTAAAAGCTTGTCA-GCGCCGTTTA-TCT-AC--GC-AA-C-GCGCCATTT-TT-GCC---GCTAATGAC-TAATAAATGT-AATCAGATAATTATTCACTTTCTCACTT--GTAAGGGTGAATGCAA-GTTCATGTTT---AAAG-GTGGTAACGCGAAGAA-CGCACTGTATTTGTTAGGAGGTTTTGGGATGCGGGGGGTCGGCGAGG-AGGGCGTGGTGGTGTGTCCGT-ATGATAA--TTA---ACAACTAT--A-CGCAGCCC-ACCTTCGCTCACAACA
gi|6 : cgatAAA-TATATAAC------GCCATA--A-C-AATACATACTTCG-TC--A-A-CA---TCGATAA-C--ATTTACTA--------TAA-CT-----C--GCGA------AG---AT--GT-G------TTG-AG--TAA-AGT-----T----G-G-ACAGGGC--GA-TATATAAGGACAGTTT----GGTCAAAA---------T-T-G-CGGACATA-TA-GTGCA-GCGGA-A-TA----TA-AG-GACAG-TT-GGTCC-A--AAAATTT-GGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-GAGC--GGACA---TA-TA----GACAGTTT-GG--TCC-AAA----GGGCGGACAATTTAG-T--GC-AGGC-GAT-A-ATAAGG-ACA-GGCAGG-AAAT
gi|7 : --A-AACA---C-AATGAGCTGACTCACTG--AAATTTTAA-TGGCAGGC--G-GACATTGTAG---A---GC-GACAAGTTTG-GG--AAA-AA-------------A-G---GGCG-GA-CATATAGTGACACTTTTGGGGGGGGGGGGA-A-----TGG-G-CG-ACATACTA-GTGCAGGAGGACA-TAATTATA-GGCGACATTTT-GGTCC-A--AAAATTT-GGGCGGGACATT--------TAGTGCA-G-GT--GGACA---TA-T-AGTCGACAGTTT-TGATTCC-AAAAT---GGCGGAC-ATTTAG-TGCGC-AGGCGGAC-ATATAAGG-AC
gi|8 : AGGAAAAC-TTATTTAATTTTGGGGGGACTATAGG--TTTAC-ATCA---GTAGACATAAAAGACAAAGAC-TTAACATTGTG-AGGG-ATGTTCCAGCTTGCCGTGTGATAGTATTTGAACACAACATATATTTAT-ATGAAAGACTGTCGTGTTTGCA--CCTTTTGACGTAATTGTCTAACCCGTACATAGCTATAAAAACTTAGCCCCAACCCGAACTTATA-GTGTCCGGCATACAGT
gi|9 : TCGCTC--ACAACA---T-GATATAC--ATTTACTGCTAACTTTATT-CTGCTGAC---CGA------AG---AT---C-G--------GAGG--TAAGAGTGGTCTT----GAG-G---GGCG-GATCATATATGACCACTTT----GGA-AAAAAA-G-----TGGAG-CGGACATA-TAGGTGCAGGC-GACA--A----TA-AG-GACAGTTTGGGGCC-AATAAA--TT-GGGCGG-ACATT--------
Alignments
lowQualScore : 1 1 1 222 1 1 11 1 11 1 222222 1 1 1 33333 22 22 1 1 2222 222 22 1 22 1 1 1 1 1 11111 11 1 1 2 11111 1 3333 1 1 1 2222 1 1 11 1 3333333333 1 11111 1 11 333333 1 1 1 11 222222 1 1 11 3333 333333 1 1 1 11 11111 1 111111 111 1111111 111111 3333333333333333333 1111 1111111 1111 11111111 1111 11 1
lowQualScore : 5 5 5 111 5 5 7 6 88 7 3 88 6 6 3 666666 7 3 3 3 33333 7 7 00 55 3 3 2222 333 00 7 3 22 3 3 1 3 0 3 2 7 7 0 2 3 22222 33 0 0 0 88888 0 2222 0 3 0 0 1111 0 3 0 3 33 2 0 8888888888 3 88888 3 88 888888 0 2 0 0 22 2 111111 0 0 33 3333 111111 0 2 0 66 0 8 6 777 1 6 8 0 55 6 11111 1 99 1 0 6 7 99 666666 000 888 5 8888888 000000 5 2222222222222222222 5 5 99 0000 3 0 8888888 4 4 8 3 3 5555 3 6 3 3 44 99 3 3 55555555 3 3 55 666 3 1111 4 00 4 66 4 4 66 4 4 1 5 6 8 0 8
lowQualScore : . . . ... . . . . .. . . .. . . . ...... . . . . ..... . . .. .. . . .... ... .. . . .. . . . . . . . . . . . . ..... .. . . . ..... . .... . . . . .... . . . . .. . . .......... . ..... . .. ...... . . . . .. . ...... . . .. .... ...... . . . .. . . . ... . . . . .. . ..... . .. . . . . .. ...... ... ... . ....... ...... . ................... . . .. .... . . ....... . . . . . .... . . . . .. .. . . ........ . . .. ... . .... . .. . .. . . .. . . . . . . . .
lowQualScore : 0 5 5 555 5 5 3 7 33 3 3 33 7 7 3 000000 3 3 3 3 00000 3 3 77 33 3 3 7777 333 77 3 3 77 3 3 0 3 7 3 5 3 3 0 5 2 00000 88 0 0 0 55555 0 5555 0 2 0 0 2222 0 2 0 2 88 5 0 7777777777 3 77777 3 33 333333 0 5 0 0 55 5 000000 0 0 88 0000 888888 0 5 0 44 8 0 7 555 0 7 0 6 88 7 88888 7 22 7 8 7 5 22 444444 000 000 7 1111111 888888 0 2222222222222222222 0 0 00 6666 4 9 9999999 0 0 0 6 6 0000 6 7 6 6 66 22 3 3 44444444 6 6 00 444 6 8888 4 66 4 22 4 4 11 4 4 9 0 7 0 0 8
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACTATGCCTCAGCATGTTATTGGCTAGATTGTTTTTTTAAAATTCCTCACACATATATCTCCGTTATTGAAAGAAGGAAAACCTTAT--AAATTTGGGGGGACTA-AAG--TTTAAGATCACATGTGGACATAAAAGA-AAAG-C-T--ACATTGTGTGGGG-ATGTTCCAGCTTGC-GTGTGAT-TTGTTTGAACA--GCATATAATTATA-TGAAAG-CT-GT-GAGTTTGCA-TCCTTTTGA---AATTGT-TAACCTCTACA-AGCTATAAAA-CTTA-CCCCCACCC-AACNTATA-GTGTCCGG-ATACAGTGGCTGATTTAGAGGGGGCAGCCNCCCCCCCCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGATAGGGCGATTTGTAAAAGCTTGACA-GCGCCGTTCC-T-T-AC--GC-AA-C-GCGCC---T-TT-GCC---GCTAAT-ACATAAT-AATGT-AA----ATAATT-TTCA-TTTTTCGCTT--CTAAGGGTGAATGCAA-GTTTA---TT---AAAG-GTGTTAACGCGA--AA-CGCGCTGT-TTTGTTA--AGGGTTTG------GGGGGGT-GGC-AGG-TGGG-GTGGTGTTG---CTAT-TTGA-AA--GTAC--GCAACT-T--A-CGAAGCGC-ACCTTCGCTCA-AACATTTTTTTTTCTCTTTTATTAAAAT-TCAAA-TATATCACA-C-ATGCCATAT-ATC-AATACATACTTCGCTC--A-AACA---T-GATAAAC--ATTTACTAGTAACTTTTAA-CTGCTGAC--GCGA------AG---AT--GC-G------CTG-GG--TAA-AGT-----T----G-G-A---GGCG-GA-CATATAGGGACACTTT----GGGGAAAAAA-G-----TGG-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-GGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-TAAG--GACAGTTT-GG--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGCGGAC-ATATAAGG-ACA-GGC-GG-ACATATAAG
Reference ( family-8199 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACTATGCCTCAGCATGTTATTGGCTAGATTGTTTTTTTAAAATTCCTCACACATATATCTCCGTTATTGAAAGAAGGAAAACCTTAT--AAATTTGGGGGGACTA-AAG--TTTAAGATCACATGTGGACATAAAAGA-AAAG-C-T--ACATTGTGTGGGG-ATGTTCCAGCTTGC-GTGTGAT-TTGTTTGAACA--GCATATAATTATA-TGAAAG-CT-GT-GAGTTTGCA-TCCTTTTGA---AATTGT-TAACCTCTACA-AGCTATAAAAACTTA-CCCCCACCC-AACNTATA-GTGTCCGG-ATACAGTGGCTGATTTAGAGGGGGCAGCCGCCCCCCCCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGATAGGGCGATTTGTAAAAGCTTGACA-GCGCCGTTCC-T-T-AC--GC-AA-C-GCGCC---T-TT-GCC---GCTAAT-ACATAAT-AATGT-AA----ATAATT-TTCA-TTTTTCGCTT--CTAAGGGTGAATGCAA-GTTCG---TT---AAAG-GTGTTAACGCGA--AA-CGCGCTGT-TTTGTTA--AGGGTTTG------GGGGGGT-GGC-AGG-TGGG-GTGGTGTTG---CTAT-TTGA-AA--GTAC--GCAACT-T--A-CGAAGCGC-ACCTTCGCTCA-AACATTTTTTTTTCTCTTTTATTAAAAT-TCAAA-TATATCACA-C-ATGCCATAT-ATC-AATACATACTTCGCTC--A-AACA---T-GATAAAC--ATTTACTAGTAACTTTTAA-CTGCTGAC--GCGA------AG---AT--GC-G------CTG-GG--TAA-AGT-----T----G-G-A---GGCG-GA-CATATAGGGACACTTT----GGGGAAAAAA-G-----TGG-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-GGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-TAAG--GACAGTTT-GG--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGCGGAC-ATATAAGG-ACA-GGC-GG-ACATATAAG
gi|1 : GTACTATGCCTCAGCATGTTATTGGC-AGATTGTTTTTTTAAAATTCCTC-CACATATATCTCCGTTATTGAAAGAAGGAAA-CCTTAT--AAATT-GGGGGGACTA-AAGCGTTTAAGATCACATGTGGACATAAAAGA-AAAG-C-T--ACATTGTGTGGGG-ATTTTCCAGCTTGC-GTGTGCT-TTGTTTGAACA---TAT-TAATTATAATGAAA--CT-GT-GAGTTTGCAATCTTTTTGA---AATTGT--AACCTCT-CA-AGCTATAAAA-CTTA-CCCCCACAC-AAACTATAGGTGTCTGG-ATACAGTAGCTGATTTAGAGGGGGCAGCCCCCCCCCCCC
gi|1 : tatcgctgtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncGGATAGGGCGATT-GTAAA-GCTTGACATGCGCCG--CC-T-TGAC--GC-AAACAGCGCC---TGTT-GC----GCTAAT-ACATAAT-AATGTCAA----ATAATT-TTCA-TTTT-CGCTT--CTAAGGGTGAATGCAATGTTTA---TTGATAAAG-GTGTTAACGCGA--AATCGCGCTGT-TTTGTGA--AGGGTTTT------GGTAGGT-GGC-AGG-TGGG--TAGTGTTG---TTAT-TTGA-AA--GTAC--CCAACT-TTAG-CGAAGCGCCACCTTCGCC---AACACTTTTTT--CTTCTTTATTAAAAT-TCAAA-TCTATCACA-C-AT-CCATATGATCGAATACATACTTCGCTTCGA-AACACATT-GATAAAC--ATT-ACTAGTAACTTTTAA-CTGCTGAC--GCGA------AG---AT--GC-G------CTG-GAGTTAA-AGT-----T----GAG-A---GGGGCGA-CATATA-GGACACTCT-----TGGAAAAAA-G-----TGG-GTCGGACATATTA-GTGCAGGCGGACA-GAG---TA-A--GAC-GTTG-GTTCCAA--AAA--TT-GGGCGG-ACATT--------T-GTGCAGG-GCGGGGACAGCGTA-TAAG--TTC-GTTT-GG--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAGTT--GCGAGGCGGAC-ACATAAGGAACATGGC-GGAACATATAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggatagggcgattgtaaagcttgacatgcgccgccttgacgcaaacagcgcctgttgcgctaatacataataatgtcaaataattttcattttcgcttctaagggtgaatgcaatgtttattgataaaggtgttaacgcgaaatcgcgctgttttgtgaagggttttggtaggtggcaggtgggtagtgttgttatttgaaagtacccaactttagcgaagcgccaccttcgccaacacttttttcttctttattaaaattcaaatctatcacacatccatatgatcgaatacatacttcgcttcgaaacacattgataaacattactagtaacttttaactgctgacgcgaagatgcgctggagttaaagttgagaggggcgacatataggacactcttggaaaaaagtgggtcggacatattagtgcaggcggacagagtaagacgttggttccaaaaattgggcggacatttgtgcagggcggggacagcgtataagttcgtttggtccaaaattgggcggacatttagttgcgaggcggacacataaggaacatggcggaacatataaggac
gi|10 : tatcgctgtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtactatgcctcagcatgttattggcagattgtttttttaaaattcctccacatatatctccgttattgaaagaaggaaaccttataaattggggggactaaagcgtttaagatcacatgtggacataaaagaaaagctacattgtgtggggattttccagcttgcgtgtgctttgtttgaacatattaattataatgaaactgtgagtttgcaatctttttgaaattgtaacctctcaagctataaaacttacccccacacaaactataggtgtctggatacagtagctgatttagagggggcagccccccccccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTGGACA-GCGCCGTTCCCT-T-ATCTGCCAA-CTGCGCC---T-TTTGCCCAAGCTAAT-ACAAAAT-AATGT-AA----AGAATT-T--A-TTTTTGGCTTTGCTAA-GGTGAATGCAA-TTTgac
gi|11 : --AAA--CC-GGGTGG-ATATA--------TAGTGCA-G-GC--GCACA---TA-TAAC--GGCAATTT-GGT-TTC-AAAATT-GGGCGAAG-ATTTAG-T--AT-AGGCGGAC-ATAT-AGT-GCA-GGA-GG-ACACATAAGaattgagtaaa
gi|12 : -G-CGGGCATA-TA-AGACAGATGGACA-TA----CAGAGCGACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-TGGTAG-GAATTCATACGTATAGTGCA-G-GC--GGACA---AA-TAAG--GAgac
gi|13 : t-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--AT-AGGCGG-ATATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-TA------------------------------GCGGAC-ATAAAG-T--GC-AGGCGGAC-ATA-AAG
gi|14 : -GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GATTC-A--ACA--TT-CGGTGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-
gi|15 : TTTTCTTTCTCTTTTATTAAAATGTCAAA-TATATCACA-CAATGCCATAT-ATC-AA
gi|16 : TTTTTTTTTCTCTTTTATTAAAAT-TCAAA-TATATCACA-C-ATACCATAT-AT
gi|17 : G-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-G
gi|2 : gtggaGTACTATGCCTCA-CATGTTAT-GGCTAGATTGTTTT---AAAATTCCTCACATATATATCTCCGTTAT-GAAAGAAGGAAAACCTTAT--AAATTTGGGGGGACTA-AAG--TTTAAGATCACATGTGGACATAAAAGA-AAAG-CCT--ACATTGTGTGGGGGATGTTCCAGCTTGC-GTGTGAT-TTGTTTGAACA--GC-TATAATTA-A--GAAAA-CTTGT-GAGTTTGCA-TC-TTTTGA---AATTGT-TAACCTCTACA-AGCTATAAA--CTTA-CCCCCACCC-AACATATA-GTGTCTGG-ATACAGTGGCTGATTTAGAGGGGGCAGCCGCCCCCCCCCCga
gi|2 : tgctacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGATAGGGCGATTTGTAAAAGCTTGACA-GCGC-GTTCC-T-T-AC--GC-AA-C-GCGCC---T-TT-GC----GCTAAT-ACATAAT-AATGT-AA----ATAATT-TTCA-TTTTTCGCTT--CTAAGGGTGAATGCAA-GTTTG---TA---AAAGCGTGTTAACGCAA--GA-CGCGCTGT-TTTGTTA--AGGGTTTG------GGGGGGT-G-C-AGG-TGGG-GTAGTGTTG---C-AT-TTGA-AA--GTA---GCAACT----A-CGAAGCGC-ACCTTCGCTCA-AACATTTTTTTTTCTCTTTTATTAAAAT-TCAAA-TATATCACA-C-ATGCCATAT-ATC-AATACATACT-CGCTC--A-AACA---T-GATAAAC--ATTTACTAGTAACTTTTAA-CTGCTGAC--GCGA------AG---AT--GC-G------CTG-GG--TAA-AGT-----T----G-G-A---GGCG-GA-CATATAAGGACACTTT----GGAAAAAAAA-G-----TGG-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-GGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-TAAG--GACAGTTT-GG--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGCGGAC-ATATAAGG-ACA-GGC-GG-A-ATATAAGccccccccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggatagggcgatttgtaaaagcttgacagcgcgttccttacgcaacgcgcctttgcgctaatacataataatgtaaataattttcatttttcgcttctaagggtgaatgcaagtttgtaaaagcgtgttaacgcaagacgcgctgttttgttaagggtttgggggggtgcaggtggggtagtgttgcatttgaaagtagcaactacgaagcgcaccttcgctcaaacatttttttttctcttttattaaaattcaaatatatcacacatgccatatatcaatacatactcgctcaaacatgataaacatttactagtaacttttaactgctgacgcgaagatgcgctgggtaaagttggaggcggacatataaggacactttggaaaaaaaagtgggcggacatatagtgcaggcggacatataaggacagtttggtccaaaattgggcggacatttagtgcaggcggacatataaggacagtttggtccaaaattgggcggacatttagtgcaggcggacatataaggacaggcggaatataagactc
gi|3 : tgctacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtactatgcctcacatgttatggctagattgttttaaaattcctcacatatatatctccgttatgaaagaaggaaaaccttataaatttggggggactaaagtttaagatcacatgtggacataaaagaaaagcctacattgtgtgggggatgttccagcttgcgtgtgatttgtttgaacagctataattaagaaaacttgtgagtttgcatcttttgaaattgttaacctctacaagctataaacttacccccacccaacatatagtgtctggatacagtggctgatttagagggggcagccgccccccccccccccccccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGT-GGC-AGGATGGG-GTG---TT----CTATATTGA-AATAGTATTAGCAACT-T--AACGAAGCGC-ACTCTCGCTCA-AACATTTTTTTT-CTCTTTT-TTAAAAT-TCAAAATATATCACATC-ATGCCATAT-ATA-ATTACATACT-CGCTCT-A-AACA---T-GA-AAAC--ATTTACTAGTAACATGTGATCTGC-GACTTGCGA------AGTTCATTTGCTG------CTGTGG--TAA-AGT-----G----G-A-A---GGCG--A-CATATAG--ACACTTT----GAAAAAAAAGTG-----TGC-G-CGAACATA-TA--TGCAGGCG-ACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-GGGC-G-ACATTG-------CAG-GCA---GC--GAACA---TA-TAAG--GACAGTTT-GG--TCCAAAAATT-GGGCGGA--ATTTA--T--GC-AGGCGGAC-ATAT-AGT-GCA-GGC-actc
gi|4 : GA------TG---AC--GC-A------CTG------AA-ATT-----TTAATG-GCA---GGCG-GA-CATATAGCGACAGTTT----GGGGAAAAAA-------TGG-G-CGGACATA-TA-GTG-------ACACTT----TG-GG-GGGGGGGG-GG-------GAA--T--GGGCGG-ACATA--------TAGTGCA-G-GA--GGACA---TAATAGC--GACATTTT-GG--TCC-AAAATTTGGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGTGGAC-ATATAGCG-ACA-G
gi|4 : gcactgaatagtcgaactattcaatgactaaacacatgG-GG--AAA-AAA-----T----G-G------GCG-GA-CATATAGTGACACTTT----GGGGGGGGGG-GGGGAATGG-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGAGGACA-TAA---TA-GC-GACATTTT-GGTCC-A--AAA--TTTGGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GT--GGACA---TA-TAGC--GACAGTTTTGA--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGCGGACAATATAAGG-ACttttgatccaaaattgggcggacatttagtgcaggcggacaatataaggac
gi|5 : gcactgaatagtcgaactattcaatgactaaacacatggatgacgcactgaaattttaatggcaggcggacatatagcgacagtttgCGATTTGTAAAAGCTTGTCA-GCGCCGTTTA-TCT-AC--GC-AA-C-GCGCCATTT-TT-GCC---GCTAATGAC-TAATAAATGT-AATCAGATAATTATTCACTTTCTCACTT--GTAAGGGTGAATGCAA-GTTCATGTTT---AAAG-GTGGTAACGCGAAGAA-CGCACTGTATTTGTTAGGAGGTTTTGGGATGCGGGGGGTCGGCGAGG-AGGGCGTGGTGGTGTGTCCGT-ATGATAA--TTA---ACAACTAT--A-CGCAGCCC-ACCTTCGCTCACAACA
gi|6 : cgatAAA-TATATAAC------GCCATA--A-C-AATACATACTTCG-TC--A-A-CA---TCGATAA-C--ATTTACTA--------TAA-CT-----C--GCGA------AG---AT--GT-G------TTG-AG--TAA-AGT-----T----G-G-ACAGGGC--GA-TATATAAGGACAGTTT----GGTCAAAA---------T-T-G-CGGACATA-TA-GTGCA-GCGGA-A-TA----TA-AG-GACAG-TT-GGTCC-A--AAAATTT-GGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-GAGC--GGACA---TA-TA----GACAGTTT-GG--TCC-AAA----GGGCGGACAATTTAG-T--GC-AGGC-GAT-A-ATAAGG-ACA-GGCAGG-AAAT
gi|7 : --A-AACA---C-AATGAGCTGACTCACTG--AAATTTTAA-TGGCAGGC--G-GACATTGTAG---A---GC-GACAAGTTTG-GG--AAA-AA-------------A-G---GGCG-GA-CATATAGTGACACTTTTGGGGGGGGGGGGA-A-----TGG-G-CG-ACATACTA-GTGCAGGAGGACA-TAATTATA-GGCGACATTTT-GGTCC-A--AAAATTT-GGGCGGGACATT--------TAGTGCA-G-GT--GGACA---TA-T-AGTCGACAGTTT-TGATTCC-AAAAT---GGCGGAC-ATTTAG-TGCGC-AGGCGGAC-ATATAAGG-AC
gi|8 : AGGAAAAC-TTATTTAATTTTGGGGGGACTATAGG--TTTAC-ATCA---GTAGACATAAAAGACAAAGAC-TTAACATTGTG-AGGG-ATGTTCCAGCTTGCCGTGTGATAGTATTTGAACACAACATATATTTATA-TGAAAGACT-GTCGTGTTTGCA--CCTTTTGACGTAATTGTCTAACCCGTACATAGCTATAAAAACTTAGCCCCAACCCGAACTTATA-GTGTCCGGCATACAGT
gi|9 : TCGCTC--ACAACA---T-GATATAC--ATTTACTGCTAACTTTATT-CTGCTGAC---CGA------AG---AT---C-G--------GAGG--TAAGAGTGGTCTT----GAG-G---GGCG-GATCATATATGACCACTTT----GGA-AAAAAA-G-----TGGAG-CGGACATA-TAGGTGCAGGC-GACA--A----TA-AG-GACAGTTTGGGGCC-AATAAA--TT-GGGCGG-ACATT--------
Alignments
lowQualScore : 1 1 1 222 1 1 11 11111 1 222222 1 1 1 11 111 22 22 1 1 11111 222 22 1 22 1 1 1 1 1 11111 11 1 1 2 11111 1 3333 1 1 1 2222 1 1 11 1 22222222 1 11111 1 11 333333 1 1 1 11 222222 1 1 11 3333 333333 1 1 1 11 11111 1 111111 111 1111111 111111 3333333333333333333 1111 1111111 1111 11111111 1111 11 1
lowQualScore : 5 5 5 111 5 5 7 6 88 7 88888 6 6 3 666666 7 3 3 3 88 444 7 00 7 55 3 3 33333 333 00 7 3 00 3 3 1 3 0 3 1 7 7 0 2 3 22222 33 0 0 0 88888 0 2222 0 3 0 0 1111 0 3 0 3 33 2 0 1 33333333 3 88888 3 88 888888 0 2 0 0 22 2 111111 0 0 33 3333 111111 0 2 0 66 0 8 6 777 1 6 8 0 55 6 11111 1 99 1 0 6 7 99 666666 000 888 5 8888888 000000 5 2222222222222222222 5 5 99 0000 3 0 8888888 4 4 8 3 3 5555 3 6 3 3 44 99 3 3 55555555 3 3 55 666 3 1111 4 00 4 66 4 4 66 4 4 1 5 6 8 0 8
lowQualScore : . . . ... . . . . .. . ..... . . . ...... . . . . .. ... . .. . .. . . ..... ... .. . . .. . . . . . . . . . . . . ..... .. . . . ..... . .... . . . . .... . . . . .. . . . ........ . ..... . .. ...... . . . . .. . ...... . . .. .... ...... . . . .. . . . ... . . . . .. . ..... . .. . . . . .. ...... ... ... . ....... ...... . ................... . . .. .... . . ....... . . . . . .... . . . . .. .. . . ........ . . .. ... . .... . .. . .. . . .. . . . . . . . .
lowQualScore : 0 5 5 555 5 5 3 7 33 3 77777 7 7 3 000000 3 3 3 3 33 777 3 77 3 33 3 3 77777 333 77 3 3 77 3 3 0 3 7 3 0 3 3 0 5 2 00000 88 0 0 0 55555 0 5555 0 2 0 0 2222 0 2 0 2 88 5 0 2 55555555 3 77777 3 33 333333 0 5 0 0 55 5 000000 0 0 88 0000 888888 0 5 0 44 8 0 7 555 0 7 0 6 88 7 88888 7 22 7 8 7 5 22 444444 000 000 7 1111111 888888 0 2222222222222222222 0 0 00 6666 4 9 9999999 0 0 0 6 6 0000 6 7 6 6 66 22 3 3 44444444 6 6 00 444 6 8888 4 66 4 22 4 4 11 4 4 9 0 7 0 0 8
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACTATGCCTCAGCATGTTATTGGCTAGATTGTTTTTTTAAAATTCCTCACACATATATCTCCGTTATTGAAAGAAGGAAAACCTTAT--AAATTTGGGGGGACTA-AA--GTTTAAGATCACATGTGGACATAAAAGA-AAAG-C-T--ACATTGTGTGGGG-ATGTTCCAGCTTG-CGTGTGAT-TTGTTTGA--ACAGCATATAATTAT-ATGAAAG-CT-GT-GAGTTTGC-ATCCTTTTGA---AATTGT-TAACCTCTACA-AGCTAT-AAAACTTA-CCCCCACCC-AACNTATA-GTGTCCGG-ATACAGTGGCTGATTTAGAGGGGGCAGCCNCCCCCCCCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGATAGGGCGATTTGTAAAAGCTTGACA-GCGCCGTTCC-T-T-AC--GC-AA-C-GCGCC---T-TT-GCC---GCTAAT-ACATAAT-AATGT-AA----ATAATT-TTCA-TTTTTCGCTT--CTAAGGGTGAATGCAA-GTTTA---TT---AAAG-GTGTTAACGCGA--AA-CGCGCTGT-TTTGTTA--AGGGTTTG------GGGGGGT-GGC-AGG-TGGG-GTGGTGTTG---CTAT-TTGA-AA--GTAC--GCAACT-T--A-CGAAGCGC-ACCTTCGCTCA-AACATTTTTTTTTCTCTTTTATTAAAAT-TCAAA-TATATCACA-C-ATGCCATAT-ATC-AATACATACTTCGCTC--A-AACA---T-GATAAAC--ATTTACTAGTAACTTTTAA-CTGCTGAC--GCGA------AG---AT--GC-G------CTG-GG--TAA-AGT-----T----G-G-A---GGCG-GA-CATATAGGGACACTTT----GGGGAAAAAA-G-----TGG-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-GGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-TAAG--GACAGTTT-GG--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGCGGAC-ATATAAGG-ACA-GGC-GG-ACATATAAG
Reference ( family-8199 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACTATGCCTCAGCATGTTATTGGCTAGATTGTTTTTTTAAAATTCCTCACACATATATCTCCGTTATTGAAAGAAGGAAAACCTTAT--AAATTTGGGGGGACTA-AA--GTTTAAGATCACATGTGGACATAAAAGA-AAAG-C-T--ACATTGTGTGGGG-ATGTTCCAGCTTG-CGTGTGAT-TTGTTTGA--ACAGCATATAATTAT-ATGAAAG-CT-GT-GAGTTTGC-ATCCTTTTGA---AATTGT-TAACCTCTACA-AGCTAT-AAAACTTA-CCCCCACCC-AACNTATA-GTGTCCGG-ATACAGTGGCTGATTTAGAGGGGGCAGCCNCCCCCCCCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGATAGGGCGATTTGTAAAAGCTTGACA-GCGCCGTTCC-T-T-AC--GC-AA-C-GCGCC---T-TT-GCC---GCTAAT-ACATAAT-AATGT-AA----ATAATT-TTCA-TTTTTCGCTT--CTAAGGGTGAATGCAA-GTTTA---TT---AAAG-GTGTTAACGCGA--AA-CGCGCTGT-TTTGTTA--AGGGTTTG------GGGGGGT-GGC-AGG-TGGG-GTGGTGTTG---CTAT-TTGA-AA--GTAC--GCAACT-T--A-CGAAGCGC-ACCTTCGCTCA-AACATTTTTTTTTCTCTTTTATTAAAAT-TCAAA-TATATCACA-C-ATGCCATAT-ATC-AATACATACTTCGCTC--A-AACA---T-GATAAAC--ATTTACTAGTAACTTTTAA-CTGCTGAC--GCGA------AG---AT--GC-G------CTG-GG--TAA-AGT-----T----G-G-A---GGCG-GA-CATATAGGGACACTTT----GGGGAAAAAA-G-----TGG-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-GGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-TAAG--GACAGTTT-GG--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGCGGAC-ATATAAGG-ACA-GGC-GG-ACATATAAG
gi|1 : GTACTATGCCTCAGCATGTTATTGGC-AGATTGTTTTTTTAAAATTCCTC-CACATATATCTCCGTTATTGAAAGAAGG-AAACCTTAT--AAA-TTGGGGGGACTA-AAGCGTTTAAGATCACATGTGGACATAAAAGA-AAAG-C-T--ACATTGTGTGGGG-ATTTTCCAGCTTG-CGTGTGCT-TTGTTTGA--ACA-TAT-TAATTATAATGAAA--CT-GT-GAGTTTGCAATCTTTTTGA---AATTG--TAACCTCT-CA-AGCTAT-AAAACTTA-CCCCCACAC-AAACTATAGGTGTCTGG-ATACAGTAGCTGATTTAGAGGGGGCAGCCCCCCCCCCCC
gi|1 : tatcgctgtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncGGATAGGGCGATT-GTAAA-GCTTGACATGCGCCG--CC-T-TGAC--GC-AAACAGCGCC---TGTT-GC----GCTAAT-ACATAAT-AATGTCAA----ATAATT-TTCA-TTTT-CGCTT--CTAAGGGTGAATGCAATGTTTA---TTGATAAAG-GTGTTAACGCGA--AATCGCGCTGT-TTTGTGA--AGGGTTTT------GGTAGGT-GGC-AGG-TGGG--TAGTGTTG---TTAT-TTGA-AA--GTAC--CCAACT-TTAG-CGAAGCGCCACCTTCGCC---AACACTTTTTT--CTTCTTTATTAAAAT-TCAAA-TCTATCACA-C-AT-CCATATGATCGAATACATACTTCGCTTCGA-AACACATT-GATAAAC--ATT-ACTAGTAACTTTTAA-CTGCTGAC--GCGA------AG---AT--GC-G------CTG-GAGTTAA-AGT-----T----GAG-A---GGGGCGA-CATATA-GGACACTCT-----TGGAAAAAA-G-----TGG-GTCGGACATATTA-GTGCAGGCGGACA-GAG---TA-A--GAC-GTTG-GTTCCAA--AAA--TT-GGGCGG-ACATT--------T-GTGCAGG-GCGGGGACAGCGTA-TAAG--TTC-GTTT-GG--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAGTT--GCGAGGCGGAC-ACATAAGGAACATGGC-GGAACATATAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggatagggcgattgtaaagcttgacatgcgccgccttgacgcaaacagcgcctgttgcgctaatacataataatgtcaaataattttcattttcgcttctaagggtgaatgcaatgtttattgataaaggtgttaacgcgaaatcgcgctgttttgtgaagggttttggtaggtggcaggtgggtagtgttgttatttgaaagtacccaactttagcgaagcgccaccttcgccaacacttttttcttctttattaaaattcaaatctatcacacatccatatgatcgaatacatacttcgcttcgaaacacattgataaacattactagtaacttttaactgctgacgcgaagatgcgctggagttaaagttgagaggggcgacatataggacactcttggaaaaaagtgggtcggacatattagtgcaggcggacagagtaagacgttggttccaaaaattgggcggacatttgtgcagggcggggacagcgtataagttcgtttggtccaaaattgggcggacatttagttgcgaggcggacacataaggaacatggcggaacatataaggac
gi|10 : tatcgctgtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtactatgcctcagcatgttattggcagattgtttttttaaaattcctccacatatatctccgttattgaaagaaggaaaccttataaattggggggactaaagcgtttaagatcacatgtggacataaaagaaaagctacattgtgtggggattttccagcttgcgtgtgctttgtttgaacatattaattataatgaaactgtgagtttgcaatctttttgaaattgtaacctctcaagctataaaacttacccccacacaaactataggtgtctggatacagtagctgatttagagggggcagccccccccccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTGGACA-GCGCCGTTCCCT-T-ATCTGCCAA-CTGCGCC---T-TTTGCCCAAGCTAAT-ACAAAAT-AATGT-AA----AGAATT-T--A-TTTTTGGCTTTGCTAA-GGTGAATGCAA-TTTAA---TT---GAgac
gi|11 : --AAA--CC-GGGTGG-ATATA--------TAGTGCA-G-GC--GCACA---TA-TAAC--GGCAATTT-GGT-TTC-AAAATT-GGGCGAAG-ATTTAG-T--AT-AGGCGGAC-ATAT-AGT-GCA-GGA-GG-ACACATAAGgtaaa
gi|12 : -G-CGGGCATA-TA-AGACAGATGGACA-TA----CAGAGCGACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-TGGTAG-GAATTCATACGTATAGTGCA-G-GC--GGACA---AA-TAAG--GAgac
gi|13 : t-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--AT-AGGCGG-ATATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-TA------------------------------GCGGAC-ATAAAG-T--GC-AGGCGGAC-ATA-AAG
gi|14 : -GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GATTC-A--ACA--TT-CGGTGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-
gi|15 : TTTTCTTTCTCTTTTATTAAAATGTCAAA-TATATCACA-CAATGCCATAT-ATC-AA
gi|16 : TTTTTTTTTCTCTTTTATTAAAAT-TCAAA-TATATCACA-C-ATACCATAT-AT
gi|17 : G-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-G
gi|2 : gtggaGTACTATGCCTCA-CATGTTAT-GGCTAGATTGTTTT---AAAATTCCTCACATATATATCTCCGTTAT-GAAAGAAGGAAAACCTTAT--AAATTTGGGGGGACTA-AA--GTTTAAGATCACATGTGGACATAAAAGA-AAAG-CCT--ACATTGTGTGGGGGATGTTCCAGCTTG-CGTGTGAT-TTGTTTGA--ACAGC-TATAATTA--A-GAAAA-CTTGT-GAGTTTGC-ATC-TTTTGA---AATTGT-TAACCTCTACA-AGCTAT--AAACTTA-CCCCCACCC-AACATATA-GTGTCTGG-ATACAGTGGCTGATTTAGAGGGGGCAGCCGCCCCCCCCCCga
gi|2 : tgctacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGATAGGGCGATTTGTAAAAGCTTGACA-GCGC-GTTCC-T-T-AC--GC-AA-C-GCGCC---T-TT-GC----GCTAAT-ACATAAT-AATGT-AA----ATAATT-TTCA-TTTTTCGCTT--CTAAGGGTGAATGCAA-GTTTG---TA---AAAGCGTGTTAACGCAA--GA-CGCGCTGT-TTTGTTA--AGGGTTTG------GGGGGGT-G-C-AGG-TGGG-GTAGTGTTG---C-AT-TTGA-AA--GTA---GCAACT----A-CGAAGCGC-ACCTTCGCTCA-AACATTTTTTTTTCTCTTTTATTAAAAT-TCAAA-TATATCACA-C-ATGCCATAT-ATC-AATACATACT-CGCTC--A-AACA---T-GATAAAC--ATTTACTAGTAACTTTTAA-CTGCTGAC--GCGA------AG---AT--GC-G------CTG-GG--TAA-AGT-----T----G-G-A---GGCG-GA-CATATAAGGACACTTT----GGAAAAAAAA-G-----TGG-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-GGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-TAAG--GACAGTTT-GG--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGCGGAC-ATATAAGG-ACA-GGC-GG-A-ATATAAGccccccccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggatagggcgatttgtaaaagcttgacagcgcgttccttacgcaacgcgcctttgcgctaatacataataatgtaaataattttcatttttcgcttctaagggtgaatgcaagtttgtaaaagcgtgttaacgcaagacgcgctgttttgttaagggtttgggggggtgcaggtggggtagtgttgcatttgaaagtagcaactacgaagcgcaccttcgctcaaacatttttttttctcttttattaaaattcaaatatatcacacatgccatatatcaatacatactcgctcaaacatgataaacatttactagtaacttttaactgctgacgcgaagatgcgctgggtaaagttggaggcggacatataaggacactttggaaaaaaaagtgggcggacatatagtgcaggcggacatataaggacagtttggtccaaaattgggcggacatttagtgcaggcggacatataaggacagtttggtccaaaattgggcggacatttagtgcaggcggacatataaggacaggcggaatataagactc
gi|3 : tgctacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtactatgcctcacatgttatggctagattgttttaaaattcctcacatatatatctccgttatgaaagaaggaaaaccttataaatttggggggactaaagtttaagatcacatgtggacataaaagaaaagcctacattgtgtgggggatgttccagcttgcgtgtgatttgtttgaacagctataattaagaaaacttgtgagtttgcatcttttgaaattgttaacctctacaagctataaacttacccccacccaacatatagtgtctggatacagtggctgatttagagggggcagccgccccccccccccccccccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGT-GGC-AGGATGGG-GTG---TT----CTATATTGA-AATAGTATTAGCAACT-T--AACGAAGCGC-ACTCTCGCTCA-AACATTTTTTTT-CTCTTTT-TTAAAAT-TCAAAATATATCACATC-ATGCCATAT-ATA-ATTACATACT-CGCTCT-A-AACA---T-GA-AAAC--ATTTACTAGTAACATGTGATCTGC-GACTTGCGA------AGTTCATTTGCTG------CTGTGG--TAA-AGT-----G----G-A-A---GGCG--A-CATATAG--ACACTTT----GAAAAAAAAGTG-----TGC-G-CGAACATA-TA--TGCAGGCG-ACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-GGGC-G-ACATTG-------CAG-GCA---GC--GAACA---TA-TAAG--GACAGTTT-GG--TCCAAAAATT-GGGCGGA--ATTTA--T--GC-AGGCGGAC-ATAT-AGT-GCA-GGC-actc
gi|4 : GA------TG---AC--GC-A------CTG------AA-ATT-----TTAATG-GCA---GGCG-GA-CATATAGCGACAGTTT----GGGGAAAAAA-------TGG-G-CGGACATA-TA-GTG-------ACACTT----TG-GG-GGGGGGGG-GG-------GAA--T--GGGCGG-ACATA--------TAGTGCA-G-GA--GGACA---TAATAGC--GACATTTT-GG--TCC-AAAATTTGGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGTGGAC-ATATAGCG-ACA-G
gi|4 : gcactgaatagtcgaactattcaatgactaaacacatgG-GG--AAA-AAA-----T----G-G------GCG-GA-CATATAGTGACACTTT----GGGGGGGGGG-GGGGAATGG-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGAGGACA-TAA---TA-GC-GACATTTT-GGTCC-A--AAA--TTTGGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GT--GGACA---TA-TAGC--GACAGTTTTGA--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGCGGACAATATAAGG-ACttttgatccaaaattgggcggacatttagtgcaggcggacaatataaggac
gi|5 : gcactgaatagtcgaactattcaatgactaaacacatggatgacgcactgaaattttaatggcaggcggacatatagcgacagtttgCGATTTGTAAAAGCTTGTCA-GCGCCGTTTA-TCT-AC--GC-AA-C-GCGCCATTT-TT-GCC---GCTAATGAC-TAATAAATGT-AATCAGATAATTATTCACTTTCTCACTT--GTAAGGGTGAATGCAA-GTTCATGTTT---AAAG-GTGGTAACGCGAAGAA-CGCACTGTATTTGTTAGGAGGTTTTGGGATGCGGGGGGTCGGCGAGG-AGGGCGTGGTGGTGTGTCCGT-ATGATAA--TTA---ACAACTAT--A-CGCAGCCC-ACCTTCGCTCACAACA
gi|6 : cgatAAA-TATATAAC------GCCATA--A-C-AATACATACTTCG-TC--A-A-CA---TCGATAA-C--ATTTACTA--------TAA-CT-----C--GCGA------AG---AT--GT-G------TTG-AG--TAA-AGT-----T----G-G-ACAGGGC--GA-TATATAAGGACAGTTT----GGTCAAAA---------T-T-G-CGGACATA-TA-GTGCA-GCGGA-A-TA----TA-AG-GACAG-TT-GGTCC-A--AAAATTT-GGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-GAGC--GGACA---TA-TA----GACAGTTT-GG--TCC-AAA----GGGCGGACAATTTAG-T--GC-AGGC-GAT-A-ATAAGG-ACA-GGCAGG-AAAT
gi|7 : --A-AACA---C-AATGAGCTGACTCACTG--AAATTTTAA-TGGCAGGC--G-GACATTGTAG---A---GC-GACAAGTTTG-GG--AAA-AA-------------A-G---GGCG-GA-CATATAGTGACACTTTTGGGGGGGGGGGGA-A-----TGG-G-CG-ACATACTA-GTGCAGGAGGACA-TAATTATA-GGCGACATTTT-GGTCC-A--AAAATTT-GGGCGGGACATT--------TAGTGCA-G-GT--GGACA---TA-T-AGTCGACAGTTT-TGATTCC-AAAAT---GGCGGAC-ATTTAG-TGCGC-AGGCGGAC-ATATAAGG-AC
gi|8 : AGGAAAAC-TTATTTAATTTTGGGGGGACTATAG--GTTTAC-ATCA---GTAGACATAAAAGACAAAGAC-TTAACATTGTG-AGGG-ATGTTCCAGCTTGCCGTGTGATAGTATTTGAACACAACATATATTTAT-ATGAAAGACT-GTCGTGTTTGC-A-CCTTTTGACGTAATTGTCTAACCCGTACATAGCTATAAAAACTTAGCCCCAACCCGAACTTATA-GTGTCCGGCATACAGT
gi|9 : TCGCTC--ACAACA---T-GATATAC--ATTTACTGCTAACTTTATT-CTGCTGAC---CGA------AG---AT---C-G--------GAGG--TAAGAGTGGTCTT----GAG-G---GGCG-GATCATATATGACCACTTT----GGA-AAAAAA-G-----TGGAG-CGGACATA-TAGGTGCAGGC-GACA--A----TA-AG-GACAGTTTGGGGCC-AATAAA--TT-GGGCGG-ACATT--------
Alignments
lowQualScore : 1 1 1 222 1 1 11 11111 1 222222 1 1 1 11 111 22 22 1 1 11111 222 22 1 22 1 1 1 1 1 11111 11 1 1 2 11111 1 3333 1 1 1 2222 1 1 11 1 22222222 1 11111 1 11 333333 1 1 1 11 222222 1 1 11 3333 333333 1 1 1 11 11111 1 111111 111 1111111 111111 3333333333333333333 1111 1111111 1111 11111111 1111 11 1
lowQualScore : 5 5 5 111 5 5 7 6 88 7 88888 6 6 3 666666 7 3 3 3 88 444 7 00 7 55 3 3 33333 333 00 7 3 00 3 3 1 3 0 3 1 7 7 0 2 3 22222 33 0 0 0 88888 0 2222 0 3 0 0 1111 0 3 0 3 33 2 0 1 33333333 3 88888 3 88 888888 0 2 0 0 22 2 111111 0 0 33 3333 111111 0 2 0 66 0 8 6 777 1 6 8 0 55 6 11111 1 99 1 0 6 7 99 666666 000 888 5 8888888 000000 5 2222222222222222222 5 5 99 0000 3 0 8888888 4 4 8 3 3 5555 3 6 3 3 44 99 3 3 55555555 3 3 55 666 3 1111 4 00 4 66 4 4 66 4 4 1 5 6 8 0 8
lowQualScore : . . . ... . . . . .. . ..... . . . ...... . . . . .. ... . .. . .. . . ..... ... .. . . .. . . . . . . . . . . . . ..... .. . . . ..... . .... . . . . .... . . . . .. . . . ........ . ..... . .. ...... . . . . .. . ...... . . .. .... ...... . . . .. . . . ... . . . . .. . ..... . .. . . . . .. ...... ... ... . ....... ...... . ................... . . .. .... . . ....... . . . . . .... . . . . .. .. . . ........ . . .. ... . .... . .. . .. . . .. . . . . . . . .
lowQualScore : 0 5 5 555 5 5 3 7 33 3 77777 7 7 3 000000 3 3 3 3 33 777 3 77 3 33 3 3 77777 333 77 3 3 77 3 3 0 3 7 3 0 3 3 0 5 2 00000 88 0 0 0 55555 0 5555 0 2 0 0 2222 0 2 0 2 88 5 0 2 55555555 3 77777 3 33 333333 0 5 0 0 55 5 000000 0 0 88 0000 888888 0 5 0 44 8 0 7 555 0 7 0 6 88 7 88888 7 22 7 8 7 5 22 444444 000 000 7 1111111 888888 0 2222222222222222222 0 0 00 6666 4 9 9999999 0 0 0 6 6 0000 6 7 6 6 66 22 3 3 44444444 6 6 00 444 6 8888 4 66 4 22 4 4 11 4 4 9 0 7 0 0 8
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACTATGCCTCAGCATGTTATTGGCTAGATTGTTTTTTTAAAATTCCTCACACATATATCTCCGTTATTGAAAGAAGGAAAACCTTAT--AAATTTGGGGGGACTA-AA--GTTTAAGATCACATGTGGACATAAAAGA-AAAG-C-T--ACATTGTGTGGGG-ATGTTCCAGCTTG-CGTGTGAT-TTGTTTGA--ACAGCATATAATTAT-ATGAAAG-CT-GT-GAGTTTGC-ATCCTTTTGA---AATTGT-TAACCTCTACA-AGCTAT-AAAACTTA-CCCCCACCC-AACNTATA-GTGTCCGG-ATACAGTGGCTGATTTAGAGGGGGCAGCCNCCCCCCCCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGATAGGGCGATTTGTAAAAGCTTGACA-GCGCCGTTCC-T-T-AC--GC-AA-C-GCGCC---T-TT-GCC---GCTAAT-ACATAAT-AATGT-AA----ATAATT-TTCA-TTTTTCGCTT--CTAAGGGTGAATGCAA-GTTTA---TT---AAAG-GTGTTAACGCGA--AA-CGCGCTGT-TTTGTTA--AGGGTTTG------GGGGGGT-GGC-AGG-TGGG-GTGGTGTTG---CTAT-TTGA-AA--GTAC--GCAACT-T--A-CGAAGCGC-ACCTTCGCTCA-AACATTTTTTTTTCTCTTTTATTAAAAT-TCAAA-TATATCACA-C-ATGCCATAT-ATC-AATACATACTTCGCTC--A-AACA---T-GATAAAC--ATTTACTAGTAACTTTTAA-CTGCTGAC--GCGA------AG---AT--GC-G------CTG-GG--TAA-AGT-----T----G-G-A---GGCG-GA-CATATAGGGACACTTT----GGGGAAAAAA-G-----TGG-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-GGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-TAAG--GACAGTTT-GG--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGCGGAC-ATATAAGG-ACA-GGC-GG-ACATATAAG
Reference ( family-8199 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACTATGCCTCAGCATGTTATTGGCTAGATTGTTTTTTTAAAATTCCTCACACATATATCTCCGTTATTGAAAGAAGGAAAACCTTAT--AAATTTGGGGGGACTA-AA--GTTTAAGATCACATGTGGACATAAAAGA-AAAG-C-T--ACATTGTGTGGGG-ATGTTCCAGCTTG-CGTGTGAT-TTGTTTGA--ACAGCATATAATTAT-ATGAAAG-CT-GT-GAGTTTGC-ATCCTTTTGA---AATTGT-TAACCTCTACA-AGCTAT-AAAACTTA-CCCCCACCC-AACNTATA-GTGTCCGG-ATACAGTGGCTGATTTAGAGGGGGCAGCCNCCCCCCCCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGATAGGGCGATTTGTAAAAGCTTGACA-GCGCCGTTCC-T-T-AC--GC-AA-C-GCGCC---T-TT-GCC---GCTAAT-ACATAAT-AATGT-AA----ATAATT-TTCA-TTTTTCGCTT--CTAAGGGTGAATGCAA-GTTTA---TT---AAAG-GTGTTAACGCGA--AA-CGCGCTGT-TTTGTTA--AGGGTTTG------GGGGGGT-GGC-AGG-TGGG-GTGGTGTTG---CTAT-TTGA-AA--GTAC--GCAACT-T--A-CGAAGCGC-ACCTTCGCTCA-AACATTTTTTTTTCTCTTTTATTAAAAT-TCAAA-TATATCACA-C-ATGCCATAT-ATC-AATACATACTTCGCTC--A-AACA---T-GATAAAC--ATTTACTAGTAACTTTTAA-CTGCTGAC--GCGA------AG---AT--GC-G------CTG-GG--TAA-AGT-----T----G-G-A---GGCG-GA-CATATAGGGACACTTT----GGGGAAAAAA-G-----TGG-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-GGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-TAAG--GACAGTTT-GG--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGCGGAC-ATATAAGG-ACA-GGC-GG-ACATATAAG
gi|1 : GTACTATGCCTCAGCATGTTATTGGC-AGATTGTTTTTTTAAAATTCCTC-CACATATATCTCCGTTATTGAAAGAAGG-AAACCTTAT--AAA-TTGGGGGGACTA-AAGCGTTTAAGATCACATGTGGACATAAAAGA-AAAG-C-T--ACATTGTGTGGGG-ATTTTCCAGCTTG-CGTGTGCT-TTGTTTGA--ACA-TAT-TAATTATAATGAAA--CT-GT-GAGTTTGCAATCTTTTTGA---AATTG--TAACCTCT-CA-AGCTAT-AAAACTTA-CCCCCACAC-AAACTATAGGTGTCTGG-ATACAGTAGCTGATTTAGAGGGGGCAGCCCCCCCCCCCC
gi|1 : tatcgctgtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncGGATAGGGCGATT-GTAAA-GCTTGACATGCGCCG--CC-T-TGAC--GC-AAACAGCGCC---TGTT-GC----GCTAAT-ACATAAT-AATGTCAA----ATAATT-TTCA-TTTT-CGCTT--CTAAGGGTGAATGCAATGTTTA---TTGATAAAG-GTGTTAACGCGA--AATCGCGCTGT-TTTGTGA--AGGGTTTT------GGTAGGT-GGC-AGG-TGGG--TAGTGTTG---TTAT-TTGA-AA--GTAC--CCAACT-TTAG-CGAAGCGCCACCTTCGCC---AACACTTTTTT--CTTCTTTATTAAAAT-TCAAA-TCTATCACA-C-AT-CCATATGATCGAATACATACTTCGCTTCGA-AACACATT-GATAAAC--ATT-ACTAGTAACTTTTAA-CTGCTGAC--GCGA------AG---AT--GC-G------CTG-GAGTTAA-AGT-----T----GAG-A---GGGGCGA-CATATA-GGACACTCT-----TGGAAAAAA-G-----TGG-GTCGGACATATTA-GTGCAGGCGGACA-GAG---TA-A--GAC-GTTG-GTTCCAA--AAA--TT-GGGCGG-ACATT--------T-GTGCAGG-GCGGGGACAGCGTA-TAAG--TTC-GTTT-GG--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAGTT--GCGAGGCGGAC-ACATAAGGAACATGGC-GGAACATATAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggatagggcgattgtaaagcttgacatgcgccgccttgacgcaaacagcgcctgttgcgctaatacataataatgtcaaataattttcattttcgcttctaagggtgaatgcaatgtttattgataaaggtgttaacgcgaaatcgcgctgttttgtgaagggttttggtaggtggcaggtgggtagtgttgttatttgaaagtacccaactttagcgaagcgccaccttcgccaacacttttttcttctttattaaaattcaaatctatcacacatccatatgatcgaatacatacttcgcttcgaaacacattgataaacattactagtaacttttaactgctgacgcgaagatgcgctggagttaaagttgagaggggcgacatataggacactcttggaaaaaagtgggtcggacatattagtgcaggcggacagagtaagacgttggttccaaaaattgggcggacatttgtgcagggcggggacagcgtataagttcgtttggtccaaaattgggcggacatttagttgcgaggcggacacataaggaacatggcggaacatataaggac
gi|10 : tatcgctgtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtactatgcctcagcatgttattggcagattgtttttttaaaattcctccacatatatctccgttattgaaagaaggaaaccttataaattggggggactaaagcgtttaagatcacatgtggacataaaagaaaagctacattgtgtggggattttccagcttgcgtgtgctttgtttgaacatattaattataatgaaactgtgagtttgcaatctttttgaaattgtaacctctcaagctataaaacttacccccacacaaactataggtgtctggatacagtagctgatttagagggggcagccccccccccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTGGACA-GCGCCGTTCCCT-T-ATCTGCCAA-CTGCGCC---T-TTTGCCCAAGCTAAT-ACAAAAT-AATGT-AA----AGAATT-T--A-TTTTTGGCTTTGCTAA-GGTGAATGCAA-TTTAA---TT---GAgac
gi|11 : --AAA--CC-GGGTGG-ATATA--------TAGTGCA-G-GC--GCACA---TA-TAAC--GGCAATTT-GGT-TTC-AAAATT-GGGCGAAG-ATTTAG-T--AT-AGGCGGAC-ATAT-AGT-GCA-GGA-GG-ACACATAAGgtaaa
gi|12 : -G-CGGGCATA-TA-AGACAGATGGACA-TA----CAGAGCGACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-TGGTAG-GAATTCATACGTATAGTGCA-G-GC--GGACA---AA-TAAG--GAgac
gi|13 : t-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--AT-AGGCGG-ATATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-TA------------------------------GCGGAC-ATAAAG-T--GC-AGGCGGAC-ATA-AAG
gi|14 : -GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GATTC-A--ACA--TT-CGGTGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-
gi|15 : TTTTCTTTCTCTTTTATTAAAATGTCAAA-TATATCACA-CAATGCCATAT-ATC-AA
gi|16 : TTTTTTTTTCTCTTTTATTAAAAT-TCAAA-TATATCACA-C-ATACCATAT-AT
gi|17 : G-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-G
gi|2 : gtggaGTACTATGCCTCA-CATGTTAT-GGCTAGATTGTTTT---AAAATTCCTCACATATATATCTCCGTTAT-GAAAGAAGGAAAACCTTAT--AAATTTGGGGGGACTA-AA--GTTTAAGATCACATGTGGACATAAAAGA-AAAG-CCT--ACATTGTGTGGGGGATGTTCCAGCTTG-CGTGTGAT-TTGTTTGA--ACAGC-TATAATTA--A-GAAAA-CTTGT-GAGTTTGC-ATC-TTTTGA---AATTGT-TAACCTCTACA-AGCTAT--AAACTTA-CCCCCACCC-AACATATA-GTGTCTGG-ATACAGTGGCTGATTTAGAGGGGGCAGCCGCCCCCCCCCCga
gi|2 : tgctacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGATAGGGCGATTTGTAAAAGCTTGACA-GCGC-GTTCC-T-T-AC--GC-AA-C-GCGCC---T-TT-GC----GCTAAT-ACATAAT-AATGT-AA----ATAATT-TTCA-TTTTTCGCTT--CTAAGGGTGAATGCAA-GTTTG---TA---AAAGCGTGTTAACGCAA--GA-CGCGCTGT-TTTGTTA--AGGGTTTG------GGGGGGT-G-C-AGG-TGGG-GTAGTGTTG---C-AT-TTGA-AA--GTA---GCAACT----A-CGAAGCGC-ACCTTCGCTCA-AACATTTTTTTTTCTCTTTTATTAAAAT-TCAAA-TATATCACA-C-ATGCCATAT-ATC-AATACATACT-CGCTC--A-AACA---T-GATAAAC--ATTTACTAGTAACTTTTAA-CTGCTGAC--GCGA------AG---AT--GC-G------CTG-GG--TAA-AGT-----T----G-G-A---GGCG-GA-CATATAAGGACACTTT----GGAAAAAAAA-G-----TGG-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-GGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-TAAG--GACAGTTT-GG--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGCGGAC-ATATAAGG-ACA-GGC-GG-A-ATATAAGccccccccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggatagggcgatttgtaaaagcttgacagcgcgttccttacgcaacgcgcctttgcgctaatacataataatgtaaataattttcatttttcgcttctaagggtgaatgcaagtttgtaaaagcgtgttaacgcaagacgcgctgttttgttaagggtttgggggggtgcaggtggggtagtgttgcatttgaaagtagcaactacgaagcgcaccttcgctcaaacatttttttttctcttttattaaaattcaaatatatcacacatgccatatatcaatacatactcgctcaaacatgataaacatttactagtaacttttaactgctgacgcgaagatgcgctgggtaaagttggaggcggacatataaggacactttggaaaaaaaagtgggcggacatatagtgcaggcggacatataaggacagtttggtccaaaattgggcggacatttagtgcaggcggacatataaggacagtttggtccaaaattgggcggacatttagtgcaggcggacatataaggacaggcggaatataagactc
gi|3 : tgctacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtactatgcctcacatgttatggctagattgttttaaaattcctcacatatatatctccgttatgaaagaaggaaaaccttataaatttggggggactaaagtttaagatcacatgtggacataaaagaaaagcctacattgtgtgggggatgttccagcttgcgtgtgatttgtttgaacagctataattaagaaaacttgtgagtttgcatcttttgaaattgttaacctctacaagctataaacttacccccacccaacatatagtgtctggatacagtggctgatttagagggggcagccgccccccccccccccccccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGT-GGC-AGGATGGG-GTG---TT----CTATATTGA-AATAGTATTAGCAACT-T--AACGAAGCGC-ACTCTCGCTCA-AACATTTTTTTT-CTCTTTT-TTAAAAT-TCAAAATATATCACATC-ATGCCATAT-ATA-ATTACATACT-CGCTCT-A-AACA---T-GA-AAAC--ATTTACTAGTAACATGTGATCTGC-GACTTGCGA------AGTTCATTTGCTG------CTGTGG--TAA-AGT-----G----G-A-A---GGCG--A-CATATAG--ACACTTT----GAAAAAAAAGTG-----TGC-G-CGAACATA-TA--TGCAGGCG-ACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-GGGC-G-ACATTG-------CAG-GCA---GC--GAACA---TA-TAAG--GACAGTTT-GG--TCCAAAAATT-GGGCGGA--ATTTA--T--GC-AGGCGGAC-ATAT-AGT-GCA-GGC-actc
gi|4 : GA------TG---AC--GC-A------CTG------AA-ATT-----TTAATG-GCA---GGCG-GA-CATATAGCGACAGTTT----GGGGAAAAAA-------TGG-G-CGGACATA-TA-GTG-------ACACTT----TG-GG-GGGGGGGG-GG-------GAA--T--GGGCGG-ACATA--------TAGTGCA-G-GA--GGACA---TAATAGC--GACATTTT-GG--TCC-AAAATTTGGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGTGGAC-ATATAGCG-ACA-G
gi|4 : gcactgaatagtcgaactattcaatgactaaacacatgG-GG--AAA-AAA-----T----G-G------GCG-GA-CATATAGTGACACTTT----GGGGGGGGGG-GGGGAATGG-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGAGGACA-TAA---TA-GC-GACATTTT-GGTCC-A--AAA--TTTGGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GT--GGACA---TA-TAGC--GACAGTTTTGA--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGCGGACAATATAAGG-ACttttgatccaaaattgggcggacatttagtgcaggcggacaatataaggac
gi|5 : gcactgaatagtcgaactattcaatgactaaacacatggatgacgcactgaaattttaatggcaggcggacatatagcgacagtttgCGATTTGTAAAAGCTTGTCA-GCGCCGTTTA-TCT-AC--GC-AA-C-GCGCCATTT-TT-GCC---GCTAATGAC-TAATAAATGT-AATCAGATAATTATTCACTTTCTCACTT--GTAAGGGTGAATGCAA-GTTCATGTTT---AAAG-GTGGTAACGCGAAGAA-CGCACTGTATTTGTTAGGAGGTTTTGGGATGCGGGGGGTCGGCGAGG-AGGGCGTGGTGGTGTGTCCGT-ATGATAA--TTA---ACAACTAT--A-CGCAGCCC-ACCTTCGCTCACAACA
gi|6 : cgatAAA-TATATAAC------GCCATA--A-C-AATACATACTTCG-TC--A-A-CA---TCGATAA-C--ATTTACTA--------TAA-CT-----C--GCGA------AG---AT--GT-G------TTG-AG--TAA-AGT-----T----G-G-ACAGGGC--GA-TATATAAGGACAGTTT----GGTCAAAA---------T-T-G-CGGACATA-TA-GTGCA-GCGGA-A-TA----TA-AG-GACAG-TT-GGTCC-A--AAAATTT-GGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-GAGC--GGACA---TA-TA----GACAGTTT-GG--TCC-AAA----GGGCGGACAATTTAG-T--GC-AGGC-GAT-A-ATAAGG-ACA-GGCAGG-AAAT
gi|7 : --A-AACA---C-AATGAGCTGACTCACTG--AAATTTTAA-TGGCAGGC--G-GACATTGTAG---A---GC-GACAAGTTTG-GG--AAA-AA-------------A-G---GGCG-GA-CATATAGTGACACTTTTGGGGGGGGGGGGA-A-----TGG-G-CG-ACATACTA-GTGCAGGAGGACA-TAATTATA-GGCGACATTTT-GGTCC-A--AAAATTT-GGGCGGGACATT--------TAGTGCA-G-GT--GGACA---TA-T-AGTCGACAGTTT-TGATTCC-AAAAT---GGCGGAC-ATTTAG-TGCGC-AGGCGGAC-ATATAAGG-AC
gi|8 : AGGAAAAC-TTATTTAATTTTGGGGGGACTATAG--GTTTAC-ATCA---GTAGACATAAAAGACAAAGAC-TTAACATTGTG-AGGG-ATGTTCCAGCTTGCCGTGTGATAGTATTTGAACACAACATATATTTAT-ATGAAAGACT-GTCGTGTTTGC-A-CCTTTTGACGTAATTGTCTAACCCGTACATAGCTATAAAAACTTAGCCCCAACCCGAACTTATA-GTGTCCGGCATACAGT
gi|9 : TCGCTC--ACAACA---T-GATATAC--ATTTACTGCTAACTTTATT-CTGCTGAC---CGA------AG---AT---C-G--------GAGG--TAAGAGTGGTCTT----GAG-G---GGCG-GATCATATATGACCACTTT----GGA-AAAAAA-G-----TGGAG-CGGACATA-TAGGTGCAGGC-GACA--A----TA-AG-GACAGTTTGGGGCC-AATAAA--TT-GGGCGG-ACATT--------
blockSeqs : . . T . A . A C TT T TAG G C C ACTTA T G C A AC ACA A T T GA T C ATC CGT TC A T AA G G A . C G T A . C T CTT CT C . T ATTT T CCAA G A A . TCAG A T C T TG G . A TGTTT C AGAA A GG GGATGC C G G A CG G GTGTCC A T TA TTAG TAA . C C TT G A CA G . . T T C TC A TG T G T T TT CATTGT TTC TTT T ACAAGTT TGGT G TGGTCTTGAGG . T AG TGGG A GGGGAA A . C G C ATTA G C G . AT AT T G CATACGTA . A . . A AGTC T AT A TT A . GC . A A . . A . C
blockSeqs : A . . T AA . . . CCT . . . . . GC A . . A . . ACC . T A . . . . T . . T A . C T TCT . . . . T . C . A . . . . T . T . G . T TT . GA . . . . G . . G G GC . . . G ATA . C . TT . . TC A . . T . . T A . T G . A . . . T . C AGGT . TTTAATGGCA . . GC . A TG . . . . . A . C . . . AT . . G . . . . . AC . T . T . . . . . A . . . . A
blockSeqs : . . T TT . . . . T . . . . . . . . . . T . . . C TA . . . . G . CT . . . A A . C . TT . . C G . . . . . T G . T C . T . . . C . C GGT . TTGGACAG . . GT . G G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . T . . . . . A . . . . .
blockSeqs : T . . C G . . . . . C A . C . . . . . . T . C GGA . TTGGA . . AG . G A . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . T . . . . . A . . .
blockSeqs : . . G . . . T . . T . . . . . . T . T AGT . TGGAA . . GT . C G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . AG . . . T . . . . . A . .
blockSeqs : . . . . . GGA . ATGG . . TG . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GC . . . . . . . . . A .
blockSeqs : . . AG . . G . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . GC . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . . . . . . . . . . . . .
blockSeqs : . . . . . .
blockSeqCons : TT C** ** T**** GGN*** TTGGA************** GN **** ** ***
originalCons : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACTATGCCTCAGCATGTTATTGGCTAGATTGTTTTTTTAAAATTCCTCACACATATATCTCCGTTATTGAAAGAAGGAAAACCTTAT--AAATTTGGGGGGACTA-AA--GTTTAAGATCACATGTGGACATAAAAGA-AAAG-C-T--ACATTGTGTGGGG-ATGTTCCAGCTTG-CGTGTGAT-TTGTTTGA--ACAGCATATAATTAT-ATGAAAG-CT-GT-GAGTTTGC-ATCCTTTTGA---AATTGT-TAACCTCTACA-AGCTAT-AAAACTTA-CCCCCACCC-AACNTATA-GTGTCCGG-ATACAGTGGCTGATTTAGAGGGGGCAGCCNCCCCCCCCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGATAGGGCGATTTGTAAAAGCTTGACA-GCGCCGTTCC-T-T-AC--GC-AA-C-GCGCC---T-TT-GCC---GCTAAT-ACATAAT-AATGT-AA----ATAATT-TTCA-TTTTTCGCTT--CTAAGGGTGAATGCAA-GTTTA---TT---AAAG-GTGTTAACGCGA--AA-CGCGCTGT-TTTGTTA--AGGGTTTG------GGGGGGT-GGC-AGG-TGGG-GTGGTGTTG---CTAT-TTGA-AA--GTAC--GCAACT-T--A-CGAAGCGC-ACCTTCGCTCA-AACATTTTTTTTTCTCTTTTATTAAAAT-TCAAA-TATATCACA-C-ATGCCATAT-ATC-AATACATACTTCGCTC--A-AACA---T-GATAAAC--ATTTACTAGTAACTTTTAA-CTGCTGAC--GCGA------AG---AT--GC-G------CTG-GG--TAA-AGT-----T----G-G-A---GGCG-GA-CATATAGGGACACTTT----GGGGAAAAAA-G-----TGG-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-GGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-TAAG--GACAGTTT-GG--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGCGGAC-ATATAAGG-ACA-GGC-GG-ACATATAAG
finalCons : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACTATGCCTCAGCATGTTATTGGCTAGATTGTTTTTTTAAAATTCCTCACACATATATCTCCGTTATTGAAAGAAGGAAAACCTTAT--AAATTTGGGGGGACTA-AA--GTTTAAGATCACATGTGGACATAAAAGA-AAAG-C-T--ACATTGTGTGGGG-ATGTTCCAGCTTG-CGTGTGAT-TTGTTTGA--ACAGCATATAATTAT-ATGAAAG-CT-GT-GAGTTTGC-ATCCTTTTGA---AATTGT-TAACCTCTACA-AGCTAT-AAAACTTA-CCCCCACCC-AACNTATA-GTGTCCGG-ATACAGTGGCTGATTTAGAGGGGGCAGCCNCCCCCCCCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGATAGGGCGATTTGTAAAAGCTTGACA-GCGCCGTTCC-T-T-AC--GC-AA-C-GCGCC---T-TT-GCC---GCTAAT-ACATAAT-AATGT-AA----ATAATT-TTCA-TTTTTCGCTT--CTAAGGGTGAATGCAA-GTTTA---TT---AAAG-GTGTTAACGCGA--AA-CGCGCTGT-TTTGTTA--AGGGTTTG------GGGGGGT-GGC-AGG-TGGG-GTGGTGTTG---CTAT-TTGA-AA--GTAC--GCAACT-T--A-CGAAGCGC-ACCTTCGCTCA-AACATTTTTTTTTCTCTTTTATTAAAAT-TCAAA-TATATCACAC--ATGCCATAT-ATC-AATACATACTTCGCTC--A-AACAT----GATAAAC--ATTTACTAGTAACTTTTAA-CTGCTGAC--GCGA------AG---AT--GC-G------CTGGGN---AA-AGTTGGA--------------GGCG-GA-CATATAGNGACACTTT----GGGGAAAAAA-G-----TGG-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-GGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-TAAG--GACAGTTT-GG--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGCGGAC-ATATAAGG-ACA-GGC-GG-ACATATAAG
Alignments
lowQualScore : 1 1 1 222 1 1 11 11111 1 222222 1 1 1 11 111 22 22 1 1 11111 222 22 1 22 1 1 1 1 1 11111 11 1 1 2 11111 1 3333 1 1 1 2222 1 1 11 1 22222222 1 11111 1 11 333333 1 1 1 11 222222 1 1 11 3333 333333 1 1 1 11 11111 1 111111 111 111111 111111 3333333333333333333 11 11111 1111111 1111 11111111 1111 11 1
lowQualScore : 5 5 5 111 5 5 7 6 88 7 88888 6 6 3 666666 7 3 3 3 88 444 7 00 7 55 3 3 33333 333 00 7 3 00 3 3 1 3 0 3 1 7 7 0 2 3 22222 33 0 0 0 88888 0 2222 0 3 0 0 1111 0 3 0 3 33 2 0 1 33333333 3 88888 3 88 888888 0 2 0 0 22 2 111111 0 0 33 3333 111111 0 2 0 66 0 8 6 777 1 6 8 0 55 6 11111 1 99 1 0 6 7 99 666666 000 888 5 666666 111111 2222222222222222222 5 5 11 5 33333 0 8888888 4 4 8 3 3 5555 3 6 3 3 44 99 3 3 55555555 3 3 55 666 3 1111 4 00 4 66 4 4 66 4 4 1 5 6 8 0 8
lowQualScore : . . . ... . . . . .. . ..... . . . ...... . . . . .. ... . .. . .. . . ..... ... .. . . .. . . . . . . . . . . . . ..... .. . . . ..... . .... . . . . .... . . . . .. . . . ........ . ..... . .. ...... . . . . .. . ...... . . .. .... ...... . . . .. . . . ... . . . . .. . ..... . .. . . . . .. ...... ... ... . ...... ...... ................... . . .. . ..... . ....... . . . . . .... . . . . .. .. . . ........ . . .. ... . .... . .. . .. . . .. . . . . . . . .
lowQualScore : 0 5 5 555 5 5 3 7 33 3 77777 7 7 3 000000 3 3 3 3 33 777 3 77 3 33 3 3 77777 333 77 3 3 77 3 3 0 3 7 3 0 3 3 0 5 2 00000 88 0 0 0 55555 0 5555 0 2 0 0 2222 0 2 0 2 88 5 0 2 55555555 3 77777 3 33 333333 0 5 0 0 55 5 000000 0 0 88 0000 888888 0 5 0 44 8 0 7 555 0 7 0 6 88 7 88888 7 22 7 8 7 5 22 444444 000 000 7 444444 111111 2222222222222222222 0 0 00 0 11111 9 9999999 0 0 0 6 6 0000 6 7 6 6 66 22 3 3 44444444 6 6 00 444 6 8888 4 66 4 22 4 4 11 4 4 9 0 7 0 0 8
consensus : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACTATGCCTCAGCATGTTATTGGCTAGATTGTTTTTTTAAAATTCCTCACACATATATCTCCGTTATTGAAAGAAGGAAAACCTTAT--AAATTTGGGGGGACTA-AA--GTTTAAGATCACATGTGGACATAAAAGA-AAAG-C-T--ACATTGTGTGGGG-ATGTTCCAGCTTG-CGTGTGAT-TTGTTTGA--ACAGCATATAATTAT-ATGAAAG-CT-GT-GAGTTTGC-ATCCTTTTGA---AATTGT-TAACCTCTACA-AGCTAT-AAAACTTA-CCCCCACCC-AACNTATA-GTGTCCGG-ATACAGTGGCTGATTTAGAGGGGGCAGCCNCCCCCCCCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGATAGGGCGATTTGTAAAAGCTTGACA-GCGCCGTTCC-T-T-AC--GC-AA-C-GCGCC---T-TT-GCC---GCTAAT-ACATAAT-AATGT-AA----ATAATT-TTCA-TTTTTCGCTT--CTAAGGGTGAATGCAA-GTTTA---TT---AAAG-GTGTTAACGCGA--AA-CGCGCTGT-TTTGTTA--AGGGTTTG------GGGGGGT-GGC-AGG-TGGG-GTGGTGTTG---CTAT-TTGA-AA--GTAC--GCAACT-T--A-CGAAGCGC-ACCTTCGCTCA-AACATTTTTTTTTCTCTTTTATTAAAAT-TCAAA-TATATCACA-C-ATGCCATAT-ATC-AATACATACTTCGCTC--A-AACA---T-GATAAAC--ATTTACTAGTAACTTTTAA-CTGCTGAC--GCGA------AG---AT--GC-G------CTG-GG--NAAAG-----TT----G-G-A---GGCG-GA-CATATAGTGA-CACTTT----GGGGAAAAAA-G-----TGG-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-GGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-TAAG--GACAGTTT-GG--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGCGGAC-ATATAAGG-ACA-GGC-GG-ACATATAAG
Reference ( family-8199 ) : NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTACTATGCCTCAGCATGTTATTGGCTAGATTGTTTTTTTAAAATTCCTCACACATATATCTCCGTTATTGAAAGAAGGAAAACCTTAT--AAATTTGGGGGGACTA-AA--GTTTAAGATCACATGTGGACATAAAAGA-AAAG-C-T--ACATTGTGTGGGG-ATGTTCCAGCTTG-CGTGTGAT-TTGTTTGA--ACAGCATATAATTAT-ATGAAAG-CT-GT-GAGTTTGC-ATCCTTTTGA---AATTGT-TAACCTCTACA-AGCTAT-AAAACTTA-CCCCCACCC-AACNTATA-GTGTCCGG-ATACAGTGGCTGATTTAGAGGGGGCAGCCNCCCCCCCCCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGGATAGGGCGATTTGTAAAAGCTTGACA-GCGCCGTTCC-T-T-AC--GC-AA-C-GCGCC---T-TT-GCC---GCTAAT-ACATAAT-AATGT-AA----ATAATT-TTCA-TTTTTCGCTT--CTAAGGGTGAATGCAA-GTTTA---TT---AAAG-GTGTTAACGCGA--AA-CGCGCTGT-TTTGTTA--AGGGTTTG------GGGGGGT-GGC-AGG-TGGG-GTGGTGTTG---CTAT-TTGA-AA--GTAC--GCAACT-T--A-CGAAGCGC-ACCTTCGCTCA-AACATTTTTTTTTCTCTTTTATTAAAAT-TCAAA-TATATCACA-C-ATGCCATAT-ATC-AATACATACTTCGCTC--A-AACA---T-GATAAAC--ATTTACTAGTAACTTTTAA-CTGCTGAC--GCGA------AG---AT--GC-G------CTG-GG--NAAAG-----TT----G-G-A---GGCG-GA-CATATAGNGA-CACTTT----GGGGAAAAAA-G-----TGG-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-GGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-TAAG--GACAGTTT-GG--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGCGGAC-ATATAAGG-ACA-GGC-GG-ACATATAAG
gi|1 : GTACTATGCCTCAGCATGTTATTGGC-AGATTGTTTTTTTAAAATTCCTC-CACATATATCTCCGTTATTGAAAGAAGG-AAACCTTAT--AAA-TTGGGGGGACTA-AAGCGTTTAAGATCACATGTGGACATAAAAGA-AAAG-C-T--ACATTGTGTGGGG-ATTTTCCAGCTTG-CGTGTGCT-TTGTTTGA--ACA-TAT-TAATTATAATGAAA--CT-GT-GAGTTTGCAATCTTTTTGA---AATTG--TAACCTCT-CA-AGCTAT-AAAACTTA-CCCCCACAC-AAACTATAGGTGTCTGG-ATACAGTAGCTGATTTAGAGGGGGCAGCCCCCCCCCCCC
gi|1 : tatcgctgtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncGGATAGGGCGATT-GTAAA-GCTTGACATGCGCCG--CC-T-TGAC--GC-AAACAGCGCC---TGTT-GC----GCTAAT-ACATAAT-AATGTCAA----ATAATT-TTCA-TTTT-CGCTT--CTAAGGGTGAATGCAATGTTTA---TTGATAAAG-GTGTTAACGCGA--AATCGCGCTGT-TTTGTGA--AGGGTTTT------GGTAGGT-GGC-AGG-TGGG--TAGTGTTG---TTAT-TTGA-AA--GTAC--CCAACT-TTAG-CGAAGCGCCACCTTCGCC---AACACTTTTTT--CTTCTTTATTAAAAT-TCAAA-TCTATCACA-C-AT-CCATATGATCGAATACATACTTCGCTTCGA-AACACATT-GATAAAC--ATT-ACTAGTAACTTTTAA-CTGCTGAC--GCGA------AG---AT--GC-G------CTG-GAGTTAAAG-----TT----GAG-A---GGGGCGA-CATATAG-GA-CACTCT-----TGGAAAAAA-G-----TGG-GTCGGACATATTA-GTGCAGGCGGACA-GAG---TA-A--GAC-GTTG-GTTCCAA--AAA--TT-GGGCGG-ACATT--------T-GTGCAGG-GCGGGGACAGCGTA-TAAG--TTC-GTTT-GG--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAGTT--GCGAGGCGGAC-ACATAAGGAACATGGC-GGAACATATAAGnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggatagggcgattgtaaagcttgacatgcgccgccttgacgcaaacagcgcctgttgcgctaatacataataatgtcaaataattttcattttcgcttctaagggtgaatgcaatgtttattgataaaggtgttaacgcgaaatcgcgctgttttgtgaagggttttggtaggtggcaggtgggtagtgttgttatttgaaagtacccaactttagcgaagcgccaccttcgccaacacttttttcttctttattaaaattcaaatctatcacacatccatatgatcgaatacatacttcgcttcgaaacacattgataaacattactagtaacttttaactgctgacgcgaagatgcgctggagttaaagttgagaggggcgacatataggacactcttggaaaaaagtgggtcggacatattagtgcaggcggacagagtaagacgttggttccaaaaattgggcggacatttgtgcagggcggggacagcgtataagttcgtttggtccaaaattgggcggacatttagttgcgaggcggacacataaggaacatggcggaacatataaggac
gi|10 : tatcgctgtatgnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnncgtactatgcctcagcatgttattggcagattgtttttttaaaattcctccacatatatctccgttattgaaagaaggaaaccttataaattggggggactaaagcgtttaagatcacatgtggacataaaagaaaagctacattgtgtggggattttccagcttgcgtgtgctttgtttgaacatattaattataatgaaactgtgagtttgcaatctttttgaaattgtaacctctcaagctataaaacttacccccacacaaactataggtgtctggatacagtagctgatttagagggggcagccccccccccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnCTGGACA-GCGCCGTTCCCT-T-ATCTGCCAA-CTGCGCC---T-TTTGCCCAAGCTAAT-ACAAAAT-AATGT-AA----AGAATT-T--A-TTTTTGGCTTTGCTAA-GGTGAATGCAA-TTTAA---TT---GAgac
gi|11 : --AAA--CC-GGGTGG-ATATA--------TAGTGCA-G-GC--GCACA---TA-TAAC--GGCAATTT-GGT-TTC-AAAATT-GGGCGAAG-ATTTAG-T--AT-AGGCGGAC-ATAT-AGT-GCA-GGA-GG-ACACATAAGgtaaa
gi|12 : -G-CGGGCATA-TA-AGACAGATGGACA-TA----CAGAGCGACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-TGGTAG-GAATTCATACGTATAGTGCA-G-GC--GGACA---AA-TAAG--GAgac
gi|13 : t-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--AT-AGGCGG-ATATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-TA------------------------------GCGGAC-ATAAAG-T--GC-AGGCGGAC-ATA-AAG
gi|14 : -GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GATTC-A--ACA--TT-CGGTGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-
gi|15 : TTTTCTTTCTCTTTTATTAAAATGTCAAA-TATATCACA-CAATGCCATAT-ATC-AA
gi|16 : TTTTTTTTTCTCTTTTATTAAAAT-TCAAA-TATATCACA-C-ATACCATAT-AT
gi|17 : G-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-G
gi|2 : gtggaGTACTATGCCTCA-CATGTTAT-GGCTAGATTGTTTT---AAAATTCCTCACATATATATCTCCGTTAT-GAAAGAAGGAAAACCTTAT--AAATTTGGGGGGACTA-AA--GTTTAAGATCACATGTGGACATAAAAGA-AAAG-CCT--ACATTGTGTGGGGGATGTTCCAGCTTG-CGTGTGAT-TTGTTTGA--ACAGC-TATAATTA--A-GAAAA-CTTGT-GAGTTTGC-ATC-TTTTGA---AATTGT-TAACCTCTACA-AGCTAT--AAACTTA-CCCCCACCC-AACATATA-GTGTCTGG-ATACAGTGGCTGATTTAGAGGGGGCAGCCGCCCCCCCCCCga
gi|2 : tgctacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGATAGGGCGATTTGTAAAAGCTTGACA-GCGC-GTTCC-T-T-AC--GC-AA-C-GCGCC---T-TT-GC----GCTAAT-ACATAAT-AATGT-AA----ATAATT-TTCA-TTTTTCGCTT--CTAAGGGTGAATGCAA-GTTTG---TA---AAAGCGTGTTAACGCAA--GA-CGCGCTGT-TTTGTTA--AGGGTTTG------GGGGGGT-G-C-AGG-TGGG-GTAGTGTTG---C-AT-TTGA-AA--GTA---GCAACT----A-CGAAGCGC-ACCTTCGCTCA-AACATTTTTTTTTCTCTTTTATTAAAAT-TCAAA-TATATCACA-C-ATGCCATAT-ATC-AATACATACT-CGCTC--A-AACA---T-GATAAAC--ATTTACTAGTAACTTTTAA-CTGCTGAC--GCGA------AG---AT--GC-G------CTG-GG--TAAAG-----TT----G-G-A---GGCG-GA-CATATAAGGA-CACTTT----GGAAAAAAAA-G-----TGG-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGCGGACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-GGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GC--GGACA---TA-TAAG--GACAGTTT-GG--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGCGGAC-ATATAAGG-ACA-GGC-GG-A-ATATAAGccccccccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnggatagggcgatttgtaaaagcttgacagcgcgttccttacgcaacgcgcctttgcgctaatacataataatgtaaataattttcatttttcgcttctaagggtgaatgcaagtttgtaaaagcgtgttaacgcaagacgcgctgttttgttaagggtttgggggggtgcaggtggggtagtgttgcatttgaaagtagcaactacgaagcgcaccttcgctcaaacatttttttttctcttttattaaaattcaaatatatcacacatgccatatatcaatacatactcgctcaaacatgataaacatttactagtaacttttaactgctgacgcgaagatgcgctgggtaaagttggaggcggacatataaggacactttggaaaaaaaagtgggcggacatatagtgcaggcggacatataaggacagtttggtccaaaattgggcggacatttagtgcaggcggacatataaggacagtttggtccaaaattgggcggacatttagtgcaggcggacatataaggacaggcggaatataagactc
gi|3 : tgctacnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnngtactatgcctcacatgttatggctagattgttttaaaattcctcacatatatatctccgttatgaaagaaggaaaaccttataaatttggggggactaaagtttaagatcacatgtggacataaaagaaaagcctacattgtgtgggggatgttccagcttgcgtgtgatttgtttgaacagctataattaagaaaacttgtgagtttgcatcttttgaaattgttaacctctacaagctataaacttacccccacccaacatatagtgtctggatacagtggctgatttagagggggcagccgccccccccccccccccccccnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnnGGT-GGC-AGGATGGG-GTG---TT----CTATATTGA-AATAGTATTAGCAACT-T--AACGAAGCGC-ACTCTCGCTCA-AACATTTTTTTT-CTCTTTT-TTAAAAT-TCAAAATATATCACATC-ATGCCATAT-ATA-ATTACATACT-CGCTCT-A-AACA---T-GA-AAAC--ATTTACTAGTAACATGTGATCTGC-GACTTGCGA------AGTTCATTTGCTG------CTGTGG--TAAAG-----TG----G-A-A---GGCG--A-CATATAG--A-CACTTT----GAAAAAAAAGTG-----TGC-G-CGAACATA-TA--TGCAGGCG-ACA-TA----TA-AG-GACAGTTT-GGTCC-A--AAA--TT-GGGC-G-ACATTG-------CAG-GCA---GC--GAACA---TA-TAAG--GACAGTTT-GG--TCCAAAAATT-GGGCGGA--ATTTA--T--GC-AGGCGGAC-ATAT-AGT-GCA-GGC-actc
gi|4 : GA------TG---AC--GC-A------CTG------AAAT-----TTTAATG-GCA---GGCG-GA-CATATAGCGA-CAGTTT----GGGGAAAAAA-------TGG-G-CGGACATA-TA-GTG-------ACACTT----TG-GG-GGGGGGGG-GG-------GAA--T--GGGCGG-ACATA--------TAGTGCA-G-GA--GGACA---TAATAGC--GACATTTT-GG--TCC-AAAATTTGGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGTGGAC-ATATAGCG-ACA-G
gi|4 : gcactgaatagtcgaactattcaatgactaaacacatgG-GG--AAAAA-----AT----G-G------GCG-GA-CATATAGTGA-CACTTT----GGGGGGGGGG-GGGGAATGG-G-CGGACATA-TA-GTGCAGGAGGACA-TAA---TA-GC-GACATTTT-GGTCC-A--AAA--TTTGGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-G-GT--GGACA---TA-TAGC--GACAGTTTTGA--TCC-AAAATT-GGGCGGAC-ATTTAG-T--GC-AGGCGGACAATATAAGG-ACttttgatccaaaattgggcggacatttagtgcaggcggacaatataaggac
gi|5 : gcactgaatagtcgaactattcaatgactaaacacatggatgacgcactgaaattttaatggcaggcggacatatagcgacagtttgCGATTTGTAAAAGCTTGTCA-GCGCCGTTTA-TCT-AC--GC-AA-C-GCGCCATTT-TT-GCC---GCTAATGAC-TAATAAATGT-AATCAGATAATTATTCACTTTCTCACTT--GTAAGGGTGAATGCAA-GTTCATGTTT---AAAG-GTGGTAACGCGAAGAA-CGCACTGTATTTGTTAGGAGGTTTTGGGATGCGGGGGGTCGGCGAGG-AGGGCGTGGTGGTGTGTCCGT-ATGATAA--TTA---ACAACTAT--A-CGCAGCCC-ACCTTCGCTCACAACA
gi|6 : cgatAAA-TATATAAC------GCCATA--A-C-AATACATACTTCG-TC--A-A-CA---TCGATAA-C--ATTTACTA--------TAA-CT-----C--GCGA------AG---AT--GT-G------TTG-AG--TAAAG-----TT----G-G-ACAGGGC--GA-TATATAAGGA-CAGTTT----GGTCAAAA---------T-T-G-CGGACATA-TA-GTGCA-GCGGA-A-TA----TA-AG-GACAG-TT-GGTCC-A--AAAATTT-GGGCGG-ACATT--------TAGTGCA-GAGC--GGACA---TA-TA----GACAGTTT-GG--TCC-AAA----GGGCGGACAATTTAG-T--GC-AGGC-GAT-A-ATAAGG-ACA-GGCAGG-AAAT
gi|7 : --A-AACA---C-AATGAGCTGACTCACTG--AAATTTTAA-TGGCAGGC--G-GACATTGTAG---A---GC-GACAAGTTTG-GG--AAAAA-------------A-G---GGCG-GA-CATATAGTGA-CACTTTTGGGGGGGGGGGGA-A-----TGG-G-CG-ACATACTA-GTGCAGGAGGACA-TAATTATA-GGCGACATTTT-GGTCC-A--AAAATTT-GGGCGGGACATT--------TAGTGCA-G-GT--GGACA---TA-T-AGTCGACAGTTT-TGATTCC-AAAAT---GGCGGAC-ATTTAG-TGCGC-AGGCGGAC-ATATAAGG-AC
gi|8 : AGGAAAAC-TTATTTAATTTTGGGGGGACTATAG--GTTTAC-ATCA---GTAGACATAAAAGACAAAGAC-TTAACATTGTG-AGGG-ATGTTCCAGCTTGCCGTGTGATAGTATTTGAACACAACATATATTTAT-ATGAAAGACT-GTCGTGTTTGC-A-CCTTTTGACGTAATTGTCTAACCCGTACATAGCTATAAAAACTTAGCCCCAACCCGAACTTATA-GTGTCCGGCATACAGT
gi|9 : TCGCTC--ACAACA---T-GATATAC--ATTTACTGCTAACTTTATT-CTGCTGAC---CGA------AG---AT---C-G------GAG-GT--AAGAGTGGTCTT----GAG-G---GGCG-GATCATATA-TGACCACTTT-----GGAAAAAAA-G-----TGGAG-CGGACATA-TAGGTGCAGGC-GACA--A----TA-AG-GACAGTTTGGGGCC-AATAAA--TT-GGGCGG-ACATT--------